# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1
# text = Table des Matières
1	Table	table	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Matières	Matières	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2
# text = Table des Illustrations
1	Table	table	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Illustrations	Illustrations	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3
# text = Figure 0 :
1	Figure	figurer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	0	0	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-4
# text = Les paramètres de définition de la superhélicité de l'ADN 11
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	paramètres	paramètre	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	définition	définition	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	ADN	ADN	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	11	11	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-5
# text = Figure 1 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-6
# text = Activité des différentes Topos 13
1	Activité	activité	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	différentes	différent	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	Topos	Topos	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	13	13	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-7
# text = Figure 2 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	2	2	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-8
# text = Mécanisme d'action d'une Topo de type IIA 14
1	Mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	action	action	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	Topo	Topo	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	type	type	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	IIA	IIA	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	14	14	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-9
# text = Figure 3 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	3	3	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-10
# text = Structure d'une Topo de type IA 15
1	Structure	structure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	une	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	Topo	Topo	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	type	type	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	IA	IA	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	15	15	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-11
# text = Figure 4 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	4	4	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-12
# text = Mécanisme d'action de la TopoI 15
1	Mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	action	action	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	TopoI	TopoI	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	15	15	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-13
# text = Figure 5 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	5	5	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-14
# text = Modèle de Liu et Wang et boucles R 17
1	Modèle	modèle	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Liu	Liu	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	Wang	Wang	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	7	mark	_	_	_	_	_
7	boucles	boucle	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
8	R	R	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	17	17	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-15
# text = Figure 6 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	6	6	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-16
# text = Les différents domaines des Topos de type IIA 20
1	Les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	différents	différent	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	domaines	domaine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	des	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	Topos	Topos	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	type	type	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	IIA	IIA	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	20	20	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-17
# text = Figure 7 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	7	7	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-18
# text = Mécanisme d'action des Topos de type II , ici de la gyrase 20
1	Mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	action	action	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	Topos	Topos	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	type	type	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	II	II	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
10	ici	ici	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	gyrase	gyrase	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	20	20	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-19
# text = Figure 8 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	8	8	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-20
# text = Rôle de la sous-unité GyrA de la gyrase d'E. coli dans la modification de la superhélicité de l'ADN 21
1	Rôle	rôle	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	sous-unité	sous-	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	GyrA	GyrA	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	gyrase	gyrase	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	E.	E.	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	coli	coli	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	modification	modification	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	ADN	ADN	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	21	21	NUM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-21
# text = Figure 9 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	9	9	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-22
# text = Effets sur l'ADN de la protéine H-NS 24
1	Effets	effet	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	sur	sur	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	ADN	ADN	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	protéine	protéine	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	H-NS	H-NS	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	24	24	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-23
# text = Figure 10 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	10	10	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-24
# text = Mécanisme de répression de la transcription par H-NS 24
1	Mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	répression	répression	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	transcription	transcription	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	par	par	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	H-NS	H-NS	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	24	24	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-25
# text = Figure 11 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	11	11	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-26
# text = Effet sur l'ADN des protéines courbant l'ADN 25
1	Effet	effet	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	sur	sur	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	ADN	ADN	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	protéines	protéine	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	courbant	courber	VPR	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	ADN	ADN	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	25	25	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-27
# text = Figure 12 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	12	12	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-28
# text = Effet antagoniste de HU et H-NS sur un plasmide 26
1	Effet	effet	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	antagoniste	antagoniste	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	HU	HU	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	H-NS	H-NS	NOM	_	_	4	para	_	_	_	_	_
7	sur	sur	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	un	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	plasmide	plasmode	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	26	26	NUM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-29
# text = Figure 13 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	13	13	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-30
# text = Protection de l'ADN par Dps 27
1	Protection	protection	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	ADN	ADN	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	Dps	Dps	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	27	27	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-31
# text = Figure 14 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	14	14	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-32
# text = Effet de la protéine Fis sur la structure du nucléoïde et la transcription 29
1	Effet	effet	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	protéine	protéine	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	Fis	Fis	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	sur	sur	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	structure	structure	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	du	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	nucléoïde	nucléoïde	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	transcription	transcription	NOM	_	_	8	para	_	_	_	_	_
14	29	29	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-33
# text = Figure 15 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	15	15	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-34
# text = Structure d'un dimère de Fis 30
1	Structure	structure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	un	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	dimère	dimère	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	Fis	Fis	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	30	30	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-35
# text = Figure 16 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	16	16	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-36
# text = Régulation du promoteur de fis 31
1	Régulation	régulation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	du	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	promoteur	promoteur	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	31	31	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-37
# text = Figure 17 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	17	17	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-38
# text = Complémentarité entre l'ARNr 16S et l'extrémité 5 'non traduite de l'ARNm fis 33
1	Complémentarité	complémentarité	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	entre	entre	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	ARNr	ARNr	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	16S	16S	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	extrémité	extrémité	NOM	_	_	4	para	_	_	_	_	_
9	5	5	NUM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
10	'	'	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
11	non	non	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	traduite	traduire	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	ARNm	ARNm	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	fis	faire	VRB	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
17	33	33	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-39
# text = Figure 18 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	18	18	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-40
# text = Région promotrice de rrnB 34
1	Région	région	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	promotrice	promoteur	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	rrnB	rrnB	VNF	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	34	34	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-41
# text = Figure 19 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	19	19	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-42
# text = Modèle d'interaction de Fis avec l'ARN polymérase sur le promoteur rr B P1 34
1	Modèle	modeler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	interaction	interaction	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	Fis	Fis	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	avec	avec	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
8	ARN	ARN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	polymérase	polymérase	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	sur	sur	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	le	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	promoteur	promoteur	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	rr	ra	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	B	B	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	P1	P1	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
16	34	34	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-43
# text = Figure 20 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	20	20	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-44
# text = Système de recombinaison par Hin 36
1	Système	système	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	par	par	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	Hin	Hin	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	36	36	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-45
# text = Figure 21 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	21	21	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-46
# text = Types de structures formées par MukB 41
1	Types	type	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	structures	structure	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	formées	former	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	MukB	MukB	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	41	41	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-47
# text = Figure 22 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	22	22	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-48
# text = Système rapporteur sensible à la superhélicité de l'ADN 42
1	Système	système	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	rapporteur	rapporteur	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	sensible	sensible	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	à	à	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	ADN	ADN	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	42	42	NUM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-49
# text = Figure 23 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	23	23	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-50
# text = Modèle de compaction du chromosome par H-NS et Fis 44
1	Modèle	modèle	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	compaction	compaction	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	du	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	chromosome	chromosome	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	H-NS	H-NS	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	Fis	Fis	NOM	_	_	7	para	_	_	_	_	_
10	44	44	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-51
# text = Figure 24 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	24	24	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-52
# text = Structure des macrodomaines d'E. coli et leur réponse à la topologie de l'ADN 47
1	Structure	structure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	macrodomaines	macro-	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	E.	E.	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	coli	coli	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
8	leur	son	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	réponse	réponse	NOM	_	_	6	para	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	topologie	topologie	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	ADN	ADN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	47	47	NUM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-53
# text = Figure 25 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	25	25	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-54
# text = Réorganisation du chromosome en fonction des conditions de croissance 48
1	Réorganisation	réorganisation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	du	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	chromosome	chromosome	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	en	en	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	fonction	fonction	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
7	conditions	condition	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	croissance	croissance	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	48	48	NUM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-55
# text = Figure 26 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	26	26	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-56
# text = Boucle de régulation homéostatique de la superhélicité de l'ADN 51
1	Boucle	boucle	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	régulation	régulation	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	homéostatique	homéostatique	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	ADN	ADN	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	51	51	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-57
# text = Figure 27 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	27	27	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-58
# text = Détermination du fitness de clones évolués par des expériences de compétitions 59
1	Détermination	détermination	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	du	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	fitness	fine	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	clones	clone	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	évolués	évolué	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	des	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	expériences	expérience	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	compétitions	compétition	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	59	59	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-59
# text = Figure 28 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	28	28	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-60
# text = Effet sur le fitness des allèles évolués topA
1	Effet	effet	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
2	sur	sur	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	le	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	fitness	fine	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	allèles	allèle	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	évolués	évolué	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	topA	toper	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-61
# text = - 1 et fis
1	-	-	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	4	mark	_	_	_	_	_
4	fis	faire	VRB	_	_	2	para	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-62
# text = - 1 dans le contexte génétique du clone ancêtre 98
1	-	-	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	dans	dans	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	contexte	contexte	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	génétique	génétique	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	du	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	clone	clone	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	98	98	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-63
# text = Figure 29 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	29	29	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-64
# text = Les régions promotrices des gènes ompF et ompC 107
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	régions	région	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	promotrices	promoteur	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	gènes	gène	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ompF	ompF	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	ompC	ompC	VPR	_	_	6	para	_	_	_	_	_
9	107	107	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-65
# text = Figure 30 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	30	30	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-66
# text = Activités spécifiques & 206;& 178;-galactosidase correspondant aux fusions ompFB-lacZ
1	Activités	activité	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	spécifiques	spécifique	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	β-galactosidase	β-galactosidase	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	correspondant	correspondre	VPR	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	aux	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	fusions	fusion	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ompFB-lacZ	ompFB-lacZ	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-67
# text = dans différents contextes génétiques isogéniques du clone ancêtre 108
1	dans	dans	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	différents	différent	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	contextes	contexte	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	génétiques	génétique	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	isogéniques	isogénique	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	du	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	clone	clone	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	108	108	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-68
# text = Figure 31 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	31	31	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-69
# text = Activités spécifiques & 206;& 178;-galactosidase des fusions ompFB-lacZ en fonction de la concentration en NaCl 108
1	Activités	activité	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
2	spécifiques	spécifique	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	β-galactosidase	β-galactosidase	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	fusions	fusion	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ompFB-lacZ	ompFB-lacZ	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	en	en	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	fonction	fonction	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	concentration	concentration	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	en	en	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	NaCl	NaCl	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	108	108	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-70
# text = Figure 32 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	32	32	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-71
# text = Fixation de Fis sur la région promotrice de ompF 109
1	Fixation	fixation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Fis	Fis	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	sur	sur	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	région	région	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	promotrice	promoteur	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	ompF	ompF	VNF	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	109	109	NUM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-72
# text = Figure 33 :
1	Figure	figurer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	33	33	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-73
# text = Empreintes à la DNase I de la protéine Fis sur la région promotrice de ompF 110
1	Empreintes	empreinte	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	à	à	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	DNase	DNase	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	I	I	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	protéine	protéine	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	Fis	Fis	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	sur	sur	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	région	région	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	promotrice	promoteur	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	ompF	ompF	VNF	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	110	110	NUM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-74
# text = Figure 34 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	34	34	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-75
# text = Région promotrice de ompF et localisation des sites de fixation de Fis 111
1	Région	région	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	promotrice	promoteur	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ompF	ompF	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	localisation	localisation	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
7	des	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	sites	site	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	fixation	fixation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	Fis	Fis	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	111	111	NUM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-76
# text = Figure 35 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	35	35	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-77
# text = Activités spécifiques & 206;& 178;-galactosidase des fusions transcriptionnelles
1	Activités	activité	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	spécifiques	spécifique	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	β-galactosidase	β-galactosidase	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	fusions	fusion	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	transcriptionnelles	transcriptionnel	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-78
# text = ompF K 12 -lacZ dans les contextes isogéniques K12 et K 12 & 226;& 136;& 134; fis 112
1	ompF	ompF	ADV	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
2	K	K	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
3	12	12	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	-lacZ	-lacZ	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	contextes	contexte	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	isogéniques	isogénique	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	K12	K12	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
11	K	K	NOM	_	_	9	para	_	_	_	_	_
12	12	12	NUM	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	∆	∆	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
14	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	112	112	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-79
# text = Figure 36 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	36	36	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-80
# text = Activités spécifiques & 206;& 178;-galactosidase des fusions transcriptionnelles ompF B-
1	Activités	activité	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	spécifiques	spécifique	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	β-galactosidase	β-galactosidase	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	fusions	fusion	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	transcriptionnelles	transcriptionnel	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ompF	ompF	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	B-	B-	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-81
# text = lacZ ou ompF K12 - lacZ dans les contextes génétiques E. coli B ou K12 112
1	lacZ	lacZ	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	ou	ou	COO	_	_	3	mark	_	_	_	_	_
3	ompF	ompF	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	K12	K12	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	-	-	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	lacZ	lacZ	VPR	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
7	dans	dans	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	contextes	contexte	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	génétiques	génétique	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	E.	E.	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	coli	coli	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	B	B	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
14	ou	ou	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	K12	K12	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
16	112	112	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-82
# text = Figure 37 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	37	37	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-83
# text = Activités spécifiques & 206;& 178;-galactosidase des fusions transcriptionnelles
1	Activités	activité	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	spécifiques	spécifique	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	β-galactosidase	β-galactosidase	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	fusions	fusion	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	transcriptionnelles	transcriptionnel	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-84
# text = ompR - lacZ ou ompC & 226;& 128;& 147; lacZ dans les contextes génétiques E. coli B et K12 113
1	ompR	uw-uw	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
2	-	uw-uw	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	lacZ	uw-uw	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	ou	ou	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	ompC	ompC	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
6	–	–	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	lacZ	lacZ	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	dans	dans	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	les	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	contextes	contexte	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	génétiques	génétique	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	E.	E.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	coli	coli	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	B	B	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	K12	K12	NOM	_	_	14	para	_	_	_	_	_
17	113	113	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-85
# text = Figure 38 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	38	38	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-86
# text = Fixation de Fis sur les régions promotrices de ompR ( A ) ou ompC ( B ) 114
1	Fixation	fixation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Fis	Fis	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	sur	sur	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	régions	région	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	promotrices	promoteur	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	ompR	ompR	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	(	(	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	A	A	_	_	_	6	parenth	_	_	_	_	_
12	)	)	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
13	ou	ou	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	ompC	ompC	NOM	_	_	6	para	_	_	_	_	_
15	(	(	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	B	B	NOM	_	_	14	para	_	_	_	_	_
17	)	)	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
18	114	114	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-87
# text = Figure 39 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	39	39	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-88
# text = Détermination des sites de fixation de Fis sur les régions promotrices de ompR ou ompC par des expériences d'empreintes à la DNase I 114
1	Détermination	détermination	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	sites	site	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	fixation	fixation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	Fis	Fis	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	sur	sur	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
9	les	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	régions	région	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	promotrices	promoteur	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	ompR	ompR	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	ou	ou	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
15	ompC	ompC	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	par	par	PRE	_	_	12	para	_	_	_	_	_
17	des	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	expériences	expérience	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	d'	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	empreintes	empreinte	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	à	à	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	DNase	DNase	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	I	I	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	114	114	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-89
# text = Figure 40 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	40	40	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-90
# text = Régions promotrices de ompR ( A ) ou ompC
1	Régions	région	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	promotrices	promoteur	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ompR	ompR	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	(	(	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	A	A	_	_	_	1	parenth	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
8	ou	ou	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	ompC	ompC	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-91
# text = ( B ) et localisation des sites de fixation de Fis 115
1	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	B	B	NOM	_	_	5	parenth	_	_	_	_	_
3	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	localisation	localisation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	des	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	sites	site	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	fixation	fixation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	Fis	Fis	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	115	115	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-92
# text = Figure 41 :
1	Figure	figurer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	41	41	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-93
# text = Fixation de OmpR sur ompF 118
1	Fixation	fixation	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	OmpR	OmpR	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	sur	sur	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ompF	ompF	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	118	118	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-94
# text = Tableau 1 :
1	Tableau	tableau	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-95
# text = Nom des souches utilisées dans les 3 parties des résultats 89
1	Nom	nom	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	souches	souche	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	utilisées	utiliser	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
7	3	3	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	parties	partie	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	des	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	résultats	résultat	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	89	89	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-96
# text = Tableau 2 :
1	Tableau	tableau	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	2	2	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-97
# text = Modification de l'expression de protéines par les allèles évolués topA et fis
1	Modification	modification	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	expression	expression	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	protéines	protéine	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	par	par	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	allèles	allèle	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	évolués	évolué	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	topA	toper	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	fis	faire	VRB	_	_	11	para	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-98
# text = isolés dans la population Ara- 1 105
1	isolés	isoler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	dans	dans	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	population	population	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	Ara-	Ara-	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1	1	NUM	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	105	105	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-99
# text = Abréviations
1	Abréviations	abréviation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-100
# text = ADN :
1	ADN	adn	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-101
# text = Acide DéoxyRibonucléique
1	Acide	acide	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	DéoxyRibonucléique	DéoxyRibonucléique	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-102
# text = ARN ( r , m , t ) :
1	ARN	arn	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	(	(	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
3	r	gramme	NOM	_	_	1	parenth	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
5	m	Monsieur	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	t	tome	NOM	_	_	5	para	_	_	_	_	_
8	)	)	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
9	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-103
# text = Acide Ribonucléique ( Ribosomique , Messager , de Transfert )
1	Acide	acide	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Ribonucléique	Ribonucléique	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	(	(	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
4	Ribosomique	Ribosomique	NOM	_	_	1	parenth	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	Messager	Messager	NOM	_	_	4	para	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	Transfert	Transfert	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	)	)	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-104
# text = ATP :
1	ATP	atp	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-105
# text = Adénosine TriPhosphate
1	Adénosine	adénosine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	TriPhosphate	TriPhosphate	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-106
# text = CTD :
1	CTD	CTD	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-107
# text = Domaine C-Terminal
1	Domaine	domaine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	C-Terminal	C-Terminal	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-108
# text = CTP :
1	CTP	CTP	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-109
# text = Cytosine TriPhosphate
1	Cytosine	Cytosine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	TriPhosphate	TriPhosphate	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-110
# text = GTP :
1	GTP	GTP	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-111
# text = Guanine TriPhosphate
1	Guanine	guanine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	TriPhosphate	TriPhosphate	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-112
# text = IPTG :
1	IPTG	IPTG	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-113
# text = Isopropyl-& 206;& 178;-D-thiogalactopyranoside
1	Isopropyl-β-D-thiogalactopyranoside	Isopropyl-β-D-thiogalactopyranoside	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-114
# text = LB :
1	LB	lb	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-115
# text = Luria Broth
1	Luria	Luria	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Broth	Broth	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-116
# text = Lk :
1	Lk	Lk	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-117
# text = Linking number ( nombre de liens )
1	Linking	Linking	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	number	nimber	VNF	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	(	(	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	nombre	nombre	NOM	_	_	2	parenth	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	liens	lien	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-118
# text = NAP :
1	NAP	NAP	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-119
# text = Protéine Associée au Nucléoïde
1	Protéine	protéine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Associée	Associée	VPP	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	au	à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	Nucléoïde	Nucléoïde	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-120
# text = NTD :
1	NTD	NTD	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-121
# text = Domaine N-terminal
1	Domaine	domaine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	N-terminal	N-terminal	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-122
# text = ompF
1	ompF	ompF	ADV	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-123
# text = B ou K 12 :
1	B	B	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	ou	ou	COO	_	_	3	mark	_	_	_	_	_
3	K	K	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	12	12	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-124
# text = Gène ompF d'E. coli
1	Gène	gène	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	ompF	ompF	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	E.	E.	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	coli	coli	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-125
# text = B ou K12
1	B	B	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	ou	ou	COO	_	_	3	mark	_	_	_	_	_
3	K12	K12	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-126
# text = OmpR-P :
1	OmpR-P	OmpR-P	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-127
# text = Protéine OmpR phosphorylée
1	Protéine	protéiner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	OmpR	OmpR	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	phosphorylée	phosphorylée	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-128
# text = RBS :
1	RBS	rbs	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-129
# text = Site de Fixation des Ribosomes
1	Site	site	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Fixation	Fixation	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	Ribosomes	Ribosomes	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-130
# text = TA :
1	TA	son	_	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-131
# text = Tétrazolium-Arabinose
1	Tétrazolium-Arabinose	Tétrazolium-Arabinose	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-132
# text = TopoI , III , IV :
1	TopoI	TopoI	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
3	III	III	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
5	IV	IV	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-133
# text = Topoisomérase I , III ou IV
1	Topoisomérase	Topoisomérase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	I	I	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	III	III	ADJ	_	_	1	para	_	_	_	_	_
5	ou	ou	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	IV	IV	ADJ	_	_	4	para	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-134
# text = TopoIA , IIA :
1	TopoIA	TopoIA	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	IIA	IIA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-135
# text = Topoisomérases de type IA , IIA
1	Topoisomérases	Topoisomérases	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	type	type	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	IA	IA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	IIA	IIA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-136
# text = Topos :
1	Topos	topo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-137
# text = Topoisomérases
1	Topoisomérases	Topoisomérases	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-138
# text = Xgal :
1	Xgal	Xgal	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-139
# text = 5- bromo- 4- chloro- 3- indolyl-& 206;& 178;-D-Galactopyranoside
1	5-	5-	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	bromo-	brome	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	4-	4-	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	chloro-	chlorer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	3-	3-	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	indolyl-β-D-Galactopyranoside	indolyl-β-D-Galactopyranoside	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-140
# text = Glossaire
1	Glossaire	glossaire	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-141
# text = Fitness :
1	Fitness	Fitness	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-142
# text = capacité de reproduction d'une souche .
1	capacité	capacité	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	reproduction	reproduction	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	souche	souche	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-143
# text = Fixation d'une mutation :
1	Fixation	fixation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	une	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	mutation	mutation	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-144
# text = une mutation est dite «  fixée  » lorsqu'elle est portée par la majorité des clones composant la population à un temps donné .
1	une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutation	mutation	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	dite	dire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	« 	«	_	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	fixée	fixer	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	 »	»	_	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	lorsqu'	lorsque	CSU	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	elle	elle	CLS	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
10	est	être	VRB	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	portée	porter	VPP	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	par	par	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	majorité	majorité	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	des	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	clones	clone	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	composant	composer	VPR	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	population	population	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	à	à	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	un	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	temps	temps	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	donné	donner	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-145
# text = Parallélisme de l'évolution :
1	Parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	évolution	évolution	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-146
# text = Il s'agit de l'évolution indépendante , et dans une direction similaire , d'un même caractère , dans différentes populations soumises à des environnements équivalents .
1	Il	il	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	s'	s'	CLI	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	agit	agir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	évolution	évolution	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	indépendante	indépendant	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	4	para	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	direction	direction	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	similaire	similaire	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
15	d'	de	PRE	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
16	un	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
17	même	même	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	caractère	caractère	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	dans	dans	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	différentes	différent	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	populations	population	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	soumises	soumettre	VPP	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	à	à	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	des	un	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	environnements	environnement	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	équivalents	équivalent	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-147
# text = Le parallélisme de l'évolution peut se refléter à différents niveaux :
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	évolution	évolution	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	peut	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	se	se	CLI	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	refléter	refléter	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	différents	différent	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	niveaux	niveau	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	:	:	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-148
# text = phénotypique , génétique et moléculaire .
1	phénotypique	phénotypique	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	génétique	génétique	ADJ	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	moléculaire	moléculaire	ADJ	_	_	3	para	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-149
# text = Interférence clonale :
1	Interférence	interférence	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	clonale	clonal	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-150
# text = phénomène observé lorsqu'une population est composée de plusieurs sous-populations cellulaires , portant des mutations différentes mais qui apportent un avantage équivalent .
1	phénomène	phénomène	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	observé	observer	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	lorsqu'	lorsque	CSU	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	une	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	population	population	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	composée	composer	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	sous-populations	sous-	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	cellulaires	cellulaire	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
13	portant	porter	VPR	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	des	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	mutations	mutation	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	différentes	différent	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	mais	mais	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
18	qui	qui	PRQ	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
19	apportent	apporter	VRB	_	_	15	para	_	_	_	_	_
20	un	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	avantage	avantage	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	équivalent	équivalent	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-151
# text = Les sous-populations coexistent , empêchant la fixation rapide d'une des mutations bénéfiques .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	sous-populations	sous-	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	coexistent	coexister	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
5	empêchant	empêcher	VPR	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	fixation	fixation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	rapide	rapide	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	d'	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	une	un	PRQ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	des	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	mutations	mutation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-152
# text = Lorsqu'une mutation bénéfique supplémentaire apparaît dans une des sous-populations , celle  -ci devient majoritaire ainsi que les mutations qu'elle porte .
1	Lorsqu'	lorsque	CSU	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
2	une	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	mutation	mutation	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
4	bénéfique	bénéfique	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	supplémentaire	supplémentaire	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	apparaît	apparaître	VRB	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
7	dans	dans	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	une	un	PRQ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	des	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	sous-populations	sous-	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
12	celle	celui	PRQ	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
13	 -ci	 -ci	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	devient	devenir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	majoritaire	majoritaire	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	ainsi	ainsi que	COO	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	que	ainsi que	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
18	les	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	mutations	mutation	NOM	_	_	14	para	_	_	_	_	_
20	qu'	que	PRQ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
21	elle	elle	CLS	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
22	porte	porter	VRB	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-153
# text = Ce phénomène ralentit donc la fixation de mutations bénéfiques .
1	Ce	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	phénomène	phénomène	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	ralentit	ralentir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	donc	donc	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	fixation	fixation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	mutations	mutation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-154
# text = Spécialisation écologique :
1	Spécialisation	spécialisation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	écologique	écologique	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-155
# text = au cours de l'évolution , des fonctions inutiles dans l'environnement de sélection peuvent être perdues ou réduites .
1	au	à	PRE	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
2	cours	cours	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	évolution	évolution	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	des	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	fonctions	fonction	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
9	inutiles	inutile	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	environnement	environnement	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	sélection	sélection	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	être	être	VNF	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
17	perdues	perdre	VPP	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	ou	ou	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	réduites	réduire	VPP	_	_	17	para	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-156
# text = Deux mécanismes peuvent expliquer ce phénomène :
1	Deux	deux	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mécanismes	mécanisme	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	expliquer	expliquer	VNF	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ce	ce	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	phénomène	phénomène	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	:	:	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-157
# text = l'accumulation de mutations ou la pleïotropie antagoniste .
1	l'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	accumulation	accumulation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	mutations	mutation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ou	ou	COO	_	_	7	mark	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	pleïotropie	pleïotropie	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
8	antagoniste	antagoniste	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-158
# text = Les bactéries sont alors spécialisées pour leur environnement de sélection , et inadaptées à d'autres environnements nécessitant la présence des fonctions éliminées ou réduites au cours de l'évolution .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	bactéries	bactérie	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
4	alors	alors	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	spécialisées	spécialiser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	pour	pour	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	leur	son	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	environnement	environnement	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	sélection	sélection	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	inadaptées	inadapté	ADJ	_	_	9	para	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	d'	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
16	autres	autre	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	environnements	environnement	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	nécessitant	nécessiter	VPR	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	présence	présence	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	des	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	fonctions	fonction	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	éliminées	éliminer	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	ou	ou	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
25	réduites	réduire	VPP	_	_	23	para	_	_	_	_	_
26	au	au cours de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	cours	au cours de	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	de	au cours de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	l'	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	évolution	évolution	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-159
# text = Pleïotropie antagoniste :
1	Pleïotropie	Pleïotropie	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	antagoniste	antagoniste	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-160
# text = il s'agit d'un mécanisme conduisant à la spécialisation écologique .
1	il	il	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	s'	s'	CLI	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	agit	agir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	un	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	conduisant	conduire	VPR	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	spécialisation	spécialisation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	écologique	écologique	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-161
# text = Une mutation , sélectionnée pour le bénéfice qu'elle apporte dans l'environnement de sélection , peut avoir des effets néfastes dans d'autres environnements .
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutation	mutation	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	sélectionnée	sélectionner	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	pour	pour	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	le	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	bénéfice	bénéfice	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	qu'	que	PRQ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
9	elle	elle	CLS	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
10	apporte	apporter	VRB	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	dans	dans	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	environnement	environnement	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	sélection	sélection	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
17	peut	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	avoir	avoir	VNF	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	des	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	effets	effet	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	néfastes	néfaste	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	dans	dans	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
23	d'	un	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
24	autres	autre	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	environnements	environnement	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-162
# text = Elle a alors des effets pleïotropes ( c'est-à-dire multiples ) antagonistes .
1	Elle	elle	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	alors	alors	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	effets	effet	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	pleïotropes	héliotrope	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	(	(	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
8	c'	c'est-à-dire	COO	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	est-à-dire	c'est-à-dire	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	multiples	multiple	NOM	_	_	6	para	_	_	_	_	_
11	)	)	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
12	antagonistes	antagoniste	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-163
# text = Accumulation de mutations :
1	Accumulation	accumulation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	mutations	mutation	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-164
# text = il s'agit d'un autre mécanisme conduisant à la spécialisation écologique .
1	il	il	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	s'	s'	CLI	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	agit	agir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	un	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
6	autre	autre	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	conduisant	conduire	VPR	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	spécialisation	spécialisation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	écologique	écologique	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-165
# text = Au cours de l'évolution , des mutations neutres , voire faiblement délétères dans l'environnement de sélection peuvent s'accumuler dans des gènes non soumis à la sélection naturelle .
1	Au	à	PRE	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
2	cours	cours	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	évolution	évolution	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	des	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	mutations	mutation	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
9	neutres	neutre	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
11	voire	voire	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
12	faiblement	faiblement	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	délétères	délétère	ADJ	_	_	9	para	_	_	_	_	_
14	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	environnement	environnement	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	sélection	sélection	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	s'	s'	CLI	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	accumuler	accumuler	VNF	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	dans	dans	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	des	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	gènes	gène	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	non	non	ADV	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
26	soumis	soumettre	VPP	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	à	à	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	sélection	sélection	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	naturelle	naturel	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-166
# text = Avant Propos
1	Avant	avant	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Propos	Propos	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-167
# text = La superhélicité de l'ADN peut être considérée , chez tous les organismes vivants , comme une fonction biologique cruciale , réalisée en particulier par des topoisomérases et des histones , qui ont été fortement conservées au cours de l'évolution .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	peut	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	être	être	VNF	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	considérée	considérer	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
10	chez	chez	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	tous	tout	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	organismes	organisme	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	vivants	vivant	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	comme	comme	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
17	une	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	fonction	fonction	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	biologique	biologique	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	cruciale	crucial	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	réalisée	réaliser	VPP	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
23	en	en particulier	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	particulier	en particulier	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	par	par	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	des	un	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	topoisomérases	topoisomérase	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	et	et	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
29	des	de	PRE	_	_	25	para	_	_	_	_	_
30	histones	histone	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
32	qui	qui	PRQ	_	_	36	subj	_	_	_	_	_
33	ont	avoir	VRB	_	_	34	aux	_	_	_	_	_
34	été	être	VPP	_	_	36	aux	_	_	_	_	_
35	fortement	fortement	ADV	_	_	36	periph	_	_	_	_	_
36	conservées	conserver	VPP	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
37	au	au cours de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	cours	au cours de	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	de	au cours de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	l'	le	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	évolution	évolution	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-168
# text = Elles contrôlent le niveau de superhélicité de façon adéquate et permettent ainsi à la cellule d'effectuer les réactions indispensables à sa survie et à celle de sa descendance .
1	Elles	elles	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	contrôlent	contrôler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	le	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	niveau	niveau	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	façon	façon	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	adéquate	adéquat	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
11	permettent	permettre	VRB	_	_	2	para	_	_	_	_	_
12	ainsi	ainsi	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	cellule	cellule	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
17	effectuer	effectuer	VNF	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	les	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	réactions	réaction	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	indispensables	indispensable	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	à	à	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	sa	son	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	survie	survie	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
25	à	à	PRE	_	_	21	para	_	_	_	_	_
26	celle	celui	PRQ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	sa	son	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	descendance	descendance	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-169
# text = L'absence totale d'une de ces enzymes est par exemple létale chez la souris ;
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	absence	absence	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	totale	total	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	une	un	PRQ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ces	ce	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	enzymes	enzyme	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	par	par exemple	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	exemple	par exemple	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	létale	létal	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	chez	chez	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	souris	souris	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	;	;	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-170
# text = des maladies génétiques rares , liées au déficit d'une de ces protéines , ont été caractérisées chez l'homme , comme par exemple les syndromes de Werner ( dysfonctionnement d'une hélicase entraînant un vieillissement prématuré et le développement de pathologies liées au vieillissement ) ou de Bloom ( échange d'ADN trop fréquent amenant à un retard de croissance et de nombreux cancers ) .
1	des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	maladies	maladie	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
3	génétiques	génétique	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	rares	rare	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
6	liées	lier	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	au	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	déficit	déficit	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	une	un	PRQ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	ces	ce	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	protéines	protéine	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
15	ont	avoir	VRB	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	été	être	VPP	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
17	caractérisées	caractériser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	chez	chez	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	homme	homme	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
22	comme	comme	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
23	par	par exemple	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	exemple	par exemple	ADV	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	les	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	syndromes	syndrome	NOM	_	_	20	para	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	Werner	Werner	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	(	(	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
30	dysfonctionnement	dysfonctionnement	NOM	_	_	28	parenth	_	_	_	_	_
31	d'	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	une	un	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	hélicase	hélicase	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	entraînant	entraîner	VPR	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	un	un	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	vieillissement	vieillissement	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	prématuré	prématuré	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	et	et	COO	_	_	40	mark	_	_	_	_	_
39	le	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	développement	développement	NOM	_	_	36	para	_	_	_	_	_
41	de	de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	pathologies	pathologie	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	liées	lier	VPP	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	au	à	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	vieillissement	vieillissement	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	)	)	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
47	ou	ou	COO	_	_	48	mark	_	_	_	_	_
48	de	de	PRE	_	_	27	para	_	_	_	_	_
49	Bloom	Bloom	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	(	(	PUNC	_	_	51	punc	_	_	_	_	_
51	échange	échange	NOM	_	_	49	parenth	_	_	_	_	_
52	d'	de	PRE	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	ADN	ADN	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	trop	trop	ADV	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
55	fréquent	fréquent	ADJ	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
56	amenant	amener	VPR	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
57	à	à	PRE	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
58	un	un	DET	_	_	59	spe	_	_	_	_	_
59	retard	retard	NOM	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
60	de	de	PRE	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
61	croissance	croissance	NOM	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
62	et	et	COO	_	_	63	mark	_	_	_	_	_
63	de	de	PRE	_	_	60	para	_	_	_	_	_
64	nombreux	nombreux	ADJ	_	_	65	dep	_	_	_	_	_
65	cancers	cancer	NOM	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
66	)	)	PUNC	_	_	51	punc	_	_	_	_	_
67	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-171
# text = Chez les bactéries , l'altération de ces enzymes peut conduire à des cellules anucléées .
1	Chez	chez	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	bactéries	bactérie	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	altération	altération	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ces	ce	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	enzymes	enzyme	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	peut	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	conduire	conduire	VNF	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	à	à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	des	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	cellules	cellule	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	anucléées	nucléé	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-172
# text = Des molécules ciblant les topoisomérases , comme les quinolones , ont d'ailleurs été développées , et sont utilisées contre Plasmodium falciparum , parasite causant la malaria , ou comme antibiotiques .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	molécules	molécule	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
3	ciblant	cibler	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	topoisomérases	topoisomérase	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
7	comme	comme	PRE	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	quinolones	quinoléine	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
11	ont	avoir	VRB	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
12	d'	d'ailleurs	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
13	ailleurs	d'ailleurs	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	été	être	VPP	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
15	développées	développer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
18	sont	être	VRB	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
19	utilisées	utiliser	VPP	_	_	15	para	_	_	_	_	_
20	contre	contre	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	Plasmodium	Plasmodium	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	falciparum	falciparum	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
24	parasite	parasite	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	causant	causer	VPR	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	la	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	malaria	malaria	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
29	ou	ou	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
30	comme	comme	PRE	_	_	20	para	_	_	_	_	_
31	antibiotiques	antibiotique	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-173
# text = Le maintien d'un niveau précis de superenroulement de l'ADN est primordial .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	maintien	maintien	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	un	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	niveau	niveau	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	précis	précis	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	superenroulement	super-	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	ADN	ADN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	primordial	primordial	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-174
# text = La superhélicité et la structuration de l'ADN au sein de la cellule garantissent l'intégrité du chromosome et sa compaction , mais aussi son accessibilité par différentes enzymes , notamment les polymérases , afin de réaliser toutes les réactions nécessaires à la viabilité de la cellule :
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	structuration	structuration	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	ADN	ADN	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	au	au sein de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	sein	au sein de	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	au sein de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	cellule	cellule	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	garantissent	garantir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	intégrité	intégrité	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	du	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	chromosome	chromosome	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
20	sa	son	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	compaction	compaction	NOM	_	_	18	para	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
23	mais	mais aussi	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
24	aussi	mais aussi	ADV	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	son	son	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	accessibilité	accessibilité	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
27	par	par	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	différentes	différent	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	enzymes	enzyme	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_
31	notamment	notamment	ADV	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
32	les	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	polymérases	polymérase	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
34	,	,	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_
35	afin	afin de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
36	de	afin de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	réaliser	réaliser	VNF	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	toutes	tout	ADJ	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
39	les	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	réactions	réaction	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
41	nécessaires	nécessaire	ADJ	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	à	à	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	la	le	DET	_	_	44	spe	_	_	_	_	_
44	viabilité	viabilité	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	de	de	PRE	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	la	le	DET	_	_	47	spe	_	_	_	_	_
47	cellule	cellule	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
48	:	:	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-175
# text = la réplication et la réparation de l'ADN , la ségrégation des chromosomes avant la division cellulaire , la transcription globale du génome , et la recombinaison .
1	la	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	réplication	réplication	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	réparation	réparation	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	ADN	ADN	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	ségrégation	ségrégation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	des	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	chromosomes	chromosome	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	avant	avant	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	division	division	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	transcription	transcription	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
21	globale	global	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	du	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	génome	génome	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
26	la	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	20	para	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-176
# text = Les chromosomes sont des structures dynamiques , tant au niveau du degré de superhélicité de l'ADN que de leur organisation spatiale globale .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	chromosomes	chromosome	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	structures	structure	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	dynamiques	dynamique	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
8	tant	tant	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	au	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	niveau	niveau	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	du	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	degré	degré	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	ADN	ADN	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	que	que	CSU	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	leur	son	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	organisation	organisation	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	spatiale	spatial	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	globale	global	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-177
# text = Les conditions de l'environnement ( conditions nutritionnelles et stress thermiques , osmotiques , oxydatifs ... ) sont connues pour affecter cette structuration .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	conditions	condition	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	environnement	environnement	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	(	(	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	conditions	condition	NOM	_	_	2	parenth	_	_	_	_	_
8	nutritionnelles	nutritionnel	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	stress	stress	NOM	_	_	7	para	_	_	_	_	_
11	thermiques	thermique	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
13	osmotiques	osmotique	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
15	oxydatifs	oxydatif	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
16	...	...	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
17	)	)	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
18	sont	être	VRB	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
19	connues	connaître	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	pour	pour	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	affecter	affecter	VNF	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	cette	ce	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	structuration	structuration	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-178
# text = Tous les processus vitaux ( réplication , transcription ... ) , mais également la régulation de l'expression des génomes , pourraient donc être orchestrés par la structuration même de l'ADN .
1	Tous	tout	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	processus	processus	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
4	vitaux	vital	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	(	(	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
6	réplication	réplication	NOM	_	_	3	parenth	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
8	transcription	transcription	NOM	_	_	6	para	_	_	_	_	_
9	...	...	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
10	)	)	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
12	mais	mais	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
13	également	également	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	régulation	régulation	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	expression	expression	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	des	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	génomes	génome	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
22	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	donc	donc	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	être	être	VNF	_	_	25	aux	_	_	_	_	_
25	orchestrés	orchestrer	VPP	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	par	par	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	structuration	structuration	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	même	même	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	l'	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	ADN	ADN	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-179
# text = Une des principales caractéristiques des bactéries est leur capacité à coloniser toutes les niches écologiques , c'est-à-dire à s'adapter à des conditions de croissance et de stress variées .
1	Une	un	PRQ	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
2	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	principales	principal	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	caractéristiques	caractéristique	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	bactéries	bactérie	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	leur	son	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	capacité	capacité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	coloniser	coloniser	VNF	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	toutes	tout	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
13	les	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	niches	niche	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	écologiques	écologique	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
17	c'	c'est-à-dire	COO	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	est-à-dire	c'est-à-dire	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	à	à	PRE	_	_	10	para	_	_	_	_	_
20	s'	s'	CLI	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	adapter	adapter	VNF	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	à	à	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	des	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	conditions	condition	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	croissance	croissance	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	25	para	_	_	_	_	_
29	stress	stress	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	variées	varier	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-180
# text = L'adaptation à de telles conditions requiert une plasticité extrême des phénotypes bactériens .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	adaptation	adaptation	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	à	à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	telles	tel	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	conditions	condition	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	requiert	requérir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	une	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	plasticité	plasticité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	extrême	extrême	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	des	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	phénotypes	phénotype	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	bactériens	bactérien	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-181
# text = Lors de stress ou de changements d'environnement , ces modifications phénotypiques sont associées à un remaniement total de l'expression du génome , pour s'adapter aux nouvelles conditions .
1	Lors	lors de	PRE	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
2	de	lors de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	stress	stress	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ou	ou	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	2	para	_	_	_	_	_
6	changements	changement	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	environnement	environnement	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
10	ces	ce	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	modifications	modification	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
12	phénotypiques	phénotypique	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	sont	être	VRB	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	associées	associer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	un	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	remaniement	remaniement	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	total	total	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	expression	expression	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	du	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	génome	génome	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	pour	pour	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
26	s'	s'	CLI	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
27	adapter	adapter	VNF	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	aux	à	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	nouvelles	nouveau	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	conditions	condition	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-182
# text = Afin de réaliser cela , il est essentiel pour la bactérie de détecter les conditions de l'environnement et de transmettre ces signaux afin de modifier l'expression du génome .
1	Afin	afin de	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	de	afin de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	réaliser	réaliser	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	cela	cela	PRQ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	il	il	CLS	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	essentiel	essentiel	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	pour	pour	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	bactérie	bactérie	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	détecter	détecter	VNF	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	conditions	condition	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	environnement	environnement	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	12	para	_	_	_	_	_
21	transmettre	transmettre	VNF	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	ces	ce	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	signaux	signal	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	afin	afin de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	de	afin de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	modifier	modifier	VNF	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	l'	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	expression	expression	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	du	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	génome	génome	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-183
# text = La superhélicité de l'ADN a été suggérée comme intervenant dans l'adaptation à de nouvelles conditions de croissance , de par sa capacité à être modifiée en fonction des conditions et à remodeler l'expression globale des gènes .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	a	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	été	être	VPP	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	suggérée	suggérer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	comme	comme	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	intervenant	intervenant	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	adaptation	adaptation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
16	nouvelles	nouveau	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	conditions	condition	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	croissance	croissance	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	de	de par	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
22	par	de par	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	sa	son	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	capacité	capacité	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	à	à	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	être	être	VNF	_	_	27	aux	_	_	_	_	_
27	modifiée	modifier	VPP	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	en	en	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	fonction	fonction	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	des	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	conditions	condition	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	et	et	COO	_	_	33	mark	_	_	_	_	_
33	à	à	PRE	_	_	25	para	_	_	_	_	_
34	remodeler	remodeler	VNF	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	l'	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	expression	expression	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	globale	global	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	des	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	gènes	gène	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-184
# text = Le dogme central des sciences de la vie est que les systèmes biologiques émergent d'une évolution darwinienne , c'est-à-dire de modifications génétiques se produisant au hasard dans un génome , suivies de la sélection des individus mutants ayant un avantage sélectif .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	dogme	dogme	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	central	central	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	sciences	science	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	vie	vie	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	que	que	CSU	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	les	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	systèmes	système	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
13	biologiques	biologique	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	émergent	émerger	VRB	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	d'	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	une	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	évolution	évolution	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	darwinienne	darwinien	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
20	c'	c'est-à-dire	COO	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	est-à-dire	c'est-à-dire	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	15	para	_	_	_	_	_
23	modifications	modification	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	génétiques	génétique	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	se	se	CLI	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	produisant	produire	VPR	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
27	au	à	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	hasard	hasard	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	dans	dans	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
30	un	un	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	génome	génome	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
33	suivies	suivre	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	la	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	sélection	sélection	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	des	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	individus	individu	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	mutants	mutant	ADJ	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	ayant	avoir	VPR	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	un	un	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	avantage	avantage	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	sélectif	sélectif	ADJ	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-185
# text = Si la superhélicité de l'ADN est impliquée dans l'adaptation des bactéries à leur environnement , elle doit donc constituer une cible évolutive , c'est-à-dire une cible de la sélection naturelle .
1	Si	si	CSU	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
2	la	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	ADN	ADN	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	impliquée	impliquer	VPP	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	adaptation	adaptation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	des	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	bactéries	bactérie	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	leur	son	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	environnement	environnement	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
18	elle	elle	CLS	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
19	doit	devoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	donc	donc	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	constituer	constituer	VNF	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	une	un	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	cible	cible	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	évolutive	évolutif	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
26	c'	c'est-à-dire	COO	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
27	est-à-dire	c'est-à-dire	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
28	une	un	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	cible	cible	NOM	_	_	23	para	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	la	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	sélection	sélection	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	naturelle	naturel	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-186
# text = L'objectif de ma thèse est de comprendre les mécanismes d'adaptation des bactéries à leur environnement , et en particulier l'impact de la superhélicité de l'ADN sur les processus évolutifs .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	objectif	objectif	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ma	son	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	thèse	thèse	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	comprendre	comprendre	VNF	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	les	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	mécanismes	mécanisme	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	d'	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	adaptation	adaptation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	des	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	bactéries	bactérie	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	leur	son	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	environnement	environnement	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
20	en	en particulier	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	particulier	en particulier	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	l'	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	impact	impact	NOM	_	_	14	para	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	l'	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	ADN	ADN	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	sur	sur	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
31	les	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	processus	processus	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	évolutifs	évolutif	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-187
# text = Peut -elle être la cible de la sélection naturelle ?
1	Peut	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-elle	-elle	CLS	_	_	1	subj	_	_	_	_	_
3	être	être	VNF	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	cible	cible	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	sélection	sélection	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	naturelle	naturel	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	?	?	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-188
# text = Et si oui , par quels mécanismes ?
1	Et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
2	si	si	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	oui	oui	ADV	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	quels	quel	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	mécanismes	mécanisme	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	?	?	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-189
# text = La superhélicité peut -elle être impliquée dans la transmission des signaux de l'environnement à l'expression des gènes , pour permettre une réponse bactérienne adaptée à un environnement donné ?
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	peut	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	-elle	-elle	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
5	être	être	VNF	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	impliquée	impliquer	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	dans	dans	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	transmission	transmission	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	des	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	signaux	signal	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	environnement	environnement	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	expression	expression	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	des	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	gènes	gène	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	pour	pour	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
22	permettre	permettre	VNF	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	une	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	réponse	réponse	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	bactérienne	bactérien	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	adaptée	adapter	VPP	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	à	à	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	un	un	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	environnement	environnement	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	donné	donner	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	?	?	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-190
# text = Pour répondre à ces questions , j'ai utilisé une stratégie d'évolution expérimentale , où les bactéries sont adaptées pendant plusieurs dizaines de milliers de générations à des transitions nutritionnelles croissance-carence et carence-croissance , et ce à partir d'un ancêtre bien identifié .
1	Pour	pour	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	répondre	répondre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	à	à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ces	ce	DET	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	questions	question	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	j'	j'	CLS	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
8	ai	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	utilisé	utiliser	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
10	une	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	stratégie	stratégie	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	évolution	évolution	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
16	où	où	PRQ	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
17	les	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	bactéries	bactérie	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
19	sont	être	VRB	_	_	20	aux	_	_	_	_	_
20	adaptées	adapter	VPP	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
21	pendant	pendant	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	dizaines	dizaine	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	milliers	milliers	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	générations	génération	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	à	à	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	des	un	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	transitions	transition	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	nutritionnelles	nutritionnel	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
32	croissance-carence	croissance-carence	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	et	et	COO	_	_	34	mark	_	_	_	_	_
34	carence-croissance	carence-croissance	NOM	_	_	32	para	_	_	_	_	_
35	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
36	et	et	COO	_	_	38	mark	_	_	_	_	_
37	ce	ce	PRQ	_	_	9	para	_	_	_	_	_
38	à	à partir de	PRE	_	_	37	mark	_	_	_	_	_
39	partir	à partir de	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	d'	à partir de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	un	un	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	bien	bien	ADV	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
44	identifié	identifier	ADJ	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-191
# text = Dans l'introduction bibliographique , je présenterai deux parties :
1	Dans	dans	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	l'	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	introduction	introduction	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	bibliographique	bibliographique	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	je	je	CLS	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	présenterai	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	deux	deux	NUM	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	parties	partie	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	:	:	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-192
# text = la première décrira les différents acteurs protéiques de la superhélicité de l'ADN , l'organisation du chromosome , le rôle de la superhélicité au sein de la cellule , notamment en fonction des conditions environnementales , et enfin son rôle clef dans la régulation de l'expression des gènes .
1	la	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	première	premier	ADJ	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	décrira	décrire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	différents	différent	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	acteurs	acteur	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	protéiques	protéique	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	ADN	ADN	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	organisation	organisation	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	du	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	chromosome	chromosome	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
20	le	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	rôle	rôle	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	au	au sein de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	sein	au sein de	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	au sein de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	cellule	cellule	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
31	notamment	notamment	ADV	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
32	en	en	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
33	fonction	fonction	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	des	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	conditions	condition	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	environnementales	environnemental	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	,	,	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
38	et	et	COO	_	_	41	mark	_	_	_	_	_
39	enfin	enfin	ADV	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	son	son	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	rôle	rôle	NOM	_	_	35	para	_	_	_	_	_
42	clef	clef	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	dans	dans	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	la	le	DET	_	_	45	spe	_	_	_	_	_
45	régulation	régulation	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	de	de	PRE	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	l'	le	DET	_	_	48	spe	_	_	_	_	_
48	expression	expression	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
49	des	de	PRE	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	gènes	gène	NOM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-193
# text = La seconde partie présentera le système d'évolution expérimentale utilisé , ainsi que les résultats obtenus depuis l'initiation de cette expérience .
1	La	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	seconde	second	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	partie	partie	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	présentera	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	le	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	système	système	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	évolution	évolution	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	utilisé	utiliser	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
12	ainsi	ainsi que	COO	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	que	ainsi que	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	résultats	résultat	NOM	_	_	6	para	_	_	_	_	_
16	obtenus	obtenir	VPP	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	depuis	depuis	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	initiation	initiation	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	cette	ce	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	expérience	expérience	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-194
# text = Introduction Partie I La Topologie de l'ADN
1	Introduction	introduction	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Partie	Partie	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	I	I	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	La	La	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	Topologie	Topologie	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	ADN	ADN	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-195
# text = La relation topologique entre les deux brins d'une même molécule d'ADN , comme par exemple le chromosome circulaire d'Escherichia coli , est caractérisée par le « nombre de liens » , appelé Linking number , Lk .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	relation	relation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	topologique	topologique	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	entre	entre	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
6	deux	deux	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	brins	brin	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	d'	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	une	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
10	même	même	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	molécule	molécule	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	ADN	ADN	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
15	comme	comme	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
16	par	par exemple	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	exemple	par exemple	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	le	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	chromosome	chromosome	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
20	circulaire	circulaire	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	d'	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	coli	coli	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
25	est	est	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	caractérisée	caractériser	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	par	par	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	le	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
29	«	«	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
30	nombre	nombre	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	liens	lien	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	»	»	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
34	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
35	appelé	appelé	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
36	Linking	Linking	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	number	nimber	VNF	_	_	0	root	_	_	_	_	_
38	,	,	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
39	Lk	Lk	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	.	.	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-196
# text = C'est un entier qui est égal au nombre minimal de passages nécessaires d'un des deux brins par l'autre pour leur séparation .
1	C'	ce	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	un	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	entier	entier	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	qui	qui	PRQ	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	égal	égal	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	au	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	nombre	nombre	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	minimal	minimal	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	passages	passage	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	nécessaires	nécessaire	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	d'	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	un	un	PRQ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	deux	deux	NUM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	brins	brin	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	par	par	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	autre	autre	PRQ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	pour	pour	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	leur	son	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	séparation	séparation	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-197
# text = A cette fin , il est bien sûr indispensable de casser un des deux brins .
1	A	à	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	cette	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	fin	fin	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	il	il	CLS	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	bien	bien sûr	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	sûr	bien sûr	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	indispensable	indispensable	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	casser	casser	VNF	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	un	un	PRQ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	des	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	deux	deux	NUM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	brins	brin	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-198
# text = Cela signifie que le nombre d'enlacements entre les deux brins d'une molécule d'ADN est constant tant que les deux brins sont intacts , donc Lk est une propriété topologique .
1	Cela	cela	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	signifie	signifier	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	que	que	CSU	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	nombre	nombre	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
6	d'	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	enlacements	enlacement	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	entre	entre	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
10	deux	deux	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	brins	brin	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	une	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	molécule	molécule	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	d'	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	ADN	ADN	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	est	être	VRB	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
18	constant	constant	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	tant	tant que	CSU	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	que	tant que	CSU	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	les	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
22	deux	deux	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	brins	brin	NOM	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
24	sont	être	VRB	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
25	intacts	intact	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
27	donc	donc	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
28	Lk	Lk	NOM	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
29	est	être	VRB	_	_	17	para	_	_	_	_	_
30	une	un	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	propriété	propriété	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	topologique	topologique	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-199
# text = L'enroulement de l'ADN est réalisé à deux niveaux de structuration , géométriques .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	enroulement	enroulement	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	réalisé	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	deux	deux	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	niveaux	niveau	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	structuration	structuration	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	géométriques	géométrique	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-200
# text = Le tortillement des brins autour d'eux-mêmes au sein de la double hélice est décrit par le paramètre Tw ( pour twist ) ( Figure 0 Ab ) .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	tortillement	tortillement	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	brins	brin	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	autour	autour de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	d'	autour de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	eux-mêmes	lui-même	PRQ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	au	au sein de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
9	sein	au sein de	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	au sein de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
12	double	double	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	hélice	hélice	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	est	être	VRB	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
15	décrit	décrire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	par	par	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	le	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	paramètre	paramètre	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	Tw	Tw	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	(	(	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	pour	pour	PRE	_	_	15	parenth	_	_	_	_	_
22	twist	twist	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	)	)	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
24	(	(	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	Figure	Figure	VRB	_	_	22	para	_	_	_	_	_
26	0	0	NUM	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	Ab	Ab	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	)	)	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-201
# text = De ce tortillement va dépendre le pas hélicoïdal de l'ADN , c'est-à-dire le nombre de paires de bases par tour d'hélice .
1	De	de	PRE	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	ce	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	tortillement	tortillement	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	va	aller	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	dépendre	dépendre	VNF	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	le	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
7	pas	pas	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	hélicoïdal	hélicoïdal	ADJ	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	ADN	ADN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
13	c'	c'est-à-dire	COO	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	est-à-dire	c'est-à-dire	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
15	le	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	nombre	nombre	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	paires	paire	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	bases	base	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	par	par	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	tour	tour	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	d'	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	hélice	hélice	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-202
# text = Le vrillage de l'hélice sur elle-même est décrit par le paramètre Wr ( pour writh ) ( Figure 0 Ac ) , qui apparaît lorsque la molécule d'ADN circulaire ne se situe pas dans un plan .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	vrillage	vrillage	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	hélice	hélice	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	sur	sur	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	elle-même	lui-même	PRQ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	est	être	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	décrit	décrire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	par	par	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	le	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	paramètre	paramètre	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	Wr	Wr	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	(	(	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	pour	pour	PRE	_	_	9	parenth	_	_	_	_	_
16	writh	rit	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	)	)	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
18	(	(	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Figure	Figure	VRB	_	_	16	para	_	_	_	_	_
20	0	0	NUM	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	Ac	Ac	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	)	)	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
24	qui	qui	PRQ	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
25	apparaît	apparaître	VRB	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
26	lorsque	lorsque	CSU	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	molécule	molécule	NOM	_	_	34	subj	_	_	_	_	_
29	d'	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	ADN	ADN	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	circulaire	circulaire	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	ne	ne	ADV	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
33	se	se	CLI	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
34	situe	situer	VRB	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
35	pas	pas	ADV	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	dans	dans	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	un	un	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	plan	plan	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-203
# text = Lk est composé de ces deux paramètres , qui sont intimement liés .
1	Lk	Lk	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	composé	composer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ces	ce	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
6	deux	deux	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	paramètres	paramètre	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
9	qui	qui	PRQ	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
10	sont	être	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
11	intimement	intimement	ADV	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
12	liés	lier	VPP	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-204
# text = Une double hélice d'ADN adopte une conformation de moindre énergie entre Tw et Wr ( Figure 0 Ad ) .
1	Une	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	double	double	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	hélice	hélice	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	adopte	adopter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	une	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	conformation	conformation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	moindre	moindre	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	énergie	énergie	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	entre	entre	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	Tw	Tw	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	Wr	Wr	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
16	(	(	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
17	Figure	Figure	VRB	_	_	6	parenth	_	_	_	_	_
18	0	0	NUM	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	Ad	Ad	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	)	)	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-205
# text = Un signe est attribué arbitrairement à Lk :
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	signe	signe	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	attribué	attribuer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	arbitrairement	arbitrairement	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	à	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	Lk	Lk	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	:	:	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-206
# text = positif pour une hélice de pas gauche , et négatif pour une hélice de pas droit ( Figure
1	positif	positif	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	pour	pour	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	une	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	hélice	hélice	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	pas	pas	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	gauche	gauche	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
10	négatif	négatif	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	pour	pour	PRE	_	_	2	para	_	_	_	_	_
12	une	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	hélice	hélice	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	pas	pas	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	droit	droit	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	(	(	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
18	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-207
# text = 0B ) .
1	0B	0B	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-208
# text = Chez les bactéries , l'ADN est superenroulé négativement dans la cellule , ce qui permet notamment de condenser une molécule d'ADN de 1 , 5 mm de long dans une cellule d'environ
1	Chez	chez	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	bactéries	bactérie	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	ADN	ADN	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	superenroulé	super-	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	négativement	négativement	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	cellule	cellule	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	ce	ce	PRQ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	qui	qui	PRQ	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
16	permet	permettre	VRB	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	notamment	notamment	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	condenser	condenser	VNF	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	une	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	molécule	molécule	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	d'	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	ADN	ADN	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	1	1	NUM	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
26	,	1 , 5	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
27	5	5	NUM	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	mm	millimètre	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	long	long	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	dans	dans	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
32	une	un	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	cellule	cellule	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	d'	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	environ	environ	ADV	_	_	34	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-209
# text = 2 µm .
1	2	2	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	µm	micro-	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-210
# text = Tous les processus cellulaires vitaux , comme la réplication et la réparation de l'ADN , la transcription , et tous les phénomènes de recombinaison et de transposition , dépendent et influent sur le niveau de superhélicité de l'ADN .
1	Tous	tout	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	processus	processus	NOM	_	_	30	subj	_	_	_	_	_
4	cellulaires	cellulaire	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	vitaux	vital	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
7	comme	comme	PRE	_	_	30	periph	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	réplication	réplication	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	12	mark	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	réparation	réparation	NOM	_	_	9	para	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	ADN	ADN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	transcription	transcription	NOM	_	_	15	para	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
21	tous	tout	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
22	les	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	phénomènes	phénomène	NOM	_	_	18	para	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	24	para	_	_	_	_	_
28	transposition	transposition	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
30	dépendent	dépendre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
31	et	et	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
32	influent	influer	VRB	_	_	30	para	_	_	_	_	_
33	sur	sur	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	le	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	niveau	niveau	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	de	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	l'	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	ADN	ADN	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	.	.	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-211
# text = En effet , ils introduisent naturellement des boucles ou des noeuds dans la double hélice .
1	En	en effet	PRE	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	ils	ils	CLS	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	introduisent	introduire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	naturellement	naturellement	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	des	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	boucles	boucle	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	ou	ou	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
10	des	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	noeuds	noeud	NOM	_	_	8	para	_	_	_	_	_
12	dans	dans	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
14	double	double	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	hélice	hélice	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-212
# text = La progression de la fourche de réplication ainsi que le déplacement des molécules d'ARN polymérase au cours de la transcription des gènes provoquent également des torsions importantes ( Liu et Wang , 1987 ) .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	progression	progression	NOM	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	fourche	fourche	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	réplication	réplication	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ainsi	ainsi que	COO	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	que	ainsi que	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
10	le	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	déplacement	déplacement	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
12	des	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	molécules	molécule	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	d'	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	ARN	ARN	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	polymérase	polymérase	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	au	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
18	cours	cours	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	transcription	transcription	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	des	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	gènes	gène	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	provoquent	provoquer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
25	également	également	ADV	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	des	un	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	torsions	torsion	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
28	importantes	important	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	(	(	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
30	Liu	Liu	NOM	_	_	27	parenth	_	_	_	_	_
31	et	et	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
32	Wang	Wang	NOM	_	_	30	para	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
34	1987	1987	NUM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	)	)	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-213
# text = D'autre part , la réplication et la transcription nécessitent l'ouverture de la double hélice d'ADN .
1	D'	d'autre part	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	autre	d'autre part	ADV	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
3	part	d'autre part	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	réplication	réplication	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	transcription	transcription	NOM	_	_	6	para	_	_	_	_	_
10	nécessitent	nécessiter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	ouverture	ouverture	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
15	double	double	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	hélice	hélice	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	d'	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	ADN	ADN	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-214
# text = L'état thermodynamique le plus stable pour une molécule d'ADN circulaire est l'état totalement relaxé .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	état	état	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
3	thermodynamique	thermodynamique	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	plus	plus	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	stable	stable	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	pour	pour	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	une	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	molécule	molécule	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	d'	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	ADN	ADN	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	circulaire	circulaire	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	état	état	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	totalement	totalement	ADV	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	relaxé	relaxer	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-215
# text = La superhélicité négative introduite dans l'ADN par différentes enzymes est donc une source d'énergie fabuleuse qui va permettre la réalisation des différents processus cellulaires .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
3	négative	négatif	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	introduite	introduire	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ADN	ADN	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	différentes	différent	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	enzymes	enzyme	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	donc	donc	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	une	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	source	source	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	d'	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	énergie	énergie	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	fabuleuse	fabuleux	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	qui	qui	PRQ	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
19	va	aller	VRB	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
20	permettre	permettre	VNF	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	réalisation	réalisation	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	des	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	différents	différent	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	processus	processus	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	cellulaires	cellulaire	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-216
# text = En effet , une superhélicité négative correspond à un enroulement de l'ADN inférieur à celui adopté par l'ADN sans contrainte ( Lk 0 ) .
1	En	en effet	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	une	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
6	négative	négatif	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	correspond	correspondre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	un	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	enroulement	enroulement	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	ADN	ADN	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	inférieur	inférieur	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	celui	celui	PRQ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	adopté	adopter	VPP	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	par	par	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	ADN	ADN	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	sans	sans	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
22	contrainte	contrainte	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	(	(	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	Lk	Lk	NOM	_	_	22	parenth	_	_	_	_	_
25	0	0	NUM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	)	)	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-217
# text = Ce phénomène facilite donc l'ouverture de la double hélice .
1	Ce	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	phénomène	phénomène	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	facilite	faciliter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	donc	donc	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	ouverture	ouverture	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
9	double	double	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	hélice	hélice	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-218
# text = De plus , cette déformation peut également être stabilisée par la fixation de protéines .
1	De	de plus	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	cette	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	déformation	déformation	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	peut	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	également	également	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	être	être	VNF	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	stabilisée	stabiliser	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	par	par	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	fixation	fixation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	protéines	protéine	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-219
# text = Tout processus nécessitant ou utilisant ce phénomène , comme la fixation des protéines de type histone ou de l'ARN polymérase , sera ainsi favorisé sur un ADN superenroulé négativement .
1	Tout	tout	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	processus	processus	NOM	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
3	nécessitant	nécessiter	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ou	ou	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	utilisant	utiliser	VPR	_	_	3	para	_	_	_	_	_
6	ce	ce	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	phénomène	phénomène	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
9	comme	comme	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	fixation	fixation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	des	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	protéines	protéine	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	type	type	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	histone	histone	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	ou	ou	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	14	para	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
20	ARN	ARN	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	polymérase	polymérase	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
23	sera	être	VRB	_	_	25	aux	_	_	_	_	_
24	ainsi	ainsi	ADV	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	favorisé	favoriser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	sur	sur	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	un	un	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	ADN	ADN	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	superenroulé	super-	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	négativement	négativement	ADV	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-220
# text = Cependant , le niveau de superhélicité doit rester précis , une déviation du degré optimal étant rapidement défavorable pour la cellule .
1	Cependant	cependant	ADV	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	le	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	niveau	niveau	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	doit	devoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	rester	rester	VNF	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	précis	précis	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	déviation	déviation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
13	du	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	degré	degré	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	optimal	optimal	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	étant	être	VPR	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	rapidement	rapidement	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	défavorable	défavorable	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	pour	pour	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	cellule	cellule	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-221
# text = Par exemple , une superhélicité négative trop élevée génère des structures d'ADN aberrantes ( extrusion de structures cruciformes au niveau de séquences répétées , triplex d'ADN et des boucles R d'hybridation ADN-ARNm . D'autre part , un niveau de superhélicité négative trop faible génère des problèmes de ségrégation du chromosome et des fonctions chromosomiques déficientes conduisent à la mort cellulaire . Le maintien d'un niveau adéquat de superhélicité du chromosome est donc crucial pour le bon fonctionnement de toute cellule . De plus , sans structuration globale du chromosome , toute altération locale de la superhélicité se propagerait sans limite à l'ensemble de la molécule d'ADN . Afin d'éviter ces « accidents topologiques » , non seulement le niveau de superhélicité est contrôlé de façon précise dans la cellule , mais le chromosome est organisé de façon globale en domaines topologiques séparés par des barrières qui empêchent la propagation de ces altérations ( Espeli et Marians , 2004 ) .
1	Par	par exemple	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	exemple	par exemple	ADV	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	une	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
6	négative	négatif	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	trop	trop	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	élevée	élevé	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	génère	générer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	des	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	structures	structure	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	ADN	ADN	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	aberrantes	aberrant	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	(	(	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
16	extrusion	extrusion	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	structures	structure	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	cruciformes	cruciforme	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	au	à	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	niveau	niveau	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	séquences	séquence	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	répétées	répéter	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
26	triplex	triplex	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
27	d'	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	ADN	ADN	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	et	et	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
30	des	de	PRE	_	_	27	para	_	_	_	_	_
31	boucles	boucle	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	R	R	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	d'	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	hybridation	hybridation	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	ADN-ARNm	ADN-ARNm	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
37	D'	D'	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
38	autre	autre	ADJ	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
39	part	part	NOM	_	_	48	subj	_	_	_	_	_
40	,	,	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
41	un	un	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	niveau	niveau	NOM	_	_	48	subj	_	_	_	_	_
43	de	de	PRE	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	négative	négatif	ADJ	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	trop	trop	ADV	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
47	faible	faible	ADJ	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
48	génère	générer	VRB	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
49	des	un	DET	_	_	50	spe	_	_	_	_	_
50	problèmes	problème	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
51	de	de	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	ségrégation	ségrégation	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	du	de	PRE	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	chromosome	chromosome	NOM	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	et	et	COO	_	_	60	mark	_	_	_	_	_
56	des	un	DET	_	_	57	spe	_	_	_	_	_
57	fonctions	fonction	NOM	_	_	60	subj	_	_	_	_	_
58	chromosomiques	chromosomique	ADJ	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
59	déficientes	déficient	ADJ	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
60	conduisent	conduire	VRB	_	_	48	para	_	_	_	_	_
61	à	à	PRE	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
62	la	le	DET	_	_	63	spe	_	_	_	_	_
63	mort	mort	NOM	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
64	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
65	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
66	Le	Le	DET	_	_	67	spe	_	_	_	_	_
67	maintien	maintien	NOM	_	_	76	subj	_	_	_	_	_
68	d'	de	PRE	_	_	67	dep	_	_	_	_	_
69	un	un	DET	_	_	70	spe	_	_	_	_	_
70	niveau	niveau	NOM	_	_	68	dep	_	_	_	_	_
71	adéquat	adéquat	ADJ	_	_	70	dep	_	_	_	_	_
72	de	de	PRE	_	_	70	dep	_	_	_	_	_
73	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	72	dep	_	_	_	_	_
74	du	de	PRE	_	_	73	dep	_	_	_	_	_
75	chromosome	chromosome	NOM	_	_	74	dep	_	_	_	_	_
76	est	être	VRB	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
77	donc	donc	ADV	_	_	76	dep	_	_	_	_	_
78	crucial	crucial	ADJ	_	_	76	dep	_	_	_	_	_
79	pour	pour	PRE	_	_	76	dep	_	_	_	_	_
80	le	le	DET	_	_	82	spe	_	_	_	_	_
81	bon	bon	ADJ	_	_	82	dep	_	_	_	_	_
82	fonctionnement	fonctionnement	NOM	_	_	79	dep	_	_	_	_	_
83	de	de	PRE	_	_	82	dep	_	_	_	_	_
84	toute	tout	DET	_	_	85	spe	_	_	_	_	_
85	cellule	cellule	NOM	_	_	83	dep	_	_	_	_	_
86	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
87	De	De	NOM	_	_	103	subj	_	_	_	_	_
88	plus	plus	COO	_	_	97	mark	_	_	_	_	_
89	,	,	PUNC	_	_	90	punc	_	_	_	_	_
90	sans	sans	PRE	_	_	87	para	_	_	_	_	_
91	structuration	structuration	NOM	_	_	90	dep	_	_	_	_	_
92	globale	global	ADJ	_	_	91	dep	_	_	_	_	_
93	du	de	PRE	_	_	91	dep	_	_	_	_	_
94	chromosome	chromosome	NOM	_	_	93	dep	_	_	_	_	_
95	,	,	PUNC	_	_	90	punc	_	_	_	_	_
96	toute	tout	DET	_	_	97	spe	_	_	_	_	_
97	altération	altération	NOM	_	_	90	mark	_	_	_	_	_
98	locale	local	ADJ	_	_	97	dep	_	_	_	_	_
99	de	de	PRE	_	_	97	dep	_	_	_	_	_
100	la	le	DET	_	_	101	spe	_	_	_	_	_
101	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	99	dep	_	_	_	_	_
102	se	se	CLI	_	_	103	dep	_	_	_	_	_
103	propagerait	propager	VRB	_	_	76	dep	_	_	_	_	_
104	sans	sans	PRE	_	_	103	dep	_	_	_	_	_
105	limite	limite	NOM	_	_	104	dep	_	_	_	_	_
106	à	à	PRE	_	_	105	dep	_	_	_	_	_
107	l'	le	DET	_	_	108	spe	_	_	_	_	_
108	ensemble	ensemble	NOM	_	_	106	dep	_	_	_	_	_
109	de	de	PRE	_	_	108	dep	_	_	_	_	_
110	la	le	DET	_	_	111	spe	_	_	_	_	_
111	molécule	molécule	NOM	_	_	109	dep	_	_	_	_	_
112	d'	de	PRE	_	_	111	dep	_	_	_	_	_
113	ADN	ADN	NOM	_	_	112	dep	_	_	_	_	_
114	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
115	Afin	Afin	PRE	_	_	131	periph	_	_	_	_	_
116	d'	afin de	PRE	_	_	115	dep	_	_	_	_	_
117	éviter	éviter	VNF	_	_	116	dep	_	_	_	_	_
118	ces	ce	DET	_	_	120	spe	_	_	_	_	_
119	«	«	PUNC	_	_	120	punc	_	_	_	_	_
120	accidents	accident	NOM	_	_	117	dep	_	_	_	_	_
121	topologiques	topologique	ADJ	_	_	120	dep	_	_	_	_	_
122	»	»	PUNC	_	_	120	punc	_	_	_	_	_
123	,	,	PUNC	_	_	115	punc	_	_	_	_	_
124	non	non	ADV	_	_	120	dep	_	_	_	_	_
125	seulement	seulement	ADV	_	_	120	dep	_	_	_	_	_
126	le	le	DET	_	_	127	spe	_	_	_	_	_
127	niveau	niveau	NOM	_	_	117	dep	_	_	_	_	_
128	de	de	PRE	_	_	127	dep	_	_	_	_	_
129	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	128	dep	_	_	_	_	_
130	est	être	VRB	_	_	131	aux	_	_	_	_	_
131	contrôlé	contrôler	VPP	_	_	103	dep	_	_	_	_	_
132	de	de	PRE	_	_	131	dep	_	_	_	_	_
133	façon	façon	NOM	_	_	132	dep	_	_	_	_	_
134	précise	précis	ADJ	_	_	133	dep	_	_	_	_	_
135	dans	dans	PRE	_	_	131	dep	_	_	_	_	_
136	la	le	DET	_	_	137	spe	_	_	_	_	_
137	cellule	cellule	NOM	_	_	135	dep	_	_	_	_	_
138	,	,	PUNC	_	_	143	punc	_	_	_	_	_
139	mais	mais	COO	_	_	143	mark	_	_	_	_	_
140	le	le	DET	_	_	141	spe	_	_	_	_	_
141	chromosome	chromosome	NOM	_	_	143	subj	_	_	_	_	_
142	est	être	VRB	_	_	143	aux	_	_	_	_	_
143	organisé	organiser	VPP	_	_	131	para	_	_	_	_	_
144	de	de	PRE	_	_	143	dep	_	_	_	_	_
145	façon	façon	NOM	_	_	144	dep	_	_	_	_	_
146	globale	global	ADJ	_	_	145	dep	_	_	_	_	_
147	en	en	PRE	_	_	143	dep	_	_	_	_	_
148	domaines	domaine	NOM	_	_	147	dep	_	_	_	_	_
149	topologiques	topologique	ADJ	_	_	148	dep	_	_	_	_	_
150	séparés	séparer	VPP	_	_	148	dep	_	_	_	_	_
151	par	par	PRE	_	_	150	dep	_	_	_	_	_
152	des	un	DET	_	_	153	spe	_	_	_	_	_
153	barrières	barrière	NOM	_	_	151	dep	_	_	_	_	_
154	qui	qui	PRQ	_	_	155	subj	_	_	_	_	_
155	empêchent	empêcher	VRB	_	_	153	dep	_	_	_	_	_
156	la	le	DET	_	_	157	spe	_	_	_	_	_
157	propagation	propagation	NOM	_	_	155	dep	_	_	_	_	_
158	de	de	PRE	_	_	157	dep	_	_	_	_	_
159	ces	ce	DET	_	_	160	spe	_	_	_	_	_
160	altérations	altération	NOM	_	_	158	dep	_	_	_	_	_
161	(	(	PUNC	_	_	162	punc	_	_	_	_	_
162	Espeli	Espeli	NOM	_	_	157	parenth	_	_	_	_	_
163	et	et	COO	_	_	164	mark	_	_	_	_	_
164	Marians	Marians	NOM	_	_	162	para	_	_	_	_	_
165	,	,	PUNC	_	_	166	punc	_	_	_	_	_
166	2004	2004	NUM	_	_	164	dep	_	_	_	_	_
167	)	)	PUNC	_	_	162	punc	_	_	_	_	_
168	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-222
# text = Du niveau de superhélicité va également dépendre l'expression d'un grand nombre de gènes :
1	Du	de	PRE	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	niveau	niveau	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	va	aller	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	également	également	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	dépendre	dépendre	VNF	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	expression	expression	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
10	d'	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	un	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
12	grand	grand	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	nombre	nombre	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	gènes	gène	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	:	:	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-223
# text = 7 % des gènes d'E. coli sont en effet directement affectés par une diminution de la superhélicité .
1	7	7	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	%	pourcent	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	gènes	gène	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	d'	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	E.	E.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	coli	coli	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	sont	être	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
9	en	en effet	PRE	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	effet	en effet	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	directement	directement	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	affectés	affecter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	par	par	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	une	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	diminution	diminution	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-224
# text = Parmi ces gènes , certains codent des régulateurs globaux qui , à leur tour , vont avoir des effets variés sur d'autres gènes .
1	Parmi	parmi	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	gènes	gène	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	certains	certains	PRQ	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	codent	coder	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	des	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	régulateurs	régulateur	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	globaux	global	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	qui	qui	PRQ	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
12	à	à	PRE	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
13	leur	son	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	tour	tour	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
16	vont	aller	VRB	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
17	avoir	avoir	VNF	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	des	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	effets	effet	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	variés	varier	VPP	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	sur	sur	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	d'	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
23	autres	autre	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	gènes	gène	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-225
# text = De plus , des modifications de l'environnement , comme des stress ( carence nutritionnelle , osmotique , oxydatif , thermique ) , sont connues pour modifier d'une part le niveau de superhélicité , et d'autre part les profils globaux de transcription , permettant une réponse adaptée à ces stress .
1	De	de plus	PRE	_	_	25	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	des	de	PRE	_	_	25	periph	_	_	_	_	_
5	modifications	modification	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	environnement	environnement	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
10	comme	comme	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
11	des	de	PRE	_	_	6	para	_	_	_	_	_
12	stress	stress	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	(	(	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
14	carence	carence	NOM	_	_	5	parenth	_	_	_	_	_
15	nutritionnelle	nutritionnel	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
17	osmotique	osmotique	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	oxydatif	oxydatif	ADJ	_	_	17	para	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	thermique	thermique	ADJ	_	_	19	para	_	_	_	_	_
22	)	)	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
24	sont	être	VRB	_	_	25	aux	_	_	_	_	_
25	connues	connaître	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	pour	pour	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	modifier	modifier	VNF	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	d'	d'une part	ADV	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	une	d'une part	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	part	d'une part	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	le	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	niveau	niveau	NOM	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	,	,	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
36	et	et	COO	_	_	41	mark	_	_	_	_	_
37	d'	d'autre part	ADV	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	autre	d'autre part	ADJ	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
39	part	d'autre part	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	les	le	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	profils	profil	NOM	_	_	32	para	_	_	_	_	_
42	globaux	global	ADJ	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	de	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	transcription	transcription	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	,	,	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_
46	permettant	permettre	VPR	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
47	une	un	DET	_	_	48	spe	_	_	_	_	_
48	réponse	réponse	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
49	adaptée	adapté	ADJ	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	à	à	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
51	ces	ce	DET	_	_	52	spe	_	_	_	_	_
52	stress	stress	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
53	.	.	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-226
# text = Superhélicité et transcription sont donc intimement liées .
1	Superhélicité	Superhélicité	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
2	et	et	COO	_	_	3	mark	_	_	_	_	_
3	transcription	transcription	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	sont	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
5	donc	donc	ADV	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	intimement	intimement	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	liées	lier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-227
# text = Le niveau de superhélicité est constitué de deux composantes :
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	niveau	niveau	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	est	être	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	constitué	constituer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	deux	deux	NUM	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	composantes	composante	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	:	:	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-228
# text = la superhélicité dont le niveau est contrôlé par les topoisomérases est dite «  non contrainte  » , car sa valeur est conservée après l'action des topoisomérases .
1	la	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
3	dont	dont	PRQ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	niveau	niveau	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	contrôlé	contrôler	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	par	par	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	les	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	topoisomérases	topoisomérase	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	est	être	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	dite	dire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	« 	«	_	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	non	non	ADV	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
15	contrainte	contraindre	VPP	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	 »	»	_	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
18	car	car	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
19	sa	son	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	valeur	valeur	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
21	est	être	VRB	_	_	22	aux	_	_	_	_	_
22	conservée	conserver	VPP	_	_	12	para	_	_	_	_	_
23	après	après	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	l'	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	action	action	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	des	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	topoisomérases	topoisomérase	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-229
# text = La superhélicité « contrainte » est réalisée par des protéines de type histone se liant au nucléoïde , et y induisant des courbures ou des pontages entre molécules .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	«	«	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	contrainte	contraindre	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	»	»	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	réalisée	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	par	par	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	des	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	protéines	protéine	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	type	type	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	histone	histone	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	se	se	CLI	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	liant	lier	VPR	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
16	au	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	nucléoïde	nucléoïde	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
20	y	le	CLI	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	induisant	induire	VPR	_	_	15	para	_	_	_	_	_
22	des	un	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	courbures	courbure	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	ou	ou	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
25	des	un	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	pontages	pontage	NOM	_	_	23	para	_	_	_	_	_
27	entre	entre	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	molécules	molécule	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-230
# text = Cette seconde composante est perdue dès que ces protéines ne sont plus liées à l'ADN .
1	Cette	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	seconde	second	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	composante	composante	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
4	est	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	perdue	perdre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	dès	dès que	CSU	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	que	dès que	CSU	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	ces	ce	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	protéines	protéine	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
10	ne	ne	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
11	sont	être	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
12	plus	plus	ADV	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
13	liées	lier	VPP	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	ADN	ADN	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-231
# text = Les acteurs de la topologie de l'ADN
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	acteurs	acteur	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	topologie	topologie	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	ADN	ADN	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-232
# text = Les topoisomérases
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	topoisomérases	topoisomérase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-233
# text = De par leur rôle cellulaire fondamental , les topoisomérases ( Topos ) sont présentes chez tous les organismes vivants .
1	De	de par	PRE	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	par	de par	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	leur	son	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	rôle	rôle	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	fondamental	fondamental	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	topoisomérases	topoisomérase	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
10	(	(	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	Topos	Topos	NOM	_	_	9	parenth	_	_	_	_	_
12	)	)	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
13	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	présentes	présent	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	chez	chez	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	tous	tout	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
17	les	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	organismes	organisme	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	vivants	vivant	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-234
# text = Malgré une différence de séquences considérable entre les enzymes bactériennes , archéennes et eucaryotes , des conformations structurales proches sont toutefois retrouvées dans leurs domaines d'activité ( Champoux , 2001 ; Corbett et Berger , 2004 ) .
1	Malgré	malgré	PRE	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
2	une	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	différence	différence	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	séquences	séquence	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	considérable	considérable	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	entre	entre	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	enzymes	enzyme	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	bactériennes	bactérien	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	archéennes	archéen	ADJ	_	_	10	para	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	eucaryotes	eucaryote	ADJ	_	_	12	para	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
16	des	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	conformations	conformation	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
18	structurales	structural	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	proches	proche	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	sont	être	VRB	_	_	22	aux	_	_	_	_	_
21	toutefois	toutefois	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	retrouvées	retrouver	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	dans	dans	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	leurs	son	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	domaines	domaine	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	d'	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	activité	activité	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	(	(	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
29	Champoux	Champoux	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
31	2001	2001	NUM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	;	;	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
33	Corbett	Corbett	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
34	et	et	COO	_	_	35	mark	_	_	_	_	_
35	Berger	Berger	NOM	_	_	33	para	_	_	_	_	_
36	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
37	2004	2004	NUM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	)	)	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-235
# text = Il existe deux types de Topos , I et II , chacun divisé en deux familles A et B , mais toutes présentent plusieurs points communs :
1	Il	il	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	existe	exister	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	deux	deux	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	types	type	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	Topos	Topos	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
8	I	I	NOM	_	_	6	para	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	II	II	PRQ	_	_	8	para	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
12	chacun	chacun	PRQ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
13	divisé	diviser	VPP	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	en	en	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	deux	deux	NUM	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	familles	famille	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	A	A	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	B	B	NOM	_	_	17	para	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
21	mais	mais	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
22	toutes	tout	PRQ	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
23	présentent	présenter	VRB	_	_	2	para	_	_	_	_	_
24	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	points	point	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	communs	commun	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	:	:	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-236
# text = une structure en forme de pince qui va permettre les activités de coupure de l'ADN et de transfert de brins , une tyrosine catalytique responsable de l'activité de clivage et qui crée une liaison covalente avec l'une des deux extrémités de l'ADN clivé , une cavité de stockage temporaire des fragments d'ADN , et un changement conformationnel associé à une rotation ou un mouvement de l'ADN .
1	une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	structure	structure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	en	en	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	forme	forme	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	pince	pince	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	qui	qui	PRQ	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
8	va	aller	VRB	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	permettre	permettre	VNF	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	activités	activité	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	coupure	coupure	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	ADN	ADN	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
19	transfert	transfert	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	brins	brin	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
23	une	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	tyrosine	tyrosine	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_
25	catalytique	catalytique	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	responsable	responsable	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	l'	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	activité	activité	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	clivage	clivage	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	et	et	COO	_	_	34	mark	_	_	_	_	_
33	qui	qui	PRQ	_	_	34	subj	_	_	_	_	_
34	crée	créer	VRB	_	_	2	para	_	_	_	_	_
35	une	un	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	liaison	liaison	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	covalente	co-	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	avec	avec	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
39	l'	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	une	une	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	des	de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	deux	deux	NUM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
43	extrémités	extrémité	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	de	de	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	l'	le	DET	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
46	ADN	ADN	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	clivé	cliver	ADJ	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	,	,	PUNC	_	_	50	punc	_	_	_	_	_
49	une	un	DET	_	_	50	spe	_	_	_	_	_
50	cavité	cavité	NOM	_	_	43	para	_	_	_	_	_
51	de	de	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	stockage	stockage	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	temporaire	temporaire	ADJ	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	des	de	PRE	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
55	fragments	fragment	NOM	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	d'	de	PRE	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
57	ADN	ADN	NOM	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
58	,	,	PUNC	_	_	61	punc	_	_	_	_	_
59	et	et	COO	_	_	61	mark	_	_	_	_	_
60	un	un	DET	_	_	61	spe	_	_	_	_	_
61	changement	changement	NOM	_	_	50	para	_	_	_	_	_
62	conformationnel	conformation	NOM	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
63	associé	associer	VPP	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
64	à	à	PRE	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
65	une	un	DET	_	_	66	spe	_	_	_	_	_
66	rotation	rotation	NOM	_	_	64	dep	_	_	_	_	_
67	ou	ou	COO	_	_	69	mark	_	_	_	_	_
68	un	un	DET	_	_	69	spe	_	_	_	_	_
69	mouvement	mouvement	NOM	_	_	66	para	_	_	_	_	_
70	de	de	PRE	_	_	69	dep	_	_	_	_	_
71	l'	le	DET	_	_	72	spe	_	_	_	_	_
72	ADN	ADN	NOM	_	_	70	dep	_	_	_	_	_
73	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-237
# text = Les Topos de type I coupent un seul brin d'ADN ( Figure 1 ) .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	Topos	Topos	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	type	type	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	I	I	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	coupent	couper	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	un	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
8	seul	seul	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	brin	brin	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	d'	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	ADN	ADN	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Figure	Figure	NOM	_	_	11	parenth	_	_	_	_	_
14	1	1	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	)	)	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-238
# text = Les familles IA et IB diffèrent par la liaison formée entre la tyrosine catalytique et l'ADN .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	familles	famille	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	IA	IA	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	IB	IB	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
6	diffèrent	différer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	par	par	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	liaison	liaison	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	formée	former	VPP	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	entre	entre	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	tyrosine	tyrosine	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	catalytique	catalytique	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	ADN	ADN	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-239
# text = Les Topos IA forment une liaison avec l'extrémité 5 'phosphate de l'ADN , transfèrent l'autre brin et referment la coupure . Ceci a pour effet de changer le paramètre Lk par incréments de 1 ( Brown et Cozzarelli , 1981 ) . Ces Topos sont capables de relâcher les supertours négatifs seulement , mais pas jusqu'à une relaxation complète
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	Topos	Topos	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	IA	IA	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	forment	former	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	liaison	liaison	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	avec	avec	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	extrémité	extrémité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	5	5	NUM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	'	'	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
12	phosphate	phosphate	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	ADN	ADN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
17	transfèrent	transférer	VRB	_	_	4	para	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
19	autre	autre	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	brin	brin	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	referment	refermer	VRB	_	_	17	para	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	coupure	coupure	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
26	Ceci	Ceci	PRQ	_	_	27	subj	_	_	_	_	_
27	a	avoir	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
28	pour	pour	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	effet	effet	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	changer	changer	VNF	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	le	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	paramètre	paramètre	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	Lk	Lk	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	par	par	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	incréments	incrément	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	1	1	NUM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	(	(	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
40	Brown	Brown	NOM	_	_	38	parenth	_	_	_	_	_
41	et	et	COO	_	_	42	mark	_	_	_	_	_
42	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	40	para	_	_	_	_	_
43	,	,	PUNC	_	_	49	punc	_	_	_	_	_
44	1981	1981	NUM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	)	)	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
46	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
47	Ces	Ces	DET	_	_	48	spe	_	_	_	_	_
48	Topos	Topos	NOM	_	_	49	subj	_	_	_	_	_
49	sont	être	VRB	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
50	capables	capable	ADJ	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	de	de	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	relâcher	relâcher	VNF	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	les	le	DET	_	_	54	spe	_	_	_	_	_
54	supertours	super-	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
55	négatifs	négatif	ADJ	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	seulement	seulement	ADV	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
57	,	,	PUNC	_	_	60	punc	_	_	_	_	_
58	mais	mais	COO	_	_	60	mark	_	_	_	_	_
59	pas	pas	ADV	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
60	jusqu'à	jusqu'à	PRE	_	_	49	para	_	_	_	_	_
61	une	un	DET	_	_	62	spe	_	_	_	_	_
62	relaxation	relaxation	NOM	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
63	complète	complet	ADJ	_	_	62	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-240
# text = ( Champoux , 2001 ) .
1	(	(	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
2	Champoux	Champoux	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	2001	2001	NUM	_	_	2	parenth	_	_	_	_	_
5	)	)	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-241
# text = Les Topos IB forment une liaison avec une extrémité 3 'phosphate de l'ADN .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	Topos	Topos	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	IB	IB	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	forment	former	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	liaison	liaison	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	avec	avec	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	une	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	extrémité	extrémité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	3	3	NUM	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
11	'	'	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
12	phosphate	phosphate	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	ADN	ADN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-242
# text = Contrairement aux Topos IA , elles permettent au brin coupé d'effectuer une ou plusieurs rotations autour du brin intact ( Figure 1 ) , ce qui permet des modifications de Lk plus importantes .
1	Contrairement	contrairement	ADV	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	aux	à	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Topos	Topos	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	IA	IA	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	elles	elles	CLS	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	permettent	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	au	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	brin	brin	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	coupé	coupé	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	d'	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	effectuer	effectuer	VNF	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	une	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
14	ou	ou	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
15	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
16	rotations	rotation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
17	autour	autour de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	du	autour de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	brin	brin	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	intact	intact	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	(	(	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	Figure	Figure	NOM	_	_	16	parenth	_	_	_	_	_
23	1	1	NUM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	)	)	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	ce	ce	PRQ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
27	qui	qui	PRQ	_	_	28	subj	_	_	_	_	_
28	permet	permettre	VRB	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	des	un	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	modifications	modification	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	Lk	Lk	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	plus	plus	ADV	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
34	importantes	important	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-243
# text = Elles sont par contre capables de relâcher les supertours positifs comme négatifs , la relaxation étant cette fois  -ci complète .
1	Elles	elles	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	par	par contre	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	contre	par contre	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	capables	capable	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	relâcher	relâcher	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	supertours	super-	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	positifs	positif	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	comme	comme	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	négatifs	négatif	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	relaxation	relaxation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	étant	être	VPR	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	cette	ce	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	fois	fois	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	 -ci	 -ci	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	complète	complet	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-244
# text = Les Topos de type II sont capables de cliver les deux brins d'ADN et de transférer une double hélice d'ADN , provenant de la même molécule , ou d'une autre , à travers la coupure .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	Topos	Topos	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	type	type	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	II	II	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	capables	capable	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	cliver	cliver	VNF	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
11	deux	deux	NUM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	brins	brin	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	d'	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	ADN	ADN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	8	para	_	_	_	_	_
17	transférer	transférer	VNF	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	une	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
19	double	double	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	hélice	hélice	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	d'	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	ADN	ADN	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
24	provenant	provenir	VPR	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
27	même	même	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	molécule	molécule	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
30	ou	ou	COO	_	_	31	mark	_	_	_	_	_
31	d'	de	PRE	_	_	25	para	_	_	_	_	_
32	une	un	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	autre	autre	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	,	,	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
35	à	à travers	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
36	travers	à travers	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
37	la	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	coupure	coupure	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-245
# text = Elles utilisent pour cela de l'ATP et le changement résultant pour le paramètre Lk est de 2
1	Elles	elles	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	utilisent	utiliser	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	pour	pour	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	cela	cela	PRQ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ATP	ATP	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
9	le	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	changement	changement	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
11	résultant	résulter	VPR	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	pour	pour	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	le	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	paramètre	paramètre	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	Lk	Lk	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	est	être	VRB	_	_	2	para	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	2	2	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-246
# text = ( Figure 1   ; . Elles possèdent des activités diverses de relâchement , de caténation / décaténation , et d'introduction ou de suppression de noeuds . Parmi toutes les Topos , la gyrase est la seule capable d'introduire des supertours négatifs dans l'ADN . La classification en Topos de type
1	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	Figure	Figure	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	1	1	NUM	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	 	1  	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	;	;	PUNC	_	_	50	punc	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
7	Elles	Elles	CLS	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
8	possèdent	posséder	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	des	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	activités	activité	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	diverses	divers	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	relâchement	relâchement	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	12	para	_	_	_	_	_
16	caténation	caténation	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	/	ou	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	décaténation	décaténation	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
21	d'	de	PRE	_	_	18	para	_	_	_	_	_
22	introduction	introduction	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	ou	ou	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	21	para	_	_	_	_	_
25	suppression	suppression	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	noeuds	noeud	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
29	Parmi	Parmi	NOM	_	_	36	subj	_	_	_	_	_
30	toutes	tout	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
31	les	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	Topos	Topos	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
34	la	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	gyrase	gyrase	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
36	est	être	VRB	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
37	la	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	seule	seul	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	capable	capable	ADJ	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	d'	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	introduire	introduire	VNF	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	des	un	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	supertours	super-	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	négatifs	négatif	ADJ	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	dans	dans	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
46	l'	le	DET	_	_	47	spe	_	_	_	_	_
47	ADN	ADN	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
48	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
49	La	La	DET	_	_	50	spe	_	_	_	_	_
50	classification	classification	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
51	en	en	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	Topos	Topos	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	de	de	PRE	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	type	type	NOM	_	_	53	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-247
# text = IIA et IIB est essentiellement basée sur des considérations structurales .
1	IIA	iia	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
2	et	et	COO	_	_	3	mark	_	_	_	_	_
3	IIB	IIB	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	est	être	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
5	essentiellement	essentiellement	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	basée	baser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	sur	sur	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	des	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	considérations	considération	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	structurales	structural	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-248
# text = Malgré ces différences , des similarités structurales sont tout de même observées au sein des Topos .
1	Malgré	malgré	PRE	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	différences	différence	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	des	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	similarités	similarité	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
7	structurales	structural	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	sont	être	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
9	tout	tout	ADV	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	de	de même	PRE	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	même	de même	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	observées	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	au	au sein de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	sein	au sein de	DET	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	des	au sein de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	Topos	Topos	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-249
# text = Les Topos de type IA , IIA et IIB partagent deux domaines essentiels pour la liaison à l'ADN et sa coupure .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	Topos	Topos	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	type	type	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	IA	IA	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	IIA	IIA	NOM	_	_	5	para	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	IIB	IIB	NOM	_	_	7	para	_	_	_	_	_
10	partagent	partager	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	deux	deux	NUM	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	domaines	domaine	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	essentiels	essentiel	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	pour	pour	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	liaison	liaison	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	à	à	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	ADN	ADN	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
21	sa	son	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	coupure	coupure	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-250
# text = Le premier est le domaine 5Y-CAP , appelé ainsi car il se retrouve dans un grand nombre de protéines capables de lier l'ADN , dont la protéine CAP
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	premier	premier	ADJ	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	domaine	domaine	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	5Y-CAP	5Y-CAP	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
8	appelé	appeler	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
9	ainsi	ainsi	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	car	car	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
11	il	il	CLS	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
12	se	se	CLI	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	retrouve	retrouver	VRB	_	_	8	para	_	_	_	_	_
14	dans	dans	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	un	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
16	grand	grand	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	nombre	nombre	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	protéines	protéine	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	capables	capable	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	lier	lier	VNF	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	l'	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	ADN	ADN	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
26	dont	dont	PRQ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	protéine	protéine	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
29	CAP	CAP	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-251
# text = ( Catabolite Activator Protein ) .
1	(	(	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
2	Catabolite	Catabolite	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	Activator	Activator	NOM	_	_	2	parenth	_	_	_	_	_
4	Protein	Protein	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
5	)	)	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-252
# text = Le résidu catalytique de ce domaine est une tyrosine qui se retrouve liée de façon covalente à l'extrémité 5 'de l'ADN après sa coupure . Le second domaine commun à ces Topos est le domaine « toprim » , appelé ainsi car il se retrouve dans certaines Topos mais aussi dans des primases bactériennes , ou encore dans d'autres enzymes qui catalysent des transferts de groupements phosphate ou qui hydrolysent des liaisons phosphodiesters . Il est constitué de 4 ou 5 feuillets & 206;& 178; parallèles entourés d'hélices & 206;& 177;. Un groupement de résidus acides forme un site de liaison pour les ions Mg 2 + , nécessaires à l'action des Topos ( Osheroff , 1987 ) . Après l'assemblage de la topoisomérase , ce groupement se retrouve proche du domaine 5Y-CAP , avec lequel il permet le mouvement des domaines qui ouvrent ou ferment la structure de la protéine et permettent au brin d'ADN de passer entre eux .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	résidu	résidu	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	catalytique	catalytique	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	ce	ce	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	domaine	domaine	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	une	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	tyrosine	tyrosine	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	qui	qui	PRQ	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
11	se	se	CLI	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	retrouve	retrouver	VRB	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	liée	lier	VPP	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	façon	façon	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	covalente	co-	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
17	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	extrémité	extrémité	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	5	5	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	'	'	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	l'	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	ADN	ADN	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	après	après	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
26	sa	son	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	coupure	coupure	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
29	Le	Le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
30	second	second	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	domaine	domaine	NOM	_	_	36	subj	_	_	_	_	_
32	commun	commun	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	à	à	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	ces	ce	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	Topos	Topos	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	est	être	VRB	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
37	le	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	domaine	domaine	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	«	«	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
40	toprim	top	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	»	»	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
42	,	,	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
43	appelé	appeler	ADJ	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
44	ainsi	ainsi	ADV	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	car	car	COO	_	_	48	mark	_	_	_	_	_
46	il	il	CLS	_	_	48	subj	_	_	_	_	_
47	se	se	CLI	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
48	retrouve	retrouver	VRB	_	_	36	para	_	_	_	_	_
49	dans	dans	PRE	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	certaines	certain	DET	_	_	51	spe	_	_	_	_	_
51	Topos	Topos	NOM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
52	mais	mais aussi	COO	_	_	54	mark	_	_	_	_	_
53	aussi	mais aussi	ADV	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	dans	dans	PRE	_	_	49	para	_	_	_	_	_
55	des	un	DET	_	_	56	spe	_	_	_	_	_
56	primases	primase	NOM	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
57	bactériennes	bactérien	ADJ	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
58	,	,	PUNC	_	_	61	punc	_	_	_	_	_
59	ou	ou encore	COO	_	_	61	mark	_	_	_	_	_
60	encore	ou encore	ADV	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
61	dans	dans	PRE	_	_	54	para	_	_	_	_	_
62	d'	un	DET	_	_	64	spe	_	_	_	_	_
63	autres	autre	ADJ	_	_	64	dep	_	_	_	_	_
64	enzymes	enzyme	NOM	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
65	qui	qui	PRQ	_	_	66	subj	_	_	_	_	_
66	catalysent	catalyser	VRB	_	_	64	dep	_	_	_	_	_
67	des	un	DET	_	_	68	spe	_	_	_	_	_
68	transferts	transfert	NOM	_	_	66	dep	_	_	_	_	_
69	de	de	PRE	_	_	68	dep	_	_	_	_	_
70	groupements	groupement	NOM	_	_	69	dep	_	_	_	_	_
71	phosphate	phosphate	NOM	_	_	70	dep	_	_	_	_	_
72	ou	ou	COO	_	_	74	mark	_	_	_	_	_
73	qui	qui	PRQ	_	_	74	subj	_	_	_	_	_
74	hydrolysent	hydrolyser	VRB	_	_	66	para	_	_	_	_	_
75	des	un	DET	_	_	76	spe	_	_	_	_	_
76	liaisons	liaison	NOM	_	_	74	dep	_	_	_	_	_
77	phosphodiesters	phosphodiesters	ADJ	_	_	76	dep	_	_	_	_	_
78	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
79	Il	Il	CLS	_	_	81	subj	_	_	_	_	_
80	est	être	VRB	_	_	81	aux	_	_	_	_	_
81	constitué	constituer	VPP	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
82	de	de	PRE	_	_	81	dep	_	_	_	_	_
83	4	4	NUM	_	_	82	dep	_	_	_	_	_
84	ou	ou	COO	_	_	98	mark	_	_	_	_	_
85	5	5	NUM	_	_	98	subj	_	_	_	_	_
86	feuillets	feuillet	NOM	_	_	85	dep	_	_	_	_	_
87	β	β	ADJ	_	_	86	dep	_	_	_	_	_
88	parallèles	parallèle	ADJ	_	_	86	dep	_	_	_	_	_
89	entourés	entourer	ADJ	_	_	88	dep	_	_	_	_	_
90	d'	de	PRE	_	_	89	dep	_	_	_	_	_
91	hélices	hélice	NOM	_	_	90	dep	_	_	_	_	_
92	α.	α.	VPR	_	_	91	dep	_	_	_	_	_
93	Un	Un	DET	_	_	94	spe	_	_	_	_	_
94	groupement	groupement	NOM	_	_	92	dep	_	_	_	_	_
95	de	de	PRE	_	_	94	dep	_	_	_	_	_
96	résidus	résidu	NOM	_	_	95	dep	_	_	_	_	_
97	acides	acide	ADJ	_	_	96	dep	_	_	_	_	_
98	forme	former	VRB	_	_	81	para	_	_	_	_	_
99	un	un	DET	_	_	100	spe	_	_	_	_	_
100	site	site	NOM	_	_	98	dep	_	_	_	_	_
101	de	de	PRE	_	_	100	dep	_	_	_	_	_
102	liaison	liaison	NOM	_	_	101	dep	_	_	_	_	_
103	pour	pour	PRE	_	_	98	dep	_	_	_	_	_
104	les	le	DET	_	_	105	spe	_	_	_	_	_
105	ions	ion	NOM	_	_	103	dep	_	_	_	_	_
106	Mg	Mg	NOM	_	_	105	dep	_	_	_	_	_
107	2	2	NUM	_	_	105	dep	_	_	_	_	_
108	+	plus	ADV	_	_	98	dep	_	_	_	_	_
109	,	,	PUNC	_	_	132	punc	_	_	_	_	_
110	nécessaires	nécessaire	ADJ	_	_	98	dep	_	_	_	_	_
111	à	à	PRE	_	_	110	dep	_	_	_	_	_
112	l'	le	DET	_	_	113	spe	_	_	_	_	_
113	action	action	NOM	_	_	111	dep	_	_	_	_	_
114	des	de	PRE	_	_	113	dep	_	_	_	_	_
115	Topos	Topos	NOM	_	_	114	dep	_	_	_	_	_
116	(	(	PUNC	_	_	117	punc	_	_	_	_	_
117	Osheroff	Osheroff	NOM	_	_	113	parenth	_	_	_	_	_
118	,	,	PUNC	_	_	132	punc	_	_	_	_	_
119	1987	1987	NUM	_	_	117	dep	_	_	_	_	_
120	)	)	PUNC	_	_	117	punc	_	_	_	_	_
121	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
122	Après	Après	PRE	_	_	132	periph	_	_	_	_	_
123	l'	le	DET	_	_	124	spe	_	_	_	_	_
124	assemblage	assemblage	NOM	_	_	122	dep	_	_	_	_	_
125	de	de	PRE	_	_	124	dep	_	_	_	_	_
126	la	le	DET	_	_	127	spe	_	_	_	_	_
127	topoisomérase	topoisomérase	NOM	_	_	125	dep	_	_	_	_	_
128	,	,	PUNC	_	_	122	punc	_	_	_	_	_
129	ce	ce	DET	_	_	130	spe	_	_	_	_	_
130	groupement	groupement	NOM	_	_	132	subj	_	_	_	_	_
131	se	se	CLI	_	_	132	dep	_	_	_	_	_
132	retrouve	retrouver	VRB	_	_	81	dep	_	_	_	_	_
133	proche	proche	ADJ	_	_	132	dep	_	_	_	_	_
134	du	de	PRE	_	_	133	dep	_	_	_	_	_
135	domaine	domaine	NOM	_	_	134	dep	_	_	_	_	_
136	5Y-CAP	5Y-CAP	NUM	_	_	135	dep	_	_	_	_	_
137	,	,	PUNC	_	_	141	punc	_	_	_	_	_
138	avec	avec	PRE	_	_	141	periph	_	_	_	_	_
139	lequel	lequel	PRQ	_	_	138	dep	_	_	_	_	_
140	il	il	CLS	_	_	141	subj	_	_	_	_	_
141	permet	permettre	VRB	_	_	135	dep	_	_	_	_	_
142	le	le	DET	_	_	143	spe	_	_	_	_	_
143	mouvement	mouvement	NOM	_	_	141	dep	_	_	_	_	_
144	des	de	PRE	_	_	143	dep	_	_	_	_	_
145	domaines	domaine	NOM	_	_	144	dep	_	_	_	_	_
146	qui	qui	PRQ	_	_	147	subj	_	_	_	_	_
147	ouvrent	ouvrir	VRB	_	_	145	dep	_	_	_	_	_
148	ou	ou	COO	_	_	149	mark	_	_	_	_	_
149	ferment	fermer	VRB	_	_	147	para	_	_	_	_	_
150	la	le	DET	_	_	151	spe	_	_	_	_	_
151	structure	structure	NOM	_	_	149	dep	_	_	_	_	_
152	de	de	PRE	_	_	151	dep	_	_	_	_	_
153	la	le	DET	_	_	154	spe	_	_	_	_	_
154	protéine	protéine	NOM	_	_	152	dep	_	_	_	_	_
155	et	et	COO	_	_	156	mark	_	_	_	_	_
156	permettent	permettre	VRB	_	_	141	para	_	_	_	_	_
157	au	à	PRE	_	_	156	dep	_	_	_	_	_
158	brin	brin	NOM	_	_	157	dep	_	_	_	_	_
159	d'	de	PRE	_	_	158	dep	_	_	_	_	_
160	ADN	ADN	NOM	_	_	159	dep	_	_	_	_	_
161	de	de	PRE	_	_	156	dep	_	_	_	_	_
162	passer	passer	VNF	_	_	161	dep	_	_	_	_	_
163	entre	entre	PRE	_	_	162	dep	_	_	_	_	_
164	eux	lui	PRQ	_	_	163	dep	_	_	_	_	_
165	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-253
# text = Les Topos de types II partagent également deux domaines dont les activités sont liées à la fixation et à l'hydrolyse de l'ATP .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	Topos	Topos	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	types	type	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	II	II	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	partagent	partager	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	également	également	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	deux	deux	NUM	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	domaines	domaine	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	dont	dont	PRQ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
11	les	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	activités	activité	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
13	sont	être	VRB	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	liées	lier	VPP	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	fixation	fixation	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	à	à	PRE	_	_	15	para	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	hydrolyse	hydrolyse	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	l'	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	ATP	ATP	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-254
# text = Le site de liaison de l'ATP est le domaine GHKL , appelé ainsi en fonction des différentes protéines dans lesquelles il se trouve ( Gyrase , Hsp 90 , histidine kinase et MutL ) .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	site	site	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	liaison	liaison	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ATP	ATP	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	le	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	domaine	domaine	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	GHKL	GHKL	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	appelé	appeler	VPP	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	ainsi	ainsi	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	en	en	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	fonction	fonction	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	des	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	différentes	différent	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	protéines	protéine	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	dans	dans	PRE	_	_	24	periph	_	_	_	_	_
21	lesquelles	lequel	PRQ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	il	il	CLS	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
23	se	se	CLI	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	trouve	trouver	VRB	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
25	(	(	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	Gyrase	Gyrase	NOM	_	_	19	parenth	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
28	Hsp	Hsp	NOM	_	_	26	para	_	_	_	_	_
29	90	90	NUM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
31	histidine	histidine	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
32	kinase	kinase	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	et	et	COO	_	_	34	mark	_	_	_	_	_
34	MutL	MutL	NOM	_	_	28	para	_	_	_	_	_
35	)	)	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-255
# text = Il est composé de 8 feuillets & 206;& 178; couverts sur une face par 5 hélices & 206;& 177; , et d'une boucle riche en résidus glycines .
1	Il	il	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	composé	composer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	8	8	NUM	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	feuillets	feuillet	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	β	β	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	couverts	couvrir	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	sur	sur	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	une	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	face	face	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	par	par	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	5	5	NUM	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	hélices	hélice	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	α	α	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	d'	de	PRE	_	_	4	para	_	_	_	_	_
19	une	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	boucle	boucle	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	riche	riche	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	en	en	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	résidus	résidu	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	glycines	glycine	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-256
# text = Ce site se dimérise une fois l'ATP fixé et les deux boucles entrent alors en contact , formant une porte pour l'hélice d'ADN ( Figure 2 ) .
1	Ce	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	site	site	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	se	se	CLI	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	dimérise	uwSe	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	une	une fois	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	fois	une fois	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	ATP	ATP	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	fixé	fixer	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
11	les	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
12	deux	deux	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	boucles	boucle	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
14	entrent	entrer	VRB	_	_	4	para	_	_	_	_	_
15	alors	alors	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	en	en	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	contact	contact	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	formant	former	VPR	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
20	une	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	porte	porte	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	pour	pour	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	l'	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	hélice	hélice	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	d'	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	ADN	ADN	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	(	(	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
28	Figure	Figure	NOM	_	_	24	parenth	_	_	_	_	_
29	2	2	NUM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	)	)	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-257
# text = L'ATP est ensuite hydrolysé par le domaine « transducteur » au niveau d'un résidu lysine .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	ATP	ATP	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
4	ensuite	ensuite	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	hydrolysé	hydrolyser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	le	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	domaine	domaine	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	«	«	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	transducteur	transducteur	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	»	»	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
12	au	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
13	niveau	niveau	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	d'	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	un	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	résidu	résidu	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	lysine	lysine	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-258
# text = La fixation de l'ATP entraîne une rotation entre les domaines GHKL et transducteur , qui positionne le résidu lysine dans son site catalytique .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fixation	fixation	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	ATP	ATP	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	entraîne	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	une	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	rotation	rotation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	entre	entre	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	domaines	domaine	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	GHKL	GHKL	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	transducteur	transducteur	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
16	qui	qui	PRQ	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
17	positionne	positionner	VRB	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
18	le	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	résidu	résidu	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	lysine	lysine	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	dans	dans	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
22	son	son	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	site	site	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	catalytique	catalytique	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-259
# text = Cette modification de structure serait un signal pour les régions liées à l'ADN qui dirigeraient alors son passage pendant l'ouverture de l'autre brin .
1	Cette	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	modification	modification	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	structure	structure	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	serait	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	un	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	signal	signal	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	pour	pour	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	les	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	régions	région	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	liées	lier	VPP	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	à	à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	ADN	ADN	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	qui	qui	PRQ	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
16	dirigeraient	diriger	VRB	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
17	alors	alors	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	son	son	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	passage	passage	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	pendant	pendant	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	l'	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	ouverture	ouverture	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	l'	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
25	autre	autre	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	brin	brin	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-260
# text = Les Topos de type II sont les cibles de deux types d'antibiotiques :
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	Topos	Topos	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	type	type	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	II	II	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	cibles	cible	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	deux	deux	NUM	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	types	type	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	antibiotiques	antibiotique	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	:	:	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-261
# text = les coumarines et les quinolones .
1	les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	coumarines	cou	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	quinolones	quinoléine	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-262
# text = Les coumarines se fixent sur les sous-unités ATPases et entrent en compétition avec l'ATP .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	coumarines	cou	ADJ	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	se	se	CLI	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	fixent	fixer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	sur	sur	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	sous-unités	sous-	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	ATPases	ATPases	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	entrent	entrer	VRB	_	_	4	para	_	_	_	_	_
11	en	en	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	compétition	compétition	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	avec	avec	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	ATP	ATP	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-263
# text = Les quinolones se fixent sur l'enzyme complexée à l'ADN et l'immobilisent ainsi ;
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	quinolones	quinoléine	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	se	se	CLI	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	fixent	fixer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	sur	sur	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	enzyme	enzyme	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	complexée	complexé	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	ADN	ADN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
13	l'	le	CLI	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	immobilisent	immobiliser	VRB	_	_	4	para	_	_	_	_	_
15	ainsi	ainsi	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	;	;	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-264
# text = les complexes extraits à la suite de tels traitements montrent la gyrase liée de façon covalente à l'extrémité 5 'de l'ADN coupé . Ceci entraîne la fragmentation de l'ADN , aboutissant à la mort cellulaire .
1	les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	complexes	complexe	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	extraits	extraire	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	à	à	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	suite	suite	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	tels	tel	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	traitements	traitement	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	montrent	montrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	gyrase	gyrase	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	liée	lier	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	façon	façon	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	covalente	co-	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
17	à	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	extrémité	extrémité	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	5	5	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	'	'	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	l'	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	ADN	ADN	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	coupé	coupé	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
27	Ceci	Ceci	PRQ	_	_	28	subj	_	_	_	_	_
28	entraîne	entraîner	VRB	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	fragmentation	fragmentation	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	l'	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	ADN	ADN	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	,	,	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_
35	aboutissant	aboutir	VPR	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
36	à	à	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	la	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	mort	mort	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-265
# text = Chez E. coli , quatre Topos sont présentes .
1	Chez	chez	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	E.	E.	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	coli	coli	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	quatre	quatre	NUM	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	Topos	Topos	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	présentes	présent	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-266
# text = Deux sont de type IA :
1	Deux	deux	NUM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	type	type	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	IA	IA	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	:	:	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-267
# text = la
1	la	la	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-268
# text = TopoI , codée par topA et la TopoIII , codée par topB .
1	TopoI	TopoI	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	codée	coder	VPP	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	par	par	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	topA	topA	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	TopoIII	TopoIII	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	codée	coder	VPP	_	_	3	para	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	topB	topB	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-269
# text = Deux sont de type IIA :
1	Deux	deux	NUM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	type	type	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	IIA	IIA	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	:	:	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-270
# text = la gyrase , codée par gyrA et gyrB , et la TopoIV , codée par parC et parE .
1	la	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	gyrase	gyrase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
4	codée	coder	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	gyrA	gyrA	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	gyrB	gyrB	NOM	_	_	6	para	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	12	mark	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	TopoIV	TopoIV	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	codée	coder	VPP	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	par	par	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	parC	parc	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	parE	parE	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-271
# text = Les Topos de type I
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	Topos	Topos	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	type	type	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	I	I	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-272
# text = Mécanisme d'action
1	Mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	action	action	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-273
# text = Les deux Topos de type IA d'E. coli sont monomériques ( Figure 3 ) .
1	Les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	deux	deux	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	Topos	Topos	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	type	type	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	IA	IA	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	E.	E.	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	coli	coli	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	monomériques	monomérique	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Figure	Figure	NOM	_	_	10	parenth	_	_	_	_	_
14	3	3	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	)	)	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-274
# text = Les Topos IA d'E. coli sont composées de 2 domaines essentiels :
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	Topos	Topos	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	IA	IA	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	E.	E.	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	coli	coli	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	sont	être	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	composées	composer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	2	2	NUM	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	domaines	domaine	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	essentiels	essentiel	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	:	:	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-275
# text = un domaine N-terminal catalytique formant un tore , pouvant cliver l'ADN et s'ouvrir suffisamment pour transférer un brin d'ADN .
1	un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	domaine	domaine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	N-terminal	N-terminal	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	catalytique	catalytique	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	formant	former	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	un	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	tore	tore	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
9	pouvant	pouvoir	VPR	_	_	5	para	_	_	_	_	_
10	cliver	cliver	VNF	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	ADN	ADN	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
14	s'	s'	CLI	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	ouvrir	ouvrir	VNF	_	_	9	para	_	_	_	_	_
16	suffisamment	suffisamment	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	pour	pour	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	transférer	transférer	VNF	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	un	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	brin	brin	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	d'	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	ADN	ADN	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-276
# text = Ce domaine contient la tyrosine catalytique en position 319 de la TopoI , mais est incapable de l'activité de relâchement .
1	Ce	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	domaine	domaine	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	contient	contenir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	tyrosine	tyrosine	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	catalytique	catalytique	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	position	position	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	319	319	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	TopoI	TopoI	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
14	mais	mais	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	est	être	VRB	_	_	3	para	_	_	_	_	_
16	incapable	incapable	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	activité	activité	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	relâchement	relâchement	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-277
# text = Les domaines N-terminaux des Topos I et III partagent une grande homologie .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	domaines	domaine	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	N-terminaux	N-terminaux	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	Topos	Topos	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	I	I	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	III	III	NOM	_	_	5	para	_	_	_	_	_
9	partagent	partager	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
11	grande	grand	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	homologie	homologie	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-278
# text = un domaine C-terminal participant à la fixation de l'ADN ( Ahumada et Tse-Dinh , 1998 ) , ne montrant par contre aucune homologie entre les deux enzymes .
1	un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	domaine	domaine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	C-terminal	C-terminal	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	participant	participer	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	à	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	fixation	fixation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	ADN	ADN	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	(	(	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	Ahumada	Ahumada	NOM	_	_	10	parenth	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	Tse-Dinh	Tse-Dinh	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
16	1998	1998	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	)	)	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
19	ne	ne	ADV	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	montrant	montrer	VPR	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
21	par	par contre	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	contre	par contre	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	aucune	aucun	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	homologie	homologie	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
25	entre	entre	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	les	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
27	deux	deux	NUM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	enzymes	enzyme	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-279
# text = La TopoI possède de plus un domaine central liant les cations Zn 2 + , de 162 acides aminés , indispensable pour l'activité de relaxation .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	TopoI	TopoI	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	possède	posséder	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	de	de plus	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	plus	de plus	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	un	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	domaine	domaine	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	central	central	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	liant	lier	VPR	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	cations	cation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	Zn	Zn	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	2	2	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	+	plus	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
17	162	162	NUM	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	acides	acide	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	aminés	aminé	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	indispensable	indispensable	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
22	pour	pour	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	l'	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	activité	activité	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	relaxation	relaxation	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-280
# text = Malgré ces différences , leur mécanisme d'action est très similaire , et nous prendrons ici l'exemple de la TopoI .
1	Malgré	malgré	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	différences	différence	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	leur	son	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	action	action	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	très	très	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	similaire	similaire	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
14	nous	nous	CLS	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
15	prendrons	prendre	VRB	_	_	9	para	_	_	_	_	_
16	ici	ici	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	exemple	exemple	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	TopoI	TopoI	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-281
# text = Le mécanisme de relâchement de l'ADN par la TopoI ( Figure 4 ) a pu être appréhendé grâce à l'obtention de la structure 3D du fragment N-terminal de 67 kDa complexé à l'ADN ( Perry et Mondragon , 2003 ) .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	relâchement	relâchement	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ADN	ADN	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	TopoI	TopoI	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	(	(	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	Figure	Figure	NOM	_	_	10	parenth	_	_	_	_	_
13	4	4	NUM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	)	)	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
15	a	avoir	VRB	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	pu	pouvoir	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	être	être	VNF	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
18	appréhendé	appréhender	VPP	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	grâce	grâce à	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	à	grâce à	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	l'	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	obtention	obtention	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	structure	structure	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	3D	3D	NUM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	du	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	fragment	fragment	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	N-terminal	N-terminal	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
31	67	67	NUM	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
32	kDa	kDa	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
33	complexé	complexé	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
34	à	à	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	l'	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	ADN	ADN	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	(	(	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
38	Perry	Perry	NOM	_	_	36	parenth	_	_	_	_	_
39	et	et	COO	_	_	40	mark	_	_	_	_	_
40	Mondragon	Mondragon	NOM	_	_	38	para	_	_	_	_	_
41	,	,	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
42	2003	2003	NUM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	)	)	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
44	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-282
# text = Tout d'abord , la
1	Tout	tout d'abord	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	d'	tout d'abord	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	abord	tout d'abord	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
5	la	la	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-283
# text = TopoI se fixe sur l'ADN superenroulé et déforme la double hélice ( Figure 4 b ) .
1	TopoI	TopoI	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	se	se	CLI	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	fixe	fixer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	sur	sur	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	ADN	ADN	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	superenroulé	super-	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	déforme	déformer	VRB	_	_	3	para	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
11	double	double	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	hélice	hélice	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	(	(	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	Figure	Figure	NOM	_	_	12	parenth	_	_	_	_	_
15	4	4	NUM	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	b	boulevard	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	)	)	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-284
# text = Un changement conformationnel permet alors le positionnement correct du résidu Tyr 319 qui engendre la coupure de l'ADN ( Figure 4 c ) , et entraîne ainsi la formation d'une liaison covalente entre l'extrémité 5 'du brin d'ADN clivé et la tyrosine du site actif . Cette coupure provoque alors un changement de conformation qui permet l'ouverture de l'enzyme et le passage du second brin d'ADN dans la cavité de l'enzyme ( Figure 4 d et e ) . Après la fermeture de la cavité de l'enzyme , le brin d'ADN clivé est alors religaturé par la TopoI ( Figure
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	changement	changement	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	conformationnel	conformation	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	permet	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	alors	alors	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	le	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	positionnement	positionnement	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	correct	correct	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	du	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	résidu	résidu	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	Tyr	Tyr	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	319	319	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	qui	qui	PRQ	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
14	engendre	engendrer	VRB	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	coupure	coupure	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	ADN	ADN	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	(	(	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
21	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	4	4	NUM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	c	cf	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	)	)	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	111	punc	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
27	entraîne	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
28	ainsi	ainsi	ADV	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	formation	formation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
31	d'	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	une	un	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	liaison	liaison	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	covalente	co-	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	entre	entre	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	l'	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	extrémité	extrémité	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	5	5	NUM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	'	'	PUNC	_	_	47	punc	_	_	_	_	_
40	du	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
41	brin	brin	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	d'	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	ADN	ADN	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	clivé	cliver	ADJ	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
45	et	et	COO	_	_	47	mark	_	_	_	_	_
46	la	le	DET	_	_	47	spe	_	_	_	_	_
47	tyrosine	tyrosine	NOM	_	_	37	para	_	_	_	_	_
48	du	de	PRE	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	site	site	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	actif	actif	ADJ	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	.	.	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
52	Cette	Cette	DET	_	_	53	spe	_	_	_	_	_
53	coupure	coupure	NOM	_	_	54	subj	_	_	_	_	_
54	provoque	provoquer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
55	alors	alors	ADV	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	un	un	DET	_	_	57	spe	_	_	_	_	_
57	changement	changement	NOM	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
58	de	de	PRE	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
59	conformation	conformation	NOM	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
60	qui	qui	PRQ	_	_	61	subj	_	_	_	_	_
61	permet	permettre	VRB	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
62	l'	le	DET	_	_	63	spe	_	_	_	_	_
63	ouverture	ouverture	NOM	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
64	de	de	PRE	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
65	l'	le	DET	_	_	66	spe	_	_	_	_	_
66	enzyme	enzyme	NOM	_	_	64	dep	_	_	_	_	_
67	et	et	COO	_	_	69	mark	_	_	_	_	_
68	le	le	DET	_	_	69	spe	_	_	_	_	_
69	passage	passage	NOM	_	_	63	para	_	_	_	_	_
70	du	de	PRE	_	_	69	dep	_	_	_	_	_
71	second	second	ADJ	_	_	72	dep	_	_	_	_	_
72	brin	brin	NOM	_	_	70	dep	_	_	_	_	_
73	d'	de	PRE	_	_	72	dep	_	_	_	_	_
74	ADN	ADN	NOM	_	_	73	dep	_	_	_	_	_
75	dans	dans	PRE	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
76	la	le	DET	_	_	77	spe	_	_	_	_	_
77	cavité	cavité	NOM	_	_	75	dep	_	_	_	_	_
78	de	de	PRE	_	_	77	dep	_	_	_	_	_
79	l'	le	DET	_	_	80	spe	_	_	_	_	_
80	enzyme	enzyme	NOM	_	_	78	dep	_	_	_	_	_
81	(	(	PUNC	_	_	80	punc	_	_	_	_	_
82	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
83	4	4	NUM	_	_	82	dep	_	_	_	_	_
84	d	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
85	et	et	COO	_	_	86	mark	_	_	_	_	_
86	e	eh	ADV	_	_	0	root	_	_	_	_	_
87	)	)	PUNC	_	_	86	punc	_	_	_	_	_
88	.	.	PUNC	_	_	86	punc	_	_	_	_	_
89	Après	Après	PRE	_	_	106	periph	_	_	_	_	_
90	la	le	DET	_	_	91	spe	_	_	_	_	_
91	fermeture	fermeture	NOM	_	_	89	dep	_	_	_	_	_
92	de	de	PRE	_	_	91	dep	_	_	_	_	_
93	la	le	DET	_	_	94	spe	_	_	_	_	_
94	cavité	cavité	NOM	_	_	92	dep	_	_	_	_	_
95	de	de	PRE	_	_	94	dep	_	_	_	_	_
96	l'	le	DET	_	_	97	spe	_	_	_	_	_
97	enzyme	enzyme	NOM	_	_	95	dep	_	_	_	_	_
98	,	,	PUNC	_	_	89	punc	_	_	_	_	_
99	le	le	DET	_	_	100	spe	_	_	_	_	_
100	brin	brin	NOM	_	_	106	subj	_	_	_	_	_
101	d'	de	PRE	_	_	100	dep	_	_	_	_	_
102	ADN	ADN	NOM	_	_	101	dep	_	_	_	_	_
103	clivé	cliver	ADJ	_	_	100	dep	_	_	_	_	_
104	est	être	VRB	_	_	106	aux	_	_	_	_	_
105	alors	alors	ADV	_	_	106	dep	_	_	_	_	_
106	religaturé	re-	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
107	par	par	PRE	_	_	106	dep	_	_	_	_	_
108	la	le	DET	_	_	109	spe	_	_	_	_	_
109	TopoI	TopoI	NOM	_	_	107	dep	_	_	_	_	_
110	(	(	PUNC	_	_	109	punc	_	_	_	_	_
111	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-285
# text = 4 f ) .
1	4	4	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	f	ph	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-286
# text = Un second cycle d'ouverture et de fermeture de l'enzyme libère ensuite l'hélice d'ADN ( Figure 4 g et h ) et l'enzyme retrouve alors sa conformation initiale ( Figure 4 i ) , soit pour se dissocier de l'ADN , soit pour agir de manière processive .
1	Un	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	second	second	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	cycle	cycle	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ouverture	ouverture	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	7	mark	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	4	para	_	_	_	_	_
8	fermeture	fermeture	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	enzyme	enzyme	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	libère	libérer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	ensuite	ensuite	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	hélice	hélice	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	d'	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	ADN	ADN	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	(	(	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Figure	Figure	NOM	_	_	15	parenth	_	_	_	_	_
20	4	4	NUM	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	g	gramme	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	h	heure	NOM	_	_	21	para	_	_	_	_	_
24	)	)	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
26	l'	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	enzyme	enzyme	NOM	_	_	28	subj	_	_	_	_	_
28	retrouve	retrouver	VRB	_	_	12	para	_	_	_	_	_
29	alors	alors	ADV	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	sa	son	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	conformation	conformation	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
32	initiale	initial	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	(	(	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
34	Figure	Figure	VRB	_	_	28	parenth	_	_	_	_	_
35	4	4	NUM	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	i	if	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	)	)	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
38	,	,	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
39	soit	soit	COO	_	_	47	mark	_	_	_	_	_
40	pour	pour	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
41	se	se	CLI	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
42	dissocier	dissocier	VNF	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	de	de	PRE	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	l'	le	DET	_	_	45	spe	_	_	_	_	_
45	ADN	ADN	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	,	,	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
47	soit	soit	COO	_	_	48	mark	_	_	_	_	_
48	pour	pour	PRE	_	_	40	para	_	_	_	_	_
49	agir	agir	VNF	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	de	de	PRE	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	manière	manière	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	processive	processif	ADJ	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-287
# text = Ce mécanisme a pour effet de diminuer la valeur de Lk par incréments de 1 .
1	Ce	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	pour	pour	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	effet	effet	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	diminuer	diminuer	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	valeur	valeur	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	Lk	Lk	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	par	par	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	incréments	incrément	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	1	1	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-288
# text = La principale différence entre la TopoI et la TopoIII réside en deux domaines présents chez la TopoIII et absents de la TopoI. Cette différence pourrait expliquer à elle seule l'activité de décaténation spécifique de la TopoIII .
1	La	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	principale	principal	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	différence	différence	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
4	entre	entre	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	TopoI	TopoI	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	TopoIII	TopoIII	NOM	_	_	6	para	_	_	_	_	_
10	réside	résider	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	en	en	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	deux	deux	NUM	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	domaines	domaine	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	présents	présent	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	chez	chez	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	TopoIII	TopoIII	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
19	absents	absent	NOM	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	TopoI.	TopoI.	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	Cette	Cette	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	différence	différence	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	10	para	_	_	_	_	_
26	expliquer	expliquer	VNF	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	à	à	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	elle	lui	PRQ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	seule	seul	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	l'	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	activité	activité	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	décaténation	décaténation	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	spécifique	spécifique	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	la	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	TopoIII	TopoIII	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-289
# text = Le premier domaine , de fonction inconnue , correspond aux résidus 241 à 255 .
1	Le	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	premier	premier	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	domaine	domaine	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	fonction	fonction	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	inconnue	inconnu	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
9	correspond	correspondre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	aux	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	résidus	résidu	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	241	241	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	255	255	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-290
# text = Le second est responsable de l'activité de décaténation , car son remplacement par la séquence homologue de la TopoI élimine totalement cette activité ( Champoux , 2001 ) .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	second	second	ADJ	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	responsable	responsable	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	activité	activité	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	décaténation	décaténation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
11	car	car	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
12	son	son	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	remplacement	remplacement	NOM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
14	par	par	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	séquence	séquence	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	homologue	homologue	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	TopoI	TopoI	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	élimine	éliminer	VRB	_	_	3	para	_	_	_	_	_
22	totalement	totalement	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	cette	ce	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	activité	activité	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	(	(	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	Champoux	Champoux	NOM	_	_	24	parenth	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
28	2001	2001	NUM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	)	)	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
30	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-291
# text = Cette boucle , riche en résidus basiques , est localisée près de l'espace défini par le tore du domaine N-terminal .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	boucle	boucle	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	riche	riche	ADJ	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
5	en	en	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	résidus	résidu	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	basiques	basique	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
9	est	être	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	localisée	localiser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	près	près de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	près de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	espace	espace	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	défini	définir	VPP	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	par	par	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	le	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	tore	tore	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	du	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	domaine	domaine	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	N-terminal	N-terminal	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-292
# text = Elle pourrait interagir directement avec l'ADN et permettre à la TopoIII d'agir de manière processive sur des multi-caténanes , ce dont est incapable la TopoI .
1	Elle	elle	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	interagir	interagir	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	directement	directement	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	avec	avec	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ADN	ADN	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	permettre	permettre	VNF	_	_	3	para	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	TopoIII	TopoIII	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	d'	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	agir	agir	VNF	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	manière	manière	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	processive	processif	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	sur	sur	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	des	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	multi-caténanes	multi-caténanes	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	ce	ce	PRQ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
23	dont	dont	PRQ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	est	être	VRB	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	incapable	incapable	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	la	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	TopoI	TopoI	NOM	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-293
# text = Fonctions cellulaires
1	Fonctions	fonction	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	cellulaires	cellulaire	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-294
# text = La TopoI
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	TopoI	TopoI	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-295
# text = Son rôle est de limiter un superenroulement négatif trop fort , ce qui est délétère pour la cellule .
1	Son	son	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	rôle	rôle	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	limiter	limiter	VNF	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	un	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	superenroulement	super-	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	négatif	négatif	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	trop	trop	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	fort	fort	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	ce	ce	PRQ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
13	qui	qui	PRQ	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
14	est	être	VRB	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	délétère	délétère	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	pour	pour	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	cellule	cellule	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-296
# text = Cependant , cette enzyme n'est active que lorsqu'un certain niveau de superhélicité négative est dépassé , pour le réajuster à un degré physiologique optimal pour l'expression des gènes .
1	Cependant	cependant	ADV	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	cette	ce	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	enzyme	enzyme	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	n'	ne	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	active	actif	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	que	que	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	lorsqu'	lorsque	CSU	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	un	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
11	certain	certain	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	niveau	niveau	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	négative	négatif	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	est	être	VRB	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
17	dépassé	dépasser	VPP	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	pour	pour	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	le	le	CLI	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	réajuster	réajuster	VNF	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	à	à	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	un	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	degré	degré	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	physiologique	physiologique	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	optimal	optimal	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	pour	pour	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
28	l'	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	expression	expression	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	des	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	gènes	gène	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-297
# text = Ceci est réalisé en parallèle de l'activité de la gyrase , qui , elle , introduit des supertours négatifs dans l'ADN .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	réalisé	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	en	en	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	parallèle	parallèle	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	activité	activité	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	gyrase	gyrase	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
13	qui	qui	PRQ	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
15	elle	lui	PRQ	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
17	introduit	introduire	VRB	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
18	des	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	supertours	super-	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	négatifs	négatif	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	dans	dans	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
22	l'	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	ADN	ADN	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-298
# text = Un équilibre entre les activités de ces deux enzymes est ainsi établi dans la cellule en fonction des conditions et stress rencontrés ( voir paragraphe IV.B ) .
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	équilibre	équilibre	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
3	entre	entre	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	activités	activité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ces	ce	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
8	deux	deux	NUM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	enzymes	enzyme	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	est	être	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
11	ainsi	ainsi	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	établi	établir	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	dans	dans	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	cellule	cellule	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	en	en	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	fonction	fonction	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	conditions	condition	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
21	stress	stress	NOM	_	_	19	para	_	_	_	_	_
22	rencontrés	rencontrer	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	(	(	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	voir	voir	VNF	_	_	22	parenth	_	_	_	_	_
25	paragraphe	paragraphe	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	IV.B	IV.B	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	)	)	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-299
# text = Un deuxième rôle majeur de la TopoI dans la cellule a été récemment mis en évidence
1	Un	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	deuxième	deuxième	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	rôle	rôle	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
4	majeur	majeur	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	TopoI	TopoI	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	dans	dans	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	cellule	cellule	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	a	avoir	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	été	être	VPP	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
13	récemment	récemment	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	mis	mettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	en	en	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	évidence	évidence	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-300
# text = ( Masse et Drolet , 1999 ) , lié à l'activité de la machinerie transcriptionnelle dans la cellule .
1	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	Masse	Masse	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	4	mark	_	_	_	_	_
4	Drolet	Drolet	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
6	1999	1999	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
9	lié	lier	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	activité	activité	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	machinerie	machinerie	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	transcriptionnelle	transcriptionnel	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	dans	dans	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	cellule	cellule	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-301
# text = Au cours de la transcription , le complexe ARN polymérase-ARN polymérase-ARN progresse le long de l'ADN , qui est ancré à des structures fixes .
1	Au	au cours de	PRE	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	cours	au cours de	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	au cours de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	transcription	transcription	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	le	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	complexe	complexe	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
9	ARN	ARN	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	polymérase-ARN	polymérase-ARN	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	polymérase-ARN	polymérase-arn	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	progresse	progresser	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	le	le long de	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	long	le long de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	le long de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	ADN	ADN	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
19	qui	qui	PRQ	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
20	est	être	VRB	_	_	21	aux	_	_	_	_	_
21	ancré	ancrer	VPP	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
22	à	à	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	des	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	structures	structure	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	fixes	fixe	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-302
# text = Or , la progression du complexe requiert de déplacer la bulle de transcription .
1	Or	or	COO	_	_	7	mark	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	progression	progression	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
5	du	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	complexe	complexe	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	requiert	requérir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	déplacer	déplacer	VNF	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	bulle	bulle	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	transcription	transcription	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-303
# text = Pour ce faire , le complexe pourrait effectuer des rotations afin de suivre l'hélice d'ADN , mais celui  -ci , comportant la polymérase , l'ARN et la machinerie traductionnelle , est bien trop imposant pour pivoter .
1	Pour	pour ce faire	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	ce	pour ce faire	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	faire	pour ce faire	ADV	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
5	le	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	complexe	complexe	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	effectuer	effectuer	VNF	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	des	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	rotations	rotation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	afin	afin de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	de	afin de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	suivre	suivre	VNF	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	hélice	hélice	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	d'	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	ADN	ADN	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
19	mais	mais	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
20	celui	celui	PRQ	_	_	15	para	_	_	_	_	_
21	 -ci	 -ci	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
23	comportant	comporter	VPR	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	polymérase	polymérase	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
27	l'	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	ARN	ARN	NOM	_	_	25	para	_	_	_	_	_
29	et	et	COO	_	_	31	mark	_	_	_	_	_
30	la	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	machinerie	machinerie	NOM	_	_	28	para	_	_	_	_	_
32	traductionnelle	traductionnel	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
34	est	est	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
35	bien	bien	ADV	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
36	trop	trop	ADV	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
37	imposant	imposant	ADJ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
38	pour	pour	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	pivoter	pivoter	VNF	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-304
# text = C'est donc l'ADN qui effectue des rotations et , sans l'intervention de Topos pour résoudre ce problème , il s'ensuivrait une accumulation de tours positifs en amont du complexe de transcription et de supertours négatifs en aval ( Figure 5
1	C'	ce	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	donc	donc	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	qui	qui	PRQ	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	effectue	effectuer	VRB	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	des	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	rotations	rotation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
12	sans	sans	PRE	_	_	24	periph	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	intervention	intervention	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	Topos	Topos	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	pour	pour	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	résoudre	résoudre	VNF	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	ce	ce	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	problème	problème	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
22	il	il	CLS	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
23	s'	s'	CLI	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	ensuivrait	ensuivre	VRB	_	_	7	para	_	_	_	_	_
25	une	un	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	accumulation	accumulation	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	tours	tour	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	positifs	positif	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	en	en amont de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
31	amont	en amont de	DET	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	du	en amont de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	complexe	complexe	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	transcription	transcription	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	et	et	COO	_	_	37	mark	_	_	_	_	_
37	de	de	PRE	_	_	34	para	_	_	_	_	_
38	supertours	super-	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	négatifs	négatif	ADJ	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	en	en	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	aval	aval	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	(	(	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
43	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
44	5	5	NUM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-305
# text = A ;
1	A	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	;	;	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-306
# text = Liu et Wang , 1987 ) .
1	Liu	Liu	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	et	et	COO	_	_	3	mark	_	_	_	_	_
3	Wang	Wang	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
5	1987	1987	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-307
# text = La TopoI est impliquée dans l'élimination des supertours négatifs qui s'accumulent en aval de l'ARN polymérase au cours de la transcription , la gyrase ayant pour rôle d'éliminer les supertours positifs apparaissant en amont du complexe de transcription ( Liu et Wang , 1987 ) .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	TopoI	TopoI	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	impliquée	impliquer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	élimination	élimination	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	des	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	supertours	super-	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	négatifs	négatif	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	qui	qui	PRQ	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
12	s'	s'	CLI	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	accumulent	accumuler	VRB	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	en	en aval de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	aval	en aval de	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	en aval de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
18	ARN	ARN	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	polymérase	polymérase	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	au	au cours de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
21	cours	au cours de	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	de	au cours de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	transcription	transcription	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
26	la	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	gyrase	gyrase	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
28	ayant	avoir	VPR	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	pour	pour	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	rôle	rôle	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	d'	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	éliminer	éliminer	VNF	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	les	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	supertours	super-	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	positifs	positif	ADJ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	apparaissant	apparaître	VPR	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	en	en amont de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	amont	en amont de	DET	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	du	en amont de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	complexe	complexe	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	de	de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	transcription	transcription	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	(	(	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
44	Liu	Liu	NOM	_	_	40	parenth	_	_	_	_	_
45	et	et	COO	_	_	46	mark	_	_	_	_	_
46	Wang	Wang	NOM	_	_	44	para	_	_	_	_	_
47	,	,	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
48	1987	1987	NUM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
49	)	)	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
50	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-308
# text = Une accumulation trop importante de supertours négatifs en aval de l'ARN polymérase entraînerait l'ouverture de la double hélice d'ADN et pourrait favoriser l'hybridation de l'ARNm nouvellement synthétisé avec le brin d'ADN matrice , ces structures ayant été appelées boucles R .
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	accumulation	accumulation	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
3	trop	trop	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	importante	important	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	supertours	super-	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	négatifs	négatif	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	en	en aval de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	aval	en aval de	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	en aval de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
12	ARN	ARN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	polymérase	polymérase	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	entraînerait	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	ouverture	ouverture	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
19	double	double	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	hélice	hélice	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	d'	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	ADN	ADN	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	et	et	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
24	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	14	para	_	_	_	_	_
25	favoriser	favoriser	VNF	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	l'	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	hybridation	hybridation	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	l'	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	ARNm	ARNm	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	nouvellement	nouvellement	ADV	_	_	32	periph	_	_	_	_	_
32	synthétisé	synthétiser	VPP	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	avec	avec	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	le	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	brin	brin	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	d'	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	ADN	ADN	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
38	matrice	matrice	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	,	,	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
40	ces	ce	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	structures	structure	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
42	ayant	avoir	VPR	_	_	43	aux	_	_	_	_	_
43	été	être	VPP	_	_	44	aux	_	_	_	_	_
44	appelées	appeler	VPP	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
45	boucles	boucle	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	R	R	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-309
# text = L'accumulation de ces boucles R entraînerait soit une inhibition de la transcription en bloquant l'avancement de l'ARN polymérase , soit une inhibition de la synthèse protéique en entraînant la dégradation des ARNs synthétisés et hybridés sur le brin matrice ( Figure 5
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	accumulation	accumulation	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ces	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	boucles	boucle	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	R	R	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	entraînerait	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	soit	soit	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
9	une	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	inhibition	inhibition	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	transcription	transcription	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	en	le	CLI	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	bloquant	bloquer	VPR	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	avancement	avancement	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
20	ARN	ARN	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	polymérase	polymérase	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
23	soit	soit	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
24	une	un	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	inhibition	inhibition	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	synthèse	synthèse	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	protéique	protéique	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	en	en	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
31	entraînant	entraîner	VPR	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	la	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	dégradation	dégradation	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	des	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	ARNs	ARNs	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	synthétisés	synthétiser	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	et	et	COO	_	_	38	mark	_	_	_	_	_
38	hybridés	hybrider	VPP	_	_	36	para	_	_	_	_	_
39	sur	sur	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	le	le	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	brin	brin	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	matrice	matrice	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	(	(	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
44	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
45	5	5	NUM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-310
# text = B ;
1	B	B	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	;	;	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-311
# text = Drolet , 2006 ) .
1	Drolet	Drolet	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	2006	2006	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-312
# text = Un mutant topA , dépourvu d'activité TopoI , révèle une accumulation de structures de type boucles R ( Masse et Drolet , 1999 ) .
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutant	mutant	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	topA	topA	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
5	dépourvu	dépourvu	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	d'	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	activité	activité	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	TopoI	TopoI	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
10	révèle	révéler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	accumulation	accumulation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	structures	structure	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	type	type	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	boucles	boucle	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
18	R	R	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	(	(	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	Masse	Masse	NOM	_	_	17	parenth	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	Drolet	Drolet	NOM	_	_	20	para	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	1999	1999	NUM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
25	)	)	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-313
# text = La TopoI est donc essentielle dans la cellule , notamment pour l'élimination des supertours négatifs en aval de l'ARN polymérase , ce qui évite la formation de boucles R .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	TopoI	TopoI	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	donc	donc	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	essentielle	essentiel	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	dans	dans	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	cellule	cellule	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
10	notamment	notamment	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	pour	pour	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	élimination	élimination	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	des	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	supertours	super-	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	négatifs	négatif	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	en	en aval de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	aval	en aval de	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	en aval de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
21	ARN	ARN	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	polymérase	polymérase	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	ce	ce	PRQ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
25	qui	qui	PRQ	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
26	évite	éviter	VRB	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	formation	formation	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	boucles	boucle	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	R	R	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-314
# text = Par ailleurs , il a été démontré que le domaine de fixation du zinc de la TopoI était capable d'interagir avec la sous-unité & 206;& 178;'de l'ARN polymérase , ce qui pourrait suggérer que la TopoI soit localisée en aval de l'ARN polymérase au cours de la transcription pour éliminer les boucles R .
1	Par	par ailleurs	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	ailleurs	par ailleurs	ADV	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	il	il	CLS	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
5	a	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	été	être	VPP	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	démontré	démontrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	que	que	CSU	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	le	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	domaine	domaine	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	fixation	fixation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	du	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	zinc	zinc	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	TopoI	TopoI	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	était	être	VRB	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
19	capable	capable	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	d'	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	interagir	interagir	VNF	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	avec	avec	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	sous-unité	sous-	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	β'de	β'de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	l'	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
27	ARN	ARN	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	polymérase	polymérase	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
30	ce	ce	PRQ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
31	qui	qui	PRQ	_	_	32	subj	_	_	_	_	_
32	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	suggérer	suggérer	VNF	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	que	que	CSU	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	la	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	TopoI	TopoI	NOM	_	_	38	subj	_	_	_	_	_
37	soit	être	VRB	_	_	38	aux	_	_	_	_	_
38	localisée	localiser	VPP	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
39	en	en aval de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	aval	en aval de	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	de	en aval de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	l'	le	DET	_	_	44	spe	_	_	_	_	_
43	ARN	ARN	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
44	polymérase	polymérase	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
45	au	au cours de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
46	cours	au cours de	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	de	au cours de	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	la	le	DET	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
49	transcription	transcription	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	pour	pour	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
51	éliminer	éliminer	VNF	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	les	le	DET	_	_	53	spe	_	_	_	_	_
53	boucles	boucle	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
54	R	R	NOM	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-315
# text = La TopoI remplit donc au moins 2 fonctions cruciales dans les cellules bactériennes :
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	TopoI	TopoI	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	remplit	remplir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	donc	donc	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	au	à+le	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	moins	au moins	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	2	2	NUM	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	fonctions	fonction	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
9	cruciales	crucial	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
11	les	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	cellules	cellule	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	bactériennes	bactérien	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	:	:	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-316
# text = le maintien d'un niveau adéquat de superhélicité de l'ADN nécessaire à tous les processus vitaux de la cellule , et l'élimination des boucles R pour assurer le couplage transcription & 226;& 128;& 147; traduction .
1	le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	maintien	maintien	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	un	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	niveau	niveau	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	adéquat	adéquat	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	ADN	ADN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	nécessaire	nécessaire	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	tous	tout	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
15	les	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	processus	processus	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	vitaux	vital	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	cellule	cellule	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
23	l'	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	élimination	élimination	NOM	_	_	20	para	_	_	_	_	_
25	des	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	boucles	boucle	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	R	R	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	pour	pour	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
29	assurer	assurer	VNF	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	le	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	couplage	couplage	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	transcription	transcription	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	–	–	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	traduction	traduction	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-317
# text = De par ces activités essentielles pour la cellule , des mutants du gène topA pourraient s'avérer non viables .
1	De	de par	PRE	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
2	par	de par	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	ces	ce	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	activités	activité	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	essentielles	essentiel	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	pour	pour	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	cellule	cellule	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
10	des	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	mutants	mutant	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
12	du	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	gène	gène	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	topA	topA	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	s'	s'	CLI	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	avérer	avérer	VNF	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	non	non	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	viables	viable	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-318
# text = Des analyses génétiques ont effectivement démontré que des mutations de topA ne pouvaient être observées qu'en association avec des mutations secondaires compensatrices dans les gènes gyrA et gyrB , codant pour les deux sous-unités de la gyrase .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	analyses	analyse	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	génétiques	génétique	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ont	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
5	effectivement	effectivement	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	démontré	démontrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	que	que	CSU	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	des	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	mutations	mutation	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	topA	topA	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	ne	ne	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	pouvaient	pouvoir	VRB	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	être	être	VNF	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
15	observées	observer	VPP	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	qu'	que	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	en	en	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	association	association	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	avec	avec	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
20	des	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	mutations	mutation	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	secondaires	secondaire	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	compensatrices	compensateur	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	dans	dans	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
25	les	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	gènes	gène	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	gyrA	gyrA	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	et	et	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
29	gyrB	gyrB	ADJ	_	_	27	para	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
31	codant	coder	VPR	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
32	pour	pour	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	les	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
34	deux	deux	NUM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
35	sous-unités	sous-	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
36	de	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	la	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	gyrase	gyrase	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-319
# text = Les mutations dans gyrA et gyrB diminuent l'activité de la gyrase , ce qui a pour effet de restaurer un niveau de superhélicité physiologique dans un mutant topA. Ces travaux suggéraient donc que le gène topA était essentiel chez E. coli .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutations	mutation	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	dans	dans	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	gyrA	gyrA	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	gyrB	gyrB	NOM	_	_	4	para	_	_	_	_	_
7	diminuent	diminuer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	activité	activité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	gyrase	gyrase	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
14	ce	ce	PRQ	_	_	32	subj	_	_	_	_	_
15	qui	qui	PRQ	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
16	a	avoir	VRB	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	pour	pour	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	effet	effet	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	restaurer	restaurer	VNF	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	un	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	niveau	niveau	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	physiologique	physiologique	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	dans	dans	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
27	un	un	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	mutant	mutant	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	topA.	topA.	VPR	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	Ces	Ces	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	travaux	travail	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	suggéraient	suggérer	VRB	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
33	donc	donc	ADV	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	que	que	CSU	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	le	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	gène	gène	NOM	_	_	38	subj	_	_	_	_	_
37	topA	topA	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	était	être	VRB	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
39	essentiel	essentiel	ADJ	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	chez	chez	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	E.	E.	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
42	coli	coli	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-320
# text = En revanche , ce phénomène n'a pas été observé chez Salmonella typhimurium et Shigella flexneri , deux autres entérobactéries
1	En	en revanche	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	revanche	en revanche	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	ce	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	phénomène	phénomène	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
6	n'	ne	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
7	a	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
8	pas	pas	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
9	été	être	VPP	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	observé	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	chez	chez	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	Salmonella	Salmonella	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	typhimurium	typhimurium	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
15	Shigella	Shigella	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	flexneri	flexneri	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
18	deux	deux	NUM	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
19	autres	autre	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	entérobactéries	entérobactérie	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-321
# text = . Afin d'éviter les mutations secondaires , Stupina et Wang ( 2005 ) ont alors construit et analysé des souches d'E. coli possédant des allèles mutants du gène topA codant des TopoI thermosensibles .
1	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
2	Afin	Afin	PRE	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
3	d'	afin de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	éviter	éviter	VNF	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	mutations	mutation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	secondaires	secondaire	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
9	Stupina	Stupina	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
11	Wang	Wang	NOM	_	_	9	para	_	_	_	_	_
12	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	2005	2005	NUM	_	_	11	parenth	_	_	_	_	_
14	)	)	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
15	ont	avoir	VRB	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
16	alors	alors	ADV	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	construit	construire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	analysé	analyser	VPP	_	_	17	para	_	_	_	_	_
20	des	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	souches	souche	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	d'	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	E.	E.	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	coli	coli	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	possédant	posséder	VPR	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
26	des	un	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	allèles	allèle	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	mutants	mutant	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	du	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	gène	gène	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	topA	topA	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	codant	coder	VPR	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	des	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
34	TopoI	TopoI	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	thermosensibles	thermosensible	ADJ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-322
# text = Ces gènes topA sont soit sous le contrôle de leur propre promoteur , soit sous le contrôle du promoteur Plac , donc inductibles par l'IPTG dans le second cas .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	gènes	gène	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	topA	topA	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	soit	soit	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
6	sous	sous	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	le	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	contrôle	contrôle	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	leur	son	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
11	propre	propre	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	promoteur	promoteur	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
14	soit	soit	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	sous	sous	PRE	_	_	6	para	_	_	_	_	_
16	le	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	contrôle	contrôle	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	du	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	promoteur	promoteur	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	Plac	Plac	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
22	donc	donc	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	inductibles	inductible	ADJ	_	_	18	para	_	_	_	_	_
24	par	par	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
25	l'	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	IPTG	IPTG	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	dans	dans	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
28	le	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
29	second	second	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	cas	cas	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-323
# text = Les souches mutantes sont viables à 37 °C et 42 °C , sans nécessité de mutation compensatoire .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	souches	souche	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	mutantes	mutant	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	viables	viable	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	à	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	37	37	NUM	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	°C	degré	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
10	42	42	NUM	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	°C	degré	NOM	_	_	8	para	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	sans	sans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
14	nécessité	nécessité	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	mutation	mutation	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	compensatoire	compensatoire	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-324
# text = En revanche , ce n'est plus le cas à des températures plus basses .
1	En	en revanche	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	revanche	en revanche	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	ce	ce	CLS	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	n'	ne	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	plus	plus	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	cas	cas	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	des	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	températures	température	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	plus	plus	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	basses	bas	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-325
# text = Par ailleurs , ces auteurs ont démontré que la viabilité des mutants du gène topA était strictement dépendante de la présence de la TopoIII , l'autre Topo de type
1	Par	par ailleurs	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	ailleurs	par ailleurs	ADV	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	ces	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	auteurs	auteur	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
6	ont	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	démontré	démontrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	que	que	CSU	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	viabilité	viabilité	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
11	des	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	mutants	mutant	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	du	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	gène	gène	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	topA	topA	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	était	être	VRB	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
17	strictement	strictement	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	dépendante	dépendant	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	présence	présence	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	TopoIII	TopoIII	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
26	l'	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
27	autre	autre	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	Topo	Topo	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	type	type	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-326
# text = IA présente chez E. coli et codée par le gène topB. En effet , des doubles mutants topA topB ne sont pas viables , quelle que soit la température .
1	IA	ia	NOM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
2	présente	présent	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	chez	chez	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	E.	E.	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	coli	coli	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
7	codée	coder	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	par	par	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	le	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	gène	gène	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	topB.	topB.	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	En	En	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
13	effet	effet	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
15	des	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
16	doubles	double	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	mutants	mutant	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
18	topA	topA	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	topB	topB	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	ne	ne	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	pas	pas	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	viables	viable	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	quelle	quel?	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
26	que	que	PRQ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
27	soit	être	VRB	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	température	température	NOM	_	_	27	subj	_	_	_	_	_
30	.	.	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-327
# text = Deux hypothèses ont été émises pour expliquer l'absence de viabilité des mutants topA à basse température .
1	Deux	deux	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	hypothèses	hypothèse	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	ont	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	émises	émettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	pour	pour	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	expliquer	expliquer	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	absence	absence	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	viabilité	viabilité	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	des	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	mutants	mutant	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	topA	topA	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	basse	bas	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	température	température	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-328
# text = Une basse température pourrait soit favoriser la formation de boucles R , ce qui nécessiterait la présence absolue de la TopoI , soit réduire de façon additionnelle l'activité déjà faible de relâchement de l'ADN de la TopoIII ( voir paragraphe suivant ) .
1	Une	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	basse	bas	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	température	température	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	soit	soit	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	favoriser	favoriser	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	formation	formation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	boucles	boucle	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	R	R	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	ce	ce	PRQ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
14	qui	qui	PRQ	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
15	nécessiterait	nécessiter	VRB	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	présence	présence	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	absolue	absolu	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	TopoI	TopoI	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
23	soit	soit	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
24	réduire	réduire	VPP	_	_	15	para	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	façon	façon	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	additionnelle	additionnel	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	l'	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	activité	activité	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
30	déjà	déjà	ADV	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	faible	faible	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
33	relâchement	relâchement	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	l'	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	ADN	ADN	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
38	la	le	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	TopoIII	TopoIII	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	(	(	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
41	voir	voir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
42	paragraphe	paragraphe	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
43	suivant	suivant	ADJ	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	)	)	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
45	.	.	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-329
# text = La nécessité de mutations compensatoires dans les gènes gyrAB lors des premières études était liée à un biais dans la construction des mutations dans le gène topA
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	nécessité	nécessité	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	mutations	mutation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	compensatoires	compensatoire	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	gènes	gène	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	gyrAB	gyrAB	VPR	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	lors	lors	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	des	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
12	premières	premier	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	études	étude	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	était	être	VRB	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
15	liée	lier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	à	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	un	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	biais	biais	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	dans	dans	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	construction	construction	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	des	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	mutations	mutation	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	dans	dans	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	le	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	gène	gène	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	topA	topA	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-330
# text = ( Stupina et Wang , 2005 ) .
1	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	Stupina	Stupina	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	4	mark	_	_	_	_	_
4	Wang	Wang	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	2005	2005	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-331
# text = La TopoIII
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	TopoIII	TopoIII	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-332
# text = Les fonctions occupées par la TopoIII ne sont pas encore totalement élucidées .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fonctions	fonction	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
3	occupées	occuper	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	par	par	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	TopoIII	TopoIII	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	ne	ne	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
8	sont	être	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
9	pas	pas	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
10	encore	encore	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	totalement	totalement	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	élucidées	élucider	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-333
# text = En effet , un mutant pour la TopoIII ne montre pas de phénotype clairement différent chez E. coli .
1	En	en effet	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	un	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	mutant	mutant	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
6	pour	pour	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	TopoIII	TopoIII	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	ne	ne	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	montre	montrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	pas	pas de	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
12	de	pas de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	phénotype	phénotype	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	clairement	clairement	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	différent	différent	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	chez	chez	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
17	E.	E.	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	coli	coli	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-334
# text = De plus , en raison de la présence de codons rares dans le gène topB d'E. coli , la TopoIII est présente dans la cellule en quantités très limitées ( 1 à 10 molécules / cellule ) , alors que les autres
1	De	de plus	PRE	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	en	en raison de	PRE	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
5	raison	en raison de	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	en raison de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	présence	présence	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	codons	codon	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	rares	rare	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	dans	dans	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	le	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	gène	gène	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	topB	topB	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	d'	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	E.	E.	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	coli	coli	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	TopoIII	TopoIII	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
22	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	présente	présent	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	dans	dans	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	cellule	cellule	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	en	en	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	quantités	quantité	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	très	très	ADV	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	limitées	limiter	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	(	(	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
32	1	1	NUM	_	_	26	parenth	_	_	_	_	_
33	à	à	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	10	10	NUM	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	molécules	molécule	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	/	ou	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
37	cellule	cellule	NOM	_	_	35	para	_	_	_	_	_
38	)	)	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
39	,	,	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
40	alors	alors que	CSU	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
41	que	alors que	CSU	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
42	les	le	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	autres	autre	ADJ	_	_	41	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-335
# text = Topos sont 500 fois plus abondantes ( DiGate et Marians , 1989 ) .
1	Topos	topo	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	500	500	NUM	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	fois	fois	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	plus	plus	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	abondantes	abondant	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	(	(	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
8	DiGate	DiGate	NOM	_	_	4	parenth	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	Marians	Marians	NOM	_	_	8	para	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	1989	1989	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	)	)	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-336
# text = La TopoIII bactérienne est capable d'effectuer la décaténation des chromosomes-fils au cours de la réplication .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	TopoIII	TopoIII	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	bactérienne	bactérien	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	capable	capable	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	d'	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	effectuer	effectuer	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	décaténation	décaténation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	des	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	chromosomes-fils	chromosome-fils	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	au	au cours de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
13	cours	au cours de	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	au cours de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	réplication	réplication	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-337
# text = Bien que ce rôle soit déjà assuré par la décaténase majeure d'E. coli , la TopoIV ( voir paragraphe I.A. 2 . ) , Nurse et al. ( 2003 ) ont montré que la TopoIII était capable de séparer les chromosomes-fils après réplication dans un mutant de la TopoIV .
1	Bien	bien	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	que	que	CSU	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	ce	ce	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	rôle	rôle	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
5	soit	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
6	déjà	déjà	ADV	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
7	assuré	assurer	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	par	par	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	décaténase	décaténase	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	majeure	majeur	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	d'	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	E.	E.	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	coli	coli	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	TopoIV	TopoIV	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
18	(	(	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
19	voir	voir	VNF	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	paragraphe	paragraphe	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	I.A.	I.A.	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	2	2	NUM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
24	)	)	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
26	Nurse	Nurse	NOM	_	_	33	subj	_	_	_	_	_
27	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
28	al.	al.	NOM	_	_	26	para	_	_	_	_	_
29	(	(	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
30	2003	2003	NUM	_	_	26	parenth	_	_	_	_	_
31	)	)	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
32	ont	avoir	VRB	_	_	33	aux	_	_	_	_	_
33	montré	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
34	que	que	CSU	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	la	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	TopoIII	TopoIII	NOM	_	_	37	subj	_	_	_	_	_
37	était	être	VRB	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
38	capable	capable	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	de	de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	séparer	séparer	VNF	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	les	le	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	chromosomes-fils	chromosome-fils	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	après	après	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
44	réplication	réplication	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	dans	dans	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
46	un	un	DET	_	_	47	spe	_	_	_	_	_
47	mutant	mutant	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
48	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
49	la	le	DET	_	_	50	spe	_	_	_	_	_
50	TopoIV	TopoIV	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
51	.	.	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-338
# text = La TopoIII étant une Topo de type I , elle ne peut couper qu'un seul brin d'ADN .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	TopoIII	TopoIII	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
3	étant	être	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	une	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	Topo	Topo	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	type	type	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	I	I	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
10	elle	elle	CLS	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
11	ne	ne	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	peut	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	couper	couper	VNF	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	qu'	que	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	un	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
16	seul	seul	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	brin	brin	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
18	d'	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	ADN	ADN	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-339
# text = Son activité de décaténation nécessite donc des fragments d'ADN simple brin et se réduit , lors de la réplication , à la période où les fragments d'Okazaki sont encore présents .
1	Son	son	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	activité	activité	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	décaténation	décaténation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	nécessite	nécessiter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	donc	donc	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	des	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	fragments	fragment	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	ADN	ADN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	simple	simple	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	brin	brin	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	se	se	CLI	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	réduit	réduire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
17	lors	lors de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	lors de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	réplication	réplication	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	à	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	période	période	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	où	où	PRQ	_	_	30	periph	_	_	_	_	_
26	les	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	fragments	fragment	NOM	_	_	30	subj	_	_	_	_	_
28	d'	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	Okazaki	Okazaki	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	sont	être	VRB	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
31	encore	encore	ADV	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
32	présents	présent	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-340
# text = Les mutants du gène topB présentent un phénotype d'hyperrecombinaison RecA-indépendante , ce qui suggère que la TopoIII soit impliquée dans le contrôle de la recombinaison illégitime .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutants	mutant	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	gène	gène	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	topB	topB	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	présentent	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	un	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	phénotype	phénotype	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	hyperrecombinaison	hyper-	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	RecA-indépendante	RecA-indépendante	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	ce	ce	PRQ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
14	qui	qui	PRQ	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
15	suggère	suggérer	VRB	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	que	que	CSU	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	TopoIII	TopoIII	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
19	soit	être	VRB	_	_	20	aux	_	_	_	_	_
20	impliquée	impliquer	VPP	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	dans	dans	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	le	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	contrôle	contrôle	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	illégitime	illégitime	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-341
# text = De par son implication dans les phénomènes de décaténation et de recombinaison , la TopoIII pourrait aussi jouer un rôle dans la ségrégation des chromosomes .
1	De	de par	PRE	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
2	par	de par	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	son	son	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	implication	implication	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	phénomènes	phénomène	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	décaténation	décaténation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	8	para	_	_	_	_	_
12	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	TopoIII	TopoIII	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
16	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	aussi	aussi	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	jouer	jouer	VNF	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	un	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	rôle	rôle	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	dans	dans	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	ségrégation	ségrégation	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	des	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	chromosomes	chromosome	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-342
# text = En effet , des mutants des gènes topA et topB présentent des phénotypes de filamentation avec des structures de nucléoïdes anormales .
1	En	en effet	PRE	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	mutants	mutant	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
6	des	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	gènes	gène	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	topA	topA	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	topB	topB	ADJ	_	_	8	para	_	_	_	_	_
11	présentent	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	des	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	phénotypes	phénotype	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	défi	ADV	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	filamentation	défi	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	avec	avec	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	des	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	structures	structure	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	nucléoïdes	nucléoïde	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	anormales	anormal	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-343
# text = Cependant , ces structures ne sont pas dues à un défaut de décaténation des chromosomes-fils , car une surexpression de la TopoIV , autre enzyme possédant une grande activité de décaténation , ne supprime pas ce phénotype .
1	Cependant	cependant	ADV	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	ces	ce	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	structures	structure	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
5	ne	ne	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
6	sont	être	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
7	pas	pas	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	dues	devoir	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	un	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	défaut	défaut	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	décaténation	décaténation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	des	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	chromosomes-fils	chromosome-fils	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
17	car	car	COO	_	_	34	mark	_	_	_	_	_
18	une	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	surexpression	sur-	NOM	_	_	34	subj	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	TopoIV	TopoIV	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
24	autre	autre	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	enzyme	enzyme	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	possédant	posséder	VPR	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	une	un	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
28	grande	grand	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
29	activité	activité	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	décaténation	décaténation	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
33	ne	ne	ADV	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
34	supprime	supprimer	VRB	_	_	8	para	_	_	_	_	_
35	pas	pas	ADV	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	ce	ce	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	phénotype	phénotype	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
38	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-344
# text = En revanche , une délétion de recA résout le problème , ce qui confirme que les
1	En	en revanche	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	revanche	en revanche	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	une	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	délétion	délétion	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	recA	recA	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	résout	résoudre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	le	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	problème	problème	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
12	ce	ce	PRQ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
13	qui	qui	PRQ	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
14	confirme	confirmer	VRB	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	que	que?	PRQ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	les	le	_	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-345
# text = Topos de type I pourraient être impliquées dans des phénomènes de recombinaison , probablement au niveau des jonctions de Holliday , qui , en reliant deux molécules d'ADN indépendantes , pourraient générer des tensions lors de l'avancement du complexe de réplication .
1	Topos	topo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	type	type	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	I	I	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	être	être	VNF	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	impliquées	impliquer	VPP	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	dans	dans	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	des	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	phénomènes	phénomène	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
14	probablement	probablement	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	au	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	niveau	niveau	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	des	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	jonctions	jonction	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	Holliday	Holliday	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
22	qui	qui	PRQ	_	_	32	subj	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
24	en	en	PRE	_	_	32	periph	_	_	_	_	_
25	reliant	relier	VPR	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	deux	deux	NUM	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	molécules	molécule	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	d'	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	ADN	ADN	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	indépendantes	indépendant	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
32	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
33	générer	générer	VNF	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	des	un	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	tensions	tension	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	lors	lors de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
37	de	lors de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	l'	le	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	avancement	avancement	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	du	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	complexe	complexe	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	de	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	réplication	réplication	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-346
# text = L'activité de décaténation de la TopoIII permettrait de résoudre de tels problèmes .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	activité	activité	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	décaténation	décaténation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	TopoIII	TopoIII	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	permettrait	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	résoudre	résoudre	VNF	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
12	tels	tel	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	problèmes	problème	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-347
# text = Les Topos de type II
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	Topos	Topos	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	type	type	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	II	II	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-348
# text = Mécanisme d'action
1	Mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	action	action	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-349
# text = E . coli possède deux Topos de type IIA  :
1	E	e	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	coli	colis	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	possède	posséder	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	deux	deux	NUM	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	Topos	Topos	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	type	type	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	IIA	IIA	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	 :	:	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-350
# text = la TopoIV , codée par les gènes parC et parE , a une activité majoritaire de décaténation , mais aussi de relâchement des supertours négatifs comme positifs .
1	la	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	TopoIV	TopoIV	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	codée	coder	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	gènes	gène	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	parC	parC	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	parE	parE	NOM	_	_	7	para	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
12	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	une	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	activité	activité	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	majoritaire	majoritaire	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	décaténation	décaténation	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
19	mais	mais aussi	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
20	aussi	mais aussi	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	16	para	_	_	_	_	_
22	relâchement	relâchement	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	des	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	supertours	super-	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	négatifs	négatif	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	comme	comme	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	positifs	positif	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-351
# text = La gyrase , codée par les gènes gyrA et gyrB , est la seule Topo à introduire des supertours négatifs dans l'ADN , et peut aussi décaténer l'ADN .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	gyrase	gyrase	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	codée	coder	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	gènes	gène	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	gyrA	gyrA	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	gyrB	gyrB	ADJ	_	_	8	para	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
12	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	seule	seul	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	Topo	Topo	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	à	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	introduire	introduire	VNF	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	des	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	supertours	super-	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	négatifs	négatif	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	dans	dans	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
22	l'	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	ADN	ADN	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
26	peut	pouvoir	VRB	_	_	12	para	_	_	_	_	_
27	aussi	aussi	ADV	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	décaténer	décaféiner	VNF	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	l'	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	ADN	ADN	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-352
# text = Elles sont toutes deux hétérotétramériques de type A2B2 , contrairement aux Topos de type II eucaryotes , qui sont homodimériques ( Champoux , 2001 ) .
1	Elles	elles	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	toutes	tout	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	deux	deux	NUM	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	hétérotétramériques	hétérotétramériques	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	type	type	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	A2B2	A2B2	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	contrairement	contrairement	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
11	aux	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	Topos	Topos	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	type	type	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	II	II	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	eucaryotes	eucaryote	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
18	qui	qui	PRQ	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
19	sont	être	VRB	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
20	homodimériques	homodimériques	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	(	(	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	Champoux	Champoux	NOM	_	_	19	parenth	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	2001	2001	NUM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	)	)	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-353
# text = Les sous-unités GyrB et ParE sont similaires entre elles et contiennent le site de fixation de l'ATP et les domaines transducteur et toprim ( Figure 6 ) .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	sous-unités	sous-	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	GyrB	GyrB	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	ParE	ParE	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
6	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	similaires	similaire	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	entre	entre	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	elles	lui	PRQ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
11	contiennent	contenir	VRB	_	_	6	para	_	_	_	_	_
12	le	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	site	site	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	fixation	fixation	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	ATP	ATP	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
20	les	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	domaines	domaine	NOM	_	_	18	para	_	_	_	_	_
22	transducteur	transducteur	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	et	et	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
24	toprim	top	NOM	_	_	22	para	_	_	_	_	_
25	(	(	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	Figure	Figure	NOM	_	_	21	parenth	_	_	_	_	_
27	6	6	NUM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	)	)	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-354
# text = Les sous-unités GyrA et ParC sont elles aussi similaires et comprennent les éléments 5Y-CAP , dans lesquels se situe le résidu tyrosine catalytique .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	sous-unités	sous-	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	GyrA	GyrA	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	ParC	ParC	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
6	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	elles	elles	CLS	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
8	aussi	aussi	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	similaires	similaire	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
11	comprennent	comprendre	VRB	_	_	6	para	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	éléments	élément	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	5Y-CAP	5Y-CAP	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
16	dans	dans	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
17	lesquels	lequel	PRQ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	se	se	CLI	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	situe	situer	VRB	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
20	le	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	résidu	résidu	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
22	tyrosine	tyrosine	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	catalytique	catalytique	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-355
# text = GyrA et ParC forment aussi un élément appelé « porte C » , ou C-gate
1	GyrA	GyrA	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	et	et	COO	_	_	3	mark	_	_	_	_	_
3	ParC	ParC	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	forment	former	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	aussi	aussi	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	un	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	élément	élément	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	appelé	appeler	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	«	«	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	porte	porte	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	C	C	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	»	»	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
14	ou	ou	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	C-gate	C-gate	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-356
# text = ( Figure 6 ) , ainsi qu'un domaine globulaire à l'extrémité C-terminale spécifique aux Topos de type II bactériennes , qui se lie à la double hélice d'ADN fixée qui sera ensuite transférée ( Champoux , 2001 ; Corbett et Berger , 2004 ) .
1	(	(	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	6	6	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	)	)	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
6	ainsi	ainsi que	CSU	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	qu'	ainsi que	CSU	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	un	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	domaine	domaine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	globulaire	globulaire	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	extrémité	extrémité	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	C-terminale	C-terminale	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	spécifique	spécifique	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	aux	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	Topos	Topos	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	type	type	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	II	II	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	bactériennes	bactérien	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
23	qui	qui	PRQ	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
24	se	se	CLI	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	lie	lier	VRB	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
26	à	à	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
28	double	double	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
29	hélice	hélice	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
30	d'	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
31	ADN	ADN	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	fixée	fixer	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	qui	qui	PRQ	_	_	36	subj	_	_	_	_	_
34	sera	être	VRB	_	_	36	aux	_	_	_	_	_
35	ensuite	ensuite	ADV	_	_	36	periph	_	_	_	_	_
36	transférée	transférer	VPP	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
37	(	(	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
38	Champoux	Champoux	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
39	,	,	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
40	2001	2001	NUM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	;	;	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
42	Corbett	Corbett	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
43	et	et	COO	_	_	44	mark	_	_	_	_	_
44	Berger	Berger	NOM	_	_	42	para	_	_	_	_	_
45	,	,	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_
46	2004	2004	NUM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	)	)	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_
48	.	.	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-357
# text = Le mécanisme d'action de la gyrase est le suivant :
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	action	action	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	gyrase	gyrase	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	le	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	suivant	suivant	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	:	:	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-358
# text = l'ADN qui sera clivé ( double hélice G pour Gate ) vient d'abord se fixer aux éléments catalytiques toprim et 5Y-CAP ( Figure 6 et 7.1 ) .
1	l'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	ADN	ADN	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
3	qui	qui	PRQ	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
4	sera	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	clivé	cliver	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	(	(	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
7	double	double	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	hélice	hélice	NOM	_	_	2	parenth	_	_	_	_	_
9	G	G	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	pour	pour	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	Gate	Gate	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	)	)	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
13	vient	venir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	d'	d'abord	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	abord	d'abord	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	se	se	CLI	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	fixer	fixer	VNF	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
18	aux	à	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	éléments	élément	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	catalytiques	catalytique	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	toprim	top	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	5Y-CAP	5Y-CAP	NUM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	(	(	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	Figure	Figure	NOM	_	_	21	parenth	_	_	_	_	_
26	6	6	NUM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
28	7.1	7.1	NUM	_	_	25	para	_	_	_	_	_
29	)	)	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
30	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-359
# text = L'enroulement d'environ 140 pb d'ADN autour des domaines
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	enroulement	enroulement	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	environ	environ	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
5	140	140	NUM	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	pb	problème	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ADN	ADN	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	autour	autour de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
10	des	autour de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	domaines	domaine	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-360
# text = C-terminaux ( CTD ) des deux sous-unités GyrA ( Figure
1	C-terminaux	C-terminaux	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	(	(	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	CTD	CTD	NOM	_	_	1	parenth	_	_	_	_	_
4	)	)	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	deux	deux	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	sous-unités	sous-	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	GyrA	GyrA	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	(	(	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
10	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-361
# text = 7
1	7	7	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-362
# text = . 2   ;
1	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
2	2	2	NUM	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	 	2  	PRQ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	;	;	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-363
# text = suivi d'un changement de conformation au niveau des domaines GHKL et transducteurs , formant le domaine ATPase , permet de capturer une seconde double hélice
1	suivi	suivi	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
2	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	un	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	changement	changement	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	conformation	conformation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	au	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	niveau	niveau	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	des	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	domaines	domaine	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	GHKL	GHKL	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	transducteurs	transducteur	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
15	formant	former	VPR	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
16	le	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	domaine	domaine	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	ATPase	ATPase	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
20	permet	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	capturer	capturer	VNF	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	une	un	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
24	seconde	second	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
25	double	double	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	hélice	hélice	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-364
# text = ( T pour Transfer ) dans une configuration de supertour positif ( Figure 7
1	(	(	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
2	T	T	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	pour	pour	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	Transfer	Transfer	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	)	)	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	dans	dans	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	une	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	configuration	configuration	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	supertour	super-	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	positif	positif	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	(	(	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
13	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	7	7	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-365
# text = . 2 , vue de dessus et Figure
1	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
2	2	2	NUM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	vue	voir	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	dessus	dessus	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	Figure	Figure	NOM	_	_	6	para	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-366
# text = 7
1	7	7	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-367
# text = .
1	.	.	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-368
# text = 3 ) .
1	3	3	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-369
# text = Ceci nécessite deux molécules d'ATP et entraîne la coupure de l'hélice G à travers laquelle est alors transférée l'hélice T ( Figure 7
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	nécessite	nécessiter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	deux	deux	NUM	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	molécules	molécule	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	d'	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ATP	ATP	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	entraîne	entraîner	VRB	_	_	2	para	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	coupure	coupure	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	hélice	hélice	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	G	G	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	à	à travers	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	travers	à travers	PRE	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
17	laquelle	lequel	PRQ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	est	être	VRB	_	_	20	aux	_	_	_	_	_
19	alors	alors	ADV	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	transférée	transférer	VPP	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
21	l'	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	hélice	hélice	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
23	T	T	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	(	(	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
25	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	7	7	NUM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-370
# text = .
1	.	.	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-371
# text = 4 ) .
1	4	4	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-372
# text = Ce transfert a pour effet d'inverser la configuration de supertour positif , et crée ainsi deux supertours négatifs .
1	Ce	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	transfert	transfert	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	pour	pour	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	effet	effet	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	d'	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	inverser	inverser	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	configuration	configuration	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	supertour	super-	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	positif	positif	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	crée	créer	VRB	_	_	3	para	_	_	_	_	_
16	ainsi	ainsi	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	deux	deux	NUM	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	supertours	super-	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	négatifs	négatif	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-373
# text = Cette inversion est permise par un autre changement de configuration , un abaissement d'un des domaines CTD des sous-unités
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	inversion	inversion	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	permise	permettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	un	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
7	autre	autre	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	changement	changement	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	configuration	configuration	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
12	un	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	abaissement	abaissement	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
14	d'	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	un	un	PRQ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	domaines	domaine	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	CTD	CTD	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	des	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	sous-unités	sous-	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-374
# text = GyrA qui sont reliés aux domaines N-terminaux par une région flexible ( Figure 8 ; Schoeffler et Berger , 2005 ) .
1	GyrA	GyrA	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	qui	qui	PRQ	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	reliés	relier	VPP	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	aux	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	domaines	domaine	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	N-terminaux	N-terminaux	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	une	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	région	région	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	flexible	flexible	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	(	(	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
13	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	8	8	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	;	;	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Schoeffler	Schoeffler	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	Berger	Berger	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	2005	2005	NUM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	)	)	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-375
# text = L'hélice
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	hélice	hélice	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-376
# text = G est ensuite religaturée puis la double hélice T est probablement libérée par l'ouverture des portes C ( Figure 7
1	G	gramme	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	ensuite	ensuite	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	religaturée	re-	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	puis	puis	COO	_	_	12	mark	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
7	double	double	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	hélice	hélice	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
9	T	T	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	est	être	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
11	probablement	probablement	ADV	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
12	libérée	libérer	VPP	_	_	2	para	_	_	_	_	_
13	par	par	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	ouverture	ouverture	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	portes	porte	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	C	C	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	(	(	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
20	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	7	7	NUM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-377
# text = .
1	.	.	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-378
# text = 5 ) .
1	5	5	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-379
# text = Si les doubles hélices G et T font partie de la même molécule d'ADN , le niveau de superhélicité Lk de celle  -ci sera modifié par incréments de 2 .
1	Si	si	CSU	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
2	les	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	doubles	double	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	hélices	hélice	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
5	G	G	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	7	mark	_	_	_	_	_
7	T	T	NOM	_	_	5	para	_	_	_	_	_
8	font	faire	VRB	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	partie	partie	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
12	même	même	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	molécule	molécule	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	d'	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	ADN	ADN	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
17	le	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	niveau	niveau	NOM	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	Lk	Lk	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	celle	celui	PRQ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	 -ci	 -ci	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	sera	être	VRB	_	_	26	aux	_	_	_	_	_
26	modifié	modifier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
27	par	par	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	incréments	incrément	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	2	2	NUM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-380
# text = En revanche , si les deux doubles hélices correspondent à deux molécules d'ADN différentes , l'activité ainsi générée sera une caténation ou une décaténation .
1	En	en revanche	PRE	_	_	21	periph	_	_	_	_	_
2	revanche	en revanche	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	si	si	CSU	_	_	21	periph	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
6	deux	deux	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
7	doubles	double	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	hélices	hélice	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
9	correspondent	correspondre	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	deux	deux	NUM	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	molécules	molécule	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	d'	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	ADN	ADN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	différentes	différent	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	activité	activité	NOM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
19	ainsi	ainsi	ADV	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	générée	générer	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	sera	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	une	un	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	caténation	caténation	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	ou	ou	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
25	une	un	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	décaténation	décaténation	NOM	_	_	23	para	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-381
# text = Le mécanisme d'action de la TopoIV , qui , contrairement à la gyrase , relâche l'ADN , est similaire à celui de la gyrase à deux exceptions près .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	action	action	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	TopoIV	TopoIV	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
9	qui	qui	PRQ	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
11	contrairement	contrairement	ADV	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
12	à	à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	gyrase	gyrase	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
16	relâche	relâcher	VRB	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	ADN	ADN	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
20	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	similaire	similaire	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	à	à	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	celui	celui	PRQ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	gyrase	gyrase	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	à	à	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	deux	deux	NUM	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	exceptions	exception	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	près	près	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-382
# text = Tout d'abord , il n'y a pas d'enroulement de l'ADN , qui est dû , pour la gyrase , à la présence au niveau du CTD de GyrA d'une « boîte GyrA » de 7 acides aminés , absente chez la TopoIV ( Figure 7
1	Tout	tout d'abord	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	d'	tout d'abord	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	abord	tout d'abord	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	il	il	CLS	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
6	n'	ne	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
7	y	le	CLI	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	pas	pas	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	d'	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	enroulement	enroulement	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	ADN	ADN	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	49	punc	_	_	_	_	_
16	qui	qui	PRQ	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
17	est	être	VRB	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
18	dû	devoir	VPP	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	49	punc	_	_	_	_	_
20	pour	pour	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	gyrase	gyrase	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	49	punc	_	_	_	_	_
24	à	à	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	présence	présence	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	au	à	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	niveau	niveau	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	du	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	CTD	CTD	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	GyrA	GyrA	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	d'	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
34	une	un	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
35	«	«	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
36	boîte	boîte	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
37	GyrA	GyrA	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	»	»	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
39	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
40	7	7	NUM	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	acides	acide	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	aminés	aminé	ADJ	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	,	,	PUNC	_	_	49	punc	_	_	_	_	_
44	absente	absent	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
45	chez	chez	PRE	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	la	le	DET	_	_	47	spe	_	_	_	_	_
47	TopoIV	TopoIV	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
48	(	(	PUNC	_	_	47	punc	_	_	_	_	_
49	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
50	7	7	NUM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-383
# text = . 2   ;
1	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
2	2	2	NUM	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	 	2  	PRQ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	;	;	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-384
# text = Kramlinger et Hiasa , 2006 ) .
1	Kramlinger	Kramlinger	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	et	et	COO	_	_	3	mark	_	_	_	_	_
3	Hiasa	Hiasa	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
5	2006	2006	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-385
# text = Deuxièmement , la flexibilité du CTD est propre à GyrA et permet l'ajout de supertours négatifs à l'ADN après abaissement d'un des deux domaines ( Figure 8
1	Deuxièmement	deuxièmement	NUM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	flexibilité	flexibilité	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
5	du	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	CTD	CTD	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	propre	propre	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	GyrA	GyrA	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	12	mark	_	_	_	_	_
12	permet	permettre	VRB	_	_	7	para	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	ajout	ajout	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	supertours	super-	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	négatifs	négatif	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	à	à	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	ADN	ADN	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	après	après	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
22	abaissement	abaissement	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	d'	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	un	un	PRQ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	des	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	deux	deux	NUM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
27	domaines	domaine	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	(	(	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
29	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
30	8	8	NUM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-386
# text = B ) .
1	B	b	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-387
# text = La TopoIV , ne possédant ni cette activité d'enroulement ni la possibilité d'abaissement des CTD de ParC , ne peut introduire de supertours négatifs à l'ADN .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	TopoIV	TopoIV	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	ne	ne	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	possédant	posséder	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	ni	ni	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
7	cette	ce	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	activité	activité	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	enroulement	enroulement	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	ni	ni	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	possibilité	possibilité	NOM	_	_	8	para	_	_	_	_	_
14	d'	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	abaissement	abaissement	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	CTD	CTD	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
19	ParC	ParC	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
21	ne	ne	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	peut	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	introduire	introduire	VNF	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	de	un	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	supertours	super-	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	négatifs	négatif	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	à	à	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	l'	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	ADN	ADN	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	.	.	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-388
# text = Fonctions cellulaires
1	Fonctions	fonction	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	cellulaires	cellulaire	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-389
# text = La gyrase
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	gyrase	gyrase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-390
# text = La gyrase étant la seule enzyme capable d'introduire des supertours négatifs dans l'ADN , sa fonction est essentielle .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	gyrase	gyrase	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
3	étant	être	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	seule	seul	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	enzyme	enzyme	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	capable	capable	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	d'	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	introduire	introduire	VNF	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	des	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	supertours	super-	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	négatifs	négatif	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	dans	dans	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	ADN	ADN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
17	sa	son	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	fonction	fonction	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
19	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	essentielle	essentiel	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-391
# text = Elle est nécessaire à l'initiation de la réplication de l'ADN et de la transcription , car l'augmentation de superhélicité négative permet d'abaisser la quantité d'énergie requise pour l'ouverture de la double hélice .
1	Elle	elle	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	nécessaire	nécessaire	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	à	à	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	initiation	initiation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	réplication	réplication	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	ADN	ADN	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	10	para	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	transcription	transcription	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
18	car	car	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	augmentation	augmentation	NOM	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	négative	négatif	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	permet	permettre	VRB	_	_	2	para	_	_	_	_	_
25	d'	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	abaisser	abaisser	VNF	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	quantité	quantité	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	d'	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	énergie	énergie	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	requise	requérir	VPP	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	pour	pour	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	l'	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	ouverture	ouverture	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	la	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
37	double	double	ADJ	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
38	hélice	hélice	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-392
# text = De plus , elle convertit en supertours négatifs les supertours positifs qui sont générés en amont des complexes de réplication et de transcription ( Liu et Wang , 1987 ) , ce qui est essentiel à la progression de la fourche de réplication et de l'ARN polymérase .
1	De	de plus	PRE	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	elle	elle	CLS	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	convertit	convertir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	supertours	super-	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	négatifs	négatif	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	les	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	supertours	super-	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	positifs	positif	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	qui	qui	PRQ	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
13	sont	être	VRB	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	générés	générer	VPP	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	en	en amont de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	amont	en amont de	DET	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	des	en amont de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	complexes	complexe	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	réplication	réplication	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	19	para	_	_	_	_	_
23	transcription	transcription	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	(	(	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	Liu	Liu	NOM	_	_	18	parenth	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
27	Wang	Wang	NOM	_	_	25	para	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
29	1987	1987	NUM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	)	)	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
32	ce	ce	PRQ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
33	qui	qui	PRQ	_	_	34	subj	_	_	_	_	_
34	est	être	VRB	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	essentiel	essentiel	ADJ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	à	à	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	la	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	progression	progression	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	de	de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	la	le	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	fourche	fourche	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	de	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	réplication	réplication	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	et	et	COO	_	_	45	mark	_	_	_	_	_
45	de	de	PRE	_	_	42	para	_	_	_	_	_
46	l'	le	DET	_	_	48	spe	_	_	_	_	_
47	ARN	ARN	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
48	polymérase	polymérase	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
49	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-393
# text = La gyrase est donc une enzyme essentielle et les mutations dans les gènes gyrAB sont conditionnelles et létales , l'incubation à la température restrictive provoquant un arrêt de la réplication de l'ADN , et donc la mort cellulaire ( Kreuzer et Cozzarelli , 1979 ) .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	gyrase	gyrase	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	donc	donc	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	enzyme	enzyme	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	essentielle	essentiel	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
9	les	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	mutations	mutation	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
11	dans	dans	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	gènes	gène	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	gyrAB	gyrAB	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	sont	être	VRB	_	_	3	para	_	_	_	_	_
16	conditionnelles	conditionnel	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	létales	létal	ADJ	_	_	16	para	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	incubation	incubation	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
22	à	à	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	température	température	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	restrictive	restrictif	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	provoquant	provoquer	VPR	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	un	un	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	arrêt	arrêt	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	la	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	réplication	réplication	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	l'	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	ADN	ADN	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	,	,	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
36	et	et	COO	_	_	39	mark	_	_	_	_	_
37	donc	donc	ADV	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	la	le	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	mort	mort	NOM	_	_	31	para	_	_	_	_	_
40	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	(	(	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
42	Kreuzer	Kreuzer	NOM	_	_	39	parenth	_	_	_	_	_
43	et	et	COO	_	_	44	mark	_	_	_	_	_
44	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	42	para	_	_	_	_	_
45	,	,	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_
46	1979	1979	NUM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	)	)	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
48	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-394
# text = Certains de ces mutants entraînent une augmentation de la recombinaison illégitime , ce qui implique la gyrase dans les phénomènes de recombinaison .
1	Certains	certains	PRQ	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	ces	ce	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	mutants	mutant	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	entraînent	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	augmentation	augmentation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	illégitime	illégitime	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	ce	ce	PRQ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
14	qui	qui	PRQ	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
15	implique	impliquer	VRB	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	gyrase	gyrase	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	dans	dans	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	les	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	phénomènes	phénomène	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-395
# text = Le modèle d'échange de sous-unités de gyrase a été proposé , selon lequel la gyrase se fixe et clive l'ADN , avec chaque sous-unité GyrB liée de façon covalente à l'extrémité 5 'de l'ADN . Un échange de sous-unités entre plusieurs molécules de gyrase fixées à des sites différents de l'ADN aboutirait à un échange de brins d'ADN et donc à un événement de recombinaison . Des sites de reconnaissance de la gyrase sont présents sur les chromosomes bactériens , sur les plasmides ou l'ADN des bactériophages . Dans le cas de l'ADN du bactériophage Mu , des sites
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	modèle	modèle	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	échange	échange	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	sous-unités	sous-	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	gyrase	gyrase	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	a	avoir	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	été	être	VPP	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	proposé	proposer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
13	selon	selon	PRE	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
14	lequel	lequel	PRQ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	gyrase	gyrase	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
17	se	se	CLI	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	fixe	fixer	VRB	_	_	11	para	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
20	clive	cliver	VRB	_	_	18	para	_	_	_	_	_
21	l'	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	ADN	ADN	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	58	punc	_	_	_	_	_
24	avec	avec	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
25	chaque	chaque	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	sous-unité	sous-	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	GyrB	GyrB	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	liée	lier	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
30	façon	façon	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	covalente	co-	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
32	à	à	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
33	l'	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	extrémité	extrémité	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	5	5	NUM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	'	'	PUNC	_	_	58	punc	_	_	_	_	_
37	de	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
38	l'	le	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	ADN	ADN	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
41	Un	Un	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	échange	échange	NOM	_	_	58	subj	_	_	_	_	_
43	de	de	PRE	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	sous-unités	sous-	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	entre	entre	PRE	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	47	spe	_	_	_	_	_
47	molécules	molécule	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
48	de	de	PRE	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	gyrase	gyrase	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	fixées	fixer	VPP	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
51	à	à	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	des	un	DET	_	_	53	spe	_	_	_	_	_
53	sites	site	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
54	différents	différent	ADJ	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	de	de	PRE	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
56	l'	le	DET	_	_	57	spe	_	_	_	_	_
57	ADN	ADN	NOM	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
58	aboutirait	aboutir	VRB	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
59	à	à	PRE	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
60	un	un	DET	_	_	61	spe	_	_	_	_	_
61	échange	échange	NOM	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
62	de	de	PRE	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
63	brins	brin	NOM	_	_	62	dep	_	_	_	_	_
64	d'	de	PRE	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
65	ADN	ADN	NOM	_	_	64	dep	_	_	_	_	_
66	et	et	COO	_	_	68	mark	_	_	_	_	_
67	donc	donc	ADV	_	_	66	dep	_	_	_	_	_
68	à	à	PRE	_	_	64	para	_	_	_	_	_
69	un	un	DET	_	_	70	spe	_	_	_	_	_
70	événement	événement	NOM	_	_	68	dep	_	_	_	_	_
71	de	de	PRE	_	_	70	dep	_	_	_	_	_
72	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	71	dep	_	_	_	_	_
73	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
74	Des	Des	DET	_	_	75	spe	_	_	_	_	_
75	sites	site	NOM	_	_	81	subj	_	_	_	_	_
76	de	de	PRE	_	_	75	dep	_	_	_	_	_
77	reconnaissance	reconnaissance	NOM	_	_	76	dep	_	_	_	_	_
78	de	de	PRE	_	_	77	dep	_	_	_	_	_
79	la	le	DET	_	_	80	spe	_	_	_	_	_
80	gyrase	gyrase	NOM	_	_	78	dep	_	_	_	_	_
81	sont	être	VRB	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
82	présents	présent	ADJ	_	_	81	dep	_	_	_	_	_
83	sur	sur	PRE	_	_	82	dep	_	_	_	_	_
84	les	le	DET	_	_	85	spe	_	_	_	_	_
85	chromosomes	chromosome	NOM	_	_	83	dep	_	_	_	_	_
86	bactériens	bactérien	ADJ	_	_	85	dep	_	_	_	_	_
87	,	,	PUNC	_	_	97	punc	_	_	_	_	_
88	sur	sur	PRE	_	_	81	dep	_	_	_	_	_
89	les	le	DET	_	_	90	spe	_	_	_	_	_
90	plasmides	plasmode	NOM	_	_	88	dep	_	_	_	_	_
91	ou	ou	COO	_	_	93	mark	_	_	_	_	_
92	l'	le	DET	_	_	93	spe	_	_	_	_	_
93	ADN	ADN	NOM	_	_	90	para	_	_	_	_	_
94	des	de	PRE	_	_	93	dep	_	_	_	_	_
95	bactériophages	bactériophage	NOM	_	_	94	dep	_	_	_	_	_
96	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
97	Dans	Dans	PRE	_	_	81	dep	_	_	_	_	_
98	le	le	DET	_	_	99	spe	_	_	_	_	_
99	cas	cas	NOM	_	_	97	dep	_	_	_	_	_
100	de	de	PRE	_	_	99	dep	_	_	_	_	_
101	l'	le	DET	_	_	102	spe	_	_	_	_	_
102	ADN	ADN	NOM	_	_	100	dep	_	_	_	_	_
103	du	de	PRE	_	_	102	dep	_	_	_	_	_
104	bactériophage	bactériophage	NOM	_	_	103	dep	_	_	_	_	_
105	Mu	Mu	NOM	_	_	104	dep	_	_	_	_	_
106	,	,	PUNC	_	_	108	punc	_	_	_	_	_
107	des	un	DET	_	_	108	spe	_	_	_	_	_
108	sites	site	NOM	_	_	104	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-396
# text = SGS ( Strong Gyrase Site ) sont présents , et la fixation de la gyrase sur ces sites permet l'alignement des extrémités de Mu , et donc sa transposition ( Sokolsky et Baker , 2003 ) .
1	SGS	sgs ( strong gyrase site )	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
2	(	sgs ( strong gyrase site )	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
3	Strong	Strong	NOM	_	_	1	parenth	_	_	_	_	_
4	Gyrase	Gyrase	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
5	Site	Site	NOM	_	_	4	para	_	_	_	_	_
6	)	sgs ( strong gyrase site )	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
7	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	présents	présent	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	fixation	fixation	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	gyrase	gyrase	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	sur	sur	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	ces	ce	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	sites	site	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	permet	permettre	VRB	_	_	7	para	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	alignement	alignement	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	des	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	extrémités	extrémité	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	Mu	Mu	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
27	et	et	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
28	donc	donc	ADV	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	sa	son	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	transposition	transposition	NOM	_	_	25	para	_	_	_	_	_
31	(	(	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
32	Sokolsky	Sokolsky	NOM	_	_	30	parenth	_	_	_	_	_
33	et	et	COO	_	_	34	mark	_	_	_	_	_
34	Baker	Baker	NOM	_	_	32	para	_	_	_	_	_
35	,	,	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
36	2003	2003	NUM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	)	)	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
38	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-397
# text = La topoisomérase IV
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	topoisomérase	topoisomérase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	IV	IV	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-398
# text = La TopoIV est principalement responsable de la décaténation de l'ADN , notamment au cours de la réplication ( Hiasa et Marians , 1996 ) , mais aussi lors des processus de recombinaison site-spécifique .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	TopoIV	TopoIV	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	principalement	principalement	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	responsable	responsable	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	décaténation	décaténation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	ADN	ADN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
13	notamment	notamment	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	au	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	cours	cours	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	réplication	réplication	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	(	(	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	Hiasa	Hiasa	NOM	_	_	18	parenth	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	Marians	Marians	NOM	_	_	20	para	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
24	1996	1996	NUM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	)	)	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
27	mais	mais aussi	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
28	aussi	mais aussi	ADV	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	lors	lors	ADV	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	des	de	PRE	_	_	16	para	_	_	_	_	_
31	processus	processus	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	site-spécifique	site	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-399
# text = Elle est également impliquée dans la ségrégation des chromosomes pendant la réplication .
1	Elle	elle	CLS	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
3	également	également	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	impliquée	impliquer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ségrégation	ségrégation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	des	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	chromosomes	chromosome	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	pendant	pendant	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	réplication	réplication	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-400
# text = La TopoIV joue aussi un rôle dans le contrôle du niveau global de superhélicité de l'ADN
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	TopoIV	TopoIV	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	joue	jouer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	aussi	aussi	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	un	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	rôle	rôle	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	dans	dans	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	contrôle	contrôle	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	du	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	niveau	niveau	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	global	global	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	ADN	ADN	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-401
# text = . Ce rôle a longtemps été occulté car les inhibiteurs ( coumarines et quinolones ) utilisés contre la gyrase inhibent aussi la TopoIV .
1	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
2	Ce	Ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	rôle	rôle	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
4	a	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
5	longtemps	longtemps	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
6	été	être	VPP	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	occulté	occulter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	car	car	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
9	les	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	inhibiteurs	inhibiteur	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
11	(	(	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	coumarines	cou	NOM	_	_	10	parenth	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	quinolones	quinoléine	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
15	)	)	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
16	utilisés	utiliser	VPP	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
17	contre	contre	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	gyrase	gyrase	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	inhibent	inhiber	VRB	_	_	7	para	_	_	_	_	_
21	aussi	aussi	ADV	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	TopoIV	TopoIV	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-402
# text = Zechiedrich et al. ( 2000 ) ont montré que l'absence simultanée des activités TopoI et TopoIV entraînait un niveau de superhélicité plus élevé que l'absence de la TopoI seulement .
1	Zechiedrich	Zechiedrich	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
2	et	et	COO	_	_	3	mark	_	_	_	_	_
3	al.	al.	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	(	(	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
5	2000	2000	NUM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
6	)	)	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
7	ont	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	montré	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	que	que	CSU	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	absence	absence	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
12	simultanée	simultané	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	des	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	activités	activité	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	TopoI	TopoI	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
17	TopoIV	TopoIV	NOM	_	_	15	para	_	_	_	_	_
18	entraînait	entraîner	VRB	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
19	un	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	niveau	niveau	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	plus	plus	ADV	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	élevé	élevé	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
25	que	que	CSU	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	l'	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	absence	absence	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	TopoI	TopoI	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	seulement	seulement	ADV	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-403
# text = De plus , bien que la TopoI ait une activité de relâchement plus importante que la TopoIV , seule cette dernière permet un relâchement complet d'une molécule plasmidique circulaire .
1	De	de plus	PRE	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	bien	bien que	CSU	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	que	bien que	CSU	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	TopoI	TopoI	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
8	ait	avoir	VRB	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	une	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	activité	activité	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	relâchement	relâchement	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	plus	plus	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	importante	important	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	que	que	CSU	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	TopoIV	TopoIV	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
19	seule	seul	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
20	cette	ce	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	dernière	dernier	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
22	permet	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	un	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	relâchement	relâchement	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	complet	complet	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	d'	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	une	un	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	molécule	molécule	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	plasmidique	plasmidique	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	circulaire	circulaire	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-404
# text = Comme dans le cas de la gyrase , des mutations dans les gènes parC et parE sont létales conditionnelles .
1	Comme	comme	PRE	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
2	dans	dans	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	le	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	cas	cas	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	gyrase	gyrase	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
9	des	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	mutations	mutation	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
11	dans	dans	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	gènes	gène	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	parC	parC	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	parE	parE	ADJ	_	_	14	para	_	_	_	_	_
17	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	létales	létal	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	conditionnelles	conditionnel	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-405
# text = Les cultures de ces mutants à la température restrictive résultent en l'absence de ségrégation des chromosomes qui s'accumulent donc au centre de cellules élonguées .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	cultures	culture	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ces	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	mutants	mutant	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	à	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	température	température	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	restrictive	restrictif	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	résultent	résulter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	en	en	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	absence	absence	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	ségrégation	ségrégation	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	chromosomes	chromosome	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	qui	qui	PRQ	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
19	s'	s'	CLI	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	accumulent	accumuler	VRB	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	donc	donc	ADV	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	au	au centre de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	centre	au centre de	NUM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	de	au centre de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	cellules	cellule	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	élonguées	élingué	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-406
# text = Les protéines de type histone
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéines	protéine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	type	type	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	histone	histone	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-407
# text = Mises à part les topoisomérases , des protéines de type histone , aussi appelées NAP
1	Mises	mettre	VPP	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
2	à	à part	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	part	à part	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	topoisomérases	topoisomérase	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	des	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	protéines	protéine	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	type	type	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	histone	histone	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
13	aussi	aussi	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	appelées	appeler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	NAP	NAP	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-408
# text = ( Protéines Associées au Nucléoïde ) ( Dorman et Deighan , 2003 ) , interviennent dans la structure et l'état de superenroulement du chromosome .
1	(	(	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
2	Protéines	Protéines	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
3	Associées	Associées	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	au	à	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	Nucléoïde	Nucléoïde	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	)	)	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
7	(	(	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
8	Dorman	Dorman	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	Deighan	Deighan	NOM	_	_	8	para	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
12	2003	2003	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	)	)	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
15	interviennent	intervenir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	dans	dans	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	structure	structure	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	état	état	NOM	_	_	18	para	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	superenroulement	super-	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	du	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	chromosome	chromosome	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-409
# text = Chez E. coli , il y en a
1	Chez	chez	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	E.	E.	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	coli	coli	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	il	il	CLS	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
6	y	le	CLI	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
7	en	le	CLI	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-410
# text = 5 majeures  :
1	5	5	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	majeures	majeur	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	 :	:	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-411
# text = Dps , Fis , H-NS , HU et IHF .
1	Dps	Dps	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	Fis	Fis	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
5	H-NS	H-NS	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	HU	HU	NOM	_	_	5	para	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	IHF	IHF	NOM	_	_	7	para	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-412
# text = Elles assurent la compaction et la condensation du chromosome en une structure appelée nucléoïde .
1	Elles	elles	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	assurent	assurer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	compaction	compaction	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	et	et	COO	_	_	7	mark	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	condensation	condensation	NOM	_	_	4	para	_	_	_	_	_
8	du	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	chromosome	chromosome	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	en	en	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	structure	structure	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	appelée	appeler	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	nucléoïde	nucléoïde	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-413
# text = Elles peuvent remplir différentes fonctions dans la cellule , mais leur point commun est de lier l'ADN et de modifier sa superhélicité de façon globale ou locale , en introduisant une topologie contrainte .
1	Elles	elles	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	remplir	remplir	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	différentes	différent	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	fonctions	fonction	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	dans	dans	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	cellule	cellule	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
10	mais	mais	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
11	leur	son	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	point	point	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
13	commun	commun	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	est	être	VRB	_	_	3	para	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	lier	lier	VNF	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	ADN	ADN	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	15	para	_	_	_	_	_
21	modifier	modifier	VNF	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	sa	son	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	façon	façon	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	globale	global	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	ou	ou	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
28	locale	local	ADJ	_	_	26	para	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
30	en	en	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
31	introduisant	introduire	VPR	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	une	un	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	topologie	topologie	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	contrainte	contraindre	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-414
# text = Certaines de ces protéines peuvent courber l'ADN , comme IHF , HU ou Fis , alors que d'autres établissent des ponts entre molécules d'ADN , comme H-NS ou Dps .
1	Certaines	certains	PRQ	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	ces	ce	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	protéines	protéine	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	courber	courber	VNF	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	ADN	ADN	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
10	comme	comme	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
11	IHF	IHF	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	HU	HU	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_
14	ou	ou	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	Fis	Fis	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
17	alors	alors que	CSU	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	que	alors que	CSU	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
19	d'	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	autres	autre	ADJ	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
21	établissent	établir	VRB	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	des	un	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	ponts	pont	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	entre	entre	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	molécules	molécule	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	d'	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	ADN	ADN	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	comme	comme	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
30	H-NS	H-NS	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	ou	ou	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
32	Dps	Dps	NOM	_	_	30	para	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-415
# text = Les profils de fixation à l'ADN ont été réalisés pour 3 protéines de type histone ( Fis , H-NS et IHF ) par immunoprécipitation de la chromatine associée à des puces à ADN .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	profils	profil	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	fixation	fixation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	à	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ADN	ADN	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	ont	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	été	être	VPP	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	réalisés	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	pour	pour	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	3	3	NUM	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	protéines	protéine	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	type	type	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	histone	histone	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	(	(	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	Fis	Fis	NOM	_	_	13	parenth	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	H-NS	H-NS	NOM	_	_	18	para	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	IHF	IHF	NOM	_	_	20	para	_	_	_	_	_
23	)	)	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
24	par	par	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
25	immunoprécipitation	immunoprécipitation	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	chromatine	chromatine	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	associée	associer	VPP	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	à	à	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	des	un	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	puces	puce	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	à	à	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	ADN	ADN	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-416
# text = Des centaines de sites de fixation ont été mis en évidence sur le génome d'E. coli .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	centaines	centaines	NUM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	sites	site	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	fixation	fixation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ont	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	été	être	VPP	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	mis	mettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	en	en	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	évidence	évidence	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	sur	sur	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	le	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	génome	génome	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	d'	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	E.	E.	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	coli	coli	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-417
# text = Environ la moitié de ces sites sont localisés dans des régions intergéniques , qui représentent moins de 10 % du génome d'E. coli , ce qui pourrait indiquer une préférence pour ces régions , et donc un rôle de ces protéines dans l'organisation générale du chromosome ( voir paragraphe II.A. 4 ) .
1	Environ	environ	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	la	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	moitié	moitié	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ces	ce	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	sites	site	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	sont	être	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	localisés	localiser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	des	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	régions	région	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	intergéniques	intergénique	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
14	qui	qui	PRQ	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
15	représentent	représenter	VRB	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
16	moins	moins	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	10	10	NUM	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	%	pourcent	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	du	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	génome	génome	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	d'	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	E.	E.	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	coli	coli	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
26	ce	ce	PRQ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
27	qui	qui	PRQ	_	_	28	subj	_	_	_	_	_
28	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	indiquer	indiquer	VNF	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	une	un	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	préférence	préférence	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	pour	pour	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
33	ces	ce	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	régions	région	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	,	,	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
36	et	et donc	COO	_	_	37	mark	_	_	_	_	_
37	donc	et donc	COO	_	_	39	mark	_	_	_	_	_
38	un	un	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	rôle	rôle	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_
40	de	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	ces	ce	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	protéines	protéine	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	dans	dans	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
44	l'	le	DET	_	_	45	spe	_	_	_	_	_
45	organisation	organisation	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	générale	général	ADJ	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	du	de	PRE	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
48	chromosome	chromosome	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	(	(	PUNC	_	_	50	punc	_	_	_	_	_
50	voir	voir	VNF	_	_	8	parenth	_	_	_	_	_
51	paragraphe	paragraphe	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	II.A.	II.A.	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	4	4	NUM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
54	)	)	PUNC	_	_	50	punc	_	_	_	_	_
55	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-418
# text = Une préférence de fixation pour les régions riches en AT , qui peuvent présenter une courbure intrinsèque , a également été observée , ainsi qu'une association avec les régions promotrices .
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	préférence	préférence	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	fixation	fixation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	pour	pour	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	régions	région	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	riches	riche	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	en	en	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	AT	AT	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
12	qui	qui	PRQ	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
13	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	présenter	présenter	VNF	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	une	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	courbure	courbure	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	intrinsèque	intrinsèque	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
19	a	avoir	VRB	_	_	21	aux	_	_	_	_	_
20	également	également	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
21	été	être	VPP	_	_	22	aux	_	_	_	_	_
22	observée	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
24	ainsi	ainsi que	COO	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	qu'	ainsi que	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
26	une	un	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	association	association	NOM	_	_	22	para	_	_	_	_	_
28	avec	avec	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	les	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	régions	région	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	promotrices	promoteur	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-419
# text = De plus , des interactions ont été récemment mises en évidence entre certaines NAPs et des sous-unités de l'ARN polymérase et des ribosomes .
1	De	de plus	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	interactions	interaction	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
6	ont	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	été	être	VPP	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
8	récemment	récemment	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	mises	mettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	en	en	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	évidence	évidence	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	entre	entre	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	certaines	certain	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	NAPs	NAPs	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	des	de	PRE	_	_	12	para	_	_	_	_	_
17	sous-unités	sous-	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
20	ARN	ARN	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	polymérase	polymérase	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	des	de	PRE	_	_	18	para	_	_	_	_	_
24	ribosomes	ribosome	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-420
# text = Ainsi , en plus de leur rôle dans le contrôle de la superhélicité de l'ADN , certaines NAPs sont également connues pour être des régulateurs de la transcription d'un grand nombre de gènes ( Dorman et Deighan , 2003 ) .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	en	en plus de	PRE	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
4	plus	en plus de	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	en plus de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	leur	son	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	rôle	rôle	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	dans	dans	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	le	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	contrôle	contrôle	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	ADN	ADN	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
18	certaines	certain	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	NAPs	NAPs	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
20	sont	être	VRB	_	_	22	aux	_	_	_	_	_
21	également	également	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	connues	connaître	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	pour	pour	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	être	être	VNF	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	des	un	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	régulateurs	régulateur	NOM	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	transcription	transcription	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	d'	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	un	un	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
32	grand	grand	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
33	nombre	nombre	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	gènes	gène	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	(	(	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
37	Dorman	Dorman	NOM	_	_	35	parenth	_	_	_	_	_
38	et	et	COO	_	_	39	mark	_	_	_	_	_
39	Deighan	Deighan	NOM	_	_	37	para	_	_	_	_	_
40	,	,	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
41	2003	2003	NUM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	)	)	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
43	.	.	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-421
# text = Elles peuvent en outre affecter le superenroulement de l'ADN par la régulation des gènes de topoisomérases .
1	Elles	elles	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	en	en outre	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	outre	en outre	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	affecter	affecter	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	le	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	superenroulement	super-	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	ADN	ADN	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	régulation	régulation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	des	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	gènes	gène	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	topoisomérases	topoisomérase	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-422
# text = Comme nous le verrons au paragraphe III , un lien étroit existe donc entre le niveau de superhélicité du chromosome et la transcription globale des gènes .
1	Comme	comme	CSU	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	nous	nous	CLS	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	le	le	CLI	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	verrons	voir	VRB	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	au	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	paragraphe	paragraphe	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	III	III	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
9	un	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	lien	lien	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
11	étroit	étroit	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	existe	exister	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	donc	donc	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	entre	entre	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	le	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	niveau	niveau	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	du	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	chromosome	chromosome	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	transcription	transcription	NOM	_	_	20	para	_	_	_	_	_
24	globale	global	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	des	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	gènes	gène	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-423
# text = Enfin , les NAPs sont exprimées différentiellement au cours du cycle cellulaire .
1	Enfin	enfin	ADV	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	les	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	NAPs	NAPs	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	exprimées	exprimer	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	différentiellement	différentielle	N+V	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	au	au cours de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	cours	au cours de	DET	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	du	au cours de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	cycle	cycle	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-424
# text = De par leur rôle dans le contrôle de la superhélicité de l'ADN et sur la transcription , les NAPs vont entraîner une dynamique importante du nucléoïde bactérien et de l'expression globale des gènes .
1	De	de par	PRE	_	_	21	periph	_	_	_	_	_
2	par	de par	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	leur	son	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	rôle	rôle	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	le	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	contrôle	contrôle	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	ADN	ADN	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	sur	sur	PRE	_	_	11	para	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	transcription	transcription	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
19	les	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	NAPs	NAPs	NOM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
21	vont	aller	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	entraîner	entraîner	VNF	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	une	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	dynamique	dynamique	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	importante	important	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	du	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	nucléoïde	nucléoïde	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	bactérien	bactérien	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	et	et	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	26	para	_	_	_	_	_
31	l'	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	expression	expression	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	globale	global	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	des	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	gènes	gène	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-425
# text = Les propriétés et fonctions des 5 NAPs majeures sont décrites dans les paragraphes suivants .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	propriétés	propriété	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	4	mark	_	_	_	_	_
4	fonctions	fonction	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	5	5	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	NAPs	NAPs	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	majeures	majeur	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	sont	être	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	décrites	décrire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	dans	dans	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	paragraphes	paragraphe	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	suivants	suivant	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-426
# text = Les NAPs ne possédant aucune spécificité de fixation
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	NAPs	NAPs	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	ne	ne	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	possédant	posséder	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	aucune	aucun	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	spécificité	spécificité	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	fixation	fixation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-427
# text = H-NS ( Histone-like Nucleoid Structuring protein )
1	H-NS	heure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	(	(	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
3	Histone-like	Histone-like	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	Nucleoid	Nucleoid	NOM	_	_	1	parenth	_	_	_	_	_
5	Structuring	Structuring	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	protein	protein	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-428
# text = La protéine de type histone H-NS se fixe de manière non spécifique à l'ADN , bien qu'une préférence pour des séquences riches en AT présentant une courbure ait été suggérée .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéine	protéine	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	type	type	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	histone	histone	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	H-NS	H-NS	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	se	se	CLI	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	fixe	fixer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	manière	manière	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	non	non	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	spécifique	spécifique	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	ADN	ADN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
17	bien	bien que	CSU	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	qu'	bien que	CSU	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
19	une	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	préférence	préférence	NOM	_	_	32	subj	_	_	_	_	_
21	pour	pour	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	des	un	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	séquences	séquence	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	riches	riche	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	en	en	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	AT	AT	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	présentant	présenter	VPR	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
28	une	un	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	courbure	courbure	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	ait	avoir	VRB	_	_	31	aux	_	_	_	_	_
31	été	être	VPP	_	_	32	aux	_	_	_	_	_
32	suggérée	suggérer	VPP	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-429
# text = Après fixation , elle provoque la condensation de l'ADN chromosomique et contraint des supertours négatifs in vitro .
1	Après	après	PRE	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	fixation	fixation	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	elle	elle	CLS	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	provoque	provoquer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	condensation	condensation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	ADN	ADN	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	chromosomique	chromosomique	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	contraint	contraindre	VRB	_	_	5	para	_	_	_	_	_
14	des	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	supertours	super-	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	négatifs	négatif	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	in	in vitro	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	vitro	in vitro	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-430
# text = En effet , des mutants dépourvus de H-NS présentent une diminution de la superhélicité globale .
1	En	en effet	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	mutants	mutant	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
6	dépourvus	dépourvoir	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	H-NS	H-NS	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	présentent	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	une	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	diminution	diminution	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	globale	global	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-431
# text = La protéine H-NS est composée de deux domaines de fonctionnalités différentes , séparés par une partie flexible ( Figure 9 ) .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéine	protéine	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	H-NS	H-NS	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	est	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	composée	composer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	deux	deux	NUM	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	domaines	domaine	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	fonctionnalités	fonctionnalité	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	différentes	différent	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	séparés	séparer	VPP	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
14	par	par	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	une	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	partie	partie	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	flexible	flexible	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	(	(	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Figure	Figure	NOM	_	_	16	parenth	_	_	_	_	_
20	9	9	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	)	)	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-432
# text = Le domaine
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	domaine	domaine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-433
# text = C-terminal est impliqué dans la liaison à l'ADN , alors que le domaine N-terminal permet l'oligomérisation de la protéine ( Dame , 2005 ) .
1	C-terminal	C-terminal	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	impliqué	impliquer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	dans	dans	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	liaison	liaison	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	ADN	ADN	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
11	alors	alors que	CSU	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	que	alors que	CSU	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
13	le	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	domaine	domaine	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
15	N-terminal	N-terminal	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	permet	permettre	VRB	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	NOM	_	_	18	det	_	_	_	_	_
18	oligomérisation	le	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	protéine	protéine	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	(	(	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
23	Dame	Dame	NOM	_	_	21	parenth	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	2005	2005	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	)	)	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-434
# text = H-NS se fixerait à l'ADN sous forme de dimères , mais il a été montré que des oligomères pouvaient se former in vitro , qui pourraient servir de squelette pour compacter l'ADN ( Dorman , 2004 ) .
1	H-NS	heure	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	se	se	CLI	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	fixerait	fixer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	à	à	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	ADN	ADN	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	sous	sous	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	forme	forme	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	dimères	dimère	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
12	mais	mais	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
13	il	il	CLS	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
14	a	avoir	VRB	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
15	été	être	VPP	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	montré	montrer	VPP	_	_	3	para	_	_	_	_	_
17	que	que	CSU	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	des	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	oligomères	oligomères	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
20	pouvaient	pouvoir	VRB	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	se	se	CLI	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	former	former	VNF	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	in	in vitro	ADV	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	vitro	in vitro	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
26	qui	qui	PRQ	_	_	27	subj	_	_	_	_	_
27	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
28	servir	servir	VNF	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	squelette	squelette	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	pour	pour	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
32	compacter	compacter	VNF	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	l'	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	ADN	ADN	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	(	(	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
36	Dorman	Dorman	NOM	_	_	34	parenth	_	_	_	_	_
37	,	,	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
38	2004	2004	NUM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	)	)	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
40	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-435
# text = En effet , les dimères s'oligomériseraient après fixation à l'ADN , et une structure du type « fermeture éclair » pourrait se former , aboutissant à la condensation de l'ADN ( Figure 9 ) .
1	En	en	PRE	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
2	effet	effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	dimères	dimère	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	s'	s'	CLI	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	oligomériseraient	uwSe	VPR	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	après	après	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	fixation	fixation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	ADN	ADN	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
15	une	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	structure	structure	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
17	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
18	type	type	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	«	«	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
20	fermeture	fermeture	NOM	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
21	éclair	éclair	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	»	»	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
23	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	se	se	CLI	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	former	former	VNF	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
27	aboutissant	aboutir	VPR	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
28	à	à	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	condensation	condensation	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	l'	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	ADN	ADN	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	(	(	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_
35	Figure	Figure	NOM	_	_	30	parenth	_	_	_	_	_
36	9	9	NUM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	)	)	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_
38	.	.	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-436
# text = Ces propriétés de H-NS sont à l'origine d'une activité de répression de l'expression des gènes .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	propriétés	propriété	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	H-NS	H-NS	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	à	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	origine	origine	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	une	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	activité	activité	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	répression	répression	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	expression	expression	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	des	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	gènes	gène	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-437
# text = En effet , des études génétiques et moléculaires ont montré qu'H-NS était un régulateur global de l'expression des gènes , affectant environ 5 % des gènes d'E. coli , la plupart étant réprimés .
1	En	en effet	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	études	étude	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
6	génétiques	génétique	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	moléculaires	moléculaire	ADJ	_	_	6	para	_	_	_	_	_
9	ont	avoir	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	montré	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	qu'	que	CSU	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	H-NS	H-NS	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
13	était	être	VRB	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	un	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	régulateur	régulateur	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	global	global	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	expression	expression	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	des	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	gènes	gène	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
23	affectant	affecter	VPR	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
24	environ	environ	ADV	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
25	5	5	NUM	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	%	pourcent	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
27	des	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	gènes	gène	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	d'	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	E.	E.	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	coli	coli	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
33	la	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	plupart	plupart	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
35	étant	être	VPR	_	_	36	aux	_	_	_	_	_
36	réprimés	réprimer	VPP	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-438
# text = Le mécanisme de cette répression a été explicité dans le cas du promoteur P1 des opérons d'ARN ribosomiques ( Figure 10
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	cette	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	répression	répression	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	a	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	été	être	VPP	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	explicité	expliciter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	le	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	cas	cas	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	du	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	promoteur	promoteur	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	P1	P1	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	des	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	opérons	opéron	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	d'	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	ARN	ARN	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	ribosomiques	ribosomiques	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	(	(	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
21	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	10	10	NUM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-439
# text = ; Dame et al. , 2002 ) .
1	;	;	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	Dame	Dame	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	4	mark	_	_	_	_	_
4	al.	al.	ADV	_	_	2	para	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	2002	2002	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-440
# text = La caractéristique des promoteurs réprimés par
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	caractéristique	caractéristique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	réprimés	réprimer	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	par	par	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-441
# text = H-NS serait d'être flanqués de régions possédant un fort potentiel de courbure .
1	H-NS	heure	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	serait	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	être	être	VNF	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	flanqués	flanquer	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	régions	région	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	possédant	posséder	VPR	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	un	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
10	fort	fort	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	potentiel	potentiel	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	courbure	courbure	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-442
# text = La fixation de l'ARN polymérase sur ces promoteurs ( Figure
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fixation	fixation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	ARN	ARN	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	polymérase	polymérase	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	sur	sur	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	ces	ce	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	(	(	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
11	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-443
# text = 10 i ) entraînerait le rapprochement des régions flanquantes intrinsèquement courbées ( Figure 10 ii ) .
1	10	10	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	i	if	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	)	)	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	entraînerait	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	le	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	rapprochement	rapprochement	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	des	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	régions	région	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	flanquantes	flanquant	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	intrinsèquement	intrinsèquement	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	courbées	courber	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Figure	Figure	VRB	_	_	6	parenth	_	_	_	_	_
14	10	10	NUM	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	ii	if	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	)	)	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-444
# text = H-NS présentant une préférence de fixation sur les séquences d'ADN courbées , plusieurs dimères d'H-NS pourraient alors se fixer sur l'ADN , piégeant ainsi l'ARN polymérase ( Figure 10 iii ) .
1	H-NS	heure	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
2	présentant	présenter	VPR	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	une	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	préférence	préférence	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	fixation	fixation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	sur	sur	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	séquences	séquence	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	d'	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	ADN	ADN	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	courbées	courber	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
14	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	dimères	dimère	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
16	d'	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	H-NS	H-NS	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	alors	alors	ADV	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	se	se	CLI	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	fixer	fixer	VNF	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	sur	sur	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	l'	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	ADN	ADN	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	piégeant	piéger	VPR	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
27	ainsi	ainsi	ADV	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	l'	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
29	ARN	ARN	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	polymérase	polymérase	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
31	(	(	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
32	Figure	Figure	VRB	_	_	30	parenth	_	_	_	_	_
33	10	10	NUM	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	iii	if	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	)	)	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-445
# text = Ces complexes ne pourraient se séparer qu'après l'intervention d'activateurs de la transcription ou dans certaines conditions ( Figure 10 iv ) , comme une élévation de température ou d'osmolarité , qui sont par ailleurs connues pour modifier la superhélicité de l'ADN ( voir paragraphe IV.A ) .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	complexes	complexe	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	ne	ne	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	se	se	CLI	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	séparer	séparer	VNF	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	qu'	que	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	après	après	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	intervention	intervention	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	d'	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	activateurs	activateur	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	transcription	transcription	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	ou	ou	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
17	dans	dans	PRE	_	_	13	para	_	_	_	_	_
18	certaines	certain	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	conditions	condition	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	(	(	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	Figure	Figure	VRB	_	_	10	parenth	_	_	_	_	_
22	10	10	NUM	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	iv	ive	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	)	)	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	comme	comme	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
27	une	un	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	élévation	élévation	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	température	température	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	ou	ou	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
32	d'	de	ADV	_	_	29	para	_	_	_	_	_
33	osmolarité	de	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	,	,	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
35	qui	qui	PRQ	_	_	39	subj	_	_	_	_	_
36	sont	être	VRB	_	_	39	aux	_	_	_	_	_
37	par	par ailleurs	PRE	_	_	39	periph	_	_	_	_	_
38	ailleurs	par ailleurs	ADV	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	connues	connaître	VPP	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
40	pour	pour	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	modifier	modifier	VNF	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	la	le	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	de	de	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	l'	le	DET	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
46	ADN	ADN	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	(	(	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
48	voir	voir	VNF	_	_	39	parenth	_	_	_	_	_
49	paragraphe	paragraphe	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	IV.A	IV.A	NOM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	)	)	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
52	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-446
# text = Ainsi , le degré de superhélicité de l'ADN va affecter la transcription des gènes réprimés par H-NS , ce qui souligne encore le lien entre superhélicité de l'ADN , protéines de type histone et transcription globale des gènes .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	le	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	degré	degré	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	ADN	ADN	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	va	aller	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	affecter	affecter	VNF	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	transcription	transcription	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	des	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	gènes	gène	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	réprimés	réprimer	VPP	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	par	par	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	H-NS	H-NS	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
20	ce	ce	PRQ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	qui	qui	PRQ	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
22	souligne	souligner	VRB	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	encore	encore	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	le	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	lien	lien	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	entre	entre	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	l'	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	ADN	ADN	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
32	protéines	protéine	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	type	type	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
35	histone	histone	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	et	et	COO	_	_	37	mark	_	_	_	_	_
37	transcription	transcription	NOM	_	_	32	para	_	_	_	_	_
38	globale	global	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	des	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	gènes	gène	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-447
# text = Un certain nombre de gènes peuvent également être activés par H-NS .
1	Un	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	certain	certain	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	nombre	nombre	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	gènes	gène	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	également	également	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	être	être	VNF	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	activés	activer	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	par	par	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	H-NS	H-NS	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-448
# text = Il s'agit essentiellement des gènes régulés négativement par ( p ) ppGpp , qui est l'effecteur de la réponse stringente , permettant l'adaptation des bactéries aux périodes de carences nutritionnelles .
1	Il	il	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	s'	s'	CLI	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	agit	agir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	essentiellement	essentiellement	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	gènes	gène	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	régulés	réguler	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	négativement	négativement	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	par	par	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	(	(	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	p	p	ADJ	_	_	13	parenth	_	_	_	_	_
12	)	)	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
13	ppGpp	ppGpp	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
15	qui	qui	PRQ	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
16	est	être	VRB	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	effecteur	effecteur	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	réponse	réponse	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	stringente	astringent	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	permettant	permettre	VPR	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	l'	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	adaptation	adaptation	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	des	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	bactéries	bactérie	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	aux	à	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	périodes	période	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	carences	carence	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	nutritionnelles	nutritionnel	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-449
# text = Le mécanisme par lequel H-NS active ces gènes serait lié à sa capacité à augmenter le superenroulement de l'ADN .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	par	par	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	lequel	lequel	PRQ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	H-NS	H-NS	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	active	activer	VRB	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	ces	ce	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	gènes	gène	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	serait	être	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	lié	lier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	à	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	sa	son	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	capacité	capacité	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	augmenter	augmenter	VNF	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	le	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	superenroulement	super-	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	ADN	ADN	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-450
# text = Au cours de la croissance chez E. coli , la quantité de H-NS diminue , passant de 20 000 molécules en phase exponentielle à 8000 en phase stationnaire .
1	Au	au cours de	PRE	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
2	cours	au cours de	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	au cours de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	croissance	croissance	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	chez	chez	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	E.	E.	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	coli	coli	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	quantité	quantité	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	H-NS	H-NS	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	diminue	diminuer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	passant	passer	VPR	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	20	20	NUM	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	000	000	NUM	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	molécules	molécule	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	en	en	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
22	phase	phase	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	à	à	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	8000	8000	NUM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	en	en	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
27	phase	phase	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-451
# text = Son expression est fortement activée en cas de baisse de la température ( Free et Dorman , 1995 ) .
1	Son	son	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	expression	expression	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
4	fortement	fortement	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	activée	activer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	en	en cas de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	cas	en cas de	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	en cas de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	baisse	baisse	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	température	température	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	(	(	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	Free	Free	NOM	_	_	12	parenth	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	Dorman	Dorman	NOM	_	_	14	para	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	1995	1995	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	)	)	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-452
# text = Un paralogue de H-NS est également présent dans les bactéries gram-négatives .
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	paralogue	paralogue	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	H-NS	H-NS	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	également	également	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	présent	présent	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	dans	dans	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	les	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	bactéries	bactérie	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	gram-négatives	gram-négative	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-453
# text = Cette protéine , appelée StpA chez E. coli , présente 58 % d'identité de séquence avec H-NS .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	protéine	protéine	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	appelée	appelé	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	StpA	StpA	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	chez	chez	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	E.	E.	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	coli	coli	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
10	présente	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	58	58	NUM	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	%	pourcent	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	d'	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	identité	identité	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	séquence	séquence	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	avec	avec	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
18	H-NS	H-NS	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-454
# text = Elle partage certaines fonctions de régulation et de maintien de la superhélicité avec H-NS .
1	Elle	elle	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	partage	partager	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	certaines	certain	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	fonctions	fonction	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	régulation	régulation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	5	para	_	_	_	_	_
9	maintien	maintien	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	avec	avec	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	H-NS	H-NS	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-455
# text = Ces deux protéines peuvent former des hétérodimères in vivo , ce qui pourrait altérer leurs fonctions respectives ( Cusick et Belfort , 1998 ) .
1	Ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	deux	deux	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	protéines	protéine	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	former	former	VNF	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	des	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	hétérodimères	herero	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	in	in vivo	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	vivo	in vivo	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	ce	ce	PRQ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
12	qui	qui	PRQ	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
13	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	altérer	altérer	VNF	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	leurs	son	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	fonctions	fonction	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	respectives	respectif	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	(	(	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Cusick	Cusick	NOM	_	_	16	parenth	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
21	Belfort	Belfort	NOM	_	_	19	para	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
23	1998	1998	NUM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	)	)	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-456
# text = HU ( Histone-like protein from E. coli strain
1	HU	HU	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	(	(	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	Histone-like	Histone-like	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	protein	protein	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	from	frou	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	E.	E.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	coli	coli	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	strain	strain	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-457
# text = U93 )
1	U93	U93	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-458
# text = HU a été initialement isolée chez E. coli comme étant capable de former des structures de type nucléosome ( Rouviere-Yaniv et Gros , 1975 ) , sans reconnaître de séquence particulière de l'ADN .
1	HU	HU	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
2	a	avoir	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
4	initialement	initialement	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	isolée	isoler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	chez	chez	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	E.	E.	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	coli	coli	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	comme	comme	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	étant	étant	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	capable	capable	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	former	former	VNF	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	des	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	structures	structure	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	type	type	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	nucléosome	nucléé	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	(	(	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	Rouviere-Yaniv	Rouviere-Yaniv	NOM	_	_	15	parenth	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	Gros	Gros	NOM	_	_	20	para	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
24	1975	1975	NUM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	)	)	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
27	sans	sans	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
28	reconnaître	reconnaître	VNF	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	séquence	séquence	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	particulière	particulier	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	l'	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	ADN	ADN	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-459
# text = En revanche , HU semble se fixer préférentiellement sur l'ADN superenroulé négativement .
1	En	en	PRE	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	revanche	revanche	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	HU	HU	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	semble	sembler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	se	se	CLI	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	fixer	fixer	VNF	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	préférentiellement	préférentiellement	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	sur	sur	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	ADN	ADN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	superenroulé	super-	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	négativement	négativement	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-460
# text = L'étude des effets de HU sur la structure de l'ADN ont conduit à des résultats controversés .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	étude	étude	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	effets	effet	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	HU	HU	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	sur	sur	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	structure	structure	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	ADN	ADN	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	ont	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	conduit	conduit	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	des	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	résultats	résultat	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	controversés	controversé	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-461
# text = HU se lie à l'ADN et y induit une courbure d'environ 160 ° ( Figure 11
1	HU	HU	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	se	se	CLI	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	lie	lier	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	à	à	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	ADN	ADN	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
8	y	le	CLI	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	induit	induire	VRB	_	_	3	para	_	_	_	_	_
10	une	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	courbure	courbure	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	environ	environ	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
14	160	160	NUM	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	°	degré	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	(	(	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
17	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	11	11	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-462
# text = B ) , ce qui provoque la compaction de molécules d'ADN in vitro .
1	B	b	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	ce	ce	PRQ	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
5	qui	qui	PRQ	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	provoque	provoquer	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	compaction	compaction	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	molécules	molécule	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	d'	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	ADN	ADN	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	in	in vitro	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	vitro	in vitro	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-463
# text = De plus , HU est attirée par des structures spécifiques d'ADN , comme des jonctions en croix ou des coupures simple brin , ce type de liaison à l'ADN lui donnant un rôle dans les processus de recombinaison .
1	De	de plus	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	HU	HU	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	est	être	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	attirée	attirer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	par	par	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	des	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	structures	structure	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	spécifiques	spécifique	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	d'	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	ADN	ADN	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	comme	comme	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
15	des	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	jonctions	jonction	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	en	en	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	croix	croix	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	ou	ou	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
20	des	de	PRE	_	_	17	para	_	_	_	_	_
21	coupures	coupure	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	simple	simple	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	brin	brin	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
25	ce	ce	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	type	type	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	liaison	liaison	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	à	à	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	l'	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	ADN	ADN	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	lui	le	CLI	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
33	donnant	donner	VPR	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	un	un	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	rôle	rôle	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	dans	dans	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	les	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	processus	processus	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	de	de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-464
# text = In vivo , HU semble également compacter l'ADN , car des souches dépourvues de cette protéine sélectionnent des mutations secondaires dans gyrB qui augmentent la capacité de superenroulement de la gyrase .
1	In	in vivo	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	vivo	in vivo	ADV	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	HU	HU	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	semble	sembler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	également	également	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	compacter	compacter	VNF	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	ADN	ADN	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
11	car	car	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
12	des	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	souches	souche	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
14	dépourvues	dépourvu	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	cette	ce	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	protéine	protéine	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	sélectionnent	sélectionner	VRB	_	_	7	para	_	_	_	_	_
19	des	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	mutations	mutation	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	secondaires	secondaire	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	dans	dans	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	gyrB	gyrB	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	qui	qui	PRQ	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
25	augmentent	augmenter	VRB	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
26	la	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	capacité	capacité	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	superenroulement	super-	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	la	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	gyrase	gyrase	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-465
# text = Ceci a été interprété comme un phénomène de compensation pour pallier une perte de superhélicité engendrée par l'absence de HU .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	a	avoir	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	été	être	VPP	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	interprété	interpréter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	comme	comme	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	un	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	phénomène	phénomène	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	compensation	compensation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	pour	pour	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
11	pallier	pallier	VNF	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	une	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	perte	perte	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	engendrée	engendrer	VPP	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	par	par	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	absence	absence	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	HU	HU	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-466
# text = Cependant , à fortes concentrations , HU donne un aspect circulaire relâché à l'ADN ( Dame et Goosen , 2002 ) .
1	Cependant	cependant	ADV	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	à	à	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
4	fortes	fort	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	concentrations	concentration	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
7	HU	HU	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
8	donne	donner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	un	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	aspect	aspect	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	circulaire	circulaire	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	relâché	relâcher	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	ADN	ADN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	(	(	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
17	Dame	Dame	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	Goosen	Goosen	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	2002	2002	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	)	)	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-467
# text = HU pourrait alors avoir un effet sur le pas de l'hélice d'ADN , qui serait constitué de 10 , 9 pb par tour d'hélice au lieu de 10 , 5 pb .
1	HU	HU	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	alors	alors	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	avoir	avoir	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	un	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	effet	effet	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	sur	sur	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	pas	pas	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	hélice	hélice	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	d'	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	ADN	ADN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
16	qui	qui	PRQ	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
17	serait	être	VRB	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
18	constitué	constituer	VPP	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	10	10	NUM	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
21	,	10 , 9	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
22	9	9	NUM	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	pb	problème	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
24	par	par	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	tour	tour	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	d'	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	hélice	hélice	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	au	au lieu de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
29	lieu	au lieu de	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	de	au lieu de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	10	10	NUM	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
32	,	10 , 5	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
33	5	5	NUM	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	pb	problème	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-468
# text = Cet accroissement se ferait par la contrainte de supertours négatifs supplémentaires ( Dame et Goosen , 2002 ) et entraînerait une rigidification de la double hélice .
1	Cet	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	accroissement	accroissement	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	se	se	CLI	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	ferait	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	contrainte	contrainte	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	supertours	super-	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	négatifs	négatif	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	supplémentaires	supplémentaire	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	(	(	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
13	Dame	Dame	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	Goosen	Goosen	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
17	2002	2002	NUM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	)	)	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
20	entraînerait	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	une	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	rigidification	rigidification	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
25	double	double	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	hélice	hélice	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-469
# text = A plus basses concentrations , HU a un effet de courbure sur l'ADN , et l'aspect circulaire est alors moins rigide ( Figure 11
1	A	à	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	plus	plus	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	basses	bas	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	concentrations	concentration	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	HU	HU	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	un	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	effet	effet	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	courbure	courbure	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	sur	sur	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	ADN	ADN	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	aspect	aspect	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
19	circulaire	circulaire	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	est	être	VRB	_	_	7	para	_	_	_	_	_
21	alors	alors	ADV	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	moins	moins	ADV	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	rigide	rigide	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
24	(	(	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
25	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	11	11	NUM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-470
# text = B ;
1	B	B	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	;	;	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-471
# text = .
1	.	.	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-472
# text = En plus de son rôle structural , HU est impliquée dans l'expression des gènes .
1	En	en plus de	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	plus	en plus de	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	en plus de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	son	son	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	rôle	rôle	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	structural	structural	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
8	HU	HU	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
9	est	être	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	impliquée	impliquer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	dans	dans	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	expression	expression	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	des	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	gènes	gène	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-473
# text = De profonds changements de la transcription globale ont été détectés chez les mutants HU , ainsi que des modifications morphologiques des cellules mutantes .
1	De	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	profonds	profond	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	changements	changement	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	transcription	transcription	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	globale	global	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ont	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	été	être	VPP	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	détectés	détecter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	chez	chez	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	mutants	mutant	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	HU	HU	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
16	ainsi	ainsi que	COO	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	que	ainsi que	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
18	des	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	modifications	modification	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
20	morphologiques	morphologique	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	des	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	cellules	cellule	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	mutantes	mutant	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-474
# text = Par son rôle structural sur l'ADN , HU est par ailleurs connue pour assister certains régulateurs au niveau de leur promoteur .
1	Par	par	PRE	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	son	son	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	rôle	rôle	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	structural	structural	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	sur	sur	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ADN	ADN	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
9	HU	HU	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
10	est	être	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
11	par	par ailleurs	PRE	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
12	ailleurs	par ailleurs	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	connue	connaître	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	pour	pour	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	assister	assister	VNF	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	certains	certain	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	régulateurs	régulateur	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	au	à	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	niveau	niveau	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	leur	son	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	promoteur	promoteur	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-475
# text = Par exemple , HU permet l'interaction entre des dimères du répresseur GalR pour conduire à la répression des gènes gal ( Kar et Adhya , 2001 ) .
1	Par	par exemple	PRE	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	exemple	par exemple	ADV	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	HU	HU	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	permet	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	interaction	interaction	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	entre	entre	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	des	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	dimères	dimère	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	du	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	répresseur	répresseur	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	GalR	GalR	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	pour	pour	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
15	conduire	conduire	VNF	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	à	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	répression	répression	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	des	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	gènes	gène	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	gal	gal	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	(	(	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
23	Kar	Kar	NOM	_	_	20	parenth	_	_	_	_	_
24	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
25	Adhya	Adhya	NOM	_	_	23	para	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
27	2001	2001	NUM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	)	)	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-476
# text = La protéine HU est présente en quantités abondantes dans la cellule , de 30 000 à 55 000 molécules en phase exponentielle .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéine	protéine	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	HU	HU	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	est	être	VRB	_	_	19	det	_	_	_	_	_
5	présente	présent	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	quantités	quantité	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	abondantes	abondant	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	cellule	cellule	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	30	30	NUM	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	000	000	NUM	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
16	à	à	PRE	_	_	13	para	_	_	_	_	_
17	55	55	NUM	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	000	000	NUM	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	molécules	molécule	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	en	en	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	phase	phase	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-477
# text = Lors du passage en phase stationnaire , le nombre de molécules de HU diminue pour passer à moins de 20 000 molécules .
1	Lors	lors de	PRE	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
2	du	lors de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	passage	passage	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	en	en	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	phase	phase	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	nombre	nombre	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	molécules	molécule	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	HU	HU	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	diminue	diminuer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	pour	pour	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	passer	passer	VNF	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	à	à	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	moins	moins	ADV	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	20	20	NUM	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	000	000	NUM	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	molécules	molécule	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-478
# text = Chez la plupart des bactéries , HU est un homodimère , alors qu'elle existe sous forme d'hétérodimère chez E. coli .
1	Chez	chez	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	la	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	plupart	plupart	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	des	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	bactéries	bactérie	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	HU	HU	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
8	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	un	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	homodimère	homo-	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
12	alors	alors que	CSU	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	qu'	alors que	CSU	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
14	elle	elle	CLS	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
15	existe	exister	VRB	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	sous	sous	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	forme	forme	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	d'	de	ADV	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	hétérodimère	de	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	chez	chez	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
21	E.	E.	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	coli	coli	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-479
# text = Les deux sous-unités sont codées par les gènes hupA et hupB. Des formes homodimériques ont également été mises en évidence chez E. coli .
1	Les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	deux	deux	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	sous-unités	sous-	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
4	sont	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	codées	coder	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	gènes	gène	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	hupA	hupA	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
11	hupB.	hupB.	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
12	Des	Des	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	formes	forme	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	homodimériques	homodimériques	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	ont	avoir	VRB	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
16	également	également	ADV	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
17	été	être	VPP	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
18	mises	mettre	VPP	_	_	5	para	_	_	_	_	_
19	en	en	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	évidence	évidence	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	chez	chez	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	E.	E.	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	coli	coli	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-480
# text = Leur fonction n'est pas connue , mais pourrait influer sur les propriétés des dimères de HU .
1	Leur	son	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fonction	fonction	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	n'	ne	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
4	est	être	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
5	pas	pas	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	connue	connaître	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
8	mais	mais	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	6	para	_	_	_	_	_
10	influer	influer	VNF	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	sur	sur	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	propriétés	propriété	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	des	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	dimères	dimère	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	HU	HU	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-481
# text = Enfin , les deux NAPs HU et H-NS exercent des effets antagonistes dans la cellule ( Figure 12 ) .
1	Enfin	enfin	ADV	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	les	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	deux	deux	NUM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
5	NAPs	NAPs	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	HU	HU	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	H-NS	H-NS	NOM	_	_	6	para	_	_	_	_	_
9	exercent	exercer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	des	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	effets	effet	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	antagonistes	antagoniste	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	dans	dans	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	cellule	cellule	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	(	(	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
17	Figure	Figure	NOM	_	_	15	parenth	_	_	_	_	_
18	12	12	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	)	)	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-482
# text = Alors que H-NS compacte et condense l'ADN , HU lui donne une forme circulaire rigide .
1	Alors	alors	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	que	queComp?	PRQ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	H-NS	H-NS	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	compacte	compact	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	condense	condenser	VRB	_	_	12	mark	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	ADN	ADN	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
10	HU	HU	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
11	lui	le	CLI	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	donne	donner	VRB	_	_	2	para	_	_	_	_	_
13	une	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	forme	forme	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	circulaire	circulaire	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	rigide	rigide	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-483
# text = De plus , la capacité de H-NS à réprimer la transcription d'un certain nombre de gènes est accrue dans les mutants dépourvus de HU , cette dernière étant capable de lever la répression de ces gènes ( Dame et Goosen , 2002 ) .
1	De	de plus	PRE	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	capacité	capacité	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	H-NS	H-NS	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	réprimer	réprimer	VNF	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	transcription	transcription	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	un	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
14	certain	certain	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	nombre	nombre	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	gènes	gène	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	est	être	VRB	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
19	accrue	accroître	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	dans	dans	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	les	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	mutants	mutant	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	dépourvus	dépourvoir	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	HU	HU	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
27	cette	ce	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	dernière	dernier	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
29	étant	être	VPR	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	capable	capable	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	lever	lever	VNF	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	la	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	répression	répression	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	ces	ce	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	gènes	gène	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	(	(	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
39	Dame	Dame	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
40	et	et	COO	_	_	41	mark	_	_	_	_	_
41	Goosen	Goosen	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
42	,	,	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
43	2002	2002	NUM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	)	)	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
45	.	.	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-484
# text = Dps ( DNA-binding Protection from Starved cells )
1	Dps	Dps	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	(	(	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
3	DNA-binding	DNA-binding	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
4	Protection	Protection	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	from	from	NOM	_	_	1	parenth	_	_	_	_	_
6	Starved	Starved	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	cells	cell	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	)	)	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-485
# text = La protéine Dps se lie de façon non spécifique à l'ADN , et sa principale fonction est de le protéger pendant les périodes de stress , dont la phase stationnaire .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéine	protéine	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	Dps	Dps	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	se	se	CLI	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	lie	lier	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	façon	façon	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	non	non	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	spécifique	spécifique	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	ADN	ADN	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
15	sa	son	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
16	principale	principal	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	fonction	fonction	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
18	est	être	VRB	_	_	5	para	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	le	le	CLI	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	protéger	protéger	VNF	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	pendant	pendant	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	les	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	périodes	période	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	stress	stress	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
28	dont	dont	PRQ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	phase	phase	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
31	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-486
# text = Alors que seulement
1	Alors	alors	ADV	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	que	que	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	seulement	seulement	ADV	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-487
# text = 6000 molécules de Dps sont présentes chez E. coli en phase exponentielle , près de 200   000 molécules ont été dénombrées en phase stationnaire , ce qui en fait la protéine la plus abondante de la cellule .
1	6000	6000	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	molécules	molécule	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	Dps	Dps	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	présentes	présent	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	chez	chez	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	E.	E.	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	coli	coli	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	phase	phase	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
14	près	près	ADV	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	200	200	NUM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
17	 	200   000	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	000	000	NUM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	molécules	molécule	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	ont	avoir	VRB	_	_	21	aux	_	_	_	_	_
21	été	être	VPP	_	_	22	aux	_	_	_	_	_
22	dénombrées	dénombrer	VPP	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
23	en	en	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	phase	phase	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
27	ce	ce	PRQ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
28	qui	qui	PRQ	_	_	30	subj	_	_	_	_	_
29	en	le	CLI	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	fait	faire	VRB	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
31	la	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	protéine	protéine	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	la	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
34	plus	plus	ADV	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
35	abondante	abondant	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
36	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
37	la	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	cellule	cellule	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-488
# text = Sur des bases structurales , Dps est considérée comme un membre des bactérioferritines , chaque monomère formant une structure entrelaçée de 4 hélices .
1	Sur	sur	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	des	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	bases	base	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	structurales	structural	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	Dps	Dps	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	considérée	considérer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	comme	comme	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	un	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	membre	membre	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	des	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	bactérioferritines	bactérioferritines	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
15	chaque	chaque	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	monomère	monomère	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
17	formant	former	VPR	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	une	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	structure	structure	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	entrelaçée	entrelacé	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	4	4	NUM	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	hélices	hélice	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-489
# text = Dps est formée de 12 de ces monomères formant une sphère creuse ( Figure
1	Dps	Dps	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	formée	former	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	12	12	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ces	ce	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	monomères	monomère	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	formant	former	VPR	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	une	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	sphère	sphère	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	creuse	creux	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	(	(	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
14	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-490
# text = 13 ) , ces sphères s'assemblant ensuite en nids d'abeilles .
1	13	13	NUM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	ces	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	sphères	sphère	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
6	s'	s'	CLI	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	assemblant	assembler	VPR	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	ensuite	ensuite	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	en	en	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	nids	nid	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	d'	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	abeilles	abeille	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-491
# text = La surface ainsi formée ne présente pas de domaine spécifique de fixation à l'ADN , mais des résidus lysines , chargés positivement et présents dans les pores situés entre les sphères , pourraient interagir avec l'ADN .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	surface	surface	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	ainsi	ainsi	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	formée	former	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	ne	ne	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	présente	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	pas	pas	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	domaine	domaine	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	spécifique	spécifique	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	fixation	fixation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	ADN	ADN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
17	mais	mais	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	des	de	PRE	_	_	13	para	_	_	_	_	_
19	résidus	résidu	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	lysines	lysine	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
22	chargés	charger	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
23	positivement	positivement	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
25	présents	présent	ADJ	_	_	12	para	_	_	_	_	_
26	dans	dans	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
27	les	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	pores	pore	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	situés	situer	VPP	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	entre	entre	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	les	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	sphères	sphère	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_
34	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
35	interagir	interagir	VNF	_	_	0	root	_	_	_	_	_
36	avec	avec	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	l'	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	ADN	ADN	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-492
# text = La liaison à l'ADN pourrait induire des interactions entre dodécamères de Dps , conduisant à la formation de couches superposées de Dps et d'ADN .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	liaison	liaison	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	à	à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	induire	induire	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	des	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	interactions	interaction	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	entre	entre	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	dodécamères	do	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	Dps	Dps	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	conduisant	conduire	VPR	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
16	à	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	formation	formation	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	couches	couche	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	superposées	superposer	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
23	Dps	Dps	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
25	d'	de	PRE	_	_	22	para	_	_	_	_	_
26	ADN	ADN	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-493
# text = La formation de ces structures très organisées permettrait une forte compaction de l'ADN .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	formation	formation	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ces	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	structures	structure	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	très	très	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	organisées	organiser	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	permettrait	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	une	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
10	forte	fort	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	compaction	compaction	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	ADN	ADN	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-494
# text = Les effets de Dps sur la structure de l'ADN ont été visualisés par microscopie .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	effets	effet	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	Dps	Dps	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	sur	sur	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	structure	structure	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	ADN	ADN	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	ont	avoir	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	été	être	VPP	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	visualisés	visualiser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	par	par	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	microscopie	microscopie	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-495
# text = Après 24h de carence nutritionelle , des structures toroïdale Dps-ADN sont formées ;
1	Après	après	PRE	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	24h	24h	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	carence	carence	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	nutritionelle	nutritionel	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	des	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	structures	structure	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
9	toroïdale	toroïdal	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	Dps-ADN	Dps-ADN	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	sont	être	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	formées	former	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	;	;	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-496
# text = après une phase stationnaire prolongée de 48h , ces structures laissent place à des cristaux où les couches de Dps et d'ADN sont alternées ( Figure 13
1	après	après	PRE	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	une	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	phase	phase	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	prolongée	prolonger	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	48h	48h	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
9	ces	ce	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	structures	structure	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
11	laissent	laisser	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	place	place	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	des	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	cristaux	cristal	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	où	où	PRQ	_	_	25	periph	_	_	_	_	_
17	les	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	couches	couche	NOM	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	Dps	Dps	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	d'	de	PRE	_	_	19	para	_	_	_	_	_
23	ADN	ADN	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	sont	être	VRB	_	_	25	aux	_	_	_	_	_
25	alternées	alterner	VPP	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
26	(	(	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
27	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
28	13	13	NUM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-497
# text = ; Frenkiel-Krispin et al. , 2004 ) .
1	;	;	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
2	Frenkiel-Krispin	Frenkiel-Krispin	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	4	mark	_	_	_	_	_
4	al.	al.	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
6	2004	2004	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-498
# text = Les structures formées par Dps permettent de protéger l'ADN des stress oxydatifs , thermiques , et des radiations UV .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	structures	structure	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	formées	former	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	par	par	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	Dps	Dps	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	permettent	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	protéger	protéger	VNF	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	ADN	ADN	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	des	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	stress	stress	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	oxydatifs	oxydatif	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
15	thermiques	thermique	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	des	de	PRE	_	_	11	para	_	_	_	_	_
19	radiations	radiation	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	UV	UV	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-499
# text = Dps fait d'ailleurs partie du régulon de OxyR , celui de la réponse aux stress oxydatifs .
1	Dps	Dps	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	fait	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	d'	d'ailleurs	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ailleurs	d'ailleurs	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	partie	partie	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	du	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	régulon	ré-	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	OxyR	OxyR	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	celui	celui	PRQ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	réponse	réponse	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	aux	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	stress	stress	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	oxydatifs	oxydatif	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-500
# text = Pendant de tels stress , cette protection stérique serait couplée à une protection chimique , grâce à la liaison des ions Fe 2 + à
1	Pendant	pendant	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	tels	tel	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	stress	stress	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
6	cette	ce	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	protection	protection	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
8	stérique	stérique	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	serait	être	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	couplée	coupler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	à	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	une	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	protection	protection	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	chimique	chimique	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
16	grâce	grâce à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
17	à	grâce à	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	liaison	liaison	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	des	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	ions	ion	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	Fe	Fe	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	2	2	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	+	plus	ADV	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	à	à	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-501
# text = Dps .
1	Dps	Dps	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-502
# text = En effet , les stress oxydatifs sont associés à la production de radicaux libres , toxiques pour les cellules , via les réactions de Fenton impliquant les ions Fe 2 + .
1	En	en	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	effet	effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	stress	stress	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
6	oxydatifs	oxydatif	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	sont	être	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	associés	associer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	production	production	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	radicaux	radical	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	libres	libre	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
16	toxiques	toxique	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	pour	pour	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	les	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	cellules	cellule	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	via	via	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
22	les	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	réactions	réaction	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	Fenton	Fenton	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	impliquant	impliquer	VPR	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
27	les	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	ions	ion	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	Fe	Fe	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	2	2	NUM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	+	plus	ADV	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-503
# text = Ces radicaux peuvent notamment conduire à des cassures simple brin ou double brin de l'ADN par oxydation des bases nucléotidiques .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	radicaux	radical	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	notamment	notamment	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	conduire	conduire	VNF	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	à	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	des	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	cassures	cassure	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	simple	simple	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	brin	brin	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	ou	ou	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
12	double	double	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	brin	brin	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	ADN	ADN	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
18	oxydation	oxydation	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	des	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	bases	base	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	nucléotidiques	nucléotidique	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-504
# text = Dps est capable de séquestrer les ions
1	Dps	Dps	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	capable	capable	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	séquestrer	séquestrer	VNF	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ions	ion	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-505
# text = Fe 2 + et ainsi d'empêcher la production de radicaux libres .
1	Fe	Fe	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	2	2	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	+	-	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
5	ainsi	ainsi	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	d'	de	PRE	_	_	1	para	_	_	_	_	_
7	empêcher	empêcher	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	production	production	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	radicaux	radical	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	libres	libre	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-506
# text = La protéine IHF
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéine	protéine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	IHF	IHF	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-507
# text = La protéine IHF ( Integration Host Factor ) est la NAP présentant la plus forte spécificité de fixation à l'ADN avec une séquence consensus clairement définie , qui ressort de l'analyse de plusieurs sites de fixation ( Dorman et Deighan , 2003 ) .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéine	protéine	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	IHF	IHF	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	(	ihf ( integration host factor )	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
5	Integration	Integration	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	Host	Host	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	Factor	Factor	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	)	ihf ( integration host factor )	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
9	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	NAP	NAP	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	présentant	présenter	VPR	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
14	plus	plus	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	forte	fort	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	spécificité	spécificité	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	fixation	fixation	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	à	à	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	ADN	ADN	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	avec	avec	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
23	une	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	séquence	séquence	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	consensus	consensus	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	clairement	clairement	ADV	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
27	définie	définir	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
29	qui	qui	PRQ	_	_	30	subj	_	_	_	_	_
30	ressort	ressortir	VRB	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	l'	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	analyse	analyse	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	sites	site	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	fixation	fixation	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	(	(	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
40	Dorman	Dorman	NOM	_	_	36	parenth	_	_	_	_	_
41	et	et	COO	_	_	42	mark	_	_	_	_	_
42	Deighan	Deighan	NOM	_	_	40	para	_	_	_	_	_
43	,	,	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
44	2003	2003	NUM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	)	)	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
46	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-508
# text = IHF est un hétérodimère dont les sous-unités & 206;& 177; et & 206;& 178; sont codées par les gènes himA et himB et dont la séquence et la structure ressemblent à celles de HU .
1	IHF	ihf	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	un	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	hétérodimère	herero	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	dont	dont	PRQ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	sous-unités	sous-	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
8	α	α	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	β	β	ADJ	_	_	8	para	_	_	_	_	_
11	sont	être	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	codées	coder	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
13	par	par	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	gènes	gène	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	himA	himA	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	himB	himB	NOM	_	_	15	para	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
20	dont	dont	PRQ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	séquence	séquence	NOM	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
23	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	structure	structure	NOM	_	_	22	para	_	_	_	_	_
26	ressemblent	ressembler	VRB	_	_	12	para	_	_	_	_	_
27	à	à	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	celles	celui	PRQ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	HU	HU	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-509
# text = IHF se fixe sur une séquence de 30 pb , dont 13 sont conservées , et y induit une courbure allant jusqu'à 180 ° ( Figure 11
1	IHF	ihf	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	se	se	CLI	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	fixe	fixer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	sur	sur	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	séquence	séquence	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	30	30	NUM	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	pb	problème	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
11	dont	dont	PRQ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
12	13	13	NUM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
13	sont	être	VRB	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	conservées	conserver	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
17	y	le	CLI	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	induit	induire	VRB	_	_	3	para	_	_	_	_	_
19	une	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	courbure	courbure	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	allant	aller	VPR	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	jusqu'à	jusqu'à	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
23	180	180	NUM	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	°	degré	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	(	(	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
26	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
27	11	11	NUM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-510
# text = A ;
1	A	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	;	;	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-511
# text = . Seuls 1000 sites de fixation à haute affinité pour IHF sont présents sur le chromosome , alors que 12   000 molécules d'IHF sont présentes chez E. coli en phase exponentielle , et 55   000 en début de phase stationnaire
1	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
2	Seuls	Seuls	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
3	1000	1000	NUM	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	sites	site	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	fixation	fixation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	haute	haut	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	affinité	affinité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	pour	pour	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	IHF	IHF	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	présents	présent	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	sur	sur	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	le	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	chromosome	chromosome	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
18	alors	alors que	CSU	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	que	alors que	CSU	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
20	12	12	NUM	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
21	 	12   000	DET	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	000	000	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	molécules	molécule	NOM	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
24	d'	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	IHF	IHF	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	sont	être	VRB	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
27	présentes	présent	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	chez	chez	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	E.	E.	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	coli	coli	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	en	en	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
32	phase	phase	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	,	,	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
35	et	et	COO	_	_	38	mark	_	_	_	_	_
36	55	55	NUM	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
37	 	55   000	PRQ	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
38	000	000	NUM	_	_	32	para	_	_	_	_	_
39	en	en début de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	début	en début de	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	de	en début de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	phase	phase	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-512
# text = . Un fort excès d'IHF est donc présent par rapport à ses sites de haute affinité .
1	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
2	Un	Un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	fort	fort	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	excès	excès	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
5	d'	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	IHF	IHF	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	donc	donc	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	présent	présent	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	par	par rapport à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	rapport	par rapport à	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	à	par rapport à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	ses	son	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	sites	site	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	haute	haut	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	affinité	affinité	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-513
# text = IHF pourrait donc également se fixer à l'ADN par des interactions non spécifiques , car la majorité d'IHF in vivo est liée à l'ADN ( Yang et Nash , 1995 ) .
1	IHF	ihf	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	donc	donc	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
4	également	également	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	se	se	CLI	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	fixer	fixer	VNF	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	ADN	ADN	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	par	par	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
11	des	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	interactions	interaction	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	non	non	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	spécifiques	spécifique	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
16	car	car	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	majorité	majorité	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
19	d'	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	IHF	IHF	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	in	in vivo	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	vivo	in vivo	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
23	est	être	VRB	_	_	2	para	_	_	_	_	_
24	liée	lier	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	à	à	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	l'	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	ADN	ADN	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	(	(	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	Yang	Yang	NOM	_	_	27	parenth	_	_	_	_	_
30	et	et	COO	_	_	31	mark	_	_	_	_	_
31	Nash	Nash	NOM	_	_	29	para	_	_	_	_	_
32	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
33	1995	1995	NUM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	)	)	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-514
# text = La fixation d'IHF à l'ADN in vitro provoque une réduction de la longueur de l'ADN de 30 % , liée à l'activité de courbure d'IHF et conduisant à la compaction de l'ADN
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fixation	fixation	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	IHF	IHF	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	à	à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ADN	ADN	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	in	in vitro	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	vitro	in vitro	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	provoque	provoquer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	réduction	réduction	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	longueur	longueur	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	ADN	ADN	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
20	30	30	NUM	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	%	pourcent	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
23	liée	lier	VPP	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
24	à	à	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	l'	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	activité	activité	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	courbure	courbure	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	d'	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	IHF	IHF	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	et	et	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
32	conduisant	conduire	VPR	_	_	27	para	_	_	_	_	_
33	à	à	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	la	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	compaction	compaction	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	de	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	l'	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	ADN	ADN	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-515
# text = . L'expression maximale d'IHF lors du passage en phase stationnaire permet d'envisager la compaction du chromosome par IHF à ce moment du cycle cellulaire , avant que Dps ne prenne le relais .
1	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
2	L'	L'	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	expression	expression	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
4	maximale	maximal	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	IHF	IHF	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	lors	lors de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	du	lors de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	passage	passage	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	en	en	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	phase	phase	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	permet	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	d'	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	envisager	envisager	VNF	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	compaction	compaction	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	du	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	chromosome	chromosome	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	par	par	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	IHF	IHF	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	à	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
23	ce	ce	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	moment	moment	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	du	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	cycle	cycle	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
29	avant	avant que	CSU	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	que	avant que	CSU	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
31	Dps	Dps	NOM	_	_	33	subj	_	_	_	_	_
32	ne	ne	ADV	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
33	prenne	prendre	VRB	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
34	le	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	relais	relais	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-516
# text = En plus de son rôle structural d'organisation de l'ADN , IHF est impliquée dans les phénomènes de régulation de la transcription chez les bactéries , la réplication de l'ADN , la recombinaison site-spécifique ( Dorman et Higgins , 1987 ) , et la transposition .
1	En	en plus de	PRE	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
2	plus	en plus de	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	en plus de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	son	son	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	rôle	rôle	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	structural	structural	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	organisation	organisation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	ADN	ADN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
13	IHF	IHF	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
14	est	être	VRB	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
15	impliquée	impliquer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	dans	dans	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	les	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	phénomènes	phénomène	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	régulation	régulation	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	transcription	transcription	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	chez	chez	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	les	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	bactéries	bactérie	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	réplication	réplication	NOM	_	_	23	para	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	l'	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	ADN	ADN	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_
34	la	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	29	para	_	_	_	_	_
36	site-spécifique	site	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	(	(	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
38	Dorman	Dorman	NOM	_	_	35	parenth	_	_	_	_	_
39	et	et	COO	_	_	40	mark	_	_	_	_	_
40	Higgins	Higgins	NOM	_	_	38	para	_	_	_	_	_
41	,	,	PUNC	_	_	47	punc	_	_	_	_	_
42	1987	1987	NUM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	)	)	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
44	,	,	PUNC	_	_	47	punc	_	_	_	_	_
45	et	et	COO	_	_	47	mark	_	_	_	_	_
46	la	le	DET	_	_	47	spe	_	_	_	_	_
47	transposition	transposition	NOM	_	_	40	para	_	_	_	_	_
48	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-517
# text = Son activité de courbure est cruciale pour ces fonctions additionnelles , car elle induit des interactions à grande échelle entre différentes protéines .
1	Son	son	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	activité	activité	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	courbure	courbure	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	cruciale	crucial	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	pour	pour	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	ces	ce	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	fonctions	fonction	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	additionnelles	additionnel	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
12	car	car	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
13	elle	elle	CLS	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
14	induit	induire	VRB	_	_	5	para	_	_	_	_	_
15	des	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	interactions	interaction	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	à	à	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	grande	grand	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	échelle	échelle	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	entre	entre	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	différentes	différent	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	protéines	protéine	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-518
# text = D'autre part , l'influence d'IHF sur la structure de l'ADN contribue notamment au contrôle de la transcription .
1	D'	d'autre part	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	autre	d'autre part	ADV	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
3	part	d'autre part	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	influence	influence	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	IHF	IHF	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	sur	sur	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	structure	structure	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	ADN	ADN	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	contribue	contribuer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	notamment	notamment	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	au	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	contrôle	contrôle	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	transcription	transcription	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-519
# text = Ainsi , la liaison d'IHF sur un de ses sites de fixation en amont du promoteur ilvPG améliore l'ouverture de la bulle de transcription en transférant la tension induite par la courbure de l'ADN de sites riches en AT en amont du promoteur vers celui  -ci .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	liaison	liaison	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
5	d'	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	IHF	IHF	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	sur	sur	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	un	un	PRQ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	ses	son	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	sites	site	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	fixation	fixation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	en	en	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	amont	amont	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	du	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	promoteur	promoteur	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	ilvPG	ilvPG	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	améliore	améliorer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	ouverture	ouverture	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	bulle	bulle	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	transcription	transcription	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	en	en	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
28	transférant	transférer	VPR	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	tension	tension	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	induite	induire	VPP	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	par	par	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	la	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	courbure	courbure	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	l'	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	ADN	ADN	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
39	sites	site	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	riches	riche	ADJ	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	en	en	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	AT	AT	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	en	en amont de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
44	amont	en amont de	DET	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	du	en amont de	PRE	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	promoteur	promoteur	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	vers	vers	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	celui	celui	PRQ	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	 -ci	 -ci	ADJ	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-520
# text = Des profils globaux de transcription ont été réalisés chez S. typhimurium afin de comparer la souche de référence et des mutants dépourvus d'IHF .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	profils	profil	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	globaux	global	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	transcription	transcription	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ont	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	été	être	VPP	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	réalisés	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	chez	chez	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	S.	S.	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	typhimurium	typhimurium	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	afin	afin de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
13	de	afin de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	comparer	comparer	VNF	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	souche	souche	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	référence	référence	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
20	des	de	PRE	_	_	17	para	_	_	_	_	_
21	mutants	mutant	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	dépourvus	dépourvoir	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	d'	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	IHF	IHF	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-521
# text = De profonds changements de la transcription ont été observés suite à l'absence d'IHF , les gènes affectés étant notamment impliqués dans la transition entre les phases exponentielle et stationnaire , mais aussi dans la virulence et l'invasion des cellules épithéliales , ce qui montre le rôle d'IHF dans la régulation coordonnée des traits pathogéniques et de l'adaptation aux carences .
1	De	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	profonds	profond	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	changements	changement	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	transcription	transcription	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	ont	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	été	être	VPP	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	observés	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	suite	suite à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	à	suite à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	absence	absence	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	d'	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	IHF	IHF	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	45	punc	_	_	_	_	_
17	les	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	gènes	gène	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	affectés	affecter	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	étant	être	VPR	_	_	22	aux	_	_	_	_	_
21	notamment	notamment	ADV	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
22	impliqués	impliquer	VPP	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
23	dans	dans	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	transition	transition	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	entre	entre	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	les	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	phases	phase	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	exponentielle	exponentielle	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	et	et	COO	_	_	31	mark	_	_	_	_	_
31	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	29	para	_	_	_	_	_
32	,	,	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_
33	mais	mais aussi	COO	_	_	35	mark	_	_	_	_	_
34	aussi	mais aussi	ADV	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	dans	dans	PRE	_	_	23	para	_	_	_	_	_
36	la	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	virulence	virulence	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	et	et	COO	_	_	40	mark	_	_	_	_	_
39	l'	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	invasion	invasion	NOM	_	_	37	para	_	_	_	_	_
41	des	de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	cellules	cellule	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	épithéliales	épithélial	ADJ	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	,	,	PUNC	_	_	45	punc	_	_	_	_	_
45	ce	ce	PRQ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
46	qui	qui	PRQ	_	_	47	subj	_	_	_	_	_
47	montre	montrer	VRB	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
48	le	le	DET	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
49	rôle	rôle	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	d'	de	PRE	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	IHF	IHF	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	dans	dans	PRE	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
53	la	le	DET	_	_	54	spe	_	_	_	_	_
54	régulation	régulation	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
55	coordonnée	coordonné	ADJ	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	des	de	PRE	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
57	traits	trait	NOM	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
58	pathogéniques	pathogéniques	ADJ	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
59	et	et	COO	_	_	60	mark	_	_	_	_	_
60	de	de	PRE	_	_	56	para	_	_	_	_	_
61	l'	le	DET	_	_	62	spe	_	_	_	_	_
62	adaptation	adaptation	NOM	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
63	aux	à	PRE	_	_	62	dep	_	_	_	_	_
64	carences	carence	NOM	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
65	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-522
# text = La protéine Fis
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéine	protéine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	Fis	Fis	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-523
# text = La protéine Fis ( Factor for Inversion Stimulation ) , un homodimère de 98 acides aminés , fut découverte dans les années 1980 chez E. coli et S. typhimurium pour son implication dans les phénomènes de recombinaison site-spécifique
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéine	protéine	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
3	Fis	Fis	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	(	(	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
5	Factor	Factor	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
6	for	factor for inversion stimulation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
7	Inversion	Inversion	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	Stimulation	Stimulation	NOM	_	_	2	parenth	_	_	_	_	_
9	)	)	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
11	un	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	homodimère	homo-	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	98	98	NUM	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	acides	acide	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	aminés	aminé	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
18	fut	être	VRB	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
19	découverte	découvrir	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	dans	dans	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	les	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	années	année	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	1980	1980	NUM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	chez	chez	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
25	E.	E.	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	coli	coli	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
28	S.	S.	NOM	_	_	26	para	_	_	_	_	_
29	typhimurium	typhimurium	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	pour	pour	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
31	son	son	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	implication	implication	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	dans	dans	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	les	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	phénomènes	phénomène	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	de	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	site-spécifique	site	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-524
# text = . Depuis , un grand nombre de fonctions lui ont été attribuées dans la cellule , et elles ont pu être corrélées à sa structure , connue depuis 1991 .
1	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
2	Depuis	Depuis	ADV	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	un	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	grand	grand	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	nombre	nombre	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	fonctions	fonction	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	lui	le	CLI	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
10	ont	avoir	VRB	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	été	être	VPP	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	attribuées	attribuer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	dans	dans	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	cellule	cellule	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
18	elles	elles	CLS	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
19	ont	avoir	VRB	_	_	20	aux	_	_	_	_	_
20	pu	pouvoir	VPP	_	_	12	para	_	_	_	_	_
21	être	être	VNF	_	_	22	aux	_	_	_	_	_
22	corrélées	corréler	VPP	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	à	à	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	sa	son	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	structure	structure	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
27	connue	connaître	VPP	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	depuis	depuis	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	1991	1991	NUM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-525
# text = Rôle de Fis dans la superhélicité de l'ADN
1	Rôle	rôle	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Fis	Fis	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	dans	dans	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	ADN	ADN	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-526
# text = Des sites à haute affinité pour Fis ont été mis en évidence , ce qui a permis de déduire une séquence consensus de fixation de Fis sur l'ADN , de 15 pb .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	sites	site	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	à	à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	haute	haut	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	affinité	affinité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	pour	pour	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	Fis	Fis	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ont	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	été	être	VPP	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	mis	mettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	en	en	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	évidence	évidence	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	ce	ce	PRQ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	qui	qui	PRQ	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
16	a	avoir	VRB	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
17	permis	permettre	VPP	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	déduire	déduire	VNF	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	une	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	séquence	séquence	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	consensus	consensus	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	fixation	fixation	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	Fis	Fis	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	sur	sur	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
28	l'	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	ADN	ADN	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
32	15	15	NUM	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	pb	problème	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-527
# text = Cette séquence est cependant très dégénérée .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	séquence	séquence	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	cependant	cependant	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	très	très	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	dégénérée	dégénéré	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-528
# text = De plus , le nombre de sites à haute affinité répertoriés sur le chromosome d'E. coli , estimé à 6000 , est bien inférieur au nombre de molécules de Fis dans la cellule en phase exponentielle ( plus de 50 000 molécules ) .
1	De	de plus	PRE	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	nombre	nombre	NOM	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	sites	site	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	haute	haut	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	affinité	affinité	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	répertoriés	répertorier	VPP	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	sur	sur	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	le	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	chromosome	chromosome	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	d'	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	E.	E.	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	coli	coli	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
19	estimé	estimer	VPP	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
20	à	à	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	6000	6000	NUM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
23	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	bien	bien	ADV	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	inférieur	inférieur	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	au	à	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	nombre	nombre	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	molécules	molécule	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	Fis	Fis	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	dans	dans	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
33	la	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	cellule	cellule	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	en	en	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	phase	phase	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	(	(	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
39	plus	plus	ADV	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
40	de	de	PRE	_	_	34	parenth	_	_	_	_	_
41	50	50	NUM	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	000	000	NUM	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	molécules	molécule	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
44	)	)	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
45	.	.	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-529
# text = Ainsi , Fis est également capable de se fixer de manière non spécifique à l'ADN , avec une préférence pour des régions courbées .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	Fis	Fis	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	également	également	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	capable	capable	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	se	se	CLI	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	fixer	fixer	VNF	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	manière	manière	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	non	non	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	spécifique	spécifique	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	ADN	ADN	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	avec	avec	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
19	une	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	préférence	préférence	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	pour	pour	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	des	un	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	régions	région	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	courbées	courber	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-530
# text = La fixation de Fis sur l'ADN provoque une courbure de 50 à 90 ° , ainsi qu'un phénomène d'extrusion de boucles de l'ADN ( Figure 11
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fixation	fixation	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	sur	sur	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ADN	ADN	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	provoque	provoquer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	une	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	courbure	courbure	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	50	50	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	90	90	NUM	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	°	degré	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
17	ainsi	ainsi que	COO	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	qu'	ainsi que	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
19	un	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	phénomène	phénomène	NOM	_	_	8	para	_	_	_	_	_
21	d'	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	extrusion	extrusion	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	boucles	boucle	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	l'	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	ADN	ADN	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	(	(	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
29	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
30	11	11	NUM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-531
# text = C ;
1	C	C	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	;	;	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-532
# text = Schneider et al. , 2001 ) .
1	Schneider	schneider	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
3	al.	al.	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
5	2001	2001	NUM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
6	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-533
# text = La capacité de Fis à se fixer de manière à la fois non spécifique et sur des sites à haute affinité lui permet d'influer sur la topologie de l'ADN aussi bien au niveau global que local .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	capacité	capacité	NOM	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	à	à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	se	se	CLI	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	fixer	fixer	VNF	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
9	manière	manière	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	fois	fois	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	non	non	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	spécifique	spécifique	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	sur	sur	PRE	_	_	8	para	_	_	_	_	_
17	des	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	sites	site	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	à	à	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	haute	haut	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	affinité	affinité	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	lui	le	CLI	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	permet	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	d'	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	influer	influer	VNF	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	sur	sur	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	topologie	topologie	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	l'	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	ADN	ADN	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	aussi	aussi bien	ADV	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
33	bien	aussi bien	ADV	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
34	au	à	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
35	niveau	niveau	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	global	global	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	que	que	CSU	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
38	local	local	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-534
# text = En effet , de par sa capacité à se fixer de façon non spécifique et à former des « branches » et des boucles d'ADN , Fis est impliquée dans la structuration globale du chromosome .
1	En	en effet	PRE	_	_	30	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	de	de par	PRE	_	_	30	periph	_	_	_	_	_
5	par	de par	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	sa	son	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	capacité	capacité	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	se	se	CLI	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	fixer	fixer	VNF	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	façon	façon	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	non	non	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	spécifique	spécifique	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	à	à	PRE	_	_	14	para	_	_	_	_	_
17	former	former	VNF	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	des	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
19	«	«	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	branches	branche	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	»	»	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	des	de	PRE	_	_	11	para	_	_	_	_	_
24	boucles	boucle	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	d'	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	ADN	ADN	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
28	Fis	Fis	NOM	_	_	30	subj	_	_	_	_	_
29	est	être	VRB	_	_	30	aux	_	_	_	_	_
30	impliquée	impliquer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
31	dans	dans	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	la	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	structuration	structuration	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	globale	global	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	du	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	chromosome	chromosome	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	.	.	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-535
# text = Ainsi , Fis forme des barrières qui contribuent au maintien de domaines topologiques , et son absence engendre un relâchement général du chromosome ( voir paragraphe II.A. 4 ; Hardy et Cozzarelli , 2005 ) .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	Fis	Fis	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	forme	former	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	des	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	barrières	barrière	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	qui	qui	PRQ	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
8	contribuent	contribuer	VRB	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	au	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	maintien	maintien	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	domaines	domaine	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	topologiques	topologique	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
16	son	son	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	absence	absence	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
18	engendre	engendrer	VRB	_	_	4	para	_	_	_	_	_
19	un	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	relâchement	relâchement	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	général	général	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	du	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	chromosome	chromosome	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	(	(	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
25	voir	voir	VNF	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	paragraphe	paragraphe	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	II.A.	II.A.	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	4	4	NUM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	;	;	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
30	Hardy	Hardy	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
31	et	et	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
32	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	30	para	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
34	2005	2005	NUM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	)	)	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-536
# text = Au niveau local , Fis se fixe sur des sites de reconnaissance à haute spécificité , qui sont souvent localisés dans les régions promotrices de certains gènes , ce qui fait de Fis un régulateur global de la transcription ( Dorman et Deighan , 2003 ) .
1	Au	à	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	niveau	niveau	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	local	local	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	Fis	Fis	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
6	se	se	CLI	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	fixe	fixer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	sur	sur	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	des	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	sites	site	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	reconnaissance	reconnaissance	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	haute	haut	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	spécificité	spécificité	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
17	qui	qui	PRQ	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
18	sont	être	VRB	_	_	20	aux	_	_	_	_	_
19	souvent	souvent	ADV	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
20	localisés	localiser	VPP	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
21	dans	dans	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	les	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	régions	région	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	promotrices	promoteur	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	certains	certain	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	gènes	gène	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	ce	ce	PRQ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
30	qui	qui	PRQ	_	_	31	subj	_	_	_	_	_
31	fait	faire	VRB	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	Fis	Fis	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	un	un	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	régulateur	régulateur	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
36	global	global	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	de	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	la	le	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	transcription	transcription	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	(	(	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
41	Dorman	Dorman	NOM	_	_	39	parenth	_	_	_	_	_
42	et	et	COO	_	_	43	mark	_	_	_	_	_
43	Deighan	Deighan	NOM	_	_	41	para	_	_	_	_	_
44	,	,	PUNC	_	_	45	punc	_	_	_	_	_
45	2003	2003	NUM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	)	)	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
47	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-537
# text = Ces sites de fixation sont appelés Upstream Activating Sequence ( UAS ) et ont été particulièrement bien étudiés dans le cas des opérons d'ARN ribosomiques , qui sont activés par Fis .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	sites	site	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	fixation	fixation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	sont	être	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	appelés	appeler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	Upstream	Upstream	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	Activating	Activating	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	Sequence	Sequence	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	(	upstream activating sequence ( uas )	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	UAS	UAS	NOM	_	_	7	parenth	_	_	_	_	_
12	)	upstream activating sequence ( uas )	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
14	ont	avoir	VRB	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
15	été	être	VPP	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
16	particulièrement	particulièrement	ADV	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
17	bien	bien	ADV	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
18	étudiés	étudier	VPP	_	_	6	para	_	_	_	_	_
19	dans	dans	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	le	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	cas	cas	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	des	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	opérons	opéron	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	d'	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	ARN	ARN	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	ribosomiques	ribosomiques	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
28	qui	qui	PRQ	_	_	30	subj	_	_	_	_	_
29	sont	être	VRB	_	_	30	aux	_	_	_	_	_
30	activés	activer	VPP	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
31	par	par	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	Fis	Fis	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-538
# text = Leur région régulatrice possède en effet plusieurs sites de fixation de Fis qui sont séparés par une distance correspondant au pas de l'hélice , le site majeur étant localisé à la position - 71 par rapport au site d'initiation de la transcription .
1	Leur	son	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	région	région	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	régulatrice	régulateur	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	possède	posséder	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	en	en effet	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	effet	en effet	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	sites	site	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	fixation	fixation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	Fis	Fis	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	qui	qui	PRQ	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
14	sont	être	VRB	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
15	séparés	séparer	VPP	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
16	par	par	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	une	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	distance	distance	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	correspondant	correspondre	VPR	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	au	à	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	pas	pas	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	l'	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	hélice	hélice	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
26	le	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	site	site	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
28	majeur	majeur	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	étant	être	VPR	_	_	30	aux	_	_	_	_	_
30	localisé	localiser	VPP	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
31	à	à	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	la	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	position	position	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	-	- 71	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
35	71	71	NUM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	par	par rapport à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
37	rapport	par rapport à	DET	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	au	par rapport à	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	site	site	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
40	d'	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	initiation	initiation	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	de	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
43	la	le	DET	_	_	44	spe	_	_	_	_	_
44	transcription	transcription	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-539
# text = Cette structuration des UAS leur permet d'être tous localisés du même côté de la double hélice d'ADN .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	structuration	structuration	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	UAS	UAS	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	leur	le	CLI	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	permet	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	être	être	VNF	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
9	tous	tout	PRQ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	localisés	localiser	VPP	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	du	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	même	même	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	côté	côté	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
16	double	double	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	hélice	hélice	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	d'	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	ADN	ADN	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-540
# text = La fixation de Fis sur ces UAS entraîne des courbures de l'ADN et la formation de boucles d'ADN , ces boucles favorisant la fixation de l'ARN polymérase .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fixation	fixation	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	sur	sur	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	ces	ce	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	UAS	UAS	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	entraîne	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	des	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	courbures	courbure	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	ADN	ADN	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	formation	formation	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	boucles	boucle	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	d'	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	ADN	ADN	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
22	ces	ce	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	boucles	boucle	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	favorisant	favoriser	VPR	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	fixation	fixation	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	l'	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
29	ARN	ARN	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	polymérase	polymérase	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-541
# text = Elles pourraient donc favoriser la transcription des opérons d'ARNr par l'intermédiaire de Fis .
1	Elles	elles	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	donc	donc	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	favoriser	favoriser	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	transcription	transcription	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	des	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	opérons	opéron	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	ARNr	ARNr	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	intermédiaire	intermédiaire	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	Fis	Fis	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-542
# text = Ainsi , les deux effets de Fis sur l'ADN , aux niveaux global et local , impliquent le même mécanisme structural :
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
4	deux	deux	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	effets	effet	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	Fis	Fis	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	sur	sur	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	ADN	ADN	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
12	aux	à	PRE	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
13	niveaux	niveau	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	global	global	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	local	local	ADJ	_	_	14	para	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
18	impliquent	impliquer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	le	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
20	même	même	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	structural	structural	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	:	:	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-543
# text = une forte courbure de l'ADN avec pour conséquence la formation de boucles ( Figure 14
1	une	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	forte	fort	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	courbure	courbure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	ADN	ADN	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	avec	avec	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	pour	pour	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	conséquence	conséquence	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	formation	formation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	boucles	boucle	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
15	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	14	14	NUM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-544
# text = ; Muskhelishvili et Travers , 2003 ) .
1	;	;	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	Muskhelishvili	Muskhelishvili	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	4	mark	_	_	_	_	_
4	Travers	Travers	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	2003	2003	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-545
# text = Un autre exemple est constitué par la région promotrice de tyrT , qui contient trois sites où Fis se fixe de manière coopérative .
1	Un	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	autre	autre	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	exemple	exemple	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
4	est	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	constitué	constituer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	région	région	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	promotrice	promoteur	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	tyrT	tyrT	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
13	qui	qui	PRQ	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
14	contient	contenir	VRB	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	trois	trois	NUM	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	sites	site	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	où	où	PRQ	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
18	Fis	Fis	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
19	se	se	CLI	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	fixe	fixer	VRB	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
22	manière	manière	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	coopérative	coopératif	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-546
# text = L'effet de cette fixation est de stimuler l'ouverture du promoteur , probablement à l'aide de la torsion introduite par les trois dimères de Fis .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	effet	effet	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	cette	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	fixation	fixation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	stimuler	stimuler	VNF	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	ouverture	ouverture	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	du	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	promoteur	promoteur	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
14	probablement	probablement	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	aide	aide	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	torsion	torsion	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	introduite	introduire	VPP	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	par	par	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	les	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
24	trois	trois	NUM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	dimères	dimère	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	Fis	Fis	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-547
# text = L'effet local de Fis sur les promoteurs possédant des sites de fixation à haute affinité serait de moduler , en l'augmentant , le superenroulement local de l'ADN de ces promoteurs .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	effet	effet	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
3	local	local	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	Fis	Fis	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	sur	sur	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	possédant	posséder	VPR	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	des	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	sites	site	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	fixation	fixation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	haute	haut	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	affinité	affinité	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	serait	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	moduler	moduler	VNF	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
21	en	en	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	l'	le	CLI	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	augmentant	augmenter	VPR	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
25	le	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	superenroulement	super-	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
27	local	local	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	l'	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	ADN	ADN	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	ces	ce	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-548
# text = De cette façon , Fis permettrait à ces promoteurs de rester actifs même si la superhélicité globale de l'ADN devenait défavorable à la transcription de ces promoteurs ( Muskhelishvili et Travers , 2003 ) .
1	De	de	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	cette	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	façon	façon	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	Fis	Fis	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	permettrait	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ces	ce	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
11	rester	rester	VNF	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	actifs	actif	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	même	même si	CSU	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	si	même si	CSU	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
17	globale	global	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	ADN	ADN	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	devenait	devenir	VRB	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
22	défavorable	défavorable	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	à	à	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	transcription	transcription	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	ces	ce	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	(	(	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
30	Muskhelishvili	Muskhelishvili	NOM	_	_	28	parenth	_	_	_	_	_
31	et	et	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
32	Travers	Travers	NOM	_	_	30	para	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
34	2003	2003	NUM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	)	)	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-549
# text = Par exemple , en augmentant localement la superhélicité de l'ADN en amont des opérons d'ARNr , Fis favorise leur transcription qui nécessite une superhélicité forte , et ce même si la superhélicité globale du chromosome venait à diminuer .
1	Par	par exemple	PRE	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
2	exemple	par exemple	ADV	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	en	en	PRE	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
5	augmentant	augmenter	VPR	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	localement	localement	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	ADN	ADN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	en	en amont de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
13	amont	en amont de	DET	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	des	en amont de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	opérons	opéron	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	d'	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	ARNr	ARNr	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
19	Fis	Fis	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
20	favorise	favoriser	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	leur	son	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	transcription	transcription	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	qui	qui	PRQ	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
24	nécessite	nécessiter	VRB	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	une	un	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	forte	fort	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
29	et	et	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
30	ce	ce	PRQ	_	_	20	para	_	_	_	_	_
31	même	même	ADV	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	si	si	CSU	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
33	la	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	38	subj	_	_	_	_	_
35	globale	global	ADJ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	du	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	chromosome	chromosome	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	venait	venir	VRB	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
39	à	à	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	diminuer	diminuer	VNF	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	.	.	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-550
# text = Ce n'est que lorsque la concentration de Fis diminue , lors du passage en phase stationnaire , que la transcription de ces opérons va diminuer .
1	Ce	ce	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	n'	ne	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	que	que	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	lorsque	lorsque	CSU	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	concentration	concentration	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	Fis	Fis	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	diminue	diminuer	VRB	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	lors	lors de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	du	lors de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	passage	passage	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	en	en	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	phase	phase	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
19	que	que	PRQ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	transcription	transcription	NOM	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	ces	ce	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	opérons	opéron	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	va	aller	VRB	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
26	diminuer	diminuer	VNF	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-551
# text = Enfin , Fis agit également sur le niveau de superhélicité de l'ADN de façon indirecte , en régulant les gènes codant les topoisomérases .
1	Enfin	enfin	ADV	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	Fis	Fis	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	agit	agir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	également	également	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	sur	sur	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	le	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	niveau	niveau	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	ADN	ADN	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	façon	façon	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	indirecte	indirect	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	en	en	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
19	régulant	réguler	VPR	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	les	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	gènes	gène	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	codant	coder	VPR	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	les	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	topoisomérases	topoisomérase	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-552
# text = En effet , Fis réprime l'expression des gènes codant la gyrase et active topA , qui code la TopoI , lors de stress oxydatifs .
1	En	en effet	PRE	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	réprime	réprimer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	expression	expression	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	des	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	gènes	gène	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	codant	coder	VPR	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	gyrase	gyrase	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	active	actif	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
15	topA	topA	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
17	qui	qui	PRQ	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
18	code	coder	VRB	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	TopoI	TopoI	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	lors	lors de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
23	de	lors de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	stress	stress	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	oxydatifs	oxydatif	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-553
# text = Fis est ainsi impliquée dans le contrôle homéostatique du degré de superhélicité de l'ADN ( voir paragraphe IV.B. ) .
1	Fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	est	est	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	ainsi	ainsi	ADV	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
4	impliquée	impliquer	VPP	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	le	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	contrôle	contrôle	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	homéostatique	homéostatique	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	du	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	degré	degré	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de+le	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	l'	de+le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	ADN	ADN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	(	(	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
17	voir	voir	VNF	_	_	1	parenth	_	_	_	_	_
18	paragraphe	paragraphe	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	IV.B.	IV.B.	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	)	)	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-554
# text = En effet , la transcription de fis est sensible au niveau de superhélicité .
1	En	en effet	PRE	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	transcription	transcription	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	est	est	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	sensible	sensible	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	au	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	niveau	niveau	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-555
# text = Tous ces mécanismes font de Fis une protéine centrale du contrôle de la superhélicité , agissant comme senseur des conditions de l'environnement , organisateur de la structure du chromosome et enfin régulateur des topoisomérases ..
1	Tous	tout	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	mécanismes	mécanisme	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	font	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	Fis	Fis	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	une	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	protéine	protéine	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	centrale	central	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	du	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	contrôle	contrôle	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	agissant	agir	VPR	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	comme	comme	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	senseur	senseur	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	des	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	conditions	condition	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	l'	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	environnement	environnement	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	organisateur	organisateur	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	structure	structure	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	du	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	chromosome	chromosome	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	et	et	COO	_	_	33	mark	_	_	_	_	_
32	enfin	enfin	ADV	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	régulateur	régulateur	NOM	_	_	30	para	_	_	_	_	_
34	des	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	topoisomérases	topoisomérase	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	..	...	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-556
# text = Structure de Fis
1	Structure	structure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Fis	Fis	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-557
# text = La structure d'un monomère de Fis révèle 4 hélices & 206;& 177; entremêlées A à D ( Figure 15
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	structure	structure	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	un	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	monomère	monomère	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	Fis	Fis	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	révèle	révéler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	4	4	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	hélices	hélice	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	α	α	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	entremêlées	entremêler	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	A	A	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	D	D	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	(	(	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
17	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	15	15	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-558
# text = A ) .
1	A	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-559
# text = Ces hélices s'étendent des résidus 27 à 42 ( A ) , 50 à 70 ( B ) , 74 à
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	hélices	hélice	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	s'	s'	CLI	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	étendent	étendre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	résidus	résidu	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	27	27	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	42	42	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	(	(	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	A	A	_	_	_	9	parenth	_	_	_	_	_
12	)	)	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
14	50	50	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	70	70	NUM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	(	(	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	B	B	NOM	_	_	14	parenth	_	_	_	_	_
19	)	)	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
21	74	74	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
22	à	à	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-560
# text = 81 ( C ) et 85 à 94 ( D ) .
1	81	81	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	(	(	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	C	C	NOM	_	_	1	parenth	_	_	_	_	_
4	)	)	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
5	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	85	85	NUM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	94	94	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	(	(	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	D	D	NOM	_	_	8	parenth	_	_	_	_	_
11	)	)	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-561
# text = La structure formée par les 25 premiers acides aminés a longtemps été inconnue , et était donc supposée non structurée .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	structure	structure	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
3	formée	former	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	par	par	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
6	25	25	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
7	premiers	premier	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	acides	acide	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	aminés	aminé	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	a	avoir	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
11	longtemps	longtemps	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	été	être	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	inconnue	inconnu	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	était	être	VRB	_	_	12	para	_	_	_	_	_
17	donc	donc	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	supposée	supposer	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	non	non	ADV	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	structurée	structurer	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-562
# text = Un mutant a été isolé , dont la structure a révélé une organisation en épingle à cheveux formée par deux feuillets & 206;& 178; et rattachés au corps de la protéine par des interactions hydrophobes et des liaisons hydrogène .
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutant	mutant	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	a	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	isolé	isoler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
7	dont	dont	PRQ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	structure	structure	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
10	a	avoir	VRB	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	révélé	révéler	VPP	_	_	5	para	_	_	_	_	_
12	une	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	organisation	organisation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	en	en	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	épingle	épingle	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	à	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	cheveux	cheveu	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	formée	former	VPP	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
19	par	par	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	deux	deux	NUM	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	feuillets	feuillet	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	β	β	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	et	et	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
24	rattachés	rattacher	VPP	_	_	11	para	_	_	_	_	_
25	au	à	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	corps	corps	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	protéine	protéine	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	par	par	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	des	un	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	interactions	interaction	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	hydrophobes	hydrophobe	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	et	et	COO	_	_	35	mark	_	_	_	_	_
35	des	de	PRE	_	_	27	para	_	_	_	_	_
36	liaisons	liaison	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	hydrogène	hydrogène	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-563
# text = Les hélices A et B sont localisées dans la partie N-terminale de la protéine et sont impliquées dans des interactions entre monomères pour construire une structure compacte dont la taille est d'environ 25 × 35 × 50 Å ..
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	hélices	hélice	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	A	A	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	B	B	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
6	sont	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	localisées	localiser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	dans	dans	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	partie	partie	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	N-terminale	N-terminale	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	protéine	protéine	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
16	sont	être	VRB	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
17	impliquées	impliquer	VPP	_	_	7	para	_	_	_	_	_
18	dans	dans	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	des	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	interactions	interaction	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	entre	entre	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	monomères	monomère	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	pour	pour	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
24	construire	construire	VNF	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	une	un	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	structure	structure	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	compacte	compact	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	dont	dont	PRQ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	taille	taille	NOM	_	_	31	subj	_	_	_	_	_
31	est	être	VRB	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
32	d'	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
33	environ	environ	ADV	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
34	25	25	NUM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	×	×	VPR	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	35	35	NUM	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	×	×	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	50	50	NUM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	Å	Å	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	..	...	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-564
# text = L'hélice A d'un monomère n'a aucun contact avec les hélices C'et D'de l'autre monomère , mais elle établit de nombreuses liaisons hydrogène et de Van der Waals avec l'hélice B'de l'autre monomère .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	hélice	hélice	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	A	A	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	un	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	monomère	monomère	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	n'	ne	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	aucun	aucun	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	contact	contact	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	avec	avec	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	hélices	hélice	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	C'	C'	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	D'	D'	NOM	_	_	14	para	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
19	autre	autre	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	monomère	monomère	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
22	mais	mais	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
23	elle	elle	CLS	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
24	établit	établir	VRB	_	_	8	para	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	nombreuses	nombreux	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
27	liaisons	liaison	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	hydrogène	hydrogène	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	et	et	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	25	para	_	_	_	_	_
31	Van	Van	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	der	der	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	Waals	Waals	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	avec	avec	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
35	l'	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	hélice	hélice	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	B'de	B'de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	l'	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
39	autre	autre	ADJ	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
40	monomère	monomère	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
41	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-565
# text = L'hélice B est courbée en son milieu en direction de l'hélice C'avec laquelle elle forme une hélice virtuelle plus longue par l'intermédiaire de liaisons hydrogène ( Figure 15
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	hélice	hélice	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	B	B	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	est	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	courbée	courber	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	son	son	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	milieu	milieu	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	direction	direction	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	hélice	hélice	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	C'	C'	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	avec	avec	PRE	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
16	laquelle	lequel	PRQ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	elle	elle	CLS	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
18	forme	former	VRB	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
19	une	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	hélice	hélice	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	virtuelle	virtuel	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	plus	plus	ADV	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	longue	long	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	par	par	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	l'	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	intermédiaire	intermédiaire	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	liaisons	liaison	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	hydrogène	hydrogène	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	(	(	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
31	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
32	15	15	NUM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-566
# text = A ) .
1	A	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-567
# text = Les hélices C et D sont situées dans la région C-terminale de la protéine et forment un motif hélice-tour-hélice de liaison à l'ADN .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	hélices	hélice	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	C	C	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	D	D	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
6	sont	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	situées	situer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	dans	dans	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	région	région	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	C-terminale	C-terminale	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	protéine	protéine	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	forment	former	VRB	_	_	7	para	_	_	_	_	_
17	un	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	motif	motif	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	hélice-tour-hélice	hélice	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	liaison	liaison	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	à	à	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	l'	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	ADN	ADN	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-568
# text = Les protéines contenant un tel motif s'insèrent généralement dans le grand sillon de l'ADN .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéines	protéine	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	contenant	contenir	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	un	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	tel	tel	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	motif	motif	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	s'	s'	CLI	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	insèrent	insérer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	généralement	généralement	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	le	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
12	grand	grand	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	sillon	sillon	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	ADN	ADN	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-569
# text = L'orientation des groupements phosphate de l'ADN responsables des interactions avec Fis est telle que la distance entre deux grands sillons varie de 29 à 34 Å. Bien que les deux hélices D d'un dimère de Fis soient orientées correctement pour s'insérer dans les grands sillons , elles ne sont espacées que de 25 Å. La fixation de Fis résulte ainsi en une courbure de l'ADN ( Figure 11
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	orientation	orientation	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	groupements	groupement	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	phosphate	phosphate	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	ADN	ADN	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	responsables	responsable	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
10	des	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	interactions	interaction	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	avec	avec	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	Fis	Fis	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	est	être	VRB	_	_	28	det	_	_	_	_	_
15	telle	tel	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	que	que	CSU	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	distance	distance	NOM	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
19	entre	entre	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	deux	deux	NUM	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
21	grands	grand	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	sillons	sillon	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	varie	varier	VRB	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	29	29	NUM	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
26	à	à	PRE	_	_	24	para	_	_	_	_	_
27	34	34	NUM	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	Å.	Å.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
29	Bien	Bien	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	que	que	CSU	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
31	les	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
32	deux	deux	NUM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
33	hélices	hélice	NOM	_	_	41	subj	_	_	_	_	_
34	D	D	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	d'	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	un	un	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	dimère	dimère	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	Fis	Fis	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	soient	être	VRB	_	_	41	aux	_	_	_	_	_
41	orientées	orienter	VPP	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
42	correctement	correctement	ADV	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	pour	pour	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	s'	s'	CLI	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
45	insérer	insérer	VNF	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	dans	dans	PRE	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	les	le	DET	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
48	grands	grand	ADJ	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
49	sillons	sillon	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
50	,	,	PUNC	_	_	72	punc	_	_	_	_	_
51	elles	elles	CLS	_	_	54	subj	_	_	_	_	_
52	ne	ne	ADV	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
53	sont	être	VRB	_	_	54	aux	_	_	_	_	_
54	espacées	espacer	VPP	_	_	28	det	_	_	_	_	_
55	que	que	CSU	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	de	de	PRE	_	_	63	periph	_	_	_	_	_
57	25	25	NUM	_	_	58	spe	_	_	_	_	_
58	Å.	Å.	NOM	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
59	La	La	DET	_	_	60	spe	_	_	_	_	_
60	fixation	fixation	NOM	_	_	63	subj	_	_	_	_	_
61	de	de	PRE	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
62	Fis	Fis	NOM	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
63	résulte	résulter	VRB	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
64	ainsi	ainsi	ADV	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
65	en	en	PRE	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
66	une	un	DET	_	_	67	spe	_	_	_	_	_
67	courbure	courbure	NOM	_	_	65	dep	_	_	_	_	_
68	de	de	PRE	_	_	67	dep	_	_	_	_	_
69	l'	le	DET	_	_	70	spe	_	_	_	_	_
70	ADN	ADN	NOM	_	_	68	dep	_	_	_	_	_
71	(	(	PUNC	_	_	70	punc	_	_	_	_	_
72	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
73	11	11	NUM	_	_	72	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-570
# text = C et 15B ) d'environ 50 à 90 ° .
1	C	C	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	et	et	COO	_	_	3	mark	_	_	_	_	_
3	15B	15B	NUM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	)	)	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
5	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	environ	environ	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	50	50	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	90	90	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	°	degré	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-571
# text = La régulation de Fis
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	régulation	régulation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-572
# text = Le gène fis est le deuxième gène d'un opéron comportant également dusB , codant une dihydrouridine synthase .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	gène	gène	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	est	est	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	le	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
6	deuxième	deuxième	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	gène	gène	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	d'	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	un	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	opéron	opéron	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	comportant	comporter	VPR	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	également	également	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	dusB	dusB	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	codant	coder	VPR	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
16	une	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
17	dihydrouridine	dihydrouridine	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	synthase	synthase	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-573
# text = L'opéron dusB-fis est sous le contrôle d'un promoteur unique , fisP .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	opéron	opéron	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	dusB-fis	dusB-fis	A+V	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	est	est	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	sous	sous	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	le	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	contrôle	contrôle	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	d'	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	un	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	promoteur	promoteur	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	unique	unique	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	fisP	fisP	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-574
# text = Le nombre de molécules de Fis varie de façon importante au cours du cycle cellulaire .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	nombre	nombre	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	molécules	molécule	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	Fis	Fis	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	varie	varier	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	façon	façon	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	importante	important	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	au	au cours de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	cours	au cours de	DET	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	du	au cours de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	cycle	cycle	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-575
# text = Il est maximal lors de l'entrée en phase exponentielle , environ 1h après dilution dans du milieu frais ( plus de 50 000 molécules ) , puis diminue jusqu'à une quasi-disparition de Fis en phase stationnaire ( moins de 100 molécules ) .
1	Il	il	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	maximal	maximal	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	lors	lors de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	lors de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	entrée	entrée	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	en	en	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	phase	phase	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
12	environ	environ	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	1h	1h	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	après	après	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	dilution	dilution	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	dans	dans	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	du	de+le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	milieu	milieu	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	frais	frais	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	(	(	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
21	plus	plus	ADV	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	18	parenth	_	_	_	_	_
23	50	50	NUM	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	000	000	NUM	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	molécules	molécule	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	)	)	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
28	puis	puis	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
29	diminue	diminuer	VRB	_	_	2	para	_	_	_	_	_
30	jusqu'à	jusqu'à	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	une	un	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	quasi-disparition	quasi-	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	Fis	Fis	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	en	en	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
36	phase	phase	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	(	(	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
39	moins	moins	NOM	_	_	36	parenth	_	_	_	_	_
40	de	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	100	100	NUM	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	molécules	molécule	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	)	)	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
44	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-576
# text = Régulation transcriptionnelle
1	Régulation	régulation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	transcriptionnelle	transcriptionnel	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-577
# text = Le promoteur fisP est reconnu par le facteur sigma végétatif & 207;& 131; 70 ( Figure 16 ) , même si la boîte - 35 est plus éloignée de la séquence consensus .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	promoteur	promoteur	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	fisP	fisP	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	est	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	reconnu	reconnaître	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
8	facteur	facteur	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	sigma	sigma	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	végétatif	végétatif	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	σ	σ	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	70	70	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	(	(	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	Figure	Figure	NOM	_	_	9	parenth	_	_	_	_	_
15	16	16	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	)	)	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
18	même	même si	CSU	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	si	même si	CSU	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	boîte	boîte	NOM	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
22	-	- 35	PUNC	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	35	35	NUM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	est	être	VRB	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
25	plus	plus	ADV	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	éloignée	éloigné	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	séquence	séquence	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	consensus	consensus	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-578
# text = Quatre caractéristiques de ce promoteur sont à l'origine d'une forte transcription en phase exponentielle , suivie d'un arrêt en phase stationnaire .
1	Quatre	quatre	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	caractéristiques	caractéristique	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ce	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	promoteur	promoteur	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	origine	origine	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	d'	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
12	forte	fort	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	transcription	transcription	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	en	en	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	phase	phase	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	suivie	suivre	VPP	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
19	d'	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	un	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	arrêt	arrêt	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	en	en	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	phase	phase	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-579
# text = Premièrement , ce promoteur se caractérise par la présence d'une séquence riche en GC entre la boîte - 10 et le site d'initiation de la transcription , appelée discriminateur
1	Premièrement	premièrement	ADV	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	ce	ce	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	promoteur	promoteur	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	se	se	CLI	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	caractérise	caractériser	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	par	par	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	présence	présence	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	d'	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	séquence	séquence	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	riche	riche	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	en	en	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	GC	GC	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	entre	entre	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	boîte	boîte	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	-	- 10	PUNC	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	10	10	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
22	le	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	site	site	NOM	_	_	18	para	_	_	_	_	_
24	d'	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	initiation	initiation	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	transcription	transcription	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
30	appelée	appeler	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	discriminateur	discriminateur	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-580
# text = ( Figure 16
1	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	16	16	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-581
# text = ; Walker et al. , 1999 ) .
1	;	;	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	Walker	Walker	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
4	al.	al.	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	1999	1999	NUM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-582
# text = Cette séquence crée une barrière énergétique pour l'ouverture de la double hélice lors de l'initiation de la transcription .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	séquence	séquence	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	crée	créer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	une	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	barrière	barrière	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	énergétique	énergétique	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	pour	pour	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	ouverture	ouverture	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
12	double	double	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	hélice	hélice	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	lors	lors de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
15	de	lors de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	initiation	initiation	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	transcription	transcription	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-583
# text = Elle constitue la signature de gènes dont la transcription nécessite une superhélicité négative de l'ADN élevée .
1	Elle	elle	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	constitue	constituer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	signature	signature	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	gènes	gène	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	dont	dont	PRQ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	transcription	transcription	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
10	nécessite	nécessiter	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	négative	négatif	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	ADN	ADN	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	élevée	élevé	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-584
# text = En effet , fis est activé par une superhélicité forte , caractéristique de la phase exponentielle de croissance ( voir paragraphe IV.A. ) .
1	En	en	PRE	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	effet	effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	est	est	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
6	activé	activer	VPP	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	par	par	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	une	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	forte	fort	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
12	caractéristique	caractéristique	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	phase	phase	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	croissance	croissance	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	(	(	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	voir	voir	VNF	_	_	4	parenth	_	_	_	_	_
21	paragraphe	paragraphe	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	IV.A.	IV.A.	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	)	)	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-585
# text = Ceci est à la base du contrôle homéostatique de la superhélicité de l'ADN par Fis .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	à	à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	base	base	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	du	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	contrôle	contrôle	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	homéostatique	homéostatique	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	ADN	ADN	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	par	par	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
16	Fis	Fis	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-586
# text = Deuxièmement , deux sites d'initiation de la transcription sont observés , dont le majeur est situé 8 pb après la boîte - 10 ( Figure 16 ) et fait intervenir un CTP comme nucléotide initiateur .
1	Deuxièmement	deuxièmement	NUM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	deux	deux	NUM	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	sites	site	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
5	d'	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	initiation	initiation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	transcription	transcription	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	sont	être	VRB	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	observés	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
13	dont	dont	PRQ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
14	le	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	majeur	majeur	ADJ	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
16	est	être	VRB	_	_	11	para	_	_	_	_	_
17	situé	situer	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	8	8	NUM	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	pb	problème	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	après	après	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	boîte	boîte	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	-	- 10	PUNC	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	10	10	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	(	(	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	Figure	Figure	NOM	_	_	22	parenth	_	_	_	_	_
27	16	16	NUM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	)	)	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
29	et	et	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
30	fait	faire	VRB	_	_	16	para	_	_	_	_	_
31	intervenir	intervenir	VNF	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	un	un	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	CTP	CTP	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	comme	comme	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
35	nucléotide	nucléotide	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	initiateur	initiateur	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-587
# text = Le second est situé 2 pb en amont et implique un GTP , mais ne participe que très faiblement à l'initiation de la transcription .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	second	second	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	situé	situer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	2	2	NUM	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	pb	problème	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
7	en	en	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	amont	amont	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	implique	impliquer	VRB	_	_	4	para	_	_	_	_	_
11	un	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	GTP	GTP	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
14	mais	mais	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
15	ne	ne	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	participe	participer	VRB	_	_	10	para	_	_	_	_	_
17	que	que	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	très	très	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	faiblement	faiblement	ADV	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	à	à	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	l'	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	initiation	initiation	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	transcription	transcription	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-588
# text = Le fait d'initier la transcription par un CTP est un phénomène relativement rare chez E. coli , du fait de sa faible abondance , et de la faible interaction qu'il établit avec l'ARN polymérase ( Wu et Goldthwait , 1969 ) .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fait	fait	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	initier	initier	VNF	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	transcription	transcription	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	par	par	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	un	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	CTP	CTP	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	un	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	phénomène	phénomène	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	relativement	relativement	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	rare	rare	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	chez	chez	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
16	E.	E.	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	coli	coli	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	du	du fait de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
20	fait	du fait de	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	de	du fait de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	sa	son	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
23	faible	faible	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	abondance	abondance	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	21	para	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
29	faible	faible	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	interaction	interaction	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
31	qu'	que	PRQ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
32	il	il	CLS	_	_	33	subj	_	_	_	_	_
33	établit	établir	VRB	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
34	avec	avec	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	l'	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
36	ARN	ARN	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
37	polymérase	polymérase	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
38	(	(	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
39	Wu	Wu	NOM	_	_	37	parenth	_	_	_	_	_
40	et	et	COO	_	_	41	mark	_	_	_	_	_
41	Goldthwait	Goldthwait	NOM	_	_	39	para	_	_	_	_	_
42	,	,	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
43	1969	1969	NUM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	)	)	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
45	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-589
# text = Ceci en fait ainsi un remarquable mécanisme de régulation de la transcription pour des gènes qui sont transcrits rapidement puis réprimés tout aussi rapidement , ce qui est le cas de fis .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	en	le	CLI	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	fait	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	ainsi	ainsi	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	un	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
6	remarquable	remarquable	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	régulation	régulation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	transcription	transcription	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	pour	pour	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	des	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	gènes	gène	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	qui	qui	PRQ	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
17	sont	être	VRB	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
18	transcrits	transcrire	VPP	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	rapidement	rapidement	ADV	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	puis	puis	CSU	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
21	réprimés	réprimer	VPP	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	tout	tout	ADV	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	aussi	aussi	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	rapidement	rapidement	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
26	ce	ce	PRQ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
27	qui	qui	PRQ	_	_	28	subj	_	_	_	_	_
28	est	être	VRB	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	le	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	cas	cas	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
32	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-590
# text = En effet , à l'entrée en phase exponentielle de croissance , la concentration en
1	En	en	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	effet	effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
4	à	à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	entrée	entrée	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	en	en	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	phase	phase	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	croissance	croissance	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	concentration	concentration	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	en	en	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-591
# text = CTP augmente , ce qui favorise une activation de la transcription de fis par la stabilisation du complexe ouvert .
1	CTP	CTP	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	augmente	augmenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
4	ce	ce	PRQ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	qui	qui	PRQ	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	favorise	favoriser	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	une	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	activation	activation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	transcription	transcription	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	par	par	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	stabilisation	stabilisation	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	du	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	complexe	complexe	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	ouvert	ouvrir	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-592
# text = En milieu de phase exponentielle , la quantité de CTP disponible diminue fortement , et la transcription de fis aussi et , bien que cette diminution soit due à différents facteurs , elle suit la concentration en CTP de manière remarquable .
1	En	en	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	milieu	milieu	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	phase	phase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	quantité	quantité	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	CTP	CTP	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	disponible	disponible	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	diminue	diminuer	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
13	fortement	fortement	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	transcription	transcription	NOM	_	_	4	para	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	aussi	aussi	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
23	bien	bien que	CSU	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	que	bien que	CSU	_	_	34	periph	_	_	_	_	_
25	cette	ce	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	diminution	diminution	NOM	_	_	28	subj	_	_	_	_	_
27	soit	être	VRB	_	_	28	aux	_	_	_	_	_
28	due	devoir	VPP	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
29	à	à	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	différents	différent	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	facteurs	facteur	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
33	elle	elle	CLS	_	_	34	subj	_	_	_	_	_
34	suit	suivre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
35	la	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	concentration	concentration	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	en	en	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	CTP	CTP	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
40	manière	manière	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	remarquable	remarquable	ADJ	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	.	.	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-593
# text = Le remplacement de ce C par un A entraîne une prolongation de l'expression de fis jusqu'en phase stationnaire .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	remplacement	remplacement	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ce	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	C	C	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	un	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	A	A	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	entraîne	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	une	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	prolongation	prolongation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	expression	expression	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	jusqu'en	jusqu'en	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	phase	phase	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-594
# text = Troisièmement , le promoteur de fis est soumis à une autorépression .
1	Troisièmement	troisièmement	NUM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	le	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	promoteur	promoteur	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	est	est	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	soumis	soumettre	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	une	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	autorépression	auto-	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-595
# text = En effet , Fis se fixe sur son propre promoteur , sur 6 sites répartis des résidus - 231 à + 30 ( Finkel et Johnson , 1992 ; . Fis présente une grande affinité pour les sites I et II , mais c'est surtout le site II qui participe à la répression . En effet , il chevauche la région - 35 du promoteur et , avec le site I , se superpose au site de fixation de l'ARN polymérase . L'hypothèse la plus probable est que la fixation de Fis empêche l'ARN polymérase d'initier la transcription .
1	En	en effet	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	se	se	CLI	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	fixe	fixer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	sur	sur	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	son	son	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
9	propre	propre	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	promoteur	promoteur	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	60	punc	_	_	_	_	_
12	sur	sur	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
13	6	6	NUM	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	sites	site	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	répartis	répartir	VPP	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	résidus	résidu	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	-	- 231	PUNC	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	231	231	NUM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	à	à plus	INT	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	+	à plus	INT	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
22	30	30	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
23	(	(	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
24	Finkel	Finkel	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
26	Johnson	Johnson	NOM	_	_	24	para	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	60	punc	_	_	_	_	_
28	1992	1992	NUM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	;	;	PUNC	_	_	60	punc	_	_	_	_	_
30	.	.	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
31	Fis	Fis	NOM	_	_	32	subj	_	_	_	_	_
32	présente	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
33	une	un	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
34	grande	grand	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
35	affinité	affinité	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
36	pour	pour	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
37	les	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	sites	site	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	I	I	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	et	et	COO	_	_	41	mark	_	_	_	_	_
41	II	II	NOM	_	_	38	para	_	_	_	_	_
42	,	,	PUNC	_	_	45	punc	_	_	_	_	_
43	mais	mais	COO	_	_	45	mark	_	_	_	_	_
44	c'	ce	CLS	_	_	45	subj	_	_	_	_	_
45	est	être	VRB	_	_	32	para	_	_	_	_	_
46	surtout	surtout	ADV	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	le	le	DET	_	_	48	spe	_	_	_	_	_
48	site	site	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
49	II	II	ADJ	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	qui	qui	PRQ	_	_	51	subj	_	_	_	_	_
51	participe	participer	VRB	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
52	à	à	PRE	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	la	le	DET	_	_	54	spe	_	_	_	_	_
54	répression	répression	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
55	.	.	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
56	En	En	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
57	effet	effet	NOM	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
58	,	,	PUNC	_	_	60	punc	_	_	_	_	_
59	il	il	CLS	_	_	60	subj	_	_	_	_	_
60	chevauche	chevaucher	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
61	la	le	DET	_	_	62	spe	_	_	_	_	_
62	région	région	NOM	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
63	-	- 35	PUNC	_	_	62	dep	_	_	_	_	_
64	35	35	NUM	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
65	du	de	PRE	_	_	62	dep	_	_	_	_	_
66	promoteur	promoteur	NOM	_	_	65	dep	_	_	_	_	_
67	et	et	COO	_	_	75	mark	_	_	_	_	_
68	,	,	PUNC	_	_	75	punc	_	_	_	_	_
69	avec	avec	PRE	_	_	75	periph	_	_	_	_	_
70	le	le	DET	_	_	71	spe	_	_	_	_	_
71	site	site	NOM	_	_	69	dep	_	_	_	_	_
72	I	I	NOM	_	_	71	dep	_	_	_	_	_
73	,	,	PUNC	_	_	75	punc	_	_	_	_	_
74	se	se	CLI	_	_	75	dep	_	_	_	_	_
75	superpose	superposer	VRB	_	_	60	para	_	_	_	_	_
76	au	à	PRE	_	_	75	dep	_	_	_	_	_
77	site	site	NOM	_	_	76	dep	_	_	_	_	_
78	de	un	DET	_	_	79	spe	_	_	_	_	_
79	fixation	fixation	NOM	_	_	75	subj	_	_	_	_	_
80	de	de	PRE	_	_	79	dep	_	_	_	_	_
81	l'	le	DET	_	_	83	spe	_	_	_	_	_
82	ARN	ARN	NOM	_	_	83	dep	_	_	_	_	_
83	polymérase	polymérase	NOM	_	_	80	dep	_	_	_	_	_
84	.	.	PUNC	_	_	60	punc	_	_	_	_	_
85	L'	L'	DET	_	_	86	spe	_	_	_	_	_
86	hypothèse	hypothèse	NOM	_	_	90	subj	_	_	_	_	_
87	la	le	DET	_	_	89	spe	_	_	_	_	_
88	plus	plus	ADV	_	_	89	dep	_	_	_	_	_
89	probable	probable	ADJ	_	_	86	dep	_	_	_	_	_
90	est	être	VRB	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
91	que	que	CSU	_	_	90	dep	_	_	_	_	_
92	la	le	DET	_	_	93	spe	_	_	_	_	_
93	fixation	fixation	NOM	_	_	96	subj	_	_	_	_	_
94	de	de	PRE	_	_	93	dep	_	_	_	_	_
95	Fis	Fis	NOM	_	_	94	dep	_	_	_	_	_
96	empêche	empêcher	VRB	_	_	91	dep	_	_	_	_	_
97	l'	le	DET	_	_	99	spe	_	_	_	_	_
98	ARN	ARN	NOM	_	_	99	dep	_	_	_	_	_
99	polymérase	polymérase	NOM	_	_	96	dep	_	_	_	_	_
100	d'	de	PRE	_	_	96	dep	_	_	_	_	_
101	initier	initier	VNF	_	_	100	dep	_	_	_	_	_
102	la	le	DET	_	_	103	spe	_	_	_	_	_
103	transcription	transcription	NOM	_	_	101	dep	_	_	_	_	_
104	.	.	PUNC	_	_	60	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-596
# text = Quatrièmement , le promoteur de fis est soumis au contrôle stringent , c'est-à-dire à la répression par ( p ) ppGpp , l'effecteur de la réponse stringente permettant la réponse aux carences nutritionnelles .
1	Quatrièmement	quatrièmement	ADV	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	le	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	promoteur	promoteur	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	est	est	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	soumis	soumettre	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	au	à	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	contrôle	contrôle	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	stringent	astringent	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
13	c'	c'est-à-dire	COO	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	est-à-dire	c'est-à-dire	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	9	para	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	répression	répression	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	par	par	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	(	(	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	p	p	ADJ	_	_	22	parenth	_	_	_	_	_
21	)	)	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
22	ppGpp	ppGpp	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
24	l'	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	effecteur	effecteur	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	réponse	réponse	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	stringente	astringent	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	permettant	permettre	VPR	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	la	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	réponse	réponse	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	aux	à	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	carences	carence	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	nutritionnelles	nutritionnel	ADJ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-597
# text = Les nucléotides ( p ) ppGpp sont synthétisés lors de carences nutritionnelles .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	nucléotides	nucléotide	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	(	(	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	p	page	NOM	_	_	2	parenth	_	_	_	_	_
5	)	)	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
6	ppGpp	ppGpp	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	sont	être	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	synthétisés	synthétiser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	lors	lors de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	lors de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	carences	carence	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	nutritionnelles	nutritionnel	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-598
# text = Ils répriment alors les gènes nécessaires à la croissance et activent certains gènes nécessaires à la survie .
1	Ils	ils	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	répriment	réprimer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	alors	alors	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	gènes	gène	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	nécessaires	nécessaire	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	croissance	croissance	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
11	activent	activer	VRB	_	_	2	para	_	_	_	_	_
12	certains	certain	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	gènes	gène	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	nécessaires	nécessaire	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	survie	survie	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-599
# text = Une des caractéristiques des promoteurs régulés négativement par la réponse stringente est la présence du discriminateur riche en GC entre la région - 10 et le + 1 de transcription .
1	Une	un	PRQ	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
2	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	caractéristiques	caractéristique	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	des	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	régulés	réguler	VPP	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	négativement	négativement	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	par	par	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	réponse	réponse	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	stringente	astringent	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	présence	présence	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	du	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	discriminateur	discriminateur	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	riche	riche	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	en	en	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	GC	GC	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	entre	entre	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	région	région	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	-	- 10	PUNC	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	10	10	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
26	le	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	+	+ 1	PRE	_	_	22	para	_	_	_	_	_
28	1	1	NUM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	transcription	transcription	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-600
# text = Le promoteur de fis est ainsi soumis à la répression par ( p ) ppGpp .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	promoteur	promoteur	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	est	est	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ainsi	ainsi	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	soumis	soumettre	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	répression	répression	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	p	p	ADJ	_	_	15	parenth	_	_	_	_	_
14	)	)	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
15	ppGpp	ppGpp	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-601
# text = Le contrôle stringent ainsi exercé sur fisP participe donc également à la chute de transcrits observée avant le passage en phase stationnaire .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	contrôle	contrôle	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	stringent	astringent	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ainsi	ainsi	ADV	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
5	exercé	exercer	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	sur	sur	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	fisP	fisP	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	participe	participer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	donc	donc	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	également	également	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	chute	chute	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	transcrits	transcrire	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	observée	observer	VPP	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	avant	avant	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	le	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	passage	passage	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	en	en	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	phase	phase	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-602
# text = A côté des différents niveaux de régulation transcriptionnelle précédents , un autre régulateur est impliqué dans l'activation de l'opéron dusB-fis :
1	A	à côté de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	côté	à côté de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	des	à côté de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
4	différents	différent	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	niveaux	niveau	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	régulation	régulation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	transcriptionnelle	transcriptionnel	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	précédents	précédent	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
11	un	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
12	autre	autre	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	régulateur	régulateur	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
14	est	est	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	impliqué	impliquer	VPP	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	dans	dans	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	activation	activation	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	opéron	opéron	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	dusB-fis	dusB-fis	A+V	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	:	:	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-603
# text = IHF .
1	IHF	ihf	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-604
# text = Un site de fixation d'IHF est centré 114 pb en amont du + 1 de transcription du gène fis .
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	site	site	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	fixation	fixation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	d'	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	IHF	IHF	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	centré	centrer	NUM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	114	114	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	pb	problème	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	en	en amont de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	amont	en amont de	DET	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	du	en amont de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	+	+ 1	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	1	1	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	transcription	transcription	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	du	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	gène	gène	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-605
# text = La fixation d'IHF sur ce site entraîne une activation de la transcription de 3 ou 4 fois .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fixation	fixation	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	IHF	IHF	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	sur	sur	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	ce	ce	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	site	site	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	entraîne	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	une	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	activation	activation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	transcription	transcription	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	3	3	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	ou	ou	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
17	4	4	NUM	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	fois	fois	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-606
# text = Régulation traductionnelle
1	Régulation	régulation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	traductionnelle	traductionnel	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-607
# text = La régulation de l'expression de fis s'exerce également au niveau de la traduction par une protéine à activité GTPase , appelée BipA , et qui présente des homologies avec des facteurs d'élongation de type EF-G .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	régulation	régulation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	expression	expression	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	s'	s'	CLI	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	exerce	exercer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	également	également	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	au	à	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	niveau	niveau	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	traduction	traduction	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	par	par	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	une	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	protéine	protéine	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	à	à	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	activité	activité	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	GTPase	GTPase	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
23	appelée	appelé	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	BipA	BipA	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
27	qui	qui	PRQ	_	_	28	subj	_	_	_	_	_
28	présente	présenter	VRB	_	_	19	para	_	_	_	_	_
29	des	un	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	homologies	homologie	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	avec	avec	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
32	des	un	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	facteurs	facteur	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	d'	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	élongation	élongation	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	de	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	type	type	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	EF-G	EF-G	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-608
# text = Son profil d'expression est similaire à celui de Fis :
1	Son	son	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	profil	profil	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	expression	expression	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	similaire	similaire	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	celui	celui	PRQ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	Fis	Fis	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	:	:	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-609
# text = de très abondante en début de phase exponentielle , BipA devient quasiment indétectable après 3h de culture .
1	de	de	PRE	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	très	très	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	abondante	abondant	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	en	en	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	début	début	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	phase	phase	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
10	BipA	BipA	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
11	devient	devenir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	quasiment	quasiment	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	indétectable	indétectable	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	après	après	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	3h	3h	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	culture	culture	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-610
# text = BipA interagit avec les ribosomes et son rôle est de favoriser l'initiation de la traduction de l'ARNm de fis .
1	BipA	bipper	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	interagit	interagir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	avec	avec	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	ribosomes	ribosome	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	7	mark	_	_	_	_	_
7	son	son	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	rôle	rôle	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
9	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	favoriser	favoriser	VNF	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	initiation	initiation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	traduction	traduction	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	ARNm	ARNm	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-611
# text = En effet , des interactions particulièrement fortes existent entre la région 5 'non traduite de l'ARNm de fis et les ribosomes , et BipA permettrait de déstabiliser ces interactions pour débuter l'initiation de la traduction par les ribosomes ( Figure 17
1	En	en effet	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	interactions	interaction	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
6	particulièrement	particulièrement	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	fortes	fort	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	existent	exister	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	entre	entre	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	région	région	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	5	5	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	'	'	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
14	non	non	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	traduite	traduire	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	ARNm	ARNm	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
22	les	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	ribosomes	ribosome	NOM	_	_	27	subj	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
26	BipA	BipA	NOM	_	_	23	para	_	_	_	_	_
27	permettrait	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	déstabiliser	déstabiliser	VNF	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	ces	ce	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	interactions	interaction	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	pour	pour	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
33	débuter	débuter	VNF	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	l'	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	initiation	initiation	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	de	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	la	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	traduction	traduction	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	par	par	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	les	le	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	ribosomes	ribosome	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	(	(	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
43	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
44	17	17	NUM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-612
# text = ; Owens et al. , 2004 ) .
1	;	;	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	Owens	Owens	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	4	mark	_	_	_	_	_
4	al.	al.	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	2004	2004	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-613
# text = Les auteurs émettent deux hypothèses principales quant au rôle physiologique de BipA :
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	auteurs	auteur	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	émettent	émettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	deux	deux	NUM	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	hypothèses	hypothèse	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	principales	principal	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	quant	quant à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	au	quant à	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
9	rôle	rôle	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	physiologique	physiologique	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	BipA	BipA	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	:	:	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-614
# text = la première est que l'interaction
1	la	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	première	premier	ADJ	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	que	que?	PRQ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	interaction	interaction	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-615
# text = BipA-ribosomes permettrait de recruter ceux  -ci pour traduire fis , ce qui est indispensable en phase exponentielle , c'est-à-dire au moment où la traduction de nombreux ARNs est en cours .
1	BipA-ribosomes	BipA-ribosomes	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	permettrait	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
4	recruter	recruter	VNF	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ceux	celui	PRQ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	 -ci	 -ci	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	pour	pour	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	traduire	traduire	VNF	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	ce	ce	PRQ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	qui	qui	PRQ	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
13	est	être	VRB	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	indispensable	indispensable	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	en	en	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	phase	phase	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
19	c'	c'est-à-dire	COO	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	est-à-dire	c'est-à-dire	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
21	au	à	PRE	_	_	15	para	_	_	_	_	_
22	moment	moment	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	où	où	PRQ	_	_	29	periph	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	traduction	traduction	NOM	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	nombreux	nombreux	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	ARNs	ARNs	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	est	être	VRB	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
30	en	en cours	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	cours	en cours	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-616
# text = Ceci permettrait ainsi une synthèse préférentielle et rapide de Fis en début de phase exponentielle et une synthèse continue pendant la phase exponentielle .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	permettrait	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	ainsi	ainsi	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	une	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	synthèse	synthèse	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	préférentielle	préférentiel	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	rapide	rapide	ADJ	_	_	6	para	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	Fis	Fis	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	en	en début de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
12	début	en début de	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	en début de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	phase	phase	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
17	une	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	synthèse	synthèse	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
19	continue	continuer	VRB	_	_	2	para	_	_	_	_	_
20	pendant	pendant	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	phase	phase	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-617
# text = La seconde hypothèse est que l'activité GTPase de BipA aurait un rôle de senseur de la concentration en GTP , et ne permettrait la traduction de fis que lorsque la concentration est optimale , la traduction étant un phénomène particulièrement consommateur de GTP .
1	La	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	seconde	second	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	hypothèse	hypothèse	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	que	que	CSU	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	activité	activité	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
8	GTPase	GTPase	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	BipA	BipA	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	aurait	avoir	VRB	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
12	un	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	rôle	rôle	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	senseur	senseur	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	concentration	concentration	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	en	en	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	GTP	GTP	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
23	ne	ne	ADV	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	permettrait	permettre	VRB	_	_	11	para	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	traduction	traduction	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
28	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
29	que	que?	PRQ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
30	lorsque	lorsque	CSU	_	_	0	root	_	_	_	_	_
31	la	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	concentration	concentration	NOM	_	_	33	subj	_	_	_	_	_
33	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
34	optimale	optimal	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
36	la	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	traduction	traduction	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
38	étant	être	VPR	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	un	un	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	phénomène	phénomène	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	particulièrement	particulièrement	ADV	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
42	consommateur	consommateur	ADJ	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	de	de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
44	GTP	GTP	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	.	.	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-618
# text = Un second niveau de régulation de la traduction de Fis est réalisé par l'intermédiaire des polyamines ( putrescine , spermidine et spermine ) , la quantité de Fis augmentant en leur présence .
1	Un	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	second	second	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	niveau	niveau	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	régulation	régulation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	traduction	traduction	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	Fis	Fis	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	est	être	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	réalisé	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	par	par	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	intermédiaire	intermédiaire	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	polyamines	polyamine	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	(	(	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	putrescine	putrescence	NOM	_	_	17	parenth	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	spermidine	spermicide	NOM	_	_	19	para	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	spermine	permien	NOM	_	_	21	para	_	_	_	_	_
24	)	)	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
26	la	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	quantité	quantité	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	Fis	Fis	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	augmentant	augmenter	VPR	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
31	en	en	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	leur	son	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	présence	présence	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-619
# text = Ces petites molécules interagissent avec les ARNs messagers et affectent ainsi la traduction des protéines .
1	Ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	petites	petit	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	molécules	molécule	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	interagissent	interagir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	avec	avec	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
7	ARNs	ARNs	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	messagers	messagers	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	affectent	affecter	VRB	_	_	4	para	_	_	_	_	_
11	ainsi	ainsi	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	traduction	traduction	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	des	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	protéines	protéine	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-620
# text = En déstabilisant les ARNm doubles brins , les polyamines rendent libre la séquence de Shine-Dalgarno , sur laquelle la sous-unité 30S du ribosome peut ensuite venir se fixer .
1	En	en	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	déstabilisant	déstabiliser	VPR	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	les	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	ARNm	ARNm	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	doubles	double	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	brins	brin	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	polyamines	polyamine	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
10	rendent	rendre	VRB	_	_	24	periph	_	_	_	_	_
11	libre	libre	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	séquence	séquence	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	Shine-Dalgarno	Shine-Dalgarno	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
17	sur	sur	PRE	_	_	24	periph	_	_	_	_	_
18	laquelle	lequel	PRQ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	sous-unité	sous-	NOM	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
21	30S	30S	NUM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	du	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	ribosome	ribosome	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	peut	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
25	ensuite	ensuite	ADV	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	venir	venir	VNF	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	se	se	CLI	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	fixer	fixer	VNF	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-621
# text = Autres rôles de Fis dans la cellule
1	Autres	autre	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	rôles	rôle	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	cellule	cellule	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-622
# text = En plus de son rôle dans le maintien d'un niveau optimal de superhélicité de l'ADN , Fis intervient dans de nombreux processus cellulaires fondamentaux .
1	En	en plus de	PRE	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
2	plus	en plus de	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	en plus de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	son	son	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	rôle	rôle	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	dans	dans	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	le	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	maintien	maintien	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	un	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	niveau	niveau	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	optimal	optimal	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	ADN	ADN	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
19	Fis	Fis	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
20	intervient	intervenir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	dans	dans	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	de	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
23	nombreux	nombreux	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	processus	processus	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	cellulaires	cellulaire	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	fondamentaux	fondamental	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-623
# text = Fis est en effet un régulateur de la transcription de nombreux gènes , mais est également impliquée dans la réplication du chromosome et dans des phénomènes de recombinaison et d'inversion site-spécifique .
1	Fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	en	en	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	effet	effet	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	un	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	régulateur	régulateur	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	transcription	transcription	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	nombreux	nombreux	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	gènes	gène	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
14	mais	mais	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	est	est	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
16	également	également	ADV	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
17	impliquée	impliquer	VPP	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
18	dans	dans	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	réplication	réplication	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	du	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	chromosome	chromosome	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	et	et	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
24	dans	dans	PRE	_	_	21	para	_	_	_	_	_
25	des	un	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	phénomènes	phénomène	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	et	et	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
30	d'	de	PRE	_	_	27	para	_	_	_	_	_
31	inversion	inversion	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	site-spécifique	site	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-624
# text = Régulateur global de l'expression des gènes
1	Régulateur	régulateur	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	global	global	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	expression	expression	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	des	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	gènes	gène	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-625
# text = Fis est connue pour réguler la transcription d'un grand nombre de gènes .
1	Fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	est	est	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	connue	connaître	VPP	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	pour	pour	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	réguler	réguler	VNF	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	transcription	transcription	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	d'	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	un	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
10	grand	grand	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	nombre	nombre	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	gènes	gène	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-626
# text = Parmi ceux  -ci , Fis active la transcription des promoteurs d'ARN ribosomiques et d'ARN de transfert .
1	Parmi	parmi	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	ceux	celui	PRQ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	 -ci	 -ci	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	Fis	Fis	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	active	activer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	transcription	transcription	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	des	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	d'	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	ARN	ARN	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	ribosomiques	ribosomiques	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	d'	de	PRE	_	_	11	para	_	_	_	_	_
16	ARN	ARN	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	transfert	transfert	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-627
# text = Fis interagit avec 3 sites de fixation situés en amont du promoteur P1 de rrnB , mais c'est la fixation sur le site I qui est la plus importante pour l'activation du promoteur ( Figure 18 ) .
1	Fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	interagit	interagir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	avec	avec	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	3	3	NUM	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	sites	site	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	fixation	fixation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	situés	situer	VPP	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	en	en amont de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	amont	en amont de	DET	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	du	en amont de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	promoteur	promoteur	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	P1	P1	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	rrnB	rrnB	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
17	mais	mais	ADV	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	c'	ce	CLS	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
19	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	fixation	fixation	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	sur	sur	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	le	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	site	site	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	I	I	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	qui	qui	PRQ	_	_	27	subj	_	_	_	_	_
27	est	être	VRB	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
29	plus	plus	ADV	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	importante	important	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
31	pour	pour	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
32	l'	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	activation	activation	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	du	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	promoteur	promoteur	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	(	(	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
37	Figure	Figure	NOM	_	_	35	parenth	_	_	_	_	_
38	18	18	NUM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	)	)	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
40	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-628
# text = En plus de modifications structurales de l'ADN ( voir plus haut ) , la fixation d'un dimère de Fis sur ce site permet son interaction avec la sous-unité & 206;& 177; de l'ARN polymérase ( Figure 19 ) , par l'intermédiaire des résidus situés à des positions comprises entre 68 et 74 d'un des monomères de Fis , c'est-à-dire situés à la connexion entre les hélices B et C ( Figure 15
1	En	en	PRE	_	_	25	periph	_	_	_	_	_
2	plus	plus	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	modifications	modification	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	structurales	structural	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	ADN	ADN	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	(	(	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	voir	voir	VNF	_	_	8	parenth	_	_	_	_	_
11	plus	plus	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	haut	haut	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	)	)	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	fixation	fixation	NOM	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
17	d'	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	un	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	dimère	dimère	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	Fis	Fis	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	sur	sur	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	ce	ce	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	site	site	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	permet	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	son	son	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	interaction	interaction	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	avec	avec	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	sous-unité	sous-	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	α	α	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	l'	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	ARN	ARN	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	polymérase	polymérase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
36	(	(	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
37	Figure	Figure	NOM	_	_	35	parenth	_	_	_	_	_
38	19	19	NUM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	)	)	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
40	,	,	PUNC	_	_	75	punc	_	_	_	_	_
41	par	par	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
42	l'	le	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	intermédiaire	intermédiaire	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	des	de	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	résidus	résidu	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	situés	situer	VPP	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	à	à	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	des	un	DET	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
49	positions	position	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	comprises	comprendre	VPP	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	entre	entre	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	68	68	NUM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	et	et	COO	_	_	54	mark	_	_	_	_	_
54	74	74	NUM	_	_	52	para	_	_	_	_	_
55	d'	de	PRE	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	un	un	PRQ	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
57	des	de	PRE	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
58	monomères	monomère	NOM	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
59	de	de	PRE	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
60	Fis	Fis	NOM	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
61	,	,	PUNC	_	_	75	punc	_	_	_	_	_
62	c'	c'est-à-dire	ADV	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
63	est-à-dire	c'est-à-dire	ADV	_	_	64	periph	_	_	_	_	_
64	situés	situer	VPP	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
65	à	à	PRE	_	_	64	dep	_	_	_	_	_
66	la	le	DET	_	_	67	spe	_	_	_	_	_
67	connexion	connexion	NOM	_	_	65	dep	_	_	_	_	_
68	entre	entre	PRE	_	_	67	dep	_	_	_	_	_
69	les	le	DET	_	_	70	spe	_	_	_	_	_
70	hélices	hélice	NOM	_	_	68	dep	_	_	_	_	_
71	B	B	NOM	_	_	70	dep	_	_	_	_	_
72	et	et	COO	_	_	73	mark	_	_	_	_	_
73	C	C	NOM	_	_	71	para	_	_	_	_	_
74	(	(	PUNC	_	_	73	punc	_	_	_	_	_
75	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
76	15	15	NUM	_	_	75	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-629
# text = ;
1	;	;	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-630
# text = . La présence de 3 sites de fixation de Fis consécutifs pourrait induire une plus grande torsion de l'ADN et ainsi un plus grand contact avec l'ARN polymérase .
1	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
2	La	La	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	présence	présence	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	3	3	NUM	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	sites	site	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	fixation	fixation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	Fis	Fis	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	consécutifs	consécutif	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	induire	induire	VNF	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	une	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
15	plus	plus	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	grande	grand	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	torsion	torsion	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	ADN	ADN	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
22	ainsi	ainsi	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	un	un	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
24	plus	plus	ADV	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	grand	grand	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	contact	contact	NOM	_	_	17	para	_	_	_	_	_
27	avec	avec	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	l'	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
29	ARN	ARN	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	polymérase	polymérase	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-631
# text = Fis est également un régulateur des gènes de topoisomérases , en inhibant la transcription des gènes gyrA et gyrB codant les sous-unités de la gyrase et en activant le gène topA codant la
1	Fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	également	également	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	un	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	régulateur	régulateur	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	des	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	gènes	gène	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	topoisomérases	topoisomérase	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
11	en	le	CLI	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	inhibant	inhiber	VPR	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	transcription	transcription	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	des	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	gènes	gène	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	gyrA	gyrA	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	gyrB	gyrB	ADJ	_	_	17	para	_	_	_	_	_
20	codant	coder	VPR	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	les	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	sous-unités	sous-	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	gyrase	gyrase	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
27	en	en	PRE	_	_	23	para	_	_	_	_	_
28	activant	activer	VPR	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	le	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	gène	gène	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	topA	topA	ADV	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
32	codant	codant	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
33	la	la	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-632
# text = TopoI .
1	TopoI	TopoI	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-633
# text = Fis se lie au promoteur de gyrA , et la transcription est inhibée directement , Fis empêchant la fixation de l'ARN polymérase sur le promoteur .
1	Fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	se	se	CLI	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	lie	lier	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	au	à	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	promoteur	promoteur	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	gyrA	gyrA	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	transcription	transcription	NOM	_	_	5	para	_	_	_	_	_
12	est	est	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	inhibée	inhiber	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	directement	directement	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
16	Fis	Fis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	empêchant	empêcher	VPR	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	fixation	fixation	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	l'	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
22	ARN	ARN	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	polymérase	polymérase	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	sur	sur	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
25	le	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	promoteur	promoteur	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-634
# text = Pour gyrB , le mécanisme est moins clair :
1	Pour	pour	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	gyrB	gyrB	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	moins	moins	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	clair	clair	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	:	:	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-635
# text = l'ARN polymérase se fixe sur le promoteur même en présence de Fis , mais une probable stabilisation de la structure empêcherait le début de la transcription .
1	l'	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	ARN	ARN	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	polymérase	polymérase	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
4	se	se	CLI	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	fixe	fixer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	sur	sur	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	le	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	promoteur	promoteur	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	même	même	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	en	en	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	présence	présence	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
13	Fis	Fis	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
15	mais	mais	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
16	une	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
17	probable	probable	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	stabilisation	stabilisation	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	structure	structure	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	empêcherait	empêcher	VRB	_	_	5	para	_	_	_	_	_
23	le	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	début	début	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	la	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	transcription	transcription	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-636
# text = Fis intervient également dans le contrôle de différentes voies métaboliques en régulant , de façon indirecte cette fois , l'expression de gènes impliqués dans le catabolisme de sources de carbone ou d'acides nucléiques , comme glpK , ntlD , rbsB , cdd et udp .
1	Fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	intervient	intervenir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	également	également	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	dans	dans	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	le	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	contrôle	contrôle	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	différentes	différent	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	voies	voie	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	métaboliques	métabolique	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	en	le	CLI	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	régulant	réguler	VPR	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
14	de	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	façon	façon	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	indirecte	indirect	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	cette	ce	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	fois	fois	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	expression	expression	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	gènes	gène	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	impliqués	impliquer	VPP	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	dans	dans	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	le	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	catabolisme	catabolisme	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	sources	source	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	carbone	carbone	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	ou	ou	COO	_	_	33	mark	_	_	_	_	_
33	d'	de	PRE	_	_	28	para	_	_	_	_	_
34	acides	acide	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	nucléiques	nucléique	ADJ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	,	,	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
37	comme	comme	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
38	glpK	glpK	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	,	,	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
40	ntlD	ntlD	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
41	,	,	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
42	rbsB	rbsB	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
43	,	,	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_
44	cdd	CD	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	et	et	COO	_	_	46	mark	_	_	_	_	_
46	udp	udp	NOM	_	_	42	para	_	_	_	_	_
47	.	.	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-637
# text = La recherche de gènes régulés par Fis a permis à Xu et Johnson
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	recherche	recherche	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	gènes	gène	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	régulés	réguler	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	Fis	Fis	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	a	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	permis	permettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	Xu	Xu	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	Johnson	Johnson	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-638
# text = ( Xu et Johnson , 1995b ) d'en identifier 13 autres , dont 5 seulement ont une fonction connue .
1	(	(	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
2	Xu	Xu	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	4	mark	_	_	_	_	_
4	Johnson	Johnson	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
6	1995b	1995b	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
8	d'	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	en	le	CLI	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	identifier	identifier	VNF	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	13	13	NUM	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	autres	autre	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
14	dont	dont	PRQ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
15	5	5	NUM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
16	seulement	seulement	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	ont	avoir	VRB	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
18	une	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	fonction	fonction	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	connue	connu	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-639
# text = Trois d'entre eux codent pour des protéines nécessaires à la croissance en milieu pauvre :
1	Trois	trois	NUM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
2	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	entre	entre	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	eux	lui	PRQ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	codent	coder	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	pour	pour	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	des	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	protéines	protéine	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	nécessaires	nécessaire	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	croissance	croissance	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
14	milieu	milieu	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	pauvre	pauvre	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	:	:	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-640
# text = des transporteurs du D-xylose ( XylF ) , de la glutamine ( GlnQ ) et des méthylgalactosides
1	des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	transporteurs	transporteur	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	D-xylose	D-xylose	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	(	(	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	XylF	XylF	NOM	_	_	4	parenth	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	3	para	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	glutamine	glutamique	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	GlnQ	GlnQ	NOM	_	_	11	parenth	_	_	_	_	_
14	)	)	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	des	de	PRE	_	_	9	para	_	_	_	_	_
17	méthylgalactosides	méthylgalactosides	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-641
# text = ( MglA ) .
1	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	MglA	MglA	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-642
# text = Les deux autres gènes identifiés codent SdhA , une sous-unité de la succinate déshydrogénase , et AldB , une aldéhyde déshydrogénase qui participe à la détoxification des alcools et aldéhydes ( Xu et Johnson , 1995a ) .
1	Les	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
2	deux	deux	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
3	autres	autre	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	gènes	gène	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	identifiés	identifié	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	codent	coder	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	SdhA	SdhA	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
9	une	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	sous-unité	sous-	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
13	succinate	succint	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	déshydrogénase	déshydrogénase	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
17	AldB	AldB	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
19	une	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	aldéhyde	aldéhyde	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	déshydrogénase	déshydrogénase	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	qui	qui	PRQ	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
23	participe	participer	VRB	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	à	à	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	détoxification	détoxification	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	des	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	alcools	alcool	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	et	et	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
30	aldéhydes	aldéhyde	NOM	_	_	28	para	_	_	_	_	_
31	(	(	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
32	Xu	Xu	NOM	_	_	28	parenth	_	_	_	_	_
33	et	et	COO	_	_	34	mark	_	_	_	_	_
34	Johnson	Johnson	NOM	_	_	32	para	_	_	_	_	_
35	,	,	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
36	1995a	1995a	NUM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	)	)	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
38	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-643
# text = D'autres gènes impliqués dans différentes voies métaboliques et réprimés par Fis ont été identifiés :
1	D'	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	autres	autre	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	gènes	gène	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
4	impliqués	impliquer	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	différentes	différent	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	voies	voie	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	métaboliques	métabolique	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	réprimés	réprimer	VPP	_	_	8	para	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	Fis	Fis	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	ont	avoir	VRB	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	été	être	VPP	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
15	identifiés	identifier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	:	:	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-644
# text = acs , qui code l'acétyl-coenzyme A synthétase , qui permet à la cellule d'utiliser l'acétate lors de carences en sources de carbone et à l'entrée en phase stationnaire  ;
1	acs	cas	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
3	qui	qui	PRQ	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	code	coder	VRB	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	acétyl-coenzyme	acétyle-coenzyme	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	A	A	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	synthétase	synthétase	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
10	qui	qui	PRQ	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
11	permet	permettre	VRB	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	à	à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	cellule	cellule	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
16	utiliser	utiliser	VNF	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	acétate	acétate	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	lors	lors de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	de	lors de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	carences	carence	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	en	en	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
23	sources	source	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	carbone	carbone	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
27	à	à	PRE	_	_	24	para	_	_	_	_	_
28	l'	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	entrée	entrée	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	en	en	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	phase	phase	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	 ;	;	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-645
# text = l'opéron nir , codant une nitrite-réductase cytoplasmique intervenant en conditions d'anaérobiose  ;
1	l'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	opéron	opéron	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	nir	Nir	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
5	codant	coder	VPR	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	nitrite-réductase	nitrite-réductase	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	cytoplasmique	cytoplasmique	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	intervenant	intervenir	VPR	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	en	en	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	conditions	condition	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	anaérobiose	anaérobiose	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	 ;	;	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-646
# text = ou encore l'opéron nrf , actif lui aussi en anaérobiose et responsable de la réduction des nitrites par le formate .
1	ou	ou encore	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
2	encore	ou encore	ADV	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	opéron	opéron	NOM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
5	nrf	nerf	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	actif	actif	NOM	_	_	5	para	_	_	_	_	_
8	lui	lui	PRQ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
9	aussi	aussi	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	en	en	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	anaérobiose	anaérobiose	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	responsable	responsable	NOM	_	_	7	para	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	réduction	réduction	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	des	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	nitrites	nitrite	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	par	par	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	le	le	CLI	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	formate	formater	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-647
# text = Sur un certain nombre de ces promoteurs , Fis agit de concert avec d'autres régulateurs de la transcription et assure ainsi une expression très fine et précise de ces gènes .
1	Sur	sur	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	un	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	certain	certain	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	nombre	nombre	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ces	ce	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
9	Fis	Fis	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
10	agit	agir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	concert	concert	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	avec	avec	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	d'	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
15	autres	autre	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	régulateurs	régulateur	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	transcription	transcription	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
21	assure	assurer	VRB	_	_	10	para	_	_	_	_	_
22	ainsi	ainsi	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	une	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	expression	expression	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	très	très	ADV	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	fine	fin	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
28	précise	précis	ADJ	_	_	26	para	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
30	ces	ce	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	gènes	gène	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-648
# text = De par les gènes qu'elle contrôle , notamment les opérons d'ARNr , la protéine de type histone Fis est donc un point de contrôle clef de la croissance bactérienne .
1	De	de par	PRE	_	_	21	periph	_	_	_	_	_
2	par	de par	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	les	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	gènes	gène	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	qu'	que	PRQ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
6	elle	elle	CLS	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	contrôle	contrôler	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
9	notamment	notamment	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	opérons	opéron	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	ARNr	ARNr	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	protéine	protéine	NOM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	type	type	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	histone	histone	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	Fis	Fis	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	donc	donc	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	un	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	point	point	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	contrôle	contrôle	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	clef	clef	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	croissance	croissance	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	bactérienne	bactérien	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-649
# text = Il a d'ailleurs été récemment démontré que Fis participait à la régulation du facteur & 207;& 131;S spécifique des conditions de stress nutritionnel , en réprimant la transcription de rpoS en phase exponentielle chez S. typhimurium ( Hirsch et Elliott , 2005 ) .
1	Il	il	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	d'	d'ailleurs	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
4	ailleurs	d'ailleurs	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	été	été	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
6	récemment	récemment	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	démontré	démontrer	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	que	que	PRQ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	Fis	Fis	VRB	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	participait	participer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	à	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	régulation	régulation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	du	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	facteur	facteur	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	σS	σS	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	spécifique	spécifique	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	conditions	condition	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	stress	stress	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	nutritionnel	nutritionnel	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	en	en	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
25	réprimant	réprimer	VPR	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	la	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	transcription	transcription	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	rpoS	rpoS	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	en	en	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
31	phase	phase	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	chez	chez	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	S.	S.	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	typhimurium	typhimurium	ADJ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	(	(	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
37	Hirsch	Hirsch	NOM	_	_	34	parenth	_	_	_	_	_
38	et	et	COO	_	_	39	mark	_	_	_	_	_
39	Elliott	Elliott	NOM	_	_	37	para	_	_	_	_	_
40	,	,	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
41	2005	2005	NUM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	)	)	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
43	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-650
# text = Fis agirait ici par le même mécanisme que sur son propre promoteur , c'est-à-dire en empêchant la fixation de l'ARN polymérase à l'ADN .
1	Fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	agirait	agir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	ici	ici	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	par	par	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	le	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
6	même	même	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	que	que	CSU	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	sur	sur	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	son	son	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
11	propre	propre	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	promoteur	promoteur	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
14	c'	c'est-à-dire	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	est-à-dire	c'est-à-dire	ADV	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
16	en	le	CLI	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	empêchant	empêcher	VPR	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	fixation	fixation	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	l'	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
22	ARN	ARN	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	polymérase	polymérase	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	à	à	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
25	l'	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	ADN	ADN	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-651
# text = Enfin , Fis est également impliquée dans le contrôle de l'expression des gènes de virulence dans des souches pathogènes d'E. coli , chez S. flexneri et chez S. typhimurium .
1	Enfin	enfin	ADV	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	Fis	Fis	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
4	est	être	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
5	également	également	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	impliquée	impliquer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	dans	dans	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	contrôle	contrôle	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	expression	expression	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	des	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	gènes	gène	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	virulence	virulence	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	dans	dans	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
18	des	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	souches	souche	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	pathogènes	pathogène	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	d'	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	E.	E.	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	coli	coli	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	chez	chez	PRE	_	_	21	para	_	_	_	_	_
26	S.	S.	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
27	flexneri	flexneri	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	et	et	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
29	chez	chez	PRE	_	_	25	para	_	_	_	_	_
30	S.	S.	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	typhimurium	typhimurium	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-652
# text = En effet , chez S. typhimurium , Fis active des gènes faisant partie des îlots de pathogénicité .
1	En	en effet	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	chez	chez	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	S.	S.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	typhimurium	typhimurium	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
8	Fis	Fis	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
9	active	activer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	des	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	gènes	gène	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	faisant	faire	VPR	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	partie	partie	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	des	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	îlots	îlot	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	pathogénicité	pathogénicité	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-653
# text = La délétion de fis entraîne la diminution de l'expression de hilA et invF , associée à un déficit sérieux de virulence , chez la souris .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	délétion	délétion	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	entraîne	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	diminution	diminution	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	expression	expression	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	hilA	hilA	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	invF	invF	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	associée	associer	VPP	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
17	à	à	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	un	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	déficit	déficit	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	sérieux	sérieux	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	virulence	virulence	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	chez	chez	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	souris	souris	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-654
# text = Ces deux gènes sont responsables de l'activation de plusieurs opérons de SPI- 1 , un îlot de pathogénicité de S. typhimurium qui contient en partie le système de sécrétion de type III .
1	Ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	deux	deux	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	gènes	gène	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	responsables	responsable	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	activation	activation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	opérons	opéron	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	SPI-	SPI-	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	1	1	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
16	un	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	îlot	îlot	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	pathogénicité	pathogénicité	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	S.	S.	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	typhimurium	typhimurium	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	qui	qui	PRQ	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
24	contient	contenir	VRB	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
25	en	en partie	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	partie	en partie	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	le	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	système	système	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	sécrétion	sécrétion	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	type	type	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	III	III	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-655
# text = De plus , la comparaison des profils globaux de transcription entre une souche de référence de S. typhimurium et un mutant dépourvu de Fis a révélé que Fis activait les gènes du système de sécrétion de type III , d'invasion des cellules épithéliales , de la survie dans les macrophages et de fabrication des flagelles , ces gènes étant répartis dans les îlots de pathogénicité SPI- 1 à 5 .
1	De	de plus	PRE	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	comparaison	comparaison	NOM	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
6	des	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	profils	profil	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	globaux	global	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	transcription	transcription	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	entre	entre	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	une	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	souche	souche	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	référence	référence	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	S.	S.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	typhimurium	typhimurium	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
20	un	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	mutant	mutant	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
22	dépourvu	dépourvu	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
24	Fis	Fis	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	a	avoir	VRB	_	_	26	aux	_	_	_	_	_
26	révélé	révéler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
27	que	que	CSU	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	Fis	Fis	NOM	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
29	activait	activer	VRB	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	les	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	gènes	gène	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	du	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	système	système	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	sécrétion	sécrétion	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	de	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	type	type	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	III	III	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	,	,	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
40	d'	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
41	invasion	invasion	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	des	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	cellules	cellule	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	épithéliales	épithélial	ADJ	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	,	,	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_
46	de	de	PRE	_	_	42	para	_	_	_	_	_
47	la	le	DET	_	_	48	spe	_	_	_	_	_
48	survie	survie	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
49	dans	dans	PRE	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	les	le	DET	_	_	51	spe	_	_	_	_	_
51	macrophages	macro-	NOM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
52	et	et	COO	_	_	53	mark	_	_	_	_	_
53	de	de	PRE	_	_	46	para	_	_	_	_	_
54	fabrication	fabrication	NOM	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	des	de	PRE	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	flagelles	flagelle	NOM	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
57	,	,	PUNC	_	_	59	punc	_	_	_	_	_
58	ces	ce	DET	_	_	59	spe	_	_	_	_	_
59	gènes	gène	NOM	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
60	étant	être	VPR	_	_	61	aux	_	_	_	_	_
61	répartis	répartir	VPP	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
62	dans	dans	PRE	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
63	les	le	DET	_	_	64	spe	_	_	_	_	_
64	îlots	îlot	NOM	_	_	62	dep	_	_	_	_	_
65	de	de	PRE	_	_	64	dep	_	_	_	_	_
66	pathogénicité	pathogénicité	NOM	_	_	65	dep	_	_	_	_	_
67	SPI-	SPI-	NOM	_	_	66	dep	_	_	_	_	_
68	1	1	NUM	_	_	66	dep	_	_	_	_	_
69	à	à	PRE	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
70	5	5	NUM	_	_	69	dep	_	_	_	_	_
71	.	.	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-656
# text = Des gènes impliqués dans des voies métaboliques nécessaires à la survie dans l'intestin des mammifères sont régulés négativement par Fis ( utilisation du propanediol , biosynthèse de la biotine , transport de la vitamine B12 , métabolisme de l'acétate , ... ) .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	gènes	gène	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
3	impliqués	impliquer	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	dans	dans	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	des	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	voies	voie	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	métaboliques	métabolique	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	nécessaires	nécessaire	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	survie	survie	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	dans	dans	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	intestin	intestin	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	des	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	mammifères	mammifère	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	sont	être	VRB	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
18	régulés	réguler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	négativement	négativement	ADV	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	par	par	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	Fis	Fis	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	(	(	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
23	utilisation	utilisation	NOM	_	_	21	parenth	_	_	_	_	_
24	du	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	propanediol	propane	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
27	biosynthèse	biosynthèse	NOM	_	_	25	para	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	biotine	biotine	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
32	transport	transport	NOM	_	_	30	para	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	la	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	vitamine	vitamine	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	B12	B12	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	,	,	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
38	métabolisme	métabolisme	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
39	de	de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	l'	le	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	acétate	acétate	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	,	,	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_
43	...	...	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
44	)	)	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
45	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-657
# text = Ainsi Fis joue un rôle central en coordonnant l'expression de facteurs nécessaires à la croissance mais également à la virulence .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	Fis	Fis	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	joue	jouer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	un	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	rôle	rôle	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	central	central	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	en	en	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	coordonnant	coordonner	VPR	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	expression	expression	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	facteurs	facteur	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	nécessaires	nécessaire	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	croissance	croissance	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	mais	mais	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
18	également	également	ADV	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	à	à	PRE	_	_	14	para	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	virulence	virulence	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-658
# text = La réplication
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	réplication	réplication	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-659
# text = Un autre rôle fondamental de Fis est celui joué dans l'initiation de la réplication .
1	Un	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	autre	autre	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	rôle	rôle	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
4	fondamental	fondamental	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	Fis	Fis	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	celui	celui	PRQ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	joué	jouer	VPP	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	initiation	initiation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	réplication	réplication	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-660
# text = Fis possède en effet un ou plusieurs sites de fixation au niveau de l'origine de réplication oriC .
1	Fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	possède	posséder	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	en	en	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	effet	effet	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	un	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
6	ou	ou	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
7	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
8	sites	site	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	fixation	fixation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	au	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	niveau	niveau	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	origine	origine	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	réplication	réplication	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	oriC	oriC	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-661
# text = Bien que la raison de cette fixation demeure inconnue , des mutants fis produisent une asynchronie de l'initiation de la réplication dans des conditions de croissance rapide .
1	Bien	bien	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	que	que	CSU	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	raison	raison	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	cette	ce	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	fixation	fixation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	demeure	demeure	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	inconnue	inconnu	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
11	des	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	mutants	mutant	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
13	fis	faire	VRB	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
14	produisent	produire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	une	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	asynchronie	asynchrone	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	initiation	initiation	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	réplication	réplication	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	dans	dans	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
24	des	un	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	conditions	condition	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	croissance	croissance	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	rapide	rapide	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-662
# text = Une courbure induite par la fixation de Fis près d'oriC pourrait faciliter l'initiation de la réplication .
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	courbure	courbure	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
3	induite	induire	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	par	par	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	fixation	fixation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	Fis	Fis	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	près	près de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
10	d'	près de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	oriC	oriC	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	faciliter	faciliter	VNF	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	initiation	initiation	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	réplication	réplication	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-663
# text = Des interactions existent également au niveau d'oriC entre Fis , IHF et DnaA .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	interactions	interaction	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	existent	exister	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	également	également	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	au	à	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	niveau	niveau	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	oriC	oriC	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	entre	entre	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	Fis	Fis	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	IHF	IHF	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	DnaA	DnaA	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-664
# text = Les phénomènes d'inversion et de recombinaison site-spécifique
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	phénomènes	phénomène	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	inversion	inversion	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	3	para	_	_	_	_	_
7	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	site-spécifique	site	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-665
# text = Fis a été découverte par sa capacité à favoriser les réactions d'inversion catalysées par les recombinases du type Hin , Gin et Cin ( Finkel et Johnson , 1992 ) .
1	Fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	été	été	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	découverte	découvrir	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	sa	son	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	capacité	capacité	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	favoriser	favoriser	VNF	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	réactions	réaction	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	inversion	inversion	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	catalysées	catalyser	VPP	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	par	par	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	les	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	recombinases	recombinase	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	du	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	type	type	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	Hin	Hin	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	Gin	Gin	NOM	_	_	20	para	_	_	_	_	_
23	et	et	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
24	Cin	Cin	NOM	_	_	22	para	_	_	_	_	_
25	(	(	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	Finkel	Finkel	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
27	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
28	Johnson	Johnson	NOM	_	_	26	para	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
30	1992	1992	NUM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
31	)	)	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-666
# text = Durant ces réactions , Fis se lie à deux sites entourant une séquence de recombinaison ( Recombinational
1	Durant	durant	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	réactions	réaction	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	Fis	Fis	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
6	se	se	CLI	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	lie	lier	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	deux	deux	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	sites	site	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	entourant	entourer	VPR	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	une	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	séquence	séquence	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	(	(	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
17	Recombinational	Recombinational	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-667
# text = Enhancer ) d'environ 60 pb ( Figure 20 ) .
1	Enhancer	Enhancer	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	environ	environ	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
5	60	60	NUM	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	pb	problème	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	(	(	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
8	Figure	Figure	NOM	_	_	6	parenth	_	_	_	_	_
9	20	20	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	)	)	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-668
# text = D'autre part , la recombinase Hin se fixe au niveau des deux sites de recombinaison hixR et hixL et y est responsable du clivage et de la ligation des brins d'ADN .
1	D'	d'autre part	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	autre	d'autre part	ADV	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	part	d'autre part	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	recombinase	recombinase	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
7	Hin	Hin	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	se	se	CLI	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	fixe	fixer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	au	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	niveau	niveau	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	des	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	deux	deux	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	sites	site	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	hixR	hixR	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	hixL	hixL	ADJ	_	_	17	para	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
21	y	le	CLI	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	est	être	VRB	_	_	9	para	_	_	_	_	_
23	responsable	responsable	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	du	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	clivage	clivage	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	24	para	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	ligation	ligation	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	des	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	brins	brin	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	d'	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	ADN	ADN	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-669
# text = La fixation de Fis permet le rapprochement des deux sites hixR et hixL et du site stimulateur de la recombinaison .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fixation	fixation	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	permet	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	le	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	rapprochement	rapprochement	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	des	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	deux	deux	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	sites	site	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	hixR	hixR	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	hixL	hixL	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	du	de	PRE	_	_	8	para	_	_	_	_	_
16	site	site	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	stimulateur	stimulateur	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-670
# text = Ceci génère alors un intermédiaire de recombinaison au sein duquel duquel l'interaction entre Fis et la recombinase Hin induit l'événement de recombinaison , par extrusion sous forme de boucles de l'ADN situé entre hixR et hixL ( Figure 20
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	génère	générer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	alors	alors	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	un	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	intermédiaire	intermédiaire	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	au	au sein de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
9	sein	au sein de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	duquel	au sein de	PRE	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
11	duquel	lequel	PRQ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	interaction	interaction	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
14	entre	entre	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	Fis	Fis	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	recombinase	recombinase	NOM	_	_	15	para	_	_	_	_	_
19	Hin	Hin	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	induit	induire	VRB	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
21	l'	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	événement	événement	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
26	par	par	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
27	extrusion	extrusion	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	sous	sous	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	forme	forme	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	boucles	boucle	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
33	l'	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	ADN	ADN	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	situé	situer	VPP	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	entre	entre	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	hixR	hixR	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	et	et	COO	_	_	39	mark	_	_	_	_	_
39	hixL	hixL	NOM	_	_	37	para	_	_	_	_	_
40	(	(	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
41	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
42	20	20	NUM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-671
# text = ; Osuna et al. , 1991 ) .
1	;	;	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	Osuna	Osuna	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
4	al.	al.	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	1991	1991	NUM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-672
# text = On retrouve ainsi l'effet de la fixation de Fis sur l'ADN décrit précédemment .
1	On	on	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	retrouve	retrouver	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	ainsi	ainsi	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	effet	effet	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	fixation	fixation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	Fis	Fis	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	sur	sur	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	ADN	ADN	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	décrit	décrire	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	précédemment	précédemment	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-673
# text = Enfin , Fis stimule également l'intégration et l'excision de l'ADN du bactériophage & 206;& 187; en se liant au site attR du génome phagique ( Ball et Johnson , 1991a , b ) .
1	Enfin	enfin	ADV	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	Fis	Fis	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	stimule	stimuler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	également	également	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	intégration	intégration	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	excision	excision	NOM	_	_	7	para	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	ADN	ADN	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	du	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	bactériophage	bactériophage	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	λ	λ	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	en	en	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
18	se	se	CLI	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	liant	lier	VPR	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	au	à	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	site	site	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	attR	attR	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	du	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	génome	génome	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	phagique	phagique	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	(	(	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
27	Ball	Ball	NOM	_	_	24	parenth	_	_	_	_	_
28	et	et	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
29	Johnson	Johnson	NOM	_	_	27	para	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
31	1991a	1991a	NUM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
33	b	boulevard	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
34	)	)	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-674
# text = En introduisant une courbure dans l'ADN , Fis favorise l'intégration et l'excision de l'ADN du phage ( Esposito et Gerard , 2003 ) .
1	En	en	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	introduisant	introduire	VPR	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	une	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	courbure	courbure	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ADN	ADN	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
9	Fis	Fis	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
10	favorise	favoriser	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	intégration	intégration	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	excision	excision	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	ADN	ADN	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	du	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
20	phage	phage	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	(	(	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	Esposito	Esposito	NOM	_	_	20	parenth	_	_	_	_	_
23	et	et	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
24	Gerard	Gerard	NOM	_	_	22	para	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	2003	2003	NUM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	)	)	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-675
# text = Dynamique d'expression des NAPs
1	Dynamique	dynamique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	expression	expression	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	des	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	NAPs	NAPs	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-676
# text = Comme nous venons de le voir , Fis est la protéine de type histone majoritaire pendant la phase exponentielle .
1	Comme	comme	CSU	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	nous	nous	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	venons	venir	VRB	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	le	le	CLI	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	voir	voir	VNF	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
8	Fis	Fis	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
9	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	protéine	protéine	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	type	type	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	histone	histone	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	majoritaire	majoritaire	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	pendant	pendant	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	phase	phase	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-677
# text = Son niveau augmente très rapidement au moment de la reprise de la croissance , pour atteindre plus de 50 000 molécules par cellule .
1	Son	son	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	niveau	niveau	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	augmente	augmenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	très	très	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	rapidement	rapidement	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	au	au moment de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	moment	au moment de	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	au moment de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	reprise	reprise	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	croissance	croissance	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	pour	pour	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
16	atteindre	atteindre	VNF	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	plus	plus	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	50	50	NUM	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	000	000	NUM	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	molécules	molécule	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	par	par	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	cellule	cellule	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-678
# text = Deux autres NAPs , HU
1	Deux	deux	NUM	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	autres	autre	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	NAPs	NAPs	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
5	HU	HU	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-679
# text = ( 30   000 à 50   000 molécules ) et H-NS ( 20   000 molécules ) sont abondantes en phase exponentielle .
1	(	(	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
2	30	30	NUM	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	 	30   000	PRQ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	000	000	NUM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
5	à	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	50	50	NUM	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
7	 	50   000	DET	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	000	000	NUM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	molécules	molécule	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	)	)	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
12	H-NS	H-NS	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
13	(	(	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
14	20	20	NUM	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
15	 	20   000	DET	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	000	000	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	molécules	molécule	NOM	_	_	12	parenth	_	_	_	_	_
18	)	)	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
19	sont	être	VRB	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
20	abondantes	abondant	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	en	en	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	phase	phase	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-680
# text = En fin de phase exponentielle , leur niveau décroît , en même temps que le degré de superhélicité de l'ADN :
1	En	en	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	fin	fin	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	phase	phase	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	leur	son	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	niveau	niveau	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
9	décroît	décroître	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	en	en	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	même	même	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	temps	temps	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	que	que	CSU	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	le	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	degré	degré	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	ADN	ADN	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	:	:	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-681
# text = Fis disparaît presque totalement alors que HU reste à un niveau basal correspondant à moins d'un tiers de sa concentration en phase exponentielle .
1	Fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	disparaît	disparaître	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	presque	presque	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	totalement	totalement	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	alors	alors	ADV	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	que	queComp?	PRQ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	HU	HU	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	reste	rester	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	un	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	niveau	niveau	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	basal	basal	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	correspondant	correspondre	VPR	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	moins	moins	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	d'	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	un	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	tiers	tiers	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	sa	son	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	concentration	concentration	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	en	en	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	phase	phase	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-682
# text = H-NS subit une diminution de concentration d'environ deux fois , et reste ainsi présente en phase stationnaire .
1	H-NS	heure	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	subit	subir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	une	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	diminution	diminution	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	concentration	concentration	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	environ	environ	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
9	deux	deux	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	fois	fois	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	reste	rester	VRB	_	_	2	para	_	_	_	_	_
14	ainsi	ainsi	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	présente	présent	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	en	en	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	phase	phase	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-683
# text = Lors de la transition entre les phases exponentielle et stationnaire , deux autres NAP deviennent majoritaires :
1	Lors	lors de	PRE	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
2	de	lors de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	transition	transition	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	entre	entre	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	phases	phase	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	exponentielle	exponentielle	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	8	para	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
12	deux	deux	NUM	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
13	autres	autre	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	NAP	NAP	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
15	deviennent	devenir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	majoritaires	majoritaire	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	:	:	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-684
# text = Dps ( près de 200 000 molécules ) et IHF .
1	Dps	Dps	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	(	(	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	près	près	ADV	_	_	1	parenth	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	200	200	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	000	000	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	molécules	molécule	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	)	)	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	IHF	IHF	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-685
# text = Le rôle principal d'IHF se situe pendant cette transition , puisque son niveau atteint un pic ( 55 000 molécules ) , puis diminue par la suite , tout en restant à la moitié de son niveau maximal .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	rôle	rôle	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	principal	principal	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	IHF	IHF	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	se	se	CLI	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	situe	situer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	pendant	pendant	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	cette	ce	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	transition	transition	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	puisque	puisque	CSU	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
13	son	son	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	niveau	niveau	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
15	atteint	atteindre	VRB	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	un	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	pic	pic	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	(	(	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
19	55	55	NUM	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	000	000	NUM	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	molécules	molécule	NOM	_	_	17	parenth	_	_	_	_	_
22	)	)	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
24	puis	puis	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
25	diminue	diminuer	VRB	_	_	15	para	_	_	_	_	_
26	par	par	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	suite	suite	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
30	tout	tout en	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	en	tout en	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
32	restant	rester	VPR	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	à	à	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	la	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	moitié	moitié	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	de	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	son	son	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	niveau	niveau	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	maximal	maximal	ADJ	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-686
# text = Enfin , en phase stationnaire prolongée , la protéine Dps est de loin majoritaire .
1	Enfin	enfin	ADV	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	en	en	PRE	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
4	phase	phase	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	prolongée	prolonger	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	protéine	protéine	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
10	Dps	Dps	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	de	de loin	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	loin	de loin	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	majoritaire	majoritaire	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-687
# text = Une certaine hiérarchie entre ces protéines a donc été mise en évidence au cours du cycle cellulaire d'E. coli .
1	Une	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	certaine	certain	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	hiérarchie	hiérarchie	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
4	entre	entre	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ces	ce	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	protéines	protéine	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	a	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
8	donc	donc	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
9	été	être	VPP	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	mise	mettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	en	en	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	évidence	évidence	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	au	au cours de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	cours	au cours de	DET	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	du	au cours de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	cycle	cycle	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	d'	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	E.	E.	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	coli	coli	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-688
# text = L'expression de ces protéines de type histone est très dynamique tout au long de la croissance bactérienne .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	expression	expression	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ces	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	protéines	protéine	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	type	type	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	histone	histone	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	très	très	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	dynamique	dynamique	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	tout	tout au long de	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	au	tout au long de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	long	tout au long de	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	tout au long de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	croissance	croissance	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	bactérienne	bactérien	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-689
# text = Ces protéines sont impliquées dans la régulation de la transcription de nombreux gènes , mais aussi dans les processus de réplication du chromosome et de recombinaison .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéines	protéine	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	impliquées	impliquer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	régulation	régulation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	transcription	transcription	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	nombreux	nombreux	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	gènes	gène	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
15	mais	mais aussi	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
16	aussi	mais aussi	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	dans	dans	PRE	_	_	5	para	_	_	_	_	_
18	les	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	processus	processus	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	réplication	réplication	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	du	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	chromosome	chromosome	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	22	para	_	_	_	_	_
26	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-690
# text = Leurs différentes fonctions sont souvent réalisées de par leur effet sur la topologie de l'ADN .
1	Leurs	son	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	différentes	différent	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	fonctions	fonction	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
4	sont	être	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
5	souvent	souvent	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	réalisées	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	de	de par	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	par	de par	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	leur	son	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	effet	effet	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	sur	sur	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	topologie	topologie	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	ADN	ADN	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-691
# text = Ainsi , la dynamique d'expression de ces histones va conduire à des variations de superhélicité de l'ADN , locales ou globales , et ceci pourrait avoir un impact important sur les capacités de réponse des cellules aux fluctuations de leur environnement .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	dynamique	dynamique	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
5	d'	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	expression	expression	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ces	ce	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	histones	histone	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	va	aller	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	conduire	conduire	VNF	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	à	à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	des	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	variations	variation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	ADN	ADN	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	locales	local	ADJ	_	_	17	para	_	_	_	_	_
22	ou	ou	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	globales	global	ADJ	_	_	21	para	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
26	ceci	ceci	PRQ	_	_	27	subj	_	_	_	_	_
27	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	10	para	_	_	_	_	_
28	avoir	avoir	VNF	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	un	un	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	impact	impact	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	important	important	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	sur	sur	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	les	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	capacités	capacité	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	réponse	réponse	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	des	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	cellules	cellule	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	aux	à	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	fluctuations	fluctuation	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	de	de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	leur	son	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	environnement	environnement	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-692
# text = De plus , comme nous allons le voir dans la partie suivante , les NAP sont également impliquées dans la structuration du chromosome en domaines plus ou moins larges et leur expression différentielle entraîne une plasticité importante de la structure du chromosome .
1	De	de plus	PRE	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	comme	comme	CSU	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
5	nous	nous	CLS	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	allons	aller	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	le	le	CLI	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	voir	voir	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	partie	partie	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	suivante	suivant	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	NAP	NAP	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
16	sont	être	VRB	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
17	également	également	ADV	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	impliquées	impliquer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	dans	dans	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	structuration	structuration	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	du	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	chromosome	chromosome	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	en	en	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	domaines	domaine	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	plus	plus ou moins	ADV	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
27	ou	plus ou moins	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
28	moins	plus ou moins	NOM	_	_	26	para	_	_	_	_	_
29	larges	large	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
30	et	et	COO	_	_	34	mark	_	_	_	_	_
31	leur	son	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	expression	expression	NOM	_	_	34	subj	_	_	_	_	_
33	différentielle	différentiel	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	entraîne	entraîner	VRB	_	_	18	para	_	_	_	_	_
35	une	un	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	plasticité	plasticité	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	importante	important	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	la	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	structure	structure	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	du	de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	chromosome	chromosome	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-693
# text = Organisation du chromosome dans la cellule
1	Organisation	organisation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	du	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	chromosome	chromosome	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	dans	dans	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	cellule	cellule	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-694
# text = Chez les eucaryotes , les chromosomes sont organisés en plusieurs niveaux de compaction , l'unité de base étant la structure nucléosomique réalisée par les histones ( Kornberg et Lorch , 1999 ) .
1	Chez	chez	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	eucaryotes	eucaryote	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	chromosomes	chromosome	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
7	sont	être	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	organisés	organiser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	en	en	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	niveaux	niveau	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	compaction	compaction	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	unité	unité	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	base	base	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	étant	être	VPR	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	structure	structure	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	nucléosomique	nucléosomique	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	réalisée	réaliser	VPP	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	par	par	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	les	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	histones	histone	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	(	(	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
28	Kornberg	Kornberg	NOM	_	_	26	parenth	_	_	_	_	_
29	et	et	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
30	Lorch	Lorch	NOM	_	_	28	para	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
32	1999	1999	NUM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	)	)	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-695
# text = Le nucléosome est le point central du contrôle de la transcription .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	nucléosome	nucléé	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	point	point	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	central	central	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	du	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	contrôle	contrôle	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	transcription	transcription	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-696
# text = Chez les bactéries , une telle structuration est absente , mais l'ADN est aussi organisé au sein du nucléoïde par son association avec différentes protéines ( Pettijohn , 1996 ) .
1	Chez	chez	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	bactéries	bactérie	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
6	telle	tel	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	structuration	structuration	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
8	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	absente	absent	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
11	mais	mais	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	ADN	ADN	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
14	est	être	VRB	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
15	aussi	aussi	ADV	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
16	organisé	organiser	VPP	_	_	8	para	_	_	_	_	_
17	au	au sein de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	sein	au sein de	DET	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	du	au sein de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	nucléoïde	nucléoïde	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	par	par	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
22	son	son	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	association	association	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	avec	avec	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	différentes	différent	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	protéines	protéine	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	(	(	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
28	Pettijohn	Pettijohn	NOM	_	_	26	parenth	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
30	1996	1996	NUM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	)	)	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-697
# text = Une telle organisation est nécessaire pour compacter le chromosome de manière à le contenir dans la cellule ( compaction de 1000 fois pour le chromosome d'E. coli ) , mais aussi pour permettre la flexibilité nécessaire à la réplication du chromosome et à la transcription des gènes , processus qui vont par ailleurs être modifiés en fonction des conditions de l'environnement .
1	Une	un tel	DET	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	telle	un tel	DET	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	organisation	organisation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	nécessaire	nécessaire	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	pour	pour	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	compacter	compacter	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	chromosome	chromosome	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de manière à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	manière	de manière à	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	à	de manière à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	le	le	CLI	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	contenir	contenir	VNF	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	dans	dans	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	cellule	cellule	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	(	(	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	compaction	compaction	NOM	_	_	17	parenth	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	1000	1000	NUM	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	fois	fois	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	pour	pour	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
24	le	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	chromosome	chromosome	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	d'	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	E.	E.	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	coli	coli	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	)	)	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
31	mais	mais aussi	COO	_	_	33	mark	_	_	_	_	_
32	aussi	mais aussi	ADV	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	pour	pour	PRE	_	_	6	para	_	_	_	_	_
34	permettre	permettre	VNF	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	la	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	flexibilité	flexibilité	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	nécessaire	nécessaire	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	à	à	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	la	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	réplication	réplication	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	du	de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	chromosome	chromosome	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	et	et	COO	_	_	44	mark	_	_	_	_	_
44	à	à	PRE	_	_	38	para	_	_	_	_	_
45	la	le	DET	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
46	transcription	transcription	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	des	de	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	gènes	gène	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	,	,	PUNC	_	_	50	punc	_	_	_	_	_
50	processus	processus	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
51	qui	qui	PRQ	_	_	52	subj	_	_	_	_	_
52	vont	aller	VRB	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
53	par	par ailleurs	PRE	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	ailleurs	par ailleurs	ADV	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	être	être	VNF	_	_	56	aux	_	_	_	_	_
56	modifiés	modifier	VPP	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
57	en	en	PRE	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
58	fonction	fonction	NOM	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
59	des	de	PRE	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
60	conditions	condition	NOM	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
61	de	de	PRE	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
62	l'	le	DET	_	_	63	spe	_	_	_	_	_
63	environnement	environnement	NOM	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
64	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-698
# text = Une partie de cette organisation repose sur le fait que le chromosome bactérien présente une superhélicité négative , qui facilite les transitions entre les conformations double et simple brin , nécessaires à tous les processus vitaux ( réplication , transcription , recombinaison ) .
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	partie	partie	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	cette	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	organisation	organisation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	repose	reposer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	sur	sur	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	fait	fait	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	que	que	CSU	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	le	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	chromosome	chromosome	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
13	bactérien	bactérien	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	présente	présenter	VRB	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	une	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	négative	négatif	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
19	qui	qui	PRQ	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
20	facilite	faciliter	VRB	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	les	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	transitions	transition	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	entre	entre	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	les	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	conformations	conformation	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	double	double	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	et	et	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
28	simple	simple	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
29	brin	brin	NOM	_	_	25	para	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
31	nécessaires	nécessaire	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
32	à	à	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	tous	tout	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
34	les	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	processus	processus	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
36	vitaux	vital	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	(	(	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
38	réplication	réplication	NOM	_	_	35	parenth	_	_	_	_	_
39	,	,	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
40	transcription	transcription	NOM	_	_	38	para	_	_	_	_	_
41	,	,	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
42	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	40	para	_	_	_	_	_
43	)	)	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
44	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-699
# text = En revanche , le niveau global d'organisation du nucléoïde reste peu connu , bien que des travaux récents permettent de mettre en évidence la structuration spatiale du chromosome bactérien sous forme de domaines topologiques et de macrodomaines .
1	En	en revanche	PRE	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	revanche	en revanche	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	niveau	niveau	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
6	global	global	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	organisation	organisation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	du	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	nucléoïde	nucléoïde	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	reste	rester	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	peu	peu	ADV	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
13	connu	connaître	VPP	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
15	bien	bien que	CSU	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	que	bien que	CSU	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	des	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	travaux	travail	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
19	récents	récent	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	permettent	permettre	VRB	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	mettre	mettre	VNF	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	en	en	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	évidence	évidence	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	structuration	structuration	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
27	spatiale	spatial	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	du	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	chromosome	chromosome	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	bactérien	bactérien	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	sous	sous	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	forme	forme	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	domaines	domaine	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	topologiques	topologique	ADJ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	et	et	COO	_	_	37	mark	_	_	_	_	_
37	de	de	PRE	_	_	33	para	_	_	_	_	_
38	macrodomaines	macro-	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-700
# text = Les domaines topologiques
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	domaines	domaine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	topologiques	topologique	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-701
# text = Le premier niveau de compaction du chromosome est sa division en domaines topologiques , un domaine étant défini comme la région relaxée par une coupure simple ou double brin de l'ADN
1	Le	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	premier	premier	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	niveau	niveau	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	compaction	compaction	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	du	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	chromosome	chromosome	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	sa	son	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	division	division	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	en	en	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	domaines	domaine	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	topologiques	topologique	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
15	un	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	domaine	domaine	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
17	étant	être	VPR	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
18	défini	définir	VPP	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	comme	comme	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	région	région	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	relaxée	relaxer	VPP	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	par	par	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	une	un	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	coupure	coupure	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	simple	simple	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	ou	ou	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
28	double	double	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
29	brin	brin	NOM	_	_	25	para	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	l'	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	ADN	ADN	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-702
# text = ( Pettijohn , 1996 ) .
1	(	(	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
2	Pettijohn	Pettijohn	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	1996	1996	NUM	_	_	2	parenth	_	_	_	_	_
5	)	)	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-703
# text = En l'absence de domaines topologiques , une coupure aurait pour effet la rotation des brins d'ADN autour de cette coupure , conduisant à la perte rapide et catastrophique de la superhélicité négative , qui pourrait alors se propager à l'ensemble du chromosome et conduire ainsi à la mort cellulaire .
1	En	en	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	l'	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	absence	absence	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	domaines	domaine	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	topologiques	topologique	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
8	une	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	coupure	coupure	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
10	aurait	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	pour	pour	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	effet	effet	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	rotation	rotation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	des	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	brins	brin	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	d'	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	ADN	ADN	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	autour	autour de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	de	autour de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	cette	ce	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	coupure	coupure	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	conduisant	conduire	VPR	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	à	à	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	la	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	perte	perte	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	rapide	rapide	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	et	et	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
30	catastrophique	catastrophique	ADJ	_	_	28	para	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
32	la	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	négative	négatif	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
36	qui	qui	PRQ	_	_	37	subj	_	_	_	_	_
37	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
38	alors	alors	ADV	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	se	se	CLI	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
40	propager	propager	VNF	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
41	à	à	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	l'	le	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	ensemble	ensemble	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	du	de	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	chromosome	chromosome	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	et	et	COO	_	_	47	mark	_	_	_	_	_
47	conduire	conduire	VNF	_	_	40	para	_	_	_	_	_
48	ainsi	ainsi	ADV	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	à	à	PRE	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	la	le	DET	_	_	51	spe	_	_	_	_	_
51	mort	mort	NOM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
52	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-704
# text = De telles coupures peuvent en effet être générées in vivo par des altérations chimiques ( radicaux oxygénés , alkylation , dépurination ) , des endonucléases cellulaires , ou par le processus même de la réplication .
1	De	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	telles	tel	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	coupures	coupure	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	en	en	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	effet	effet	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	être	être	VNF	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	générées	générer	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	in	in vivo	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	vivo	in vivo	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	des	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	altérations	altération	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	chimiques	chimique	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	(	(	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
16	radicaux	radical	NOM	_	_	13	parenth	_	_	_	_	_
17	oxygénés	oxygéner	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	alkylation	alkylation	NOM	_	_	17	para	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	dépurination	dépurination	NOM	_	_	19	para	_	_	_	_	_
22	)	)	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	des	de	PRE	_	_	11	para	_	_	_	_	_
25	endonucléases	endonucléase	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	cellulaires	cellulaire	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
28	ou	ou	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
29	par	par	PRE	_	_	24	para	_	_	_	_	_
30	le	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	processus	processus	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	même	même	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	la	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	réplication	réplication	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-705
# text = Ainsi , la répartition de domaines topologiques tout au long du chromosome permet de préserver celui  -ci :
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	répartition	répartition	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	domaines	domaine	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	topologiques	topologique	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	tout	tout au long de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	au	tout au long de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	long	tout au long de	DET	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	du	tout au long de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	chromosome	chromosome	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	permet	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	préserver	préserver	VNF	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	celui	celui	PRQ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	 -ci	 -ci	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	:	:	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-706
# text = suite à une coupure , seul un domaine sera relâché , et non le chromosome entier .
1	suite	suite	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	à	à	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	une	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	coupure	coupure	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
6	seul	seul	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
7	un	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	domaine	domaine	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
9	sera	être	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	relâché	relâcher	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
13	non	non	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	le	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	chromosome	chromosome	NOM	_	_	4	para	_	_	_	_	_
16	entier	entier	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-707
# text = Les changements de superhélicité seront ainsi restreints à un niveau local , grâce à la présence de barrières empêchant la diffusion des supertours entre différents domaines .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	changements	changement	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	seront	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
6	ainsi	ainsi	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	restreints	restreindre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	un	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	niveau	niveau	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	local	local	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	grâce	grâce à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	à	grâce à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	présence	présence	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	barrières	barrière	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	empêchant	empêcher	VPR	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	diffusion	diffusion	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	des	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	supertours	super-	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	entre	entre	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	différents	différent	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	domaines	domaine	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-708
# text = Les premiers travaux effectués ont montré la nécessité de multiples coupures pour relâcher totalement le chromosome in vitro , ce qui suggérait la présence de différents domaines topologiques ( Worcel et Burgi , 1972 ) .
1	Les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	premiers	premier	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	travaux	travail	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
4	effectués	effectuer	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ont	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	montré	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	nécessité	nécessité	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	multiples	multiple	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	coupures	coupure	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	pour	pour	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
13	relâcher	relâcher	VNF	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	totalement	totalement	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	le	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	chromosome	chromosome	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	in	in vitro	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	vitro	in vitro	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	ce	ce	PRQ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
21	qui	qui	PRQ	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
22	suggérait	suggérer	VRB	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	présence	présence	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	différents	différent	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	domaines	domaine	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	topologiques	topologique	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	(	(	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
30	Worcel	Worcel	NOM	_	_	27	parenth	_	_	_	_	_
31	et	et	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
32	Burgi	Burgi	NOM	_	_	30	para	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
34	1972	1972	NUM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	)	)	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-709
# text = Ces études , ainsi que d'autres basées sur l'utilisation de triméthylpsoralène tritié ( Sinden et Pettijohn , 1981 ) , ont conclu à l'existence d'une quarantaine de domaines , d'environ 100 kb chacun .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	études	étude	NOM	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	ainsi	ainsi que	COO	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	que	ainsi que	COO	_	_	7	mark	_	_	_	_	_
6	d'	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	autres	autre	ADJ	_	_	2	para	_	_	_	_	_
8	basées	baser	VPP	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	sur	sur	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	utilisation	utilisation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	triméthylpsoralène	triméthylpsoralène	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	tritié	Trixie	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	(	(	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Sinden	Sinden	NOM	_	_	13	parenth	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	Pettijohn	Pettijohn	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
20	1981	1981	NUM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	)	)	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
23	ont	avoir	VRB	_	_	24	aux	_	_	_	_	_
24	conclu	conclure	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
25	à	à	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	l'	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	existence	existence	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	d'	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	une	un	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	quarantaine	quarantaine	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	domaines	domaine	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
34	d'	un	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
35	environ	environ	ADV	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
36	100	100	NUM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
37	kb	kilogramme	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
38	chacun	chacun	PRQ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-710
# text = Plus récemment , deux méthodes indépendantes ont été utilisées pour étudier plus finement l'organisation chromosomique en domaines topologiques .
1	Plus	plus	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	récemment	récemment	ADV	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	deux	deux	NUM	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	méthodes	méthode	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
6	indépendantes	indépendant	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ont	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	été	être	VPP	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	utilisées	utiliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	pour	pour	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	étudier	étudier	VNF	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	plus	plus	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	finement	finement	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	organisation	organisation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
16	chromosomique	chromosomique	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	en	en	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
18	domaines	domaine	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	topologiques	topologique	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-711
# text = La première est basée sur l'identification de 306 gènes dont la transcription est modifiée suite à un relâchement de l'ADN , ces gènes étant dispersés sur le chromosome d'E. coli .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	première	premier	ADJ	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	basée	baser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	sur	sur	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	identification	identification	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	306	306	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	gènes	gène	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	dont	dont	PRQ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	transcription	transcription	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
14	est	être	VRB	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
15	modifiée	modifier	VPP	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
16	suite	suite à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	à	suite à	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	un	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	relâchement	relâchement	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	l'	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	ADN	ADN	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
24	ces	ce	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	gènes	gène	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
26	étant	être	VPR	_	_	27	aux	_	_	_	_	_
27	dispersés	disperser	VPP	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	sur	sur	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	le	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	chromosome	chromosome	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	d'	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	E.	E.	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
33	coli	coli	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-712
# text = Postow et al. ( 2004 ) se sont servis de cette étude pour déterminer l'impact d'une coupure du chromosome sur la transcription de ces 306 gènes .
1	Postow	postow	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
2	et	et	COO	_	_	3	mark	_	_	_	_	_
3	al.	Al	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	(	(	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
5	2004	2004	NUM	_	_	3	parenth	_	_	_	_	_
6	)	)	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
7	se	se	CLI	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
8	sont	être	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	servis	servir	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	cette	ce	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	étude	étude	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	pour	pour	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	déterminer	déterminer	VNF	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	impact	impact	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	d'	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	une	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	coupure	coupure	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	du	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	chromosome	chromosome	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	sur	sur	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	transcription	transcription	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	ces	ce	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
27	306	306	NUM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	gènes	gène	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-713
# text = Des coupures doubles brins ont été introduites à des positions définies du chromosome par l'induction in vivo de l'expression de l'enzyme de restriction SwaI , qui présente 117 sites de coupures sur le chromosome d'E. coli .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	coupures	coupure	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	doubles	double	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	brins	brin	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	ont	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	été	être	VPP	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	introduites	introduire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	des	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	positions	position	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	définies	définir	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	du	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	chromosome	chromosome	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	par	par	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	induction	induction	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	in	in vivo	ADV	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	vivo	in vivo	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	expression	expression	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	l'	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	enzyme	enzyme	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	restriction	restriction	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	SwaI	SwaI	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
29	qui	qui	PRQ	_	_	30	subj	_	_	_	_	_
30	présente	présenter	VRB	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
31	117	117	NUM	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	sites	site	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	coupures	coupure	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	sur	sur	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
36	le	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	chromosome	chromosome	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	d'	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	E.	E.	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
40	coli	coli	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-714
# text = L'effet de ces coupures étant un relâchement de l'ADN , la transcription des gènes situés à proximité , notamment ceux sensibles à la superhélicité , va être affectée .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	effet	effet	NOM	_	_	28	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ces	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	coupures	coupure	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	étant	être	VPR	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	un	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	relâchement	relâchement	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	ADN	ADN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	transcription	transcription	NOM	_	_	28	subj	_	_	_	_	_
15	des	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	gènes	gène	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	situés	situer	VPP	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	à	à	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	proximité	proximité	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
21	notamment	notamment	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	ceux	celui	PRQ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	sensibles	sensible	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	à	à	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
28	va	aller	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
29	être	être	VNF	_	_	30	aux	_	_	_	_	_
30	affectée	affecter	VPP	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-715
# text = Le profil global de transcription a donc été déterminé avant et après coupure par SwaI. Connaissant la distance entre les sites de restriction et les gènes sensibles au relâchement de l'ADN , les auteurs ont pu conclure à un nombre de domaines d'environ 450 , chacun ayant en moyenne une taille de 10 kb .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	profil	profil	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	global	global	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	transcription	transcription	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	a	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
7	donc	donc	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
8	été	être	VPP	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	déterminé	déterminer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	avant	avant	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	12	mark	_	_	_	_	_
12	après	après	PRE	_	_	10	para	_	_	_	_	_
13	coupure	coupure	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	par	par	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	SwaI.	SwaI.	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	Connaissant	Connaissant	VPR	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	distance	distance	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	entre	entre	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	les	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	sites	site	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	restriction	restriction	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	et	et	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
25	les	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	gènes	gène	NOM	_	_	21	para	_	_	_	_	_
27	sensibles	sensible	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	au	à	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	relâchement	relâchement	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	l'	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	ADN	ADN	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
34	les	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	auteurs	auteur	NOM	_	_	37	subj	_	_	_	_	_
36	ont	avoir	VRB	_	_	37	aux	_	_	_	_	_
37	pu	pouvoir	VPP	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
38	conclure	conclure	VNF	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	à	à	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	un	un	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	nombre	nombre	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	de	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	domaines	domaine	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	d'	de	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	environ	environ	ADV	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
46	450	450	NUM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	,	,	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
48	chacun	chacun	PRQ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
49	ayant	avoir	VPR	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	en	en moyenne	PRE	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	moyenne	en moyenne	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	une	un	DET	_	_	53	spe	_	_	_	_	_
53	taille	taille	NOM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
54	de	de	PRE	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	10	10	NUM	_	_	56	spe	_	_	_	_	_
56	kb	kilomètre	NOM	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
57	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-716
# text = Ces résultats ont été appuyés par une mesure directe de la taille des boucles chromosomiques formées par microscopie électronique .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	résultats	résultat	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	ont	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	appuyés	appuyer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	une	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	mesure	mesure	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	directe	direct	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	taille	taille	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	des	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	boucles	boucle	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	chromosomiques	chromosomique	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	formées	former	VPP	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	par	par	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	microscopie	microscopie	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	électronique	électronique	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-717
# text = La deuxième étude porte sur des souches de S. typhimurium dans lesquelles des paires de sites res de recombinaison site-spécifique ont été introduites à différentes distances chromosomiques .
1	La	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	deuxième	deuxième	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	étude	étude	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	porte	porter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	sur	sur	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	des	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	souches	souche	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	S.	S.	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	typhimurium	typhimurium	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	dans	dans	PRE	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
12	lesquelles	lequel	PRQ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	des	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	paires	paire	NOM	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	sites	site	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	res	ré	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	site-spécifique	site	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	ont	avoir	VRB	_	_	22	aux	_	_	_	_	_
22	été	être	VPP	_	_	23	aux	_	_	_	_	_
23	introduites	introduire	VPP	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
24	à	à	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	différentes	différent	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	distances	distance	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	chromosomiques	chromosomique	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-718
# text = Ces souches contiennent également les gènes , inductibles par l'IPTG , codant les résolvases des transposons Tn 3 ou & 206;& 179;& 206;& 180; .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	souches	souche	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	contiennent	contenir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	également	également	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	gènes	gène	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
8	inductibles	inductible	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
9	par	par	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	IPTG	IPTG	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	codant	coder	VPR	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	résolvases	résolvase	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	transposons	transposon	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	Tn	Tn	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	3	3	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	ou	ou	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
21	γδ	γδ	NOM	_	_	17	para	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-719
# text = Un système de sélection permet de détecter et de quantifier les événements de recombinaison entre les sites res .
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	système	système	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	sélection	sélection	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	permet	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	détecter	détecter	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	6	para	_	_	_	_	_
10	quantifier	quantifier	VNF	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	les	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	événements	événement	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	entre	entre	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	les	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	sites	site	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	res	ré	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-720
# text = Ce système de recombinaison site-spécifique est basé sur l'alignement précis de 2 sites res dont la taille est de 140 pb , et dépend d'un niveau adéquat de superhélicité négative ( Stark et Boocock , 1995 ) .
1	Ce	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	système	système	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	site-spécifique	site	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	basé	baser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	sur	sur	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	alignement	alignement	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	précis	précis	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	2	2	NUM	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	sites	site	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	res	ré	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	dont	dont	PRQ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	taille	taille	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
19	est	être	VRB	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	140	140	NUM	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	pb	problème	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
24	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
25	dépend	dépendre	VRB	_	_	7	para	_	_	_	_	_
26	d'	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	un	un	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	niveau	niveau	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	adéquat	adéquat	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	négative	négatif	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	(	(	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
34	Stark	Stark	NOM	_	_	31	parenth	_	_	_	_	_
35	et	et	COO	_	_	36	mark	_	_	_	_	_
36	Boocock	Boocock	NOM	_	_	34	para	_	_	_	_	_
37	,	,	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
38	1995	1995	NUM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	)	)	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
40	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-721
# text = Ainsi , 2 sites res ne peuvent recombiner qu'à l'intérieur d'un même domaine topologique , afin de permettre la diffusion de superhélicité négative entre les deux sites .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	2	2	NUM	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	sites	site	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
5	res	ré	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ne	ne	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	recombiner	recombiner	VNF	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	qu'	que	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	intérieur	intérieur	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	d'	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	un	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
15	même	même	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	domaine	domaine	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	topologique	topologique	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	afin	afin de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
20	de	afin de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	permettre	permettre	VNF	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	diffusion	diffusion	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	négative	négatif	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	entre	entre	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	les	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
29	deux	deux	NUM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	sites	site	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-722
# text = L'utilisation de ce système ingénieux a révélé que la taille moyenne d'un domaine était d'environ 25 kb .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	utilisation	utilisation	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ce	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	système	système	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	ingénieux	ingénieux	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	a	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	révélé	révéler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	que	que	CSU	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	taille	taille	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
12	moyenne	moyen	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	un	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	domaine	domaine	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	était	être	VRB	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
17	d'	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	environ	environ	ADV	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
19	25	25	NUM	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	kb	kilomètre	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-723
# text = Cette valeur , basée sur la stabilité des barrières entre domaines et sur celle de la résolvase Tn 3 ou & 206;& 179;& 206;& 180; utilisée , est probablement sur-estimée .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	valeur	valeur	NOM	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	basée	baser	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	sur	sur	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	stabilité	stabilité	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	des	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	barrières	barrière	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	entre	entre	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	domaines	domaine	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	sur	sur	PRE	_	_	5	para	_	_	_	_	_
14	celle	celui	PRQ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	résolvase	résolvase	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	Tn	Tn	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	3	3	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	ou	ou	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
21	γδ	γδ	ADV	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
22	utilisée	utiliser	VPP	_	_	19	para	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
24	est	être	VRB	_	_	26	aux	_	_	_	_	_
25	probablement	probablement	ADV	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	sur-estimée	sur-	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-724
# text = En effet , la stabilité élevée de ces résolvases rend non détectables des domaines dont la durée de vie serait trop courte .
1	En	en effet	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	stabilité	stabilité	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
6	élevée	élevé	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	ces	ce	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	résolvases	résolvase	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	rend	rendre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	non	non	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	détectables	détectable	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	des	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	domaines	domaine	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	dont	dont	PRQ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	durée	durée	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	vie	vie	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	serait	être	VRB	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
21	trop	trop	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	courte	court	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-725
# text = Des mutants de la résolvase présentant des demi-vies variées ( de 5 min à plusieurs heures ) ont alors été utilisés pour étudier la dynamique du chromosome .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutants	mutant	NOM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	résolvase	résolvase	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	présentant	présenter	VPR	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	des	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	demi-vies	demi-	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	variées	varier	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	(	(	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	8	parenth	_	_	_	_	_
12	5	5	NUM	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	min	minimum	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	heures	heure	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	)	)	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
18	ont	avoir	VRB	_	_	20	aux	_	_	_	_	_
19	alors	alors	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
20	été	être	VPP	_	_	21	aux	_	_	_	_	_
21	utilisés	utiliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	pour	pour	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	étudier	étudier	VNF	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	dynamique	dynamique	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	du	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	chromosome	chromosome	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-726
# text = Ces mutants ont permis de montrer que S. typhimurium , comme E. coli , possédait plus de 400 domaines topologiques par chromosome , de taille moyenne comprise entre 11 et 13 kb .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutants	mutant	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	ont	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	permis	permettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	montrer	montrer	VNF	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	que	que	CSU	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	S.	S.	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
9	typhimurium	typhimurium	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
11	comme	comme	PRE	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
12	E.	E.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	coli	coli	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
15	possédait	posséder	VRB	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
16	plus	plus	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	400	400	NUM	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	domaines	domaine	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	topologiques	topologique	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	par	par	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	chromosome	chromosome	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	taille	taille	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	moyenne	moyen	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	comprise	comprendre	VPP	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	entre	entre	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	11	11	NUM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	et	et	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
31	13	13	NUM	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	kb	kilomètre	NOM	_	_	29	para	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-727
# text = D'autre part , ces domaines présentent une structure extrêmement dynamique , ce qui avait été montré précédemment
1	D'	d'autre part	ADV	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	autre	d'autre part	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	part	d'autre part	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	ces	ce	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	domaines	domaine	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	présentent	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	une	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	structure	structure	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	extrêmement	extrêmement	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	dynamique	dynamique	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	ce	ce	PRQ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	qui	qui	PRQ	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
15	avait	avoir	VRB	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	été	être	VPP	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
17	montré	montrer	VPP	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
18	précédemment	précédemment	ADV	_	_	17	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-728
# text = . La dynamique de ces domaines est indispensable pour les processus de réplication et de transcription .
1	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
2	La	La	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	dynamique	dynamique	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ces	ce	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	domaines	domaine	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	indispensable	indispensable	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	pour	pour	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	processus	processus	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	réplication	réplication	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	12	para	_	_	_	_	_
16	transcription	transcription	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-729
# text = En effet , ceux  -ci provoquent une forte altération du superenroulement et les domaines topologiques doivent se refermer rapidement après le passage de la fourche de réplication ou de l'ARN polymérase .
1	En	en effet	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	ceux	celui	PRQ	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	 -ci	 -ci	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	provoquent	provoquer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	une	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
8	forte	fort	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	altération	altération	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	du	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	superenroulement	super-	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
13	les	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	domaines	domaine	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
15	topologiques	topologique	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	doivent	devoir	VRB	_	_	6	para	_	_	_	_	_
17	se	se	CLI	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	refermer	refermer	VNF	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	rapidement	rapidement	ADV	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	après	après	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	le	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	passage	passage	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	fourche	fourche	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	réplication	réplication	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	ou	ou	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	26	para	_	_	_	_	_
30	l'	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
31	ARN	ARN	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
32	polymérase	polymérase	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-730
# text = Tous ces résultats impliquent non seulement la présence de barrières délimitant les différents domaines topologiques , mais également un grand dynamisme quant à leur localisation .
1	Tous	tout	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	résultats	résultat	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	impliquent	impliquer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	non	non	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	seulement	seulement	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	présence	présence	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	barrières	barrière	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	délimitant	délimiter	VPR	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
13	différents	différent	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	domaines	domaine	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	topologiques	topologique	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
17	mais	mais	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
18	également	également	ADV	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	un	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
20	grand	grand	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	dynamisme	dynamisme	NOM	_	_	8	para	_	_	_	_	_
22	quant	quant à	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	à	quant à	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	leur	son	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	localisation	localisation	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-731
# text = Plusieurs hypothèses sont formulées quant à leur nature .
1	Plusieurs	plusieurs	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	hypothèses	hypothèse	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	formulées	formuler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	quant	quant à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	à	quant à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	leur	son	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	nature	nature	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-732
# text = La transcription
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	transcription	transcription	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-733
# text = Le processus de transcription de gènes codant des protéines membranaires pourrait générer des barrières à la diffusion des supertours .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	processus	processus	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	transcription	transcription	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	gènes	gène	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	codant	coder	VPR	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	des	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	protéines	protéine	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	membranaires	membranaire	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	générer	générer	VNF	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	des	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	barrières	barrière	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	diffusion	diffusion	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	des	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	supertours	super-	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-734
# text = En effet , il a été démontré que la transcription de tels gènes provoquait une augmentation drastique de la superhélicité de l'ADN ( Lynch et Wang , 1993 ) .
1	En	en effet	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	il	il	CLS	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
5	a	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	été	être	VPP	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	démontré	démontrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	que	que	CSU	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	transcription	transcription	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	tels	tel	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	gènes	gène	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	provoquait	provoquer	VRB	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	une	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	augmentation	augmentation	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	drastique	drastique	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	l'	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	ADN	ADN	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	(	(	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	Lynch	Lynch	NOM	_	_	20	parenth	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
27	Wang	Wang	NOM	_	_	25	para	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	1993	1993	NUM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	)	)	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-735
# text = Le phénomène d'ancrage à la membrane cytoplasmique issu de la transcription / traduction de protéines membranaires pourrait ainsi contribuer à la formation de barrières topologiques .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	phénomène	phénomène	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ancrage	ancrage	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	à	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	membrane	membrane	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	cytoplasmique	cytoplasmique	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	issu	issu	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	transcription	transcription	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	/	sur	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
14	traduction	traduction	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	protéines	protéine	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	membranaires	membranaire	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	ainsi	ainsi	ADV	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	contribuer	contribuer	VNF	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	à	à	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	formation	formation	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	barrières	barrière	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	topologiques	topologique	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-736
# text = Ceci a été récemment confirmé en utilisant le système de recombinaison site-spécifique entre deux sites res .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
2	a	avoir	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
4	récemment	récemment	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	confirmé	confirmer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	utilisant	utiliser	VPR	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	système	système	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	site-spécifique	site	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	entre	entre	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	deux	deux	NUM	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	sites	site	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	res	ré	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-737
# text = Ces deux sites , ainsi que le gène tetA codant une pompe à efflux membranaire pour la tétracycline , ont été introduits à l'intérieur d'un domaine topologique chez S. typhimurium .
1	Ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	deux	deux	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	sites	site	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
5	ainsi	ainsi que	COO	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	que	ainsi que	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
7	le	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	gène	gène	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
9	tetA	tetA	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	codant	coder	VPR	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	pompe	pompe	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	efflux	afflux	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	membranaire	membranaire	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	pour	pour	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	tétracycline	tétracycline	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
20	ont	avoir	VRB	_	_	21	aux	_	_	_	_	_
21	été	être	VPP	_	_	22	aux	_	_	_	_	_
22	introduits	introduire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	à	à	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	l'	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	intérieur	intérieur	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	d'	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	un	un	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	domaine	domaine	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	topologique	topologique	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	chez	chez	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	S.	S.	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	typhimurium	typhimurium	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-738
# text = L'induction de la transcription de tetA engendre une réduction d'un facteur 20 de la recombinaison entre les deux sites res , ce qui suggère que la transcription d'un gène codant une protéine membranaire crée des barrières topologiques .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	induction	induction	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	transcription	transcription	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	tetA	tetA	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	engendre	engendrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	une	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	réduction	réduction	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	d'	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	un	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	facteur	facteur	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	20	20	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	entre	entre	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	les	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
20	deux	deux	NUM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	sites	site	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	res	ré	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	ce	ce	PRQ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
25	qui	qui	PRQ	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
26	suggère	suggérer	VRB	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	que	que	CSU	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	transcription	transcription	NOM	_	_	37	subj	_	_	_	_	_
30	d'	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	un	un	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	gène	gène	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	codant	coder	VPR	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	une	un	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	protéine	protéine	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	membranaire	membranaire	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	crée	créer	VRB	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
38	des	un	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	barrières	barrière	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	topologiques	topologique	ADJ	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-739
# text = Cependant , la transcription de gènes codant des protéines cytoplasmiques induit la même diminution de recombinaison entre sites res .
1	Cependant	cependant	ADV	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	transcription	transcription	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	gènes	gène	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	codant	coder	VPR	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	des	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	protéines	protéine	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	cytoplasmiques	cytoplasmique	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	induit	induire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
13	même	même	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	diminution	diminution	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	entre	entre	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	sites	site	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	res	ré	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-740
# text = Ainsi , le phénomène d'ancrage à la membrane n'est pas indispensable , et ce serait l'activité transcriptionnelle qui serait en elle-même responsable de la formation de domaines topologiques .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	le	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	phénomène	phénomène	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
5	d'	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ancrage	ancrage	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	membrane	membrane	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	n'	ne	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	pas	pas	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	indispensable	indispensable	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
16	ce	ce	CLS	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
17	serait	être	VRB	_	_	11	para	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	activité	activité	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	transcriptionnelle	transcriptionnel	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	qui	qui	PRQ	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
22	serait	être	VRB	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	en	en	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	elle-même	lui-même	PRQ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	responsable	responsable	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	formation	formation	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	domaines	domaine	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	topologiques	topologique	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-741
# text = Deng et al.
1	Deng	Deng	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	et	et	COO	_	_	3	mark	_	_	_	_	_
3	al.	al.	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-742
# text = ( 2004 ) suggèrent cependant qu'un niveau élevé de transcription serait nécessaire , et qu'une telle activité transcriptionnelle est rare dans la cellule .
1	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	2004	2004	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	suggèrent	suggérer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	cependant	cependant	ADV	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
6	qu'	queComp?	PRQ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
7	un	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	niveau	niveau	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
9	élevé	élevé	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	transcription	transcription	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	serait	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	nécessaire	nécessaire	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
16	qu'	queComp?	PRQ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
17	une	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
18	telle	tel	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	activité	activité	NOM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
20	transcriptionnelle	transcriptionnel	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	est	être	VRB	_	_	12	para	_	_	_	_	_
22	rare	rare	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
23	dans	dans	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	cellule	cellule	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-743
# text = Ainsi , bien que la transcription contribue à la formation de barrières topologiques , elle ne peut expliquer à elle seule la présence de plus de 400 domaines topologiques .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	bien	bien que	CSU	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	que	bien que	CSU	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	transcription	transcription	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	contribue	contribuer	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	formation	formation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	barrières	barrière	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	topologiques	topologique	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
15	elle	elle	CLS	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
16	ne	ne	ADV	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	peut	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	expliquer	expliquer	VNF	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	à	à	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	elle	lui	PRQ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	seule	seul	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	présence	présence	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	plus	plus	ADV	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	400	400	NUM	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	domaines	domaine	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	topologiques	topologique	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-744
# text = Les complexes SMC
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	complexes	complexe	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	SMC	SMC	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-745
# text = Dans les cellules eucaryotes , les protéines SMC ( Maintenance Structurale des Chromosomes ) assurent la structuration et l'organisation des chromosomes ( Heck , 1997 ) .
1	Dans	dans	PRE	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
2	les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	cellules	cellule	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	eucaryotes	eucaryote	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	protéines	protéine	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
8	SMC	SMC	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	(	(	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Maintenance	Maintenance	NOM	_	_	7	parenth	_	_	_	_	_
11	Structurale	Structurale	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	des	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	Chromosomes	Chromosomes	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	)	)	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
15	assurent	assurer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	structuration	structuration	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	organisation	organisation	NOM	_	_	17	para	_	_	_	_	_
21	des	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	chromosomes	chromosome	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	(	(	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	Heck	Heck	NOM	_	_	22	parenth	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	1997	1997	NUM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	)	)	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-746
# text = Cette famille de protéines inclut les condensines ( ségrégation des chromosomes ) , et les cohésines ( alignement des chromatides soeur ) .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	famille	famille	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	protéines	protéine	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	inclut	inclure	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	les	le	CLI	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	condensines	condenser	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	(	(	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	ségrégation	ségrégation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	des	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	chromosomes	chromosome	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	)	)	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	les	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	cohésines	cohésif	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	(	(	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	alignement	alignement	NOM	_	_	16	parenth	_	_	_	_	_
19	des	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	chromatides	chromatides	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	soeur	soeur	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	)	)	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-747
# text = Dans la cellule bactérienne , un seul complexe a été répertorié comme membre de la famille des protéines SMC :
1	Dans	dans	PRE	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	la	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	cellule	cellule	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	bactérienne	bactérien	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	un	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
7	seul	seul	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	complexe	complexe	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
9	a	avoir	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	été	être	VPP	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	répertorié	répertorier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	comme	comme	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	membre	membre	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	famille	famille	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	des	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	protéines	protéine	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	SMC	SMC	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	:	:	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-748
# text = il a été appelé MukBEF chez E. coli , et BsSMC chez Bacillus subtilis ( Hirano et Hirano , 2006 ) .
1	il	il	CLS	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	a	avoir	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	été	être	VPP	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	appelé	appeler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	MukBEF	MukBEF	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	chez	chez	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	E.	E.	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	coli	coli	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
11	BsSMC	BsSMC	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
12	chez	chez	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	Bacillus	Bacillus	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	subtilis	subtiliser	VRB	_	_	4	para	_	_	_	_	_
15	(	(	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Hirano	Hirano	NOM	_	_	14	parenth	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	Hirano	Hirano	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	2006	2006	NUM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	)	)	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-749
# text = Les protéines SMC jouent un rôle dans le maintien du niveau de superhélicité de l'ADN .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéines	protéine	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	SMC	SMC	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	jouent	jouer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	un	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	rôle	rôle	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	maintien	maintien	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	du	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	niveau	niveau	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	ADN	ADN	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-750
# text = En effet , des mutants de ces gènes chez E. coli et B. subtilis présentent un changement de superhélicité de l'ADN plasmidique et chromosomique , ainsi qu'une décondensation du nucléoïde .
1	En	en effet	PRE	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	mutants	mutant	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ces	ce	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	gènes	gène	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	chez	chez	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	E.	E.	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	coli	coli	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	B.	B.	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_
14	subtilis	subtiliser	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	présentent	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	un	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	changement	changement	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	l'	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	ADN	ADN	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	plasmidique	plasmidique	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
25	chromosomique	chromosomique	ADJ	_	_	23	para	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
27	ainsi	ainsi que	COO	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	qu'	ainsi que	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
29	une	un	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	décondensation	décondensation	NOM	_	_	17	para	_	_	_	_	_
31	du	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	nucléoïde	nucléoïde	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-751
# text = Ces mutants montrent également une baisse de viabilité à des températures supérieures à 30 °C. De plus , certaines de ces mutations interfèrent avec les phénotypes conférés par d'autres mutations connues pour affecter le niveau de superenroulement dans les cellules .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutants	mutant	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	montrent	montrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	également	également	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	baisse	baisse	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	viabilité	viabilité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	des	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	températures	température	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	supérieures	supérieur	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	30	30	NUM	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	°C.	°C.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	De	De	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	plus	plus	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
19	certaines	certains	PRQ	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	ces	ce	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	mutations	mutation	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	interfèrent	interférer	VRB	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
24	avec	avec	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	les	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	phénotypes	phénotype	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	conférés	conférer	VPP	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	par	par	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	d'	un	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
30	autres	autre	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	mutations	mutation	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
32	connues	connaître	VPP	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	pour	pour	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	affecter	affecter	VNF	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	le	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	niveau	niveau	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	superenroulement	super-	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	dans	dans	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
40	les	le	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	cellules	cellule	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-752
# text = Par exemple , la sensibilité thermique de ces mutants est supprimée par des mutations du gène topA , codant la TopoI .
1	Par	par exemple	PRE	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	exemple	par exemple	ADV	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	sensibilité	sensibilité	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
6	thermique	thermique	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	ces	ce	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	mutants	mutant	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	est	être	VRB	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	supprimée	supprimer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	par	par	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	des	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	mutations	mutation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	du	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	gène	gène	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	topA	topA	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	codant	coder	VPR	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	TopoI	TopoI	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-753
# text = Les protéines de type SMC sont actives sous forme de dimères dont la forme est celle d'un
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéines	protéine	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	type	type	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	SMC	SMC	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	actives	actif	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	sous	sous	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	forme	forme	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	dimères	dimère	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	dont	dont	PRQ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	forme	forme	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
15	est	être	VRB	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
16	celle	celui	PRQ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	d'	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	un	un	PRQ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-754
# text = V , chaque sous-unité étant repliée et enroulée sur elle-même de manière anti-parallèle
1	V	v	ADJ	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	chaque	chaque	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	sous-unité	sous-	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	étant	être	VPR	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	repliée	replier	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	enroulée	enrouler	VPP	_	_	6	para	_	_	_	_	_
9	sur	sur	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	elle-même	lui-même	PRQ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	manière	manière	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	anti-parallèle	anti-	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-755
# text = ( Hirano et Hirano , 2006 ) .
1	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	Hirano	Hirano	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	4	mark	_	_	_	_	_
4	Hirano	Hirano	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	2006	2006	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-756
# text = Les extrémités de cette structure en V se regroupent et forment un site de liaison capable d'hydrolyser l'ATP après liaison à l'ADN .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	extrémités	extrémité	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	cette	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	structure	structure	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	V	V	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	se	se	CLI	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	regroupent	regrouper	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
11	forment	former	VRB	_	_	9	para	_	_	_	_	_
12	un	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	site	site	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	liaison	liaison	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	capable	capable	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	d'	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	hydrolyser	hydrolyser	VNF	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	ATP	ATP	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	après	après	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	liaison	liaison	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	à	à	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	l'	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	ADN	ADN	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-757
# text = Dans le cas de MukB , le dimère est stabilisé par les co-facteurs MukE et MukF , qui permettraient la formation de polymères de complexes qui , en se liant à l'ADN , le compacteraient en structures de type « rosettes » ( Figure 21 ; Matoba et al. , 2005 ; Hirano et Hirano , 2006 ) .
1	Dans	dans	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	le	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	cas	cas	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	MukB	MukB	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	le	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	dimère	dimère	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
9	est	être	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	stabilisé	stabiliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	co-facteurs	co-	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	MukE	MukE	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	MukF	MukF	NOM	_	_	14	para	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	52	punc	_	_	_	_	_
18	qui	qui	PRQ	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
19	permettraient	permettre	VRB	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	formation	formation	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	polymères	polymère	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	complexes	complexe	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	qui	quiAcc?	PRQ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	52	punc	_	_	_	_	_
28	en	en	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
29	se	se	CLI	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	liant	lier	VPR	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	à	à	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	l'	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	ADN	ADN	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	,	,	PUNC	_	_	52	punc	_	_	_	_	_
35	le	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	compacteraient	compacteraient	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
37	en	en	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
38	structures	structure	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	de	de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	type	type	ADJ	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
41	«	«	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
42	rosettes	rosette	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
43	»	»	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
44	(	(	PUNC	_	_	45	punc	_	_	_	_	_
45	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
46	21	21	NUM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	;	;	PUNC	_	_	52	punc	_	_	_	_	_
48	Matoba	Matoba	NOM	_	_	52	periph	_	_	_	_	_
49	et	et	COO	_	_	50	mark	_	_	_	_	_
50	al.	al.	NOM	_	_	48	para	_	_	_	_	_
51	,	,	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
52	2005	2005	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
53	;	;	PUNC	_	_	54	punc	_	_	_	_	_
54	Hirano	Hirano	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
55	et	et	COO	_	_	56	mark	_	_	_	_	_
56	Hirano	Hirano	NOM	_	_	54	para	_	_	_	_	_
57	,	,	PUNC	_	_	58	punc	_	_	_	_	_
58	2006	2006	NUM	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
59	)	)	PUNC	_	_	58	punc	_	_	_	_	_
60	.	.	PUNC	_	_	52	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-758
# text = Cependant , le nombre total de molécules de MukB dans la cellule est de l'ordre de 150 , ce qui est bien trop faible pour être impliqué dans la formation de l'ensemble des 400 domaines topologiques .
1	Cependant	cependant	ADV	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	le	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	nombre	nombre	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
5	total	total	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	molécules	molécule	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	MukB	MukB	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	cellule	cellule	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	de	de l'ordre de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	l'	de l'ordre de	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	ordre	de l'ordre de	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de l'ordre de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	150	150	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	ce	ce	PRQ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
21	qui	qui	PRQ	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
22	est	être	VRB	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	bien	bien	ADV	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	trop	trop	ADV	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	faible	faible	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	pour	pour	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	être	être	VNF	_	_	28	aux	_	_	_	_	_
28	impliqué	impliquer	VPP	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	dans	dans	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	la	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	formation	formation	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	l'	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	ensemble	ensemble	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	des	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	400	400	NUM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
37	domaines	domaine	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	topologiques	topologique	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-759
# text = Comme dans le cas de la transcription , les complexes MukBEF ne peuvent contribuer qu'à la formation d'une partie des domaines topologiques .
1	Comme	comme	PRE	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	dans	dans	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	le	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	cas	cas	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	transcription	transcription	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
9	les	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	complexes	complexe	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
11	MukBEF	MukBEF	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	ne	ne	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	contribuer	contribuer	VNF	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	qu'	que	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	à	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	formation	formation	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	d'	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	une	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	partie	partie	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	des	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	domaines	domaine	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	topologiques	topologique	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-760
# text = Les Topos
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	Topos	Topos	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-761
# text = L'utilisation du système de recombinaison site-spécifique entre deux sites res , décrit ci-dessus , a montré que le nombre de domaines topologiques augmentait dans certains mutants des gènes codant la gyrase ..
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	utilisation	utilisation	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
3	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	système	système	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	site-spécifique	site	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	entre	entre	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	deux	deux	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	sites	site	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	res	ré	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
13	décrit	décrire	VPP	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
14	ci-dessus	ci-dessus	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
16	a	avoir	VRB	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
17	montré	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	que	que	CSU	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	le	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	nombre	nombre	NOM	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	domaines	domaine	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	topologiques	topologique	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	augmentait	augmenter	VRB	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
25	dans	dans	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	certains	certain	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	mutants	mutant	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	des	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	gènes	gène	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	codant	coder	VPR	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	la	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	gyrase	gyrase	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	..	...	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-762
# text = Les Topos pourraient donc intervenir dans la mise en place de domaines topologiques .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	Topos	Topos	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	donc	donc	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	intervenir	intervenir	VNF	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	dans	dans	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	mise	mise	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	en	en	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	place	place	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	domaines	domaine	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	topologiques	topologique	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-763
# text = Plus récemment , Moulin et al. ( 2005 ) ont démontré la capacité de la gyrase à former des barrières en utilisant un autre système expérimental .
1	Plus	plus	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	récemment	récemment	ADV	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	Moulin	Moulin	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
5	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	al.	al.	NOM	_	_	4	para	_	_	_	_	_
7	(	(	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
8	2005	2005	NUM	_	_	4	parenth	_	_	_	_	_
9	)	)	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
10	ont	avoir	VRB	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	démontré	démontrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	capacité	capacité	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	gyrase	gyrase	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	à	à	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	former	former	VNF	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	des	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	barrières	barrière	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	en	en	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	utilisant	utiliser	VPR	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	un	un	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
24	autre	autre	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	système	système	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	expérimental	expérimental	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-764
# text = Il s'agit d'une construction comportant d'une part un promoteur inductible fusionné au gène rapporteur uidA , codant la & 206;& 178;-glucuronidase ( GUS ) , suivi d'un terminateur fort de la transcription , et d'autre part le promoteur du gène gyrA , sensible à la superhélicité , et qui a été fusionné à lacZ , codant la & 206;& 178;-galactosidase
1	Il	il	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	s'	s'	CLI	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	agit	agir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	construction	construction	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	comportant	comporter	VPR	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	d'	d'une part	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	une	d'une part	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	part	d'une part	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	un	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	promoteur	promoteur	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
13	inductible	inductible	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	fusionné	fusionner	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	au	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	gène	gène	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	rapporteur	rapporteur	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	uidA	uidA	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	55	punc	_	_	_	_	_
20	codant	coder	VPR	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	β-glucuronidase	β-glucuronidase	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	(	(	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	GUS	GUS	NOM	_	_	22	parenth	_	_	_	_	_
25	)	)	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	55	punc	_	_	_	_	_
27	suivi	suivre	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
28	d'	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
29	un	un	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	terminateur	terminateur	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	fort	fort	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	la	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	transcription	transcription	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	,	,	PUNC	_	_	55	punc	_	_	_	_	_
36	et	et	COO	_	_	41	mark	_	_	_	_	_
37	d'	d'autre part	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	autre	d'autre part	ADV	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	part	d'autre part	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	le	le	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	promoteur	promoteur	NOM	_	_	34	para	_	_	_	_	_
42	du	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	gène	gène	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	gyrA	gyrA	ADJ	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	,	,	PUNC	_	_	55	punc	_	_	_	_	_
46	sensible	sensible	ADJ	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
47	à	à	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	la	le	DET	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
49	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	,	,	PUNC	_	_	55	punc	_	_	_	_	_
51	et	et	COO	_	_	55	mark	_	_	_	_	_
52	qui	qui	PRQ	_	_	55	subj	_	_	_	_	_
53	a	avoir	VRB	_	_	54	aux	_	_	_	_	_
54	été	être	VPP	_	_	55	aux	_	_	_	_	_
55	fusionné	fusionner	VPP	_	_	4	para	_	_	_	_	_
56	à	à	PRE	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
57	lacZ	lacZ	NOM	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
58	,	,	PUNC	_	_	59	punc	_	_	_	_	_
59	codant	coder	VPR	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
60	la	le	DET	_	_	61	spe	_	_	_	_	_
61	β-galactosidase	β-galactosidase	NOM	_	_	59	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-765
# text = ( Figure 22 ) .
1	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	Figure	Figure	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	22	22	NUM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
4	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
5	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-766
# text = Selon le modèle de Liu et Wang ( 1987 ) , l'avancée de l'ARN polymérase sur l'ADN lors de la transcription provoque des supertours positifs en amont de la machinerie transcriptionnelle et des supertours négatifs en aval ( Figure 5
1	Selon	selon	PRE	_	_	25	periph	_	_	_	_	_
2	le	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	modèle	modèle	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	Liu	Liu	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	7	mark	_	_	_	_	_
7	Wang	Wang	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
8	(	(	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
9	1987	1987	NUM	_	_	7	parenth	_	_	_	_	_
10	)	)	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	avancée	avancée	NOM	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
16	ARN	ARN	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	polymérase	polymérase	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	sur	sur	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	ADN	ADN	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	lors	lors de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
22	de	lors de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	transcription	transcription	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	provoque	provoquer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	des	un	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	supertours	super-	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	positifs	positif	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	en	en amont de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
30	amont	en amont de	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	de	en amont de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	la	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	machinerie	machinerie	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	transcriptionnelle	transcriptionnel	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	et	et	COO	_	_	36	mark	_	_	_	_	_
36	des	de	PRE	_	_	31	para	_	_	_	_	_
37	supertours	super-	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	négatifs	négatif	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	en	en	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	aval	aval	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	(	(	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
42	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
43	5	5	NUM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-767
# text = A ) .
1	A	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-768
# text = L'induction de la transcription de uidA va ainsi provoquer des supertours positifs qui pourraient se transmettre jusqu'au promoteur gyrA. Suite à l'induction de la transcription du gène uidA , Moulin et al. ( 2005 ) ont démontré un accroissement de l'activité & 206;& 178;-galactosidase , et donc de l'activité du promoteur gyrA sensible au niveau de superhélicité du chromosome .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	induction	induction	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	transcription	transcription	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	uidA	uidA	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	va	aller	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	ainsi	ainsi	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	provoquer	provoquer	VNF	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	des	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	supertours	super-	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	positifs	positif	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	qui	qui	PRQ	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
15	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	se	se	CLI	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	transmettre	transmettre	VNF	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	jusqu'au	jusqu'à	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	promoteur	promoteur	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	gyrA.	gyrA.	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	Suite	Suite	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	à	à	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	l'	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	induction	induction	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	la	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	transcription	transcription	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	du	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	gène	gène	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	uidA	uidA	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
32	Moulin	Moulin	NOM	_	_	39	subj	_	_	_	_	_
33	et	et	COO	_	_	34	mark	_	_	_	_	_
34	al.	al.	NOM	_	_	32	para	_	_	_	_	_
35	(	(	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
36	2005	2005	NUM	_	_	39	periph	_	_	_	_	_
37	)	)	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
38	ont	avoir	VRB	_	_	39	aux	_	_	_	_	_
39	démontré	démontrer	VPP	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
40	un	un	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	accroissement	accroissement	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	de	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	l'	le	DET	_	_	44	spe	_	_	_	_	_
44	activité	activité	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	β-galactosidase	β-galactosidase	ADJ	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	,	,	PUNC	_	_	49	punc	_	_	_	_	_
47	et	et donc	COO	_	_	49	mark	_	_	_	_	_
48	donc	et donc	ADV	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	de	de	PRE	_	_	42	para	_	_	_	_	_
50	l'	le	DET	_	_	51	spe	_	_	_	_	_
51	activité	activité	NOM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
52	du	de	PRE	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	promoteur	promoteur	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	gyrA	gyrA	ADJ	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	sensible	sensible	ADJ	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
56	au	à	PRE	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
57	niveau	niveau	NOM	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
58	de	de	PRE	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
59	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
60	du	de	PRE	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
61	chromosome	chromosome	NOM	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
62	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-769
# text = La diffusion de supertours positifs créés par la transcription de uidA , et donc l'induction du promoteur de gyrA , peut se faire à des distances d'environ 4 kb .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	diffusion	diffusion	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	supertours	super-	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	positifs	positif	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	créés	créer	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	par	par	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	transcription	transcription	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	uidA	uidA	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
14	donc	donc	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	induction	induction	NOM	_	_	9	para	_	_	_	_	_
17	du	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	promoteur	promoteur	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	gyrA	gyrA	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
22	peut	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	se	se	CLI	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	faire	faire	VNF	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	à	à	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	des	un	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	distances	distance	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	d'	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	environ	environ	ADV	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
30	4	4	NUM	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	kb	kilomètre	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-770
# text = Des séquences d'ADN connues pour contenir des sites de fixation de la gyrase ont alors été insérées entre le promoteur inductible et le promoteur de gyrA .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	séquences	séquence	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ADN	ADN	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	connues	connaître	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	pour	pour	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	contenir	contenir	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	des	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	sites	site	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	fixation	fixation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	gyrase	gyrase	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	ont	avoir	VRB	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
16	alors	alors	ADV	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
17	été	être	VPP	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
18	insérées	insérer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	entre	entre	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	le	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	promoteur	promoteur	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	inductible	inductible	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
24	le	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	promoteur	promoteur	NOM	_	_	21	para	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	gyrA	gyrA	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-771
# text = Ces insertions entraînent une diminution de la transcription à partir du promoteur gyrA et empêchent donc la diffusion des supertours positifs générés par l'induction transcriptionnelle du gène uidA. Des sites de fixation de la gyrase peuvent donc faire office de barrières pour les domaines topologiques , et cette capacité est fortement corrélée à l'activité de coupure de l'ADN par l'enzyme .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	insertions	insertion	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	entraînent	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	une	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	diminution	diminution	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	transcription	transcription	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	à	à partir de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
10	partir	à partir de	DET	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	du	à partir de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	promoteur	promoteur	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	gyrA	gyrA	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	empêchent	empêcher	VRB	_	_	3	para	_	_	_	_	_
16	donc	donc	COO	_	_	37	mark	_	_	_	_	_
17	la	la	NOM	_	_	37	subj	_	_	_	_	_
18	diffusion	diffusion	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	des	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	supertours	super-	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	positifs	positif	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	générés	générer	VPP	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	par	par	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	l'	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	induction	induction	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	transcriptionnelle	transcriptionnel	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	du	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	gène	gène	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	uidA.	uidA.	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	Des	Des	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	sites	site	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	fixation	fixation	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	la	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	gyrase	gyrase	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	15	para	_	_	_	_	_
38	donc	donc	ADV	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	faire	faire	VNF	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	office	office	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	de	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	barrières	barrière	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	pour	pour	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
44	les	le	DET	_	_	45	spe	_	_	_	_	_
45	domaines	domaine	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	topologiques	topologique	ADJ	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	,	,	PUNC	_	_	53	punc	_	_	_	_	_
48	et	et	COO	_	_	53	mark	_	_	_	_	_
49	cette	ce	DET	_	_	50	spe	_	_	_	_	_
50	capacité	capacité	NOM	_	_	53	subj	_	_	_	_	_
51	est	être	VRB	_	_	53	aux	_	_	_	_	_
52	fortement	fortement	ADV	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
53	corrélée	corréler	VPP	_	_	15	para	_	_	_	_	_
54	à	à	PRE	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	l'	le	DET	_	_	56	spe	_	_	_	_	_
56	activité	activité	NOM	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
57	de	de	PRE	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
58	coupure	coupure	NOM	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
59	de	de	PRE	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
60	l'	le	DET	_	_	61	spe	_	_	_	_	_
61	ADN	ADN	NOM	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
62	par	par	PRE	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
63	l'	le	DET	_	_	64	spe	_	_	_	_	_
64	enzyme	enzyme	NOM	_	_	62	dep	_	_	_	_	_
65	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-772
# text = La gyrase est connue pour se fixer sur des sites spécifiques appelés SGS ( Strong Gyrase
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	gyrase	gyrase	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	connue	connaître	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	pour	pour	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	se	se	CLI	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	fixer	fixer	VNF	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	sur	sur	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	des	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	sites	site	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	spécifiques	spécifique	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	appelés	appeler	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	SGS	SGS	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
15	Strong	Strong	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	Gyrase	Gyrase	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-773
# text = Site ) dans le cas du génome du bactériophage Mu , mais également présents sur des plasmides , à différentes positions sur le chromosome , et sur le génome d'autres bactériophages
1	Site	site	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	dans	dans	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	cas	cas	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	du	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	génome	génome	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	du	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	bactériophage	bactériophage	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	Mu	Mu	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
12	mais	mais	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
13	également	également	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	présents	présent	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
15	sur	sur	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	des	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	plasmides	plasmode	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	à	à	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	différentes	différent	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	positions	position	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	sur	sur	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	le	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	chromosome	chromosome	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
27	sur	sur	PRE	_	_	22	para	_	_	_	_	_
28	le	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	génome	génome	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	d'	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	autres	autre	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
32	bactériophages	bactériophage	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-774
# text = ( Morrison et Cozzarelli , 1979 ; Lockshon et Morris , 1985 ; Franco et Drlica , 1988 ) .
1	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	Morrison	Morrison	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	4	mark	_	_	_	_	_
4	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
6	1979	1979	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	;	;	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
8	Lockshon	Lockshon	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	Morris	Morris	NOM	_	_	8	para	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
12	1985	1985	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	;	;	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	Franco	Franco	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	Drlica	Drlica	NOM	_	_	14	para	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	1988	1988	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	)	)	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-775
# text = D'autre part , la gyrase se fixe sur des séquences répétées présentes en plusieurs centaines de copies chez E. coli et S. typhimurium , nommées séquences REP ( Repetitive Extragenic Palindromic ) ( Yang et Ames , 1988 ) et BIME (
1	D'	d'autre part	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	autre	d'autre part	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	part	d'autre part	ADV	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	gyrase	gyrase	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
7	se	se	CLI	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	fixe	fixer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	sur	sur	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	des	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	séquences	séquence	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	répétées	répéter	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	présentes	présent	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	en	en	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	centaines	centaines	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	copies	copie	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	chez	chez	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
20	E.	E.	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	coli	coli	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	S.	S.	NOM	_	_	21	para	_	_	_	_	_
24	typhimurium	typhimurium	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
26	nommées	nommer	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
27	séquences	séquence	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	REP	REP	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
29	(	rep ( repetitive extragenic palindromic )	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
30	Repetitive	Repetitive	NOM	_	_	28	parenth	_	_	_	_	_
31	Extragenic	Extragenic	NOM	_	_	30	para	_	_	_	_	_
32	Palindromic	Palindromic	NOM	_	_	31	para	_	_	_	_	_
33	)	rep ( repetitive extragenic palindromic )	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
34	(	(	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_
35	Yang	Yang	NOM	_	_	23	parenth	_	_	_	_	_
36	et	et	COO	_	_	37	mark	_	_	_	_	_
37	Ames	Ames	NOM	_	_	35	para	_	_	_	_	_
38	,	,	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
39	1988	1988	NUM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	)	)	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_
41	et	et	COO	_	_	42	mark	_	_	_	_	_
42	BIME	BIME	NOM	_	_	37	para	_	_	_	_	_
43	(	(	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-776
# text = Interspersed Mosaic Elements ) .
1	Interspersed	Interspersed	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Mosaic	Mosaic	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Elements	Elements	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-777
# text = Le fait que la gyrase puisse constituer un type de barrières en se fixant sur ces sites rappelle la situation observée chez les eucaryotes , où la topoisomérase II est localisée à la base des boucles d'ADN ( Earnshaw et Heck , 1985 ) .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fait	fait	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
3	que	que	CSU	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	gyrase	gyrase	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	puisse	pouvoir	VRB	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	constituer	constituer	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	un	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	type	type	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	barrières	barrière	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	en	en	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
13	se	se	CLI	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	fixant	fixer	VPR	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	sur	sur	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	ces	ce	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	sites	site	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	rappelle	rappeler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	situation	situation	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	observée	observer	VPP	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	chez	chez	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	les	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	eucaryotes	eucaryote	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
26	où	où	PRQ	_	_	31	periph	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	topoisomérase	topoisomérase	NOM	_	_	31	subj	_	_	_	_	_
29	II	II	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	est	être	VRB	_	_	31	aux	_	_	_	_	_
31	localisée	localiser	VPP	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
32	à	à	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	la	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	base	base	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	des	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	boucles	boucle	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	d'	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	ADN	ADN	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	(	(	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
40	Earnshaw	Earnshaw	NOM	_	_	38	parenth	_	_	_	_	_
41	et	et	COO	_	_	42	mark	_	_	_	_	_
42	Heck	Heck	NOM	_	_	40	para	_	_	_	_	_
43	,	,	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
44	1985	1985	NUM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	)	)	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
46	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-778
# text = Les protéines liées au nucléoïde
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéines	protéine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	liées	lier	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	au	à	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	nucléoïde	nucléoïde	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-779
# text = Les protéines de type histone jouent un rôle majeur dans l'organisation du nucléoïde grâce à deux propriétés fondamentales :
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéines	protéine	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	type	type	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	histone	histone	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	jouent	jouer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	un	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	rôle	rôle	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	majeur	majeur	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	organisation	organisation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	du	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	nucléoïde	nucléoïde	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	grâce	grâce à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
16	à	grâce à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	deux	deux	NUM	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	propriétés	propriété	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	fondamentales	fondamental	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	:	:	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-780
# text = elles sont présentes en quantités abondantes dans les cellules bactériennes et se fixent à l'ADN de manière non spécifique .
1	elles	elles	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	présentes	présent	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	en	en	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	quantités	quantité	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	abondantes	abondant	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	dans	dans	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	cellules	cellule	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	bactériennes	bactérien	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
12	se	se	CLI	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	fixent	fixer	VRB	_	_	2	para	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	ADN	ADN	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	manière	manière	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	non	non	ADV	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	spécifique	spécifique	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-781
# text = Même pour celles présentant une certaine spécificité de fixation , comme IHF ou Fis , les quantités présentes sont bien supérieures au nombre de sites de fixation à forte affinité , et elles vont donc également se fixer de manière aspécifique .
1	Même	même	ADJ	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
2	pour	pour	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	celles	celui	PRQ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	présentant	présenter	VPR	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
6	certaine	certain	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	spécificité	spécificité	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	fixation	fixation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
11	comme	comme	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
12	IHF	IHF	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	ou	ou	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	Fis	Fis	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
16	les	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	quantités	quantité	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
18	présentes	présent	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	bien	bien	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	supérieures	supérieur	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	au	à	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	nombre	nombre	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	sites	site	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	fixation	fixation	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	à	à	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	forte	fort	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	affinité	affinité	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
32	et	et	COO	_	_	34	mark	_	_	_	_	_
33	elles	elles	CLS	_	_	34	subj	_	_	_	_	_
34	vont	aller	VRB	_	_	19	para	_	_	_	_	_
35	donc	donc	ADV	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	également	également	ADV	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	se	se	CLI	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
38	fixer	fixer	VNF	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
39	de	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
40	manière	manière	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	aspécifique	aspécifique	ADJ	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-782
# text = Hardy et Cozzarelli ( 2005 ) ont tenté d'identifier les constituants des barrières topologiques en utilisant un crible génétique afin d'identifier des mutants de ces barrières chez E. coli .
1	Hardy	hardy	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
2	et	et	COO	_	_	3	mark	_	_	_	_	_
3	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	(	(	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
5	2005	2005	NUM	_	_	1	parenth	_	_	_	_	_
6	)	)	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
7	ont	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	tenté	tenter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	identifier	identifier	VNF	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	les	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	constituants	constituant	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	des	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	barrières	barrière	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	topologiques	topologique	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	en	en	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
17	utilisant	utiliser	VPR	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	un	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	crible	crible	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	génétique	génétique	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	afin	afin de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
22	d'	afin de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	identifier	identifier	VNF	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	des	un	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	mutants	mutant	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	ces	ce	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	barrières	barrière	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	chez	chez	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
30	E.	E.	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	coli	coli	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-783
# text = L'hypothèse de départ consiste à imaginer qu'un mutant de barrières topologiques va présenter un ADN globalement plus relâché que la souche sauvage .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	hypothèse	hypothèse	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	départ	départ	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	consiste	consister	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	à	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	imaginer	imaginer	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	qu'	que	CSU	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	un	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	mutant	mutant	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	barrières	barrière	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	topologiques	topologique	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	va	aller	VRB	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	présenter	présenter	VNF	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	un	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	ADN	ADN	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	globalement	globalement	ADV	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
19	plus	plus	ADV	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	relâché	relâcher	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	que	que	CSU	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	souche	souche	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	sauvage	sauvage	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-784
# text = Une souche a été construite , contenant les gènes rapporteurs bla et lacZ , codant respectivement la & 206;& 178;-lactamase et la & 206;& 178;-galactosidase , chacun sous le contrôle du promoteur de gyrB , dont la transcription dépend du degré de superhélicité et augmente suite à un relâchement de l'ADN .
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	souche	souche	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	a	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	construite	construire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_
7	contenant	contenir	VPR	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	gènes	gène	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	rapporteurs	rapporteur	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	bla	bal	NOM	_	_	35	subj	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	lacZ	lacZ	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
15	codant	coder	VPR	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
16	respectivement	respectivement	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	β-lactamase	β-lactamase	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	β-galactosidase	β-galactosidase	NOM	_	_	18	para	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
23	chacun	chacun	PRQ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
24	sous	sous	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	le	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	contrôle	contrôle	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	du	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	promoteur	promoteur	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	gyrB	gyrB	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
32	dont	dont	PRQ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
33	la	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	transcription	transcription	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
35	dépend	dépendre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
36	du	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	degré	degré	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	et	et	COO	_	_	41	mark	_	_	_	_	_
41	augmente	augmenter	VRB	_	_	35	para	_	_	_	_	_
42	suite	suite à	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
43	à	suite à	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	un	un	DET	_	_	45	spe	_	_	_	_	_
45	relâchement	relâchement	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	de	de	PRE	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	l'	le	DET	_	_	48	spe	_	_	_	_	_
48	ADN	ADN	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
49	.	.	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-785
# text = Chacun des gènes rapporteurs a été intégré dans le chromosome de la souche rapporteur , les deux gènes étant insérés à deux loci différents ( Hardy et Cozzarelli , 2005 ) .
1	Chacun	chacun	PRQ	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
2	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	gènes	gène	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	rapporteurs	rapporteur	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	a	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	été	être	VPP	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	intégré	intégrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	dans	dans	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	le	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	chromosome	chromosome	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	souche	souche	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	rapporteur	rapporteur	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
16	les	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
17	deux	deux	NUM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	gènes	gène	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
19	étant	être	VPR	_	_	20	aux	_	_	_	_	_
20	insérés	insérer	VPP	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	à	à	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	deux	deux	NUM	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	loci	locus	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	différents	différent	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	(	(	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	Hardy	Hardy	NOM	_	_	23	parenth	_	_	_	_	_
27	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
28	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	26	para	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
30	2005	2005	NUM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	)	)	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-786
# text = Ainsi , la sélection sur les deux phénotypes simultanés , c'est-à-dire la résistance à l'ampicilline et une forte activité & 206;& 178;-galactosidase , permet de visualiser l'activation de la transcription du promoteur gyrB probablement due à un relâchement de l'ADN .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	24	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	sélection	sélection	NOM	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
5	sur	sur	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
7	deux	deux	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	phénotypes	phénotype	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	simultanés	simultané	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
11	c'	c'est-à-dire	COO	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	est-à-dire	c'est-à-dire	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	résistance	résistance	NOM	_	_	8	para	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	ampicilline	amoxicilline	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
19	une	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
20	forte	fort	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	activité	activité	NOM	_	_	17	para	_	_	_	_	_
22	β-galactosidase	β-galactosidase	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
24	permet	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	visualiser	visualiser	VNF	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	l'	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	activation	activation	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	la	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	transcription	transcription	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	du	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	promoteur	promoteur	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	gyrB	gyrB	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	probablement	probablement	ADV	_	_	36	periph	_	_	_	_	_
36	due	devoir	VPP	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
37	à	à	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	un	un	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	relâchement	relâchement	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	de	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	l'	le	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	ADN	ADN	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	.	.	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-787
# text = Celui  -ci a lieu au niveau global du chromosome , plutôt qu'à un niveau local , car les deux gènes rapporteurs sont insérés à deux loci différents .
1	Celui	celui	PRQ	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	 -ci	 -ci	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	lieu	lieu	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	au	à	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	niveau	niveau	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	global	global	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	du	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	chromosome	chromosome	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
11	plutôt	plutôt que	CSU	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	qu'	plutôt que	CSU	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	24	periph	_	_	_	_	_
14	un	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	niveau	niveau	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	local	local	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
18	car	car	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
19	les	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
20	deux	deux	NUM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	gènes	gène	NOM	_	_	15	para	_	_	_	_	_
22	rapporteurs	rapporteur	NOM	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
23	sont	être	VRB	_	_	24	aux	_	_	_	_	_
24	insérés	insérer	VPP	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
25	à	à	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	deux	deux	NUM	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	loci	locus	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	différents	différent	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-788
# text = Une mutagenèse par insertion utilisant le transposon mini-Tn 10 a été effectué , et les clones portant une insertion aléatoire du mini-Tn 10 ont alors été sélectionnés et criblés pour une fréquence de résistance à l'ampicilline accrue , ainsi que pour une production accrue de & 206;& 178;-galactosidase , par étalement sur un milieu contenant de l'ampicilline et du Xgal .
1	Une	un	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	mutagenèse	muter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	par	par	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	insertion	insertion	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	utilisant	utiliser	VPR	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	le	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	transposon	transposon	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	mini-Tn	mini-	VPR	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	10	10	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	été	été	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	effectué	effectuer	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
15	les	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	clones	clone	NOM	_	_	27	subj	_	_	_	_	_
17	portant	porter	VPR	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	une	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	insertion	insertion	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	aléatoire	aléatoire	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	du	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	mini-Tn	mini-	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	10	10	NUM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	ont	avoir	VRB	_	_	26	aux	_	_	_	_	_
25	alors	alors	ADV	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
26	été	être	VPP	_	_	27	aux	_	_	_	_	_
27	sélectionnés	sélectionner	VPP	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
28	et	et	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
29	criblés	cribler	VPP	_	_	27	para	_	_	_	_	_
30	pour	pour	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	une	un	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	fréquence	fréquence	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	résistance	résistance	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	à	à	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	l'	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	ampicilline	amoxicilline	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	accrue	accru	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	,	,	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
40	ainsi	ainsi que	COO	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
41	que	ainsi que	COO	_	_	49	mark	_	_	_	_	_
42	pour	pour	PRE	_	_	11	para	_	_	_	_	_
43	une	un	DET	_	_	44	spe	_	_	_	_	_
44	production	production	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	accrue	accru	ADJ	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	de	de	PRE	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	β-galactosidase	β-galactosidase	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	,	,	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
49	par	par	NOM	_	_	42	mark	_	_	_	_	_
50	étalement	étalement	NOM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	sur	sur	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	un	un	DET	_	_	53	spe	_	_	_	_	_
53	milieu	milieu	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
54	contenant	contenir	VPR	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	de	de	PRE	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
56	l'	le	DET	_	_	57	spe	_	_	_	_	_
57	ampicilline	amoxicilline	NOM	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
58	et	et	COO	_	_	59	mark	_	_	_	_	_
59	du	de	PRE	_	_	55	para	_	_	_	_	_
60	Xgal	Xgal	NOM	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
61	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-789
# text = Parmi les gènes identifiés par cette approche génétique , Hardy et Cozzarelli ( 2005 ) ont identifié hns , codant la protéine de type histone H-NS , qui constitue donc une barrière de domaines topologiques .
1	Parmi	parmi	PRE	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
2	les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	gènes	gène	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	identifiés	identifier	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	cette	ce	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	approche	approche	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	génétique	génétique	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
10	Hardy	Hardy	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	12	mark	_	_	_	_	_
12	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
13	(	(	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	2005	2005	NUM	_	_	12	parenth	_	_	_	_	_
15	)	)	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
16	ont	avoir	VRB	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
17	identifié	identifier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	hns	un	PRQ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	codant	coder	VPR	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	protéine	protéine	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	type	type	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	histone	histone	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	H-NS	H-NS	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
28	qui	qui	PRQ	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
29	constitue	constituer	VRB	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
30	donc	donc	ADV	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	une	un	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	barrière	barrière	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	domaines	domaine	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	topologiques	topologique	ADJ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-790
# text = Afin d'analyser de façon plus exhaustive le rôle potentiel des protéines de type histone , Hardy et Cozzarelli ( 2005 ) ont également utilisé une approche plus ciblée en délétant chacun des gènes d'histone dans leur souche rapporteur .
1	Afin	afin de	PRE	_	_	25	periph	_	_	_	_	_
2	d'	afin de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	analyser	analyser	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	façon	façon	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	plus	plus	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	exhaustive	exhaustif	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	rôle	rôle	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
10	potentiel	potentiel	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	des	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	protéines	protéine	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	type	type	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	histone	histone	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
17	Hardy	Hardy	NOM	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	17	para	_	_	_	_	_
20	(	(	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	2005	2005	NUM	_	_	19	parenth	_	_	_	_	_
22	)	)	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
23	ont	avoir	VRB	_	_	25	aux	_	_	_	_	_
24	également	également	ADV	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	utilisé	utiliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	une	un	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	approche	approche	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	plus	plus	ADV	_	_	29	periph	_	_	_	_	_
29	ciblée	cibler	VPP	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	en	en	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	délétant	délégant	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	chacun	chacun	PRQ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
33	des	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	gènes	gène	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	d'	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	histone	histone	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	dans	dans	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
38	leur	son	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	souche	souche	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	rapporteur	rapporteur	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	.	.	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-791
# text = Ceci leur a permis de montrer que Fis constituait également une barrière , ce qui n'était pas le cas d'IHF , de StpA ou de HU .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	leur	le	CLI	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
3	a	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	permis	permettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	montrer	montrer	VNF	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	que	que	CSU	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	Fis	Fis	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
9	constituait	constituer	VRB	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	également	également	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	barrière	barrière	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	ce	ce	PRQ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
15	qui	qui	PRQ	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
16	n'	ne	ADV	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	était	être	VRB	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	pas	pas	ADV	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	le	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	cas	cas	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	d'	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	IHF	IHF	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	21	para	_	_	_	_	_
25	StpA	StpA	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	ou	ou	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	24	para	_	_	_	_	_
28	HU	HU	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-792
# text = Les protéines de type histone Fis et H-NS ont été particulièrement étudiées au niveau structural pour leur interaction avec l'ADN , sur lequel elles forment des boucles .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéines	protéine	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	type	type	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	histone	histone	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	Fis	Fis	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	H-NS	H-NS	NOM	_	_	6	para	_	_	_	_	_
9	ont	avoir	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	été	être	VPP	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
11	particulièrement	particulièrement	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	étudiées	étudier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	au	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	niveau	niveau	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	structural	structural	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	pour	pour	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
17	leur	son	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	interaction	interaction	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	avec	avec	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	ADN	ADN	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
23	sur	sur	PRE	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
24	lequel	lequel	PRQ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	elles	elles	CLS	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
26	forment	former	VRB	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
27	des	un	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	boucles	boucle	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-793
# text = Elles peuvent donc constituer des barrières de domaines topologiques .
1	Elles	elles	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	donc	donc	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	constituer	constituer	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	des	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	barrières	barrière	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	domaines	domaine	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	topologiques	topologique	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-794
# text = H-NS forme des oligomères et peut se fixer de façon coopérative sur plusieurs centaines de paires de bases .
1	H-NS	heure	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	forme	former	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	des	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	oligomères	oligomères	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	peut	pouvoir	VRB	_	_	2	para	_	_	_	_	_
7	se	se	CLI	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	fixer	fixer	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	façon	façon	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	coopérative	coopératif	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	sur	sur	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
13	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	centaines	centaines	NUM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	paires	paire	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	bases	base	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-795
# text = Ces auteurs ont montré par microscopie à force atomique que de telles structures ADN / H-NS pouvaient s'associer entre elles , provoquant ainsi non seulement la condensation de l'ADN , mais aussi une extrusion sous forme de boucles d'ADN libre ( Figure 23A ) .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	auteurs	auteur	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	ont	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	montré	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	microscopie	microscopie	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	force	force	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	atomique	atomique	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	que	que	CSU	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
11	de	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
12	telles	tel	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	structures	structure	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
14	ADN	ADN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	/	sur	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
16	H-NS	H-NS	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	pouvaient	pouvoir	VRB	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
18	s'	s'	CLI	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	associer	associer	VNF	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	entre	entre	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	elles	lui	PRQ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
23	provoquant	provoquer	VPR	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
24	ainsi	ainsi	ADV	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	non	non	ADV	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	seulement	seulement	ADV	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	condensation	condensation	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	l'	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	ADN	ADN	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	,	,	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
33	mais	mais aussi	COO	_	_	36	mark	_	_	_	_	_
34	aussi	mais aussi	ADV	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	une	un	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	extrusion	extrusion	NOM	_	_	28	para	_	_	_	_	_
37	sous	sous	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	forme	forme	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	de	de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	boucles	boucle	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	d'	de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	ADN	ADN	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	libre	libre	ADJ	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	(	(	PUNC	_	_	45	punc	_	_	_	_	_
45	Figure	Figure	NOM	_	_	40	parenth	_	_	_	_	_
46	23A	23A	NUM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	)	)	PUNC	_	_	45	punc	_	_	_	_	_
48	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-796
# text = Par ailleurs , des mutants H-NS présentent une fréquence élevée de cellules anucléées ..
1	Par	par ailleurs	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	ailleurs	par ailleurs	ADV	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	mutants	mutant	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
6	H-NS	H-NS	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	présentent	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	une	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	fréquence	fréquence	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	élevée	élevé	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	cellules	cellule	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	anucléées	nucléé	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	..	...	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-797
# text = Toutes ces données font d'H-NS une frontière idéale de domaines topologiques .
1	Toutes	tout	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	données	donnée	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	font	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	d'	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	H-NS	H-NS	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	une	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	frontière	frontière	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	idéale	idéal	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	domaines	domaine	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	topologiques	topologique	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-798
# text = Fis est capable de se lier à l'ADN sur une séquence spécifique , bien que dégénérée , mais également de façon non spécifique ( voir paragraphe I.B. 3 ) .
1	Fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	est	est	NOM	_	_	1	subj	_	_	_	_	_
3	capable	capable	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	se	se	CLI	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	lier	lier	VNF	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	ADN	ADN	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	sur	sur	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	séquence	séquence	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	spécifique	spécifique	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
15	bien	bien que	CSU	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	que	bien que	CSU	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
17	dégénérée	dégénéré	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
19	mais	mais	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
20	également	également	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	façon	façon	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	non	non	ADV	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	spécifique	spécifique	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	(	(	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	voir	voir	VNF	_	_	1	parenth	_	_	_	_	_
27	paragraphe	paragraphe	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	I.B.	I.B.	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	3	3	NUM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	)	)	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-799
# text = In vitro , Fis se fixe préférentiellement à des points de croisements et de branchements sur l'ADN superenroulé , suggérant que Fis puisse , comme H-NS , contraindre des boucles d'ADN ( Figure 23B ) .
1	In	in vitro	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	vitro	in vitro	ADV	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	se	se	CLI	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	fixe	fixer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	préférentiellement	préférentiellement	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	des	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	points	point	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	croisements	croisement	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	11	para	_	_	_	_	_
15	branchements	branchement	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	sur	sur	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	ADN	ADN	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	superenroulé	super-	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	suggérant	suggérer	VPR	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
22	que	que	CSU	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	Fis	Fis	NOM	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
24	puisse	pouvoir	VRB	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
26	comme	comme	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	H-NS	H-NS	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	contraindre	contraindre	VNF	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
30	des	un	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	boucles	boucle	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	d'	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	ADN	ADN	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	(	(	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_
35	Figure	Figure	NOM	_	_	31	parenth	_	_	_	_	_
36	23B	23B	NUM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	)	)	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_
38	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-800
# text = Des mutants fis présentent des défauts de ségrégation des chromosomes et de division cellulaire à haute température .
1	Des	de	PRE	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	mutants	mutant	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	présentent	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	des	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	défauts	défaut	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ségrégation	ségrégation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	des	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	chromosomes	chromosome	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	12	mark	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	9	para	_	_	_	_	_
13	division	division	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	haute	haut	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	température	température	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-801
# text = De plus , Fis est présente en quantités extrêmement importantes dans la cellule en phase exponentielle de croissance ( plus de 50 000 molécules par cellule ) , moment où le nombre de domaines topologiques est élevé , puis diminue fortement en phase stationnaire , avec le nombre de domaines .
1	De	de plus	PRE	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	présente	présent	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	en	en	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	quantités	quantité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	extrêmement	extrêmement	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	importantes	important	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	dans	dans	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	cellule	cellule	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	en	en	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	phase	phase	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	croissance	croissance	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	(	(	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
20	plus	plus	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	18	parenth	_	_	_	_	_
22	50	50	NUM	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	000	000	NUM	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	molécules	molécule	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	par	par	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	cellule	cellule	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	)	)	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	moment	moment	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
30	où	où	PRQ	_	_	37	periph	_	_	_	_	_
31	le	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	nombre	nombre	NOM	_	_	37	subj	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	domaines	domaine	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	topologiques	topologique	ADJ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	est	être	VRB	_	_	37	aux	_	_	_	_	_
37	élevé	élever	VPP	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
38	,	,	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
39	puis	puis	COO	_	_	40	mark	_	_	_	_	_
40	diminue	diminuer	VRB	_	_	37	para	_	_	_	_	_
41	fortement	fortement	ADV	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	en	en	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	phase	phase	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	,	,	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_
46	avec	avec	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
47	le	le	DET	_	_	48	spe	_	_	_	_	_
48	nombre	nombre	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
49	de	de	PRE	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	domaines	domaine	NOM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-802
# text = Les autres protéines
1	Les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	autres	autre	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	protéines	protéine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-803
# text = La stratégie utilisée par Hardy et Cozzarelli ( 2005 ) leur a également permis de mettre en évidence 3 autres protéines pouvant contribuer à la formation des barrières topologiques .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	stratégie	stratégie	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
3	utilisée	utiliser	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	par	par	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	Hardy	Hardy	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	7	mark	_	_	_	_	_
7	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	5	para	_	_	_	_	_
8	(	(	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
9	2005	2005	NUM	_	_	2	parenth	_	_	_	_	_
10	)	)	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
11	leur	le	CLI	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
12	a	avoir	VRB	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
13	également	également	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	permis	permettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	mettre	mettre	VNF	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	en	en	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	évidence	évidence	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	3	3	NUM	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
20	autres	autre	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	protéines	protéine	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
22	pouvant	pouvoir	VPR	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	contribuer	contribuer	VNF	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	à	à	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	formation	formation	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	des	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	barrières	barrière	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	topologiques	topologique	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-804
# text = La première , codée par le gène pgm , est une phosphoglucomutase impliquée dans la glycolyse .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	première	premier	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	codée	coder	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	le	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	gène	gène	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	pgm	Pam	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
10	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	phosphoglucomutase	phosphoglucomutase	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	impliquée	impliquer	VPP	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	dans	dans	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	glycolyse	glycolyse	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-805
# text = Ce gène forme un opéron avec seqA , codant la protéine SeqA , qui se lie à l'ADN hémiméthylé et séquestre l'origine de réplication chez E. coli , assurant ainsi la coordination entre l'initiation de la réplication et le cycle cellulaire .
1	Ce	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	gène	gène	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	forme	former	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	un	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	opéron	opéron	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	avec	avec	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	seqA	seqA	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
9	codant	coder	VPR	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	protéine	protéine	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	SeqA	SeqA	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
14	qui	qui	PRQ	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
15	se	se	CLI	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	lie	lier	VRB	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
17	à	à	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	ADN	ADN	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	hémiméthylé	Hemi	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	séquestre	séquestrer	VRB	_	_	16	para	_	_	_	_	_
23	l'	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	origine	origine	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	réplication	réplication	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	chez	chez	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
28	E.	E.	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
29	coli	coli	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
31	assurant	assurer	VPR	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
32	ainsi	ainsi	ADV	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	la	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	coordination	coordination	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
35	entre	entre	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	l'	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	initiation	initiation	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	la	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	réplication	réplication	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	et	et	COO	_	_	43	mark	_	_	_	_	_
42	le	le	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	cycle	cycle	NOM	_	_	37	para	_	_	_	_	_
44	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-806
# text = SeqA est également impliquée dans la condensation du chromosome .
1	SeqA	SeqA	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
3	également	également	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	impliquée	impliquer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	condensation	condensation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	du	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	chromosome	chromosome	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-807
# text = Cependant , le rôle précis de Pgm et/ou de SeqA en tant que barrières topologiques n'est pas connu ( Hardy et Cozzarelli , 2005 ) .
1	Cependant	cependant	ADV	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	le	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	rôle	rôle	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
5	précis	précis	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	Pgm	Pgm	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	et/ou	et-ou	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	6	para	_	_	_	_	_
10	SeqA	SeqA	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	en	en tant que	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	tant	en tant que	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	que	en tant que	CSU	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	barrières	barrière	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	topologiques	topologique	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	n'	ne	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
17	est	être	VRB	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
18	pas	pas	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	connu	connaître	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	(	(	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	Hardy	Hardy	NOM	_	_	19	parenth	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	21	para	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	2005	2005	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	)	)	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-808
# text = La deuxième protéine identifiée est DksA. Des mutants du gène dksA chez E. coli et S. flexneri présentent des cellules filamenteuses .
1	La	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	deuxième	deuxième	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	protéine	protéine	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
4	identifiée	identifier	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	DksA.	DksA.	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	Des	Des	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	mutants	mutant	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	du	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	gène	gène	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	dksA	dksA	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	chez	chez	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
13	E.	E.	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	coli	coli	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
16	S.	S.	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	flexneri	flexneri	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
18	présentent	présenter	VRB	_	_	5	para	_	_	_	_	_
19	des	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	cellules	cellule	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	filamenteuses	filamenteux	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-809
# text = Ces mutants révèlent également des interactions génétiques entre dksA et d'autres gènes , tels que dnaK , qui code un facteur de l'hôte nécessaire à la réplication de l'ADN du bactériophage & 206;& 187; ( Georgopoulos , 1977 ) , mukB , codant une protéine de type SMC ( voir paragraphe
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutants	mutant	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	révèlent	révéler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	également	également	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	interactions	interaction	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	génétiques	génétique	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	entre	entre	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	dksA	dksA	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
11	d'	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
12	autres	autre	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	gènes	gène	NOM	_	_	6	para	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	51	punc	_	_	_	_	_
15	tels	tel	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
16	que	que	CSU	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	dnaK	dnaK	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	51	punc	_	_	_	_	_
19	qui	qui	PRQ	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
20	code	coder	VRB	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	un	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	facteur	facteur	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	l'	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	hôte	hôte	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	nécessaire	nécessaire	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	à	à	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	réplication	réplication	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	l'	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	ADN	ADN	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	du	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
34	bactériophage	bactériophage	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	λ	λ	ADJ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	(	(	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
37	Georgopoulos	Georgopoulos	NOM	_	_	34	parenth	_	_	_	_	_
38	,	,	PUNC	_	_	51	punc	_	_	_	_	_
39	1977	1977	NUM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	)	)	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
41	,	,	PUNC	_	_	51	punc	_	_	_	_	_
42	mukB	mukB	VNF	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
43	,	,	PUNC	_	_	51	punc	_	_	_	_	_
44	codant	coder	VPR	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
45	une	un	DET	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
46	protéine	protéine	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
47	de	de	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	type	type	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	SMC	SMC	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
50	(	(	PUNC	_	_	49	punc	_	_	_	_	_
51	voir	voir	VNF	_	_	0	root	_	_	_	_	_
52	paragraphe	paragraphe	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-810
# text = II.A.2 ) , ruv , impliqué dans les phénomènes de recombinaison ( West , 1997 ) , et recN , codant une protéine de type SMC induite par le système SOS .
1	II.A.2	ii.a.2	NOM	_	_	21	periph	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	ruv	rue	NOM	_	_	21	periph	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
6	impliqué	impliquer	VPP	_	_	21	periph	_	_	_	_	_
7	dans	dans	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	phénomènes	phénomène	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	West	West	NOM	_	_	11	parenth	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
15	1997	1997	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	)	)	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	recN	recN	ADV	_	_	6	para	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
21	codant	coder	VPR	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	une	un	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	protéine	protéine	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	type	type	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	SMC	SMC	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
27	induite	induire	VPP	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
28	par	par	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	le	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	système	système	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	SOS	SOS	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-811
# text = Les phénotypes des mutants dksA suggèrent ainsi un rôle dans la maintenance structurale du chromosome ( Hardy et Cozzarelli , 2005 ) .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	phénotypes	phénotype	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	mutants	mutant	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	dksA	dksA	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	suggèrent	suggérer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	ainsi	ainsi	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	un	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	rôle	rôle	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	maintenance	maintenance	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	structurale	structural	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	du	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	chromosome	chromosome	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	(	(	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
17	Hardy	Hardy	NOM	_	_	15	parenth	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	17	para	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	2005	2005	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	)	)	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-812
# text = Ce rôle pourrait également être lié à l'activité de l'ARN polymérase , car DksA peut se fixer au niveau du canal secondaire de l'ARN polymérase où elle stabiliserait la fixation de ( p ) ppGpp , l'effecteur de la réponse stringente .
1	Ce	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	rôle	rôle	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	également	également	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	être	être	VNF	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	lié	lier	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	activité	activité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
12	ARN	ARN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	polymérase	polymérase	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
15	car	car	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
16	DksA	DksA	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
17	peut	pouvoir	VRB	_	_	6	para	_	_	_	_	_
18	se	se	CLI	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	fixer	fixer	VNF	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	au	à	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	niveau	niveau	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	du	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	canal	canal	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	secondaire	secondaire	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	l'	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
27	ARN	ARN	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	polymérase	polymérase	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
29	où	où	PRQ	_	_	31	periph	_	_	_	_	_
30	elle	elle	CLS	_	_	31	subj	_	_	_	_	_
31	stabiliserait	stabiliser	VRB	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
32	la	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	fixation	fixation	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	(	(	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
36	p	p	ADJ	_	_	38	parenth	_	_	_	_	_
37	)	)	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
38	ppGpp	ppGpp	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
39	,	,	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
40	l'	le	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	effecteur	effecteur	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
42	de	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	la	le	DET	_	_	44	spe	_	_	_	_	_
44	réponse	réponse	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	stringente	astringent	ADJ	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-813
# text = La troisième protéine identifiée est TktA , la transcétolase majeure du métabolisme des sucres chez E. coli ( Josephson et Fraenkel , 1969 ) .
1	La	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	troisième	troisième	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	protéine	protéine	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
4	identifiée	identifier	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	TktA	TktA	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	transcétolase	transcétolase	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	majeure	majeur	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	du	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	métabolisme	métabolisme	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	des	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	sucres	sucre	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	chez	chez	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	E.	E.	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	coli	coli	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	(	(	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Josephson	Josephson	NOM	_	_	17	parenth	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
21	Fraenkel	Fraenkel	NOM	_	_	19	para	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
23	1969	1969	NUM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	)	)	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-814
# text = Il s'agit de l'enzyme majeure du cycle des pentoses phosphate .
1	Il	il	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	s'	s'	CLI	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	agit	agir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	enzyme	enzyme	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	majeure	majeur	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	du	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	cycle	cycle	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	des	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	pentoses	pentose	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	phosphate	phosphate	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-815
# text = Là aussi , son rôle dans les barrières topologiques reste mystérieux , mais tktA a été récemment identifié lors d'un criblage de mutants sensibles à la norfloxacine , un antibiotique ciblant les Topos de type II chez Bacteroides thetaiotaomicron ( Ueda et Yoshimura , 2003 ) .
1	Là	là	ADV	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	aussi	aussi	ADV	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	son	son	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	rôle	rôle	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
6	dans	dans	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	barrières	barrière	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	topologiques	topologique	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	reste	rester	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	mystérieux	mystérieux	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
13	mais	mais	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
14	tktA	tktA	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
15	a	avoir	VRB	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	été	être	VPP	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
17	récemment	récemment	ADV	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
18	identifié	identifier	VPP	_	_	10	para	_	_	_	_	_
19	lors	lors de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	d'	lors de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	un	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	criblage	criblage	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	mutants	mutant	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	sensibles	sensible	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	à	à	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	norfloxacine	norfloxacine	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
30	un	un	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	antibiotique	antibiotique	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
32	ciblant	cibler	VPR	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	les	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	Topos	Topos	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	type	type	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	II	II	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	chez	chez	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
39	Bacteroides	Bacteroides	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	thetaiotaomicron	thetaiotaomicron	ADJ	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	(	(	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
42	Ueda	Ueda	NOM	_	_	39	parenth	_	_	_	_	_
43	et	et	COO	_	_	44	mark	_	_	_	_	_
44	Yoshimura	Yoshimura	NOM	_	_	42	para	_	_	_	_	_
45	,	,	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_
46	2003	2003	NUM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	)	)	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
48	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-816
# text = De plus , TktA est un homologue de RecP , une protéine impliquée dans les processus de recombinaison chez Streptococcus pneumoniae .
1	De	de plus	PRE	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	TktA	TktA	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	un	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	homologue	homologue	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	RecP	RecP	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	protéine	protéine	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	impliquée	impliquer	VPP	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	dans	dans	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	les	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	processus	processus	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	chez	chez	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
20	Streptococcus	Streptococcus	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	pneumoniae	pneumoniae	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-817
# text = TktA pourrait donc avoir une double fonctionnalité , dans le métabolisme des sucres et l'organisation du chromosome .
1	TktA	TktA	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	donc	donc	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	avoir	avoir	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
6	double	double	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	fonctionnalité	fonctionnalité	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
10	le	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	métabolisme	métabolisme	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	des	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	sucres	sucre	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	organisation	organisation	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
17	du	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	chromosome	chromosome	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-818
# text = En plus des protéines identifiées par l'étude de Hardy et Cozzarelli ( 2005 ) , les protéines intervenant dans la ségrégation du chromosome au cours de la division cellulaire pourraient également jouer un rôle de barrières de domaines topologiques .
1	En	en plus de	PRE	_	_	31	periph	_	_	_	_	_
2	plus	en plus de	DET	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	des	en plus de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	protéines	protéine	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	identifiées	identifier	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	étude	étude	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	Hardy	Hardy	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	12	mark	_	_	_	_	_
12	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
13	(	(	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	2005	2005	NUM	_	_	10	parenth	_	_	_	_	_
15	)	)	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
17	les	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	protéines	protéine	NOM	_	_	31	subj	_	_	_	_	_
19	intervenant	intervenir	VPR	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	dans	dans	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	ségrégation	ségrégation	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	du	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	chromosome	chromosome	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	au	à	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	cours	cours	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	division	division	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
32	également	également	ADV	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	jouer	jouer	VNF	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	un	un	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	rôle	rôle	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	de	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	barrières	barrière	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	domaines	domaine	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	topologiques	topologique	ADJ	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	.	.	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-819
# text = D'une part , FtsK coordonne la division cellulaire avec la ségrégation du chromosome .
1	D'	d'une part	ADV	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	une	d'une part	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	part	d'une part	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	FtsK	FtsK	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	coordonne	coordonner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	division	division	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	avec	avec	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	ségrégation	ségrégation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	du	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	chromosome	chromosome	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-820
# text = Elle est ancrée par son domaine N-terminal dans la membrane plasmique au niveau du septum par une interaction avec la protéine FtsZ , pendant que le domaine C-terminal aide à la translocation de l'ADN en dehors de l'espace du septum et facilite la décaténation .
1	Elle	elle	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	ancrée	ancrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	par	par	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	son	son	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	domaine	domaine	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	N-terminal	N-terminal	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	dans	dans	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	membrane	membrane	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	plasmique	plasmique	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	au	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	niveau	niveau	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	du	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	septum	septum	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	par	par	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	une	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	interaction	interaction	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	avec	avec	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	protéine	protéine	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	FtsZ	FtsZ	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
24	pendant	pendant que	CSU	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	que	pendant que	CSU	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
26	le	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	domaine	domaine	NOM	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
28	C-terminal	C-terminal	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	aide	aider	VRB	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
30	à	à	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	la	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	translocation	translocation	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	l'	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	ADN	ADN	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	en	en dehors de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
37	dehors	en dehors de	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	de	en dehors de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	l'	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	espace	espace	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	du	de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	septum	septum	NUM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	et	et	COO	_	_	44	mark	_	_	_	_	_
44	facilite	faciliter	VRB	_	_	29	para	_	_	_	_	_
45	la	le	DET	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
46	décaténation	décaténation	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-821
# text = D'autre part , MreB est une protéine dont la structure est homologue à l'actine des eucaryotes et participe aussi au déplacement de l'ADN après la réplication ( Kruse et Gerdes , 2005 ) .
1	D'	d'autre part	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	autre	d'autre part	ADV	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	part	d'autre part	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
5	MreB	MreB	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	une	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	protéine	protéine	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	dont	dont	PRQ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	structure	structure	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
12	est	être	VRB	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
13	homologue	homologue	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	actine	actine	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	des	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	eucaryotes	eucaryote	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
20	participe	participer	VRB	_	_	12	para	_	_	_	_	_
21	aussi	aussi	ADV	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	au	à	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	déplacement	déplacement	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	l'	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	ADN	ADN	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	après	après	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	réplication	réplication	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	(	(	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
31	Kruse	Kruse	NOM	_	_	29	parenth	_	_	_	_	_
32	et	et	COO	_	_	33	mark	_	_	_	_	_
33	Gerdes	Gerdes	NOM	_	_	31	para	_	_	_	_	_
34	,	,	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_
35	2005	2005	NUM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	)	)	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
37	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-822
# text = Les macrodomaines
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	macrodomaines	macro-	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-823
# text = L'organisation du chromosome en domaines topologiques ne reflète qu'un premier niveau de structuration , sous-jacent à un degré d'organisation impliquant de grandes distances chromosomiques bien supérieures à 10 kb .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	organisation	organisation	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	chromosome	chromosome	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	en	en	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	domaines	domaine	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	topologiques	topologique	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ne	ne	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	reflète	refléter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	qu'	que	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	un	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
12	premier	premier	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	niveau	niveau	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	structuration	structuration	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
17	sous-jacent	sous-jacent	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
18	à	à	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	un	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	degré	degré	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	d'	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	organisation	organisation	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	impliquant	impliquer	VPR	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	de	un	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
25	grandes	grand	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	distances	distance	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
27	chromosomiques	chromosomique	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	bien	bien	ADV	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
29	supérieures	supérieur	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
30	à	à	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	10	10	NUM	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	kb	kilomètre	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-824
# text = En particulier , des analyses d'hybridation in situ par fluorescence ( FISH ) chez E. coli ont révélé l'existence de 2 grandes régions d'environ 1 Mb chacune , appelées macrodomaines , l'une située autour de l'origine de réplication oriC et l'autre autour du terminus de réplication ter .
1	En	en particulier	PRE	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
2	particulier	en particulier	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	analyses	analyse	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
6	d'	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	hybridation	hybridation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	in	in situ	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	situ	in situ	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	par	par	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	fluorescence	fluorescence	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	FISH	FISH	NOM	_	_	11	parenth	_	_	_	_	_
14	)	)	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
15	chez	chez	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
16	E.	E.	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	coli	coli	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	ont	avoir	VRB	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
19	révélé	révéler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	existence	existence	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	2	2	NUM	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
24	grandes	grand	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	régions	région	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	d'	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	environ	environ	ADV	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	1	1	NUM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	Mb	Mb	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	chacune	chacun	PRQ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
32	appelées	appeler	VPP	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	macrodomaines	macro-	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	,	,	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
35	l'	l'un	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	une	l'un	PRQ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
37	située	situer	VPP	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	autour	autour de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	de	autour de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	l'	le	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	origine	origine	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	de	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	réplication	réplication	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	oriC	oriC	ADJ	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	et	et	COO	_	_	48	mark	_	_	_	_	_
46	l'	le	DET	_	_	48	spe	_	_	_	_	_
47	autre	autre	ADJ	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
48	autour	autour	NOM	_	_	41	para	_	_	_	_	_
49	du	de	PRE	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	terminus	terminus	NOM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	de	de	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	réplication	réplication	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	ter	ter	ADV	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
54	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-825
# text = Comme dans le cas des domaines topologiques , les macrodomaines ont une structure dynamique au cours du cycle cellulaire .
1	Comme	comme	PRE	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	dans	dans	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	le	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	cas	cas	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	domaines	domaine	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	topologiques	topologique	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
9	les	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	macrodomaines	macro-	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
11	ont	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	une	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	structure	structure	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	dynamique	dynamique	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	au	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	cours	cours	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	du	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	cycle	cycle	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-826
# text = Cette organisation en macrodomaines a été confirmée et précisée par une approche génétique , basée sur le système de recombinaison site-spécifique du bactériophage & 206;& 187; , afin de détecter la proximité spatiale de séquences d'ADN éloignées sur la structure primaire de la double hélice .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	organisation	organisation	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	en	en	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	macrodomaines	macro-	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	a	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	été	être	VPP	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	confirmée	confirmer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	précisée	préciser	VPP	_	_	7	para	_	_	_	_	_
10	par	par	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	approche	approche	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	génétique	génétique	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	basée	baser	VPP	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	sur	sur	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	le	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	système	système	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	site-spécifique	site	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	du	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
23	bactériophage	bactériophage	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	λ	λ	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	afin	afin de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
27	de	afin de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	détecter	détecter	VNF	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	proximité	proximité	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	spatiale	spatial	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	séquences	séquence	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	d'	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	ADN	ADN	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	éloignées	éloigner	VPP	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	sur	sur	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	la	le	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	structure	structure	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	primaire	primaire	ADJ	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	de	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	la	le	DET	_	_	44	spe	_	_	_	_	_
43	double	double	ADJ	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
44	hélice	hélice	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
45	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-827
# text = Différentes souches ont été construites , comportant 2 sites d'attachement att du génome de & 206;& 187; , l'un à une position définie du chromosome et l'autre à des positions variées suivant les souches .
1	Différentes	différent	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	souches	souche	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	ont	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	construites	construire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	comportant	comporter	VPR	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	2	2	NUM	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	sites	site	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	d'	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	attachement	attachement	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	att	avant	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
13	du	de+le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	génome	génome	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	λ	λ	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	un	un	PRQ	_	_	14	para	_	_	_	_	_
20	à	à	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	une	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	position	position	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	définie	définir	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	du	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	chromosome	chromosome	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
27	l'	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	autre	autre	PRQ	_	_	19	para	_	_	_	_	_
29	à	à	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	des	un	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	positions	position	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	variées	varier	VPP	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	suivant	suivant	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	les	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	souches	souche	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-828
# text = Celles pour lesquelles un événement de recombinaison a eu lieu entre 2 sites att ont été sélectionnées .
1	Celles	celui	PRQ	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
2	pour	pour	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	lesquelles	lequel	PRQ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	un	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	événement	événement	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	a	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	eu	avoir	VPP	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
10	lieu	lieu	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	entre	entre	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	2	2	NUM	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	sites	site	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	att	art	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	ont	avoir	VRB	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	été	être	VPP	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
17	sélectionnées	sélectionner	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-829
# text = Les fréquences de recombinaison reflètent ainsi la capacité d'interactions et donc la proximité spatiale de séquences d'ADN .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fréquences	fréquence	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	reflètent	refléter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	ainsi	ainsi	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	capacité	capacité	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	interactions	interaction	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	et	et donc	COO	_	_	12	mark	_	_	_	_	_
12	donc	et donc	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	proximité	proximité	NOM	_	_	8	para	_	_	_	_	_
15	spatiale	spatial	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	séquences	séquence	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	d'	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	ADN	ADN	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-830
# text = Valens et al. ( 2004 ) ont montré que les événements de recombinaison étaient fortement limités à certaines régions chromosomiques , ce qui a permis de révéler la présence de 4 macrodomaines sur le chromosome d'E. coli , séparés par deux régions moins structurées ( Figure 24 ) .
1	Valens	Valens	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
2	et	et	COO	_	_	3	mark	_	_	_	_	_
3	al.	al.	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	(	(	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
5	2004	2004	NUM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
6	)	)	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
7	ont	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	montré	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	que	que	CSU	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	événements	événement	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	étaient	être	VRB	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
15	fortement	fortement	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	limités	limiter	VPP	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
17	à	à	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	certaines	certain	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	régions	région	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	chromosomiques	chromosomique	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	ce	ce	PRQ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
23	qui	qui	PRQ	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
24	a	avoir	VRB	_	_	25	aux	_	_	_	_	_
25	permis	permettre	VPP	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	révéler	révéler	VNF	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	présence	présence	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	4	4	NUM	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	macrodomaines	macro-	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	sur	sur	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	le	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	chromosome	chromosome	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	d'	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	E.	E.	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
38	coli	coli	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	,	,	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
40	séparés	séparer	VPP	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	par	par	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	deux	deux	NUM	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	régions	région	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	moins	moins	ADV	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
45	structurées	structurer	ADJ	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	(	(	PUNC	_	_	47	punc	_	_	_	_	_
47	Figure	Figure	NOM	_	_	43	parenth	_	_	_	_	_
48	24	24	NUM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	)	)	PUNC	_	_	47	punc	_	_	_	_	_
50	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-831
# text = Deux de ces macrodomaines entourant oriC et ter et d'environ 1 Mb chacun , correspondent à ceux déterminés précédemment par FISH .
1	Deux	deux	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	ces	ce	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	macrodomaines	macro-	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	entourant	entourer	VPR	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	oriC	oriC	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	ter	ter	ADV	_	_	6	para	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	d'	de	PRE	_	_	2	para	_	_	_	_	_
11	environ	environ	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	1	1	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	Mb	Mb	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	chacun	chacun	PRQ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
16	correspondent	correspondre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	à	à	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	ceux	celui	PRQ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	déterminés	déterminer	VPP	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	précédemment	précédemment	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	par	par	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	FISH	FISH	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-832
# text = Cette organisation en macrodomaines permettrait d'une part la condensation de l'ADN conduisant à l'interaction entre séquences d'ADN à l'intérieur d'un même macrodomaine , et d'autre part la séquestration des macrodomaines , inhibant ainsi la recombinaison de séquences d'ADN localisées dans des macrodomaines différents .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	organisation	organisation	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	en	en	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	macrodomaines	macro-	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	permettrait	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	d'	d'une part	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	une	d'une part	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	part	d'une part	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	condensation	condensation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	ADN	ADN	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	conduisant	conduire	VPR	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	interaction	interaction	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	entre	entre	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	séquences	séquence	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	d'	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	ADN	ADN	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	à	à	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	l'	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	intérieur	intérieur	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	d'	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	un	un	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
27	même	même	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	macrodomaine	macro-	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_
30	et	et	COO	_	_	35	mark	_	_	_	_	_
31	d'	d'autre part	ADV	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	autre	d'autre part	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
33	part	d'autre part	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	la	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	séquestration	séquestration	NOM	_	_	28	para	_	_	_	_	_
36	des	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	macrodomaines	macro-	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	,	,	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
39	inhibant	inhiber	VPR	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	ainsi	ainsi	ADV	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	la	le	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
43	de	de	PRE	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	séquences	séquence	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	d'	de	PRE	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	ADN	ADN	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	localisées	localiser	VPP	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
48	dans	dans	PRE	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	des	un	DET	_	_	50	spe	_	_	_	_	_
50	macrodomaines	macro-	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
51	différents	différent	ADJ	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-833
# text = Cette organisation physique du chromosome en macrodomaines a des répercussions sur l'expression globale du génome .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	organisation	organisation	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	physique	physique	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	chromosome	chromosome	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	macrodomaines	macro-	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	des	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	répercussions	répercussion	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	sur	sur	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	expression	expression	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	globale	global	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	du	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	génome	génome	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-834
# text = En effet , l'analyse du profil global de transcription des gènes chez E. coli en fonction de leur position sur le chromosome a permis de détecter une organisation spatiale de la transcription des gènes .
1	En	en effet	PRE	_	_	25	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	analyse	analyse	NOM	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
6	du	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	profil	profil	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	global	global	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	transcription	transcription	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	des	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	gènes	gène	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	chez	chez	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	E.	E.	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	coli	coli	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	en	en	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
17	fonction	fonction	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	leur	son	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	position	position	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	sur	sur	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	le	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	chromosome	chromosome	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	a	avoir	VRB	_	_	25	aux	_	_	_	_	_
25	permis	permettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	détecter	détecter	VNF	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	une	un	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	organisation	organisation	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	spatiale	spatial	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	la	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	transcription	transcription	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	des	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	gènes	gène	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-835
# text = La transcription globale a été analysée en présence et en absence de norfloxacine , un inhibiteur de la gyrase .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	transcription	transcription	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	globale	global	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	a	avoir	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	été	être	VPP	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	analysée	analyser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	en	en	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	présence	présence	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	en	en	PRE	_	_	7	para	_	_	_	_	_
11	absence	absence	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	norfloxacine	norfloxacine	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
15	un	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	inhibiteur	inhibiteur	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	gyrase	gyrase	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-836
# text = Les profils de transcription obtenus ont été analysés sur la base de l'activité transcriptionnelle de chaque gène individuellement , mais également en fonction de similitudes régionales .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	profils	profil	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	transcription	transcription	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	obtenus	obtenir	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	ont	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	été	être	VPP	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	analysés	analyser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	sur	sur	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	base	base	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	activité	activité	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	transcriptionnelle	transcriptionnel	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	chaque	chaque	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	gène	gène	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	individuellement	individuellement	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
21	mais	mais	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
22	également	également	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	en	en	PRE	_	_	8	para	_	_	_	_	_
24	fonction	fonction	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	similitudes	similitude	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	régionales	régional	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-837
# text = Trois profils spatiaux de transcription ont été mis en évidence .
1	Trois	trois	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	profils	profil	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	spatiaux	spatial	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	transcription	transcription	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ont	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	été	être	VPP	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	mis	mettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	en	en	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	évidence	évidence	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-838
# text = Tout d'abord , dans un premier groupe de gènes , séparés par une distance allant jusqu'à 16 kb , la transcription est dépendante du niveau de superhélicité de l'ADN , c'est-à-dire du traitement à la norfloxacine .
1	Tout	tout d'abord	NOM	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
2	d'	tout d'abord	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	abord	tout d'abord	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
6	un	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
7	premier	premier	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	groupe	groupe	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	gènes	gène	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
12	séparés	séparer	VPP	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	par	par	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	une	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	distance	distance	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	allant	aller	VPR	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	jusqu'à	jusqu'à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
18	16	16	NUM	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	kb	kilomètre	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	transcription	transcription	NOM	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
23	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	dépendante	dépendant	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	du	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	niveau	niveau	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	l'	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	ADN	ADN	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	,	,	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_
33	c'	c'est-à-dire	COO	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
34	est-à-dire	c'est-à-dire	COO	_	_	35	mark	_	_	_	_	_
35	du	de	PRE	_	_	27	para	_	_	_	_	_
36	traitement	traitement	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	à	à	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	la	le	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	norfloxacine	norfloxacine	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	.	.	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-839
# text = Les deux autres profils spatiaux de transcription correspondent à des régions plus grandes , d'une part de l'ordre de 100 kb , et d'autre part de 600 à 800 kb .
1	Les	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
2	deux	deux	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
3	autres	autre	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	profils	profil	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
5	spatiaux	spatial	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	transcription	transcription	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	correspondent	correspondre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	des	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	régions	région	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	plus	plus	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	grandes	grand	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
16	une	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	part	part	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	ordre	ordre	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	100	100	NUM	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	kb	kilomètre	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	33	mark	_	_	_	_	_
26	d'	d'autre part	ADV	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	autre	d'autre part	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	part	d'autre part	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	21	para	_	_	_	_	_
30	600	600	NUM	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
31	à	à	PRE	_	_	29	para	_	_	_	_	_
32	800	800	NUM	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	kb	kilomètre	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-840
# text = La formation de ces deux derniers profils de transcription est quant à elle indépendante du degré de superhélicité du chromosome , mais semble être corrélée à la distribution des sites de fixation de la gyrase .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	formation	formation	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ces	ce	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
5	deux	deux	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
6	derniers	dernier	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	profils	profil	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	transcription	transcription	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	quant	quant à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	à	quant à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	elle	lui	PRQ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	indépendante	indépendant	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	du	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	degré	degré	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	du	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	chromosome	chromosome	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
22	mais	mais	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	semble	sembler	VRB	_	_	10	para	_	_	_	_	_
24	être	être	VNF	_	_	25	aux	_	_	_	_	_
25	corrélée	corréler	VPP	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	à	à	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	distribution	distribution	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	des	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	sites	site	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	fixation	fixation	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	la	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	gyrase	gyrase	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-841
# text = De plus , Jeong et al. ( 2004 ) ont également montré que les profils de transcription sont plus importants au niveau du bras gauche de la fourche de réplication à partir d'oriC ( Figure 24 ) .
1	De	de plus	PRE	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Jeong	Jeong	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
5	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	al.	al.	NOM	_	_	4	para	_	_	_	_	_
7	(	(	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
8	2004	2004	NUM	_	_	6	parenth	_	_	_	_	_
9	)	)	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
10	ont	avoir	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
11	également	également	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	montré	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	que	que	CSU	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	profils	profil	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	transcription	transcription	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	sont	être	VRB	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
19	plus	plus	ADV	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	importants	important	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	au	à	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	niveau	niveau	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	du	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	bras	bras	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	gauche	gauche	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	fourche	fourche	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	réplication	réplication	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	à	à partir de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
32	partir	à partir de	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	d'	à partir de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	oriC	oriC	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	(	(	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
36	Figure	Figure	NOM	_	_	34	parenth	_	_	_	_	_
37	24	24	NUM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	)	)	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-842
# text = La transcription de certains gènes proches de oriC et autour de ter est également sensible au niveau de superhélicité .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	transcription	transcription	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	certains	certain	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	gènes	gène	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	proches	proche	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	oriC	oriC	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
10	autour	autour	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	7	para	_	_	_	_	_
12	ter	ter	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	également	également	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	sensible	sensible	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	au	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	niveau	niveau	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-843
# text = Ainsi , l'organisation physique du chromosome en domaines topologiques et en macrodomaines a de fortes répercussions sur les profils spatiaux de transcription des gènes .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	organisation	organisation	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
5	physique	physique	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	du	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	chromosome	chromosome	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	en	en	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	domaines	domaine	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	topologiques	topologique	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	12	mark	_	_	_	_	_
12	en	en	PRE	_	_	8	para	_	_	_	_	_
13	macrodomaines	macro-	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	de	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
16	fortes	fort	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	répercussions	répercussion	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	sur	sur	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	les	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	profils	profil	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	spatiaux	spatial	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	transcription	transcription	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	des	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	gènes	gène	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-844
# text = De plus , les conditions de l'environnement vont influer sur ces deux fonctions cellulaires , structure du chromosome et transcription globale des gènes , qui sont donc non seulement intimement connectés , mais également dynamiques et modulables .
1	De	de plus	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	conditions	condition	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	environnement	environnement	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	vont	aller	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	influer	influer	VNF	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	sur	sur	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	ces	ce	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
13	deux	deux	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	fonctions	fonction	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	cellulaires	cellulaire	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
17	structure	structure	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	du	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	chromosome	chromosome	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
21	transcription	transcription	NOM	_	_	19	para	_	_	_	_	_
22	globale	global	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	des	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	gènes	gène	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
26	qui	qui	PRQ	_	_	32	subj	_	_	_	_	_
27	sont	être	VRB	_	_	32	aux	_	_	_	_	_
28	donc	donc	ADV	_	_	32	periph	_	_	_	_	_
29	non	non	ADV	_	_	32	periph	_	_	_	_	_
30	seulement	seulement	ADV	_	_	32	periph	_	_	_	_	_
31	intimement	intimement	ADV	_	_	32	periph	_	_	_	_	_
32	connectés	connecter	VPP	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
34	mais	mais	COO	_	_	36	mark	_	_	_	_	_
35	également	également	ADV	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
36	dynamiques	dynamique	ADJ	_	_	23	para	_	_	_	_	_
37	et	et	COO	_	_	38	mark	_	_	_	_	_
38	modulables	modulable	ADJ	_	_	36	para	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-845
# text = Des expériences de microscopie en fluorescence , utilisant une fusion du gène rpoC , codant la sous-unité & 206;& 178;'de l'ARN polymérase , avec le gène gfp codant la protéine de fluorescence verte de méduse , ont permis d'étudier la distribution des molécules d'ARN polymérase dans la cellule et en particulier au niveau du nucléoïde et de sa périphérie
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	expériences	expérience	NOM	_	_	37	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	microscopie	microscopie	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	en	en	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	fluorescence	fluorescence	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
8	utilisant	utiliser	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
9	une	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	fusion	fusion	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	du	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	gène	gène	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	rpoC	rpoC	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
15	codant	coder	VPR	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	sous-unité	sous-	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	β'de	β'de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
20	ARN	ARN	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	polymérase	polymérase	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
23	avec	avec	PRE	_	_	37	periph	_	_	_	_	_
24	le	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	gène	gène	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	gfp	gap	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	codant	coder	VPR	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	protéine	protéine	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	fluorescence	fluorescence	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	verte	vert	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	méduse	méduse	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
36	ont	avoir	VRB	_	_	37	aux	_	_	_	_	_
37	permis	permettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
38	d'	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	étudier	étudier	VNF	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	la	le	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	distribution	distribution	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	des	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	molécules	molécule	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	d'	de	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	ARN	ARN	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
46	polymérase	polymérase	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	dans	dans	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
48	la	le	DET	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
49	cellule	cellule	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	et	et	COO	_	_	53	mark	_	_	_	_	_
51	en	en particulier	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	particulier	en particulier	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	au	à	PRE	_	_	47	para	_	_	_	_	_
54	niveau	niveau	NOM	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	du	de	PRE	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	nucléoïde	nucléoïde	NOM	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
57	et	et	COO	_	_	58	mark	_	_	_	_	_
58	de	de	PRE	_	_	55	para	_	_	_	_	_
59	sa	son	DET	_	_	60	spe	_	_	_	_	_
60	périphérie	périphérie	NOM	_	_	58	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-846
# text = ( Cabrera et Jin , 2003 ) .
1	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	Cabrera	Cabrera	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	4	mark	_	_	_	_	_
4	Jin	Jin	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	2003	2003	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-847
# text = La distribution des molécules d'ARN polymérase est fortement dépendante des conditions de culture .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	distribution	distribution	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	molécules	molécule	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	d'	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ARN	ARN	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	polymérase	polymérase	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	fortement	fortement	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	dépendante	dépendant	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	des	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	conditions	condition	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	culture	culture	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-848
# text = En conditions de croissance rapide , l'ARN polymérase est concentrée au niveau de spots de fluorescence qui correspondent aux opérons d'ARNr .
1	En	en	PRE	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	conditions	condition	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	croissance	croissance	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	rapide	rapide	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
8	ARN	ARN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	polymérase	polymérase	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
10	est	être	VRB	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	concentrée	concentrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	au	à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	niveau	niveau	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	spots	spot	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	fluorescence	fluorescence	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	qui	qui	PRQ	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
19	correspondent	correspondre	VRB	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
20	aux	à	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	opérons	opéron	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	d'	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	ARNr	ARNr	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-849
# text = Cette forte activité transcriptionnelle semble d'ailleurs être corrélée à une condensation du chromosome ( Cabrera et Jin , 2003 ) .
1	Cette	cette	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	forte	fort	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	activité	activité	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
4	transcriptionnelle	transcriptionnel	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	semble	sembler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	d'	d'ailleurs	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ailleurs	d'ailleurs	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	être	être	VNF	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	corrélée	corréler	VPP	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	condensation	condensation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	du	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	chromosome	chromosome	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	(	(	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Cabrera	Cabrera	NOM	_	_	14	parenth	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	Jin	Jin	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	2003	2003	NUM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	)	)	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-850
# text = Tout traitement inhibant la transcription des ARNr , par exemple l'induction de la réponse stringente par une carence en acides aminés , fait d'une part disparaître les spots de fluorescence et d'autre part diminuer la condensation du chromosome .
1	Tout	tout	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	traitement	traitement	NOM	_	_	24	periph	_	_	_	_	_
3	inhibant	inhiber	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	transcription	transcription	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	des	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ARNr	ARNr	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
9	par	par exemple	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	exemple	par exemple	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	induction	induction	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	réponse	réponse	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	stringente	astringent	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	par	par	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	une	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	carence	carence	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	en	en	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	acides	acide	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	aminés	aminé	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
24	fait	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
25	d'	d'une part	ADV	_	_	24	periph	_	_	_	_	_
26	une	d'une part	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	part	d'une part	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	disparaître	disparaître	VNF	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
29	les	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	spots	spot	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	fluorescence	fluorescence	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	et	et	COO	_	_	37	mark	_	_	_	_	_
34	d'	d'autre part	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	autre	d'autre part	ADV	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	part	d'autre part	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	diminuer	diminuer	VNF	_	_	28	para	_	_	_	_	_
38	la	le	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	condensation	condensation	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	du	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	chromosome	chromosome	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	.	.	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-851
# text = Ainsi , non seulement l'activité transcriptionnelle a une influence sur la structuration du chromosome ( voir paragraphe II.A. 1 ) , mais la structure du chromosome , ainsi que les quantités des différentes NAPs , influent sur la transcription et sont modifiées au cours du cycle cellulaire chez E. coli ( Figure 25 ) et dans différentes conditions de l'environnement , par exemple les carences nutritionnelles ( voir paragraphe IV.A. ) .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	non	non	ADV	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
4	seulement	seulement	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	activité	activité	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
7	transcriptionnelle	transcriptionnel	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	une	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	influence	influence	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	sur	sur	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	structuration	structuration	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	du	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	chromosome	chromosome	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	(	(	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
17	voir	voir	VNF	_	_	13	parenth	_	_	_	_	_
18	paragraphe	paragraphe	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	II.A.	II.A.	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	1	1	NUM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	)	)	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
23	mais	mais	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	structure	structure	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
26	du	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	chromosome	chromosome	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
29	ainsi	ainsi que	COO	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	que	ainsi que	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
31	les	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	quantités	quantité	NOM	_	_	27	para	_	_	_	_	_
33	des	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	différentes	différent	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
35	NAPs	NAPs	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
37	influent	influer	VRB	_	_	8	para	_	_	_	_	_
38	sur	sur	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	la	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	transcription	transcription	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	et	et	COO	_	_	43	mark	_	_	_	_	_
42	sont	être	VRB	_	_	43	aux	_	_	_	_	_
43	modifiées	modifier	VPP	_	_	37	para	_	_	_	_	_
44	au	au cours de	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	cours	au cours de	DET	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	du	au cours de	PRE	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	cycle	cycle	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	chez	chez	PRE	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	E.	E.	NOM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	coli	colis	NOM	_	_	43	subj	_	_	_	_	_
52	(	(	PUNC	_	_	53	punc	_	_	_	_	_
53	Figure	Figure	NOM	_	_	51	parenth	_	_	_	_	_
54	25	25	NUM	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	)	)	PUNC	_	_	53	punc	_	_	_	_	_
56	et	et	COO	_	_	57	mark	_	_	_	_	_
57	dans	dans	PRE	_	_	64	mark	_	_	_	_	_
58	différentes	différent	DET	_	_	59	spe	_	_	_	_	_
59	conditions	condition	NOM	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
60	de	de	PRE	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
61	l'	le	DET	_	_	62	spe	_	_	_	_	_
62	environnement	environnement	NOM	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
63	,	,	PUNC	_	_	64	punc	_	_	_	_	_
64	par	par	NOM	_	_	51	para	_	_	_	_	_
65	exemple	exemple	NOM	_	_	64	dep	_	_	_	_	_
66	les	le	DET	_	_	67	spe	_	_	_	_	_
67	carences	carence	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
68	nutritionnelles	nutritionnel	ADJ	_	_	67	dep	_	_	_	_	_
69	(	(	PUNC	_	_	70	punc	_	_	_	_	_
70	voir	voir	VNF	_	_	43	parenth	_	_	_	_	_
71	paragraphe	paragraphe	NOM	_	_	70	dep	_	_	_	_	_
72	IV.A.	IV.A.	NOM	_	_	71	dep	_	_	_	_	_
73	)	)	PUNC	_	_	70	punc	_	_	_	_	_
74	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-852
# text = Le passage de la phase exponentielle à la phase stationnaire est caractérisé par une restructuration complète du chromosome bactérien , aboutissant tout d'abord à des structures toroïdales puis à des structures cristallines au sein desquelles desquelles l'ADN est séquestré et protégé .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	passage	passage	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	phase	phase	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	phase	phase	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	est	être	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	caractérisé	caractériser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	par	par	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	une	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	restructuration	restructuration	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	complète	complet	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	du	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	chromosome	chromosome	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	bactérien	bactérien	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	aboutissant	aboutir	VPR	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
22	tout	tout d'abord	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	d'	tout d'abord	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	abord	tout d'abord	ADV	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	à	à	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
26	des	un	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	structures	structure	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	toroïdales	toroïdal	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	puis	puis	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
30	à	à	PRE	_	_	25	para	_	_	_	_	_
31	des	un	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	structures	structure	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	cristallines	cristallin	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	au	au sein de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
35	sein	au sein de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
36	desquelles	au sein de	PRE	_	_	41	periph	_	_	_	_	_
37	desquelles	lequel	PRQ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	l'	le	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	ADN	ADN	NOM	_	_	41	subj	_	_	_	_	_
40	est	être	VRB	_	_	41	aux	_	_	_	_	_
41	séquestré	séquestrer	VPP	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
42	et	et	COO	_	_	43	mark	_	_	_	_	_
43	protégé	protéger	VPP	_	_	41	para	_	_	_	_	_
44	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-853
# text = La structure du nucléoïde est donc dynamique et varie en fonction des conditions de l'environnement , qui en retour conduisent à des fluctuations des profils d'expression du génome .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	structure	structure	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	nucléoïde	nucléoïde	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	donc	donc	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	dynamique	dynamique	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	varie	varier	VRB	_	_	5	para	_	_	_	_	_
10	en	en	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	fonction	fonction	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	des	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	conditions	condition	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	environnement	environnement	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
18	qui	qui	PRQ	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
19	en	en	PRE	_	_	21	periph	_	_	_	_	_
20	retour	retour	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	conduisent	conduire	VRB	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
22	à	à	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	des	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	fluctuations	fluctuation	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	des	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	profils	profil	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	d'	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	expression	expression	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	du	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	génome	génome	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-854
# text = Ces deux processus pourraient être associés afin de permettre une réponse adéquate des bactéries aux fluctuations de leur environnement .
1	Ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	deux	deux	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	processus	processus	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	être	être	VNF	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	associés	associer	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	afin	afin de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	afin de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	permettre	permettre	VNF	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	une	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	réponse	réponse	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	adéquate	adéquat	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	des	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	bactéries	bactérie	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	aux	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	fluctuations	fluctuation	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	leur	son	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	environnement	environnement	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-855
# text = Impact de la superhélicité de l'ADN sur l'expression des gènes
1	Impact	impact	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ADN	ADN	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	sur	sur	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	expression	expression	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	des	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	gènes	gène	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-856
# text = Les fluctuations du niveau de superhélicité de l'ADN ont des conséquences importantes sur l'expression de nombreux gènes , dont la transcription des opérons d'ARN ribosomiques
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fluctuations	fluctuation	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	niveau	niveau	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	ADN	ADN	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	ont	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	des	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	conséquences	conséquence	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	importantes	important	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	sur	sur	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	expression	expression	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	nombreux	nombreux	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	gènes	gène	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
21	dont	dont	PRQ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	transcription	transcription	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
24	des	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	opérons	opéron	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	d'	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	ARN	ARN	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	ribosomiques	ribosomiques	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-857
# text = ( Muskhelishvili et Travers , 2003 ) .
1	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	Muskhelishvili	Muskhelishvili	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	4	mark	_	_	_	_	_
4	Travers	Travers	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	2003	2003	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-858
# text = Une superhélicité négative est en effet requise pour leur transcription .
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	négative	négatif	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	est	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
5	en	en effet	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	effet	en effet	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	requise	requérir	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	pour	pour	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	leur	son	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	transcription	transcription	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-859
# text = Ainsi , ne serait -ce que par son effet sur la synthèse des ARNr , le niveau de superhélicité de l'ADN doit être régulé de façon précise pour l'adaptation des bactéries à des conditions de croissance ou de carences .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	ne	ne	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	serait	être	VRB	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
5	-ce	ce	CLS	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
6	que	que	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	son	son	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	effet	effet	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	sur	sur	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	synthèse	synthèse	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	des	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	ARNr	ARNr	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
16	le	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	niveau	niveau	NOM	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	l'	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	ADN	ADN	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	doit	devoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	être	être	VNF	_	_	25	aux	_	_	_	_	_
25	régulé	réguler	VPP	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	façon	façon	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	précise	précis	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	pour	pour	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
30	l'	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	adaptation	adaptation	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	des	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	bactéries	bactérie	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	à	à	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	des	un	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	conditions	condition	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	croissance	croissance	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	ou	ou	COO	_	_	40	mark	_	_	_	_	_
40	de	de	PRE	_	_	37	para	_	_	_	_	_
41	carences	carence	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	.	.	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-860
# text = D'autre part , une augmentation de la superhélicité négative du chromosome provoquée par une mutation du gène topA entraîne une modification de l'expression des gènes , observée par électrophorèse bidimensionnelle de protéines .
1	D'	d'autre part	ADV	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
2	autre	d'autre part	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	part	d'autre part	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	augmentation	augmentation	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	négative	négatif	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	du	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	chromosome	chromosome	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	provoquée	provoquer	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
14	par	par	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	une	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	mutation	mutation	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	du	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	gène	gène	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	topA	topA	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	entraîne	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	une	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	modification	modification	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	l'	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	expression	expression	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	des	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	gènes	gène	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	observée	observer	VPP	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
30	par	par	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	électrophorèse	électrophorèse	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	bidimensionnelle	bidimensionnel	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	protéines	protéine	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-861
# text = Des effets similaires sont obtenus suite à une mutation du gène hupA , codant la sous-unité & 206;& 177; de HU , qui provoque une compaction du chromosome .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	effets	effet	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	similaires	similaire	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	sont	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	obtenus	obtenir	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	suite	suite à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	à	suite à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	une	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	mutation	mutation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	du	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	gène	gène	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	hupA	hupA	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	codant	coder	VPR	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	sous-unité	sous-	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	α	α	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	HU	HU	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
21	qui	qui	PRQ	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
22	provoque	provoquer	VRB	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	une	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	compaction	compaction	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	du	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	chromosome	chromosome	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-862
# text = De façon générale , des mutations affectant les gènes codant les NAPs ( H-NS , Fis , HU , IHF ) ont des effets drastiques sur la transcription globale des gènes .
1	De	de	PRE	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
2	façon	façon	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	générale	général	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	des	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	mutations	mutation	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
7	affectant	affecter	VPR	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	gènes	gène	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	codant	coder	VPR	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	les	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	NAPs	NAPs	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	(	(	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
14	H-NS	H-NS	NOM	_	_	12	parenth	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Fis	Fis	NOM	_	_	14	para	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	HU	HU	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	IHF	IHF	NOM	_	_	18	para	_	_	_	_	_
21	)	)	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
22	ont	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	des	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	effets	effet	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	drastiques	drastique	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	sur	sur	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	transcription	transcription	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	globale	global	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	des	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	gènes	gène	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-863
# text = Des modifications de superhélicité de l'ADN provoquent également de profonds changements d'expression chez d'autres bactéries , comme par exemple chez Haemophilus influenzae , ou même chez la levure
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	modifications	modification	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ADN	ADN	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	provoquent	provoquer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	également	également	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
11	profonds	profond	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	changements	changement	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
13	d'	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	expression	expression	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	chez	chez	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	d'	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
17	autres	autre	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	bactéries	bactérie	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	comme	comme	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
21	par	par	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	exemple	exemple	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	chez	chez	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	Haemophilus	Haemophilus	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	influenzae	influenzae	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
27	ou	ou	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
28	même	même	ADV	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	chez	chez	PRE	_	_	23	para	_	_	_	_	_
30	la	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	levure	levure	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-864
# text = Saccharomyces cerevisiae .
1	Saccharomyces	saccharomyces	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	cerevisiae	ce	CL+V	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-865
# text = Plus récemment , la comparaison des profils de transcription globale d'une souche d'E. coli dont le chromosome présente un défaut de superhélicité ( inactivation des gènes codant la gyrase ) avec une souche de référence , ou de cette souche de référence cultivée en présence ou en absence d'inhibiteurs de la gyrase , révèle que l'expression de 7 % des gènes du chromosome est affectée par le niveau de superhélicité .
1	Plus	plus	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	récemment	récemment	ADV	_	_	57	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	comparaison	comparaison	NOM	_	_	57	subj	_	_	_	_	_
6	des	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	profils	profil	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	transcription	transcription	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	globale	global	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	d'	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	une	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	souche	souche	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	d'	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	E.	E.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	coli	coli	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	dont	dont	PRQ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
18	le	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	chromosome	chromosome	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
20	présente	présenter	VRB	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	un	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	défaut	défaut	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	(	(	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	inactivation	inactivation	NOM	_	_	24	parenth	_	_	_	_	_
27	des	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	gènes	gène	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	codant	coder	VPR	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	la	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	gyrase	gyrase	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	)	)	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
33	avec	avec	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
34	une	un	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	souche	souche	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	de	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	référence	référence	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
39	ou	ou	COO	_	_	48	mark	_	_	_	_	_
40	de	de	PRE	_	_	57	periph	_	_	_	_	_
41	cette	ce	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	souche	souche	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	de	de	PRE	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	référence	référence	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	cultivée	cultiver	VPP	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
46	en	en	PRE	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	présence	présence	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	ou	ou	COO	_	_	49	mark	_	_	_	_	_
49	en	en absence de	PRE	_	_	40	para	_	_	_	_	_
50	absence	en absence de	NOM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	d'	en absence de	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	inhibiteurs	inhibiteur	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	de	de	PRE	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	la	le	DET	_	_	55	spe	_	_	_	_	_
55	gyrase	gyrase	NOM	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
56	,	,	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
57	révèle	révéler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
58	que	que	CSU	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
59	l'	le	DET	_	_	60	spe	_	_	_	_	_
60	expression	expression	NOM	_	_	69	subj	_	_	_	_	_
61	de	de	PRE	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
62	7	7	NUM	_	_	63	spe	_	_	_	_	_
63	%	pourcent	NOM	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
64	des	de	PRE	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
65	gènes	gène	NOM	_	_	64	dep	_	_	_	_	_
66	du	de	PRE	_	_	65	dep	_	_	_	_	_
67	chromosome	chromosome	NOM	_	_	66	dep	_	_	_	_	_
68	est	être	VRB	_	_	69	aux	_	_	_	_	_
69	affectée	affecter	VPP	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
70	par	par	PRE	_	_	69	dep	_	_	_	_	_
71	le	le	DET	_	_	72	spe	_	_	_	_	_
72	niveau	niveau	NOM	_	_	70	dep	_	_	_	_	_
73	de	de	PRE	_	_	72	dep	_	_	_	_	_
74	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	73	dep	_	_	_	_	_
75	.	.	PUNC	_	_	57	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-866
# text = La relaxation du chromosome provoque l'activation de la transcription de 106 gènes et l'inhibition de celle de 200 gènes .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	relaxation	relaxation	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	chromosome	chromosome	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	provoque	provoquer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	activation	activation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	transcription	transcription	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	106	106	NUM	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	gènes	gène	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	inhibition	inhibition	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	celle	celui	PRQ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	200	200	NUM	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	gènes	gène	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-867
# text = Les gènes dont la transcription est modifiée remplissent des fonctions diverses et sont dispersés sur le chromosome .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	gènes	gène	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	dont	dont	PRQ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	transcription	transcription	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	modifiée	modifier	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	remplissent	remplir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	des	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	fonctions	fonction	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	diverses	divers	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
13	sont	être	VRB	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	dispersés	disperser	VPP	_	_	8	para	_	_	_	_	_
15	sur	sur	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	le	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	chromosome	chromosome	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-868
# text = Les gènes induits présentent des séquences riches en AT à la fois aux niveaux des promoteurs et des régions codantes , ce qui n'est pas le cas des gènes dont l'expression est réprimée dans ces conditions .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	gènes	gène	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	induits	induire	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	présentent	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	des	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	séquences	séquence	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	riches	riche	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	en	en	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	AT	AT	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	fois	fois	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	aux	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	niveaux	niveau	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	des	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	des	de	PRE	_	_	15	para	_	_	_	_	_
19	régions	région	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	codantes	codant	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	ce	ce	PRQ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
23	qui	qui	PRQ	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
24	n'	ne	ADV	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	est	être	VRB	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	pas	pas	ADV	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	le	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	cas	cas	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
29	des	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	gènes	gène	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	dont	dont	PRQ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
32	l'	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	expression	expression	NOM	_	_	35	subj	_	_	_	_	_
34	est	être	VRB	_	_	35	aux	_	_	_	_	_
35	réprimée	réprimer	VPP	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
36	dans	dans	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	ces	ce	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	conditions	condition	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-869
# text = Une superhélicité négative élevée réprimerait l'échappement de l'ARN polymérase au niveau de promoteurs riches en AT ainsi que l'élongation de la transcription .
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	négative	négatif	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	élevée	élevé	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	réprimerait	réprimer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	échappement	échappement	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
10	ARN	ARN	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	polymérase	polymérase	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	au	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
13	niveau	niveau	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	riches	riche	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	en	en	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	AT	AT	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	ainsi	ainsi que	COO	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	que	ainsi que	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
21	l'	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	élongation	élongation	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	transcription	transcription	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-870
# text = A l'opposé , une superhélicité négative élevée est connue pour favoriser l'initiation de la transcription au niveau de promoteurs possédant une séquence discriminatrice riche en GC entre la boîte - 10 et le site + 1 d'initiation de la transcription .
1	A	à	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	l'	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	opposé	opposé	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
7	négative	négatif	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	élevée	élevé	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	est	être	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	connue	connaître	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	pour	pour	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	favoriser	favoriser	VNF	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	initiation	initiation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	transcription	transcription	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	au	à	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	niveau	niveau	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	possédant	posséder	VPR	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	une	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	séquence	séquence	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	discriminatrice	discriminateur	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	riche	riche	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	en	en	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
28	GC	GC	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	entre	entre	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
30	la	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	boîte	boîte	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	-	- 10	PUNC	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	10	10	NUM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	et	et	COO	_	_	36	mark	_	_	_	_	_
35	le	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	site	site	NOM	_	_	31	para	_	_	_	_	_
37	+	+ 1	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	1	1	NUM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	d'	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	initiation	initiation	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	de	de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	la	le	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	transcription	transcription	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-871
# text = Un discriminateur est présent au niveau des promoteurs des opérons d'ARNs ribosomiques , ce qui explique la nécessité d'un superenroulement négatif élevé pour leur transcription .
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	discriminateur	discriminateur	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	présent	présent	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	au	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	niveau	niveau	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	des	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	des	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	opérons	opéron	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	d'	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	ARNs	ARNs	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	ribosomiques	ribosomiques	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	ce	ce	PRQ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
16	qui	qui	PRQ	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
17	explique	expliquer	VRB	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	nécessité	nécessité	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	d'	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	un	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	superenroulement	super-	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	négatif	négatif	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	élevé	élevé	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	pour	pour	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	leur	son	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	transcription	transcription	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-872
# text = Celui  -ci permettrait de lever la barrière énergétique posée par le discriminateur riche en GC .
1	Celui	celui	PRQ	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	 -ci	 -ci	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	permettrait	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	lever	lever	VNF	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	barrière	barrière	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	énergétique	énergétique	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	posée	poser	VPP	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	par	par	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	le	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	discriminateur	discriminateur	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	riche	riche	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	en	en	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
15	GC	GC	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-873
# text = Un discriminateur est présent pour tous les promoteurs connus pour être réprimés par ( p ) ppGpp , l'effecteur de la réponse stringente .
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	discriminateur	discriminateur	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	présent	présent	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	pour	pour	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	tous	tout	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
7	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	connus	connaître	VPP	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	pour	pour	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	être	être	VNF	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	réprimés	réprimer	VPP	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	par	par	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	(	(	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	p	p	ADJ	_	_	17	parenth	_	_	_	_	_
16	)	)	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
17	ppGpp	ppGpp	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	effecteur	effecteur	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	réponse	réponse	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	stringente	astringent	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-874
# text = Ainsi , la plupart des gènes exprimés dans les conditions optimales de croissance nécessitent une superhélicité négative élevée .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	la	la plupart du	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
4	plupart	la plupart du	DET	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	des	la plupart du	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	gènes	gène	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
7	exprimés	exprimer	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	dans	dans	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	les	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	conditions	condition	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	optimales	optimal	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	croissance	croissance	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	nécessitent	nécessiter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	une	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	négative	négatif	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	élevée	élevé	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-875
# text = La superhélicité de l'ADN est donc intimement liée à l'expression des gènes et pourrait représenter un élément régulateur majeur de l'adaptation des bactéries à leur environnement , en ajustant la transcription globale des gènes aux variations de l'environnement ( Figure 25 ) .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
7	donc	donc	ADV	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
8	intimement	intimement	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	liée	lier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	expression	expression	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	des	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	gènes	gène	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	9	para	_	_	_	_	_
17	représenter	représenter	VNF	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	un	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	élément	élément	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	régulateur	régulateur	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	majeur	majeur	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	l'	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	adaptation	adaptation	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	des	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	bactéries	bactérie	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	à	à	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	leur	son	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	environnement	environnement	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
31	en	en	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
32	ajustant	ajuster	VPR	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	la	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	transcription	transcription	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	globale	global	ADJ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	des	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	gènes	gène	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	aux	à	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	variations	variation	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	de	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	l'	le	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	environnement	environnement	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	(	(	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
44	Figure	Figure	NOM	_	_	39	parenth	_	_	_	_	_
45	25	25	NUM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	)	)	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
47	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-876
# text = Cependant , malgré une organisation dynamique de la structure de l'ADN , sa superhélicité doit être contrôlée de façon précise pour éviter des modifications trop importantes qui auraient des conséquences létales pour la cellule .
1	Cependant	cependant	ADV	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	malgré	malgré	PRE	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
4	une	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	organisation	organisation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	dynamique	dynamique	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	structure	structure	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	ADN	ADN	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
14	sa	son	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
16	doit	devoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	être	être	VNF	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
18	contrôlée	contrôler	VPP	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	façon	façon	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	précise	précis	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	pour	pour	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
23	éviter	éviter	VNF	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	des	un	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	modifications	modification	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	trop	trop	ADV	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
27	importantes	important	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	qui	qui	PRQ	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
29	auraient	avoir	VRB	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
30	des	un	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	conséquences	conséquence	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	létales	létal	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	pour	pour	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
34	la	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	cellule	cellule	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-877
# text = Ceci est réalisé par l'intermédiaire d'un contrôle homéostatique du niveau de superhélicité de l'ADN .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	réalisé	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	par	par	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	intermédiaire	intermédiaire	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	un	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	contrôle	contrôle	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	homéostatique	homéostatique	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	du	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	niveau	niveau	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	ADN	ADN	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-878
# text = Régulation et contrôle homéostatique du niveau de superhélicité de l'ADN
1	Régulation	régulation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	et	et	COO	_	_	3	mark	_	_	_	_	_
3	contrôle	contrôle	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	homéostatique	homéostatique	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	du	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	niveau	niveau	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	ADN	ADN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-879
# text = La régulation de la superhélicité de l'ADN est finement contrôlée à plusieurs niveaux .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	régulation	régulation	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	ADN	ADN	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	est	être	VRB	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
10	finement	finement	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	contrôlée	contrôler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	à	à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	niveaux	niveau	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-880
# text = Le premier est une régulation croisée des gènes de Topos en fonction du degré de superhélicité de l'ADN .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	premier	premier	ADJ	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	une	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	régulation	régulation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	croisée	croisé	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	des	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	gènes	gène	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	Topos	Topos	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	en	en	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	fonction	fonction	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	du	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	degré	degré	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	ADN	ADN	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-881
# text = L'expression et l'activité de la gyrase sont en effet inhibées par un superenroulement de l'ADN trop élevé ( Menzel et Gellert , 1983 ) .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	expression	expression	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	activité	activité	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	gyrase	gyrase	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	sont	être	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
10	en	en effet	PRE	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	effet	en effet	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	inhibées	inhiber	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	par	par	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	un	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	superenroulement	super-	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	ADN	ADN	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	trop	trop	ADV	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	élevé	élevé	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	(	(	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	Menzel	Menzel	NOM	_	_	18	parenth	_	_	_	_	_
23	et	et	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
24	Gellert	Gellert	NOM	_	_	22	para	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	1983	1983	NUM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	)	)	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-882
# text = A l'opposé , les promoteurs des gènes gyrA et gyrB sont activés en cas de relâchement de l'ADN ( Franco et Drlica , 1989 ) .
1	A	à	PRE	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	l'	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	opposé	opposé	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
7	des	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	gènes	gène	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	gyrA	gyrA	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
11	gyrB	gyrB	ADJ	_	_	9	para	_	_	_	_	_
12	sont	être	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	activés	activer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	en	en cas de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	cas	en cas de	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	en cas de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	relâchement	relâchement	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	ADN	ADN	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	(	(	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	Franco	Franco	NOM	_	_	20	parenth	_	_	_	_	_
23	et	et	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
24	Drlica	Drlica	NOM	_	_	22	para	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	1989	1989	NUM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	)	)	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-883
# text = Le promoteur gyrA est d'ailleurs utilisé comme senseur de la topologie de l'ADN .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	promoteur	promoteur	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	gyrA	gyrA	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	est	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
5	d'	d'ailleurs	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	ailleurs	d'ailleurs	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	utilisé	utiliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	comme	comme	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	senseur	senseur	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	topologie	topologie	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	ADN	ADN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-884
# text = Le mécanisme par lequel ce promoteur est activé par un relâchement de l'ADN reste inconnu , mais la boîte - 10 du promoteur serait impliquée .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
3	par	par	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
4	lequel	lequel	PRQ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ce	ce	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	promoteur	promoteur	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	activé	activer	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
9	par	par	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	un	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	relâchement	relâchement	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	ADN	ADN	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	reste	rester	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	inconnu	inconnu	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
18	mais	mais	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	boîte	boîte	NOM	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
21	-	- 10	PUNC	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	10	10	NUM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	du	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	promoteur	promoteur	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	serait	être	VRB	_	_	26	aux	_	_	_	_	_
26	impliquée	impliquer	VPP	_	_	15	para	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-885
# text = La formation du complexe ouvert lors de l'initiation de la transcription de gyrA et gyrB pourrait également constituer une étape sur laquelle le relâchement de l'ADN agirait comme activateur ( Menzel et Gellert , 1987 ) .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	formation	formation	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
3	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	complexe	complexe	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ouvert	ouvrir	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	lors	lors de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	lors de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	initiation	initiation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	transcription	transcription	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	gyrA	gyrA	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	gyrB	gyrB	NOM	_	_	14	para	_	_	_	_	_
17	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	également	également	ADV	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	constituer	constituer	VNF	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	une	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	étape	étape	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	sur	sur	PRE	_	_	29	periph	_	_	_	_	_
23	laquelle	lequel	PRQ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	le	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	relâchement	relâchement	NOM	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	l'	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	ADN	ADN	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	agirait	agir	VRB	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
30	comme	comme	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	activateur	activateur	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	(	(	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
33	Menzel	Menzel	NOM	_	_	31	parenth	_	_	_	_	_
34	et	et	COO	_	_	35	mark	_	_	_	_	_
35	Gellert	Gellert	NOM	_	_	33	para	_	_	_	_	_
36	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
37	1987	1987	NUM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	)	)	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-886
# text = Contrairement à la gyrase qui est activée par une diminution de la superhélicité de l'ADN , la
1	Contrairement	contrairement	ADV	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	à	à	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	gyrase	gyrase	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	qui	qui	PRQ	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	activée	activer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	par	par	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	une	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	diminution	diminution	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	ADN	ADN	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	la	la	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-887
# text = TopoI est elle activée par une augmentation du niveau de superhélicité .
1	TopoI	TopoI	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
3	elle	elle	CLS	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	activée	activer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	augmentation	augmentation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	du	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	niveau	niveau	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-888
# text = L'état de superenroulement du chromosome établit ainsi une boucle d'autorégulation des Topos dans la cellule , permettant le maintien d'un niveau adéquat de superhélicité .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	état	état	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	superenroulement	super-	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	du	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	chromosome	chromosome	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	établit	établir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	ainsi	ainsi	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	une	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	boucle	boucle	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	d'	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	autorégulation	autorégulation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	des	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	Topos	Topos	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	dans	dans	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	cellule	cellule	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	permettant	permettre	VPR	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	le	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	maintien	maintien	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	d'	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	un	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	niveau	niveau	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	adéquat	adéquat	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-889
# text = Les fluctuations de l'environnement influencent fortement le niveau de superhélicité du chromosome bactérien , comme par exemple les carences nutritionnelles ( Balke et Gralla , 1987 ) , les stress osmotiques ( Higgins et al. , 1988 ) , oxydatifs , thermiques et de pH .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fluctuations	fluctuation	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	environnement	environnement	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	influencent	influencer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	fortement	fortement	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	niveau	niveau	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	du	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	chromosome	chromosome	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	bactérien	bactérien	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
16	comme	comme	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
17	par	par exemple	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	exemple	par exemple	ADV	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	les	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	carences	carence	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
21	nutritionnelles	nutritionnel	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	(	(	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
23	Balke	Balke	NOM	_	_	20	parenth	_	_	_	_	_
24	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
25	Gralla	Gralla	NOM	_	_	23	para	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
27	1987	1987	NUM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	)	)	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
30	les	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	stress	stress	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
32	osmotiques	osmotique	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	(	(	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
34	Higgins	Higgins	NOM	_	_	31	parenth	_	_	_	_	_
35	et	et	COO	_	_	38	mark	_	_	_	_	_
36	al.	al.	ADV	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	,	,	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
38	1988	1988	NUM	_	_	34	para	_	_	_	_	_
39	)	)	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
40	,	,	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
41	oxydatifs	oxydatif	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
42	,	,	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
43	thermiques	thermique	ADJ	_	_	41	para	_	_	_	_	_
44	et	et	COO	_	_	45	mark	_	_	_	_	_
45	de	de	PRE	_	_	43	para	_	_	_	_	_
46	pH	pH	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-890
# text = La seule autorégulation des Topos sur elles-mêmes ne peut pas expliquer les variations de superhélicité observées en fonction des conditions environnementales .
1	La	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	seule	seul	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	autorégulation	autorégulation	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
4	des	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	Topos	Topos	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	sur	sur	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	elles-mêmes	lui-même	PRQ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ne	ne	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	peut	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	pas	pas	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	expliquer	expliquer	VNF	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	variations	variation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	observées	observer	VPP	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	en	en	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	fonction	fonction	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	des	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	conditions	condition	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	environnementales	environnemental	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-891
# text = Des niveaux supplémentaires de régulation du degré de superhélicité , et donc des gènes codant les Topos , doivent donc exister pour détecter et répondre aux signaux de l'environnement .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	niveaux	niveau	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
3	supplémentaires	supplémentaire	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	régulation	régulation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	du	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	degré	degré	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
11	et	et donc	COO	_	_	12	mark	_	_	_	_	_
12	donc	et donc	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	des	de	PRE	_	_	8	para	_	_	_	_	_
14	gènes	gène	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	codant	coder	VPR	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	les	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	Topos	Topos	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
19	doivent	devoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	donc	donc	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	exister	exister	VNF	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	pour	pour	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	détecter	détecter	VNF	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
25	répondre	répondre	VNF	_	_	23	para	_	_	_	_	_
26	aux	à	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	signaux	signal	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	l'	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	environnement	environnement	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-892
# text = Contrôle homéostatique de la superhélicité de l'ADN en fonction des conditions environnementales
1	Contrôle	contrôle	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	homéostatique	homéostatique	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	ADN	ADN	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	fonction	fonction	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	des	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	conditions	condition	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	environnementales	environnemental	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-893
# text = Le mécanisme moléculaire par lequel le niveau de superhélicité de l'ADN varie en fonction des conditions de l'environnement , tout en étant maintenu à des niveaux physiologiques adéquats , est le mieux décrit dans le cas des transitions entre apports de nutriments et carences nutritionnelles , et vice versa .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	35	subj	_	_	_	_	_
3	moléculaire	moléculaire	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	par	par	PRE	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
5	lequel	lequel	PRQ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	le	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	niveau	niveau	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	ADN	ADN	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	varie	varier	VRB	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
14	en	en	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	fonction	fonction	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	des	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	conditions	condition	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	environnement	environnement	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
22	tout	tout en	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	en	tout en	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
24	étant	être	VPR	_	_	25	aux	_	_	_	_	_
25	maintenu	maintenir	VPP	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	à	à	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	des	un	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	niveaux	niveau	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	physiologiques	physiologique	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	adéquats	adéquat	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
32	est	être	VRB	_	_	35	aux	_	_	_	_	_
33	le	le mieux	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	mieux	le mieux	ADV	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
35	décrit	décrire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
36	dans	dans	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	le	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	cas	cas	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	des	de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	transitions	transition	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	entre	entre	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	apports	apport	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	de	de	PRE	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	nutriments	nutriment	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	et	et	COO	_	_	46	mark	_	_	_	_	_
46	carences	carence	NOM	_	_	44	para	_	_	_	_	_
47	nutritionnelles	nutritionnel	ADJ	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	,	,	PUNC	_	_	51	punc	_	_	_	_	_
49	et	et	COO	_	_	51	mark	_	_	_	_	_
50	vice	vice	NOM	_	_	51	subj	_	_	_	_	_
51	versa	verser	VRB	_	_	35	para	_	_	_	_	_
52	.	.	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-894
# text = En coordination avec certains facteurs de transcription , c'est la protéine de type histone Fis ( voir paragraphe I.B. 3 ) qui joue le rôle majeur dans cette régulation , qui consiste en un contrôle homéostatique de la superhélicité de l'ADN ( Figure 26 ) .
1	En	en	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	coordination	coordination	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	avec	avec	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	certains	certain	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	facteurs	facteur	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	transcription	transcription	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
9	c'	ce	CLS	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
10	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	protéine	protéine	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	type	type	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	histone	histone	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	Fis	Fis	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	(	(	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	voir	voir	VNF	_	_	10	parenth	_	_	_	_	_
19	paragraphe	paragraphe	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	I.B.	I.B.	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	3	3	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	)	)	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
23	qui	qui	PRQ	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
24	joue	jouer	VRB	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
25	le	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	rôle	rôle	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	majeur	majeur	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	dans	dans	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
29	cette	ce	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	régulation	régulation	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
32	qui	qui	PRQ	_	_	33	subj	_	_	_	_	_
33	consiste	consister	VRB	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
34	en	en	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	un	un	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	contrôle	contrôle	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	homéostatique	homéostatique	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	la	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	de	de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	l'	le	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	ADN	ADN	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	(	(	PUNC	_	_	45	punc	_	_	_	_	_
45	Figure	Figure	NOM	_	_	40	parenth	_	_	_	_	_
46	26	26	NUM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	)	)	PUNC	_	_	45	punc	_	_	_	_	_
48	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-895
# text = En effet , Fis exerce un contrôle transcriptionnel sur les gènes de Topos et en retour , le niveau de superhélicité de l'ADN régule la transcription du gène fis .
1	En	en effet	PRE	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	exerce	exercer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	un	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	contrôle	contrôle	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	transcriptionnel	transcription	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	sur	sur	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	gènes	gène	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	Topos	Topos	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
15	en	en	PRE	_	_	30	periph	_	_	_	_	_
16	retour	retour	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
18	le	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	niveau	niveau	NOM	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	l'	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	ADN	ADN	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	régule	réguler	VRB	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
26	la	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	transcription	transcription	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	du	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
29	gène	gène	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	fis	faire	VRB	_	_	5	para	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-896
# text = Lors d'un apport de nutriments , c'est-à-dire en début de phase exponentielle de croissance , l'activité de la gyrase augmente suite à l'accroissement de la charge énergétique cellulaire , en l'occurrence du rapport [ ATP ] / [ ADP ] .
1	Lors	lors de	PRE	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
2	d'	lors de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	un	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	apport	apport	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	nutriments	nutriment	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
8	c'	c'est-à-dire	COO	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	est-à-dire	c'est-à-dire	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	en	en début de	PRE	_	_	2	para	_	_	_	_	_
11	début	en début de	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	en début de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	phase	phase	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	croissance	croissance	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	activité	activité	NOM	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	gyrase	gyrase	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	augmente	augmenter	VRB	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
24	suite	suite à	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	à	suite à	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	l'	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	accroissement	accroissement	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	charge	charge	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	énergétique	énergétique	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
34	en	en	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
35	l'	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	occurrence	occurrence	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	du	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	rapport	rapport	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	[	(	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
40	ATP	ATP	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	]	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
42	/	/	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
43	[	(	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
44	ADP	ADP	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
45	]	)	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
46	.	.	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-897
# text = Il s'ensuit une augmentation du niveau de superhélicité négative de l'ADN ( Balke et Gralla , 1987 ) , qui active alors la transcription de fis .
1	Il	il	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	s'	s'	CLI	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	ensuit	ensuivre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	une	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	augmentation	augmentation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	du	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	niveau	niveau	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	négative	négatif	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	ADN	ADN	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	(	(	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	Balke	Balke	NOM	_	_	13	parenth	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
17	Gralla	Gralla	NOM	_	_	15	para	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
19	1987	1987	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	)	)	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
22	qui	qui	PRQ	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
23	active	activer	VRB	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
24	alors	alors	ADV	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	transcription	transcription	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
28	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-898
# text = La protéine Fis atteint sa concentration maximale lors de la phase de croissance exponentielle .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéine	protéine	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	Fis	Fis	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	atteint	atteindre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	sa	son	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	concentration	concentration	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	maximale	maximal	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	lors	lors de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	de	lors de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	phase	phase	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	croissance	croissance	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-899
# text = Cette augmentation de la superhélicité de l'ADN et de Fis est alors favorable à la transcription des gènes nécessaires à la croissance bactérienne , dont les opérons d'ARN ribosomiques .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	augmentation	augmentation	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	ADN	ADN	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	6	para	_	_	_	_	_
11	Fis	Fis	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	alors	alors	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	favorable	favorable	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	transcription	transcription	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	des	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	gènes	gène	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	nécessaires	nécessaire	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	à	à	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	croissance	croissance	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	bactérienne	bactérien	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
26	dont	dont	PRQ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
27	les	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	opérons	opéron	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
29	d'	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	ARN	ARN	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	ribosomiques	ribosomiques	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-900
# text = En parallèle , Fis va également réprimer la transcription des gènes gyrA et gyrB , ce qui va entraîner en fin de phase exponentielle une diminution de la superhélicité de l'ADN .
1	En	en	PRE	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	parallèle	parallèle	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	va	aller	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	également	également	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	réprimer	réprimer	VNF	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	transcription	transcription	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	des	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	gènes	gène	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	gyrA	gyrA	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	gyrB	gyrB	ADJ	_	_	12	para	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	ce	ce	PRQ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
17	qui	qui	PRQ	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
18	va	aller	VRB	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	entraîner	entraîner	VNF	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	en	en	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	fin	fin	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	phase	phase	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	une	un	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	diminution	diminution	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	l'	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	ADN	ADN	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-901
# text = La transcription de fis nécessitant une superhélicité élevée , ce relâchement de l'ADN entraîne la diminution de la transcription de fis
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	transcription	transcription	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	nécessitant	nécessiter	VPR	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	élevée	élevé	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
10	ce	ce	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	relâchement	relâchement	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	ADN	ADN	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	entraîne	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	diminution	diminution	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	transcription	transcription	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-902
# text = . A ce moment , lors du passage en phase stationnaire , il y a également induction de la réponse stringente et donc de la synthèse de ( p ) ppGpp , qui va inhiber la transcription de fis .
1	.	.	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
2	A	A	PRE	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
3	ce	ce	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	moment	moment	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
6	lors	lors de	PRE	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
7	du	lors de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	passage	passage	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	en	en	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	phase	phase	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
13	il	il	CLS	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
14	y	le	CLI	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	également	également	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	induction	induction	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	réponse	réponse	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	stringente	astringent	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	et	et donc	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
23	donc	et donc	ADV	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	18	para	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	synthèse	synthèse	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	(	(	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	p	p	ADJ	_	_	31	parenth	_	_	_	_	_
30	)	)	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
31	ppGpp	ppGpp	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
32	,	,	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
33	qui	qui	PRQ	_	_	34	subj	_	_	_	_	_
34	va	aller	VRB	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
35	inhiber	inhiber	VNF	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	la	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	transcription	transcription	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
39	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
40	.	.	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-903
# text = Tous ces mécanismes conduisent à une forte diminution de la transcription des opérons d'ARNr .
1	Tous	tout	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	mécanismes	mécanisme	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	conduisent	conduire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	à	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	une	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
7	forte	fort	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	diminution	diminution	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	transcription	transcription	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	des	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	opérons	opéron	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	d'	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	ARNr	ARNr	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-904
# text = La forte diminution de concentration de Fis va alors lever l'inhibition sur la transcription des gènes gyrA et gyrB. Malgré cela , un relâchement de l'ADN est observé lors du passage en phase stationnaire , et cela s'explique en partie par l'accumulation de & 207;& 131;S
1	La	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	forte	fort	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	diminution	diminution	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	concentration	concentration	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	Fis	Fis	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	va	aller	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	alors	alors	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	lever	lever	VNF	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	inhibition	inhibition	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	sur	sur	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	transcription	transcription	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	gènes	gène	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	gyrA	gyrA	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
20	gyrB.	gyrB.	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	Malgré	Malgré	PRE	_	_	30	periph	_	_	_	_	_
22	cela	cela	PRQ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
24	un	un	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	relâchement	relâchement	NOM	_	_	30	subj	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	l'	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	ADN	ADN	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	est	être	VRB	_	_	30	aux	_	_	_	_	_
30	observé	observer	VPP	_	_	8	para	_	_	_	_	_
31	lors	lors de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	du	lors de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	passage	passage	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	en	en	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
35	phase	phase	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	,	,	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
38	et	et	COO	_	_	41	mark	_	_	_	_	_
39	cela	cela	PRQ	_	_	41	subj	_	_	_	_	_
40	s'	s'	CLI	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
41	explique	expliquer	VRB	_	_	30	para	_	_	_	_	_
42	en	en partie	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	partie	en partie	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	par	par	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
45	l'	le	DET	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
46	accumulation	accumulation	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	de	de	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	σS	σS	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-905
# text = ( Hengge-Aronis , 2002 ) .
1	(	(	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
2	Hengge-Aronis	Hengge-Aronis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	2002	2002	NUM	_	_	2	parenth	_	_	_	_	_
5	)	)	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-906
# text = En effet , parmi les nombreux gènes-cibles de & 207;& 131;S , se trouvent gyrI , codant un inhibiteur de la gyrase , et topA , dont un des promoteurs est & 207;& 131;S-dépendant .
1	En	en	PRE	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	effet	effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	parmi	parmi	PRE	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
6	nombreux	nombreux	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	gènes-cibles	gène-cible	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	σS	σS	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
11	se	se	CLI	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	trouvent	trouver	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	gyrI	gyrI	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	codant	coder	VPR	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	un	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	inhibiteur	inhibiteur	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	gyrase	gyrase	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	topA	topA	NOM	_	_	20	para	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
25	dont	dont	PRQ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
26	un	un	PRQ	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
27	des	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	est	être	VRB	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
30	σS-dépendant	σS-dépendant	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-907
# text = Une interaction directe de la gyrase avec GyrI a été montrée , et ceci a été confirmé par l'étude du mécanisme d'action de cet inhibiteur , qui séquestrerait la gyrase probablement en empêchant son interaction avec l'ADN ( Chatterji et Nagaraja , 2002 ) .
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	interaction	interaction	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
3	directe	direct	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	gyrase	gyrase	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	avec	avec	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	GyrI	GyrI	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	a	avoir	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	été	être	VPP	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	montrée	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
14	ceci	ceci	PRQ	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
15	a	avoir	VRB	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	été	être	VPP	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
17	confirmé	confirmer	VPP	_	_	11	para	_	_	_	_	_
18	par	par	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	étude	étude	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	du	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	d'	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	action	action	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	cet	ce	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	inhibiteur	inhibiteur	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
29	qui	qui	PRQ	_	_	30	subj	_	_	_	_	_
30	séquestrerait	séquestrer	VRB	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
31	la	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	gyrase	gyrase	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	probablement	probablement	ADV	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
34	en	en	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
35	empêchant	empêcher	VPR	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	son	son	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	interaction	interaction	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	avec	avec	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
39	l'	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	ADN	ADN	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	(	(	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
42	Chatterji	Chatterji	NOM	_	_	40	parenth	_	_	_	_	_
43	et	et	COO	_	_	44	mark	_	_	_	_	_
44	Nagaraja	Nagaraja	NOM	_	_	42	para	_	_	_	_	_
45	,	,	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_
46	2002	2002	NUM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	)	)	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
48	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-908
# text = D'autre part , la diminution de la quantité de nutriments dans le milieu va empêcher l'activité de la gyrase , sensible au rapport [ ATP ] / [ ADP ] .
1	D'	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	autre	autre	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	part	part	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	diminution	diminution	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	quantité	quantité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	nutriments	nutriment	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	dans	dans	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	le	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	milieu	milieu	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	va	aller	VRB	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
16	empêcher	empêcher	VNF	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	activité	activité	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	gyrase	gyrase	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
23	sensible	sensible	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
24	au	à	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	rapport	rapport	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	[	(	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
27	ATP	ATP	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	]	)	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	/	/	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
30	[	(	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
31	ADP	ADP	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
32	]	)	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-909
# text = Ainsi , malgré la transcription des gènes codant la gyrase suite à la levée de la répression par Fis , le degré de superhélicité de l'ADN diminue en phase stationnaire .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	28	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	malgré	malgré	PRE	_	_	28	periph	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	transcription	transcription	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	des	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	gènes	gène	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	codant	coder	VPR	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	gyrase	gyrase	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	suite	suite à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	à	suite à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	levée	levée	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	répression	répression	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	par	par	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	Fis	Fis	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
21	le	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	degré	degré	NOM	_	_	28	subj	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	l'	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	ADN	ADN	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	diminue	diminuer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
29	en	en	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	phase	phase	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-910
# text = Le relâchement de l'ADN en phase stationnaire est alors favorable à la transcription des gènes & 207;& 131;S-dépendants .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	relâchement	relâchement	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	en	en	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	phase	phase	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	alors	alors	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	favorable	favorable	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	à	à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	transcription	transcription	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	des	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	gènes	gène	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	σS-dépendants	σS-dépendants	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-911
# text = En effet , même en phase stationnaire , & 207;& 131;S ne représente que 30 % de la quantité du facteur sigma végétatif & 207;& 131; 70 , et un des principaux facteurs discriminants pour la transcription des gènes entre & 207;& 131; 70 et & 207;& 131;S est le degré de superhélicité du promoteur .
1	En	en effet	PRE	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	même	même	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	en	en	PRE	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
6	phase	phase	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
9	σS	σS	ADV	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
10	ne	ne	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	représente	représenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	que	que	CSU	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	30	30	NUM	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	%	pourcent	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	quantité	quantité	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	du	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	facteur	facteur	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	sigma	sigma	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	végétatif	végétatif	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	σ	σ	VRB	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
23	70	70	NUM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	41	mark	_	_	_	_	_
26	un	un	PRQ	_	_	41	subj	_	_	_	_	_
27	des	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	principaux	principal	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
29	facteurs	facteur	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	discriminants	discriminant	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	pour	pour	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	la	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	transcription	transcription	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	des	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	gènes	gène	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	entre	entre	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	σ	σ	VNF	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	70	70	NUM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	et	et	COO	_	_	40	mark	_	_	_	_	_
40	σS	σS	NOM	_	_	38	para	_	_	_	_	_
41	est	être	VRB	_	_	22	para	_	_	_	_	_
42	le	le	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	degré	degré	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	de	de	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	du	de	PRE	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	promoteur	promoteur	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-912
# text = La diminution de superhélicité permet ainsi d'activer les gènes essentiels à la survie en phase stationnaire , et permet donc l'adaptation des bactéries aux conditions de carences .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	diminution	diminution	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	permet	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	ainsi	ainsi	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	activer	activer	VNF	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	les	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	gènes	gène	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	essentiels	essentiel	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	à	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	survie	survie	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	en	en	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
16	phase	phase	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
20	permet	permettre	VRB	_	_	5	para	_	_	_	_	_
21	donc	donc	ADV	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	l'	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	adaptation	adaptation	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	des	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	bactéries	bactérie	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	aux	à	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	conditions	condition	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	carences	carence	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-913
# text = Bien que l'activité de la gyrase soit diminuée en phase stationnaire , sa quantité reste constante .
1	Bien	bien que	CSU	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	que	bien que	CSU	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
3	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	activité	activité	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	gyrase	gyrase	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	soit	être	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	diminuée	diminuer	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
10	en	en	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	phase	phase	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
14	sa	son	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	quantité	quantité	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
16	reste	rester	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	constante	constant	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-914
# text = Lors d'un apport en nutriments , ceci permet probablement une augmentation immédiate du niveau de superenroulement de l'ADN suite à l'augmentation de la charge énergétique , et donc une reprise de la croissance cellulaire .
1	Lors	lors de	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	d'	lors de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	un	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	apport	apport	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	en	en	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	nutriments	nutriment	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
8	ceci	ceci	PRQ	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
9	permet	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	probablement	probablement	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	augmentation	augmentation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	immédiate	immédiat	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	du	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	niveau	niveau	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	superenroulement	super-	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	ADN	ADN	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	suite	suite à	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	à	suite à	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
23	l'	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	augmentation	augmentation	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	la	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	charge	charge	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	énergétique	énergétique	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
30	et	et donc	COO	_	_	31	mark	_	_	_	_	_
31	donc	et donc	COO	_	_	33	mark	_	_	_	_	_
32	une	un	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	reprise	reprise	NOM	_	_	24	para	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	la	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	croissance	croissance	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-915
# text = La protéine Fis va être à nouveau synthétisée et jouer son rôle majeur sur le contrôle homéostatique de la superhélicité de l'ADN et sur la croissance cellulaire .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéine	protéine	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	Fis	Fis	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	va	aller	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	être	être	VNF	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
6	à	à nouveau	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
7	nouveau	à nouveau	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	synthétisée	synthétiser	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	jouer	jouer	VNF	_	_	8	para	_	_	_	_	_
11	son	son	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	rôle	rôle	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	majeur	majeur	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	sur	sur	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	le	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	contrôle	contrôle	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	homéostatique	homéostatique	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	l'	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	ADN	ADN	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
25	sur	sur	PRE	_	_	21	para	_	_	_	_	_
26	la	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	croissance	croissance	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-916
# text = Fis est donc un régulateur essentiel de la croissance bactérienne en fonction des conditions nutritionnelles de l'environnement .
1	Fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	est	est	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	donc	donc	ADV	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	un	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	régulateur	régulateur	NOM	_	_	1	subj	_	_	_	_	_
6	essentiel	essentiel	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	croissance	croissance	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	bactérienne	bactérien	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
12	fonction	fonction	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	des	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	conditions	condition	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	nutritionnelles	nutritionnel	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	environnement	environnement	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-917
# text = Autres stress environnementaux et topologie de l'ADN
1	Autres	autre	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	stress	stress	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	environnementaux	environnemental	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	topologie	topologie	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	ADN	ADN	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-918
# text = Le niveau de superhélicité de l'ADN est aussi modifié suite à différents stress , tels que les stress osmotique ou oxydatif .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	niveau	niveau	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ADN	ADN	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	aussi	aussi	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	modifié	modifier	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	suite	suite à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	à	suite à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	différents	différent	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	stress	stress	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
16	tels	tel	PRQ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
17	que	que	CSU	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
18	les	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	stress	stress	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	osmotique	osmotique	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
21	ou	ou	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	oxydatif	oxydatif	ADJ	_	_	20	para	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-919
# text = Cette modification est transitoire et associée à des changements , eux aussi temporaires , de l'expression des gènes .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	modification	modification	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	transitoire	transitoire	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	associée	associer	VPP	_	_	4	para	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	des	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	changements	changement	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
11	eux	lui	PRQ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	aussi	aussi	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	temporaires	temporaire	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	expression	expression	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	des	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	gènes	gène	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-920
# text = Ceci permet ainsi la synthèse de protéines nécessaires à la survie de la cellule .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	permet	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	ainsi	ainsi	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	synthèse	synthèse	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	protéines	protéine	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	nécessaires	nécessaire	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	survie	survie	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	cellule	cellule	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-921
# text = Quand les conditions de stress disparaissent , le niveau de superenroulement de l'ADN revient à celui d'origine , comme les profils de transcription des gènes .
1	Quand	quand	CSU	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
2	les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	conditions	condition	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	stress	stress	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	disparaissent	disparaître	VRB	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	niveau	niveau	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	superenroulement	super-	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	ADN	ADN	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	revient	revenir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	à	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	celui	celui	PRQ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	d'	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	origine	origine	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	comme	comme	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
22	les	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	profils	profil	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	transcription	transcription	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	des	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	gènes	gène	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-922
# text = Lors de stress oxydatifs , c'est à nouveau la protéine Fis qui intervient dans le contrôle de la superhélicité et de l'expression des gènes nécessaires à la survie dans ces conditions .
1	Lors	lors de	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	de	lors de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	stress	stress	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	oxydatifs	oxydatif	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	c'	ce	CLS	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	à	à nouveau	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	nouveau	à nouveau	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	protéine	protéine	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	Fis	Fis	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	qui	qui	PRQ	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
14	intervient	intervenir	VRB	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	dans	dans	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	le	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	contrôle	contrôle	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	18	para	_	_	_	_	_
23	l'	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	expression	expression	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	des	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	gènes	gène	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	nécessaires	nécessaire	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	à	à	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	survie	survie	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	dans	dans	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	ces	ce	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	conditions	condition	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-923
# text = Un stress oxydatif a pour effet de diminuer la superhélicité de l'ADN .
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	stress	stress	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	oxydatif	oxydatif	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	pour	pour	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	effet	effet	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	diminuer	diminuer	VNF	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	ADN	ADN	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-924
# text = Ceci est réalisé par l'induction du gène topA , codant la TopoI. La protéine de type histone
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	réalisé	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	par	par	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	induction	induction	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	du	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	gène	gène	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	topA	topA	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	codant	coder	VPR	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	TopoI.	TopoI.	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	La	La	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	protéine	protéine	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	type	type	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	histone	histone	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-925
# text = Fis a été démontrée comme étant indispensable à la survie au stress oxydatif , car Fis active topA dans ces conditions .
1	Fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	été	été	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	démontrée	démontrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	comme	comme	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	étant	étant	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	indispensable	indispensable	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	survie	survie	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	au	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	stress	stress	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	oxydatif	oxydatif	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
15	car	car	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	Fis	Fis	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
17	active	actif	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	topA	topA	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
20	ces	ce	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	conditions	condition	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-926
# text = Un mutant dépourvu de Fis est en effet sensible au stress oxydatif .
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutant	mutant	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	dépourvu	dépourvu	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	Fis	Fis	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	en	en effet	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	effet	en effet	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	sensible	sensible	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	au	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	stress	stress	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	oxydatif	oxydatif	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-927
# text = De plus , un tel stress induit la synthèse de polyamines
1	De	de plus	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	un	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	tel	tel	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	stress	stress	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	induit	induire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	synthèse	synthèse	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	polyamines	polyamine	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-928
# text = ( Tkachenko et Nesterova , 2003 ) , connues pour activer la traduction de Fis .
1	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
2	Tkachenko	Tkachenko	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	4	mark	_	_	_	_	_
4	Nesterova	Nesterova	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
6	2003	2003	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
9	connues	connu	ADJ	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
10	pour	pour	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	activer	activer	VNF	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	traduction	traduction	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	Fis	Fis	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-929
# text = La diminution de superhélicité , liée à l'activation de topA par Fis , entraîne alors l'induction des gènes nécessaires à la réparation des dommages de l'ADN suite au stress oxydatif et à la détoxification des espèces réactives de l'oxygène , permettant ainsi d'éliminer le stress .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	diminution	diminution	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
6	liée	lier	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	activation	activation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	topA	topA	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	par	par	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
13	Fis	Fis	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
15	entraîne	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	alors	alors	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	induction	induction	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	des	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	gènes	gène	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	nécessaires	nécessaire	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	à	à	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	réparation	réparation	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	des	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	dommages	dommage	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	l'	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	ADN	ADN	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	suite	suite à	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	au	suite à	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
32	stress	stress	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	oxydatif	oxydatif	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	et	et	COO	_	_	35	mark	_	_	_	_	_
35	à	à	PRE	_	_	31	para	_	_	_	_	_
36	la	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	détoxification	détoxification	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	des	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	espèces	espèce	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	réactives	réactif	ADJ	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	de	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	l'	le	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	oxygène	oxygène	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	,	,	PUNC	_	_	45	punc	_	_	_	_	_
45	permettant	permettre	VPR	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	ainsi	ainsi	ADV	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	d'	de	PRE	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
48	éliminer	éliminer	VNF	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	le	le	DET	_	_	50	spe	_	_	_	_	_
50	stress	stress	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
51	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-930
# text = Ensuite , la superhélicité augmente à nouveau suite à la diminution de transcription de topA et les gènes nécessaires à la survie ne sont plus transcrits .
1	Ensuite	ensuite	ADV	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	augmente	augmenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	à	à nouveau	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	nouveau	à nouveau	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	suite	suite à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	à	suite à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	diminution	diminution	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	transcription	transcription	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	topA	topA	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
17	les	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	gènes	gène	NOM	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
19	nécessaires	nécessaire	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	à	à	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	survie	survie	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	ne	ne	ADV	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
24	sont	être	VRB	_	_	26	aux	_	_	_	_	_
25	plus	plus	ADV	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
26	transcrits	transcrire	VPP	_	_	5	para	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-931
# text = Fis est donc un régulateur global de l'expression des gènes , qui permet l'adaptation des bactéries à leur environnement via un contrôle du degré de superhélicité de l'ADN .
1	Fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	donc	donc	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	un	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	régulateur	régulateur	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	global	global	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	expression	expression	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	des	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	gènes	gène	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
13	qui	qui	PRQ	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
14	permet	permettre	VRB	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	adaptation	adaptation	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	des	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	bactéries	bactérie	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	à	à	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	leur	son	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	environnement	environnement	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	via	via	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	un	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	contrôle	contrôle	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	du	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	degré	degré	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	l'	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	ADN	ADN	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-932
# text = En plus du stress oxydatif , la transcription du gène topA est capable de répondre à d'autres stress grâce à la présence de 4 promoteurs , qui sont activés dans des conditions différentes :
1	En	en plus de	PRE	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	plus	en plus de	DET	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	du	en plus de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	stress	stress	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	oxydatif	oxydatif	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	transcription	transcription	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
9	du	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	gène	gène	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	topA	topA	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	capable	capable	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	répondre	répondre	VNF	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	à	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	d'	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
18	autres	autre	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	stress	stress	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	grâce	grâce à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
21	à	grâce à	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	présence	présence	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	4	4	NUM	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
28	qui	qui	PRQ	_	_	30	subj	_	_	_	_	_
29	sont	être	VRB	_	_	30	aux	_	_	_	_	_
30	activés	activer	VPP	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
31	dans	dans	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	des	un	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	conditions	condition	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	différentes	différent	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	:	:	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-933
# text = P1 est activé par un choc à haute température par l'intermédiaire de & 207;& 131; 32 , le facteur sigma induit au cours de chocs thermiques ;
1	P1	P1	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	activé	activer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	par	par	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	un	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	choc	choc	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	haute	haut	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	température	température	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	par	par	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	intermédiaire	intermédiaire	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	σ	σ	VNF	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	32	32	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
17	le	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	facteur	facteur	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	sigma	sigma	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	induit	induire	VPP	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	au	au cours de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	cours	au cours de	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	de	au cours de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	chocs	choc	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	thermiques	thermique	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	;	;	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-934
# text = P2 et P4 sont les promoteurs majoritaires au cours de la phase exponentielle à
1	P2	P2	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	et	et	COO	_	_	3	mark	_	_	_	_	_
3	P4	P4	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	majoritaires	majoritaire	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	au	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	cours	cours	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	phase	phase	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-935
# text = 37 °C et 30 °C  ;
1	37	37	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	°C	degré	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
4	30	30	NUM	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	°C	degré	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
6	 ;	;	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-936
# text = P5 ( ou PX1 ) est induit en phase stationnaire par l'intermédiaire de & 207;& 131;S , le facteur sigma spécifique de la phase stationnaire et d'autres stress chez E. coli .
1	P5	P5	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
2	(	(	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	ou	ou	COO	_	_	4	mark	_	_	_	_	_
4	PX1	PX1	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
5	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	induit	induire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	en	en	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	phase	phase	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	intermédiaire	intermédiaire	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	σS	σS	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
17	le	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	facteur	facteur	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
19	sigma	sigma	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	spécifique	spécifique	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	phase	phase	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
26	d'	un	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
27	autres	autre	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	stress	stress	NOM	_	_	23	para	_	_	_	_	_
29	chez	chez	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	E.	E.	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	coli	coli	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-937
# text = Ces multiples promoteurs permettraient la synthèse de novo de TopoI en cas de changement de conditions de croissance , et donc un changement rapide du niveau de superhélicité .
1	Ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	multiples	multiple	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	permettraient	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	synthèse	synthèse	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	novo	nova	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	TopoI	TopoI	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	en	en cas de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
12	cas	en cas de	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	en cas de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	changement	changement	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	conditions	condition	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	croissance	croissance	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
20	et	et donc	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
21	donc	et donc	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
22	un	un	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	changement	changement	NOM	_	_	6	para	_	_	_	_	_
24	rapide	rapide	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	du	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	niveau	niveau	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-938
# text = Lors d'un choc osmotique , le superenroulement de l'ADN augmente , à la suite de l'augmentation du rapport [ ATP ] / [ ADP ] dans la cellule , qui stimule l'activité de la gyrase .
1	Lors	lors de	PRE	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	d'	lors de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	un	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	choc	choc	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	osmotique	osmotique	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	le	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	superenroulement	super-	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	ADN	ADN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	augmente	augmenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	suite	suite	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	augmentation	augmentation	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	du	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	rapport	rapport	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	[	(	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
23	ATP	ATP	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	]	)	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
25	/	ou	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
26	[	(	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
27	ADP	ADP	NOM	_	_	20	para	_	_	_	_	_
28	]	)	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
29	dans	dans	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	la	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	cellule	cellule	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
33	qui	qui	PRQ	_	_	34	subj	_	_	_	_	_
34	stimule	stimuler	VRB	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
35	l'	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	activité	activité	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	la	le	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	gyrase	gyrase	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-939
# text = Ceci active la transcription des gènes impliqués dans la réponse à ce stress , notamment des gènes codant des osmorégulateurs ou impliqués dans la synthèse du peptidoglycane .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	active	activer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	transcription	transcription	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	gènes	gène	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	impliqués	impliquer	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	dans	dans	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	réponse	réponse	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	à	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	ce	ce	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	stress	stress	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
15	notamment	notamment	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	des	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	gènes	gène	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
18	codant	coder	VPR	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	des	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	osmorégulateurs	osmorégulateur	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	ou	ou	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	impliqués	impliquer	VPP	_	_	7	para	_	_	_	_	_
23	dans	dans	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	synthèse	synthèse	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	du	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	peptidoglycane	peptidoglycane	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-940
# text = Le gène proU par exemple , codant un système de transport d'osmoprotecteurs tels que la glycine-bétaïne , est fortement induit .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	gène	gène	NOM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
3	proU	proU	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	par	par	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	exemple	exemple	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
7	codant	coder	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	un	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	système	système	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	transport	transport	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	d'	de	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	osmoprotecteurs	de	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	tels	tel	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	que	que	CSU	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	glycine-bétaïne	glycine-bétoine	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
19	est	être	VRB	_	_	21	aux	_	_	_	_	_
20	fortement	fortement	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	induit	induire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-941
# text = Une mutation dans le gène topA , par l'augmentation de superhélicité qu'elle induit , peut mimer l'effet d'un stress osmotique et induire l'expression de proU. Après un stress osmotique , la superhélicité revient à son niveau d'origine , ainsi que l'expression de proU et des autres gènes .
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutation	mutation	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
3	dans	dans	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	gène	gène	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	topA	topA	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
8	par	par	PRE	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	augmentation	augmentation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	qu'	que	PRQ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
14	elle	elle	CLS	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
15	induit	induire	VRB	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
17	peut	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	mimer	mimer	VNF	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	effet	effet	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	d'	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	un	un	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	stress	stress	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	osmotique	osmotique	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
26	induire	induire	VNF	_	_	18	para	_	_	_	_	_
27	l'	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	expression	expression	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	proU.	pro-	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	Après	Après	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	un	un	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	stress	stress	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	osmotique	osmotique	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	,	,	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
36	la	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	38	subj	_	_	_	_	_
38	revient	revenir	VRB	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
39	à	à	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	son	son	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	niveau	niveau	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	d'	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	origine	origine	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	,	,	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
45	ainsi	ainsi que	COO	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
46	que	ainsi que	COO	_	_	48	mark	_	_	_	_	_
47	l'	le	DET	_	_	48	spe	_	_	_	_	_
48	expression	expression	NOM	_	_	28	para	_	_	_	_	_
49	de	de	PRE	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	proU	proU	NOM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	et	et	COO	_	_	52	mark	_	_	_	_	_
52	des	de	PRE	_	_	49	para	_	_	_	_	_
53	autres	autre	ADJ	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
54	gènes	gène	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
55	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-942
# text = D'autres stress ( pH , thermique ) influent également de façon transitoire sur le niveau de superhélicité de l'ADN .
1	D'	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	autres	autre	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	stress	stress	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
4	(	(	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
5	pH	pH	NOM	_	_	3	parenth	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
7	thermique	thermique	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	)	)	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
9	influent	influer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	également	également	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	façon	façon	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	transitoire	transitoire	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	sur	sur	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	le	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	niveau	niveau	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	ADN	ADN	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-943
# text = Comme les deux cas décrits ci-dessus , ces changements de superhélicité sont transitoires et vont également influer de façon temporaire sur la transcription des gènes nécessaires à la survie à ces stress , ce qui permet aux bactéries de s'adapter à ces conditions de l'environnement .
1	Comme	comme	PRE	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	les	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	deux	deux	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	cas	cas	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	décrits	décrire	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ci-dessus	ci-dessus	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
8	ces	ce	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	changements	changement	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	transitoires	transitoire	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	vont	aller	VRB	_	_	12	para	_	_	_	_	_
16	également	également	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	influer	influer	VNF	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	façon	façon	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	temporaire	temporaire	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	sur	sur	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	transcription	transcription	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	des	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	gènes	gène	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	nécessaires	nécessaire	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	à	à	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	survie	survie	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	à	à	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	ces	ce	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	stress	stress	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
34	ce	ce	PRQ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
35	qui	qui	PRQ	_	_	36	subj	_	_	_	_	_
36	permet	permettre	VRB	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	aux	à	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	bactéries	bactérie	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
40	s'	s'	CLI	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
41	adapter	adapter	VNF	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	à	à	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	ces	ce	DET	_	_	44	spe	_	_	_	_	_
44	conditions	condition	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	de	de	PRE	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	l'	le	DET	_	_	47	spe	_	_	_	_	_
47	environnement	environnement	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
48	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-944
# text = La superhélicité de l'ADN représente donc un point de contrôle clef de l'adaptation des bactéries aux transitions nutritionnelles et aux stress environnementaux .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	représente	représenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	donc	donc	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	un	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	point	point	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	contrôle	contrôle	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	clef	clef	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	adaptation	adaptation	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	bactéries	bactérie	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	aux	à	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	transitions	transition	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	nutritionnelles	nutritionnel	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	aux	à	PRE	_	_	18	para	_	_	_	_	_
23	stress	stress	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	environnementaux	environnemental	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-945
# text = Les fluctuations de l'environnement entraînent des modifications du niveau de superenroulement de l'ADN , qui en retour provoquent des changements dans les profils globaux de transcription des gènes .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fluctuations	fluctuation	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	environnement	environnement	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	entraînent	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	des	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	modifications	modification	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	du	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	niveau	niveau	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	superenroulement	super-	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	ADN	ADN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
17	qui	qui	PRQ	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
18	en	en	PRE	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
19	retour	retour	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	provoquent	provoquer	VRB	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
21	des	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	changements	changement	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	dans	dans	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	les	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	profils	profil	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	globaux	global	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	transcription	transcription	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	des	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	gènes	gène	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-946
# text = Ceci permet ainsi l'adaptation des bactéries à leur environnement .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	permet	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	ainsi	ainsi	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	adaptation	adaptation	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	des	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	bactéries	bactérie	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	leur	son	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	environnement	environnement	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-947
# text = Un contrôle homéostatique du niveau de superenroulement permet également son maintien à un niveau physiologique , nécessaire au bon fonctionnement de tous les processus vitaux pour la cellule .
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	contrôle	contrôle	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	homéostatique	homéostatique	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	niveau	niveau	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	superenroulement	super-	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	permet	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	également	également	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	son	son	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	maintien	maintien	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
13	un	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	niveau	niveau	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	physiologique	physiologique	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
17	nécessaire	nécessaire	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	au	à	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	bon	bon	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	fonctionnement	fonctionnement	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	tous	tout	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
23	les	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	processus	processus	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	vitaux	vital	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	pour	pour	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	cellule	cellule	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-948
# text = Toutes ces propriétés font de la superhélicité de l'ADN un réseau de régulation global de l'expression des gènes , indispensable à la détection de signaux de l'environnement et à la transmission de ces signaux à la machinerie cellulaire .
1	Toutes	tout	PRQ	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	propriétés	propriété	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	font	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	ADN	ADN	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	un	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	réseau	réseau	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	régulation	régulation	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	global	global	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	expression	expression	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	des	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	gènes	gène	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	indispensable	indispensable	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
23	à	à	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	détection	détection	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	signaux	signal	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	l'	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	environnement	environnement	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	et	et	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
32	à	à	PRE	_	_	28	para	_	_	_	_	_
33	la	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	transmission	transmission	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	ces	ce	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	signaux	signal	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	à	à	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	la	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	machinerie	machinerie	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-949
# text = Ce réseau pourrait donc constituer une cible de la sélection naturelle et donc des processus évolutifs .
1	Ce	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	réseau	réseau	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	donc	donc	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	constituer	constituer	VNF	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	cible	cible	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	sélection	sélection	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	naturelle	naturel	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
13	donc	donc	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	des	de	PRE	_	_	8	para	_	_	_	_	_
15	processus	processus	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	évolutifs	évolutif	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-950
# text = Introduction Partie II La Stratégie d'Evolution Expérimentale
1	Introduction	introduction	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Partie	Partie	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	II	II	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	La	La	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	Stratégie	Stratégie	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	d'	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	Evolution	Evolution	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	Expérimentale	Expérimentale	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-951
# text = L'évolution fait depuis longtemps l'objet de recherches dont le but est d'en comprendre les mécanismes .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	évolution	évolution	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	fait	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	depuis	depuis	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	longtemps	longtemps	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	objet	objet	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	recherches	recherche	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	dont	dont	PRQ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
11	le	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	but	but	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
13	est	être	VRB	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	d'	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	en	le	CLI	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	comprendre	comprendre	VNF	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	les	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	mécanismes	mécanisme	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-952
# text = Cependant , il est difficile d'appréhender les différentes étapes et les modifications qui amènent un organisme à s'adapter à son environnement .
1	Cependant	cependant	ADV	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	il	il	CLS	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	difficile	difficile	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	d'	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	appréhender	appréhender	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
9	différentes	différent	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	étapes	étape	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	modifications	modification	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
14	qui	qui	PRQ	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
15	amènent	amener	VRB	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	un	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	organisme	organisme	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	à	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	s'	s'	CLI	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	adapter	adapter	VNF	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	à	à	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	son	son	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	environnement	environnement	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-953
# text = Les nombreuses études comparatives menées ( Losos et al. , 1998 ; Rundle et al. , 2000 ; Derome et al. , 2006 ) présentent en effet deux inconvénients majeurs :
1	Les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	nombreuses	nombreux	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	études	étude	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	comparatives	comparatif	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	menées	mener	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	(	(	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
7	Losos	Losos	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
9	al.	al.	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	1998	1998	NUM	_	_	7	para	_	_	_	_	_
12	;	;	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
13	Rundle	Rundle	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	al.	al.	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
17	2000	2000	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	;	;	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
19	Derome	Derome	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
21	al.	al.	NOM	_	_	19	para	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
23	2006	2006	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
24	)	)	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
25	présentent	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	en	en effet	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
27	effet	en effet	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	deux	deux	NUM	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	inconvénients	inconvénient	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
30	majeurs	majeur	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	:	:	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-954
# text = les fluctuations de l'environnement et l'absence de dénominateur commun , c'est-à-dire la non-connaissance de l'organisme ancêtre .
1	les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fluctuations	fluctuation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	environnement	environnement	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	absence	absence	NOM	_	_	5	para	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	dénominateur	dénominateur	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	commun	commun	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
13	c'	c'est-à-dire	COO	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	est-à-dire	c'est-à-dire	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	non-connaissance	non-	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	organisme	organisme	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-955
# text = Ainsi , l'évolution darwinienne , c'est-à-dire la diversification des organismes suivie de la sélection des individus les plus adaptés à leur environnement , est soumise à deux contraintes qui rendent son étude difficile :
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	27	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	évolution	évolution	NOM	_	_	27	subj	_	_	_	_	_
5	darwinienne	darwinien	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	c'	c'est-à-dire	COO	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	est-à-dire	c'est-à-dire	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	diversification	diversification	NOM	_	_	4	para	_	_	_	_	_
11	des	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	organismes	organisme	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	suivie	suivre	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	sélection	sélection	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	des	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	individus	individu	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	les	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
20	plus	plus	ADV	_	_	21	periph	_	_	_	_	_
21	adaptés	adapter	VPP	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	à	à	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	leur	son	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	environnement	environnement	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
26	est	être	VRB	_	_	27	aux	_	_	_	_	_
27	soumise	soumettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
28	à	à	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	deux	deux	NUM	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	contraintes	contrainte	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	qui	qui	PRQ	_	_	32	subj	_	_	_	_	_
32	rendent	rendre	VRB	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	son	son	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	étude	étude	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	difficile	difficile	ADJ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	:	:	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-956
# text = l'environnement et l'histoire évolutive passée .
1	l'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	environnement	environnement	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	histoire	histoire	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
6	évolutive	évolutif	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	passée	passer	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-957
# text = C'est pourquoi des stratégies d'évolution expérimentale ont vu le jour au cours des dernières décennies .
1	C'	ce	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	pourquoi	pourquoi?	ADV	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	stratégies	stratégie	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
6	d'	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	évolution	évolution	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	ont	avoir	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	vu	voir	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
11	le	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	jour	jour	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	au	au cours de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	cours	au cours de	DET	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	des	au cours de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	dernières	dernier	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	décennies	décennie	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-958
# text = Ces stratégies utilisent pour la plupart des microorganismes ( virus , bactéries ou levures ) , qui présentent différents avantages :
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	stratégies	stratégie	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	utilisent	utiliser	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	pour	pour	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	plupart	plupart	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	des	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	microorganismes	microorganisme	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	(	(	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	virus	virus	NOM	_	_	8	parenth	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	bactéries	bactérie	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
13	ou	ou	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	levures	levure	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
15	)	)	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
17	qui	qui	PRQ	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
18	présentent	présenter	VRB	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
19	différents	différent	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	avantages	avantage	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	:	:	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-959
# text = temps de génération court , culture aisée ( par rapport à des organismes plus complexes ) , et présence de plusieurs réplicats pour chaque expérience .
1	temps	temps	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	génération	génération	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	court	court	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
6	culture	culture	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
7	aisée	aisé	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	(	(	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
9	par	par rapport à	PRE	_	_	6	parenth	_	_	_	_	_
10	rapport	par rapport à	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	à	par rapport à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	des	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	organismes	organisme	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	plus	plus	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	complexes	complexe	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	)	)	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	présence	présence	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	plusieurs	plusieurs	PRQ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	réplicats	repli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	pour	pour	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	chaque	chaque	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	expérience	expérience	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-960
# text = Un certain nombre de stratégies d'évolution expérimentale ont utilisé des bactériophages ( Bull et al. , 1997 ) .
1	Un	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	certain	certain	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	nombre	nombre	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	stratégies	stratégie	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	d'	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	évolution	évolution	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	ont	avoir	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	utilisé	utiliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	des	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	bactériophages	bactériophage	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	(	(	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	Bull	Bull	NOM	_	_	12	parenth	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
16	al.	al.	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	1997	1997	NUM	_	_	14	para	_	_	_	_	_
19	)	)	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-961
# text = Cependant , ce sont des organismes beaucoup moins complexes que les bactéries , ne présentant par exemple pas de réseaux complexes de régulation des gènes .
1	Cependant	cependant	ADV	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	ce	ce	CLS	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	des	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	organismes	organisme	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	beaucoup	beaucoup	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	moins	moins	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	complexes	complexe	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	que	que	CSU	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	les	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	bactéries	bactérie	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
14	ne	ne	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	présentant	présenter	VPR	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	par	par exemple	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	exemple	par exemple	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	pas	pas	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	de	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	réseaux	réseau	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
21	complexes	complexe	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	régulation	régulation	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	des	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	gènes	gène	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-962
# text = La bactérie E. coli a été très souvent utilisée dans de telles expériences d'évolution .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	bactérie	bactérie	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	E.	E.	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	coli	coli	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	a	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	été	être	VPP	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
7	très	très	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	souvent	souvent	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	utilisée	utiliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
12	telles	tel	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	expériences	expérience	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	d'	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	évolution	évolution	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-963
# text = Plusieurs conditions de croissance ont été étudiées , et notamment une adaptation à de longues périodes de carence .
1	Plusieurs	plusieurs	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	conditions	condition	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	croissance	croissance	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ont	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	été	être	VPP	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	étudiées	étudier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	notamment	notamment	ADV	_	_	7	para	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	adaptation	adaptation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
15	longues	long	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	périodes	période	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	carence	carence	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-964
# text = Les bactéries s'adaptent par des modifications du gène rpoS , codant le facteur sigma de la phase stationnaire ( Zinser et Kolter , 2000 ) , mais également en augmentant leurs capacités à utiliser les acides aminés comme sources de carbone ( Zinser et Kolter , 1999 ) .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	bactéries	bactérie	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	s'	s'	CLI	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	adaptent	adapter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	des	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	modifications	modification	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	du	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	gène	gène	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	rpoS	rpoS	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	codant	coder	VPR	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
13	le	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
14	facteur	facteur	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	sigma	sigma	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	phase	phase	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	(	(	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	Zinser	Zinser	NOM	_	_	18	parenth	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	Kolter	Kolter	NOM	_	_	21	para	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
25	2000	2000	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	)	)	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
28	mais	mais	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
29	également	également	ADV	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	en	en	PRE	_	_	16	para	_	_	_	_	_
31	augmentant	augmenter	VPR	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	leurs	son	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	capacités	capacité	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	à	à	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	utiliser	utiliser	VNF	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	les	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	acides	acide	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	aminés	aminé	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	comme	comme	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
40	sources	source	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	de	de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	carbone	carbone	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	(	(	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
44	Zinser	Zinser	NOM	_	_	40	parenth	_	_	_	_	_
45	et	et	COO	_	_	46	mark	_	_	_	_	_
46	Kolter	Kolter	NOM	_	_	44	para	_	_	_	_	_
47	,	,	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
48	1999	1999	NUM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
49	)	)	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
50	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-965
# text = Le second type d'évolution expérimentale est une adaptation à une croissance continue en chémostat , dans laquelle les bactéries sont maintenues dans un état physiologique constant .
1	Le	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	second	second	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	type	type	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	évolution	évolution	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	une	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	adaptation	adaptation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	croissance	croissance	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	continue	continu	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	en	en	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
15	chémostat	rhéostat	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
17	dans	dans	PRE	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
18	laquelle	lequel	PRQ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	les	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	bactéries	bactérie	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
21	sont	être	VRB	_	_	22	aux	_	_	_	_	_
22	maintenues	maintenir	VPP	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
23	dans	dans	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	un	un	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	état	état	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	physiologique	physiologique	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	constant	constant	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-966
# text = Des modifications parallèles conduisant à un transport amélioré du glucose à travers la membrane ont été détectées dans des populations indépendantes
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	modifications	modification	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
3	parallèles	parallèle	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	conduisant	conduire	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	à	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	un	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	transport	transport	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	amélioré	améliorer	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	du	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	glucose	glucose	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	à	à travers	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	travers	à travers	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	membrane	membrane	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	ont	avoir	VRB	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	été	être	VPP	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
17	détectées	détecter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	dans	dans	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	des	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	populations	population	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	indépendantes	indépendant	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-967
# text = ( Ferenci , 2001 ) .
1	(	(	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
2	Ferenci	Ferenci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	2001	2001	NUM	_	_	2	parenth	_	_	_	_	_
5	)	)	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-968
# text = Enfin , le dernier type d'évolution expérimentale est celui initié par Richard
1	Enfin	enfin	ADV	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
4	dernier	dernier	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	type	type	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
6	d'	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	évolution	évolution	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	celui	celui	PRQ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	initié	initier	VPP	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	par	par	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	Richard	Richard	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-969
# text = Lenski , et qui consiste à adapter les bactéries à des transitions quotidiennes entre phase de croissance et carences nutritionnelles .
1	Lenski	Lenski	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
4	qui	qui	PRQ	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	consiste	consister	VRB	_	_	1	para	_	_	_	_	_
6	à	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	adapter	adapter	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	bactéries	bactérie	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	des	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	transitions	transition	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	quotidiennes	quotidien	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	entre	entre	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	phase	phase	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	croissance	croissance	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	carences	carence	NOM	_	_	17	para	_	_	_	_	_
20	nutritionnelles	nutritionnel	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-970
# text = Cette expérience possède plusieurs particularités :
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	expérience	expérience	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	possède	posséder	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	particularités	particularité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	:	:	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-971
# text = c'est tout d'abord la plus longue qui ait été effectuée à ce jour , puisqu'elle n'a quasiment pas été interrompue pendant 18 ans .
1	c'	ce	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	tout	tout d'abord	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	d'	tout d'abord	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	abord	tout d'abord	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
7	plus	plus	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	longue	long	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
9	qui	qui	PRQ	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
10	ait	avoir	VRB	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	été	être	VPP	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	effectuée	effectuer	VPP	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	ce	ce	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	jour	jour	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
17	puisqu'	puisque	CSU	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
18	elle	elle	CLS	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
19	n'	ne	ADV	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
20	a	avoir	VRB	_	_	23	aux	_	_	_	_	_
21	quasiment	quasiment	ADV	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
22	pas	pas	ADV	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
23	été	être	VPP	_	_	24	aux	_	_	_	_	_
24	interrompue	interrompre	VPP	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
25	pendant	pendant	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	18	18	NUM	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	ans	an	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-972
# text = Ensuite , tous les intermédiaires d'évolution ont été conservés et peuvent donc être « ressuscités » à tout moment .
1	Ensuite	ensuite	ADV	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	tous	tout	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	intermédiaires	intermédiaire	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
6	d'	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	évolution	évolution	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ont	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	été	être	VPP	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	conservés	conserver	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	12	mark	_	_	_	_	_
12	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	10	para	_	_	_	_	_
13	donc	donc	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	être	être	VNF	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
15	«	«	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	ressuscités	ressusciter	VPP	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
17	»	»	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
18	à	à	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	tout	tout	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	moment	moment	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-973
# text = Enfin , les nombreux travaux effectués à partir de cette stratégie en font une des mieux caractérisées , jusqu'à présent .
1	Enfin	enfin	ADV	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
4	nombreux	nombreux	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	travaux	travail	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
6	effectués	effectuer	VPP	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	à	à partir de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	partir	à partir de	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	à partir de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	cette	ce	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	stratégie	stratégie	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	en	le	CLI	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	font	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	une	un	PRQ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	des	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	mieux	mieux	ADV	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	caractérisées	caractérisé	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
19	jusqu'à	jusqu'à présent	ADV	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	présent	jusqu'à présent	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-974
# text = Cette stratégie d'évolution expérimentale , utilisée dans ce travail , fait l'objet d'une revue intitulée « Global regulatory networks plasticity during experimental evolution in E. coli » , qui sera soumise à la revue BioEssays
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	stratégie	stratégie	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	évolution	évolution	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
7	utilisée	utiliser	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	dans	dans	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	ce	ce	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	travail	travail	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
12	fait	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	objet	objet	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	d'	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	une	un	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
17	revue	revoir	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	intitulée	intituler	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
19	«	«	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
20	Global	Global	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
21	regulatory	global regulatory networks plasticity during experimental	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
22	networks	global regulatory networks plasticity during experimental	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
23	plasticity	global regulatory networks plasticity during experimental	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
24	during	global regulatory networks plasticity during experimental	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	experimental	global regulatory networks plasticity during experimental	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
26	evolution	évolution	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	in	in	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	E.	E.	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
29	coli	coli	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
30	»	»	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
32	qui	qui	PRQ	_	_	34	subj	_	_	_	_	_
33	sera	être	VRB	_	_	34	aux	_	_	_	_	_
34	soumise	soumettre	VPP	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
35	à	à	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	la	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	revue	revue	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	BioEssays	BioEssays	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-975
# text = ( Philippe N. , Crozat E. , Lenski RE. , and Schneider D. ) .
1	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
2	Philippe	Philippe	NOM	_	_	3	parenth	_	_	_	_	_
3	N.	N.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
5	Crozat	Crozat	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	E.	E.	NOM	_	_	5	para	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
8	Lenski	Lenski	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	RE.	RE.	NOM	_	_	8	para	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
11	and	and schneider d.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
12	Schneider	Schneider	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	D.	D.	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
14	)	)	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-976
# text = Une présentation d'ensemble de cette stratégie d'évolution expérimentale est donnée ici .
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	présentation	présentation	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ensemble	ensemble	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	cette	ce	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	stratégie	stratégie	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	d'	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	évolution	évolution	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	est	être	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	donnée	donner	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	ici	ici	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-977
# text = Le système d'évolution expérimentale a été initié dans le laboratoire du Pr .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	système	système	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	évolution	évolution	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	a	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	été	être	VPP	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	initié	initier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	le	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	laboratoire	laboratoire	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	du	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	Pr	Pr	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-978
# text = Richard Lenski
1	Richard	Richard	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Lenski	Lenski	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-979
# text = ( Michigan State University , USA ) en 1988 .
1	(	(	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
2	Michigan	Michigan	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
3	State	State	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	University	University	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
6	USA	USA	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
8	en	en	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	1988	1988	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-980
# text = Un clone ancêtre d'E. coli B , de phénotype Ara- , c'est-à-dire incapable d'utiliser l'arabinose comme source de carbone , ainsi qu'un variant isogénique de phénotype Ara + , ont été utilisés pour initier 12 populations indépendantes , 6 étant issues de l'ancêtre Ara- ( appelées Ara- 1 à Ara- 6 ) et 6 de l'ancêtre Ara + ( appelées Ara + 1 à Ara + 6 ) .
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	clone	clone	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
3	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	E.	E.	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	coli	coli	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	B	B	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
10	phénotype	phénotype	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	Ara-	Ara-	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
13	c'	c'est-à-dire	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	est-à-dire	c'est-à-dire	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	incapable	incapable	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
16	d'	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	utiliser	utiliser	VNF	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	l'	le	D+N+V	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	arabinose	le	PRO+N+V	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	comme	comme	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	source	source	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	carbone	carbone	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	67	punc	_	_	_	_	_
25	ainsi	ainsi que	CSU	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	qu'	ainsi que	CSU	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
27	un	un	PRQ	_	_	37	periph	_	_	_	_	_
28	variant	varier	VPR	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	isogénique	isogénique	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	phénotype	phénotype	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	Ara	Ara	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	+	plus	ADV	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
34	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
35	ont	avoir	VRB	_	_	36	aux	_	_	_	_	_
36	été	être	VPP	_	_	37	aux	_	_	_	_	_
37	utilisés	utiliser	VPP	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
38	pour	pour	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	initier	initier	VNF	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	12	12	NUM	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	populations	population	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	indépendantes	indépendant	ADJ	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	,	,	PUNC	_	_	67	punc	_	_	_	_	_
44	6	6	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
45	étant	être	VPR	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	issues	issu	ADJ	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	de	de	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	l'	le	DET	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
49	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	Ara-	Ara-	NOM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	(	(	PUNC	_	_	52	punc	_	_	_	_	_
52	appelées	appelé	NOM	_	_	49	parenth	_	_	_	_	_
53	Ara-	Ara-	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	1	1	NUM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
55	à	à	PRE	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
56	Ara-	Ara-	NOM	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
57	6	6	NUM	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
58	)	)	PUNC	_	_	52	punc	_	_	_	_	_
59	et	et	COO	_	_	60	mark	_	_	_	_	_
60	6	6	NUM	_	_	49	para	_	_	_	_	_
61	de	de	PRE	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
62	l'	le	DET	_	_	63	spe	_	_	_	_	_
63	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
64	Ara	Ara	NOM	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
65	+	plus	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
66	(	(	PUNC	_	_	67	punc	_	_	_	_	_
67	appelées	appelé	NOM	_	_	19	parenth	_	_	_	_	_
68	Ara	Ara	NOM	_	_	67	dep	_	_	_	_	_
69	+	+ 1	PRE	_	_	67	dep	_	_	_	_	_
70	1	1	NUM	_	_	69	dep	_	_	_	_	_
71	à	à	PRE	_	_	67	dep	_	_	_	_	_
72	Ara	Ara	NOM	_	_	71	dep	_	_	_	_	_
73	+	+ 6	PRE	_	_	67	dep	_	_	_	_	_
74	6	6	NUM	_	_	73	dep	_	_	_	_	_
75	)	)	PUNC	_	_	67	punc	_	_	_	_	_
76	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-981
# text = Le phénotype d'utilisation de l'arabinose est utilisé comme marqueur dans les expériences de compétition et a été démontré comme étant neutre dans ces conditions .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	phénotype	phénotype	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	utilisation	utilisation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	NOM	_	_	7	det	_	_	_	_	_
7	arabinose	le	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	est	être	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	utilisé	utiliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	comme	comme	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	marqueur	marqueur	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	dans	dans	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	les	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	expériences	expérience	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	compétition	compétition	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
18	a	avoir	VRB	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
19	été	être	VPP	_	_	20	aux	_	_	_	_	_
20	démontré	démontrer	VPP	_	_	9	para	_	_	_	_	_
21	comme	comme	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	étant	étant	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	neutre	neutre	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	dans	dans	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
25	ces	ce	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	conditions	condition	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-982
# text = Toutes ces populations sont propagées pendant 24h à 37 °C , sous agitation , dans 10 mL de milieu minimum Davis ( DM ) contenant une quantité limitée de glucose ( 25 µg / mL , DM25 ) .
1	Toutes	tout	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	populations	population	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
4	sont	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	propagées	propager	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	pendant	pendant	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	24h	24h	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	37	37	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	°C	degré	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
12	sous	sous	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
13	agitation	agitation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	dans	dans	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
16	10	10	NUM	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	mL	millilitre	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	milieu	milieu	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	minimum	minimum	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	Davis	Davis	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
22	(	(	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
23	DM	DM	NOM	_	_	17	parenth	_	_	_	_	_
24	)	)	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
25	contenant	contenir	VPR	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
26	une	un	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	quantité	quantité	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	limitée	limiter	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	glucose	glucose	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	(	(	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
32	25	25	NUM	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	µg	micro-	NOM	_	_	27	parenth	_	_	_	_	_
34	/	sur	PUNC	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	mL	millilitre	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
37	DM25	DM25	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	)	)	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-983
# text = Chaque jour , elles sont diluées au 1 / 100ème dans le même milieu .
1	Chaque	chaque	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	jour	jour	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	elles	elles	CLS	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	sont	être	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	diluées	diluer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	au	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	1	1	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
9	/	1 / 100ème	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
10	100ème	100ème	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	dans	dans	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
12	le	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
13	même	même	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	milieu	milieu	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-984
# text = Cette dilution permet environ 6 , 64 générations par 24h ( log 2 100 ) , et une concentration d'environ
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	dilution	dilution	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	permet	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	environ	environ	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
5	6	6	NUM	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
6	,	6 , 64	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
7	64	64	NUM	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	générations	génération	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
9	par	par	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	24h	24h	NUM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	(	(	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	log	logarithme	NOM	_	_	10	parenth	_	_	_	_	_
13	2	2	NUM	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	100	100	NUM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	)	)	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
18	une	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	concentration	concentration	NOM	_	_	8	para	_	_	_	_	_
20	d'	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	environ	environ	ADV	_	_	20	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-985
# text = 5.107 cellules / mL est obtenue après 24h de culture .
1	5.107	5.107	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	cellules	cellule	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	/	sur	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	mL	millilitre	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	est	être	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	obtenue	obtenir	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	après	après	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	24h	24h	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	culture	culture	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-986
# text = Depuis 1988 , les 12 populations ont donc évolué pendant plus de 40 000 générations dans ce milieu constant , de façon indépendante à partir d'un ancêtre commun , ce qui , à l'échelle humaine , correspondrait environ à un million d'années .
1	Depuis	depuis	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	1988	1988	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	12	12	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	populations	population	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
7	ont	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
8	donc	donc	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	évolué	évoluer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	pendant	pendant	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	plus	plus	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	40	40	NUM	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	000	000	NUM	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	générations	génération	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	dans	dans	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
17	ce	ce	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	milieu	milieu	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	constant	constant	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
22	façon	façon	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	indépendante	indépendant	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	à	à partir de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	partir	à partir de	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	d'	à partir de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	un	un	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	commun	commun	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
31	ce	ce	PRQ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
32	qui	qui	PRQ	_	_	39	subj	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
34	à	à	PRE	_	_	39	periph	_	_	_	_	_
35	l'	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	échelle	échelle	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	humaine	humain	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
39	correspondrait	correspondre	VRB	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
40	environ	environ	ADV	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	à	à	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	un	un million	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	million	un million	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	d'	de	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	années	année	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-987
# text = Chaque jour , ces populations rencontrent d'abord une phase de latence , une phase exponentielle , puis elles entrent en phase stationnaire jusqu'au jour suivant , où les cellules recommencent à croître dans le milieu frais .
1	Chaque	chaque	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	jour	jour	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	ces	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	populations	population	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	rencontrent	rencontrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	d'	d'abord	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	abord	d'abord	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	une	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	phase	phase	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	latence	latence	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
14	une	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	phase	phase	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
16	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
18	puis	puis	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
19	elles	elles	CLS	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
20	entrent	entrer	VRB	_	_	6	para	_	_	_	_	_
21	en	en	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	phase	phase	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	jusqu'au	jusqu'à	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
25	jour	jour	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	suivant	suivant	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
28	où	où	PRQ	_	_	31	periph	_	_	_	_	_
29	les	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	cellules	cellule	NOM	_	_	31	subj	_	_	_	_	_
31	recommencent	recommencer	VRB	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
32	à	à	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	croître	croître	VNF	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	dans	dans	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	le	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	milieu	milieu	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	frais	frais	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-988
# text = Ces populations sont donc propagées dans des conditions où elles alternent tous les jours entre des conditions de croissance et de carences nutritionnelles , et vice versa .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	populations	population	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
4	donc	donc	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	propagées	propager	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	dans	dans	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	des	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	conditions	condition	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	où	où	PRQ	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
10	elles	elles	CLS	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
11	alternent	alterner	VRB	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	tous	tout	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
13	les	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	jours	jour	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	entre	entre	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
16	des	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	conditions	condition	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	croissance	croissance	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	18	para	_	_	_	_	_
22	carences	carence	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	nutritionnelles	nutritionnel	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
26	vice	vice	NOM	_	_	27	subj	_	_	_	_	_
27	versa	verser	VRB	_	_	5	para	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-989
# text = Outre les nombreux avantages liés à E. coli ( multiplication rapide et clonale , grande taille de populations , données disponibles très nombreuses ) , ce système d'évolution expérimentale présente un certain nombre d'atouts :
1	Outre	outre	PRE	_	_	31	periph	_	_	_	_	_
2	les	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	nombreux	nombreux	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	avantages	avantage	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	liés	lier	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	à	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	E.	E.	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	coli	coli	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	(	(	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	multiplication	multiplication	NOM	_	_	8	parenth	_	_	_	_	_
11	rapide	rapide	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
13	clonale	clonal	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
15	grande	grand	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	taille	taille	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	populations	population	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
20	données	donnée	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	disponibles	disponible	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	très	très	ADV	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	nombreuses	nombreux	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	)	)	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
26	ce	ce	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	système	système	NOM	_	_	31	subj	_	_	_	_	_
28	d'	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	évolution	évolution	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	présente	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
32	un	un	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
33	certain	certain	ADJ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
34	nombre	nombre	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
35	d'	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	atouts	atout	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	:	:	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-990
# text = des échantillons des 12 populations ont été prélevés et congelés toutes les 500 générations , permettant ainsi d'isoler des individus évolués à chacun des temps d'évolution et dans chacune des 12 populations .
1	des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	échantillons	échantillon	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	12	12	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	populations	population	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	ont	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	été	être	VPP	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	prélevés	prélever	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	congelés	congeler	VPP	_	_	8	para	_	_	_	_	_
11	toutes	tout	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
13	500	500	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	générations	génération	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	permettant	permettre	VPR	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	ainsi	ainsi	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	d'	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	isoler	isoler	VNF	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	des	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	individus	individu	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	évolués	évolué	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	à	à	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	chacun	chacun	PRQ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	des	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	temps	temps	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	d'	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	évolution	évolution	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	et	et	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
30	dans	dans	PRE	_	_	27	para	_	_	_	_	_
31	chacune	chacun	PRQ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	des	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	12	12	NUM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
34	populations	population	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-991
# text = N'importe quel clone évolué peut donc être comparé à son clone ancêtre , par exemple par des expériences de compétitions , mais aussi pour tout paramètre phénotypique ou moléculaire .
1	N'	n'importe quel	DET	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	importe	n'importe quel	DET	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	quel	n'importe quel	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	clone	clone	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	évolué	évolué	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	peut	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	donc	donc	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	être	être	VNF	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	comparé	comparer	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	son	son	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	clone	clone	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
15	par	par exemple	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
16	exemple	par exemple	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	par	par	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
18	des	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	expériences	expérience	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	compétitions	compétition	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
23	mais	mais aussi	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
24	aussi	mais aussi	ADV	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	pour	pour	PRE	_	_	20	para	_	_	_	_	_
26	tout	tout	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	paramètre	paramètre	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	phénotypique	phénotypique	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	ou	ou	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
30	moléculaire	moléculaire	ADJ	_	_	28	para	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-992
# text = les mutations identifiées au cours de cette évolution expérimentale peuvent être introduites par recombinaison homologue dans le chromosome de l'ancêtre et de tout clone évolué , au moyen de plasmides suicides , et leurs effets peuvent être analysés dans différents contextes génétiques et environnementaux .
1	les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutations	mutation	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	identifiées	identifier	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	au	au cours de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	cours	au cours de	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	au cours de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	cette	ce	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	évolution	évolution	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	être	être	VNF	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	introduites	introduire	VPP	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	par	par	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	homologue	homologue	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	dans	dans	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
17	le	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	chromosome	chromosome	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	19	para	_	_	_	_	_
24	tout	tout	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	clone	clone	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	évolué	évolué	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
28	au	au moyen de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
29	moyen	au moyen de	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	de	au moyen de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	plasmides	plasmode	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	suicides	suicide	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
34	et	et	COO	_	_	37	mark	_	_	_	_	_
35	leurs	son	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	effets	effet	NOM	_	_	37	subj	_	_	_	_	_
37	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	12	para	_	_	_	_	_
38	être	être	VNF	_	_	39	aux	_	_	_	_	_
39	analysés	analyser	VPP	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	dans	dans	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	différents	différent	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	contextes	contexte	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	génétiques	génétique	ADJ	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	et	et	COO	_	_	45	mark	_	_	_	_	_
45	environnementaux	environnemental	ADJ	_	_	43	para	_	_	_	_	_
46	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-993
# text = Le stade d'apparition et de fixation de chaque mutation peut aussi être déterminé .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	stade	stade	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	apparition	apparition	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	3	para	_	_	_	_	_
7	fixation	fixation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	chaque	chaque	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	mutation	mutation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	peut	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	aussi	aussi	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	être	être	VNF	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	déterminé	déterminer	VPP	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-994
# text = Les expériences de compétition consistent , après 24h d'adaptation de chaque compétiteur au milieu étudié , à mélanger un clone évolué et le clone ancêtre de marqueur Ara opposé ( Figure 27 ) .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	expériences	expérience	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	compétition	compétition	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	consistent	consister	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
7	après	après	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	24h	24h	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	adaptation	adaptation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	chaque	chaque	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	compétiteur	compétiteur	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	au	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	milieu	milieu	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	étudié	étudier	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	à	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
19	mélanger	mélanger	VNF	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	un	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	clone	clone	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	évolué	évolué	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
24	le	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	clone	clone	NOM	_	_	21	para	_	_	_	_	_
26	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	marqueur	marqueur	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	Ara	Ara	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	opposé	opposer	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	(	(	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
32	Figure	Figure	NOM	_	_	28	parenth	_	_	_	_	_
33	27	27	NUM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	)	)	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-995
# text = Au temps zéro , c'est-à-dire à l'instant du mélange , un premier prélèvement est effectué et une dilution adéquate est étalée sur un milieu solide contenant du tétrazolium et de l'arabinose .
1	Au	à	PRE	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
2	temps	temps	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	zéro	zéro	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
5	c'	c'est-à-dire	COO	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	est-à-dire	c'est-à-dire	COO	_	_	7	mark	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	1	para	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	instant	instant	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	du	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	mélange	mélange	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
13	un	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
14	premier	premier	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	prélèvement	prélèvement	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
16	est	être	VRB	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
17	effectué	effectuer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
19	une	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	dilution	dilution	NOM	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
21	adéquate	adéquat	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	est	être	VRB	_	_	23	aux	_	_	_	_	_
23	étalée	étaler	VPP	_	_	17	para	_	_	_	_	_
24	sur	sur	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	un	un	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	milieu	milieu	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	solide	solide	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	contenant	contenir	VPR	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	du	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
30	tétrazolium	tétrazolium	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	et	et	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	29	para	_	_	_	_	_
33	l'	le	NOM	_	_	34	det	_	_	_	_	_
34	arabinose	le	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-996
# text = Sur ce milieu , les colonies Ara + apparaissent roses alors que les Ara- apparaissent rouges , ce qui permet de les distinguer et de les dénombrer .
1	Sur	sur	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	ce	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	milieu	milieu	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	colonies	colonie	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
7	Ara	Ara	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	+	plus	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	apparaissent	apparaître	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	roses	rose	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	alors	alors que	CSU	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	que	alors que	CSU	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	les	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	Ara-	Ara-	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
15	apparaissent	apparaître	VRB	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	rouges	rouge	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	ce	ce	PRQ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	qui	qui	PRQ	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
20	permet	permettre	VRB	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	les	le	CLI	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	distinguer	distinguer	VNF	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	21	para	_	_	_	_	_
26	les	le	CLI	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
27	dénombrer	dénombrer	VNF	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-997
# text = Après 24h de co-culture , un nouvel échantillon est prélevé , dilué puis étalé , et les deux compétiteurs sont à nouveau dénombrés .
1	Après	après	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	24h	24h	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	co-culture	co-	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	un	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
7	nouvel	nouveau	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	échantillon	échantillon	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
9	est	être	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	prélevé	prélever	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
12	dilué	diluer	VPP	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	puis	puis	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	étalé	étaler	VPP	_	_	12	para	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
17	les	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
18	deux	deux	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	compétiteurs	compétiteur	NOM	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
20	sont	être	VRB	_	_	23	aux	_	_	_	_	_
21	à	à nouveau	PRE	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
22	nouveau	à nouveau	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	dénombrés	dénombrer	VPP	_	_	10	para	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-998
# text = Les proportions des 2 compétiteurs déterminées au début et à la fin de la co-culture permettent de calculer le fitness :
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	proportions	proportion	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	2	2	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	compétiteurs	compétiteur	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	déterminées	déterminé	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	au	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	début	début	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	7	para	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	fin	fin	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	co-culture	co-	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	permettent	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	calculer	calculer	VNF	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	le	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	fitness	fine	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	:	:	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-999
# text = c'est le ratio des taux de croissance de ces deux compétiteurs ( Figure 27 ) .
1	c'	ce	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	le	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	ratio	ratio	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	taux	taux	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	croissance	croissance	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	ces	ce	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
11	deux	deux	NUM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	compétiteurs	compétiteur	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	(	(	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	Figure	Figure	NOM	_	_	12	parenth	_	_	_	_	_
15	27	27	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	)	)	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1000
# text = La trajectoire d'évolution du fitness de chacune des 12 populations a été déterminée au cours du temps , par rapport au clone ancêtre .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	trajectoire	trajectoire	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	évolution	évolution	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	du	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	fitness	fine	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	chacune	chacun	PRQ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	des	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	12	12	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	populations	population	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	a	avoir	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	été	être	VPP	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	déterminée	déterminer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	au	au cours de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	cours	au cours de	DET	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	du	au cours de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	temps	temps	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	par	par rapport à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
21	rapport	par rapport à	DET	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	au	par rapport à	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	clone	clone	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1001
# text = Le fitness augmente de 70 % en moyenne après 20 000 générations d'évolution ( Lenski et Travisano , 1994 ; Cooper et Lenski , 2000 ) , avec une augmentation très forte pendant les 2000 premières générations , puis plus lente par la suite ( voir figure 1 de l'article suivant ) .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fitness	fine	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	augmente	augmenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	70	70	NUM	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	%	pourcent	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	en	en	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	moyenne	moyenne	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	après	après	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
10	20	20	NUM	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	000	000	NUM	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	générations	génération	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	d'	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	évolution	évolution	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	(	(	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
16	Lenski	Lenski	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	Travisano	Travisano	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
20	1994	1994	NUM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	;	;	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
22	Cooper	Cooper	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
23	et	et	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
24	Lenski	Lenski	NOM	_	_	22	para	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
26	2000	2000	NUM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	)	)	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	avec	avec	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
30	une	un	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	augmentation	augmentation	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	très	très	ADV	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
33	forte	fort	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	pendant	pendant	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
35	les	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
36	2000	2000	NUM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
37	premières	premier	ADJ	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
38	générations	génération	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
39	,	,	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
40	puis	puis	COO	_	_	42	mark	_	_	_	_	_
41	plus	plus	ADV	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	lente	lente	NOM	_	_	38	para	_	_	_	_	_
43	par	par	PRE	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	la	le	DET	_	_	45	spe	_	_	_	_	_
45	suite	suite	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	(	(	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
47	voir	voir	VNF	_	_	48	subj	_	_	_	_	_
48	figure	figurer	VRB	_	_	45	parenth	_	_	_	_	_
49	1	1	NUM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	de	de	PRE	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	l'	le	DET	_	_	52	spe	_	_	_	_	_
52	article	article	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
53	suivant	suivant	ADJ	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	)	)	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
55	.	.	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1002
# text = Cette augmentation de fitness est similaire au sein des
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	augmentation	augmentation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	fitness	fine	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	est	est	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	similaire	similaire	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	au	à+le	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	sein	au sein de	N+_	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	des	de+le	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1003
# text = 12 populations , ce qui révèle une évolution phénotypique parallèle , caractéristique de l'adaptation des bactéries à ces conditions expérimentales .
1	12	12	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	populations	population	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	ce	ce	PRQ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	qui	qui	PRQ	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	révèle	révéler	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	une	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	évolution	évolution	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	phénotypique	phénotypique	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	parallèle	parallèle	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	caractéristique	caractéristique	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	adaptation	adaptation	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	bactéries	bactérie	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	à	à	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	ces	ce	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	conditions	condition	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	expérimentales	expérimental	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1004
# text = D'autres phénotypes ont été identifiés sur la base de leur évolution parallèle dans la majorité des 12 populations .
1	D'	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	autres	autre	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	phénotypes	phénotype	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
4	ont	avoir	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	été	être	VPP	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	identifiés	identifier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	sur	sur	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	base	base	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	leur	son	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	évolution	évolution	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	parallèle	parallèle	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	dans	dans	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	majorité	majorité	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	des	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	12	12	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	populations	population	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1005
# text = Le phénotype le plus visible est une modification de la morphologie cellulaire , associée à une augmentation de la taille et du volume cellulaire , de 50 à 100 % , qui suit de manière similaire l'augmentation du fitness ( Mongold et Lenski , 1996 ) .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	phénotype	phénotype	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
4	plus	plus	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	visible	visible	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	30	det	_	_	_	_	_
7	une	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	modification	modification	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	morphologie	morphologie	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
14	associée	associer	VPP	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	une	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	augmentation	augmentation	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	taille	taille	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	du	de	PRE	_	_	18	para	_	_	_	_	_
23	volume	volume	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
27	50	50	NUM	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
28	à	à	PRE	_	_	26	para	_	_	_	_	_
29	100	100	NUM	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	%	pourcent	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
32	qui	qui	PRQ	_	_	33	subj	_	_	_	_	_
33	suit	suivre	VRB	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	manière	manière	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	similaire	similaire	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	l'	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	augmentation	augmentation	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
39	du	de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	fitness	fine	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	(	(	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
42	Mongold	Mongold	NOM	_	_	38	parenth	_	_	_	_	_
43	et	et	COO	_	_	44	mark	_	_	_	_	_
44	Lenski	Lenski	NOM	_	_	42	para	_	_	_	_	_
45	,	,	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_
46	1996	1996	NUM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	)	)	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
48	.	.	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1006
# text = Les paramètres de la croissance et les capacités cataboliques des cellules sont également affectés de manière parallèle au cours de l'évolution ..
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	paramètres	paramètre	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	croissance	croissance	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
7	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	capacités	capacité	NOM	_	_	5	para	_	_	_	_	_
9	cataboliques	catabolique	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	des	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	cellules	cellule	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	sont	être	VRB	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
13	également	également	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	affectés	affecter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	manière	manière	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	parallèle	parallèle	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	au	au cours de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
19	cours	au cours de	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	de	au cours de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	l'	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	évolution	évolution	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	..	...	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1007
# text = En effet , chacune des 12 populations évoluées révèle une forte augmentation du taux de croissance , ainsi qu'une diminution du temps de latence .
1	En	en effet	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	chacune	chacun	PRQ	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	12	12	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	populations	population	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	évoluées	évolué	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	révèle	révéler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
11	forte	fort	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	augmentation	augmentation	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
13	du	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	taux	taux	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	croissance	croissance	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
18	ainsi	ainsi que	COO	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	qu'	ainsi que	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
20	une	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	diminution	diminution	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
22	du	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	temps	temps	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	latence	latence	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1008
# text = D'autre part , la croissance prolongée de ces populations avec du glucose comme seule source de carbone a conduit à une diminution de 42 % en moyenne de la capacité de croissance sur une grande diversité de substrats ( Cooper et Lenski , 2000 ) .
1	D'	d'autre part	ADV	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
2	autre	d'autre part	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	part	d'autre part	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	croissance	croissance	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
7	prolongée	prolonger	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	ces	ce	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	populations	population	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	avec	avec	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	du	de+le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	glucose	glucose	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	comme	comme	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	seule	seul	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	source	source	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	carbone	carbone	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	a	avoir	VRB	_	_	20	aux	_	_	_	_	_
20	conduit	conduire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	à	à	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	une	un	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	diminution	diminution	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	42	42	NUM	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	%	pourcent	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	en	en	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
28	moyenne	moyenne	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
30	la	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	capacité	capacité	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	croissance	croissance	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	sur	sur	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
35	une	un	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
36	grande	grand	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
37	diversité	diversité	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	substrats	substrat	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	(	(	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
41	Cooper	Cooper	NOM	_	_	37	parenth	_	_	_	_	_
42	et	et	COO	_	_	43	mark	_	_	_	_	_
43	Lenski	Lenski	NOM	_	_	41	para	_	_	_	_	_
44	,	,	PUNC	_	_	45	punc	_	_	_	_	_
45	2000	2000	NUM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	)	)	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
47	.	.	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1009
# text = Sur 64 substrats testés , les clones évolués de la majorité des 12 populations présentent une capacité réduite à utiliser 16 sources de carbone après 10 000 générations ( Cooper et Lenski , 2000 ) .
1	Sur	sur	PRE	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
2	64	64	NUM	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	substrats	substrat	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	testés	tester	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	clones	clone	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
8	évolués	évolué	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	majorité	majorité	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	des	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	12	12	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	populations	population	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	présentent	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	une	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	capacité	capacité	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	réduite	réduire	VPP	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	à	à	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	utiliser	utiliser	VNF	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	16	16	NUM	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	sources	source	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	carbone	carbone	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	après	après	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
26	10	10	NUM	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	000	000	NUM	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	générations	génération	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
29	(	(	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
30	Cooper	Cooper	NOM	_	_	28	parenth	_	_	_	_	_
31	et	et	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
32	Lenski	Lenski	NOM	_	_	30	para	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
34	2000	2000	NUM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	)	)	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1010
# text = Cette diminution touche vraisemblablement des fonctions non indispensables dans l'environnement de l'évolution où le glucose est la seule source de carbone .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	diminution	diminution	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	touche	toucher	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	vraisemblablement	vraisemblablement	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	des	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	fonctions	fonction	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	non	non	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	indispensables	indispensable	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	environnement	environnement	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	évolution	évolution	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	où	où	PRQ	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
16	le	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	glucose	glucose	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
18	est	être	VRB	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
20	seule	seul	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	source	source	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	carbone	carbone	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1011
# text = L'adaptation des bactéries se caractérise ainsi par un phénomène de spécialisation écologique .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	adaptation	adaptation	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	bactéries	bactérie	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	se	se	CLI	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	caractérise	caractériser	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	ainsi	ainsi	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	par	par	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	un	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	phénomène	phénomène	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	spécialisation	spécialisation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	écologique	écologique	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1012
# text = Dans un cas extrême , une perte de fonction a été observée pour les 12 populations :
1	Dans	dans	PRE	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	un	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	cas	cas	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	extrême	extrême	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	perte	perte	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	fonction	fonction	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	a	avoir	VRB	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	été	être	VPP	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	observée	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	pour	pour	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
15	12	12	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	populations	population	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	:	:	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1013
# text = la capacité à utiliser le ribose comme source de carbone .
1	la	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	capacité	capacité	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	à	à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	utiliser	utiliser	VNF	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	le	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	ribose	ribose	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	comme	comme	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	source	source	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	carbone	carbone	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1014
# text = Ceci est dû à des délétions de l'opéron rbs d'utilisation du ribose , associées à l'activité d'une séquence d'insertion IS150 .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	dû	devoir	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	à	à	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	des	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	délétions	délétion	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	opéron	opéron	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	rbs	ru	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	d'	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	utilisation	utilisation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	du	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	ribose	ribose	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	associées	associer	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
17	à	à	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	activité	activité	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	d'	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	une	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	séquence	séquence	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	d'	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	insertion	insertion	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	IS150	IS150	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1015
# text = Des modifications parallèles de phénotypes au cours de l'évolution représentent une signature de la sélection naturelle , ces changements phénotypiques pouvant alors représenter des modifications bénéfiques dans ces conditions .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	modifications	modification	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
3	parallèles	parallèle	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	phénotypes	phénotype	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	au	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	cours	cours	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	évolution	évolution	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	représentent	représenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	une	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	signature	signature	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	sélection	sélection	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	naturelle	naturel	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
19	ces	ce	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	changements	changement	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	phénotypiques	phénotypique	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	pouvant	pouvoir	VPR	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	alors	alors	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	représenter	représenter	VNF	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	des	un	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	modifications	modification	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	dans	dans	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	ces	ce	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	conditions	condition	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1016
# text = Il a ainsi été démontré que les délétions de l'opéron ribose étaient effectivement bénéfiques dans ces conditions d'évolution expérimentale , procurant un effet positif d'environ 2 % sur le fitness .
1	Il	il	CLS	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
2	a	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
3	ainsi	ainsi	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
4	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	démontré	démontrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	que	que	CSU	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	délétions	délétion	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	opéron	opéron	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	ribose	ribose	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	étaient	être	VRB	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
14	effectivement	effectivement	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	dans	dans	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	ces	ce	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	conditions	condition	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	d'	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	évolution	évolution	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
23	procurant	procurer	VPR	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	un	un	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	effet	effet	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	positif	positif	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	d'	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	environ	environ	ADV	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
29	2	2	NUM	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	%	pourcent	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
31	sur	sur	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
32	le	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	fitness	fine	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1017
# text = D'autre part , le taux de mutation est un autre caractère présentant des changements parallèles au cours de cette évolution expérimentale .
1	D'	d'autre part	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	autre	d'autre part	ADV	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	part	d'autre part	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
5	le	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	taux	taux	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	mutation	mutation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	un	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
11	autre	autre	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	caractère	caractère	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	présentant	présenter	VPR	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	des	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	changements	changement	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	parallèles	parallèle	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	au	au cours de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
18	cours	au cours de	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	au cours de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	cette	ce	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	évolution	évolution	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1018
# text = En effet , 4 des 12 populations présentent un taux de mutation environ 100 fois plus élevé que celui de l'ancêtre , suite à des mutations dans les gènes codant les protéines impliquées dans le système de réparation des mésappariements de l'ADN .
1	En	en	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	effet	effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	4	4	NUM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	12	12	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	populations	population	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	présentent	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	un	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	taux	taux	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	mutation	mutation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	environ	environ	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
14	100	100	NUM	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	fois	fois	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	plus	plus	ADV	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	élevé	élevé	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
18	que	que	CSU	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	celui	celui	PRQ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	l'	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	suite	suite à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
25	à	suite à	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	des	un	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	mutations	mutation	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
28	dans	dans	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	les	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	gènes	gène	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	codant	coder	VPR	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	les	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	protéines	protéine	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	impliquées	impliquer	VPP	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	dans	dans	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	le	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	système	système	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	réparation	réparation	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	des	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	mésappariements	désappariement	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	de	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	l'	le	DET	_	_	44	spe	_	_	_	_	_
44	ADN	ADN	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1019
# text = Les mutations responsables de l'adaptation des bactéries à leur environnement , et pouvant conférer un fitness accru dans ces conditions , ont été recherchées par 2 types d'approches :
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutations	mutation	NOM	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
3	responsables	responsable	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	adaptation	adaptation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	des	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	bactéries	bactérie	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	leur	son	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	environnement	environnement	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	pouvant	pouvoir	VPR	_	_	4	para	_	_	_	_	_
15	conférer	conférer	VNF	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	un	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	fitness	fin	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	accru	accroître	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	dans	dans	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
20	ces	ce	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	conditions	condition	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
23	ont	avoir	VRB	_	_	24	aux	_	_	_	_	_
24	été	être	VPP	_	_	25	aux	_	_	_	_	_
25	recherchées	rechercher	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	par	par	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	2	2	NUM	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	types	type	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	d'	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	approches	approche	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	:	:	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1020
# text = l'utilisation de marqueurs génomiques et l'analyse moléculaire de phénotypes modifiés de façon parallèle dans la majorité des 12 populations au cours de l'évolution .
1	l'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	utilisation	utilisation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	marqueurs	marqueur	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	génomiques	génomique	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	analyse	analyse	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
9	moléculaire	moléculaire	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	phénotypes	phénotype	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	modifiés	modifier	VPP	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	façon	façon	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	parallèle	parallèle	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	dans	dans	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	majorité	majorité	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	des	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	12	12	NUM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	populations	population	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	au	au cours de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
23	cours	au cours de	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	de	au cours de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	l'	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	évolution	évolution	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1021
# text = Une analyse de l'évolution des génomes a été effectuée par polymorphisme de longueur de fragments de restriction ( RFLP ) , en utilisant les séquences d'insertion IS connues chez E. coli comme marqueurs génomiques au sein de deux populations appelées
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	analyse	analyse	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	évolution	évolution	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	des	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	génomes	génome	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	a	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	été	être	VPP	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	effectuée	effectuer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	polymorphisme	polymorphisme	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	longueur	longueur	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	fragments	fragment	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	restriction	restriction	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	(	(	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	RFLP	RFLP	NOM	_	_	16	parenth	_	_	_	_	_
21	)	)	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
23	en	en	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
24	utilisant	utiliser	VPR	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	les	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	séquences	séquence	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	d'	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	insertion	insertion	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	IS	IS	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
30	connues	connaître	VPP	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
31	chez	chez	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	E.	E.	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
33	coli	coli	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	comme	comme	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
35	marqueurs	marqueur	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	génomiques	génomique	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	au	au sein de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
38	sein	au sein de	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	de	au sein de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	deux	deux	NUM	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	populations	population	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	appelées	appeler	ADJ	_	_	41	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1022
# text = Ara- 1 et Ara + 1 .
1	Ara-	Ara-	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	4	mark	_	_	_	_	_
4	Ara	Ara	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
5	+	-	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	1	1	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1023
# text = Une vingtaine de clones évolués ont été isolés , dans chacune des deux populations , à différents temps d'évolution , et leur ADN génomique a été hybridé avec les 7 séquences IS présentes chez E. coli B utilisées comme sondes moléculaires .
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	vingtaine	vingtaine	NUM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	clones	clone	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	évolués	évolué	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ont	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	été	être	VPP	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	isolés	isoler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	chacune	chacun	PRQ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	des	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	deux	deux	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	populations	population	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
16	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
17	différents	différent	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	temps	temps	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	d'	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	évolution	évolution	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
23	leur	son	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
24	ADN	ADN	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	génomique	génomique	NOM	_	_	28	subj	_	_	_	_	_
26	a	avoir	VRB	_	_	27	aux	_	_	_	_	_
27	été	être	VPP	_	_	28	aux	_	_	_	_	_
28	hybridé	hybrider	VPP	_	_	8	para	_	_	_	_	_
29	avec	avec	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	les	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
31	7	7	NUM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
32	séquences	séquence	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
33	IS	IS	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	présentes	présent	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	chez	chez	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	E.	E.	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
37	coli	coli	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	B	B	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	utilisées	utiliser	VPP	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
40	comme	comme	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	sondes	sonde	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	moléculaires	moléculaire	ADJ	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1024
# text = Leurs profils d'hybridation ont été comparés à celui du clone ancêtre et des arbres phylogénétiques ont été construits .
1	Leurs	son	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	profils	profil	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	hybridation	hybridation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ont	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	été	être	VPP	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	comparés	comparer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	celui	celui	PRQ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	du	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	clone	clone	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
14	des	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	arbres	arbre	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
16	phylogénétiques	phylogénétique	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	ont	avoir	VRB	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
18	été	être	VPP	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
19	construits	construire	VPP	_	_	7	para	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1025
# text = Ceux  -ci ont permis la mise en évidence de mutations , détectées de façon précoce pendant les 2000 premières générations , période où l'augmentation de fitness est la plus forte .
1	Ceux	celui	PRQ	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	 -ci	 -ci	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	ont	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	permis	permettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	mise	mise	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	en	en	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	évidence	évidence	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	mutations	mutation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	détectées	détecter	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	façon	façon	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	précoce	précoce	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	pendant	pendant	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
17	les	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
18	2000	2000	NUM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
19	premières	premier	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	générations	génération	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	période	période	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	où	où	PRQ	_	_	28	periph	_	_	_	_	_
24	l'	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	augmentation	augmentation	NOM	_	_	28	subj	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	fitness	fine	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	est	être	VRB	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
30	plus	plus	ADV	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	forte	fort	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1026
# text = Ces mutations sont conservées chez tous les descendants dans chacune des deux populations .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutations	mutation	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	conservées	conserver	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	chez	chez	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	tous	tout	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
7	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	descendants	descendant	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
10	chacune	chacun	PRQ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	des	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	deux	deux	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	populations	population	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1027
# text = Elles mettent donc en valeur des gènes qui constituent de bons candidats pour la recherche des mutations bénéfiques et qui ont été caractérisés par la détermination des sites d'insertion des IS correspondantes .
1	Elles	elles	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	mettent	mettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	donc	donc	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	en	en	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	valeur	valeur	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	des	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	gènes	gène	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	qui	qui	PRQ	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
9	constituent	constituer	VRB	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
11	bons	bon	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	candidats	candidat	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	pour	pour	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	recherche	recherche	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	mutations	mutation	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
20	qui	qui	PRQ	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
21	ont	avoir	VRB	_	_	22	aux	_	_	_	_	_
22	été	être	VPP	_	_	23	aux	_	_	_	_	_
23	caractérisés	caractériser	VPP	_	_	9	para	_	_	_	_	_
24	par	par	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	détermination	détermination	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	des	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	sites	site	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	d'	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	insertion	insertion	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	des	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
32	IS	IS	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	correspondantes	correspondant	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1028
# text = En plus des délétions de l'opéron ribose ( voir plus haut ) , 4 autres mutations correspondant à des transpositions d'IS ont été mises en évidence .
1	En	le	CLI	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	plus	plaire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	délétions	délétion	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de+le	PRE	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
6	l'	de+le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	opéron	opéron	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	ribose	ribose	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	(	(	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	voir	voir	VNF	_	_	2	parenth	_	_	_	_	_
11	plus	plus	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	haut	haut	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	)	)	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
15	4	4	NUM	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
16	autres	autre	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	mutations	mutation	NOM	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
18	correspondant	correspondre	VPR	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	à	à	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	des	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	transpositions	transposition	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	d'	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	IS	IS	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	ont	avoir	VRB	_	_	25	aux	_	_	_	_	_
25	été	être	VPP	_	_	26	aux	_	_	_	_	_
26	mises	mettre	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
27	en	en	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	évidence	évidence	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1029
# text = Elles affectent les gènes pykF ( codant la pyruvate kinaseI ) , nadR ( codant un régulateur du métabolisme du Nicotinamide Adénine Di-nucléotide ) ( Tritz et Chandler , 1973 ) , hokB-sokB ( un locus homologue des systèmes de maintien de plasmides )
1	Elles	elles	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	affectent	affecter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	les	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	gènes	gène	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	pykF	pykF	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	(	(	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	codant	coder	VPR	_	_	4	parenth	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	pyruvate	pyruvate	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	kinaseI	kinaseI	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	)	)	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
13	nadR	nadR	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
14	(	(	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	codant	coder	VPR	_	_	13	parenth	_	_	_	_	_
16	un	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	régulateur	régulateur	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	du	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	métabolisme	métabolisme	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	du	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	Nicotinamide	Nicotinamide	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	Adénine	Adénine	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	Di-nucléotide	Di-nucléotide	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	)	)	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
25	(	(	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	Tritz	Tritz	NOM	_	_	23	para	_	_	_	_	_
27	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
28	Chandler	Chandler	NOM	_	_	26	para	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
30	1973	1973	NUM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	)	)	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
32	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
33	hokB-sokB	hokB-sokB	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
34	(	(	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
35	un	un	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	locus	locus	NOM	_	_	33	parenth	_	_	_	_	_
37	homologue	homologue	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	des	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	systèmes	système	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	de	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	maintien	maintien	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	de	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	plasmides	plasmode	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	)	)	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1030
# text = ( Pedersen et Gerdes , 1999 ) , et pbpA-rodA ( codant les protéines BP2 et RodA impliquées dans la biosynthèse de la paroi ) .
1	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	Pedersen	Pedersen	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	4	mark	_	_	_	_	_
4	Gerdes	Gerdes	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
6	1999	1999	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	pbpA-rodA	pbpA-rodA	ADV	_	_	4	para	_	_	_	_	_
11	(	(	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	codant	coder	VPR	_	_	2	parenth	_	_	_	_	_
13	les	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	protéines	protéine	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	BP2	BP2	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
17	RodA	RodA	NOM	_	_	14	para	_	_	_	_	_
18	impliquées	impliquer	VPP	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
19	dans	dans	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	biosynthèse	biosynthèse	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	paroi	paroi	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	)	)	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1031
# text = Les loci nadR
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	loci	locus	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	nadR	nadR	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1032
# text = ( Ara + 1 ) , pykF ( Ara- 1 ) et hokB-sokB ( Ara + 1 ) sont mutés par des transpositions d'IS 150 à l'intérieur des séquences codantes , aboutissant probablement à l'inactivation de ces gènes .
1	(	(	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
2	Ara	Ara	NOM	_	_	34	periph	_	_	_	_	_
3	+	+ 1	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	1	1	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	)	)	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
7	pykF	pykF	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
8	(	(	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
9	Ara-	Ara-	NOM	_	_	7	parenth	_	_	_	_	_
10	1	1	NUM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	)	)	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	hokB-sokB	hokB-sokB	NOM	_	_	7	para	_	_	_	_	_
14	(	(	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	Ara	Ara	NOM	_	_	13	parenth	_	_	_	_	_
16	+	+ 1	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	1	1	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	)	)	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
19	sont	être	VRB	_	_	20	aux	_	_	_	_	_
20	mutés	muter	VPP	_	_	34	periph	_	_	_	_	_
21	par	par	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	des	un	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	transpositions	transposition	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	d'	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	IS	IS	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	150	150	NUM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	à	à	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
28	l'	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	intérieur	intérieur	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	des	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	séquences	séquence	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	codantes	codant	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
34	aboutissant	aboutir	VPR	_	_	0	root	_	_	_	_	_
35	probablement	probablement	ADV	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	à	à	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	l'	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	inactivation	inactivation	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	de	de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	ces	ce	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	gènes	gène	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	.	.	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1033
# text = L'opéron pbpA-rodA est muté par l'insertion d'une copie d'IS 150 11 pb en amont du promoteur , provoquant une dérégulation de l'expression de ces gènes ( Philippe , 2006 ) .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	opéron	opéron	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	pbpA-rodA	pbpA-rodA	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	est	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	muté	muter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	insertion	insertion	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	une	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	copie	copie	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	IS	IS	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	150	150	NUM	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	11	11	NUM	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	pb	problème	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	en	en amont de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
18	amont	en amont de	DET	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	du	en amont de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	promoteur	promoteur	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	provoquant	provoquer	VPR	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	une	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	dérégulation	dérégulation	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	l'	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	expression	expression	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	ces	ce	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	gènes	gène	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	(	(	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
32	Philippe	Philippe	NOM	_	_	30	parenth	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
34	2006	2006	NUM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	)	)	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1034
# text = Le séquençage de ces 4 gènes dans les 12 populations à 20 000 générations a révélé un fort degré de parallélisme génétique :
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	séquençage	séquençage	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ces	ce	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	4	4	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	gènes	gène	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	dans	dans	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
9	12	12	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	populations	population	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	à	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	20	20	NUM	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	000	000	NUM	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	générations	génération	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	a	avoir	VRB	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	révélé	révéler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	un	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
18	fort	fort	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	degré	degré	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	génétique	génétique	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	:	:	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1035
# text = en effet , des mutations ont été détectées dans les gènes pykF et nadR dans toutes les populations , et dans les gènes pbpA-rodA et hokB-sokB dans la moitié des populations .
1	en	en effet	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	mutations	mutation	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
6	ont	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	été	être	VPP	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	détectées	détecter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	gènes	gène	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	pykF	pykF	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	nadR	uwSe	VPP	_	_	8	para	_	_	_	_	_
15	dans	dans	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	toutes	tout	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
17	les	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	populations	population	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
21	dans	dans	PRE	_	_	15	para	_	_	_	_	_
22	les	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	gènes	gène	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	pbpA-rodA	pbpA-rodA	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
26	hokB-sokB	uwSe	VPP	_	_	14	para	_	_	_	_	_
27	dans	dans	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	moitié	moitié	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	des	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	populations	population	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1036
# text = Ces résultats ont été comparés aux séquences obtenues pour 36 gènes choisis au hasard chez des clones évolués isolés à 20 000 générations de chacune des 12 populations d'évolution expérimentale .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	résultats	résultat	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	ont	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	comparés	comparer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	aux	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	séquences	séquence	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	obtenues	obtenir	VPP	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	pour	pour	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	36	36	NUM	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	gènes	gène	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	choisis	choisir	VPP	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	au	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	hasard	hasard	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	chez	chez	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	des	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	clones	clone	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	évolués	évolué	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	isolés	isolé	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	à	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
21	20	20	NUM	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	000	000	NUM	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	générations	génération	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	chacune	chacun	PRQ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	des	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	12	12	NUM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	populations	population	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	d'	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	évolution	évolution	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1037
# text = Seulement 6 mutations ont alors été détectées dans ces 36 gènes , et uniquement dans les populations mutatrices , présentant un taux de mutation 100 fois supérieur à celui de l'ancêtre .
1	Seulement	seulement	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	6	6	NUM	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	mutations	mutation	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
4	ont	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
5	alors	alors	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
6	été	être	VPP	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	détectées	détecter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	dans	dans	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	ces	ce	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
10	36	36	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	gènes	gène	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
14	uniquement	uniquement	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	dans	dans	PRE	_	_	8	para	_	_	_	_	_
16	les	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	populations	population	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	mutatrices	mutateur	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	présentant	présenter	VPR	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	un	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	taux	taux	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	mutation	mutation	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	100	100	NUM	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	fois	fois	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
27	supérieur	supérieur	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
28	à	à	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	celui	celui	PRQ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	l'	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1038
# text = De plus , chacune des 6 mutations n'a été observée que dans une seule population .
1	De	de plus	PRE	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	chacune	chacun	PRQ	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	6	6	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	mutations	mutation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	n'	ne	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
9	a	avoir	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	été	être	VPP	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	observée	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	que	que	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	dans	dans	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	une	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
15	seule	seul	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	population	population	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1039
# text = Le fort parallélisme génétique observé pour les 4 loci nadR , pykF , pbpA-rodA et hokB-sokB contraste donc de façon importante avec la quasi-absence de mutations mise en évidence pour le groupe de 36 gènes choisis aléatoirement .
1	Le	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	fort	fort	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
4	génétique	génétique	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	observé	observer	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	pour	pour	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	les	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
8	4	4	NUM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	loci	locus	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	nadR	nadR	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	pykF	pykF	ADV	_	_	10	para	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	pbpA-rodA	pbpA-rodA	ADV	_	_	12	para	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	hokB-sokB	hokB-sokB	ADV	_	_	14	para	_	_	_	_	_
17	contraste	contraster	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	donc	donc	ADV	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	façon	façon	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	importante	important	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	avec	avec	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	quasi-absence	quasi-	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	mutations	mutation	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	mise	mettre	VPP	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
28	en	en	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	évidence	évidence	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	pour	pour	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
31	le	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	groupe	groupe	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	36	36	NUM	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	gènes	gène	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	choisis	choisir	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	aléatoirement	aléatoirement	ADV	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1040
# text = Ceci suggère que les 4 loci sont soumis à la sélection naturelle et que les mutations correspondantes pourraient conférer un avantage sélectif au cours de l'évolution expérimentale .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	suggère	suggérer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	que	que	CSU	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	4	4	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	loci	locus	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
7	sont	être	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	soumis	soumettre	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	sélection	sélection	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	naturelle	naturel	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	que	que	CSU	_	_	3	para	_	_	_	_	_
15	les	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	mutations	mutation	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
17	correspondantes	correspondant	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
19	conférer	conférer	VNF	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	un	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	avantage	avantage	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	sélectif	sélectif	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	au	au cours de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
24	cours	au cours de	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	de	au cours de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	l'	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	évolution	évolution	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1041
# text = La seconde stratégie d'identification de mutations bénéfiques a consisté à mesurer et comparer , par rapport à celui du clone ancêtre , les profils globaux d'expression des gènes de deux clones évolués indépendants , isolés à 20 000 générations des populations Ara- 1 et Ara + 1 .
1	La	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	seconde	second	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	stratégie	stratégie	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	identification	identification	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	mutations	mutation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	a	avoir	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	consisté	consister	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	à	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	mesurer	mesurer	VNF	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	comparer	comparer	VNF	_	_	12	para	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
16	par	par rapport à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	rapport	par rapport à	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	à	par rapport à	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	celui	celui	PRQ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	du	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	clone	clone	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
24	les	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	profils	profil	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
26	globaux	global	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	d'	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	expression	expression	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	des	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	gènes	gène	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	deux	deux	NUM	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	clones	clone	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	évolués	évolué	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	indépendants	indépendant	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	,	,	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
37	isolés	isoler	VPP	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
38	à	à	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	20	20	NUM	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	000	000	NUM	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	générations	génération	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
42	des	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	populations	population	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	Ara-	Ara-	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	1	1	NUM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	et	et	COO	_	_	47	mark	_	_	_	_	_
47	Ara	Ara	NOM	_	_	41	para	_	_	_	_	_
48	+	+ 1	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
49	1	1	NUM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1042
# text = Ces analyses globales d'expression ont été réalisées par détermination des profils globaux de transcription et protéiques .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	analyses	analyse	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	globales	global	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	expression	expression	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ont	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	été	être	VPP	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	réalisées	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	par	par	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	détermination	détermination	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	des	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	profils	profil	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	globaux	global	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	transcription	transcription	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
17	protéiques	protéique	ADJ	_	_	11	para	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1043
# text = Les deux types d'analyses ont révélé un fort degré de parallélisme , car un nombre important de gènes et de protéines subissent des changements d'expression similaires , allant dans la même direction par rapport au clone ancêtre , et ce dans les deux clones évolués indépendants .
1	Les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	deux	deux	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	types	type	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	analyses	analyse	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ont	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	révélé	révéler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	un	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
9	fort	fort	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	degré	degré	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
14	car	car	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
15	un	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	nombre	nombre	NOM	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
17	important	important	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	gènes	gène	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	18	para	_	_	_	_	_
22	protéines	protéine	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	subissent	subir	VRB	_	_	7	para	_	_	_	_	_
24	des	un	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	changements	changement	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	d'	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	expression	expression	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	similaires	similaire	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
30	allant	aller	VPR	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
31	dans	dans	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	la	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
33	même	même	ADJ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
34	direction	direction	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
35	par	par rapport à	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
36	rapport	par rapport à	DET	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	au	par rapport à	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	clone	clone	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
39	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	,	,	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
41	et	et	COO	_	_	43	mark	_	_	_	_	_
42	ce	ce	PRQ	_	_	30	para	_	_	_	_	_
43	dans	dans	PRE	_	_	42	mark	_	_	_	_	_
44	les	le	DET	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
45	deux	deux	NUM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
46	clones	clone	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
47	évolués	évolué	ADJ	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	indépendants	indépendant	ADJ	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
49	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1044
# text = En effet , dans ces deux clones évolués , les profils transcriptionnels révèlent la modification parallèle de la transcription de 59 gènes , tandis que les profils protéiques montrent une modification parallèle de 38 protéines , sur 300 à 400 visualisées .
1	En	en effet	PRE	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	dans	dans	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	ces	ce	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
6	deux	deux	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	clones	clone	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	évolués	évolué	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	profils	profil	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
12	transcriptionnels	transcription	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
13	révèlent	révéler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	modification	modification	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	parallèle	parallèle	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	transcription	transcription	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	59	59	NUM	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	gènes	gène	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
24	tandis	tandis que	CSU	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	que	tandis que	CSU	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
26	les	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	profils	profil	NOM	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
28	protéiques	protéique	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	montrent	montrer	VRB	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
30	une	un	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	modification	modification	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	parallèle	parallèle	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	38	38	NUM	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	protéines	protéine	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
37	sur	sur	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
38	300	300	NUM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	à	à	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	400	400	NUM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	visualisées	visualiser	ADJ	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1045
# text = Conformément à l'hypothèse nulle selon laquelle ces différences reflèteraient des changements aléatoires pendant l'évolution ou la préparation des échantillons , il n'est pas attendu d'observer une telle correspondance au niveau de la direction des changements d'expression des gènes chez les clones évolués .
1	Conformément	conformément	ADV	_	_	27	periph	_	_	_	_	_
2	à	à	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	hypothèse	hypothèse	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	nulle	nul	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	selon	selon	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
7	laquelle	lequel	PRQ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ces	ce	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	différences	différence	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
10	reflèteraient	refléter	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
11	des	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	changements	changement	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	aléatoires	aléatoire	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	pendant	pendant	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	évolution	évolution	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	ou	ou	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	préparation	préparation	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
20	des	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	échantillons	échantillon	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
23	il	il	CLS	_	_	27	subj	_	_	_	_	_
24	n'	ne	ADV	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
25	est	être	VRB	_	_	27	aux	_	_	_	_	_
26	pas	pas	ADV	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
27	attendu	attendre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
28	d'	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	observer	observer	VNF	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	une	un	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
31	telle	tel	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
32	correspondance	correspondance	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
33	au	à	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	niveau	niveau	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	la	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	direction	direction	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	des	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	changements	changement	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	d'	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	expression	expression	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	des	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	gènes	gène	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	chez	chez	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	les	le	DET	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
46	clones	clone	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	évolués	évolué	ADJ	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	.	.	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1046
# text = Ainsi , les différences parallèles observées par ces deux approches ont sans doute une signification physiologique et sont vraisemblablement le reflet de mutations bénéfiques qui se sont produites au cours de l'évolution expérimentale .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	les	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	différences	différence	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
5	parallèles	parallèle	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	observées	observer	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	par	par	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ces	ce	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
9	deux	deux	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	approches	approche	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	ont	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	sans	sans doute	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	doute	sans doute	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	une	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	signification	signification	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
16	physiologique	physiologique	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	sont	être	VRB	_	_	11	para	_	_	_	_	_
19	vraisemblablement	vraisemblablement	ADV	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	le	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	reflet	reflet	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	mutations	mutation	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	qui	qui	PRQ	_	_	28	subj	_	_	_	_	_
26	se	se	CLI	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
27	sont	être	VRB	_	_	28	aux	_	_	_	_	_
28	produites	produire	VPP	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
29	au	au cours de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	cours	au cours de	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	de	au cours de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	l'	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	évolution	évolution	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1047
# text = Une analyse plus détaillée des gènes dont l'expression est modifiée de façon parallèle a révélé que la moitié sont connus pour être régulés par ( p ) ppGpp , l'effecteur de la réponse stringente , un réseau de régulation permettant l'adaptation des bactéries à des conditions de carences nutritionnelles .
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	analyse	analyse	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
3	plus	plus	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	détaillée	détaillé	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	gènes	gène	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	dont	dont	PRQ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	expression	expression	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
10	est	être	VRB	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	modifiée	modifier	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
13	façon	façon	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	parallèle	parallèle	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	a	avoir	VRB	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	révélé	révéler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	que	que	CSU	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	moitié	moitié	NOM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
20	sont	être	VRB	_	_	21	aux	_	_	_	_	_
21	connus	connaître	VPP	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
22	pour	pour	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	être	être	VNF	_	_	24	aux	_	_	_	_	_
24	régulés	réguler	VPP	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	par	par	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
26	(	(	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
27	p	p	ADV	_	_	29	periph	_	_	_	_	_
28	)	)	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
29	ppGpp	ppGpp	VNF	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
31	l'	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	effecteur	effecteur	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	la	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	réponse	réponse	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	stringente	astringent	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	,	,	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
38	un	un	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	réseau	réseau	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
40	de	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	régulation	régulation	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	permettant	permettre	VPR	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
43	l'	le	DET	_	_	44	spe	_	_	_	_	_
44	adaptation	adaptation	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	des	de	PRE	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	bactéries	bactérie	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	à	à	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	des	un	DET	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
49	conditions	condition	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	de	de	PRE	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	carences	carence	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	nutritionnelles	nutritionnel	ADJ	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1048
# text = Le séquençage des gènes impliqués directement dans le métabolisme de ( p ) ppGpp , relA et spoT , a révélé des mutations dans le gène spoT dans 8 des 12 populations , démontrant une fois de plus une évolution génétique parallèle .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	séquençage	séquençage	NOM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	gènes	gène	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	impliqués	impliquer	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	directement	directement	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	dans	dans	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	métabolisme	métabolisme	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	(	(	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	p	p	ADJ	_	_	14	parenth	_	_	_	_	_
13	)	)	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
14	ppGpp	ppGpp	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
16	relA	relA	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	spoT	spot	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
20	a	avoir	VRB	_	_	21	aux	_	_	_	_	_
21	révélé	révéler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	des	un	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	mutations	mutation	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	dans	dans	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	le	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	gène	gène	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	spoT	spoT	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	dans	dans	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
29	8	8	NUM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	des	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	12	12	NUM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
32	populations	population	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
34	démontrant	démontrer	VPR	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	une	un	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	fois	fois	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	de	de plus	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
38	plus	de plus	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	une	un	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	évolution	évolution	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
41	génétique	génétique	ADJ	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	parallèle	parallèle	ADJ	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	.	.	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1049
# text = L'effet sur le fitness apporté par la mutation spoT a été mesuré par des expériences de compétitions entre la souche ancêtre dans laquelle une des mutations a été introduite et la souche ancêtre de départ .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	effet	effet	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
3	sur	sur	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	fitness	fin	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	apporté	apporter	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	mutation	mutation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	spoT	spoT	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	a	avoir	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	été	être	VPP	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	mesuré	mesurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	par	par	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	des	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	expériences	expérience	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	compétitions	compétition	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	entre	entre	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	souche	souche	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	dans	dans	PRE	_	_	30	periph	_	_	_	_	_
24	laquelle	lequel	PRQ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	une	un	PRQ	_	_	30	subj	_	_	_	_	_
26	des	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	mutations	mutation	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	a	avoir	VRB	_	_	29	aux	_	_	_	_	_
29	été	être	VPP	_	_	30	aux	_	_	_	_	_
30	introduite	introduire	VPP	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
31	et	et	COO	_	_	33	mark	_	_	_	_	_
32	la	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	souche	souche	NOM	_	_	21	para	_	_	_	_	_
34	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	départ	départ	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1050
# text = Cette mutation apporte un avantage considérable , d'environ 10 % .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	mutation	mutation	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	apporte	apporter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	un	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	avantage	avantage	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	considérable	considérable	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
8	d'	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	environ	environ	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
10	10	10	NUM	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	%	pourcent	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1051
# text = Un autre point commun révélé par la comparaison des profils transcriptionnels et protéiques consiste en une forte diminution de l'expression des gènes impliqués dans l'utilisation du maltose dans les deux populations analysées .
1	Un	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	autre	autre	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	point	point	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
4	commun	commun	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	révélé	révéler	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	comparaison	comparaison	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	des	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	profils	profil	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	transcriptionnels	transcription	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	protéiques	protéique	ADJ	_	_	3	para	_	_	_	_	_
14	consiste	consister	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	en	en	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	une	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
17	forte	fort	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	diminution	diminution	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	expression	expression	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	des	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	gènes	gène	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	impliqués	impliquer	VPP	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	dans	dans	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	l'	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	utilisation	utilisation	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	du	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	maltose	maltose	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	dans	dans	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
31	les	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
32	deux	deux	NUM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
33	populations	population	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
34	analysées	analyser	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1052
# text = Le séquençage du gène malT , codant l'activateur transcriptionnel de ces gènes , a révélé la présence de mutations dans 8 des 12 populations , induisant ainsi la diminution parallèle de la capacité à utiliser le maltose dans la majorité des populations .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	séquençage	séquençage	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
3	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	gène	gène	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	malT	malT	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
7	codant	coder	VPR	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	activateur	activateur	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	transcriptionnel	transcription	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	ces	ce	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	gènes	gène	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
15	a	avoir	VRB	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	révélé	révéler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	présence	présence	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	mutations	mutation	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	dans	dans	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
22	8	8	NUM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	des	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	12	12	NUM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	populations	population	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
27	induisant	induire	VPR	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
28	ainsi	ainsi	ADV	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	diminution	diminution	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
31	parallèle	parallèle	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	la	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	capacité	capacité	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	à	à	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	utiliser	utiliser	VNF	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	le	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	maltose	maltose	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	dans	dans	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
40	la	le	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	majorité	majorité	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	des	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	populations	population	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1053
# text = Des expériences de compétitions entre souches ancêtres isogéniques , excepté pour les mutations du gène malT , ont démontré leur effet positif sur le fitness d'environ 1 , 5 % .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	expériences	expérience	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	compétitions	compétition	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	entre	entre	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	souches	souche	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ancêtres	ancêtre	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	isogéniques	isogénique	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
10	excepté	excepter	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
11	pour	pour	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	mutations	mutation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	du	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	gène	gène	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	malT	malT	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
18	ont	avoir	VRB	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
19	démontré	démontrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	leur	son	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	effet	effet	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	positif	positif	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	sur	sur	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	le	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	fitness	fine	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	d'	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	environ	environ	ADV	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
28	1	1	NUM	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
29	,	1 , 5	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
30	5	5	NUM	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	%	pourcent	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1054
# text = Seuls 3 types de mutations ont été démontrés comme apportant un bénéfice dans ces conditions d'évolution expérimentale chez E. coli .
1	Seuls	seul	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	3	3	NUM	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	types	type	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	mutations	mutation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ont	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	été	être	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	démontrés	démontrer	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	comme	comme	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	apportant	apporter	VPR	_	_	8	para	_	_	_	_	_
11	un	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	bénéfice	bénéfice	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	dans	dans	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	ces	ce	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	conditions	condition	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	d'	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	évolution	évolution	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	chez	chez	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	E.	E.	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	coli	coli	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1055
# text = Elles affectent les gènes suivant :
1	Elles	elles	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	affectent	affecter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	les	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	gènes	gène	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	suivant	suivre	VPR	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	:	:	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1056
# text = rbs ( avantage de 2 % ) , spoT ( avantage de 10 % ) , et malT ( avantage de 1 , 5 % ) .
1	rbs	ru	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	(	(	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	avantage	avantage	NOM	_	_	1	parenth	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	2	2	NUM	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	%	pourcent	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
9	spoT	spot	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
10	(	(	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	avantage	avantage	NOM	_	_	9	parenth	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	10	10	NUM	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	%	pourcent	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	)	)	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	malT	malt	NOM	_	_	9	para	_	_	_	_	_
19	(	(	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	avantage	avantage	NOM	_	_	18	parenth	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	1	1	NUM	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
23	,	1 , 5	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
24	5	5	NUM	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	%	pourcent	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
26	)	)	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1057
# text = Si ces mutations ont un effet additif sur le fitness , le bénéfice total apporté n'est que de 13 à 14 % , ce qui est très éloigné de la valeur de fitness de 70 % en moyenne mesurée dans les clones évolués à 20 000 générations dans les 12 populations ( Cooper et Lenski , 2000 ) .
1	Si	si	CSU	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
2	ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	mutations	mutation	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	ont	avoir	VRB	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	un	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	effet	effet	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	additif	additif	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	sur	sur	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	le	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	fitness	fine	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
12	le	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	bénéfice	bénéfice	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
14	total	total	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	apporté	apporter	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	n'	ne	ADV	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	est	être	VRB	_	_	23	det	_	_	_	_	_
18	que	que	ADV	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	13	13	NUM	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
21	à	à	PRE	_	_	19	para	_	_	_	_	_
22	14	14	NUM	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	%	pourcent	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	ce	ce	PRQ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
26	qui	qui	PRQ	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
27	est	être	VRB	_	_	29	aux	_	_	_	_	_
28	très	très	ADV	_	_	29	periph	_	_	_	_	_
29	éloigné	éloigner	VPP	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	la	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	valeur	valeur	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	fitness	fine	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
36	70	70	NUM	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	%	pourcent	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	en	en moyenne	PRE	_	_	40	periph	_	_	_	_	_
39	moyenne	en moyenne	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	mesurée	mesurer	VPP	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
41	dans	dans	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	les	le	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	clones	clone	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	évolués	évolué	ADJ	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	à	à	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	20	20	NUM	_	_	47	spe	_	_	_	_	_
47	000	000	NUM	_	_	48	spe	_	_	_	_	_
48	générations	génération	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
49	dans	dans	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
50	les	le	DET	_	_	52	spe	_	_	_	_	_
51	12	12	NUM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
52	populations	population	NOM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
53	(	(	PUNC	_	_	54	punc	_	_	_	_	_
54	Cooper	Cooper	NOM	_	_	52	parenth	_	_	_	_	_
55	et	et	COO	_	_	56	mark	_	_	_	_	_
56	Lenski	Lenski	NOM	_	_	54	para	_	_	_	_	_
57	,	,	PUNC	_	_	58	punc	_	_	_	_	_
58	2000	2000	NUM	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
59	)	)	PUNC	_	_	54	punc	_	_	_	_	_
60	.	.	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1058
# text = De même , les clones évolués isolés à 2000 générations , après la période de forte augmentation du fitness ( Lenski et Travisano , 1994 ) , présentent en moyenne un fitness accru de 20 à 25 % .
1	De	de même	PRE	_	_	28	periph	_	_	_	_	_
2	même	de même	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	clones	clone	NOM	_	_	28	subj	_	_	_	_	_
6	évolués	évolué	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	isolés	isolé	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	2000	2000	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	générations	génération	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
12	après	après	PRE	_	_	28	periph	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	période	période	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	forte	fort	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	augmentation	augmentation	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	du	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	fitness	fine	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	(	(	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	Lenski	Lenski	NOM	_	_	19	parenth	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	Travisano	Travisano	NOM	_	_	21	para	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
25	1994	1994	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	)	)	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
28	présentent	présenter	VRB	_	_	38	det	_	_	_	_	_
29	en	en	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	moyenne	moyenne	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	un	un	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	fitness	fin	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
33	accru	accroître	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	20	20	NUM	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
36	à	à	PRE	_	_	34	para	_	_	_	_	_
37	25	25	NUM	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	%	pourcent	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1059
# text = Ainsi , de nombreuses mutations bénéfiques sont encore inconnues , et certaines d'entre elles pourraient avoir un effet important sur le fitness .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	de	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
4	nombreuses	nombreux	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	mutations	mutation	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
6	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	encore	encore	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	inconnues	inconnu	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
12	certaines	certains	PRQ	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
13	d'	d'entre	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	entre	d'entre	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	elles	lui	PRQ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	7	para	_	_	_	_	_
17	avoir	avoir	VNF	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	un	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	effet	effet	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	important	important	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	sur	sur	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	le	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	fitness	fine	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1060
# text = L'objectif de ma thèse entre dans le cadre de la thématique générale de l'équipe « Dynamique et Evolution des Génomes Microbiens » , qui est de comprendre les mécanismes écologiques et moléculaires de l'adaptation des bactéries à leur environnement .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	objectif	objectif	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ma	son	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	thèse	thèse	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	entre	entrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	dans	dans	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	cadre	cadre	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	thématique	thématique	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	générale	général	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	équipe	équipe	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	«	«	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	Dynamique	Dynamique	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
20	Evolution	Evolution	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
21	des	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	Génomes	Génomes	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	Microbiens	Microbiens	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	»	»	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
26	qui	qui	PRQ	_	_	27	subj	_	_	_	_	_
27	est	être	VRB	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	comprendre	comprendre	VNF	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	les	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	mécanismes	mécanisme	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	écologiques	écologique	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	et	et	COO	_	_	34	mark	_	_	_	_	_
34	moléculaires	moléculaire	ADJ	_	_	32	para	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
36	l'	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	adaptation	adaptation	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	des	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	bactéries	bactérie	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	à	à	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	leur	son	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	environnement	environnement	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1061
# text = En particulier , la recherche de mutations bénéfiques , responsables de l'augmentation du fitness au cours de l'évolution expérimentale chez E. coli , en est le point d'orgue .
1	En	en particulier	PRE	_	_	27	periph	_	_	_	_	_
2	particulier	en particulier	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	recherche	recherche	NOM	_	_	27	periph	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	mutations	mutation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
10	responsables	responsable	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	augmentation	augmentation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	du	de+le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	fitness	fine	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
16	au	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
17	cours	cours	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	évolution	évolution	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	chez	chez	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	E.	E.	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	coli	coli	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
26	en	le	CLI	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
27	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
28	le	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	point	point	NOM	_	_	27	subj	_	_	_	_	_
30	d'	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	orgue	orgue	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1062
# text = Je me suis particulièrement intéressée à l'importance de la superhélicité de l'ADN dans les processus adaptatifs , les 12 populations ayant été adaptées à des transitions nutritionnelles pendant plus de 40 000 générations .
1	Je	je	CLS	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
2	me	me	CLI	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
3	suis	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
4	particulièrement	particulièrement	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	intéressée	intéresser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	à	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	importance	importance	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	ADN	ADN	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	dans	dans	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
16	les	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	processus	processus	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	adaptatifs	adaptatif	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
20	les	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
21	12	12	NUM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	populations	population	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
23	ayant	avoir	VPR	_	_	24	aux	_	_	_	_	_
24	été	être	VPP	_	_	25	aux	_	_	_	_	_
25	adaptées	adapter	VPP	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	à	à	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	des	un	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	transitions	transition	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	nutritionnelles	nutritionnel	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	pendant	pendant	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
31	plus	plus	ADV	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	40	40	NUM	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	000	000	NUM	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	générations	génération	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1063
# text = Ces conditions sont en effet connues pour affecter le degré de superhélicité de l'ADN .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	conditions	condition	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
4	en	en effet	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	effet	en effet	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	connues	connaître	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	pour	pour	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	affecter	affecter	VNF	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	le	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	degré	degré	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	ADN	ADN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1064
# text = Cette étude permettra notamment de répondre aux questions suivantes :
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	étude	étude	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	permettra	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	notamment	notamment	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	répondre	répondre	VNF	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	aux	à	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	questions	question	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	suivantes	suivant	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	:	:	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1065
# text = la superhélicité peut -elle représenter une cible de la sélection naturelle , c'est-à-dire être impliquée dans les processus évolutifs et adaptatifs  ?
1	la	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	peut	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	-elle	-elle	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
5	représenter	représenter	VNF	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	cible	cible	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	sélection	sélection	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	naturelle	naturel	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
13	c'	c'est-à-dire	COO	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	est-à-dire	c'est-à-dire	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
15	être	être	VNF	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	impliquée	impliquer	VPP	_	_	5	para	_	_	_	_	_
17	dans	dans	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	les	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	processus	processus	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	évolutifs	évolutif	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	adaptatifs	adaptatif	ADJ	_	_	20	para	_	_	_	_	_
23	 ?	?	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1066
# text = Par quels types de modifications génétiques ?
1	Par	par	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	quels	quel	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	types	type	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	modifications	modification	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	génétiques	génétique	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	?	?	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1067
# text = Un parallélisme phénotypique et génétique est -il sous-jacent à des changements éventuels de superhélicité de l'ADN ?
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	phénotypique	phénotypique	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	génétique	génétique	ADJ	_	_	3	para	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	-il	-il	CLS	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
8	sous-jacent	sous-jacent	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	des	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	changements	changement	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	éventuels	éventuel	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	ADN	ADN	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	?	?	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1068
# text = Quels sont les mécanismes impliqués ?
1	Quels	quel?	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	les	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	mécanismes	mécanisme	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
5	impliqués	impliquer	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	?	?	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1069
# text = Résultats
1	Résultats	résultat	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1070
# text = Les résultats de ce travail sont exposés ici en trois parties .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	résultats	résultat	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ce	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	travail	travail	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	sont	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	exposés	exposer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	ici	ici	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	en	en	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	trois	trois	NUM	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	parties	partie	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1071
# text = Dans la première partie , nous avons montré que la superhélicité de l'ADN était la cible de la sélection naturelle au cours de l'évolution expérimentale .
1	Dans	dans	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	première	premier	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	partie	partie	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	nous	nous	CLS	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
7	avons	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	montré	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	que	que	CSU	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	ADN	ADN	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	était	être	VRB	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	cible	cible	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	sélection	sélection	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	naturelle	naturel	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	au	à	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	cours	cours	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	l'	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	évolution	évolution	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1072
# text = Des modifications parallèles de superhélicité ont ainsi été mises en évidence dans la majorité des 12 populations , et une population modèle , Ara- 1 , a été étudiée plus en détails .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	modifications	modification	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	parallèles	parallèle	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ont	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
7	ainsi	ainsi	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
8	été	être	VPP	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	mises	mettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	en	en	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	évidence	évidence	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	dans	dans	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	majorité	majorité	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	des	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	12	12	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	populations	population	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
20	une	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	population	population	NOM	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
22	modèle	modèle	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
24	Ara-	Ara-	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	1	1	NUM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
27	a	avoir	VRB	_	_	28	aux	_	_	_	_	_
28	été	être	VPP	_	_	29	aux	_	_	_	_	_
29	étudiée	étudier	VPP	_	_	9	para	_	_	_	_	_
30	plus	plus	ADV	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	en	en	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	détails	détail	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1073
# text = La seconde partie porte sur le prolongement de cette étude aux 11 autres populations et montre que le parallélisme phénotypique observé au niveau de la superhélicité de l'ADN a une base génétique .
1	La	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	seconde	second	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	partie	partie	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	porte	porter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	sur	sur	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	le	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	prolongement	prolongement	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	cette	ce	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	étude	étude	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	aux	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	11	11	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
13	autres	autre	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	populations	population	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	montre	montrer	VRB	_	_	4	para	_	_	_	_	_
17	que	que	CSU	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	le	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	30	subj	_	_	_	_	_
20	phénotypique	phénotypique	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	observé	observer	VPP	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	au	à	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	niveau	niveau	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	l'	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	ADN	ADN	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	a	avoir	VRB	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
31	une	un	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	base	base	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	génétique	génétique	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1074
# text = Enfin , la dernière partie détaille et caractérise au niveau moléculaire une des cibles de la sélection naturelle , le gène fis .
1	Enfin	enfin	ADV	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
4	dernière	dernier	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	partie	partie	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	détaille	détailler	VRB	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	caractérise	caractériser	VRB	_	_	6	para	_	_	_	_	_
9	au	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	niveau	niveau	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	moléculaire	moléculaire	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	une	un	PRQ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
13	des	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	cibles	cible	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de+le	PRE	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
16	la	de+le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	sélection	sélection	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	naturelle	naturel	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
20	le	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	gène	gène	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
22	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1075
# text = Toutes les souches utilisées au cours de ce travail sont résumées dans le Tableau 1 .
1	Toutes	tout	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	souches	souche	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
4	utilisées	utiliser	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	au	au cours de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	cours	au cours de	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	au cours de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ce	ce	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	travail	travail	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	sont	être	VRB	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	résumées	résumer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	dans	dans	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	le	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	Tableau	Tableau	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	1	1	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1076
# text = La nomenclature utilisée pour certaines souches a été modifiée entre la partie I des résultats et les parties II et III .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	nomenclature	nomenclature	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	utilisée	utiliser	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	pour	pour	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	certaines	certain	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	souches	souche	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	a	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	été	être	VPP	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	modifiée	modifier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	entre	entre	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	partie	partie	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	I	I	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	des	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	résultats	résultat	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
17	les	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	parties	partie	NOM	_	_	15	para	_	_	_	_	_
19	II	II	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
21	III	III	NOM	_	_	18	para	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1077
# text = Les correspondances sont données dans le Tableau 1 .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	correspondances	correspondance	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	données	donner	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	le	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	Tableau	Tableau	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	1	1	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1078
# text = Ces différences sont dues au fait que seule la population Ara- 1 ait été étudiée dans un premier temps et ces résultats ont été publiés ( Crozat et al. , 2005 ) .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	différences	différence	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	dues	devoir	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	au	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	fait	fait	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	que	que	CSU	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	seule	seul	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	population	population	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
11	Ara-	Ara-	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	1	1	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	ait	avoir	VRB	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	été	être	VPP	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
15	étudiée	étudier	VPP	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
16	dans	dans	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	un	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
18	premier	premier	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	temps	temps	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
21	ces	ce	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	résultats	résultat	NOM	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
23	ont	avoir	VRB	_	_	24	aux	_	_	_	_	_
24	été	être	VPP	_	_	25	aux	_	_	_	_	_
25	publiés	publier	VPP	_	_	4	para	_	_	_	_	_
26	(	(	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
27	Crozat	Crozat	NOM	_	_	25	parenth	_	_	_	_	_
28	et	et	COO	_	_	31	mark	_	_	_	_	_
29	al.	al.	ADV	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
31	2005	2005	NUM	_	_	27	para	_	_	_	_	_
32	)	)	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1079
# text = Ils ont ensuite été étendus aux autres populations , ce qui a nécessité une modification de nomenclature .
1	Ils	ils	CLS	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
2	ont	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
3	ensuite	ensuite	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
4	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	étendus	étendre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	aux	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	autres	autre	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	populations	population	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	ce	ce	PRQ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	qui	qui	PRQ	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
12	a	avoir	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	nécessité	nécessiter	VPP	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	une	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	modification	modification	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	nomenclature	nomenclature	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1080
# text = Résultats Partie I La Topologie de l'ADN comme Cible de la Sélection Naturelle
1	Résultats	résultat	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Partie	Partie	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	I	I	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	La	La	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	Topologie	Topologie	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	ADN	ADN	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	comme	comme	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	Cible	Cible	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	Sélection	Sélection	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	Naturelle	Naturelle	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1081
# text = Cette partie a fait l'objet de la publication ci-jointe intitulée « Long-term Experimental
1	Cette	cette	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	partie	partir	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	a	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	fait	faire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	objet	objet	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	publication	publication	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	ci-jointe	ci-joint	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	intitulée	intituler	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	«	«	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Long-term	Long-term	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	Experimental	Experimental	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1082
# text = Evolution in Escherichia coli .
1	Evolution	évolution	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	in	in	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Escherichia	Escherichia	_	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	coli	coli	_	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1083
# text = XII . DNA Topology as a Key Target of
1	XII	xii	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	DNA	DNA	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
4	Topology	Topology	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	as	dna topology as a key target of	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
6	a	dna topology as a key target of	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
7	Key	Key	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
8	Target	Target	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	of	dna topology as a key target of	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1084
# text = Selection » ( E. Crozat , N. Phlippe , J. Geiselman and D. Schneider , Genetics , 2005 , 169 : 523 - 532 ) .
1	Selection	sélection	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	»	»	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	(	(	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
4	E.	E.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	Crozat	Crozat	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
7	N.	N.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	Phlippe	Phlippe	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
10	J.	J.	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
11	Geiselman	Geiselman	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
12	and	j. geiselman and d. schneider	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
13	D.	D.	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	Schneider	Schneider	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
16	Genetics	Genetics	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
18	2005	2005	NUM	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
19	,	2005 , 169	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
20	169	169	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
21	:	:	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	523	523	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	-	523 - 532	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
24	532	532	NUM	_	_	22	parenth	_	_	_	_	_
25	)	)	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1085
# text = Tous les jours depuis 1988 , les cultures des douze populations sont diluées dans du milieu frais , après 24h d'incubation à 37 °C. Elles sont alors soumises à une phase de latence , suivie d'une période de croissance active qui est stoppée lorsque les nutriments s'épuisent .
1	Tous	tout	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	jours	jour	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
4	depuis	depuis	PRE	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
5	1988	1988	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
7	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	cultures	culture	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
9	des	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	douze	douze	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	populations	population	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	sont	être	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	diluées	diluer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	dans	dans	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	du	de+le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	milieu	milieu	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	frais	frais	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
19	après	après	ADV	_	_	29	periph	_	_	_	_	_
20	24h	24h	NUM	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
21	d'	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	incubation	incubation	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	à	à	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	37	37	NUM	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	°C.	°C.	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	Elles	Elles	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	sont	être	VRB	_	_	29	aux	_	_	_	_	_
28	alors	alors	ADV	_	_	29	periph	_	_	_	_	_
29	soumises	soumettre	VPP	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
30	à	à	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	une	un	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	phase	phase	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	latence	latence	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	,	,	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
36	suivie	suivre	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
37	d'	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	une	un	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	période	période	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	de	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	croissance	croissance	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	active	actif	ADJ	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	qui	qui	PRQ	_	_	45	subj	_	_	_	_	_
44	est	être	VRB	_	_	45	aux	_	_	_	_	_
45	stoppée	stopper	VPP	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
46	lorsque	lorsque	CSU	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	les	le	DET	_	_	48	spe	_	_	_	_	_
48	nutriments	nutriment	NOM	_	_	50	subj	_	_	_	_	_
49	s'	s'	CLI	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
50	épuisent	épuiser	VRB	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
51	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1086
# text = Les cellules entrent alors en phase stationnaire jusqu'au lendemain , où la dilution dans du milieu frais les place à nouveau dans des conditions favorables à leur croissance .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	cellules	cellule	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	entrent	entrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	alors	alors	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	en	en	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	phase	phase	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	jusqu'au	jusqu'à	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
9	lendemain	lendemain	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
11	où	où	PRQ	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	dilution	dilution	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
14	dans	dans	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	du	de+le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	milieu	milieu	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	frais	frais	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	les	le	CLI	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	place	placer	VRB	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
20	à	à nouveau	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	nouveau	à nouveau	ADV	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	dans	dans	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	des	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	conditions	condition	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	favorables	favorable	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	à	à	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	leur	son	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	croissance	croissance	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1087
# text = Ces transitions croissance-carence et carence-croissance sont connues pour affecter la superhélicité de l'ADN .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	transitions	transition	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	croissance-carence	croissance-carence	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	carence-croissance	carence-croissance	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
6	sont	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	connues	connaître	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	pour	pour	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	affecter	affecter	VNF	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	ADN	ADN	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1088
# text = Des modifications de topologie de l'ADN sont par ailleurs connues pour modifier la transcription globale des gènes .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	modifications	modification	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	topologie	topologie	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ADN	ADN	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	sont	être	VRB	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
9	par	par ailleurs	PRE	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
10	ailleurs	par ailleurs	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	connues	connaître	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	pour	pour	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	modifier	modifier	VNF	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	transcription	transcription	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	globale	global	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	gènes	gène	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1089
# text = Ceci pourrait ainsi permettre aux bactéries d'adapter rapidement l'expression de leurs gènes aux conditions de croissance , notamment lors des transitions nutritionnelles .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	ainsi	ainsi	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	permettre	permettre	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	aux	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	bactéries	bactérie	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	adapter	adapter	VNF	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	rapidement	rapidement	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	expression	expression	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	leurs	son	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	gènes	gène	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	aux	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	conditions	condition	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	croissance	croissance	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
20	notamment	notamment	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
21	lors	lors de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
22	des	lors de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	transitions	transition	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	nutritionnelles	nutritionnel	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1090
# text = La superhélicité de l'ADN a été mesurée au sein des 12 populations au cours de l'évolution .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	a	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	été	être	VPP	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	mesurée	mesurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	au	au sein de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	sein	au sein de	DET	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	des	au sein de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	12	12	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	populations	population	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	au	au cours de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	cours	au cours de	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	au cours de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	évolution	évolution	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1091
# text = Ces mesures ont été réalisées en utilisant un plasmide rapporteur , ici pUC 18 , dont le niveau de superhélicité reflète qualitativement celui du chromosome .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mesures	mesure	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	ont	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	réalisées	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	utilisant	utiliser	VPR	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	un	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	plasmide	plasmode	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	rapporteur	rapporteur	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
12	ici	ici	ADV	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
13	pUC	pUC	VPR	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	18	18	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
16	dont	dont	PRQ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
17	le	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	niveau	niveau	NOM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	reflète	refléter	VRB	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
22	qualitativement	qualitativement	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	celui	celui	PRQ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	du	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	chromosome	chromosome	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1092
# text = Ce plasmide rapporteur a été introduit dans 3 clones évolués isolés à 2000 , 10 000 et 20 000 générations de chacune des 12 populations , ainsi que dans le clone ancêtre .
1	Ce	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	plasmide	plasmode	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	rapporteur	rapporteur	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	a	avoir	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	été	être	VPP	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	introduit	introduire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	dans	dans	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	3	3	NUM	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	clones	clone	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	évolués	évolué	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	isolés	isolé	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
13	2000	2000	NUM	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
14	,	2000 , 10 000	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
15	10	10	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	000	000	NUM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
18	20	20	NUM	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	000	000	NUM	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	générations	génération	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	chacune	chacun	PRQ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	des	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	12	12	NUM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	populations	population	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
27	ainsi	ainsi que	COO	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	que	ainsi que	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
29	dans	dans	PRE	_	_	21	para	_	_	_	_	_
30	le	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	clone	clone	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1093
# text = La distribution des topoisomères plasmidiques de tous les clones évolués a été comparée à celle du clone ancêtre par électrophorèse sur gels d'agarose contenant de la chloroquine .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	distribution	distribution	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	topoisomères	topo	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	plasmidiques	plasmidique	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	tous	tout	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	clones	clone	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	évolués	évolué	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	a	avoir	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	été	être	VPP	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	comparée	comparer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	celle	celui	PRQ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	du	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	clone	clone	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	par	par	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
20	électrophorèse	électrophorèse	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	sur	sur	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	gels	gel	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	d'	de	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	agarose	de	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	contenant	contenir	VPR	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	de	de+le	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	la	de+le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	chloroquine	chlore	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1094
# text = Cette molécule s'intercale dans l'ADN et permet de visualiser les différents topoisomères d'un plasmide .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	molécule	molécule	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	s'	s'	CLI	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	intercale	intercaler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ADN	ADN	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	permet	permettre	VRB	_	_	4	para	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	visualiser	visualiser	VNF	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	différents	différent	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	topoisomères	topo	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	d'	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	un	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	plasmide	plasmode	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1095
# text = Les clones évolués de 10 populations sur 12 présentent une augmentation de superhélicité du chromosome à 20 000 générations par rapport à l'ancêtre .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	clones	clone	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	évolués	évolué	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	10	10	NUM	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	populations	population	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	sur	sur	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	12	12	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	présentent	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	une	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	augmentation	augmentation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	du	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	chromosome	chromosome	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	à	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	20	20	NUM	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	000	000	NUM	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	générations	génération	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	par	par rapport à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
21	rapport	par rapport à	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	à	par rapport à	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	l'	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1096
# text = Parmi ces populations , 9 présentent des modifications importantes au cours des
1	Parmi	parmi	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	populations	population	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	9	9	NUM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	présentent	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	des	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	modifications	modification	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	importantes	important	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	au	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	cours	cours	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	des	de+le	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1097
# text = 2000 premières générations d'évolution , période d'amélioration rapide du fitness ( Lenski et Travisano , 1994 ; Cooper et Lenski , 2000 ) .
1	2000	2000	NUM	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	premières	premier	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	générations	génération	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	évolution	évolution	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
7	période	période	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	d'	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	amélioration	amélioration	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	rapide	rapide	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	du	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	fitness	fine	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	(	(	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
14	Lenski	Lenski	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	Travisano	Travisano	NOM	_	_	14	para	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
18	1994	1994	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	;	;	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	Cooper	Cooper	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	Lenski	Lenski	NOM	_	_	20	para	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	2000	2000	NUM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
25	)	)	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1098
# text = L'augmentation de superhélicité de l'ADN est donc une modification phénotypique supplémentaire observée de façon parallèle dans la majorité des populations au cours de l'évolution ( voir Introduction Partie II ) .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	augmentation	augmentation	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ADN	ADN	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	donc	donc	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	une	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	modification	modification	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	phénotypique	phénotypique	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	supplémentaire	supplémentaire	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	observée	observer	VPP	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	façon	façon	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	parallèle	parallèle	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	dans	dans	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	majorité	majorité	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	des	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	populations	population	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	au	au cours de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
24	cours	au cours de	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	de	au cours de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	l'	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	évolution	évolution	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	(	(	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	voir	voir	VNF	_	_	14	parenth	_	_	_	_	_
30	Introduction	Introduction	NOM	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
31	Partie	Partie	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	II	II	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	)	)	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1099
# text = Les changements phénotypiques apparaissant de façon parallèle au sein de lignées indépendantes suggèrent une évolution adaptative .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	changements	changement	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
3	phénotypiques	phénotypique	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	apparaissant	apparaître	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	façon	façon	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	parallèle	parallèle	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	au	au sein de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	sein	au sein de	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	au sein de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	lignées	lignée	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	indépendantes	indépendant	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	suggèrent	suggérer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	une	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	évolution	évolution	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	adaptative	adaptatif	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1100
# text = L'accroissement du niveau de superhélicité de l'ADN observé dans la majorité des populations dès 2000 générations , pendant la période de forte augmentation de fitness , pourrait donc être impliqué dans l'adaptation des bactéries aux conditions de l'évolution expérimentale .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	accroissement	accroissement	NOM	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
3	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	niveau	niveau	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	ADN	ADN	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	observé	observer	VPP	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	dans	dans	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	majorité	majorité	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	des	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	populations	population	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	dès	dès	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
17	2000	2000	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	générations	génération	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
20	pendant	pendant	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	période	période	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	forte	fort	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	augmentation	augmentation	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	fitness	fine	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
29	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
30	donc	donc	ADV	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	être	être	VNF	_	_	32	aux	_	_	_	_	_
32	impliqué	impliquer	VPP	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
33	dans	dans	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	l'	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	adaptation	adaptation	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	des	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	bactéries	bactérie	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	aux	à	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	conditions	condition	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	de	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	l'	le	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	évolution	évolution	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	.	.	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1101
# text = Les mutations susceptibles d'être à l'origine de cet accroissement de superhélicité ont été recherchées dans la population modèle Ara- 1 , utilisée dans la plupart des autres études génétiques réalisées .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutations	mutation	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
3	susceptibles	susceptible	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	être	être	VNF	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	à	à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	origine	origine	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	cet	ce	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	accroissement	accroissement	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	ont	avoir	VRB	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
15	été	être	VPP	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	recherchées	rechercher	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	dans	dans	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	population	population	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	modèle	modèle	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	Ara-	Ara-	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	1	1	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	utilisée	utiliser	VPP	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
25	dans	dans	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	la	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	plupart	plupart	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	des	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	autres	autre	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	études	étude	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	génétiques	génétique	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	réalisées	réaliser	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1102
# text = Cette population présente deux augmentations successives de superhélicité , l'une intervenant avant 2000 générations , l'autre après 10 000 générations .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	population	population	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	présente	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	deux	deux	NUM	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	augmentations	augmentation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	successives	successif	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
10	l'	l'un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	une	l'un	PRQ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	intervenant	intervenir	VPR	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	avant	avant	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	2000	2000	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	générations	génération	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	autre	autre	PRQ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
19	après	après	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
20	10	10	NUM	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	000	000	NUM	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	générations	génération	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1103
# text = Ceci suggère l'implication d'au moins deux mutations , qui , après séquençage des gènes connus pour être impliqués dans la topologie de l'ADN , ont effectivement été mises en évidence dans deux de ces gènes .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	suggère	suggérer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	implication	implication	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	d'	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	au	à+le	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	moins	au moins	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
8	deux	deux	NUM	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	mutations	mutation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
11	qui	qui	PRQ	_	_	31	subj	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
13	après	après	PRE	_	_	31	periph	_	_	_	_	_
14	séquençage	séquençage	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	des	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	gènes	gène	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	connus	connaître	VPP	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	pour	pour	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	être	être	VNF	_	_	20	aux	_	_	_	_	_
20	impliqués	impliquer	VPP	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	dans	dans	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	topologie	topologie	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	l'	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	ADN	ADN	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
28	ont	avoir	VRB	_	_	30	aux	_	_	_	_	_
29	effectivement	effectivement	ADV	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
30	été	être	VPP	_	_	31	aux	_	_	_	_	_
31	mises	mettre	VPP	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
32	en	en	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	évidence	évidence	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	dans	dans	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
35	deux	deux	NUM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	de	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	ces	ce	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	gènes	gène	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1104
# text = Une mutation cible le gène topA ( H33Y ) , codant la topoisomérase I , qui relâche les supertours négatifs , tandis que l'autre modifie le site de fixation des ribosomes ( RBS ) du gène fis , codant une protéine de type histone .
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutation	mutation	NOM	_	_	38	subj	_	_	_	_	_
3	cible	cible	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	gène	gène	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	topA	topA	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	(	(	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
8	H33Y	H33Y	NOM	_	_	2	parenth	_	_	_	_	_
9	)	)	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
11	codant	coder	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	topoisomérase	topoisomérase	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	I	I	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
16	qui	qui	PRQ	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
17	relâche	relâcher	VRB	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
18	les	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	supertours	super-	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	négatifs	négatif	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
22	tandis	tandis que	CSU	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	que	tandis que	CSU	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
24	l'	l'autre	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	autre	l'autre	PRQ	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
26	modifie	modifier	VRB	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
27	le	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	site	site	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	fixation	fixation	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	des	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	ribosomes	ribosome	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	(	(	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
34	RBS	RBS	NOM	_	_	32	parenth	_	_	_	_	_
35	)	)	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
36	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
37	gène	gène	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
39	,	,	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
40	codant	coder	VPR	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	une	un	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	protéine	protéine	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	de	de	PRE	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	type	type	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	histone	histone	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	.	.	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1105
# text = La présence de ces mutations a alors été recherchée chez une cinquantaine de clones isolés à 500 , 1000 , 1500 , 2000 et 10 000 générations , ce qui a permis de déterminer leur dynamique de fixation au sein de la population Ara- 1 .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	présence	présence	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ces	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	mutations	mutation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	a	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
7	alors	alors	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
8	été	être	VPP	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	recherchée	rechercher	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	chez	chez	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	cinquantaine	cinquantaine	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	clones	clone	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	isolés	isolé	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	à	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	500	500	NUM	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
18	,	500 , 1000	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
19	1000	1000	NUM	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
21	1500	1500	NUM	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
22	,	1500 , 2000	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
23	2000	2000	NUM	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
24	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
25	10	10	NUM	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	000	000	NUM	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
27	générations	génération	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	ce	ce	PRQ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
30	qui	qui	PRQ	_	_	32	subj	_	_	_	_	_
31	a	avoir	VRB	_	_	32	aux	_	_	_	_	_
32	permis	permettre	VPP	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	déterminer	déterminer	VNF	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	leur	son	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	dynamique	dynamique	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	fixation	fixation	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	au	au sein de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
40	sein	au sein de	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	de	au sein de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	la	le	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	population	population	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	Ara-	Ara-	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	1	1	NUM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1106
# text = La mutation du gène topA est apparue avant 500 générations et a été fixée entre 1000 et 1500 générations , bien avant la mutation du gène fis , fixée après 10 000 générations .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutation	mutation	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	gène	gène	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	topA	topA	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	apparue	apparaître	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	avant	avant	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	500	500	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	générations	génération	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
12	a	avoir	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	été	être	VPP	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	fixée	fixer	VPP	_	_	7	para	_	_	_	_	_
15	entre	entre	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	1000	1000	NUM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
18	1500	1500	NUM	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	générations	génération	NOM	_	_	27	subj	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
21	bien	bien	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	avant	avant	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	mutation	mutation	NOM	_	_	27	subj	_	_	_	_	_
25	du	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	gène	gène	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	fis	faire	VRB	_	_	14	para	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	fixée	fixer	VPP	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	après	après	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	10	10	NUM	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	000	000	NUM	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	générations	génération	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1107
# text = Ceci correspond aux deux périodes où des changements de superhélicité ont été mesurés dans cette population Ara- 1 .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	correspond	correspondre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	aux	à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	deux	deux	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	périodes	période	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	où	où	PRQ	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
7	des	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	changements	changement	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	ont	avoir	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	été	être	VPP	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	mesurés	mesurer	VPP	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
14	dans	dans	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	cette	ce	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	population	population	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	Ara-	Ara-	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	1	1	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1108
# text = Afin d'analyser les effets phénotypiques de ces mutations , elles ont été introduites seules ou en combinaison dans le contexte génétique ancestral , au moyen du plasmide suicide pKO 3 .
1	Afin	afin de	PRE	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
2	d'	afin de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	analyser	analyser	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	effets	effet	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	phénotypiques	phénotypique	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	ces	ce	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	mutations	mutation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
11	elles	elles	CLS	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
12	ont	avoir	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	été	être	VPP	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	introduites	introduire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	seules	seul	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	ou	ou	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
17	en	en	PRE	_	_	15	para	_	_	_	_	_
18	combinaison	combinaison	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	dans	dans	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	le	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	contexte	contexte	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	génétique	génétique	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	ancestral	ancestral	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
25	au	au moyen de	PRE	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
26	moyen	au moyen de	DET	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	du	au moyen de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	plasmide	plasmode	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	suicide	suicide	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	pKO	pKO	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	3	3	NUM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1109
# text = Ceci a permis d'obtenir plusieurs souches ancestrales isogéniques à l'exception des allèles topA et/ou fis .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	a	avoir	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	permis	permettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	obtenir	obtenir	VNF	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	souches	souche	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	ancestrales	ancestral	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	isogéniques	isogénique	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	exception	exception	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	des	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	allèles	allèle	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	topA	topA	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	et/ou	et-ou	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
17	fis	faire	VRB	_	_	3	para	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1110
# text = De la même façon , un clone isolé à
1	De	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
2	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	même	même	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	façon	façon	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	un	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	clone	clone	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	isolé	isolé	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1111
# text = 2000 générations dans la population Ara- 1 a été modifié par remplacement de l'allèle évolué de topA par son allèle ancestral .
1	2000	2000	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	générations	génération	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	dans	dans	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	population	population	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	Ara-	Ara-	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	1	1	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	a	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	été	être	VPP	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	modifié	modifier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	remplacement	remplacement	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	allèle	allèle	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	évolué	évolué	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	topA	topA	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	par	par	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	son	son	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	allèle	allèle	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	ancestral	ancestral	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1112
# text = Ces différentes constructions ont permis d'étudier l'effet des deux mutations sur la topologie de l'ADN , le fitness des bactéries , mais aussi sur l'activité de la topoisomérase I et l'expression de Fis .
1	Ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	différentes	différent	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	constructions	construction	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
4	ont	avoir	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	permis	permettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	d'	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	étudier	étudier	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	effet	effet	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	des	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	deux	deux	NUM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	mutations	mutation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	sur	sur	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	topologie	topologie	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	ADN	ADN	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
20	le	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	fitness	fine	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	des	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	bactéries	bactérie	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
25	mais	mais aussi	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
26	aussi	mais aussi	ADV	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	sur	sur	PRE	_	_	13	para	_	_	_	_	_
28	l'	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	activité	activité	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	la	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	topoisomérase	topoisomérase	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	I	I	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	et	et	COO	_	_	36	mark	_	_	_	_	_
35	l'	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	expression	expression	NOM	_	_	32	para	_	_	_	_	_
37	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	Fis	Fis	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1113
# text = Des mesures de topologie de l'ADN ont été effectuées , de la même façon que précédemment , sur les souches portant les allèles évolués ou ancestraux de topA et fis .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mesures	mesure	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	topologie	topologie	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ADN	ADN	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	ont	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	été	être	VPP	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	effectuées	effectuer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
12	de	de la même façon que	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
13	la	de la même façon que	CSU	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
14	même	de la même façon que	CSU	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
15	façon	de la même façon que	CSU	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	que	de la même façon que	CSU	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	précédemment	précédemment	ADV	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
19	sur	sur	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	les	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	souches	souche	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	portant	porter	VPR	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	les	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	allèles	allèle	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	évolués	évolué	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	ou	ou	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
27	ancestraux	ancestral	ADJ	_	_	25	para	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
29	topA	topA	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	et	et	COO	_	_	31	mark	_	_	_	_	_
31	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1114
# text = Chacune des deux mutations augmente la superhélicité négative de l'ADN plasmidique dans le contexte génétique de l'ancêtre .
1	Chacune	chacun	PRQ	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
2	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	deux	deux	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	mutations	mutation	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	augmente	augmenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	négative	négatif	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	ADN	ADN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	plasmidique	plasmidique	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	dans	dans	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
14	le	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	contexte	contexte	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	génétique	génétique	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1115
# text = La mutation topA reproduit le changement de topologie observé chez les clones évolués isolés à 2000 générations dans la population Ara- 1 , tandis que les deux mutations combinées reproduisent les changements de topologie observés chez les clones évolués isolés à 20 000 générations .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutation	mutation	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	topA	topA	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	reproduit	reproduire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	le	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	changement	changement	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	topologie	topologie	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	observé	observer	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	chez	chez	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	les	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	clones	clone	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	évolués	évolué	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	isolés	isoler	VPP	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	2000	2000	NUM	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	générations	génération	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	dans	dans	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	population	population	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	Ara-	Ara-	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	1	1	NUM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
24	tandis	tandis que	CSU	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	que	tandis que	CSU	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
26	les	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
27	deux	deux	NUM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	mutations	mutation	NOM	_	_	30	subj	_	_	_	_	_
29	combinées	combiner	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	reproduisent	reproduire	VRB	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
31	les	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	changements	changement	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	topologie	topologie	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	observés	observer	VPP	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
36	chez	chez	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	les	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	clones	clone	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	évolués	évolué	ADJ	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	isolés	isolé	ADJ	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	à	à	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
42	20	20	NUM	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	000	000	NUM	_	_	44	spe	_	_	_	_	_
44	générations	génération	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
45	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1116
# text = Ce résultat est étroitement corrélé à la dynamique de fixation des mutations :
1	Ce	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	résultat	résultat	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
4	étroitement	étroitement	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	corrélé	corréler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	à	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	dynamique	dynamique	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	fixation	fixation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	des	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	mutations	mutation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	:	:	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1117
# text = ainsi , la première augmentation de superhélicité correspondrait à la fixation de la mutation dans le gène topA , tandis que la deuxième correspondrait à la fixation de la mutation dans le gène fis .
1	ainsi	ainsi	ADV	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
4	première	premier	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	augmentation	augmentation	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	correspondrait	correspondre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	fixation	fixation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	mutation	mutation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
16	le	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	gène	gène	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	topA	topA	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
20	tandis	tandis que	CSU	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	que	tandis que	CSU	_	_	34	periph	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	deuxième	deuxième	NUM	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
24	correspondrait	correspondre	VRB	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	à	à	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	la	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	fixation	fixation	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	34	periph	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	mutation	mutation	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	dans	dans	PRE	_	_	34	periph	_	_	_	_	_
32	le	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	gène	gène	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	fis	faire	VRB	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1118
# text = Ces deux mutations semblent donc être responsables de toutes les modifications de superhélicité observées dans la population Ara- 1 .
1	Ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	deux	deux	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	mutations	mutation	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	semblent	sembler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	donc	donc	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	être	être	VNF	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	responsables	responsable	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	toutes	tout	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	modifications	modification	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	observées	observer	VPP	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	dans	dans	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	population	population	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	Ara-	Ara-	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	1	1	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1119
# text = Des expériences de compétition ont été réalisées entre les clones ancêtres portant les allèles évolués et ancestraux des gènes topA et fis .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	expériences	expérience	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	compétition	compétition	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ont	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	été	être	VPP	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	réalisées	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	entre	entre	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	les	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	clones	clone	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	ancêtres	ancêtre	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	portant	porter	VPR	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	les	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	allèles	allèle	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	évolués	évolué	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
17	ancestraux	ancestral	ADJ	_	_	15	para	_	_	_	_	_
18	des	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
19	gènes	gène	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	topA	topA	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	fis	faire	VRB	_	_	7	para	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1120
# text = Ces expériences ont permis de montrer que l'allèle évolué du gène topA apporte un bénéfice important de 13 , 3 % , alors que l'allèle évolué du gène fis est bénéfique d'environ 3 % .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	expériences	expérience	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	ont	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	permis	permettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	montrer	montrer	VNF	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	que	que	CSU	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	allèle	allèle	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
10	évolué	évolué	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	du	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	gène	gène	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	topA	topA	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	apporte	apporter	VRB	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
15	un	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	bénéfice	bénéfice	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	important	important	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	13	13	NUM	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
20	,	13 , 3	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
21	3	3	NUM	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	%	pourcent	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
24	alors	alors que	CSU	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	que	alors que	CSU	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
26	l'	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	allèle	allèle	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	évolué	évolué	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	du	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
30	gène	gène	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
32	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
33	bénéfique	bénéfique	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
34	d'	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
35	environ	environ	ADV	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
36	3	3	NUM	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	%	pourcent	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
38	.	.	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1121
# text = Lorsque les deux mutations sont combinées , le gain de fitness est d'environ 16 % , ce qui n'est pas statistiquement différent d'un effet additif .
1	Lorsque	lorsque	CSU	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	les	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	deux	deux	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	mutations	mutation	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	sont	être	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	combinées	combiner	VPP	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	gain	gain	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	fitness	fine	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	d'	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	environ	environ	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
15	16	16	NUM	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	%	pourcent	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	ce	ce	PRQ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
19	qui	qui	PRQ	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
20	n'	ne	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	est	être	VRB	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	pas	pas	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	statistiquement	statistiquement	ADV	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	différent	différent	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	d'	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	un	un	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	effet	effet	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	additif	additif	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1122
# text = Ces deux mutations permettent donc l'adaptation des bactéries aux conditions de l'évolution expérimentale .
1	Ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	deux	deux	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	mutations	mutation	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	permettent	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	donc	donc	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	adaptation	adaptation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	des	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	bactéries	bactérie	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	aux	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	conditions	condition	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	évolution	évolution	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1123
# text = Elles ont un effet additif aussi bien en terme d'augmentation de superhélicité de l'ADN que de fitness .
1	Elles	elles	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	ont	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	un	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	effet	effet	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	additif	additif	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	aussi	aussi bien	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	bien	aussi bien	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
8	en	en terme de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	terme	en terme de	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	d'	en terme de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	augmentation	augmentation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	ADN	ADN	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	que	que	CSU	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	fitness	fine	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1124
# text = La mutation dans le gène topA touche un résidu très conservé ( Chen et Wang , 1998 ) du domaine I de la topoisomérase I , situé dans le domaine N-terminal , et probablement impliqué dans l'interaction avec l'ADN .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutation	mutation	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	dans	dans	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	gène	gène	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	topA	topA	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	touche	toucher	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	un	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	résidu	résidu	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	très	très	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	conservé	conservé	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Chen	Chen	NOM	_	_	9	parenth	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	Wang	Wang	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
17	1998	1998	NUM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	)	)	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
19	du	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
20	domaine	domaine	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	I	I	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	topoisomérase	topoisomérase	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	I	I	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
27	situé	situer	VPP	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
28	dans	dans	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	le	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	domaine	domaine	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	N-terminal	N-terminal	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	,	,	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_
33	et	et	COO	_	_	35	mark	_	_	_	_	_
34	probablement	probablement	ADV	_	_	35	periph	_	_	_	_	_
35	impliqué	impliquer	VPP	_	_	27	para	_	_	_	_	_
36	dans	dans	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	l'	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	interaction	interaction	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	avec	avec	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
40	l'	le	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	ADN	ADN	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1125
# text = La topoisomérase I a pour rôle de diminuer la superhélicité négative de l'ADN .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	topoisomérase	topoisomérase	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	I	I	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	pour	pour	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	rôle	rôle	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	diminuer	diminuer	VNF	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	négative	négatif	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	ADN	ADN	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1126
# text = L'allèle topA évolué entraînant une augmentation de superhélicité , il provoque probablement une baisse de l'activité de la topoisomérase I. L'effet de la mutation découverte dans le RBS du gène fis sur l'expression de la protéine a été analysé par western-blot en utilisant des anticorps dirigés contre Fis .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	allèle	allèle	NOM	_	_	34	subj	_	_	_	_	_
3	topA	topA	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	évolué	évolué	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	entraînant	entraîner	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	augmentation	augmentation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
11	il	il	CLS	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
12	provoque	provoquer	VRB	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
13	probablement	probablement	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	une	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	baisse	baisse	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	activité	activité	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	topoisomérase	topoisomérase	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	I.	I.	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	L'	L'	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	effet	effet	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	la	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	mutation	mutation	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	découverte	découvrir	VPP	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	dans	dans	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	le	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	RBS	RBS	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	du	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	gène	gène	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
35	sur	sur	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	l'	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	expression	expression	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	la	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	protéine	protéine	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
42	été	été	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
43	analysé	analyser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
44	par	par	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	western-blot	western	ADJ	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	en	en	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
47	utilisant	utiliser	VPR	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	des	un	DET	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
49	anticorps	anticorps	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	dirigés	diriger	VPP	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	contre	contre	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	Fis	Fis	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	.	.	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1127
# text = Cette mutation provoque une diminution de la quantité de Fis , qui est un répresseur transcriptionnel de l'expression de gyrA et gyrB codant la gyrase .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	mutation	mutation	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	provoque	provoquer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	une	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	diminution	diminution	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	quantité	quantité	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	Fis	Fis	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
12	qui	qui	PRQ	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
13	est	être	VRB	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
14	un	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	répresseur	répresseur	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	transcriptionnel	transcription	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	expression	expression	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	gyrA	gyrA	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	gyrB	gyrB	NOM	_	_	21	para	_	_	_	_	_
24	codant	coder	VPR	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	gyrase	gyrase	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1128
# text = Ceci pourrait donc expliquer l'augmentation de superhélicité de l'ADN induite par cette mutation .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	donc	donc	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	expliquer	expliquer	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	augmentation	augmentation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	ADN	ADN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	induite	induire	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
13	par	par	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	cette	ce	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	mutation	mutation	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1129
# text = La mutation topA est détectée de façon très précoce ( avant 500 générations ) , et ce dans 1 / 3 des individus testés à ce temps évolutif .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutation	mutation	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	topA	topA	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	est	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	détectée	détecter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	façon	façon	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	très	très	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	précoce	précoce	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	(	(	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	avant	avant	PRE	_	_	5	parenth	_	_	_	_	_
12	500	500	NUM	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	générations	génération	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	)	)	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
17	ce	ce	PRQ	_	_	5	para	_	_	_	_	_
18	dans	dans	PRE	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
19	1	1	NUM	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
20	/	1 / 3	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
21	3	3	NUM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	des	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	individus	individu	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	testés	tester	VPP	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	à	à	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	ce	ce	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	temps	temps	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	évolutif	évolutif	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1130
# text = Une mutation apportant un tel avantage ( 13 % ) aurait dû être fixée en moins de 200 générations , c'est-à-dire bien avant 1000 générations .
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutation	mutation	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
3	apportant	apporter	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	un	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	tel	tel	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	avantage	avantage	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	(	(	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
8	13	13	NUM	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	%	pourcent	NOM	_	_	6	parenth	_	_	_	_	_
10	)	)	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
11	aurait	avoir	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	dû	devoir	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	être	être	VNF	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	fixée	fixer	VPP	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	en	en	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	moins	moins	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	200	200	NUM	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	générations	génération	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
21	c'	c'est-à-dire	COO	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	est-à-dire	c'est-à-dire	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	bien	bien	NOM	_	_	19	para	_	_	_	_	_
24	avant	avant	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
25	1000	1000	NUM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	générations	génération	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1131
# text = Or il faut attendre 1500 générations pour que tous les individus analysés présentent l'allèle évolué du gène topA. Ceci pourrait être dû à un phénomène appelé interférence clonale .
1	Or	or	COO	_	_	2	mark	_	_	_	_	_
2	il	il	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	faut	falloir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	attendre	attendre	VNF	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	1500	1500	NUM	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	générations	génération	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	pour	pour que	CSU	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	que	pour que	CSU	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
9	tous	tout	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	individus	individu	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
12	analysés	analyser	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	présentent	présenter	VRB	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	allèle	allèle	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	évolué	évolué	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	du	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	gène	gène	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	topA.	topA.	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	Ceci	Ceci	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	être	être	VNF	_	_	23	aux	_	_	_	_	_
23	dû	devoir	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	à	à	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	un	un	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	phénomène	phénomène	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	appelé	appeler	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	interférence	interférence	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	clonale	clonal	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	.	.	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1132
# text = A une même étape de l'évolution , la population peut en effet être composée de plusieurs sous-populations constituées de cellules portant des mutations bénéfiques différentes mais apportant un avantage équivalent ( Gerrish et Lenski , 1998 ) .
1	A	à	PRE	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	une	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	même	même	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	étape	étape	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	évolution	évolution	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	population	population	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
11	peut	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	en	en	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	effet	effet	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	être	être	VNF	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
15	composée	composer	VPP	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	sous-populations	sous-	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	constituées	constituer	VPP	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	cellules	cellule	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	portant	porter	VPR	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	des	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	mutations	mutation	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	différentes	différent	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	mais	mais	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
28	apportant	apporter	VPR	_	_	22	para	_	_	_	_	_
29	un	un	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	avantage	avantage	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	équivalent	équivalent	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	(	(	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
33	Gerrish	Gerrish	NOM	_	_	30	parenth	_	_	_	_	_
34	et	et	COO	_	_	35	mark	_	_	_	_	_
35	Lenski	Lenski	NOM	_	_	33	para	_	_	_	_	_
36	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
37	1998	1998	NUM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	)	)	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1133
# text = Cette compétition entraîne alors un retard de fixation des mutations .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	compétition	compétition	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	entraîne	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	alors	alors	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	un	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	retard	retard	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	fixation	fixation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	des	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	mutations	mutation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1134
# text = Il faut en effet attendre qu'une seconde mutation bénéfique apparaisse dans une des sous-populations , et que cette mutation confère une augmentation suffisante du fitness , pour permettre la fixation de cette sous-population aux dépends des autres .
1	Il	il	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	faut	falloir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	en	en effet	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	effet	en effet	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	attendre	attendre	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	qu'	que	CSU	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	une	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
8	seconde	second	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	mutation	mutation	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
10	bénéfique	bénéfique	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	apparaisse	apparaître	VRB	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
12	dans	dans	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	une	une	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	des	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	sous-populations	sous-	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	que	que	CSU	_	_	6	para	_	_	_	_	_
19	cette	ce	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	mutation	mutation	NOM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
21	confère	conférer	VRB	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	une	un	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	augmentation	augmentation	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	suffisante	suffisant	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	du	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	fitness	fine	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
28	pour	pour	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
29	permettre	permettre	VNF	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	la	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	fixation	fixation	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	cette	ce	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	sous-population	sous-	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	aux	à+le	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
36	dépends	dépendre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
37	des	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	autres	autre	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1135
# text = A 1000 générations , la population Ara- 1 serait donc constituée d'au moins 2 sous-populations , l'une composée de cellules portant l'allèle évolué de topA , l'autre de bactéries portant l'allèle ancestral de topA mais comportant une ou plusieurs autres mutations bénéfiques .
1	A	à	PRE	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	1000	1000	NUM	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	générations	génération	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	population	population	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
7	Ara-	Ara-	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	1	1	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	serait	être	VRB	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
10	donc	donc	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	constituée	constituer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	au	à+le	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
14	moins	au moins	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	2	2	NUM	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	sous-populations	sous-	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
18	l'	l'un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	une	l'un	PRQ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	composée	composer	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	cellules	cellule	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	portant	porter	VPR	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	l'	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	allèle	allèle	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	évolué	évolué	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	topA	topA	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
30	l'	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	autre	autre	PRQ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	bactéries	bactérie	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	portant	porter	VPR	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	l'	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	allèle	allèle	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	ancestral	ancestral	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	topA	topA	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	mais	mais	COO	_	_	41	mark	_	_	_	_	_
41	comportant	comporter	VPR	_	_	34	para	_	_	_	_	_
42	une	un	DET	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
43	ou	ou	COO	_	_	46	mark	_	_	_	_	_
44	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
45	autres	autre	ADJ	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
46	mutations	mutation	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
47	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1136
# text = Le fitness et le niveau de superhélicité de 4 clones évolués isolés à 1000 générations au sein de la population Ara- 1 ont été mesurés , 2 des clones ne portant pas l'allèle évolué de topA , les 2 autres le possédant .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fitness	fine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	4	mark	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	niveau	niveau	NOM	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	4	4	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	clones	clone	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	évolués	évolué	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	isolés	isoler	VPP	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	1000	1000	NUM	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	générations	génération	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	au	au sein de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
17	sein	au sein de	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	au sein de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	population	population	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	Ara-	Ara-	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	1	1	NUM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	ont	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	été	être	VNF	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	mesurés	mesurer	VNF	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
27	2	2	NUM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	des	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	clones	clone	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	ne	ne	ADV	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	portant	porter	VPR	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	pas	pas	ADV	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	l'	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	allèle	allèle	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
35	évolué	évolué	ADJ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	de	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	topA	topA	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	,	,	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
39	les	le	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
40	2	2	NUM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
41	autres	autre	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
42	le	le	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	possédant	possédant	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
44	.	.	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1137
# text = Or ces 4 clones présentent un fitness et un niveau de superhélicité de l'ADN similaires .
1	Or	or	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
2	ces	ce	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	4	4	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	clones	clone	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	présentent	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	un	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	fitness	fine	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
9	un	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	niveau	niveau	NOM	_	_	7	para	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	ADN	ADN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	similaires	similaire	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1138
# text = Ce résultat signifie donc que les clones ne possédant pas l'allèle évolué de topA portent une ou plusieurs autres mutations ayant un effet équivalent sur le fitness .
1	Ce	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	résultat	résultat	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	signifie	signifier	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	donc	donc	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	que	que	CSU	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	clones	clone	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
8	ne	ne	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	possédant	posséder	VPR	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	pas	pas	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	allèle	allèle	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	évolué	évolué	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	topA	topA	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	portent	porter	VRB	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
17	une	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
18	ou	ou	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
19	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
20	autres	autre	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	mutations	mutation	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
22	ayant	avoir	VPR	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	un	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	effet	effet	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	équivalent	équivalent	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	sur	sur	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	le	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	fitness	fine	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1139
# text = La topologie de l'ADN étant la même que pour la sous-population portant l'allèle évolué de topA , il est probable qu'une de ces mutations bénéfiques affecte également un gène impliqué dans le contrôle de la superhélicité de l'ADN .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	topologie	topologie	NOM	_	_	21	periph	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	étant	être	VPR	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	même	même	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	que	que	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	pour	pour	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	sous-population	sous-	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	portant	porter	VPR	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	allèle	allèle	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	évolué	évolué	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	topA	topA	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
20	il	il	CLS	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
21	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	probable	probable	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	qu'	que	CSU	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	une	un	PRQ	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	ces	ce	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	mutations	mutation	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	affecte	affecter	VRB	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
30	également	également	ADV	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	un	un	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	gène	gène	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
33	impliqué	impliquer	VPP	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	dans	dans	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	le	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	contrôle	contrôle	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	la	le	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	de	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	l'	le	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	ADN	ADN	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	.	.	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1140
# text = Ces expériences ont permis de mettre en évidence une nouvelle classe de mutations bénéfiques , permettant l'adaptation des bactéries aux conditions de l'évolution expérimentale .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	expériences	expérience	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	ont	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	permis	permettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	mettre	mettre	VNF	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	en	en	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	évidence	évidence	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	une	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
10	nouvelle	nouveau	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	classe	classe	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	mutations	mutation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	permettant	permettre	VPR	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	adaptation	adaptation	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	des	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	bactéries	bactérie	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	aux	à	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	conditions	condition	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	l'	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	évolution	évolution	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1141
# text = Elles affectent le degré de superhélicité de l'ADN , qui est un point de contrôle des transitions nutritionnelles et de la réponse aux stress chez les bactéries .
1	Elles	elles	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	affectent	affecter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	le	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	degré	degré	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	ADN	ADN	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
11	qui	qui	PRQ	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
12	est	être	VRB	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	un	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	point	point	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	contrôle	contrôle	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	des	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	transitions	transition	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	nutritionnelles	nutritionnel	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	17	para	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	réponse	réponse	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	aux	à	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	stress	stress	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	chez	chez	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	les	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	bactéries	bactérie	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1142
# text = La superhélicité de l'ADN est donc une cible majeure de la sélection naturelle .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	donc	donc	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	une	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	cible	cible	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	majeure	majeur	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	sélection	sélection	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	naturelle	naturel	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1143
# text = En effet , l'accroissement de superhélicité a été mis en évidence de façon parallèle dans la majorité des populations mais également dans différentes sous-populations éléments d'une même population .
1	En	en	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	effet	effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	accroissement	accroissement	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	a	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	été	être	VPP	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	mis	mettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	en	en	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	évidence	évidence	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	façon	façon	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	parallèle	parallèle	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	dans	dans	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	majorité	majorité	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	des	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	populations	population	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	mais	mais	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
22	également	également	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	dans	dans	PRE	_	_	16	para	_	_	_	_	_
24	différentes	différent	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	sous-populations	sous-	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	éléments	élément	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	d'	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	une	un	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
29	même	même	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	population	population	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1144
# text = Résultats Partie II Evolution Bactérienne et Superhélicité de l'ADN :
1	Résultats	résultat	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Partie	Partie	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	II	II	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	Evolution	Evolution	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	Bactérienne	Bactérienne	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	7	mark	_	_	_	_	_
7	Superhélicité	Superhélicité	NOM	_	_	4	para	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	ADN	ADN	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1145
# text = Degré Exceptionnel de Parallélisme Génétique et Phénotypique
1	Degré	degré	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Exceptionnel	Exceptionnel	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	Parallélisme	Parallélisme	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	Génétique	Génétique	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	7	mark	_	_	_	_	_
7	Phénotypique	Phénotypique	NOM	_	_	5	para	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1146
# text = Cette partie s'inscrit dans la continuité des travaux décrits dans l'article précédent et fait l'objet de la publication ci-jointe intitulée « Bacterial Evolution by Exceptional Levels of Parallel Genetic Changes in DNA Superhelicity » ( E. Crozat , C . Winkworth , P. Fisher Hallin , M.A . Riley , R.E . Lenski and D. Schneider , à soumettre à la revue PLoS Biology ) .
1	Cette	cette	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	partie	partir	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	s'	s'	CLI	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	inscrit	inscrire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	continuité	continuité	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	des	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	travaux	travail	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	décrits	décrire	VPP	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	dans	dans	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	article	article	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	précédent	précédent	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	fait	faire	VRB	_	_	4	para	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	objet	objet	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	publication	publication	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	ci-jointe	ci-joint	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	intitulée	intituler	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	«	«	PUNC	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
25	Bacterial	Bacterial	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
26	Evolution	Evolution	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
27	by	bacterial evolution by exceptional levels of parallel genetic changes in dna superhelicity	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
28	Exceptional	Exceptional	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
29	Levels	Levels	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
30	of	bacterial evolution by exceptional levels of parallel genetic changes in dna superhelicity	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
31	Parallel	Parallel	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
32	Genetic	Genetic	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
33	Changes	Changes	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
34	in	bacterial evolution by exceptional levels of parallel genetic changes in dna superhelicity	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
35	DNA	DNA	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
36	Superhelicity	Superhelicity	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
37	»	»	PUNC	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
38	(	(	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
39	E.	E.	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
40	Crozat	Crozat	NOM	_	_	16	parenth	_	_	_	_	_
41	,	,	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
42	C	C	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
43	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
44	Winkworth	Winkworth	NOM	_	_	42	para	_	_	_	_	_
45	,	,	PUNC	_	_	61	punc	_	_	_	_	_
46	P.	P.	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	Fisher	Fisher	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	Hallin	Hallin	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
49	,	,	PUNC	_	_	61	punc	_	_	_	_	_
50	M.A	M.A	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
51	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
52	Riley	Riley	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
53	,	,	PUNC	_	_	61	punc	_	_	_	_	_
54	R.E	R.E	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
55	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
56	Lenski	Lenski	NOM	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
57	and	lenski and d. schneider	NOM	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
58	D.	D.	NOM	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
59	Schneider	Schneider	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
60	,	,	PUNC	_	_	61	punc	_	_	_	_	_
61	à	à	PRE	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
62	soumettre	soumettre	VNF	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
63	à	à	PRE	_	_	62	dep	_	_	_	_	_
64	la	le	DET	_	_	67	spe	_	_	_	_	_
65	revue	revoir	ADJ	_	_	67	dep	_	_	_	_	_
66	PLoS	PLoS	NOM	_	_	67	dep	_	_	_	_	_
67	Biology	Biology	NOM	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
68	)	)	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
69	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1147
# text = Dans la première partie des résultats , nous avons démontré une augmentation parallèle de la superhélicité négative de l'ADN dans 10 des 12 populations , cette augmentation intervenant dès
1	Dans	dans	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	première	premier	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	partie	partie	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	résultats	résultat	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
8	nous	nous	CLS	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
9	avons	avoir	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	démontré	démontrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	augmentation	augmentation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	parallèle	parallèle	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	négative	négatif	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	ADN	ADN	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	dans	dans	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
22	10	10	NUM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	des	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
24	12	12	NUM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	populations	population	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
27	cette	ce	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	augmentation	augmentation	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
29	intervenant	intervenir	VPR	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	dès	dès	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1148
# text = 2000 générations pour la majorité des populations .
1	2000	2000	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	générations	génération	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	pour	pour	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	majorité	majorité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	des	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	populations	population	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1149
# text = Au sein de la population modèle Ara- 1 , la découverte et l'étude de mutations responsables de ces changements de superhélicité nous ont permis de suggérer que ces modifications étaient liées à une sélection positive au cours de l'évolution .
1	Au	au sein de	PRE	_	_	25	periph	_	_	_	_	_
2	sein	au sein de	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	au sein de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	population	population	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	modèle	modèle	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	Ara-	Ara-	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	1	1	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	découverte	découverte	NOM	_	_	5	para	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	étude	étude	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	mutations	mutation	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	responsables	responsable	NOM	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	ces	ce	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	changements	changement	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	nous	le	CLI	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
24	ont	avoir	VRB	_	_	25	aux	_	_	_	_	_
25	permis	permettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	suggérer	suggérer	VNF	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	que	que	CSU	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	ces	ce	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	modifications	modification	NOM	_	_	32	subj	_	_	_	_	_
31	étaient	être	VRB	_	_	32	aux	_	_	_	_	_
32	liées	lier	VPP	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
33	à	à	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	une	un	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	sélection	sélection	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	positive	positif	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	au	à	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	cours	cours	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	de	de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	l'	le	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	évolution	évolution	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	.	.	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1150
# text = Dans cette seconde partie des résultats , nous nous sommes intéressés aux changements génétiques liés aux modifications de superhélicité de l'ADN dans les 11 autres populations , afin de répondre aux questions suivantes :
1	Dans	dans	PRE	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	cette	ce	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	seconde	second	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	partie	partie	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	résultats	résultat	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
8	nous	nous	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
9	nous	nous	CLS	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
10	sommes	être	VRB	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	intéressés	intéresser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	aux	à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	changements	changement	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	génétiques	génétique	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	liés	lier	VPP	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	aux	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	modifications	modification	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	l'	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	ADN	ADN	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	dans	dans	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
24	les	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
25	11	11	NUM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
26	autres	autre	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
27	populations	population	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	afin	afin de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
30	de	afin de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	répondre	répondre	VNF	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	aux	à	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	questions	question	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	suivantes	suivant	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	:	:	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1151
# text = le parallélisme phénotypique observé au niveau de la superhélicité de l'ADN s'explique -t-il par un parallélisme génétique  ?
1	le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
3	phénotypique	phénotypique	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	observé	observer	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	au	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	niveau	niveau	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	ADN	ADN	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	s'	s'	CLI	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	explique	expliquer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	-t-il	-t-il	CLS	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
16	par	par	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	un	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	génétique	génétique	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	 ?	?	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1152
# text = Où sont localisées les mutations responsables de l'augmentation de superhélicité ?
1	Où	où?	ADV	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	sont	être	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	localisées	localiser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	mutations	mutation	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
6	responsables	responsable	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	augmentation	augmentation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	?	?	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1153
# text = Quels sont leurs effets ?
1	Quels	quel?	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	leurs	son	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	effets	effet	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
5	?	?	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1154
# text = Les mêmes gènes sont -ils touchés par des mutations dans la majorité des populations ?
1	Les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	mêmes	même	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	gènes	gène	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
4	sont	être	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
5	-ils	-ils	CLS	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	touchés	toucher	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	par	par	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	des	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	mutations	mutation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	majorité	majorité	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	des	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	populations	population	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	?	?	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1155
# text = Si oui , trouve -t-on les mêmes mutations plusieurs fois de façon indépendante ?
1	Si	si	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	oui	oui	ADV	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	trouve	trouver	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	-t-on	-t-on	CLS	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
7	mêmes	même	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	mutations	mutation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	fois	fois	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	façon	façon	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	indépendante	indépendant	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	?	?	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1156
# text = Au moins deux hypothèses peuvent être envisagées à priori .
1	Au	à	PRE	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	moins	moins	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	deux	deux	NUM	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	hypothèses	hypothèse	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	être	être	VNF	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	envisagées	envisager	VPP	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	à	a priori	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	priori	a priori	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1157
# text = A un extrême , il se peut que seul un accroissement de superhélicité de l'ADN soit important pour l'adaptation des bactéries à leur environnement .
1	A	à	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	un	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	extrême	extrême	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	il	il	CLS	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
6	se	se	CLI	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	peut	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	que	que	CSU	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	seul	seul	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
10	un	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	accroissement	accroissement	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	ADN	ADN	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	soit	être	VRB	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
18	important	important	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	pour	pour	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	adaptation	adaptation	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	des	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	bactéries	bactérie	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	à	à	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	leur	son	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	environnement	environnement	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1158
# text = Dans ce cas , les différentes populations peuvent présenter des mutations dans tous types de gènes impliqués dans la superhélicité , pourvu qu'elles conduisent à une augmentation de superhélicité .
1	Dans	dans	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	ce	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	cas	cas	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
6	différentes	différent	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	populations	population	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
8	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	présenter	présenter	VNF	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	des	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	mutations	mutation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	dans	dans	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	tous	tout	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	types	type	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	gènes	gène	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	impliqués	impliquer	VPP	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	dans	dans	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
22	pourvu	pourvu que	CSU	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	qu'	pourvu que	CSU	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
24	elles	elles	CLS	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
25	conduisent	conduire	VRB	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	à	à	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	une	un	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	augmentation	augmentation	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1159
# text = A l'autre extrême , l'augmentation de fitness pourrait être liée à des fonctions particulières d'un petit nombre de gènes impliqués dans le contrôle de la superhélicité .
1	A	à	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	autre	autre	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	extrême	extrême	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	augmentation	augmentation	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	fitness	fine	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	être	être	VNF	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	liée	lier	VPP	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	des	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	fonctions	fonction	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	particulières	particulier	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	d'	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	un	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
19	petit	petit	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	nombre	nombre	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	gènes	gène	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	impliqués	impliquer	VPP	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	dans	dans	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	le	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	contrôle	contrôle	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1160
# text = Dans ce cas , seuls certains gènes de contrôle de la topologie seront les cibles de la sélection naturelle .
1	Dans	dans	PRE	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	ce	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	cas	cas	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	seuls	seul	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
6	certains	certain	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	gènes	gène	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	contrôle	contrôle	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	topologie	topologie	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	seront	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	cibles	cible	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	sélection	sélection	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	naturelle	naturel	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1161
# text = Ainsi , la mise en évidence du degré de parallélisme génétique à la base des changements de superhélicité de l'ADN pourrait nous éclairer sur les mécanismes mis en jeu .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	mise	mise	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
5	en	en	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	évidence	évidence	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	du	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	degré	degré	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	génétique	génétique	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	à	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	base	base	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	des	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	changements	changement	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	ADN	ADN	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	nous	le	CLI	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	éclairer	éclairer	VNF	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	sur	sur	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	les	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	mécanismes	mécanisme	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	mis	mettre	VPP	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	en	en	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	jeu	jeu	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1162
# text = Pour répondre à ces questions , nous avons séquencé 9 loci ( 17 gènes ) connus pour être impliqués dans la régulation de la topologie de l'ADN .
1	Pour	pour	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	répondre	répondre	VNF	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	à	à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ces	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	questions	question	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	nous	nous	CLS	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
8	avons	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	séquencé	séquencer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	9	9	NUM	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	loci	locus	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	(	(	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
13	17	17	NUM	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	gènes	gène	NOM	_	_	11	parenth	_	_	_	_	_
15	)	)	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
16	connus	connaître	VPP	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
17	pour	pour	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	être	être	VNF	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
19	impliqués	impliquer	VPP	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	dans	dans	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	régulation	régulation	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	topologie	topologie	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	l'	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	ADN	ADN	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1163
# text = Ces loci comprennent des gènes codant les topoisomérases ( gyrA , gyrB , parC , parE , topA , topB ) et des protéines de type histone ( dps , fis , hns ) .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	loci	locus	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	comprennent	comprendre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	gènes	gène	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	codant	coder	VPR	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	topoisomérases	topoisomérase	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	(	(	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
10	gyrA	gyrA	NOM	_	_	8	parenth	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	gyrB	gyrB	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	parC	parc	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
16	parE	parE	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
18	topA	topA	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
20	topB	topB	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
21	)	)	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	des	de	PRE	_	_	3	para	_	_	_	_	_
24	protéines	protéine	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	type	type	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	histone	histone	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	(	(	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
29	dps	un	_	_	_	0	root	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
31	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
32	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
33	hns	an	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
34	)	)	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1164
# text = Dans les cas où les gènes se situent dans des opérons ( fis , parC , parE et topB ) , la totalité de ceux  -ci ont été séquencés , ce qui donne un total de 17 gènes et 23 102 pb .
1	Dans	dans	PRE	_	_	29	periph	_	_	_	_	_
2	les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	cas	cas	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	où	où	PRQ	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	gènes	gène	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
7	se	se	CLI	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	situent	situer	VRB	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	des	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	opérons	opéron	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	fis	faire	VRB	_	_	8	parenth	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
15	parC	parC	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
17	parE	parE	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	topB	topB	NOM	_	_	17	para	_	_	_	_	_
20	)	)	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	totalité	totalité	NOM	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	ceux	celui	PRQ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	 -ci	 -ci	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	ont	avoir	VRB	_	_	28	aux	_	_	_	_	_
28	été	être	VPP	_	_	29	aux	_	_	_	_	_
29	séquencés	séquencer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
31	ce	ce	PRQ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	qui	qui	PRQ	_	_	33	subj	_	_	_	_	_
33	donne	donner	VRB	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	un	un	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	total	total	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	de	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	17	17	NUM	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	gènes	gène	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	et	et	COO	_	_	42	mark	_	_	_	_	_
40	23	23	NUM	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	102	102	NUM	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	pb	problème	NOM	_	_	38	para	_	_	_	_	_
43	.	.	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1165
# text = Chacun de ces loci a été séquencé dans un clone évolué isolé à 20 000 générations de chacune des 12 populations .
1	Chacun	chacun	PRQ	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	ces	ce	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	loci	locus	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	a	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	été	être	VPP	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	séquencé	séquencer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	dans	dans	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	un	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	clone	clone	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	évolué	évolué	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	isolé	isolé	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	20	20	NUM	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	000	000	NUM	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	générations	génération	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	chacune	chacun	PRQ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	des	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	12	12	NUM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	populations	population	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1166
# text = Un total de 27 mutations a été mis en évidence ( Tableau 1 du manuscrit joint ) .
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	total	total	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	27	27	NUM	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	mutations	mutation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	a	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	été	être	VPP	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	mis	mettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	en	en	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	évidence	évidence	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	(	(	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	Tableau	Tableau	NOM	_	_	10	parenth	_	_	_	_	_
13	1	1	NUM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	du	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	manuscrit	manuscrit	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	joint	joindre	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	)	)	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1167
# text = Ces différentes séquences ont été comparées à celles réalisées pour 36 gènes choisis au hasard ( pour un total de 18 374 pb ) dans des clones évolués isolés à 20 000 générations dans chacune des 12 populations .
1	Ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	différentes	différent	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	séquences	séquence	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
4	ont	avoir	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	été	être	VPP	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	comparées	comparer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	celles	celui	PRQ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	réalisées	réaliser	VPP	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	pour	pour	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	36	36	NUM	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	gènes	gène	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	choisis	choisir	VPP	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	au	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	hasard	hasard	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	(	(	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
17	pour	pour	PRE	_	_	13	parenth	_	_	_	_	_
18	un	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	total	total	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	18	18	NUM	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	374	374	NUM	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	pb	problème	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	)	)	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
25	dans	dans	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
26	des	un	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	clones	clone	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	évolués	évolué	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	isolés	isoler	VPP	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	à	à	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	20	20	NUM	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	000	000	NUM	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	générations	génération	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
34	dans	dans	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
35	chacune	chacun	PRQ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	des	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	12	12	NUM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
38	populations	population	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1168
# text = Cette dernière étude n'a permis d'isoler que 6 mutations au sein de ces 36 gènes , toutes apparues dans des gènes différents et dans les populations devenues mutatrices au cours de l'évolution . ( Il est important de rappeler ici que 4 populations sur 12 présentent , bien avant 20 000 générations , un taux de mutation 100 fois supérieur à celui de l'ancêtre , suite à des mutations dans les gènes de réparation des mésappariements ) .
1	Cette	cette	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	dernière	dernier	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	étude	étude	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
4	n'	ne	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
5	a	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	permis	permettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	isoler	isoler	VNF	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	que	que	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	6	6	NUM	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	mutations	mutation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	au	au sein de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
13	sein	au sein de	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	au sein de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	ces	ce	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
16	36	36	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	gènes	gène	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
19	toutes	tout	PRQ	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
20	apparues	apparaître	VPP	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	dans	dans	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	des	un	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	gènes	gène	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	différents	différent	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
26	dans	dans	PRE	_	_	21	para	_	_	_	_	_
27	les	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	populations	population	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	devenues	devenir	VPP	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	mutatrices	mutateur	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	au	au cours de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	cours	au cours de	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	de	au cours de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	l'	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	évolution	évolution	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
37	(	(	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
38	Il	Il	CLS	_	_	39	subj	_	_	_	_	_
39	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
40	important	important	ADJ	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	de	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	rappeler	rappeler	VNF	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	ici	ici	ADV	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	que	que	CSU	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	4	4	NUM	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
46	populations	population	NOM	_	_	49	subj	_	_	_	_	_
47	sur	sur	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	12	12	NUM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	présentent	présenter	VRB	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
50	,	,	PUNC	_	_	70	punc	_	_	_	_	_
51	bien	bien	ADV	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
52	avant	avant	PRE	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
53	20	20	NUM	_	_	54	spe	_	_	_	_	_
54	000	000	NUM	_	_	55	spe	_	_	_	_	_
55	générations	génération	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
56	,	,	PUNC	_	_	70	punc	_	_	_	_	_
57	un	un	DET	_	_	58	spe	_	_	_	_	_
58	taux	taux	NOM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
59	de	de	PRE	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
60	mutation	mutation	NOM	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
61	100	100	NUM	_	_	62	spe	_	_	_	_	_
62	fois	fois	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
63	supérieur	supérieur	ADJ	_	_	62	dep	_	_	_	_	_
64	à	à	PRE	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
65	celui	celui	PRQ	_	_	64	dep	_	_	_	_	_
66	de	de	PRE	_	_	65	dep	_	_	_	_	_
67	l'	le	DET	_	_	68	spe	_	_	_	_	_
68	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	66	dep	_	_	_	_	_
69	,	,	PUNC	_	_	70	punc	_	_	_	_	_
70	suite	suite à	PRE	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
71	à	suite à	PRE	_	_	70	dep	_	_	_	_	_
72	des	un	DET	_	_	73	spe	_	_	_	_	_
73	mutations	mutation	NOM	_	_	70	dep	_	_	_	_	_
74	dans	dans	PRE	_	_	73	dep	_	_	_	_	_
75	les	le	DET	_	_	76	spe	_	_	_	_	_
76	gènes	gène	NOM	_	_	74	dep	_	_	_	_	_
77	de	de	PRE	_	_	76	dep	_	_	_	_	_
78	réparation	réparation	NOM	_	_	77	dep	_	_	_	_	_
79	des	de	PRE	_	_	78	dep	_	_	_	_	_
80	mésappariements	désappariement	NOM	_	_	79	dep	_	_	_	_	_
81	)	)	PUNC	_	_	80	punc	_	_	_	_	_
82	.	.	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1169
# text = Quatre tests statistiques ont été utilisés pour comparer ces deux catégories de gènes ( liés à la topologie de l'ADN ou choisis au hasard ) .
1	Quatre	quatre	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	tests	test	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	statistiques	statistique	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ont	avoir	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	été	être	VPP	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	utilisés	utiliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	pour	pour	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	comparer	comparer	VNF	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	ces	ce	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
10	deux	deux	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	catégories	catégorie	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	gènes	gène	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	(	(	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	liés	lier	VPP	_	_	13	parenth	_	_	_	_	_
16	à	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	topologie	topologie	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	ADN	ADN	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	ou	ou	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	choisis	choisir	VPP	_	_	15	para	_	_	_	_	_
24	au	à	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	hasard	hasard	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	)	)	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1170
# text = Un degré exceptionnel de parallélisme génétique a été mis en évidence , avec seulement 3 gènes ( topA , fis et dusB ) soumis à sélection positive au cours de l'évolution .
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	degré	degré	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	exceptionnel	exceptionnel	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	génétique	génétique	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	a	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	été	être	VPP	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	mis	mettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	en	en	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	évidence	évidence	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
13	avec	avec	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	seulement	seulement	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	3	3	NUM	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	gènes	gène	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
17	(	(	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
18	topA	topA	ADV	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
20	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	dusB	dusB	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	)	)	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
24	soumis	soumettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
25	à	à	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	sélection	sélection	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	positive	positif	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	au	à	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	cours	cours	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	l'	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	évolution	évolution	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1171
# text = Malgré ce parallélisme génétique , les mutations identifiées dans chacun des 3 gènes dans les différentes populations sont différentes les unes des autres .
1	Malgré	malgré	PRE	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
2	ce	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	génétique	génétique	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	mutations	mutation	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
8	identifiées	identifier	VPP	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	chacun	chacun	PRQ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	des	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	3	3	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	gènes	gène	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	les	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
16	différentes	différent	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	populations	population	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	différentes	différent	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
20	les	l'un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	unes	l'un	PRQ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	des	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	autres	autre	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1172
# text = L'analyse moléculaire des différents allèles évolués du gène fis ( modifié aux niveaux transcriptionnel , traductionnel et de la séquence codante ) nous a permis de montrer que ces mutations divergentes conduisaient cependant à des effets moléculaires similaires :
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	analyse	analyse	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	moléculaire	moléculaire	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	différents	différent	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	allèles	allèle	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	évolués	évolué	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	du	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	gène	gène	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	(	(	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	modifié	modifier	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	aux	à	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	niveaux	niveau	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	transcriptionnel	transcription	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
17	traductionnel	traduction	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
19	de	de+le	PRE	_	_	15	para	_	_	_	_	_
20	la	de+le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	séquence	séquence	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	codante	codant	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	)	)	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	nous	lui	PRQ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
25	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	permis	permettre	VNF	_	_	0	root	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	montrer	montrer	VNF	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	que	que	CSU	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	ces	ce	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	mutations	mutation	NOM	_	_	33	subj	_	_	_	_	_
32	divergentes	divergent	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	conduisaient	conduire	VRB	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
34	cependant	cependant	ADV	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	à	à	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	des	un	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	effets	effet	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	moléculaires	moléculaire	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	similaires	similaire	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	:	:	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1173
# text = une diminution de la quantité ou de l'activité de la protéine Fis .
1	une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	diminution	diminution	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	quantité	quantité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	ou	ou	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
7	de	de+le	PRE	_	_	2	para	_	_	_	_	_
8	l'	de+le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	activité	activité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	protéine	protéine	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	Fis	Fis	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1174
# text = Cette seconde partie des résultats nous a permis également d'identifier de nouvelles mutations bénéfiques , encore inconnues dans ces populations et affectant le gène dusB. De plus , nos résultats suggèrent des fonctions communes entre fis et dusB. Enfin , l'effet du contexte génétique sur l'accroissement de superhélicité de l'ADN a été étudié .
1	Cette	cette	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
2	seconde	second	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	partie	partir	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	résultats	résultat	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	nous	le	CLI	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
7	a	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	permis	permettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	également	également	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	identifier	identifier	VNF	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	nouvelles	nouvelle	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	mutations	mutation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
17	encore	encore	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	inconnues	inconnu	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
19	dans	dans	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
20	ces	ce	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	populations	population	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
23	affectant	affecter	VPR	_	_	32	periph	_	_	_	_	_
24	le	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	gène	gène	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	dusB.	dusB.	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	De	De	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	plus	plus	ADV	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
30	nos	son	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	résultats	résultat	NOM	_	_	32	subj	_	_	_	_	_
32	suggèrent	suggérer	VRB	_	_	8	para	_	_	_	_	_
33	des	un	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	fonctions	fonction	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	communes	commun	ADJ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	entre	entre	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
37	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
38	et	et	COO	_	_	39	mark	_	_	_	_	_
39	dusB.	dusB.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
40	Enfin	Enfin	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	,	,	PUNC	_	_	57	punc	_	_	_	_	_
42	l'	le	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	effet	effet	NOM	_	_	57	subj	_	_	_	_	_
44	du	de	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	contexte	contexte	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	génétique	génétique	ADJ	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	sur	sur	PRE	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
48	l'	le	DET	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
49	accroissement	accroissement	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	de	de	PRE	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	de	de	PRE	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	l'	le	DET	_	_	54	spe	_	_	_	_	_
54	ADN	ADN	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
55	a	avoir	VRB	_	_	56	aux	_	_	_	_	_
56	été	être	VPP	_	_	57	aux	_	_	_	_	_
57	étudié	étudier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
58	.	.	PUNC	_	_	57	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1175
# text = Tous ces résultats sont présentés en anglais sous la forme de l'article suivant .
1	Tous	tout	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	résultats	résultat	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
4	sont	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	présentés	présenter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	anglais	anglais	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	sous	sous la forme de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	la	sous la forme de	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	forme	sous la forme de	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	sous la forme de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	article	article	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	suivant	suivant	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1176
# text = Cette étude a été complétée par l'analyse de l'effet de l'environnement sur le fitness conféré par les mutations isolées au sein de la population Ara- 1 affectant le niveau de superhélicité de l'ADN .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	étude	étude	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	a	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	complétée	compléter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	analyse	analyse	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	effet	effet	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	environnement	environnement	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	sur	sur	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	le	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	fitness	fin	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	conféré	conférer	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	par	par	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	les	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	mutations	mutation	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	isolées	isoler	VPP	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	au	au sein de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	sein	au sein de	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	de	au sein de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	la	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	population	population	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	Ara-	Ara-	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	1	1	NUM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	affectant	affecter	VPR	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
31	le	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	niveau	niveau	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	l'	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	ADN	ADN	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1177
# text = En effet , l'adaptation prolongée au milieu de l'évolution est associée à une augmentation de la superhélicité de l'ADN , mais celle  -ci pourrait avoir des effets pleïotropes dans d'autres milieux .
1	En	en effet	PRE	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	adaptation	adaptation	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
6	prolongée	prolonger	VPP	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	au	au milieu de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	milieu	au milieu de	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	au milieu de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	évolution	évolution	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	est	être	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	associée	associer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	une	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	augmentation	augmentation	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	l'	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	ADN	ADN	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
24	mais	mais	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
25	celle	celui	PRQ	_	_	27	subj	_	_	_	_	_
26	 -ci	 -ci	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	13	para	_	_	_	_	_
28	avoir	avoir	VNF	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	des	un	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	effets	effet	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	pleïotropes	héliotrope	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	dans	dans	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
33	d'	un	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
34	autres	autre	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
35	milieux	milieu	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1178
# text = Nous avons donc réalisé des compétitions entre chacune des souches décrites précédemment , 606 topA
1	Nous	nous	CLS	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	avons	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
3	donc	donc	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	réalisé	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	des	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	compétitions	compétition	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	entre	entre	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	chacune	chacun	PRQ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	des	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	souches	souche	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	décrites	décrire	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	précédemment	précédemment	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
14	606	606	NUM	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	topA	topA	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1179
# text = - 1 , souche isogénique à l'ancêtre sauf pour la mutation topA de la population Ara- 1 , 606 fis
1	-	-	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	souche	souche	NOM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
5	isogénique	isogénique	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	à	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	sauf	sauf	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	pour	pour	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	mutation	mutation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	topA	topA	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	population	population	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	Ara-	Ara-	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	1	1	NUM	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
19	,	1 , 606	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
20	606	606	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1180
# text = - 1 , isogénique à l'ancêtre sauf pour la mutation fis de la population Ara- 1 , et la souche ancêtre de départ .
1	-	-	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	isogénique	isogénique	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	à	à	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	sauf	sauf	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	pour	pour	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	mutation	mutation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	de	de+le	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	la	de+le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	population	population	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	Ara-	Ara-	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	1	1	NUM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	souche	souche	NOM	_	_	15	para	_	_	_	_	_
22	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	départ	départ	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1181
# text = Les résultats des expériences de compétitions sont résumés dans la Figure 28 .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	résultats	résultat	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	expériences	expérience	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	compétitions	compétition	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	sont	être	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	résumés	résumer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	Figure	Figure	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	28	28	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1182
# text = Les compétitions sont réalisées dans les mêmes conditions que celles décrites dans la Partie I des résultats .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	compétitions	compétition	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	réalisées	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
7	mêmes	même	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	conditions	condition	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	que	que	CSU	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	celles	celui	PRQ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	décrites	décrire	VPP	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	dans	dans	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	Partie	Partie	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	I	I	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	des	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	résultats	résultat	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1183
# text = Seul l'environnement , c'est-à-dire le milieu de culture ou la température d'incubation , est différent .
1	Seul	seul	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	l'	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	environnement	environnement	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
5	c'	c'est-à-dire	COO	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	est-à-dire	c'est-à-dire	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
7	le	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	milieu	milieu	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	culture	culture	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	ou	ou	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	température	température	NOM	_	_	8	para	_	_	_	_	_
14	d'	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	incubation	incubation	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
17	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	différent	différent	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1184
# text = Les effets initialement mesurés par des expériences de compétitions dans le milieu
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	effets	effet	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	initialement	initialement	ADV	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
4	mesurés	mesurer	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	des	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	expériences	expérience	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	compétitions	compétition	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
11	le	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	milieu	milieu	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1185
# text = DM25 de l'évolution expérimentale sont une augmentation du fitness de 13 % pour la souche 606 topA
1	DM25	DM25	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	évolution	évolution	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	une	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	augmentation	augmentation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	du	de+le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	fitness	fine	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	13	13	NUM	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	%	pourcent	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	pour	pour	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	souche	souche	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	606	606	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	topA	topA	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1186
# text = - 1 par rapport à l'ancêtre et de 3 % pour la souche 606 fis
1	-	-	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
3	par	par rapport à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	rapport	par rapport à	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	à	par rapport à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	3	para	_	_	_	_	_
10	3	3	NUM	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	%	pourcent	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	pour	pour	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	souche	souche	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	606	606	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1187
# text = - 1 . Dans tous les cas et dans tous les milieux testés , le marqueur arabinose a été vérifié comme étant neutre par compétition de l'ancêtre Ara + ( REL607 ) contre l'ancêtre Ara- ( REL606 ) .
1	-	-	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	Dans	Dans	PRE	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
5	tous	tout	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	cas	cas	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	4	para	_	_	_	_	_
10	tous	tout	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
11	les	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	milieux	milieu	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	testés	tester	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
15	le	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	marqueur	marqueur	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
17	arabinose	arabinose	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	a	avoir	VRB	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
19	été	être	VPP	_	_	20	aux	_	_	_	_	_
20	vérifié	vérifier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	comme	comme	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	étant	étant	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	neutre	neutre	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	par	par	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	compétition	compétition	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	l'	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	Ara	Ara	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	+	plus	COO	_	_	34	mark	_	_	_	_	_
31	(	(	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
32	REL607	REL607	NOM	_	_	30	parenth	_	_	_	_	_
33	)	)	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
34	contre	contre	PRE	_	_	26	para	_	_	_	_	_
35	l'	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	Ara-	Ara-	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	(	(	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
39	REL606	REL606	NOM	_	_	36	parenth	_	_	_	_	_
40	)	)	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
41	.	.	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1188
# text = En milieu riche ( LB ) et à 37 °C , les deux mutations fis et topA apportent chacune un bénéfice considérable de 65 à 70 % par rapport à l'ancêtre .
1	En	en	PRE	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
2	milieu	milieu	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	riche	riche	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	(	(	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
5	LB	LB	NOM	_	_	2	parenth	_	_	_	_	_
6	)	)	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	1	para	_	_	_	_	_
9	37	37	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	°C	degré	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	deux	deux	NUM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
14	mutations	mutation	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	fis	faire	VRB	_	_	27	det	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
17	topA	topA	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
18	apportent	apporter	VRB	_	_	15	para	_	_	_	_	_
19	chacune	chacun	PRQ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	un	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	bénéfice	bénéfice	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	considérable	considérable	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	65	65	NUM	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
25	à	à	PRE	_	_	23	para	_	_	_	_	_
26	70	70	NUM	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	%	pourcent	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
28	par	par rapport à	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
29	rapport	par rapport à	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	à	par rapport à	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	l'	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1189
# text = Cette augmentation de fitness est visible après seulement 24h de compétition .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	augmentation	augmentation	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	fitness	fine	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	visible	visible	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	après	après	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	seulement	seulement	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	24h	24h	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	compétition	compétition	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1190
# text = Pour donner un ordre de grandeur , rappelons que les clones évolués des 12 populations ont en moyenne un fitness accru de 70 % après 20 000 générations d'évolution et qu'ils possèdent plusieurs dizaines de mutations bénéfiques .
1	Pour	pour	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	donner	donner	VNF	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	un	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	ordre	ordre	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	grandeur	grandeur	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
8	rappelons	rappeler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	que	que	CSU	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	clones	clone	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
12	évolués	évolué	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	des	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	12	12	NUM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	populations	population	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	ont	avoir	VRB	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
17	en	en moyenne	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	moyenne	en moyenne	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	un	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	fitness	fin	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	accru	accroître	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	70	70	NUM	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	%	pourcent	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	après	après	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
26	20	20	NUM	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	000	000	NUM	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	générations	génération	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
29	d'	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	évolution	évolution	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	et	et	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
32	qu'	que	CSU	_	_	9	para	_	_	_	_	_
33	ils	ils	CLS	_	_	34	subj	_	_	_	_	_
34	possèdent	posséder	VRB	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	dizaines	dizaine	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	mutations	mutation	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1191
# text = Quand le milieu LB est dilué 2 fois , les valeurs de fitness sont toujours élevées :
1	Quand	quand	CSU	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
2	le	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	milieu	milieu	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
4	LB	LB	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	est	être	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	dilué	diluer	VPP	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
7	2	2	NUM	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	fois	fois	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	valeurs	valeur	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	fitness	fine	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	sont	être	VRB	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
15	toujours	toujours	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	élevées	élever	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	:	:	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1192
# text = + 22 % pour la mutation topA et + 6 , 5 % pour la mutation fis .
1	+	+ 22	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	22	22	NUM	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	%	pourcent	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
4	pour	pour	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	mutation	mutation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	topA	topA	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
9	+	+ 6 , 5	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
10	6	6	NUM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
11	,	+ 6 , 5	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
12	5	5	NUM	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	%	pourcent	NOM	_	_	6	para	_	_	_	_	_
14	pour	pour	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	mutation	mutation	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1193
# text = Ces valeurs sont intermédiaires entre celles mesurées en
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	valeurs	valeur	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	intermédiaires	intermédiaire	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	entre	entre	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	celles	celui	PRQ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	mesurées	mesurer	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	en	en	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1194
# text = DM25 et en LB .
1	DM25	DM25	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	et	et	COO	_	_	3	mark	_	_	_	_	_
3	en	en	PRE	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	LB	LB	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1195
# text = Un lien potentiel entre taux de croissance et bénéfice apporté par ces deux mutations pourrait exister .
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	lien	lien	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
3	potentiel	potentiel	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	entre	entre	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	taux	taux	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	croissance	croissance	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	bénéfice	bénéfice	NOM	_	_	5	para	_	_	_	_	_
10	apporté	apporter	VPP	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	ces	ce	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
13	deux	deux	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	mutations	mutation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	exister	exister	VNF	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1196
# text = Nous avons également testé l'effet des mutations dans un milieu contenant une autre source de carbone .
1	Nous	nous	CLS	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	avons	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
3	également	également	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	testé	tester	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	effet	effet	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	des	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	mutations	mutation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
10	un	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	milieu	milieu	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	contenant	contenir	VPR	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	une	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
14	autre	autre	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	source	source	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	carbone	carbone	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1197
# text = Des compétitions ont été réalisées dans les mêmes conditions que l'évolution ( milieu minimum DM25 , 37 °C ) mais le glucose a été remplacé par du maltose .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	compétitions	compétition	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	ont	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	réalisées	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	dans	dans	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	les	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
8	mêmes	même	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	conditions	condition	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	que	que	CSU	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	évolution	évolution	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	(	(	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
14	milieu	milieu	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	minimum	minimum	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	DM25	DM25	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
18	37	37	NUM	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	°C	degré	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	)	)	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
21	mais	mais	ADV	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
22	le	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	glucose	glucose	NOM	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
24	a	avoir	VRB	_	_	25	aux	_	_	_	_	_
25	été	être	VPP	_	_	26	aux	_	_	_	_	_
26	remplacé	remplacer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
27	par	par	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	du	de+le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	maltose	maltose	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	.	.	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1198
# text = Encore une fois , les deux mutations confèrent une augmentation de fitness de 6 % pour la mutation topA et 2 % pour la mutation fis .
1	Encore	encore	ADV	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	une	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	fois	fois	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
6	deux	deux	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	mutations	mutation	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
8	confèrent	conférer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	une	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	augmentation	augmentation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	fitness	fine	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	6	6	NUM	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	%	pourcent	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	pour	pour	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	mutation	mutation	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	topA	topA	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
21	2	2	NUM	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	%	pourcent	NOM	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
23	pour	pour	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	mutation	mutation	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	fis	faire	VRB	_	_	8	para	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1199
# text = Enfin , une sensibilité au froid ayant été observée dans des mutants & 206;& 148;topA ( Stupina et Wang , 2005 ) , nous avons testé l'effet d'une baisse de température sur le fitness de la souche 606 topA
1	Enfin	enfin	ADV	_	_	24	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	une	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	sensibilité	sensibilité	NOM	_	_	24	periph	_	_	_	_	_
5	au	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	froid	froid	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ayant	avoir	VPR	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	été	être	VPP	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	observée	observer	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	des	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	mutants	mutant	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	ΔtopA	ΔtopA	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	(	(	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	Stupina	Stupina	NOM	_	_	12	parenth	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
17	Wang	Wang	NOM	_	_	15	para	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
19	2005	2005	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	)	)	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
22	nous	nous	CLS	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
23	avons	avoir	VRB	_	_	24	aux	_	_	_	_	_
24	testé	tester	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
25	l'	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	effet	effet	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	d'	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	une	un	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	baisse	baisse	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	température	température	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	sur	sur	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
33	le	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	fitness	fine	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	la	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	souche	souche	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	606	606	NUM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	topA	topA	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1200
# text = - 1 . A 30 °C , cette mutation s'est également révélée bénéfique en augmentant le fitness de 12 % , ce qui est similaire à l'effet observé sur le fitness à 37 °C. Ceci confirme l'effet modéré de la mutation sur l'activité de la topoisomérase I , celle  -ci étant diminuée , mais pas supprimée .
1	-	-	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	A	A	PRE	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
5	30	30	NUM	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	°C	degré	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
8	cette	ce	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	mutation	mutation	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
10	s'	s'	CLI	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
11	est	être	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
12	également	également	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	révélée	révéler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	bénéfique	bénéfique	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	en	en	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	augmentant	augmenter	VPR	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	le	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	fitness	fine	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	12	12	NUM	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	%	pourcent	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	59	punc	_	_	_	_	_
23	ce	ce	PRQ	_	_	38	subj	_	_	_	_	_
24	qui	qui	PRQ	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
25	est	être	VRB	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	similaire	similaire	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	à	à	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	l'	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	effet	effet	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	observé	observer	VPP	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	sur	sur	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	le	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	fitness	fine	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	à	à	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	37	37	NUM	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	°C.	°C.	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	Ceci	Ceci	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	confirme	confirmer	VRB	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
39	l'	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	effet	effet	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	modéré	modérer	ADJ	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	de	de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	la	le	DET	_	_	44	spe	_	_	_	_	_
44	mutation	mutation	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	sur	sur	PRE	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	l'	le	DET	_	_	47	spe	_	_	_	_	_
47	activité	activité	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
48	de	de	PRE	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	la	le	DET	_	_	50	spe	_	_	_	_	_
50	topoisomérase	topoisomérase	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
51	I	I	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	,	,	PUNC	_	_	59	punc	_	_	_	_	_
53	celle	celui	PRQ	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
54	 -ci	 -ci	ADJ	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	étant	être	VPR	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
56	diminuée	diminuer	ADJ	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
57	,	,	PUNC	_	_	60	punc	_	_	_	_	_
58	mais	mais	COO	_	_	60	mark	_	_	_	_	_
59	pas	pas	ADV	_	_	0	root	_	_	_	_	_
60	supprimée	supprimer	VPP	_	_	56	para	_	_	_	_	_
61	.	.	PUNC	_	_	59	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1201
# text = Résultats Partie III Une Nouvelle Fonction de Régulation pour FIS
1	Résultats	résultat	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Partie	Partie	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	III	III	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	Une	Une	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	Nouvelle	Nouvelle	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	Fonction	Fonction	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	Régulation	Régulation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	pour	pour	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	FIS	FIS	VRB	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1202
# text = Comme nous l'avons vu dans l'introduction , la superhélicité de l'ADN et la protéine Fis jouent un rôle primordial dans l'organisation du chromosome d'E. coli ainsi que dans la transcription de nombreux gènes .
1	Comme	comme	CSU	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
2	nous	nous	CLS	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	l'	le	CLI	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
4	avons	avoir	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	vu	voir	VPP	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	dans	dans	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	introduction	introduction	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	ADN	ADN	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	protéine	protéine	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_
18	Fis	Fis	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	jouent	jouer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	un	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	rôle	rôle	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	primordial	primordial	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	dans	dans	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
24	l'	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	organisation	organisation	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	du	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	chromosome	chromosome	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	d'	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	E.	E.	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	coli	coli	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	ainsi	ainsi que	COO	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
32	que	ainsi que	COO	_	_	33	mark	_	_	_	_	_
33	dans	dans	PRE	_	_	28	para	_	_	_	_	_
34	la	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	transcription	transcription	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	de	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	nombreux	nombreux	ADJ	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
38	gènes	gène	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1203
# text = Des mutations dans les gènes topA et fis ayant été fixées au cours de l'évolution expérimentale , et démontrées comme étant bénéfiques ( voir Résultats , Partie I ) , nous avons voulu comprendre quels étaient les effets de ces mutations au sein de la cellule .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutations	mutation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	dans	dans	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	gènes	gène	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	topA	topA	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	fis	faire	VRB	_	_	2	para	_	_	_	_	_
9	ayant	avoir	VPR	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	été	être	VPP	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	fixées	fixer	VPP	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	au	à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	cours	cours	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de+le	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	l'	de+le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	évolution	évolution	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
20	démontrées	démontrer	VPP	_	_	17	para	_	_	_	_	_
21	comme	comme	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	étant	étant	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
23	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	(	(	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	voir	voir	VNF	_	_	16	parenth	_	_	_	_	_
26	Résultats	Résultats	NOM	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
28	Partie	Partie	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
29	I	I	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
30	)	)	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
32	nous	nous	CLS	_	_	34	subj	_	_	_	_	_
33	avons	avoir	VRB	_	_	34	aux	_	_	_	_	_
34	voulu	vouloir	VPP	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
35	comprendre	comprendre	VNF	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	quels	quel?	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
37	étaient	être	VRB	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	les	le	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	effets	effet	NOM	_	_	37	subj	_	_	_	_	_
40	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
41	ces	ce	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	mutations	mutation	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	au	au sein de	PRE	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	sein	au sein de	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	de	au sein de	PRE	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	la	le	DET	_	_	47	spe	_	_	_	_	_
47	cellule	cellule	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
48	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1204
# text = Pour cela , nous avons réalisé des électrophorèses protéiques bidimensionnelles , pour comparer les profils protéiques globaux des souches isogéniques à l'ancêtre portant les allèles évolués topA ou fis isolés dans la population Ara- 1 , à celui du clone ancêtre .
1	Pour	pour	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	cela	celer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
4	nous	nous	CLS	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	avons	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	réalisé	réaliser	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	des	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	électrophorèses	électrophorèse	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	protéiques	protéique	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	bidimensionnelles	bidimensionnel	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
12	pour	pour	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
13	comparer	comparer	VNF	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	profils	profil	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	protéiques	protéique	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	globaux	global	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	souches	souche	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	isogéniques	isogénique	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	à	à	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	l'	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	portant	porter	VPR	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	les	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	allèles	allèle	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	évolués	évolué	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	topA	topA	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	ou	ou	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
30	fis	faire	VRB	_	_	2	para	_	_	_	_	_
31	isolés	isoler	VPP	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	dans	dans	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	la	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	population	population	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	Ara-	Ara-	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	1	1	NUM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
37	,	,	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
38	à	à	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
39	celui	celui	PRQ	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	du	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	clone	clone	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1205
# text = Quelques protéines dont la quantité est modifiée par ces mutations ont été identifiées , dont la porine majeure OmpF d'E. coli B. Des analyses moléculaires et biochimiques plus précises ont ensuite été réalisées .
1	Quelques	quelque	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéines	protéine	NOM	_	_	34	subj	_	_	_	_	_
3	dont	dont	PRQ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	quantité	quantité	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
6	est	est	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	modifiée	modifier	VPP	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	par	par	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	ces	ce	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	mutations	mutation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	ont	avoir	VRB	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
12	été	été	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	identifiées	identifier	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
15	dont	dont	PRQ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	CLI	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	porine	potiner	VRB	_	_	13	para	_	_	_	_	_
18	majeure	majeur	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	OmpF	OmpF	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
20	d'	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	E.	E.	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	coli	coli	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	B.	B.	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	Des	Des	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	analyses	analyse	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	moléculaires	moléculaire	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
28	biochimiques	biochimique	ADJ	_	_	17	para	_	_	_	_	_
29	plus	plus	ADV	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	précises	précis	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	ont	avoir	VRB	_	_	33	aux	_	_	_	_	_
32	ensuite	ensuite	ADV	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
33	été	être	VPP	_	_	34	aux	_	_	_	_	_
34	réalisées	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1206
# text = Matériel et méthodes
1	Matériel	matériel	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	et	et	COO	_	_	3	mark	_	_	_	_	_
3	méthodes	méthode	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1207
# text = Milieux de cultures , souches et plasmides
1	Milieux	milieu	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	cultures	culture	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
5	souches	souche	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	7	mark	_	_	_	_	_
7	plasmides	plasmode	NOM	_	_	5	para	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1208
# text = Les souches analysées par électrophorèse bidimensionnelle ont été cultivées dans le milieu
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	souches	souche	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	analysées	analyser	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	par	par	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	électrophorèse	électrophorèse	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	bidimensionnelle	bidimensionnel	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ont	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	été	être	VPP	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	cultivées	cultiver	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	le	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	milieu	milieu	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1209
# text = DM250 .
1	DM250	DM250	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1210
# text = Il s'agit du même milieu que celui utilisé lors de l'évolution expérimentale ( voir
1	Il	il	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	s'	s'	CLI	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	agit	agir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	du	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	même	même	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	milieu	milieu	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	que	que	CSU	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	celui	celui	PRQ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	utilisé	utiliser	VPP	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	lors	lors de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	lors de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	évolution	évolution	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	(	(	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
16	voir	voir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1211
# text = Résultats , Partie I ) , mais avec une concentration 10 fois plus élevée en glucose , ce qui permet l'obtention d'une quantité suffisante de protéines .
1	Résultats	résultat	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
3	Partie	Partie	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	I	I	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
7	mais	mais	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	avec	avec	PRE	_	_	1	para	_	_	_	_	_
9	une	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	concentration	concentration	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	10	10	NUM	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	fois	fois	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	plus	plus	ADV	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
14	élevée	élever	VPP	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	en	en	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	glucose	glucose	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	ce	ce	PRQ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
19	qui	qui	PRQ	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
20	permet	permettre	VRB	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	l'	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	obtention	obtention	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	d'	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	une	un	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	quantité	quantité	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	suffisante	suffisant	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	protéines	protéine	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1212
# text = Les souches 606 , 606 topA
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	souches	souche	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	606	606	NUM	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
4	,	606 , 606	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
5	606	606	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	topA	topA	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1213
# text = - 1 , 606 fis
1	-	-	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	,	1 , 606	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	606	606	NUM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1214
# text = - 1 , 606 topA
1	-	-	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	,	1 , 606	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	606	606	NUM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	topA	toper	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1215
# text = - 1 fis
1	-	-	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1216
# text = - 1 et 606 & 226;& 136;& 134; fis utilisées ici ont été décrites auparavant ( Tableau
1	-	-	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
4	606	606	NUM	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	∆	∆	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
6	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	utilisées	utiliser	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	ici	ici	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	ont	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	été	été	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	décrites	décrire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	auparavant	auparavant	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	(	(	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
14	Tableau	Tableau	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1217
# text = 1 ) , et dérivent toutes de l'ancêtre REL606 .
1	1	1	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	dérivent	dériver	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	toutes	tout	PRQ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	REL606	REL606	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1218
# text = La souche d'E. coli
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	souche	souche	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	E.	E.	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	coli	coli	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1219
# text = K12 utilisée est CF7968 ( MG1655 rph
1	K12	K12	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	utilisée	utiliser	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	CF7968	CF7968	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	(	(	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
6	MG1655	MG1655	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	rph	rph	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1220
# text = + & 206;& 148;lacI-Z ) et nous a été fournie par Michael
1	+	+	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	ΔlacI-Z	ΔlacI-Z	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	)	)	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
5	nous	le	CLI	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
6	a	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	été	être	VPP	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	fournie	fournir	VPP	_	_	2	para	_	_	_	_	_
9	par	par	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	Michael	Michael	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1221
# text = Cashel .
1	Cashel	cashel	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1222
# text = Une délétion de fis a également été construite dans cette souche , ce qui a conduit à la souche K 12 & 226;& 136;& 134; fis .
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	délétion	délétion	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	également	également	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	été	être	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	construite	construire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	cette	ce	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	souche	souche	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
13	ce	ce	PRQ	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
14	qui	qui	PRQ	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
15	a	avoir	VRB	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	conduit	conduire	VPP	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	à	à	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	souche	souche	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	K	K	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	12	12	NUM	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	∆	∆	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
23	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1223
# text = Sa construction a été réalisée par recombinaison homologue dans le chromosome en utilisant le plasmide suicide pKO 3 ( comme décrit dans la Partie I des
1	Sa	son	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	construction	construction	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	a	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	réalisée	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	homologue	homologue	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	le	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	chromosome	chromosome	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
13	utilisant	utiliser	VPR	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	le	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	plasmide	plasmode	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	suicide	suicide	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	pKO	pKO	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	3	3	NUM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	(	(	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
20	comme	comme	CSU	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	décrit	décrire	VRB	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	dans	dans	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	Partie	Partie	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	I	I	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	des	de+le	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1224
# text = Résultats ) .
1	Résultats	résultat	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1225
# text = Les plasmides pRS 550 et pRS 551 , permettant la construction de fusions transcriptionnelles avec le gène rapporteur lacZ , ont été décrits par
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	plasmides	plasmode	NOM	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
3	pRS	pRS	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	550	550	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	pRS	pRS	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
7	551	551	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
9	permettant	permettre	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	construction	construction	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	fusions	fusion	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	transcriptionnelles	transcriptionnel	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	avec	avec	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
16	le	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	gène	gène	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	rapporteur	rapporteur	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	lacZ	lacZ	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
21	ont	avoir	VRB	_	_	22	aux	_	_	_	_	_
22	été	être	VPP	_	_	23	aux	_	_	_	_	_
23	décrits	décrire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	par	par	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1226
# text = Simons et al. ( 1987 ) .
1	Simons	Simons	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	et	et	COO	_	_	3	mark	_	_	_	_	_
3	al.	al.	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	(	(	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
5	1987	1987	NUM	_	_	1	parenth	_	_	_	_	_
6	)	)	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1227
# text = Electrophorèses bidimensionnelles
1	Electrophorèses	électrophorèse	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	bidimensionnelles	bidimensionnel	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1228
# text = Le principe est d'effectuer une double séparation sur un échantillon protéique , la première se faisant en fonction du point isoélectrique et la seconde en fonction de la masse molaire des protéines .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	principe	principe	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	effectuer	effectuer	VNF	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	une	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
7	double	double	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	séparation	séparation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	sur	sur	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	un	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	échantillon	échantillon	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	protéique	protéique	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	première	premier	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_
16	se	se	CLI	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	faisant	faire	VPR	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	en	en	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	fonction	fonction	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	du	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	point	point	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	isoélectrique	isoélectrique	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	seconde	seconde	NOM	_	_	15	para	_	_	_	_	_
26	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
27	fonction	fonction	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	masse	masse	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	molaire	molaire	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	des	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	protéines	protéine	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1229
# text = Des précultures de nuit des souches d'intérêt ont été réalisées dans du milieu DM250 , puis diluées au 1 / 100ème dans 1L de milieu DM250 , incubées à 37 °C avec agitation jusqu'à une DO 600 nm = 0 , 1 ( début de phase exponentielle ) , et centrifugées .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	précultures	pré-	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	nuit	nuit	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	souches	souche	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	intérêt	intérêt	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	ont	avoir	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	été	être	VPP	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	réalisées	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	dans	dans	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	du	de+le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	milieu	milieu	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	DM250	DM250	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
17	puis	puis	CSU	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
18	diluées	diluer	VPP	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	au	à	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	1	1	NUM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
21	/	1 / 100ème	PUNC	_	_	52	punc	_	_	_	_	_
22	100ème	100ème	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	dans	dans	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
24	1L	1L	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	milieu	milieu	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	DM250	DM250	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	52	punc	_	_	_	_	_
29	incubées	incuber	VPP	_	_	40	subj	_	_	_	_	_
30	à	à	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	37	37	NUM	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	°C	degré	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	avec	avec	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
34	agitation	agitation	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	jusqu'à	jusqu'à	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
36	une	un	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	DO	DO	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	600	600	NUM	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	nm	minute	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	=	égaler	VRB	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
41	0	0	NUM	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
42	,	0 , 1	PUNC	_	_	52	punc	_	_	_	_	_
43	1	1	NUM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
44	(	(	PUNC	_	_	45	punc	_	_	_	_	_
45	début	début	NOM	_	_	43	parenth	_	_	_	_	_
46	de	de	PRE	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	phase	phase	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	)	)	PUNC	_	_	45	punc	_	_	_	_	_
50	,	,	PUNC	_	_	52	punc	_	_	_	_	_
51	et	et	COO	_	_	52	mark	_	_	_	_	_
52	centrifugées	centrifuger	NUM	_	_	18	para	_	_	_	_	_
53	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1230
# text = Les culots sont lavés dans 50 mM de Tris pH 8 , resuspendus dans 200 µL d'une solution de 50 mM Tris pH 8 , 0 , 2M DTT , 0 , 3 % SDS et 1 mM EDTA , et chauffés à 100 °C pendant 5 min .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	culots	culot	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	lavés	laver	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	50	50	NUM	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	mM	millimètre	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	Tris	Tris	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	pH	pH	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	8	8	NUM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	resuspendus	re-	VPP	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	dans	dans	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	200	200	NUM	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	µL	micro-	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	d'	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	une	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	solution	solution	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	50	50	NUM	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	mM	millimètre	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	Tris	Tris	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	pH	pH	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	8	8	NUM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
27	0	0	NUM	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
28	,	0 , 2m	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
29	2M	2M	NUM	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	DTT	DTT	NOM	_	_	22	para	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
32	0	0	NUM	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
33	,	0 , 3	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
34	3	3	NUM	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	%	pourcent	NOM	_	_	30	para	_	_	_	_	_
36	SDS	SDS	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	et	et	COO	_	_	39	mark	_	_	_	_	_
38	1	1	NUM	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	mM	millimètre	NOM	_	_	30	para	_	_	_	_	_
40	EDTA	EDTA	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	,	,	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
42	et	et	COO	_	_	43	mark	_	_	_	_	_
43	chauffés	chauffer	VPP	_	_	13	para	_	_	_	_	_
44	à	à	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	100	100	NUM	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
46	°C	degré	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	pendant	pendant	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
48	5	5	NUM	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
49	min	minute	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1231
# text = Vingt microlitres d'une solution contenant 50 mM Tris pH 7 , 5 , 50 mM MgCl 2 , 1 mg / mL DNaseI et 0 , 25 mg / mL RNase A sont ajoutés aux extraits cellulaires et le tout est incubé pendant 10 min sur la glace .
1	Vingt	vingt	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	microlitres	micro-	NOM	_	_	35	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	une	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	solution	solution	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	contenant	contenir	VPR	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	50	50	NUM	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	mM	millimètre	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	Tris	Tris	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	pH	pH	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	7	7	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
13	5	5	NUM	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
14	,	5 , 50	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
15	50	50	NUM	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	mM	millimètre	NOM	_	_	5	para	_	_	_	_	_
17	MgCl	MgCl	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	2	2	NUM	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
19	,	2 , 1	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
20	1	1	NUM	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	mg	milligramme	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
22	/	sur	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
23	mL	millilitre	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	DNaseI	DNaseI	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
26	0	0	NUM	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
27	,	0 , 25	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
28	25	25	NUM	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	mg	milligramme	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
30	/	sur	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
31	mL	millilitre	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	RNase	RNase	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	A	A	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
34	sont	être	VRB	_	_	35	aux	_	_	_	_	_
35	ajoutés	ajouter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
36	aux	à	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	extraits	extrait	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	cellulaires	cellulaire	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	et	et	COO	_	_	43	mark	_	_	_	_	_
40	le	le	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	tout	tout	ADJ	_	_	43	subj	_	_	_	_	_
42	est	être	VRB	_	_	43	aux	_	_	_	_	_
43	incubé	incuber	VPP	_	_	35	para	_	_	_	_	_
44	pendant	pendant	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	10	10	NUM	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
46	min	minimum	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	sur	sur	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
48	la	le	DET	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
49	glace	glace	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	.	.	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1232
# text = Les protéines sont solubilisées par l'ajout de 800 µL d'un tampon contenant 10M urée , 4 % NP40 , 0 , 1M DTT et 2 , 2 % ampholines avec une gamme de pH allant de 3 à 10 ( v / v ) ( Amersham Pharmacia ) .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéines	protéine	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	solubilisées	solubiliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ajout	ajout	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	800	800	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	µL	micro-	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	d'	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	un	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	tampon	tampon	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	contenant	contenir	VPR	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	10M	10M	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	urée	urée	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
18	4	4	NUM	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	%	pourcent	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
20	NP40	NP40	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
22	0	0	NUM	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
23	,	0 , 1m	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
24	1M	1M	NUM	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	DTT	DTT	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
27	2	2	NUM	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
28	,	2 , 2	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
29	2	2	NUM	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	%	pourcent	NOM	_	_	25	para	_	_	_	_	_
31	ampholines	ampholyte	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	avec	avec	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
33	une	un	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	gamme	gamme	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	pH	pH	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	allant	aller	VPR	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
39	3	3	NUM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	à	à	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
41	10	10	NUM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	(	(	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
43	v	verset	NOM	_	_	41	parenth	_	_	_	_	_
44	/	sur	PUNC	_	_	49	punc	_	_	_	_	_
45	v	vers	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	)	)	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
47	(	(	PUNC	_	_	49	punc	_	_	_	_	_
48	Amersham	Amersham	NOM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
49	Pharmacia	Pharmacia	NOM	_	_	7	parenth	_	_	_	_	_
50	)	)	PUNC	_	_	49	punc	_	_	_	_	_
51	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1233
# text = Les échantillons sont stockés à - 20 °C. Les électrophorèses bidimensionnelles en gels de polyacrylamide ont été réalisées avec un système
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	échantillons	échantillon	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	stockés	stocker	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	à	à	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	-	- 20	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
7	20	20	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	°C.	°C.	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
9	Les	Les	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	électrophorèses	électrophorèse	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	bidimensionnelles	bidimensionnel	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	en	en	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	gels	gel	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	polyacrylamide	polyacrylamide	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	ont	avoir	VRB	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
17	été	être	VPP	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
18	réalisées	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	avec	avec	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	un	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	système	système	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1234
# text = Multiphor II ( Amersham Pharmacia ) pour l'isoélectrofocalisation et Protean II xi cell
1	Multiphor	Multiphor	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	II	II	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	(	(	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
4	Amersham	Amersham	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	Pharmacia	Pharmacia	NOM	_	_	1	parenth	_	_	_	_	_
6	)	)	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
7	pour	pour	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	isoélectrofocalisation	isoélectrofocalisation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
11	Protean	Protean	NOM	_	_	9	para	_	_	_	_	_
12	II	II	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	xi	xi	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	cell	cell	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1235
# text = ( Bio-Rad , Hercules , CA ) pour la seconde dimension .
1	(	(	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
2	Bio-Rad	Bio-Rad	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	Hercules	Hercules	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
6	CA	CA	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
8	pour	pour	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
10	seconde	second	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	dimension	dimension	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1236
# text = Les bandes de première dimension ( 18 cm , gamme de pH de 4 à 8 ) sont réhydratées dans les échantillons protéiques ( 500 mg ) préparés dans
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	bandes	bande	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	première	premier	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	dimension	dimension	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	(	(	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
7	18	18	NUM	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	cm	centimètre	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
10	gamme	gamme	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	pH	pH	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	4	4	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
16	8	8	NUM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	)	)	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
18	sont	être	VRB	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
19	réhydratées	réhydrater	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	dans	dans	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	les	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	échantillons	échantillon	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	protéiques	protéique	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	(	(	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
25	500	500	NUM	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	mg	milligramme	NOM	_	_	22	parenth	_	_	_	_	_
27	)	)	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
28	préparés	préparer	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
29	dans	dans	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1237
# text = 2M thiourée , 5M urée , 1 , 6 % 3 - [ ( 3- cholamidopropyl ) -diméthylammonio ] - 1- propanesulfonate ( p / v ) , 100 mM DTT et 0 , 8 % ampholines .
1	2M	2M	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	thiourée	chourer	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
4	5M	5M	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	urée	urée	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
7	1	1	NUM	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
8	,	1 , 6	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
9	6	6	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	%	pourcent	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	3	3	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	-	-	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
13	[	(	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
14	(	(	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
15	3-	3-	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	cholamidopropyl	cholamidopropyl	ADV	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
17	)	)	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	-diméthylammonio	-diméthylammonio	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	]	)	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
20	-	-	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	1-	1-	NUM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	propanesulfonate	propane	N+V	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	(	(	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
24	p	page	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
25	/	sur	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
26	v	vers	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	)	)	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
29	100	100	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
30	mM	mM	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
31	DTT	DTT	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
32	et	et	COO	_	_	36	mark	_	_	_	_	_
33	0	0	NUM	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
34	,	0 , 8	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
35	8	8	NUM	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	%	pourcent	NOM	_	_	31	para	_	_	_	_	_
37	ampholines	ampholyte	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	.	.	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1238
# text = L'isoélectrofocalisation est effectuée jusqu'à atteindre l'équilibre de pH ( Lelong et Rabilloud , 2003 ) .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	isoélectrofocalisation	isoélectrofocalisation	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	effectuée	effectuer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	jusqu'à	jusqu'à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	atteindre	atteindre	VNF	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	équilibre	équilibre	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	pH	pH	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	(	(	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	Lelong	Lelong	NOM	_	_	8	parenth	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	Rabilloud	Rabilloud	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	2003	2003	NUM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
17	)	)	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1239
# text = Les bandes sont ensuite équilibrées pendant
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	bandes	bande	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	ensuite	ensuite	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	équilibrées	équilibré	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	pendant	pendant	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1240
# text = 10 min dans une solution de Tris pH 6 , 8 contenant 2 , 5 % SDS , 30 % glycérol , 6M urée et 50 mM DTT .
1	10	10	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	min	minimum	NOM	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
3	dans	dans	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	une	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	solution	solution	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	Tris	Tris	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	pH	pH	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	6	6	NUM	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
10	,	6 , 8	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
11	8	8	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	contenant	contenir	VPR	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
13	2	2	NUM	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
14	,	2 , 5	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
15	5	5	NUM	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	%	pourcent	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
17	SDS	SDS	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
19	30	30	NUM	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	%	pourcent	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	glycérol	glycérol	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
23	6M	6M	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	urée	urée	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
26	50	50	NUM	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	mM	millimètre	NOM	_	_	24	para	_	_	_	_	_
28	DTT	DTT	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1241
# text = Cette étape est effectuée une seconde fois en remplaçant le DTT par 100 mM d'iodoacétamide .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	étape	étape	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	effectuée	effectuer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
6	seconde	second	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	fois	fois	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	en	en	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	remplaçant	remplacer	VPR	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	le	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	DTT	DTT	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	par	par	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	100	100	NUM	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	mM	millimètre	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	d'	de	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	iodoacétamide	de	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1242
# text = Pour la seconde dimension , l'électrophorèse est réalisée comme décrit précédemment ( Laemmli , 1970 ) , en utilisant des gels d'acrylamide à 12 % , avec les modifications suivantes :
1	Pour	pour	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	seconde	second	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	dimension	dimension	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	électrophorèse	électrophorèse	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
8	est	être	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	réalisée	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	comme	comme	CSU	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	décrit	décrire	VPP	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	précédemment	précédemment	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	(	(	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	Laemmli	Laemmli	NOM	_	_	11	parenth	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
16	1970	1970	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	)	)	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	en	en	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
20	utilisant	utiliser	VPR	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	des	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	gels	gel	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	d'	de	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	acrylamide	de	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	à	à	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	12	12	NUM	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	%	pourcent	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	avec	avec	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
30	les	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	modifications	modification	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	suivantes	suivant	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	:	:	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1243
# text = les tampons de migration de la cathode et de l'anode sont remplacés par une solution de 50 mM
1	les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	tampons	tampon	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	migration	migration	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	cathode	cathode	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	5	para	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	anode	anode	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	sont	être	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	remplacés	remplacer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	par	par	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	une	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	solution	solution	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	50	50	NUM	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	mM	millimètre	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1244
# text = Tris , 0 , 1 % SDS et 200 mM taurine ou 380 mM glycine , respectivement .
1	Tris	tri	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
3	0	0	NUM	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
4	,	0 , 1	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
5	1	1	NUM	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	%	pourcent	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
7	SDS	SDS	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
9	200	200	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	mM	mM	NOM	_	_	6	para	_	_	_	_	_
11	taurine	taurin	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	ou	ou	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
13	380	380	NUM	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	mM	millimètre	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
15	glycine	glycine	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
17	respectivement	respectivement	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1245
# text = Les protéines sont ensuite colorées au bleu de Coomassie ou au nitrate d'argent .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéines	protéine	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
4	ensuite	ensuite	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	colorées	colorer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	au	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	bleu	bleu	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	Coomassie	Coomassie	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	ou	ou	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
11	au	à	PRE	_	_	6	para	_	_	_	_	_
12	nitrate	nitrate	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	d'	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	argent	argent	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1246
# text = Analyse des électrophorèses bidimensionnelles
1	Analyse	analyse	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	électrophorèses	électrophorèse	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	bidimensionnelles	bidimensionnel	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1247
# text = Le profil protéique global des 5 souches ( 606 , 606 topA
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	profil	profil	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	protéique	protéique	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	global	global	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	5	5	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	souches	souche	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	(	(	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
9	606	606	NUM	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
10	,	606 , 606	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
11	606	606	NUM	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	topA	topA	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1248
# text = - 1 , 606 fis
1	-	-	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	,	1 , 606	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	606	606	NUM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1249
# text = - 1 , 606 topA
1	-	-	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	,	1 , 606	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	606	606	NUM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	topA	toper	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1250
# text = - 1 fis
1	-	-	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1251
# text = - 1 , 606 & 206;& 148; fis ) a été réalisé en triplicats à partir de 3 cultures indépendantes de chaque souche .
1	-	-	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	,	1 , 606	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	606	606	NUM	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	Δ	Δ	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	été	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	réalisé	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	en	en	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	triplicats	triplicata	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	à	à partir de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	partir	à partir de	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	à partir de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	3	3	NUM	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	cultures	culture	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	indépendantes	indépendant	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	chaque	chaque	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	souche	souche	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1252
# text = Chaque série de 5 souches a été effectuée le même jour , avec les mêmes solutions , pour donner un maximum de reproductibilité .
1	Chaque	chaque	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	série	série	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	5	5	NUM	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	souches	souche	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	a	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	été	être	VPP	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	effectuée	effectuer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	le	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
10	même	même	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	jour	jour	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
13	avec	avec	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
15	mêmes	même	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	solutions	solution	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	pour	pour	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
19	donner	donner	VNF	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	un	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	maximum	maximum	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	reproductibilité	reproductibilité	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1253
# text = Chaque profil a été comparé à celui de l'ancêtre , et seules les protéines dont la quantité variait dans le même sens pour chacun des
1	Chaque	chaque	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	profil	profil	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	a	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	comparé	comparer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	à	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	celui	celui	PRQ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
13	seules	seul	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	protéines	protéine	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
16	dont	dont	PRQ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	quantité	quantité	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
19	variait	varier	VRB	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
20	dans	dans	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	le	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
22	même	même	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	sens	sens	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	pour	pour	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
25	chacun	chacun	PRQ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	des	de+le	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1254
# text = 3 réplicats ont été analysées .
1	3	3	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	réplicats	repli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	ont	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	été	être	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	analysées	analysé	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1255
# text = Les spots correspondants ont été excisés à partir de gels colorés au bleu de Coomassie , oxydés par 7 % de H2O2 , et soumis à une digestion tryptique .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	spots	spot	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	correspondants	correspondant	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ont	avoir	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	été	être	VPP	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	excisés	exciser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	à	à partir de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	partir	à partir de	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	à partir de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	gels	gel	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	colorés	coloré	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	au	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	bleu	bleu	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	Coomassie	Coomassie	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
17	oxydés	oxyder	VPP	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
18	par	par	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	7	7	NUM	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	%	pourcent	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	H2O2	H2O2	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
24	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
25	soumis	soumettre	VPP	_	_	17	para	_	_	_	_	_
26	à	à	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	une	un	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	digestion	digestion	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	tryptique	tryptique	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1256
# text = Les peptides ont été analysés par MALDI & 226;& 128;& 147; TOF & 226;& 128;& 147; MS ( matrix-assisted laser desorption ionization & 226;& 128;& 147; time of flight & 226;& 128;& 147; mass spectrometry ) par resuspension dans une solution matrice ( acide & 206;& 177;-cyano- 4- hydroxycinnamique à mi-saturation dans 60 % d'acétonitrile et 0 , 1 % d'acide trifluoroacétique ) .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	peptides	peptide	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	ont	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	analysés	analyser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	MALDI	MALDI	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
8	–	maldi – tof – ms ( matrix-assisted laser desorption ionization – time of flight – mass spectrometry )	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
9	TOF	TOF	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
10	–	maldi – tof – ms ( matrix-assisted laser desorption ionization – time of flight – mass spectrometry )	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
11	MS	MS	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
12	(	maldi – tof – ms ( matrix-assisted laser desorption ionization – time of flight – mass spectrometry )	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	matrix-assisted	maldi – tof – ms ( matrix-assisted laser desorption ionization – time of flight – mass spectrometry )	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
14	laser	maldi – tof – ms ( matrix-assisted laser desorption ionization – time of flight – mass spectrometry )	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
15	desorption	maldi – tof – ms ( matrix-assisted laser desorption ionization – time of flight – mass spectrometry )	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
16	ionization	maldi – tof – ms ( matrix-assisted laser desorption ionization – time of flight – mass spectrometry )	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
17	–	maldi – tof – ms ( matrix-assisted laser desorption ionization – time of flight – mass spectrometry )	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
18	time	maldi – tof – ms ( matrix-assisted laser desorption ionization – time of flight – mass spectrometry )	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
19	of	maldi – tof – ms ( matrix-assisted laser desorption ionization – time of flight – mass spectrometry )	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
20	flight	maldi – tof – ms ( matrix-assisted laser desorption ionization – time of flight – mass spectrometry )	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
21	–	maldi – tof – ms ( matrix-assisted laser desorption ionization – time of flight – mass spectrometry )	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
22	mass	maldi – tof – ms ( matrix-assisted laser desorption ionization – time of flight – mass spectrometry )	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
23	spectrometry	maldi – tof – ms ( matrix-assisted laser desorption ionization – time of flight – mass spectrometry )	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	)	maldi – tof – ms ( matrix-assisted laser desorption ionization – time of flight – mass spectrometry )	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
25	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
26	resuspension	re-	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	dans	dans	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
28	une	un	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	solution	solution	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	matrice	matrice	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	(	(	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
32	acide	acide	NOM	_	_	29	parenth	_	_	_	_	_
33	α-cyano-	α-cyano- 4- hydroxycinnamique	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
34	4-	4-	NUM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
35	hydroxycinnamique	α-cyano- 4- hydroxycinnamique	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
36	à	à	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
37	mi-saturation	mi-	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	dans	dans	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	60	60	NUM	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	%	pourcent	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	d'	de	ADV	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	acétonitrile	de	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	et	et	COO	_	_	47	mark	_	_	_	_	_
44	0	0	NUM	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
45	,	0 , 1	PUNC	_	_	47	punc	_	_	_	_	_
46	1	1	NUM	_	_	47	spe	_	_	_	_	_
47	%	pourcent	NOM	_	_	40	para	_	_	_	_	_
48	d'	de	PRE	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	acide	acide	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	trifluoroacétique	trifluoroacétique	ADJ	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	)	)	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
52	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1257
# text = L'analyse est ensuite faite avec un spectromètre de masse MALDI-TOF ( Autoflex , Bruker Daltonik , Bremen , Allemagne ) en mode extraction avec une gamme de masse de 0 à 4200 Da .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	analyse	analyse	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
4	ensuite	ensuite	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	faite	faire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	avec	avec	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	un	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	spectromètre	spectromètre	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	masse	masse	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	MALDI-TOF	MALDI-TOF	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	(	(	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
13	Autoflex	Autoflex	NOM	_	_	8	parenth	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
15	Bruker	Bruker	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	Daltonik	Daltonik	NOM	_	_	15	para	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	Bremen	Bremen	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	Allemagne	Allemagne	NOM	_	_	18	para	_	_	_	_	_
21	)	)	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
22	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
23	mode	mode	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	extraction	extraction	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	avec	avec	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	une	un	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	gamme	gamme	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	masse	masse	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
31	0	0	NUM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	à	à	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
33	4200	4200	NUM	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	Da	Da	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1258
# text = Une recherche consécutive automatique dans la base de données Swissprot Trembl a été effectuée à l'aide du logiciel Mascot .
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	recherche	recherche	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
3	consécutive	consécutif	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	automatique	automatique	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	base	base	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	données	donnée	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	Swissprot	Swissprot	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	Trembl	Trembl	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	a	avoir	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	été	être	VPP	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	effectuée	effectuer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	aide	aide	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	du	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	logiciel	logiciel	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	Mascot	Mascot	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1259
# text = Lorsqu'aucun résultat n'a été obtenu par cette méthode , une analyse par nano-LC & 226;& 128;& 147; TMS / MS ( nano-liquid chromatography & 226;& 128;& 147; tandem mass spectrometry ) a été réalisée .
1	Lorsqu'	lorsque	CSU	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	aucun	aucun	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	résultat	résultat	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
4	n'	ne	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
5	a	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	été	être	VPP	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	obtenu	obtenir	VPP	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	par	par	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	cette	ce	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	méthode	méthode	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
12	une	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	analyse	analyse	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	par	par	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	nano-LC	nano-lc – tms / ms	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
16	–	nano-lc – tms / ms	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
17	TMS	TMS	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
18	/	nano-lc – tms / ms	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
19	MS	MS	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
20	(	(	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
21	nano-liquid	nano-liquid chromatography –	NOM	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
22	chromatography	nano-liquid chromatography –	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	–	nano-liquid chromatography –	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	tandem	tandem	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	mass	mas	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	spectrometry	spectrometry	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	)	)	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
28	a	avoir	VRB	_	_	29	aux	_	_	_	_	_
29	été	être	VPP	_	_	30	aux	_	_	_	_	_
30	réalisée	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1260
# text = Les peptides ont alors été extraits avec de l'acide formique et de l'acétonitrile et injectés dans un système CapLC ( Waters , Milford , MA ) nanoLC directement couplé à un spectromètre de masse QTOF Ultima ( Waters ) .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	peptides	peptide	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	ont	avoir	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
4	alors	alors	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
5	été	être	VPP	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	extraits	extraire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	avec	avec	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de+le	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	l'	de+le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	acide	acide	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	formique	formique	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	7	para	_	_	_	_	_
14	l'	le	NOM	_	_	15	det	_	_	_	_	_
15	acétonitrile	le	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
17	injectés	injecter	VPP	_	_	6	para	_	_	_	_	_
18	dans	dans	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	un	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	système	système	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	CapLC	CapLC	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	(	(	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
23	Waters	Waters	NOM	_	_	20	parenth	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	Milford	Milford	NOM	_	_	23	para	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
27	MA	MA	NOM	_	_	25	para	_	_	_	_	_
28	)	)	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
29	nanoLC	nanoLC	ADV	_	_	31	periph	_	_	_	_	_
30	directement	directement	ADV	_	_	31	periph	_	_	_	_	_
31	couplé	coupler	VPP	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
32	à	à	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	un	un	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	spectromètre	spectromètre	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	masse	masse	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	QTOF	QTOF	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	Ultima	Ultima	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	(	(	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
40	Waters	Waters	NOM	_	_	36	parenth	_	_	_	_	_
41	)	)	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
42	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1261
# text = L'acquisition des données est faite avec le logiciel MassLynx ( Waters ) , et l'identification des protéines est alors effectuée de la même façon que précédemment .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	acquisition	acquisition	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	données	donnée	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	est	être	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	faite	faire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	avec	avec	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	logiciel	logiciel	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	MassLynx	MassLynx	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	(	(	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	Waters	Waters	NOM	_	_	9	parenth	_	_	_	_	_
13	)	)	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	identification	identification	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
18	des	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	protéines	protéine	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	est	être	VRB	_	_	22	aux	_	_	_	_	_
21	alors	alors	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	effectuée	effectuer	VPP	_	_	6	para	_	_	_	_	_
23	de	de la même façon	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	de la même façon	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
25	même	de la même façon	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	façon	de la même façon	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
27	que	que	ADV	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	précédemment	précédemment	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1262
# text = Toutes les analyses par spectrométrie de masse ont été réalisées par Lauriane Kühn dans le cadre d'une collaboration avec le laboratoire Chimie des Protéines ( DRDC-CI , ERM0201 CEA / INSERM / UJF , CEA , Grenoble ) dirigé par Jérôme Garin .
1	Toutes	tout	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	analyses	analyse	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
4	par	par	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	spectrométrie	spectrométrie	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	masse	masse	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ont	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	été	être	VPP	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	réalisées	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	Lauriane	Lauriane	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	Kühn	Kühn	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	dans	dans	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	le	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	cadre	cadre	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	d'	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	une	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	collaboration	collaboration	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	avec	avec	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	le	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	laboratoire	laboratoire	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	Chimie	Chimie	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	des	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	Protéines	Protéines	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	(	(	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
27	DRDC-CI	DRDC-CI	NOM	_	_	25	parenth	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
29	ERM0201	ERM0201	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	CEA	CEA	NOM	_	_	27	para	_	_	_	_	_
31	/	ou	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
32	INSERM	INSERM	NOM	_	_	30	para	_	_	_	_	_
33	/	ou	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
34	UJF	UJF	NOM	_	_	30	para	_	_	_	_	_
35	,	,	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
36	CEA	CEA	NOM	_	_	34	para	_	_	_	_	_
37	,	,	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
38	Grenoble	Grenoble	NOM	_	_	36	para	_	_	_	_	_
39	)	)	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
40	dirigé	diriger	VPP	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
41	par	par	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	Jérôme	Jérôme	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	Garin	Garin	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1263
# text = Fusions transcriptionnelles
1	Fusions	fusion	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	transcriptionnelles	transcriptionnel	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1264
# text = La transcription des gènes ompF , ompC , ompR , micF et greB a été analysée par construction de fusions transcriptionnelles des promoteurs de chacun de ces gènes avec le gène rapporteur lacZ , codant la & 206;& 178;-galactosidase .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	transcription	transcription	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	gènes	gène	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ompF	ompF	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	ompC	ompC	ADJ	_	_	5	para	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
9	ompR	ompR	ADJ	_	_	7	para	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	micF	micF	ADJ	_	_	7	para	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	greB	greB	ADJ	_	_	7	para	_	_	_	_	_
14	a	avoir	VRB	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
15	été	être	VPP	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	analysée	analyser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	par	par	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	construction	construction	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	fusions	fusion	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	transcriptionnelles	transcriptionnel	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	des	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	chacun	chacun	PRQ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	ces	ce	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	gènes	gène	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	avec	avec	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	le	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	gène	gène	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	rapporteur	rapporteur	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	lacZ	lacZ	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	,	,	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_
35	codant	coder	VPR	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
36	la	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	β-galactosidase	β-galactosidase	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1265
# text = Les gènes micF et greB ont été inclus dans cette analyse car leur région promotrice est adjacente et divergente de celle de ompC et ompR , respectivement .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	gènes	gène	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	micF	micF	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	greB	greB	ADJ	_	_	3	para	_	_	_	_	_
6	ont	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	été	être	VPP	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	inclus	inclure	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	cette	ce	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	analyse	analyse	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	car	car	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
13	leur	son	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	région	région	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
15	promotrice	promoteur	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	est	être	VRB	_	_	8	para	_	_	_	_	_
17	adjacente	adjacent	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	divergente	divergent	ADJ	_	_	17	para	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	celle	celui	PRQ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	ompC	ompC	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
25	ompR	uwSe	VPP	_	_	16	para	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
27	respectivement	respectivement	ADV	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1266
# text = Les fragments contenant les différentes régions promotrices ont été amplifiés par PCR , puis clonés dans le plasmide pCRII-TOPO ( Invitrogen ) .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fragments	fragment	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	contenant	contenir	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	différentes	différent	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	régions	région	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	promotrices	promoteur	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ont	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	été	être	VPP	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	amplifiés	amplifier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	PCR	PCR	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
14	puis	puis	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	clonés	cloner	VPP	_	_	10	para	_	_	_	_	_
16	dans	dans	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	le	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	plasmide	plasmode	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	pCRII-TOPO	pCRII-TOPO	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	(	(	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	Invitrogen	Invitrogen	NOM	_	_	18	parenth	_	_	_	_	_
22	)	)	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1267
# text = Pour ompF , le fragment amplifié s'étend des positions - 422 à + 148 ( amorces ODS 451 :
1	Pour	pour	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	ompF	ompF	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	fragment	fragment	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
6	amplifié	amplifier	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	s'	s'	CLI	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	étend	étendre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	des	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	positions	position	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	-	- 422	PUNC	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	422	422	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	à	à plus	INT	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	+	à plus	INT	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	148	148	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
16	(	(	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
17	amorces	amorcer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	ODS	ODS	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
19	451	451	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	:	:	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1268
# text = 5 '-gcagggacgatcactgccag- 3 'et ODS 453   :
1	5	5	NUM	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	'	'	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	-gcagggacgatcactgccag-	-gcagggacgatcactgccag-	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	3	3	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	'	'	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	7	mark	_	_	_	_	_
7	ODS	ODS	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
8	453	453	NUM	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	 	453  	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	:	:	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1269
# text = 5 '-agtcaagcaatctatttgca- 3 ') et l'ADN chromosomique d'E. coli B ou K12 a été utilisé .
1	5	5	NUM	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
2	'	"	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	-agtcaagcaatctatttgca-	-agtcaagcaatctatttgca-	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	3	3	NUM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
5	'	"	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
6	)	)	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	ADN	ADN	NOM	_	_	4	para	_	_	_	_	_
10	chromosomique	chromosomique	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	d'	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	E.	E.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	coli	coli	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	B	B	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	ou	ou	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	K12	K12	NOM	_	_	14	para	_	_	_	_	_
17	a	avoir	VRB	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
18	été	être	VPP	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
19	utilisé	utiliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1270
# text = Pour ompC , le fragment s'étend des positions - 211 à + 110 ( amorces ODS 456 : 5 '-accaggagggacagtacttt- 3 'et ODS 457 : 5 '-cagtgctgtcaaatacttaag- 3 ') et a été amplifié à partir d'ADN chromosomique d'E. coli K12 .
1	Pour	pour	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	ompC	ompC	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	fragment	fragment	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
6	s'	s'	CLI	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	étend	étendre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	des	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	positions	position	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	-	- 211	PUNC	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	211	211	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	à	à plus	INT	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	+	à plus	INT	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	110	110	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
15	(	(	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
16	amorces	amorce	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	ODS	ODS	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	456	456	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	:	:	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
20	5	5	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	'	"	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
22	-accaggagggacagtacttt-	-accaggagggacagtacttt-	VNF	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	3	3	NUM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	'	'	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
26	ODS	ODS	NOM	_	_	23	para	_	_	_	_	_
27	457	457	NUM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	:	:	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
29	5	5	NUM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
30	'	"	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
31	-cagtgctgtcaaatacttaag-	-cagtgctgtcaaatacttaag-	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
32	3	3	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
33	'	'	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
34	)	)	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_
35	et	et	COO	_	_	36	mark	_	_	_	_	_
36	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
37	été	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
38	amplifié	amplifier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
39	à	à	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	partir	partir	VNF	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	d'	de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	ADN	ADN	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	chromosomique	chromosomique	ADJ	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	d'	de	PRE	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	E.	E.	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
46	coli	coli	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	K12	K12	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	.	.	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1271
# text = Pour ompR , le fragment s'étend des positions - 116 à + 199 ( amorces ODS 396 : 5 '-cggtgagataacgttccagcag- 3 'et ODS 455 :
1	Pour	pour	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	ompR	ompR	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	fragment	fragment	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
6	s'	s'	CLI	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	étend	étendre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	des	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	positions	position	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	-	- 116	PUNC	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	116	116	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	à	à plus	INT	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	+	à plus	INT	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	199	199	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
15	(	(	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
16	amorces	amorcer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	ODS	ODS	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
18	396	396	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	:	:	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
20	5	5	NUM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
21	'	'	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
22	-cggtgagataacgttccagcag-	-cggtgagataacgttccagcag-	VRB	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
23	3	3	NUM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	'	'	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
26	ODS	ODS	NOM	_	_	23	para	_	_	_	_	_
27	455	455	NUM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
28	:	:	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1272
# text = 5 '-gggcgttttcatctcgttga- 3 ') et a été amplifié à partir d'ADN chromosomique d'E. coli B. Pour le promoteur de micF , le fragment cloné s'étend des positions - 304 à + 110 et les amorces utilisées sont ODS456 et ODS460 ( 5 '-acagagattcaggatccgaatgacggtaa- 3 ') et a été amplifié à partir d'ADN chromosomique d'E.   coli K12 .
1	5	5	NUM	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	'	"	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	-gggcgttttcatctcgttga-	-gggcgttttcatctcgttga-	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	3	3	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	'	"	PUNC	_	_	65	punc	_	_	_	_	_
6	)	)	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	été	été	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	amplifié	amplifier	VPP	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	à	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	partir	partir	VNF	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	d'	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	ADN	ADN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	chromosomique	chromosomique	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	d'	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	E.	E.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	coli	colis	NOM	_	_	30	subj	_	_	_	_	_
19	B.	B.	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	Pour	Pour	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	le	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	promoteur	promoteur	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	micF	micF	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
26	le	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	fragment	fragment	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
28	cloné	cloner	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	s'	s'	CLI	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	étend	étendre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
31	des	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	positions	position	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	-	- 304	PUNC	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	304	304	NUM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	à	à plus	INT	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
36	+	à plus	INT	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
37	110	110	NUM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
38	et	et	COO	_	_	42	mark	_	_	_	_	_
39	les	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	amorces	amorce	NOM	_	_	42	subj	_	_	_	_	_
41	utilisées	utiliser	ADJ	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	sont	être	VRB	_	_	30	para	_	_	_	_	_
43	ODS456	ODS456	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	et	et	COO	_	_	45	mark	_	_	_	_	_
45	ODS460	ODS460	NOM	_	_	43	para	_	_	_	_	_
46	(	(	PUNC	_	_	49	punc	_	_	_	_	_
47	5	5	NUM	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
48	'	'	PUNC	_	_	56	punc	_	_	_	_	_
49	-acagagattcaggatccgaatgacggtaa-	-acagagattcaggatccgaatgacggtaa-	NOM	_	_	43	parenth	_	_	_	_	_
50	3	3	NUM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	'	'	PUNC	_	_	56	punc	_	_	_	_	_
52	)	)	PUNC	_	_	49	punc	_	_	_	_	_
53	et	et	COO	_	_	56	mark	_	_	_	_	_
54	a	avoir	VRB	_	_	55	aux	_	_	_	_	_
55	été	être	VPP	_	_	56	aux	_	_	_	_	_
56	amplifié	amplifier	VPP	_	_	42	para	_	_	_	_	_
57	à	à	PRE	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
58	partir	partir	VNF	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
59	d'	de	PRE	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
60	ADN	ADN	NOM	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
61	chromosomique	chromosomique	ADJ	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
62	d'	de	PRE	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
63	E.	E.	NOM	_	_	62	dep	_	_	_	_	_
64	 	 	ADJ	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
65	coli	colis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
66	K12	K12	NOM	_	_	65	dep	_	_	_	_	_
67	.	.	PUNC	_	_	65	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1273
# text = Toutes les positions nucléotidiques sont données par rapport au site + 1 majeur d'initiation de la transcription pour chacun des gènes .
1	Toutes	tout	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	positions	position	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
4	nucléotidiques	nucléotidique	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	sont	être	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	données	donner	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	par	par rapport à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	rapport	par rapport à	DET	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	au	par rapport à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	site	site	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	+	plus	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
12	1	1	NUM	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	majeur	majeur	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
14	d'	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	initiation	initiation	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	transcription	transcription	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	pour	pour	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	chacun	chacun	PRQ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	des	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	gènes	gène	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1274
# text = La séquence de chacun des fragments a ensuite été vérifiée par séquençage , puis les fragments contenant les promoteurs des gènes ompF , ompC et micF ont été clonés dans le plasmide pRS 551 ..
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	séquence	séquence	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	chacun	chacun	PRQ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	fragments	fragment	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	a	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
8	ensuite	ensuite	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
9	été	être	VPP	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	vérifiée	vérifier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	séquençage	séquençage	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
14	puis	puis	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
15	les	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	fragments	fragment	NOM	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
17	contenant	contenir	VPR	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	les	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	des	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	gènes	gène	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	ompF	ompF	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	ompC	ompC	ADJ	_	_	22	para	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
26	micF	micF	ADJ	_	_	24	para	_	_	_	_	_
27	ont	avoir	VRB	_	_	28	aux	_	_	_	_	_
28	été	être	VPP	_	_	29	aux	_	_	_	_	_
29	clonés	cloner	VPP	_	_	10	para	_	_	_	_	_
30	dans	dans	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	le	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	plasmide	plasmode	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	pRS	pRS	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	551	551	NUM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	..	...	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1275
# text = La région promotrice de ompR a quant à elle été clonée à la fois dans pRS 551 et pRS 550 , dont le site multiple de clonage est inversé par rapport à pRS 551 , afin d'obtenir les fusions transcriptionnelles ompR-lacZ et greB-lacZ .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	région	région	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
3	promotrice	promoteur	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ompR	ompR	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	a	avoir	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
7	quant	quant à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	à	quant à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
9	elle	lui	PRQ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	été	être	VPP	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	clonée	cloner	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	à	à la fois	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	à la fois	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	fois	à la fois	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	dans	dans	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
16	pRS	pRS	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	551	551	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	pRS	pRS	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
20	550	550	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
22	dont	dont	PRQ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
23	le	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	site	site	NOM	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
25	multiple	multiple	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	clonage	clonage	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	est	être	VRB	_	_	29	aux	_	_	_	_	_
29	inversé	inverser	VPP	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
30	par	par rapport à	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	rapport	par rapport à	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	à	par rapport à	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	pRS	pRS	VNF	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
34	551	551	NUM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	,	,	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
36	afin	afin de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
37	d'	afin de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	obtenir	obtenir	VNF	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	les	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	fusions	fusion	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	transcriptionnelles	transcriptionnel	ADJ	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	ompR-lacZ	ompR-lacZ	ADJ	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	et	et	COO	_	_	44	mark	_	_	_	_	_
44	greB-lacZ	greB-lacZ	ADV	_	_	38	para	_	_	_	_	_
45	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1276
# text = ( Les gènes ompR et greB sont divergents ) .
1	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	Les	Les	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	gènes	gène	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
4	ompR	ompR	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	greB	greB	ADJ	_	_	4	para	_	_	_	_	_
7	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	divergents	divergent	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	)	)	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1277
# text = Les fusions transcriptionnelles ont ensuite été réalisées de la même façon que précédemment ( voir
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fusions	fusion	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	transcriptionnelles	transcriptionnel	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ont	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
5	ensuite	ensuite	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
6	été	être	VPP	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	réalisées	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
10	même	même	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	façon	façon	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	que	que	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	précédemment	précédemment	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
15	voir	voir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1278
# text = Résultats , Partie II , Materials and Methods ) par intégration du bactériophage & 206;& 187;RS 45 dans le chromosome de la souche d'intérêt et sélection et criblage des bactéries lysogènes sur les phénotypes de résistance à la kanamycine , dont le gène conférant la résistance est porté par pRS 550 , pRS 551 et & 206;& 187;RS 45 , et de couleur bleue sur milieu contenant de la kanamycine et du
1	Résultats	résultat	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	69	punc	_	_	_	_	_
3	Partie	Partie	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	II	II	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	53	punc	_	_	_	_	_
6	Materials	Materials	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
7	and	materials and methods	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	Methods	Methods	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
9	)	)	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
10	par	par	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
11	intégration	intégration	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	du	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	bactériophage	bactériophage	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	λRS	λRS	VPR	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	45	45	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	dans	dans	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	le	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	chromosome	chromosome	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	souche	souche	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	d'	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	intérêt	intérêt	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
25	sélection	sélection	NOM	_	_	23	para	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
27	criblage	criblage	NOM	_	_	25	para	_	_	_	_	_
28	des	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
29	bactéries	bactérie	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	lysogènes	lysogène	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	sur	sur	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	les	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	phénotypes	phénotype	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	résistance	résistance	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	à	à	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	la	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	kanamycine	kanamycine	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	,	,	PUNC	_	_	53	punc	_	_	_	_	_
40	dont	dont	PRQ	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
41	le	le	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	gène	gène	NOM	_	_	47	subj	_	_	_	_	_
43	conférant	conférer	VPR	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	la	le	DET	_	_	45	spe	_	_	_	_	_
45	résistance	résistance	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	est	être	VRB	_	_	47	aux	_	_	_	_	_
47	porté	porter	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
48	par	par	PRE	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	pRS	pRS	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	550	550	NUM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	,	,	PUNC	_	_	53	punc	_	_	_	_	_
52	pRS	pRS	ADV	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
53	551	551	NUM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
54	et	et	COO	_	_	55	mark	_	_	_	_	_
55	λRS	λRS	VPR	_	_	53	para	_	_	_	_	_
56	45	45	NUM	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
57	,	,	PUNC	_	_	59	punc	_	_	_	_	_
58	et	et	COO	_	_	59	mark	_	_	_	_	_
59	de	de	PRE	_	_	55	para	_	_	_	_	_
60	couleur	couleur	NOM	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
61	bleue	bleu	ADJ	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
62	sur	sur	PRE	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
63	milieu	milieu	NOM	_	_	62	dep	_	_	_	_	_
64	contenant	contenir	VPR	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
65	de	de	PRE	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
66	la	le	DET	_	_	67	spe	_	_	_	_	_
67	kanamycine	kanamycine	NOM	_	_	65	dep	_	_	_	_	_
68	et	et	COO	_	_	69	mark	_	_	_	_	_
69	du	de+le	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1279
# text = Xgal .
1	Xgal	Xgal	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1280
# text = Retards sur gels
1	Retards	retard	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	sur	sur	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	gels	gel	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1281
# text = La fixation de Fis sur les régions promotrices de ompF , ompC et ompR a été étudiée par des expériences de retards sur gel .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fixation	fixation	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	sur	sur	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	régions	région	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	promotrices	promoteur	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	ompF	ompF	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	ompC	ompC	ADV	_	_	10	para	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	ompR	ompR	ADV	_	_	12	para	_	_	_	_	_
15	a	avoir	VRB	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	été	être	VPP	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
17	étudiée	étudier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	par	par	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	des	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	expériences	expérience	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	retards	retard	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	sur	sur	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	gel	gel	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1282
# text = Tous les fragments d'ADN utilisés recouvrent les régions promotrices ainsi que les sites d'initiation de la transcription des gènes .
1	Tous	tout	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	fragments	fragment	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	utilisés	utiliser	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	recouvrent	recouvrir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	régions	région	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	promotrices	promoteur	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	ainsi	ainsi que	COO	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	que	ainsi que	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
13	les	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	sites	site	NOM	_	_	9	para	_	_	_	_	_
15	d'	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	initiation	initiation	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	transcription	transcription	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	des	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	gènes	gène	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1283
# text = Les mêmes fragments que ceux clonés pour la construction des fusions transcriptionnelles ( voir paragraphe précédent ) ont été amplifiés par PCR .
1	Les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	mêmes	même	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	fragments	fragment	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
4	que	que	CSU	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ceux	celui	PRQ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	clonés	cloner	VPP	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	pour	pour	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	construction	construction	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	des	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	fusions	fusion	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	transcriptionnelles	transcriptionnel	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	(	(	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
14	voir	voir	VNF	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
15	paragraphe	paragraphe	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	précédent	précédent	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	)	)	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
18	ont	avoir	VRB	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
19	été	être	VPP	_	_	20	aux	_	_	_	_	_
20	amplifiés	amplifier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	par	par	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	PCR	PCR	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1284
# text = Les marquages radioactifs , ainsi que les conditions utilisées lors des expériences de retards sur gel , sont les mêmes que ceux décrits précédemment ( voir Résultats , Partie II , Materials and
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	marquages	marquage	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
3	radioactifs	radioactif	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
5	ainsi	ainsi que	COO	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	que	ainsi que	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
7	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	conditions	condition	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
9	utilisées	utiliser	VPP	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	lors	lors de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	des	lors de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	expériences	expérience	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	retards	retard	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	sur	sur	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	gel	gel	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
18	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	les	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	mêmes	même	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	que	que	CSU	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	ceux	celui	PRQ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	décrits	décrire	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	précédemment	précédemment	ADV	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	(	(	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
26	voir	voir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
27	Résultats	Résultats	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	Partie	Partie	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
30	II	II	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
32	Materials	Materials	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
33	and	materials and	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1285
# text = Methods ) .
1	Methods	Methods	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1286
# text = Les contrôles pour tester la spécificité des retards observés sont également similaires à ceux décrits et utilisés précédemment .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	contrôles	contrôle	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	pour	pour	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	tester	tester	VNF	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	spécificité	spécificité	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	des	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	retards	retard	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	observés	observer	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	également	également	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	similaires	similaire	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	ceux	celui	PRQ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	décrits	décrire	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
17	utilisés	utiliser	VPP	_	_	15	para	_	_	_	_	_
18	précédemment	précédemment	ADV	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1287
# text = Empreintes à la DNase I
1	Empreintes	empreinte	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	à	à	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	DNase	DNase	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	I	I	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1288
# text = Les mêmes fragments d'ADN que ceux utilisés pour les retards sur gel ont été employés pour réaliser les empreintes à la DNase I , ainsi que la protéine Fis ancestrale purifiée comme décrit dans la Partie II des résultats ( Materials and Methods ) .
1	Les	le	DET	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	mêmes	même	ADJ	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	fragments	fragment	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	que	que	CSU	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	ceux	celui	PRQ	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
8	utilisés	utiliser	VPP	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	pour	pour	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	retards	retard	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	sur	sur	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	gel	gel	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	ont	avoir	VRB	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
15	été	être	VPP	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	employés	employer	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
17	pour	pour	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	réaliser	réaliser	VNF	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	les	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	empreintes	empreinte	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	à	à	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	DNase	DNase	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	I	I	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
26	ainsi	ainsi que	COO	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
27	que	ainsi que	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	protéine	protéine	NOM	_	_	20	para	_	_	_	_	_
30	Fis	Fis	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	ancestrale	ancestral	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	purifiée	purifier	VPP	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
33	comme	comme	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	décrit	décrire	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	dans	dans	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
36	la	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	Partie	Partie	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	II	II	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	des	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	résultats	résultat	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	(	(	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
42	Materials	Materials	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
43	and	materials and methods	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
44	Methods	Methods	NOM	_	_	37	parenth	_	_	_	_	_
45	)	)	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
46	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1289
# text = Pour chaque fragment d'ADN , les empreintes à la DNase I ont systématiquement été réalisées avec chacun des deux brins marqués , correspondant respectivement aux brins codant et non codant .
1	Pour	pour	PRE	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
2	chaque	chaque	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	fragment	fragment	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	empreintes	empreinte	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	DNase	DNase	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	I	I	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	ont	avoir	VRB	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
14	systématiquement	systématiquement	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
15	été	être	VPP	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	réalisées	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	avec	avec	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	chacun	chacun	PRQ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	des	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	deux	deux	NUM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	brins	brin	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	marqués	marquer	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	correspondant	correspondre	VPR	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	respectivement	respectivement	ADV	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	aux	à	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	brins	brin	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	codant	coder	VPR	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	et	et	COO	_	_	31	mark	_	_	_	_	_
30	non	non	ADV	_	_	31	periph	_	_	_	_	_
31	codant	coder	VPR	_	_	28	para	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1290
# text = Les marquages ont été réalisés par la T4 nucléotide kinase en marquant avec du & 206;& 179;-32P dATP
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	marquages	marquage	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	ont	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	réalisés	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	T4	T4	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	nucléotide	nucléotide	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	kinase	kinase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	en	le	CLI	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	marquant	marquer	VPR	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	avec	avec	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	du	de+le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	γ-32P	γ-32P	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	dATP	dATP	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1291
# text = ( Amersham ) l'extrémité 5 'de chacune des deux amorces utilisées pour amplifier chacun des fragments d'ADN . Pour ompF , en plus du fragment obtenu à l'aide des amorces ODS451 et ODS453 , deux autres fragments ont été utilisés , obtenus à l'aide des amorces ODS453-ODS458 ( 5 '-ctaaacggaaattttgtttcgt- 3 ') et ODS452-ODS459
1	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	Amersham	Amersham	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	extrémité	extrémité	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	5	5	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	'	'	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	chacune	chacun	PRQ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	des	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	deux	deux	NUM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	amorces	amorce	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	utilisées	utiliser	VPP	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	pour	pour	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	amplifier	amplifier	VNF	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	chacun	chacun	PRQ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	des	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	fragments	fragment	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	d'	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	ADN	ADN	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
22	Pour	Pour	PRE	_	_	44	periph	_	_	_	_	_
23	ompF	ompF	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
25	en	en plus de	PRE	_	_	44	periph	_	_	_	_	_
26	plus	en plus de	DET	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	du	en plus de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	fragment	fragment	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	obtenu	obtenir	VPP	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	à	à	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	l'	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	aide	aide	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	des	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	amorces	amorce	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	ODS451	ODS451	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	et	et	COO	_	_	37	mark	_	_	_	_	_
37	ODS453	ODS453	NOM	_	_	35	para	_	_	_	_	_
38	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
39	deux	deux	NUM	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
40	autres	autre	ADJ	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
41	fragments	fragment	NOM	_	_	44	subj	_	_	_	_	_
42	ont	avoir	VRB	_	_	43	aux	_	_	_	_	_
43	été	être	VPP	_	_	44	aux	_	_	_	_	_
44	utilisés	utiliser	VPP	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
45	,	,	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_
46	obtenus	obtenir	VPP	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	à	à	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	l'	le	DET	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
49	aide	aide	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	des	de	PRE	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	amorces	amorce	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	ODS453-ODS458	ODS453-ODS458	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	(	(	PUNC	_	_	56	punc	_	_	_	_	_
54	5	5	NUM	_	_	56	spe	_	_	_	_	_
55	'	'	PUNC	_	_	61	punc	_	_	_	_	_
56	-ctaaacggaaattttgtttcgt-	-ctaaacggaaattttgtttcgt-	NOM	_	_	51	parenth	_	_	_	_	_
57	3	3	NUM	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
58	'	'	PUNC	_	_	61	punc	_	_	_	_	_
59	)	)	PUNC	_	_	56	punc	_	_	_	_	_
60	et	et	COO	_	_	61	mark	_	_	_	_	_
61	ODS452-ODS459	ODS452-ODS459	NOM	_	_	51	para	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1292
# text = ( 5 '-cagaaacaaaatttccgtttag- 3 ') , pour confirmer l'empreinte à la DNase   I ( Figure 34 ) .
1	(	(	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
2	5	5	NUM	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	'	'	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	-cagaaacaaaatttccgtttag-	-cagaaacaaaatttccgtttag-	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
5	3	3	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	'	'	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
9	pour	pour	PRE	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
10	confirmer	confirmer	VNF	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	empreinte	empreinte	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	DNase	DNase	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	 	 	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	I	I	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	(	(	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Figure	Figure	NOM	_	_	17	parenth	_	_	_	_	_
20	34	34	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	)	)	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1293
# text = La quantité de fragment radiomarqué dans une réaction d'empreinte à la
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	quantité	quantité	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	fragment	fragment	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	radiomarqué	radio-	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	dans	dans	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	une	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	réaction	réaction	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	empreinte	empreinte	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	à	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	la	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1294
# text = DNase I est ici de 30 cpm par tube ;
1	DNase	DNase	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	I	I	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	ici	ici	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	30	30	NUM	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	cpm	centimètre	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	par	par	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	tube	tube	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	;	;	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1295
# text = les rendements de la réaction de radiomarquage ainsi que de la purification des produits PCR radiomarqués ( PCR purification kit , Qiagen ) n'étant pas toujours constants , la dilution appropriée pour obtenir 30 cpm / tube a été systématiquement déterminée , et la quantité d'ADN présent dans le volume utilisé calculée .
1	les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	rendements	rendement	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	réaction	réaction	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	radiomarquage	radio-	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ainsi	ainsi que	COO	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	que	ainsi que	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	6	para	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	purification	purification	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	des	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	produits	produit	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	PCR	PCR	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	radiomarqués	radio-	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	(	(	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
18	PCR	PCR	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	purification	purification	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	kit	kit	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_
22	Qiagen	Qiagen	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	)	)	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
24	n'	ne	ADV	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	étant	être	VPR	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	pas	pas	ADV	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	toujours	toujours	ADV	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	constants	constant	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_
30	la	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	dilution	dilution	NOM	_	_	42	subj	_	_	_	_	_
32	appropriée	approprier	VPP	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	pour	pour	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	obtenir	obtenir	VNF	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	30	30	NUM	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	cpm	centimètre	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	/	sur	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
38	tube	tube	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	a	avoir	VRB	_	_	40	aux	_	_	_	_	_
40	été	être	VPP	_	_	42	aux	_	_	_	_	_
41	systématiquement	systématiquement	ADV	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	déterminée	déterminer	VPP	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
43	,	,	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_
44	et	et	COO	_	_	45	mark	_	_	_	_	_
45	la	le	DET	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
46	quantité	quantité	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
47	d'	de	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	ADN	ADN	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	présent	présent	ADJ	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	dans	dans	PRE	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	le	le	DET	_	_	52	spe	_	_	_	_	_
52	volume	volume	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
53	utilisé	utiliser	ADJ	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	calculée	calculer	ADJ	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
55	.	.	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1296
# text = La quantité de protéine Fis à ajouter dans chaque échantillon a ainsi été déterminée afin d'obtenir le même rapport molaire que lors des expériences de retards sur gels .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	quantité	quantité	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	protéine	protéine	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	Fis	Fis	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	à	à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	ajouter	ajouter	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	dans	dans	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	chaque	chaque	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	échantillon	échantillon	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	a	avoir	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
12	ainsi	ainsi	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
13	été	être	VPP	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	déterminée	déterminer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	afin	afin de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	d'	afin de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	obtenir	obtenir	VNF	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	le	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
19	même	même	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	rapport	rapport	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	molaire	molaire	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	que	que	ADV	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
23	lors	lors de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
24	des	lors de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	expériences	expérience	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	retards	retard	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	sur	sur	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	gels	gel	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1297
# text = C'est ce rapport molaire qui est donné dans les figures .
1	C'	ce	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	ce	ce	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	rapport	rapport	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	molaire	molaire	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	qui	qui	PRQ	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	donné	donner	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	figures	figure	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1298
# text = Les complexes Fis / ADN ont été réalisés dans les mêmes conditions que pour les retards sur gel ( voir Résultats Partie II , Materials and Methods ) , dans le même tampon et dans un volume total de 15 µL. Après 20 min d'incubation à 37 °C , les échantillons sont traités par 0 , 75 ng de DNase I ( Worthington ) pendant 35s à température ambiante .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	complexes	complexe	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	Fis	Fis	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	/	/	PUNC	_	_	67	punc	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
6	ont	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	été	être	VPP	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	réalisés	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
11	mêmes	même	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	conditions	condition	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	que	que	CSU	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	pour	pour	PRE	_	_	54	periph	_	_	_	_	_
15	les	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	retards	retard	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	sur	sur	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	gel	gel	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	(	(	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	voir	voir	VNF	_	_	18	parenth	_	_	_	_	_
21	Résultats	Résultats	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
22	Partie	Partie	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	II	II	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
25	Materials	Materials	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
26	and	materials and methods	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
27	Methods	Methods	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
28	)	)	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
30	dans	dans	PRE	_	_	17	para	_	_	_	_	_
31	le	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
32	même	même	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
33	tampon	tampon	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
34	et	et	COO	_	_	35	mark	_	_	_	_	_
35	dans	dans	PRE	_	_	30	para	_	_	_	_	_
36	un	un	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	volume	volume	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	total	total	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	de	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	15	15	NUM	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	µL.	micro-	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	Après	Après	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	20	20	NUM	_	_	44	spe	_	_	_	_	_
44	min	minimum	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	d'	de	PRE	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	incubation	incubation	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	à	à	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	37	37	NUM	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
49	°C	degré	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
51	les	le	DET	_	_	52	spe	_	_	_	_	_
52	échantillons	échantillon	NOM	_	_	54	subj	_	_	_	_	_
53	sont	être	VRB	_	_	54	aux	_	_	_	_	_
54	traités	traiter	VPP	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
55	par	par	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
56	0	0	NUM	_	_	58	spe	_	_	_	_	_
57	,	0 , 75	PUNC	_	_	60	punc	_	_	_	_	_
58	75	75	NUM	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
59	ng	ni	COO	_	_	60	mark	_	_	_	_	_
60	de	de	PRE	_	_	55	para	_	_	_	_	_
61	DNase	DNase	NOM	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
62	I	I	NOM	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
63	(	(	PUNC	_	_	64	punc	_	_	_	_	_
64	Worthington	Worthington	NOM	_	_	61	parenth	_	_	_	_	_
65	)	)	PUNC	_	_	64	punc	_	_	_	_	_
66	pendant	pendre	VPR	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
67	35s	35s	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
68	à	à	PRE	_	_	67	dep	_	_	_	_	_
69	température	température	NOM	_	_	68	dep	_	_	_	_	_
70	ambiante	ambiant	ADJ	_	_	69	dep	_	_	_	_	_
71	.	.	PUNC	_	_	67	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1299
# text = La réaction est arrêtée par l'ajout de 50 µL de phénol pur pH 8 , puis 180 µL d'une solution d'arrêt ( 12 , 5 mM EDTA pH 8 , 0 , 4M acétate de sodium et 250 µg ADN de sperme de hareng ) sont ajoutés .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	réaction	réaction	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	arrêtée	arrêter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ajout	ajout	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	50	50	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	µL	micro-	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	phénol	phénol	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	pur	pur	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	pH	pH	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	8	8	NUM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	50	punc	_	_	_	_	_
17	puis	puis	COO	_	_	50	mark	_	_	_	_	_
18	180	180	NUM	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	µL	micro-	NOM	_	_	50	subj	_	_	_	_	_
20	d'	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	une	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	solution	solution	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	d'	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	arrêt	arrêt	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	(	(	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
26	12	12	NUM	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
27	,	12 , 5	PUNC	_	_	50	punc	_	_	_	_	_
28	5	5	NUM	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	mM	millimètre	NOM	_	_	22	parenth	_	_	_	_	_
30	EDTA	EDTA	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	pH	pH	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	8	8	NUM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	50	punc	_	_	_	_	_
34	0	0	NUM	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
35	,	0 , 4m	PUNC	_	_	50	punc	_	_	_	_	_
36	4M	4M	NUM	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	acétate	acétate	NOM	_	_	29	para	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	sodium	sodium	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	et	et	COO	_	_	42	mark	_	_	_	_	_
41	250	250	NUM	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	µg	micro-	NOM	_	_	37	para	_	_	_	_	_
43	ADN	ADN	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	de	de	PRE	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	sperme	sperme	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	de	de	PRE	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	hareng	hareng	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	)	)	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
49	sont	être	VRB	_	_	50	aux	_	_	_	_	_
50	ajoutés	ajouter	VPP	_	_	4	para	_	_	_	_	_
51	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1300
# text = L'ADN est ensuite précipité puis resuspendu dans 5 µL de bleu de formamide ( 10 mM EDTA pH 8 , 5 mg bleu de bromophénol et xylène cyanol dans 10 mL de formamide ) , chauffé à 90 °C pendant 3 min et déposé sur un gel de polyacrylamide à 8 % ( TBE 1X , 1 , 5M urée ) .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	ADN	ADN	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
4	ensuite	ensuite	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	précipité	précipiter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	puis	puis	COO	_	_	7	mark	_	_	_	_	_
7	resuspendu	re-	VPP	_	_	5	para	_	_	_	_	_
8	dans	dans	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	5	5	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	µL	micro-	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	bleu	bleu	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	déformer	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	formamide	déformer	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	(	(	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
16	10	10	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	mM	mM	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	EDTA	EDTA	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	pH	pH	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	8	8	NUM	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
21	,	8 , 5	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
22	5	5	NUM	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	mg	milligramme	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	bleu	bleu	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	bromophénol	oromo	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
28	xylène	xylène	NOM	_	_	26	para	_	_	_	_	_
29	cyanol	cyanose	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
30	dans	dans	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	10	10	NUM	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	mL	millilitre	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	de	déformer	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
34	formamide	déformer	PRE	_	_	33	parenth	_	_	_	_	_
35	)	)	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
36	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
37	chauffé	chauffer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
38	à	à	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	90	90	NUM	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	°C	degré	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	pendant	pendant	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
42	3	3	NUM	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	min	minute	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	et	et	COO	_	_	45	mark	_	_	_	_	_
45	déposé	déposer	VPP	_	_	37	para	_	_	_	_	_
46	sur	sur	PRE	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	un	un	DET	_	_	48	spe	_	_	_	_	_
48	gel	gel	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
49	de	de	PRE	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	polyacrylamide	polyacrylamide	NOM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	à	à	PRE	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
52	8	8	NUM	_	_	53	spe	_	_	_	_	_
53	%	pourcent	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
54	(	(	PUNC	_	_	61	punc	_	_	_	_	_
55	TBE	TBE	NOM	_	_	48	parenth	_	_	_	_	_
56	1X	1X	NUM	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
57	,	,	PUNC	_	_	61	punc	_	_	_	_	_
58	1	1	NUM	_	_	60	spe	_	_	_	_	_
59	,	1 , 5m	PUNC	_	_	58	punc	_	_	_	_	_
60	5M	5M	NUM	_	_	61	spe	_	_	_	_	_
61	urée	urée	NOM	_	_	60	para	_	_	_	_	_
62	)	)	PUNC	_	_	61	punc	_	_	_	_	_
63	.	.	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1301
# text = Afin de déterminer les positions des sites de fixation de Fis , une réaction de séquençage G + A de Maxam et Gilbert ( Maxam et Gilbert , 1977 ) , réalisée sur le même fragment radiomarqué , est déposée en parallèle sur le gel .
1	Afin	afin de	PRE	_	_	40	periph	_	_	_	_	_
2	de	afin de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	déterminer	déterminer	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	positions	position	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	des	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	sites	site	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	fixation	fixation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	Fis	Fis	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
13	une	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	réaction	réaction	NOM	_	_	40	subj	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	séquençage	séquençage	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	G	G	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	+	plus	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	A	A	NOM	_	_	17	para	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	Maxam	Maxam	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	Gilbert	Gilbert	NOM	_	_	21	para	_	_	_	_	_
24	(	(	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	Maxam	Maxam	NOM	_	_	21	parenth	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
27	Gilbert	Gilbert	NOM	_	_	25	para	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
29	1977	1977	NUM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	)	)	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
32	réalisée	réaliser	VPP	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
33	sur	sur	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	le	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
35	même	même	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
36	fragment	fragment	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
37	radiomarqué	radio-	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
39	est	être	VRB	_	_	40	aux	_	_	_	_	_
40	déposée	déposer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
41	en	en	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	parallèle	parallèle	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	sur	sur	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
44	le	le	DET	_	_	45	spe	_	_	_	_	_
45	gel	gel	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	.	.	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1302
# text = L'électrophorèse est réalisée dans un tampon TBE 0 , 5X et , après un temps de migration adéquat , le gel est séché 1h30 à 80 °C , et révélé de la même manière que les gels de retards .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	électrophorèse	électrophorèse	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	réalisée	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	un	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	tampon	tampon	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	TBE	TBE	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	0	0	NUM	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
10	,	0 , 5x	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
11	5X	5X	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
14	après	après	PRE	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
15	un	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	temps	temps	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	migration	migration	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	adéquat	adéquat	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
21	le	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	gel	gel	NOM	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
23	est	être	VRB	_	_	4	para	_	_	_	_	_
24	séché	sécher	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	1h30	1h30	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	à	à	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	80	80	NUM	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	°C	degré	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
30	et	et	COO	_	_	31	mark	_	_	_	_	_
31	révélé	révéler	VPP	_	_	23	para	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	la	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
34	même	même	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
35	manière	manière	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
36	que	que	CSU	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	les	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	gels	gel	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	de	de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	retards	retard	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1303
# text = Résultats
1	Résultats	résultat	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1304
# text = Modification des profils protéiques
1	Modification	modification	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	profils	profil	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	protéiques	protéique	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1305
# text = Les profils protéiques de 4 souches ancestrales isogéniques portant les allèles évolués de topA et fis identifiés dans la population
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	profils	profil	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	protéiques	protéique	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	4	4	NUM	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	souches	souche	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	ancestrales	ancestral	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	isogéniques	isogénique	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	portant	porter	VPR	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	allèles	allèle	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	évolués	évolué	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	topA	topA	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	identifiés	identifier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	dans	dans	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	population	population	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1306
# text = Ara- 1 , seuls ou en combinaison , ou une délétion de fis ( 606 topA
1	Ara-	Ara-	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	seuls	seul	ADJ	_	_	2	para	_	_	_	_	_
5	ou	ou	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	en	en	PRE	_	_	4	para	_	_	_	_	_
7	combinaison	combinaison	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
9	ou	ou	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
10	une	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	délétion	délétion	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
15	606	606	NUM	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	topA	topA	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1307
# text = - 1 , 606 fis
1	-	-	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	,	1 , 606	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	606	606	NUM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1308
# text = - 1 , 606 topA
1	-	-	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	,	1 , 606	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	606	606	NUM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	topA	toper	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1309
# text = - 1 fis
1	-	-	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1310
# text = - 1 , 606 & 206;& 148; fis ) ont été comparés à celui du clone ancêtre par électrophorèses bidimensionnelles .
1	-	-	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	,	1 , 606	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	606	606	NUM	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	Δ	Δ	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
8	ont	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	été	été	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	comparés	comparé	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	à	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	celui	celui	PRQ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	du	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	clone	clone	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	par	par	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	électrophorèses	électrophorèse	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	bidimensionnelles	bidimensionnel	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1311
# text = Trois profils protéiques ont été réalisés à partir de trois cultures indépendantes de chacune des souches dans du milieu DM250 , les protéines ayant été extraites en phase exponentielle .
1	Trois	trois	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	profils	profil	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	protéiques	protéique	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ont	avoir	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	été	être	VPP	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	réalisés	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	à	à partir de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	partir	à partir de	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	à partir de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	trois	trois	NUM	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	cultures	culture	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	indépendantes	indépendant	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	chacune	chacun	PRQ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	des	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	souches	souche	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	dans	dans	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
18	du	de+le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	milieu	milieu	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	DM250	DM250	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
22	les	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	protéines	protéine	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
24	ayant	avoir	VPR	_	_	25	aux	_	_	_	_	_
25	été	être	VPP	_	_	26	aux	_	_	_	_	_
26	extraites	extraire	VPP	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
27	en	en	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	phase	phase	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1312
# text = Seules les protéines dont la quantité variait de manière similaire au sein des 3 réplicats ont été identifiées par MALDI-TOF-MS ou LC-MS .
1	Seules	seul	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	protéines	protéine	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
4	dont	dont	PRQ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	quantité	quantité	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	variait	varier	VRB	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	manière	manière	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	similaire	similaire	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	au	au sein de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	sein	au sein de	DET	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	des	au sein de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	3	3	NUM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	réplicats	repli	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	ont	avoir	VRB	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
17	été	être	VPP	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
18	identifiées	identifier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	par	par	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	MALDI-TOF-MS	MALDI-TOF-MS	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	ou	ou	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	LC-MS	LC-MS	NOM	_	_	20	para	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1313
# text = La liste de ces protéines est donnée dans le Tableau 2 .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	liste	liste	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ces	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	protéines	protéine	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	donnée	donner	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	dans	dans	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	le	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	Tableau	Tableau	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	2	2	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1314
# text = Trois protéines varient ici de manière systématique soit dans les 4 souches , soit dans les
1	Trois	trois	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéines	protéine	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	varient	varier	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	ici	ici	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	manière	manière	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	systématique	systématique	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	soit	soit	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	7	para	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
11	4	4	NUM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	souches	souche	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
14	soit	soit	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	dans	dans	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	les	le	_	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1315
# text = 3 modifiées pour fis  :
1	3	3	NUM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	modifiées	modifier	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	pour	pour	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	 :	:	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1316
# text = PAL , OmpA et OmpF. Ces deux dernières protéines sont des porines , OmpF étant la porine principale présente chez E. coli B. Chez E. coli K12 , les deux porines majeures sont OmpF et OmpC. Cette dernière est absente chez les dérivés de la souche E. coli
1	PAL	Pål	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	OmpA	OmpA	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	OmpF.	OmpF.	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
6	Ces	Ces	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
7	deux	deux	NUM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
8	dernières	dernier	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	protéines	protéine	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
10	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	des	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	porines	purine	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
14	OmpF	OmpF	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
15	étant	être	VPR	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	porine	purine	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	principale	principal	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	présente	présenter	VRB	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
20	chez	chez	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	E.	E.	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	coli	coli	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	B.	B.	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
24	Chez	Chez	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
25	E.	E.	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	coli	coli	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	K12	K12	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
29	les	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
30	deux	deux	NUM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	porines	porines	NOM	_	_	33	subj	_	_	_	_	_
32	majeures	majeur	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	sont	être	VRB	_	_	19	para	_	_	_	_	_
34	OmpF	OmpF	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	et	et	COO	_	_	39	mark	_	_	_	_	_
36	OmpC.	OmpC.	NOM	_	_	39	subj	_	_	_	_	_
37	Cette	Cette	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	dernière	dernier	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	est	être	VRB	_	_	33	para	_	_	_	_	_
40	absente	absent	ADJ	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	chez	chez	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	les	le	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	dérivés	dérivé	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	de	de	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	la	le	DET	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
46	souche	souche	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	E.	E.	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	coli	coli	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1317
# text = B utilisés ici , suite à la délétion d'une partie du gène ompC .
1	B	B	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	utilisés	utiliser	VPP	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	ici	ici	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
5	suite	suite à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	à	suite à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	délétion	délétion	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	une	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	partie	partie	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	du	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	gène	gène	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	ompC	ompC	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1318
# text = Nous avons choisi de nous focaliser sur les analyses des porines , et notamment de OmpF. En effet , la composition de la membrane externe pourrait jouer un rôle important au cours de cette évolution expérimentale .
1	Nous	nous	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	avons	avoir	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	choisi	choisir	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	nous	le	CLI	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	focaliser	focaliser	VNF	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	sur	sur	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	analyses	analyse	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	des	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	porines	purine	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
14	notamment	notamment	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	10	para	_	_	_	_	_
16	OmpF.	OmpF.	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	En	En	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
18	effet	effet	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	composition	composition	NOM	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	membrane	membrane	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	externe	externe	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
27	jouer	jouer	VNF	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	un	un	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	rôle	rôle	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	important	important	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	au	au cours de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
32	cours	au cours de	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	de	au cours de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	cette	ce	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	évolution	évolution	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1319
# text = Nous avons donc étudié l'expression du gène ompF dans nos souches ancestrales isogéniques portant les allèles ancestraux ou évolués de topA et fis .
1	Nous	nous	CLS	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	avons	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
3	donc	donc	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	étudié	étudier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	expression	expression	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	du	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	gène	gène	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	ompF	ompF	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
11	nos	son	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	souches	souche	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	ancestrales	ancestral	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	isogéniques	isogénique	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	portant	porter	VPR	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	les	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	allèles	allèle	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	ancestraux	ancestral	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	ou	ou	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
20	évolués	évolué	ADJ	_	_	18	para	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
22	topA	topA	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	et	et	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
24	fis	faire	VRB	_	_	4	para	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1320
# text = Avant de détailler les expériences effectuées , une brève description des porines d'E. coli et de leur régulation est donnée .
1	Avant	avant de	PRE	_	_	21	periph	_	_	_	_	_
2	de	avant de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	détailler	détailler	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	expériences	expérience	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	effectuées	effectuer	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
8	une	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
9	brève	bref	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	description	description	NOM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
11	des	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	porines	purine	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	d'	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	E.	E.	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	coli	coli	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	13	para	_	_	_	_	_
18	leur	son	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	régulation	régulation	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	est	être	VRB	_	_	21	aux	_	_	_	_	_
21	donnée	donner	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1321
# text = Les porines d'E. coli
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	porines	purine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	E.	E.	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	coli	coli	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1322
# text = Trois porines majeures ont été décrites chez E. coli :
1	Trois	trois	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	porines	purine	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	majeures	majeur	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ont	avoir	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	été	être	VPP	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	décrites	décrire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	chez	chez	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	E.	E.	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	coli	coli	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	:	:	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1323
# text = OmpC , OmpF et OmpA. Les porines sont des protéines insérées dans la membrane externe , qui forment des pores permettant l'entrée passive de petits composants .
1	OmpC	OmpC	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	OmpF	OmpF	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	OmpA.	OmpA.	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
6	Les	Les	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	porines	purine	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	des	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	protéines	protéine	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	insérées	insérer	VPP	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	dans	dans	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	membrane	membrane	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	externe	externe	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
17	qui	qui	PRQ	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
18	forment	former	VRB	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
19	des	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	pores	pore	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	permettant	permettre	VPR	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	l'	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	entrée	entrée	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	passive	passif	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	petits	petit	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
27	composants	composant	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1324
# text = Elles sont impliquées dans le transport de molécules , la discrimination se faisant essentiellement sur la base de leur taille .
1	Elles	elles	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	sont	être	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	impliquées	impliquer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	dans	dans	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	le	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	transport	transport	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	molécules	molécule	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	discrimination	discrimination	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	se	se	CLI	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	faisant	faire	VPR	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	essentiellement	essentiellement	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	sur	sur	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	base	base	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	leur	son	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	taille	taille	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1325
# text = Les deux principales , OmpC et OmpF , se différencient par la taille des pores formés , OmpF formant des pores de 1 , 16 nm , alors que ceux formés par OmpC sont plus petits ( 1 , 08 nm ) et rendent ainsi plus difficile la diffusion des molécules ( Nikaido et Rosenberg , 1983 ) .
1	Les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	deux	deux	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	principales	principale	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
5	OmpC	OmpC	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	7	mark	_	_	_	_	_
7	OmpF	OmpF	NOM	_	_	5	para	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
9	se	se	CLI	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	différencient	différencier	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	taille	taille	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	des	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	pores	pore	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	formés	former	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
18	OmpF	OmpF	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	formant	formant	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
20	des	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	pores	pore	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	1	1	NUM	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
24	,	1 , 16	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
25	16	16	NUM	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	nm	minute	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
28	alors	alors que	CSU	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
29	que	alors que	CSU	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
30	ceux	celui	PRQ	_	_	34	subj	_	_	_	_	_
31	formés	former	VPP	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	par	par	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	OmpC	OmpC	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	sont	être	VRB	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
35	plus	plus	ADV	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
36	petits	petit	ADJ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	(	(	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
38	1	1	NUM	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
39	,	1 , 08	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
40	08	08	NUM	_	_	34	parenth	_	_	_	_	_
41	nm	minute	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	)	)	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
43	et	et	COO	_	_	44	mark	_	_	_	_	_
44	rendent	rendre	VRB	_	_	34	para	_	_	_	_	_
45	ainsi	ainsi	ADV	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	plus	plus	ADV	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
47	difficile	difficile	ADJ	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
48	la	le	DET	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
49	diffusion	diffusion	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
50	des	de	PRE	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	molécules	molécule	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	(	(	PUNC	_	_	53	punc	_	_	_	_	_
53	Nikaido	Nikaido	NOM	_	_	51	parenth	_	_	_	_	_
54	et	et	COO	_	_	55	mark	_	_	_	_	_
55	Rosenberg	Rosenberg	NOM	_	_	53	para	_	_	_	_	_
56	,	,	PUNC	_	_	57	punc	_	_	_	_	_
57	1983	1983	NUM	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
58	)	)	PUNC	_	_	53	punc	_	_	_	_	_
59	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1326
# text = La quantité de chacune de ces porines est fonction de la composition du milieu dans lequel se trouve la cellule , et leur régulation se fait de façon opposée .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	quantité	quantité	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	chacune	chacun	PRQ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	ces	ce	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	porines	purine	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	fonction	fonction	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	composition	composition	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	du	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	milieu	milieu	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	dans	dans	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
16	lequel	lequel	PRQ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	se	se	CLI	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	trouve	trouver	VRB	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	cellule	cellule	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
23	leur	son	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	régulation	régulation	NOM	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
25	se	se	CLI	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	fait	faire	VRB	_	_	18	para	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	façon	façon	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	opposée	opposer	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1327
# text = Dans l'intestin par exemple , la concentration en nutriments , mais aussi en composés toxiques comme les sels biliaires , est élevée :
1	Dans	dans	PRE	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
2	l'	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	intestin	intestin	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	par	par	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	exemple	exemple	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	concentration	concentration	NOM	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
9	en	en	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	nutriments	nutriment	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
12	mais	mais aussi	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
13	aussi	mais aussi	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	en	en	PRE	_	_	9	para	_	_	_	_	_
15	composés	composé	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	toxiques	toxique	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	comme	comme	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	les	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	sels	sels	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	biliaires	biliaire	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
22	est	être	VRB	_	_	23	aux	_	_	_	_	_
23	élevée	élever	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	:	:	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1328
# text = dans ces conditions , la quantité de porine OmpC est plus élevée que celle de OmpF .
1	dans	dans	PRE	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	conditions	condition	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	quantité	quantité	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	porine	porcin	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	OmpC	OmpC	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	est	être	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
11	plus	plus	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	élevée	élever	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	que	que	CSU	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	celle	celui	PRQ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	OmpF	OmpF	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1329
# text = Dans un milieu plus dilué , l'inverse se produit ( Pratt et Silhavy , 1995 ) .
1	Dans	dans	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	un	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	milieu	milieu	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	plus	plus	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	dilué	diluer	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	inverse	inverse	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
9	se	se	CLI	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	produit	produire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	(	(	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	Pratt	Pratt	NOM	_	_	10	parenth	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	Silhavy	Silhavy	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	1995	1995	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	)	)	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1330
# text = Dans des conditions de stress osmotique , OmpC est également majoritaire par rapport à OmpF. Ces changements d'expression sont dus à différentes voies de régulation des deux porines , et les mécanismes de régulation ont été particulièrement bien étudiés dans le cas d'un stress osmotique .
1	Dans	dans	PRE	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
2	des	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	conditions	condition	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	stress	stress	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	osmotique	osmotique	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
8	OmpC	OmpC	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
9	est	être	VRB	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
10	également	également	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	majoritaire	majoritaire	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	par	par rapport à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	rapport	par rapport à	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	à	par rapport à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	OmpF.	OmpF.	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	Ces	Ces	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	changements	changement	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
18	d'	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	expression	expression	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	dus	devoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	à	à	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	différentes	différent	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	voies	voie	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	régulation	régulation	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	des	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	deux	deux	NUM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
29	porines	purine	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
31	et	et	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
32	les	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	mécanismes	mécanisme	NOM	_	_	40	subj	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	régulation	régulation	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	ont	avoir	VRB	_	_	37	aux	_	_	_	_	_
37	été	être	VPP	_	_	40	aux	_	_	_	_	_
38	particulièrement	particulièrement	ADV	_	_	40	periph	_	_	_	_	_
39	bien	bien	ADV	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
40	étudiés	étudier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
41	dans	dans	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	le	le	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	cas	cas	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	d'	de	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	un	un	DET	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
46	stress	stress	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	osmotique	osmotique	ADJ	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	.	.	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1331
# text = La régulation majeure exercée au niveau transcriptionnel passe par l'intermédiaire du système à deux composants OmpR / EnvZ ( Hall et Silhavy , 1981 ) .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	régulation	régulation	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	majeure	majeur	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	exercée	exercer	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	au	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	niveau	niveau	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	transcriptionnel	transcription	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	passe	passer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	par	par	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	intermédiaire	intermédiaire	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	du	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	système	système	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	deux	deux	NUM	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	composants	composant	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	OmpR	OmpR	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	/	ou	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	EnvZ	EnvZ	NOM	_	_	17	para	_	_	_	_	_
20	(	(	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	Hall	Hall	NOM	_	_	13	parenth	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	Silhavy	Silhavy	NOM	_	_	21	para	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	1981	1981	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	)	)	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1332
# text = La protéine senseur EnvZ , une histidine kinase , est insérée dans la membrane externe et détecte les variations d'osmolarité de l'environnement .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéine	protéine	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
3	senseur	senseur	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	EnvZ	EnvZ	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
6	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	histidine	histidine	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	kinase	kinase	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
10	est	être	VRB	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	insérée	insérer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	dans	dans	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	membrane	membrane	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	externe	externe	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
17	détecte	détecter	VRB	_	_	11	para	_	_	_	_	_
18	les	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	variations	variation	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	d'	de	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	osmolarité	de	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	l'	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	environnement	environnement	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1333
# text = Ses activités de phosphorylation et de déphosphorylation exercées sur le régulateur de réponses OmpR permettent de réguler l'expression de OmpC et OmpF. En effet , suite à des variations d'osmolarité , il y a autophosphorylation de EnvZ sur le résidu H243 , puis transfert du groupement phosphate sur le résidu D55 de OmpR , qui régule la transcription des deux porines , la phosphorylation de OmpR accroissant sa capacité à se fixer sur les régions promotrices de ompF et ompC ( Aiba et Mizuno , 1990 ) .
1	Ses	son	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	activités	activité	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	phosphorylation	phosphorylation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	3	para	_	_	_	_	_
7	déphosphorylation	déphosphorylation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	exercées	exercer	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
9	sur	sur	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	le	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	régulateur	régulateur	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	réponses	réponse	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	OmpR	OmpR	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	permettent	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	réguler	réguler	VNF	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	expression	expression	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	OmpC	OmpC	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	OmpF.	OmpF.	NOM	_	_	21	para	_	_	_	_	_
24	En	En	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
25	effet	effet	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
27	suite	suite	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
28	à	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
29	des	un	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	variations	variation	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	d'	de	ADV	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	osmolarité	de	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
34	il	il y a	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
35	y	il y a	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
36	a	il y a	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
37	autophosphorylation	autophosphorylation	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	EnvZ	EnvZ	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	sur	sur	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
41	le	le	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	résidu	résidu	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	H243	H243	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	,	,	PUNC	_	_	58	punc	_	_	_	_	_
45	puis	puis	COO	_	_	58	mark	_	_	_	_	_
46	transfert	transfert	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	du	de	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	groupement	groupement	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	phosphate	phosphate	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	sur	sur	PRE	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
51	le	le	DET	_	_	52	spe	_	_	_	_	_
52	résidu	résidu	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
53	D55	D55	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	de	de	PRE	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
55	OmpR	OmpR	NOM	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	,	,	PUNC	_	_	58	punc	_	_	_	_	_
57	qui	qui	PRQ	_	_	58	subj	_	_	_	_	_
58	régule	réguler	VRB	_	_	36	para	_	_	_	_	_
59	la	le	DET	_	_	60	spe	_	_	_	_	_
60	transcription	transcription	NOM	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
61	des	de	PRE	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
62	deux	deux	NUM	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
63	porines	porines	NOM	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
64	,	,	PUNC	_	_	66	punc	_	_	_	_	_
65	la	le	DET	_	_	66	spe	_	_	_	_	_
66	phosphorylation	phosphorylation	NOM	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
67	de	de	PRE	_	_	66	dep	_	_	_	_	_
68	OmpR	OmpR	NOM	_	_	67	dep	_	_	_	_	_
69	accroissant	accroître	VPR	_	_	66	dep	_	_	_	_	_
70	sa	son	DET	_	_	71	spe	_	_	_	_	_
71	capacité	capacité	NOM	_	_	69	dep	_	_	_	_	_
72	à	à	PRE	_	_	71	dep	_	_	_	_	_
73	se	se	CLI	_	_	74	dep	_	_	_	_	_
74	fixer	fixer	VNF	_	_	72	dep	_	_	_	_	_
75	sur	sur	PRE	_	_	74	dep	_	_	_	_	_
76	les	le	DET	_	_	77	spe	_	_	_	_	_
77	régions	région	NOM	_	_	75	dep	_	_	_	_	_
78	promotrices	promoteur	NOM	_	_	77	dep	_	_	_	_	_
79	de	de	PRE	_	_	77	dep	_	_	_	_	_
80	ompF	ompF	NOM	_	_	79	dep	_	_	_	_	_
81	et	et	COO	_	_	82	mark	_	_	_	_	_
82	ompC	ompC	NOM	_	_	80	para	_	_	_	_	_
83	(	(	PUNC	_	_	84	punc	_	_	_	_	_
84	Aiba	Aiba	NOM	_	_	77	parenth	_	_	_	_	_
85	et	et	COO	_	_	86	mark	_	_	_	_	_
86	Mizuno	Mizuno	NOM	_	_	84	para	_	_	_	_	_
87	,	,	PUNC	_	_	88	punc	_	_	_	_	_
88	1990	1990	NUM	_	_	86	dep	_	_	_	_	_
89	)	)	PUNC	_	_	84	punc	_	_	_	_	_
90	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1334
# text = A faible osmolarité , la quantité de OmpR phosphorylé ( OmpR-P ) est faible , et OmpR-P se fixe alors de façon coopérative sur trois sites à haute affinité , appelés F1 à F3 , localisés en amont du promoteur de ompF ( Figure
1	A	à	PRE	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	faible	faible	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	osmolarité	osmolarité	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	quantité	quantité	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	OmpR	OmpR	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	phosphorylé	phosphorylé	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	(	(	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	OmpR-P	OmpR-P	NOM	_	_	8	parenth	_	_	_	_	_
12	)	)	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
13	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	faible	faible	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
17	OmpR-P	OmpR-P	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
18	se	se	CLI	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	fixe	fixer	VRB	_	_	13	para	_	_	_	_	_
20	alors	alors	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	de	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	façon	façon	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	coopérative	coopératif	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	sur	sur	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	trois	trois	NUM	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	sites	site	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	à	à	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	haute	haut	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
29	affinité	affinité	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
31	appelés	appelé	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	F1	F1	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	à	à	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	F3	F3	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	,	,	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
36	localisés	localiser	VPP	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
37	en	en amont de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	amont	en amont de	DET	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	du	en amont de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	promoteur	promoteur	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	de	de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	ompF	ompF	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	(	(	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
44	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1335
# text = 29 ) .
1	29	29	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1336
# text = Ceci entraîne l'activation de la transcription de ompF , probablement grâce à une interaction avec l'ARN polymérase ( Pratt et Silhavy , 1994 ) .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	entraîne	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	activation	activation	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	transcription	transcription	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	ompF	ompF	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
11	probablement	probablement	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
12	grâce	grâce à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	à	grâce à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
14	une	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	interaction	interaction	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	avec	avec	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
18	ARN	ARN	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	polymérase	polymérase	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	(	(	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	Pratt	Pratt	NOM	_	_	19	parenth	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	Silhavy	Silhavy	NOM	_	_	21	para	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	1994	1994	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	)	)	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1337
# text = En revanche , cette concentration de OmpR-P n'est pas suffisante pour occuper les trois sites C1 à C3 de la région promotrice de ompC et entraîne donc une transcription à un niveau basal de ce gène .
1	En	en revanche	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	revanche	en revanche	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	cette	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	concentration	concentration	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	OmpR-P	OmpR-P	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	n'	ne	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	pas	pas	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	suffisante	suffisant	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	pour	pour	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	occuper	occuper	VNF	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
15	trois	trois	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	sites	site	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	C1	C1	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	à	à	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	C3	C3	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	région	région	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	promotrice	promoteur	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	ompC	ompC	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
27	entraîne	entraîner	VRB	_	_	9	para	_	_	_	_	_
28	donc	donc	ADV	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	une	un	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	transcription	transcription	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
31	à	à	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	un	un	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	niveau	niveau	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	basal	basal	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	ce	ce	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	gène	gène	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1338
# text = L'expression des porines est également régulée de façon post-transcriptionnelle par de petits ARNs , MicF , MicC et MicA , dont la séquence est complémentaire de l'extrémité 5 'non traduite des ARNm de OmpF , OmpC et OmpA , respectivement . Ainsi , l'hybridation de ces trois
1	L'	le	DET	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	expression	expression	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	porines	porines	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	également	également	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	régulée	réguler	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	façon	façon	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	post-transcriptionnelle	post-transcriptionnelle	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
13	petits	petit	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	ARNs	ARNs	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	MicF	MicF	NOM	_	_	14	para	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	MicC	MicC	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
20	MicA	MicA	NOM	_	_	18	para	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
22	dont	dont	PRQ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	séquence	séquence	NOM	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
25	est	être	VRB	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
26	complémentaire	complémentaire	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	l'	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	extrémité	extrémité	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	5	5	NUM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	'	'	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
32	non	non	ADV	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
33	traduite	traduire	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
34	des	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
35	ARNm	ARNm	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	de	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	OmpF	OmpF	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	,	,	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
39	OmpC	OmpC	NOM	_	_	37	para	_	_	_	_	_
40	et	et	COO	_	_	41	mark	_	_	_	_	_
41	OmpA	OmpA	NOM	_	_	39	para	_	_	_	_	_
42	,	,	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
43	respectivement	respectivement	ADV	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
44	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
45	Ainsi	Ainsi	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
46	,	,	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
47	l'	le	DET	_	_	48	spe	_	_	_	_	_
48	hybridation	hybridation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
49	de	de	PRE	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	ces	ce	DET	_	_	51	spe	_	_	_	_	_
51	trois	trois	NUM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1339
# text = ARNs au niveau des ARNm entraîne l'inhibition de la traduction de OmpF , OmpC et OmpA. De plus , le gène micF est transcrit de façon divergente à ompC ( Figure 29A ) , et est activé de la même façon en cas de stress osmotique .
1	ARNs	ARNs	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
2	au	à	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	niveau	niveau	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	des	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ARNm	ARNm	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	entraîne	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	inhibition	inhibition	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	traduction	traduction	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	OmpF	OmpF	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	OmpC	OmpC	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
17	OmpA.	OmpA.	NOM	_	_	15	para	_	_	_	_	_
18	De	De	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
19	plus	plus	ADV	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
21	le	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	gène	gène	NOM	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
23	micF	micF	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	est	être	VRB	_	_	25	aux	_	_	_	_	_
25	transcrit	transcrire	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	façon	façon	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	divergente	divergent	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	à	à	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	ompC	ompC	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	(	(	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
32	Figure	Figure	NOM	_	_	27	parenth	_	_	_	_	_
33	29A	29A	NUM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	)	)	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
35	,	,	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
36	et	et	COO	_	_	38	mark	_	_	_	_	_
37	est	être	VRB	_	_	38	aux	_	_	_	_	_
38	activé	activer	VPP	_	_	25	para	_	_	_	_	_
39	de	de la même façon	ADV	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	la	de la même façon	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
41	même	de la même façon	ADJ	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
42	façon	de la même façon	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
43	en	en cas de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
44	cas	en cas de	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	de	en cas de	PRE	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	stress	stress	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	osmotique	osmotique	ADJ	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1340
# text = Ceci a pour effet une inhibition très rapide de OmpF dans ces conditions .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	pour	pour	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	effet	effet	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	inhibition	inhibition	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	très	très	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	rapide	rapide	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	OmpF	OmpF	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	dans	dans	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
12	ces	ce	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	conditions	condition	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1341
# text = La régulation de ompF par H-NS et Lrp est réalisée par l'intermédiaire de micF .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	régulation	régulation	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ompF	ompF	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	H-NS	H-NS	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	Lrp	Lrp	NOM	_	_	6	para	_	_	_	_	_
9	est	être	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	réalisée	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	intermédiaire	intermédiaire	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	micF	micF	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1342
# text = Chez E. coli B , une région correspondant à la totalité de micF et à une partie de ompC est délétée .
1	Chez	chez	PRE	_	_	21	periph	_	_	_	_	_
2	E.	E.	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	coli	coli	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	B	B	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	région	région	NOM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
8	correspondant	correspondre	VPR	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	totalité	totalité	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	micF	micF	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	12	para	_	_	_	_	_
16	une	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	partie	partie	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	ompC	ompC	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	est	être	VRB	_	_	21	aux	_	_	_	_	_
21	délétée	déliter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1343
# text = Ainsi , OmpF est la seule porine majoritaire présente chez E. coli B etsa régulation négative par micF est absente .
1	Ainsi	ainsi	CSU	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
3	OmpF	OmpF	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
6	seule	seul	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	porine	porine	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	majoritaire	majoritaire	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	présente	présent	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	chez	chez	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
11	E.	E.	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	coli	coli	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	B	B	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	etsa	ester	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	régulation	régulation	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
16	négative	négatif	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	par	par	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	micF	micF	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	absente	absent	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1344
# text = Au vu des résultats obtenus par électrophorèse bidimensionnelle , nous nous sommes d'abord intéressés à l'effet des mutations topA et fis sur la transcription de ompF chez E. coli B dans nos souches isogéniques dérivées du clone ancêtre .
1	Au	au vu de	PRE	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
2	vu	au vu de	DET	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	des	au vu de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	résultats	résultat	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	obtenus	obtenir	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	électrophorèse	électrophorèse	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	bidimensionnelle	bidimensionnel	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
10	nous	nous	CLI	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
11	nous	le	CLI	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
12	sommes	être	VRB	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
13	d'	d'abord	PRE	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
14	abord	d'abord	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	intéressés	intéresser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	à	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	effet	effet	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	des	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	mutations	mutation	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
21	topA	topA	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	fis	faire	VRB	_	_	15	para	_	_	_	_	_
24	sur	sur	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	transcription	transcription	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	ompF	ompF	VNF	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	chez	chez	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	E.	E.	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	coli	coli	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	B	B	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
33	dans	dans	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
34	nos	son	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	souches	souche	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	isogéniques	isogénique	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	dérivées	dériver	VPP	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	du	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	clone	clone	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1345
# text = Effets des mutations topA et fis sur la transcription de ompF
1	Effets	effet	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	mutations	mutation	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	topA	topA	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	fis	faire	VRB	_	_	1	para	_	_	_	_	_
7	sur	sur	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	transcription	transcription	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	ompF	ompF	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1346
# text = La transcription de ompF dépend de la superhélicité de l'ADN et de Fis
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	transcription	transcription	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ompF	ompF	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	dépend	dépendre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	ADN	ADN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	6	para	_	_	_	_	_
14	Fis	Fis	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1347
# text = Une fusion transcriptionnelle a été construite pour le promoteur du gène ompF d'E. coli B ( ompFB ) avec le gène rapporteur lacZ , codant la & 206;& 178;-galactosidase .
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fusion	fusion	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	transcriptionnelle	transcriptionnel	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	a	avoir	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	été	être	VPP	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	construite	construire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	pour	pour	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	promoteur	promoteur	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	du	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	gène	gène	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	ompF	ompF	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	E.	E.	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	coli	coli	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	B	B	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	(	(	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	ompFB	ompFB	ADJ	_	_	11	parenth	_	_	_	_	_
19	)	)	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
20	avec	avec	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
21	le	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	gène	gène	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	rapporteur	rapporteur	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	lacZ	lacZ	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	codant	coder	VPR	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	β-galactosidase	β-galactosidase	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1348
# text = Cette fusion a été introduite à l'aide du bactériophage & 206;& 187;RS 45 dans le chromosome du clone ancêtre , ainsi que des souches isogéniques dérivées 606 topA
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	fusion	fusion	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	a	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	introduite	introduire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	à	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	aide	aide	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	du	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	bactériophage	bactériophage	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	λRS	λRS	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	45	45	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	dans	dans	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
14	le	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	chromosome	chromosome	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	du	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	clone	clone	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
20	ainsi	ainsi que	COO	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	que	ainsi que	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	des	de	PRE	_	_	16	para	_	_	_	_	_
23	souches	souche	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	isogéniques	isogénique	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	dérivées	dériver	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	606	606	NUM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	topA	topA	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1349
# text = - 1 , 606 fis
1	-	-	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	,	1 , 606	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	606	606	NUM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1350
# text = - 1 et 606 & 206;& 148; fis .
1	-	-	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
4	606	606	NUM	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	Δ	Δ	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
6	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1351
# text = Des mesures d'activité & 206;& 178;-galactosidase ont alors été effectuées en fonction de la phase de croissance et de la concentration en NaCl , et chacune des expériences a été réalisée à partir de 3 cultures indépendantes .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mesures	mesure	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	activité	activité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	β-galactosidase	β-galactosidase	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ont	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
7	alors	alors	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
8	été	être	VPP	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	effectuées	effectuer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	en	en	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	fonction	fonction	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	phase	phase	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	croissance	croissance	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	15	para	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	concentration	concentration	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	en	en	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	NaCl	NaCl	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
24	et	et	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
25	chacune	chacun	PRQ	_	_	30	subj	_	_	_	_	_
26	des	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	expériences	expérience	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	a	avoir	VRB	_	_	29	aux	_	_	_	_	_
29	été	être	VPP	_	_	30	aux	_	_	_	_	_
30	réalisée	réaliser	VPP	_	_	9	para	_	_	_	_	_
31	à	à partir de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	partir	à partir de	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	de	à partir de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	3	3	NUM	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	cultures	culture	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	indépendantes	indépendant	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1352
# text = Les prélèvements réalisés pour chaque souche au cours du temps ( Figure
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	prélèvements	prélèvement	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	réalisés	réaliser	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	pour	pour	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	chaque	chaque	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	souche	souche	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	au	au cours de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	cours	au cours de	DET	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	du	au cours de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	temps	temps	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	(	(	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
12	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1353
# text = 30 ) , montrent que la transcription de ompF chez E. coli B est quasiment constitutive , avec une légère baisse en fin de phase exponentielle .
1	30	30	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
4	montrent	montrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	que	que	CSU	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	transcription	transcription	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	ompF	ompF	VNF	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	chez	chez	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	E.	E.	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	coli	coli	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	B	B	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	quasiment	quasiment	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	constitutive	constitutif	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
18	avec	avec	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
19	une	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
20	légère	léger	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	baisse	baisse	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	en	en	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	fin	fin	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	de	un	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	phase	phase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1354
# text = Une diminution de la transcription est observée dans la souche 606 topA
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	diminution	diminution	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	transcription	transcription	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	observée	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	dans	dans	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	souche	souche	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	606	606	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	topA	topA	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1355
# text = - 1 . Cette mutation entraînant une augmentation de superhélicité de l'ADN , ceci pourrait indiquer un rôle potentiel de la superhélicité dans l'activité de ce promoteur , ce qui a été suggéré auparavant .
1	-	-	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	Cette	Cette	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	mutation	mutation	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
6	entraînant	entraîner	VPR	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	une	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	augmentation	augmentation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	ADN	ADN	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
15	ceci	ceci	PRQ	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
16	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	indiquer	indiquer	VNF	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	un	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	rôle	rôle	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	potentiel	potentiel	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	dans	dans	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
25	l'	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	activité	activité	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	ce	ce	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	promoteur	promoteur	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
31	ce	ce	PRQ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
32	qui	qui	PRQ	_	_	35	subj	_	_	_	_	_
33	a	avoir	VRB	_	_	34	aux	_	_	_	_	_
34	été	être	VPP	_	_	35	aux	_	_	_	_	_
35	suggéré	suggérer	VPP	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
36	auparavant	auparavant	ADV	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1356
# text = Cette baisse de transcription est observée pendant toute la croissance cellulaire , avec cependant un effet plus marqué ( diminution de la transcription de 3 fois ) en phase exponentielle .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	baisse	baisse	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	transcription	transcription	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	est	être	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	observée	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	pendant	pendant	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	toute	tout	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	croissance	croissance	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
13	avec	avec	ADV	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
14	cependant	cependant	ADV	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
15	un	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	effet	effet	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
17	plus	plus	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	marqué	marquer	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
19	(	(	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	diminution	diminution	NOM	_	_	18	parenth	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	transcription	transcription	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	3	3	NUM	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	fois	fois	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	)	)	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
28	en	en	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
29	phase	phase	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1357
# text = Une baisse de transcription de l'ordre de 3 fois est également observée suite à une diminution de quantité ou à une disparition de Fis ( souches 606 fis
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	baisse	baisse	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	transcription	transcription	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ordre	ordre	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
9	3	3	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	fois	fois	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	est	être	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
12	également	également	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	observée	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	suite	suite à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	à	suite à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	une	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	diminution	diminution	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	quantité	quantité	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	ou	ou	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
21	à	à	PRE	_	_	15	para	_	_	_	_	_
22	une	un	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	disparition	disparition	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	Fis	Fis	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	(	(	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
27	souches	souche	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
28	606	606	NUM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1358
# text = - 1 et 606 & 206;& 148; fis , respectivement ) .
1	-	-	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
4	606	606	NUM	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	Δ	Δ	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
6	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
8	respectivement	respectivement	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	)	)	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1359
# text = Ces résultats confirment les profils protéiques .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	résultats	résultat	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	confirment	confirmer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	profils	profil	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	protéiques	protéique	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1360
# text = Ainsi , Fis activerait la transcription de ompF de façon directe ou indirecte .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	Fis	Fis	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	activerait	activer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	transcription	transcription	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ompF	ompF	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	façon	façon	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	directe	direct	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	ou	ou	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	indirecte	indirect	ADJ	_	_	11	para	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1361
# text = Cette régulation est spécifique de la phase exponentielle et n'est plus observée en phase stationnaire .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	régulation	régulation	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	spécifique	spécifique	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	phase	phase	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
10	n'	ne	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
11	est	être	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
12	plus	plus	ADV	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
13	observée	observer	VPP	_	_	3	para	_	_	_	_	_
14	en	en	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	phase	phase	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1362
# text = Ceci est cohérent avec le profil d'expression de Fis , protéine très abondante en phase exponentielle mais quasiment absente en phase stationnaire ( voir
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	cohérent	cohérent	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	avec	avec	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	le	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	profil	profil	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	expression	expression	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	Fis	Fis	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
12	protéine	protéine	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
13	très	très	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	abondante	abondant	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	en	en	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	phase	phase	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	mais	mais	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
19	quasiment	quasiment	ADV	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	absente	absent	ADJ	_	_	17	para	_	_	_	_	_
21	en	en	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
22	phase	phase	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	(	(	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
25	voir	voir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1363
# text = Introduction Partie I ,
1	Introduction	introduction	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Partie	Partie	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	I	I	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1364
# text = I.B.3 ) .
1	I.B.3	i.b.3	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1365
# text = La transcription du promoteur ompFB a également été mesurée , grâce à la même fusion transcriptionnelle , dans les souches 606 et 606 & 206;& 148; fis en fonction de la concentration en NaCl , c'est-à-dire en absence et en présence d'un stress osmotique ( Figure 31 ) .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	transcription	transcription	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	promoteur	promoteur	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ompFB	ompFB	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	a	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
7	également	également	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
8	été	être	VPP	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	mesurée	mesurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
11	grâce	grâce à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	à	grâce à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
14	même	même	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	fusion	fusion	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
16	transcriptionnelle	transcriptionnel	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
18	dans	dans	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
19	les	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	souches	souche	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	606	606	NUM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
23	606	606	NUM	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	Δ	Δ	NOM	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
25	fis	faire	VRB	_	_	9	para	_	_	_	_	_
26	en	en	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	fonction	fonction	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	concentration	concentration	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	en	en	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	NaCl	NaCl	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
34	c'	c'est-à-dire	COO	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
35	est-à-dire	c'est-à-dire	COO	_	_	36	mark	_	_	_	_	_
36	en	en	PRE	_	_	26	para	_	_	_	_	_
37	absence	absence	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	et	et	COO	_	_	39	mark	_	_	_	_	_
39	en	en	PRE	_	_	36	para	_	_	_	_	_
40	présence	présence	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	d'	de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	un	un	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	stress	stress	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	osmotique	osmotique	ADJ	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	(	(	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_
46	Figure	Figure	NOM	_	_	43	parenth	_	_	_	_	_
47	31	31	NUM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	)	)	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_
49	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1366
# text = Trois concentrations en
1	Trois	trois	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	concentrations	concentration	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	en	en	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1367
# text = NaCl ont été utilisées :
1	NaCl	NaCl	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	ont	avoir	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	été	être	VPP	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	utilisées	utiliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	:	:	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1368
# text = 0 , 086M , correspondant à la concentration habituelle du milieu LB , 0 , 2M et 0 , 5M .
1	0	0	NUM	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	,	0 , 086m	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	086M	086M	NUM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
5	correspondant	correspondre	VPR	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	à	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	concentration	concentration	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	habituelle	habituel	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	du	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	milieu	milieu	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	LB	LB	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
14	0	0	NUM	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
15	,	0 , 2m	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
16	2M	2M	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
18	0	0	NUM	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
19	,	0 , 5m	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	5M	5M	NUM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1369
# text = Deux prélèvements ont été effectués pour chaque souche et chaque concentration , en début de phase exponentielle ( DO 600 nm = 0 , 2 ) et en phase stationnaire ( DO 600 nm = 4 ) .
1	Deux	deux	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	prélèvements	prélèvement	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	ont	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	effectués	effectuer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	pour	pour	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	chaque	chaque	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	souche	souche	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
10	chaque	chaque	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	concentration	concentration	NOM	_	_	8	para	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
13	en	en	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	début	début	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
16	phase	phase	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	(	(	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
19	DO	DO	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
20	600	600	NUM	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	nm	minute	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	=	égaler	VRB	_	_	11	parenth	_	_	_	_	_
23	0	0	NUM	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
24	,	0 , 2	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
25	2	2	NUM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	)	)	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
27	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
28	en	en	PRE	_	_	6	para	_	_	_	_	_
29	phase	phase	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	(	(	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_
32	DO	DO	NOM	_	_	35	subj	_	_	_	_	_
33	600	600	NUM	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	nm	minute	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	=	égaler	VRB	_	_	5	parenth	_	_	_	_	_
36	4	4	NUM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	)	)	PUNC	_	_	35	punc	_	_	_	_	_
38	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1370
# text = Bien que le stress osmotique soit connu pour entraîner l'inhibition de la transcription de ompF chez E. coli K12 et ses dérivés , cette inhibition n'a pas été observée ici chez E. coli B ( Figure 31 ) .
1	Bien	bien que	CSU	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	que	bien que	CSU	_	_	31	periph	_	_	_	_	_
3	le	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	stress	stress	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
5	osmotique	osmotique	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	soit	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	connu	connaître	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	pour	pour	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	entraîner	entraîner	VNF	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	inhibition	inhibition	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	transcription	transcription	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	ompF	ompF	VNF	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	chez	chez	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	E.	E.	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	coli	coli	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	K12	K12	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
22	ses	son	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	dérivés	dérivé	NOM	_	_	20	para	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
25	cette	ce	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	inhibition	inhibition	NOM	_	_	31	subj	_	_	_	_	_
27	n'	ne	ADV	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
28	a	avoir	VRB	_	_	30	aux	_	_	_	_	_
29	pas	pas	ADV	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
30	été	être	VPP	_	_	31	aux	_	_	_	_	_
31	observée	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
32	ici	ici	ADV	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	chez	chez	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	E.	E.	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
35	coli	coli	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	B	B	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	(	(	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
38	Figure	Figure	NOM	_	_	35	parenth	_	_	_	_	_
39	31	31	NUM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	)	)	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
41	.	.	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1371
# text = Une légère augmentation de la transcription de ompF semble même se produire en augmentant la concentration en NaCl .
1	Une	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	légère	léger	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	augmentation	augmentation	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	transcription	transcription	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ompF	ompF	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	semble	sembler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	même	même	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	se	se	CLI	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	produire	produire	VNF	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	en	en	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	augmentant	augmenter	VPR	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	concentration	concentration	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	en	en	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	NaCl	NaCl	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1372
# text = Ces résultats devraient être confirmés en introduisant dans nos expériences une souche E. coli K12 , ainsi qu'un dérivé délété du gène fis ( ces travaux sont en cours ) .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	résultats	résultat	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	devraient	devoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	être	être	VNF	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	confirmés	confirmer	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	en	en	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	introduisant	introduire	VPR	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	dans	dans	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	nos	son	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	expériences	expérience	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	souche	souche	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
13	E.	E.	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	coli	coli	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	K12	K12	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
17	ainsi	ainsi que	CSU	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	qu'	ainsi que	CSU	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
19	un	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	dérivé	dérivé	NOM	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
21	délété	déliter	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	du	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	gène	gène	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	fis	faire	VRB	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
25	(	(	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
26	ces	ce	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	travaux	travail	NOM	_	_	28	subj	_	_	_	_	_
28	sont	être	VRB	_	_	24	parenth	_	_	_	_	_
29	en	en cours	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	cours	en cours	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	)	)	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1373
# text = D'autre part , la validité du stress osmotique devra également être réalisée par utilisation d'un milieu minimum additionné ou non de saccharose .
1	D'	d'autre part	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	autre	d'autre part	ADV	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
3	part	d'autre part	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	validité	validité	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
7	du	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	stress	stress	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	osmotique	osmotique	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	devra	devoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	également	également	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	être	être	VNF	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	réalisée	réaliser	VPP	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	par	par	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	utilisation	utilisation	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	d'	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	un	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	milieu	milieu	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	minimum	minimum	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	additionné	additionné	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	ou	ou	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
22	non	non	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	16	para	_	_	_	_	_
24	saccharose	saccharose	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1374
# text = La régulation de ompF B par Fis révèle quelques différences lors d'un stress osmotique ( Figure 31 ) .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	régulation	régulation	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ompF	ompF	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	B	B	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	Fis	Fis	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	révèle	révéler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	quelques	quelque	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	différences	différence	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	lors	lors de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	d'	lors de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	un	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	stress	stress	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	osmotique	osmotique	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	(	(	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
17	Figure	Figure	NOM	_	_	14	parenth	_	_	_	_	_
18	31	31	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	)	)	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1375
# text = En milieu LB classique ( 0 , 086M
1	En	en	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	milieu	milieu	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	LB	LB	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	classique	classique	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	(	(	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
6	0	0	NUM	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
7	,	0 , 086m	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
8	086M	086M	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1376
# text = NaCl ) , l'activation de la transcription de ompF B par Fis a été retrouvée , uniquement en phase exponentielle .
1	NaCl	NaCl	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	activation	activation	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	transcription	transcription	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	ompF	ompF	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	B	B	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
13	Fis	Fis	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	a	avoir	VRB	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
15	été	être	VPP	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	retrouvée	retrouver	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
18	uniquement	uniquement	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	en	en	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	phase	phase	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1377
# text = En revanche , lorsque la concentration en NaCl augmente , l'activation de la transcription de ompF B par Fis est détectée aussi bien en phase exponentielle qu'en phase stationnaire .
1	En	en revanche	PRE	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
2	revanche	en revanche	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	lorsque	lorsque	CSU	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	concentration	concentration	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
7	en	en	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	NaCl	NaCl	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	augmente	augmenter	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	activation	activation	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	transcription	transcription	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	ompF	ompF	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	B	B	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	par	par	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
20	Fis	Fis	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	est	être	VRB	_	_	22	aux	_	_	_	_	_
22	détectée	détecter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	aussi	aussi bien	ADV	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	bien	aussi bien	ADV	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	en	en	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	phase	phase	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	qu'	que	CSU	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
29	en	en	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	phase	phase	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1378
# text = De plus amples expériences seraient ici nécessaires afin de comprendre le rôle joué par Fis dans la régulation de ompF B en fonction du stress osmotique .
1	De	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
2	plus	plus	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	amples	ample	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	expériences	expérience	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	seraient	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	ici	ici	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	nécessaires	nécessaire	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	afin	afin de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	afin de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	comprendre	comprendre	VNF	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	le	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	rôle	rôle	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	joué	jouer	VPP	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	par	par	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	Fis	Fis	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	dans	dans	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	régulation	régulation	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	ompF	ompF	VNF	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	B	B	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	en	en	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	fonction	fonction	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	du	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	stress	stress	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	osmotique	osmotique	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1379
# text = Notamment , l'expression de Fis en fonction de la concentration en NaCl devrait être analysée .
1	Notamment	notamment	ADV	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	expression	expression	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	Fis	Fis	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	en	en	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	fonction	fonction	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	concentration	concentration	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	en	en	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	NaCl	NaCl	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	devrait	devoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	être	être	VNF	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	analysée	analyser	VPP	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1380
# text = Ces expériences sont actuellement en cours au laboratoire .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	expériences	expérience	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	actuellement	actuellement	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	en	en	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	cours	cours	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	au	à	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	laboratoire	laboratoire	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1381
# text = L'activation de ompF par Fis est directe
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	activation	activation	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ompF	ompF	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	Fis	Fis	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	directe	direct	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1382
# text = Afin de savoir si le mécanisme d'activation de ompF par Fis était direct ou indirect , des retards sur gels ont été réalisés en utilisant d'une part la protéine Fis purifiée à partir de la souche ancêtre ( voir Résultats , Partie II ) et d'autre part la région promotrice de ompF , amplifiée également à partir de la souche ancêtre ( Figure
1	Afin	afin de	PRE	_	_	24	periph	_	_	_	_	_
2	de	afin de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	savoir	savoir	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	si	si	CSU	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	le	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	activation	activation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	ompF	ompF	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	Fis	Fis	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	était	être	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
14	direct	direct	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	ou	ou	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	indirect	indirect	ADJ	_	_	14	para	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
18	des	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	retards	retard	NOM	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
20	sur	sur	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	gels	gel	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	ont	avoir	VRB	_	_	23	aux	_	_	_	_	_
23	été	être	VPP	_	_	24	aux	_	_	_	_	_
24	réalisés	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
25	en	en	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	utilisant	utiliser	VPR	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	d'	d'une part	ADV	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	une	d'une part	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	part	d'une part	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	la	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	protéine	protéine	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
32	Fis	Fis	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	purifiée	purifier	VPP	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	à	à partir de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	partir	à partir de	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	de	à partir de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	la	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	souche	souche	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	(	(	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
41	voir	voir	VNF	_	_	33	parenth	_	_	_	_	_
42	Résultats	Résultats	NOM	_	_	41	subj	_	_	_	_	_
43	,	,	PUNC	_	_	52	punc	_	_	_	_	_
44	Partie	Partie	ADJ	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	II	II	ADJ	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
46	)	)	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
47	et	et	COO	_	_	52	mark	_	_	_	_	_
48	d'	d'autre part	ADV	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	autre	d'autre part	ADJ	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
50	part	d'autre part	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
51	la	le	DET	_	_	52	spe	_	_	_	_	_
52	région	région	NOM	_	_	31	para	_	_	_	_	_
53	promotrice	promoteur	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	de	de	PRE	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	ompF	ompF	NOM	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	,	,	PUNC	_	_	66	punc	_	_	_	_	_
57	amplifiée	amplifier	VPP	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
58	également	également	ADV	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
59	à	à partir de	PRE	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
60	partir	à partir de	NOM	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
61	de	à partir de	PRE	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
62	la	le	DET	_	_	63	spe	_	_	_	_	_
63	souche	souche	NOM	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
64	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
65	(	(	PUNC	_	_	64	punc	_	_	_	_	_
66	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1383
# text = 32 ) .
1	32	32	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1384
# text = Un retard est visible dès 0 , 2 nM de Fis et augmente jusqu'à une concentration en protéine de 40 nM ( Figure 32A ) .
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	retard	retard	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	visible	visible	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	dès	dès	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	0	0	NUM	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
7	,	0 , 2	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
8	2	2	NUM	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	nM	nM	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	Fis	Fis	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	augmente	augmenter	VRB	_	_	3	para	_	_	_	_	_
14	jusqu'à	jusqu'à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	une	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	concentration	concentration	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	en	en	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
18	protéine	protéine	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	40	40	NUM	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	nM	nM	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	(	(	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
23	Figure	Figure	NOM	_	_	21	parenth	_	_	_	_	_
24	32A	32A	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	)	)	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1385
# text = De multiples bandes retardées sont observées , ce qui pourrait indiquer la présence de plusieurs sites de fixation de Fis dans la région promotrice de ompF. La constante de dissociation , calculée de la même façon que dans la Partie II des résultats ( Materials and
1	De	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	multiples	multiple	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	bandes	bande	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
4	retardées	retarder	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	sont	être	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	observées	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_
8	ce	ce	PRQ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	qui	qui	PRQ	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
10	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	indiquer	indiquer	VNF	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	présence	présence	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	sites	site	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	fixation	fixation	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	Fis	Fis	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	dans	dans	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	région	région	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	promotrice	promoteur	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	ompF.	ompF.	VNF	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	La	La	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	constante	constante	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	dissociation	dissociation	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_
32	calculée	calculer	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	de	de la même façon	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
34	la	de la même façon	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
35	même	de la même façon	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
36	façon	de la même façon	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
37	que	que	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
38	dans	dans	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
39	la	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	Partie	Partie	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	II	II	ADJ	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	des	de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	résultats	résultat	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	(	(	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
45	Materials	Materials	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
46	and	materials and	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1386
# text = Methods ) est de 2 nM. Trois types de contrôles pour tester la spécificité de la fixation ont été effectués .
1	Methods	Methods	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	est	est	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	de	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	2	2	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	nM.	nM.	VPR	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	Trois	Trois	NUM	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	types	type	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	contrôles	contrôle	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	pour	pour	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
12	tester	tester	VNF	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	spécificité	spécificité	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	fixation	fixation	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	ont	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	été	été	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	effectués	effectuer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1387
# text = Le premier a consisté à ajouter un anticorps anti-Fis au mélange ADN-Fis .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	premier	premier	ADJ	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	a	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	consisté	consister	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	à	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ajouter	ajouter	VNF	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	un	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	anticorps	anticorps	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	anti-Fis	anti-	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	au	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
11	mélange	mélange	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	ADN-Fis	ADN-Fis	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1388
# text = Un retard de migration supplémentaire ( supershift ) a été observé ( résultat non montré ) .
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	retard	retard	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	migration	migration	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	supplémentaire	supplémentaire	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	(	(	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	supershift	super-	NOM	_	_	4	parenth	_	_	_	_	_
8	)	)	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
9	a	avoir	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	été	être	VPP	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	observé	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	résultat	résultat	NOM	_	_	11	parenth	_	_	_	_	_
14	non	non	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	montré	montrer	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	)	)	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1389
# text = Le second a consisté à remplacer la protéine Fis purifiée par une fraction plus tardive de la purification sur SP-sépharose par FPLC ( voir Résultats Partie II , Materials and Methods ) .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	second	second	ADJ	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	a	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	consisté	consister	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	à	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	remplacer	remplacer	VNF	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	protéine	protéine	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	Fis	Fis	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	purifiée	purifier	VPP	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	une	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	fraction	fraction	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	plus	plus	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	tardive	tardif	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	purification	purification	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	sur	sur	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	SP-sépharose	SP-sépharose	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	par	par	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
22	FPLC	FPLC	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	(	(	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	voir	voir	VNF	_	_	4	parenth	_	_	_	_	_
25	Résultats	Résultats	NOM	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
26	Partie	Partie	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	II	II	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
29	Materials	Materials	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
30	and	materials and methods	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	Methods	Methods	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
32	)	)	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1390
# text = Aucun retard de migration n'a alors été constaté ( résultat non montré ) .
1	Aucun	aucun	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	retard	retard	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	migration	migration	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	n'	ne	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
6	a	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
7	alors	alors	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
8	été	être	VPP	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	constaté	constater	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	(	(	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	résultat	résultat	NOM	_	_	9	parenth	_	_	_	_	_
12	non	non	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	montré	montrer	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	)	)	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1391
# text = Enfin , le troisième contrôle a consisté à ajouter deux types d'oligonucléotides non marqués radioactivement , en quantités croissantes , au mélange ADN-Fis ( Figure 32B ) .
1	Enfin	enfin	ADV	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
4	troisième	troisième	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	contrôle	contrôle	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
6	a	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	consisté	consister	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	ajouter	ajouter	VNF	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	deux	deux	NUM	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	types	type	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	d'	de	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	oligonucléotides	de	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	non	non	ADV	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
15	marqués	marquer	VPP	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	radioactivement	radio-	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
18	en	en	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	quantités	quantité	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	croissantes	croissant	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	au	à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
23	mélange	mélange	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	ADN-Fis	ADN-Fis	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	(	(	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	Figure	Figure	NOM	_	_	23	parenth	_	_	_	_	_
27	32B	32B	NUM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	)	)	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1392
# text = Le premier type contient une séquence consensus de fixation de Fis ( Finkel et Johnson , 1992 ) , ici le site I à haute affinité présent dans la région promotrice du gène fis lui-même ;
1	Le	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	premier	premier	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	type	type	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	contient	contenir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	séquence	séquence	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	consensus	consensus	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	fixation	fixation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	Fis	Fis	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Finkel	Finkel	NOM	_	_	11	parenth	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	Johnson	Johnson	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
17	1992	1992	NUM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	)	)	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
20	ici	ici	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
21	le	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	site	site	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
23	I	I	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	à	à	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	haute	haut	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	affinité	affinité	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	présent	présent	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	dans	dans	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	région	région	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	promotrice	promoteur	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	du	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	gène	gène	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
35	lui-même	lui-même	PRQ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	;	;	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1393
# text = dans ce cas , le retard de migration observé diminue rapidement avec l'augmentation de la concentration de l'oligonucléotide .
1	dans	dans	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	ce	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	cas	cas	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	le	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	retard	retard	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	migration	migration	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	observé	observer	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	diminue	diminuer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	rapidement	rapidement	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	avec	avec	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	augmentation	augmentation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	concentration	concentration	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	NOM	_	_	20	det	_	_	_	_	_
20	oligonucléotide	le	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1394
# text = Le deuxième type correspond à la même séquence d'ADN mais pour laquelle le site de fixation de Fis a été mutagénisé .
1	Le	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	deuxième	deuxième	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	type	type	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	correspond	correspondre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	à	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
7	même	même	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	séquence	séquence	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	ADN	ADN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	mais	mais	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
12	pour	pour	PRE	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
13	laquelle	lequelComp?	PRQ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
14	le	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	site	site	NOM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	fixation	fixation	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	Fis	Fis	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	a	avoir	VRB	_	_	21	aux	_	_	_	_	_
21	été	être	VPP	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
22	mutagénisé	muter	VRB	_	_	4	para	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1395
# text = Aucune différence de retard de migration n'a alors été observée , quelle que soit la concentration en oligonucléotide .
1	Aucune	aucun	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	différence	différence	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	retard	retard	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	migration	migration	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	n'	ne	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
8	a	avoir	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
9	alors	alors	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
10	été	être	VPP	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	observée	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	quelle	quel?	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	que	que	PRQ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	soit	être	VRB	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	concentration	concentration	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
18	en	en	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	oligonucléotide	oligonucléotide	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1396
# text = Tous ces contrôles démontrent que la fixation de Fis sur le promoteur ompF est spécifique .
1	Tous	tout	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	contrôles	contrôle	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	démontrent	démontrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	que	que	CSU	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	fixation	fixation	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	Fis	Fis	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	sur	sur	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	le	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	promoteur	promoteur	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	ompF	ompF	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	est	être	VRB	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
15	spécifique	spécifique	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1397
# text = Ces résultats montrent également que Fis active la transcription de ompF de manière directe , en se fixant sur la région promotrice du gène .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	résultats	résultat	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	montrent	montrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	également	également	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	que	que	CSU	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	Fis	Fis	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	active	activer	VRB	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	transcription	transcription	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	ompF	ompF	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	manière	manière	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	directe	direct	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	en	en	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
17	se	se	CLI	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	fixant	fixer	VPR	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	sur	sur	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	région	région	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	promotrice	promoteur	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	du	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	gène	gène	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1398
# text = Détermination des sites de fixation de Fis sur ompF
1	Détermination	détermination	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	sites	site	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	fixation	fixation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	Fis	Fis	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	sur	sur	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
9	ompF	ompF	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1399
# text = Afin de déterminer précisément les sites de fixation de Fis dans la région promotrice de ompF , nous avons réalisé des empreintes à la DNase I sur cette région protégée par Fis ( Figure 33 ) .
1	Afin	afin de	PRE	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
2	de	afin de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	déterminer	déterminer	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	précisément	précisément	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	sites	site	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	fixation	fixation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	Fis	Fis	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	dans	dans	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	région	région	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	promotrice	promoteur	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	ompF	ompF	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
18	nous	nous	CLS	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
19	avons	avoir	VRB	_	_	20	aux	_	_	_	_	_
20	réalisé	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	des	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	empreintes	empreinte	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	à	à	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	DNase	DNase	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	I	I	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	sur	sur	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	cette	ce	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	région	région	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	protégée	protéger	VPP	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	par	par	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	Fis	Fis	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	(	(	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
34	Figure	Figure	NOM	_	_	32	parenth	_	_	_	_	_
35	33	33	NUM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	)	)	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
37	.	.	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1400
# text = Des quantités croissantes de Fis ont été employées , correspondant aux rapports molaires utilisés dans les expériences de retards sur gel .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	quantités	quantité	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	croissantes	croissant	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	Fis	Fis	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ont	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	été	être	VPP	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	employées	employer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	correspondant	correspondre	VPR	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	aux	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	rapports	rapport	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	molaires	molaire	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	utilisés	utiliser	VPP	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	dans	dans	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	les	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	expériences	expérience	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	retards	retard	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	sur	sur	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
21	gel	gel	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1401
# text = Quatre couples d'amorces ont été utilisés ( Figure 34 ) pour amplifier par PCR quatre fragments d'ADN de la région promotrice de ompF B , qui ont ensuite permis de réaliser des expériences d'empreintes à la DNase I
1	Quatre	quatre	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	couples	couple	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	amorces	amorce	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ont	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	été	être	VPP	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	utilisés	utiliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	(	(	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
9	Figure	Figure	NOM	_	_	7	parenth	_	_	_	_	_
10	34	34	NUM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	)	)	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
12	pour	pour	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
13	amplifier	amplifier	VNF	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	par	par	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	PCR	PCR	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	quatre	quatre	NUM	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	fragments	fragment	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
18	d'	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	ADN	ADN	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	région	région	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	promotrice	promoteur	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	ompF	ompF	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	B	B	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
28	qui	qui	PRQ	_	_	31	subj	_	_	_	_	_
29	ont	avoir	VRB	_	_	31	aux	_	_	_	_	_
30	ensuite	ensuite	ADV	_	_	31	periph	_	_	_	_	_
31	permis	permettre	VPP	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	réaliser	réaliser	VNF	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	des	un	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	expériences	expérience	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	d'	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	empreintes	empreinte	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	à	à	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	la	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	DNase	DNase	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	I	I	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1402
# text = ( Figure 33 ) .
1	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	Figure	Figure	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	33	33	NUM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
4	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
5	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1403
# text = Les empreintes à la DNase I révèlent 5 zones de protection par Fis dans la région promotrice de ompF , au sein desquelles desquelles sont observés des sites d'hypersensibilité ( Figure 33 ) caractéristiques de la courbure engendrée par la fixation de Fis sur l'ADN , ce qui exposerait particulièrement quelques bases localisées entre les deux domaines C-terminaux de Fis ( Slany et Kersten , 1992 ) .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	empreintes	empreinte	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	à	à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	DNase	DNase	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	I	I	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	révèlent	révéler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	5	5	NUM	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	zones	zone	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	protection	protection	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	par	par	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
13	Fis	Fis	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	dans	dans	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	région	région	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	promotrice	promoteur	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	ompF	ompF	VNF	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	49	punc	_	_	_	_	_
21	au	au sein de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
22	sein	au sein de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	desquelles	au sein de	PRE	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
24	desquelles	quel?	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	sont	être	VRB	_	_	26	aux	_	_	_	_	_
26	observés	observer	VPP	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
27	des	un	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	sites	site	NOM	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
29	d'	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	hypersensibilité	hypersensibilité	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	(	(	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
32	Figure	Figure	NOM	_	_	28	parenth	_	_	_	_	_
33	33	33	NUM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	)	)	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
35	caractéristiques	caractéristique	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
36	de	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	la	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	courbure	courbure	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	engendrée	engendrer	VPP	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	par	par	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	la	le	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	fixation	fixation	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	de	de	PRE	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	Fis	Fis	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	sur	sur	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
46	l'	le	DET	_	_	47	spe	_	_	_	_	_
47	ADN	ADN	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
48	,	,	PUNC	_	_	49	punc	_	_	_	_	_
49	ce	ce	PRQ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
50	qui	qui	PRQ	_	_	51	subj	_	_	_	_	_
51	exposerait	exposer	VRB	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
52	particulièrement	particulièrement	ADV	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	quelques	quelque	DET	_	_	54	spe	_	_	_	_	_
54	bases	base	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
55	localisées	localiser	VPP	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	entre	entre	PRE	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
57	les	le	DET	_	_	59	spe	_	_	_	_	_
58	deux	deux	NUM	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
59	domaines	domaine	NOM	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
60	C-terminaux	C-terminaux	NOM	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
61	de	de	PRE	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
62	Fis	Fis	NOM	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
63	(	(	PUNC	_	_	64	punc	_	_	_	_	_
64	Slany	Slany	NOM	_	_	62	parenth	_	_	_	_	_
65	et	et	COO	_	_	66	mark	_	_	_	_	_
66	Kersten	Kersten	NOM	_	_	64	para	_	_	_	_	_
67	,	,	PUNC	_	_	68	punc	_	_	_	_	_
68	1992	1992	NUM	_	_	66	dep	_	_	_	_	_
69	)	)	PUNC	_	_	64	punc	_	_	_	_	_
70	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1404
# text = Cinq sites de fixation de Fis , I à V , ont ainsi été mis en évidence ( Figure 34 ) .
1	Cinq	cinq	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	sites	site	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	fixation	fixation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	Fis	Fis	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
8	I	I	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	V	V	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
12	ont	avoir	VRB	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
13	ainsi	ainsi	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
14	été	être	VPP	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
15	mis	mettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	en	en	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	évidence	évidence	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	(	(	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Figure	Figure	NOM	_	_	17	parenth	_	_	_	_	_
20	34	34	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	)	)	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1405
# text = Le premier est situé en amont de la boîte - 35 du promoteur , chevauchant les sites F1 , F2 et F3 de fixation de OmpR , ainsi qu'un des sites de fixation d'IHF .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	premier	premier	ADJ	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	situé	situé	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	en	en amont de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	amont	en amont de	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	en amont de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	boîte	boîte	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	-	-	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	35	35	NUM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	du	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	promoteur	promoteur	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	chevauchant	chevaucher	VPR	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	les	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	sites	site	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	F1	F1	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	F2	F2	NOM	_	_	18	para	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	F3	F3	NOM	_	_	20	para	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
24	fixation	fixation	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	OmpR	OmpR	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
28	ainsi	ainsi que	COO	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
29	qu'	ainsi que	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
30	un	un	PRQ	_	_	24	para	_	_	_	_	_
31	des	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	sites	site	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	fixation	fixation	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	d'	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	IHF	IHF	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1406
# text = L'étendue de ce premier site , des positions - 45 à - 118 , laisse supposer la fixation de plusieurs dimères de Fis , bien qu'un seul site proche de la séquence consensus ait pu être identifié .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	étendue	étendue	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ce	ce	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	premier	premier	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	site	site	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
8	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
9	positions	position	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	-	- 45	PUNC	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	45	45	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	-	- 118	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
14	118	118	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
16	laisse	laisser	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	supposer	supposer	VNF	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	fixation	fixation	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	dimères	dimère	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	Fis	Fis	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
26	bien	bien que	CSU	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
27	qu'	bien que	CSU	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
28	un	un	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
29	seul	seul	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	site	site	NOM	_	_	37	subj	_	_	_	_	_
31	proche	proche	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	la	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	séquence	séquence	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	consensus	consensus	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	ait	avoir	VRB	_	_	37	aux	_	_	_	_	_
37	pu	pouvoir	VPP	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
38	être	être	VNF	_	_	39	aux	_	_	_	_	_
39	identifié	identifier	VPP	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1407
# text = La localisation de ce site pourrait également suggérer des interactions entre Fis et OmpR au niveau de la régulation de ompF .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	localisation	localisation	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ce	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	site	site	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	également	également	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	suggérer	suggérer	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	des	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	interactions	interaction	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	entre	entre	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	Fis	Fis	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	OmpR	OmpR	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
15	au	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
16	niveau	niveau	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	régulation	régulation	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	ompF	ompF	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1408
# text = Les quatre autres sites de fixation de Fis s'étendent des positions - 130 à - 363 et sont tous localisés entre les sites F1 et F4 de fixation de OmpR. Le centre des différents sites de fixation de Fis est espacé , respectivement de 69 pb ( I à II ) , 82 pb ( II à III ) , 60 pb ( III à IV ) et 54 pb ( IV à V ) .
1	Les	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
2	quatre	quatre	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
3	autres	autre	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	sites	site	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	fixation	fixation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	Fis	Fis	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	s'	s'	CLI	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	étendent	étendre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	des	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	positions	position	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	-	- 130	PUNC	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	130	130	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
16	-	- 363	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
17	363	363	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	sont	être	VRB	_	_	10	para	_	_	_	_	_
20	tous	tout	PRQ	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
21	localisés	localiser	VPP	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	entre	entre	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	les	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	sites	site	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	F1	F1	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	42	mark	_	_	_	_	_
27	F4	F4	NOM	_	_	42	subj	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	fixation	fixation	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	OmpR.	OmpR.	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	Le	Le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	centre	centre	NUM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	des	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	différents	différent	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
36	sites	site	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	fixation	fixation	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	de	de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	Fis	Fis	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	est	être	VRB	_	_	42	aux	_	_	_	_	_
42	espacé	espacer	VPP	_	_	19	para	_	_	_	_	_
43	,	,	PUNC	_	_	45	punc	_	_	_	_	_
44	respectivement	respectivement	ADV	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
45	de	de	PRE	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
46	69	69	NUM	_	_	47	spe	_	_	_	_	_
47	pb	problème	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
48	(	(	PUNC	_	_	49	punc	_	_	_	_	_
49	I	I	NOM	_	_	47	parenth	_	_	_	_	_
50	à	à	PRE	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	II	II	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	)	)	PUNC	_	_	49	punc	_	_	_	_	_
53	,	,	PUNC	_	_	55	punc	_	_	_	_	_
54	82	82	NUM	_	_	55	spe	_	_	_	_	_
55	pb	problème	NOM	_	_	47	para	_	_	_	_	_
56	(	(	PUNC	_	_	57	punc	_	_	_	_	_
57	II	II	NOM	_	_	55	parenth	_	_	_	_	_
58	à	à	PRE	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
59	III	III	NOM	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
60	)	)	PUNC	_	_	57	punc	_	_	_	_	_
61	,	,	PUNC	_	_	71	punc	_	_	_	_	_
62	60	60	NUM	_	_	63	spe	_	_	_	_	_
63	pb	problème	NOM	_	_	55	para	_	_	_	_	_
64	(	(	PUNC	_	_	65	punc	_	_	_	_	_
65	III	III	NOM	_	_	63	parenth	_	_	_	_	_
66	à	à	PRE	_	_	65	dep	_	_	_	_	_
67	IV	IV	NOM	_	_	66	dep	_	_	_	_	_
68	)	)	PUNC	_	_	65	punc	_	_	_	_	_
69	et	et	COO	_	_	71	mark	_	_	_	_	_
70	54	54	NUM	_	_	71	spe	_	_	_	_	_
71	pb	problème	NOM	_	_	55	para	_	_	_	_	_
72	(	(	PUNC	_	_	73	punc	_	_	_	_	_
73	IV	IV	NOM	_	_	71	parenth	_	_	_	_	_
74	à	à	PRE	_	_	73	dep	_	_	_	_	_
75	V	V	NOM	_	_	74	dep	_	_	_	_	_
76	)	)	PUNC	_	_	73	punc	_	_	_	_	_
77	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1409
# text = L'éloignement de ces sites pourrait suggérer que les dimères de Fis puissent se fixer pour la plupart du même côté de la double hélice d'ADN et y induire une forte courbure qui entraînerait l'activation de la transcription .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	éloignement	éloignement	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ces	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	sites	site	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	suggérer	suggérer	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	que	que	CSU	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	les	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	dimères	dimère	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	Fis	Fis	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	puissent	pouvoir	VRB	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
14	se	se	CLI	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	fixer	fixer	VNF	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	pour	pour	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	plupart	plupart	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	du	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	même	même	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	côté	côté	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
24	double	double	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	hélice	hélice	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	d'	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	ADN	ADN	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	et	et	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
29	y	le	CLI	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	induire	induire	VNF	_	_	15	para	_	_	_	_	_
31	une	un	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
32	forte	fort	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
33	courbure	courbure	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
34	qui	qui	PRQ	_	_	35	subj	_	_	_	_	_
35	entraînerait	entraîner	VRB	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	l'	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	activation	activation	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	la	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	transcription	transcription	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1410
# text = In vivo , cette région pourrait déjà présenter une courbure intrinsèque importante , puisqu'elle est riche en AT , à laquelle viendrait s'ajouter celle induite par la fixation de Fis .
1	In	in vivo	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	vivo	in vivo	ADV	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	cette	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	région	région	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	déjà	déjà	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	présenter	présenter	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	une	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	courbure	courbure	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	intrinsèque	intrinsèque	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	importante	important	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	puisqu'	puisque	CSU	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
15	elle	elle	CLS	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
16	est	être	VRB	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	riche	riche	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	en	en	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	AT	AT	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
21	à	à	PRE	_	_	25	periph	_	_	_	_	_
22	laquelle	lequel	PRQ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	viendrait	venir	VRB	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
24	s'	s'	CLI	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	ajouter	ajouter	VNF	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	celle	celui	PRQ	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
27	induite	induire	VPP	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	par	par	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	fixation	fixation	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	Fis	Fis	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1411
# text = Nous avons ici démontré que Fis activait la transcription du gène ompF d'E. coli B en se fixant sur 5 sites présents dans la région promotrice .
1	Nous	nous	CLS	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	avons	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
3	ici	ici	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	démontré	démontrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	que	que	CSU	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	Fis	Fis	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	activait	activer	VRB	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	transcription	transcription	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	du	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	gène	gène	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	ompF	ompF	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	E.	E.	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	coli	coli	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	B	B	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	en	en	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
18	se	se	CLI	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	fixant	fixer	VPR	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	sur	sur	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	5	5	NUM	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	sites	site	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	présents	présent	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	dans	dans	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	région	région	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	promotrice	promoteur	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1412
# text = Bien que la régulation des porines soit relativement bien connue chez
1	Bien	bien	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	que	que	CSU	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	régulation	régulation	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	porines	purine	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	soit	être	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
8	relativement	relativement	ADV	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
9	bien	bien	ADV	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
10	connue	connaître	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
11	chez	chez	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1413
# text = E . coli K12 , et étudiée depuis plus de 30 ans maintenant , aucune régulation par Fis des gènes de porines , que ce soit ompF ou ompC , ou des gènes de régulation ompR et envZ , n'a été répertoriée , ce qui peut paraître surprenant .
1	E	e	NOM	_	_	43	periph	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	coli	colis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	K12	K12	NOM	_	_	43	subj	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
7	étudiée	étudier	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	depuis	depuis	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	plus	plus	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	30	30	NUM	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	ans	an	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	maintenant	maintenant	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
15	aucune	aucun	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	régulation	régulation	NOM	_	_	4	para	_	_	_	_	_
17	par	par	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	Fis	Fis	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	des	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	gènes	gène	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	porines	purine	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
24	que	que	PRQ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
25	ce	ce	CLS	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
26	soit	être	VRB	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
27	ompF	ompF	ADV	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	ou	ou	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
29	ompC	ompC	ADV	_	_	27	para	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
31	ou	ou	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
32	des	de	PRE	_	_	19	para	_	_	_	_	_
33	gènes	gène	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	régulation	régulation	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	ompR	ompR	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	et	et	COO	_	_	38	mark	_	_	_	_	_
38	envZ	envZ	ADJ	_	_	36	para	_	_	_	_	_
39	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
40	n'	ne	ADV	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
41	a	avoir	VRB	_	_	42	aux	_	_	_	_	_
42	été	être	VPP	_	_	43	aux	_	_	_	_	_
43	répertoriée	répertorier	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
44	,	,	PUNC	_	_	45	punc	_	_	_	_	_
45	ce	ce	PRQ	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	qui	qui	PRQ	_	_	47	subj	_	_	_	_	_
47	peut	pouvoir	VRB	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
48	paraître	paraître	VNF	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	surprenant	surprenant	ADJ	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1414
# text = Ceci pourrait être lié au fait que la régulation que nous venons de mettre en évidence soit spécifique d'E. coli B. Nous avons donc réalisé les mêmes expériences dans l'isolat d'E. coli le plus utilisé en laboratoire :
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	être	être	VNF	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	lié	lier	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	au	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	fait	fait	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	que	que	CSU	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	régulation	régulation	NOM	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
10	que	que	PRQ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
11	nous	nous	CLS	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
12	venons	venir	VRB	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	mettre	mettre	VNF	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	en	en	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
16	évidence	évidence	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	soit	soit	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	spécifique	spécifique	ADJ	_	_	15	para	_	_	_	_	_
19	d'	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
20	E.	E.	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	coli	coli	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	B.	B.	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	Nous	Nous	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	avons	avoir	VRB	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
25	donc	donc	ADV	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
26	réalisé	réaliser	VPP	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	les	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	mêmes	même	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
29	expériences	expérience	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	dans	dans	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
31	l'	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	isolat	isolat	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	d'	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	E.	E.	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
35	coli	coli	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	le	le plus	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	plus	le plus	ADV	_	_	38	periph	_	_	_	_	_
38	utilisé	utiliser	VPP	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
39	en	en	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	laboratoire	laboratoire	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	:	:	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1415
# text = K12 .
1	K12	K12	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1416
# text = Pour ce faire , nous avons utilisé la souche CF7968 , un dérivé Lac- de la souche
1	Pour	pour ce faire	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	ce	pour ce faire	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	faire	pour ce faire	ADV	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
5	nous	nous	CLS	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
6	avons	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	utilisé	utiliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	souche	souche	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	CF7968	CF7968	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
12	un	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	dérivé	dérivé	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	Lac-	Lac-	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	souche	souche	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1417
# text = MG1655 , dont la séquence du génome est disponible .
1	MG1655	MG1655	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
3	dont	dont	PRQ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	séquence	séquence	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
6	du	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	génome	génome	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	est	être	VRB	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	disponible	disponible	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1418
# text = Au préalable , nous avons construit , toujours en utilisant le plasmide suicide pKO 3 , une délétion en phase du gène fis dans la souche CF7968 ( appelée K12 ) , ce qui nous a permis d'obtenir une souche isogénique CF 7968 & 206;& 148; fis ( appelée K 12 & 206;& 148; fis ) .
1	Au	à	PRE	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
2	préalable	préalable	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	nous	nous	CLS	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	avons	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	construit	construire	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
8	toujours	toujours	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	en	le	CLI	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	utilisant	utiliser	VPR	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
11	le	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	plasmide	plasmode	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	suicide	suicide	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	pKO	pKO	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	3	3	NUM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
17	une	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	délétion	délétion	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
19	en	en	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	phase	phase	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	du	de+le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	gène	gène	NOM	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
23	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	dans	dans	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	souche	souche	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	CF7968	CF7968	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	(	(	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	appelée	appelé	NOM	_	_	26	parenth	_	_	_	_	_
30	K12	K12	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	)	)	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
32	,	,	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_
33	ce	ce	PRQ	_	_	46	subj	_	_	_	_	_
34	qui	qui	PRQ	_	_	37	subj	_	_	_	_	_
35	nous	le	CLI	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
36	a	avoir	VRB	_	_	37	aux	_	_	_	_	_
37	permis	permettre	VPP	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
38	d'	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	obtenir	obtenir	VNF	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	une	un	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	souche	souche	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	isogénique	isogénique	ADJ	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	CF	CF	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	7968	7968	NUM	_	_	45	spe	_	_	_	_	_
45	Δ	Δ	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	fis	faire	VRB	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
47	(	(	PUNC	_	_	52	punc	_	_	_	_	_
48	appelée	appelé	NOM	_	_	52	subj	_	_	_	_	_
49	K	K	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	12	12	NUM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
51	Δ	Δ	ADJ	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
52	fis	faire	VRB	_	_	46	parenth	_	_	_	_	_
53	)	)	PUNC	_	_	52	punc	_	_	_	_	_
54	.	.	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1419
# text = La régulation des gènes ompF et ompR a été comparée dans les 4 souches :
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	régulation	régulation	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	gènes	gène	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ompF	ompF	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	7	mark	_	_	_	_	_
7	ompR	ompR	ADJ	_	_	5	para	_	_	_	_	_
8	a	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	été	être	VPP	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	comparée	comparer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	dans	dans	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
13	4	4	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	souches	souche	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	:	:	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1420
# text = B , K12 , ainsi que leurs dérivés délétés du gène fis .
1	B	B	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
3	K12	K12	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
5	ainsi	ainsi que	COO	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	que	ainsi que	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
7	leurs	son	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	dérivés	dérivé	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
9	délétés	déliter	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	du	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	gène	gène	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1421
# text = L'utilisation d'un contexte génétique
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	utilisation	utilisation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	un	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	contexte	contexte	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	génétique	génétique	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1422
# text = K12 nous a également permis d'inclure l'analyse de la régulation du gène ompC , absent chez les dérivés d'E. coli B. La régulation de chacun de ces gènes a été analysée en fonction de la phase de croissance , en phase exponentielle et en phase stationnaire .
1	K12	K12	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
2	nous	le	CLI	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
3	a	avoir	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
4	également	également	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	permis	permettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	d'	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	inclure	inclure	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	analyse	analyse	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	régulation	régulation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	du	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	gène	gène	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	ompC	ompC	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
17	absent	absent	NOM	_	_	33	subj	_	_	_	_	_
18	chez	chez	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	les	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	dérivés	dérivé	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	d'	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	E.	E.	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	coli	coli	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	B.	B.	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	La	La	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	régulation	régulation	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	chacun	chacun	PRQ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	ces	ce	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	gènes	gène	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	a	avoir	VRB	_	_	33	aux	_	_	_	_	_
33	été	être	VPP	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
34	analysée	analysé	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	en	en	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	fonction	fonction	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	la	le	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	phase	phase	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	de	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	croissance	croissance	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	,	,	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
43	en	en	PRE	_	_	37	para	_	_	_	_	_
44	phase	phase	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	et	et	COO	_	_	47	mark	_	_	_	_	_
47	en	en	PRE	_	_	43	para	_	_	_	_	_
48	phase	phase	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1423
# text = Régulation des gènes ompF , ompC et ompR chez E. coli B et K12
1	Régulation	régulation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	gènes	gène	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ompF	ompF	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	ompC	ompC	ADJ	_	_	4	para	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	ompR	ompR	ADJ	_	_	6	para	_	_	_	_	_
9	chez	chez	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
10	E.	E.	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	coli	coli	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	B	B	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	K12	K12	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1424
# text = Les trois mêmes types d'analyses ont été réalisés pour les régions promotrices de chacun des trois gènes :
1	Les	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
2	trois	trois	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
3	mêmes	même	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	types	type	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
5	d'	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	analyses	analyse	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ont	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	été	être	VPP	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	réalisés	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	pour	pour	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	les	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	régions	région	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	promotrices	promoteur	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	chacun	chacun	PRQ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	trois	trois	NUM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	gènes	gène	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	:	:	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1425
# text = des fusions transcriptionnelles avec le gène lacZ , des retards sur gel pour analyser la fixation de Fis , et des empreintes à la DNase I pour identifier les sites de fixation potentiels .
1	des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fusions	fusion	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	transcriptionnelles	transcriptionnel	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	avec	avec	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	le	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	gène	gène	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	lacZ	lacZ	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
9	des	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	retards	retard	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	sur	sur	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	gel	gel	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	pour	pour	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	analyser	analyser	VNF	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	fixation	fixation	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	Fis	Fis	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
21	des	de	PRE	_	_	17	para	_	_	_	_	_
22	empreintes	empreinte	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	à	à	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	DNase	DNase	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	I	I	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	pour	pour	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
28	identifier	identifier	VNF	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	les	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	sites	site	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	fixation	fixation	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	potentiels	potentiel	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1426
# text = Régulation du gène ompF K12
1	Régulation	régulation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	du	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	gène	gène	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ompF	ompF	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	K12	K12	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1427
# text = Les fusions transcriptionnelles du promoteur ompFK 12 ont été construites comme précédemment ( voir paragraphe I.D. de cette partie ) par clonage dans pRS 551 d'un produit PCR correspondant à la région promotrice de ompF mais obtenu cette fois à partir de l'ADN génomique de K12 , transfert sur l'ADN de & 206;& 187;RS 45 et introduction dans le chromosome par lysogénisation des souches K12 et K 12 & 206;& 148; fis .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fusions	fusion	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	transcriptionnelles	transcriptionnel	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	promoteur	promoteur	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ompFK	ompFK	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	12	12	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	ont	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	été	être	VPP	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	construites	construire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	comme	comme	COO	_	_	71	mark	_	_	_	_	_
12	précédemment	précédemment	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	(	(	PUNC	_	_	71	punc	_	_	_	_	_
14	voir	voir	VNF	_	_	71	periph	_	_	_	_	_
15	paragraphe	paragraphe	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	I.D.	I.D.	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	cette	ce	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	partie	partie	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	)	)	PUNC	_	_	71	punc	_	_	_	_	_
21	par	par	PRE	_	_	71	periph	_	_	_	_	_
22	clonage	clonage	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	dans	dans	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	pRS	pRS	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	551	551	NUM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	d'	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	un	un	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	produit	produit	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	PCR	PCR	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	correspondant	correspondre	VPR	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	à	à	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	la	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	région	région	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	promotrice	promoteur	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	ompF	ompF	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	mais	mais	COO	_	_	38	mark	_	_	_	_	_
38	obtenu	obtenir	VPP	_	_	23	para	_	_	_	_	_
39	cette	ce	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	fois	fois	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	à	à partir de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
42	partir	à partir de	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	de	à partir de	PRE	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	l'	le	DET	_	_	45	spe	_	_	_	_	_
45	ADN	ADN	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	génomique	génomique	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	de	de	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	K12	K12	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	,	,	PUNC	_	_	71	punc	_	_	_	_	_
50	transfert	transfert	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
51	sur	sur	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	l'	le	DET	_	_	53	spe	_	_	_	_	_
53	ADN	ADN	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
54	de	de	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
55	λRS	λRS	VNF	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	45	45	NUM	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
57	et	et	COO	_	_	58	mark	_	_	_	_	_
58	introduction	introduction	NOM	_	_	56	para	_	_	_	_	_
59	dans	dans	PRE	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
60	le	le	DET	_	_	61	spe	_	_	_	_	_
61	chromosome	chromosome	NOM	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
62	par	par	PRE	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
63	lysogénisation	lysogénisation	NOM	_	_	62	dep	_	_	_	_	_
64	des	de	PRE	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
65	souches	souche	NOM	_	_	64	dep	_	_	_	_	_
66	K12	K12	NOM	_	_	65	dep	_	_	_	_	_
67	et	et	COO	_	_	68	mark	_	_	_	_	_
68	K	K	NOM	_	_	66	para	_	_	_	_	_
69	12	12	NUM	_	_	70	spe	_	_	_	_	_
70	Δ	Δ	NOM	_	_	71	subj	_	_	_	_	_
71	fis	faire	VRB	_	_	10	para	_	_	_	_	_
72	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1428
# text = Le promoteur ompFK 12 contient trois mutations par rapport à celui d'E. coli B ( Figure
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	promoteur	promoteur	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	ompFK	ompFK	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	12	12	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	contient	contenir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	trois	trois	NUM	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	mutations	mutation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	par	par rapport à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	rapport	par rapport à	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	à	par rapport à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	celui	celui	PRQ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	E.	E.	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	coli	coli	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	B	B	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	(	(	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
17	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1429
# text = 34 ) , localisées dans les sites de fixation F2 et F4 de OmpR et entre les boîtes - 35 et - 10 du promoteur .
1	34	34	NUM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	localisées	localiser	VPP	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	sites	site	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	fixation	fixation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	F2	F2	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	12	mark	_	_	_	_	_
12	F4	F4	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	OmpR	OmpR	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	entre	entre	PRE	_	_	13	para	_	_	_	_	_
17	les	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	boîtes	boîte	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	-	- 35	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	35	35	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	-	- 10	PUNC	_	_	19	coord	_	_	_	_	_
23	10	10	NUM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	du	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	promoteur	promoteur	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1430
# text = Les cultures des deux souches K12 et K 12 & 206;& 148; fis portant les fusions transcriptionnelles ont été réalisées en triplicats dans du milieu LB .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	cultures	culture	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	deux	deux	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	souches	souche	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	K12	K12	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	K	K	NOM	_	_	6	para	_	_	_	_	_
9	12	12	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	Δ	Δ	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	portant	portant	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	les	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	fusions	fusion	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
15	transcriptionnelles	transcriptionnel	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	ont	avoir	VRB	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
17	été	être	VPP	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
18	réalisées	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	en	en	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	triplicats	triplicata	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	dans	dans	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	du	de+le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	milieu	milieu	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	LB	LB	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1431
# text = Des prélèvements ont été effectués au cours de la croissance et des mesures d'activités spécifiques & 206;& 178;-galactosidase ont été réalisées ( Figure 35 ) .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	prélèvements	prélèvement	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	ont	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	effectués	effectuer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	au	au cours de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	cours	au cours de	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	au cours de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	croissance	croissance	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
12	des	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	mesures	mesure	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
14	d'	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	activités	activité	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	spécifiques	spécifique	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	β-galactosidase	β-galactosidase	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	ont	avoir	VRB	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
19	été	être	VPP	_	_	20	aux	_	_	_	_	_
20	réalisées	réaliser	VPP	_	_	5	para	_	_	_	_	_
21	(	(	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	Figure	Figure	NOM	_	_	20	parenth	_	_	_	_	_
23	35	35	NUM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	)	)	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1432
# text = Contrairement au promoteur ompFB dont la transcription était quasiment constitutive tout au long de la croissance ( Figure 30 ) , la transcription de ompFK 12 présente un niveau de base en phase exponentielle de croissance et est activée en phase stationnaire ( Figure 35 ) pour atteindre un niveau d'expression semblable à celui de ompFB .
1	Contrairement	contrairement	ADV	_	_	39	periph	_	_	_	_	_
2	au	à	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	promoteur	promoteur	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ompFB	ompFB	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	dont	dont	PRQ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	transcription	transcription	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
8	était	être	VRB	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
9	quasiment	quasiment	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	constitutive	constitutif	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	tout	tout au long de	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	au	tout au long de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
13	long	tout au long de	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	tout au long de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	croissance	croissance	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	(	(	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	Figure	Figure	NOM	_	_	16	parenth	_	_	_	_	_
19	30	30	NUM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	)	)	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	transcription	transcription	NOM	_	_	27	subj	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	ompFK	ompFK	VNF	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	12	12	NUM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	présente	présenter	VRB	_	_	8	para	_	_	_	_	_
28	un	un	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	niveau	niveau	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	base	base	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	en	en	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
33	phase	phase	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	croissance	croissance	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	et	et	COO	_	_	38	mark	_	_	_	_	_
38	est	être	VRB	_	_	27	para	_	_	_	_	_
39	activée	activer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
40	en	en	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	phase	phase	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	(	(	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
44	Figure	Figure	NOM	_	_	41	parenth	_	_	_	_	_
45	35	35	NUM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	)	)	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
47	pour	pour	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
48	atteindre	atteindre	VNF	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	un	un	DET	_	_	50	spe	_	_	_	_	_
50	niveau	niveau	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
51	d'	de	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	expression	expression	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	semblable	semblable	ADJ	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	à	à	PRE	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	celui	celui	PRQ	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	de	de	PRE	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
57	ompFB	ompFB	NOM	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
58	.	.	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1433
# text = Une seconde différence a été observée entre ompFK 12 et ompFB :
1	Une	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	seconde	second	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	différence	différence	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
4	a	avoir	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	été	être	VPP	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	observée	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	entre	entre	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ompFK	ompFK	VNF	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	12	12	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
11	ompFB	uwSe	VPP	_	_	6	para	_	_	_	_	_
12	:	:	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1434
# text = Fis ne semble pas réguler la transcription de ompFK 12 , ce qui pourrait expliquer l'absence d'activation du promoteur ompFK 12 en phase exponentielle par rapport à ompFB ( Figures 30 et 35 ) .
1	Fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	ne	ne	ADV	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	semble	sembler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	pas	pas	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	réguler	réguler	VNF	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	transcription	transcription	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	ompFK	ompFK	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	12	12	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	ce	ce	PRQ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	qui	qui	PRQ	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
14	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	expliquer	expliquer	VNF	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	absence	absence	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	d'	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	activation	activation	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	du	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	promoteur	promoteur	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	ompFK	ompFK	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	12	12	NUM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	en	en	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
25	phase	phase	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	par	par rapport à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
28	rapport	par rapport à	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	à	par rapport à	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	ompFB	ompFB	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
31	(	(	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
32	Figures	Figures	NOM	_	_	30	parenth	_	_	_	_	_
33	30	30	NUM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	et	et	COO	_	_	35	mark	_	_	_	_	_
35	35	35	NUM	_	_	32	para	_	_	_	_	_
36	)	)	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
37	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1435
# text = Une hypothèse qui permettrait d'expliquer en partie ce résultat serait que Fis ne se fixe pas sur le promoteur de K12 , malgré de faibles différences entre les séquences des promoteurs ompFB et K12 .
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	hypothèse	hypothèse	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
3	qui	qui	PRQ	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	permettrait	permettre	VRB	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	d'	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	expliquer	expliquer	VNF	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	en	en partie	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	partie	en partie	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	ce	ce	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	résultat	résultat	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
11	serait	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	que	que	CSU	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	Fis	Fis	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
14	ne	ne	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
15	se	se	CLI	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	fixe	fixer	VRB	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
17	pas	pas	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	sur	sur	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	le	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	promoteur	promoteur	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	K12	K12	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	malgré	malgré	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
25	de	un	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
26	faibles	faible	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
27	différences	différence	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
28	entre	entre	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	les	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	séquences	séquence	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	des	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	ompFB	ompFB	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	et	et	COO	_	_	35	mark	_	_	_	_	_
35	K12	K12	NOM	_	_	30	para	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1436
# text = Des expériences de retard sur gel ont donc été effectuées dans les mêmes conditions que celle décrites dans le paragraphe II.C .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	expériences	expérience	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	retard	retard	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	sur	sur	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	gel	gel	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ont	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
8	donc	donc	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
9	été	être	VPP	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	effectuées	effectuer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	dans	dans	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
13	mêmes	même	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	conditions	condition	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	que	que	CSU	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	celle	celui	PRQ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	décrites	décrire	VPP	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	dans	dans	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	le	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	paragraphe	paragraphe	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	II.C	II.C	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1437
# text = 2 . , mais cette fois avec un fragment d'ADN correspondant au promoteur ompFK 12 ( obtenu par PCR avec les mêmes amorces que précédemment ) .
1	2	2	NUM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	mais	mai	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
5	cette	ce	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	fois	fois	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
7	avec	avec	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	un	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	fragment	fragment	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	d'	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	ADN	ADN	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	correspondant	correspondre	VPR	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	au	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	promoteur	promoteur	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	ompFK	ompFK	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	12	12	NUM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	(	(	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	obtenu	obtenir	VPP	_	_	16	parenth	_	_	_	_	_
19	par	par	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	PCR	PCR	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	avec	avec	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	les	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
23	mêmes	même	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	amorces	amorce	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	que	que	ADV	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	précédemment	précédemment	ADV	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
27	)	)	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1438
# text = La fixation de Fis sur ompFK 12 est strictement équivalente à celle de Fis sur ompFB , avec une constante de dissociation de 1 , 5 nM ( résultats non montrés ) .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fixation	fixation	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	sur	sur	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	ompFK	ompFK	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	12	12	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	strictement	strictement	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	équivalente	équivalent	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	à	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	celle	celui	PRQ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	Fis	Fis	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	sur	sur	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	ompFB	ompFB	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	avec	avec	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
19	une	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	constante	constante	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	dissociation	dissociation	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	1	1	NUM	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
25	,	1 , 5	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
26	5	5	NUM	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	nM	nM	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
28	(	(	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	résultats	résultat	NOM	_	_	20	parenth	_	_	_	_	_
30	non	non	ADV	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	montrés	montrer	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	)	)	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1439
# text = Ce n'est donc pas une différence de liaison à l'ADN qui explique les différences de régulation observées entre ompFB et ompFK 12 .
1	Ce	ce	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	n'	ne	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	donc	donc	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	pas	pas	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	différence	différence	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	liaison	liaison	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	ADN	ADN	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	qui	qui	PRQ	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
14	explique	expliquer	VRB	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	les	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	différences	différence	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	régulation	régulation	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	observées	observer	VPP	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	entre	entre	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	ompFB	ompFB	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	ompFK	ompFK	NOM	_	_	21	para	_	_	_	_	_
24	12	12	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1440
# text = Afin de comprendre les différences de régulation entre ompFB et ompFK 12 , nous avons mesuré l'activité des deux promoteurs en introduisant chacune des fusions transcriptionnelles ompFB-lacZ et ompFK 12 -lacZ dans chacune des souches E. coli B et K12 .
1	Afin	afin de	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	de	afin de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	comprendre	comprendre	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	différences	différence	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	régulation	régulation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	entre	entrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	ompFB	ompFB	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	12	mark	_	_	_	_	_
11	ompFK	ompFK	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	12	12	NUM	_	_	9	para	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
14	nous	nous	CLS	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
15	avons	avoir	VRB	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	mesuré	mesurer	VPP	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	activité	activité	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	des	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	deux	deux	NUM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	en	en	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
23	introduisant	introduire	VPR	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	chacune	chacun	PRQ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	des	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	fusions	fusion	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	transcriptionnelles	transcriptionnel	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	ompFB-lacZ	ompFB-lacZ	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	et	et	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
30	ompFK	ompFK	VRB	_	_	16	para	_	_	_	_	_
31	12	12	NUM	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	-lacZ	-lacZ	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	dans	dans	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
34	chacune	chacun	PRQ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	des	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	souches	souche	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	E.	E.	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	coli	coli	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	B	B	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
40	et	et	COO	_	_	41	mark	_	_	_	_	_
41	K12	K12	NOM	_	_	39	para	_	_	_	_	_
42	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1441
# text = Des cultures des deux souches portant chacune des deux fusions transcriptionnelles ont été réalisées en triplicat en milieu LB .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	cultures	culture	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	deux	deux	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	souches	souche	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	portant	porter	VPR	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	chacune	chacun	PRQ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	des	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	deux	deux	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	fusions	fusion	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	transcriptionnelles	transcriptionnel	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	ont	avoir	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	été	être	VPP	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	réalisées	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	en	en	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	triplicat	trip	N+V	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	en	en	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	milieu	milieu	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	LB	LB	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1442
# text = Des prélèvements ont été effectués au cours de la croissance et les activités spécifiques & 206;& 178;-galactosidase ont été mesurées ( Figure 36 ) .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	prélèvements	prélèvement	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	ont	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	effectués	effectuer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	au	au cours de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	cours	au cours de	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	au cours de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	croissance	croissance	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	activités	activité	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
14	spécifiques	spécifique	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	β-galactosidase	β-galactosidase	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	ont	avoir	VRB	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
17	été	être	VPP	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
18	mesurées	mesurer	VPP	_	_	5	para	_	_	_	_	_
19	(	(	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	Figure	Figure	NOM	_	_	18	parenth	_	_	_	_	_
21	36	36	NUM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	)	)	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1443
# text = Les deux résultats précédents ont été retrouvés :
1	Les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	deux	deux	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	résultats	résultat	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
4	précédents	précédent	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ont	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	été	être	VPP	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	retrouvés	retrouver	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	:	:	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1444
# text = l'activité constitutive du promoteur ompFB dans E.   coli B et l'activation du promoteur ompFK 12 dans E.   coli K12 en phase stationnaire et à des niveaux équivalents à ceux de ompFB .
1	l'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	activité	activité	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	constitutive	constitutif	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	promoteur	promoteur	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ompFB	ompFB	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	dans	dans	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	E.	E.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	 	 	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	coli	colis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	B	B	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	activation	activation	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_
15	du	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	promoteur	promoteur	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	ompFK	ompFK	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	12	12	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	dans	dans	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	E.	E.	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	 	 	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	coli	colis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	K12	K12	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	en	en	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	phase	phase	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
28	à	à	PRE	_	_	24	para	_	_	_	_	_
29	des	un	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	niveaux	niveau	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	équivalents	équivalent	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	à	à	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	ceux	celui	PRQ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	ompFB	ompFB	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1445
# text = En revanche , la fusion transcriptionnelle ompFK 12 -lacZ exprimée dans E. coli B révèle maintenant une expression de base , et donc une absence d'activation , en phase exponentielle , alors qu'une activation est toujours observée en phase stationnaire ( Figure 36 ) .
1	En	en revanche	PRE	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
2	revanche	en revanche	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	fusion	fusion	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
6	transcriptionnelle	transcriptionnel	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ompFK	ompFK	VPR	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	12	12	NUM	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	-lacZ	-lacZ	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	exprimée	exprimer	VPP	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	dans	dans	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	E.	E.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	coli	coli	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	B	B	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	révèle	révéler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	maintenant	maintenant	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	une	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	expression	expression	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	base	base	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
23	donc	donc	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	une	un	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	absence	absence	NOM	_	_	18	para	_	_	_	_	_
26	d'	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	activation	activation	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
29	en	en	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
30	phase	phase	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
33	alors	alors que	CSU	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
34	qu'	alors que	CSU	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
35	une	un	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	activation	activation	NOM	_	_	39	subj	_	_	_	_	_
37	est	être	VRB	_	_	39	aux	_	_	_	_	_
38	toujours	toujours	ADV	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
39	observée	observer	VPP	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
40	en	en	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	phase	phase	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	(	(	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
44	Figure	Figure	NOM	_	_	41	parenth	_	_	_	_	_
45	36	36	NUM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	)	)	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
47	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1446
# text = Une légère diminution de la transcription se produit par la suite .
1	Une	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	légère	léger	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	diminution	diminution	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	transcription	transcription	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	se	se	CLI	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	produit	produire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	par	par	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	suite	suite	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1447
# text = Ainsi , il semblerait que les trois changements nucléotidiques entre les promoteurs ompFB et K12 pourraient être à l'origine des différences de transcription observées en phase exponentielle .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	il	il	CLS	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	semblerait	sembler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	que	que	CSU	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
7	trois	trois	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	changements	changement	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
9	nucléotidiques	nucléotidique	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	entre	entre	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	les	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	ompFB	ompFB	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	K12	K12	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
16	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
17	être	être	VNF	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	à	à	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	origine	origine	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	des	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	différences	différence	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	transcription	transcription	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	observées	observer	VPP	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	en	en	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	phase	phase	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1448
# text = Ces trois modifications nucléotidiques ( ou l'une ou deux d'entre elles ) chez
1	Ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	trois	trois	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	modifications	modification	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	nucléotidiques	nucléotidique	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	(	(	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
6	ou	ou	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	une	une	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
9	ou	ou	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	deux	deux	NUM	_	_	8	para	_	_	_	_	_
11	d'	d'entre	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	entre	d'entre	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	elles	lui	PRQ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	)	)	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
15	chez	chez	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1449
# text = E .  coli B pourraient être à la base de l'activation de la transcription par Fis .
1	E	e	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	. 	. 	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	coli	colis	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
4	B	B	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	être	être	VNF	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	base	base	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	activation	activation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	transcription	transcription	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	par	par	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	Fis	Fis	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1450
# text = Nous sommes actuellement en train de tester l'activation par Fis de ompFK 12 dans le contexte génétique d'E. coli
1	Nous	nous	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	sommes	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	actuellement	actuellement	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	en	en train de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	train	en train de	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	en train de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	tester	tester	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	activation	activation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	par	par	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	Fis	Fis	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	ompFK	ompFK	VNF	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	12	12	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	dans	dans	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
16	le	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	contexte	contexte	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	génétique	génétique	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	d'	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	E.	E.	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	coli	coli	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1451
# text = B . Cependant , ces modifications de séquences nucléotidiques entre ompFB et ompFK 12 ne semblent pas être suffisantes pour expliquer les différences de régulation observées .
1	B	b	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	Cependant	Cependant	ADV	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
5	ces	ce	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	modifications	modification	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	séquences	séquence	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	nucléotidiques	nucléotidique	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	entre	entre	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	ompFB	ompFB	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	ompFK	ompFK	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_
14	12	12	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	ne	ne	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	semblent	sembler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	pas	pas	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	être	être	VNF	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	suffisantes	suffisant	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	pour	pour	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	expliquer	expliquer	VNF	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	les	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	différences	différence	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	régulation	régulation	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	observées	observer	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1452
# text = En effet , la fusion transcriptionnelle ompFB-lacZ exprimée dans E. coli K12 révèle le même comportement que ompFK 12 -lacZ , c'est-à-dire une expression de base en phase exponentielle suivie d'une activation en phase stationnaire ( Figure 36 ) .
1	En	en effet	PRE	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	fusion	fusion	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
6	transcriptionnelle	transcriptionnel	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ompFB-lacZ	ompFB-lacZ	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	exprimée	exprimer	VPP	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	E.	E.	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	coli	coli	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	K12	K12	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
13	révèle	révéler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	le	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
15	même	même	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	comportement	comportement	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	que	que	PRQ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	ompFK	ompFK	VRB	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	12	12	NUM	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	-lacZ	-lacZ	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
22	c'	c'est-à-dire	COO	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	est-à-dire	c'est-à-dire	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
24	une	un	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	expression	expression	NOM	_	_	20	para	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	base	base	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	en	en	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	phase	phase	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	suivie	suivre	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	d'	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
33	une	un	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	activation	activation	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	en	en	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	phase	phase	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	(	(	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
39	Figure	Figure	NOM	_	_	34	parenth	_	_	_	_	_
40	36	36	NUM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	)	)	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
42	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1453
# text = Ceci indique , en plus des différences de séquences nucléotidiques entre les promoteurs ompFB et K12 , des différences de régulation entre les deux isolats d'E. coli .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	indique	indiquer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
4	en	en plus de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	plus	en plus de	DET	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	des	en plus de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	différences	différence	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	séquences	séquence	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	nucléotidiques	nucléotidique	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	entre	entre	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	ompFB	ompFB	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	K12	K12	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
18	des	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	différences	différence	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	régulation	régulation	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	entre	entre	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	les	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
24	deux	deux	NUM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	isolats	isolat	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	d'	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	E.	E.	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	coli	coli	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1454
# text = En particulier , des différences de séquences ont été identifiées dans les gènes ompR et envZ entre les deux isolats , ce qui pourrait expliquer une partie des différences de régulation observées .
1	En	en	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	particulier	particulier	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	différences	différence	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	séquences	séquence	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ont	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	été	être	VPP	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	identifiées	identifier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	dans	dans	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	gènes	gène	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	ompR	ompR	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	envZ	uwSe	VPP	_	_	10	para	_	_	_	_	_
17	entre	entre	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	les	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
19	deux	deux	NUM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	isolats	isolat	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	ce	ce	PRQ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
23	qui	qui	PRQ	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
24	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	expliquer	expliquer	VNF	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	une	un	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	partie	partie	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	des	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	différences	différence	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	régulation	régulation	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	observées	observer	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1455
# text = Ceci sera abordé dans la partie Discussion de ce chapitre .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	sera	être	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	abordé	aborder	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	dans	dans	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	partie	partie	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	Discussion	Discussion	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	ce	ce	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	chapitre	chapitre	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1456
# text = Nous avons donc montré ici que la protéine Fis se fixait sur le promoteur de ompF de K12 , sans pour autant avoir d'effet détectable sur sa transcription dans les conditions testées .
1	Nous	nous	CLS	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	avons	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
3	donc	donc	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	montré	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	ici	ici	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	que	que	CSU	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	protéine	protéine	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
9	Fis	Fis	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	se	se	CLI	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	fixait	fixer	VRB	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
12	sur	sur	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	le	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	promoteur	promoteur	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	ompF	ompF	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	K12	K12	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	sans	sans	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
21	pour	pour autant	PRE	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
22	autant	pour autant	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	avoir	avoir	VNF	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	d'	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	effet	effet	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	détectable	détectable	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	sur	sur	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	sa	son	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	transcription	transcription	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	dans	dans	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
31	les	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	conditions	condition	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	testées	tester	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1457
# text = Ceci est différent du promoteur ompFB qui est activé par Fis en phase exponentielle .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	différent	différent	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	du	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	promoteur	promoteur	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ompFB	ompFB	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	qui	qui	PRQ	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
8	est	être	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	activé	activer	VPP	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	par	par	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	Fis	Fis	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	en	en	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	phase	phase	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1458
# text = Nous avons également démontré que deux conditions étaient nécessaires à cette activation de ompFB par Fis :
1	Nous	nous	CLS	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	avons	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
3	également	également	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	démontré	démontrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	que	que	CSU	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	deux	deux	NUM	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	conditions	condition	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
8	étaient	être	VRB	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	nécessaires	nécessaire	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	cette	ce	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	activation	activation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	ompFB	ompFB	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	par	par	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	Fis	Fis	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	:	:	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1459
# text = la séquence promotrice issue de la souche B , ainsi que le contexte génomique d'E.   coli B. Il est donc probable que les différences de régulation observées soient fonction de plusieurs facteurs , dont par exemple des différences au niveau du système à deux composantes OmpR / EnvZ .
1	la	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	séquence	séquence	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	promotrice	promoteur	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	issue	issu	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	souche	souche	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	B	B	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	ainsi	ainsi que	COO	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	que	ainsi que	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
12	le	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	contexte	contexte	NOM	_	_	7	para	_	_	_	_	_
14	génomique	génomique	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	d'	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	E.	E.	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	 	 	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	coli	colis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	B.	B.	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	Il	Il	CLS	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
21	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	donc	donc	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	probable	probable	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	que	que	CSU	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	les	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	différences	différence	NOM	_	_	30	subj	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	régulation	régulation	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	observées	observer	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
30	soient	être	VRB	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
31	fonction	fonction	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	facteurs	facteur	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
36	dont	dont	PRQ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
37	par	par	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
38	exemple	exemple	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	des	de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	différences	différence	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	au	à	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	niveau	niveau	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	du	de	PRE	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	système	système	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	à	à	PRE	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	deux	deux	NUM	_	_	47	spe	_	_	_	_	_
47	composantes	composante	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
48	OmpR	OmpR	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	/	/	PUNC	_	_	50	punc	_	_	_	_	_
50	EnvZ	EnvZ	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
51	.	.	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1460
# text = Régulation des gènes ompC et ompR
1	Régulation	régulation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	gènes	gène	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ompC	ompC	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	ompR	ompR	ADJ	_	_	4	para	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1461
# text = Des fusions transcriptionnelles ompC-lacZ et ompR-lacZ ont été construites de la même façon que celle décrite précédemment pour ompF , avec les fragments d'ADN contenant les régions promotrices de ompC et ompR provenant respectivement des souches E. coli K12 et B .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fusions	fusion	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	transcriptionnelles	transcriptionnel	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ompC-lacZ	ompC-lacZ	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	ompR-lacZ	ompR-lacZ	ADJ	_	_	4	para	_	_	_	_	_
7	ont	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	été	être	VPP	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	construites	construire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
12	même	même	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	façon	façon	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	que	que	CSU	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	celle	celui	PRQ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	décrite	décrire	VPP	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	précédemment	précédemment	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	pour	pour	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	ompF	ompF	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	avec	avec	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
22	les	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	fragments	fragment	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	d'	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	ADN	ADN	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	contenant	contenir	VPR	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	les	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	régions	région	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	promotrices	promoteur	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	ompC	ompC	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	et	et	COO	_	_	33	mark	_	_	_	_	_
33	ompR	ompR	NOM	_	_	31	para	_	_	_	_	_
34	provenant	provenir	VPR	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
35	respectivement	respectivement	ADV	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	des	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	souches	souche	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	E.	E.	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	coli	coli	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	K12	K12	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
41	et	et	COO	_	_	42	mark	_	_	_	_	_
42	B	B	NOM	_	_	40	para	_	_	_	_	_
43	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1462
# text = Les fusions transcriptionnelles ont été introduites au site d'attachement de l'ADN du bactériophage & 206;& 187; dans les souches 606 , 606 & 206;& 148; fis , K12 et K 12 & 206;& 148; fis .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fusions	fusion	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	transcriptionnelles	transcriptionnel	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ont	avoir	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	été	être	VPP	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	introduites	introduire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	au	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	site	site	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	attachement	attachement	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	ADN	ADN	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	du	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	bactériophage	bactériophage	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	λ	λ	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	dans	dans	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
18	les	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	souches	souche	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	606	606	NUM	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
21	,	606 , 606	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
22	606	606	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	Δ	Δ	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
24	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
26	K12	K12	NOM	_	_	31	subj	_	_	_	_	_
27	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
28	K	K	NOM	_	_	26	para	_	_	_	_	_
29	12	12	NUM	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	Δ	Δ	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
31	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1463
# text = Des prélèvements ont été effectués au cours de la croissance en milieu LB et les activités spécifiques & 206;& 178;-galactosidase ont été mesurées ( Figure 37 ) .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	prélèvements	prélèvement	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	ont	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	effectués	effectuer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	au	au cours de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	cours	au cours de	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	au cours de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	croissance	croissance	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
12	milieu	milieu	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	LB	LB	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
15	les	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	activités	activité	NOM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
17	spécifiques	spécifique	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	β-galactosidase	β-galactosidase	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	ont	avoir	VRB	_	_	20	aux	_	_	_	_	_
20	été	être	VPP	_	_	21	aux	_	_	_	_	_
21	mesurées	mesurer	VPP	_	_	5	para	_	_	_	_	_
22	(	(	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
23	Figure	Figure	NOM	_	_	21	parenth	_	_	_	_	_
24	37	37	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	)	)	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1464
# text = Ces mesures montrent trois résultats majeurs :
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mesures	mesure	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	montrent	montrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	trois	trois	NUM	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	résultats	résultat	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	majeurs	majeur	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	:	:	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1465
# text = i ) l'activité du promoteur ompC est environ 3 fois plus élevée que celle du promoteur ompR , quelle que soit la phase de croissance  ;
1	i	i	NOM	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
3	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	activité	activité	NOM	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
5	du	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	promoteur	promoteur	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ompC	ompC	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	est	est	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	environ	environ	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
10	3	3	NUM	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	fois	fois	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	plus	plus	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	élevée	élevé	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
14	que	que	CSU	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	celle	celui	PRQ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	du	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	promoteur	promoteur	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	ompR	ompR	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
20	quelle	quel?	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	que	que	PRQ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	soit	être	VRB	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	phase	phase	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	croissance	croissance	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	 ;	;	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1466
# text = ii ) les deux promoteurs présentent une activité de base en phase exponentielle de croissance et sont activés d'un facteur 2 en phase stationnaire  ;
1	ii	id est	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
4	deux	deux	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	présentent	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	une	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	activité	activité	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	base	base	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	en	en	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
12	phase	phase	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	croissance	croissance	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
17	sont	être	VRB	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
18	activés	activer	VPP	_	_	6	para	_	_	_	_	_
19	d'	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	un	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	facteur	facteur	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	2	2	NUM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	en	en	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
24	phase	phase	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	 ;	;	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1467
# text = iii ) aucune régulation par Fis de ces deux promoteurs n'a été observée .
1	iii	id est	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	aucune	aucun	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	régulation	régulation	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	Fis	Fis	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	ces	ce	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
9	deux	deux	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	n'	ne	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
12	a	avoir	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	été	être	VPP	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	observée	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1468
# text = Des expériences de retard sur gel ont été réalisées pour analyser la fixation éventuelle de Fis sur les promoteurs ompC et ompR. Les fragments d'ADN utilisés sont les mêmes que ceux clonés pour les fusions transcriptionnelles et les conditions expérimentales ainsi que les contrôles sont les mêmes que ceux décrits précédemment ( Figure 38 ) .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	expériences	expérience	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	retard	retard	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	sur	sur	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	gel	gel	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ont	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	été	être	VPP	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	réalisées	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	pour	pour	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	analyser	analyser	VNF	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	fixation	fixation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	éventuelle	éventuel	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	Fis	Fis	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	sur	sur	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
18	les	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	ompC	ompC	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
22	ompR.	ompR.	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	Les	Les	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	fragments	fragment	NOM	_	_	28	subj	_	_	_	_	_
25	d'	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	ADN	ADN	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	utilisés	utiliser	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
28	sont	être	VRB	_	_	9	para	_	_	_	_	_
29	les	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	mêmes	même	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	que	que	CSU	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
32	ceux	celui	PRQ	_	_	46	subj	_	_	_	_	_
33	clonés	cloner	VPP	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	pour	pour	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	les	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	fusions	fusion	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	transcriptionnelles	transcriptionnel	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	et	et	COO	_	_	40	mark	_	_	_	_	_
39	les	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	conditions	condition	NOM	_	_	36	para	_	_	_	_	_
41	expérimentales	expérimental	ADJ	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	ainsi	ainsi que	COO	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
43	que	ainsi que	COO	_	_	45	mark	_	_	_	_	_
44	les	le	DET	_	_	45	spe	_	_	_	_	_
45	contrôles	contrôle	NOM	_	_	40	para	_	_	_	_	_
46	sont	être	VRB	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
47	les	le	DET	_	_	48	spe	_	_	_	_	_
48	mêmes	même	ADJ	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
49	que	que	CSU	_	_	0	root	_	_	_	_	_
50	ceux	celui	PRQ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
51	décrits	décrire	ADJ	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	précédemment	précédemment	ADV	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	(	(	PUNC	_	_	54	punc	_	_	_	_	_
54	Figure	Figure	NOM	_	_	50	parenth	_	_	_	_	_
55	38	38	NUM	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	)	)	PUNC	_	_	54	punc	_	_	_	_	_
57	.	.	PUNC	_	_	50	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1469
# text = Les mêmes observations que dans le cas du promoteur ompF peuvent être faites :
1	Les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	mêmes	même	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	observations	observation	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
4	que	que	PRQ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
6	le	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	cas	cas	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	du	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	promoteur	promoteur	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	ompF	ompF	VRB	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
11	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	être	être	VNF	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	faites	faire	VPP	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	:	:	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1470
# text = la première bande retardée est observée dès 0 , 2 nM de Fis , et la quantité d'ADN retardé , ainsi que le nombre de bandes , augmentent avec la concentration en Fis , jusqu'à 20 nM. Les constantes de dissociation calculées dans ces conditions sont d'environ 1 , 5 nM pour chacun des promoteurs , ce qui indique une forte fixation de Fis .
1	la	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	première	premier	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	bande	bande	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
4	retardée	retarder	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	est	être	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	observée	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	dès	dès	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	0	0	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
9	,	0 , 2	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
10	2	2	NUM	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	nM	nM	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	Fis	Fis	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	quantité	quantité	NOM	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
18	d'	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	ADN	ADN	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	retardé	retarder	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
22	ainsi	ainsi que	COO	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	que	ainsi que	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
24	le	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	nombre	nombre	NOM	_	_	17	para	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	bandes	bande	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	augmentent	augmenter	VRB	_	_	6	para	_	_	_	_	_
30	avec	avec	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	la	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	concentration	concentration	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	en	en	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
34	Fis	Fis	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	,	,	PUNC	_	_	59	punc	_	_	_	_	_
36	jusqu'à	jusque	PRE	_	_	47	periph	_	_	_	_	_
37	20	20	NUM	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	nM.	nM.	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	Les	Les	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	constantes	constante	NOM	_	_	47	subj	_	_	_	_	_
41	de	de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	dissociation	dissociation	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	calculées	calculer	VPP	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
44	dans	dans	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	ces	ce	DET	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
46	conditions	condition	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	sont	être	VRB	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
48	d'	de	PRE	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	environ	environ	ADV	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
50	1	1	NUM	_	_	52	spe	_	_	_	_	_
51	,	1 , 5	PUNC	_	_	50	punc	_	_	_	_	_
52	5	5	NUM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
53	nM	nM	ADJ	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	pour	pour	PRE	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
55	chacun	chacun	PRQ	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	des	de	PRE	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
57	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
58	,	,	PUNC	_	_	59	punc	_	_	_	_	_
59	ce	ce	PRQ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
60	qui	qui	PRQ	_	_	61	subj	_	_	_	_	_
61	indique	indiquer	VRB	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
62	une	un	DET	_	_	64	spe	_	_	_	_	_
63	forte	fort	ADJ	_	_	64	dep	_	_	_	_	_
64	fixation	fixation	NOM	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
65	de	de	PRE	_	_	64	dep	_	_	_	_	_
66	Fis	Fis	NOM	_	_	65	dep	_	_	_	_	_
67	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1471
# text = Pour localiser avec précision les sites de fixation , des expériences d'empreintes à la DNase I ont été réalisées sur ces deux promoteurs , et ce dans les mêmes conditions que pour le promoteur ompF ( Figure 39 ) .
1	Pour	pour	PRE	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
2	localiser	localiser	VNF	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	avec	avec	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	précision	précision	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	sites	site	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	fixation	fixation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
10	des	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	expériences	expérience	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
12	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	empreintes	empreinte	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	DNase	DNase	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	I	I	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	ont	avoir	VRB	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
19	été	être	VPP	_	_	20	aux	_	_	_	_	_
20	réalisées	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	sur	sur	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	ces	ce	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
23	deux	deux	NUM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
27	ce	ce	PRQ	_	_	20	para	_	_	_	_	_
28	dans	dans	PRE	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
29	les	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
30	mêmes	même	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	conditions	condition	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
32	que	que	CSU	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	pour	pour	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	le	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	promoteur	promoteur	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	ompF	ompF	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	(	(	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
38	Figure	Figure	NOM	_	_	35	parenth	_	_	_	_	_
39	39	39	NUM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	)	)	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
41	.	.	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1472
# text = Ces expériences ont mis en évidence des sites de fixation de Fis dans les régions régulatrices de ompR et ompC ( Figure 40 ) .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	expériences	expérience	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	ont	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	mis	mettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	en	en	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	évidence	évidence	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	des	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	sites	site	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	fixation	fixation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	Fis	Fis	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	régions	région	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	régulatrices	régulateur	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	ompR	ompR	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
20	ompC	ompC	NOM	_	_	18	para	_	_	_	_	_
21	(	(	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	Figure	Figure	NOM	_	_	15	parenth	_	_	_	_	_
23	40	40	NUM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	)	)	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1473
# text = La région promotrice de ompR présente cinq sites de fixation spécifique de Fis , contenant chacun une séquence proche de la séquence consensus de fixation de la protéine .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	région	région	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	promotrice	promoteur	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ompR	ompR	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	présente	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	cinq	cinq	NUM	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	sites	site	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	fixation	fixation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	spécifique	spécifique	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	Fis	Fis	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	contenant	contenir	VPR	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
16	chacun	chacun	PRQ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	une	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	séquence	séquence	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	proche	proche	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	séquence	séquence	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	consensus	consensus	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	fixation	fixation	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	protéine	protéine	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1474
# text = Le profil de fixation de Fis est relativement atypique , avec trois différences importantes par rapport à ce qui avait été observé dans la région promotrice de ompF ( Figure 34 et 40A ) :
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	profil	profil	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	fixation	fixation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	Fis	Fis	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	relativement	relativement	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	atypique	atypique	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	avec	avec	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	trois	trois	NUM	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	différences	différence	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	importantes	important	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	par	par rapport à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	rapport	par rapport à	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	à	par rapport à	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	ce	ce	PRQ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	qui	qui	PRQ	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
20	avait	avoir	VRB	_	_	21	aux	_	_	_	_	_
21	été	être	VPP	_	_	22	aux	_	_	_	_	_
22	observé	observer	VPP	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
23	dans	dans	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	région	région	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	promotrice	promoteur	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	ompF	ompF	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	(	(	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
30	Figure	Figure	NOM	_	_	25	parenth	_	_	_	_	_
31	34	34	NUM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	et	et	COO	_	_	33	mark	_	_	_	_	_
33	40A	40A	NUM	_	_	30	para	_	_	_	_	_
34	)	)	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
35	:	:	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1475
# text = i ) le site I recouvre le codon ATG d'initiation de la traduction de ompR  ;
1	i	i	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
3	le	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	site	site	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	I	I	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	recouvre	recouvrir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	le	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	codon	codon	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	ATG	ATG	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	initiation	initiation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	traduction	traduction	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	ompR	ompR	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	 ;	;	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1476
# text = ii ) les sites II et III sont situés sur une séquence correspondant à la région 5 'non traduite de l'ARNm de ompR  ; iii ) le site IV recouvre le site d'initiation majeur de la transcription . L'absence d'effet de Fis sur la transcription de ompR malgré la présence des ces sites de fixation sera abordée dans la Discussion de cette partie . De la même façon , le site V recouvre une région localisée juste en amont du codon
1	ii	id est	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	les	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	sites	site	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
5	II	II	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	7	mark	_	_	_	_	_
7	III	III	ADJ	_	_	5	para	_	_	_	_	_
8	sont	être	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	situés	situer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	sur	sur	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	séquence	séquence	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	correspondant	correspondre	VPR	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	région	région	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	5	5	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	'	'	PUNC	_	_	62	punc	_	_	_	_	_
19	non	non	ADV	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	traduite	traduire	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
22	l'	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	ARNm	ARNm	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	ompR	ompR	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	 ;	;	PUNC	_	_	62	punc	_	_	_	_	_
27	iii	id est	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
28	)	)	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	le	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	site	site	NOM	_	_	32	subj	_	_	_	_	_
31	IV	IV	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	recouvre	recouvrir	VRB	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
33	le	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	site	site	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	d'	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	initiation	initiation	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	majeur	majeur	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	la	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	transcription	transcription	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
42	L'	L'	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	absence	absence	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
44	d'	de	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	effet	effet	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	de	de	PRE	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	Fis	Fis	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	sur	sur	PRE	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
49	la	le	DET	_	_	50	spe	_	_	_	_	_
50	transcription	transcription	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
51	de	de	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	ompR	ompR	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	malgré	malgré	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
54	la	le	DET	_	_	55	spe	_	_	_	_	_
55	présence	présence	NOM	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
56	des	de+le	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
57	ces	ce	DET	_	_	58	spe	_	_	_	_	_
58	sites	site	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
59	de	un	DET	_	_	60	spe	_	_	_	_	_
60	fixation	fixation	NOM	_	_	62	subj	_	_	_	_	_
61	sera	être	VRB	_	_	62	aux	_	_	_	_	_
62	abordée	aborder	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
63	dans	dans	PRE	_	_	62	dep	_	_	_	_	_
64	la	le	DET	_	_	65	spe	_	_	_	_	_
65	Discussion	Discussion	NOM	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
66	de	de	PRE	_	_	65	dep	_	_	_	_	_
67	cette	ce	DET	_	_	68	spe	_	_	_	_	_
68	partie	partie	NOM	_	_	66	dep	_	_	_	_	_
69	.	.	PUNC	_	_	62	punc	_	_	_	_	_
70	De	De	PRE	_	_	78	periph	_	_	_	_	_
71	la	le	DET	_	_	73	spe	_	_	_	_	_
72	même	même	ADJ	_	_	73	dep	_	_	_	_	_
73	façon	façon	NOM	_	_	70	dep	_	_	_	_	_
74	,	,	PUNC	_	_	70	punc	_	_	_	_	_
75	le	le	DET	_	_	76	spe	_	_	_	_	_
76	site	site	NOM	_	_	78	subj	_	_	_	_	_
77	V	V	ADJ	_	_	76	dep	_	_	_	_	_
78	recouvre	recouvrir	VRB	_	_	62	dep	_	_	_	_	_
79	une	un	DET	_	_	80	spe	_	_	_	_	_
80	région	région	NOM	_	_	78	dep	_	_	_	_	_
81	localisée	localiser	VPP	_	_	80	dep	_	_	_	_	_
82	juste	juste	ADV	_	_	81	dep	_	_	_	_	_
83	en	en amont de	PRE	_	_	81	dep	_	_	_	_	_
84	amont	en amont de	DET	_	_	83	dep	_	_	_	_	_
85	du	en amont de	PRE	_	_	84	dep	_	_	_	_	_
86	codon	codon	NOM	_	_	85	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1477
# text = GTG d'initiation de la traduction de greB ( Figure
1	GTG	GTG	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	initiation	initiation	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	traduction	traduction	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	greB	greB	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	(	(	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
10	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1478
# text = 40A ) .
1	40A	40A	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1479
# text = En ce qui concerne la région promotrice de ompC , le profil de fixation de Fis est similaire à celui observé pour ompR ( Figure 40B ) , avec le site I de fixation de Fis dans la région 5 'non traduite de l'ARNm de ompC et proche du site d'initiation majeur de la transcription , T1 , le site II recouvrant la région - 35 de ce promoteur . Chacun de ces sites présente une séquence consensus de fixation de Fis . En amont de ces deux sites , une région d'environ 100 pb , appelée site III , est protégée des coupures par la DNase I , mais elle ne contient qu'une seule séquence consensus de fixation de Fis . Cette région recouvre en grande partie les sites de fixation C1 à C3 de OmpR , le site III étant localisé en amont .
1	En	en	PRE	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
2	ce	ce	PRQ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	qui	qui	PRQ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	concerne	concerner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	région	région	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	promotrice	promoteur	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	ompC	ompC	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
11	le	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	profil	profil	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	fixation	fixation	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	Fis	Fis	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	est	être	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
18	similaire	similaire	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	à	à	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	celui	celui	PRQ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	observé	observer	VPP	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	pour	pour	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	ompR	ompR	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	(	(	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	Figure	Figure	NOM	_	_	23	parenth	_	_	_	_	_
26	40B	40B	NUM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	)	)	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	78	punc	_	_	_	_	_
29	avec	avec	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
30	le	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	site	site	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	I	I	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	fixation	fixation	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	Fis	Fis	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	dans	dans	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
38	la	le	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	région	région	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	5	5	NUM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	'	'	PUNC	_	_	78	punc	_	_	_	_	_
42	non	non	ADV	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
43	traduite	traduire	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
44	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
45	l'	le	DET	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
46	ARNm	ARNm	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	de	de	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	ompC	ompC	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	et	et	COO	_	_	50	mark	_	_	_	_	_
50	proche	proche	NOM	_	_	48	para	_	_	_	_	_
51	du	de	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	site	site	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	d'	de	PRE	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	initiation	initiation	NOM	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	majeur	majeur	ADJ	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
56	de	de	PRE	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
57	la	le	DET	_	_	58	spe	_	_	_	_	_
58	transcription	transcription	NOM	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
59	,	,	PUNC	_	_	78	punc	_	_	_	_	_
60	T1	T1	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
61	,	,	PUNC	_	_	78	punc	_	_	_	_	_
62	le	le	DET	_	_	63	spe	_	_	_	_	_
63	site	site	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
64	II	II	ADJ	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
65	recouvrant	recouvrir	VPR	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
66	la	le	DET	_	_	67	spe	_	_	_	_	_
67	région	région	NOM	_	_	65	dep	_	_	_	_	_
68	-	- 35	PUNC	_	_	67	dep	_	_	_	_	_
69	35	35	NUM	_	_	68	dep	_	_	_	_	_
70	de	de	PRE	_	_	68	dep	_	_	_	_	_
71	ce	ce	DET	_	_	72	spe	_	_	_	_	_
72	promoteur	promoteur	NOM	_	_	70	dep	_	_	_	_	_
73	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
74	Chacun	Chacun	PRQ	_	_	78	subj	_	_	_	_	_
75	de	de	PRE	_	_	74	dep	_	_	_	_	_
76	ces	ce	DET	_	_	77	spe	_	_	_	_	_
77	sites	site	NOM	_	_	75	dep	_	_	_	_	_
78	présente	présenter	VRB	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
79	une	un	DET	_	_	80	spe	_	_	_	_	_
80	séquence	séquence	NOM	_	_	78	dep	_	_	_	_	_
81	consensus	consensus	NOM	_	_	80	dep	_	_	_	_	_
82	de	de	PRE	_	_	80	dep	_	_	_	_	_
83	fixation	fixation	NOM	_	_	82	dep	_	_	_	_	_
84	de	de	PRE	_	_	83	dep	_	_	_	_	_
85	Fis	Fis	NOM	_	_	84	dep	_	_	_	_	_
86	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
87	En	En	PRE	_	_	106	periph	_	_	_	_	_
88	amont	amont	NOM	_	_	87	dep	_	_	_	_	_
89	de	de	PRE	_	_	88	dep	_	_	_	_	_
90	ces	ce	DET	_	_	92	spe	_	_	_	_	_
91	deux	deux	NUM	_	_	92	dep	_	_	_	_	_
92	sites	site	NOM	_	_	89	dep	_	_	_	_	_
93	,	,	PUNC	_	_	87	punc	_	_	_	_	_
94	une	un	DET	_	_	95	spe	_	_	_	_	_
95	région	région	NOM	_	_	106	subj	_	_	_	_	_
96	d'	de	PRE	_	_	95	dep	_	_	_	_	_
97	environ	environ	ADV	_	_	99	dep	_	_	_	_	_
98	100	100	NUM	_	_	99	spe	_	_	_	_	_
99	pb	problème	NOM	_	_	96	dep	_	_	_	_	_
100	,	,	PUNC	_	_	95	punc	_	_	_	_	_
101	appelée	appeler	ADJ	_	_	95	dep	_	_	_	_	_
102	site	site	NOM	_	_	101	dep	_	_	_	_	_
103	III	III	ADJ	_	_	102	dep	_	_	_	_	_
104	,	,	PUNC	_	_	95	punc	_	_	_	_	_
105	est	être	VRB	_	_	106	aux	_	_	_	_	_
106	protégée	protéger	VPP	_	_	78	dep	_	_	_	_	_
107	des	de	PRE	_	_	106	dep	_	_	_	_	_
108	coupures	coupure	NOM	_	_	107	dep	_	_	_	_	_
109	par	par	PRE	_	_	108	dep	_	_	_	_	_
110	la	le	DET	_	_	111	spe	_	_	_	_	_
111	DNase	DNase	NOM	_	_	109	dep	_	_	_	_	_
112	I	I	NOM	_	_	111	dep	_	_	_	_	_
113	,	,	PUNC	_	_	117	punc	_	_	_	_	_
114	mais	mais	COO	_	_	117	mark	_	_	_	_	_
115	elle	elle	CLS	_	_	117	subj	_	_	_	_	_
116	ne	ne	ADV	_	_	117	dep	_	_	_	_	_
117	contient	contenir	VRB	_	_	106	para	_	_	_	_	_
118	qu'	que	ADV	_	_	117	dep	_	_	_	_	_
119	une	un	DET	_	_	121	spe	_	_	_	_	_
120	seule	seul	ADJ	_	_	121	dep	_	_	_	_	_
121	séquence	séquence	NOM	_	_	117	dep	_	_	_	_	_
122	consensus	consensus	NOM	_	_	121	dep	_	_	_	_	_
123	de	de	PRE	_	_	122	dep	_	_	_	_	_
124	fixation	fixation	NOM	_	_	123	dep	_	_	_	_	_
125	de	de	PRE	_	_	124	dep	_	_	_	_	_
126	Fis	Fis	NOM	_	_	125	dep	_	_	_	_	_
127	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
128	Cette	Cette	NOM	_	_	129	dep	_	_	_	_	_
129	région	région	NOM	_	_	130	subj	_	_	_	_	_
130	recouvre	recouvrir	VRB	_	_	78	dep	_	_	_	_	_
131	en	en	PRE	_	_	130	dep	_	_	_	_	_
132	grande	grand	ADJ	_	_	133	dep	_	_	_	_	_
133	partie	partie	NOM	_	_	131	dep	_	_	_	_	_
134	les	le	DET	_	_	135	spe	_	_	_	_	_
135	sites	site	NOM	_	_	130	dep	_	_	_	_	_
136	de	de	PRE	_	_	135	dep	_	_	_	_	_
137	fixation	fixation	NOM	_	_	136	dep	_	_	_	_	_
138	C1	C1	NOM	_	_	137	dep	_	_	_	_	_
139	à	à	PRE	_	_	137	dep	_	_	_	_	_
140	C3	C3	NOM	_	_	139	dep	_	_	_	_	_
141	de	de	PRE	_	_	135	dep	_	_	_	_	_
142	OmpR	OmpR	NOM	_	_	141	dep	_	_	_	_	_
143	,	,	PUNC	_	_	145	punc	_	_	_	_	_
144	le	le	DET	_	_	145	spe	_	_	_	_	_
145	site	site	NOM	_	_	142	dep	_	_	_	_	_
146	III	III	ADJ	_	_	145	dep	_	_	_	_	_
147	étant	être	VPR	_	_	148	aux	_	_	_	_	_
148	localisé	localiser	VPP	_	_	145	dep	_	_	_	_	_
149	en	en	PRE	_	_	148	dep	_	_	_	_	_
150	amont	amont	NOM	_	_	149	dep	_	_	_	_	_
151	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1480
# text = Régulation de ompF au cours de l'évolution expérimentale
1	Régulation	régulation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	ompF	ompF	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	au	à	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	cours	cours	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	évolution	évolution	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1481
# text = Les résultats présentés dans ce paragraphe sont préliminaires .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	résultats	résultat	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	présentés	présenter	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	dans	dans	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ce	ce	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	paragraphe	paragraphe	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	préliminaires	préliminaire	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1482
# text = Les protéines FIS évoluées
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéines	protéine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	FIS	FIS	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	évoluées	évolué	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1483
# text = Ara- 3 et Ara- 4 ( voir Résultats Partie II , Materials and Methods ) ont été utilisées lors d'expériences de retards sur gel avec le promoteur ompFB , dans les mêmes conditions que celles décrites précédemment .
1	Ara-	Ara-	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
2	3	3	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	4	mark	_	_	_	_	_
4	Ara-	Ara-	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
5	4	4	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	(	(	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
7	voir	voir	VNF	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
8	Résultats	Résultats	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
9	Partie	Partie	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	II	II	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
12	Materials	Materials	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
13	and	materials and methods	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	Methods	Methods	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	)	)	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
16	ont	avoir	VRB	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
17	été	être	VPP	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
18	utilisées	utiliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	lors	lors de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	d'	lors de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	expériences	expérience	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	retards	retard	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	sur	sur	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	gel	gel	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	avec	avec	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
27	le	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	promoteur	promoteur	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	ompFB	ompFB	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
31	dans	dans	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
32	les	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
33	mêmes	même	ADJ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
34	conditions	condition	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
35	que	que	CSU	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	celles	celui	PRQ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	décrites	décrire	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	précédemment	précédemment	ADV	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1484
# text = Aucune fixation n'a alors été observée ( résultats non montrés ) , suggérant une absence d'activation de ompF en phase exponentielle dans les clones évolués .
1	Aucune	aucun	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fixation	fixation	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	n'	ne	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
4	a	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
5	alors	alors	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
6	été	être	VPP	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	observée	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	(	(	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
9	résultats	résultat	NOM	_	_	7	parenth	_	_	_	_	_
10	non	non	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	montrés	montrer	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	)	)	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	suggérant	suggérer	VPR	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
15	une	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	absence	absence	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	d'	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	activation	activation	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	ompF	ompF	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	en	en	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
22	phase	phase	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	dans	dans	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
25	les	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	clones	clone	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	évolués	évolué	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1485
# text = Ceci reste cependant à confirmer par l'analyse des fusions transcriptionnelles ompFB-lacZ dans les souches ancestrales isogéniques portant les différents allèles évolués de fis , et dans les clones évolués isolés au cours du temps dans les différentes populations d'évolution .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	reste	rester	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	cependant	cependant	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	à	à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	confirmer	confirmer	VNF	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	analyse	analyse	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	des	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	fusions	fusion	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	transcriptionnelles	transcriptionnel	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	ompFB-lacZ	ompFB-lacZ	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	dans	dans	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	souches	souche	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	ancestrales	ancestral	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	isogéniques	isogénique	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	portant	porter	VPR	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	les	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
20	différents	différent	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	allèles	allèle	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	évolués	évolué	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
27	dans	dans	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
28	les	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	clones	clone	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	évolués	évolué	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	isolés	isoler	VPP	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	au	au cours de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	cours	au cours de	DET	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	du	au cours de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	temps	temps	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	dans	dans	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
37	les	le	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
38	différentes	différent	ADJ	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
39	populations	population	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
40	d'	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	évolution	évolution	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	.	.	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1486
# text = Un premier résultat nous indique toutefois que les mutations apparues dans le gène fis résultent en une absence d'activation du promoteur ompFB par la protéine .
1	Un	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	premier	premier	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	résultat	résultat	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
4	nous	le	CLI	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	indique	indiquer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	toutefois	toutefois	ADV	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
7	que	queComp?	PRQ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	mutations	mutation	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
10	apparues	apparaître	VPP	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	dans	dans	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	le	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	gène	gène	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	fis	faire	VRB	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
15	résultent	résulter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	en	en	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	une	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	absence	absence	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	d'	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	activation	activation	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	du	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	promoteur	promoteur	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	ompFB	ompFB	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	par	par	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	protéine	protéine	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1487
# text = En effet , la fusion transcriptionnelle ompFB-lacZ introduite dans
1	En	en	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	effet	effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	fusion	fusion	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	transcriptionnelle	transcriptionnel	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ompFB-lacZ	ompFB-lacZ	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	introduite	introduire	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1488
# text = 606 fis
1	606	606	NUM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1489
# text = - 1 montre la même diminution d'activité par rapport à 606 que lorsqu'elle est introduite dans 606 & 206;& 148; fis ( Figure 30 ) , montrant ainsi qu'une diminution de 3 fois de la quantité de protéine a le même effet sur la transcription de ompFB qu'une absence totale de Fis .
1	-	-	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	montre	montrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	même	même	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	diminution	diminution	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	activité	activité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	par	par rapport à	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
10	rapport	par rapport à	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	à	par rapport à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	606	606	NUM	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	que	que?	PRQ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	lorsqu'	lorsque	CSU	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
15	elle	elle	CLS	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
16	est	être	VRB	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
17	introduite	introduire	VPP	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	dans	dans	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	606	606	NUM	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	Δ	Δ	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	(	(	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	30	30	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	)	)	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
27	montrant	montrer	VPR	_	_	0	root	_	_	_	_	_
28	ainsi	ainsi	ADV	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	qu'	que	CSU	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	une	un	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	diminution	diminution	NOM	_	_	40	subj	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	3	3	NUM	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	fois	fois	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
36	la	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	quantité	quantité	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	protéine	protéine	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	a	avoir	VRB	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
41	le	le	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
42	même	même	ADJ	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
43	effet	effet	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
44	sur	sur	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	la	le	DET	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
46	transcription	transcription	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	de	de	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	ompFB	ompFB	VNF	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	qu'	que	ADV	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	une	un	DET	_	_	51	spe	_	_	_	_	_
51	absence	absence	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
52	totale	total	ADJ	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	de	de	PRE	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
54	Fis	Fis	NOM	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	.	.	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1490
# text = De plus , des différences de régulation au niveau de ompF se sont probablement produites au cours des 20 000 générations d'évolution expérimentale .
1	De	de plus	PRE	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	différences	différence	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	régulation	régulation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	au	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	niveau	niveau	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	ompF	ompF	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	se	se	CLI	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
13	sont	être	VRB	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
14	probablement	probablement	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	produites	produire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	au	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	cours	cours	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	des	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	20	20	NUM	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	000	000	NUM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	générations	génération	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	d'	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	évolution	évolution	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1491
# text = En effet , l'estimation des quantités de OmpF par extraction des protéines membranaires et électrophorèse en gel SDS-PAGE , a révélé que les allèles fis évolués introduits dans le contexte génétique du clone ancêtre entraînaient une diminution de la quantité de OmpF. Ces allèles évolués diminuant la quantité ou l'activité de Fis , ces résultats confirment le mécanisme d'activation de Fis sur l'expression de ompF. En revanche , dans le contexte génétique des clones évolués isolés des différentes populations d'évolution , aucune diminution de la quantité de OmpF n'a été détectée malgré la présence des allèles évolués de fis .
1	En	en effet	PRE	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	estimation	estimation	NOM	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
6	des	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	quantités	quantité	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	OmpF	OmpF	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	extraction	extraction	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	des	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	protéines	protéine	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	membranaires	membranaire	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	électrophorèse	électrophorèse	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
17	en	en	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	gel	gel	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	SDS-PAGE	SDS-PAGE	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
21	a	avoir	VRB	_	_	22	aux	_	_	_	_	_
22	révélé	révéler	VPP	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
23	que	que?	PRQ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	les	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	allèles	allèle	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
26	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
27	évolués	évolué	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	introduits	introduire	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	dans	dans	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
30	le	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	contexte	contexte	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	génétique	génétique	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	du	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	clone	clone	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	entraînaient	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
37	une	un	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	diminution	diminution	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
39	de	de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	la	le	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	quantité	quantité	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	de	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	OmpF.	OmpF.	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	Ces	Ces	DET	_	_	45	spe	_	_	_	_	_
45	allèles	allèle	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	évolués	évolué	ADJ	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	diminuant	diminuer	VPR	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
48	la	le	DET	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
49	quantité	quantité	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	ou	ou	COO	_	_	52	mark	_	_	_	_	_
51	l'	le	DET	_	_	52	spe	_	_	_	_	_
52	activité	activité	NOM	_	_	38	para	_	_	_	_	_
53	de	de	PRE	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	Fis	Fis	NOM	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	,	,	PUNC	_	_	105	punc	_	_	_	_	_
56	ces	ce	DET	_	_	57	spe	_	_	_	_	_
57	résultats	résultat	NOM	_	_	58	subj	_	_	_	_	_
58	confirment	confirmer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
59	le	le	DET	_	_	60	spe	_	_	_	_	_
60	mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
61	d'	de	PRE	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
62	activation	activation	NOM	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
63	de	de	PRE	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
64	Fis	Fis	NOM	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
65	sur	sur	PRE	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
66	l'	le	DET	_	_	67	spe	_	_	_	_	_
67	expression	expression	NOM	_	_	65	dep	_	_	_	_	_
68	de	de	PRE	_	_	67	dep	_	_	_	_	_
69	ompF.	ompF.	NOM	_	_	68	dep	_	_	_	_	_
70	En	En	PRE	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
71	revanche	revanche	NOM	_	_	70	dep	_	_	_	_	_
72	,	,	PUNC	_	_	105	punc	_	_	_	_	_
73	dans	dans	PRE	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
74	le	le	DET	_	_	75	spe	_	_	_	_	_
75	contexte	contexte	NOM	_	_	73	dep	_	_	_	_	_
76	génétique	génétique	ADJ	_	_	75	dep	_	_	_	_	_
77	des	de	PRE	_	_	75	dep	_	_	_	_	_
78	clones	clone	NOM	_	_	77	dep	_	_	_	_	_
79	évolués	évolué	ADJ	_	_	78	dep	_	_	_	_	_
80	isolés	isolé	ADJ	_	_	78	dep	_	_	_	_	_
81	des	de	PRE	_	_	78	dep	_	_	_	_	_
82	différentes	différent	ADJ	_	_	83	dep	_	_	_	_	_
83	populations	population	NOM	_	_	81	dep	_	_	_	_	_
84	d'	de	PRE	_	_	83	dep	_	_	_	_	_
85	évolution	évolution	NOM	_	_	84	dep	_	_	_	_	_
86	,	,	PUNC	_	_	105	punc	_	_	_	_	_
87	aucune	aucun	DET	_	_	88	spe	_	_	_	_	_
88	diminution	diminution	NOM	_	_	97	subj	_	_	_	_	_
89	de	de	PRE	_	_	88	dep	_	_	_	_	_
90	la	le	DET	_	_	91	spe	_	_	_	_	_
91	quantité	quantité	NOM	_	_	89	dep	_	_	_	_	_
92	de	de	PRE	_	_	91	dep	_	_	_	_	_
93	OmpF	OmpF	NOM	_	_	92	dep	_	_	_	_	_
94	n'	ne	ADV	_	_	97	dep	_	_	_	_	_
95	a	avoir	VRB	_	_	96	aux	_	_	_	_	_
96	été	être	VPP	_	_	97	aux	_	_	_	_	_
97	détectée	détecter	VPP	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
98	malgré	malgré	PRE	_	_	97	dep	_	_	_	_	_
99	la	le	DET	_	_	100	spe	_	_	_	_	_
100	présence	présence	NOM	_	_	98	dep	_	_	_	_	_
101	des	de	PRE	_	_	100	dep	_	_	_	_	_
102	allèles	allèle	NOM	_	_	101	dep	_	_	_	_	_
103	évolués	évolué	ADJ	_	_	102	dep	_	_	_	_	_
104	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
105	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
106	.	.	PUNC	_	_	105	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1492
# text = Ceci signifie que la régulation de ompF par Fis a été éliminée probablement à la suite d'autres mutations substituées dans ces populations .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	signifie	signifier	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	que	que	CSU	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	régulation	régulation	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ompF	ompF	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	Fis	Fis	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	a	avoir	VRB	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	été	être	VPP	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	éliminée	éliminer	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
13	probablement	probablement	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	suite	suite	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	d'	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	autres	autre	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	mutations	mutation	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	substituées	substituer	VPP	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	dans	dans	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	ces	ce	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	populations	population	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1493
# text = Ces phénomènes sont actuellement en cours d'étude .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	phénomènes	phénomène	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	actuellement	actuellement	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	en	en	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	cours	cours	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	étude	étude	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1494
# text = Discussion
1	Discussion	discussion	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1495
# text = Les profils protéomiques des souches ancestrales portant les allèles ancestraux ou évolués des gènes fis et/ou topA , ont révélé que l'expression d'un certain nombre de gènes codant des protéines ancrées dans la membrane externe ( PAL , OmpA , OmpF ) , et de surA impliqué dans la régulation des protéines membranaires ( Lazar et Kolter , 1996 ) , était modifiée par la présence des allèles évolués .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	profils	profil	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	protéomiques	protéomique	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	souches	souche	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ancestrales	ancestral	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	portant	porter	VPR	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	allèles	allèle	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	ancestraux	ancestral	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	ou	ou	COO	_	_	12	mark	_	_	_	_	_
12	évolués	évolué	ADJ	_	_	10	para	_	_	_	_	_
13	des	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	gènes	gène	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	et/ou	et-ou	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
17	topA	topA	ADV	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
19	ont	avoir	VRB	_	_	20	aux	_	_	_	_	_
20	révélé	révéler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	que	que	CSU	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	l'	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	expression	expression	NOM	_	_	65	subj	_	_	_	_	_
24	d'	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	un	un	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
26	certain	certain	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
27	nombre	nombre	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	gènes	gène	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	codant	coder	VPR	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	des	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	protéines	protéine	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	ancrées	ancrer	VPP	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	dans	dans	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	la	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	membrane	membrane	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	externe	externe	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	(	(	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
39	PAL	PAL	NOM	_	_	32	parenth	_	_	_	_	_
40	,	,	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
41	OmpA	OmpA	NOM	_	_	39	para	_	_	_	_	_
42	,	,	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
43	OmpF	OmpF	NOM	_	_	41	para	_	_	_	_	_
44	)	)	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
45	,	,	PUNC	_	_	47	punc	_	_	_	_	_
46	et	et	COO	_	_	47	mark	_	_	_	_	_
47	de	de	PRE	_	_	28	para	_	_	_	_	_
48	surA	sur-	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	impliqué	impliquer	VPP	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	dans	dans	PRE	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	la	le	DET	_	_	52	spe	_	_	_	_	_
52	régulation	régulation	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
53	des	de	PRE	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	protéines	protéine	NOM	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	membranaires	membranaire	ADJ	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	(	(	PUNC	_	_	57	punc	_	_	_	_	_
57	Lazar	Lazar	NOM	_	_	54	parenth	_	_	_	_	_
58	et	et	COO	_	_	59	mark	_	_	_	_	_
59	Kolter	Kolter	NOM	_	_	57	para	_	_	_	_	_
60	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
61	1996	1996	NUM	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
62	)	)	PUNC	_	_	57	punc	_	_	_	_	_
63	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
64	était	être	VRB	_	_	65	aux	_	_	_	_	_
65	modifiée	modifier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
66	par	par	PRE	_	_	65	dep	_	_	_	_	_
67	la	le	DET	_	_	68	spe	_	_	_	_	_
68	présence	présence	NOM	_	_	66	dep	_	_	_	_	_
69	des	de	PRE	_	_	68	dep	_	_	_	_	_
70	allèles	allèle	NOM	_	_	69	dep	_	_	_	_	_
71	évolués	évolué	ADJ	_	_	70	dep	_	_	_	_	_
72	.	.	PUNC	_	_	65	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1496
# text = Nous nous sommes focalisés au cours de ce travail sur les gènes codant les porines majeures d'E. coli .
1	Nous	nous	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
2	nous	nous	CLS	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	sommes	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	focalisés	focaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	au	au cours de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	cours	au cours de	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	au cours de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ce	ce	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	travail	travail	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	sur	sur	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	les	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	gènes	gène	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	codant	coder	VPR	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	porines	purine	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	majeures	majeur	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	d'	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	E.	E.	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	coli	coli	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1497
# text = Dans un premier temps , nous avons pu montrer que l'allèle évolué de topA , qui diminue l'activité de la TopoI et entraîne ainsi une augmentation de superhélicité de l'ADN , conduisait à une diminution de la transcription de ompF. Ceci avait déjà été observé chez E. coli K12 , et ce phénomène pourrait également contribuer à la répression de la transcription de ompF lors d'un choc osmotique .
1	Dans	dans	PRE	_	_	48	periph	_	_	_	_	_
2	un	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	premier	premier	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	temps	temps	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	nous	nous	CLS	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
7	avons	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	pu	pouvoir	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	montrer	montrer	VNF	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	que	que	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	allèle	allèle	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	évolué	évolué	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	topA	topA	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
17	qui	qui	PRQ	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
18	diminue	diminuer	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	activité	activité	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	TopoI	TopoI	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
25	entraîne	entraîner	VRB	_	_	18	para	_	_	_	_	_
26	ainsi	ainsi	ADV	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	une	un	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	augmentation	augmentation	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
32	l'	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	ADN	ADN	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
35	conduisait	conduire	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
36	à	à	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	une	un	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	diminution	diminution	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	de	de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	la	le	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	transcription	transcription	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	de	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	ompF.	ompF.	VNF	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	Ceci	Ceci	PRQ	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	avait	avoir	VRB	_	_	47	aux	_	_	_	_	_
46	déjà	déjà	ADV	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
47	été	être	VPP	_	_	48	aux	_	_	_	_	_
48	observé	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
49	chez	chez	PRE	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	E.	E.	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
51	coli	coli	NOM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
52	K12	K12	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	,	,	PUNC	_	_	57	punc	_	_	_	_	_
54	et	et	COO	_	_	57	mark	_	_	_	_	_
55	ce	ce	DET	_	_	56	spe	_	_	_	_	_
56	phénomène	phénomène	NOM	_	_	57	subj	_	_	_	_	_
57	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	48	para	_	_	_	_	_
58	également	également	ADV	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
59	contribuer	contribuer	VNF	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
60	à	à	PRE	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
61	la	le	DET	_	_	62	spe	_	_	_	_	_
62	répression	répression	NOM	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
63	de	de	PRE	_	_	62	dep	_	_	_	_	_
64	la	le	DET	_	_	65	spe	_	_	_	_	_
65	transcription	transcription	NOM	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
66	de	de	PRE	_	_	65	dep	_	_	_	_	_
67	ompF	ompF	NOM	_	_	66	dep	_	_	_	_	_
68	lors	lors de	PRE	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
69	d'	lors de	PRE	_	_	68	dep	_	_	_	_	_
70	un	un	DET	_	_	71	spe	_	_	_	_	_
71	choc	choc	NOM	_	_	69	dep	_	_	_	_	_
72	osmotique	osmotique	ADJ	_	_	71	dep	_	_	_	_	_
73	.	.	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1498
# text = En effet , le stress osmotique est connu pour augmenter de façon transitoire la superhélicité de l'ADN .
1	En	en effet	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	stress	stress	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
6	osmotique	osmotique	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	connu	connaître	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	pour	pour	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	augmenter	augmenter	VNF	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	façon	façon	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	transitoire	transitoire	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	ADN	ADN	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1499
# text = Nous avons pu également démontrer que la transcription de ompF chez E. coli B était dépendante d'une activation par Fis , mais uniquement au cours de la phase exponentielle de croissance .
1	Nous	nous	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	avons	avoir	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	pu	pouvoir	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	également	également	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	démontrer	démontrer	VNF	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	que	que	CSU	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	transcription	transcription	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	ompF	ompF	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	chez	chez	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	E.	E.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	coli	coli	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	B	B	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	était	être	VRB	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
16	dépendante	dépendant	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	d'	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	une	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	activation	activation	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	par	par	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	Fis	Fis	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
23	mais	mais	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
24	uniquement	uniquement	ADV	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	au	à	PRE	_	_	17	para	_	_	_	_	_
26	cours	cours	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	phase	phase	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	croissance	croissance	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1500
# text = Le profil d'expression de Fis est tout à fait compatible avec cette activation , Fis étant abondante en phase exponentielle et quasiment absente en phase stationnaire .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	profil	profil	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	expression	expression	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	Fis	Fis	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	tout	tout à fait	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
9	à	tout à fait	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	fait	tout à fait	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	compatible	compatible	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	avec	avec	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
13	cette	ce	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	activation	activation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Fis	Fis	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	étant	être	VPR	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	abondante	abondant	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	en	en	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	phase	phase	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
23	quasiment	quasiment	ADV	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	absente	absent	ADJ	_	_	21	para	_	_	_	_	_
25	en	en	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
26	phase	phase	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1501
# text = Il peut paraître surprenant que cette régulation de ompF par Fis n'ait jamais été détectée auparavant , et nous pensons que ceci est dû au fait que cette activation est spécifique d'E. coli B .
1	Il	il	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	peut	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	paraître	paraître	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	surprenant	surprenant	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	que	que	CSU	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	cette	ce	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	régulation	régulation	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	ompF	ompF	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	par	par	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	Fis	Fis	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	n'	ne	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
13	ait	avoir	VRB	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
14	jamais	jamais	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
15	été	être	VPP	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	détectée	détecter	VPP	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
17	auparavant	auparavant	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
20	nous	nous	CLS	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
21	pensons	penser	VRB	_	_	3	para	_	_	_	_	_
22	que	que	CSU	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	ceci	ceci	PRQ	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
24	est	être	VRB	_	_	25	aux	_	_	_	_	_
25	dû	devoir	VPP	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	au	à	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	fait	fait	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	que	que	CSU	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	cette	ce	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	activation	activation	NOM	_	_	31	subj	_	_	_	_	_
31	est	être	VRB	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
32	spécifique	spécifique	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
33	d'	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	E.	E.	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
35	coli	coli	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	B	B	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1502
# text = Elle n'a en effet pas été observée dans une souche d'E. coli K12 .
1	Elle	elle	CLS	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
2	n'	ne	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
3	a	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
4	en	en	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
5	effet	effet	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	pas	pas	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
7	été	être	VPP	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	observée	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	une	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	souche	souche	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	E.	E.	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	coli	coli	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	K12	K12	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1503
# text = Contrairement à la situation chez E. coli B où la transcription de ompF est constitutive , la transcription de ompF chez E. coli K12 est indépendante de Fis et , après un niveau de base en phase exponentielle , elle est activée en phase stationnaire .
1	Contrairement	contrairement	ADV	_	_	25	periph	_	_	_	_	_
2	à	à	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	situation	situation	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	chez	chez	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	E.	E.	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	coli	colis	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	B	B	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	où	où	PRQ	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	transcription	transcription	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	ompF	ompF	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	est	être	VRB	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
15	constitutive	constitutif	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	transcription	transcription	NOM	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	ompF	ompF	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	chez	chez	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	E.	E.	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	coli	coli	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	K12	K12	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	indépendante	indépendant	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	Fis	Fis	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	et	et	COO	_	_	42	mark	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
31	après	après	PRE	_	_	42	periph	_	_	_	_	_
32	un	un	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	niveau	niveau	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	base	base	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	en	en	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	phase	phase	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	,	,	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
40	elle	elle	CLS	_	_	42	subj	_	_	_	_	_
41	est	être	VRB	_	_	42	aux	_	_	_	_	_
42	activée	activer	VPP	_	_	25	para	_	_	_	_	_
43	en	en	PRE	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	phase	phase	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	.	.	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1504
# text = L'absence de forte transcription de ompFK 12 en phase exponentielle pourrait être liée à l'absence d'activation par Fis .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	absence	absence	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	forte	fort	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	transcription	transcription	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ompFK	ompFK	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	12	12	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	en	en	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	phase	phase	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	être	être	VNF	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	liée	lier	VPP	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	absence	absence	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	d'	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	activation	activation	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	par	par	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	Fis	Fis	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1505
# text = Le mécanisme permettant une activation de la transcription de ompFK 12 et le maintien d'une transcription élevée de ompFB en phase stationnaire est inconnu .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
3	permettant	permettre	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	une	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	activation	activation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	transcription	transcription	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	ompFK	ompFK	VNF	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	12	12	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
13	le	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	maintien	maintien	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_
15	d'	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	une	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	transcription	transcription	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	élevée	élevé	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
20	ompFB	ompFB	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	en	en	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	phase	phase	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
25	inconnu	inconnu	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1506
# text = Quelles pourraient être les bases moléculaires de cette différence de régulation de ompF entre E. coli B et K 12 ?
1	Quelles	quel?	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	être	être	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	bases	base	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
6	moléculaires	moléculaire	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	cette	ce	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	différence	différence	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	régulation	régulation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	ompF	ompF	VNF	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	entre	entre	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	E.	E.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	coli	coli	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	B	B	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	K	K	NOM	_	_	17	para	_	_	_	_	_
20	12	12	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
21	?	?	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1507
# text = L'analyse de chacune des fusions transcriptionnelles ompFB et ompFK 12 dans chacune des deux souches a révélé qu'une forte transcription en phase exponentielle ne pouvait se faire que si deux conditions étaient réunies :
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	analyse	analyse	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	chacune	chacun	PRQ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	fusions	fusion	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	transcriptionnelles	transcriptionnel	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ompFB	ompFB	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	ompFK	ompFK	VPR	_	_	8	para	_	_	_	_	_
11	12	12	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	dans	dans	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	chacune	chacun	PRQ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	des	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	deux	deux	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	souches	souche	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	a	avoir	VRB	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
18	révélé	révéler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	qu'	que	CSU	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	une	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
21	forte	fort	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	transcription	transcription	NOM	_	_	27	subj	_	_	_	_	_
23	en	en	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	phase	phase	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	ne	ne	ADV	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
27	pouvait	pouvoir	VRB	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
28	se	se	CLI	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
29	faire	faire	VNF	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	que	que	ADV	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	si	si	CSU	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
32	deux	deux	NUM	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	conditions	condition	NOM	_	_	35	subj	_	_	_	_	_
34	étaient	être	VRB	_	_	35	aux	_	_	_	_	_
35	réunies	réunir	VPP	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
36	:	:	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1508
# text = avoir le promoteur de ompFB et le contexte génétique d'E.   coli B .
1	avoir	avoir	VNF	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	le	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	promoteur	promoteur	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ompFB	ompFB	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
7	le	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	contexte	contexte	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
9	génétique	génétique	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	E.	E.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	 	 	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	coli	colis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	B	B	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1509
# text = En ce qui concerne le promoteur ompFB , trois différences nucléotidiques existent par rapport à ompFK 12 ( Figure
1	En	en	PRE	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	ce	ce	PRQ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	qui	qui	PRQ	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	concerne	concerner	VRB	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	le	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	promoteur	promoteur	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	ompFB	ompFB	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
9	trois	trois	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	différences	différence	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
11	nucléotidiques	nucléotidique	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	existent	exister	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	par	par rapport à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	rapport	par rapport à	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	à	par rapport à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	ompFK	ompFK	VNF	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	12	12	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	(	(	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
19	Figure	Figure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1510
# text = 34 ) , deux d'entre elles étant situées au sein des sites de fixation F2 et F4 de OmpR .
1	34	34	NUM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	deux	deux	NUM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
5	d'	d'entre	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	entre	d'entre	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	elles	lui	PRQ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	étant	être	VPR	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	situées	situer	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
10	au	au sein de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	sein	au sein de	DET	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	des	au sein de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	sites	site	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	fixation	fixation	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	F2	F2	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	F4	F4	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	OmpR	OmpR	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1511
# text = Dans notre hypothèse , c'est la mutation située dans le site F2 , correspondant à une délétion d'un résidu T ( Figure 34 ) , qui serait un des facteurs cruciaux de la différence de régulation entre E. coli B et K12 .
1	Dans	dans	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	notre	son	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	hypothèse	hypothèse	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	c'	ce	CLS	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	mutation	mutation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	située	situer	VPP	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	le	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	site	site	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	F2	F2	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	correspondant	correspondre	VPR	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	à	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	une	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	délétion	délétion	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	d'	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	un	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	résidu	résidu	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	T	T	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	(	(	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	Figure	Figure	NOM	_	_	21	parenth	_	_	_	_	_
25	34	34	NUM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	)	)	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
28	qui	qui	PRQ	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
29	serait	être	VRB	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
30	un	un	PRQ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	des	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	facteurs	facteur	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	cruciaux	crucial	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	la	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	différence	différence	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	régulation	régulation	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	entre	entre	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	E.	E.	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
41	coli	coli	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	B	B	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	et	et	COO	_	_	44	mark	_	_	_	_	_
44	K12	K12	NOM	_	_	42	para	_	_	_	_	_
45	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1512
# text = Toujours selon notre hypothèse , Fis serait responsable de la transcription de ompFB en phase exponentielle .
1	Toujours	toujours	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	selon	selon	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	notre	son	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	hypothèse	hypothèse	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
6	Fis	Fis	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	serait	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	responsable	responsable	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	transcription	transcription	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	ompFB	ompFB	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	en	en	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	phase	phase	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1513
# text = Il a récemment été montré que l'activation du promoteur ompF par OmpR se faisait par un modèle « galopant » .
1	Il	il	CLS	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
2	a	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
3	récemment	récemment	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
4	été	être	VPP	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	montré	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	que	que	CSU	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	activation	activation	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
9	du	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	promoteur	promoteur	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	ompF	ompF	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	par	par	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	OmpR	OmpR	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	se	se	CLI	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	faisait	faire	VRB	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
16	par	par	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	un	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	modèle	modèle	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	«	«	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	galopant	galoper	VPR	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	»	»	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1514
# text = Ces auteurs ont démontré que chaque site F1 à F4 de fixation de OmpR était divisé en deux sous-sites a et b , chacun fixant une molécule de OmpR ( Figure 41 ) .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	auteurs	auteur	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	ont	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	démontré	démontrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	que	que	CSU	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	chaque	chaque	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	site	site	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
8	F1	F1	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	F4	F4	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	fixation	fixation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	OmpR	OmpR	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	était	être	VRB	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	divisé	diviser	VPP	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
17	en	en	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	deux	deux	NUM	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	sous-sites	sous-	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	b	boulevard	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	chacun	chacun	PRQ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
25	fixant	fixer	VPR	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	une	un	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	molécule	molécule	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	OmpR	OmpR	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	(	(	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
31	Figure	Figure	NOM	_	_	29	parenth	_	_	_	_	_
32	41	41	NUM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	)	)	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1515
# text = Ainsi , six molécules de OmpR au total peuvent se fixer sur les sites F1 à F3 .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	six	six	NUM	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	molécules	molécule	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	OmpR	OmpR	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	au	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	total	total	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	se	se	CLI	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	fixer	fixer	VNF	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	sur	sur	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	les	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	sites	site	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	F1	F1	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	à	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	F3	F3	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1516
# text = Le modèle « galopant » implique un ordre de fixation séquentiel , avec une première molécule de OmpR se fixant d'abord sur F 1b , ce qui permet la fixation d'une seconde molécule de OmpR sur F 1a , puis d'une troisième sur F 2b , d'une quatrième sur F 2a , etc ...
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	modèle	modèle	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	«	«	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	galopant	galoper	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	»	»	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
6	implique	impliquer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	un	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	ordre	ordre	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	fixation	fixation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	séquentiel	séquentiel	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
13	avec	avec	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
14	une	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
15	première	premier	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	molécule	molécule	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	OmpR	OmpR	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	se	se	CLI	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	fixant	fixer	VPR	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	d'	d'abord	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	abord	d'abord	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	sur	sur	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	F	F	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	1b	1b	NUM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
27	ce	ce	PRQ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
28	qui	qui	PRQ	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
29	permet	permettre	VRB	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	la	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	fixation	fixation	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	d'	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	une	un	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
34	seconde	second	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
35	molécule	molécule	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
36	de	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	OmpR	OmpR	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	sur	sur	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
39	F	F	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	1a	1a	NUM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	,	,	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
42	puis	puis	COO	_	_	43	mark	_	_	_	_	_
43	d'	de	PRE	_	_	32	para	_	_	_	_	_
44	une	un	DET	_	_	45	spe	_	_	_	_	_
45	troisième	troisième	NUM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	sur	sur	PRE	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	F	F	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	2b	2b	NUM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	,	,	PUNC	_	_	50	punc	_	_	_	_	_
50	d'	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
51	une	un	DET	_	_	52	spe	_	_	_	_	_
52	quatrième	quatrième	PRQ	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
53	sur	sur	PRE	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	F	F	NOM	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	2a	2a	NUM	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
57	etc	etc.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
58	...	...	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1517
# text = ( Figure 41 ) .
1	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	Figure	Figure	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	41	41	NUM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
4	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
5	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1518
# text = L'activation de ompF a lieu à partir du recouvrement des sites F1 et F2 par OmpR .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	activation	activation	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ompF	ompF	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	lieu	lieu	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	à	à partir de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	partir	à partir de	DET	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	du	à partir de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	recouvrement	recouvrement	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	des	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	sites	site	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	F1	F1	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	F2	F2	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
16	par	par	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
17	OmpR	OmpR	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1519
# text = Selon notre hypothèse , la délétion d'une base se produisant chez E. coli B au sein du site F 2a entraînerait un déficit de reconnaissance de ce sous-site par OmpR , ce qui bloquerait le « galop » .
1	Selon	selon	PRE	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
2	notre	son	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	hypothèse	hypothèse	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	délétion	délétion	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	une	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	base	base	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	se	se	CLI	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	produisant	produire	VPR	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	chez	chez	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	E.	E.	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	coli	coli	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	B	B	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	au	au sein de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
17	sein	au sein de	DET	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	du	au sein de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	site	site	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	F	F	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	2a	2a	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	entraînerait	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	un	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	déficit	déficit	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	reconnaissance	reconnaissance	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	ce	ce	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	sous-site	sous-	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	par	par	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	OmpR	OmpR	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
33	ce	ce	PRQ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
34	qui	qui	PRQ	_	_	35	subj	_	_	_	_	_
35	bloquerait	bloquer	VRB	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	le	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
37	«	«	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
38	galop	galop	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
39	»	»	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
40	.	.	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1520
# text = Notre hypothèse est que cette mutation affecterait gravement la capacité de OmpR à activer ce promoteur .
1	Notre	son	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	hypothèse	hypothèse	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	que	que	CSU	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	cette	ce	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	mutation	mutation	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	affecterait	affecter	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	gravement	gravement	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	capacité	capacité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	OmpR	OmpR	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	activer	activer	VNF	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	ce	ce	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	promoteur	promoteur	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1521
# text = Cette même délétion d'un nucléotide chez E. coli
1	Cette	cette	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	même	même	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	délétion	délétion	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	un	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	nucléotide	nucléotide	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	chez	chez	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	E.	E.	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	coli	coli	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1522
# text = B a également pour conséquence de rapprocher la séquence du site I de fixation de Fis que nous avons déterminé ( Figure 34 ) de la séquence consensus de fixation de Fis
1	B	B	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	également	également	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	pour	pour	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	conséquence	conséquence	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	rapprocher	rapprocher	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	séquence	séquence	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	du	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	site	site	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	I	I	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	fixation	fixation	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	Fis	Fis	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	que	que	PRQ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
18	nous	nous	CLS	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
19	avons	avoir	VRB	_	_	20	aux	_	_	_	_	_
20	déterminé	déterminer	VPP	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	(	(	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	Figure	Figure	NOM	_	_	16	parenth	_	_	_	_	_
23	34	34	NUM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	)	)	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
26	la	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	séquence	séquence	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	consensus	consensus	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	fixation	fixation	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	Fis	Fis	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1523
# text = ( 11 pb conservées sur 13 au lieu de 10 ) .
1	(	(	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
2	11	11	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	pb	problème	NOM	_	_	2	parenth	_	_	_	_	_
4	conservées	conserver	VPP	_	_	3	para	_	_	_	_	_
5	sur	sur	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	13	13	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	au	au lieu de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	lieu	au lieu de	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	au lieu de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	10	10	NUM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	)	)	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1524
# text = Ceci améliorerait donc la capacité de liaison de Fis à cette région , et l'activation par Fis se substituerait à celle par OmpR. Cependant , nos résultats indiquent que ceci ne serait pas suffisant pour permettre l'activation du promoteur ompFB par Fis , puisque , dans le contexte génétique d'E. coli K12 , celui  -ci n'est pas activé par Fis ( Figure 36 ) .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	améliorerait	améliorer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	donc	donc	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	capacité	capacité	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	liaison	liaison	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	Fis	Fis	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
11	cette	ce	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	région	région	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	activation	activation	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
17	par	par	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	Fis	Fis	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	se	se	CLI	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	substituerait	substituer	VRB	_	_	2	para	_	_	_	_	_
21	à	à	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	celle	celui	PRQ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	par	par	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	OmpR.	OmpR.	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	Cependant	Cependant	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	62	punc	_	_	_	_	_
27	nos	son	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	résultats	résultat	NOM	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
29	indiquent	indiquer	VRB	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
30	que	que	CSU	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	ceci	ceci	PRQ	_	_	33	subj	_	_	_	_	_
32	ne	ne	ADV	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
33	serait	être	VRB	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
34	pas	pas	ADV	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	suffisant	suffisant	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	pour	pour	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
37	permettre	permettre	VNF	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	l'	le	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	activation	activation	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	du	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	promoteur	promoteur	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	ompFB	ompFB	ADJ	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	par	par	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	Fis	Fis	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	,	,	PUNC	_	_	62	punc	_	_	_	_	_
46	puisque	puisque	CSU	_	_	0	root	_	_	_	_	_
47	,	,	PUNC	_	_	62	punc	_	_	_	_	_
48	dans	dans	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
49	le	le	DET	_	_	50	spe	_	_	_	_	_
50	contexte	contexte	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
51	génétique	génétique	ADJ	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	d'	de	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
53	E.	E.	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	coli	colis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
55	K12	K12	NOM	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	,	,	PUNC	_	_	62	punc	_	_	_	_	_
57	celui	celui	PRQ	_	_	62	subj	_	_	_	_	_
58	 -ci	 -ci	ADJ	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
59	n'	ne	ADV	_	_	62	dep	_	_	_	_	_
60	est	être	VRB	_	_	62	aux	_	_	_	_	_
61	pas	pas	ADV	_	_	62	dep	_	_	_	_	_
62	activé	activer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
63	par	par	PRE	_	_	62	dep	_	_	_	_	_
64	Fis	Fis	NOM	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
65	(	(	PUNC	_	_	66	punc	_	_	_	_	_
66	Figure	Figure	NOM	_	_	64	parenth	_	_	_	_	_
67	36	36	NUM	_	_	66	dep	_	_	_	_	_
68	)	)	PUNC	_	_	66	punc	_	_	_	_	_
69	.	.	PUNC	_	_	62	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1525
# text = Ces résultats suggèrent en effet une régulation différentielle sur le promoteur ompFB entre E. coli B et K12 .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	résultats	résultat	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	suggèrent	suggérer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	en	en effet	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	effet	en effet	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	régulation	régulation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	différentielle	différentiel	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	sur	sur	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	le	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	promoteur	promoteur	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	ompFB	ompFB	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	entre	entre	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	E.	E.	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	coli	coli	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	B	B	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	K12	K12	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1526
# text = Nous suggérons que cette différence pourrait provenir des protéines OmpR ou EnvZ elles-mêmes .
1	Nous	nous	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	suggérons	suggérer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	que	que	CSU	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	cette	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	différence	différence	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	provenir	provenir	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	des	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	protéines	protéine	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	OmpR	OmpR	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	ou	ou	COO	_	_	12	mark	_	_	_	_	_
12	EnvZ	EnvZ	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
13	elles-mêmes	lui-même	PRQ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1527
# text = En effet , de multiples modifications nucléotidiques existent pour les gènes ompR et envZ entre E. coli B et K12 , et trois d'entre elles conduisent à des changements non-synonymes d'acides aminés ;
1	En	en effet	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	de	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	multiples	multiple	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	modifications	modification	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
7	nucléotidiques	nucléotidique	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	existent	exister	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	pour	pour	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	gènes	gène	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	ompR	ompR	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	envZ	envZ	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_
15	entre	entre	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	E.	E.	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	coli	coli	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	B	B	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
20	K12	K12	NOM	_	_	18	para	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
23	trois	trois	NUM	_	_	27	subj	_	_	_	_	_
24	d'	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	entre	entre	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	elles	lui	PRQ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	conduisent	conduire	VRB	_	_	8	para	_	_	_	_	_
28	à	à	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	des	un	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	changements	changement	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	non-synonymes	non-	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	d'	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	acides	acide	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	aminés	aminé	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	;	;	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1528
# text = deux au niveau de OmpR ( K6N et A130T ) , et un au niveau d'EnvZ ( P41L ) .
1	deux	deux	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	au	à	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	niveau	niveau	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	OmpR	OmpR	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	(	(	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	K6N	K6N	NOM	_	_	5	parenth	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	A130T	A130T	NOM	_	_	7	para	_	_	_	_	_
10	)	)	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	un	un	PRQ	_	_	1	para	_	_	_	_	_
14	au	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	niveau	niveau	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	d'	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	EnvZ	EnvZ	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	(	(	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	P41L	P41L	NOM	_	_	17	parenth	_	_	_	_	_
20	)	)	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1529
# text = La protéine senseur EnvZ est l'histidine kinase qui phosphoryle le régulateur transcriptionnel OmpR et le résidu P41 n'est pas connu pour être impliqué dans ce processus .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéine	protéine	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	senseur	senseur	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	EnvZ	EnvZ	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	histidine	histidine	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	kinase	kinase	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	qui	qui	PRQ	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
10	phosphoryle	phosphoryle	VRB	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	le	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	régulateur	régulateur	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	transcriptionnel	transcription	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	OmpR	OmpR	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
16	le	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	résidu	résidu	NOM	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
18	P41	P41	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	n'	ne	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
20	est	être	VRB	_	_	22	aux	_	_	_	_	_
21	pas	pas	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	connu	connaître	VPP	_	_	5	para	_	_	_	_	_
23	pour	pour	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	être	être	VNF	_	_	25	aux	_	_	_	_	_
25	impliqué	impliquer	VPP	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	dans	dans	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
27	ce	ce	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	processus	processus	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1530
# text = Les résidus K6 et A130 de OmpR ne sont pas non plus connus pour être impliqués dans l'activité de la protéine .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	résidus	résidu	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
3	K6	K6	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	A130	A130	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	OmpR	OmpR	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ne	ne	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
9	sont	être	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
10	pas	pas	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
11	non	non	ADV	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
12	plus	plus	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	connus	connaître	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	pour	pour	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	être	être	VNF	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	impliqués	impliquer	VPP	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	dans	dans	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	activité	activité	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	protéine	protéine	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1531
# text = En revanche , le résidu A130 est situé dans la région reliant les domaines N-terminal et C-terminal et permettant la flexibilité de la protéine .
1	En	en revanche	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	revanche	en revanche	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	résidu	résidu	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
6	A130	A130	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	situé	situer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	région	région	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	reliant	relier	VPR	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	les	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	domaines	domaine	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	N-terminal	N-terminal	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
17	C-terminal	C-terminal	NOM	_	_	14	para	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	permettant	permettre	VPR	_	_	12	para	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	flexibilité	flexibilité	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	protéine	protéine	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1532
# text = La protéine OmpR modifiée pourrait montrer un déficit de fixation à l'ADN qui favoriserait la liaison de Fis , qui se fixerait alors sur la région promotrice de ompFB et activerait la transcription en phase exponentielle .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	protéine	protéine	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	OmpR	OmpR	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	modifiée	modifier	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	montrer	montrer	VNF	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	un	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	déficit	déficit	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	fixation	fixation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	à	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	ADN	ADN	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	qui	qui	PRQ	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
15	favoriserait	favoriser	VRB	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	liaison	liaison	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	Fis	Fis	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
21	qui	qui	PRQ	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
22	se	se	CLI	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	fixerait	fixer	VRB	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
24	alors	alors	ADV	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	sur	sur	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	la	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	région	région	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	promotrice	promoteur	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	ompFB	ompFB	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	et	et	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
32	activerait	activer	VRB	_	_	23	para	_	_	_	_	_
33	la	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	transcription	transcription	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	en	en	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	phase	phase	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1533
# text = Ces hypothèses sont actuellement testées d'une part par des approches génétiques en introduisant les mutations ompF et ompR présentes chez E. coli B dans le chromosome d'E. coli K12 , et réciproquement .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	hypothèses	hypothèse	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
4	actuellement	actuellement	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	testées	tester	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	d'	d'une part	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	une	d'une part	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	part	d'une part	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	des	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	approches	approche	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	génétiques	génétique	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
14	introduisant	introduire	VPR	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	les	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	mutations	mutation	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	ompF	ompF	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	ompR	ompR	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
20	présentes	présent	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	chez	chez	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	E.	E.	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	coli	coli	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	B	B	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	dans	dans	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
26	le	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	chromosome	chromosome	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	d'	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	E.	E.	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	coli	coli	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	K12	K12	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
33	et	et	COO	_	_	34	mark	_	_	_	_	_
34	réciproquement	réciproquement	ADV	_	_	5	para	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1534
# text = La transcription de ompF sera alors analysée dans ces différents contextes génétiques .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	transcription	transcription	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ompF	ompF	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	sera	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
6	alors	alors	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	analysée	analyser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	dans	dans	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	ces	ce	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
10	différents	différent	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	contextes	contexte	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	génétiques	génétique	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1535
# text = D'autre part , des approches biochimiques pourront être utilisées , notamment par purification des protéines OmpR d'E. coli B et K12 et par des expériences de retard sur gel avec ces protéines et la protéine Fis , en utilisant les promoteurs de ompFB ou K12 .
1	D'	d'autre part	ADV	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	autre	d'autre part	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	part	d'autre part	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	des	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	approches	approche	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
7	biochimiques	biochimique	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	pourront	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	être	être	VNF	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	utilisées	utiliser	VPP	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
12	notamment	notamment	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	par	par	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	purification	purification	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	des	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	protéines	protéine	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	OmpR	OmpR	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	d'	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	E.	E.	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	coli	coli	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	B	B	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	K12	K12	NOM	_	_	21	para	_	_	_	_	_
24	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
25	par	par	PRE	_	_	13	para	_	_	_	_	_
26	des	un	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	expériences	expérience	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	retard	retard	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	sur	sur	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	gel	gel	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	avec	avec	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	ces	ce	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	protéines	protéine	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	et	et	COO	_	_	37	mark	_	_	_	_	_
36	la	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	protéine	protéine	NOM	_	_	34	para	_	_	_	_	_
38	Fis	Fis	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	,	,	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
40	en	en	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
41	utilisant	utiliser	VPR	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	les	le	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	de	de	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	ompFB	ompFB	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	ou	ou	COO	_	_	47	mark	_	_	_	_	_
47	K12	K12	NOM	_	_	43	para	_	_	_	_	_
48	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1536
# text = Ces différences entre les deux souches d'E. coli entraîneraient donc une expression constitutive de ompF chez E. coli
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	différences	différence	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	entre	entre	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	deux	deux	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	souches	souche	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	E.	E.	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	coli	coli	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	entraîneraient	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	donc	donc	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	une	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	expression	expression	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	constitutive	constitutif	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	ompF	ompF	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	chez	chez	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
18	E.	E.	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	coli	coli	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1537
# text = B . OmpC et OmpF étant les porines majeures d'E.   coli , la perte de OmpC chez E.   coli B aurait ainsi pu être compensée par ces mutations dans le promoteur de ompF et dans ompR et envZ. Cette compensation entraînerait la régulation d'un gène de porine par Fis , qui est un régulateur central chez les bactéries , permettant l'adaptation bactérienne à de multiples conditions de l'environnement ( état nutritionnel , stress oxydatif ... ) .
1	B	b	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	OmpC	OmpC	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	OmpF	OmpF	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
6	étant	être	VPR	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	porines	porines	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	majeures	majeur	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	E.	E.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	 	 	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	coli	colis	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
15	la	la	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	perte	perte	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	OmpC	OmpC	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	chez	chez	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
20	E.	E.	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	 	 	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	coli	colis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	B	B	NOM	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
24	aurait	avoir	VRB	_	_	26	aux	_	_	_	_	_
25	ainsi	ainsi	ADV	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	pu	pouvoir	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
27	être	être	VNF	_	_	28	aux	_	_	_	_	_
28	compensée	compenser	VPP	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	par	par	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	ces	ce	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	mutations	mutation	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	dans	dans	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
33	le	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	promoteur	promoteur	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	ompF	ompF	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	et	et	COO	_	_	44	mark	_	_	_	_	_
38	dans	dans	PRE	_	_	44	periph	_	_	_	_	_
39	ompR	ompR	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	et	et	COO	_	_	41	mark	_	_	_	_	_
41	envZ.	envZ.	NOM	_	_	39	para	_	_	_	_	_
42	Cette	Cette	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
43	compensation	compensation	NOM	_	_	44	subj	_	_	_	_	_
44	entraînerait	entraîner	VRB	_	_	28	para	_	_	_	_	_
45	la	le	DET	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
46	régulation	régulation	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	d'	de	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	un	un	DET	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
49	gène	gène	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	de	de	PRE	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	porine	purine	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	par	par	PRE	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
53	Fis	Fis	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	,	,	PUNC	_	_	56	punc	_	_	_	_	_
55	qui	qui	PRQ	_	_	56	subj	_	_	_	_	_
56	est	être	VRB	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
57	un	un	DET	_	_	58	spe	_	_	_	_	_
58	régulateur	régulateur	NOM	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
59	central	central	NUM	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
60	chez	chez	PRE	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
61	les	le	DET	_	_	62	spe	_	_	_	_	_
62	bactéries	bactérie	NOM	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
63	,	,	PUNC	_	_	64	punc	_	_	_	_	_
64	permettant	permettre	VPR	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
65	l'	le	DET	_	_	66	spe	_	_	_	_	_
66	adaptation	adaptation	NOM	_	_	64	dep	_	_	_	_	_
67	bactérienne	bactérien	ADJ	_	_	66	dep	_	_	_	_	_
68	à	à	PRE	_	_	66	dep	_	_	_	_	_
69	de	un	DET	_	_	71	spe	_	_	_	_	_
70	multiples	multiple	ADJ	_	_	71	dep	_	_	_	_	_
71	conditions	condition	NOM	_	_	68	dep	_	_	_	_	_
72	de	de	PRE	_	_	71	dep	_	_	_	_	_
73	l'	le	DET	_	_	74	spe	_	_	_	_	_
74	environnement	environnement	NOM	_	_	72	dep	_	_	_	_	_
75	(	(	PUNC	_	_	79	punc	_	_	_	_	_
76	état	état	NOM	_	_	71	parenth	_	_	_	_	_
77	nutritionnel	nutritionnel	ADJ	_	_	76	dep	_	_	_	_	_
78	,	,	PUNC	_	_	79	punc	_	_	_	_	_
79	stress	stress	NOM	_	_	77	para	_	_	_	_	_
80	oxydatif	oxydatif	ADJ	_	_	79	dep	_	_	_	_	_
81	...	...	PUNC	_	_	71	punc	_	_	_	_	_
82	)	)	PUNC	_	_	79	punc	_	_	_	_	_
83	.	.	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1538
# text = Enfin , nous avons également montré que Fis se fixait sur les régions promotrices des gènes ompC et ompR , sans toutefois réguler leur transcription de façon détectable .
1	Enfin	enfin	ADV	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	nous	nous	CLS	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
4	avons	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
5	également	également	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	montré	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	que	que	CSU	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	Fis	Fis	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
9	se	se	CLI	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	fixait	fixer	VRB	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	sur	sur	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	régions	région	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	promotrices	promoteur	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	des	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	gènes	gène	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	ompC	ompC	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	ompR	ompR	ADJ	_	_	17	para	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	sans	sans	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
22	toutefois	toutefois	ADV	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
23	réguler	réguler	VNF	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	leur	son	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	transcription	transcription	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	façon	façon	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	détectable	détectable	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1539
# text = Trois hypothèses pourraient expliquer ce résultat .
1	Trois	trois	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	hypothèses	hypothèse	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	expliquer	expliquer	VNF	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ce	ce	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	résultat	résultat	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1540
# text = Tout d'abord , il est possible que les conditions testées ne soient pas celles dans lesquelles Fis intervient .
1	Tout	tout d'abord	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	d'	tout d'abord	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	abord	tout d'abord	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	il	il	CLS	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	possible	possible	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	que	que	CSU	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	les	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	conditions	condition	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
11	testées	tester	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	ne	ne	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	soient	être	VRB	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
14	pas	pas	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	celles	celui	PRQ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	dans	dans	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
17	lesquelles	lequel	PRQ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	Fis	Fis	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
19	intervient	intervenir	VRB	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1541
# text = Il est par exemple connu que Fis active topA , mais cela n'a pour l'instant été détecté que dans des conditions de stress oxydatif .
1	Il	il	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	par	par exemple	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	exemple	par exemple	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	connu	connu	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	que	que	PRQ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	Fis	Fis	VRB	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	active	actif	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
9	topA	topA	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
11	mais	mai	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
12	cela	cela	PRQ	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
13	n'	ne	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
14	a	avoir	VRB	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
15	pour	pour	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	instant	instant	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	été	être	VPP	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
19	détecté	détecter	VPP	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
20	que	que	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	dans	dans	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	des	un	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	conditions	condition	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	stress	stress	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	oxydatif	oxydatif	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1542
# text = N'ayant testé qu'une seule condition , la croissance en milieu LB , il est possible que Fis régule ces promoteurs dans d'autres conditions .
1	N'	ne	ADV	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	ayant	avoir	VPR	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	testé	tester	VPP	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
4	qu'	que	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
6	seule	seul	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	condition	condition	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	croissance	croissance	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	en	en	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	milieu	milieu	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	LB	LB	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
15	il	il	CLS	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
16	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	possible	possible	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	que	que	CSU	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	Fis	Fis	VRB	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	régule	régule	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	ces	ce	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	dans	dans	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
24	d'	un	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
25	autres	autre	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	conditions	condition	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1543
# text = La seconde hypothèse serait que la régulation par Fis ait lieu sur les gènes transcrits de façon divergente à ompC et ompR , respectivement micF et greB. Les fusions transcriptionnelles de ces régions promotrices avec lacZ ont été réalisées .
1	La	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	seconde	second	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	hypothèse	hypothèse	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	serait	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	que	que	CSU	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	régulation	régulation	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
8	par	par	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	Fis	Fis	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	ait	avoir	VRB	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	lieu	lieu	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	sur	sur	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
13	les	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	gènes	gène	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	transcrits	transcrire	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	façon	façon	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	divergente	divergent	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	à	à	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	ompC	ompC	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	ompR	ompR	NOM	_	_	20	para	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
24	respectivement	respectivement	ADV	_	_	25	periph	_	_	_	_	_
25	micF	micF	VRB	_	_	4	para	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	39	mark	_	_	_	_	_
27	greB.	greB.	ADV	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	Les	Les	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	fusions	fusion	NOM	_	_	39	subj	_	_	_	_	_
30	transcriptionnelles	transcriptionnel	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	ces	ce	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	régions	région	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	promotrices	promoteur	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	avec	avec	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	lacZ	lacZ	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	ont	avoir	VRB	_	_	38	aux	_	_	_	_	_
38	été	être	VPP	_	_	39	aux	_	_	_	_	_
39	réalisées	réaliser	VPP	_	_	25	para	_	_	_	_	_
40	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1544
# text = La fusion contenant le promoteur de greB ne montre pas de régulation par Fis au cours de la croissance en milieu LB , et celle contenant le promoteur de micF est en cours d'étude .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fusion	fusion	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	contenant	contenir	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	promoteur	promoteur	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	greB	greB	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ne	ne	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	montre	montrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	pas	pas	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	régulation	régulation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	par	par	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	Fis	Fis	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	au	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
16	cours	cours	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	croissance	croissance	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	en	en	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	milieu	milieu	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	LB	LB	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
24	et	et	COO	_	_	31	mark	_	_	_	_	_
25	celle	celui	PRQ	_	_	31	subj	_	_	_	_	_
26	contenant	contenir	VPR	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	le	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	promoteur	promoteur	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	micF	micF	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	est	être	VRB	_	_	9	para	_	_	_	_	_
32	en	en	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	cours	cours	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	d'	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	étude	étude	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1545
# text = La troisième hypothèse serait que Fis régule ompC et ompR au niveau post-transcriptionnel .
1	La	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	troisième	troisième	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	hypothèse	hypothèse	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	serait	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	que	que	CSU	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	Fis	Fis	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	régule	réguler	VRB	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	ompC	ompC	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	ompR	ompR	ADV	_	_	8	para	_	_	_	_	_
11	au	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	niveau	niveau	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	post-transcriptionnel	post-transcriptionnel	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1546
# text = A notre connaissance , une telle fonction n'a jamais été montrée pour
1	A	à	PRE	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	notre	son	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	connaissance	connaissance	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
6	telle	tel	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	fonction	fonction	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
8	n'	ne	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
9	a	avoir	VRB	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
10	jamais	jamais	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
11	été	être	VPP	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	montrée	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	pour	pour	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1547
# text = Fis .
1	Fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1548
# text = Cependant , la protéine Fis présente de fortes homologies avec le domaine C-terminal de NtrC ( Morett et Bork , 1998 , et Résultats , Partie II , Discussion ) , un régulateur de réponse qui fait partie d'un système à deux composants impliqués dans la réponse cellulaire aux carences en azote ( Keener et Kustu , 1988 ) .
1	Cependant	cependant	ADV	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	protéine	protéine	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	Fis	Fis	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	présente	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	de	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
8	fortes	fort	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	homologies	homologie	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	avec	avec	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	le	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	domaine	domaine	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	C-terminal	C-terminal	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	NtrC	NtrC	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	(	(	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
17	Morett	Morett	NOM	_	_	15	parenth	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	Bork	Bork	NOM	_	_	17	para	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	1998	1998	NUM	_	_	19	para	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
23	et	et	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
24	Résultats	Résultats	NOM	_	_	21	para	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
26	Partie	Partie	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	II	II	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
29	Discussion	Discussion	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
30	)	)	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
32	un	un	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	régulateur	régulateur	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	réponse	réponse	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	qui	qui	PRQ	_	_	37	subj	_	_	_	_	_
37	fait	faire	VRB	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
38	partie	partie	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	d'	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	un	un	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	système	système	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	à	à	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	deux	deux	NUM	_	_	44	spe	_	_	_	_	_
44	composants	composant	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	impliqués	impliquer	VPP	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	dans	dans	PRE	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	la	le	DET	_	_	48	spe	_	_	_	_	_
48	réponse	réponse	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
49	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	aux	à	PRE	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
51	carences	carence	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	en	en	PRE	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	azote	azote	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	(	(	PUNC	_	_	55	punc	_	_	_	_	_
55	Keener	Keener	NOM	_	_	51	parenth	_	_	_	_	_
56	et	et	COO	_	_	57	mark	_	_	_	_	_
57	Kustu	Kustu	NOM	_	_	55	para	_	_	_	_	_
58	,	,	PUNC	_	_	59	punc	_	_	_	_	_
59	1988	1988	NUM	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
60	)	)	PUNC	_	_	55	punc	_	_	_	_	_
61	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1549
# text = La partie C-terminale de NtrC permet sa fixation à l'ADN et donc l'activation transcriptionnelle de certains gènes .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	partie	partie	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	C-terminale	C-terminale	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	NtrC	NtrC	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	permet	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	sa	son	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	fixation	fixation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	ADN	ADN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	et	et donc	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	donc	et donc	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	activation	activation	NOM	_	_	8	para	_	_	_	_	_
16	transcriptionnelle	transcriptionnel	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	certains	certain	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	gènes	gène	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1550
# text = Cependant , il a aussi été montré pour cette protéine un rôle d'activateur de la traduction de NifR 3 , dont le gène est situé en amont de ntrC au sein du même opéron ..
1	Cependant	cependant	ADV	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	il	il	CLS	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
4	a	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
5	aussi	aussi	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
6	été	être	VPP	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	montré	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	pour	pour	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	cette	ce	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	protéine	protéine	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	un	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	rôle	rôle	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	d'	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	activateur	activateur	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	traduction	traduction	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	NifR	NifR	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	3	3	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	dont	dont	PRQ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
23	le	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	gène	gène	NOM	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
25	est	être	VRB	_	_	26	aux	_	_	_	_	_
26	situé	situer	VPP	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
27	en	en amont de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	amont	en amont de	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	de	en amont de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	ntrC	ntrC	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	au	au sein de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
32	sein	au sein de	DET	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	du	au sein de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	même	même	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
35	opéron	opéron	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	..	...	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1551
# text = Des sites de fixation de NtrC ont été mis en évidence dans la région promotrice de nifR 3 , situés à la position - 81 et autour du + 1 de transcription , ce dernier site recouvrant également la boîte
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	sites	site	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	fixation	fixation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	NtrC	NtrC	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ont	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	été	être	VPP	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	mis	mettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	en	en	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	évidence	évidence	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	dans	dans	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	région	région	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	promotrice	promoteur	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	nifR	nifR	VNF	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	3	3	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
20	situés	situer	VPP	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
21	à	à	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	position	position	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	-	- 81	PUNC	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	81	81	NUM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	21	para	_	_	_	_	_
27	autour	autour de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
28	du	autour de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	+	+ 1	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	1	1	NUM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	transcription	transcription	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
34	ce	ce	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
35	dernier	dernier	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
36	site	site	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
37	recouvrant	recouvrir	VPR	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	également	également	ADV	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	la	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	boîte	boîte	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1552
# text = - 10 du promoteur .
1	-	-	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	10	10	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	promoteur	promoteur	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1553
# text = Les auteurs ont alors suggéré une activation de la traduction par NtrC , soit par une interaction avec l'ARN polymérase , qui ralentirait l'étape d'élongation de la transcription et favoriserait le recrutement des ribosomes et ainsi la traduction , soit par une interaction directe avec l'ARNm de nifR 3 qui favoriserait également la traduction .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	auteurs	auteur	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	ont	avoir	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
4	alors	alors	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	suggéré	suggérer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	activation	activation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	traduction	traduction	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
12	NtrC	NtrC	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
14	soit	soit	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	par	par	PRE	_	_	11	para	_	_	_	_	_
16	une	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	interaction	interaction	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	avec	avec	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
20	ARN	ARN	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	polymérase	polymérase	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
23	qui	qui	PRQ	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
24	ralentirait	ralentir	VRB	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	l'	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	étape	étape	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	d'	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	élongation	élongation	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	la	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	transcription	transcription	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	et	et	COO	_	_	33	mark	_	_	_	_	_
33	favoriserait	favoriser	VRB	_	_	24	para	_	_	_	_	_
34	le	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	recrutement	recrutement	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	des	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	ribosomes	ribosome	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	et	et	COO	_	_	41	mark	_	_	_	_	_
39	ainsi	ainsi	ADV	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	la	le	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	traduction	traduction	NOM	_	_	37	para	_	_	_	_	_
42	,	,	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
43	soit	soit	COO	_	_	44	mark	_	_	_	_	_
44	par	par	PRE	_	_	36	para	_	_	_	_	_
45	une	un	DET	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
46	interaction	interaction	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	directe	direct	ADJ	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	avec	avec	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
49	l'	le	DET	_	_	50	spe	_	_	_	_	_
50	ARNm	ARNm	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
51	de	de	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	nifR	nifR	VNF	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	3	3	NUM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	qui	qui	PRQ	_	_	55	subj	_	_	_	_	_
55	favoriserait	favoriser	VRB	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
56	également	également	ADV	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
57	la	le	DET	_	_	58	spe	_	_	_	_	_
58	traduction	traduction	NOM	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
59	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1554
# text = Cette situation correspond à celle observée pour les régions promotrices de ompR et ompC , où les sites de fixation de Fis recouvrent le + 1 de transcription de ompR ainsi que la boîte - 10 ( site
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	situation	situation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	correspond	correspondre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	à	à	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	celle	celui	PRQ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	observée	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	pour	pour	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	régions	région	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	promotrices	promoteur	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	ompR	ompR	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	ompC	ompC	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
16	où	où	PRQ	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
17	les	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	sites	site	NOM	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	fixation	fixation	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	Fis	Fis	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	recouvrent	recouvrir	VRB	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
24	le	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	+	+ 1	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	1	1	NUM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	transcription	transcription	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	ompR	ompR	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	ainsi	ainsi que	COO	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
32	que	ainsi que	COO	_	_	34	mark	_	_	_	_	_
33	la	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	boîte	boîte	NOM	_	_	25	para	_	_	_	_	_
35	-	- 10	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
36	10	10	NUM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	(	(	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
38	site	site	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1555
# text = IV ) .
1	IV	iv	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1556
# text = Trois autres sites se situent également entre le + 1 et l'ATG qui pourraient jouer sur la traduction de ompR ( Figure 40A ) .
1	Trois	trois	NUM	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	autres	autre	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	sites	site	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
4	se	se	CLI	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	situent	situer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	également	également	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	entre	entre	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	+	+ 1	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	1	1	NUM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	ATG	ATG	NOM	_	_	9	para	_	_	_	_	_
14	qui	qui	PRQ	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
15	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
16	jouer	jouer	VNF	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	sur	sur	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	traduction	traduction	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	ompR	ompR	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	(	(	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
23	Figure	Figure	NOM	_	_	19	parenth	_	_	_	_	_
24	40A	40A	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	)	)	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1557
# text = De même pour ompC , les sites de fixation de Fis ( Figure 40B ) recouvrent une partie de la région 5 'non traduite , ainsi que la boîte - 35 du promoteur . Un rôle de Fis dans le contrôle de la traduction des deux protéines pourrait donc être imaginé .
1	De	de même	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	même	de même	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	pour	pour	PRE	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
4	ompC	ompC	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	sites	site	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	fixation	fixation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	Fis	Fis	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Figure	Figure	NOM	_	_	11	parenth	_	_	_	_	_
14	40B	40B	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	)	)	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
16	recouvrent	recouvrir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	une	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	partie	partie	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	région	région	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	5	5	NUM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	'	'	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
24	non	non	ADV	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	traduite	traduire	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
27	ainsi	ainsi que	COO	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	que	ainsi que	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	boîte	boîte	NOM	_	_	18	para	_	_	_	_	_
31	-	-	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
32	35	35	NUM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	du	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	promoteur	promoteur	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
36	Un	Un	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	rôle	rôle	NOM	_	_	49	subj	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	Fis	Fis	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	dans	dans	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
41	le	le	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	contrôle	contrôle	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	de	de	PRE	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	la	le	DET	_	_	45	spe	_	_	_	_	_
45	traduction	traduction	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	des	de	PRE	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	deux	deux	NUM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
48	protéines	protéine	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
49	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
50	donc	donc	ADV	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	être	être	VNF	_	_	52	aux	_	_	_	_	_
52	imaginé	imaginer	VPP	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
53	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1558
# text = De plus , des interactions entre Fis et l'ARN polymérase ont été mises en évidence .
1	De	de plus	PRE	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	interactions	interaction	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
6	entre	entre	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	Fis	Fis	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
10	ARN	ARN	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	polymérase	polymérase	NOM	_	_	7	para	_	_	_	_	_
12	ont	avoir	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	été	être	VPP	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	mises	mettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	en	en	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	évidence	évidence	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1559
# text = Cette hypothèse est actuellement testée au laboratoire .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	hypothèse	hypothèse	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
4	actuellement	actuellement	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	testée	tester	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	au	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	laboratoire	laboratoire	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1560
# text = Discussion Générale
1	Discussion	discussion	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Générale	Générale	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1561
# text = Les résultats obtenus au cours de ce travail nous ont permis de révéler l'importance du rôle joué par la superhélicité de l'ADN dans les processus évolutifs .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	résultats	résultat	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
3	obtenus	obtenir	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	au	au cours de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	cours	au cours de	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	au cours de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ce	ce	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	travail	travail	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	nous	le	CLI	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
10	ont	avoir	VRB	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	permis	permettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	révéler	révéler	VNF	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	importance	importance	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	du	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	rôle	rôle	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	joué	jouer	VPP	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	par	par	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	l'	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	ADN	ADN	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	dans	dans	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
26	les	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	processus	processus	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	évolutifs	évolutif	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1562
# text = En effet , des changements parallèles et reproductibles de superhélicité ont été mesurés à trois niveaux .
1	En	en effet	PRE	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	changements	changement	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
6	parallèles	parallèle	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	reproductibles	reproductible	ADJ	_	_	6	para	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	ont	avoir	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	été	être	VPP	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	mesurés	mesurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	trois	trois	NUM	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	niveaux	niveau	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1563
# text = Premièrement , nos résultats démontrent une association forte entre l'augmentation de superhélicité négative de l'ADN et celle du fitness .
1	Premièrement	premièrement	ADV	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	nos	son	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	résultats	résultat	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	démontrent	démontrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	association	association	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	forte	fort	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	entre	entre	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	augmentation	augmentation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	négative	négatif	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	ADN	ADN	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	celle	celui	PRQ	_	_	11	para	_	_	_	_	_
20	du	de+le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	fitness	fine	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1564
# text = Un parallélisme phénotypique important a été mis en évidence avec une augmentation de superhélicité de l'ADN dans la majorité des populations .
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	phénotypique	phénotypique	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	important	important	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	a	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	été	être	VPP	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	mis	mettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	en	en	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	évidence	évidence	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	avec	avec	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	augmentation	augmentation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	ADN	ADN	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	dans	dans	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	majorité	majorité	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	des	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	populations	population	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1565
# text = De plus , cette augmentation est souvent détectée pendant les 2000 premières générations , période de forte augmentation du fitness ( Lenski et Travisano , 1994 ) .
1	De	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
2	plus	plus	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	cette	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	augmentation	augmentation	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	souvent	souvent	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	détectée	détecter	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	pendant	pendant	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
11	2000	2000	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	premières	premier	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	générations	génération	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
15	période	période	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	forte	fort	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	augmentation	augmentation	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	du	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
20	fitness	fine	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	(	(	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	Lenski	Lenski	NOM	_	_	20	parenth	_	_	_	_	_
23	et	et	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
24	Travisano	Travisano	NOM	_	_	22	para	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	1994	1994	NUM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	)	)	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1566
# text = Deuxièmement , ce parallélisme phénotypique s'explique par un parallélisme génétique exceptionnel :
1	Deuxièmement	deuxièmement	NUM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	ce	ce	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
5	phénotypique	phénotypique	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	s'	s'	CLI	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	explique	expliquer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	par	par	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	un	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	génétique	génétique	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	exceptionnel	exceptionnel	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	:	:	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1567
# text = tous les gènes impliqués dans la régulation de la superhélicité de l'ADN ne sont pas la cible de la sélection naturelle , seuls trois d'entre eux le sont  :
1	tous	tout	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	gènes	gène	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
4	impliqués	impliquer	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	régulation	régulation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	ADN	ADN	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	ne	ne	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	pas	pas	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	cible	cible	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	sélection	sélection	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	naturelle	naturel	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
24	seuls	seul	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	trois	trois	NUM	_	_	30	subj	_	_	_	_	_
26	d'	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	entre	entre	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	eux	lui	PRQ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	le	le	CLI	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	sont	être	VRB	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
31	 :	:	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1568
# text = topA , fis et dusB. Bien que le mécanisme par lequel l'augmentation de superhélicité confère un avantage sélectif à ces cellules soit encore inconnu , il est probablement lié à une ou plusieurs fonctions associées aux protéines
1	topA	toper	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
3	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	dusB.	dusB.	VNF	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	Bien	Bien	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	que	que	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	par	par	PRE	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
11	lequel	lequel	PRQ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	augmentation	augmentation	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	confère	conférer	VRB	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
17	un	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	avantage	avantage	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	sélectif	sélectif	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	à	à	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	ces	ce	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	cellules	cellule	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	soit	soit	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
24	encore	encore	ADV	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	inconnu	inconnu	NOM	_	_	22	para	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
27	il	il	CLS	_	_	30	subj	_	_	_	_	_
28	est	être	VRB	_	_	30	aux	_	_	_	_	_
29	probablement	probablement	ADV	_	_	30	periph	_	_	_	_	_
30	lié	lier	VPP	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
31	à	à	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	une	un	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
33	ou	ou	COO	_	_	35	mark	_	_	_	_	_
34	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
35	fonctions	fonction	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
36	associées	associer	VPP	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	aux	à	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	protéines	protéine	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1569
# text = Fis , DusB et à la TopoI .
1	Fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	DusB	DusB	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	à	à	PRE	_	_	3	para	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	TopoI	TopoI	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1570
# text = Troisièmement , une forte divergence allélique est observée pour un même gène dans les différentes populations .
1	Troisièmement	troisièmement	NUM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	une	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
4	forte	fort	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	divergence	divergence	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
6	allélique	allélique	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	observée	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	pour	pour	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	un	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
11	même	même	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	gène	gène	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
15	différentes	différent	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	populations	population	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1571
# text = Quatre allèles évolués différents du gène fis , isolés dans quatre populations indépendantes affectent tous les niveaux de régulation du gène :
1	Quatre	quatre	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	allèles	allèle	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	évolués	évolué	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	différents	différent	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	gène	gène	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
9	isolés	isolé	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	quatre	quatre	NUM	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	populations	population	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	indépendantes	indépendant	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	affectent	affecter	VRB	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
15	tous	tout	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
16	les	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	niveaux	niveau	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	régulation	régulation	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	du	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	gène	gène	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	:	:	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1572
# text = transcriptionnel , traductionnel et l'activité de liaison à l'ADN de la protéine .
1	transcriptionnel	transcription	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
3	traductionnel	traduction	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	activité	activité	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	liaison	liaison	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	ADN	ADN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	protéine	protéine	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1573
# text = Malgré cette divergence au niveau mutationnel , les différents allèles conduisent à des conséquences similaires :
1	Malgré	malgré	PRE	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	cette	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	divergence	divergence	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	au	à	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	niveau	niveau	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	mutationnel	mutation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
9	différents	différent	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	allèles	allèle	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
11	conduisent	conduire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	à	à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	des	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	conséquences	conséquence	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	similaires	similaire	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	:	:	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1574
# text = une diminution soit de la quantité , soit de l'activité de la protéine de type histone Fis .
1	une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	diminution	diminution	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
3	soit	soit	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	quantité	quantité	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
8	soit	soit	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	4	para	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	activité	activité	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	protéine	protéine	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	type	type	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	histone	histone	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	Fis	Fis	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1575
# text = Au cours de l'analyse de cette évolution expérimentale et des allèles évolués du gène fis , nous avons également pu mettre en évidence une nouvelle fonction de Fis :
1	Au	à	PRE	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
2	cours	cours	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	de+le	PRE	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
4	l'	de+le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	analyse	analyse	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	cette	ce	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	évolution	évolution	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
11	des	de	PRE	_	_	6	para	_	_	_	_	_
12	allèles	allèle	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	évolués	évolué	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	du	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	gène	gène	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
18	nous	nous	CLS	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
19	avons	avoir	VRB	_	_	21	aux	_	_	_	_	_
20	également	également	ADV	_	_	21	periph	_	_	_	_	_
21	pu	pouvoir	VPP	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
22	mettre	mettre	VNF	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	en	en	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	évidence	évidence	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	une	un	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
26	nouvelle	nouveau	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
27	fonction	fonction	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	Fis	Fis	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	:	:	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1576
# text = la régulation de l'expression des porines au niveau transcriptionnel chez E.   coli B , et peut-être au niveau traductionnel chez E.   coli K12 .
1	la	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	régulation	régulation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	expression	expression	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	des	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	porines	purine	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	au	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	niveau	niveau	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	transcriptionnel	transcription	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	chez	chez	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	E.	E.	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	 	 	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	coli	colis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	B	B	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
18	peut-être	peut-être	ADV	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	au	à	PRE	_	_	14	para	_	_	_	_	_
20	niveau	niveau	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	traductionnel	traduction	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	chez	chez	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	E.	E.	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	 	 	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	coli	colis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	K12	K12	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1577
# text = De façon plus générale , ces travaux ont permis de montrer l'originalité et l'intérêt de ces stratégies d'évolution expérimentale .
1	De	de	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	façon	façon	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	plus	plus	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	générale	général	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	ces	ce	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	travaux	travail	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
8	ont	avoir	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	permis	permettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	montrer	montrer	VNF	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	originalité	originalité	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	intérêt	intérêt	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	ces	ce	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	stratégies	stratégie	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	d'	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	évolution	évolution	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1578
# text = Les mutations isolées ont la particularité d'avoir été sélectionnées au cours de l'évolution bactérienne pour l'effet bénéfique qu'elles confèrent .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutations	mutation	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	isolées	isolé	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ont	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	particularité	particularité	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	avoir	avoir	VNF	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	été	être	VPP	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	sélectionnées	sélectionner	VPP	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	au	au cours de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	cours	au cours de	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	au cours de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	évolution	évolution	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	bactérienne	bactérien	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	pour	pour	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	effet	effet	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	bénéfique	bénéfique	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	qu'	que	PRQ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
22	elles	elles	CLS	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
23	confèrent	conférer	VRB	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1579
# text = Ceci est donc totalement différent des approches génétiques classiques où une délétion ou une modification de gènes est réalisée pour analyser leur fonction dans des environnements donnés ou en réponse à certains stress .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	donc	donc	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	totalement	totalement	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	différent	différent	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	des	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	approches	approche	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	génétiques	génétique	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	classiques	classique	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	où	où	PRQ	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	délétion	délétion	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
13	ou	ou	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
14	une	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	modification	modification	NOM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	gènes	gène	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	est	être	VRB	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
19	réalisée	réaliser	VPP	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
20	pour	pour	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	analyser	analyser	VNF	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	leur	son	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	fonction	fonction	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	dans	dans	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
25	des	un	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	environnements	environnement	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	donnés	donner	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	ou	ou	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
29	en	en	PRE	_	_	24	para	_	_	_	_	_
30	réponse	réponse	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	à	à	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	certains	certain	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	stress	stress	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1580
# text = En particulier , des fonctions nouvelles peuvent être mises en évidence , par exemple ici l'implication de Fis dans le contrôle de la composition protéique de la membrane externe ou l'implication de dusB dans les processus évolutifs , avec une connexion probable avec Fis .
1	En	en	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	particulier	particulier	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	fonctions	fonction	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
6	nouvelles	nouveau	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	être	être	VNF	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	mises	mettre	VPP	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	en	en	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	évidence	évidence	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_
13	par	par exemple	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	exemple	par exemple	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	ici	ici	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	implication	implication	NOM	_	_	46	subj	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	Fis	Fis	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	dans	dans	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	le	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	contrôle	contrôle	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	composition	composition	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	protéique	protéique	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	membrane	membrane	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	externe	externe	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	ou	ou	COO	_	_	33	mark	_	_	_	_	_
32	l'	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	implication	implication	NOM	_	_	25	para	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	dusB	dusB	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	dans	dans	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
37	les	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	processus	processus	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	évolutifs	évolutif	ADJ	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
41	avec	avec	ADV	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
42	une	un	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	connexion	connexion	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
44	probable	probable	ADJ	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	avec	avec	ADV	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	Fis	Fis	VRB	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
47	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1581
# text = Une analyse plus détaillée de ces mutations est nécessaire pour caractériser ces fonctions .
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	analyse	analyse	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	plus	plus	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	détaillée	détaillé	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ces	ce	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	mutations	mutation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	nécessaire	nécessaire	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	pour	pour	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	caractériser	caractériser	VNF	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	ces	ce	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	fonctions	fonction	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1582
# text = D'autre part , les résultats obtenus dans ce travail , ainsi que précédemment , ont permis de montrer que les stratégies d'évolution expérimentale pouvaient constituer un excellent outil de prédiction .
1	D'	d'autre part	ADV	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
2	autre	d'autre part	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	part	d'autre part	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	résultats	résultat	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
7	obtenus	obtenir	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	dans	dans	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	ce	ce	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	travail	travail	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
12	ainsi	ainsi	ADV	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
13	que	que?	PRQ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
14	précédemment	précédemment	ADV	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
16	ont	avoir	VRB	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
17	permis	permettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	montrer	montrer	VNF	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	que	que	CSU	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	les	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	stratégies	stratégie	NOM	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
23	d'	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	évolution	évolution	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	pouvaient	pouvoir	VRB	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
27	constituer	constituer	VNF	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	un	un	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
29	excellent	excellent	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	outil	outil	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	prédiction	prédiction	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1583
# text = Ceci n'est évidemment possible que par la présence de plusieurs populations indépendantes .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	n'	ne	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	évidemment	évidemment	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	possible	possible	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	que	que	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	par	par	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	présence	présence	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	populations	population	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	indépendantes	indépendant	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1584
# text = Sur la base des séquences de gènes , il est possible de prédire par des tests statistiques lesquels peuvent être des cibles de la sélection naturelle .
1	Sur	sur	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	la	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	base	base	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	des	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	séquences	séquence	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	gènes	gène	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
9	il	il	CLS	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
10	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	possible	possible	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	prédire	prédire	VNF	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	par	par	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	des	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	tests	test	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	statistiques	statistique	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	lesquels	lequel	PRQ	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
19	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	être	être	VNF	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	des	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	cibles	cible	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	sélection	sélection	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	naturelle	naturel	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1585
# text = Nous avons d'ailleurs utilisé cet outil de prédiction afin d'analyser des mutations isolées dans le gène dusB dont la fonction n'est pas connue précisément .
1	Nous	nous	CLS	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
2	avons	avoir	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
3	d'	d'ailleurs	PRE	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	ailleurs	d'ailleurs	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	utilisé	utiliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	cet	ce	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	outil	outil	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	prédiction	prédiction	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	afin	afin de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	d'	afin de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	analyser	analyser	VNF	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	des	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	mutations	mutation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	isolées	isolé	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	dans	dans	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
17	le	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	gène	gène	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	dusB	dusB	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	dont	dont	PRQ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	fonction	fonction	NOM	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
23	n'	ne	ADV	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
24	est	être	VRB	_	_	26	aux	_	_	_	_	_
25	pas	pas	ADV	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	connue	connaître	VPP	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
27	précisément	précisément	ADV	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1586
# text = Nous pouvons prédire que ces mutations sont bénéfiques , et que ce gène est un bon candidat pour intervenir dans la superhélicité de l'ADN , ces prédictions étant actuellement testées expérimentalement .
1	Nous	nous	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	pouvons	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	prédire	prédire	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	que	que	CSU	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ces	ce	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	mutations	mutation	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	sont	être	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
11	que	que	CSU	_	_	4	para	_	_	_	_	_
12	ce	ce	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	gène	gène	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
14	est	être	VRB	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	un	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
16	bon	bon	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	candidat	candidat	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	pour	pour	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
19	intervenir	intervenir	VNF	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	dans	dans	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	l'	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	ADN	ADN	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
27	ces	ce	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	prédictions	prédiction	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
29	étant	être	VPR	_	_	31	aux	_	_	_	_	_
30	actuellement	actuellement	ADV	_	_	31	periph	_	_	_	_	_
31	testées	tester	VPP	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
32	expérimentalement	expérimentalement	ADV	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1587
# text = L'adaptation des bactéries au cours de cette stratégie d'évolution expérimentale se caractérise par deux processus fondamentaux , que nous allons maintenant discuter :
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	adaptation	adaptation	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	bactéries	bactérie	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	au	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	cours	cours	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	cette	ce	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	stratégie	stratégie	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	d'	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	évolution	évolution	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	se	se	CLI	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	caractérise	caractériser	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	par	par	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	deux	deux	NUM	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	processus	processus	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	fondamentaux	fondamental	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
20	que	que	PRQ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
21	nous	nous	CLS	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
22	allons	aller	VRB	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
23	maintenant	maintenant	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	discuter	discuter	VNF	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	:	:	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1588
# text = le parallélisme évolutif et l'implication de la superhélicité de l'ADN et , de façon plus générale , des réseaux de régulation globale .
1	le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	évolutif	évolutif	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	implication	implication	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	ADN	ADN	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
16	façon	façon	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	plus	plus	ADV	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	générale	général	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	des	de	PRE	_	_	10	para	_	_	_	_	_
21	réseaux	réseau	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	régulation	régulation	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	globale	global	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1589
# text = De plus , ces travaux peuvent également soulever deux questions importantes , que nous discuterons également :
1	De	de plus	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	ces	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	travaux	travail	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	également	également	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	soulever	soulever	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	deux	deux	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	questions	question	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	importantes	important	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
13	que	que	PRQ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
14	nous	nous	CLS	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
15	discuterons	discuter	VRB	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
16	également	également	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	:	:	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1590
# text = par quels mécanismes une augmentation de superhélicité de l'ADN peut -elle être bénéfique  ?
1	par	par	PRE	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	quels	quel	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	mécanismes	mécanisme	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	une	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	augmentation	augmentation	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	ADN	ADN	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	peut	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	-elle	-elle	CLS	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
13	être	être	VNF	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	bénéfique	bénéfique	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	 ?	?	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1591
# text = Qu'en est -il de la généralisation de ces phénomènes dans d'autres conditions ?
1	Qu'	que	CSU	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	en	le	CLI	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	-il	-il	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	généralisation	généralisation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	ces	ce	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	phénomènes	phénomène	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	dans	dans	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	d'	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
13	autres	autre	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	conditions	condition	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	?	?	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1592
# text = Parallélisme de l'évolution
1	Parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	évolution	évolution	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1593
# text = Le parallélisme évolutif au cours de notre stratégie d'évolution expérimentale n'est pas observé uniquement au niveau du degré de superhélicité de l'ADN .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
3	évolutif	évolutif	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	au	à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	cours	cours	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	notre	son	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	stratégie	stratégie	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	évolution	évolution	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	n'	ne	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
13	est	être	VRB	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
14	pas	pas	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	observé	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	uniquement	uniquement	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	au	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	niveau	niveau	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	du	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	degré	degré	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	l'	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	ADN	ADN	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1594
# text = Au niveau phénotypique tout d'abord , le fitness ainsi que le volume cellulaire augmentent de façon similaire au sein des
1	Au	à	PRE	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
2	niveau	niveau	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	phénotypique	phénotypique	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	tout	tout d'abord	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	d'	tout d'abord	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	abord	tout d'abord	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	fitness	fine	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
10	ainsi	ainsi que	COO	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	que	ainsi que	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
12	le	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	volume	volume	NOM	_	_	9	para	_	_	_	_	_
14	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	augmentent	augmenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	façon	façon	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	similaire	similaire	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	au	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
20	sein	sein	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	des	de+le	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1595
# text = 12 populations ( Lenski et Travisano , 1994 ; Lenski , 2004 ) .
1	12	12	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	populations	population	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	Lenski	Lenski	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	Travisano	Travisano	NOM	_	_	4	para	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
8	1994	1994	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	;	;	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Lenski	Lenski	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	2004	2004	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	)	)	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1596
# text = D'autre part , des diminutions , voire des pertes de fonctions cataboliques caractérisent les différentes populations .
1	D'	d'autre part	ADV	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
2	autre	d'autre part	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	part	d'autre part	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	des	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	diminutions	diminution	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
8	voire	voire	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
9	des	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	pertes	perte	NOM	_	_	6	para	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	fonctions	fonction	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	cataboliques	catabolique	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	caractérisent	caractériser	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	les	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
16	différentes	différent	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	populations	population	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1597
# text = Les profils globaux de transcription et d'expression des protéines ( Pelosi et al. , 2006 ) révèlent également des changements parallèles de l'expression des gènes .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	profils	profil	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
3	globaux	global	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	transcription	transcription	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	7	mark	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	4	para	_	_	_	_	_
8	expression	expression	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	des	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	protéines	protéine	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	(	(	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	Pelosi	Pelosi	NOM	_	_	10	parenth	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
14	al.	al.	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	2006	2006	NUM	_	_	12	para	_	_	_	_	_
17	)	)	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
18	révèlent	révéler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	également	également	ADV	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	des	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	changements	changement	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	parallèles	parallèle	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	l'	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	expression	expression	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	des	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	gènes	gène	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1598
# text = D'autre part , à chaque fois que cela a été analysé , les changements phénotypiques parallèles sont associés à un parallélisme génétique , les mutations responsables des modifications étant situées dans les mêmes gènes dans la majorité des 12 populations .
1	D'	d'autre part	ADV	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
2	autre	d'autre part	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	part	d'autre part	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	à	à chaque fois que	CSU	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
6	chaque	à chaque fois que	CSU	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
7	fois	à chaque fois que	CSU	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	que	à chaque fois que	CSU	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
9	cela	cela	PRQ	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
10	a	avoir	VRB	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	été	être	VPP	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	analysé	analyser	VPP	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	changements	changement	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
16	phénotypiques	phénotypique	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	parallèles	parallèle	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	sont	être	VRB	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
19	associés	associer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	à	à	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	un	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	génétique	génétique	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
25	les	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	mutations	mutation	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
27	responsables	responsable	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	des	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	modifications	modification	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	étant	être	VPR	_	_	31	aux	_	_	_	_	_
31	situées	situer	VPP	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	dans	dans	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	les	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
34	mêmes	même	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
35	gènes	gène	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
36	dans	dans	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
37	la	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	majorité	majorité	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	des	de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	12	12	NUM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
41	populations	population	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1599
# text = Ainsi , des mutations dans l'opéron rbs ( dans 12 populations ) , et les gènes malT ( 8 populations ) et spoT ( 8 populations ) sont à l'origine de réductions parallèles des capacités cataboliques et de changements parallèles d'expression des gènes .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	29	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	des	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	mutations	mutation	NOM	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
5	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	opéron	opéron	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	rbs	ris	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	(	(	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	4	parenth	_	_	_	_	_
11	12	12	NUM	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	populations	population	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	)	)	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
16	les	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	gènes	gène	NOM	_	_	4	para	_	_	_	_	_
18	malT	malT	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	(	(	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
20	8	8	NUM	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	populations	population	NOM	_	_	17	parenth	_	_	_	_	_
22	)	)	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
23	et	et	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
24	spoT	spot	NOM	_	_	17	para	_	_	_	_	_
25	(	(	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
26	8	8	NUM	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	populations	population	NOM	_	_	24	parenth	_	_	_	_	_
28	)	)	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
29	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
30	à	à	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	l'	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	origine	origine	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	réductions	réduction	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	parallèles	parallèle	ADJ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	des	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	capacités	capacité	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	cataboliques	catabolique	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	et	et	COO	_	_	40	mark	_	_	_	_	_
40	de	de	PRE	_	_	36	para	_	_	_	_	_
41	changements	changement	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	parallèles	parallèle	ADJ	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	d'	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	expression	expression	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	des	de	PRE	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	gènes	gène	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	.	.	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1600
# text = Comme dans le cas du gène fis , le parallélisme génétique s'accompagne d'une grande divergence allélique et il est fort probable qu'elle conduise également à un fort parallélisme moléculaire .
1	Comme	comme	CSU	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	dans	dans	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	le	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	cas	cas	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	du	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	gène	gène	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	fis	faire	VRB	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
9	le	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
11	génétique	génétique	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	s'	s'	CLI	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	accompagne	accompagner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	d'	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	une	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
16	grande	grand	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	divergence	divergence	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	allélique	allélique	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
20	il	il	CLS	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
21	est	être	VRB	_	_	13	para	_	_	_	_	_
22	fort	fort	ADV	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	probable	probable	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	qu'	que	CSU	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	elle	elle	CLS	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
26	conduise	conduire	VRB	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	également	également	ADV	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	à	à	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	un	un	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
30	fort	fort	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
32	moléculaire	moléculaire	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1601
# text = Un fort degré de parallélisme a également été observé lors d'autres expériences d'évolution , y compris dans des conditions différentes ou en utilisant des organismes différents .
1	Un	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	fort	fort	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	degré	degré	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	a	avoir	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
7	également	également	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
8	été	être	VPP	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	observé	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	lors	lors de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	d'	lors de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	autres	autre	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	expériences	expérience	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	d'	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	évolution	évolution	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
17	y	y compris	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	compris	y compris	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
19	dans	dans	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	des	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	conditions	condition	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	différentes	différent	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	ou	ou	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
24	en	en	PRE	_	_	22	para	_	_	_	_	_
25	utilisant	utiliser	VPR	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	des	un	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	organismes	organisme	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	différents	différent	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1602
# text = En effet , des mutations sont sélectionnées de façon répétée au sein des mêmes gènes , et certains gènes sont même des cibles fréquentes de la sélection naturelle dans différentes stratégies d'évolution expérimentale .
1	En	en	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	effet	effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	mutations	mutation	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
6	sont	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	sélectionnées	sélectionner	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	façon	façon	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	répétée	répéter	VPP	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	au	au sein de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	sein	au sein de	DET	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	des	au sein de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	mêmes	même	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	gènes	gène	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
18	certains	certain	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	gènes	gène	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
20	sont	être	VRB	_	_	7	para	_	_	_	_	_
21	même	même	ADV	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	des	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	cibles	cible	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	fréquentes	fréquent	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	la	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	sélection	sélection	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	naturelle	naturel	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	dans	dans	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	différentes	différent	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	stratégies	stratégie	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	d'	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	évolution	évolution	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1603
# text = D'autres expériences d'évolution ont employé E. coli comme organisme modèle , en propageant ces bactéries soit dans des conditions de carences prolongées , soit dans des conditions de cultures continues en chémostat où la nourriture est apportée continuellement .
1	D'	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	autres	autre	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	expériences	expérience	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	évolution	évolution	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ont	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	employé	employer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	E.	E.	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	coli	coli	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	comme	comme	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	organisme	organisme	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	modèle	modèle	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	en	en	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
15	propageant	propager	VPR	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	ces	ce	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	bactéries	bactérie	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	soit	soit	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	dans	dans	PRE	_	_	14	para	_	_	_	_	_
20	des	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	conditions	condition	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	carences	carence	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	prolongées	prolonger	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
26	soit	soit	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
27	dans	dans	PRE	_	_	22	para	_	_	_	_	_
28	des	un	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	conditions	condition	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	cultures	culture	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	continues	continu	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	en	en	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	chémostat	rhéostat	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	où	où	PRQ	_	_	39	periph	_	_	_	_	_
36	la	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	nourriture	nourriture	NOM	_	_	39	subj	_	_	_	_	_
38	est	être	VRB	_	_	39	aux	_	_	_	_	_
39	apportée	apporter	VPP	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
40	continuellement	continuellement	ADV	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1604
# text = Dans la première expérience , des modifications parallèles des mêmes phénotypes permettent l'adaptation aux carences .
1	Dans	dans	PRE	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	première	premier	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	expérience	expérience	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	des	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	modifications	modification	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
8	parallèles	parallèle	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	des	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	mêmes	même	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	phénotypes	phénotype	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	permettent	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	adaptation	adaptation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	aux	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	carences	carence	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1605
# text = En l'occurrence , les bactéries accroissent leurs capacités à utiliser des acides aminés comme source de carbone
1	En	en	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	l'	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	occurrence	occurrence	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	bactéries	bactérie	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	accroissent	accroître	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	leurs	son	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	capacités	capacité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	utiliser	utiliser	VNF	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	des	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	acides	acide	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	aminés	aminé	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	comme	comme	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
16	source	source	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	carbone	carbone	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1606
# text = ( Zinser et Kolter , 1999 ) .
1	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	Zinser	Zinser	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	4	mark	_	_	_	_	_
4	Kolter	Kolter	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	1999	1999	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1607
# text = Des mutations se produisant en parallèle dans les mêmes gènes ( impliqués dans le catabolisme des acides aminés , dans rpoS codant le facteur & 207;& 131;S de la phase stationnaire ou dans lrp codant un régulateur de type histone ) sont responsables de ces changements phénotypiques .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mutations	mutation	NOM	_	_	40	subj	_	_	_	_	_
3	se	se	CLI	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	produisant	produire	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	en	en	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	parallèle	parallèle	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
9	mêmes	même	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	gènes	gène	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	(	(	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	impliqués	impliquer	VPP	_	_	10	parenth	_	_	_	_	_
13	dans	dans	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	le	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	catabolisme	catabolisme	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	acides	acide	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	aminés	aminé	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
20	dans	dans	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
21	rpoS	rpoS	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	codant	coder	VPR	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	le	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	facteur	facteur	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	σS	σS	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	la	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	phase	phase	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	ou	ou	COO	_	_	31	mark	_	_	_	_	_
31	dans	dans	PRE	_	_	26	para	_	_	_	_	_
32	lrp	laps	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	codant	coder	VPR	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	un	un	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	régulateur	régulateur	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	de	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	type	type	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	histone	histone	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	)	)	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
40	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
41	responsables	responsable	ADJ	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	de	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	ces	ce	DET	_	_	44	spe	_	_	_	_	_
44	changements	changement	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	phénotypiques	phénotypique	ADJ	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	.	.	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1608
# text = Dans des conditions de cultures continues en chémostat , des modifications parallèles au niveau du transport du glucose à travers la membrane ont été détectées dans des populations indépendantes d'E. coli ( Ferenci , 2001 ) .
1	Dans	dans	PRE	_	_	25	periph	_	_	_	_	_
2	des	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	conditions	condition	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	cultures	culture	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	continues	continu	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	chémostat	rhéostat	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
10	des	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	modifications	modification	NOM	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
12	parallèles	parallèle	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	au	à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	niveau	niveau	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	du	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	transport	transport	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	du	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	glucose	glucose	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	à	à travers	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	travers	à travers	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	membrane	membrane	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	ont	avoir	VRB	_	_	24	aux	_	_	_	_	_
24	été	être	VPP	_	_	25	aux	_	_	_	_	_
25	détectées	détecter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	dans	dans	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	des	un	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	populations	population	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	indépendantes	indépendant	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	d'	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	E.	E.	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
32	coli	coli	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	(	(	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
34	Ferenci	Ferenci	NOM	_	_	32	parenth	_	_	_	_	_
35	,	,	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
36	2001	2001	NUM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	)	)	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
38	.	.	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1609
# text = A nouveau , un fort parallélisme génétique en est responsable , avec notamment des mutations dans rpoS et malT .
1	A	à nouveau	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	nouveau	à nouveau	ADV	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	un	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	fort	fort	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
7	génétique	génétique	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	en	le	CLI	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	responsable	responsable	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	avec	avec	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	notamment	notamment	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
14	des	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	mutations	mutation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	dans	dans	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	rpoS	rpoS	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	malT	malt	NOM	_	_	17	para	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1610
# text = De plus , l'étude de l'évolution de souches pathogènes d'E. coli montre que les lignées anciennes ont acquis les mêmes facteurs de virulence de façon indépendante et parallèle , incluant un îlot de pathogénicité ainsi que des gènes de toxines .
1	De	de plus	PRE	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	étude	étude	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	évolution	évolution	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	souches	souche	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	pathogènes	pathogène	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
13	E.	E.	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	coli	coli	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	montre	montrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	que	que	CSU	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	les	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	lignées	lignée	NOM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
19	anciennes	ancien	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	ont	avoir	VRB	_	_	21	aux	_	_	_	_	_
21	acquis	acquérir	VPP	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
22	les	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
23	mêmes	même	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	facteurs	facteur	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	virulence	virulence	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	façon	façon	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	indépendante	indépendant	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	et	et	COO	_	_	31	mark	_	_	_	_	_
31	parallèle	parallèle	ADJ	_	_	29	para	_	_	_	_	_
32	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
33	incluant	inclure	VPR	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
34	un	un	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	îlot	îlot	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	de	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	pathogénicité	pathogénicité	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	ainsi	ainsi que	COO	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
39	que	ainsi que	COO	_	_	41	mark	_	_	_	_	_
40	des	un	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	gènes	gène	NOM	_	_	35	para	_	_	_	_	_
42	de	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	toxines	toxine	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1611
# text = D'autres expériences d'évolution ont utilisé d'autres organismes qu'E. coli , et le parallélisme phénotypique et génétique de l'évolution a été retrouvé à tous les niveaux de complexité des organismes :
1	D'	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	autres	autre	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	expériences	expérience	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	évolution	évolution	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ont	avoir	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	utilisé	utiliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	d'	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
9	autres	autre	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	organismes	organisme	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	qu'	que	CSU	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	E.	E.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	coli	coli	NOM	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
16	le	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
18	phénotypique	phénotypique	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
20	génétique	génétique	ADJ	_	_	18	para	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
22	l'	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	évolution	évolution	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	a	avoir	VRB	_	_	25	aux	_	_	_	_	_
25	été	être	VPP	_	_	26	aux	_	_	_	_	_
26	retrouvé	retrouver	VPP	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
27	à	à	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	tous	tout	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
29	les	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	niveaux	niveau	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	complexité	complexité	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	des	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	organismes	organisme	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	:	:	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1612
# text = depuis des lignées indépendantes de virus adaptées à des températures élevées , où la moitié des substitutions nucléotidiques sont identiques , en passant par des populations indépendantes de levure adaptées à des transitions glucose-galactose dans lesquelles le même gène répresseur de la voie d'utilisation du galactose a été désactivé , jusqu'à des poissons vivants dans des lacs différents où des modifications parallèles de phénotypes ( métabolisme énergétique et déplacement ) sont dues à un parallélisme génétique ( augmentation de l'expression des gènes codant la crystalline-& 206;& 179; et la parvalbumine-& 206;& 178; notamment ) .
1	depuis	depuis	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	des	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	lignées	lignée	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	indépendantes	indépendant	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	virus	virus	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	adaptées	adapter	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	des	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	températures	température	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	élevées	élevé	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	50	punc	_	_	_	_	_
13	où	où	PRQ	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	moitié	moitié	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
16	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	substitutions	substitution	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	nucléotidiques	nucléotidique	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	sont	être	VRB	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
20	identiques	identique	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	50	punc	_	_	_	_	_
22	en	en	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
23	passant	passer	VPR	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	par	par	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	des	un	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	populations	population	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	indépendantes	indépendant	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	levure	levure	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	adaptées	adapter	VPP	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
31	à	à	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	des	un	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	transitions	transition	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	glucose-galactose	glucose	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
35	dans	dans	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	lesquelles	lequelComp?	PRQ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	le	le	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
38	même	même	ADJ	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
39	gène	gène	NOM	_	_	50	subj	_	_	_	_	_
40	répresseur	répresseur	ADJ	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	de	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	la	le	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	voie	voie	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	d'	de	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	utilisation	utilisation	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	du	de	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
47	galactose	galactose	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	a	avoir	VRB	_	_	49	aux	_	_	_	_	_
49	été	être	VPP	_	_	50	aux	_	_	_	_	_
50	désactivé	désactiver	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
51	,	,	PUNC	_	_	52	punc	_	_	_	_	_
52	jusqu'à	jusqu'à	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
53	des	un	DET	_	_	54	spe	_	_	_	_	_
54	poissons	poisson	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
55	vivants	vivant	ADJ	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	dans	dans	PRE	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
57	des	un	DET	_	_	58	spe	_	_	_	_	_
58	lacs	lacs	NOM	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
59	différents	différent	ADJ	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
60	où	où	PRQ	_	_	73	periph	_	_	_	_	_
61	des	un	DET	_	_	62	spe	_	_	_	_	_
62	modifications	modification	NOM	_	_	73	subj	_	_	_	_	_
63	parallèles	parallèle	ADJ	_	_	62	dep	_	_	_	_	_
64	de	de	PRE	_	_	62	dep	_	_	_	_	_
65	phénotypes	phénotype	NOM	_	_	64	dep	_	_	_	_	_
66	(	(	PUNC	_	_	67	punc	_	_	_	_	_
67	métabolisme	métabolisme	NOM	_	_	62	parenth	_	_	_	_	_
68	énergétique	énergétique	ADJ	_	_	67	dep	_	_	_	_	_
69	et	et	COO	_	_	70	mark	_	_	_	_	_
70	déplacement	déplacement	NOM	_	_	67	para	_	_	_	_	_
71	)	)	PUNC	_	_	67	punc	_	_	_	_	_
72	sont	être	VRB	_	_	73	aux	_	_	_	_	_
73	dues	devoir	VPP	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
74	à	à	PRE	_	_	73	dep	_	_	_	_	_
75	un	un	DET	_	_	76	spe	_	_	_	_	_
76	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	74	dep	_	_	_	_	_
77	génétique	génétique	ADJ	_	_	76	dep	_	_	_	_	_
78	(	(	PUNC	_	_	79	punc	_	_	_	_	_
79	augmentation	augmentation	NOM	_	_	76	parenth	_	_	_	_	_
80	de	de	PRE	_	_	79	dep	_	_	_	_	_
81	l'	le	DET	_	_	82	spe	_	_	_	_	_
82	expression	expression	NOM	_	_	80	dep	_	_	_	_	_
83	des	de	PRE	_	_	82	dep	_	_	_	_	_
84	gènes	gène	NOM	_	_	83	dep	_	_	_	_	_
85	codant	coder	VPR	_	_	79	dep	_	_	_	_	_
86	la	le	DET	_	_	87	spe	_	_	_	_	_
87	crystalline-γ	crystalline-γ	NOM	_	_	85	dep	_	_	_	_	_
88	et	et	COO	_	_	90	mark	_	_	_	_	_
89	la	le	DET	_	_	90	spe	_	_	_	_	_
90	parvalbumine-β	parvalbumine-β	NOM	_	_	87	para	_	_	_	_	_
91	notamment	notamment	ADV	_	_	90	dep	_	_	_	_	_
92	)	)	PUNC	_	_	79	punc	_	_	_	_	_
93	.	.	PUNC	_	_	50	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1613
# text = Dans ce dernier cas , il ne s'agit plus d'évolution expérimentale , mais d'études réalisées dans des environnements naturels .
1	Dans	dans	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	ce	ce	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	dernier	dernier	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	cas	cas	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	il	il	CLS	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
7	ne	ne	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
8	s'	s'	CLI	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	agit	agir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	plus	plus	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	d'	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	évolution	évolution	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
15	mais	mais	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	d'	de	PRE	_	_	11	para	_	_	_	_	_
17	études	étude	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	réalisées	réaliser	VPP	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	dans	dans	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	des	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	environnements	environnement	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	naturels	naturel	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1614
# text = De telles conclusions ont également été obtenues pour d'autres eucaryotes , comme par exemple la drosophile .
1	De	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	telles	tel	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	conclusions	conclusion	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
4	ont	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
5	également	également	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
6	été	être	VPP	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	obtenues	obtenir	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	pour	pour	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	d'	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
10	autres	autre	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	eucaryotes	eucaryote	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
13	comme	comme	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
14	par	par exemple	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	exemple	par exemple	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	drosophile	drosophile	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1615
# text = Le parallélisme est donc un point commun à tous les types d'évolutions , en laboratoire ou dans la nature .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	parallélisme	parallélisme	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	donc	donc	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	un	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	point	point	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	commun	commun	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	tous	tout	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	types	type	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	évolutions	évolution	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	en	en	PRE	_	_	12	para	_	_	_	_	_
16	laboratoire	laboratoire	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	ou	ou	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	dans	dans	PRE	_	_	15	para	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	nature	nature	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1616
# text = Les systèmes d'évolution expérimentale sont donc des outils tout à fait appropriés pour comprendre les mécanismes sous-jacents de l'adaptation d'un organisme à un environnement donné .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	systèmes	système	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	évolution	évolution	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	donc	donc	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	des	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	outils	outil	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	tout	tout à fait	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
11	à	tout à fait	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	fait	tout à fait	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	appropriés	approprier	VPP	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	pour	pour	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	comprendre	comprendre	VNF	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	les	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	mécanismes	mécanisme	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	sous-jacents	sous-jacent	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	adaptation	adaptation	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	d'	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	un	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	organisme	organisme	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	à	à	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	un	un	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	environnement	environnement	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	donné	donner	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1617
# text = Plasticité des réseaux de régulation globale
1	Plasticité	plasticité	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	réseaux	réseau	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	régulation	régulation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	globale	global	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1618
# text = Toutes les mutations conférant une augmentation du fitness , et mises en évidence à ce jour dans la stratégie d'évolution expérimentale , affectent les gènes ou opérons suivants :
1	Toutes	tout	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	mutations	mutation	NOM	_	_	24	periph	_	_	_	_	_
4	conférant	conférer	VPR	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	augmentation	augmentation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	du	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	fitness	fine	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
11	mises	mise	NOM	_	_	8	para	_	_	_	_	_
12	en	en	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
13	évidence	évidence	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
15	ce	ce	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	jour	jour	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	stratégie	stratégie	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	d'	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	évolution	évolution	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
24	affectent	affecter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
25	les	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	gènes	gène	NOM	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
27	ou	ou	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
28	opérons	opéron	NOM	_	_	26	para	_	_	_	_	_
29	suivants	suivant	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
30	:	:	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1619
# text = rbs , spoT , topA , fis , dusB ( ce travail ) , malT , nadR , pbpA-rodA , pykF , hokB-sokB .
1	rbs	rire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
3	spoT	spoT	ADV	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
5	topA	topA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
7	fis	faire	VRB	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
9	dusB	dusB	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
10	(	(	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
11	ce	ce	DET	_	_	1	parenth	_	_	_	_	_
12	travail	travail	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_
13	)	)	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
15	malT	malT	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
17	nadR	nadR	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
19	pbpA-rodA	pbpA-rodA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
21	pykF	pykF	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
23	hokB-sokB	hokB-sokB	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1620
# text = Près d'un tiers de ces gènes ( topA , fis , spoT ) codent des régulateurs globaux de l'expression des gènes , intervenant dans deux des plus importants réseaux de régulation génétique :
1	Près	près	ADV	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
2	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	un	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	tiers	tiers	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ces	ce	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	gènes	gène	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	(	(	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
9	topA	topA	ADV	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
11	fis	faire	VRB	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
13	spoT	spoT	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	)	)	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	codent	coder	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	des	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	régulateurs	régulateur	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	globaux	global	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	expression	expression	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	des	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	gènes	gène	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	intervenant	intervenir	VPR	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	dans	dans	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	deux	deux	NUM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	des	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	plus	plus	ADV	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	importants	important	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	réseaux	réseau	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	régulation	régulation	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	génétique	génétique	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	:	:	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1621
# text = la superhélicité de l'ADN et la réponse stringente .
1	la	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	réponse	réponse	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
9	stringente	astringent	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1622
# text = La plasticité des réseaux de régulation globale est donc un paramètre crucial permettant l'adaptation des bactéries à leur environnement .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	plasticité	plasticité	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	réseaux	réseau	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	régulation	régulation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	globale	global	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	donc	donc	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	un	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	paramètre	paramètre	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	crucial	crucial	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	permettant	permettre	VPR	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	adaptation	adaptation	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	bactéries	bactérie	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	à	à	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	leur	son	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	environnement	environnement	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1623
# text = Au sein de la population modèle Ara- 1 , les mutations substituées dans les gènes topA et spoT apparaissent très tôt ( avant 500 et 1500 générations , respectivement ) et confèrent les augmentations de fitness les plus importantes identifiées à ce jour ( 13 % et 10 % , respectivement ) .
1	Au	au sein de	PRE	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
2	sein	au sein de	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	au sein de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	population	population	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	modèle	modèle	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	Ara-	Ara-	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	1	1	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	mutations	mutation	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
12	substituées	substituer	VPP	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	dans	dans	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	gènes	gène	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	topA	topA	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	spoT	spot	NOM	_	_	15	para	_	_	_	_	_
19	apparaissent	apparaître	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	très	très	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	tôt	tôt	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	(	(	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
23	avant	avant	PRE	_	_	19	parenth	_	_	_	_	_
24	500	500	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
26	1500	1500	NUM	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	générations	génération	NOM	_	_	24	para	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
29	respectivement	respectivement	ADV	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
30	)	)	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
31	et	et	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
32	confèrent	conférer	VRB	_	_	19	para	_	_	_	_	_
33	les	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	augmentations	augmentation	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	fitness	fine	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	les	le	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
38	plus	plus	ADV	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
39	importantes	important	ADJ	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
40	identifiées	identifier	VPP	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
41	à	à	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	ce	ce	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	jour	jour	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	(	(	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_
45	13	13	NUM	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
46	%	pourcent	NOM	_	_	34	parenth	_	_	_	_	_
47	et	et	COO	_	_	49	mark	_	_	_	_	_
48	10	10	NUM	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
49	%	pourcent	NOM	_	_	46	para	_	_	_	_	_
50	,	,	PUNC	_	_	51	punc	_	_	_	_	_
51	respectivement	respectivement	ADV	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
52	)	)	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_
53	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1624
# text = La modification de ces deux réseaux de régulation fondamentaux de la cellule doit forcément engendrer des effets pleïotropes , et il est improbable que tous ces effets soient bénéfiques .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	modification	modification	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ces	ce	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	deux	deux	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	réseaux	réseau	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	régulation	régulation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	fondamentaux	fondamental	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	cellule	cellule	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	doit	devoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	forcément	forcément	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	engendrer	engendrer	VNF	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	des	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	effets	effet	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	pleïotropes	héliotrope	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
21	il	il	CLS	_	_	22	subj	_	_	_	_	_
22	est	être	VRB	_	_	15	para	_	_	_	_	_
23	improbable	improbable	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	que	que	CSU	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	tous	tout	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
26	ces	ce	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	effets	effet	NOM	_	_	28	subj	_	_	_	_	_
28	soient	être	VRB	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
29	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1625
# text = Certains d'entre eux sont sans doute neutres , voire faiblement néfastes , mais compensés par des effets bénéfiques plus importants .
1	Certains	certains	PRQ	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
2	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	entre	entre	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	eux	lui	PRQ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	sans	sans doute	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	doute	sans doute	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	neutres	neutre	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
10	voire	voire	COO	_	_	12	mark	_	_	_	_	_
11	faiblement	faiblement	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	néfastes	néfaste	ADJ	_	_	8	para	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
14	mais	mais	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	compensés	compenser	VPP	_	_	12	para	_	_	_	_	_
16	par	par	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	des	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	effets	effet	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	plus	plus	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	importants	important	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1626
# text = Il est alors possible d'imaginer qu'une fois ces mutations fixées , la cellule puisse continuer à s'adapter en compensant les effets néfastes par d'autres mutations plus tardives .
1	Il	il	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	alors	alors	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	possible	possible	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	imaginer	imaginer	VNF	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	qu'	que	CSU	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	une	une fois	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	fois	une fois	PRE	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
10	ces	ce	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	mutations	mutation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	fixées	fixer	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	cellule	cellule	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
16	puisse	pouvoir	VRB	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
17	continuer	continuer	VNF	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	à	à	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	s'	s'	CLI	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	adapter	adapter	VNF	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	en	en	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
22	compensant	compenser	VPR	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	les	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	effets	effet	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	néfastes	néfaste	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	par	par	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	d'	un	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
28	autres	autre	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
29	mutations	mutation	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
30	plus	plus	ADV	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	tardives	tardif	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1627
# text = Un tel effet de compensation pourrait expliquer le bénéfice conféré par les mutations du gène fis , dont nous avons démontré qu'elles provoquaient une diminution de la quantité ou de l'activité de Fis .
1	Un	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	tel	tel	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	effet	effet	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	compensation	compensation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	expliquer	expliquer	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	bénéfice	bénéfice	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	conféré	conférer	VPP	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	les	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	mutations	mutation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	du	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	gène	gène	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
18	dont	dont	PRQ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	nous	nous	CLS	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
20	avons	avoir	VRB	_	_	21	aux	_	_	_	_	_
21	démontré	démontrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	qu'	que	CSU	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	elles	elles	CLS	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
24	provoquaient	provoquer	VRB	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	une	un	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	diminution	diminution	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	quantité	quantité	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	ou	ou	COO	_	_	31	mark	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	27	para	_	_	_	_	_
32	l'	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	activité	activité	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	Fis	Fis	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1628
# text = En effet , nous avons observé une augmentation de la quantité de Fis chez des clones évolués isolés à 2000 générations , c'est-à-dire avant l'apparition des mutations dans fis .
1	En	en effet	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	nous	nous	CLS	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	avons	avoir	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	observé	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	une	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	augmentation	augmentation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	quantité	quantité	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	Fis	Fis	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	chez	chez	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
15	des	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	clones	clone	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	évolués	évolué	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	isolés	isolé	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	à	à	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	2000	2000	NUM	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	générations	génération	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
23	c'	c'est-à-dire	COO	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	est-à-dire	c'est-à-dire	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
25	avant	avant	PRE	_	_	14	para	_	_	_	_	_
26	l'	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	apparition	apparition	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	des	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	mutations	mutation	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	dans	dans	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
31	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1629
# text = Cette augmentation de la quantité de Fis pourrait être néfaste et être liée à une autre mutation fixée avant 2000 générations .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	augmentation	augmentation	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	quantité	quantité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	Fis	Fis	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	être	être	VNF	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	néfaste	néfaste	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
12	être	être	VNF	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	liée	lier	VPP	_	_	9	para	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	une	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
16	autre	autre	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	mutation	mutation	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	fixée	fixer	VPP	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	avant	avant	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	2000	2000	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	générations	génération	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1630
# text = Ainsi , les mutations fis , toutes fixées vers 10 000 générations , permettraient de compenser ce « défaut » .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	les	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	mutations	mutation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	toutes	tout	PRQ	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
8	fixées	fixer	VPP	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	vers	vers	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	10	10	NUM	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	000	000	NUM	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	générations	génération	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
14	permettraient	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	compenser	compenser	VNF	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	ce	ce	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
18	«	«	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	défaut	défaut	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
20	»	»	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1631
# text = Pour essayer de confirmer cette hypothèse , nous avons introduit par recombinaison homologue dans le chromosome de la souche ancêtre une mutation affectant la boîte - 35 du promoteur de fis ( le résidu T en position - 34 est modifié en G ) et résultant en une augmentation de 18 fois de la transcription de fis
1	Pour	pour	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	essayer	essayer	VNF	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	confirmer	confirmer	VNF	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	cette	ce	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	hypothèse	hypothèse	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
8	nous	nous	CLS	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
9	avons	avoir	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	introduit	introduire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	homologue	homologue	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	dans	dans	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	le	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	chromosome	chromosome	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	souche	souche	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	une	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	mutation	mutation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
23	affectant	affecter	VPR	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	boîte	boîte	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	-	- 35	PUNC	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	35	35	NUM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	du	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
29	promoteur	promoteur	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
31	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
32	(	(	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
33	le	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	résidu	résidu	NOM	_	_	41	subj	_	_	_	_	_
35	T	T	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	en	en	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	position	position	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	-	- 34	PUNC	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	34	34	NUM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	est	être	VRB	_	_	41	aux	_	_	_	_	_
41	modifié	modifier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
42	en	en	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	G	G	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	)	)	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
45	et	et	COO	_	_	46	mark	_	_	_	_	_
46	résultant	résulter	VPR	_	_	0	root	_	_	_	_	_
47	en	en	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	une	un	DET	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
49	augmentation	augmentation	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	de	de	PRE	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	18	18	NUM	_	_	52	spe	_	_	_	_	_
52	fois	fois	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
53	de	de	PRE	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
54	la	le	DET	_	_	55	spe	_	_	_	_	_
55	transcription	transcription	NOM	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
56	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
57	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1632
# text = ( Walker et al. , 1999 ) .
1	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	Walker	Walker	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
4	al.	al.	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	1999	1999	NUM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1633
# text = Nous avons vérifié cette augmentation par Western blot et mesuré le fitness de cette souche par des expériences de compétitions , qui ont révélé une diminution de fitness .
1	Nous	nous	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	avons	avoir	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	vérifié	vérifier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	cette	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	augmentation	augmentation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	Western	Western	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	blot	blet	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	mesuré	mesurer	VPP	_	_	3	para	_	_	_	_	_
11	le	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	fitness	fitness	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	cette	ce	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	souche	souche	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	par	par	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	des	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	expériences	expérience	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	compétitions	compétition	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
22	qui	qui	PRQ	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
23	ont	avoir	VRB	_	_	24	aux	_	_	_	_	_
24	révélé	révéler	VPP	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
25	une	un	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	diminution	diminution	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	fitness	fine	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1634
# text = Ainsi , les mutations fis pourraient compenser les effets néfastes liés à une augmentation de Fis en diminuant la concentration ou l'activité de Fis .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	les	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	mutations	mutation	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	compenser	compenser	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	les	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	effets	effet	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	néfastes	néfaste	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	liés	lier	VPP	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	à	à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	une	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	augmentation	augmentation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	Fis	Fis	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	en	en	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
18	diminuant	diminuer	VPR	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	concentration	concentration	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	ou	ou	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
22	l'	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	activité	activité	NOM	_	_	20	para	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	Fis	Fis	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1635
# text = Un tel phénomène de compensation d'effets pleïotropes a été observé dans une autre étude d'évolution expérimentale , au cours de laquelle 7 populations indépendantes d'E. coli ont été adaptées pendant 600 à 1000 générations à deux conditions différentes :
1	Un	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	tel	tel	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	phénomène	phénomène	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	compensation	compensation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	d'	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	effets	effet	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	pleïotropes	héliotrope	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	a	avoir	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	été	être	VPP	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	observé	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	dans	dans	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	une	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
14	autre	autre	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	étude	étude	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	d'	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	évolution	évolution	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
20	au	à	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	cours	cours	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	32	periph	_	_	_	_	_
23	laquelle	lequel	PRQ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	7	7	NUM	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	populations	population	NOM	_	_	32	subj	_	_	_	_	_
26	indépendantes	indépendant	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	d'	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	E.	E.	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
29	coli	coli	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	ont	avoir	VRB	_	_	31	aux	_	_	_	_	_
31	été	être	VPP	_	_	32	aux	_	_	_	_	_
32	adaptées	adapter	VPP	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
33	pendant	pendant	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	600	600	NUM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	à	à	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
36	1000	1000	NUM	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	générations	génération	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	à	à	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
39	deux	deux	NUM	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	conditions	condition	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	différentes	différent	ADJ	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	:	:	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1636
# text = du milieu minimum contenant du glycérol ou du lactate comme seule source de carbone .
1	du	de+le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	milieu	milieu	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	minimum	minimum	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	contenant	contenir	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	glycérol	glycérol	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ou	ou	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	du	de	PRE	_	_	5	para	_	_	_	_	_
9	lactate	lactate	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	comme	comme	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	seule	seul	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	source	source	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	carbone	carbone	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1637
# text = L'analyse du profil de transcription de ces 14 populations au cours de l'évolution révèle que l'expression de nombreux gènes est modifiée en début d'expérience en réponse aux nouvelles conditions de croissance .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	analyse	analyse	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
3	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	profil	profil	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	transcription	transcription	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ces	ce	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
9	14	14	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	populations	population	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	au	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	cours	cours	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	évolution	évolution	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	révèle	révéler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	que	que	CSU	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	expression	expression	NOM	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	nombreux	nombreux	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	gènes	gène	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	est	être	VRB	_	_	24	aux	_	_	_	_	_
24	modifiée	modifier	VPP	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
25	en	en début de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	début	en début de	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	d'	en début de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	expérience	expérience	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	en	en	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
30	réponse	réponse	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	aux	à	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	nouvelles	nouveau	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
33	conditions	condition	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	croissance	croissance	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1638
# text = Ceci est rapidement suivi d'un retour de l'expression de la plupart de ces gènes au niveau initial .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
3	rapidement	rapidement	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	suivi	suivre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	d'	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	un	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	retour	retour	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	expression	expression	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	plupart	plupart	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	ces	ce	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	gènes	gène	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	au	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
18	niveau	niveau	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	initial	initial	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1639
# text = Ainsi , un ensemble relativement restreint de gènes est exprimé différentiellement dans les clones évolués par rapport à l'ancêtre , et un nombre important de changements compensatoires d'expression des gènes est observé au cours de l'évolution .
1	Ainsi	ainsi	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	un	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	ensemble	ensemble	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
5	relativement	relativement	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	restreint	restreindre	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	gènes	gène	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	est	est	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	exprimé	exprimer	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	différentiellement	différentiel	A+V	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	dans	dans	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	les	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	clones	clone	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	évolués	évolué	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	par	par rapport à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
17	rapport	par rapport à	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	à	par rapport à	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	34	mark	_	_	_	_	_
23	un	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	nombre	nombre	NOM	_	_	34	subj	_	_	_	_	_
25	important	important	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	changements	changement	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	compensatoires	compensatoire	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	d'	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	expression	expression	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	des	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	gènes	gène	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	est	être	VRB	_	_	34	aux	_	_	_	_	_
34	observé	observer	VPP	_	_	11	para	_	_	_	_	_
35	au	au cours de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	cours	au cours de	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	de	au cours de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	l'	le	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	évolution	évolution	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1640
# text = La plasticité des réseaux de régulation est également visible chez les isolats naturels .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	plasticité	plasticité	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	réseaux	réseau	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	régulation	régulation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	également	également	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	visible	visible	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	chez	chez	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	les	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	isolats	isolat	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	naturels	naturel	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1641
# text = En effet , l'étude de 41 isolats cliniques de Salmonella sérotype Typhi montre que 15 isolats présentent des mutations de types insertions , délétions et mutations non-sens dans le gène rpoS , codant le facteur & 207;& 131;S de réponse aux stress ( Hengge-Aronis , 2002 ) requis pour la virulence chez la souris .
1	En	en effet	PRE	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	étude	étude	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	41	41	NUM	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	isolats	isolat	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	cliniques	clinique	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	Salmonella	Salmonella	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	sérotype	sérotype	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	Typhi	Typhi	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	montre	montrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	que	que	CSU	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	15	15	NUM	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	isolats	isolat	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
18	présentent	présenter	VRB	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	des	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	mutations	mutation	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	types	type	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	insertions	insertion	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	délétions	délétion	NOM	_	_	20	para	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
27	mutations	mutation	NOM	_	_	25	para	_	_	_	_	_
28	non-sens	non-sens	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	dans	dans	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
30	le	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	gène	gène	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	rpoS	rpoS	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
34	codant	coder	VPR	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
35	le	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	facteur	facteur	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	σS	σS	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	réponse	réponse	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	aux	à	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	stress	stress	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	(	(	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
43	Hengge-Aronis	Hengge-Aronis	NOM	_	_	41	parenth	_	_	_	_	_
44	,	,	PUNC	_	_	47	punc	_	_	_	_	_
45	2002	2002	NUM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	)	)	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
47	requis	requérir	VPP	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
48	pour	pour	PRE	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	la	le	DET	_	_	50	spe	_	_	_	_	_
50	virulence	virulence	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
51	chez	chez	PRE	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
52	la	le	DET	_	_	53	spe	_	_	_	_	_
53	souris	souris	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
54	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1642
# text = Ce régulateur est également très variable chez différents isolats naturels d'E. coli qui présentent une variation de l'activité de RpoS corrélée avec des différences de résistance à la pression osmotique .
1	Ce	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	régulateur	régulateur	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	également	également	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	très	très	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	variable	variable	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	chez	chez	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	différents	différent	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	isolats	isolat	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	naturels	naturel	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	d'	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	E.	E.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	coli	coli	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	qui	qui	PRQ	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
15	présentent	présenter	VRB	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
16	une	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	variation	variation	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	activité	activité	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	RpoS	RpoS	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	corrélée	corréler	VPP	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	avec	avec	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	des	un	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	différences	différence	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	résistance	résistance	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	à	à	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
30	la	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	pression	pression	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	osmotique	osmotique	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1643
# text = Les isolats de laboratoire et naturels d'E. coli présentent des niveaux relatifs différents des deux facteurs sigma
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	isolats	isolat	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	laboratoire	laboratoire	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	naturels	naturel	ADJ	_	_	3	para	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	E.	E.	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	coli	coli	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	présentent	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	des	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	niveaux	niveau	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	relatifs	relatif	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	différents	différent	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	des	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	deux	deux	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	facteurs	facteur	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	sigma	sigma	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1644
# text = RpoS et RpoD , ce qui affecte la transcription globale et aboutit à une variabilité des capacités métaboliques et de résistance à divers stress .
1	RpoS	RpoS	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	et	et	COO	_	_	3	mark	_	_	_	_	_
3	RpoD	RpoD	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	ce	ce	PRQ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	qui	qui	PRQ	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	affecte	affecter	VRB	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	transcription	transcription	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	globale	global	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	12	mark	_	_	_	_	_
12	aboutit	aboutir	VRB	_	_	7	para	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	une	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	variabilité	variabilité	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	capacités	capacité	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	métaboliques	métabolique	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	16	para	_	_	_	_	_
21	résistance	résistance	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	à	à	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	divers	divers	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	stress	stress	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1645
# text = Ces deux facteurs sigma entrent en compétition pour la liaison à l'ARN polymérase , la liaison de RpoD améliorant la croissance , celle de RpoS favorisant la résistance aux stress .
1	Ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	deux	deux	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	facteurs	facteur	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
4	sigma	sigma	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	entrent	entrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	compétition	compétition	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	pour	pour	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	liaison	liaison	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	à	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
13	ARN	ARN	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	polymérase	polymérase	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	liaison	liaison	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	RpoD	RpoD	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	améliorant	améliorer	VPR	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	croissance	croissance	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	celle	celui	PRQ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	RpoS	RpoS	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	favorisant	favoriser	VPR	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	la	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	résistance	résistance	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	aux	à	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	stress	stress	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1646
# text = La modification de ce réseau de régulation majeur dont le pivot est RpoS permet donc l'adaptation à des environnements différents .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	modification	modification	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ce	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	réseau	réseau	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	régulation	régulation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	majeur	majeur	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	dont	dont	PRQ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
10	le	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	pivot	pivot	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
12	est	être	VRB	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
13	RpoS	RpoS	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	permet	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	donc	donc	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	adaptation	adaptation	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	à	à	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	des	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	environnements	environnement	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	différents	différent	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1647
# text = La complexité et la plasticité des réseaux de régulation pourraient ainsi avoir été sélectionnées au cours de l'évolution , de par leur capacité à accroître le spectre évolutif des organismes .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	complexité	complexité	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	plasticité	plasticité	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
6	des	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	réseaux	réseau	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	régulation	régulation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	ainsi	ainsi	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	avoir	avoir	VNF	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	été	être	VPP	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	sélectionnées	sélectionner	VPP	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	au	au cours de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	cours	au cours de	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	au cours de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	évolution	évolution	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	de	de par	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
22	par	de par	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	leur	son	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	capacité	capacité	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	à	à	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	accroître	accroître	VNF	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	le	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	spectre	spectre	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	évolutif	évolutif	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	des	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	organismes	organisme	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1648
# text = Dans notre expérience d'évolution , la plasticité des réseaux de régulation permet une adaptation rapide par de grandes modifications de l'expression des gènes , puis les effets bénéfiques sont conservés , et les effets néfastes seraient compensés par des mutations ultérieures .
1	Dans	dans	PRE	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	notre	son	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	expérience	expérience	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	évolution	évolution	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	plasticité	plasticité	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
9	des	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	réseaux	réseau	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	régulation	régulation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	permet	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	une	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	adaptation	adaptation	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	rapide	rapide	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	par	par	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
19	grandes	grand	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	modifications	modification	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	l'	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	expression	expression	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	des	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	gènes	gène	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
27	puis	puis	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
28	les	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	effets	effet	NOM	_	_	32	subj	_	_	_	_	_
30	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	sont	être	VRB	_	_	32	aux	_	_	_	_	_
32	conservés	conserver	VPP	_	_	13	para	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
34	et	et	COO	_	_	39	mark	_	_	_	_	_
35	les	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	effets	effet	NOM	_	_	39	subj	_	_	_	_	_
37	néfastes	néfaste	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	seraient	être	VRB	_	_	39	aux	_	_	_	_	_
39	compensés	compenser	VPP	_	_	32	para	_	_	_	_	_
40	par	par	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	des	un	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	mutations	mutation	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	ultérieures	ultérieur	ADJ	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1649
# text = Ceci constitue non seulement un premier indice sur le mécanisme d'adaptation des bactéries à leur environnement , mais aussi un phénotype supplémentaire révélant une évolution parallèle au sein des 12 populations .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	constitue	constituer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	non	non	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	seulement	seulement	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	un	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
6	premier	premier	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	indice	indice	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	sur	sur	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	le	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	d'	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	adaptation	adaptation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	des	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	bactéries	bactérie	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	leur	son	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	environnement	environnement	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
19	mais	mais aussi	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
20	aussi	mais aussi	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	un	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	phénotype	phénotype	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
23	supplémentaire	supplémentaire	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	révélant	révéler	VPR	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	une	un	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	évolution	évolution	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	parallèle	parallèle	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	au	au sein de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
29	sein	au sein de	DET	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	des	au sein de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	12	12	NUM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
32	populations	population	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1650
# text = Les mécanismes moléculaires de l'adaptation
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	mécanismes	mécanisme	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	moléculaires	moléculaire	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	adaptation	adaptation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1651
# text = Au cours de l'évolution expérimentale , deux catégories de mutations bénéfiques ont été sélectionnées .
1	Au	à	PRE	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
2	cours	cours	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	évolution	évolution	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
8	deux	deux	NUM	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	catégories	catégorie	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	mutations	mutation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	ont	avoir	VRB	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	été	être	VPP	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
15	sélectionnées	sélectionner	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1652
# text = La première touche des gènes de structure ou des régulateurs d'un petit nombre de gènes , ce qui conduit à des phénotypes relativement clairs et évidents .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	première	premier	ADJ	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	touche	toucher	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	gènes	gène	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	structure	structure	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	ou	ou	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	des	de	PRE	_	_	6	para	_	_	_	_	_
10	régulateurs	régulateur	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	d'	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	un	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
13	petit	petit	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	nombre	nombre	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	gènes	gène	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	ce	ce	PRQ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
19	qui	qui	PRQ	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
20	conduit	conduire	VRB	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	à	à	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	des	un	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	phénotypes	phénotype	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	relativement	relativement	ADV	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	clairs	clair	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
27	évidents	évident	ADJ	_	_	25	para	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1653
# text = Par exemple , les délétions de l'opéron rbs provoquent la perte de la capacité à utiliser le ribose , et les mutations dans le gène malT diminuent la capacité des bactéries à utiliser le maltose comme source de carbone .
1	Par	par exemple	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	exemple	par exemple	ADV	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	délétions	délétion	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	opéron	opéron	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	rbs	ris	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	provoquent	provoquer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	perte	perte	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	capacité	capacité	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	à	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	utiliser	utiliser	VNF	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	le	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	ribose	ribose	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
22	les	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	mutations	mutation	NOM	_	_	28	subj	_	_	_	_	_
24	dans	dans	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	le	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	gène	gène	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	malT	malT	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	diminuent	diminuer	VRB	_	_	10	para	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	capacité	capacité	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	des	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	bactéries	bactérie	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	à	à	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	utiliser	utiliser	VNF	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	le	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	maltose	maltose	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	comme	comme	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
38	source	source	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	de	de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	carbone	carbone	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1654
# text = La deuxième catégorie de mutations affecte des gènes de régulation globale , comme la superhélicité de l'ADN ou la réponse stringente .
1	La	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	deuxième	deuxième	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	catégorie	catégorie	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	mutations	mutation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	affecte	affecter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	des	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	gènes	gène	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	régulation	régulation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	globale	global	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	comme	comme	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	l'	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	ADN	ADN	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	ou	ou	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	réponse	réponse	NOM	_	_	15	para	_	_	_	_	_
22	stringente	astringent	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1655
# text = Les effets de ces mutations sont beaucoup plus difficiles à appréhender , pour plusieurs raisons .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	effets	effet	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ces	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	mutations	mutation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	beaucoup	beaucoup	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	plus	plus	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	difficiles	difficile	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	appréhender	appréhender	VNF	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	pour	pour	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	raisons	raison	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1656
# text = Tout d'abord , les effets pleïotropes de ces mutations peuvent rendre les effets bénéfiques majeurs difficiles à caractériser .
1	Tout	tout d'abord	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	d'	tout d'abord	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	abord	tout d'abord	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	effets	effet	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
7	pleïotropes	héliotrope	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	ces	ce	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	mutations	mutation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	rendre	rendre	VNF	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	les	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	effets	effet	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	majeurs	majeur	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	difficiles	difficile	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	à	à	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	caractériser	caractériser	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1657
# text = Ensuite , les mutations sélectionnées ont des effets subtils .
1	Ensuite	ensuite	ADV	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	les	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	mutations	mutation	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	sélectionnées	sélectionner	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ont	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	des	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	effets	effet	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	subtils	subtil	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1658
# text = En effet , elles ne correspondent pas à des délétions ou des inactivations de fonction , mais entraînent des variations plus faibles :
1	En	en effet	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	elles	elles	CLS	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	ne	ne	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	correspondent	correspondre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	pas	pas	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	des	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	délétions	délétion	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	ou	ou	COO	_	_	12	mark	_	_	_	_	_
12	des	de	PRE	_	_	8	para	_	_	_	_	_
13	inactivations	inactivation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	fonction	fonction	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
17	mais	mais	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	entraînent	entraîner	VRB	_	_	6	para	_	_	_	_	_
19	des	un	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	variations	variation	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	plus	plus	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	faibles	faible	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	:	:	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1659
# text = par exemple , les mutations du gène fis dans les populations Ara- 1 et Ara + 1 diminuent la quantité de protéine de 3 fois .
1	par	par exemple	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	exemple	par exemple	ADV	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	mutations	mutation	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
6	du	de+le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	gène	gène	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
8	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	dans	dans	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	populations	population	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	Ara-	Ara-	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	1	1	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
15	Ara	Ara	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
16	+	+ 1	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	1	1	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	diminuent	diminuer	VRB	_	_	8	para	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	quantité	quantité	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	protéine	protéine	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	3	3	NUM	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	fois	fois	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1660
# text = De plus , les travaux effectués au cours de cette thèse et de celle de N. Philippe ( Philippe , 2006 ) suggèrent que le bénéfice apporté par les mutations isolées n'est pas directement lié aux fonctions connues de ces gènes .
1	De	de plus	PRE	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	travaux	travail	NOM	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
6	effectués	effectuer	VPP	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	au	au cours de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	cours	au cours de	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	au cours de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	cette	ce	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	thèse	thèse	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	9	para	_	_	_	_	_
14	celle	celui	PRQ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	N.	N.	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	Philippe	Philippe	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	(	(	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Philippe	Philippe	NOM	_	_	16	parenth	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
21	2006	2006	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	)	)	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
23	suggèrent	suggérer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	que	que	CSU	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	le	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	bénéfice	bénéfice	NOM	_	_	36	subj	_	_	_	_	_
27	apporté	apporter	VPP	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	par	par	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	les	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	mutations	mutation	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	isolées	isolé	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	n'	ne	ADV	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
33	est	être	VRB	_	_	36	aux	_	_	_	_	_
34	pas	pas	ADV	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
35	directement	directement	ADV	_	_	36	periph	_	_	_	_	_
36	lié	lier	VPP	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
37	aux	à	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	fonctions	fonction	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	connues	connaître	VPP	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	de	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	ces	ce	DET	_	_	42	spe	_	_	_	_	_
42	gènes	gène	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
43	.	.	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1661
# text = Par exemple , les mutations bénéfiques affectant le gène spoT , codant une des protéines majeures responsable du métabolisme ( synthèse et dégradation ) de ( p ) ppGpp , l'effecteur de la réponse stringente ( Cashel et al. , 1996 ) , ne modifient aucunement son niveau dans la cellule , ni ses taux de synthèse ou de dégradation ( Philippe , Crozat , Lenski et Schneider , manuscrit en préparation ) .
1	Par	par exemple	PRE	_	_	46	periph	_	_	_	_	_
2	exemple	par exemple	ADV	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	mutations	mutation	NOM	_	_	46	subj	_	_	_	_	_
6	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	affectant	affecter	VPR	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	gène	gène	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	spoT	spoT	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
12	codant	coder	VPR	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	une	un	PRQ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	des	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	protéines	protéine	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	majeures	majeur	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	responsable	responsable	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	du	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	métabolisme	métabolisme	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	(	(	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	synthèse	synthèse	NOM	_	_	19	parenth	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	dégradation	dégradation	NOM	_	_	21	para	_	_	_	_	_
24	)	)	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
26	(	(	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
27	p	p	ADJ	_	_	29	parenth	_	_	_	_	_
28	)	)	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
29	ppGpp	ppGpp	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
31	l'	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	effecteur	effecteur	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
33	de	de	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	la	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	réponse	réponse	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	stringente	astringent	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	(	(	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
38	Cashel	Cashel	NOM	_	_	35	parenth	_	_	_	_	_
39	et	et	COO	_	_	42	mark	_	_	_	_	_
40	al.	al.	ADV	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	,	,	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
42	1996	1996	NUM	_	_	38	para	_	_	_	_	_
43	)	)	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
44	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
45	ne	ne	ADV	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
46	modifient	modifier	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
47	aucunement	aucunement	ADV	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	son	son	DET	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
49	niveau	niveau	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
50	dans	dans	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
51	la	le	DET	_	_	52	spe	_	_	_	_	_
52	cellule	cellule	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
53	,	,	PUNC	_	_	56	punc	_	_	_	_	_
54	ni	ni	COO	_	_	56	mark	_	_	_	_	_
55	ses	son	DET	_	_	56	spe	_	_	_	_	_
56	taux	taux	NOM	_	_	52	para	_	_	_	_	_
57	de	de	PRE	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
58	synthèse	synthèse	NOM	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
59	ou	ou	COO	_	_	60	mark	_	_	_	_	_
60	de	de	PRE	_	_	57	para	_	_	_	_	_
61	dégradation	dégradation	NOM	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
62	(	(	PUNC	_	_	63	punc	_	_	_	_	_
63	Philippe	Philippe	NOM	_	_	61	parenth	_	_	_	_	_
64	,	,	PUNC	_	_	65	punc	_	_	_	_	_
65	Crozat	Crozat	NOM	_	_	63	para	_	_	_	_	_
66	,	,	PUNC	_	_	67	punc	_	_	_	_	_
67	Lenski	Lenski	NOM	_	_	65	para	_	_	_	_	_
68	et	et	COO	_	_	69	mark	_	_	_	_	_
69	Schneider	Schneider	NOM	_	_	67	para	_	_	_	_	_
70	,	,	PUNC	_	_	71	punc	_	_	_	_	_
71	manuscrit	manuscrit	NOM	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
72	en	en	PRE	_	_	71	dep	_	_	_	_	_
73	préparation	préparation	NOM	_	_	72	dep	_	_	_	_	_
74	)	)	PUNC	_	_	63	punc	_	_	_	_	_
75	.	.	PUNC	_	_	46	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1662
# text = De même , Fis étant connue pour réprimer la transcription des gènes codant la gyrase , la diminution de quantité ou d'activité de Fis observée au cours de l'évolution pourrait conduire à une augmentation de la quantité de gyrase , ce qui permettrait d'expliquer la seconde augmentation de superhélicité observée à 20 000 générations dans la population
1	De	de même	PRE	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	même	de même	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	étant	être	VPR	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	connue	connaître	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	pour	pour	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	réprimer	réprimer	VNF	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	transcription	transcription	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	des	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	gènes	gène	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	codant	coder	VPR	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	gyrase	gyrase	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
17	la	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	diminution	diminution	NOM	_	_	32	subj	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	quantité	quantité	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	ou	ou	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	d'	de	PRE	_	_	19	para	_	_	_	_	_
23	activité	activité	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	Fis	Fis	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	observée	observer	VPP	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	au	au cours de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	cours	au cours de	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	de	au cours de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	l'	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	évolution	évolution	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
33	conduire	conduire	VNF	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	à	à	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	une	un	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	augmentation	augmentation	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	la	le	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	quantité	quantité	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	de	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	gyrase	gyrase	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	,	,	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
43	ce	ce	PRQ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
44	qui	qui	PRQ	_	_	45	subj	_	_	_	_	_
45	permettrait	permettre	VRB	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
46	d'	de	PRE	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	expliquer	expliquer	VNF	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	la	le	DET	_	_	50	spe	_	_	_	_	_
49	seconde	second	ADJ	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
50	augmentation	augmentation	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
51	de	de	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	observée	observer	VPP	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
54	à	à	PRE	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	20	20	NUM	_	_	56	spe	_	_	_	_	_
56	000	000	NUM	_	_	57	spe	_	_	_	_	_
57	générations	génération	NOM	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
58	dans	dans	PRE	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
59	la	le	DET	_	_	60	spe	_	_	_	_	_
60	population	population	NOM	_	_	58	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1663
# text = Ara- 1 .
1	Ara-	Ara-	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1664
# text = Cependant , les expériences de Western blot effectuées n'ont pas permis de détecter une telle modification suite aux mutations du gène fis ( résultats non montrés ) .
1	Cependant	cependant	ADV	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	les	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	expériences	expérience	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	Western	Western	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	blot	blet	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	effectuées	effectuer	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	n'	ne	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
10	ont	avoir	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
11	pas	pas	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	permis	permettre	VPP	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	détecter	détecter	VNF	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	une	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
16	telle	tel	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	modification	modification	NOM	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
18	suite	suite à	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	aux	suite à	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	mutations	mutation	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	du	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	gène	gène	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	(	(	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	résultats	résultat	NOM	_	_	23	parenth	_	_	_	_	_
26	non	non	ADV	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
27	montrés	montrer	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	)	)	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1665
# text = L'augmentation de superhélicité de l'ADN pourrait être bénéfique par augmentation de la transcription des ARN stables qui est dépendante d'un niveau élevé de superhélicité négative .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	augmentation	augmentation	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ADN	ADN	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	être	être	VNF	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	bénéfique	bénéfique	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	augmentation	augmentation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	transcription	transcription	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	ARN	ARN	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	stables	stable	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	qui	qui	PRQ	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
20	est	être	VRB	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
21	dépendante	dépendant	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	d'	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	un	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	niveau	niveau	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	élevé	élevé	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	négative	négatif	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1666
# text = Ceci permettrait alors une croissance plus rapide et pourrait ainsi conduire à une augmentation du fitness .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	permettrait	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	alors	alors	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	une	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	croissance	croissance	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	plus	plus	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	rapide	rapide	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	2	para	_	_	_	_	_
10	ainsi	ainsi	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	conduire	conduire	VNF	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	à	à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	une	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	augmentation	augmentation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	du	de+le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	fitness	fine	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1667
# text = Cependant , des fusions transcriptionnelles entre le promoteur P1 de l'opéron d'ARN ribosomiques rrnB avec le gène rapporteur lacZ , introduites dans le chromosome des souches ancestrales isogéniques
1	Cependant	cependant	ADV	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
4	fusions	fusion	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	transcriptionnelles	transcriptionnel	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	entre	entre	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	le	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	promoteur	promoteur	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	P1	P1	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	opéron	opéron	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	d'	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	ARN	ARN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	ribosomiques	ribosomiques	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	rrnB	rrnB	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
17	avec	avec	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
18	le	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	gène	gène	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	rapporteur	rapporteur	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	lacZ	lacZ	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
23	introduites	introduire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	dans	dans	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	le	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	chromosome	chromosome	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	des	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	souches	souche	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	ancestrales	ancestral	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	isogéniques	isogénique	ADJ	_	_	28	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1668
# text = 606 , 606 fis
1	606	606	NUM	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	,	606 , 606	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	606	606	NUM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1669
# text = - 1 , 606 topA
1	-	-	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
3	,	1 , 606	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	606	606	NUM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	topA	toper	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1670
# text = - 1 , et 606 topA
1	-	-	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	606	606	NUM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
6	topA	toper	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1671
# text = - 1 fis
1	-	-	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1672
# text = - 1 , n'ont révélé aucune différence significative dans l'expression de ce promoteur .
1	-	-	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	n'	ne	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	ont	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	révélé	révéler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	aucune	aucun	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	différence	différence	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	significative	significatif	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	expression	expression	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	ce	ce	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	promoteur	promoteur	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1673
# text = Nous avons également quantifié les contenus cellulaires en ADN , ARN et protéines de ces quatre souches , ce qui n'a également révélé aucune différence .
1	Nous	nous	CLS	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	avons	avoir	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
3	également	également	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	quantifié	quantifier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	contenus	contenu	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	cellulaires	cellulaire	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	en	en	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	ADN	ADN	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
11	ARN	ARN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	protéines	protéine	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	ces	ce	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
16	quatre	quatre	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	souches	souche	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	ce	ce	PRQ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
20	qui	qui	PRQ	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
21	n'	ne	ADV	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
22	a	avoir	VRB	_	_	24	aux	_	_	_	_	_
23	également	également	ADV	_	_	24	periph	_	_	_	_	_
24	révélé	révéler	VPP	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
25	aucune	aucun	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	différence	différence	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1674
# text = Le bénéfice conféré par les mutations fis et topA ne réside donc pas dans une différence phénotypique évidente .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	bénéfice	bénéfice	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	conféré	conférer	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	par	par	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	mutations	mutation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
9	topA	topA	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
10	ne	ne	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	réside	résider	VRB	_	_	7	para	_	_	_	_	_
12	donc	donc	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	pas	pas	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	dans	dans	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	une	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	différence	différence	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	phénotypique	phénotypique	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	évidente	évident	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1675
# text = La superhélicité de l'ADN est connue pour favoriser la transcription de gènes nécessaires à la croissance , comme les opérons d'ARN ribosomiques , notamment lors de l'initiation de la transcription .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	connue	connaître	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	pour	pour	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	favoriser	favoriser	VNF	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	transcription	transcription	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	gènes	gène	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	nécessaires	nécessaire	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	croissance	croissance	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
19	comme	comme	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
20	les	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	opérons	opéron	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	d'	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	ARN	ARN	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	ribosomiques	ribosomiques	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
26	notamment	notamment	ADV	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
27	lors	lors de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
28	de	lors de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	l'	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	initiation	initiation	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	la	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	transcription	transcription	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1676
# text = Ces gènes sont caractérisés par la présence d'un discriminateur riche en GC situé entre la boîte - 10 du promoteur et le site + 1 d'initiation de la transcription .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	gènes	gène	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	caractérisés	caractériser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	présence	présence	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	d'	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	un	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	discriminateur	discriminateur	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	riche	riche	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	en	en	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
13	GC	GC	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	situé	situer	VPP	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	entre	entre	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	boîte	boîte	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	-	- 10	PUNC	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	10	10	NUM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	du	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	promoteur	promoteur	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
23	le	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	site	site	NOM	_	_	21	para	_	_	_	_	_
25	+	+ 1	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	1	1	NUM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	d'	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	initiation	initiation	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	la	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	transcription	transcription	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1677
# text = Ce discriminateur constitue une barrière énergétique qu'il faut surmonter pour l'initiation de la transcription de ces gènes .
1	Ce	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	discriminateur	discriminateur	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	constitue	constituer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	une	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	barrière	barrière	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	énergétique	énergétique	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	qu'	que	PRQ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
8	il	il	CLS	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
9	faut	falloir	VRB	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	surmonter	surmonter	VNF	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	pour	pour	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	initiation	initiation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	transcription	transcription	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	ces	ce	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	gènes	gène	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1678
# text = L'augmentation de superhélicité pourrait ainsi améliorer le taux d'initiation de la transcription de certains de ces gènes .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	augmentation	augmentation	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	ainsi	ainsi	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	améliorer	améliorer	VNF	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	taux	taux	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	d'	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	initiation	initiation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	transcription	transcription	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	certains	certains	PRQ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	ces	ce	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	gènes	gène	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1679
# text = Ceci pourrait conférer un avantage sélectif important d'une part au niveau de la phase de croissance , mais aussi à la reprise de la croissance lors des transferts journaliers des cellules dans du milieu frais .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	conférer	conférer	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	un	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	avantage	avantage	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	sélectif	sélectif	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	important	importer	VPR	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	d'	d'une part	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	une	d'une part	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	part	d'une part	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	au	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	niveau	niveau	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	la	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	phase	phase	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	croissance	croissance	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
19	mais	mais aussi	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
20	aussi	mais aussi	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	à	à	PRE	_	_	13	para	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	reprise	reprise	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	croissance	croissance	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	lors	lors de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
28	des	lors de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	transferts	transfert	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	journaliers	journalier	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	des	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	cellules	cellule	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	dans	dans	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	du	de+le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	milieu	milieu	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	frais	frais	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1680
# text = Nous avons montré que le bénéfice apporté par une augmentation de la superhélicité de l'ADN était associé à des mutations apparues non pas dans l'ensemble des gènes régulant la superhélicité , mais spécifiquement dans topA , fis et dusB. Ainsi , des fonctions spécifiques de ces trois gènes pourraient avoir été soumises à pression de sélection au cours de cette évolution expérimentale .
1	Nous	nous	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	avons	avoir	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	montré	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	que	que	CSU	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	le	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	bénéfice	bénéfice	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
7	apporté	apporter	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	par	par	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	une	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	augmentation	augmentation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	ADN	ADN	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	était	être	VRB	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
18	associé	associer	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
19	à	à	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	des	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	mutations	mutation	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	apparues	apparaître	VPP	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	non	non	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	pas	pas	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	dans	dans	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	l'	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	ensemble	ensemble	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	des	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	gènes	gène	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	régulant	réguler	VPR	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	la	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
34	mais	mais	COO	_	_	36	mark	_	_	_	_	_
35	spécifiquement	spécifiquement	ADV	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	dans	dans	PRE	_	_	18	para	_	_	_	_	_
37	topA	topA	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	,	,	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
39	fis	faire	VRB	_	_	3	para	_	_	_	_	_
40	et	et	COO	_	_	51	mark	_	_	_	_	_
41	dusB.	dusB.	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	Ainsi	Ainsi	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	,	,	PUNC	_	_	51	punc	_	_	_	_	_
44	des	un	DET	_	_	45	spe	_	_	_	_	_
45	fonctions	fonction	NOM	_	_	51	subj	_	_	_	_	_
46	spécifiques	spécifique	ADJ	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	de	de	PRE	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
48	ces	ce	DET	_	_	50	spe	_	_	_	_	_
49	trois	trois	NUM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
50	gènes	gène	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
51	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	39	para	_	_	_	_	_
52	avoir	avoir	VNF	_	_	53	aux	_	_	_	_	_
53	été	être	VPP	_	_	54	aux	_	_	_	_	_
54	soumises	soumettre	VPP	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
55	à	à	PRE	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	pression	pression	NOM	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
57	de	de	PRE	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
58	sélection	sélection	NOM	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
59	au	au cours de	PRE	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
60	cours	au cours de	NOM	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
61	de	au cours de	PRE	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
62	cette	ce	DET	_	_	63	spe	_	_	_	_	_
63	évolution	évolution	NOM	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
64	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
65	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1681
# text = Les allèles évolués des gènes topA et fis pourraient entraîner des modifications du profil d'expression globale , dont certaines pourraient conférer une augmentation du fitness .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	allèles	allèle	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	évolués	évolué	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	gènes	gène	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	topA	toper	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	fis	faire	VRB	_	_	6	para	_	_	_	_	_
9	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	entraîner	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	des	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	modifications	modification	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	du	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	profil	profil	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	d'	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	expression	expression	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	globale	global	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
19	dont	dont	PRQ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
20	certaines	certains	PRQ	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
21	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
22	conférer	conférer	VNF	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	une	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	augmentation	augmentation	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	du	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	fitness	fine	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1682
# text = En effet , des mutations du gène topA sont connues pour affecter les profils protéomiques chez les bactéries , et Fis est connue pour réguler la transcription d'un grand nombre de gènes .
1	En	en effet	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	mutations	mutation	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
6	du	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	gène	gène	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	topA	topA	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	sont	être	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	connues	connaître	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	pour	pour	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	affecter	affecter	VNF	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	les	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	profils	profil	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	protéomiques	protéomique	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	chez	chez	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
17	les	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	bactéries	bactérie	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
21	Fis	Fis	NOM	_	_	23	subj	_	_	_	_	_
22	est	être	VRB	_	_	23	aux	_	_	_	_	_
23	connue	connaître	VPP	_	_	10	para	_	_	_	_	_
24	pour	pour	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	réguler	réguler	VNF	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	la	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	transcription	transcription	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	d'	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	un	un	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
30	grand	grand	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	nombre	nombre	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	gènes	gène	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1683
# text = Nous avons démontré au cours de ces travaux que les mutations bénéfiques dans topA et fis provoquaient une diminution de l'activité de la
1	Nous	nous	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	avons	avoir	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	démontré	démontrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	au	au cours de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	cours	au cours de	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	au cours de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ces	ce	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	travaux	travail	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	que	que?	PRQ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	mutations	mutation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	dans	dans	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	topA	topA	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	provoquaient	provoquer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	une	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	diminution	diminution	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	l'	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	activité	activité	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	la	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1684
# text = TopoI ainsi que de Fis .
1	TopoI	TopoI	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	ainsi	ainsi que	COO	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	que	ainsi que	COO	_	_	4	mark	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	1	para	_	_	_	_	_
5	Fis	Fis	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1685
# text = En ce qui concerne Fis , elle est capable de se fixer de façon spécifique sur des sites à haute affinité , mais également de manière aspécifique .
1	En	en	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	ce	ce	PRQ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	qui	qui	PRQ	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	concerne	concerner	VRB	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	Fis	Fis	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	elle	elle	CLS	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
8	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	capable	capable	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	se	se	CLI	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	fixer	fixer	VNF	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	façon	façon	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	spécifique	spécifique	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	sur	sur	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	des	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	sites	site	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	à	à	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	haute	haut	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	affinité	affinité	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
23	mais	mais	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
24	également	également	ADV	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	13	para	_	_	_	_	_
26	manière	manière	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	aspécifique	aspécifique	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1686
# text = De plus , l'affinité de Fis pour ses différents sites de fixation est très variable ( Muskhelishvili et Travers , 2003 ) .
1	De	de plus	PRE	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
2	plus	de plus	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	affinité	affinité	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	Fis	Fis	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	pour	pour	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	ses	son	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
10	différents	différent	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	sites	site	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	fixation	fixation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	très	très	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	variable	variable	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	(	(	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	Muskhelishvili	Muskhelishvili	NOM	_	_	14	parenth	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
20	Travers	Travers	NOM	_	_	18	para	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	2003	2003	NUM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	)	)	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1687
# text = La diminution de la quantité ou de l'activité de Fis ne pourrait donc affecter qu'un certain nombre de sites à plus faible affinité et de ce fait ne modifier la transcription que de cette catégorie de gènes dépendants de Fis .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	diminution	diminution	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	quantité	quantité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	ou	ou	COO	_	_	7	mark	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	3	para	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	activité	activité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	Fis	Fis	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	ne	ne	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	donc	donc	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	affecter	affecter	VNF	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	qu'	que	ADV	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	un	un	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
18	certain	certain	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	nombre	nombre	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	sites	site	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	à	à	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	plus	plus	ADV	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	faible	faible	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	affinité	affinité	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	et	et	COO	_	_	31	mark	_	_	_	_	_
27	de	de ce fait	ADV	_	_	31	periph	_	_	_	_	_
28	ce	de ce fait	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	fait	de ce fait	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	ne	ne	ADV	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	modifier	modifier	VNF	_	_	15	para	_	_	_	_	_
32	la	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	transcription	transcription	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	que	que	ADV	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
35	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
36	cette	ce	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	catégorie	catégorie	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	gènes	gène	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	dépendants	dépendant	ADJ	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	de	de	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	Fis	Fis	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1688
# text = La transcription des gènes d'opérons d'ARN ribosomiques ne serait ainsi pas affectée .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	transcription	transcription	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	gènes	gène	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	d'	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	opérons	opéron	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	ARN	ARN	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	ribosomiques	ribosomiques	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	ne	ne	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
11	serait	être	VRB	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
12	ainsi	ainsi	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	pas	pas	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	affectée	affecter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1689
# text = Enfin , le bénéfice apporté par ces mutations pourrait être lié à un effet sur la structure globale du chromosome .
1	Enfin	enfin	ADV	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	le	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	bénéfice	bénéfice	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
5	apporté	apporter	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ces	ce	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	mutations	mutation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	être	être	VNF	_	_	11	aux	_	_	_	_	_
11	lié	lier	VPP	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	à	à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	un	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	effet	effet	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	sur	sur	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	structure	structure	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	globale	global	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	du	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	chromosome	chromosome	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1690
# text = En effet , Fis est impliquée dans la formation de domaines topologiques et constitue une barrière à ces domaines ( Hardy et Cozzarelli , 2005 ) .
1	En	en effet	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	est	être	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	impliquée	impliquer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	dans	dans	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	formation	formation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	domaines	domaine	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	topologiques	topologique	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	constitue	constituer	VRB	_	_	6	para	_	_	_	_	_
15	une	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	barrière	barrière	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	à	à	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	ces	ce	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	domaines	domaine	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	(	(	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	Hardy	Hardy	NOM	_	_	19	parenth	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	21	para	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	2005	2005	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	)	)	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1691
# text = La diminution de quantité ou d'activité de liaison à l'ADN de Fis pourrait diminuer le nombre de barrières topologiques et , dans les conditions de l'évolution expérimentale , ceci pourrait avoir un effet bénéfique en accélérant les processus de réplication du chromosome en limitant les pauses du complexe de réplication dues à la présence de ces barrières .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	diminution	diminution	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	quantité	quantité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ou	ou	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	d'	de	PRE	_	_	3	para	_	_	_	_	_
7	activité	activité	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	liaison	liaison	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	ADN	ADN	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	Fis	Fis	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	diminuer	diminuer	VNF	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	le	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	nombre	nombre	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	barrières	barrière	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	topologiques	topologique	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	33	mark	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
24	dans	dans	PRE	_	_	33	periph	_	_	_	_	_
25	les	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	conditions	condition	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	l'	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	évolution	évolution	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
32	ceci	ceci	PRQ	_	_	33	subj	_	_	_	_	_
33	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	16	para	_	_	_	_	_
34	avoir	avoir	VNF	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	un	un	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	effet	effet	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	bénéfique	bénéfique	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	en	en	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
39	accélérant	accélérer	VPR	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	les	le	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	processus	processus	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	de	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	réplication	réplication	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	du	de	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	chromosome	chromosome	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	en	en	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
47	limitant	limiter	VPR	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	les	le	DET	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
49	pauses	pause	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	du	de	PRE	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	complexe	complexe	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	de	de	PRE	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	réplication	réplication	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	dues	devoir	VPP	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
55	à	à	PRE	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	la	le	DET	_	_	57	spe	_	_	_	_	_
57	présence	présence	NOM	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
58	de	de	PRE	_	_	57	dep	_	_	_	_	_
59	ces	ce	DET	_	_	60	spe	_	_	_	_	_
60	barrières	barrière	NOM	_	_	58	dep	_	_	_	_	_
61	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1692
# text = L'augmentation de superhélicité de l'ADN via les allèles évolués de topA pourrait également favoriser une structure chromosomique permettant une meilleure ségrégation des chromosomes-fils au moment de la division cellulaire .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	augmentation	augmentation	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ADN	ADN	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	via	via	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
9	les	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	allèles	allèle	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	évolués	évolué	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	topA	topA	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	également	également	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	favoriser	favoriser	VNF	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	une	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	structure	structure	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	chromosomique	chromosomique	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	permettant	permettre	VPR	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	une	un	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
22	meilleure	meilleur	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	ségrégation	ségrégation	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	des	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	chromosomes-fils	chromosome-fils	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	au	au moment de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	moment	au moment de	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	de	au moment de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	la	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	division	division	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	cellulaire	cellulaire	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1693
# text = En effet , lors d'une augmentation de superhélicité , l'efficacité de décaténation des chromosomes-fils augmente de manière exponentielle avec la longueur de l'ADN .
1	En	en effet	PRE	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
2	effet	en effet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	lors	lors de	PRE	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
5	d'	lors de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	augmentation	augmentation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	efficacité	efficacité	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	décaténation	décaténation	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	des	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	chromosomes-fils	chromosome-fils	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	augmente	augmenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	manière	manière	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	avec	avec	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	longueur	longueur	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	l'	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	ADN	ADN	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1694
# text = La superhélicité de l'ADN dans la nature
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	dans	dans	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	nature	nature	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1695
# text = Nous avons observé une augmentation systématique de la superhélicité dans 10 des 12 populations d'évolution , ces modifications étant bénéfiques dans ces conditions .
1	Nous	nous	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	avons	avoir	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	observé	observer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	une	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	augmentation	augmentation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	systématique	systématique	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
11	10	10	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	des	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	12	12	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	populations	population	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	d'	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	évolution	évolution	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
18	ces	ce	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	modifications	modification	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
20	étant	être	VPR	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	dans	dans	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	ces	ce	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	conditions	condition	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1696
# text = Afin d'étendre ces résultats à d'autres environnements , des expériences de compétitions ont été réalisées dans différents milieux avec les souches ancêtres portant les allèles évolués de fis et topA identifiés dans la population Ara- 1
1	Afin	afin de	PRE	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
2	d'	afin de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	étendre	étendre	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ces	ce	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	résultats	résultat	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	à	à	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	d'	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
8	autres	autre	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	environnements	environnement	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
11	des	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	expériences	expérience	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	compétitions	compétition	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	ont	avoir	VRB	_	_	16	aux	_	_	_	_	_
16	été	être	VPP	_	_	17	aux	_	_	_	_	_
17	réalisées	réaliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	dans	dans	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	différents	différent	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	milieux	milieu	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	avec	avec	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
22	les	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	souches	souche	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	ancêtres	ancêtre	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	portant	porter	VPR	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	les	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	allèles	allèle	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	évolués	évolué	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
30	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
31	et	et	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
32	topA	topA	ADV	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
33	identifiés	identifier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
34	dans	dans	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	la	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	population	population	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	Ara-	Ara-	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	1	1	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1697
# text = ( Résultats Partie II ) .
1	(	(	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
2	Résultats	Résultats	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	Partie	Partie	NOM	_	_	2	parenth	_	_	_	_	_
4	II	II	ADJ	_	_	3	para	_	_	_	_	_
5	)	)	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1698
# text = Quelles que soient les conditions ( milieu riche , source de carbone différente ou basse température ) , les deux mutations se sont révélées bénéfiques .
1	Quelles	quel?	ADJ	_	_	24	periph	_	_	_	_	_
2	que	que	PRQ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	soient	être	VRB	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	conditions	condition	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
6	(	(	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	milieu	milieu	NOM	_	_	5	parenth	_	_	_	_	_
8	riche	riche	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	source	source	NOM	_	_	7	para	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	carbone	carbone	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	différente	différent	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	ou	ou	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
15	basse	bas	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	température	température	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
17	)	)	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
19	les	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
20	deux	deux	NUM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	mutations	mutation	NOM	_	_	24	subj	_	_	_	_	_
22	se	se	CLI	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
23	sont	être	VRB	_	_	24	aux	_	_	_	_	_
24	révélées	révéler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
25	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1699
# text = Il semblerait donc qu'une augmentation de superhélicité soit bénéfique dans une grande variété d'environnements .
1	Il	il	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	semblerait	sembler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	donc	donc	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	qu'	que	CSU	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	augmentation	augmentation	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	soit	être	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
10	bénéfique	bénéfique	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	dans	dans	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	une	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
13	grande	grand	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	variété	variété	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	d'	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	environnements	environnement	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1700
# text = Les bactéries , dans leur environnement naturel , sont confrontées à des fluctuations des conditions externes ( carences nutritionnelles , apports nutritifs , stress de température , oxydatif , osmotique ... ) .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	bactéries	bactérie	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	dans	dans	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
5	leur	son	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	environnement	environnement	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	naturel	naturel	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
9	sont	être	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	confrontées	confronter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	à	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	des	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	fluctuations	fluctuation	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	des	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	conditions	condition	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	externes	externe	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	(	(	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
18	carences	carence	NOM	_	_	15	parenth	_	_	_	_	_
19	nutritionnelles	nutritionnel	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	apports	apport	NOM	_	_	19	para	_	_	_	_	_
22	nutritifs	nutritif	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	stress	stress	NOM	_	_	22	para	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	température	température	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
28	oxydatif	oxydatif	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
30	osmotique	osmotique	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
31	...	...	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
32	)	)	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1701
# text = Cela se traduit par une forte diversité des réseaux de régulation dans les isolats naturels , par exemple des niveaux relatifs de RpoS et RpoD , ce qui conduit alors à des compromis évolutifs entre croissance et survie .
1	Cela	cela	PRQ	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	se	se	CLI	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	traduit	traduire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	par	par	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
6	forte	fort	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	diversité	diversité	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	des	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	réseaux	réseau	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	régulation	régulation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	dans	dans	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
13	les	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	isolats	isolat	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	naturels	naturel	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
17	par	par	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	exemple	exemple	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	des	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	niveaux	niveau	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	relatifs	relatif	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	RpoS	RpoS	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
25	RpoD	RpoD	NOM	_	_	23	para	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
27	ce	ce	PRQ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
28	qui	qui	PRQ	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
29	conduit	conduire	VRB	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	alors	alors	ADV	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	à	à	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
32	des	un	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	compromis	compromis	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	évolutifs	évolutif	ADJ	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	entre	entre	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	croissance	croissance	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	et	et	COO	_	_	38	mark	_	_	_	_	_
38	survie	survie	NOM	_	_	36	para	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1702
# text = L'implication évidente de la superhélicité de l'ADN dans les processus évolutifs pourrait se traduire de la même façon dans les isolats naturels par un polymorphisme important du niveau de superhélicité .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	implication	implication	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
3	évidente	évident	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	ADN	ADN	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
11	les	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	processus	processus	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	évolutifs	évolutif	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	se	se	CLI	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	traduire	traduire	VNF	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
19	même	même	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	façon	façon	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	dans	dans	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
22	les	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	isolats	isolat	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	naturels	naturel	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	par	par	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	un	un	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	polymorphisme	polymorphisme	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	important	important	ADJ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	du	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	niveau	niveau	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1703
# text = Cela permettrait alors des compromis évolutifs et une adaptation appropriée à différents types d'environnements .
1	Cela	cela	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	permettrait	permettre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	alors	alors	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	des	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	compromis	compromis	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	évolutifs	évolutif	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
8	une	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	adaptation	adaptation	NOM	_	_	5	para	_	_	_	_	_
10	appropriée	approprier	VPP	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	à	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	différents	différent	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	types	type	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	d'	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	environnements	environnement	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1704
# text = Perspectives
1	Perspectives	perspective	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1705
# text = Le but principal de cette expérience d'évolution en laboratoire étant de comprendre les mécanismes d'adaptation des bactéries à leur environnement , il est crucial de disséquer les différentes étapes de l'évolution , en essayant de comprendre les effets des différentes mutations bénéfiques les unes par rapport aux autres .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	but	but	NOM	_	_	25	periph	_	_	_	_	_
3	principal	principal	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	cette	ce	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	expérience	expérience	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	évolution	évolution	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	en	en	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	laboratoire	laboratoire	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	étant	être	VPR	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	comprendre	comprendre	VNF	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	mécanismes	mécanisme	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	d'	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	adaptation	adaptation	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	bactéries	bactérie	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	à	à	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	leur	son	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	environnement	environnement	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
24	il	il	CLS	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
25	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	crucial	crucial	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	disséquer	disséquer	VNF	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	les	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
30	différentes	différent	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	étapes	étape	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	l'	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	évolution	évolution	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	,	,	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
36	en	en	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
37	essayant	essayer	VPR	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	comprendre	comprendre	VNF	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	les	le	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	effets	effet	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
42	des	de	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	différentes	différent	ADJ	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
44	mutations	mutation	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	bénéfiques	bénéfique	ADJ	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	les	le	DET	_	_	47	spe	_	_	_	_	_
47	unes	une	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
48	par	par rapport à	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
49	rapport	par rapport à	DET	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	aux	par rapport à	PRE	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	autres	autre	ADJ	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
52	.	.	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1706
# text = L'histoire évolutive d'une population peut notamment être reconstruite .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	histoire	histoire	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	évolutive	évolutif	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	population	population	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	peut	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	notamment	notamment	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	être	être	VNF	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
10	reconstruite	reconstruire	VPP	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1707
# text = Par exemple dans notre population modèle , une dizaine de mutations conférant une augmentation du fitness ont été caractérisées .
1	Par	par	PRE	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
2	exemple	exemple	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	dans	dans	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	notre	son	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	population	population	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	modèle	modèle	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
8	une	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	dizaine	dizaine	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	mutations	mutation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	conférant	conférer	VPR	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	une	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	augmentation	augmentation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	du	de+le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	fitness	fine	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	ont	avoir	VRB	_	_	18	aux	_	_	_	_	_
18	été	être	VPP	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
19	caractérisées	caractériser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1708
# text = Un des projets du laboratoire est de les introduire une par une , dans leur ordre d'apparition , dans la souche ancêtre , et en parallèle , d'introduire chacune de ces mutations séparément dans l'ancêtre .
1	Un	un	PRQ	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
2	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	projets	projet	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	du	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	laboratoire	laboratoire	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	les	le	CLI	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	introduire	introduire	VNF	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	une	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	par	par	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
12	une	une	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
14	dans	dans	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
15	leur	son	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	ordre	ordre	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	d'	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	apparition	apparition	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	dans	dans	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	souche	souche	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
26	en	en	PRE	_	_	20	para	_	_	_	_	_
27	parallèle	parallèle	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	d'	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	introduire	introduire	VNF	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	chacune	chacun	PRQ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	ces	ce	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	mutations	mutation	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	séparément	séparément	ADV	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
36	dans	dans	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
37	l'	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1709
# text = Leur effet pourra alors être analysé à deux niveaux :
1	Leur	son	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	effet	effet	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	pourra	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	alors	alors	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	être	être	VNF	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	analysé	analyser	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	deux	deux	NUM	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	niveaux	niveau	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	:	:	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1710
# text = dans le contexte génétique de l'ancêtre , et dans le contexte génétique où elle est apparue .
1	dans	dans	PRE	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
2	le	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	contexte	contexte	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	génétique	génétique	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	5	para	_	_	_	_	_
11	le	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	contexte	contexte	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	génétique	génétique	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	où	où	PRQ	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
15	elle	elle	CLS	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
16	est	être	VRB	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
17	apparue	apparaître	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1711
# text = Dans le cas particulier des mutations fis et topA , l'étude de leurs effets sur les domaines topologiques et la mise en place de barrières de ces domaines devrait être envisagée .
1	Dans	dans	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	le	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	cas	cas	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
4	particulier	particulier	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	mutations	mutation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
9	topA	topA	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	étude	étude	NOM	_	_	30	subj	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	leurs	son	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	effets	effet	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	sur	sur	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	les	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	domaines	domaine	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	topologiques	topologique	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	mise	mise	NOM	_	_	18	para	_	_	_	_	_
23	en	en	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	place	place	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	barrières	barrière	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	ces	ce	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	domaines	domaine	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	devrait	devoir	VRB	_	_	7	para	_	_	_	_	_
31	être	être	VNF	_	_	32	aux	_	_	_	_	_
32	envisagée	envisager	VPP	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1712
# text = Ceci pourrait par exemple se faire de deux façons , qui ont été décrites dans l'introduction , soit par l'étude des événements de recombinaison entre sites res , soit par l'étude du profil de transcription de gènes sensibles à la superhélicité avant et après coupure du chromosome par une enzyme de restriction .
1	Ceci	ceci	PRQ	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	par	par exemple	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	exemple	par exemple	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	se	se	CLI	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	faire	faire	VNF	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	deux	deux	NUM	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	façons	façon	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
11	qui	qui	PRQ	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
12	ont	avoir	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	été	être	VPP	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	décrites	décrire	VPP	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
15	dans	dans	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	introduction	introduction	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
19	soit	soit	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
20	par	par	PRE	_	_	7	para	_	_	_	_	_
21	l'	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	étude	étude	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	des	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	événements	événement	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	entre	entre	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	sites	site	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	res	ré	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
31	soit	soit	COO	_	_	32	mark	_	_	_	_	_
32	par	par	PRE	_	_	23	para	_	_	_	_	_
33	l'	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	étude	étude	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	du	de	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	profil	profil	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	transcription	transcription	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	de	de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	gènes	gène	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	sensibles	sensible	ADJ	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	à	à	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	la	le	DET	_	_	44	spe	_	_	_	_	_
44	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
45	avant	avant	PRE	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	et	et	COO	_	_	47	mark	_	_	_	_	_
47	après	après	PRE	_	_	45	para	_	_	_	_	_
48	coupure	coupure	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
49	du	de	PRE	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	chromosome	chromosome	NOM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	par	par	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	une	un	DET	_	_	53	spe	_	_	_	_	_
53	enzyme	enzyme	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
54	de	de	PRE	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	restriction	restriction	NOM	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1713
# text = L'effet des mutations fis et topA sur la réplication et la ségrégation des chromosomes pourrait également être étudié .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	effet	effet	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	mutations	mutation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
7	topA	topA	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
8	sur	sur	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	réplication	réplication	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	ségrégation	ségrégation	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
14	des	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	chromosomes	chromosome	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	5	para	_	_	_	_	_
17	également	également	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	être	être	VNF	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
19	étudié	étudier	VPP	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1714
# text = Concernant la protéine Fis , son rôle sur l'expression des porines reste à élucider , en tentant par exemple d'identifier les conditions dans lesquelles cette protéine régule les gènes ompF , ompC et ompR chez E. coli K12 , ainsi qu'un rôle éventuel dans la traduction des ARNm .
1	Concernant	concerner	VPR	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	la	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	protéine	protéine	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
6	son	son	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	rôle	rôle	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
8	sur	sur	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	expression	expression	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	des	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	porines	purine	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	reste	rester	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	à	à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	élucider	élucider	VNF	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
17	en	en	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	tentant	tenter	VPR	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	par	par exemple	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	exemple	par exemple	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	d'	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	identifier	identifier	VNF	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	les	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	conditions	condition	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	dans	dans	PRE	_	_	29	periph	_	_	_	_	_
26	lesquelles	lequel	PRQ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	cette	ce	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	protéine	protéine	NOM	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
29	régule	réguler	VRB	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
30	les	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	gènes	gène	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	ompF	ompF	ADJ	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
34	ompC	ompC	ADJ	_	_	32	para	_	_	_	_	_
35	et	et	COO	_	_	36	mark	_	_	_	_	_
36	ompR	ompR	ADJ	_	_	34	para	_	_	_	_	_
37	chez	chez	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
38	E.	E.	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
39	coli	coli	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	K12	K12	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	,	,	PUNC	_	_	45	punc	_	_	_	_	_
42	ainsi	ainsi que	COO	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
43	qu'	ainsi que	COO	_	_	45	mark	_	_	_	_	_
44	un	un	DET	_	_	45	spe	_	_	_	_	_
45	rôle	rôle	NOM	_	_	29	para	_	_	_	_	_
46	éventuel	éventuel	ADJ	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	dans	dans	PRE	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
48	la	le	DET	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
49	traduction	traduction	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	des	de	PRE	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	ARNm	ARNm	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1715
# text = La seconde découverte liée à Fis est son rôle commun potentiel avec DusB. La construction d'une des mutations isolées dans le gène dusB est en cours , et son rôle sur le fitness et la superhélicité de l'ADN sera étudié .
1	La	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	seconde	second	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	découverte	découverte	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
4	liée	lier	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	à	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	Fis	Fis	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	son	son	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	rôle	rôle	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	commun	commun	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	potentiel	potentiel	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	avec	avec	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	DusB.	DusB.	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	La	La	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	construction	construction	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	d'	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	une	un	PRQ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	des	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	mutations	mutation	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	isolées	isoler	VPP	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	dans	dans	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	le	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	gène	gène	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	dusB	dusB	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	est	est	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	en	en	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
27	cours	cours	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	42	punc	_	_	_	_	_
29	et	et	COO	_	_	42	mark	_	_	_	_	_
30	son	son	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	rôle	rôle	NOM	_	_	42	subj	_	_	_	_	_
32	sur	sur	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	le	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	fitness	fine	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	et	et	COO	_	_	37	mark	_	_	_	_	_
36	la	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
37	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	34	para	_	_	_	_	_
38	de	de	PRE	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	l'	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
40	ADN	ADN	NOM	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
41	sera	être	VRB	_	_	42	aux	_	_	_	_	_
42	étudié	étudier	VPP	_	_	7	para	_	_	_	_	_
43	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1716
# text = De futures études pourraient également porter sur l'influence des mutations localisées dans dusB sur la traduction de l'ARNm de fis .
1	De	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	futures	futur	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	études	étude	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	pourraient	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	également	également	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	porter	porter	VNF	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	sur	sur	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	influence	influence	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	des	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	mutations	mutation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
12	localisées	localiser	VPP	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	dans	dans	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	dusB	dusB	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	sur	sur	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	traduction	traduction	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	ARNm	ARNm	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1717
# text = Enfin , la topologie de l'ADN dans des isolats naturels pourrait être étudiée , afin tout d'abord de voir comment le niveau de superhélicité varie entre différents isolats , et ensuite de tester si une augmentation de superhélicité serait bénéfique , dans des isolats pathogènes ou dans différentes conditions de croissance par exemple .
1	Enfin	enfin	ADV	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	topologie	topologie	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ADN	ADN	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	des	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	isolats	isolat	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	naturels	naturel	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	être	être	VNF	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	étudiée	étudier	VPP	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
16	afin	afin	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	tout	tout d'abord	NOM	_	_	27	periph	_	_	_	_	_
18	d'	tout d'abord	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	abord	tout d'abord	ADV	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	27	subj	_	_	_	_	_
21	voir	voir	VNF	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	comment	comment?	ADV	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	le	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	niveau	niveau	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	varie	varier	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
28	entre	entre	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	différents	différent	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	isolats	isolat	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
32	et	et	COO	_	_	34	mark	_	_	_	_	_
33	ensuite	ensuite	ADV	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	27	para	_	_	_	_	_
35	tester	tester	VNF	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	si	si	CSU	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	une	un	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	augmentation	augmentation	NOM	_	_	41	subj	_	_	_	_	_
39	de	de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	serait	être	VRB	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
42	bénéfique	bénéfique	ADJ	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	,	,	PUNC	_	_	44	punc	_	_	_	_	_
44	dans	dans	PRE	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
45	des	un	DET	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
46	isolats	isolat	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
47	pathogènes	pathogène	ADJ	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	ou	ou	COO	_	_	49	mark	_	_	_	_	_
49	dans	dans	PRE	_	_	44	para	_	_	_	_	_
50	différentes	différent	DET	_	_	51	spe	_	_	_	_	_
51	conditions	condition	NOM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
52	de	de	PRE	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	croissance	croissance	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	par	par	PRE	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	exemple	exemple	NOM	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	.	.	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1718
# text = Références Bibliographiques
1	Références	référence	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bibliographiques	Bibliographiques	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1719
# text = Adams DE , Shekhtman EM , Zechiedrich EL , Schmid MB , Cozzarelli NR. 1992 .
1	Adams	adams	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	DE	DE	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Shekhtman	Shekhtman	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	EM	EM	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Zechiedrich	Zechiedrich	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	EL	EL	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Schmid	Schmid	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	MB	MB	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	NR.	NR.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	1992	1992	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1720
# text = The role of topoisomerase IV in partitioning bacterial replicons and the structure of catenated intermediates in DNA replication .
1	The	the role of topoisomerase iv in partitioning bacterial replicons and the structure of catenated intermediates in dna replication	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
2	role	the role of topoisomerase iv in partitioning bacterial replicons and the structure of catenated intermediates in dna replication	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
3	of	the role of topoisomerase iv in partitioning bacterial replicons and the structure of catenated intermediates in dna replication	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
4	topoisomerase	the role of topoisomerase iv in partitioning bacterial replicons and the structure of catenated intermediates in dna replication	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
5	IV	IV	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
6	in	the role of topoisomerase iv in partitioning bacterial replicons and the structure of catenated intermediates in dna replication	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
7	partitioning	the role of topoisomerase iv in partitioning bacterial replicons and the structure of catenated intermediates in dna replication	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
8	bacterial	the role of topoisomerase iv in partitioning bacterial replicons and the structure of catenated intermediates in dna replication	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
9	replicons	the role of topoisomerase iv in partitioning bacterial replicons and the structure of catenated intermediates in dna replication	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
10	and	the role of topoisomerase iv in partitioning bacterial replicons and the structure of catenated intermediates in dna replication	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
11	the	the role of topoisomerase iv in partitioning bacterial replicons and the structure of catenated intermediates in dna replication	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
12	structure	the role of topoisomerase iv in partitioning bacterial replicons and the structure of catenated intermediates in dna replication	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
13	of	the role of topoisomerase iv in partitioning bacterial replicons and the structure of catenated intermediates in dna replication	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
14	catenated	the role of topoisomerase iv in partitioning bacterial replicons and the structure of catenated intermediates in dna replication	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
15	intermediates	the role of topoisomerase iv in partitioning bacterial replicons and the structure of catenated intermediates in dna replication	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
16	in	the role of topoisomerase iv in partitioning bacterial replicons and the structure of catenated intermediates in dna replication	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
17	DNA	DNA	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	replication	the role of topoisomerase iv in partitioning bacterial replicons and the structure of catenated intermediates in dna replication	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1721
# text = Cell 71 :
1	Cell	cell	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	71	71	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1722
# text = 277 - 288 .
1	277	277	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	277 - 288	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	288	288	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1723
# text = Ahumada A , Tse-Dinh YC. 1998 .
1	Ahumada	ahumada	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	A	A	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
4	Tse-Dinh	Tse-Dinh	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	YC.	YC.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	1998	1998	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1724
# text = The Zn ( II ) binding motifs of Escherichia coli DNA topoisomerase I is part of a high-affinity DNA binding domain .
1	The	the zn	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	Zn	Zn	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	(	(	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	II	II	ADJ	_	_	21	parenth	_	_	_	_	_
5	)	)	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
6	binding	binding motifs of escherichia coli dna topoisomerase i is part of a high-affinity dna binding domain	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
7	motifs	binding motifs of escherichia coli dna topoisomerase i is part of a high-affinity dna binding domain	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
8	of	binding motifs of escherichia coli dna topoisomerase i is part of a high-affinity dna binding domain	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
9	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
10	coli	binding motifs of escherichia coli dna topoisomerase i is part of a high-affinity dna binding domain	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
11	DNA	DNA	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
12	topoisomerase	binding motifs of escherichia coli dna topoisomerase i is part of a high-affinity dna binding domain	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
13	I	I	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
14	is	binding motifs of escherichia coli dna topoisomerase i is part of a high-affinity dna binding domain	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
15	part	binding motifs of escherichia coli dna topoisomerase i is part of a high-affinity dna binding domain	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
16	of	binding motifs of escherichia coli dna topoisomerase i is part of a high-affinity dna binding domain	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
17	a	binding motifs of escherichia coli dna topoisomerase i is part of a high-affinity dna binding domain	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
18	high-affinity	binding motifs of escherichia coli dna topoisomerase i is part of a high-affinity dna binding domain	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
19	DNA	DNA	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
20	binding	binding motifs of escherichia coli dna topoisomerase i is part of a high-affinity dna binding domain	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	domain	binding motifs of escherichia coli dna topoisomerase i is part of a high-affinity dna binding domain	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1725
# text = Biochem .
1	Biochem	Biochem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1726
# text = Biophys .
1	Biophys	Biophys	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1727
# text = Res .
1	Res	ré	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1728
# text = Commun .
1	Commun	commun	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1729
# text = 251 :
1	251	251	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1730
# text = 509 - 514 .
1	509	509	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	509 - 514	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	514	514	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1731
# text = Aiba H , Mizuno T. 1990 .
1	Aiba	Aiba	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	H	H	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Mizuno	Mizuno	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	T.	T.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1990	1990	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1732
# text = Phosphorylation of a bacterial activator protein , OmpR , by a protein kinase , EnvZ , stimulates the transcription of the ompF and ompC genes in Escherichia coli .
1	Phosphorylation	phosphorylation of a bacterial activator protein	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
2	of	phosphorylation of a bacterial activator protein	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
3	a	phosphorylation of a bacterial activator protein	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
4	bacterial	phosphorylation of a bacterial activator protein	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
5	activator	phosphorylation of a bacterial activator protein	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	protein	phosphorylation of a bacterial activator protein	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
8	OmpR	OmpR	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
10	by	By	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
11	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	protein	protéine	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	kinase	kinase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
15	EnvZ	EnvZ	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
17	stimulates	stimulates the transcription of the ompf and ompc genes in escherichia coli	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
18	the	stimulates the transcription of the ompf and ompc genes in escherichia coli	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
19	transcription	stimulates the transcription of the ompf and ompc genes in escherichia coli	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
20	of	stimulates the transcription of the ompf and ompc genes in escherichia coli	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
21	the	stimulates the transcription of the ompf and ompc genes in escherichia coli	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
22	ompF	stimulates the transcription of the ompf and ompc genes in escherichia coli	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
23	and	stimulates the transcription of the ompf and ompc genes in escherichia coli	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
24	ompC	stimulates the transcription of the ompf and ompc genes in escherichia coli	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
25	genes	stimulates the transcription of the ompf and ompc genes in escherichia coli	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
26	in	stimulates the transcription of the ompf and ompc genes in escherichia coli	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
27	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	coli	stimulates the transcription of the ompf and ompc genes in escherichia coli	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1733
# text = FEBS Lett .
1	FEBS	FEBS	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Lett	Lett	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1734
# text = 261 :
1	261	261	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1735
# text = 19 - 22 .
1	19	19	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	-	19 - 22 .	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	22	22	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	.	19 - 22 .	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1736
# text = Aiyar SE , McLeod SM , Ross W , Hirvonen CA , Thomas MS , Johnson RC , Gourse RL. 2002 .
1	Aiyar	Aiyar	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	SE	SE	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	McLeod	McLeod	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	SM	SM	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Ross	Ross	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	W	W	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
10	Hirvonen	Hirvonen	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	CA	CA	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
13	Thomas	Thomas	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	MS	MS	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
16	Johnson	Johnson	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	RC	RC	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Gourse	Gourse	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
20	RL.	RL.	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	2002	2002	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1737
# text = Architecture of Fis-activated transcription complexes at the Escherichia coli rr B P1 and rrnE P1 promoters .
1	Architecture	architecture of fis-activated	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	of	architecture of fis-activated	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	Fis-activated	Fis-activated	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	transcription	transcription	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	complexes	complexe	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	at	avoir	VRB	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	the	the escherichia coli rr b p1 and rrne p1 promoters	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
8	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
9	coli	the escherichia coli rr b p1 and rrne p1 promoters	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
10	rr	the escherichia coli rr b p1 and rrne p1 promoters	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
11	B	B	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
12	P1	P1	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
13	and	the escherichia coli rr b p1 and rrne p1 promoters	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
14	rrnE	the escherichia coli rr b p1 and rrne p1 promoters	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
15	P1	P1	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	promoters	the escherichia coli rr b p1 and rrne p1 promoters	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1738
# text = J. Mol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Mol	Mol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1739
# text = Biol .
1	Biol	biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1740
# text = 316 :
1	316	316	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1741
# text = 501 - 516 .
1	501	501	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	501 - 516	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	516	516	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1742
# text = Alexandrov AI , Cozzarelli NR , Holmes VF , Khodursky AB , Peter BJ , Postow L , Rybenkov V , Vologodskii AV. 1999 .
1	Alexandrov	alexandrov	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	AI	AI	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	NR	NR	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	Holmes	Holmes	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	VF	VF	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
10	Khodursky	Khodursky	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	AB	AB	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
13	Peter	Peter	VNF	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	BJ	BJ	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
16	Postow	Postow	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	L	L	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
19	Rybenkov	Rybenkov	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
20	V	V	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	Vologodskii	Vologodskii	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
23	AV.	AV.	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	1999	1999	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1743
# text = Mechanisms of separation of the complementary strands of DNA during replication .
1	Mechanisms	mechanisms of separation of the complementary strands of dna during replication	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	of	mechanisms of separation of the complementary strands of dna during replication	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
3	separation	mechanisms of separation of the complementary strands of dna during replication	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
4	of	mechanisms of separation of the complementary strands of dna during replication	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
5	the	mechanisms of separation of the complementary strands of dna during replication	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
6	complementary	mechanisms of separation of the complementary strands of dna during replication	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
7	strands	mechanisms of separation of the complementary strands of dna during replication	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
8	of	mechanisms of separation of the complementary strands of dna during replication	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
9	DNA	DNA	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
10	during	mechanisms of separation of the complementary strands of dna during replication	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	replication	mechanisms of separation of the complementary strands of dna during replication	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1744
# text = Genetica 106 :
1	Genetica	Genetica	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	106	106	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1745
# text = 131 - 140 .
1	131	131	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	131 - 140	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	140	140	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1746
# text = Ali BM , Amit R , Braslavsky I , Oppenheim AB , Gileadi O , Stavans J. 2001 .
1	Ali	Ali	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	BM	BM	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Amit	Amit	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	R	R	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Braslavsky	Braslavsky	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	I	I	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Oppenheim	Oppenheim	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	AB	AB	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Gileadi	Gileadi	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	O	O	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Stavans	Stavans	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	J.	J.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	2001	2001	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1747
# text = Compaction of single DNA molecules induced by binding of integration host factor
1	Compaction	compaction of single dna molecules induced by binding of integration host factor	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	of	compaction of single dna molecules induced by binding of integration host factor	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
3	single	compaction of single dna molecules induced by binding of integration host factor	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
4	DNA	DNA	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
5	molecules	compaction of single dna molecules induced by binding of integration host factor	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
6	induced	compaction of single dna molecules induced by binding of integration host factor	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	by	compaction of single dna molecules induced by binding of integration host factor	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	binding	compaction of single dna molecules induced by binding of integration host factor	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	of	compaction of single dna molecules induced by binding of integration host factor	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	integration	compaction of single dna molecules induced by binding of integration host factor	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	host	compaction of single dna molecules induced by binding of integration host factor	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	factor	compaction of single dna molecules induced by binding of integration host factor	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1748
# text = ( IHF ) .
1	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	IHF	IHF	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1749
# text = Proc .
1	Proc	proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1750
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1751
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1752
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1753
# text = U.S.A 98 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	98	98	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1754
# text = 10658 - 10663 .
1	10658	10658	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	10658 - 10663	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	10663	10663	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1755
# text = Altuvia S , Almiron M , Huisman G , Kolter R , Storz G. 1994 .
1	Altuvia	Altuvia	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	S	S	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Almiron	Almiron	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	M	M	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Huisman	Huisman	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	G	G	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Kolter	Kolter	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	R	R	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Storz	Storz	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	G.	G.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	1994	1994	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1756
# text = The dps promoter is activated by OxyR during growth and by IHF and sigma S in stationary phase .
1	The	the dps promoter is activated by oxyr during growth and by ihf and sigma s in stationary phase	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
2	dps	the dps promoter is activated by oxyr during growth and by ihf and sigma s in stationary phase	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
3	promoter	the dps promoter is activated by oxyr during growth and by ihf and sigma s in stationary phase	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
4	is	the dps promoter is activated by oxyr during growth and by ihf and sigma s in stationary phase	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
5	activated	the dps promoter is activated by oxyr during growth and by ihf and sigma s in stationary phase	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
6	by	the dps promoter is activated by oxyr during growth and by ihf and sigma s in stationary phase	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
7	OxyR	OxyR	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
8	during	the dps promoter is activated by oxyr during growth and by ihf and sigma s in stationary phase	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
9	growth	the dps promoter is activated by oxyr during growth and by ihf and sigma s in stationary phase	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
10	and	the dps promoter is activated by oxyr during growth and by ihf and sigma s in stationary phase	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
11	by	the dps promoter is activated by oxyr during growth and by ihf and sigma s in stationary phase	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
12	IHF	IHF	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
13	and	the dps promoter is activated by oxyr during growth and by ihf and sigma s in stationary phase	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
14	sigma	the dps promoter is activated by oxyr during growth and by ihf and sigma s in stationary phase	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
15	S	S	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
16	in	the dps promoter is activated by oxyr during growth and by ihf and sigma s in stationary phase	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
17	stationary	the dps promoter is activated by oxyr during growth and by ihf and sigma s in stationary phase	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	phase	the dps promoter is activated by oxyr during growth and by ihf and sigma s in stationary phase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1757
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1758
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1759
# text = 13 :
1	13	13	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1760
# text = 265 - 272 .
1	265	265	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	265 - 272	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	272	272	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1761
# text = Aravind L , Leipe DD , Koonin EV. 1998 .
1	Aravind	Aravind	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	L	L	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Leipe	Leipe	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	DD	DD	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Koonin	Koonin	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	EV.	EV.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1998	1998	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1762
# text = Toprim -- conserved catalytic domain in type IA and II topoisomerases , DnaG-type primases , OLD family nucleases and RecR proteins .
1	Toprim	toprim -- conserved catalytic domain in type ia and ii topoisomerases	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
2	--	toprim -- conserved catalytic domain in type ia and ii topoisomerases	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
3	conserved	toprim -- conserved catalytic domain in type ia and ii topoisomerases	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
4	catalytic	toprim -- conserved catalytic domain in type ia and ii topoisomerases	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
5	domain	toprim -- conserved catalytic domain in type ia and ii topoisomerases	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
6	in	toprim -- conserved catalytic domain in type ia and ii topoisomerases	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
7	type	toprim -- conserved catalytic domain in type ia and ii topoisomerases	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
8	IA	IA	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
9	and	toprim -- conserved catalytic domain in type ia and ii topoisomerases	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
10	II	II	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	topoisomerases	toprim -- conserved catalytic domain in type ia and ii topoisomerases	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
13	DnaG-type	DnaG-type	N+V	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	primases	primase	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
16	OLD	OLD	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
17	family	old family nucleases and recr proteins	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
18	nucleases	old family nucleases and recr proteins	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
19	and	old family nucleases and recr proteins	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
20	RecR	RecR	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	proteins	old family nucleases and recr proteins	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1763
# text = Nucleic Acids Res .
1	Nucleic	Nucleic	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Acids	Acids	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Res	Res	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1764
# text = 26 :
1	26	26	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1765
# text = 4205 - 4213 .
1	4205	4205	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	4205 - 4213	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	4213	4213	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1766
# text = Ashizawa Y , Yokochi T , Ogata Y , Shobuike Y , Kato J , Ikeda H. 1999 .
1	Ashizawa	Ashizawa	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Y	Y	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Yokochi	Yokochi	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	T	T	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Ogata	Ogata	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	Y	Y	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Shobuike	Shobuike	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	Y	Y	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Kato	Kato	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	J	J	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Ikeda	Ikeda	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	H.	H.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	1999	1999	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1767
# text = Mechanism of DNA gyrase-mediated illegitimate recombination :
1	Mechanism	mechanism of dna gyrase-mediated illegitimate recombination	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	of	mechanism of dna gyrase-mediated illegitimate recombination	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	DNA	DNA	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	gyrase-mediated	mechanism of dna gyrase-mediated illegitimate recombination	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	illegitimate	mechanism of dna gyrase-mediated illegitimate recombination	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	recombination	mechanism of dna gyrase-mediated illegitimate recombination	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	:	:	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1768
# text = characterization of Escherichia coli gyrA mutations that confer hyper-recombination phenotype .
1	characterization	characterization of escherichia	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	of	characterization of escherichia	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	coli	colis	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	gyrA	gyrA	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	mutations	mutation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	that	that confer hyper-recombination phenotype	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
8	confer	that confer hyper-recombination phenotype	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
9	hyper-recombination	that confer hyper-recombination phenotype	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	phenotype	that confer hyper-recombination phenotype	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1769
# text = J. Mol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Mol	Mol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1770
# text = Biol .
1	Biol	biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1771
# text = 289 :
1	289	289	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1772
# text = 447 - 458 .
1	447	447	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	447 - 458	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	458	458	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1773
# text = Asoh S , Matsuzawa H , Ishino F , Strominger JL , Matsuhashi M , Ohta T. 1986 .
1	Asoh	Asoh	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	S	S	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
4	Matsuzawa	Matsuzawa	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	H	H	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
7	Ishino	Ishino	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	F	F	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
10	Strominger	Strominger	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	JL	JL	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
13	Matsuhashi	Matsuhashi	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	M	M	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Ohta	Ohta	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	T.	T.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	1986	1986	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1774
# text = Nucleotide sequence of the pbpA gene and characteristics of the deduced amino acid sequence of penicillin-binding protein 2 of Escherichia coli K12 .
1	Nucleotide	nucleotide sequence of the pbpa gene and characteristics of the deduced amino acid sequence of penicillin-binding protein 2 of escherichia coli k12	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
2	sequence	nucleotide sequence of the pbpa gene and characteristics of the deduced amino acid sequence of penicillin-binding protein 2 of escherichia coli k12	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
3	of	nucleotide sequence of the pbpa gene and characteristics of the deduced amino acid sequence of penicillin-binding protein 2 of escherichia coli k12	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
4	the	nucleotide sequence of the pbpa gene and characteristics of the deduced amino acid sequence of penicillin-binding protein 2 of escherichia coli k12	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
5	pbpA	nucleotide sequence of the pbpa gene and characteristics of the deduced amino acid sequence of penicillin-binding protein 2 of escherichia coli k12	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
6	gene	nucleotide sequence of the pbpa gene and characteristics of the deduced amino acid sequence of penicillin-binding protein 2 of escherichia coli k12	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
7	and	nucleotide sequence of the pbpa gene and characteristics of the deduced amino acid sequence of penicillin-binding protein 2 of escherichia coli k12	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
8	characteristics	nucleotide sequence of the pbpa gene and characteristics of the deduced amino acid sequence of penicillin-binding protein 2 of escherichia coli k12	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
9	of	nucleotide sequence of the pbpa gene and characteristics of the deduced amino acid sequence of penicillin-binding protein 2 of escherichia coli k12	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
10	the	nucleotide sequence of the pbpa gene and characteristics of the deduced amino acid sequence of penicillin-binding protein 2 of escherichia coli k12	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
11	deduced	nucleotide sequence of the pbpa gene and characteristics of the deduced amino acid sequence of penicillin-binding protein 2 of escherichia coli k12	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
12	amino	nucleotide sequence of the pbpa gene and characteristics of the deduced amino acid sequence of penicillin-binding protein 2 of escherichia coli k12	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
13	acid	nucleotide sequence of the pbpa gene and characteristics of the deduced amino acid sequence of penicillin-binding protein 2 of escherichia coli k12	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
14	sequence	nucleotide sequence of the pbpa gene and characteristics of the deduced amino acid sequence of penicillin-binding protein 2 of escherichia coli k12	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
15	of	nucleotide sequence of the pbpa gene and characteristics of the deduced amino acid sequence of penicillin-binding protein 2 of escherichia coli k12	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
16	penicillin-binding	nucleotide sequence of the pbpa gene and characteristics of the deduced amino acid sequence of penicillin-binding protein 2 of escherichia coli k12	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
17	protein	nucleotide sequence of the pbpa gene and characteristics of the deduced amino acid sequence of penicillin-binding protein 2 of escherichia coli k12	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
18	2	2	NUM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
19	of	nucleotide sequence of the pbpa gene and characteristics of the deduced amino acid sequence of penicillin-binding protein 2 of escherichia coli k12	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
20	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
21	coli	nucleotide sequence of the pbpa gene and characteristics of the deduced amino acid sequence of penicillin-binding protein 2 of escherichia coli k12	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	K12	K12	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1775
# text = Eur .
1	Eur	heur	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1776
# text = J. Biochem .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biochem	Biochem	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1777
# text = 160 :
1	160	160	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1778
# text = 231 - 238 .
1	231	231	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	231 - 238	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	238	238	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1779
# text = Auner H , Buckle M , Deufel A , Kutateladze T , Lazarus L , Mavathur R , Muskhelishvili G , Pemberton I , Schneider R , Travers A. 2003 .
1	Auner	Auner	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	H	H	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Buckle	Buckle	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	M	M	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Deufel	Deufel	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	A	A	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
10	Kutateladze	Kutateladze	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	T	T	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
13	Lazarus	Lazarus	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	L	L	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
16	Mavathur	Mavathur	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	R	R	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
19	Muskhelishvili	Muskhelishvili	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	G	G	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
22	Pemberton	Pemberton	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
23	I	I	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
25	Schneider	Schneider	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	R	R	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
28	Travers	Travers	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
29	A.	A.	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	2003	2003	NUM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1780
# text = Mechanism of transcriptional activation by FIS :
1	Mechanism	mechanism of transcriptional	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	of	mechanism of transcriptional	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	transcriptional	mechanism of transcriptional	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	activation	activation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	by	by	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	FIS	FIS	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	:	:	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1781
# text = role of core promoter structure and DNA topology .
1	role	role of core promoter structure and dna topology	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	of	role of core promoter structure and dna topology	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
3	core	role of core promoter structure and dna topology	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
4	promoter	role of core promoter structure and dna topology	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
5	structure	role of core promoter structure and dna topology	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
6	and	role of core promoter structure and dna topology	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
7	DNA	DNA	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	topology	role of core promoter structure and dna topology	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1782
# text = J. Mol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Mol	Mol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1783
# text = Biol .
1	Biol	biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1784
# text = 331 :
1	331	331	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1785
# text = 331 - 344 .
1	331	331	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	331 - 344	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	344	344	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1786
# text = Aussel L , Barre FX , Aroyo M , Stasiak A , Stasiak AZ , Sherratt D. 2002 .
1	Aussel	Aussel	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	L	L	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Barre	Barre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	FX	FX	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
7	Aroyo	Aroyo	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	M	M	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
10	Stasiak	Stasiak	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	A	A	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
13	Stasiak	Stasiak	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	AZ	AZ	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Sherratt	Sherratt	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
17	D.	D.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	2002	2002	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1787
# text = FtsK is a DNA motor protein that activates chromosome dimer resolution by switching the catalytic state of the XerC and XerD recombinases .
1	FtsK	ftsk is a dna motor protein that activates chromosome dimer resolution by switching the catalytic state of the xerc and xerd recombinases	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
2	is	ftsk is a dna motor protein that activates chromosome dimer resolution by switching the catalytic state of the xerc and xerd recombinases	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
3	a	ftsk is a dna motor protein that activates chromosome dimer resolution by switching the catalytic state of the xerc and xerd recombinases	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
4	DNA	DNA	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
5	motor	ftsk is a dna motor protein that activates chromosome dimer resolution by switching the catalytic state of the xerc and xerd recombinases	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
6	protein	ftsk is a dna motor protein that activates chromosome dimer resolution by switching the catalytic state of the xerc and xerd recombinases	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
7	that	ftsk is a dna motor protein that activates chromosome dimer resolution by switching the catalytic state of the xerc and xerd recombinases	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
8	activates	ftsk is a dna motor protein that activates chromosome dimer resolution by switching the catalytic state of the xerc and xerd recombinases	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
9	chromosome	ftsk is a dna motor protein that activates chromosome dimer resolution by switching the catalytic state of the xerc and xerd recombinases	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
10	dimer	ftsk is a dna motor protein that activates chromosome dimer resolution by switching the catalytic state of the xerc and xerd recombinases	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
11	resolution	ftsk is a dna motor protein that activates chromosome dimer resolution by switching the catalytic state of the xerc and xerd recombinases	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
12	by	ftsk is a dna motor protein that activates chromosome dimer resolution by switching the catalytic state of the xerc and xerd recombinases	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
13	switching	ftsk is a dna motor protein that activates chromosome dimer resolution by switching the catalytic state of the xerc and xerd recombinases	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
14	the	ftsk is a dna motor protein that activates chromosome dimer resolution by switching the catalytic state of the xerc and xerd recombinases	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
15	catalytic	ftsk is a dna motor protein that activates chromosome dimer resolution by switching the catalytic state of the xerc and xerd recombinases	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
16	state	ftsk is a dna motor protein that activates chromosome dimer resolution by switching the catalytic state of the xerc and xerd recombinases	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
17	of	ftsk is a dna motor protein that activates chromosome dimer resolution by switching the catalytic state of the xerc and xerd recombinases	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
18	the	ftsk is a dna motor protein that activates chromosome dimer resolution by switching the catalytic state of the xerc and xerd recombinases	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
19	XerC	XerC	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
20	and	ftsk is a dna motor protein that activates chromosome dimer resolution by switching the catalytic state of the xerc and xerd recombinases	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
21	XerD	XerD	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	recombinases	ftsk is a dna motor protein that activates chromosome dimer resolution by switching the catalytic state of the xerc and xerd recombinases	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1788
# text = Cell
1	Cell	cell	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1789
# text = 108 :
1	108	108	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1790
# text = 195 - 205 .
1	195	195	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	195 - 205	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	205	205	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1791
# text = Badaut C , Williams R , Arluison V , Bouffartigues E , Robert B , Buc H , Rimsky S. 2002 .
1	Badaut	Badaut	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	C	C	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
4	Williams	Williams	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	R	R	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
7	Arluison	Arluison	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	V	V	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
10	Bouffartigues	Bouffartigues	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	E	E	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
13	Robert	Robert	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	B	B	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Buc	Buc	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
17	H	H	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Rimsky	Rimsky	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	S.	S.	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	2002	2002	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1792
# text = The degree of oligomerization of the H-NS nucleoid structuring protein is related to specific binding to DNA .
1	The	the degree of oligomerization of the h-ns nucleoid structuring protein is related to specific binding to dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
2	degree	the degree of oligomerization of the h-ns nucleoid structuring protein is related to specific binding to dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
3	of	the degree of oligomerization of the h-ns nucleoid structuring protein is related to specific binding to dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
4	oligomerization	the degree of oligomerization of the h-ns nucleoid structuring protein is related to specific binding to dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
5	of	the degree of oligomerization of the h-ns nucleoid structuring protein is related to specific binding to dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
6	the	the degree of oligomerization of the h-ns nucleoid structuring protein is related to specific binding to dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
7	H-NS	H-NS	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
8	nucleoid	the degree of oligomerization of the h-ns nucleoid structuring protein is related to specific binding to dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
9	structuring	the degree of oligomerization of the h-ns nucleoid structuring protein is related to specific binding to dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
10	protein	the degree of oligomerization of the h-ns nucleoid structuring protein is related to specific binding to dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
11	is	the degree of oligomerization of the h-ns nucleoid structuring protein is related to specific binding to dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
12	related	the degree of oligomerization of the h-ns nucleoid structuring protein is related to specific binding to dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
13	to	the degree of oligomerization of the h-ns nucleoid structuring protein is related to specific binding to dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
14	specific	the degree of oligomerization of the h-ns nucleoid structuring protein is related to specific binding to dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
15	binding	the degree of oligomerization of the h-ns nucleoid structuring protein is related to specific binding to dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
16	to	the degree of oligomerization of the h-ns nucleoid structuring protein is related to specific binding to dna	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	DNA	DNA	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1793
# text = J. Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1794
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1795
# text = 277 :
1	277	277	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1796
# text = 41657 - 41666 .
1	41657	41657	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	41657 - 41666	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	41666	41666	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1797
# text = Balke VL , Gralla JD. 1987 .
1	Balke	Balke	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	VL	VL	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Gralla	Gralla	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	JD.	JD.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1987	1987	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1798
# text = Changes in the linking number of supercoiled DNA accompany growth transitions in Escherichia coli .
1	Changes	changes in the linking number of supercoiled dna accompany growth	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	in	changes in the linking number of supercoiled dna accompany growth	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
3	the	changes in the linking number of supercoiled dna accompany growth	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
4	linking	changes in the linking number of supercoiled dna accompany growth	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
5	number	changes in the linking number of supercoiled dna accompany growth	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
6	of	changes in the linking number of supercoiled dna accompany growth	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
7	supercoiled	changes in the linking number of supercoiled dna accompany growth	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
8	DNA	DNA	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
9	accompany	changes in the linking number of supercoiled dna accompany growth	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	growth	changes in the linking number of supercoiled dna accompany growth	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	transitions	transition	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	in	in	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	Escherichia	Escherichia	_	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	coli	coli	_	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1799
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1800
# text = 169 :
1	169	169	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1801
# text = 4499 - 4506 .
1	4499	4499	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	4499 - 4506	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	4506	4506	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1802
# text = Ball CA , Johnson RC. 1991a .
1	Ball	ball	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	CA	CA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Johnson	Johnson	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	RC.	RC.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1991a	1991a	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1803
# text = Efficient excision of phage lambda from the Escherichia coli chromosome requires the Fis protein .
1	Efficient	efficient	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	excision	excision	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	of	off	ADV	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	phage	phage	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	lambda	lambda	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	from	frou	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	the	the escherichia coli chromosome requires the fis protein	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
8	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
9	coli	the escherichia coli chromosome requires the fis protein	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
10	chromosome	the escherichia coli chromosome requires the fis protein	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
11	requires	the escherichia coli chromosome requires the fis protein	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
12	the	the escherichia coli chromosome requires the fis protein	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
13	Fis	Fis	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	protein	the escherichia coli chromosome requires the fis protein	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1804
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1805
# text = 173 :
1	173	173	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1806
# text = 4027 - 4031 .
1	4027	4027	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	4027 - 4031	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	4031	4031	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1807
# text = Ball CA , Johnson RC. 1991b .
1	Ball	ball	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	CA	CA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Johnson	Johnson	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	RC.	RC.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1991b	1991b	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1808
# text = Multiple effects of Fis on integration and the control of lysogeny in phage lambda .
1	Multiple	multiple effects of fis on integration and the control of lysogeny	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	effects	multiple effects of fis on integration and the control of lysogeny	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
3	of	multiple effects of fis on integration and the control of lysogeny	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
5	on	multiple effects of fis on integration and the control of lysogeny	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
6	integration	multiple effects of fis on integration and the control of lysogeny	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
7	and	multiple effects of fis on integration and the control of lysogeny	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
8	the	multiple effects of fis on integration and the control of lysogeny	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
9	control	multiple effects of fis on integration and the control of lysogeny	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
10	of	multiple effects of fis on integration and the control of lysogeny	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	lysogeny	multiple effects of fis on integration and the control of lysogeny	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	in	in	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	phage	phage	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	lambda	lambda	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1809
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1810
# text = 173 :
1	173	173	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1811
# text = 4032 - 4038 .
1	4032	4032	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	4032 - 4038	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	4038	4038	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1812
# text = Ball CA , Osuna R , Ferguson KC , Johnson RC. 1992 .
1	Ball	ball	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	CA	CA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
4	Osuna	Osuna	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	R	R	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
7	Ferguson	Ferguson	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	KC	KC	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Johnson	Johnson	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	RC.	RC.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	1992	1992	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1813
# text = Dramatic changes in
1	Dramatic	Dramatic	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	changes	changes	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	in	in	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1814
# text = Fis levels upon nutrient upshift in Escherichia coli .
1	Fis	fis levels upon nutrient upshift in escherichia coli	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	levels	fis levels upon nutrient upshift in escherichia coli	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
3	upon	fis levels upon nutrient upshift in escherichia coli	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
4	nutrient	fis levels upon nutrient upshift in escherichia coli	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
5	upshift	fis levels upon nutrient upshift in escherichia coli	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
6	in	fis levels upon nutrient upshift in escherichia coli	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
7	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	coli	fis levels upon nutrient upshift in escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1815
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1816
# text = 174 :
1	174	174	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1817
# text = 8043 - 8056 .
1	8043	8043	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	8043 - 8056	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	8056	8056	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1818
# text = Baquero MR , Bouzon M , Varea J , Moreno F. 1995 .
1	Baquero	Baquero	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	MR	MR	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Bouzon	Bouzon	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	M	M	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Varea	Varea	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	J	J	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Moreno	Moreno	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	F.	F.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	1995	1995	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1819
# text = sbmC , a stationary-phase induced SOS Escherichia coli gene , whose product protects cells from the DNA replication inhibitor microcin B17 .
1	sbmC	sbmC	ADV	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
3	a	a stationary-phase induced sos escherichia coli gene	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
4	stationary-phase	a stationary-phase induced sos escherichia coli gene	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
5	induced	a stationary-phase induced sos escherichia coli gene	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
6	SOS	SOS	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
7	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
8	coli	a stationary-phase induced sos escherichia coli gene	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	gene	a stationary-phase induced sos escherichia coli gene	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
11	whose	whose product protects cells from the dna replication inhibitor microcin b17	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
12	product	whose product protects cells from the dna replication inhibitor microcin b17	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
13	protects	whose product protects cells from the dna replication inhibitor microcin b17	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
14	cells	whose product protects cells from the dna replication inhibitor microcin b17	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
15	from	whose product protects cells from the dna replication inhibitor microcin b17	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
16	the	whose product protects cells from the dna replication inhibitor microcin b17	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
17	DNA	DNA	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
18	replication	whose product protects cells from the dna replication inhibitor microcin b17	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
19	inhibitor	whose product protects cells from the dna replication inhibitor microcin b17	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
20	microcin	whose product protects cells from the dna replication inhibitor microcin b17	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	B17	B17	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1820
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1821
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1822
# text = 18 :
1	18	18	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1823
# text = 301 - 311 .
1	301	301	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	301 - 311	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	311	311	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1824
# text = Barron A , May G , Bremer E , Villarejo M. 1986 .
1	Barron	barron	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	A	A	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	May	May	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	G	G	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Bremer	Bremer	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	E	E	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
10	Villarejo	Villarejo	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	M.	monsieur	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	1986	1986	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1825
# text = Regulation of envelope protein composition during adaptation to osmotic stress in Escherichia coli .
1	Regulation	regulation of envelope protein composition during adaptation to osmotic	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	of	regulation of envelope protein composition during adaptation to osmotic	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	envelope	regulation of envelope protein composition during adaptation to osmotic	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
4	protein	regulation of envelope protein composition during adaptation to osmotic	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	composition	regulation of envelope protein composition during adaptation to osmotic	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
6	during	regulation of envelope protein composition during adaptation to osmotic	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
7	adaptation	regulation of envelope protein composition during adaptation to osmotic	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
8	to	regulation of envelope protein composition during adaptation to osmotic	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	osmotic	regulation of envelope protein composition during adaptation to osmotic	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	stress	stress	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	in	in	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	Escherichia	Escherichia	_	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	coli	coli	_	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1826
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1827
# text = 167 :
1	167	167	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1828
# text = 433 - 438 .
1	433	433	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	433 - 438	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	438	438	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1829
# text = Bartlett MS , Gaal T , Ross W , Gourse RL. 2000 .
1	Bartlett	Bartlett	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	MS	MS	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Gaal	Gaal	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	T	T	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Ross	Ross	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	W	W	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Gourse	Gourse	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	RL.	RL.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	2000	2000	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1830
# text = Regulation of rRNA transcription is remarkably robust :
1	Regulation	regulation of rrna transcription is remarkably robust	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	of	regulation of rrna transcription is remarkably robust	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	rRNA	regulation of rrna transcription is remarkably robust	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	transcription	regulation of rrna transcription is remarkably robust	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	is	regulation of rrna transcription is remarkably robust	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	remarkably	regulation of rrna transcription is remarkably robust	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	robust	regulation of rrna transcription is remarkably robust	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	:	:	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1831
# text = FIS compensates for altered nucleoside triphosphate sensing by mutant RNA polymerases at Escherichia coli rrn P1 promoters .
1	FIS	fis compensates for altered nucleoside triphosphate sensing	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	compensates	fis compensates for altered nucleoside triphosphate sensing	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	for	fis compensates for altered nucleoside triphosphate sensing	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	altered	fis compensates for altered nucleoside triphosphate sensing	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	nucleoside	fis compensates for altered nucleoside triphosphate sensing	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	triphosphate	fis compensates for altered nucleoside triphosphate sensing	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	sensing	fis compensates for altered nucleoside triphosphate sensing	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	by	By	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	mutant	mutant	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
10	RNA	RNA	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
11	polymerases	rna polymerases at escherichia coli rrn p1 promoters	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
12	at	rna polymerases at escherichia coli rrn p1 promoters	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
13	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
14	coli	rna polymerases at escherichia coli rrn p1 promoters	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
15	rrn	rna polymerases at escherichia coli rrn p1 promoters	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
16	P1	P1	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	promoters	rna polymerases at escherichia coli rrn p1 promoters	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1832
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1833
# text = 182 :
1	182	182	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1834
# text = 1969 - 1977 .
1	1969	1969	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1969 - 1977	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1977	1977	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1835
# text = Batchelor E , Walthers D , Kenney LJ , Goulian M. 2005 .
1	Batchelor	Batchelor	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	E	E	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
4	Walthers	Walthers	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	D	D	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
7	Kenney	Kenney	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	LJ	LJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
10	Goulian	Goulian	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	M.	monsieur	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	2005	2005	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1836
# text = The Escherichia coli CpxA-CpxR envelope stress response system regulates expression of the porins ompF and ompC. J. Bacteriol .
1	The	the escherichia coli cpxa-cpxr envelope stress response system regulates expression of the porins ompf and ompc. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
2	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
3	coli	the escherichia coli cpxa-cpxr envelope stress response system regulates expression of the porins ompf and ompc. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
4	CpxA-CpxR	CpxA-CpxR	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
5	envelope	the escherichia coli cpxa-cpxr envelope stress response system regulates expression of the porins ompf and ompc. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
6	stress	the escherichia coli cpxa-cpxr envelope stress response system regulates expression of the porins ompf and ompc. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
7	response	the escherichia coli cpxa-cpxr envelope stress response system regulates expression of the porins ompf and ompc. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
8	system	the escherichia coli cpxa-cpxr envelope stress response system regulates expression of the porins ompf and ompc. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
9	regulates	the escherichia coli cpxa-cpxr envelope stress response system regulates expression of the porins ompf and ompc. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
10	expression	the escherichia coli cpxa-cpxr envelope stress response system regulates expression of the porins ompf and ompc. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
11	of	the escherichia coli cpxa-cpxr envelope stress response system regulates expression of the porins ompf and ompc. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
12	the	the escherichia coli cpxa-cpxr envelope stress response system regulates expression of the porins ompf and ompc. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
13	porins	the escherichia coli cpxa-cpxr envelope stress response system regulates expression of the porins ompf and ompc. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
14	ompF	the escherichia coli cpxa-cpxr envelope stress response system regulates expression of the porins ompf and ompc. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
15	and	the escherichia coli cpxa-cpxr envelope stress response system regulates expression of the porins ompf and ompc. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
16	ompC.	the escherichia coli cpxa-cpxr envelope stress response system regulates expression of the porins ompf and ompc. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
17	J.	J.	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1837
# text = 187 :
1	187	187	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1838
# text = 5723 - 5731 .
1	5723	5723	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	5723 - 5731	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	5731	5731	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1839
# text = Bergerat A , de Massy B , Gadelle D , Varoutas PC , Nicolas A , Forterre P. 1997 .
1	Bergerat	Bergerat	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	A	A	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	Massy	Massy	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	B	B	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
8	Gadelle	Gadelle	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	D	D	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
11	Varoutas	Varoutas	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	PC	PC	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	Nicolas	Nicolas	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
15	A	A	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
17	Forterre	Forterre	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	P.	P.	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	1997	1997	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1840
# text = An atypical topoisomerase II from Archaea with implications for meiotic recombination .
1	An	an atypical topoisomerase	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	atypical	an atypical topoisomerase	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	topoisomerase	an atypical topoisomerase	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
4	II	II	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	from	from	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	Archaea	Archaea	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	with	dire	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	implications	implication	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	for	for meiotic recombination	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
10	meiotic	for meiotic recombination	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	recombination	for meiotic recombination	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1841
# text = Nature 386 :
1	Nature	nature	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	386	386	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1842
# text = 414 - 417 .
1	414	414	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	414 - 417	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	417	417	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1843
# text = Bergstrom LC , Qin L , Harlocker SL , Egger LA , Inouye M. 1998 .
1	Bergstrom	Bergstrom	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	LC	LC	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
4	Qin	Qin	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	L	L	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
7	Harlocker	Harlocker	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	SL	SL	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
10	Egger	Egger	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	LA	LA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
13	Inouye	Inouye	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	M.	monsieur	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
15	1998	1998	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1844
# text = Hierarchical and co-operative binding of OmpR to a fusion construct containing the ompC and ompF upstream regulatory sequences of Escherichia coli .
1	Hierarchical	hierarchical and co-operative binding of ompr to	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	and	hierarchical and co-operative binding of ompr to	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	co-operative	hierarchical and co-operative binding of ompr to	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	binding	hierarchical and co-operative binding of ompr to	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	of	hierarchical and co-operative binding of ompr to	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	OmpR	OmpR	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	to	hierarchical and co-operative binding of ompr to	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	a	avoir	VRB	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	fusion	fusion	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	construct	construct containing the ompc and ompf upstream regulatory sequences of escherichia coli	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
11	containing	construct containing the ompc and ompf upstream regulatory sequences of escherichia coli	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
12	the	construct containing the ompc and ompf upstream regulatory sequences of escherichia coli	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
13	ompC	construct containing the ompc and ompf upstream regulatory sequences of escherichia coli	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
14	and	construct containing the ompc and ompf upstream regulatory sequences of escherichia coli	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
15	ompF	construct containing the ompc and ompf upstream regulatory sequences of escherichia coli	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
16	upstream	construct containing the ompc and ompf upstream regulatory sequences of escherichia coli	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
17	regulatory	construct containing the ompc and ompf upstream regulatory sequences of escherichia coli	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
18	sequences	construct containing the ompc and ompf upstream regulatory sequences of escherichia coli	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
19	of	construct containing the ompc and ompf upstream regulatory sequences of escherichia coli	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
20	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	coli	construct containing the ompc and ompf upstream regulatory sequences of escherichia coli	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1845
# text = Genes Cells 3 :
1	Genes	genes	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Cells	Cells	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	3	3	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1846
# text = 777 - 788 .
1	777	777	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	777 - 788	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	788	788	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1847
# text = Bhriain NN , Dorman CJ. 1993 .
1	Bhriain	Bhriain	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	NN	NN	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Dorman	Dorman	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	CJ.	CJ.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1993	1993	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1848
# text = Isolation and characterization of a topA mutant of Shigella flexneri .
1	Isolation	isolation and characterization of	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	and	isolation and characterization of	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	characterization	isolation and characterization of	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	of	isolation and characterization of	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	a	avoir	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	topA	topA	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	mutant	mutant	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
8	of	of shigella flexneri	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
9	Shigella	Shigella	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	flexneri	of shigella flexneri	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1849
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1850
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1851
# text = 7 :
1	7	7	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1852
# text = 351 - 358 .
1	351	351	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	351 - 358	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	358	358	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1853
# text = Bishop AC , Xu J , Johnson RC , Schimmel P , Crecy-Lagard V. 200 2 .
1	Bishop	Bishop	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	AC	AC	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Xu	Xu	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	J	J	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Johnson	Johnson	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	RC	RC	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Schimmel	Schimmel	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	P	P	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Crecy-Lagard	Crecy-Lagard	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	V.	V.	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	200	200	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	2	2	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1854
# text = Identification of the tRNA-dihydrouridine synthase family .
1	Identification	identification of the trna-dihydrouridine synthase family	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	of	identification of the trna-dihydrouridine synthase family	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	the	identification of the trna-dihydrouridine synthase family	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	tRNA-dihydrouridine	identification of the trna-dihydrouridine synthase family	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	synthase	identification of the trna-dihydrouridine synthase family	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	family	identification of the trna-dihydrouridine synthase family	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1855
# text = J. Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1856
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1857
# text = 277 :
1	277	277	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1858
# text = 25090 - 25095 .
1	25090	25090	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	25090 - 25095	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	25095	25095	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1859
# text = Blattner FR , Plunkett G , III , Bloch CA , Perna NT , Burland V , Riley M , Collado-Vides J , Glasner JD , Rode CK , Mayhew GF , Gregor J , Davis NW , Kirkpatrick HA , Goeden MA , Rose DJ , Mau B , Shao Y. 1997 .
1	Blattner	Blattner	NOM	_	_	45	subj	_	_	_	_	_
2	FR	FR	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Plunkett	Plunkett	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	G	G	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	III	III	ADJ	_	_	45	periph	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
9	Bloch	Bloch	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	CA	CA	NOM	_	_	45	periph	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
12	Perna	Perna	NOM	_	_	45	periph	_	_	_	_	_
13	NT	NT	NOM	_	_	45	periph	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
15	Burland	Burland	NOM	_	_	45	periph	_	_	_	_	_
16	V	V	ADJ	_	_	45	periph	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
18	Riley	Riley	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	M	M	NOM	_	_	45	periph	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
21	Collado-Vides	Collado-Vides	N+V	_	_	45	periph	_	_	_	_	_
22	J	J	NOM	_	_	45	periph	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
24	Glasner	Glasner	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
25	JD	JD	NOM	_	_	45	periph	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
27	Rode	Rode	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
28	CK	CK	NOM	_	_	45	periph	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
30	Mayhew	Mayhew	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
31	GF	GF	NOM	_	_	45	periph	_	_	_	_	_
32	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
33	Gregor	Gregor	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
34	J	J	NOM	_	_	45	periph	_	_	_	_	_
35	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
36	Davis	Davis	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
37	NW	NW	NOM	_	_	45	periph	_	_	_	_	_
38	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
39	Kirkpatrick	Kirkpatrick	NOM	_	_	45	periph	_	_	_	_	_
40	HA	HA	INT	_	_	45	periph	_	_	_	_	_
41	,	,	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
42	Goeden	Goeden	NOM	_	_	45	periph	_	_	_	_	_
43	MA	MA	NOM	_	_	45	periph	_	_	_	_	_
44	,	,	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
45	Rose	Rose	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
46	DJ	DJ	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
47	,	,	PUNC	_	_	53	punc	_	_	_	_	_
48	Mau	Mau	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
49	B	B	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	,	,	PUNC	_	_	53	punc	_	_	_	_	_
51	Shao	Shao	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
52	Y.	Y.	NOM	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
53	1997	1997	NUM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
54	.	.	PUNC	_	_	45	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1860
# text = The complete genome sequence of Escherichia coli K- 12 .
1	The	the complete genome sequence of escherichia coli k- 12	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	complete	the complete genome sequence of escherichia coli k- 12	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	genome	the complete genome sequence of escherichia coli k- 12	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
4	sequence	the complete genome sequence of escherichia coli k- 12	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	of	the complete genome sequence of escherichia coli k- 12	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
6	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
7	coli	the complete genome sequence of escherichia coli k- 12	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
8	K-	K-	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	12	12	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1861
# text = Science 277 :
1	Science	science	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	277	277	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1862
# text = 1453 - 1474 .
1	1453	1453	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1453 - 1474	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1474	1474	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1863
# text = Bokal AJ , Ross W , Gaal T , Johnson RC , Gourse RL. 1997 .
1	Bokal	Bokal	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	AJ	AJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Ross	Ross	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	W	W	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Gaal	Gaal	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	T	T	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Johnson	Johnson	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	RC	RC	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Gourse	Gourse	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
14	RL.	RL.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	1997	1997	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1864
# text = Molecular anatomy of a transcription activation patch :
1	Molecular	molecular anatomy of	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	anatomy	molecular anatomy of	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	of	molecular anatomy of	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	a	avoir	VRB	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	transcription	transcription	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	activation	activation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	patch	match	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	:	:	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1865
# text = FIS-RNA polymerase interactions at the Escherichia coli rr B P1 promoter .
1	FIS-RNA	FIS-RNA	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	polymerase	polymerase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	interactions	interaction	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	at	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	the	the escherichia coli rr b p1 promoter	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
6	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
7	coli	the escherichia coli rr b p1 promoter	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
8	rr	the escherichia coli rr b p1 promoter	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
9	B	B	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
10	P1	P1	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	promoter	the escherichia coli rr b p1 promoter	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1866
# text = EMBO J .
1	EMBO	embo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1867
# text = 16 :
1	16	16	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1868
# text = 154 - 162 .
1	154	154	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	154 - 162	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	162	162	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1869
# text = Bordes P , Conter A , Morales V , Bouvier J , Kolb A , Gutierrez C. 2003 .
1	Bordes	border	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	P	P	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Conter	Conter	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	A	A	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Morales	Morales	NOM	_	_	1	subj	_	_	_	_	_
8	V	V	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
10	Bouvier	Bouvier	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	J	J	NOM	_	_	1	subj	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
13	Kolb	Kolb	NOM	_	_	1	subj	_	_	_	_	_
14	A	A	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Gutierrez	Gutierrez	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
17	C.	C.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	2003	2003	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1870
# text = DNA supercoiling contributes to disconnect sigmaS accumulation from sigmaS-dependent transcription in Escherichia coli .
1	DNA	dna supercoiling contributes to disconnect	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	supercoiling	dna supercoiling contributes to disconnect	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	contributes	dna supercoiling contributes to disconnect	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	to	dna supercoiling contributes to disconnect	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	disconnect	dna supercoiling contributes to disconnect	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	sigmaS	sigmaS	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	accumulation	accumulation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	from	from	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	sigmaS-dependent	sigmaS-dependent	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	transcription	transcription	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	in	in	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	coli	coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1871
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1872
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1873
# text = 48 :
1	48	48	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1874
# text = 561 - 571 .
1	561	561	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	561 - 571	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	571	571	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1875
# text = Bosch L , Nilsson L , Vijgenboom E , Verbeek H. 1990 .
1	Bosch	bosch	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	L	L	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Nilsson	Nilsson	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	L	L	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Vijgenboom	Vijgenboom	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	E	E	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Verbeek	Verbeek	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	H.	H.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	1990	1990	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1876
# text = FIS-dependent trans-activation of tRNA and rRNA operons of Escherichia coli .
1	FIS-dependent	fis-dependent trans-activation of trna and rrna operons of escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	trans-activation	fis-dependent trans-activation of trna and rrna operons of escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
3	of	fis-dependent trans-activation of trna and rrna operons of escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
4	tRNA	fis-dependent trans-activation of trna and rrna operons of escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
5	and	fis-dependent trans-activation of trna and rrna operons of escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
6	rRNA	fis-dependent trans-activation of trna and rrna operons of escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
7	operons	fis-dependent trans-activation of trna and rrna operons of escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
8	of	fis-dependent trans-activation of trna and rrna operons of escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
9	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	coli	fis-dependent trans-activation of trna and rrna operons of escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1877
# text = Biochim .
1	Biochim	Biochim	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1878
# text = Biophys .
1	Biophys	Biophys	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1879
# text = Acta 1050 :
1	Acta	acter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	1050	1050	NUM	_	_	1	subj	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1880
# text = 293 - 301 .
1	293	293	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	293 - 301	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	301	301	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1881
# text = Boye E , Lyngstadaas A , Lobner-Olesen A , Skarstad K , Wold S. 1993 .
1	Boye	Boye	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	E	E	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Lyngstadaas	Lyngstadaas	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	A	A	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Lobner-Olesen	Lobner-Olesen	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	A	A	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Skarstad	Skarstad	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	K	K	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Wold	Wold	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	S.	S.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	1993	1993	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1882
# text = Regulation of DNA replication in Escherichia coli .
1	Regulation	regulation of dna replication in escherichia coli	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	of	regulation of dna replication in escherichia coli	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	DNA	DNA	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	replication	regulation of dna replication in escherichia coli	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	in	regulation of dna replication in escherichia coli	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	coli	regulation of dna replication in escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1883
# text = In :
1	In	in	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1884
# text = DNA replication and the cell cycle .
1	DNA	dna replication and the cell cycle	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	replication	dna replication and the cell cycle	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	and	dna replication and the cell cycle	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	the	dna replication and the cell cycle	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	cell	dna replication and the cell cycle	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	cycle	dna replication and the cell cycle	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1885
# text = Berlin :
1	Berlin	berlin	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1886
# text = Springer .
1	Springer	springer	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1887
# text = 15 - 26 .
1	15	15	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	-	15 - 26 .	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	26	26	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	.	15 - 26 .	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1888
# text = Brown PO , Cozzarelli NR. 1979 .
1	Brown	brown	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	PO	PO	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	NR.	NR.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1979	1979	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1889
# text = A sign inversion mechanism for enzymatic supercoiling of DNA .
1	A	a sign inversion mechanism for enzymatic supercoiling of dna	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	sign	a sign inversion mechanism for enzymatic supercoiling of dna	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	inversion	a sign inversion mechanism for enzymatic supercoiling of dna	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
4	mechanism	a sign inversion mechanism for enzymatic supercoiling of dna	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	for	a sign inversion mechanism for enzymatic supercoiling of dna	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
6	enzymatic	a sign inversion mechanism for enzymatic supercoiling of dna	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
7	supercoiling	a sign inversion mechanism for enzymatic supercoiling of dna	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
8	of	a sign inversion mechanism for enzymatic supercoiling of dna	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	DNA	DNA	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1890
# text = Science 206 :
1	Science	science	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	206	206	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1891
# text = 1081 - 1083 .
1	1081	1081	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1081 - 1083	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1083	1083	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1892
# text = Brown PO , Cozzarelli NR. 1981 .
1	Brown	brown	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	PO	PO	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	NR.	NR.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1981	1981	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1893
# text = Catenation and knotting of duplex DNA by type 1 topoisomerases :
1	Catenation	catenation and knotting of duplex dna	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
2	and	catenation and knotting of duplex dna	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
3	knotting	catenation and knotting of duplex dna	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
4	of	catenation and knotting of duplex dna	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
5	duplex	catenation and knotting of duplex dna	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	DNA	DNA	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
7	by	By	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	type	typer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	1	1	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	topoisomerases	topoisomerase	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	:	:	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1894
# text = a mechanistic parallel with type 2 topoisomerases .
1	a	a mechanistic parallel	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	mechanistic	a mechanistic parallel	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	parallel	a mechanistic parallel	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
4	with	bit	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	type	typer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	2	2	NUM	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	topoisomerases	topoisomerase	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1895
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1896
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1897
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1898
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1899
# text = U.S.A 78 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	78	78	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1900
# text = 843 - 847 .
1	843	843	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	843 - 847	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	847	847	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1901
# text = Browning DF , Beatty CM , Sanstad EA , Gunn KE , Busby SJ , Wolfe AJ. 2004 .
1	Browning	Browning	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	DF	DF	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
4	Beatty	Beatty	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	CM	CM	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
7	Sanstad	Sanstad	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	EA	EA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
10	Gunn	Gunn	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	KE	KE	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
13	Busby	Busby	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	SJ	SJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Wolfe	Wolfe	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	AJ.	AJ.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	2004	2004	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1902
# text = Modulation of CRP-dependent transcription at the Escherichia coli acsP 2 promoter by nucleoprotein complexes :
1	Modulation	modulation of crp-dependent transcription at the escherichia	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
2	of	modulation of crp-dependent transcription at the escherichia	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
3	CRP-dependent	CRP-dependent	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
4	transcription	modulation of crp-dependent transcription at the escherichia	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
5	at	modulation of crp-dependent transcription at the escherichia	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
6	the	modulation of crp-dependent transcription at the escherichia	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
8	coli	colis	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	acsP	acsP	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	2	2	NUM	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
11	promoter	promoter by nucleoprotein complexes	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
12	by	promoter by nucleoprotein complexes	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
13	nucleoprotein	promoter by nucleoprotein complexes	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	complexes	promoter by nucleoprotein complexes	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
15	:	:	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1903
# text = anti-activation by the nucleoid proteins
1	anti-activation	anti-activation by the nucleoid proteins	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	by	anti-activation by the nucleoid proteins	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	the	anti-activation by the nucleoid proteins	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	nucleoid	anti-activation by the nucleoid proteins	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	proteins	anti-activation by the nucleoid proteins	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1904
# text = FIS and IHF .
1	FIS	fis and ihf	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	and	fis and ihf	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	IHF	IHF	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1905
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1906
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1907
# text = 51 :
1	51	51	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1908
# text = 241 - 254 .
1	241	241	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	241 - 254	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	254	254	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1909
# text = Browning DF , Grainger DC , Beatty CM , Wolfe AJ , Cole JA , Busby SJ. 2005 .
1	Browning	Browning	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	DF	DF	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Grainger	Grainger	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	DC	DC	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Beatty	Beatty	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	CM	CM	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Wolfe	Wolfe	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	AJ	AJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Cole	Cole	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	JA	JA	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Busby	Busby	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	SJ.	SJ.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	2005	2005	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1910
# text = Integration of three signals at the Escherichia coli nrf promoter :
1	Integration	integration of three signals at the escherichia coli nrf promoter	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	of	integration of three signals at the escherichia coli nrf promoter	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
3	three	integration of three signals at the escherichia coli nrf promoter	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
4	signals	integration of three signals at the escherichia coli nrf promoter	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
5	at	integration of three signals at the escherichia coli nrf promoter	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
6	the	integration of three signals at the escherichia coli nrf promoter	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
7	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
8	coli	integration of three signals at the escherichia coli nrf promoter	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
9	nrf	integration of three signals at the escherichia coli nrf promoter	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	promoter	integration of three signals at the escherichia coli nrf promoter	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	:	:	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1911
# text = a role for Fis protein in catabolite repression .
1	a	a role for fis	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	role	a role for fis	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	for	a role for fis	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	protein	protéine	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	in	in	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	catabolite	catabolite	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	repression	répression	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1912
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1913
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1914
# text = 57 :
1	57	57	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1915
# text = 496 - 510 .
1	496	496	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	496 - 510	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	510	510	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1916
# text = Browning DF , Cole JA , Busby SJ. 2000 .
1	Browning	Browning	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	DF	DF	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Cole	Cole	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	JA	JA	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Busby	Busby	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	SJ.	SJ.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2000	2000	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1917
# text = Suppression of FNR-dependent transcription activation at the Escherichia coli nir promoter by Fis , IHF and H-NS :
1	Suppression	suppression of fnr-dependent	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	of	suppression of fnr-dependent	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	FNR-dependent	FNR-dependent	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	transcription	transcription	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	activation	activation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	at	avoir	VRB	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	the	the escherichia coli nir promoter by fis	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
8	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
9	coli	the escherichia coli nir promoter by fis	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
10	nir	the escherichia coli nir promoter by fis	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
11	promoter	the escherichia coli nir promoter by fis	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
12	by	the escherichia coli nir promoter by fis	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	Fis	Fis	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
15	IHF	IHF	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
16	and	ihf and h-ns	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	H-NS	H-NS	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
18	:	:	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1918
# text = modulation of transcription initiation by a complex nucleo-protein assembly .
1	modulation	modulation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	of	off	ADV	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	transcription	transcription	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	initiation	initiation	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	by	By	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	complex	complex nucleo-protein assembly	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
8	nucleo-protein	complex nucleo-protein assembly	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	assembly	complex nucleo-protein assembly	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1919
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1920
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1921
# text = 37 :
1	37	37	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1922
# text = 1258 - 1269 .
1	1258	1258	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1258 - 1269	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1269	1269	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1923
# text = Bull JJ , Badgett MR , Wichman HA , Huelsenbeck JP , Hillis DM , Gulati A , Ho C , Molineux IJ .
1	Bull	bull	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	JJ	JJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
4	Badgett	Badgett	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	MR	MR	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
7	Wichman	Wichman	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	HA	HA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
10	Huelsenbeck	Huelsenbeck	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	JP	JP	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
13	Hillis	Hillis	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	DM	DM	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Gulati	Gulati	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
17	A	A	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
19	Ho	Ho	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	C	C	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
22	Molineux	Molineux	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	IJ	IJ	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1924
# text = 1997 .
1	1997	1997	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1925
# text = Exceptional convergent evolution in a virus .
1	Exceptional	Exceptional	ADJ	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	convergent	convergent	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	evolution	évolution	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	in	in	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	a	avoir	VRB	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	virus	virus	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1926
# text = Genetics 147 :
1	Genetics	genetics	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	147	147	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1927
# text = 1497 - 1507 .
1	1497	1497	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1497 - 1507	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1507	1507	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1928
# text = Butland G , Peregrin-Alvarez JM , Li J , Yang W , Yang X , Canadien V , Starostine A , Richards
1	Butland	Butland	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	G	G	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
4	Peregrin-Alvarez	Peregrin-Alvarez	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	JM	JM	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
7	Li	Li	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
10	Yang	Yang	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	W	W	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
13	Yang	Yang	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	X	X	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
16	Canadien	Canadien	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	V	V	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Starostine	Starostine	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
20	A	A	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	Richards	Richards	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1929
# text = D , Beattie B , Krogan N , Davey M , Parkinson J , Greenblatt J , Emili A. 2005 .
1	D	D	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
3	Beattie	Beattie	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	B	B	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
6	Krogan	Krogan	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	N	N	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
9	Davey	Davey	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	M	M	_	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
12	Parkinson	Parkinson	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	J	J	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
15	Greenblatt	Greenblatt	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	J	J	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
18	Emili	Emili	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	A.	A.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
20	2005	2005	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1930
# text = Interaction network containing conserved and essential protein complexes in Escherichia coli .
1	Interaction	interaction network containing conserved and essential	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
2	network	interaction network containing conserved and essential	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
3	containing	interaction network containing conserved and essential	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
4	conserved	interaction network containing conserved and essential	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
5	and	interaction network containing conserved and essential	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	essential	interaction network containing conserved and essential	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	protein	protéiner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	complexes	complexe	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	in	in	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
10	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	coli	coli	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1931
# text = Nature 433 :
1	Nature	nature	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	433	433	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1932
# text = 531 - 537 .
1	531	531	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	531 - 537	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	537	537	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1933
# text = Cabrera JE , Jin DJ. 2003 .
1	Cabrera	cabrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	JE	JE	NOM	_	_	1	subj	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Jin	Jin	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	DJ.	DJ.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2003	2003	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1934
# text = The distribution of RNA polymerase in Escherichia coli is dynamic and sensitive to environmental cues .
1	The	the distribution of rna polymerase in escherichia coli is dynamic and sensitive to environmental cues	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
2	distribution	the distribution of rna polymerase in escherichia coli is dynamic and sensitive to environmental cues	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
3	of	the distribution of rna polymerase in escherichia coli is dynamic and sensitive to environmental cues	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
4	RNA	RNA	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
5	polymerase	the distribution of rna polymerase in escherichia coli is dynamic and sensitive to environmental cues	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
6	in	the distribution of rna polymerase in escherichia coli is dynamic and sensitive to environmental cues	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
7	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
8	coli	the distribution of rna polymerase in escherichia coli is dynamic and sensitive to environmental cues	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
9	is	the distribution of rna polymerase in escherichia coli is dynamic and sensitive to environmental cues	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
10	dynamic	the distribution of rna polymerase in escherichia coli is dynamic and sensitive to environmental cues	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
11	and	the distribution of rna polymerase in escherichia coli is dynamic and sensitive to environmental cues	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
12	sensitive	the distribution of rna polymerase in escherichia coli is dynamic and sensitive to environmental cues	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
13	to	the distribution of rna polymerase in escherichia coli is dynamic and sensitive to environmental cues	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
14	environmental	the distribution of rna polymerase in escherichia coli is dynamic and sensitive to environmental cues	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	cues	the distribution of rna polymerase in escherichia coli is dynamic and sensitive to environmental cues	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1935
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1936
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1937
# text = 50 :
1	50	50	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1938
# text = 1493 - 1505 .
1	1493	1493	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1493 - 1505	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1505	1505	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1939
# text = Cashel M , Gentry VJ , Hernandez VJ , Vinella D. 1996 .
1	Cashel	Cashel	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	M	M	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	Gentry	Gentry	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	VJ	VJ	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
7	Hernandez	Hernandez	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	VJ	VJ	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Vinella	Vinella	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	D.	D.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	1996	1996	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1940
# text = The stringent response .
1	The	the stringent response	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	stringent	the stringent response	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	response	the stringent response	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1941
# text = In :
1	In	in	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1942
# text = Escherichia coli and Salmonella :
1	Escherichia	escherichia coli and salmonella	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	coli	escherichia coli and salmonella	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	and	escherichia coli and salmonella	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	Salmonella	Salmonella	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	:	:	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1943
# text = cellular and molecular biology .
1	cellular	cellular and molecular biology	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	and	cellular and molecular biology	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	molecular	cellular and molecular biology	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	biology	cellular and molecular biology	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1944
# text = Washington DC :
1	Washington	Washington	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	DC	DC	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1945
# text = ASM Press .
1	ASM	asm	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Press	Press	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1946
# text = 1458 - 1496 .
1	1458	1458	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1458 - 1496	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1496	1496	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1947
# text = Champoux JJ. 2001 .
1	Champoux	champoux	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	JJ.	JJ.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	2001	2001	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1948
# text = DNA topoisomerases :
1	DNA	DNA	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	topoisomerases	topoisomerases	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1949
# text = structure , function , and mechanism .
1	structure	structurer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	function	fonction	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
5	and	and mechanism	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	mechanism	and mechanism	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1950
# text = Annu .
1	Annu	Annu	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1951
# text = Rev .
1	Rev	Rev	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1952
# text = Biochem .
1	Biochem	Biochem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1953
# text = 70 :
1	70	70	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1954
# text = 369 - 413 .
1	369	369	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	369 - 413	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	413	413	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1955
# text = Chatterji M , Nagaraja V. 200 2 .
1	Chatterji	Chatterji	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	M	M	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Nagaraja	Nagaraja	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	V.	V.	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	200	200	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	2	2	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1956
# text = GyrI :
1	GyrI	GyrI	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1957
# text = a counter-defensive strategy against proteinaceous inhibitors of DNA gyrase .
1	a	a counter-defensive strategy against proteinaceous inhibitors of dna gyrase	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	counter-defensive	a counter-defensive strategy against proteinaceous inhibitors of dna gyrase	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	strategy	a counter-defensive strategy against proteinaceous inhibitors of dna gyrase	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
4	against	a counter-defensive strategy against proteinaceous inhibitors of dna gyrase	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	proteinaceous	a counter-defensive strategy against proteinaceous inhibitors of dna gyrase	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
6	inhibitors	a counter-defensive strategy against proteinaceous inhibitors of dna gyrase	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
7	of	a counter-defensive strategy against proteinaceous inhibitors of dna gyrase	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
8	DNA	DNA	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	gyrase	a counter-defensive strategy against proteinaceous inhibitors of dna gyrase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1958
# text = EMBO Rep .
1	EMBO	EMBO	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Rep	Rep	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1959
# text = 3 :
1	3	3	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1960
# text = 261 - 267 .
1	261	261	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	261 - 267	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	267	267	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1961
# text = Chen S , Zhang A , Blyn LB , Storz G. 2004 .
1	Chen	Chen	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	S	S	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Zhang	Zhang	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	A	A	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Blyn	Blyn	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	LB	LB	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Storz	Storz	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
11	G.	G.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	2004	2004	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1962
# text = MicC , a second small-RNA regulator of Omp protein expression in Escherichia coli .
1	MicC	MicC	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	a	avoir	VRB	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
4	second	second	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	small-RNA	small-RNA	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	regulator	regulator of omp	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
7	of	regulator of omp	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	Omp	Omp	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
9	protein	protein	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	expression	expression	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	in	in	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
12	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	coli	coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1963
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1964
# text = 186 :
1	186	186	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1965
# text = 6689 - 6697 .
1	6689	6689	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	6689 - 6697	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	6697	6697	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1966
# text = Chen SJ , Wang JC. 1998 .
1	Chen	Chen	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	SJ	SJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Wang	Wang	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	JC.	JC.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1998	1998	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1967
# text = Identification of active site residues in Escherichia coli DNA topoisomerase I. J. Biol .
1	Identification	identification of active site residues in escherichia coli dna topoisomerase i. j. biol	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	of	identification of active site residues in escherichia coli dna topoisomerase i. j. biol	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
3	active	identification of active site residues in escherichia coli dna topoisomerase i. j. biol	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
4	site	identification of active site residues in escherichia coli dna topoisomerase i. j. biol	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
5	residues	identification of active site residues in escherichia coli dna topoisomerase i. j. biol	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
6	in	identification of active site residues in escherichia coli dna topoisomerase i. j. biol	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
7	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
8	coli	identification of active site residues in escherichia coli dna topoisomerase i. j. biol	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
9	DNA	DNA	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
10	topoisomerase	identification of active site residues in escherichia coli dna topoisomerase i. j. biol	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
11	I.	I.	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
12	J.	J.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	Biol	Biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1968
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1969
# text = 273 :
1	273	273	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1970
# text = 6050 - 6056 .
1	6050	6050	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	6050 - 6056	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	6056	6056	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1971
# text = Cheng B , Zhu CX , Ji C , Ahumada A , Tse-Dinh YC. 2003 .
1	Cheng	cheng	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	B	B	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Zhu	Zhu	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	CX	CX	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Ji	Ji	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	C	C	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Ahumada	Ahumada	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	A	A	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
13	Tse-Dinh	Tse-Dinh	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	YC.	YC.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	2003	2003	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1972
# text = Direct interaction between Escherichia coli RNA polymerase and the zinc ribbon domains of DNA topoisomerase I. J. Biol .
1	Direct	direct interaction between escherichia coli rna polymerase and the zinc ribbon domains of dna topoisomerase i. j. biol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
2	interaction	direct interaction between escherichia coli rna polymerase and the zinc ribbon domains of dna topoisomerase i. j. biol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
3	between	direct interaction between escherichia coli rna polymerase and the zinc ribbon domains of dna topoisomerase i. j. biol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
4	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
5	coli	direct interaction between escherichia coli rna polymerase and the zinc ribbon domains of dna topoisomerase i. j. biol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
6	RNA	RNA	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
7	polymerase	direct interaction between escherichia coli rna polymerase and the zinc ribbon domains of dna topoisomerase i. j. biol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
8	and	direct interaction between escherichia coli rna polymerase and the zinc ribbon domains of dna topoisomerase i. j. biol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
9	the	direct interaction between escherichia coli rna polymerase and the zinc ribbon domains of dna topoisomerase i. j. biol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
10	zinc	direct interaction between escherichia coli rna polymerase and the zinc ribbon domains of dna topoisomerase i. j. biol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
11	ribbon	direct interaction between escherichia coli rna polymerase and the zinc ribbon domains of dna topoisomerase i. j. biol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
12	domains	direct interaction between escherichia coli rna polymerase and the zinc ribbon domains of dna topoisomerase i. j. biol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
13	of	direct interaction between escherichia coli rna polymerase and the zinc ribbon domains of dna topoisomerase i. j. biol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
14	DNA	DNA	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
15	topoisomerase	direct interaction between escherichia coli rna polymerase and the zinc ribbon domains of dna topoisomerase i. j. biol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
16	I.	I.	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
17	J.	J.	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	Biol	Biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1973
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1974
# text = 278 :
1	278	278	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1975
# text = 30705 - 30710 .
1	30705	30705	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	30705 - 30710	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	30710	30710	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1976
# text = Cheng YS , Yang WZ , Johnson RC , Yuan HS. 2000 .
1	Cheng	cheng	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	YS	YS	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Yang	Yang	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	WZ	WZ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Johnson	Johnson	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	RC	RC	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Yuan	Yuan	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	HS.	HS.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	2000	2000	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1977
# text = Structural analysis of the transcriptional activation on Fis :
1	Structural	structural analysis of the transcriptional	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	analysis	structural analysis of the transcriptional	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	of	structural analysis of the transcriptional	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	the	structural analysis of the transcriptional	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	transcriptional	structural analysis of the transcriptional	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	activation	activation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	on	on	CLS	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
8	Fis	Fis	VRB	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	:	:	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1978
# text = crystal structures of six Fis mutants with different activation properties .
1	crystal	crystal structures of six fis	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	structures	crystal structures of six fis	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	of	crystal structures of six fis	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	six	crystal structures of six fis	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	Fis	Fis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	mutants	mutant	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	with	dire	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	different	différent	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	activation	activation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	properties	properties	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1979
# text = J. Mol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Mol	Mol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1980
# text = Biol .
1	Biol	biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1981
# text = 302 :
1	302	302	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1982
# text = 1139 - 1151 .
1	1139	1139	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1139 - 1151	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1151	1151	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1983
# text = Cheung KJ , Badarinarayana V , Selinger DW , Janse D , Church GM. 2003 .
1	Cheung	cheung	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	KJ	KJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Badarinarayana	Badarinarayana	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	V	V	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Selinger	Selinger	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	DW	DW	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Janse	Janse	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	D	D	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Church	Church	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	GM.	GM.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	2003	2003	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1984
# text = A microarray-based antibiotic screen identifies a regulatory role for supercoiling in the osmotic stress response of Escherichia coli .
1	A	a microarray-based antibiotic screen identifies a regulatory role for supercoiling in the osmotic stress response of escherichia coli	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
2	microarray-based	a microarray-based antibiotic screen identifies a regulatory role for supercoiling in the osmotic stress response of escherichia coli	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
3	antibiotic	a microarray-based antibiotic screen identifies a regulatory role for supercoiling in the osmotic stress response of escherichia coli	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
4	screen	a microarray-based antibiotic screen identifies a regulatory role for supercoiling in the osmotic stress response of escherichia coli	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
5	identifies	a microarray-based antibiotic screen identifies a regulatory role for supercoiling in the osmotic stress response of escherichia coli	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
6	a	a microarray-based antibiotic screen identifies a regulatory role for supercoiling in the osmotic stress response of escherichia coli	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
7	regulatory	a microarray-based antibiotic screen identifies a regulatory role for supercoiling in the osmotic stress response of escherichia coli	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
8	role	a microarray-based antibiotic screen identifies a regulatory role for supercoiling in the osmotic stress response of escherichia coli	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
9	for	a microarray-based antibiotic screen identifies a regulatory role for supercoiling in the osmotic stress response of escherichia coli	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
10	supercoiling	a microarray-based antibiotic screen identifies a regulatory role for supercoiling in the osmotic stress response of escherichia coli	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
11	in	a microarray-based antibiotic screen identifies a regulatory role for supercoiling in the osmotic stress response of escherichia coli	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
12	the	a microarray-based antibiotic screen identifies a regulatory role for supercoiling in the osmotic stress response of escherichia coli	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
13	osmotic	a microarray-based antibiotic screen identifies a regulatory role for supercoiling in the osmotic stress response of escherichia coli	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
14	stress	a microarray-based antibiotic screen identifies a regulatory role for supercoiling in the osmotic stress response of escherichia coli	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
15	response	a microarray-based antibiotic screen identifies a regulatory role for supercoiling in the osmotic stress response of escherichia coli	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
16	of	a microarray-based antibiotic screen identifies a regulatory role for supercoiling in the osmotic stress response of escherichia coli	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
17	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	coli	a microarray-based antibiotic screen identifies a regulatory role for supercoiling in the osmotic stress response of escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1985
# text = Genome
1	Genome	génome	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1986
# text = Res .
1	Res	ré	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1987
# text = 13 :
1	13	13	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1988
# text = 206 - 215 .
1	206	206	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	206 - 215	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	215	215	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1989
# text = Cooper TF , Rozen DE , Lenski RE. 2003 .
1	Cooper	cooper	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	TF	TF	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Rozen	Rozen	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	DE	DE	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Lenski	Lenski	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	RE.	RE.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2003	2003	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1990
# text = Parallel changes in gene expression after 20 , 000 generations of evolution in Escherichia coli .
1	Parallel	Parallel	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	changes	change	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	in	in	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
4	gene	gene expression after	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
5	expression	gene expression after	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	after	gene expression after	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	20	20	NUM	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
8	,	20 , 000	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
9	000	000	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
10	generations	generations	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	of	off	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	evolution	evolution	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	in	in	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
14	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	coli	coli	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1991
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1992
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1993
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1994
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1995
# text = U.S.A 100 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	100	100	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1996
# text = 1072 - 1077 .
1	1072	1072	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1072 - 1077	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1077	1077	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1997
# text = Cooper VS , Lenski RE. 2000 .
1	Cooper	Cooper	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	VS	VS	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Lenski	Lenski	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	RE.	RE.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2000	2000	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1998
# text = The population genetics of ecological specialization in evolving Escherichia coli populations .
1	The	the population genetics of ecological specialization in evolving escherichia coli populations	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	population	the population genetics of ecological specialization in evolving escherichia coli populations	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
3	genetics	the population genetics of ecological specialization in evolving escherichia coli populations	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
4	of	the population genetics of ecological specialization in evolving escherichia coli populations	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
5	ecological	the population genetics of ecological specialization in evolving escherichia coli populations	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
6	specialization	the population genetics of ecological specialization in evolving escherichia coli populations	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
7	in	the population genetics of ecological specialization in evolving escherichia coli populations	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
8	evolving	the population genetics of ecological specialization in evolving escherichia coli populations	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
9	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
10	coli	the population genetics of ecological specialization in evolving escherichia coli populations	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	populations	the population genetics of ecological specialization in evolving escherichia coli populations	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-1999
# text = Nature 407 :
1	Nature	nature	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	407	407	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2000
# text = 736 - 739 .
1	736	736	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	736 - 739	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	739	739	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2001
# text = Cooper VS , Schneider D , Blot M , Lenski RE. 2001 .
1	Cooper	Cooper	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	VS	VS	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Schneider	Schneider	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	D	D	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Blot	Blot	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	M	M	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Lenski	Lenski	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	RE.	RE.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	2001	2001	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2002
# text = Mechanisms causing rapid and parallel losses of ribose catabolism in evolving populations of Escherichia coli B. J. Bacteriol .
1	Mechanisms	mechanisms causing rapid and parallel losses of ribose catabolism in evolving populations of escherichia coli b. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
2	causing	mechanisms causing rapid and parallel losses of ribose catabolism in evolving populations of escherichia coli b. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
3	rapid	mechanisms causing rapid and parallel losses of ribose catabolism in evolving populations of escherichia coli b. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
4	and	mechanisms causing rapid and parallel losses of ribose catabolism in evolving populations of escherichia coli b. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
5	parallel	mechanisms causing rapid and parallel losses of ribose catabolism in evolving populations of escherichia coli b. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
6	losses	mechanisms causing rapid and parallel losses of ribose catabolism in evolving populations of escherichia coli b. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
7	of	mechanisms causing rapid and parallel losses of ribose catabolism in evolving populations of escherichia coli b. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
8	ribose	mechanisms causing rapid and parallel losses of ribose catabolism in evolving populations of escherichia coli b. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
9	catabolism	mechanisms causing rapid and parallel losses of ribose catabolism in evolving populations of escherichia coli b. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
10	in	mechanisms causing rapid and parallel losses of ribose catabolism in evolving populations of escherichia coli b. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
11	evolving	mechanisms causing rapid and parallel losses of ribose catabolism in evolving populations of escherichia coli b. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
12	populations	mechanisms causing rapid and parallel losses of ribose catabolism in evolving populations of escherichia coli b. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
13	of	mechanisms causing rapid and parallel losses of ribose catabolism in evolving populations of escherichia coli b. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
14	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
15	coli	mechanisms causing rapid and parallel losses of ribose catabolism in evolving populations of escherichia coli b. j. bacteriol	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
16	B.	B.	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
17	J.	J.	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2003
# text = 183 :
1	183	183	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2004
# text = 2834 - 2841 .
1	2834	2834	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	2834 - 2841	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	2841	2841	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2005
# text = Corbett KD , Berger JM. 2003 .
1	Corbett	Corbett	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	KD	KD	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Berger	Berger	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	JM.	JM.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2003	2003	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2006
# text = Structure of the topoisomerase VI -B subunit :
1	Structure	structure of the topoisomerase	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	of	structure of the topoisomerase	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
3	the	structure of the topoisomerase	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	topoisomerase	structure of the topoisomerase	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
5	VI	VI	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	-B	-B	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	subunit	sub-	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	:	:	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2007
# text = implications for type II topoisomerase mechanism and evolution .
1	implications	implication	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	for	for	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	type	typer	VRB	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	II	II	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
5	topoisomerase	topoisomerase mechanism and evolution	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
6	mechanism	topoisomerase mechanism and evolution	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
7	and	topoisomerase mechanism and evolution	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	evolution	topoisomerase mechanism and evolution	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2008
# text = EMBO J. 22 :
1	EMBO	embo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J.	J.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	22	22	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2009
# text = 151 - 163 .
1	151	151	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	151 - 163	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	163	163	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2010
# text = Corbett KD , Berger JM. 2004 .
1	Corbett	Corbett	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	KD	KD	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Berger	Berger	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	JM.	JM.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2004	2004	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2011
# text = Structure , molecular mechanisms , and evolutionary relationships in DNA topoisomerases .
1	Structure	structurer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
3	molecular	moléculaire	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	mechanisms	mécanisme	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
6	and	and evolutionary relationships in dna topoisomerases	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
7	evolutionary	and evolutionary relationships in dna topoisomerases	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
8	relationships	and evolutionary relationships in dna topoisomerases	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
9	in	and evolutionary relationships in dna topoisomerases	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
10	DNA	DNA	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	topoisomerases	and evolutionary relationships in dna topoisomerases	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2012
# text = Annu .
1	Annu	Annu	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2013
# text = Rev .
1	Rev	Rev	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2014
# text = Biophys .
1	Biophys	Biophys	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2015
# text = Biomol .
1	Biomol	Biomol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2016
# text = Struct .
1	Struct	Struct	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2017
# text = 33 :
1	33	33	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2018
# text = 95 - 118 .
1	95	95	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	95 - 118	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	118	118	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2019
# text = Corbett KD , Shultzaberger RK , Berger JM. 2004 .
1	Corbett	Corbett	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	KD	KD	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Shultzaberger	Shultzaberger	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	RK	RK	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Berger	Berger	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	JM.	JM.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2004	2004	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2020
# text = The C-terminal domain of DNA gyrase A adopts a DNA-bending beta-pinwheel fold .
1	The	the c-terminal domain of dna gyrase a adopts a dna-bending beta-pinwheel fold	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	C-terminal	C-terminal	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
3	domain	the c-terminal domain of dna gyrase a adopts a dna-bending beta-pinwheel fold	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
4	of	the c-terminal domain of dna gyrase a adopts a dna-bending beta-pinwheel fold	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
5	DNA	DNA	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
6	gyrase	the c-terminal domain of dna gyrase a adopts a dna-bending beta-pinwheel fold	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	A	A	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	adopts	the c-terminal domain of dna gyrase a adopts a dna-bending beta-pinwheel fold	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	a	the c-terminal domain of dna gyrase a adopts a dna-bending beta-pinwheel fold	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	DNA-bending	DNA-bending	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	beta-pinwheel	the c-terminal domain of dna gyrase a adopts a dna-bending beta-pinwheel fold	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	fold	the c-terminal domain of dna gyrase a adopts a dna-bending beta-pinwheel fold	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2021
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2022
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2023
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2024
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2025
# text = U.S.A 101 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	101	101	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2026
# text = 7293 - 7298 .
1	7293	7293	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	7293 - 7298	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	7298	7298	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2027
# text = Crellin P , Sewitz S , Chalmers R. 2004 .
1	Crellin	crellin	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	P	P	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Sewitz	Sewitz	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	S	S	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Chalmers	Chalmers	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	R.	R.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2004	2004	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2028
# text = DNA looping and catalysis ;
1	DNA	dna looping and catalysis	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	looping	dna looping and catalysis	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	and	dna looping and catalysis	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	catalysis	dna looping and catalysis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	;	;	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2029
# text = the IHF-folded arm of Tn 10 promotes conformational changes and hairpin resolution .
1	the	the ihf-folded arm of tn 10 promotes conformational changes and hairpin resolution	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	IHF-folded	IHF-folded	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
3	arm	the ihf-folded arm of tn 10 promotes conformational changes and hairpin resolution	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
4	of	the ihf-folded arm of tn 10 promotes conformational changes and hairpin resolution	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
5	Tn	Tn	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
6	10	10	NUM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	promotes	the ihf-folded arm of tn 10 promotes conformational changes and hairpin resolution	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	conformational	the ihf-folded arm of tn 10 promotes conformational changes and hairpin resolution	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	changes	the ihf-folded arm of tn 10 promotes conformational changes and hairpin resolution	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	and	the ihf-folded arm of tn 10 promotes conformational changes and hairpin resolution	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	hairpin	the ihf-folded arm of tn 10 promotes conformational changes and hairpin resolution	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	resolution	the ihf-folded arm of tn 10 promotes conformational changes and hairpin resolution	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2030
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2031
# text = Cell 13 :
1	Cell	cell	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	13	13	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2032
# text = 537 - 547 .
1	537	537	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	537 - 547	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	547	547	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2033
# text = Crozat E , Philippe N , Lenski RE , Geiselmann J , Schneider D. 2005 .
1	Crozat	Crozat	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	E	E	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Philippe	Philippe	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	N	N	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Lenski	Lenski	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	RE	RE	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Geiselmann	Geiselmann	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	J	J	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Schneider	Schneider	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	D.	D.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	2005	2005	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2034
# text = Long-term experimental evolution in Escherichia coli .
1	Long-term	long	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	experimental	experimental	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	evolution	evolution	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	in	in	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
5	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	coli	coli	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2035
# text = XII . DNA topology as a key target of selection .
1	XII	xii	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	DNA	DNA	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	topology	dna topology	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	as	as	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	key	hey	INT	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	target	target	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
9	of	of	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	selection	selection	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2036
# text = Genetics 169 :
1	Genetics	genetics	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	169	169	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2037
# text = 523 - 532 .
1	523	523	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	523 - 532	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	532	532	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2038
# text = Cullen PJ , Bowman WC , Hartnett DF , Reilly SC , Kranz RG. 1998 .
1	Cullen	Cullen	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	PJ	PJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Bowman	Bowman	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	WC	WC	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Hartnett	Hartnett	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	DF	DF	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Reilly	Reilly	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	SC	SC	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Kranz	Kranz	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	RG.	RG.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	1998	1998	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2039
# text = Translational activation by an NtrC enhancer-binding protein .
1	Translational	Translational	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	activation	activation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	by	by	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	an	an	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	NtrC	NtrC	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	enhancer-binding	enhancer-binding	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	protein	protein	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2040
# text = J. Mol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Mol	Mol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2041
# text = Biol .
1	Biol	biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2042
# text = 278 :
1	278	278	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2043
# text = 903 - 914 .
1	903	903	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	903 - 914	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	914	914	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2044
# text = Cunningham CW , Jeng K , Husti J , Badgett M , Molineux IJ , Hillis DM , Bull JJ. 1997 .
1	Cunningham	cunningham	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	CW	CW	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
4	Jeng	Jeng	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	K	K	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
7	Husti	Husti	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
10	Badgett	Badgett	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	M	M	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
13	Molineux	Molineux	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	IJ	IJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Hillis	Hillis	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
17	DM	DM	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Bull	Bull	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	JJ.	JJ.	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	1997	1997	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2045
# text = Parallel molecular evolution of deletions and nonsense mutations in bacteriophage T7 .
1	Parallel	parallel molecular evolution of deletions and nonsense	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	molecular	parallel molecular evolution of deletions and nonsense	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	evolution	parallel molecular evolution of deletions and nonsense	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	of	parallel molecular evolution of deletions and nonsense	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	deletions	parallel molecular evolution of deletions and nonsense	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	and	parallel molecular evolution of deletions and nonsense	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	nonsense	parallel molecular evolution of deletions and nonsense	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	mutations	mutation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	in	in	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	bacteriophage	bactériophage	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	T7	T7	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2046
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2047
# text = Biol .
1	Biol	biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2048
# text = Evol .
1	Evol	Evol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2049
# text = 14 :
1	14	14	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2050
# text = 113 - 116 .
1	113	113	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	113 - 116	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	116	116	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2051
# text = Cusick ME , Belfort M. 1998 .
1	Cusick	cusick	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	ME	ME	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
4	Belfort	Belfort	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	M.	monsieur	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	1998	1998	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2052
# text = Domain structure and RNA annealing activity of the Escherichia coli regulatory protein StpA. Mol .
1	Domain	domain structure and rna annealing activity of the escherichia coli regulatory protein stpa. mol	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
2	structure	domain structure and rna annealing activity of the escherichia coli regulatory protein stpa. mol	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
3	and	domain structure and rna annealing activity of the escherichia coli regulatory protein stpa. mol	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
4	RNA	RNA	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
5	annealing	domain structure and rna annealing activity of the escherichia coli regulatory protein stpa. mol	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
6	activity	domain structure and rna annealing activity of the escherichia coli regulatory protein stpa. mol	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
7	of	domain structure and rna annealing activity of the escherichia coli regulatory protein stpa. mol	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
8	the	domain structure and rna annealing activity of the escherichia coli regulatory protein stpa. mol	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
9	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
10	coli	domain structure and rna annealing activity of the escherichia coli regulatory protein stpa. mol	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
11	regulatory	domain structure and rna annealing activity of the escherichia coli regulatory protein stpa. mol	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
12	protein	domain structure and rna annealing activity of the escherichia coli regulatory protein stpa. mol	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
13	StpA.	StpA.	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	Mol	Mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2053
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2054
# text = 28 :
1	28	28	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2055
# text = 847 - 857 .
1	847	847	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	847 - 857	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	857	857	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2056
# text = Dame RT. 2005 .
1	Dame	damer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	RT.	RT.	NOM	_	_	1	subj	_	_	_	_	_
3	2005	2005	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2057
# text = The role of nucleoid-associated proteins in the organization and compaction of bacterial chromatin .
1	The	the role of nucleoid-associated proteins in the organization and compaction of bacterial chromatin	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	role	the role of nucleoid-associated proteins in the organization and compaction of bacterial chromatin	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
3	of	the role of nucleoid-associated proteins in the organization and compaction of bacterial chromatin	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
4	nucleoid-associated	the role of nucleoid-associated proteins in the organization and compaction of bacterial chromatin	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
5	proteins	the role of nucleoid-associated proteins in the organization and compaction of bacterial chromatin	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
6	in	the role of nucleoid-associated proteins in the organization and compaction of bacterial chromatin	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
7	the	the role of nucleoid-associated proteins in the organization and compaction of bacterial chromatin	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
8	organization	the role of nucleoid-associated proteins in the organization and compaction of bacterial chromatin	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
9	and	the role of nucleoid-associated proteins in the organization and compaction of bacterial chromatin	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
10	compaction	the role of nucleoid-associated proteins in the organization and compaction of bacterial chromatin	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
11	of	the role of nucleoid-associated proteins in the organization and compaction of bacterial chromatin	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
12	bacterial	the role of nucleoid-associated proteins in the organization and compaction of bacterial chromatin	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	chromatin	the role of nucleoid-associated proteins in the organization and compaction of bacterial chromatin	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2058
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2059
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2060
# text = 56 :
1	56	56	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2061
# text = 858 - 870 .
1	858	858	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	858 - 870	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	870	870	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2062
# text = Dame RT , Goosen N. 2002 .
1	Dame	damer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	RT	RT	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
4	Goosen	Goosen	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	N.	N.	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	2002	2002	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2063
# text = HU :
1	HU	HU	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2064
# text = promoting or counteracting DNA compaction ?
1	promoting	promotion	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	or	or	COO	_	_	3	mark	_	_	_	_	_
3	counteracting	conter	VNF	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	DNA	DNA	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	compaction	compaction	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	?	?	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2065
# text = FEBS Lett .
1	FEBS	FEBS	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Lett	Lett	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2066
# text = 529 :
1	529	529	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2067
# text = 151 - 156 .
1	151	151	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	151 - 156	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	156	156	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2068
# text = Dame RT , Wyman C , Goosen N. 2000 .
1	Dame	dame	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	RT	RT	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Wyman	Wyman	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	C	C	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
7	Goosen	Goosen	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	N.	N.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	2000	2000	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2069
# text = H-NS mediated compaction of DNA visualised by atomic force microscopy .
1	H-NS	h-ns mediated compaction of dna visualised by atomic force microscopy	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	mediated	h-ns mediated compaction of dna visualised by atomic force microscopy	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
3	compaction	h-ns mediated compaction of dna visualised by atomic force microscopy	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
4	of	h-ns mediated compaction of dna visualised by atomic force microscopy	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
5	DNA	DNA	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
6	visualised	h-ns mediated compaction of dna visualised by atomic force microscopy	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
7	by	h-ns mediated compaction of dna visualised by atomic force microscopy	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
8	atomic	h-ns mediated compaction of dna visualised by atomic force microscopy	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
9	force	h-ns mediated compaction of dna visualised by atomic force microscopy	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	microscopy	h-ns mediated compaction of dna visualised by atomic force microscopy	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2070
# text = Nucleic Acids Res .
1	Nucleic	Nucleic	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Acids	Acids	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Res	Res	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2071
# text = 28 :
1	28	28	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2072
# text = 3504 - 3510 .
1	3504	3504	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	3504 - 3510	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	3510	3510	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2073
# text = Dame RT , Wyman C , Goosen N. 2001 .
1	Dame	dame	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	RT	RT	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Wyman	Wyman	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	C	C	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
7	Goosen	Goosen	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	N.	N.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	2001	2001	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2074
# text = Structural basis for preferential binding of H-NS to curved DNA .
1	Structural	structural basis for preferential binding of h-ns to curved dna	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	basis	structural basis for preferential binding of h-ns to curved dna	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
3	for	structural basis for preferential binding of h-ns to curved dna	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
4	preferential	structural basis for preferential binding of h-ns to curved dna	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
5	binding	structural basis for preferential binding of h-ns to curved dna	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
6	of	structural basis for preferential binding of h-ns to curved dna	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
7	H-NS	H-NS	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
8	to	structural basis for preferential binding of h-ns to curved dna	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
9	curved	structural basis for preferential binding of h-ns to curved dna	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	DNA	DNA	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2075
# text = Biochimie 83 :
1	Biochimie	biochimie	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	83	83	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2076
# text = 231 - 234 .
1	231	231	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	231 - 234	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	234	234	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2077
# text = Dame RT , Wyman C , Wurm R , Wagner R , Goosen N. 2002 .
1	Dame	damer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	RT	RT	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Wyman	Wyman	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	C	C	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Wurm	Wurm	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	R	R	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Wagner	Wagner	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	R	R	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
13	Goosen	Goosen	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	N.	N.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	2002	2002	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2078
# text = Structural basis for H-NS-mediated trapping of RNA polymerase in the open initiation complex at the rr B P1 .
1	Structural	structural basis for h-ns-mediated trapping of rna polymerase in the open initiation complex at the rr b p1	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
2	basis	structural basis for h-ns-mediated trapping of rna polymerase in the open initiation complex at the rr b p1	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
3	for	structural basis for h-ns-mediated trapping of rna polymerase in the open initiation complex at the rr b p1	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
4	H-NS-mediated	H-NS-mediated	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
5	trapping	structural basis for h-ns-mediated trapping of rna polymerase in the open initiation complex at the rr b p1	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
6	of	structural basis for h-ns-mediated trapping of rna polymerase in the open initiation complex at the rr b p1	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
7	RNA	RNA	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
8	polymerase	structural basis for h-ns-mediated trapping of rna polymerase in the open initiation complex at the rr b p1	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
9	in	structural basis for h-ns-mediated trapping of rna polymerase in the open initiation complex at the rr b p1	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
10	the	structural basis for h-ns-mediated trapping of rna polymerase in the open initiation complex at the rr b p1	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
11	open	structural basis for h-ns-mediated trapping of rna polymerase in the open initiation complex at the rr b p1	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
12	initiation	structural basis for h-ns-mediated trapping of rna polymerase in the open initiation complex at the rr b p1	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
13	complex	structural basis for h-ns-mediated trapping of rna polymerase in the open initiation complex at the rr b p1	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
14	at	structural basis for h-ns-mediated trapping of rna polymerase in the open initiation complex at the rr b p1	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
15	the	structural basis for h-ns-mediated trapping of rna polymerase in the open initiation complex at the rr b p1	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
16	rr	structural basis for h-ns-mediated trapping of rna polymerase in the open initiation complex at the rr b p1	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
17	B	B	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	P1	P1	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2079
# text = J. Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2080
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2081
# text = 277 :
1	277	277	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2082
# text = 2146 - 2150 .
1	2146	2146	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	2146 - 2150	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	2150	2150	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2083
# text = Dame RT , van Mameren J , Luijsterburg MS , Mysiak ME , Janicijevic A , Pazdzior G , van der
1	Dame	Dame	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	RT	RT	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
4	van	van	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	Mameren	Mameren	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	J	J	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
8	Luijsterburg	Luijsterburg	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	MS	MS	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
11	Mysiak	Mysiak	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	ME	ME	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
14	Janicijevic	Janicijevic	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	A	A	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
17	Pazdzior	Pazdzior	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	G	G	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	van	van	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
21	der	der	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2084
# text = Vliet PC , Wyman C , Wuite GJ. 2005 .
1	Vliet	Vliet	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	PC	PC	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Wyman	Wyman	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	C	C	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Wuite	Wuite	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	GJ.	GJ.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2005	2005	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2085
# text = Analysis of scanning force microscopy images of protein-induced DNA bending using simulations .
1	Analysis	analysis of scanning force microscopy images of protein-induced dna bending using simulations	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	of	analysis of scanning force microscopy images of protein-induced dna bending using simulations	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
3	scanning	analysis of scanning force microscopy images of protein-induced dna bending using simulations	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
4	force	analysis of scanning force microscopy images of protein-induced dna bending using simulations	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
5	microscopy	analysis of scanning force microscopy images of protein-induced dna bending using simulations	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
6	images	analysis of scanning force microscopy images of protein-induced dna bending using simulations	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	of	analysis of scanning force microscopy images of protein-induced dna bending using simulations	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	protein-induced	analysis of scanning force microscopy images of protein-induced dna bending using simulations	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	DNA	DNA	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	bending	analysis of scanning force microscopy images of protein-induced dna bending using simulations	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	using	analysis of scanning force microscopy images of protein-induced dna bending using simulations	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	simulations	analysis of scanning force microscopy images of protein-induced dna bending using simulations	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2086
# text = Nucleic Acids
1	Nucleic	Nucleic	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Acids	Acids	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2087
# text = Res .
1	Res	ré	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2088
# text = 33 :
1	33	33	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2089
# text = 68 - 74 .
1	68	68	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	-	68 - 74 .	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	74	74	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	.	68 - 74 .	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2090
# text = Delihas N , Forst S. 2001 .
1	Delihas	Delihas	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	N	N	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Forst	Forst	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	S.	S.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2001	2001	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2091
# text = MicF :
1	MicF	MicF	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2092
# text = an antisense RNA gene involved in response of Escherichia coli to global stress factors .
1	an	an antisense rna gene involved in response of escherichia coli to	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	antisense	an antisense rna gene involved in response of escherichia coli to	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
3	RNA	RNA	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
4	gene	an antisense rna gene involved in response of escherichia coli to	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
5	involved	an antisense rna gene involved in response of escherichia coli to	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
6	in	an antisense rna gene involved in response of escherichia coli to	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
7	response	an antisense rna gene involved in response of escherichia coli to	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
8	of	an antisense rna gene involved in response of escherichia coli to	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
9	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
10	coli	an antisense rna gene involved in response of escherichia coli to	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	to	an antisense rna gene involved in response of escherichia coli to	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	global	global	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	stress	stress	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	factors	factor	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2093
# text = J. Mol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Mol	Mol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2094
# text = Biol .
1	Biol	biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2095
# text = 313 :
1	313	313	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2096
# text = 1 - 12 .
1	1	1	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	-	1 - 12 .	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	12	12	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	.	1 - 12 .	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2097
# text = Deng S , Stein RA , Higgins NP. 2004 .
1	Deng	Deng	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	S	S	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Stein	Stein	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	RA	RA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Higgins	Higgins	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	NP.	NP.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2004	2004	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2098
# text = Transcription-induced barriers to supercoil diffusion in the Salmonella typhimurium chromosome .
1	Transcription-induced	transcription-induced barriers to	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	barriers	transcription-induced barriers to	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	to	transcription-induced barriers to	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	supercoil	super-	_+_+CL	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	diffusion	diffusion	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	in	in	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
7	the	the salmonella typhimurium chromosome	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
8	Salmonella	Salmonella	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
9	typhimurium	the salmonella typhimurium chromosome	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	chromosome	the salmonella typhimurium chromosome	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2099
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2100
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2101
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2102
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2103
# text = U.S.A 101 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	101	101	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2104
# text = 3398 - 3403 .
1	3398	3398	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	3398 - 3403	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	3403	3403	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2105
# text = Deng S , Stein RA , Higgins NP. 2005 .
1	Deng	Deng	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	S	S	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Stein	Stein	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	RA	RA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Higgins	Higgins	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	NP.	NP.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2005	2005	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2106
# text = Organization of supercoil domains and their reorganization by transcription .
1	Organization	organization of supercoil domains and their	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	of	organization of supercoil domains and their	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	supercoil	organization of supercoil domains and their	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	domains	organization of supercoil domains and their	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	and	organization of supercoil domains and their	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	their	organization of supercoil domains and their	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	reorganization	reorganization	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	by	by	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	transcription	transcription	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2107
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2108
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2109
# text = 57 :
1	57	57	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2110
# text = 1511 - 1521 .
1	1511	1511	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1511 - 1521	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1521	1521	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2111
# text = Depew RE , Liu LF , Wang JC. 1978 .
1	Depew	Depew	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	RE	RE	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Liu	Liu	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	LF	LF	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Wang	Wang	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	JC.	JC.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1978	1978	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2112
# text = Interaction between DNA and Escherichia coli protein omega .
1	Interaction	interaction between dna and escherichia	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
2	between	interaction between dna and escherichia	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
3	DNA	DNA	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
4	and	interaction between dna and escherichia	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
6	coli	coli	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	protein	protéiner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	omega	omega	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2113
# text = Formation of a complex between single-stranded DNA and omega protein .
1	Formation	formation of a complex between single-stranded dna and omega protein	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	of	formation of a complex between single-stranded dna and omega protein	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
3	a	formation of a complex between single-stranded dna and omega protein	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
4	complex	formation of a complex between single-stranded dna and omega protein	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
5	between	formation of a complex between single-stranded dna and omega protein	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
6	single-stranded	formation of a complex between single-stranded dna and omega protein	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
7	DNA	DNA	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
8	and	formation of a complex between single-stranded dna and omega protein	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
9	omega	formation of a complex between single-stranded dna and omega protein	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	protein	formation of a complex between single-stranded dna and omega protein	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2114
# text = J. Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2115
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2116
# text = 253 :
1	253	253	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2117
# text = 511 - 518 .
1	511	511	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	511 - 518	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	518	518	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2118
# text = Derome N , Duchesne P , Bernatchez L. 2006 .
1	Derome	Derome	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	N	N	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	Duchesne	Duchesne	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	P	P	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Bernatchez	Bernatchez	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	L.	L.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2006	2006	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2119
# text = Parallelism in gene transcription among sympatric lake whitefish ( Coregonus clupeaformis Mitchill ) ecotypes .
1	Parallelism	Parallelism	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	in	in	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	gene	gêner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	transcription	transcription	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	among	amont	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	sympatric	sympatric lake whitefish ( coregonus clupeaformis mitchill ) ecotypes	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
7	lake	sympatric lake whitefish ( coregonus clupeaformis mitchill ) ecotypes	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
8	whitefish	sympatric lake whitefish ( coregonus clupeaformis mitchill ) ecotypes	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
9	(	sympatric lake whitefish ( coregonus clupeaformis mitchill ) ecotypes	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
10	Coregonus	Coregonus	NOM	_	_	14	parenth	_	_	_	_	_
11	clupeaformis	sympatric lake whitefish ( coregonus clupeaformis mitchill ) ecotypes	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
12	Mitchill	Mitchill	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_
13	)	sympatric lake whitefish ( coregonus clupeaformis mitchill ) ecotypes	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
14	ecotypes	sympatric lake whitefish ( coregonus clupeaformis mitchill ) ecotypes	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2120
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2121
# text = Ecol .
1	Ecol	Ecol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2122
# text = 15 :
1	15	15	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2123
# text = 1239 - 1249 .
1	1239	1239	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1239 - 1249	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1249	1249	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2124
# text = DiGate RJ , Marians KJ. 1989 .
1	DiGate	DiGate	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	RJ	RJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Marians	Marians	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	KJ.	KJ.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1989	1989	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2125
# text = Molecular cloning and DNA sequence analysis of Escherichia coli topB , the gene encoding topoisomerase III .
1	Molecular	molecular cloning and dna sequence analysis of escherichia coli topb	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	cloning	molecular cloning and dna sequence analysis of escherichia coli topb	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
3	and	molecular cloning and dna sequence analysis of escherichia coli topb	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
4	DNA	DNA	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
5	sequence	molecular cloning and dna sequence analysis of escherichia coli topb	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
6	analysis	molecular cloning and dna sequence analysis of escherichia coli topb	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
7	of	molecular cloning and dna sequence analysis of escherichia coli topb	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
8	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
9	coli	molecular cloning and dna sequence analysis of escherichia coli topb	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	topB	molecular cloning and dna sequence analysis of escherichia coli topb	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
12	the	the gene encoding topoisomerase iii	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
13	gene	the gene encoding topoisomerase iii	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
14	encoding	the gene encoding topoisomerase iii	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
15	topoisomerase	the gene encoding topoisomerase iii	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	III	III	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2126
# text = J. Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2127
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2128
# text = 264 :
1	264	264	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2129
# text = 17924 - 17930 .
1	17924	17924	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	17924 - 17930	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	17930	17930	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2130
# text = Dorman CJ. 2004 .
1	Dorman	Dorman	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	CJ.	CJ.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	2004	2004	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2131
# text = H-NS :
1	H-NS	heure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2132
# text = a universal regulator for a dynamic genome .
1	a	a universal regulator for a dynamic genome	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	universal	a universal regulator for a dynamic genome	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	regulator	a universal regulator for a dynamic genome	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	for	a universal regulator for a dynamic genome	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	a	a universal regulator for a dynamic genome	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	dynamic	a universal regulator for a dynamic genome	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	genome	a universal regulator for a dynamic genome	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2133
# text = Nat .
1	Nat	Nat	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2134
# text = Rev .
1	Rev	Rev	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2135
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2136
# text = 2 :
1	2	2	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2137
# text = 391 - 400 .
1	391	391	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	391 - 400	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	400	400	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2138
# text = Dorman CJ , Higgins CF. 1987 .
1	Dorman	Dorman	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	CJ	CJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Higgins	Higgins	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	CF.	CF.	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1987	1987	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2139
# text = Fimbrial phase variation in Escherichia coli :
1	Fimbrial	Fimbrial	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	phase	phase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	variation	variation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	in	in	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	coli	coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	:	:	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2140
# text = dependence on integration host factor and homologies with other site-specific recombinases .
1	dependence	dependence	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	on	on	CLS	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	integration	integration	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	host	host factor and homologies with other site-specific recombinases	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
5	factor	host factor and homologies with other site-specific recombinases	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
6	and	host factor and homologies with other site-specific recombinases	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
7	homologies	host factor and homologies with other site-specific recombinases	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
8	with	host factor and homologies with other site-specific recombinases	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
9	other	host factor and homologies with other site-specific recombinases	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
10	site-specific	host factor and homologies with other site-specific recombinases	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	recombinases	host factor and homologies with other site-specific recombinases	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2141
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2142
# text = 169 :
1	169	169	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2143
# text = 3840 - 3843 .
1	3840	3840	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	3840 - 3843	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	3843	3843	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2144
# text = Dorman CJ , Deighan P. 2003 .
1	Dorman	Dorman	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	CJ	CJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Deighan	Deighan	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	P.	P.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2003	2003	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2145
# text = Regulation of gene expression by histone-like proteins in bacteria .
1	Regulation	regulation of gene	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	of	regulation of gene	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	gene	regulation of gene	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	expression	expression	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
5	by	By	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	histone-like	histone-like	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	proteins	pro-	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	in	in	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	bacteria	bactérie	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2146
# text = Curr .
1	Curr	Curr	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2147
# text = Opin .
1	Opin	Opin	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2148
# text = Genet .
1	Genet	genet	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2149
# text = Dev .
1	Dev	Dev	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2150
# text = 13 :
1	13	13	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2151
# text = 179 - 184 .
1	179	179	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	179 - 184	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	184	184	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2152
# text = Drlica K , Zhao X. 199 7 .
1	Drlica	Drlica	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	K	K	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Zhao	Zhao	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	X.	X.	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	199	199	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	7	7	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2153
# text = DNA gyrase , topoisomerase IV , and the
1	DNA	dna	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	gyrase	gyrase	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
4	topoisomerase	topoisomerase	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	IV	IV	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
7	and	and the	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	the	and the	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2154
# text = 4- quinolones .
1	4-	4-	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	quinolones	quinoléine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2155
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2156
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2157
# text = Biol .
1	Biol	biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2158
# text = Rev .
1	Rev	Rev	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2159
# text = 61 :
1	61	61	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2160
# text = 377 - 392 .
1	377	377	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	377 - 392	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	392	392	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2161
# text = Drolet M. 2006 .
1	Drolet	drôle	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	M.	monsieur	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	2006	2006	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2162
# text = Growth inhibition mediated by excess negative supercoiling :
1	Growth	Growth	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	inhibition	inhibition	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	mediated	médiat	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	by	by	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	excess	excess	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	negative	negatif	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	supercoiling	supercoiling	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	:	:	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2163
# text = the interplay between transcription elongation , R-loop formation and DNA topology .
1	the	the interplay between transcription elongation	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	interplay	the interplay between transcription elongation	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	between	the interplay between transcription elongation	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	transcription	the interplay between transcription elongation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	elongation	the interplay between transcription elongation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
7	R-loop	R-loop	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
8	formation	r-loop formation and dna topology	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
9	and	r-loop formation and dna topology	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
10	DNA	DNA	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	topology	r-loop formation and dna topology	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2164
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2165
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2166
# text = 59 :
1	59	59	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2167
# text = 723 - 730 .
1	723	723	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	723 - 730	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	730	730	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2168
# text = Drolet M , Broccoli S , Rallu F , Hraiky C , Fortin C , Masse E , Baaklini I. 200 3 .
1	Drolet	drôle	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	M	M	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	Broccoli	Broccoli	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
5	S	S	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
7	Rallu	Rallu	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	F	F	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
10	Hraiky	Hraiky	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	C	C	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
13	Fortin	Fortin	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	C	C	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
16	Masse	Masse	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	E	E	INT	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Baaklini	Baaklini	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	I.	I.	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
21	200	200	NUM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	3	3	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2169
# text = The problem of hypernegative supercoiling and R-loop formation in transcription .
1	The	the problem of hypernegative supercoiling and r-loop	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	problem	the problem of hypernegative supercoiling and r-loop	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	of	the problem of hypernegative supercoiling and r-loop	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	hypernegative	the problem of hypernegative supercoiling and r-loop	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	supercoiling	the problem of hypernegative supercoiling and r-loop	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	and	the problem of hypernegative supercoiling and r-loop	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	R-loop	R-loop	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	formation	formation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	in	in	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	transcription	transcription	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2170
# text = Front Biosci .
1	Front	Front	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biosci	Biosci	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2171
# text = 8 :
1	8	8	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2172
# text = 210 - 221 .
1	210	210	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	210 - 221	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	221	221	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2173
# text = Earnshaw WC , Heck MM. 1985 .
1	Earnshaw	Earnshaw	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	WC	WC	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
4	Heck	Heck	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	MM.	MM.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	1985	1985	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2174
# text = Localization of topoisomerase II in mitotic chromosomes .
1	Localization	localization of topoisomerase	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	of	localization of topoisomerase	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	topoisomerase	localization of topoisomerase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	II	II	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	in	in	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	mitotic	mite	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	chromosomes	chromosome	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2175
# text = J. Cell Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Cell	Cell	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2176
# text = 100 :
1	100	100	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2177
# text = 1716 - 1725 .
1	1716	1716	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1716 - 1725	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1725	1725	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2178
# text = Endo T , Sasaki N , Tanaka I , Nakata M. 2002 .
1	Endo	Endo	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	T	T	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Sasaki	Sasaki	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	N	N	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	Tanaka	Tanaka	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	I	I	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
10	Nakata	Nakata	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	M.	monsieur	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	2002	2002	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2179
# text = Compact form of DNA induced by DNA-binding protein HU .
1	Compact	compact form of dna induced by dna-binding protein hu	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	form	compact form of dna induced by dna-binding protein hu	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	of	compact form of dna induced by dna-binding protein hu	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
4	DNA	DNA	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	induced	compact form of dna induced by dna-binding protein hu	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
6	by	compact form of dna induced by dna-binding protein hu	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
7	DNA-binding	DNA-binding	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
8	protein	compact form of dna induced by dna-binding protein hu	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	HU	HU	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2180
# text = Biochem .
1	Biochem	Biochem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2181
# text = Biophys .
1	Biophys	Biophys	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2182
# text = Res .
1	Res	ré	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2183
# text = Commun .
1	Commun	commun	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2184
# text = 290 :
1	290	290	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2185
# text = 546 - 551 .
1	546	546	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	546 - 551	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	551	551	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2186
# text = Eriksson PR , Mendiratta G , McLaughlin NB , Wolfsberg TG , Marino-Ramirez L , Pompa TA , Jainerin M , Landsman D , Shen CH , Clark DJ. 2005 .
1	Eriksson	eriksson	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
2	PR	PR	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Mendiratta	Mendiratta	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	G	G	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	McLaughlin	McLaughlin	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	NB	NB	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
10	Wolfsberg	Wolfsberg	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	TG	TG	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
13	Marino-Ramirez	Marino-Ramirez	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	L	L	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
16	Pompa	Pompa	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	TA	TA	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
19	Jainerin	Jainerin	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	M	M	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
22	Landsman	Landsman	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	D	D	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
25	Shen	Shen	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	CH	CH	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
28	Clark	Clark	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
29	DJ.	DJ.	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	2005	2005	NUM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2187
# text = Global regulation the yeast Spt 10 protein is mediated through chromatin structure and the histone upstream activating sequence elements .
1	Global	global	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	regulation	regulation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	the	the yeast spt 10 protein is mediated through chromatin structure and the histone upstream activating sequence elements	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
4	yeast	the yeast spt 10 protein is mediated through chromatin structure and the histone upstream activating sequence elements	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
5	Spt	Spt	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
6	10	10	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
7	protein	the yeast spt 10 protein is mediated through chromatin structure and the histone upstream activating sequence elements	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
8	is	the yeast spt 10 protein is mediated through chromatin structure and the histone upstream activating sequence elements	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
9	mediated	the yeast spt 10 protein is mediated through chromatin structure and the histone upstream activating sequence elements	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
10	through	the yeast spt 10 protein is mediated through chromatin structure and the histone upstream activating sequence elements	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
11	chromatin	the yeast spt 10 protein is mediated through chromatin structure and the histone upstream activating sequence elements	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
12	structure	the yeast spt 10 protein is mediated through chromatin structure and the histone upstream activating sequence elements	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
13	and	the yeast spt 10 protein is mediated through chromatin structure and the histone upstream activating sequence elements	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
14	the	the yeast spt 10 protein is mediated through chromatin structure and the histone upstream activating sequence elements	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
15	histone	the yeast spt 10 protein is mediated through chromatin structure and the histone upstream activating sequence elements	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
16	upstream	the yeast spt 10 protein is mediated through chromatin structure and the histone upstream activating sequence elements	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
17	activating	the yeast spt 10 protein is mediated through chromatin structure and the histone upstream activating sequence elements	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
18	sequence	the yeast spt 10 protein is mediated through chromatin structure and the histone upstream activating sequence elements	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	elements	the yeast spt 10 protein is mediated through chromatin structure and the histone upstream activating sequence elements	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2188
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2189
# text = Cell Biol .
1	Cell	cell	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2190
# text = 25 :
1	25	25	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2191
# text = 9127 - 9137 .
1	9127	9127	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	9127 - 9137	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	9137	9137	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2192
# text = Espeli O , Marians KJ. 2004 .
1	Espeli	Espeli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	O	O	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Marians	Marians	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	KJ.	KJ.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2004	2004	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2193
# text = Untangling intracellular DNA topology .
1	Untangling	untangling intracellular dna topology	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	intracellular	untangling intracellular dna topology	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	DNA	DNA	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	topology	untangling intracellular dna topology	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2194
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2195
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2196
# text = 52 :
1	52	52	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2197
# text = 925 - 931 .
1	925	925	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	925 - 931	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	931	931	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2198
# text = Esposito D , Gerard GF. 2003 .
1	Esposito	esposito	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	D	D	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Gerard	Gerard	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	GF.	GF.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2003	2003	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2199
# text = The Escherichia coli Fis protein stimulates bacteriophage lambda integrative recombination in vitro .
1	The	the escherichia coli fis protein stimulates bacteriophage lambda integrative recombination in vitro	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
3	coli	the escherichia coli fis protein stimulates bacteriophage lambda integrative recombination in vitro	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
5	protein	the escherichia coli fis protein stimulates bacteriophage lambda integrative recombination in vitro	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
6	stimulates	the escherichia coli fis protein stimulates bacteriophage lambda integrative recombination in vitro	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	bacteriophage	the escherichia coli fis protein stimulates bacteriophage lambda integrative recombination in vitro	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	lambda	the escherichia coli fis protein stimulates bacteriophage lambda integrative recombination in vitro	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	integrative	the escherichia coli fis protein stimulates bacteriophage lambda integrative recombination in vitro	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	recombination	the escherichia coli fis protein stimulates bacteriophage lambda integrative recombination in vitro	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	in	the escherichia coli fis protein stimulates bacteriophage lambda integrative recombination in vitro	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	vitro	the escherichia coli fis protein stimulates bacteriophage lambda integrative recombination in vitro	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2200
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2201
# text = 185 :
1	185	185	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2202
# text = 3076 - 3080 .
1	3076	3076	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	3076 - 3080	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	3080	3080	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2203
# text = Falconi M , Prosseda G , Giangrossi M , Beghetto E , Colonna B. 2001 .
1	Falconi	Falconi	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	M	M	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	Prosseda	Prosseda	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	G	G	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
7	Giangrossi	Giangrossi	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	M	M	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
10	Beghetto	Beghetto	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	E	E	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Colonna	Colonna	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	B.	B.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	2001	2001	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2204
# text = Involvement of FIS in the H-NS-mediated regulation of virF gene of Shigella and enteroinvasive Escherichia coli .
1	Involvement	involvement of fis in the h-ns-mediated regulation of virf gene of shigella and enteroinvasive escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
2	of	involvement of fis in the h-ns-mediated regulation of virf gene of shigella and enteroinvasive escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
3	FIS	FIS	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
4	in	involvement of fis in the h-ns-mediated regulation of virf gene of shigella and enteroinvasive escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
5	the	involvement of fis in the h-ns-mediated regulation of virf gene of shigella and enteroinvasive escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
6	H-NS-mediated	H-NS-mediated	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
7	regulation	involvement of fis in the h-ns-mediated regulation of virf gene of shigella and enteroinvasive escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
8	of	involvement of fis in the h-ns-mediated regulation of virf gene of shigella and enteroinvasive escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
9	virF	involvement of fis in the h-ns-mediated regulation of virf gene of shigella and enteroinvasive escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
10	gene	involvement of fis in the h-ns-mediated regulation of virf gene of shigella and enteroinvasive escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
11	of	involvement of fis in the h-ns-mediated regulation of virf gene of shigella and enteroinvasive escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
12	Shigella	Shigella	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
13	and	involvement of fis in the h-ns-mediated regulation of virf gene of shigella and enteroinvasive escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
14	enteroinvasive	involvement of fis in the h-ns-mediated regulation of virf gene of shigella and enteroinvasive escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
15	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	coli	involvement of fis in the h-ns-mediated regulation of virf gene of shigella and enteroinvasive escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2205
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2206
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2207
# text = 42 :
1	42	42	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2208
# text = 439 - 452 .
1	439	439	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	439 - 452	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	452	452	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2209
# text = Fennell-Fezzie R , Gradia SD , Akey D , Berger JM. 2005 .
1	Fennell-Fezzie	Fennell-Fezzie	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	R	R	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Gradia	Gradia	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	SD	SD	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Akey	Akey	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	D	D	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Berger	Berger	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	JM.	JM.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	2005	2005	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2210
# text = The MukF subunit of Escherichia coli condensin :
1	The	the mukf subunit of escherichia coli condensin	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	MukF	MukF	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	subunit	the mukf subunit of escherichia coli condensin	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	of	the mukf subunit of escherichia coli condensin	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	coli	the mukf subunit of escherichia coli condensin	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	condensin	the mukf subunit of escherichia coli condensin	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	:	:	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2211
# text = architecture and functional relationship to kleisins .
1	architecture	architecture and functional relationship to kleisins	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	and	architecture and functional relationship to kleisins	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	functional	architecture and functional relationship to kleisins	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	relationship	architecture and functional relationship to kleisins	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	to	architecture and functional relationship to kleisins	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	kleisins	architecture and functional relationship to kleisins	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2212
# text = EMBO J. 24 :
1	EMBO	embo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J.	J.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	24	24	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2213
# text = 1921 - 1930 .
1	1921	1921	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1921 - 1930	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1930	1930	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2214
# text = Ferenci T. 2001 .
1	Ferenci	Ferenci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	T.	T.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	2001	2001	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2215
# text = Hungry bacteria -- and properties of a nutritional state .
1	Hungry	hungry bacteria -- and properties of a nutritional state	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	bacteria	hungry bacteria -- and properties of a nutritional state	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	--	hungry bacteria -- and properties of a nutritional state	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
4	and	hungry bacteria -- and properties of a nutritional state	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	properties	hungry bacteria -- and properties of a nutritional state	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
6	of	hungry bacteria -- and properties of a nutritional state	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
7	a	hungry bacteria -- and properties of a nutritional state	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
8	nutritional	hungry bacteria -- and properties of a nutritional state	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	state	hungry bacteria -- and properties of a nutritional state	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2216
# text = Environ .
1	Environ	environ	ADV	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2217
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2218
# text = 3 :
1	3	3	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2219
# text = 605 - 611 .
1	605	605	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	605 - 611	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	611	611	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2220
# text = Ferrario M , Ernsting BR , Borst DW , Wiese DE , Blumenthal RM , Matthews RG. 1995 .
1	Ferrario	Ferrario	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	M	M	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	Ernsting	Ernsting	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	BR	BR	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
7	Borst	Borst	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	DW	DW	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
10	Wiese	Wiese	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	DE	DE	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
13	Blumenthal	Blumenthal	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	RM	RM	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Matthews	Matthews	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
17	RG.	RG.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	1995	1995	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2221
# text = The leucine-responsive regulatory protein of Escherichia coli negatively regulates transcription of ompC and micF and positively regulates translation of ompF .
1	The	the leucine-responsive regulatory protein of escherichia coli negatively regulates transcription of ompc and micf and positively regulates translation of ompf	NOM	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
2	leucine-responsive	the leucine-responsive regulatory protein of escherichia coli negatively regulates transcription of ompc and micf and positively regulates translation of ompf	NOM	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
3	regulatory	the leucine-responsive regulatory protein of escherichia coli negatively regulates transcription of ompc and micf and positively regulates translation of ompf	NOM	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
4	protein	the leucine-responsive regulatory protein of escherichia coli negatively regulates transcription of ompc and micf and positively regulates translation of ompf	NOM	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
5	of	the leucine-responsive regulatory protein of escherichia coli negatively regulates transcription of ompc and micf and positively regulates translation of ompf	NOM	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
6	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
7	coli	the leucine-responsive regulatory protein of escherichia coli negatively regulates transcription of ompc and micf and positively regulates translation of ompf	NOM	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
8	negatively	the leucine-responsive regulatory protein of escherichia coli negatively regulates transcription of ompc and micf and positively regulates translation of ompf	NOM	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
9	regulates	the leucine-responsive regulatory protein of escherichia coli negatively regulates transcription of ompc and micf and positively regulates translation of ompf	NOM	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
10	transcription	the leucine-responsive regulatory protein of escherichia coli negatively regulates transcription of ompc and micf and positively regulates translation of ompf	NOM	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
11	of	the leucine-responsive regulatory protein of escherichia coli negatively regulates transcription of ompc and micf and positively regulates translation of ompf	NOM	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
12	ompC	the leucine-responsive regulatory protein of escherichia coli negatively regulates transcription of ompc and micf and positively regulates translation of ompf	NOM	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
13	and	the leucine-responsive regulatory protein of escherichia coli negatively regulates transcription of ompc and micf and positively regulates translation of ompf	NOM	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
14	micF	the leucine-responsive regulatory protein of escherichia coli negatively regulates transcription of ompc and micf and positively regulates translation of ompf	NOM	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
15	and	the leucine-responsive regulatory protein of escherichia coli negatively regulates transcription of ompc and micf and positively regulates translation of ompf	NOM	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
16	positively	the leucine-responsive regulatory protein of escherichia coli negatively regulates transcription of ompc and micf and positively regulates translation of ompf	NOM	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
17	regulates	the leucine-responsive regulatory protein of escherichia coli negatively regulates transcription of ompc and micf and positively regulates translation of ompf	NOM	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
18	translation	the leucine-responsive regulatory protein of escherichia coli negatively regulates transcription of ompc and micf and positively regulates translation of ompf	NOM	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
19	of	the leucine-responsive regulatory protein of escherichia coli negatively regulates transcription of ompc and micf and positively regulates translation of ompf	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	ompF	the leucine-responsive regulatory protein of escherichia coli negatively regulates transcription of ompc and micf and positively regulates translation of ompf	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2222
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2223
# text = 177 :
1	177	177	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2224
# text = 103 - 113 .
1	103	103	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	103 - 113	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	113	113	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2225
# text = Filutowicz M , Ross W , Wild J , Gourse RL. 1992 .
1	Filutowicz	Filutowicz	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	M	M	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Ross	Ross	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	W	W	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Wild	Wild	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	J	J	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Gourse	Gourse	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
11	RL.	RL.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	1992	1992	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2226
# text = Involvement of Fis protein in replication of the Escherichia coli chromosome .
1	Involvement	involvement of fis protein in replication of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	of	involvement of fis protein in replication of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
3	Fis	Fis	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
4	protein	involvement of fis protein in replication of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
5	in	involvement of fis protein in replication of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
6	replication	involvement of fis protein in replication of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
7	of	involvement of fis protein in replication of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
8	the	involvement of fis protein in replication of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
9	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
10	coli	involvement of fis protein in replication of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	chromosome	involvement of fis protein in replication of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2227
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2228
# text = 174 :
1	174	174	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2229
# text = 398 - 407 .
1	398	398	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	398 - 407	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	407	407	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2230
# text = Finkel SE , Johnson RC. 1992 .
1	Finkel	Finkel	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	SE	SE	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Johnson	Johnson	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	RC.	RC.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1992	1992	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2231
# text = The Fis protein :
1	The	the fis	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	Fis	Fis	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	protein	protéiner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	:	:	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2232
# text = it's not just for DNA inversion anymore .
1	it's	it's	N+V	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	not	nô	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	just	jus	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	for	for dna inversion anymore	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	DNA	DNA	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	inversion	for dna inversion anymore	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	anymore	for dna inversion anymore	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2233
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2234
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2235
# text = 6 :
1	6	6	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2236
# text = 3257 - 3265 .
1	3257	3257	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	3257 - 3265	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	3265	3265	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2237
# text = Fong SS , Joyce AR , Palsson BO. 2005 .
1	Fong	Fong	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	SS	SS	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Joyce	Joyce	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	AR	AR	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Palsson	Palsson	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	BO.	BO.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2005	2005	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2238
# text = Parallel adaptive evolution cultures of Escherichia coli lead to convergent growth phenotypes with different gene expression states .
1	Parallel	Parallel	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	adaptive	adaptif	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	evolution	évolution	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	cultures	culture	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	of	of escherichia coli lead to convergent growth phenotypes	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
6	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	coli	of escherichia coli lead to convergent growth phenotypes	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	lead	of escherichia coli lead to convergent growth phenotypes	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	to	of escherichia coli lead to convergent growth phenotypes	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	convergent	of escherichia coli lead to convergent growth phenotypes	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	growth	of escherichia coli lead to convergent growth phenotypes	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	phenotypes	of escherichia coli lead to convergent growth phenotypes	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	with	dire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	different	différent	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	gene	gène	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	expression	expression	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	states	state	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2239
# text = Genome Res .
1	Genome	génome	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Res	Res	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2240
# text = 15 :
1	15	15	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2241
# text = 1365 - 1372 .
1	1365	1365	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1365 - 1372	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1372	1372	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2242
# text = Franco RJ , Drlica K. 1988 .
1	Franco	Franco	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	RJ	RJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Drlica	Drlica	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	K.	K.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1988	1988	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2243
# text = DNA gyrase on the bacterial chromosome .
1	DNA	dna gyrase on the bacterial chromosome	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	gyrase	dna gyrase on the bacterial chromosome	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	on	dna gyrase on the bacterial chromosome	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	the	dna gyrase on the bacterial chromosome	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	bacterial	dna gyrase on the bacterial chromosome	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	chromosome	dna gyrase on the bacterial chromosome	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2244
# text = Oxolinic acid-induced DNA cleavage in the dnaA-gyrB region .
1	Oxolinic	oxolinic acid-induced dna cleavage in the dnaa-gyrb region	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	acid-induced	oxolinic acid-induced dna cleavage in the dnaa-gyrb region	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
3	DNA	DNA	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
4	cleavage	oxolinic acid-induced dna cleavage in the dnaa-gyrb region	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
5	in	oxolinic acid-induced dna cleavage in the dnaa-gyrb region	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
6	the	oxolinic acid-induced dna cleavage in the dnaa-gyrb region	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
7	dnaA-gyrB	oxolinic acid-induced dna cleavage in the dnaa-gyrb region	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	region	oxolinic acid-induced dna cleavage in the dnaa-gyrb region	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2245
# text = J. Mol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Mol	Mol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2246
# text = Biol .
1	Biol	biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2247
# text = 201 :
1	201	201	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2248
# text = 229 - 233 .
1	229	229	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	229 - 233	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	233	233	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2249
# text = Franco RJ , Drlica K. 1989 .
1	Franco	Franco	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	RJ	RJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Drlica	Drlica	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	K.	K.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1989	1989	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2250
# text = Gyrase inhibitors can increase gyrA expression and DNA supercoiling .
1	Gyrase	gyrase inhibitors can increase gyra expression and dna supercoiling	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	inhibitors	gyrase inhibitors can increase gyra expression and dna supercoiling	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	can	gyrase inhibitors can increase gyra expression and dna supercoiling	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
4	increase	gyrase inhibitors can increase gyra expression and dna supercoiling	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	gyrA	gyrase inhibitors can increase gyra expression and dna supercoiling	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
6	expression	gyrase inhibitors can increase gyra expression and dna supercoiling	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
7	and	gyrase inhibitors can increase gyra expression and dna supercoiling	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
8	DNA	DNA	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	supercoiling	gyrase inhibitors can increase gyra expression and dna supercoiling	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2251
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2252
# text = 171 :
1	171	171	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2253
# text = 6573 - 6579 .
1	6573	6573	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	6573 - 6579	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	6579	6579	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2254
# text = Free A , Dorman CJ. 1995 .
1	Free	free	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	A	A	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Dorman	Dorman	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	CJ.	CJ.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1995	1995	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2255
# text = Coupling of Escherichia coli hns mRNA levels to DNA synthesis by autoregulation :
1	Coupling	coupling of escherichia coli hns mrna levels to dna synthesis by autoregulation	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	of	coupling of escherichia coli hns mrna levels to dna synthesis by autoregulation	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
3	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
4	coli	coupling of escherichia coli hns mrna levels to dna synthesis by autoregulation	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
5	hns	coupling of escherichia coli hns mrna levels to dna synthesis by autoregulation	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
6	mRNA	coupling of escherichia coli hns mrna levels to dna synthesis by autoregulation	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	levels	coupling of escherichia coli hns mrna levels to dna synthesis by autoregulation	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	to	coupling of escherichia coli hns mrna levels to dna synthesis by autoregulation	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	DNA	DNA	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	synthesis	coupling of escherichia coli hns mrna levels to dna synthesis by autoregulation	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	by	coupling of escherichia coli hns mrna levels to dna synthesis by autoregulation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	autoregulation	coupling of escherichia coli hns mrna levels to dna synthesis by autoregulation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	:	:	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2256
# text = implications for growth phase control .
1	implications	implications for growth phase control	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	for	implications for growth phase control	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	growth	implications for growth phase control	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	phase	implications for growth phase control	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	control	implications for growth phase control	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2257
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2258
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2259
# text = 18 :
1	18	18	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2260
# text = 101 - 113 .
1	101	101	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	101 - 113	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	113	113	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2261
# text = Free A , Porter ME , Deighan P , Dorman CJ. 2001 .
1	Free	free	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	A	A	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
4	Porter	Porter	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	ME	ME	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
7	Deighan	Deighan	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	P	P	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
10	Dorman	Dorman	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
11	CJ.	CJ.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	2001	2001	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2262
# text = Requirement for the molecular adapter function of StpA at the Escherichia coli bgl promoter depends upon the level of truncated H-NS protein .
1	Requirement	requirement for the molecular adapter function of stpa at the escherichia coli bgl promoter depends upon the level of truncated h-ns protein	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
2	for	requirement for the molecular adapter function of stpa at the escherichia coli bgl promoter depends upon the level of truncated h-ns protein	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
3	the	requirement for the molecular adapter function of stpa at the escherichia coli bgl promoter depends upon the level of truncated h-ns protein	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
4	molecular	requirement for the molecular adapter function of stpa at the escherichia coli bgl promoter depends upon the level of truncated h-ns protein	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
5	adapter	requirement for the molecular adapter function of stpa at the escherichia coli bgl promoter depends upon the level of truncated h-ns protein	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
6	function	requirement for the molecular adapter function of stpa at the escherichia coli bgl promoter depends upon the level of truncated h-ns protein	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
7	of	requirement for the molecular adapter function of stpa at the escherichia coli bgl promoter depends upon the level of truncated h-ns protein	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
8	StpA	StpA	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
9	at	requirement for the molecular adapter function of stpa at the escherichia coli bgl promoter depends upon the level of truncated h-ns protein	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
10	the	requirement for the molecular adapter function of stpa at the escherichia coli bgl promoter depends upon the level of truncated h-ns protein	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
11	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
12	coli	requirement for the molecular adapter function of stpa at the escherichia coli bgl promoter depends upon the level of truncated h-ns protein	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
13	bgl	requirement for the molecular adapter function of stpa at the escherichia coli bgl promoter depends upon the level of truncated h-ns protein	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
14	promoter	requirement for the molecular adapter function of stpa at the escherichia coli bgl promoter depends upon the level of truncated h-ns protein	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
15	depends	requirement for the molecular adapter function of stpa at the escherichia coli bgl promoter depends upon the level of truncated h-ns protein	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
16	upon	requirement for the molecular adapter function of stpa at the escherichia coli bgl promoter depends upon the level of truncated h-ns protein	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
17	the	requirement for the molecular adapter function of stpa at the escherichia coli bgl promoter depends upon the level of truncated h-ns protein	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
18	level	requirement for the molecular adapter function of stpa at the escherichia coli bgl promoter depends upon the level of truncated h-ns protein	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
19	of	requirement for the molecular adapter function of stpa at the escherichia coli bgl promoter depends upon the level of truncated h-ns protein	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
20	truncated	requirement for the molecular adapter function of stpa at the escherichia coli bgl promoter depends upon the level of truncated h-ns protein	NOM	_	_	22	periph	_	_	_	_	_
21	H-NS	H-NS	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	protein	requirement for the molecular adapter function of stpa at the escherichia coli bgl promoter depends upon the level of truncated h-ns protein	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2263
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2264
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2265
# text = 42 :
1	42	42	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2266
# text = 903 - 917 .
1	903	903	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	903 - 917	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	917	917	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2267
# text = Frenkiel-Krispin D , Ben Avraham I , Englander J , Shimoni E , Wolf SG , Minsky A. 2004 .
1	Frenkiel-Krispin	Frenkiel-Krispin	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	D	D	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Ben	Ben	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	Avraham	Avraham	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	I	I	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
8	Englander	Englander	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	J	J	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
11	Shimoni	Shimoni	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
12	E	E	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
14	Wolf	Wolf	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	SG	SG	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
17	Minsky	Minsky	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
18	A.	A.	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	2004	2004	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2268
# text = Nucleoid restructuring in stationary-state bacteria .
1	Nucleoid	nucleoid restructuring in stationary-state bacteria	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	restructuring	nucleoid restructuring in stationary-state bacteria	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	in	nucleoid restructuring in stationary-state bacteria	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	stationary-state	nucleoid restructuring in stationary-state bacteria	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	bacteria	nucleoid restructuring in stationary-state bacteria	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2269
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2270
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2271
# text = 51 :
1	51	51	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2272
# text = 395 - 405 .
1	395	395	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	395 - 405	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	405	405	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2273
# text = Friedberg E , Walker GC , Siede W. 1995 .
1	Friedberg	friedberg	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	E	E	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Walker	Walker	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	GC	GC	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Siede	Siede	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	W.	W.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1995	1995	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2274
# text = DNA repair and mutagenesis .
1	DNA	dna repair and mutagenesis	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	repair	dna repair and mutagenesis	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	and	dna repair and mutagenesis	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	mutagenesis	dna repair and mutagenesis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2275
# text = ASM press , Washington , DC. 376 .
1	ASM	asm	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	press	press	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Washington	Washington	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
6	DC.	DC.	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	376	376	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2276
# text = Gellert M , Mizuuchi K , O'Dea MH , Nash HA. 1976 .
1	Gellert	Gellert	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	M	M	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	Mizuuchi	Mizuuchi	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	K	K	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
7	O'Dea	O'Dea	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	MH	MH	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Nash	Nash	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	HA.	HA.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	1976	1976	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2277
# text = DNA gyrase :
1	DNA	DNA	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	gyrase	gyrase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2278
# text = an enzyme that introduces superhelical turns into DNA .
1	an	an enzyme that introduces superhelical turns into dna	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	enzyme	an enzyme that introduces superhelical turns into dna	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
3	that	an enzyme that introduces superhelical turns into dna	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
4	introduces	an enzyme that introduces superhelical turns into dna	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
5	superhelical	an enzyme that introduces superhelical turns into dna	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
6	turns	an enzyme that introduces superhelical turns into dna	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
7	into	an enzyme that introduces superhelical turns into dna	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	DNA	DNA	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2279
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2280
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2281
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2282
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2283
# text = U.S.A 73 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	73	73	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2284
# text = 3872 - 3876 .
1	3872	3872	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	3872 - 3876	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	3876	3876	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2285
# text = Georgopoulos CP. 1977 .
1	Georgopoulos	Georgopoulos	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	CP.	CP.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	1977	1977	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2286
# text = A new bacterial gene ( groPC ) which affects lambda DNA replication .
1	A	a new bacterial gene	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	new	a new bacterial gene	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	bacterial	a new bacterial gene	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	gene	a new bacterial gene	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	(	(	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	groPC	groPC	ADJ	_	_	8	parenth	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
8	which	chiche	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	affects	affect	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	lambda	lambda	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	DNA	DNA	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	replication	replication	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2287
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2288
# text = Gen .
1	Gen	Gen	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2289
# text = Genet .
1	Genet	genet	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2290
# text = 151 :
1	151	151	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2291
# text = 35 - 39 .
1	35	35	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	-	35 - 39 .	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	39	39	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	.	35 - 39 .	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2292
# text = Gerrish PJ , Lenski RE. 1998 .
1	Gerrish	Gerrish	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	PJ	PJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Lenski	Lenski	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	RE.	RE.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1998	1998	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2293
# text = The fate of competing beneficial mutations in an asexual population .
1	The	the fate of competing beneficial	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	fate	the fate of competing beneficial	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	of	the fate of competing beneficial	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	competing	the fate of competing beneficial	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	beneficial	the fate of competing beneficial	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	mutations	mutation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	in	in	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	an	an	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	asexual	asexual	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	population	population	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2294
# text = Genetica 102 - 103 :
1	Genetica	Genetica	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	102	102	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	-	102 - 103	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	103	103	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	:	:	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2295
# text = 127 - 144 .
1	127	127	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	127 - 144	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	144	144	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2296
# text = Gille H , Egan JB , Roth A , Messer W. 1991 .
1	Gille	gille	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	H	H	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Egan	Egan	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	JB	JB	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	Roth	Roth	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	A	A	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Messer	Messer	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	W.	W.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	1991	1991	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2297
# text = The FIS protein binds and bends the origin of chromosomal DNA replication , oriC , of Escherichia coli .
1	The	the fis protein binds and bends the origin of chromosomal dna replication	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	FIS	FIS	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
3	protein	the fis protein binds and bends the origin of chromosomal dna replication	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
4	binds	the fis protein binds and bends the origin of chromosomal dna replication	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
5	and	the fis protein binds and bends the origin of chromosomal dna replication	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
6	bends	the fis protein binds and bends the origin of chromosomal dna replication	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	the	the fis protein binds and bends the origin of chromosomal dna replication	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	origin	the fis protein binds and bends the origin of chromosomal dna replication	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	of	the fis protein binds and bends the origin of chromosomal dna replication	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	chromosomal	the fis protein binds and bends the origin of chromosomal dna replication	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	DNA	DNA	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	replication	the fis protein binds and bends the origin of chromosomal dna replication	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
14	oriC	oriC	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
16	of	of escherichia	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
18	coli	colis	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2298
# text = Nucleic Acids Res .
1	Nucleic	Nucleic	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Acids	Acids	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Res	Res	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2299
# text = 19 :
1	19	19	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2300
# text = 4167 - 4172 .
1	4167	4167	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	4167 - 4172	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	4172	4172	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2301
# text = Gmuender H , Kuratli K , Di Padova K , Gray CP , Keck W , Evers S. 2001 .
1	Gmuender	Gmuender	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	H	H	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Kuratli	Kuratli	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	K	K	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Di	Di	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	Padova	Padova	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	K	K	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
11	Gray	Gray	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	CP	CP	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
14	Keck	Keck	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	W	W	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
17	Evers	Evers	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
18	S.	S.	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	2001	2001	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2302
# text = Gene expression changes triggered by exposure of Haemophilus influenzae to novobiocin or ciprofloxacin :
1	Gene	gêner	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	expression	expression	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	changes	change	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	triggered	triggered by exposure of haemophilus influenzae to novobiocin or ciprofloxacin	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
5	by	triggered by exposure of haemophilus influenzae to novobiocin or ciprofloxacin	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
6	exposure	triggered by exposure of haemophilus influenzae to novobiocin or ciprofloxacin	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
7	of	triggered by exposure of haemophilus influenzae to novobiocin or ciprofloxacin	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
8	Haemophilus	Haemophilus	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
9	influenzae	triggered by exposure of haemophilus influenzae to novobiocin or ciprofloxacin	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
10	to	triggered by exposure of haemophilus influenzae to novobiocin or ciprofloxacin	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
11	novobiocin	triggered by exposure of haemophilus influenzae to novobiocin or ciprofloxacin	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
12	or	triggered by exposure of haemophilus influenzae to novobiocin or ciprofloxacin	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	ciprofloxacin	triggered by exposure of haemophilus influenzae to novobiocin or ciprofloxacin	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
14	:	:	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2303
# text = combined transcription and translation analysis .
1	combined	combined transcription and translation analysis	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	transcription	combined transcription and translation analysis	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	and	combined transcription and translation analysis	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	translation	combined transcription and translation analysis	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	analysis	combined transcription and translation analysis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2304
# text = Genome Res .
1	Genome	génome	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Res	Res	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2305
# text = 11 : 28 - 42 .
1	11	11	NUM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	:	11 : 28	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	28	28	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	-	- 42	PUNC	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	42	42	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2306
# text = Goldberg MD , Johnson M , Hinton JC , Williams PH. 2001 .
1	Goldberg	goldberg	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	MD	MD	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Johnson	Johnson	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	M	M	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Hinton	Hinton	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	JC	JC	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Williams	Williams	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	PH.	PH.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	2001	2001	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2307
# text = Role of the nucleoid-associated protein Fis in the regulation of virulence properties of enteropathogenic Escherichia coli .
1	Role	role of the nucleoid-associated protein fis in the regulation of virulence properties of enteropathogenic escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
2	of	role of the nucleoid-associated protein fis in the regulation of virulence properties of enteropathogenic escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
3	the	role of the nucleoid-associated protein fis in the regulation of virulence properties of enteropathogenic escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
4	nucleoid-associated	role of the nucleoid-associated protein fis in the regulation of virulence properties of enteropathogenic escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
5	protein	role of the nucleoid-associated protein fis in the regulation of virulence properties of enteropathogenic escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
6	Fis	Fis	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
7	in	role of the nucleoid-associated protein fis in the regulation of virulence properties of enteropathogenic escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
8	the	role of the nucleoid-associated protein fis in the regulation of virulence properties of enteropathogenic escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
9	regulation	role of the nucleoid-associated protein fis in the regulation of virulence properties of enteropathogenic escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
10	of	role of the nucleoid-associated protein fis in the regulation of virulence properties of enteropathogenic escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
11	virulence	role of the nucleoid-associated protein fis in the regulation of virulence properties of enteropathogenic escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
12	properties	role of the nucleoid-associated protein fis in the regulation of virulence properties of enteropathogenic escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
13	of	role of the nucleoid-associated protein fis in the regulation of virulence properties of enteropathogenic escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
14	enteropathogenic	role of the nucleoid-associated protein fis in the regulation of virulence properties of enteropathogenic escherichia coli	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
15	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	coli	role of the nucleoid-associated protein fis in the regulation of virulence properties of enteropathogenic escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2308
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2309
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2310
# text = 41 :
1	41	41	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2311
# text = 549 - 559 .
1	549	549	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	549 - 559	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	559	559	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2312
# text = Gonzalez-Gil G , Bringmann P , Kahmann R. 1996 .
1	Gonzalez-Gil	gonzalez-gil	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	G	G	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Bringmann	Bringmann	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	P	P	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Kahmann	Kahmann	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	R.	R.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1996	1996	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2313
# text = FIS is a regulator of metabolism in Escherichia coli .
1	FIS	fis is a regulator of	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
2	is	fis is a regulator of	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
3	a	fis is a regulator of	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
4	regulator	fis is a regulator of	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	of	fis is a regulator of	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	metabolism	metabolism	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	in	in	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
8	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	coli	coli	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2314
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2315
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2316
# text = 22 : 21 - 29 .
1	22	22	NUM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	:	22 : 21	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	21	21	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	-	- 29	PUNC	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	29	29	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2317
# text = Goosen N , van de Putte P. 1995 .
1	Goosen	goosen	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	N	N	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	van	van	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	Putte	Putte	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	P.	P.	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	1995	1995	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2318
# text = The regulation of transcription initiation by integration host factor .
1	The	the regulation of	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	regulation	the regulation of	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	of	the regulation of	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	transcription	transcription	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	initiation	initiation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	by	by	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	integration	integration	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	host	host	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	factor	factor	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2319
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2320
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2321
# text = 16 :
1	16	16	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2322
# text = 1 - 7 .
1	1	1	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	-	1 - 7 .	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	7	7	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	.	1 - 7 .	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2323
# text = Graeme-Cook KA , May G , Bremer E , Higgins CF. 1989 .
1	Graeme-Cook	Graeme-Cook	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	KA	KA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	May	May	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	G	G	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Bremer	Bremer	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	E	E	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Higgins	Higgins	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	CF.	CF.	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	1989	1989	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2324
# text = Osmotic regulation of porin expression :
1	Osmotic	osmotic regulation of porin expression	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	regulation	osmotic regulation of porin expression	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	of	osmotic regulation of porin expression	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	porin	osmotic regulation of porin expression	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	expression	osmotic regulation of porin expression	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	:	:	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2325
# text = a role for DNA supercoiling .
1	a	a role for dna supercoiling	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	role	a role for dna supercoiling	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	for	a role for dna supercoiling	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	DNA	DNA	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	supercoiling	a role for dna supercoiling	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2326
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2327
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2328
# text = 3 :
1	3	3	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2329
# text = 1287 - 1294 .
1	1287	1287	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1287 - 1294	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1294	1294	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2330
# text = Grainger DC , Hurd D , Goldberg MD , Busby SJ. 2006 .
1	Grainger	Grainger	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	DC	DC	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Hurd	Hurd	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	D	D	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Goldberg	Goldberg	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	MD	MD	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Busby	Busby	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	SJ.	SJ.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	2006	2006	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2331
# text = Association of nucleoid proteins with coding and non-coding segments of the Escherichia coli genome .
1	Association	association of nucleoid	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	of	association of nucleoid	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	nucleoid	association of nucleoid	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	proteins	pro-	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	with	dire	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	coding	coding	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	and	and	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	non-coding	non-	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	segments	segment	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	of	of the escherichia coli genome	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
11	the	of the escherichia coli genome	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
12	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
13	coli	of the escherichia coli genome	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	genome	of the escherichia coli genome	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2332
# text = Nucleic Acids Res .
1	Nucleic	Nucleic	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Acids	Acids	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Res	Res	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2333
# text = Grant RA , Filman DJ , Finkel SE , Kolter R , Hogle JM. 1998 .
1	Grant	Grant	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	RA	RA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Filman	Filman	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	DJ	DJ	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Finkel	Finkel	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	SE	SE	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Kolter	Kolter	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	R	R	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Hogle	Hogle	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
14	JM.	JM.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	1998	1998	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2334
# text = The crystal structure of Dps , a ferritin homolog that binds and protects DNA .
1	The	the crystal structure of dps	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	crystal	the crystal structure of dps	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	structure	the crystal structure of dps	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	of	the crystal structure of dps	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	Dps	Dps	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
7	a	a ferritin homolog that binds and protects dna	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
8	ferritin	a ferritin homolog that binds and protects dna	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
9	homolog	a ferritin homolog that binds and protects dna	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
10	that	a ferritin homolog that binds and protects dna	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
11	binds	a ferritin homolog that binds and protects dna	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
12	and	a ferritin homolog that binds and protects dna	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
13	protects	a ferritin homolog that binds and protects dna	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	DNA	DNA	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2335
# text = Nat .
1	Nat	Nat	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2336
# text = Struct .
1	Struct	Struct	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2337
# text = Biol .
1	Biol	biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2338
# text = 5 :
1	5	5	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2339
# text = 294 - 303 .
1	294	294	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	294 - 303	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	303	303	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2340
# text = Grossman AD , Erickson JW , Gross CA. 1984 .
1	Grossman	Grossman	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	AD	AD	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Erickson	Erickson	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	JW	JW	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Gross	Gross	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	CA.	CA.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1984	1984	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2341
# text = The htpR gene product of E. coli is a sigma factor for heat-shock promoters .
1	The	the htpr gene product of e. coli is	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	htpR	the htpr gene product of e. coli is	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
3	gene	the htpr gene product of e. coli is	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
4	product	the htpr gene product of e. coli is	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
5	of	the htpr gene product of e. coli is	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
6	E.	E.	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
7	coli	the htpr gene product of e. coli is	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	is	the htpr gene product of e. coli is	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	a	avoir	VRB	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	sigma	sigma	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	factor	factor	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	for	for heat-shock promoters	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
13	heat-shock	for heat-shock promoters	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	promoters	for heat-shock promoters	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2342
# text = Cell 38 :
1	Cell	cell	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	38	38	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2343
# text = 383 - 390 .
1	383	383	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	383 - 390	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	390	390	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2344
# text = Hall MN , Silhavy TJ. 1981 .
1	Hall	Hall	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	MN	MN	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Silhavy	Silhavy	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	TJ.	TJ.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1981	1981	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2345
# text = Genetic analysis of the ompB locus in Escherichia coli K- 12 .
1	Genetic	genetic analysis of the	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	analysis	genetic analysis of the	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	of	genetic analysis of the	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	the	genetic analysis of the	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	ompB	ompB	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	locus	locus	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	in	in	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	coli	coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	K-	K-	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	12	12	NUM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2346
# text = J. Mol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Mol	Mol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2347
# text = Biol .
1	Biol	biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2348
# text = 151 :
1	151	151	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2349
# text = 1 - 15 .
1	1	1	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	-	1 - 15 .	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	15	15	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	.	1 - 15 .	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2350
# text = Hanvey JC , Shimizu M , Wells RD. 1988 .
1	Hanvey	Hanvey	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	JC	JC	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Shimizu	Shimizu	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	M	M	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Wells	Wells	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	RD.	RD.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1988	1988	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2351
# text = Intramolecular DNA triplexes in supercoiled plasmids .
1	Intramolecular	intramolecular dna triplexes in supercoiled plasmids	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	DNA	DNA	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	triplexes	intramolecular dna triplexes in supercoiled plasmids	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	in	intramolecular dna triplexes in supercoiled plasmids	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	supercoiled	intramolecular dna triplexes in supercoiled plasmids	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	plasmids	intramolecular dna triplexes in supercoiled plasmids	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2352
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2353
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2354
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2355
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2356
# text = U.S.A 85 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	85	85	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2357
# text = 6292 - 6296 .
1	6292	6292	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	6292 - 6296	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	6296	6296	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2358
# text = Hardy CD , Cozzarelli NR. 2005 .
1	Hardy	Hardy	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	CD	CD	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	NR.	NR.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2005	2005	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2359
# text = A genetic selection for supercoiling mutants of Escherichia coli reveals proteins implicated in chromosome structure .
1	A	a genetic selection for supercoiling mutants of escherichia coli reveals proteins implicated	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
2	genetic	a genetic selection for supercoiling mutants of escherichia coli reveals proteins implicated	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
3	selection	a genetic selection for supercoiling mutants of escherichia coli reveals proteins implicated	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
4	for	a genetic selection for supercoiling mutants of escherichia coli reveals proteins implicated	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
5	supercoiling	a genetic selection for supercoiling mutants of escherichia coli reveals proteins implicated	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
6	mutants	a genetic selection for supercoiling mutants of escherichia coli reveals proteins implicated	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
7	of	a genetic selection for supercoiling mutants of escherichia coli reveals proteins implicated	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
8	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
9	coli	a genetic selection for supercoiling mutants of escherichia coli reveals proteins implicated	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
10	reveals	a genetic selection for supercoiling mutants of escherichia coli reveals proteins implicated	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
11	proteins	a genetic selection for supercoiling mutants of escherichia coli reveals proteins implicated	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	implicated	a genetic selection for supercoiling mutants of escherichia coli reveals proteins implicated	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
13	in	in	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	chromosome	chromosome	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	structure	structurer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2360
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2361
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2362
# text = 57 :
1	57	57	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2363
# text = 1636 - 1652 .
1	1636	1636	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1636 - 1652	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1652	1652	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2364
# text = Hatfield GW , Benham CJ. 2002 .
1	Hatfield	hatfield	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	GW	GW	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Benham	Benham	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	CJ.	CJ.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2002	2002	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2365
# text = DNA topology-mediated control of global gene expression in Escherichia coli .
1	DNA	dna topology-mediated control of global gene	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	topology-mediated	dna topology-mediated control of global gene	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	control	dna topology-mediated control of global gene	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	of	dna topology-mediated control of global gene	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	global	dna topology-mediated control of global gene	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	gene	dna topology-mediated control of global gene	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	expression	expression	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	in	in	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	Escherichia	Escherichia	_	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	coli	coli	_	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2366
# text = Annu .
1	Annu	Annu	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2367
# text = Rev .
1	Rev	Rev	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2368
# text = Genet .
1	Genet	genet	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2369
# text = 36 :
1	36	36	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2370
# text = 175 - 203 .
1	175	175	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	175 - 203	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	203	203	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2371
# text = Heck MM. 1997 .
1	Heck	Heck	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	MM.	MM.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	1997	1997	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2372
# text = Condensins , cohesins , and chromosome architecture :
1	Condensins	Condensins	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	cohesins	cohésif	ADJ	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
5	and	and	ADV	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	chromosome	chromosome	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	architecture	architecturer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	:	:	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2373
# text = how to make and break a mitotic chromosome .
1	how	how to make and	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	to	how to make and	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	make	how to make and	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	and	how to make and	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	break	break	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	a	avoir	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	mitotic	mite	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	chromosome	chromosome	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2374
# text = Cell 91 :
1	Cell	cell	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	91	91	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2375
# text = 5 - 8 .
1	5	5	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	-	5 - 8 .	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	8	8	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	.	5 - 8 .	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2376
# text = Heggeler-Bordier B , Wahli W , Adrian M , Stasiak A , Dubochet J. 1992 .
1	Heggeler-Bordier	Heggeler-Bordier	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	B	B	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Wahli	Wahli	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	W	W	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Adrian	Adrian	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	M	M	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Stasiak	Stasiak	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	A	A	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Dubochet	Dubochet	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	J.	J.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	1992	1992	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2377
# text = The apical localization of transcribing RNA polymerases on supercoiled DNA prevents their rotation around the template .
1	The	the apical localization of transcribing rna polymerases on supercoiled dna prevents their rotation around the template	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
2	apical	the apical localization of transcribing rna polymerases on supercoiled dna prevents their rotation around the template	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
3	localization	the apical localization of transcribing rna polymerases on supercoiled dna prevents their rotation around the template	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
4	of	the apical localization of transcribing rna polymerases on supercoiled dna prevents their rotation around the template	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
5	transcribing	the apical localization of transcribing rna polymerases on supercoiled dna prevents their rotation around the template	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
6	RNA	RNA	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
7	polymerases	the apical localization of transcribing rna polymerases on supercoiled dna prevents their rotation around the template	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
8	on	the apical localization of transcribing rna polymerases on supercoiled dna prevents their rotation around the template	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
9	supercoiled	the apical localization of transcribing rna polymerases on supercoiled dna prevents their rotation around the template	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
10	DNA	DNA	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
11	prevents	the apical localization of transcribing rna polymerases on supercoiled dna prevents their rotation around the template	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
12	their	the apical localization of transcribing rna polymerases on supercoiled dna prevents their rotation around the template	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
13	rotation	the apical localization of transcribing rna polymerases on supercoiled dna prevents their rotation around the template	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
14	around	the apical localization of transcribing rna polymerases on supercoiled dna prevents their rotation around the template	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
15	the	the apical localization of transcribing rna polymerases on supercoiled dna prevents their rotation around the template	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	template	the apical localization of transcribing rna polymerases on supercoiled dna prevents their rotation around the template	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2378
# text = EMBO J. 11 :
1	EMBO	embo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J.	J.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	11	11	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2379
# text = 667 - 672 .
1	667	667	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	667 - 672	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	672	672	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2380
# text = Hengen PN , Bartram SL , Stewart LE , Schneider TD. 1997 .
1	Hengen	Hengen	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	PN	PN	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Bartram	Bartram	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	SL	SL	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	sl , stewart le	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Stewart	Stewart	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	LE	LE	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Schneider	Schneider	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
11	TD.	TD.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	1997	1997	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2381
# text = Information analysis of Fis binding sites .
1	Information	information analysis of fis binding sites	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	analysis	information analysis of fis binding sites	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	of	information analysis of fis binding sites	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	binding	information analysis of fis binding sites	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	sites	information analysis of fis binding sites	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2382
# text = Nucleic Acids Res .
1	Nucleic	Nucleic	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Acids	Acids	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Res	Res	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2383
# text = 25 :
1	25	25	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2384
# text = 4994 - 5002 .
1	4994	4994	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	4994 - 5002	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	5002	5002	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2385
# text = Hengge-Aronis R. 2002 .
1	Hengge-Aronis	Hengge-Aronis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	R.	R.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	2002	2002	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2386
# text = Stationary phase gene regulation :
1	Stationary	Stationary	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	phase	phase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	gene	gêne	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	regulation	regulation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	:	:	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2387
# text = what makes an Escherichia coli promoter sigmaS-selective ?
1	what	what	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	makes	makes	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	an	an	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	coli	coli	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	promoter	pro-	_+V	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	sigmaS-selective	sigmaS-selective	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	?	?	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2388
# text = Curr .
1	Curr	Curr	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2389
# text = Opin .
1	Opin	Opin	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2390
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2391
# text = 5 :
1	5	5	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2392
# text = 591 - 595 .
1	591	591	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	591 - 595	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	595	595	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2393
# text = Hiasa H , DiGate RJ , Marians KJ. 1994 .
1	Hiasa	Hiasa	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	H	H	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	DiGate	DiGate	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	RJ	RJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Marians	Marians	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	KJ.	KJ.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1994	1994	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2394
# text = Decatenating activity of Escherichia coli DNA gyrase and topoisomerases I and III during oriC and pBR 322 DNA replication in vitro .
1	Decatenating	decatenating activity of escherichia coli dna gyrase and topoisomerases i and iii during oric and	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
2	activity	decatenating activity of escherichia coli dna gyrase and topoisomerases i and iii during oric and	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
3	of	decatenating activity of escherichia coli dna gyrase and topoisomerases i and iii during oric and	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
4	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
5	coli	decatenating activity of escherichia coli dna gyrase and topoisomerases i and iii during oric and	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
6	DNA	DNA	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
7	gyrase	decatenating activity of escherichia coli dna gyrase and topoisomerases i and iii during oric and	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
8	and	decatenating activity of escherichia coli dna gyrase and topoisomerases i and iii during oric and	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
9	topoisomerases	decatenating activity of escherichia coli dna gyrase and topoisomerases i and iii during oric and	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
10	I	I	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
11	and	decatenating activity of escherichia coli dna gyrase and topoisomerases i and iii during oric and	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
12	III	III	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
13	during	decatenating activity of escherichia coli dna gyrase and topoisomerases i and iii during oric and	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
14	oriC	decatenating activity of escherichia coli dna gyrase and topoisomerases i and iii during oric and	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	and	decatenating activity of escherichia coli dna gyrase and topoisomerases i and iii during oric and	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
16	pBR	pBR	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	322	322	NUM	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
18	DNA	DNA	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	replication	replication	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	in	in vitro	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	vitro	in vitro	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2395
# text = J. Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2396
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2397
# text = 269 :
1	269	269	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2398
# text = 2093 - 2099 .
1	2093	2093	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	2093 - 2099	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	2099	2099	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2399
# text = Hiasa H , Marians KJ. 1996 .
1	Hiasa	Hiasa	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	H	H	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Marians	Marians	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	KJ.	KJ.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1996	1996	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2400
# text = Two distinct modes of strand unlinking during theta-type DNA replication .
1	Two	Two	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	distinct	distinct	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	modes	mode	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	of	of strand unlinking during theta-type dna replication	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
5	strand	of strand unlinking during theta-type dna replication	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
6	unlinking	of strand unlinking during theta-type dna replication	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
7	during	of strand unlinking during theta-type dna replication	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
8	theta-type	of strand unlinking during theta-type dna replication	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
9	DNA	DNA	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	replication	of strand unlinking during theta-type dna replication	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2401
# text = J. Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2402
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2403
# text = 271 :
1	271	271	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2404
# text = 21529 - 21535 .
1	21529	21529	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	21529 - 21535	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	21535	21535	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2405
# text = Higgins CF , Dorman CJ , Stirling DA , Waddell L , Booth IR , May G , Bremer E. 1988 .
1	Higgins	higgins	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	CF	CF	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
4	Dorman	Dorman	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	CJ	CJ	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
7	Stirling	Stirling	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	DA	DA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
10	Waddell	Waddell	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	L	L	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
13	Booth	Booth	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	IR	IR	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	May	May	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
17	G	G	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Bremer	Bremer	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	E.	E.	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	1988	1988	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2406
# text = A physiological role for DNA supercoiling in the osmotic regulation of gene expression in Salmonella typhimurium and Escherichia coli .
1	A	a physiological role for dna supercoiling in the osmotic regulation of gene	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	physiological	a physiological role for dna supercoiling in the osmotic regulation of gene	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
3	role	a physiological role for dna supercoiling in the osmotic regulation of gene	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
4	for	a physiological role for dna supercoiling in the osmotic regulation of gene	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
5	DNA	DNA	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
6	supercoiling	a physiological role for dna supercoiling in the osmotic regulation of gene	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	in	a physiological role for dna supercoiling in the osmotic regulation of gene	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	the	a physiological role for dna supercoiling in the osmotic regulation of gene	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	osmotic	a physiological role for dna supercoiling in the osmotic regulation of gene	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	regulation	a physiological role for dna supercoiling in the osmotic regulation of gene	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	of	a physiological role for dna supercoiling in the osmotic regulation of gene	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	gene	a physiological role for dna supercoiling in the osmotic regulation of gene	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	expression	expression	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	in	in	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	Salmonella	Salmonella	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
16	typhimurium	salmonella typhimurium and escherichia coli	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
17	and	salmonella typhimurium and escherichia coli	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
18	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	coli	salmonella typhimurium and escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2407
# text = Cell 52 :
1	Cell	cell	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	52	52	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2408
# text = 569 - 584 .
1	569	569	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	569 - 584	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	584	584	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2409
# text = Higgins NP , Yang X , Fu Q , Roth JR. 1996 .
1	Higgins	higgins	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	NP	NP	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Yang	Yang	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	X	X	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Fu	Fu	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	Q	Q	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Roth	Roth	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	JR.	JR.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	1996	1996	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2410
# text = Surveying a supercoil domain by using the gamma delta resolution system in Salmonella typhimurium .
1	Surveying	Surveying	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	supercoil	super-	_+_+CL	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	domain	domain by using the	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	by	domain by using the	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	using	domain by using the	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	the	domain by using the	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	gamma	gamma	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	delta	delta	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	resolution	résolution	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	system	system	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	in	in	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	Salmonella	Salmonella	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	typhimurium	typhimurium	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2411
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2412
# text = 178 :
1	178	178	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2413
# text = 2825 - 2835 .
1	2825	2825	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	2825 - 2835	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	2835	2835	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2414
# text = Hiraga S , Niki H , Ogura T , Ichinose C , Mori H , Ezaki B , Jaffe A. 1989 .
1	Hiraga	Hiraga	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	S	S	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Niki	Niki	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	H	H	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Ogura	Ogura	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	T	T	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Ichinose	Ichinose	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	C	C	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
13	Mori	Mori	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	H	H	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
16	Ezaki	Ezaki	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	B	B	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Jaffe	Jaffe	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
20	A.	A.	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	1989	1989	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2415
# text = Chromosome partitioning in Escherichia coli :
1	Chromosome	chromosome	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	partitioning	partition	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	in	in	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	coli	coli	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	:	:	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2416
# text = novel mutants producing anucleate cells .
1	novel	novel mutants producing anucleate cells	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	mutants	novel mutants producing anucleate cells	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	producing	novel mutants producing anucleate cells	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	anucleate	novel mutants producing anucleate cells	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	cells	novel mutants producing anucleate cells	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2417
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2418
# text = 171 :
1	171	171	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2419
# text = 1496 - 1505 .
1	1496	1496	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1496 - 1505	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1505	1505	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2420
# text = Hirano M , Hirano T. 2006 .
1	Hirano	Hirano	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	M	M	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Hirano	Hirano	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	T.	T.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2006	2006	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2421
# text = Opening closed arms :
1	Opening	Opening	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	closed	clos	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	arms	armer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	:	:	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2422
# text = long-distance activation of SMC ATPase by hinge-DNA interactions .
1	long-distance	long-distance activation of smc atpase by hinge-dna interactions	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	activation	long-distance activation of smc atpase by hinge-dna interactions	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
3	of	long-distance activation of smc atpase by hinge-dna interactions	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
4	SMC	SMC	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
5	ATPase	ATPase	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
6	by	long-distance activation of smc atpase by hinge-dna interactions	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
7	hinge-DNA	long-distance activation of smc atpase by hinge-dna interactions	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	interactions	long-distance activation of smc atpase by hinge-dna interactions	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2423
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2424
# text = Cell
1	Cell	cell	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2425
# text = 21 :
1	21	21	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2426
# text = 175 - 186 .
1	175	175	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	175 - 186	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	186	186	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2427
# text = Hirsch M , Elliott T. 2005 .
1	Hirsch	Hirsch	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	M	M	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Elliott	Elliott	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	T.	T.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2005	2005	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2428
# text = Fis regulates transcriptional induction of RpoS in Salmonella enterica .
1	Fis	fis regulates transcriptional induction of rpos in salmonella enterica	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	regulates	fis regulates transcriptional induction of rpos in salmonella enterica	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	transcriptional	fis regulates transcriptional induction of rpos in salmonella enterica	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
4	induction	fis regulates transcriptional induction of rpos in salmonella enterica	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	of	fis regulates transcriptional induction of rpos in salmonella enterica	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
6	RpoS	RpoS	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
7	in	fis regulates transcriptional induction of rpos in salmonella enterica	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
8	Salmonella	Salmonella	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	enterica	fis regulates transcriptional induction of rpos in salmonella enterica	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2429
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2430
# text = 187 :
1	187	187	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2431
# text = 1568 - 1580 .
1	1568	1568	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1568 - 1580	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1580	1580	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2432
# text = Hirvonen CA , Ross W , Wozniak CE , Marasco E , Anthony JR , Aiyar SE , Newburn VH , Gourse RL .
1	Hirvonen	Hirvonen	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	CA	CA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Ross	Ross	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	W	W	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Wozniak	Wozniak	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	CE	CE	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Marasco	Marasco	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	E	E	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
13	Anthony	Anthony	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	JR	JR	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
16	Aiyar	Aiyar	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	SE	SE	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
19	Newburn	Newburn	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	VH	VH	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
22	Gourse	Gourse	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	RL	RL	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2433
# text = 2001 .
1	2001	2001	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2434
# text = Contributions of UP elements and the transcription factor FIS to expression from the seven rrn P1 promoters in Escherichia coli .
1	Contributions	contributions of up elements and the	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	of	contributions of up elements and the	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	UP	UP	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	elements	contributions of up elements and the	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	and	contributions of up elements and the	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	the	contributions of up elements and the	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	transcription	transcription	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	factor	factor	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	FIS	FIS	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
10	to	fis to expression from the seven rrn p1 promoters in escherichia coli	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
11	expression	fis to expression from the seven rrn p1 promoters in escherichia coli	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
12	from	fis to expression from the seven rrn p1 promoters in escherichia coli	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
13	the	fis to expression from the seven rrn p1 promoters in escherichia coli	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
14	seven	fis to expression from the seven rrn p1 promoters in escherichia coli	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
15	rrn	fis to expression from the seven rrn p1 promoters in escherichia coli	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
16	P1	P1	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
17	promoters	fis to expression from the seven rrn p1 promoters in escherichia coli	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
18	in	fis to expression from the seven rrn p1 promoters in escherichia coli	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
19	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	coli	fis to expression from the seven rrn p1 promoters in escherichia coli	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2435
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2436
# text = 183 :
1	183	183	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2437
# text = 6305 - 6314 .
1	6305	6305	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	6305 - 6314	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	6314	6314	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2438
# text = Hommais F , Krin E , Laurent-Winter C , Soutourina O , Malpertuy A , Le Caer JP , Danchin A , Bertin P. 2001 .
1	Hommais	Hommais	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	F	F	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
4	Krin	Krin	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	E	E	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
7	Laurent-Winter	Laurent-Winter	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	C	C	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
10	Soutourina	Soutourina	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	O	O	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
13	Malpertuy	Malpertuy	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	A	A	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
16	Le	Le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	Caer	Caer	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
18	JP	JP	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	Danchin	Danchin	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
21	A	A	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
23	Bertin	Bertin	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	P.	P.	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	2001	2001	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2439
# text = Large-scale monitoring of pleiotropic regulation of gene expression by the prokaryotic nucleoid-associated protein , H-NS .
1	Large-scale	large-scale monitoring of pleiotropic regulation of gene	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	monitoring	large-scale monitoring of pleiotropic regulation of gene	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	of	large-scale monitoring of pleiotropic regulation of gene	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	pleiotropic	large-scale monitoring of pleiotropic regulation of gene	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	regulation	large-scale monitoring of pleiotropic regulation of gene	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	of	large-scale monitoring of pleiotropic regulation of gene	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	gene	large-scale monitoring of pleiotropic regulation of gene	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	expression	expression	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	by	by	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
10	the	the	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
11	prokaryotic	prokaryotic	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
12	nucleoid-associated	nucleoid-associated	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	protein	protein	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	H-NS	H-NS	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2440
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2441
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2442
# text = 40 : 20 - 36 .
1	40	40	NUM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	:	40 : 20	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	20	20	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	-	- 36	PUNC	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	36	36	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2443
# text = Huang L , Tsui P , Freundlich M. 1992 .
1	Huang	Huang	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	L	L	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Tsui	Tsui	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	P	P	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
7	Freundlich	Freundlich	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	M.	monsieur	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	1992	1992	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2444
# text = Positive and negative control of ompB transcription in Escherichia coli by cyclic AMP and the cyclic AMP receptor protein .
1	Positive	positive and negative control of	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	and	positive and negative control of	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	negative	positive and negative control of	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	control	positive and negative control of	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	of	positive and negative control of	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	ompB	ompB	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	transcription	transcription	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	in	in	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	coli	coli	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
11	by	by	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
12	cyclic	cyclic	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
13	AMP	AMP	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
14	and	and	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
15	the	the	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
16	cyclic	cyclic	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
17	AMP	AMP	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
18	receptor	receptor	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	protein	protein	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2445
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2446
# text = 174 :
1	174	174	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2447
# text = 664 - 670 .
1	664	664	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	664 - 670	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	670	670	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2448
# text = Ikeda H , Aoki K , Naito A. 1982 .
1	Ikeda	ikeda	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	H	H	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Aoki	Aoki	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	K	K	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Naito	Naito	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	A.	A.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1982	1982	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2449
# text = Illegitimate recombination mediated in vitro by DNA gyrase of Escherichia coli :
1	Illegitimate	illegitimate recombination mediated	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	recombination	illegitimate recombination mediated	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	mediated	illegitimate recombination mediated	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
4	in	in	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	vitro	vitrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	by	by	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
7	DNA	DNA	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
8	gyrase	gyrase	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
9	of	of	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
10	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	coli	coli	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
12	:	:	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2450
# text = structure of recombinant DNA molecules .
1	structure	structure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	of	off	ADV	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
3	recombinant	recombiner	VPR	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	DNA	DNA	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	molecules	molecules	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2451
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2452
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2453
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2454
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2455
# text = U.S.A
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2456
# text = 79 :
1	79	79	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2457
# text = 3724 - 3728 .
1	3724	3724	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	3724 - 3728	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	3728	3728	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2458
# text = Jeong KS , Ahn J , Khodursky AB. 2004 .
1	Jeong	Jeong	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	KS	KS	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Ahn	Ahn	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Khodursky	Khodursky	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	AB.	AB.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2004	2004	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2459
# text = Spatial patterns of transcriptional activity in the chromosome of Escherichia coli .
1	Spatial	spatial patterns of transcriptional activity in the chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	patterns	spatial patterns of transcriptional activity in the chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
3	of	spatial patterns of transcriptional activity in the chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
4	transcriptional	spatial patterns of transcriptional activity in the chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
5	activity	spatial patterns of transcriptional activity in the chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
6	in	spatial patterns of transcriptional activity in the chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
7	the	spatial patterns of transcriptional activity in the chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
8	chromosome	spatial patterns of transcriptional activity in the chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
9	of	spatial patterns of transcriptional activity in the chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
10	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	coli	spatial patterns of transcriptional activity in the chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2460
# text = Genome Biol .
1	Genome	génome	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2461
# text = 5 :
1	5	5	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2462
# text = R86 .
1	R86	R86	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2463
# text = Johansson J , Balsalobre C , Wang SY , Urbonaviciene J , Jin DJ , Sonden B , Uhlin BE. 2000 .
1	Johansson	johansson	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Balsalobre	Balsalobre	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	C	C	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Wang	Wang	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	SY	SY	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Urbonaviciene	Urbonaviciene	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	J	J	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
13	Jin	Jin	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	DJ	DJ	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
16	Sonden	Sonden	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	B	B	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Uhlin	Uhlin	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
20	BE.	BE.	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	2000	2000	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2464
# text = Nucleoid proteins stimulate stringently controlled bacterial promoters :
1	Nucleoid	nucleoid proteins stimulate stringently controlled bacterial promoters	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	proteins	nucleoid proteins stimulate stringently controlled bacterial promoters	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	stimulate	nucleoid proteins stimulate stringently controlled bacterial promoters	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	stringently	nucleoid proteins stimulate stringently controlled bacterial promoters	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	controlled	nucleoid proteins stimulate stringently controlled bacterial promoters	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	bacterial	nucleoid proteins stimulate stringently controlled bacterial promoters	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	promoters	nucleoid proteins stimulate stringently controlled bacterial promoters	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	:	:	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2465
# text = a link between the cAMP-CRP and the ( p ) ppGpp regulons in Escherichia coli .
1	a	a link between the camp-crp and the	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
2	link	a link between the camp-crp and the	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
3	between	a link between the camp-crp and the	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
4	the	a link between the camp-crp and the	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
5	cAMP-CRP	a link between the camp-crp and the	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
6	and	a link between the camp-crp and the	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	the	a link between the camp-crp and the	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
8	(	(	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
9	p	page	NOM	_	_	7	parenth	_	_	_	_	_
10	)	)	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
11	ppGpp	ppGpp	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	regulons	réguler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	in	in	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
14	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	coli	coli	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2466
# text = Cell 102 :
1	Cell	cell	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	102	102	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2467
# text = 475 - 485 .
1	475	475	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	475 - 485	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	485	485	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2468
# text = Johnson RC , Bruist MF , Simon MI. 1986 .
1	Johnson	johnson	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	RC	RC	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Bruist	Bruist	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	MF	MF	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Simon	Simon	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	MI.	MI.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1986	1986	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2469
# text = Host protein requirements for in vitro site-specific DNA inversion .
1	Host	host protein requirements for	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	protein	host protein requirements for	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
3	requirements	host protein requirements for	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	for	host protein requirements for	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
5	in	in vitro	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	vitro	in vitro	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	site-specific	site	N+V	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	DNA	DNA	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	inversion	inversion	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2470
# text = Cell
1	Cell	cell	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2471
# text = 46 :
1	46	46	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2472
# text = 531 - 539 .
1	531	531	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	531 - 539	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	539	539	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2473
# text = Johnson RC , Johnson LM , Schmidt JW , Gardner JF. 2005 .
1	Johnson	johnson	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	RC	RC	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Johnson	Johnson	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	LM	LM	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Schmidt	Schmidt	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	JW	JW	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Gardner	Gardner	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	JF.	JF.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	2005	2005	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2474
# text = The major nucleoid proteins in the structure and function of the Escherichia coli chromosome .
1	The	the major nucleoid proteins in the structure and function of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
2	major	the major nucleoid proteins in the structure and function of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
3	nucleoid	the major nucleoid proteins in the structure and function of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
4	proteins	the major nucleoid proteins in the structure and function of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
5	in	the major nucleoid proteins in the structure and function of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
6	the	the major nucleoid proteins in the structure and function of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
7	structure	the major nucleoid proteins in the structure and function of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
8	and	the major nucleoid proteins in the structure and function of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
9	function	the major nucleoid proteins in the structure and function of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
10	of	the major nucleoid proteins in the structure and function of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
11	the	the major nucleoid proteins in the structure and function of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
12	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
13	coli	the major nucleoid proteins in the structure and function of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	chromosome	the major nucleoid proteins in the structure and function of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2475
# text = In :
1	In	in	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2476
# text = The bacterial chromosome .
1	The	the bacterial	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	bacterial	the bacterial	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	chromosome	chromosome	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2477
# text = Washington DC :
1	Washington	Washington	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	DC	DC	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2478
# text = ASM Press .
1	ASM	asm	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Press	Press	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2479
# text = 65 - 132 .
1	65	65	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	65 - 132	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	132	132	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2480
# text = Jones PG , Krah R , Tafuri SR , Wolffe AP. 1992 .
1	Jones	jones	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	PG	PG	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Krah	Krah	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	R	R	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Tafuri	Tafuri	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	SR	SR	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Wolffe	Wolffe	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	AP.	AP.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	1992	1992	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2481
# text = DNA gyrase , CS7 .
1	DNA	DNA	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	gyrase	gyrase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	CS7	CS7	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2482
# text = 4 , and the cold shock response in Escherichia coli .
1	4	4	NUM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	and	and the	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	the	and the	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
5	cold	col	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	shock	shock	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	response	response	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	in	in	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
9	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	coli	coli	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2483
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2484
# text = 174 :
1	174	174	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2485
# text = 5798 - 5802 .
1	5798	5798	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	5798 - 5802	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	5802	5802	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2486
# text = Josephson BL , Fraenkel DG. 1969 .
1	Josephson	Josephson	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	BL	BL	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Fraenkel	Fraenkel	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	DG.	DG.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1969	1969	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2487
# text = Transketolase mutants of Escherichia coli .
1	Transketolase	transketolase mutants of escherichia coli	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	mutants	transketolase mutants of escherichia coli	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	of	transketolase mutants of escherichia coli	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	coli	transketolase mutants of escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2488
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2489
# text = 100 :
1	100	100	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2490
# text = 1289 - 1295 .
1	1289	1289	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1289 - 1295	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1295	1295	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2491
# text = Kaidow A , Wachi M , Nakamura J , Magae J , Nagai K. 1995 .
1	Kaidow	Kaidow	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	A	A	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Wachi	Wachi	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	M	M	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Nakamura	Nakamura	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	J	J	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Magae	Magae	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
11	J	J	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Nagai	Nagai	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	K.	K.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	1995	1995	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2492
# text = Anucleate cell production by Escherichia coli delta hns mutant lacking a histone-like protein , H-NS .
1	Anucleate	Anucleate	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	cell	cell	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	production	production	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	by	by	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	coli	colis	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	delta	delta	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	hns	un	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	mutant	mutant	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	lacking	lac	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
11	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	histone-like	histone-like	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	protein	protéine	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	H-NS	H-NS	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2493
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2494
# text = 177 :
1	177	177	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2495
# text = 3589 - 3592 .
1	3589	3589	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	3589 - 3592	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	3592	3592	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2496
# text = Kampranis SC , Bates AD , Maxwell A. 1999 .
1	Kampranis	Kampranis	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	SC	SC	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Bates	Bates	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	AD	AD	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Maxwell	Maxwell	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	A.	A.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1999	1999	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2497
# text = A model for the mechanism of strand passage by DNA gyrase .
1	A	a model for the mechanism of strand	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	model	a model for the mechanism of strand	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	for	a model for the mechanism of strand	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	the	a model for the mechanism of strand	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	mechanism	a model for the mechanism of strand	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	of	a model for the mechanism of strand	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	strand	a model for the mechanism of strand	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	passage	passage	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	by	by	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	DNA	DNA	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	gyrase	gyrase	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2498
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2499
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2500
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2501
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2502
# text = U.S.A
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2503
# text = 96 :
1	96	96	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2504
# text = 8414 - 8419 .
1	8414	8414	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	8414 - 8419	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	8419	8419	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2505
# text = Kar S , Adhya S. 2001 .
1	Kar	Kar	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	S	S	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Adhya	Adhya	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	S.	S.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2001	2001	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2506
# text = Recruitment of HU by piggyback :
1	Recruitment	recruitment of hu by piggyback	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	of	recruitment of hu by piggyback	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	HU	HU	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	by	recruitment of hu by piggyback	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	piggyback	recruitment of hu by piggyback	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	:	:	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2507
# text = a special role of GalR in repressosome assembly .
1	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	special	special	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	role	rôle	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	of	of galr in repressosome assembly	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
5	GalR	GalR	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
6	in	of galr in repressosome assembly	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
7	repressosome	of galr in repressosome assembly	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	assembly	of galr in repressosome assembly	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2508
# text = Genes Dev .
1	Genes	gêne	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Dev	Dev	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2509
# text = 15 :
1	15	15	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2510
# text = 2273 - 2281 .
1	2273	2273	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	2273 - 2281	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	2281	2281	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2511
# text = Kar S , Edgar R , Adhya S. 2005 .
1	Kar	Kar	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	S	S	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Edgar	Edgar	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	R	R	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Adhya	Adhya	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	S.	S.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2005	2005	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2512
# text = Nucleoid remodeling remodeling by an altered HU protein :
1	Nucleoid	Nucleoid	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	remodeling	re-	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	remodeling	remodeling	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	by	by	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	an	an	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	altered	altérer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	HU	HU	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	protein	protein	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	:	:	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2513
# text = reorganization of the transcription program .
1	reorganization	reorganization of the transcription program	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	of	reorganization of the transcription program	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	the	reorganization of the transcription program	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	transcription	reorganization of the transcription program	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	program	reorganization of the transcription program	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2514
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2515
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2516
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2517
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2518
# text = U.S.A 102 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	102	102	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2519
# text = 16397 - 16402 .
1	16397	16397	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	16397 - 16402	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	16402	16402	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2520
# text = Keener J , Kustu S. 1988 .
1	Keener	keener	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Kustu	Kustu	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	S.	S.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1988	1988	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2521
# text = Protein kinase and phosphoprotein phosphatase activities of nitrogen regulatory proteins NTRB and NTRC of enteric bacteria :
1	Protein	protein kinase and phosphoprotein phosphatase activities of nitrogen regulatory proteins ntrb and ntrc of enteric bacteria	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
2	kinase	protein kinase and phosphoprotein phosphatase activities of nitrogen regulatory proteins ntrb and ntrc of enteric bacteria	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
3	and	protein kinase and phosphoprotein phosphatase activities of nitrogen regulatory proteins ntrb and ntrc of enteric bacteria	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
4	phosphoprotein	protein kinase and phosphoprotein phosphatase activities of nitrogen regulatory proteins ntrb and ntrc of enteric bacteria	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
5	phosphatase	protein kinase and phosphoprotein phosphatase activities of nitrogen regulatory proteins ntrb and ntrc of enteric bacteria	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
6	activities	protein kinase and phosphoprotein phosphatase activities of nitrogen regulatory proteins ntrb and ntrc of enteric bacteria	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
7	of	protein kinase and phosphoprotein phosphatase activities of nitrogen regulatory proteins ntrb and ntrc of enteric bacteria	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
8	nitrogen	protein kinase and phosphoprotein phosphatase activities of nitrogen regulatory proteins ntrb and ntrc of enteric bacteria	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
9	regulatory	protein kinase and phosphoprotein phosphatase activities of nitrogen regulatory proteins ntrb and ntrc of enteric bacteria	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
10	proteins	protein kinase and phosphoprotein phosphatase activities of nitrogen regulatory proteins ntrb and ntrc of enteric bacteria	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
11	NTRB	NTRB	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
12	and	protein kinase and phosphoprotein phosphatase activities of nitrogen regulatory proteins ntrb and ntrc of enteric bacteria	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
13	NTRC	NTRC	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
14	of	protein kinase and phosphoprotein phosphatase activities of nitrogen regulatory proteins ntrb and ntrc of enteric bacteria	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
15	enteric	protein kinase and phosphoprotein phosphatase activities of nitrogen regulatory proteins ntrb and ntrc of enteric bacteria	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	bacteria	protein kinase and phosphoprotein phosphatase activities of nitrogen regulatory proteins ntrb and ntrc of enteric bacteria	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	:	:	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2522
# text = roles of the conserved amino-terminal domain of NTRC .
1	roles	roles of the conserved amino-terminal domain of ntrc	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	of	roles of the conserved amino-terminal domain of ntrc	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
3	the	roles of the conserved amino-terminal domain of ntrc	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
4	conserved	roles of the conserved amino-terminal domain of ntrc	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
5	amino-terminal	roles of the conserved amino-terminal domain of ntrc	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
6	domain	roles of the conserved amino-terminal domain of ntrc	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
7	of	roles of the conserved amino-terminal domain of ntrc	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	NTRC	NTRC	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2523
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2524
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2525
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2526
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2527
# text = U.S.A 85 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	85	85	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2528
# text = 4976 - 4980 .
1	4976	4976	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	4976 - 4980	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	4980	4980	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2529
# text = Kelly A , Goldberg MD , Carroll RK , Danino V , Hinton JC , Dorman CJ. 2004 .
1	Kelly	Kelly	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	A	A	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Goldberg	Goldberg	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	MD	MD	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Carroll	Carroll	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	RK	RK	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
10	Danino	Danino	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	V	V	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
13	Hinton	Hinton	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	JC	JC	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Dorman	Dorman	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
17	CJ.	CJ.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	2004	2004	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2530
# text = A global for Fis in the transcriptional control of metabolism and type III secretion in Salmonella enterica serovar Typhimurium .
1	A	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	global	global	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
3	for	for fis in the transcriptional control of metabolism and type iii secretion in salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
5	in	for fis in the transcriptional control of metabolism and type iii secretion in salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
6	the	for fis in the transcriptional control of metabolism and type iii secretion in salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
7	transcriptional	for fis in the transcriptional control of metabolism and type iii secretion in salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
8	control	for fis in the transcriptional control of metabolism and type iii secretion in salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
9	of	for fis in the transcriptional control of metabolism and type iii secretion in salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
10	metabolism	for fis in the transcriptional control of metabolism and type iii secretion in salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
11	and	for fis in the transcriptional control of metabolism and type iii secretion in salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
12	type	for fis in the transcriptional control of metabolism and type iii secretion in salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
13	III	III	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
14	secretion	for fis in the transcriptional control of metabolism and type iii secretion in salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
15	in	for fis in the transcriptional control of metabolism and type iii secretion in salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
16	Salmonella	Salmonella	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
17	enterica	for fis in the transcriptional control of metabolism and type iii secretion in salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
18	serovar	for fis in the transcriptional control of metabolism and type iii secretion in salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	Typhimurium	Typhimurium	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2531
# text = 150 :
1	150	150	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2532
# text = 2037 - 2053 .
1	2037	2037	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	2037 - 2053	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	2053	2053	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2533
# text = Kenney LJ , Bauer MD , Silhavy TJ. 1995 .
1	Kenney	kenney	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	LJ	LJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Bauer	Bauer	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	MD	MD	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Silhavy	Silhavy	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	TJ.	TJ.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1995	1995	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2534
# text = Phosphorylation-dependent conformational changes in OmpR , an osmoregulatory DNA-binding protein of Escherichia coli .
1	Phosphorylation-dependent	phosphorylation	N+V	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	conformational	conformational	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	changes	change	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	in	in	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	OmpR	OmpR	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	an	an osmoregulatory dna-binding protein of escherichia coli	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
8	osmoregulatory	an osmoregulatory dna-binding protein of escherichia coli	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
9	DNA-binding	DNA-binding	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
10	protein	an osmoregulatory dna-binding protein of escherichia coli	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
11	of	an osmoregulatory dna-binding protein of escherichia coli	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
12	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	coli	an osmoregulatory dna-binding protein of escherichia coli	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2535
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2536
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2537
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2538
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2539
# text = U.S.A 92 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	92	92	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2540
# text = 8866 - 8870 .
1	8866	8866	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	8866 - 8870	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	8870	8870	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2541
# text = Kido M , Yamanaka K , Mitani T , Niki H , Ogura T , Hiraga S. 1996 .
1	Kido	Kido	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	M	M	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Yamanaka	Yamanaka	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	K	K	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Mitani	Mitani	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	T	T	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
10	Niki	Niki	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	H	H	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
13	Ogura	Ogura	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	T	T	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Hiraga	Hiraga	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
17	S.	S.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	1996	1996	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2542
# text = RNase
1	RNase	RNase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2543
# text = E polypeptides lacking a carboxyl-terminal half suppress a mukB mutation in Escherichia coli .
1	E	eh	INT	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	polypeptides	polypeptide	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	lacking	lac	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	carboxyl-terminal	carboxyle-terminal	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	half	hall	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	suppress	supère	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	a	à	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	mukB	mukB	VNF	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
10	mutation	mutation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	in	in	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
12	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	coli	coli	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2544
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2545
# text = 178 :
1	178	178	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2546
# text = 3917 - 3925 .
1	3917	3917	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	3917 - 3925	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	3925	3925	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2547
# text = King T , Ishihama A , Kori A , Ferenci T. 2004 .
1	King	king	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	T	T	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Ishihama	Ishihama	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	A	A	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Kori	Kori	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	A	A	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Ferenci	Ferenci	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	T.	T.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	2004	2004	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2548
# text = A regulatory trade-off as a source of strain variation in the species Escherichia coli .
1	A	A	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	regulatory	regulatory	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	trade-off	tarder	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	as	as	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	source	source	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	of	of strain variation in the species escherichia coli	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
8	strain	of strain variation in the species escherichia coli	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
9	variation	of strain variation in the species escherichia coli	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
10	in	of strain variation in the species escherichia coli	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
11	the	of strain variation in the species escherichia coli	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
12	species	of strain variation in the species escherichia coli	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
13	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	coli	of strain variation in the species escherichia coli	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2549
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2550
# text = 186 :
1	186	186	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2551
# text = 5614 - 5620 .
1	5614	5614	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	5614 - 5620	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	5620	5620	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2552
# text = Koch C , Kahmann R. 1986 .
1	Koch	koch	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	C	C	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Kahmann	Kahmann	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	R.	R.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1986	1986	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2553
# text = Purification and properties of the Escherichia coli host factor required for inversion of the G segment in bacteriophage Mu .
1	Purification	purification and properties of the escherichia coli host factor required for inversion of the g	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
2	and	purification and properties of the escherichia coli host factor required for inversion of the g	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
3	properties	purification and properties of the escherichia coli host factor required for inversion of the g	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
4	of	purification and properties of the escherichia coli host factor required for inversion of the g	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
5	the	purification and properties of the escherichia coli host factor required for inversion of the g	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
6	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
7	coli	purification and properties of the escherichia coli host factor required for inversion of the g	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
8	host	purification and properties of the escherichia coli host factor required for inversion of the g	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
9	factor	purification and properties of the escherichia coli host factor required for inversion of the g	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
10	required	purification and properties of the escherichia coli host factor required for inversion of the g	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
11	for	purification and properties of the escherichia coli host factor required for inversion of the g	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
12	inversion	purification and properties of the escherichia coli host factor required for inversion of the g	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
13	of	purification and properties of the escherichia coli host factor required for inversion of the g	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
14	the	purification and properties of the escherichia coli host factor required for inversion of the g	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	G	G	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	segment	segment	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	in	in	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	bacteriophage	bactériophage	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	Mu	Mu	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2554
# text = J. Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2555
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2556
# text = 261 :
1	261	261	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2557
# text = 15673 - 15678 .
1	15673	15673	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	15673 - 15678	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	15678	15678	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2558
# text = Kornberg RD , Lorch Y. 1999 .
1	Kornberg	kornberg	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	RD	RD	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Lorch	Lorch	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	Y.	Y.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1999	1999	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2559
# text = Twenty-five years of the nucleosome , fundamental particle of the eukaryote chromosome .
1	Twenty-five	twenty-five years of the nucleosome	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	years	twenty-five years of the nucleosome	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	of	twenty-five years of the nucleosome	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	the	twenty-five years of the nucleosome	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	nucleosome	twenty-five years of the nucleosome	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
7	fundamental	fundamental particle of the eukaryote chromosome	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
8	particle	fundamental particle of the eukaryote chromosome	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
9	of	fundamental particle of the eukaryote chromosome	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
10	the	fundamental particle of the eukaryote chromosome	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
11	eukaryote	fundamental particle of the eukaryote chromosome	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	chromosome	fundamental particle of the eukaryote chromosome	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2560
# text = Cell
1	Cell	cell	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2561
# text = 98 :
1	98	98	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2562
# text = 285 - 294 .
1	285	285	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	285 - 294	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	294	294	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2563
# text = Kostrewa D , Granzin J , Koch C , Choe HW , Raghunathan S , Wolf W , Labahn J , Kahmann R , Saenger W. 1991 .
1	Kostrewa	Kostrewa	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	D	D	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
4	Granzin	Granzin	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
7	Koch	Koch	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	C	C	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
10	Choe	Choe	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	HW	HW	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
13	Raghunathan	Raghunathan	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	S	S	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
16	Wolf	Wolf	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	W	W	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
19	Labahn	Labahn	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
20	J	J	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
22	Kahmann	Kahmann	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	R	R	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	Saenger	Saenger	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
26	W.	W.	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	1991	1991	NUM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2564
# text = Three-dimensional structure of the Escherichia coli DNA-binding protein FIS .
1	Three-dimensional	three-dimensional structure of the escherichia coli dna-binding protein fis	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	structure	three-dimensional structure of the escherichia coli dna-binding protein fis	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	of	three-dimensional structure of the escherichia coli dna-binding protein fis	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
4	the	three-dimensional structure of the escherichia coli dna-binding protein fis	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
6	coli	three-dimensional structure of the escherichia coli dna-binding protein fis	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
7	DNA-binding	DNA-binding	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
8	protein	three-dimensional structure of the escherichia coli dna-binding protein fis	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	FIS	FIS	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2565
# text = Nature
1	Nature	nature	ADV	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2566
# text = 349 :
1	349	349	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2567
# text = 178 - 180 .
1	178	178	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	178 - 180	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	180	180	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2568
# text = Kramlinger VM , Hiasa H. 2006 .
1	Kramlinger	Kramlinger	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	VM	VM	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Hiasa	Hiasa	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	H.	H.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2006	2006	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2569
# text = The " GyrA-box " is required for the ability of DNA gyrase to wrap DNA and catalyze the supercoiling reaction .
1	The	thé	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	"	"	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	GyrA-box	GyrA-box	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	"	"	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
5	is	is required for the ability of dna gyrase to wrap dna and catalyze the supercoiling reaction	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
6	required	is required for the ability of dna gyrase to wrap dna and catalyze the supercoiling reaction	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
7	for	is required for the ability of dna gyrase to wrap dna and catalyze the supercoiling reaction	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
8	the	is required for the ability of dna gyrase to wrap dna and catalyze the supercoiling reaction	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
9	ability	is required for the ability of dna gyrase to wrap dna and catalyze the supercoiling reaction	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
10	of	is required for the ability of dna gyrase to wrap dna and catalyze the supercoiling reaction	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
11	DNA	DNA	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
12	gyrase	is required for the ability of dna gyrase to wrap dna and catalyze the supercoiling reaction	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
13	to	is required for the ability of dna gyrase to wrap dna and catalyze the supercoiling reaction	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
14	wrap	is required for the ability of dna gyrase to wrap dna and catalyze the supercoiling reaction	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
15	DNA	DNA	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
16	and	is required for the ability of dna gyrase to wrap dna and catalyze the supercoiling reaction	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
17	catalyze	is required for the ability of dna gyrase to wrap dna and catalyze the supercoiling reaction	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
18	the	is required for the ability of dna gyrase to wrap dna and catalyze the supercoiling reaction	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
19	supercoiling	is required for the ability of dna gyrase to wrap dna and catalyze the supercoiling reaction	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	reaction	is required for the ability of dna gyrase to wrap dna and catalyze the supercoiling reaction	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2570
# text = J. Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2571
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2572
# text = 281 :
1	281	281	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2573
# text = 3738 - 3742 .
1	3738	3738	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	3738 - 3742	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	3742	3742	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2574
# text = Kreuzer KN , Cozzarelli NR. 1979 .
1	Kreuzer	Kreuzer	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	KN	KN	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	NR.	NR.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1979	1979	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2575
# text = Escherichia coli mutants thermosensitive for deoxyribonucleic acid gyrase subunit A :
1	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	coli	coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	mutants	mutant	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	thermosensitive	thermosensitive for deoxyribonucleic acid gyrase subunit a	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
5	for	thermosensitive for deoxyribonucleic acid gyrase subunit a	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
6	deoxyribonucleic	thermosensitive for deoxyribonucleic acid gyrase subunit a	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
7	acid	thermosensitive for deoxyribonucleic acid gyrase subunit a	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
8	gyrase	thermosensitive for deoxyribonucleic acid gyrase subunit a	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
9	subunit	thermosensitive for deoxyribonucleic acid gyrase subunit a	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	A	A	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	:	:	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2576
# text = effects on deoxyribonucleic acid replication , transcription , and bacteriophage growth .
1	effects	effects on deoxyribonucleic acid replication	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	on	effects on deoxyribonucleic acid replication	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	deoxyribonucleic	effects on deoxyribonucleic acid replication	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	acid	effects on deoxyribonucleic acid replication	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	replication	effects on deoxyribonucleic acid replication	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	transcription	transcription	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
9	and	and bacteriophage growth	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
10	bacteriophage	and bacteriophage growth	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	growth	and bacteriophage growth	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2577
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2578
# text = 140 :
1	140	140	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2579
# text = 424 - 435 .
1	424	424	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	424 - 435	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	435	435	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2580
# text = Kruse T , Gerdes K. 2005 .
1	Kruse	Kruse	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	T	T	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Gerdes	Gerdes	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	K.	K.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2005	2005	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2581
# text = Bacterial DNA segregation by the actin-like
1	Bacterial	bacterial dna segregation by the actin-like	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	DNA	DNA	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	segregation	bacterial dna segregation by the actin-like	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	by	bacterial dna segregation by the actin-like	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	the	bacterial dna segregation by the actin-like	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	actin-like	bacterial dna segregation by the actin-like	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2582
# text = MreB protein .
1	MreB	MreB	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	protein	protéiner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2583
# text = Trends Cell Biol .
1	Trends	trend	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Cell	Cell	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2584
# text = 15 :
1	15	15	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2585
# text = 343 - 345 .
1	343	343	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	343 - 345	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	345	345	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2586
# text = Kusano S , Ding Q , Fujita N , Ishihama A. 1996 .
1	Kusano	Kusano	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	S	S	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Ding	Ding	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	Q	Q	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Fujita	Fujita	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	N	N	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Ishihama	Ishihama	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	A.	A.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	1996	1996	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2587
# text = Promoter selectivity of Escherichia coli RNA polymerase E sigma 70 and E sigma 38 holoenzymes .
1	Promoter	promoter selectivity of escherichia coli rna polymerase e sigma 70 and e	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	selectivity	promoter selectivity of escherichia coli rna polymerase e sigma 70 and e	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
3	of	promoter selectivity of escherichia coli rna polymerase e sigma 70 and e	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
4	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
5	coli	promoter selectivity of escherichia coli rna polymerase e sigma 70 and e	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
6	RNA	RNA	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	polymerase	promoter selectivity of escherichia coli rna polymerase e sigma 70 and e	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	E	E	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	sigma	promoter selectivity of escherichia coli rna polymerase e sigma 70 and e	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	70	70	NUM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	and	promoter selectivity of escherichia coli rna polymerase e sigma 70 and e	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	E	E	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	sigma	sigma	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	38	38	NUM	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	holoenzymes	homo	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2588
# text = Effect of DNA supercoiling .
1	Effect	effect of dna supercoiling	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	of	effect of dna supercoiling	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	DNA	DNA	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	supercoiling	effect of dna supercoiling	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2589
# text = J. Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2590
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2591
# text = 271 :
1	271	271	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2592
# text = 1998 - 2004 .
1	1998	1998	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1998 - 2004	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	2004	2004	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2593
# text = Laemmli UK. 1970 .
1	Laemmli	Laemmli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	UK.	UK.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	1970	1970	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2594
# text = Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4 .
1	Cleavage	cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage t4	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	of	cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage t4	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
3	structural	cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage t4	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
4	proteins	cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage t4	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
5	during	cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage t4	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
6	the	cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage t4	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
7	assembly	cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage t4	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
8	of	cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage t4	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
9	the	cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage t4	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
10	head	cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage t4	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
11	of	cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage t4	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
12	bacteriophage	cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage t4	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	T4	T4	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2595
# text = Nature 227 :
1	Nature	nature	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	227	227	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2596
# text = 680 - 685 .
1	680	680	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	680 - 685	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	685	685	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2597
# text = Lazar SW , Kolter R. 1996 .
1	Lazar	Lazar	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	SW	SW	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Kolter	Kolter	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	R.	R.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1996	1996	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2598
# text = SurA assists the folding of Escherichia coli outer membrane proteins .
1	SurA	sura assists the folding of escherichia	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	assists	sura assists the folding of escherichia	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	the	sura assists the folding of escherichia	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	folding	sura assists the folding of escherichia	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	of	sura assists the folding of escherichia	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	coli	coli	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	outer	outre	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	membrane	membrane	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	proteins	pro-	VRB	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2599
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2600
# text = 178 :
1	178	178	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2601
# text = 1770 - 1773 .
1	1770	1770	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1770 - 1773	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1773	1773	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2602
# text = Lazarus LR , Travers AA. 1993 .
1	Lazarus	Lazarus	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	LR	LR	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Travers	Travers	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	AA.	AA.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1993	1993	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2603
# text = The Escherichia coli
1	The	the escherichia	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	coli	colis	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2604
# text = FIS protein is not required for the activation of tyrT transcription on entry into exponential growth .
1	FIS	fis protein is not required for the activation of	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	protein	fis protein is not required for the activation of	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	is	fis protein is not required for the activation of	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
4	not	fis protein is not required for the activation of	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	required	fis protein is not required for the activation of	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
6	for	fis protein is not required for the activation of	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
7	the	fis protein is not required for the activation of	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
8	activation	fis protein is not required for the activation of	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	of	fis protein is not required for the activation of	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	tyrT	tyrT	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	transcription	transcription	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	on	on	CLS	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
13	entry	entrer	VRB	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	into	into exponential growth	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
15	exponential	into exponential growth	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	growth	into exponential growth	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2605
# text = EMBO J .
1	EMBO	embo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2606
# text = 12 :
1	12	12	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2607
# text = 2483 - 2494 .
1	2483	2483	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	2483 - 2494	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	2494	2494	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2608
# text = Lelong C , Rabilloud T. 2003 .
1	Lelong	Lelong	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	C	C	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Rabilloud	Rabilloud	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	T.	T.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2003	2003	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2609
# text = Prokaryotic proteomics proteomics .
1	Prokaryotic	Prokaryotic	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	proteomics	proteomics	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	proteomics	omettre	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2610
# text = In :
1	In	in	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2611
# text = Methods and Tools in Biosciences and Medicine :
1	Methods	methods and tools in biosciences and medicine	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	and	methods and tools in biosciences and medicine	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	Tools	Tools	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	in	methods and tools in biosciences and medicine	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	Biosciences	Biosciences	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	and	methods and tools in biosciences and medicine	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	Medicine	Medicine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	:	:	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2612
# text = Prokaryotic Genomics .
1	Prokaryotic	Prokaryotic	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Genomics	Genomics	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2613
# text = Basel , Switzerland / Boston / Berlin :
1	Basel	Basel	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	Switzerland	Switzerland	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
4	/	ou	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
5	Boston	Boston	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
6	/	ou	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Berlin	Berlin	NOM	_	_	5	para	_	_	_	_	_
8	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2614
# text = Birkhäuser Verlag .
1	Birkhäuser	Birkhäuser	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Verlag	Verlag	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2615
# text = 157 - 171 .
1	157	157	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	157 - 171	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	171	171	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2616
# text = Lenski RE. 2004 .
1	Lenski	Lenski	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	RE.	RE.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	2004	2004	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2617
# text = Phenotypic and Genomic Evolution during a
1	Phenotypic	phenotypic and genomic evolution during a	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	and	phenotypic and genomic evolution during a	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	Genomic	Genomic	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	Evolution	Evolution	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	during	phenotypic and genomic evolution during a	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	a	phenotypic and genomic evolution during a	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2618
# text = 20 , 000 -Generation Experiment with the Bacterium Escherichia coli .
1	20	20	NUM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	,	20 , 000 -generation experiment with the bacterium escherichia coli	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	000	000	NUM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
4	-Generation	20 , 000 -generation experiment with the bacterium escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
5	Experiment	Experiment	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
6	with	20 , 000 -generation experiment with the bacterium escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
7	the	20 , 000 -generation experiment with the bacterium escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
8	Bacterium	Bacterium	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
9	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	coli	20 , 000 -generation experiment with the bacterium escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2619
# text = Plant Breed .
1	Plant	Plant	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Breed	Breed	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2620
# text = Rev .
1	Rev	Rev	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2621
# text = 24 :
1	24	24	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2622
# text = 225 - 265 .
1	225	225	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	225 - 265	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	265	265	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2623
# text = Lenski RE , Rose M.R. , Simpson S.C. , Tadler S.C. 1991 .
1	Lenski	Lenski	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	RE	RE	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Rose	Rose	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	M.R.	M.R.	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
7	Simpson	Simpson	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	S.C.	S.C.	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
10	Tadler	Tadler	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	S.C.	S.C.	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
12	1991	1991	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2624
# text = Long term experimental evolution in Escherichia coli .
1	Long	long term experimental	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	term	long term experimental	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	experimental	long term experimental	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	evolution	evolution	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	in	in	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
6	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	coli	coli	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2625
# text = I. Adaptation and divergence during 2 , 000 generations .
1	I.	i. adaptation and divergence during 2 , 000 generations	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	Adaptation	Adaptation	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	and	i. adaptation and divergence during 2 , 000 generations	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
4	divergence	i. adaptation and divergence during 2 , 000 generations	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	during	i. adaptation and divergence during 2 , 000 generations	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
6	2	2	NUM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
7	,	i. adaptation and divergence during 2 , 000 generations	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
8	000	000	NUM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	generations	i. adaptation and divergence during 2 , 000 generations	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2626
# text = The American naturalist
1	The	the american naturalist	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	American	American	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	naturalist	the american naturalist	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2627
# text = 138 :
1	138	138	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2628
# text = 1315 - 1341 .
1	1315	1315	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1315 - 1341	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1341	1341	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2629
# text = Lenski RE , Travisano M. 1994 .
1	Lenski	Lenski	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	RE	RE	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
4	Travisano	Travisano	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	M.	monsieur	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	1994	1994	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2630
# text = Dynamics of adaptation and diversification :
1	Dynamics	dynamics of adaptation and diversification	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	of	dynamics of adaptation and diversification	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	adaptation	dynamics of adaptation and diversification	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	and	dynamics of adaptation and diversification	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	diversification	dynamics of adaptation and diversification	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	:	:	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2631
# text = a 10 , 000- generation experiment with bacterial populations .
1	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	10	10	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
4	000-	000-	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	generation	generation	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	experiment	experiment	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	with	dire	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	bacterial	bacterial	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	populations	population	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2632
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2633
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2634
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2635
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2636
# text = U.S.A 91 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	91	91	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2637
# text = 6808 - 6814 .
1	6808	6808	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	6808 - 6814	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	6814	6814	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2638
# text = Lenski RE , Winkworth CL , Riley MA. 2003 .
1	Lenski	Lenski	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	RE	RE	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Winkworth	Winkworth	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	CL	CL	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Riley	Riley	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	MA.	MA.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2003	2003	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2639
# text = Rates of DNA sequence evolution in experimental populations of Escherichia coli during 20 , 000 generations .
1	Rates	rates of dna sequence evolution in experimental populations of escherichia coli during 20 , 000 generations	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
2	of	rates of dna sequence evolution in experimental populations of escherichia coli during 20 , 000 generations	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
3	DNA	DNA	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
4	sequence	rates of dna sequence evolution in experimental populations of escherichia coli during 20 , 000 generations	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
5	evolution	rates of dna sequence evolution in experimental populations of escherichia coli during 20 , 000 generations	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
6	in	rates of dna sequence evolution in experimental populations of escherichia coli during 20 , 000 generations	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
7	experimental	rates of dna sequence evolution in experimental populations of escherichia coli during 20 , 000 generations	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
8	populations	rates of dna sequence evolution in experimental populations of escherichia coli during 20 , 000 generations	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
9	of	rates of dna sequence evolution in experimental populations of escherichia coli during 20 , 000 generations	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
10	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
11	coli	rates of dna sequence evolution in experimental populations of escherichia coli during 20 , 000 generations	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
12	during	rates of dna sequence evolution in experimental populations of escherichia coli during 20 , 000 generations	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
13	20	20	NUM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
14	,	rates of dna sequence evolution in experimental populations of escherichia coli during 20 , 000 generations	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
15	000	000	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	generations	rates of dna sequence evolution in experimental populations of escherichia coli during 20 , 000 generations	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2640
# text = J. Mol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Mol	Mol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2641
# text = Evol .
1	Evol	Evol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2642
# text = 56 :
1	56	56	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2643
# text = 498 - 508 .
1	498	498	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	498 - 508	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	508	508	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2644
# text = Lesley SA , Jovanovich SB , Tse-Dinh YC , Burgess RR. 1990 .
1	Lesley	lesley	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	SA	SA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Jovanovich	Jovanovich	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	SB	SB	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Tse-Dinh	Tse-Dinh	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	YC	YC	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Burgess	Burgess	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	RR.	RR.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	1990	1990	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2645
# text = Identification of a heat shock promoter in the topA gene of Escherichia coli .
1	Identification	identification of a heat shock promoter in the topa gene of escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	of	identification of a heat shock promoter in the topa gene of escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
3	a	identification of a heat shock promoter in the topa gene of escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
4	heat	identification of a heat shock promoter in the topa gene of escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
5	shock	identification of a heat shock promoter in the topa gene of escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
6	promoter	identification of a heat shock promoter in the topa gene of escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
7	in	identification of a heat shock promoter in the topa gene of escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
8	the	identification of a heat shock promoter in the topa gene of escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
9	topA	identification of a heat shock promoter in the topa gene of escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
10	gene	identification of a heat shock promoter in the topa gene of escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
11	of	identification of a heat shock promoter in the topa gene of escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
12	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	coli	identification of a heat shock promoter in the topa gene of escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2646
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2647
# text = 172 :
1	172	172	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2648
# text = 6871 - 6874 .
1	6871	6871	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	6871 - 6874	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	6874	6874	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2649
# text = Levine C , Hiasa H , Marians KJ. 1998 .
1	Levine	Levine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	C	C	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Hiasa	Hiasa	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	H	H	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Marians	Marians	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	KJ.	KJ.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1998	1998	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2650
# text = DNA gyrase and topoisomerase
1	DNA	dna gyrase and topoisomerase	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	gyrase	dna gyrase and topoisomerase	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	and	dna gyrase and topoisomerase	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	topoisomerase	dna gyrase and topoisomerase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2651
# text = IV :
1	IV	iv	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2652
# text = biochemical activities , physiological roles during chromosome replication , and drug sensitivities .
1	biochemical	biochemical	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	activities	activité	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
4	physiological	physiological roles during chromosome replication	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
5	roles	physiological roles during chromosome replication	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
6	during	physiological roles during chromosome replication	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
7	chromosome	physiological roles during chromosome replication	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	replication	physiological roles during chromosome replication	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
10	and	and drug sensitivities	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
11	drug	and drug sensitivities	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	sensitivities	and drug sensitivities	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2653
# text = Biochim .
1	Biochim	Biochim	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2654
# text = Biophys .
1	Biophys	Biophys	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2655
# text = Acta 1400 :
1	Acta	acter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	1400	1400	NUM	_	_	1	subj	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2656
# text = 29 - 43 .
1	29	29	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	-	29 - 43 .	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	43	43	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	.	29 - 43 .	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2657
# text = Lima CD , Wang JC , Mondragon A. 1994 .
1	Lima	limer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	CD	CD	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
4	Wang	Wang	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	JC	JC	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
7	Mondragon	Mondragon	NOM	_	_	1	subj	_	_	_	_	_
8	A.	A.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1994	1994	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2658
# text = Three-dimensional structure of the 67K N-terminal fragment of E. coli DNA topoisomerase I. Nature 367 :
1	Three-dimensional	three-dimensional structure of the 67k n-terminal fragment of e. coli dna topoisomerase i. nature 367	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
2	structure	three-dimensional structure of the 67k n-terminal fragment of e. coli dna topoisomerase i. nature 367	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
3	of	three-dimensional structure of the 67k n-terminal fragment of e. coli dna topoisomerase i. nature 367	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
4	the	three-dimensional structure of the 67k n-terminal fragment of e. coli dna topoisomerase i. nature 367	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
5	67K	67K	NUM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
6	N-terminal	N-terminal	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
7	fragment	three-dimensional structure of the 67k n-terminal fragment of e. coli dna topoisomerase i. nature 367	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
8	of	three-dimensional structure of the 67k n-terminal fragment of e. coli dna topoisomerase i. nature 367	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
9	E.	E.	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
10	coli	three-dimensional structure of the 67k n-terminal fragment of e. coli dna topoisomerase i. nature 367	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
11	DNA	DNA	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
12	topoisomerase	three-dimensional structure of the 67k n-terminal fragment of e. coli dna topoisomerase i. nature 367	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
13	I.	I.	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
14	Nature	Nature	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	367	367	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	:	:	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2659
# text = 138 - 146 .
1	138	138	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	138 - 146	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	146	146	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2660
# text = Lindow JC , Britton RA , Grossman AD. 2002 .
1	Lindow	lindow	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	JC	JC	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Britton	Britton	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	RA	RA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Grossman	Grossman	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	AD.	AD.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2002	2002	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2661
# text = Structural maintenance of chromosomes protein of Bacillus subtilis affects supercoiling in vivo .
1	Structural	structural	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	maintenance	maintenance	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	of	off	ADV	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	chromosomes	chromosome	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	protein	protéiner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	of	of bacillus subtilis affects supercoiling in vivo	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	Bacillus	Bacillus	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	subtilis	of bacillus subtilis affects supercoiling in vivo	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	affects	of bacillus subtilis affects supercoiling in vivo	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	supercoiling	of bacillus subtilis affects supercoiling in vivo	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	in	of bacillus subtilis affects supercoiling in vivo	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	vivo	of bacillus subtilis affects supercoiling in vivo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2662
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2663
# text = 184 :
1	184	184	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2664
# text = 5317 - 5322 .
1	5317	5317	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	5317 - 5322	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	5322	5322	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2665
# text = Link AJ , Phillips D , Church GM. 1997 .
1	Link	link	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	AJ	AJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Phillips	Phillips	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	D	D	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Church	Church	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	GM.	GM.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1997	1997	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2666
# text = Methods for generating precise deletions and insertions in the genome of wild-type Escherichia coli :
1	Methods	methods for generating precise deletions and	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	for	methods for generating precise deletions and	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	generating	methods for generating precise deletions and	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	precise	methods for generating precise deletions and	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	deletions	methods for generating precise deletions and	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	and	methods for generating precise deletions and	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	insertions	insertion	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	in	in	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	the	the genome of wild-type escherichia coli	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
10	genome	the genome of wild-type escherichia coli	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
11	of	the genome of wild-type escherichia coli	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
12	wild-type	the genome of wild-type escherichia coli	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
13	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	coli	the genome of wild-type escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	:	:	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2667
# text = application to open reading frame characterization .
1	application	application	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	to	toc	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	open	open	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	reading	Reding	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	frame	frame	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	characterization	characterization	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2668
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2669
# text = 179 :
1	179	179	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2670
# text = 6228 - 6237 .
1	6228	6228	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	6228 - 6237	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	6237	6237	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2671
# text = Liu LF , Wang JC. 1987 .
1	Liu	Liu	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	LF	LF	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Wang	Wang	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	JC.	JC.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1987	1987	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2672
# text = Supercoiling of the DNA template during transcription .
1	Supercoiling	supercoiling of the dna template during transcription	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	of	supercoiling of the dna template during transcription	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	the	supercoiling of the dna template during transcription	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	DNA	DNA	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	template	supercoiling of the dna template during transcription	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	during	supercoiling of the dna template during transcription	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	transcription	supercoiling of the dna template during transcription	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2673
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2674
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2675
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2676
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2677
# text = U.S.A 84 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	84	84	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2678
# text = 7024 - 7027 .
1	7024	7024	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	7024 - 7027	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	7027	7027	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2679
# text = Lockshon D , Morris DR. 1985 .
1	Lockshon	Lockshon	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	D	D	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Morris	Morris	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	DR.	DR.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1985	1985	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2680
# text = Sites of reaction of Escherichia coli DNA gyrase on pBR 322 in vivo as revealed by oxolinic acid-induced plasmid linearization .
1	Sites	sites of reaction of escherichia coli dna gyrase	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	of	sites of reaction of escherichia coli dna gyrase	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
3	reaction	sites of reaction of escherichia coli dna gyrase	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
4	of	sites of reaction of escherichia coli dna gyrase	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
5	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
6	coli	sites of reaction of escherichia coli dna gyrase	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
7	DNA	DNA	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	gyrase	sites of reaction of escherichia coli dna gyrase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	on	on	CLS	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	pBR	pBR	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
11	322	322	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	in	in vivo	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	vivo	in vivo	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	as	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	revealed	revealed by oxolinic acid-induced plasmid linearization	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
16	by	revealed by oxolinic acid-induced plasmid linearization	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
17	oxolinic	revealed by oxolinic acid-induced plasmid linearization	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
18	acid-induced	revealed by oxolinic acid-induced plasmid linearization	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
19	plasmid	revealed by oxolinic acid-induced plasmid linearization	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	linearization	revealed by oxolinic acid-induced plasmid linearization	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2681
# text = J. Mol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Mol	Mol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2682
# text = Biol .
1	Biol	biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2683
# text = 181 :
1	181	181	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2684
# text = 63 - 74 .
1	63	63	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	-	63 - 74 .	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	74	74	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	.	63 - 74 .	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2685
# text = Lopez CR , Yang S , Deibler RW , Ray SA , Pennington JM , DiGate RJ , Hastings PJ , Rosenberg
1	Lopez	Lopez	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	CR	CR	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
4	Yang	Yang	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	S	S	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
7	Deibler	Deibler	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	RW	RW	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
10	Ray	Ray	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
11	SA	SA	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
13	Pennington	Pennington	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	JM	JM	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
16	DiGate	DiGate	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
17	RJ	RJ	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
19	Hastings	Hastings	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	PJ	PJ	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	Rosenberg	Rosenberg	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2686
# text = SM , Zechiedrich EL. 2005 .
1	SM	sm	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	Zechiedrich	Zechiedrich	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	EL.	EL.	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	2005	2005	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2687
# text = A role for topoisomerase III in a recombination pathway alternative to RuvABC .
1	A	a role for topoisomerase	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	role	a role for topoisomerase	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	for	a role for topoisomerase	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	topoisomerase	a role for topoisomerase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	III	III	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	in	in	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	a	avoir	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	recombination	recombination pathway alternative to ruvabc	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
9	pathway	recombination pathway alternative to ruvabc	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
10	alternative	recombination pathway alternative to ruvabc	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
11	to	recombination pathway alternative to ruvabc	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	RuvABC	RuvABC	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2688
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2689
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2690
# text = 58 :
1	58	58	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2691
# text = 80 - 101 .
1	80	80	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	80 - 101	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	101	101	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2692
# text = Losos JB , Jackman TR , Larson A , de Queiroz K , Rodriguez-Schettino L. 1988 .
1	Losos	Losos	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	JB	JB	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Jackman	Jackman	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	TR	TR	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Larson	Larson	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	A	A	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	Queiroz	Queiroz	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	K	K	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
14	Rodriguez-Schettino	Rodriguez-Schettino	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	L.	L.	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
16	1988	1988	NUM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2693
# text = Science 279 :
1	Science	science	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	279	279	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2694
# text = 2115 - 2118 .
1	2115	2115	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	2115 - 2118	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	2118	2118	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2695
# text = Lu M , Campbell JL , Boye E , Kleckner N. 1994 .
1	Lu	lire	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	M	M	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
4	Campbell	Campbell	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	JL	JL	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
7	Boye	Boye	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	E	E	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
10	Kleckner	Kleckner	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	N.	N.	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
12	1994	1994	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2696
# text = SeqA :
1	SeqA	SeqA	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2697
# text = a negative modulator of replication initiation in E. coli .
1	a	a negative modulator of replication	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	negative	a negative modulator of replication	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	modulator	a negative modulator of replication	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	of	a negative modulator of replication	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	replication	a negative modulator of replication	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	initiation	initiation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	in	in	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	E.	E.	_	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	coli	coli	_	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2698
# text = Cell 77 :
1	Cell	cell	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	77	77	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2699
# text = 413 - 426 .
1	413	413	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	413 - 426	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	426	426	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2700
# text = Luijsterburg MS , Noom MC , Wuite GJ , Dame RT. 2006 .
1	Luijsterburg	Luijsterburg	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	MS	MS	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Noom	Noom	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
5	MC	MC	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
7	Wuite	Wuite	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	GJ	GJ	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
10	Dame	Dame	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	RT.	RT.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	2006	2006	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2701
# text = The architectural role of nucleoid-associated proteins in the organization of bacterial chromatin :
1	The	thé	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	architectural	architectural	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	role	rôle	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	of	of nucleoid-associated proteins in the organization of bacterial chromatin	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
5	nucleoid-associated	of nucleoid-associated proteins in the organization of bacterial chromatin	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
6	proteins	of nucleoid-associated proteins in the organization of bacterial chromatin	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
7	in	of nucleoid-associated proteins in the organization of bacterial chromatin	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
8	the	of nucleoid-associated proteins in the organization of bacterial chromatin	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
9	organization	of nucleoid-associated proteins in the organization of bacterial chromatin	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
10	of	of nucleoid-associated proteins in the organization of bacterial chromatin	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
11	bacterial	of nucleoid-associated proteins in the organization of bacterial chromatin	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	chromatin	of nucleoid-associated proteins in the organization of bacterial chromatin	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
13	:	:	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2702
# text = A molecular perspective .
1	A	à	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	molecular	moléculaire	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	perspective	perspective	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2703
# text = J. Struct .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Struct	Struct	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2704
# text = Biol .
1	Biol	biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2705
# text = 156 :
1	156	156	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2706
# text = 262 - 272 .
1	262	262	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	262 - 272	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	272	272	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2707
# text = Lynch AS , Wang JC. 1993 .
1	Lynch	lynch	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	AS	AS	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Wang	Wang	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	JC.	JC.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1993	1993	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2708
# text = Anchoring of DNA to the bacterial cytoplasmic membrane through cotranscriptional synthesis of polypeptides encoding membrane proteins or proteins for export :
1	Anchoring	anchoring of dna to the bacterial cytoplasmic membrane through cotranscriptional synthesis of polypeptides encoding	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
2	of	anchoring of dna to the bacterial cytoplasmic membrane through cotranscriptional synthesis of polypeptides encoding	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
3	DNA	DNA	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
4	to	anchoring of dna to the bacterial cytoplasmic membrane through cotranscriptional synthesis of polypeptides encoding	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
5	the	anchoring of dna to the bacterial cytoplasmic membrane through cotranscriptional synthesis of polypeptides encoding	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
6	bacterial	anchoring of dna to the bacterial cytoplasmic membrane through cotranscriptional synthesis of polypeptides encoding	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
7	cytoplasmic	anchoring of dna to the bacterial cytoplasmic membrane through cotranscriptional synthesis of polypeptides encoding	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
8	membrane	anchoring of dna to the bacterial cytoplasmic membrane through cotranscriptional synthesis of polypeptides encoding	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
9	through	anchoring of dna to the bacterial cytoplasmic membrane through cotranscriptional synthesis of polypeptides encoding	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
10	cotranscriptional	anchoring of dna to the bacterial cytoplasmic membrane through cotranscriptional synthesis of polypeptides encoding	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
11	synthesis	anchoring of dna to the bacterial cytoplasmic membrane through cotranscriptional synthesis of polypeptides encoding	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
12	of	anchoring of dna to the bacterial cytoplasmic membrane through cotranscriptional synthesis of polypeptides encoding	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
13	polypeptides	anchoring of dna to the bacterial cytoplasmic membrane through cotranscriptional synthesis of polypeptides encoding	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	encoding	anchoring of dna to the bacterial cytoplasmic membrane through cotranscriptional synthesis of polypeptides encoding	NOM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
15	membrane	membrane	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	proteins	pro-	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	or	or	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	proteins	pro-	VRB	_	_	16	para	_	_	_	_	_
19	for	for	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	export	export	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	:	:	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2709
# text = a mechanism of plasmid hypernegative supercoiling in mutants deficient in DNA topoisomerase I. J. Bacteriol .
1	a	a mechanism of plasmid hypernegative supercoiling in mutants deficient in dna topoisomerase i. j. bacteriol	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
2	mechanism	a mechanism of plasmid hypernegative supercoiling in mutants deficient in dna topoisomerase i. j. bacteriol	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
3	of	a mechanism of plasmid hypernegative supercoiling in mutants deficient in dna topoisomerase i. j. bacteriol	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
4	plasmid	a mechanism of plasmid hypernegative supercoiling in mutants deficient in dna topoisomerase i. j. bacteriol	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
5	hypernegative	a mechanism of plasmid hypernegative supercoiling in mutants deficient in dna topoisomerase i. j. bacteriol	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
6	supercoiling	a mechanism of plasmid hypernegative supercoiling in mutants deficient in dna topoisomerase i. j. bacteriol	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
7	in	a mechanism of plasmid hypernegative supercoiling in mutants deficient in dna topoisomerase i. j. bacteriol	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
8	mutants	a mechanism of plasmid hypernegative supercoiling in mutants deficient in dna topoisomerase i. j. bacteriol	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
9	deficient	a mechanism of plasmid hypernegative supercoiling in mutants deficient in dna topoisomerase i. j. bacteriol	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
10	in	a mechanism of plasmid hypernegative supercoiling in mutants deficient in dna topoisomerase i. j. bacteriol	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
11	DNA	DNA	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
12	topoisomerase	a mechanism of plasmid hypernegative supercoiling in mutants deficient in dna topoisomerase i. j. bacteriol	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
13	I.	I.	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
14	J.	J.	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2710
# text = 175 :
1	175	175	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2711
# text = 1645 - 1655 .
1	1645	1645	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1645 - 1655	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1655	1655	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2712
# text = Malik M , Bensaid A , Rouviere-Yaniv J , Drlica K. 1996 .
1	Malik	Malik	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	M	M	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	Bensaid	Bensaid	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	A	A	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Rouviere-Yaniv	Rouviere-Yaniv	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	J	J	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Drlica	Drlica	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
11	K.	K.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	1996	1996	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2713
# text = Histone-like protein HU and bacterial DNA topology :
1	Histone-like	histone-like protein hu and bacterial dna topology	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	protein	histone-like protein hu and bacterial dna topology	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	HU	HU	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	and	histone-like protein hu and bacterial dna topology	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	bacterial	histone-like protein hu and bacterial dna topology	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	DNA	DNA	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	topology	histone-like protein hu and bacterial dna topology	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	:	:	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2714
# text = suppression of an HU deficiency by gyrase mutations .
1	suppression	suppression of an hu deficiency by gyrase mutations	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	of	suppression of an hu deficiency by gyrase mutations	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
3	an	suppression of an hu deficiency by gyrase mutations	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
4	HU	HU	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
5	deficiency	suppression of an hu deficiency by gyrase mutations	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
6	by	suppression of an hu deficiency by gyrase mutations	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
7	gyrase	suppression of an hu deficiency by gyrase mutations	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	mutations	suppression of an hu deficiency by gyrase mutations	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2715
# text = J. Mol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Mol	Mol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2716
# text = Biol .
1	Biol	biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2717
# text = 256 :
1	256	256	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2718
# text = 66 - 76 .
1	66	66	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	-	66 - 76 .	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	76	76	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	.	66 - 76 .	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2719
# text = Mallik P , Pratt TS , Beach MB , Bradley MD , Undamatla J , Osuna R. 2004 .
1	Mallik	Malik	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	P	P	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Pratt	Pratt	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	TS	TS	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Beach	Beach	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	MB	MB	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Bradley	Bradley	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	MD	MD	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Undamatla	Undamatla	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	J	J	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Osuna	Osuna	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	R.	R.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	2004	2004	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2720
# text = Growth phase-dependent regulation and stringent control of fis are conserved processes in enteric bacteria and involve a single promoter ( fis P ) in Escherichia coli .
1	Growth	growth phase-dependent regulation and stringent control of	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
2	phase-dependent	growth phase-dependent regulation and stringent control of	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
3	regulation	growth phase-dependent regulation and stringent control of	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
4	and	growth phase-dependent regulation and stringent control of	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
5	stringent	growth phase-dependent regulation and stringent control of	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
6	control	growth phase-dependent regulation and stringent control of	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	of	growth phase-dependent regulation and stringent control of	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
8	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	are	are	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	conserved	conserve	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	processes	processe	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	in	in	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	enteric	enteric bacteria and	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
14	bacteria	enteric bacteria and	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	and	enteric bacteria and	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	involve	in-	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
17	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	single	single	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	promoter	pro-	_+V	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	(	(	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
21	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	P	P	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	)	)	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
24	in	in	ADJ	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
25	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	coli	coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2721
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2722
# text = 186 :
1	186	186	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2723
# text = 122 - 135 .
1	122	122	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	122 - 135	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	135	135	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2724
# text = Manché K , Notley-McRobb L , Ferenci T. 1999 .
1	Manché	Manche	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	K	K	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Notley-McRobb	Notley-McRobb	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	L	L	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Ferenci	Ferenci	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	T.	T.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1999	1999	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2725
# text = Mutational adaptation of
1	Mutational	Mutational	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	adaptation	adaptation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	of	off	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2726
# text = Escherichia coli to glucose limitation involves distinct evolutionary pathways in aerobic and oxygen-limited environments .
1	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	coli	coli	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	to	top	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	glucose	glucose	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	limitation	limitation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	involves	in-	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	distinct	distinct	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	evolutionary	évolution	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	pathways	pathways in aerobic and oxygen-limited environments	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
10	in	pathways in aerobic and oxygen-limited environments	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
11	aerobic	pathways in aerobic and oxygen-limited environments	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
12	and	pathways in aerobic and oxygen-limited environments	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
13	oxygen-limited	pathways in aerobic and oxygen-limited environments	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	environments	pathways in aerobic and oxygen-limited environments	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2727
# text = Genetics
1	Genetics	genetics	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2728
# text = 153 :
1	153	153	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2729
# text = 5 - 12 .
1	5	5	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	-	5 - 12 .	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	12	12	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	.	5 - 12 .	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2730
# text = Mangan MW , Lucchini S , Danino V , O'Croinin T , Hinton JC , Dorman CJ. 2006 .
1	Mangan	Mangan	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	MW	MW	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Lucchini	Lucchini	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	S	S	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Danino	Danino	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	V	V	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	O'Croinin	O'Croinin	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	T	T	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Hinton	Hinton	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
14	JC	JC	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Dorman	Dorman	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	CJ.	CJ.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	2006	2006	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2731
# text = The integration host factor ( IHF ) integrates stationary-phase and virulence gene expression in Salmonella enterica serovar Typhimurium .
1	The	the integration host	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	integration	the integration host	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	host	the integration host	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	factor	factor	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	(	(	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	IHF	IHF	NOM	_	_	3	parenth	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
8	integrates	integrates stationary-phase and virulence gene expression in salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
9	stationary-phase	integrates stationary-phase and virulence gene expression in salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
10	and	integrates stationary-phase and virulence gene expression in salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
11	virulence	integrates stationary-phase and virulence gene expression in salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
12	gene	integrates stationary-phase and virulence gene expression in salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
13	expression	integrates stationary-phase and virulence gene expression in salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
14	in	integrates stationary-phase and virulence gene expression in salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
15	Salmonella	Salmonella	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
16	enterica	integrates stationary-phase and virulence gene expression in salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
17	serovar	integrates stationary-phase and virulence gene expression in salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	Typhimurium	Typhimurium	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2732
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2733
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2734
# text = 59 :
1	59	59	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2735
# text = 1831 - 1847 .
1	1831	1831	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1831 - 1847	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1847	1847	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2736
# text = Masse E , Drolet M. 1999 .
1	Masse	masser	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	E	E	ADV	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
4	Drolet	Drolet	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	M.	monsieur	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	1999	1999	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2737
# text = Escherichia coli DNA topoisomerase I inhibits R-loop formation by relaxing transcription-induced negative supercoiling .
1	Escherichia	escherichia coli dna topoisomerase i inhibits r-loop	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	coli	escherichia coli dna topoisomerase i inhibits r-loop	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	DNA	DNA	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	topoisomerase	escherichia coli dna topoisomerase i inhibits r-loop	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	I	I	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	inhibits	escherichia coli dna topoisomerase i inhibits r-loop	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	R-loop	R-loop	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	formation	formation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	by	By	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	relaxing	relaxing transcription-induced negative supercoiling	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
11	transcription-induced	relaxing transcription-induced negative supercoiling	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
12	negative	relaxing transcription-induced negative supercoiling	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	supercoiling	relaxing transcription-induced negative supercoiling	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2738
# text = J. Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2739
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2740
# text = 274 :
1	274	274	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2741
# text = 16659 - 16664 .
1	16659	16659	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	16659 - 16664	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	16664	16664	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2742
# text = Matoba K , Yamazoe M , Mayanagi K , Morikawa K , Hiraga S. 2005 .
1	Matoba	Matoba	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	K	K	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
4	Yamazoe	Yamazoe	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	M	M	_	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
7	Mayanagi	Mayanagi	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	K	K	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
10	Morikawa	Morikawa	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	K	K	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
13	Hiraga	Hiraga	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	S.	S.	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	2005	2005	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2743
# text = Comparison of MukB homodimer versus MukBEF complex molecular architectures by electron microscopy reveals a higher-order multimerization .
1	Comparison	comparison of mukb homodimer versus mukbef complex molecular architectures by electron microscopy reveals a higher-order multimerization	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
2	of	comparison of mukb homodimer versus mukbef complex molecular architectures by electron microscopy reveals a higher-order multimerization	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
3	MukB	MukB	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
4	homodimer	comparison of mukb homodimer versus mukbef complex molecular architectures by electron microscopy reveals a higher-order multimerization	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
5	versus	comparison of mukb homodimer versus mukbef complex molecular architectures by electron microscopy reveals a higher-order multimerization	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
6	MukBEF	MukBEF	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
7	complex	comparison of mukb homodimer versus mukbef complex molecular architectures by electron microscopy reveals a higher-order multimerization	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
8	molecular	comparison of mukb homodimer versus mukbef complex molecular architectures by electron microscopy reveals a higher-order multimerization	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
9	architectures	comparison of mukb homodimer versus mukbef complex molecular architectures by electron microscopy reveals a higher-order multimerization	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
10	by	comparison of mukb homodimer versus mukbef complex molecular architectures by electron microscopy reveals a higher-order multimerization	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
11	electron	comparison of mukb homodimer versus mukbef complex molecular architectures by electron microscopy reveals a higher-order multimerization	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
12	microscopy	comparison of mukb homodimer versus mukbef complex molecular architectures by electron microscopy reveals a higher-order multimerization	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
13	reveals	comparison of mukb homodimer versus mukbef complex molecular architectures by electron microscopy reveals a higher-order multimerization	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
14	a	comparison of mukb homodimer versus mukbef complex molecular architectures by electron microscopy reveals a higher-order multimerization	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
15	higher-order	comparison of mukb homodimer versus mukbef complex molecular architectures by electron microscopy reveals a higher-order multimerization	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	multimerization	comparison of mukb homodimer versus mukbef complex molecular architectures by electron microscopy reveals a higher-order multimerization	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2744
# text = Biochem .
1	Biochem	Biochem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2745
# text = Biophys .
1	Biophys	Biophys	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2746
# text = Res .
1	Res	ré	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2747
# text = Commun .
1	Commun	commun	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2748
# text = 333 :
1	333	333	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2749
# text = 694 - 702 .
1	694	694	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	694 - 702	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	702	702	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2750
# text = Mattison K , Oropeza R , Byers N , Kenney LJ. 2002 .
1	Mattison	Mattison	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	K	K	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Oropeza	Oropeza	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	R	R	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Byers	Byers	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	N	N	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Kenney	Kenney	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	LJ.	LJ.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	2002	2002	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2751
# text = A phosphorylation site mutant of OmpR reveals different binding conformations at ompF and ompC. J. Mol .
1	A	à	PRE	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	phosphorylation	phosphorylation	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	site	site	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	mutant	mutant	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	of	of ompr reveals different binding	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
6	OmpR	OmpR	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
7	reveals	of ompr reveals different binding	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
8	different	of ompr reveals different binding	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	binding	of ompr reveals different binding	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
10	conformations	conformation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	at	avoir	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
12	ompF	ompF	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	and	and	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	ompC.	ompC.	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	J.	J.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	Mol	Mol	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2752
# text = Biol .
1	Biol	biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2753
# text = 315 :
1	315	315	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2754
# text = 497 - 511 .
1	497	497	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	497 - 511	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	511	511	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2755
# text = Maxam AM , Gilbert W. 1977 .
1	Maxam	Maxam	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	AM	AM	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Gilbert	Gilbert	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	W.	W.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1977	1977	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2756
# text = A new method for sequencing DNA .
1	A	a new method for sequencing dna	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	new	a new method for sequencing dna	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	method	a new method for sequencing dna	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	for	a new method for sequencing dna	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	sequencing	a new method for sequencing dna	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	DNA	DNA	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2757
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2758
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2759
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2760
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2761
# text = U.S.A 74 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	74	74	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2762
# text = 560 - 564 .
1	560	560	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	560 - 564	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	564	564	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2763
# text = McCann MP , Kidwell JP , Matin A. 1991 .
1	McCann	mccann	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	MP	MP	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Kidwell	Kidwell	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	JP	JP	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Matin	Matin	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	A.	A.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1991	1991	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2764
# text = The putative sigma factor KatF has a central role in development of starvation-mediated general resistance in Escherichia coli .
1	The	thé	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	putative	putatif	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	sigma	sigma	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	factor	factor	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
5	KatF	KatF	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	has	has	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	central	central	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	role	rôle	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	in	in	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	development	développer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	of	of starvation-mediated	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	starvation-mediated	of starvation-mediated	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	general	general	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	resistance	resistance	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	in	in	ADJ	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
17	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	coli	coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2765
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2766
# text = 173 :
1	173	173	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2767
# text = 4188 - 4194 .
1	4188	4188	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	4188 - 4194	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	4194	4194	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2768
# text = McLeod SM , Aiyar SE , Gourse RL , Johnson RC. 2002 .
1	McLeod	McLeod	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	SM	SM	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Aiyar	Aiyar	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	SE	SE	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Gourse	Gourse	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	RL	RL	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Johnson	Johnson	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	RC.	RC.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	2002	2002	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2769
# text = The C-terminal domains of the RNA polymerase alpha subunits :
1	The	the c-terminal domains of the rna polymerase alpha subunits	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	C-terminal	C-terminal	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	domains	the c-terminal domains of the rna polymerase alpha subunits	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
4	of	the c-terminal domains of the rna polymerase alpha subunits	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	the	the c-terminal domains of the rna polymerase alpha subunits	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
6	RNA	RNA	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
7	polymerase	the c-terminal domains of the rna polymerase alpha subunits	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
8	alpha	the c-terminal domains of the rna polymerase alpha subunits	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	subunits	the c-terminal domains of the rna polymerase alpha subunits	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	:	:	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2770
# text = contact site with Fis and localization during co-activation with CRP at the Escherichia coli proP P2 promoter .
1	contact	contact	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	site	site	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	with	dire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	Fis	Fis	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
5	and	fis and localization during co-activation with crp at the escherichia	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
6	localization	fis and localization during co-activation with crp at the escherichia	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
7	during	fis and localization during co-activation with crp at the escherichia	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
8	co-activation	fis and localization during co-activation with crp at the escherichia	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
9	with	fis and localization during co-activation with crp at the escherichia	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
10	CRP	CRP	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
11	at	fis and localization during co-activation with crp at the escherichia	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
12	the	fis and localization during co-activation with crp at the escherichia	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	coli	colis	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	proP	pro-	VPR	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	P2	P2	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	promoter	pro-	_+V	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2771
# text = J. Mol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Mol	Mol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2772
# text = Biol .
1	Biol	biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2773
# text = 316 :
1	316	316	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2774
# text = 517 - 529 .
1	517	517	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	517 - 529	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	529	529	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2775
# text = Meddows TR , Savory AP , Grove JI , Moore T , Lloyd RG. 2005 .
1	Meddows	Meddows	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	TR	TR	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Savory	Savory	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	AP	AP	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Grove	Grove	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	JI	JI	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Moore	Moore	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	T	T	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Lloyd	Lloyd	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	RG.	RG.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	2005	2005	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2776
# text = RecN protein and transcription factor DksA combine to promote faithful recombinational repair of
1	RecN	RecN	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	protein	protéiner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	and	and	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	transcription	transcription	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	factor	factor	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	DksA	DksA	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
7	combine	dksa combine to promote faithful recombinational repair of	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
8	to	dksa combine to promote faithful recombinational repair of	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
9	promote	dksa combine to promote faithful recombinational repair of	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
10	faithful	dksa combine to promote faithful recombinational repair of	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
11	recombinational	dksa combine to promote faithful recombinational repair of	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
12	repair	dksa combine to promote faithful recombinational repair of	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	of	dksa combine to promote faithful recombinational repair of	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2777
# text = DNA double-strand double-strand breaks .
1	DNA	dna	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	double-strand	doubler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	double-strand	double-strand	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	breaks	breaks	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2778
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2779
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2780
# text = 57 :
1	57	57	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2781
# text = 97 - 110 .
1	97	97	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	97 - 110	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	110	110	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2782
# text = Menzel R , Gellert M. 1983 .
1	Menzel	Menzel	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	R	R	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
4	Gellert	Gellert	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	M.	monsieur	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	1983	1983	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2783
# text = Regulation of the genes for E. coli DNA gyrase :
1	Regulation	regulation of the genes for e. coli dna gyrase	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	of	regulation of the genes for e. coli dna gyrase	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	the	regulation of the genes for e. coli dna gyrase	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
4	genes	regulation of the genes for e. coli dna gyrase	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	for	regulation of the genes for e. coli dna gyrase	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
6	E.	E.	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
7	coli	regulation of the genes for e. coli dna gyrase	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
8	DNA	DNA	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	gyrase	regulation of the genes for e. coli dna gyrase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	:	:	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2784
# text = homeostatic control of DNA supercoiling .
1	homeostatic	homeostatic control of dna supercoiling	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	control	homeostatic control of dna supercoiling	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	of	homeostatic control of dna supercoiling	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	DNA	DNA	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	supercoiling	homeostatic control of dna supercoiling	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2785
# text = Cell 34 :
1	Cell	cell	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	34	34	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2786
# text = 105 - 113 .
1	105	105	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	105 - 113	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	113	113	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2787
# text = Menzel R , Gellert M. 1987 .
1	Menzel	Menzel	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	R	R	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
4	Gellert	Gellert	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	M.	monsieur	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	1987	1987	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2788
# text = Modulation of transcription by DNA supercoiling :
1	Modulation	modulation of	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	of	modulation of	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	transcription	transcription	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	by	by	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	DNA	DNA	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	supercoiling	supercoiling	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	:	:	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2789
# text = a deletion analysis of the Escherichia coli gyrA and gyrB promoters .
1	a	a deletion analysis of the escherichia coli gyra and gyrb promoters	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	deletion	a deletion analysis of the escherichia coli gyra and gyrb promoters	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
3	analysis	a deletion analysis of the escherichia coli gyra and gyrb promoters	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
4	of	a deletion analysis of the escherichia coli gyra and gyrb promoters	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
5	the	a deletion analysis of the escherichia coli gyra and gyrb promoters	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
6	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
7	coli	a deletion analysis of the escherichia coli gyra and gyrb promoters	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
8	gyrA	a deletion analysis of the escherichia coli gyra and gyrb promoters	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
9	and	a deletion analysis of the escherichia coli gyra and gyrb promoters	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
10	gyrB	a deletion analysis of the escherichia coli gyra and gyrb promoters	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	promoters	a deletion analysis of the escherichia coli gyra and gyrb promoters	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2790
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2791
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2792
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2793
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2794
# text = U.S.A
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2795
# text = 84 :
1	84	84	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2796
# text = 4185 - 4189 .
1	4185	4185	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	4185 - 4189	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	4189	4189	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2797
# text = Minsky A , Shimoni E , Frenkiel-Krispin D. 2002 .
1	Minsky	Minsky	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	A	A	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Shimoni	Shimoni	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	E	E	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Frenkiel-Krispin	Frenkiel-Krispin	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	D.	D.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2002	2002	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2798
# text = Stress , order and survival .
1	Stress	stress	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
3	order	order and survival	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
4	and	order and survival	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	survival	order and survival	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2799
# text = Nat .
1	Nat	Nat	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2800
# text = Rev .
1	Rev	Rev	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2801
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2802
# text = Cell Biol .
1	Cell	cell	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2803
# text = 3 : 50 - 60 .
1	3	3	NUM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	:	3 : 50	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	50	50	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	-	-	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
5	60	60	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2804
# text = Miyamoto S , Kashiwagi K , Ito K , Watanabe S , Igarashi K. 1993 .
1	Miyamoto	Miyamoto	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	S	S	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Kashiwagi	Kashiwagi	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	K	K	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Ito	Ito	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	K	K	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Watanabe	Watanabe	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
11	S	S	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Igarashi	Igarashi	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
14	K.	K.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	1993	1993	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2805
# text = Estimation of polyamine distribution and polyamine stimulation of protein synthesis in Escherichia coli .
1	Estimation	estimation of	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	of	estimation of	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	polyamine	polyamine	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	distribution	distribution	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	and	and	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	polyamine	polyamine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	stimulation	stimulation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	of	of protein synthesis in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
9	protein	of protein synthesis in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
10	synthesis	of protein synthesis in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
11	in	of protein synthesis in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
12	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	coli	of protein synthesis in escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2806
# text = Arch .
1	Arch	arch	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2807
# text = Biochem .
1	Biochem	Biochem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2808
# text = Biophys .
1	Biophys	Biophys	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2809
# text = 300 :
1	300	300	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2810
# text = 63 - 68 .
1	63	63	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	-	63 - 68 .	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	68	68	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	.	63 - 68 .	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2811
# text = Mongold JA , Lenski RE. 1996 .
1	Mongold	Mongold	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	JA	JA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Lenski	Lenski	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	RE.	RE.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1996	1996	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2812
# text = Experimental rejection of a nonadaptive explanation for increased cell size in Escherichia coli .
1	Experimental	experimental rejection of a nonadaptive explanation for increased cell size in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	rejection	experimental rejection of a nonadaptive explanation for increased cell size in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
3	of	experimental rejection of a nonadaptive explanation for increased cell size in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
4	a	experimental rejection of a nonadaptive explanation for increased cell size in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
5	nonadaptive	experimental rejection of a nonadaptive explanation for increased cell size in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
6	explanation	experimental rejection of a nonadaptive explanation for increased cell size in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
7	for	experimental rejection of a nonadaptive explanation for increased cell size in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
8	increased	experimental rejection of a nonadaptive explanation for increased cell size in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
9	cell	experimental rejection of a nonadaptive explanation for increased cell size in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
10	size	experimental rejection of a nonadaptive explanation for increased cell size in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
11	in	experimental rejection of a nonadaptive explanation for increased cell size in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
12	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	coli	experimental rejection of a nonadaptive explanation for increased cell size in escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2813
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2814
# text = 178 :
1	178	178	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2815
# text = 5333 - 5334 .
1	5333	5333	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	5333 - 5334	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	5334	5334	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2816
# text = Morett E , Bork P. 1998 .
1	Morett	Morett	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	E	E	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Bork	Bork	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	P.	P.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1998	1998	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2817
# text = Evolution of new protein function :
1	Evolution	evolution of new protein function	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	of	evolution of new protein function	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	new	evolution of new protein function	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	protein	evolution of new protein function	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	function	evolution of new protein function	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	:	:	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2818
# text = recombinational enhancer Fis originated by horizontal gene transfer from the transcriptional regulator NtrC. FEBS Lett .
1	recombinational	recombinational enhancer fis originated	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	enhancer	recombinational enhancer fis originated	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
3	Fis	Fis	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	originated	recombinational enhancer fis originated	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
5	by	By	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	horizontal	horizontal	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	gene	gêner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	transfer	transfert	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	from	frou	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	the	the transcriptional regulator ntrc. febs lett	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
11	transcriptional	the transcriptional regulator ntrc. febs lett	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
12	regulator	the transcriptional regulator ntrc. febs lett	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
13	NtrC.	NtrC.	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
14	FEBS	FEBS	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	Lett	Lett	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2819
# text = 433 :
1	433	433	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2820
# text = 108 - 112 .
1	108	108	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	108 - 112	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	112	112	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2821
# text = Morrison A , Cozzarelli NR. 1979 .
1	Morrison	morrison	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	A	A	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	NR.	NR.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1979	1979	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2822
# text = Site-specific cleavage of DNA by
1	Site-specific	site-specific cleavage of dna by	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	cleavage	site-specific cleavage of dna by	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	of	site-specific cleavage of dna by	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	DNA	DNA	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	by	site-specific cleavage of dna by	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2823
# text = E . coli DNA gyrase .
1	E	e	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	coli	colis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	DNA	DNA	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	gyrase	gyrase	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2824
# text = Cell 17 :
1	Cell	cell	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	17	17	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2825
# text = 175 - 184 .
1	175	175	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	175 - 184	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	184	184	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2826
# text = Moulin L , Rahmouni AR , Boccard F. 2005 .
1	Moulin	Moulin	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	L	L	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Rahmouni	Rahmouni	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	AR	AR	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Boccard	Boccard	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	F.	F.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2005	2005	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2827
# text = Topological insulators inhibit diffusion of transcription-induced positive supercoils in the chromosome of Escherichia coli .
1	Topological	topological insulators inhibit diffusion of transcription-induced	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	insulators	topological insulators inhibit diffusion of transcription-induced	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	inhibit	topological insulators inhibit diffusion of transcription-induced	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	diffusion	topological insulators inhibit diffusion of transcription-induced	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	of	topological insulators inhibit diffusion of transcription-induced	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	transcription-induced	topological insulators inhibit diffusion of transcription-induced	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	positive	positif	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	supercoils	super-	_+_+CL	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	in	in	ADJ	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
10	the	the chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
11	chromosome	the chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
12	of	the chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
13	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	coli	the chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2828
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2829
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2830
# text = 55 :
1	55	55	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2831
# text = 601 - 610 .
1	601	601	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	601 - 610	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	610	610	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2832
# text = Muskhelishvili G , Buckle M , Heumann H , Kahmann R , Travers AA. 1997 .
1	Muskhelishvili	Muskhelishvili	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	G	G	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Buckle	Buckle	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	M	M	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Heumann	Heumann	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	H	H	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Kahmann	Kahmann	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	R	R	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Travers	Travers	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	AA.	AA.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	1997	1997	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2833
# text = FIS activates sequential steps during transcription initiation at a stable RNA promoter .
1	FIS	fis activates sequential steps during	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	activates	fis activates sequential steps during	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	sequential	fis activates sequential steps during	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	steps	fis activates sequential steps during	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	during	fis activates sequential steps during	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	transcription	transcription	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	initiation	initiation	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
8	at	at	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
9	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	stable	stable	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	RNA	RNA	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	promoter	pro-	_+V	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2834
# text = EMBO J. 16 :
1	EMBO	embo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J.	J.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	16	16	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2835
# text = 3655 - 3665 .
1	3655	3655	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	3655 - 3665	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	3665	3665	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2836
# text = Muskhelishvili G , Travers AA , Heumann H , Kahmann R. 1995 .
1	Muskhelishvili	Muskhelishvili	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	G	G	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Travers	Travers	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	AA	AA	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Heumann	Heumann	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	H	H	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Kahmann	Kahmann	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	R.	R.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	1995	1995	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2837
# text = FIS and
1	FIS	fis and	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	and	fis and	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2838
# text = RNA polymerase holoenzyme form a specific nucleoprotein complex at a stable RNA promoter .
1	RNA	rna polymerase holoenzyme form a specific nucleoprotein complex	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
2	polymerase	rna polymerase holoenzyme form a specific nucleoprotein complex	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
3	holoenzyme	rna polymerase holoenzyme form a specific nucleoprotein complex	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
4	form	rna polymerase holoenzyme form a specific nucleoprotein complex	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
5	a	rna polymerase holoenzyme form a specific nucleoprotein complex	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
6	specific	rna polymerase holoenzyme form a specific nucleoprotein complex	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
7	nucleoprotein	rna polymerase holoenzyme form a specific nucleoprotein complex	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	complex	rna polymerase holoenzyme form a specific nucleoprotein complex	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
9	at	at	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
10	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	stable	stable	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	RNA	RNA	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	promoter	pro-	_+V	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2839
# text = EMBO J. 14 :
1	EMBO	embo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J.	J.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	14	14	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2840
# text = 1446 - 1452 .
1	1446	1446	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1446 - 1452	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1452	1452	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2841
# text = Muskhelishvili G , Travers A. 2003 .
1	Muskhelishvili	Muskhelishvili	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	G	G	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Travers	Travers	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	A.	A.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2003	2003	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2842
# text = Transcription factor as a topological homeostat .
1	Transcription	transcription	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	factor	factor	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	as	as	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	topological	topological	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	homeostat	homéostat	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2843
# text = Front Biosci .
1	Front	Front	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biosci	Biosci	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2844
# text = 8 :
1	8	8	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2845
# text = 279 - 285 .
1	279	279	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	279 - 285	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	285	285	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2846
# text = Nakanishi A , Oshida T , Matsushita T , Imajoh-Ohmi S , Ohnuki T. 1998 .
1	Nakanishi	Nakanishi	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	A	A	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
4	Oshida	Oshida	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	T	T	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
7	Matsushita	Matsushita	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	T	T	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
10	Imajoh-Ohmi	Imajoh-Ohmi	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	S	S	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
13	Ohnuki	Ohnuki	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	T.	T.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
15	1998	1998	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2847
# text = Identification of DNA gyrase inhibitor ( GyrI ) in Escherichia coli .
1	Identification	identification of dna gyrase inhibitor	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	of	identification of dna gyrase inhibitor	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	DNA	DNA	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	gyrase	identification of dna gyrase inhibitor	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	inhibitor	identification of dna gyrase inhibitor	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	(	(	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	GyrI	GyrI	NOM	_	_	5	parenth	_	_	_	_	_
8	)	)	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
9	in	in	ADJ	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
10	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	coli	coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2848
# text = J. Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2849
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2850
# text = 273 :
1	273	273	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2851
# text = 1933 - 1938 .
1	1933	1933	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1933 - 1938	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1938	1938	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2852
# text = Newlands JT , Josaitis CA , Ross W , Gourse RL. 1992 .
1	Newlands	Newlands	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	JT	JT	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Josaitis	Josaitis	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	CA	CA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Ross	Ross	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	W	W	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Gourse	Gourse	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	RL.	RL.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	1992	1992	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2853
# text = Both
1	Both	Both	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2854
# text = Fis-dependent and factor-independent upstream activation of the rr B P1 promoter are face of the helix dependent .
1	Fis-dependent	fis-dependent and factor-independent upstream activation of the rr b p1 promoter are face of the helix dependent	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
2	and	fis-dependent and factor-independent upstream activation of the rr b p1 promoter are face of the helix dependent	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
3	factor-independent	fis-dependent and factor-independent upstream activation of the rr b p1 promoter are face of the helix dependent	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
4	upstream	fis-dependent and factor-independent upstream activation of the rr b p1 promoter are face of the helix dependent	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
5	activation	fis-dependent and factor-independent upstream activation of the rr b p1 promoter are face of the helix dependent	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
6	of	fis-dependent and factor-independent upstream activation of the rr b p1 promoter are face of the helix dependent	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
7	the	fis-dependent and factor-independent upstream activation of the rr b p1 promoter are face of the helix dependent	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
8	rr	fis-dependent and factor-independent upstream activation of the rr b p1 promoter are face of the helix dependent	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
9	B	B	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
10	P1	P1	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
11	promoter	fis-dependent and factor-independent upstream activation of the rr b p1 promoter are face of the helix dependent	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
12	are	fis-dependent and factor-independent upstream activation of the rr b p1 promoter are face of the helix dependent	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
13	face	fis-dependent and factor-independent upstream activation of the rr b p1 promoter are face of the helix dependent	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
14	of	fis-dependent and factor-independent upstream activation of the rr b p1 promoter are face of the helix dependent	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
15	the	fis-dependent and factor-independent upstream activation of the rr b p1 promoter are face of the helix dependent	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
16	helix	fis-dependent and factor-independent upstream activation of the rr b p1 promoter are face of the helix dependent	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	dependent	fis-dependent and factor-independent upstream activation of the rr b p1 promoter are face of the helix dependent	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2855
# text = Nucleic Acids Res .
1	Nucleic	Nucleic	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Acids	Acids	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Res	Res	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2856
# text = 20 :
1	20	20	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2857
# text = 719 - 726 .
1	719	719	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	719 - 726	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	726	726	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2858
# text = Nichols MD , DeAngelis K , Keck JL , Berger JM. 1999 .
1	Nichols	Nichols	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	MD	MD	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	DeAngelis	DeAngelis	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	K	K	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Keck	Keck	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	JL	JL	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Berger	Berger	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	JM.	JM.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	1999	1999	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2859
# text = Structure and function of an archaeal topoisomerase VI subunit with homology to the meiotic recombination factor Spo 11 .
1	Structure	structure and function of an archaeal topoisomerase	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
2	and	structure and function of an archaeal topoisomerase	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
3	function	structure and function of an archaeal topoisomerase	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
4	of	structure and function of an archaeal topoisomerase	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
5	an	structure and function of an archaeal topoisomerase	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
6	archaeal	structure and function of an archaeal topoisomerase	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	topoisomerase	structure and function of an archaeal topoisomerase	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
8	VI	VI	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	subunit	sub-	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	with	dire	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	homology	homology to the meiotic recombination factor spo 11	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
12	to	homology to the meiotic recombination factor spo 11	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
13	the	homology to the meiotic recombination factor spo 11	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
14	meiotic	homology to the meiotic recombination factor spo 11	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
15	recombination	homology to the meiotic recombination factor spo 11	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
16	factor	homology to the meiotic recombination factor spo 11	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
17	Spo	Spo	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	11	11	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2860
# text = EMBO J. 18 :
1	EMBO	embo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J.	J.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	18	18	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2861
# text = 6177 - 6188 .
1	6177	6177	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	6177 - 6188	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	6188	6188	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2862
# text = Nikaido H , Rosenberg EY. 1983 .
1	Nikaido	Nikaido	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	H	H	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Rosenberg	Rosenberg	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	EY.	EY.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1983	1983	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2863
# text = Porin channels in Escherichia coli :
1	Porin	Porin	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	channels	charnel	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	in	in	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	coli	coli	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2864
# text = studies with liposomes reconstituted from purified proteins .
1	studies	studio	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	with	bit	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	liposomes	liposome	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
4	reconstituted	reconstituer	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	from	froc	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	purified	purifier	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	proteins	pro-	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2865
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2866
# text = 153 :
1	153	153	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2867
# text = 241 - 252 .
1	241	241	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	241 - 252	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	252	252	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2868
# text = Niki H , Yamaichi Y , Hiraga S. 2000 .
1	Niki	Niki	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	H	H	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Yamaichi	Yamaichi	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	Y	Y	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Hiraga	Hiraga	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	S.	S.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2000	2000	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2869
# text = Dynamic organization of chromosomal DNA in Escherichia coli .
1	Dynamic	dynamic organization of chromosomal dna in escherichia coli	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	organization	dynamic organization of chromosomal dna in escherichia coli	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
3	of	dynamic organization of chromosomal dna in escherichia coli	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
4	chromosomal	dynamic organization of chromosomal dna in escherichia coli	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
5	DNA	DNA	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
6	in	dynamic organization of chromosomal dna in escherichia coli	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
7	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	coli	dynamic organization of chromosomal dna in escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2870
# text = Genes Dev .
1	Genes	gêne	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Dev	Dev	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2871
# text = 14 :
1	14	14	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2872
# text = 212 - 223 .
1	212	212	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	212 - 223	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	223	223	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2873
# text = Ninnemann O , Koch C , Kahmann R. 1992 .
1	Ninnemann	Ninnemann	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	O	O	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Koch	Koch	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	C	C	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Kahmann	Kahmann	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	R.	R.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1992	1992	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2874
# text = The Escherichia coli fis promoter is subject to stringent control and autoregulation .
1	The	the escherichia coli fis promoter is subject to stringent control and autoregulation	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
3	coli	the escherichia coli fis promoter is subject to stringent control and autoregulation	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
4	fis	the escherichia coli fis promoter is subject to stringent control and autoregulation	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
5	promoter	the escherichia coli fis promoter is subject to stringent control and autoregulation	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
6	is	the escherichia coli fis promoter is subject to stringent control and autoregulation	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	subject	the escherichia coli fis promoter is subject to stringent control and autoregulation	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	to	the escherichia coli fis promoter is subject to stringent control and autoregulation	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	stringent	the escherichia coli fis promoter is subject to stringent control and autoregulation	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	control	the escherichia coli fis promoter is subject to stringent control and autoregulation	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	and	the escherichia coli fis promoter is subject to stringent control and autoregulation	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	autoregulation	the escherichia coli fis promoter is subject to stringent control and autoregulation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2875
# text = EMBO J. 11 :
1	EMBO	embo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J.	J.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	11	11	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2876
# text = 1075 - 1083 .
1	1075	1075	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1075 - 1083	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1083	1083	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2877
# text = Norioka S , Ramakrishnan G , Ikenaka K , Inouye M. 1986 .
1	Norioka	Norioka	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	S	S	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
4	Ramakrishnan	Ramakrishnan	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	G	G	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
7	Ikenaka	Ikenaka	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	K	K	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
10	Inouye	Inouye	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	M.	monsieur	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	1986	1986	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2878
# text = Interaction of a transcriptional activator , OmpR , with reciprocally osmoregulated genes , ompF and ompC , of Escherichia coli .
1	Interaction	interaction of a transcriptional activator	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
2	of	interaction of a transcriptional activator	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
3	a	interaction of a transcriptional activator	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
4	transcriptional	interaction of a transcriptional activator	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	activator	interaction of a transcriptional activator	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
7	OmpR	OmpR	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
9	with	with reciprocally osmoregulated genes	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
10	reciprocally	with reciprocally osmoregulated genes	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
11	osmoregulated	with reciprocally osmoregulated genes	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	genes	with reciprocally osmoregulated genes	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
14	ompF	ompF	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	and	and	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	ompC	ompC	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
18	of	of escherichia	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
20	coli	colis	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2879
# text = J. Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2880
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2881
# text = 261 :
1	261	261	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2882
# text = 17113 - 17119 .
1	17113	17113	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	17113 - 17119	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	17119	17119	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2883
# text = Nosil P , Crespi BJ , Sandoval CP. 2002 .
1	Nosil	Nosil	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	P	P	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Crespi	Crespi	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	BJ	BJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Sandoval	Sandoval	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	CP.	CP.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2002	2002	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2884
# text = Host-plant adaptation drives the parallel evolution of reproductive isolation .
1	Host-plant	Host-plant	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	adaptation	adaptation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	drives	drive	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	the	the parallel evolution of reproductive isolation	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	parallel	the parallel evolution of reproductive isolation	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
6	evolution	the parallel evolution of reproductive isolation	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
7	of	the parallel evolution of reproductive isolation	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
8	reproductive	the parallel evolution of reproductive isolation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	isolation	the parallel evolution of reproductive isolation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2885
# text = Nature
1	Nature	nature	ADV	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2886
# text = 417 :
1	417	417	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2887
# text = 440 - 443 .
1	440	440	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	440 - 443	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	443	443	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2888
# text = Nurse P , Levine C , Hassing H , Marians KJ. 2003 .
1	Nurse	nurse	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	P	P	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Levine	Levine	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	C	C	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Hassing	Hassing	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	H	H	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Marians	Marians	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	KJ.	KJ.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	2003	2003	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2889
# text = Topoisomerase III can serve as the cellular decatenase in Escherichia coli .
1	Topoisomerase	Topoisomerase	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	III	III	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	can	Can	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	serve	servir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	as	as	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	the	the cellular decatenase in escherichia coli	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
7	cellular	the cellular decatenase in escherichia coli	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
8	decatenase	the cellular decatenase in escherichia coli	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
9	in	the cellular decatenase in escherichia coli	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
10	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	coli	the cellular decatenase in escherichia coli	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2890
# text = J. Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2891
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2892
# text = 278 :
1	278	278	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2893
# text = 8653 - 8660 .
1	8653	8653	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	8653 - 8660	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	8660	8660	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2894
# text = Oh TJ , Jung IL , Kim IG. 2001 .
1	Oh	oh	INT	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	TJ	TJ	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	Jung	Jung	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	IL	IL	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Kim	Kim	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	IG.	IG.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2001	2001	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2895
# text = The Escherichia coli
1	The	the escherichia	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	coli	colis	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2896
# text = SOS gene sbmC is regulated by H-NS and RpoS during the SOS induction and stationary growth phase .
1	SOS	sos gene sbmc is regulated by h-ns and rpos during the sos induction and stationary growth phase	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
2	gene	sos gene sbmc is regulated by h-ns and rpos during the sos induction and stationary growth phase	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
3	sbmC	sos gene sbmc is regulated by h-ns and rpos during the sos induction and stationary growth phase	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
4	is	sos gene sbmc is regulated by h-ns and rpos during the sos induction and stationary growth phase	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
5	regulated	sos gene sbmc is regulated by h-ns and rpos during the sos induction and stationary growth phase	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
6	by	sos gene sbmc is regulated by h-ns and rpos during the sos induction and stationary growth phase	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
7	H-NS	H-NS	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
8	and	sos gene sbmc is regulated by h-ns and rpos during the sos induction and stationary growth phase	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
9	RpoS	RpoS	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
10	during	sos gene sbmc is regulated by h-ns and rpos during the sos induction and stationary growth phase	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
11	the	sos gene sbmc is regulated by h-ns and rpos during the sos induction and stationary growth phase	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
12	SOS	SOS	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
13	induction	sos gene sbmc is regulated by h-ns and rpos during the sos induction and stationary growth phase	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
14	and	sos gene sbmc is regulated by h-ns and rpos during the sos induction and stationary growth phase	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
15	stationary	sos gene sbmc is regulated by h-ns and rpos during the sos induction and stationary growth phase	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
16	growth	sos gene sbmc is regulated by h-ns and rpos during the sos induction and stationary growth phase	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	phase	sos gene sbmc is regulated by h-ns and rpos during the sos induction and stationary growth phase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2897
# text = Biochem .
1	Biochem	Biochem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2898
# text = Biophys .
1	Biophys	Biophys	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2899
# text = Res .
1	Res	ré	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2900
# text = Commun .
1	Commun	commun	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2901
# text = 288 :
1	288	288	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2902
# text = 1052 - 1058 .
1	1052	1052	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1052 - 1058	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1058	1058	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2903
# text = Orphanides G , Maxwell A. 1994 .
1	Orphanides	Orphanides	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	G	G	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Maxwell	Maxwell	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	A.	A.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1994	1994	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2904
# text = Evidence for a conformational change in the DNA gyrase-DNA complex from hydroxyl radical footprinting .
1	Evidence	evidence for a conformational change in the dna gyrase-dna complex from hydroxyl radical footprinting	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
2	for	evidence for a conformational change in the dna gyrase-dna complex from hydroxyl radical footprinting	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
3	a	evidence for a conformational change in the dna gyrase-dna complex from hydroxyl radical footprinting	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
4	conformational	evidence for a conformational change in the dna gyrase-dna complex from hydroxyl radical footprinting	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
5	change	evidence for a conformational change in the dna gyrase-dna complex from hydroxyl radical footprinting	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
6	in	evidence for a conformational change in the dna gyrase-dna complex from hydroxyl radical footprinting	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
7	the	evidence for a conformational change in the dna gyrase-dna complex from hydroxyl radical footprinting	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
8	DNA	DNA	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
9	gyrase-DNA	evidence for a conformational change in the dna gyrase-dna complex from hydroxyl radical footprinting	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
10	complex	evidence for a conformational change in the dna gyrase-dna complex from hydroxyl radical footprinting	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
11	from	evidence for a conformational change in the dna gyrase-dna complex from hydroxyl radical footprinting	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
12	hydroxyl	evidence for a conformational change in the dna gyrase-dna complex from hydroxyl radical footprinting	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
13	radical	evidence for a conformational change in the dna gyrase-dna complex from hydroxyl radical footprinting	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	footprinting	evidence for a conformational change in the dna gyrase-dna complex from hydroxyl radical footprinting	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2905
# text = Nucleic
1	Nucleic	Nucleic	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2906
# text = Acids Res .
1	Acids	Acids	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Res	Res	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2907
# text = 22 :
1	22	22	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2908
# text = 1567 - 1575 .
1	1567	1567	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1567 - 1575	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1575	1575	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2909
# text = Osheroff N. 1987 .
1	Osheroff	Osheroff	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	N.	N.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	1987	1987	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2910
# text = Role of the divalent cation in topoisomerase II mediated reactions .
1	Role	role of the divalent cation in topoisomerase ii mediated reactions	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	of	role of the divalent cation in topoisomerase ii mediated reactions	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
3	the	role of the divalent cation in topoisomerase ii mediated reactions	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
4	divalent	role of the divalent cation in topoisomerase ii mediated reactions	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
5	cation	role of the divalent cation in topoisomerase ii mediated reactions	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
6	in	role of the divalent cation in topoisomerase ii mediated reactions	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
7	topoisomerase	role of the divalent cation in topoisomerase ii mediated reactions	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
8	II	II	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
9	mediated	role of the divalent cation in topoisomerase ii mediated reactions	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	reactions	role of the divalent cation in topoisomerase ii mediated reactions	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2911
# text = Biochemistry 26 :
1	Biochemistry	biochemistry	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	26	26	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2912
# text = 6402 - 6406 .
1	6402	6402	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	6402 - 6406	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	6406	6406	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2913
# text = Osuna R , Finkel SE , Johnson RC. 1991 .
1	Osuna	osuna	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	R	R	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Finkel	Finkel	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	SE	SE	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Johnson	Johnson	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	RC.	RC.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1991	1991	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2914
# text = Identification of two functional regions in Fis :
1	Identification	identification of two functional	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	of	identification of two functional	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
3	two	identification of two functional	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	functional	identification of two functional	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
5	regions	région	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	in	in	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	Fis	Fis	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	:	:	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2915
# text = the N-terminus is required to promote Hin-mediated DNA inversion but not lambda excision .
1	the	the n-terminus is required to promote hin-mediated dna	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	N-terminus	N-terminus	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
3	is	the n-terminus is required to promote hin-mediated dna	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
4	required	the n-terminus is required to promote hin-mediated dna	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
5	to	the n-terminus is required to promote hin-mediated dna	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
6	promote	the n-terminus is required to promote hin-mediated dna	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
7	Hin-mediated	Hin-mediated	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	DNA	DNA	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	inversion	inversion	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	but	but	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	not	nô	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	lambda	lambda	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	excision	excision	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2916
# text = EMBO J. 10 :
1	EMBO	embo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J.	J.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	10	10	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2917
# text = 1593 - 1603 .
1	1593	1593	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1593 - 1603	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1603	1603	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2918
# text = Owen-Hughes TA , Pavitt GD , Santos DS , Sidebotham JM , Hulton CS , Hinton JC , Higgins CF .
1	Owen-Hughes	Owen	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	TA	TA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Pavitt	Pavitt	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	GD	GD	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Santos	Santos	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	DS	DS	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Sidebotham	Sidebotham	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	JM	JM	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Hulton	Hulton	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	CS	CS	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
16	Hinton	Hinton	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	JC	JC	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
19	Higgins	Higgins	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
20	CF	CF	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2919
# text = 1992 .
1	1992	1992	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2920
# text = The chromatin-associated protein H-NS interacts with curved DNA to influence DNA topology and gene expression .
1	The	the chromatin-associated protein h-ns interacts with curved dna to influence dna topology and gene expression	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
2	chromatin-associated	the chromatin-associated protein h-ns interacts with curved dna to influence dna topology and gene expression	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
3	protein	the chromatin-associated protein h-ns interacts with curved dna to influence dna topology and gene expression	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
4	H-NS	H-NS	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
5	interacts	the chromatin-associated protein h-ns interacts with curved dna to influence dna topology and gene expression	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
6	with	the chromatin-associated protein h-ns interacts with curved dna to influence dna topology and gene expression	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
7	curved	the chromatin-associated protein h-ns interacts with curved dna to influence dna topology and gene expression	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
8	DNA	DNA	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
9	to	the chromatin-associated protein h-ns interacts with curved dna to influence dna topology and gene expression	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
10	influence	the chromatin-associated protein h-ns interacts with curved dna to influence dna topology and gene expression	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
11	DNA	DNA	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
12	topology	the chromatin-associated protein h-ns interacts with curved dna to influence dna topology and gene expression	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
13	and	the chromatin-associated protein h-ns interacts with curved dna to influence dna topology and gene expression	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
14	gene	the chromatin-associated protein h-ns interacts with curved dna to influence dna topology and gene expression	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	expression	the chromatin-associated protein h-ns interacts with curved dna to influence dna topology and gene expression	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2921
# text = Cell 71 :
1	Cell	cell	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	71	71	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2922
# text = 255 - 265 .
1	255	255	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	255 - 265	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	265	265	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2923
# text = Owens RM , Pritchard G , Skipp P , Hodey M , Connell SR , Nierhaus KH , O'Connor CD. 2004 .
1	Owens	owens	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	RM	RM	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
4	Pritchard	Pritchard	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	G	G	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
7	Skipp	Skipp	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	P	P	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
10	Hodey	Hodey	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	M	M	_	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
13	Connell	Connell	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	SR	SR	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
16	Nierhaus	Nierhaus	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	KH	KH	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
19	O'Connor	O'Connor	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	CD.	CD.	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
21	2004	2004	NUM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2924
# text = A dedicated translation factor controls the synthesis of the global regulator Fis .
1	A	à	PRE	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	dedicated	dédicacer	VNF	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	translation	translation	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
4	factor	factor	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	controls	contrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	the	the synthesis of the global regulator fis	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
7	synthesis	the synthesis of the global regulator fis	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
8	of	the synthesis of the global regulator fis	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
9	the	the synthesis of the global regulator fis	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
10	global	the synthesis of the global regulator fis	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
11	regulator	the synthesis of the global regulator fis	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	Fis	Fis	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2925
# text = EMBO J. 23 :
1	EMBO	embo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J.	J.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	23	23	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2926
# text = 3375 - 3385 .
1	3375	3375	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	3375 - 3385	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	3385	3385	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2927
# text = Pan CQ , Finkel SE , Cramton SE , Feng JA , Sigman DS , Johnson RC. 1996 .
1	Pan	Pan	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	CQ	CQ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Finkel	Finkel	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	SE	SE	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Cramton	Cramton	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	SE	SE	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Feng	Feng	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	JA	JA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Sigman	Sigman	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	DS	DS	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Johnson	Johnson	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	RC.	RC.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	1996	1996	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2928
# text = Variable structures of Fis-DNA complexes determined by flanking DNA-protein contacts .
1	Variable	variable structures of fis-dna complexes determined by flanking dna-protein contacts	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	structures	variable structures of fis-dna complexes determined by flanking dna-protein contacts	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
3	of	variable structures of fis-dna complexes determined by flanking dna-protein contacts	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
4	Fis-DNA	Fis-DNA	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
5	complexes	variable structures of fis-dna complexes determined by flanking dna-protein contacts	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
6	determined	variable structures of fis-dna complexes determined by flanking dna-protein contacts	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
7	by	variable structures of fis-dna complexes determined by flanking dna-protein contacts	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
8	flanking	variable structures of fis-dna complexes determined by flanking dna-protein contacts	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
9	DNA-protein	DNA-protein	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	contacts	variable structures of fis-dna complexes determined by flanking dna-protein contacts	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2929
# text = J. Mol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Mol	Mol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2930
# text = Biol .
1	Biol	biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2931
# text = 264 :
1	264	264	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2932
# text = 675 - 695 .
1	675	675	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	675 - 695	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	695	695	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2933
# text = Papadopoulos D , Schneider D , Meier-Eiss J , Arber W , Lenski RE , Blot M. 1999 .
1	Papadopoulos	Papadopoulos	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	D	D	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Schneider	Schneider	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	D	D	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Meier-Eiss	Meier-Eiss	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Arber	Arber	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	W	W	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Lenski	Lenski	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	RE	RE	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
16	Blot	Blot	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	M.	monsieur	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
18	1999	1999	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2934
# text = Genomic evolution during a 10 , 000- generation experiment with bacteria .
1	Genomic	génomique	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	evolution	évolution	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	during	during	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	10	10	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	000-	000-	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	generation	generation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	experiment	experiment	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	with	dire	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	bacteria	bactérie	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2935
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2936
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2937
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2938
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2939
# text = U.S.A 96 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	96	96	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2940
# text = 3807 - 3812 .
1	3807	3807	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	3807 - 3812	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	3812	3812	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2941
# text = Parekh BS , Sheridan SD , Hatfield GW. 1996 .
1	Parekh	Parekh	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	BS	BS	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Sheridan	Sheridan	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	SD	SD	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Hatfield	Hatfield	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	GW.	GW.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1996	1996	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2942
# text = Effects of integration host factor and DNA supercoiling on transcription from the ilvPG promoter of Escherichia coli .
1	Effects	effects of integration host factor and dna supercoiling	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	of	effects of integration host factor and dna supercoiling	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
3	integration	effects of integration host factor and dna supercoiling	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
4	host	effects of integration host factor and dna supercoiling	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
5	factor	effects of integration host factor and dna supercoiling	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
6	and	effects of integration host factor and dna supercoiling	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
7	DNA	DNA	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	supercoiling	effects of integration host factor and dna supercoiling	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	on	on	CLS	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	transcription	transcription	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	from	frou	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	the	the ilvpg promoter of escherichia coli	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
13	ilvPG	the ilvpg promoter of escherichia coli	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
14	promoter	the ilvpg promoter of escherichia coli	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
15	of	the ilvpg promoter of escherichia coli	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
16	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	coli	the ilvpg promoter of escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2943
# text = J. Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2944
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2945
# text = 271 :
1	271	271	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2946
# text = 20258 - 20264 .
1	20258	20258	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	20258 - 20264	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	20264	20264	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2947
# text = Pato ML , Howe MM , Higgins NP. 1990 .
1	Pato	Pato	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	ML	ML	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Howe	Howe	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	MM	MM	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Higgins	Higgins	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	NP.	NP.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1990	1990	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2948
# text = A DNA gyrase-binding site at the center of the bacteriophage Mu genome is required for efficient replicative transposition .
1	A	à	PRE	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	DNA	DNA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	gyrase-binding	gyrase-binding	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	site	site	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	at	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	the	the center of the bacteriophage mu genome is required for efficient replicative transposition	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
7	center	the center of the bacteriophage mu genome is required for efficient replicative transposition	NUM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
8	of	the center of the bacteriophage mu genome is required for efficient replicative transposition	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
9	the	the center of the bacteriophage mu genome is required for efficient replicative transposition	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
10	bacteriophage	the center of the bacteriophage mu genome is required for efficient replicative transposition	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
11	Mu	Mu	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
12	genome	the center of the bacteriophage mu genome is required for efficient replicative transposition	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
13	is	the center of the bacteriophage mu genome is required for efficient replicative transposition	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
14	required	the center of the bacteriophage mu genome is required for efficient replicative transposition	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
15	for	the center of the bacteriophage mu genome is required for efficient replicative transposition	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
16	efficient	the center of the bacteriophage mu genome is required for efficient replicative transposition	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
17	replicative	the center of the bacteriophage mu genome is required for efficient replicative transposition	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	transposition	the center of the bacteriophage mu genome is required for efficient replicative transposition	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2949
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2950
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2951
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2952
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2953
# text = U.S.A 87 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	87	87	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2954
# text = 8716 - 8720 .
1	8716	8716	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	8716 - 8720	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	8720	8720	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2955
# text = Paul BJ , Barker MM , Ross W , Schneider DA , Webb C , Foster JW , Gourse RL. 2004 .
1	Paul	Paul	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	BJ	BJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Barker	Barker	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	MM	MM	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Ross	Ross	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	W	W	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
10	Schneider	Schneider	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	DA	DA	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
13	Webb	Webb	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	C	C	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
16	Foster	Foster	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	JW	JW	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Gourse	Gourse	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
20	RL.	RL.	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	2004	2004	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2956
# text = DksA :
1	DksA	DksA	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2957
# text = a critical component of the transcription initiation machinery that potentiates the regulation of rRNA promoters by ppGpp and the initiating NTP .
1	a	a critical component of the	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	critical	a critical component of the	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	component	a critical component of the	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	of	a critical component of the	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	the	a critical component of the	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	transcription	transcription	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	initiation	initiation	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
8	machinery	machiner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	that	that potentiates the regulation of rrna promoters	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
10	potentiates	that potentiates the regulation of rrna promoters	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
11	the	that potentiates the regulation of rrna promoters	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
12	regulation	that potentiates the regulation of rrna promoters	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
13	of	that potentiates the regulation of rrna promoters	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
14	rRNA	that potentiates the regulation of rrna promoters	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	promoters	that potentiates the regulation of rrna promoters	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
16	by	By	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
17	ppGpp	ppGpp	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	and	and the initiating ntp	NOM	_	_	21	periph	_	_	_	_	_
19	the	and the initiating ntp	NOM	_	_	21	periph	_	_	_	_	_
20	initiating	and the initiating ntp	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
21	NTP	NTP	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2958
# text = Cell 118 :
1	Cell	cell	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	118	118	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2959
# text = 311 - 322 .
1	311	311	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	311 - 322	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	322	322	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2960
# text = Pedersen K , Gerdes K. 1999 .
1	Pedersen	Pedersen	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	K	K	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Gerdes	Gerdes	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	K.	K.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1999	1999	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2961
# text = Multiple hok genes on the chromosome of
1	Multiple	multiple hok genes on the chromosome of	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	hok	multiple hok genes on the chromosome of	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	genes	multiple hok genes on the chromosome of	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	on	multiple hok genes on the chromosome of	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	the	multiple hok genes on the chromosome of	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	chromosome	multiple hok genes on the chromosome of	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	of	multiple hok genes on the chromosome of	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2962
# text = Escherichia coli .
1	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	coli	coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2963
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2964
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2965
# text = 32 :
1	32	32	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2966
# text = 1090 - 1102 .
1	1090	1090	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1090 - 1102	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1102	1102	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2967
# text = Pelosi L , Kuhn L , Guetta D , Garin J , Geiselmann J , Lenski RE , Schneider D. 2006 .
1	Pelosi	Pelosi	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
2	L	L	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Kuhn	Kuhn	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	L	L	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	Guetta	Guetta	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	D	D	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
10	Garin	Garin	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	J	J	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
13	Geiselmann	Geiselmann	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	J	J	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
16	Lenski	Lenski	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	RE	RE	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Schneider	Schneider	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
20	D.	D.	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	2006	2006	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2968
# text = Parallel changes in global protein profiles during long-term experimental evolution in Escherichia coli .
1	Parallel	Parallel	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	changes	change	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	in	in	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	global	global	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	protein	protéine	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	profiles	profiler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	during	during long-term experimental	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
8	long-term	during long-term experimental	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	experimental	during long-term experimental	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	evolution	evolution	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	in	in	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
12	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	coli	coli	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2969
# text = Genetics 173 :
1	Genetics	genetics	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	173	173	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2970
# text = 1851 - 1869 .
1	1851	1851	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1851 - 1869	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1869	1869	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2971
# text = Perederina A , Svetlov V , Vassylyeva MN , Tahirov TH , Yokoyama S , Artsimovitch I , Vassylyev
1	Perederina	Perederina	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	A	A	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
4	Svetlov	Svetlov	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	V	V	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
7	Vassylyeva	Vassylyeva	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	MN	MN	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
10	Tahirov	Tahirov	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	TH	TH	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
13	Yokoyama	Yokoyama	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
14	S	S	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Artsimovitch	Artsimovitch	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
17	I	I	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Vassylyev	Vassylyev	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2972
# text = DG. 2004 .
1	DG.	DG.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	2004	2004	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2973
# text = Regulation through the secondary channel -- framework for ppGpp-DksA synergism during transcription .
1	Regulation	regulation through the secondary channel -- framework for ppgpp-dksa synergism during transcription	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	through	regulation through the secondary channel -- framework for ppgpp-dksa synergism during transcription	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
3	the	regulation through the secondary channel -- framework for ppgpp-dksa synergism during transcription	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
4	secondary	regulation through the secondary channel -- framework for ppgpp-dksa synergism during transcription	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
5	channel	regulation through the secondary channel -- framework for ppgpp-dksa synergism during transcription	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
6	--	regulation through the secondary channel -- framework for ppgpp-dksa synergism during transcription	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	framework	regulation through the secondary channel -- framework for ppgpp-dksa synergism during transcription	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	for	regulation through the secondary channel -- framework for ppgpp-dksa synergism during transcription	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	ppGpp-DksA	regulation through the secondary channel -- framework for ppgpp-dksa synergism during transcription	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	synergism	regulation through the secondary channel -- framework for ppgpp-dksa synergism during transcription	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	during	regulation through the secondary channel -- framework for ppgpp-dksa synergism during transcription	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	transcription	regulation through the secondary channel -- framework for ppgpp-dksa synergism during transcription	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2974
# text = Cell 118 :
1	Cell	cell	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	118	118	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2975
# text = 297 - 309 .
1	297	297	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	297 - 309	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	309	309	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2976
# text = Perry K , Mondragon A. 2003 .
1	Perry	perry	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	K	K	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Mondragon	Mondragon	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	A.	A.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2003	2003	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2977
# text = Structure of a complex between E. coli DNA topoisomerase I and single-stranded DNA .
1	Structure	structure of a complex between e. coli dna topoisomerase i and single-stranded dna	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	of	structure of a complex between e. coli dna topoisomerase i and single-stranded dna	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
3	a	structure of a complex between e. coli dna topoisomerase i and single-stranded dna	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
4	complex	structure of a complex between e. coli dna topoisomerase i and single-stranded dna	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
5	between	structure of a complex between e. coli dna topoisomerase i and single-stranded dna	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
6	E.	E.	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
7	coli	structure of a complex between e. coli dna topoisomerase i and single-stranded dna	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
8	DNA	DNA	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
9	topoisomerase	structure of a complex between e. coli dna topoisomerase i and single-stranded dna	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
10	I	I	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
11	and	structure of a complex between e. coli dna topoisomerase i and single-stranded dna	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
12	single-stranded	structure of a complex between e. coli dna topoisomerase i and single-stranded dna	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	DNA	DNA	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2978
# text = Structure .
1	Structure	structure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2979
# text = 11 :
1	11	11	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2980
# text = 1349 - 1358 .
1	1349	1349	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1349 - 1358	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1358	1358	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2981
# text = Peter BJ , Arsuaga J , Breier AM , Khodursky AB , Brown PO , Cozzarelli NR. 2004 .
1	Peter	péter	VNF	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	BJ	BJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
4	Arsuaga	Arsuaga	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
7	Breier	Breier	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	AM	AM	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
10	Khodursky	Khodursky	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
11	AB	AB	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
13	Brown	Brown	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	PO	PO	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
17	NR.	NR.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	2004	2004	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2982
# text = Genomic transcriptional response to loss of chromosomal supercoiling in Escherichia coli .
1	Genomic	genomic transcriptional response to loss of chromosomal supercoiling in escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	transcriptional	genomic transcriptional response to loss of chromosomal supercoiling in escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
3	response	genomic transcriptional response to loss of chromosomal supercoiling in escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
4	to	genomic transcriptional response to loss of chromosomal supercoiling in escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
5	loss	genomic transcriptional response to loss of chromosomal supercoiling in escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
6	of	genomic transcriptional response to loss of chromosomal supercoiling in escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
7	chromosomal	genomic transcriptional response to loss of chromosomal supercoiling in escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
8	supercoiling	genomic transcriptional response to loss of chromosomal supercoiling in escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
9	in	genomic transcriptional response to loss of chromosomal supercoiling in escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
10	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	coli	genomic transcriptional response to loss of chromosomal supercoiling in escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2983
# text = Genome Biol .
1	Genome	génome	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2984
# text = 5 :
1	5	5	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2985
# text = R87 .
1	R87	R87	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2986
# text = Pettijohn DE. 1996 .
1	Pettijohn	Pettijohn	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	DE.	DE.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	1996	1996	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2987
# text = The nucleoid .
1	The	the nucleoid	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	nucleoid	the nucleoid	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2988
# text = In :
1	In	in	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2989
# text = Escherichia coli and Salmonella .
1	Escherichia	escherichia coli and salmonella	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	coli	escherichia coli and salmonella	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	and	escherichia coli and salmonella	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	Salmonella	Salmonella	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2990
# text = Washington DC :
1	Washington	Washington	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	DC	DC	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2991
# text = ASM Press .
1	ASM	asm	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Press	Press	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2992
# text = 158 - 166 .
1	158	158	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	158 - 166	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	166	166	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2993
# text = Philippe , N. 2006 .
1	Philippe	philippe	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	N.	N.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	2006	2006	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2994
# text = Mécanismes moléculaires de l'adaptation au cours de 20 000 générations d'évolution expérimentale chez Escherichia coli , Doctorat de l'Université Joseph Fourier , GrenobleI .
1	Mécanismes	mécanisme	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	moléculaires	moléculaire	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	adaptation	adaptation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	au	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	cours	cours	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	20	20	NUM	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	000	000	NUM	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	générations	génération	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	d'	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	évolution	évolution	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	expérimentale	expérimental	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	chez	chez	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	coli	coli	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Doctorat	Doctorat	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	l'	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	Université	Université	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	Joseph	Joseph	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	Fourier	Fourier	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	GrenobleI	GrenobleI	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2995
# text = Ponce E , Flores N , Martinez A , Valle F , Bolivar F. 1995 .
1	Ponce	poncer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	E	E	ADV	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
4	Flores	Flores	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	N	N	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
7	Martinez	Martinez	NOM	_	_	1	subj	_	_	_	_	_
8	A	A	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
10	Valle	Valle	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	F	F	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
13	Bolivar	Bolivar	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	F.	F.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
15	1995	1995	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2996
# text = Cloning of the two pyruvate kinase isoenzyme structural genes from Escherichia coli :
1	Cloning	cloning of the two pyruvate kinase isoenzyme structural genes from escherichia coli	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	of	cloning of the two pyruvate kinase isoenzyme structural genes from escherichia coli	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
3	the	cloning of the two pyruvate kinase isoenzyme structural genes from escherichia coli	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
4	two	cloning of the two pyruvate kinase isoenzyme structural genes from escherichia coli	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
5	pyruvate	cloning of the two pyruvate kinase isoenzyme structural genes from escherichia coli	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
6	kinase	cloning of the two pyruvate kinase isoenzyme structural genes from escherichia coli	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	isoenzyme	cloning of the two pyruvate kinase isoenzyme structural genes from escherichia coli	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	structural	cloning of the two pyruvate kinase isoenzyme structural genes from escherichia coli	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	genes	cloning of the two pyruvate kinase isoenzyme structural genes from escherichia coli	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	from	cloning of the two pyruvate kinase isoenzyme structural genes from escherichia coli	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	coli	cloning of the two pyruvate kinase isoenzyme structural genes from escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	:	:	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2997
# text = the relative roles of these enzymes in pyruvate biosynthesis .
1	the	the relative roles of these enzymes in pyruvate biosynthesis	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	relative	the relative roles of these enzymes in pyruvate biosynthesis	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	roles	the relative roles of these enzymes in pyruvate biosynthesis	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
4	of	the relative roles of these enzymes in pyruvate biosynthesis	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	these	the relative roles of these enzymes in pyruvate biosynthesis	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
6	enzymes	the relative roles of these enzymes in pyruvate biosynthesis	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
7	in	the relative roles of these enzymes in pyruvate biosynthesis	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
8	pyruvate	the relative roles of these enzymes in pyruvate biosynthesis	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	biosynthesis	the relative roles of these enzymes in pyruvate biosynthesis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2998
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-2999
# text = 177 :
1	177	177	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3000
# text = 5719 - 5722 .
1	5719	5719	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	5719 - 5722	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	5722	5722	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3001
# text = Postow L , Crisona NJ , Peter BJ , Hardy CD , Cozzarelli NR. 2001 .
1	Postow	postow	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	L	L	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Crisona	Crisona	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	NJ	NJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	Peter	Peter	VNF	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	BJ	BJ	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
10	Hardy	Hardy	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	CD	CD	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
13	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	NR.	NR.	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	2001	2001	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3002
# text = Topological challenges to DNA replication :
1	Topological	topological challenges to dna replication	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	challenges	topological challenges to dna replication	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	to	topological challenges to dna replication	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	DNA	DNA	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	replication	topological challenges to dna replication	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	:	:	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3003
# text = conformations at the fork .
1	conformations	conformations at the fork	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	at	conformations at the fork	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	the	conformations at the fork	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	fork	conformations at the fork	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3004
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3005
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3006
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3007
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3008
# text = U.S.A 98 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	98	98	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3009
# text = 8219 - 8226 .
1	8219	8219	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	8219 - 8226	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	8226	8226	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3010
# text = Postow L , Hardy CD , Arsuaga J , Cozzarelli NR. 2004 .
1	Postow	postow	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	L	L	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Hardy	Hardy	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	CD	CD	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Arsuaga	Arsuaga	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	NR.	NR.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	2004	2004	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3011
# text = Topological domain structure of the Escherichia coli chromosome .
1	Topological	topological domain structure of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	domain	topological domain structure of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
3	structure	topological domain structure of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
4	of	topological domain structure of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
5	the	topological domain structure of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
6	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
7	coli	topological domain structure of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	chromosome	topological domain structure of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3012
# text = Genes Dev .
1	Genes	gêne	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Dev	Dev	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3013
# text = 18 :
1	18	18	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3014
# text = 1766 - 1779 .
1	1766	1766	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1766 - 1779	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1779	1779	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3015
# text = Pratt LA , Silhavy TJ. 1994 .
1	Pratt	pratt	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	LA	LA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Silhavy	Silhavy	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	TJ.	TJ.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1994	1994	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3016
# text = OmpR mutants specifically defective for transcriptional activation .
1	OmpR	ompr mutants specifically defective for transcriptional activation	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	mutants	ompr mutants specifically defective for transcriptional activation	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	specifically	ompr mutants specifically defective for transcriptional activation	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	defective	ompr mutants specifically defective for transcriptional activation	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	for	ompr mutants specifically defective for transcriptional activation	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	transcriptional	ompr mutants specifically defective for transcriptional activation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	activation	ompr mutants specifically defective for transcriptional activation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3017
# text = J. Mol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Mol	Mol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3018
# text = Biol .
1	Biol	biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3019
# text = 243 :
1	243	243	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3020
# text = 579 - 594 .
1	579	579	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	579 - 594	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	594	594	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3021
# text = Pratt LA , Silhavy TJ. 1995 .
1	Pratt	pratt	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	LA	LA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Silhavy	Silhavy	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	TJ.	TJ.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1995	1995	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3022
# text = Identification of base pairs important for OmpR-DNA interaction .
1	Identification	identification of	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	of	identification of	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	base	base	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	pairs	pair	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	important	important	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	for	for ompr-dna	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	OmpR-DNA	OmpR-DNA	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	interaction	interaction	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3023
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3024
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3025
# text = 17 :
1	17	17	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3026
# text = 565 - 573 .
1	565	565	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	565 - 573	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	573	573	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3027
# text = Pratt TS , Steiner T , Feldman LS , Walker KA , Osuna R. 1997 .
1	Pratt	pratt	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	TS	TS	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Steiner	Steiner	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	T	T	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Feldman	Feldman	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	LS	LS	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Walker	Walker	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	KA	KA	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Osuna	Osuna	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
14	R.	R.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	1997	1997	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3028
# text = Deletion analysis of the fis promoter region in Escherichia coli :
1	Deletion	deletion analysis of the fis promoter	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
2	analysis	deletion analysis of the fis promoter	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
3	of	deletion analysis of the fis promoter	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
4	the	deletion analysis of the fis promoter	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
5	fis	deletion analysis of the fis promoter	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	promoter	deletion analysis of the fis promoter	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	region	region	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	in	in	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
9	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	coli	coli	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	:	:	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3029
# text = antagonistic effects of integration host factor and Fis .
1	antagonistic	antagonistic effects of integration host factor and fis	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	effects	antagonistic effects of integration host factor and fis	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
3	of	antagonistic effects of integration host factor and fis	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
4	integration	antagonistic effects of integration host factor and fis	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
5	host	antagonistic effects of integration host factor and fis	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
6	factor	antagonistic effects of integration host factor and fis	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
7	and	antagonistic effects of integration host factor and fis	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	Fis	Fis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3030
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3031
# text = 179 :
1	179	179	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3032
# text = 6367 - 6377 .
1	6367	6367	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	6367 - 6377	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	6377	6377	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3033
# text = Pruss GJ , Manes SH , Drlica K. 1982 .
1	Pruss	Pruss	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	GJ	GJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Manes	Manes	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	SH	SH	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Drlica	Drlica	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	K.	K.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1982	1982	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3034
# text = Escherichia coli DNA topoisomerase I mutants :
1	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	coli	coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	DNA	DNA	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	topoisomerase	topoisomerase	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	I	I	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	mutants	mutant	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	:	:	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3035
# text = increased supercoiling is corrected by mutations near gyrase genes .
1	increased	increased supercoiling is corrected by mutations near gyrase genes	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	supercoiling	increased supercoiling is corrected by mutations near gyrase genes	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	is	increased supercoiling is corrected by mutations near gyrase genes	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
4	corrected	increased supercoiling is corrected by mutations near gyrase genes	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	by	increased supercoiling is corrected by mutations near gyrase genes	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
6	mutations	increased supercoiling is corrected by mutations near gyrase genes	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
7	near	increased supercoiling is corrected by mutations near gyrase genes	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
8	gyrase	increased supercoiling is corrected by mutations near gyrase genes	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	genes	increased supercoiling is corrected by mutations near gyrase genes	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3036
# text = Cell 31 : 35 - 42 .
1	Cell	cell	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	31	31	NUM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	:	31 : 35	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	35	35	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	-	- 42	PUNC	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	42	42	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3037
# text = Pruss GJ , Drlica K. 1989 .
1	Pruss	Pruss	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	GJ	GJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Drlica	Drlica	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	K.	K.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1989	1989	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3038
# text = DNA supercoiling and prokaryotic transcription .
1	DNA	dna supercoiling and prokaryotic transcription	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	supercoiling	dna supercoiling and prokaryotic transcription	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	and	dna supercoiling and prokaryotic transcription	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	prokaryotic	dna supercoiling and prokaryotic transcription	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	transcription	dna supercoiling and prokaryotic transcription	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3039
# text = Cell 56 :
1	Cell	cell	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	56	56	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3040
# text = 521 - 523 .
1	521	521	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	521 - 523	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	523	523	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3041
# text = Qi H , Menzel R , Tse-Dinh YC. 1997 .
1	Qi	Qi	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	H	H	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Menzel	Menzel	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	R	R	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
7	Tse-Dinh	Tse-Dinh	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	YC.	YC.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	1997	1997	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3042
# text = Regulation of Escherichia coli topA gene transcription :
1	Regulation	regulation of escherichia	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	of	regulation of escherichia	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
4	coli	colis	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	topA	topA	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	gene	gêner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	transcription	transcription	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	:	:	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3043
# text = involvement of a sigmaS-dependent promoter .
1	involvement	involvement of	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	of	involvement of	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	sigmaS-dependent	sigmaS-dependent	ADV	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	promoter	pro-	_+V	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3044
# text = J. Mol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Mol	Mol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3045
# text = Biol .
1	Biol	biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3046
# text = 267 :
1	267	267	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3047
# text = 481 - 489 .
1	481	481	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	481 - 489	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	489	489	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3048
# text = Raji A , Zabel DJ , Laufer CS , Depew RE. 1985 .
1	Raji	Raji	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	A	A	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
4	Zabel	Zabel	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	DJ	DJ	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
7	Laufer	Laufer	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	CS	CS	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
10	Depew	Depew	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
11	RE.	RE.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	1985	1985	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3049
# text = Genetic analysis of mutations that compensate for loss of Escherichia coli DNA topoisomerase I. J. Bacteriol .
1	Genetic	genetic analysis of mutations that compensate for loss of escherichia coli dna topoisomerase i. j. bacteriol	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
2	analysis	genetic analysis of mutations that compensate for loss of escherichia coli dna topoisomerase i. j. bacteriol	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
3	of	genetic analysis of mutations that compensate for loss of escherichia coli dna topoisomerase i. j. bacteriol	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
4	mutations	genetic analysis of mutations that compensate for loss of escherichia coli dna topoisomerase i. j. bacteriol	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
5	that	genetic analysis of mutations that compensate for loss of escherichia coli dna topoisomerase i. j. bacteriol	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
6	compensate	genetic analysis of mutations that compensate for loss of escherichia coli dna topoisomerase i. j. bacteriol	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
7	for	genetic analysis of mutations that compensate for loss of escherichia coli dna topoisomerase i. j. bacteriol	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
8	loss	genetic analysis of mutations that compensate for loss of escherichia coli dna topoisomerase i. j. bacteriol	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
9	of	genetic analysis of mutations that compensate for loss of escherichia coli dna topoisomerase i. j. bacteriol	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
10	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
11	coli	genetic analysis of mutations that compensate for loss of escherichia coli dna topoisomerase i. j. bacteriol	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
12	DNA	DNA	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
13	topoisomerase	genetic analysis of mutations that compensate for loss of escherichia coli dna topoisomerase i. j. bacteriol	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
14	I.	I.	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
15	J.	J.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3050
# text = 162 :
1	162	162	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3051
# text = 1173 - 1179 .
1	1173	1173	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1173 - 1179	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1179	1179	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3052
# text = Ramani N , Huang L , Freundlich M. 1992 .
1	Ramani	Ramani	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	N	N	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
4	Huang	Huang	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	L	L	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
7	Freundlich	Freundlich	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	M.	monsieur	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
9	1992	1992	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3053
# text = In vitro interactions of integration host factor with the ompF promoter-regulatory region of Escherichia coli .
1	In	in vitro	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	vitro	in vitro	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	interactions	interaction	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	of	of integration host factor with the ompf promoter-regulatory region of escherichia coli	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
5	integration	of integration host factor with the ompf promoter-regulatory region of escherichia coli	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
6	host	of integration host factor with the ompf promoter-regulatory region of escherichia coli	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
7	factor	of integration host factor with the ompf promoter-regulatory region of escherichia coli	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
8	with	of integration host factor with the ompf promoter-regulatory region of escherichia coli	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
9	the	of integration host factor with the ompf promoter-regulatory region of escherichia coli	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
10	ompF	of integration host factor with the ompf promoter-regulatory region of escherichia coli	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
11	promoter-regulatory	of integration host factor with the ompf promoter-regulatory region of escherichia coli	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
12	region	of integration host factor with the ompf promoter-regulatory region of escherichia coli	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
13	of	of integration host factor with the ompf promoter-regulatory region of escherichia coli	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
14	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	coli	of integration host factor with the ompf promoter-regulatory region of escherichia coli	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3054
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3055
# text = Gen .
1	Gen	Gen	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3056
# text = Genet .
1	Genet	genet	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3057
# text = 231 :
1	231	231	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3058
# text = 248 - 255 .
1	248	248	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	248 - 255	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	255	255	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3059
# text = Ramani N , Hedeshian M , Freundlich M. 1994 .
1	Ramani	Ramani	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	N	N	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
4	Hedeshian	Hedeshian	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	M	M	_	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
7	Freundlich	Freundlich	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	M.	monsieur	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	1994	1994	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3060
# text = micF antisense RNA has a major role in osmoregulation of OmpF in Escherichia coli .
1	micF	micF	ADV	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	antisense	anti-	ADJ	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	RNA	RNA	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	has	has	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	major	major	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	role	rôle	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	in	in	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
9	osmoregulation	osmoregulation of ompf in escherichia coli	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
10	of	osmoregulation of ompf in escherichia coli	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
11	OmpF	OmpF	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
12	in	osmoregulation of ompf in escherichia coli	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
13	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	coli	osmoregulation of ompf in escherichia coli	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3061
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3062
# text = 176 :
1	176	176	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3063
# text = 5005 - 5010 .
1	5005	5005	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	5005 - 5010	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	5010	5010	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3064
# text = Ramstein J , Hervouet N , Coste F , Zelwer C , Oberto J , Castaing B. 2003 .
1	Ramstein	ramstein	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Hervouet	Hervouet	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	N	N	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Coste	Coste	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	F	F	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Zelwer	Zelwer	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	C	C	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Oberto	Oberto	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	J	J	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Castaing	Castaing	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	B.	B.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	2003	2003	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3065
# text = Evidence of a thermal unfolding dimeric intermediate for the Escherichia coli histone-like HU proteins :
1	Evidence	evidence of a thermal unfolding dimeric intermediate for the escherichia	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	of	evidence of a thermal unfolding dimeric intermediate for the escherichia	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
3	a	evidence of a thermal unfolding dimeric intermediate for the escherichia	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
4	thermal	evidence of a thermal unfolding dimeric intermediate for the escherichia	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
5	unfolding	evidence of a thermal unfolding dimeric intermediate for the escherichia	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
6	dimeric	evidence of a thermal unfolding dimeric intermediate for the escherichia	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
7	intermediate	evidence of a thermal unfolding dimeric intermediate for the escherichia	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
8	for	evidence of a thermal unfolding dimeric intermediate for the escherichia	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
9	the	evidence of a thermal unfolding dimeric intermediate for the escherichia	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	coli	colis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	histone-like	histone-like	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	HU	HU	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	proteins	pro-	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	:	:	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3066
# text = thermodynamics and structure .
1	thermodynamics	thermodynamics and	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	and	thermodynamics and	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	structure	structurer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3067
# text = J. Mol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Mol	Mol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3068
# text = Biol .
1	Biol	biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3069
# text = 331 :
1	331	331	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3070
# text = 101 - 121 .
1	101	101	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	101 - 121	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	121	121	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3071
# text = Reid SD , Herbelin CJ , Bumbaugh AC , Selander RK , Whittam TS. 2000 .
1	Reid	Reid	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	SD	SD	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Herbelin	Herbelin	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	CJ	CJ	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Bumbaugh	Bumbaugh	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	AC	AC	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Selander	Selander	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	RK	RK	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Whittam	Whittam	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
14	TS.	TS.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	2000	2000	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3072
# text = Parallel evolution of virulence in pathogenic Escherichia coli .
1	Parallel	Parallel	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	evolution	evolution	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	of	of	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	virulence	virulence	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	in	in	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	pathogenic	pathogénie	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	coli	coli	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3073
# text = Nature 406 :
1	Nature	nature	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	406	406	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3074
# text = 64 - 67 .
1	64	64	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	-	64 - 67 .	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	67	67	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	.	64 - 67 .	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3075
# text = Reizer J , Reizer A , Bairoch A , Saier MHJr .
1	Reizer	Reizer	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	J	J	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	Reizer	Reizer	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	A	A	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Bairoch	Bairoch	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	A	A	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
10	Saier	Saier	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	MHJr	MHJr	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3076
# text = 1993 .
1	1993	1993	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3077
# text = A diverse transketolase family that includes the RecP protein of Streptococcus pneumoniae , a protein implicated in genetic recombination .
1	A	a diverse transketolase family that includes the recp protein of streptococcus pneumoniae	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	diverse	a diverse transketolase family that includes the recp protein of streptococcus pneumoniae	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
3	transketolase	a diverse transketolase family that includes the recp protein of streptococcus pneumoniae	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
4	family	a diverse transketolase family that includes the recp protein of streptococcus pneumoniae	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
5	that	a diverse transketolase family that includes the recp protein of streptococcus pneumoniae	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
6	includes	a diverse transketolase family that includes the recp protein of streptococcus pneumoniae	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	the	a diverse transketolase family that includes the recp protein of streptococcus pneumoniae	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	RecP	RecP	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	protein	a diverse transketolase family that includes the recp protein of streptococcus pneumoniae	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	of	a diverse transketolase family that includes the recp protein of streptococcus pneumoniae	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	Streptococcus	Streptococcus	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	pneumoniae	a diverse transketolase family that includes the recp protein of streptococcus pneumoniae	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
14	a	a protein implicated in genetic recombination	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
15	protein	a protein implicated in genetic recombination	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
16	implicated	a protein implicated in genetic recombination	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
17	in	a protein implicated in genetic recombination	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
18	genetic	a protein implicated in genetic recombination	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	recombination	a protein implicated in genetic recombination	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3078
# text = Res .
1	Res	ré	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3079
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3080
# text = 144 :
1	144	144	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3081
# text = 341 - 347 .
1	341	341	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	341 - 347	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	347	347	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3082
# text = Reyes-Dominguez Y , Contreras-Ferrat G , Ramirez-Santos J , Membrillo-Hernandez J , Gomez-Eichelmann MC. 2003 .
1	Reyes-Dominguez	reyes-dominguez	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	Y	Y	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Contreras-Ferrat	Contreras-Ferrat	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	G	G	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
7	Ramirez-Santos	Ramirez-Santos	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	J	J	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
10	Membrillo-Hernandez	Membrillo-Hernandez	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	J	J	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
13	Gomez-Eichelmann	Gomez-Eichelmann	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	MC.	MC.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
15	2003	2003	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3083
# text = Plasmid DNA supercoiling and gyrase activity in Escherichia coli wild-type and rpoS stationary-phase cells .
1	Plasmid	plasmid dna supercoiling and gyrase activity in escherichia coli wild-type and rpos stationary-phase cells	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
2	DNA	DNA	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
3	supercoiling	plasmid dna supercoiling and gyrase activity in escherichia coli wild-type and rpos stationary-phase cells	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
4	and	plasmid dna supercoiling and gyrase activity in escherichia coli wild-type and rpos stationary-phase cells	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
5	gyrase	plasmid dna supercoiling and gyrase activity in escherichia coli wild-type and rpos stationary-phase cells	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
6	activity	plasmid dna supercoiling and gyrase activity in escherichia coli wild-type and rpos stationary-phase cells	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
7	in	plasmid dna supercoiling and gyrase activity in escherichia coli wild-type and rpos stationary-phase cells	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
8	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
9	coli	plasmid dna supercoiling and gyrase activity in escherichia coli wild-type and rpos stationary-phase cells	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
10	wild-type	plasmid dna supercoiling and gyrase activity in escherichia coli wild-type and rpos stationary-phase cells	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
11	and	plasmid dna supercoiling and gyrase activity in escherichia coli wild-type and rpos stationary-phase cells	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
12	rpoS	plasmid dna supercoiling and gyrase activity in escherichia coli wild-type and rpos stationary-phase cells	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
13	stationary-phase	plasmid dna supercoiling and gyrase activity in escherichia coli wild-type and rpos stationary-phase cells	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	cells	plasmid dna supercoiling and gyrase activity in escherichia coli wild-type and rpos stationary-phase cells	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3084
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3085
# text = 185 :
1	185	185	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3086
# text = 1097 - 1100 .
1	1097	1097	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1097 - 1100	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1100	1100	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3087
# text = Richardson SM , Higgins CF , Lilley DM. 1984 .
1	Richardson	Richardson	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	SM	SM	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Higgins	Higgins	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	CF	CF	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Lilley	Lilley	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	DM.	DM.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1984	1984	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3088
# text = The genetic control of
1	The	the genetic control of	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	genetic	the genetic control of	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	control	the genetic control of	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	of	the genetic control of	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3089
# text = DNA supercoiling in Salmonella typhimurium .
1	DNA	dna	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	supercoiling	supercoiling	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	in	in	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	Salmonella	Salmonella	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	typhimurium	typhimurium	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3090
# text = EMBO
1	EMBO	embo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3091
# text = J. 3 :
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	3	3	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3092
# text = 1745 - 1752 .
1	1745	1745	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1745 - 1752	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1752	1752	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3093
# text = Robbe-Saule V , Algorta G , Rouilhac I , Norel F. 2003 .
1	Robbe-Saule	Robbe-Saule	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	V	V	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Algorta	Algorta	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	G	G	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Rouilhac	Rouilhac	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	I	I	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Norel	Norel	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	F.	F.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	2003	2003	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3094
# text = Characterization of the RpoS status of clinical isolates of Salmonella enterica .
1	Characterization	characterization of the rpos status of clinical isolates of salmonella enterica	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	of	characterization of the rpos status of clinical isolates of salmonella enterica	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
3	the	characterization of the rpos status of clinical isolates of salmonella enterica	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
4	RpoS	RpoS	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
5	status	characterization of the rpos status of clinical isolates of salmonella enterica	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
6	of	characterization of the rpos status of clinical isolates of salmonella enterica	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
7	clinical	characterization of the rpos status of clinical isolates of salmonella enterica	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
8	isolates	characterization of the rpos status of clinical isolates of salmonella enterica	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
9	of	characterization of the rpos status of clinical isolates of salmonella enterica	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
10	Salmonella	Salmonella	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	enterica	characterization of the rpos status of clinical isolates of salmonella enterica	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3095
# text = Appl .
1	Appl	Appl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3096
# text = Environ .
1	Environ	environ	ADV	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3097
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3098
# text = 69 :
1	69	69	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3099
# text = 4352 - 4358 .
1	4352	4352	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	4352 - 4358	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	4358	4358	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3100
# text = Robey M , Benito A , Hutson RH , Pascual C , Park SF , Mackey BM. 2001 .
1	Robey	Robey	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	M	M	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	Benito	Benito	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	A	A	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
7	Hutson	Hutson	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	RH	RH	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
10	Pascual	Pascual	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	C	C	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
13	Park	Park	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	SF	SF	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Mackey	Mackey	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
17	BM.	BM.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	2001	2001	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3101
# text = Variation in to high hydrostatic pressure and rpoS heterogeneity in natural isolates of Escherichia coli O157 :
1	Variation	variation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	in	in	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
3	to	to high hydrostatic pressure and rpos heterogeneity	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
4	high	to high hydrostatic pressure and rpos heterogeneity	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
5	hydrostatic	to high hydrostatic pressure and rpos heterogeneity	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
6	pressure	to high hydrostatic pressure and rpos heterogeneity	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
7	and	to high hydrostatic pressure and rpos heterogeneity	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
8	rpoS	to high hydrostatic pressure and rpos heterogeneity	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	heterogeneity	to high hydrostatic pressure and rpos heterogeneity	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
10	in	in	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	natural	natural	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	isolates	isolates of escherichia coli o157	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
13	of	isolates of escherichia coli o157	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
14	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
15	coli	isolates of escherichia coli o157	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	O157	O157	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	:	:	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3102
# text = H 7 .
1	H	heure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	7	7	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3103
# text = Appl .
1	Appl	Appl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3104
# text = Environ .
1	Environ	environ	ADV	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3105
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3106
# text = 67 :
1	67	67	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3107
# text = 4901 - 4907 .
1	4901	4901	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	4901 - 4907	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	4907	4907	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3108
# text = Ross W , Thompson JF , Newlands JT , Gourse RL. 1990 .
1	Ross	ross	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	W	W	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Thompson	Thompson	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	JF	JF	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Newlands	Newlands	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	JT	JT	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Gourse	Gourse	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	RL.	RL.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	1990	1990	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3109
# text = Escherichia coli Fis protein activates ribosomal RNA transcription in vitro and in vivo .
1	Escherichia	escherichia coli fis protein activates ribosomal rna	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
2	coli	escherichia coli fis protein activates ribosomal rna	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
3	Fis	Fis	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
4	protein	escherichia coli fis protein activates ribosomal rna	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
5	activates	escherichia coli fis protein activates ribosomal rna	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
6	ribosomal	escherichia coli fis protein activates ribosomal rna	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	RNA	RNA	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
8	transcription	transcription	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	in	in	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	vitro	vitrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	and	and	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	in	in vivo	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	vivo	in vivo	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3110
# text = EMBO J .
1	EMBO	embo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3111
# text = 9 :
1	9	9	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3112
# text = 3733 - 3742 .
1	3733	3733	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	3733 - 3742	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	3742	3742	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3113
# text = Rouviere-Yaniv J , Gros F. 1975 .
1	Rouviere-Yaniv	Rouviere-Yaniv	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Gros	Gros	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	F.	F.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1975	1975	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3114
# text = Characterization of a novel , low-molecular-weight DNA-binding protein from Escherichia coli .
1	Characterization	characterization of a novel	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	of	characterization of a novel	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
3	a	characterization of a novel	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	novel	characterization of a novel	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
6	low-molecular-weight	lod	N+A+V	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
7	DNA-binding	DNA-binding	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	protein	protéiner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	from	from	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	coli	coli	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3115
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3116
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3117
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3118
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3119
# text = U.S.A 72 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	72	72	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3120
# text = 3428 - 3432 .
1	3428	3428	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	3428 - 3432	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	3432	3432	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3121
# text = Rowland SJ , Boocock MR , Stark WM. 2006 .
1	Rowland	Rowland	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	SJ	SJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Boocock	Boocock	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	MR	MR	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Stark	Stark	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	WM.	WM.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2006	2006	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3122
# text = DNA bending in the Sin recombination synapse :
1	DNA	dna bending in the sin recombination synapse	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	bending	dna bending in the sin recombination synapse	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	in	dna bending in the sin recombination synapse	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	the	dna bending in the sin recombination synapse	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	Sin	Sin	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	recombination	dna bending in the sin recombination synapse	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	synapse	dna bending in the sin recombination synapse	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	:	:	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3123
# text = functional replacement of HU by IHF .
1	functional	functional replacement of hu by ihf	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	replacement	functional replacement of hu by ihf	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	of	functional replacement of hu by ihf	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	HU	HU	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	by	functional replacement of hu by ihf	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	IHF	IHF	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3124
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3125
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3126
# text = 59 :
1	59	59	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3127
# text = 1730 - 1743 .
1	1730	1730	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1730 - 1743	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1743	1743	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3128
# text = Rundle HD , Nagel L , Boughman JW , Schluter D. 2000 .
1	Rundle	Rundle	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	HD	HD	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Nagel	Nagel	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	L	L	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Boughman	Boughman	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	JW	JW	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Schluter	Schluter	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	D.	D.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	2000	2000	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3129
# text = Science 287 :
1	Science	science	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	287	287	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3130
# text = 306 - 308 .
1	306	306	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	306 - 308	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	308	308	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3131
# text = Ruthenburg AJ , Graybosch DM , Huetsch JC , Verdine GL. 2005 .
1	Ruthenburg	Ruthenburg	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	AJ	AJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Graybosch	Graybosch	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	DM	DM	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Huetsch	Huetsch	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	JC	JC	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Verdine	Verdine	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	GL.	GL.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	2005	2005	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3132
# text = A superhelical spiral in the Escherichia coli DNA gyrase A C-terminal domain imparts unidirectional supercoiling bias .
1	A	a superhelical spiral in the escherichia coli dna gyrase a c-terminal domain imparts unidirectional supercoiling bias	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
2	superhelical	a superhelical spiral in the escherichia coli dna gyrase a c-terminal domain imparts unidirectional supercoiling bias	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
3	spiral	a superhelical spiral in the escherichia coli dna gyrase a c-terminal domain imparts unidirectional supercoiling bias	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
4	in	a superhelical spiral in the escherichia coli dna gyrase a c-terminal domain imparts unidirectional supercoiling bias	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
5	the	a superhelical spiral in the escherichia coli dna gyrase a c-terminal domain imparts unidirectional supercoiling bias	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
6	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
7	coli	a superhelical spiral in the escherichia coli dna gyrase a c-terminal domain imparts unidirectional supercoiling bias	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
8	DNA	DNA	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
9	gyrase	a superhelical spiral in the escherichia coli dna gyrase a c-terminal domain imparts unidirectional supercoiling bias	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
10	A	A	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
11	C-terminal	C-terminal	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
12	domain	a superhelical spiral in the escherichia coli dna gyrase a c-terminal domain imparts unidirectional supercoiling bias	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
13	imparts	a superhelical spiral in the escherichia coli dna gyrase a c-terminal domain imparts unidirectional supercoiling bias	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
14	unidirectional	a superhelical spiral in the escherichia coli dna gyrase a c-terminal domain imparts unidirectional supercoiling bias	NOM	_	_	16	periph	_	_	_	_	_
15	supercoiling	a superhelical spiral in the escherichia coli dna gyrase a c-terminal domain imparts unidirectional supercoiling bias	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	bias	a superhelical spiral in the escherichia coli dna gyrase a c-terminal domain imparts unidirectional supercoiling bias	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3133
# text = J. Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3134
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3135
# text = 280 :
1	280	280	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3136
# text = 26177 - 26184 .
1	26177	26177	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	26177 - 26184	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	26184	26184	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3137
# text = Ryan VT , Grimwade JE , Camara JE , Crooke E , Leonard AC. 2004 .
1	Ryan	ryan	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	VT	VT	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Grimwade	Grimwade	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	JE	JE	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Camara	Camara	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	JE	JE	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Crooke	Crooke	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	E	E	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Leonard	Leonard	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	AC.	AC.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	2004	2004	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3138
# text = Escherichia coli prereplication complex assembly is regulated by dynamic interplay among Fis , IHF and DnaA. Mol .
1	Escherichia	escherichia coli prereplication complex assembly is regulated by dynamic	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
2	coli	escherichia coli prereplication complex assembly is regulated by dynamic	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
3	prereplication	escherichia coli prereplication complex assembly is regulated by dynamic	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
4	complex	escherichia coli prereplication complex assembly is regulated by dynamic	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
5	assembly	escherichia coli prereplication complex assembly is regulated by dynamic	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
6	is	escherichia coli prereplication complex assembly is regulated by dynamic	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
7	regulated	escherichia coli prereplication complex assembly is regulated by dynamic	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
8	by	escherichia coli prereplication complex assembly is regulated by dynamic	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	dynamic	escherichia coli prereplication complex assembly is regulated by dynamic	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
10	interplay	interplay	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	among	amont	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	Fis	Fis	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
14	IHF	IHF	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
15	and	ihf and dnaa. mol	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
16	DnaA.	DnaA.	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	Mol	Mol	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3139
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3140
# text = 51 :
1	51	51	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3141
# text = 1347 - 1359 .
1	1347	1347	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1347 - 1359	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1359	1359	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3142
# text = Ryan VT , Grimwade JE , Nievera CJ , Leonard AC. 2002 .
1	Ryan	ryan	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	VT	VT	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Grimwade	Grimwade	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	JE	JE	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Nievera	Nievera	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	CJ	CJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Leonard	Leonard	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	AC.	AC.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	2002	2002	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3143
# text = IHF and HU stimulate assembly of pre-replication complexes at Escherichia coli oriC by two different mechanisms .
1	IHF	ihf and hu stimulate assembly of pre-replication	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
2	and	ihf and hu stimulate assembly of pre-replication	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
3	HU	HU	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
4	stimulate	ihf and hu stimulate assembly of pre-replication	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
5	assembly	ihf and hu stimulate assembly of pre-replication	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
6	of	ihf and hu stimulate assembly of pre-replication	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	pre-replication	ihf and hu stimulate assembly of pre-replication	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
8	complexes	complexe	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	at	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	coli	coli	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	oriC	oriC	VPR	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	by	by	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	two	two	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	different	différent	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
16	mechanisms	mécanisme	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	.	mécanisme	PONCT+PONCT	_	_	14	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3144
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3145
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3146
# text = 46 :
1	46	46	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3147
# text = 113 - 124 .
1	113	113	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	113 - 124	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	124	124	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3148
# text = Safo MK , Yang WZ , Corselli L , Cramton SE , Yuan HS , Johnson RC. 1997 .
1	Safo	Safo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	MK	MK	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Yang	Yang	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	WZ	WZ	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Corselli	Corselli	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	L	L	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Cramton	Cramton	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	SE	SE	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Yuan	Yuan	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	HS	HS	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Johnson	Johnson	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	RC.	RC.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	1997	1997	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3149
# text = The transactivation region of the Fis protein that controls site-specific DNA inversion contains extended mobile beta-hairpin arms .
1	The	thé	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	transactivation	transactivation	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	region	région	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	of	of the fis protein that controls site-specific dna inversion contains extended mobile beta-hairpin arms	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
5	the	of the fis protein that controls site-specific dna inversion contains extended mobile beta-hairpin arms	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
6	Fis	Fis	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
7	protein	of the fis protein that controls site-specific dna inversion contains extended mobile beta-hairpin arms	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
8	that	of the fis protein that controls site-specific dna inversion contains extended mobile beta-hairpin arms	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
9	controls	of the fis protein that controls site-specific dna inversion contains extended mobile beta-hairpin arms	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
10	site-specific	of the fis protein that controls site-specific dna inversion contains extended mobile beta-hairpin arms	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
11	DNA	DNA	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
12	inversion	of the fis protein that controls site-specific dna inversion contains extended mobile beta-hairpin arms	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
13	contains	of the fis protein that controls site-specific dna inversion contains extended mobile beta-hairpin arms	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
14	extended	of the fis protein that controls site-specific dna inversion contains extended mobile beta-hairpin arms	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
15	mobile	of the fis protein that controls site-specific dna inversion contains extended mobile beta-hairpin arms	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
16	beta-hairpin	of the fis protein that controls site-specific dna inversion contains extended mobile beta-hairpin arms	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	arms	of the fis protein that controls site-specific dna inversion contains extended mobile beta-hairpin arms	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3150
# text = EMBO J .
1	EMBO	embo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3151
# text = 16 :
1	16	16	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3152
# text = 6860 - 6873 .
1	6860	6860	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	6860 - 6873	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	6873	6873	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3153
# text = Sawitzke JA , Austin S. 2000 .
1	Sawitzke	Sawitzke	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	JA	JA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Austin	Austin	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	S.	S.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2000	2000	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3154
# text = Suppression of chromosome segregation defects of Escherichia coli muk mutants by mutations in topoisomerase
1	Suppression	suppression of chromosome segregation defects of escherichia coli muk	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	of	suppression of chromosome segregation defects of escherichia coli muk	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	chromosome	suppression of chromosome segregation defects of escherichia coli muk	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
4	segregation	suppression of chromosome segregation defects of escherichia coli muk	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	defects	suppression of chromosome segregation defects of escherichia coli muk	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
6	of	suppression of chromosome segregation defects of escherichia coli muk	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
7	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
8	coli	suppression of chromosome segregation defects of escherichia coli muk	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	muk	suppression of chromosome segregation defects of escherichia coli muk	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	mutants	mutant	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	by	By	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	mutations	mutation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	in	in	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	topoisomerase	topoisomerase	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3155
# text = I. Proc .
1	I.	I.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Proc	Proc	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3156
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3157
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3158
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3159
# text = U.S.A 97 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	97	97	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3160
# text = 1671 - 1676 .
1	1671	1671	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1671 - 1676	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1676	1676	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3161
# text = Schechter LM , Jain S , Akbar S , Lee CA. 2003 .
1	Schechter	Schechter	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	LM	LM	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Jain	Jain	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	S	S	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Akbar	Akbar	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	S	S	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Lee	Lee	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	CA.	CA.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	2003	2003	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3162
# text = The small nucleoid-binding proteins H-NS , HU , and Fis affect hilA expression in
1	The	the small nucleoid-binding proteins h-ns	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	small	the small nucleoid-binding proteins h-ns	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	nucleoid-binding	the small nucleoid-binding proteins h-ns	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	proteins	the small nucleoid-binding proteins h-ns	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	H-NS	H-NS	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
7	HU	HU	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
9	and	and fis	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	Fis	Fis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	affect	affect	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	hilA	hilA	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	expression	expression	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	in	in	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3163
# text = Salmonella enterica serovar Typhimurium .
1	Salmonella	salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	enterica	salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	serovar	salmonella enterica serovar typhimurium	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	Typhimurium	Typhimurium	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3164
# text = Infect .
1	Infect	infect	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3165
# text = Immun .
1	Immun	immun	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3166
# text = 71 :
1	71	71	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3167
# text = 5432 - 5435 .
1	5432	5432	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	5432 - 5435	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	5435	5435	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3168
# text = Schneider D , Duperchy E , Coursange E , Lenski RE , Blot M. 2000a .
1	Schneider	schneider	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	D	D	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
4	Duperchy	Duperchy	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	E	E	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
7	Coursange	Coursange	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	E	E	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
10	Lenski	Lenski	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	RE	RE	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
13	Blot	Blot	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	M.	monsieur	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
15	2000a	2000a	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3169
# text = Long-term experimental evolution in Escherichia coli .
1	Long-term	long	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	experimental	experimental	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	evolution	evolution	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	in	in	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
5	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	coli	coli	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3170
# text = IX .
1	IX	ix	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3171
# text = Characterization of insertion sequence-mediated mutations and rearrangements .
1	Characterization	characterization of insertion sequence-mediated mutations and rearrangements	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	of	characterization of insertion sequence-mediated mutations and rearrangements	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	insertion	characterization of insertion sequence-mediated mutations and rearrangements	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	sequence-mediated	characterization of insertion sequence-mediated mutations and rearrangements	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	mutations	characterization of insertion sequence-mediated mutations and rearrangements	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	and	characterization of insertion sequence-mediated mutations and rearrangements	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	rearrangements	characterization of insertion sequence-mediated mutations and rearrangements	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3172
# text = Genetics 156 :
1	Genetics	genetics	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	156	156	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3173
# text = 477 - 488 .
1	477	477	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	477 - 488	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	488	488	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3174
# text = Schneider D , Duperchy E , Depeyrot J , Coursange E , Lenski R , Blot M. 2002 .
1	Schneider	schneider	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	D	D	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Duperchy	Duperchy	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	E	E	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Depeyrot	Depeyrot	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Coursange	Coursange	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	E	E	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Lenski	Lenski	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	R	R	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
16	Blot	Blot	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	M.	monsieur	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
18	2002	2002	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3175
# text = Genomic comparisons among Escherichia coli strains B , K- 12 , and O157 :
1	Genomic	Genomic	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	comparisons	comparisons	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	among	among	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	coli	coli	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	strains	train	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	B	B	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
9	K-	K-	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	12	12	NUM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
12	and	and o157	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	O157	O157	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
14	:	:	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3176
# text = H 7 using IS elements as molecular markers .
1	H	h 7 using is elements as molecular markers	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	7	7	NUM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
3	using	h 7 using is elements as molecular markers	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
4	IS	IS	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
5	elements	h 7 using is elements as molecular markers	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
6	as	h 7 using is elements as molecular markers	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
7	molecular	h 7 using is elements as molecular markers	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	markers	h 7 using is elements as molecular markers	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3177
# text = BMC .
1	BMC	bmc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3178
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3179
# text = 2 : 18 .
1	2	2	NUM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	:	2 : 18	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	18	18	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3180
# text = Schneider R , Travers A , Kutateladze T , Muskhelishvili G. 1999 .
1	Schneider	Schneider	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	R	R	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Travers	Travers	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	A	A	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Kutateladze	Kutateladze	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	T	T	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
10	Muskhelishvili	Muskhelishvili	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	G.	G.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	1999	1999	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3181
# text = A DNA architectural protein couples cellular physiology and DNA topology in Escherichia coli .
1	A	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	DNA	DNA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	architectural	architectural	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	protein	protéine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	couples	couple	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	cellular	cellular	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	physiology	physiology and dna topology in escherichia coli	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
8	and	physiology and dna topology in escherichia coli	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
9	DNA	DNA	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
10	topology	physiology and dna topology in escherichia coli	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
11	in	physiology and dna topology in escherichia coli	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
12	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	coli	physiology and dna topology in escherichia coli	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3182
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3183
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3184
# text = 34 :
1	34	34	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3185
# text = 953 - 964 .
1	953	953	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	953 - 964	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	964	964	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3186
# text = Schneider R , Travers A , Muskhelishvili G. 2000b .
1	Schneider	Schneider	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	R	R	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Travers	Travers	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	A	A	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Muskhelishvili	Muskhelishvili	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	G.	G.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2000b	2000b	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3187
# text = The expression of the Escherichia coli fis gene is strongly dependent on the superhelical density of DNA .
1	The	the expression of the escherichia coli fis gene is strongly dependent on the superhelical density of dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
2	expression	the expression of the escherichia coli fis gene is strongly dependent on the superhelical density of dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
3	of	the expression of the escherichia coli fis gene is strongly dependent on the superhelical density of dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
4	the	the expression of the escherichia coli fis gene is strongly dependent on the superhelical density of dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
5	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
6	coli	the expression of the escherichia coli fis gene is strongly dependent on the superhelical density of dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
7	fis	the expression of the escherichia coli fis gene is strongly dependent on the superhelical density of dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
8	gene	the expression of the escherichia coli fis gene is strongly dependent on the superhelical density of dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
9	is	the expression of the escherichia coli fis gene is strongly dependent on the superhelical density of dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
10	strongly	the expression of the escherichia coli fis gene is strongly dependent on the superhelical density of dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
11	dependent	the expression of the escherichia coli fis gene is strongly dependent on the superhelical density of dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
12	on	the expression of the escherichia coli fis gene is strongly dependent on the superhelical density of dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
13	the	the expression of the escherichia coli fis gene is strongly dependent on the superhelical density of dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
14	superhelical	the expression of the escherichia coli fis gene is strongly dependent on the superhelical density of dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
15	density	the expression of the escherichia coli fis gene is strongly dependent on the superhelical density of dna	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
16	of	the expression of the escherichia coli fis gene is strongly dependent on the superhelical density of dna	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	DNA	DNA	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3188
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3189
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3190
# text = 38 :
1	38	38	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3191
# text = 167 - 175 .
1	167	167	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	167 - 175	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	175	175	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3192
# text = Schneider R , Lurz R , Luder G , Tolksdorf C , Travers A , Muskhelishvili G. 2001 .
1	Schneider	schneider	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	R	R	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
4	Lurz	Lurz	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	R	R	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
7	Luder	Luder	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	G	G	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
10	Tolksdorf	Tolksdorf	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	C	C	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
13	Travers	Travers	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	A	A	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Muskhelishvili	Muskhelishvili	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	G.	G.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	2001	2001	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3193
# text = An architectural role of the Escherichia coli chromatin protein FIS in organising DNA .
1	An	an	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	architectural	architectural	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	role	rôle	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	of	of the escherichia coli chromatin protein fis in organising dna	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
5	the	of the escherichia coli chromatin protein fis in organising dna	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
6	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
7	coli	of the escherichia coli chromatin protein fis in organising dna	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
8	chromatin	of the escherichia coli chromatin protein fis in organising dna	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
9	protein	of the escherichia coli chromatin protein fis in organising dna	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
10	FIS	FIS	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
11	in	of the escherichia coli chromatin protein fis in organising dna	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
12	organising	of the escherichia coli chromatin protein fis in organising dna	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	DNA	DNA	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3194
# text = Nucleic Acids Res .
1	Nucleic	Nucleic	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Acids	Acids	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Res	Res	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3195
# text = 29 :
1	29	29	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3196
# text = 5107 - 5114 .
1	5107	5107	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	5107 - 5114	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	5114	5114	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3197
# text = Schoeffler AJ , Berger JM. 2005 .
1	Schoeffler	Schoeffler	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	AJ	AJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Berger	Berger	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	JM.	JM.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2005	2005	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3198
# text = Recent advances in understanding structure-function relationships in the type II topoisomerase mechanism .
1	Recent	recent advances in understanding structure-function relationships in the type ii topoisomerase mechanism	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	advances	recent advances in understanding structure-function relationships in the type ii topoisomerase mechanism	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
3	in	recent advances in understanding structure-function relationships in the type ii topoisomerase mechanism	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
4	understanding	recent advances in understanding structure-function relationships in the type ii topoisomerase mechanism	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
5	structure-function	recent advances in understanding structure-function relationships in the type ii topoisomerase mechanism	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
6	relationships	recent advances in understanding structure-function relationships in the type ii topoisomerase mechanism	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	in	recent advances in understanding structure-function relationships in the type ii topoisomerase mechanism	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	the	recent advances in understanding structure-function relationships in the type ii topoisomerase mechanism	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	type	recent advances in understanding structure-function relationships in the type ii topoisomerase mechanism	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	II	II	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	topoisomerase	recent advances in understanding structure-function relationships in the type ii topoisomerase mechanism	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	mechanism	recent advances in understanding structure-function relationships in the type ii topoisomerase mechanism	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3199
# text = Biochem .
1	Biochem	Biochem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3200
# text = Soc .
1	Soc	soc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3201
# text = Trans .
1	Trans	trans	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3202
# text = 33 :
1	33	33	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3203
# text = 1465 - 1470 .
1	1465	1465	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1465 - 1470	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1470	1470	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3204
# text = Schultz SC , Shields GC , Steitz TA. 1991 .
1	Schultz	Schultz	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	SC	SC	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Shields	Shields	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	GC	GC	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Steitz	Steitz	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	TA.	TA.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1991	1991	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3205
# text = Crystal structure of a
1	Crystal	crystal	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	structure	structurer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	of	off	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3206
# text = CAP-DNA complex :
1	CAP-DNA	CAP-DNA	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	complex	complexer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3207
# text = the DNA is bent by 90 degrees .
1	the	the dna is	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	DNA	DNA	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	is	the dna is	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
4	bent	bent	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	by	by	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	90	90	NUM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	degrees	dégréer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3208
# text = Science
1	Science	science	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3209
# text = 253 :
1	253	253	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3210
# text = 1001 - 1007 .
1	1001	1001	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1001 - 1007	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1007	1007	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3211
# text = Scott NW , Harwood CR. 1980 .
1	Scott	scott	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	NW	NW	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Harwood	Harwood	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	CR.	CR.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1980	1980	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3212
# text = Studies on the influence of the cyclic
1	Studies	studies on the influence of the cyclic	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	on	studies on the influence of the cyclic	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	the	studies on the influence of the cyclic	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	influence	studies on the influence of the cyclic	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	of	studies on the influence of the cyclic	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	the	studies on the influence of the cyclic	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	cyclic	studies on the influence of the cyclic	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3213
# text = AMP system on major outer membrane proteins of Escherichia coli K12 .
1	AMP	AMP	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	system	system	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	on	on	CLS	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	major	major	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
5	outer	outer	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	membrane	membrane	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	proteins	pro-	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	of	of escherichia coli k12	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
9	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
10	coli	of escherichia coli k12	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	K12	K12	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3214
# text = FEMS Microbiol .
1	FEMS	fems	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Microbiol	Microbiol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3215
# text = Lett .
1	Lett	Lett	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3216
# text = 9 :
1	9	9	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3217
# text = 95 - 98 .
1	95	95	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	-	95 - 98 .	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	98	98	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	.	95 - 98 .	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3218
# text = Seeto S , Notley-McRobb L , Ferenci T. 2004 .
1	Seeto	Seeto	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	S	S	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Notley-McRobb	Notley-McRobb	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	L	L	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Ferenci	Ferenci	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	T.	T.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2004	2004	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3219
# text = The multifactorial influences of RpoS , Mlc and cAMP on ptsG expression under glucose-limited and anaerobic conditions .
1	The	the multifactorial influences of rpos	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	multifactorial	the multifactorial influences of rpos	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	influences	the multifactorial influences of rpos	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	of	the multifactorial influences of rpos	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	RpoS	RpoS	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
7	Mlc	Mlc	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	and	and	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	cAMP	cAMP	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	on	on	CLS	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	ptsG	ptsG	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	expression	expression	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	under	under glucose-limited and anaerobic conditions	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
14	glucose-limited	under glucose-limited and anaerobic conditions	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
15	and	under glucose-limited and anaerobic conditions	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
16	anaerobic	under glucose-limited and anaerobic conditions	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	conditions	under glucose-limited and anaerobic conditions	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3220
# text = Res .
1	Res	ré	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3221
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3222
# text = 155 :
1	155	155	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3223
# text = 211 - 215 .
1	211	211	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	211 - 215	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	215	215	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3224
# text = Segre AV , Murray AW , Leu JY. 2006 .
1	Segre	Segre	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	AV	AV	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Murray	Murray	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	AW	AW	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Leu	Leu	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	JY.	JY.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2006	2006	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3225
# text = High-Resolution Mutation Mapping
1	High-Resolution	High-Resolution	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Mutation	Mutation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	Mapping	Mapping	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3226
# text = Reveals Parallel Experimental Evolution in Yeast .
1	Reveals	Reveals	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Parallel	Parallel	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Experimental	Experimental	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	Evolution	Evolution	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	in	in	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	Yeast	Yeast	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3227
# text = PLoS.Biol .
1	PLoS.Biol	PLoS.Biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3228
# text = 4 :
1	4	4	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3229
# text = e 256 .
1	e	eh	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	256	256	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3230
# text = Shaver AC , Dombrowski PG , Sweeney JY , Treis T , Zappala RM , Sniegowski PD. 2002 .
1	Shaver	Shaver	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	AC	AC	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Dombrowski	Dombrowski	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	PG	PG	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Sweeney	Sweeney	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	JY	JY	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Treis	Treis	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	T	T	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Zappala	Zappala	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	RM	RM	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Sniegowski	Sniegowski	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	PD.	PD.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	2002	2002	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3231
# text = Fitness evolution and the rise of mutator alleles in experimental Escherichia coli populations .
1	Fitness	fitness evolution and the rise of mutator alleles in experimental escherichia coli populations	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	evolution	fitness evolution and the rise of mutator alleles in experimental escherichia coli populations	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
3	and	fitness evolution and the rise of mutator alleles in experimental escherichia coli populations	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
4	the	fitness evolution and the rise of mutator alleles in experimental escherichia coli populations	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
5	rise	fitness evolution and the rise of mutator alleles in experimental escherichia coli populations	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
6	of	fitness evolution and the rise of mutator alleles in experimental escherichia coli populations	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
7	mutator	fitness evolution and the rise of mutator alleles in experimental escherichia coli populations	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
8	alleles	fitness evolution and the rise of mutator alleles in experimental escherichia coli populations	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
9	in	fitness evolution and the rise of mutator alleles in experimental escherichia coli populations	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
10	experimental	fitness evolution and the rise of mutator alleles in experimental escherichia coli populations	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
11	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
12	coli	fitness evolution and the rise of mutator alleles in experimental escherichia coli populations	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	populations	fitness evolution and the rise of mutator alleles in experimental escherichia coli populations	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3232
# text = Genetics
1	Genetics	genetics	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3233
# text = 162 :
1	162	162	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3234
# text = 557 - 566 .
1	557	557	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	557 - 566	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	566	566	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3235
# text = Sheridan SD , Benham CJ , Hatfield GW. 1998 .
1	Sheridan	Sheridan	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	SD	SD	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Benham	Benham	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	CJ	CJ	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Hatfield	Hatfield	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	GW.	GW.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1998	1998	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3236
# text = Activation of gene expression by a novel DNA structural transmission mechanism that requires supercoiling-induced
1	Activation	activation of gene	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	of	activation of gene	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	gene	activation of gene	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	expression	expression	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
5	by	By	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	novel	Novel	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	DNA	DNA	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	structural	structural	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	transmission	transmission	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	mechanism	mechanism that requires supercoiling-induced	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
12	that	mechanism that requires supercoiling-induced	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
13	requires	mechanism that requires supercoiling-induced	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	supercoiling-induced	mechanism that requires supercoiling-induced	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3237
# text = DNA duplex destabilization in an upstream activating sequence .
1	DNA	dna	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	duplex	duplex	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	destabilization	destabilization	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	in	in	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	an	an	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	upstream	upstream activating sequence	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
7	activating	upstream activating sequence	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	sequence	upstream activating sequence	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3238
# text = J. Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3239
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3240
# text = 273 :
1	273	273	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3241
# text = 21298 - 21308 .
1	21298	21298	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	21298 - 21308	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	21308	21308	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3242
# text = Sherratt DJ. 2003 .
1	Sherratt	Sherratt	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	DJ.	DJ.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	2003	2003	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3243
# text = Bacterial chromosome dynamics .
1	Bacterial	Bacterial	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	chromosome	chromosome	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	dynamics	dynamiser	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3244
# text = Science 301 :
1	Science	science	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	301	301	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3245
# text = 780 - 785 .
1	780	780	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	780 - 785	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	785	785	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3246
# text = Shindo H , Furubayashi A , Shimizu M , Miyake M , Imamoto F. 1992 .
1	Shindo	Shindo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	H	H	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Furubayashi	Furubayashi	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	A	A	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Shimizu	Shimizu	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	M	M	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Miyake	Miyake	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	M	M	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Imamoto	Imamoto	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
14	F.	F.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	1992	1992	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3247
# text = Preferential binding of E.coli histone-like protein HU alpha to negatively supercoiled DNA .
1	Preferential	preferential binding of e.coli histone-like protein hu alpha to negatively supercoiled dna	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	binding	preferential binding of e.coli histone-like protein hu alpha to negatively supercoiled dna	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
3	of	preferential binding of e.coli histone-like protein hu alpha to negatively supercoiled dna	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
4	E.coli	E.coli	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
5	histone-like	preferential binding of e.coli histone-like protein hu alpha to negatively supercoiled dna	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
6	protein	preferential binding of e.coli histone-like protein hu alpha to negatively supercoiled dna	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	HU	HU	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	alpha	preferential binding of e.coli histone-like protein hu alpha to negatively supercoiled dna	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	to	preferential binding of e.coli histone-like protein hu alpha to negatively supercoiled dna	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	negatively	preferential binding of e.coli histone-like protein hu alpha to negatively supercoiled dna	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	supercoiled	preferential binding of e.coli histone-like protein hu alpha to negatively supercoiled dna	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	DNA	DNA	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3248
# text = Nucleic Acids Res .
1	Nucleic	Nucleic	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Acids	Acids	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Res	Res	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3249
# text = 20 :
1	20	20	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3250
# text = 1553 - 1558 .
1	1553	1553	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1553 - 1558	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1558	1558	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3251
# text = Simons RW , Houman F , Kleckner N. 1987 .
1	Simons	Simons	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	RW	RW	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Houman	Houman	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	F	F	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
7	Kleckner	Kleckner	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	N.	N.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	1987	1987	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3252
# text = Improved single and multicopy lac-based cloning vectors for protein and operon fusions .
1	Improved	Improved	_	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	single	single	_	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	and	and	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	multicopy	multi-	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	lac-based	lac-base	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	cloning	cloning vectors for protein and operon fusions	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	vectors	cloning vectors for protein and operon fusions	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	for	cloning vectors for protein and operon fusions	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	protein	cloning vectors for protein and operon fusions	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	and	cloning vectors for protein and operon fusions	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	operon	cloning vectors for protein and operon fusions	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	fusions	cloning vectors for protein and operon fusions	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3253
# text = Gene 53 :
1	Gene	gêner	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	53	53	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3254
# text = 85 - 96 .
1	85	85	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	-	85 - 96 .	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	96	96	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	.	85 - 96 .	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3255
# text = Sinden RR , Pettijohn DE. 1981 .
1	Sinden	Sinden	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	RR	RR	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Pettijohn	Pettijohn	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	DE.	DE.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1981	1981	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3256
# text = Chromosomes in living Escherichia coli cells are segregated into domains of supercoiling .
1	Chromosomes	chromosome	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	in	in	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	living	living	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
5	coli	escherichia coli cells are segregated into domains of supercoiling	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
6	cells	escherichia coli cells are segregated into domains of supercoiling	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
7	are	escherichia coli cells are segregated into domains of supercoiling	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
8	segregated	escherichia coli cells are segregated into domains of supercoiling	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
9	into	escherichia coli cells are segregated into domains of supercoiling	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
10	domains	escherichia coli cells are segregated into domains of supercoiling	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
11	of	escherichia coli cells are segregated into domains of supercoiling	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	supercoiling	escherichia coli cells are segregated into domains of supercoiling	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3257
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3258
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3259
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3260
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3261
# text = U.S.A 78 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	78	78	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3262
# text = 224 - 228 .
1	224	224	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	224 - 228	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	228	228	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3263
# text = Slany RK , Kersten H. 1992 .
1	Slany	slany	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	RK	RK	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Kersten	Kersten	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	H.	H.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1992	1992	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3264
# text = The promoter of the tgt / sec operon in Escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity FIS binding site .
1	The	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
2	promoter	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
3	of	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
4	the	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
5	tgt	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
6	/	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
7	sec	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
8	operon	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
9	in	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
10	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
11	coli	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
12	is	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
13	preceded	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
14	by	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
15	an	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
16	upstream	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
17	activation	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
18	sequence	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
19	that	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
20	contains	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
21	a	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
22	high	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
23	affinity	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
24	FIS	FIS	NOM	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
25	binding	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	site	the promoter of the tgt / sec operon in escherichia coli is preceded by an upstream activation sequence that contains a high affinity fis binding site	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3265
# text = Nucleic
1	Nucleic	Nucleic	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3266
# text = Acids Res .
1	Acids	Acids	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Res	Res	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3267
# text = 20 :
1	20	20	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3268
# text = 4193 - 4198 .
1	4193	4193	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	4193 - 4198	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	4198	4198	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3269
# text = Sniegowski PD , Gerrish PJ , Lenski RE. 1997 .
1	Sniegowski	Sniegowski	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	PD	PD	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Gerrish	Gerrish	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	PJ	PJ	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Lenski	Lenski	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	RE.	RE.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1997	1997	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3270
# text = Evolution of high mutation rates in experimental populations of E. coli .
1	Evolution	evolution of	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	of	evolution of	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	high	Hugh	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	mutation	mutation	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	rates	rater	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	in	in	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	experimental	experimental populations of e. coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
8	populations	experimental populations of e. coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
9	of	experimental populations of e. coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
10	E.	E.	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	coli	experimental populations of e. coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3271
# text = Nature 387 :
1	Nature	nature	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	387	387	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3272
# text = 703 - 705 .
1	703	703	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	703 - 705	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	705	705	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3273
# text = Sokolsky TD , Baker TA. 2003 .
1	Sokolsky	Sokolsky	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	TD	TD	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Baker	Baker	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	TA.	TA.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2003	2003	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3274
# text = DNA gyrase requirements distinguish the alternate pathways of Mu transposition .
1	DNA	dna gyrase requirements distinguish the alternate pathways of mu transposition	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	gyrase	dna gyrase requirements distinguish the alternate pathways of mu transposition	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
3	requirements	dna gyrase requirements distinguish the alternate pathways of mu transposition	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
4	distinguish	dna gyrase requirements distinguish the alternate pathways of mu transposition	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
5	the	dna gyrase requirements distinguish the alternate pathways of mu transposition	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
6	alternate	dna gyrase requirements distinguish the alternate pathways of mu transposition	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
7	pathways	dna gyrase requirements distinguish the alternate pathways of mu transposition	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
8	of	dna gyrase requirements distinguish the alternate pathways of mu transposition	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
9	Mu	Mu	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	transposition	dna gyrase requirements distinguish the alternate pathways of mu transposition	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3275
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3276
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3277
# text = 47 :
1	47	47	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3278
# text = 397 - 409 .
1	397	397	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	397 - 409	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	409	409	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3279
# text = Spassky A , Rimsky S , Garreau H , Buc H. 1984 .
1	Spassky	Spassky	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	A	A	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
4	Rimsky	Rimsky	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	S	S	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
7	Garreau	Garreau	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	H	H	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
10	Buc	Buc	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
11	H.	H.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	1984	1984	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3280
# text = H 1a , an E. coli DNA-binding protein which accumulates in stationary phase , strongly compacts DNA in vitro .
1	H	heure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	1a	1a	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
4	an	an e. coli dna-binding protein which accumulates in stationary phase	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
5	E.	E.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
6	coli	an e. coli dna-binding protein which accumulates in stationary phase	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
7	DNA-binding	DNA-binding	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
8	protein	an e. coli dna-binding protein which accumulates in stationary phase	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
9	which	an e. coli dna-binding protein which accumulates in stationary phase	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
10	accumulates	an e. coli dna-binding protein which accumulates in stationary phase	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
11	in	an e. coli dna-binding protein which accumulates in stationary phase	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
12	stationary	an e. coli dna-binding protein which accumulates in stationary phase	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	phase	an e. coli dna-binding protein which accumulates in stationary phase	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
15	strongly	strongle	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
16	compacts	compact	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
17	DNA	DNA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
18	in	in vitro	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	vitro	in vitro	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3281
# text = Nucleic Acids
1	Nucleic	Nucleic	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Acids	Acids	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3282
# text = Res .
1	Res	ré	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3283
# text = 12 :
1	12	12	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3284
# text = 5321 - 5340 .
1	5321	5321	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	5321 - 5340	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	5340	5340	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3285
# text = Staczek P , Higgins NP. 1998 .
1	Staczek	Staczek	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	P	P	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Higgins	Higgins	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	NP.	NP.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1998	1998	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3286
# text = Gyrase and Topo IV modulate chromosome domain size in vivo .
1	Gyrase	gyrase and topo iv modulate chromosome domain size in vivo	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	and	gyrase and topo iv modulate chromosome domain size in vivo	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
3	Topo	Topo	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
4	IV	IV	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
5	modulate	gyrase and topo iv modulate chromosome domain size in vivo	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
6	chromosome	gyrase and topo iv modulate chromosome domain size in vivo	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
7	domain	gyrase and topo iv modulate chromosome domain size in vivo	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
8	size	gyrase and topo iv modulate chromosome domain size in vivo	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
9	in	gyrase and topo iv modulate chromosome domain size in vivo	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	vivo	gyrase and topo iv modulate chromosome domain size in vivo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3287
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3288
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3289
# text = 29 :
1	29	29	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3290
# text = 1435 - 1448 .
1	1435	1435	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1435 - 1448	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1448	1448	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3291
# text = Stark WM , Boocock MR. 1995 .
1	Stark	stark	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	WM	WM	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
4	Boocock	Boocock	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	MR.	MR.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	1995	1995	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3292
# text = Gatecrashers at the catalytic party .
1	Gatecrashers	gatecrashers at the catalytic party	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	at	gatecrashers at the catalytic party	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	the	gatecrashers at the catalytic party	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	catalytic	gatecrashers at the catalytic party	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	party	gatecrashers at the catalytic party	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3293
# text = Trends Genet .
1	Trends	trend	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Genet	Genet	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3294
# text = 11 :
1	11	11	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3295
# text = 121 - 123 .
1	121	121	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	121 - 123	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	123	123	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3296
# text = Steck TR , Franco RJ , Wang JY , Drlica K. 1993 .
1	Steck	Steck	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	TR	TR	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Franco	Franco	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	RJ	RJ	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Wang	Wang	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	JY	JY	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Drlica	Drlica	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	K.	K.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	1993	1993	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3297
# text = Topoisomerase mutations affect the relative abundance of many Escherichia coli proteins .
1	Topoisomerase	Topoisomerase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	mutations	mutation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	affect	affect	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	the	the relative abundance of many escherichia coli proteins	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
5	relative	the relative abundance of many escherichia coli proteins	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
6	abundance	the relative abundance of many escherichia coli proteins	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
7	of	the relative abundance of many escherichia coli proteins	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
8	many	the relative abundance of many escherichia coli proteins	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
9	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
10	coli	the relative abundance of many escherichia coli proteins	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	proteins	the relative abundance of many escherichia coli proteins	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3298
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3299
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3300
# text = 10 :
1	10	10	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3301
# text = 473 - 481 .
1	473	473	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	473 - 481	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	481	481	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3302
# text = Stein RA , Deng S , Higgins NP. 2005 .
1	Stein	Stein	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	RA	RA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Deng	Deng	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	S	S	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Higgins	Higgins	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	NP.	NP.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2005	2005	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3303
# text = Measuring chromosome dynamics on different time scales using resolvases with varying half-lives .
1	Measuring	Measuring	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	chromosome	chromosome	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	dynamics	dynamiser	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	on	on	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
5	different	différent	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	time	cime	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	scales	scal	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
8	using	using resolvases with varying half-lives	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
9	resolvases	using resolvases with varying half-lives	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
10	with	using resolvases with varying half-lives	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
11	varying	using resolvases with varying half-lives	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	half-lives	using resolvases with varying half-lives	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3304
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3305
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3306
# text = 56 :
1	56	56	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3307
# text = 1049 - 1061 .
1	1049	1049	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1049 - 1061	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1061	1061	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3308
# text = Stewart L , Redinbo MR , Qiu X , Hol WG , Champoux JJ. 1998 .
1	Stewart	Stewart	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	L	L	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Redinbo	Redinbo	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	MR	MR	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Qiu	Qiu	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	X	X	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Hol	Hol	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	WG	WG	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Champoux	Champoux	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	JJ.	JJ.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	1998	1998	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3309
# text = A model for the mechanism of human topoisomerase I. Science 279 :
1	A	a model for the mechanism of human topoisomerase i. science 279	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	model	a model for the mechanism of human topoisomerase i. science 279	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
3	for	a model for the mechanism of human topoisomerase i. science 279	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
4	the	a model for the mechanism of human topoisomerase i. science 279	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
5	mechanism	a model for the mechanism of human topoisomerase i. science 279	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
6	of	a model for the mechanism of human topoisomerase i. science 279	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
7	human	a model for the mechanism of human topoisomerase i. science 279	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
8	topoisomerase	a model for the mechanism of human topoisomerase i. science 279	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
9	I.	I.	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
10	Science	Science	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	279	279	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	:	:	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3310
# text = 1534 - 1541 .
1	1534	1534	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1534 - 1541	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1541	1541	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3311
# text = Stivers JT , Harris TK , Mildvan AS. 1997 .
1	Stivers	Stivers	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	JT	JT	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Harris	Harris	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	TK	TK	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Mildvan	Mildvan	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	AS.	AS.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1997	1997	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3312
# text = Vaccinia DNA topoisomerase
1	Vaccinia	Vaccinia	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	DNA	DNA	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	topoisomerase	topoisomerase	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3313
# text = I :
1	I	I	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3314
# text = evidence supporting a free rotation mechanism for DNA supercoil relaxation .
1	evidence	evidence	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	supporting	support	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	free	fret	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	rotation	rotation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	mechanism	mechanism for dna supercoil relaxation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
7	for	mechanism for dna supercoil relaxation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
8	DNA	DNA	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
9	supercoil	mechanism for dna supercoil relaxation	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	relaxation	mechanism for dna supercoil relaxation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3315
# text = Biochemistry 36 :
1	Biochemistry	biochemistry	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	36	36	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3316
# text = 5212 - 5222 .
1	5212	5212	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	5212 - 5222	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	5222	5222	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3317
# text = Straney R , Krah R , Menzel R. 1994 .
1	Straney	Straney	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	R	R	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Krah	Krah	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	R	R	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Menzel	Menzel	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	R.	R.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1994	1994	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3318
# text = Mutations in the - 10 TATAAT sequence of the gyrA promoter affect both promoter strength and sensitivity to DNA supercoiling .
1	Mutations	mutation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	in	in	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	the	thé	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	-	- 10	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
5	10	10	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	TATAAT	TATAAT	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
7	sequence	tataat sequence of the gyra promoter affect both promoter strength and sensitivity to dna supercoiling	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
8	of	tataat sequence of the gyra promoter affect both promoter strength and sensitivity to dna supercoiling	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
9	the	tataat sequence of the gyra promoter affect both promoter strength and sensitivity to dna supercoiling	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
10	gyrA	tataat sequence of the gyra promoter affect both promoter strength and sensitivity to dna supercoiling	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
11	promoter	tataat sequence of the gyra promoter affect both promoter strength and sensitivity to dna supercoiling	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
12	affect	tataat sequence of the gyra promoter affect both promoter strength and sensitivity to dna supercoiling	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
13	both	tataat sequence of the gyra promoter affect both promoter strength and sensitivity to dna supercoiling	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
14	promoter	tataat sequence of the gyra promoter affect both promoter strength and sensitivity to dna supercoiling	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
15	strength	tataat sequence of the gyra promoter affect both promoter strength and sensitivity to dna supercoiling	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
16	and	tataat sequence of the gyra promoter affect both promoter strength and sensitivity to dna supercoiling	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
17	sensitivity	tataat sequence of the gyra promoter affect both promoter strength and sensitivity to dna supercoiling	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
18	to	tataat sequence of the gyra promoter affect both promoter strength and sensitivity to dna supercoiling	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
19	DNA	DNA	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	supercoiling	tataat sequence of the gyra promoter affect both promoter strength and sensitivity to dna supercoiling	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3319
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3320
# text = 176 :
1	176	176	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3321
# text = 5999 - 6006 .
1	5999	5999	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	5999 - 6006	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	6006	6006	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3322
# text = Stupina VA , Wang JC. 2005 .
1	Stupina	Stupina	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	VA	VA	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Wang	Wang	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	JC.	JC.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2005	2005	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3323
# text = Viability of Escherichia coli topA mutants lacking DNA topoisomerase I. J. Biol .
1	Viability	viability of escherichia	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	of	viability of escherichia	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	coli	colis	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	topA	topA	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	mutants	mutant	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	lacking	lacking dna topoisomerase i. j. biol	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	DNA	DNA	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	topoisomerase	lacking dna topoisomerase i. j. biol	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	I.	I.	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	J.	J.	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	Biol	Biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3324
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3325
# text = 280 :
1	280	280	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3326
# text = 355 - 360 .
1	355	355	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	355 - 360	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	360	360	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3327
# text = Sucena E , Delon I , Jones I , Payre F , Stern DL. 2003 .
1	Sucena	Sucena	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	E	E	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Delon	Delon	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	I	I	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Jones	Jones	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	I	I	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Payre	Payre	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	F	F	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Stern	Stern	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	DL.	DL.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	2003	2003	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3328
# text = Regulatory evolution of shavenbaby / ovo underlies multiple cases of morphological parallelism .
1	Regulatory	regulatory evolution of shavenbaby	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	evolution	regulatory evolution of shavenbaby	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	of	regulatory evolution of shavenbaby	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	shavenbaby	regulatory evolution of shavenbaby	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	/	ou	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	ovo	ove	NOM	_	_	4	para	_	_	_	_	_
7	underlies	un	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	multiple	multiple	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	cases	case	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	of	of morphological parallelism	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	morphological	of morphological parallelism	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	parallelism	of morphological parallelism	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3329
# text = Nature 424 :
1	Nature	nature	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	424	424	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3330
# text = 935 - 938 .
1	935	935	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	935 - 938	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	938	938	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3331
# text = Suzuki T , Ueguchi C , Mizuno T. 1996 .
1	Suzuki	suzuki	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	T	T	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Ueguchi	Ueguchi	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	C	C	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Mizuno	Mizuno	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	T.	T.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1996	1996	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3332
# text = H-NS regulates OmpF expression through micF antisense RNA in Escherichia coli .
1	H-NS	heure	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	regulates	réguler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	OmpF	OmpF	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	expression	expression	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	through	Turlough	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	micF	micF	VPR	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	antisense	anti-	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	RNA	RNA	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	in	in	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	coli	coli	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3333
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3334
# text = 178 :
1	178	178	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3335
# text = 3650 - 3653 .
1	3650	3650	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	3650 - 3653	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	3653	3653	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3336
# text = Talukder AA , Iwata A , Nishimura A , Ueda S , Ishihama A. 1999 .
1	Talukder	Talukder	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	AA	AA	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	Iwata	Iwata	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	A	A	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
7	Nishimura	Nishimura	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	A	A	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Ueda	Ueda	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	S	S	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Ishihama	Ishihama	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	A.	A.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	1999	1999	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3337
# text = Growth phase-dependent phase-dependent variation in protein composition of the Escherichia coli nucleoid .
1	Growth	Growth	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	phase-dependent	phase-dependent	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	phase-dependent	dépendre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	variation	variation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	in	in	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	protein	protéiner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	composition	composition	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	of	of the escherichia coli nucleoid	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
9	the	of the escherichia coli nucleoid	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
10	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
11	coli	of the escherichia coli nucleoid	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	nucleoid	of the escherichia coli nucleoid	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3338
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3339
# text = 181 :
1	181	181	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3340
# text = 6361 - 6370 .
1	6361	6361	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	6361 - 6370	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	6370	6370	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3341
# text = Thompson JF , Moitoso d , V , Koch C , Kahmann R , Landy A. 1987 .
1	Thompson	thompson	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	JF	JF	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Moitoso	Moitoso	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	d	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	V	V	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
9	Koch	Koch	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	C	C	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
12	Kahmann	Kahmann	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	R	R	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
15	Landy	Landy	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	A.	A.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
17	1987	1987	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3342
# text = Cellular factors couple recombination with growth phase :
1	Cellular	cellular	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	factors	factor	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	couple	couple	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	recombination	recombination	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	with	dire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	growth	growth	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	phase	phase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	:	:	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3343
# text = characterization of a new component in the lambda site-specific recombination pathway .
1	characterization	characterization of a new component in the lambda site-specific recombination pathway	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	of	characterization of a new component in the lambda site-specific recombination pathway	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
3	a	characterization of a new component in the lambda site-specific recombination pathway	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
4	new	characterization of a new component in the lambda site-specific recombination pathway	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
5	component	characterization of a new component in the lambda site-specific recombination pathway	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
6	in	characterization of a new component in the lambda site-specific recombination pathway	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
7	the	characterization of a new component in the lambda site-specific recombination pathway	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
8	lambda	characterization of a new component in the lambda site-specific recombination pathway	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
9	site-specific	characterization of a new component in the lambda site-specific recombination pathway	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
10	recombination	characterization of a new component in the lambda site-specific recombination pathway	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	pathway	characterization of a new component in the lambda site-specific recombination pathway	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3344
# text = Cell
1	Cell	cell	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3345
# text = 50 :
1	50	50	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3346
# text = 901 - 908 .
1	901	901	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	901 - 908	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	908	908	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3347
# text = Tkachenko AG , Nesterova LY. 2003 .
1	Tkachenko	Tkachenko	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	AG	AG	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Nesterova	Nesterova	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	LY.	LY.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2003	2003	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3348
# text = Polyamines as modulators of gene expression under oxidative stress in Escherichia coli .
1	Polyamines	polyamines as modulators of gene expression under oxidative	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	as	polyamines as modulators of gene expression under oxidative	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
3	modulators	polyamines as modulators of gene expression under oxidative	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
4	of	polyamines as modulators of gene expression under oxidative	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
5	gene	polyamines as modulators of gene expression under oxidative	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
6	expression	polyamines as modulators of gene expression under oxidative	NOM	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
7	under	polyamines as modulators of gene expression under oxidative	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	oxidative	polyamines as modulators of gene expression under oxidative	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	stress	stress	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	in	in	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	Escherichia	Escherichia	_	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	coli	coli	_	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3349
# text = Biochemistry ( Mosc . ) 68 :
1	Biochemistry	biochemistry	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	(	(	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	Mosc	Mosc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
5	)	)	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
6	68	68	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	:	:	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3350
# text = 850 - 856 .
1	850	850	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	850 - 856	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	856	856	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3351
# text = Travers A , Muskhelishvili G. 1998 .
1	Travers	travers	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	A	A	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Muskhelishvili	Muskhelishvili	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	G.	G.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1998	1998	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3352
# text = DNA microloops and microdomains :
1	DNA	dna microloops and microdomains	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	microloops	dna microloops and microdomains	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	and	dna microloops and microdomains	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	microdomains	dna microloops and microdomains	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	:	:	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3353
# text = a general mechanism for transcription activation by torsional transmission .
1	a	a general mechanism for	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	general	a general mechanism for	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	mechanism	a general mechanism for	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	for	a general mechanism for	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	transcription	transcription	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	activation	activation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	by	By	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	torsional	torsional	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	transmission	transmission	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3354
# text = J. Mol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Mol	Mol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3355
# text = Biol .
1	Biol	biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3356
# text = 279 :
1	279	279	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3357
# text = 1027 - 1043 .
1	1027	1027	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1027 - 1043	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1043	1043	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3358
# text = Travers A , Muskhelishvili G. 2005 .
1	Travers	travers	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	A	A	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Muskhelishvili	Muskhelishvili	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	G.	G.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2005	2005	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3359
# text = Bacterial chromatin .
1	Bacterial	Bacterial	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	chromatin	chromatin	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3360
# text = Curr .
1	Curr	Curr	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3361
# text = Opin .
1	Opin	Opin	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3362
# text = Genet .
1	Genet	genet	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3363
# text = Dev .
1	Dev	Dev	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3364
# text = 15 :
1	15	15	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3365
# text = 507 - 514 .
1	507	507	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	507 - 514	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	514	514	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3366
# text = Tritz GJ , Chandler JL. 1973 .
1	Tritz	Tritz	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	GJ	GJ	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Chandler	Chandler	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	JL.	JL.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1973	1973	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3367
# text = Recognition of a gene involved in the regulation of nicotinamide adenine dinucleotide biosynthesis .
1	Recognition	recognition of a gene involved in the regulation of nicotinamide adenine dinucleotide biosynthesis	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	of	recognition of a gene involved in the regulation of nicotinamide adenine dinucleotide biosynthesis	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
3	a	recognition of a gene involved in the regulation of nicotinamide adenine dinucleotide biosynthesis	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
4	gene	recognition of a gene involved in the regulation of nicotinamide adenine dinucleotide biosynthesis	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
5	involved	recognition of a gene involved in the regulation of nicotinamide adenine dinucleotide biosynthesis	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
6	in	recognition of a gene involved in the regulation of nicotinamide adenine dinucleotide biosynthesis	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
7	the	recognition of a gene involved in the regulation of nicotinamide adenine dinucleotide biosynthesis	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
8	regulation	recognition of a gene involved in the regulation of nicotinamide adenine dinucleotide biosynthesis	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
9	of	recognition of a gene involved in the regulation of nicotinamide adenine dinucleotide biosynthesis	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
10	nicotinamide	recognition of a gene involved in the regulation of nicotinamide adenine dinucleotide biosynthesis	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
11	adenine	recognition of a gene involved in the regulation of nicotinamide adenine dinucleotide biosynthesis	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
12	dinucleotide	recognition of a gene involved in the regulation of nicotinamide adenine dinucleotide biosynthesis	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	biosynthesis	recognition of a gene involved in the regulation of nicotinamide adenine dinucleotide biosynthesis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3368
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3369
# text = 114 :
1	114	114	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3370
# text = 128 - 136 .
1	128	128	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	128 - 136	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	136	136	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3371
# text = Tse-Dinh YC. 1985 .
1	Tse-Dinh	Tse-Dinh	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	YC.	YC.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	1985	1985	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3372
# text = Regulation of the Escherichia coli DNA topoisomerase I gene by DNA supercoiling .
1	Regulation	regulation of the escherichia coli dna topoisomerase i gene by dna supercoiling	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	of	regulation of the escherichia coli dna topoisomerase i gene by dna supercoiling	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
3	the	regulation of the escherichia coli dna topoisomerase i gene by dna supercoiling	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
4	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
5	coli	regulation of the escherichia coli dna topoisomerase i gene by dna supercoiling	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
6	DNA	DNA	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	topoisomerase	regulation of the escherichia coli dna topoisomerase i gene by dna supercoiling	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	I	I	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	gene	regulation of the escherichia coli dna topoisomerase i gene by dna supercoiling	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	by	regulation of the escherichia coli dna topoisomerase i gene by dna supercoiling	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	DNA	DNA	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	supercoiling	regulation of the escherichia coli dna topoisomerase i gene by dna supercoiling	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3373
# text = Nucleic Acids
1	Nucleic	Nucleic	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Acids	Acids	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3374
# text = Res .
1	Res	ré	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3375
# text = 13 :
1	13	13	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3376
# text = 4751 - 4763 .
1	4751	4751	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	4751 - 4763	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	4763	4763	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3377
# text = Tse YC , Kirkegaard K , Wang JC. 1980 .
1	Tse	Tse	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	YC	YC	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Kirkegaard	Kirkegaard	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	K	K	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Wang	Wang	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	JC.	JC.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1980	1980	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3378
# text = Covalent bonds between protein and DNA .
1	Covalent	covalent bonds between protein and dna	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	bonds	covalent bonds between protein and dna	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	between	covalent bonds between protein and dna	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	protein	covalent bonds between protein and dna	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	and	covalent bonds between protein and dna	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	DNA	DNA	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3379
# text = Formation of phosphotyrosine linkage between certain DNA topoisomerases and DNA .
1	Formation	formation of phosphotyrosine linkage between certain dna topoisomerases and dna	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	of	formation of phosphotyrosine linkage between certain dna topoisomerases and dna	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
3	phosphotyrosine	formation of phosphotyrosine linkage between certain dna topoisomerases and dna	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
4	linkage	formation of phosphotyrosine linkage between certain dna topoisomerases and dna	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
5	between	formation of phosphotyrosine linkage between certain dna topoisomerases and dna	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
6	certain	formation of phosphotyrosine linkage between certain dna topoisomerases and dna	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
7	DNA	DNA	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
8	topoisomerases	formation of phosphotyrosine linkage between certain dna topoisomerases and dna	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
9	and	formation of phosphotyrosine linkage between certain dna topoisomerases and dna	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	DNA	DNA	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3380
# text = J. Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3381
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3382
# text = 255 :
1	255	255	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3383
# text = 5560 - 5565 .
1	5560	5560	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	5560 - 5565	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	5565	5565	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3384
# text = Tupper AE , Owen-Hughes TA , Ussery DW , Santos DS , Ferguson DJ , Sidebotham JM , Hinton JC , Higgins CF. 1994 .
1	Tupper	Tupper	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	AE	AE	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	Owen-Hughes	Owen-Hughes	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	TA	TA	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
7	Ussery	Ussery	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	DW	DW	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
10	Santos	Santos	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	DS	DS	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
13	Ferguson	Ferguson	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	DJ	DJ	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
16	Sidebotham	Sidebotham	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
17	JM	JM	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
19	Hinton	Hinton	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	JC	JC	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	Higgins	Higgins	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
23	CF.	CF.	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	1994	1994	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3385
# text = The chromatin-associated protein H-NS alters DNA topology in vitro .
1	The	the chromatin-associated protein h-ns alters dna topology in vitro	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	chromatin-associated	the chromatin-associated protein h-ns alters dna topology in vitro	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	protein	the chromatin-associated protein h-ns alters dna topology in vitro	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
4	H-NS	H-NS	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	alters	the chromatin-associated protein h-ns alters dna topology in vitro	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
6	DNA	DNA	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
7	topology	the chromatin-associated protein h-ns alters dna topology in vitro	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
8	in	the chromatin-associated protein h-ns alters dna topology in vitro	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	vitro	the chromatin-associated protein h-ns alters dna topology in vitro	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3386
# text = EMBO J. 13 :
1	EMBO	embo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J.	J.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	13	13	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3387
# text = 258 - 268 .
1	258	258	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	258 - 268	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	268	268	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3388
# text = Udekwu KI , Darfeuille F , Vogel J , Reimegard J , Holmqvist E , Wagner EG. 2005 .
1	Udekwu	Udekwu	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	KI	KI	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Darfeuille	Darfeuille	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	F	F	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Vogel	Vogel	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Reimegard	Reimegard	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Holmqvist	Holmqvist	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	E	E	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Wagner	Wagner	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	EG.	EG.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	2005	2005	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3389
# text = Hfq-dependent regulation of OmpA synthesis is mediated by an antisense RNA .
1	Hfq-dependent	hfq-dependent regulation of ompa synthesis is mediated	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	regulation	hfq-dependent regulation of ompa synthesis is mediated	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	of	hfq-dependent regulation of ompa synthesis is mediated	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	OmpA	OmpA	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	synthesis	hfq-dependent regulation of ompa synthesis is mediated	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	is	hfq-dependent regulation of ompa synthesis is mediated	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	mediated	hfq-dependent regulation of ompa synthesis is mediated	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	by	by	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	an	an	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	antisense	anti-	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	RNA	RNA	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3390
# text = Genes Dev .
1	Genes	gêne	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Dev	Dev	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3391
# text = 19 :
1	19	19	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3392
# text = 2355 - 2366 .
1	2355	2355	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	2355 - 2366	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	2366	2366	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3393
# text = Ueda O , Yoshimura F. 2003 .
1	Ueda	ueda	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	O	O	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Yoshimura	Yoshimura	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	F.	F.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2003	2003	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3394
# text = Transposon-induced norfloxacin-sensitive mutants of Bacteroides thetaiotaomicron .
1	Transposon-induced	transposon-induced norfloxacin-sensitive mutants of bacteroides thetaiotaomicron	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	norfloxacin-sensitive	transposon-induced norfloxacin-sensitive mutants of bacteroides thetaiotaomicron	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	mutants	transposon-induced norfloxacin-sensitive mutants of bacteroides thetaiotaomicron	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	of	transposon-induced norfloxacin-sensitive mutants of bacteroides thetaiotaomicron	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	Bacteroides	Bacteroides	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	thetaiotaomicron	transposon-induced norfloxacin-sensitive mutants of bacteroides thetaiotaomicron	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3395
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3396
# text = Immunol .
1	Immunol	Immunol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3397
# text = 47 : 17 - 25 .
1	47	47	NUM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	:	47 : 17	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	17	17	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	-	- 25	PUNC	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	25	25	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3398
# text = Ussery D , Larsen TS , Wilkes KT , Friis C , Worning P , Krogh A , Brunak S. 2001 .
1	Ussery	Ussery	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	D	D	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Larsen	Larsen	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
5	TS	TS	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
7	Wilkes	Wilkes	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	KT	KT	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
10	Friis	Friis	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	C	C	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
13	Worning	Worning	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	P	P	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Krogh	Krogh	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
17	A	A	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Brunak	Brunak	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	S.	S.	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	2001	2001	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3399
# text = Genome organisation and chromatin structure in Escherichia coli .
1	Genome	genome organisation and chromatin	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	organisation	genome organisation and chromatin	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
3	and	genome organisation and chromatin	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	chromatin	genome organisation and chromatin	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	structure	structurer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	in	in	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
7	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	coli	coli	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3400
# text = Biochimie 83 :
1	Biochimie	biochimie	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	83	83	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3401
# text = 201 - 212 .
1	201	201	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	201 - 212	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	212	212	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3402
# text = Valens M , Penaud S , Rossignol M , Cornet F , Boccard F. 2004 .
1	Valens	Valens	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	M	M	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	Penaud	Penaud	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	S	S	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Rossignol	Rossignol	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	M	M	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Cornet	Cornet	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	F	F	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Boccard	Boccard	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
14	F.	F.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	2004	2004	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3403
# text = Macrodomain organization of the Escherichia coli chromosome .
1	Macrodomain	macrodomain organization of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	organization	macrodomain organization of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	of	macrodomain organization of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	the	macrodomain organization of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	coli	macrodomain organization of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	chromosome	macrodomain organization of the escherichia coli chromosome	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3404
# text = EMBO J. 23 :
1	EMBO	embo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J.	J.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	23	23	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3405
# text = 4330 - 4341 .
1	4330	4330	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	4330 - 4341	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	4341	4341	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3406
# text = van Noort J , Verbrugge S , Goosen N , Dekker C , Dame RT. 2004 .
1	van	van	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
2	Noort	Noort	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	Verbrugge	Verbrugge	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	S	S	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
8	Goosen	Goosen	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	N	N	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
11	Dekker	Dekker	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	C	C	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
14	Dame	Dame	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	RT.	RT.	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	2004	2004	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3407
# text = Dual architectural roles of HU :
1	Dual	dual architectural roles of hu	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	architectural	dual architectural roles of hu	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	roles	dual architectural roles of hu	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	of	dual architectural roles of hu	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	HU	HU	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	:	:	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3408
# text = formation of flexible hinges and rigid filaments .
1	formation	formation of flexible hinges and rigid filaments	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	of	formation of flexible hinges and rigid filaments	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	flexible	formation of flexible hinges and rigid filaments	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	hinges	formation of flexible hinges and rigid filaments	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	and	formation of flexible hinges and rigid filaments	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	rigid	formation of flexible hinges and rigid filaments	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	filaments	formation of flexible hinges and rigid filaments	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3409
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3410
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3411
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3412
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3413
# text = U.S.A 101 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	101	101	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3414
# text = 6969 - 6974 .
1	6969	6969	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	6969 - 6974	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	6974	6974	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3415
# text = van Workum M , van Dooren SJ , Oldenburg N , Molenaar D , Jensen PR , Snoep JL , Westerhoff HV .
1	van	van	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Workum	Workum	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	M	M	_	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
5	van	van	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	Dooren	Dooren	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	SJ	SJ	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
9	Oldenburg	Oldenburg	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	N	N	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
12	Molenaar	Molenaar	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	D	D	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	Jensen	Jensen	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	PR	PR	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
18	Snoep	Snoep	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	JL	JL	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
21	Westerhoff	Westerhoff	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	HV	HV	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
23	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3416
# text = 1996 .
1	1996	1996	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3417
# text = DNA supercoiling depends on the phosphorylation potential in Escherichia coli .
1	DNA	dna supercoiling depends on the phosphorylation potential in escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	supercoiling	dna supercoiling depends on the phosphorylation potential in escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
3	depends	dna supercoiling depends on the phosphorylation potential in escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
4	on	dna supercoiling depends on the phosphorylation potential in escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
5	the	dna supercoiling depends on the phosphorylation potential in escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
6	phosphorylation	dna supercoiling depends on the phosphorylation potential in escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
7	potential	dna supercoiling depends on the phosphorylation potential in escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
8	in	dna supercoiling depends on the phosphorylation potential in escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
9	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	coli	dna supercoiling depends on the phosphorylation potential in escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3418
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3419
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3420
# text = 20 :
1	20	20	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3421
# text = 351 - 360 .
1	351	351	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	351 - 360	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	360	360	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3422
# text = Vasi F , Travisano M , Lenski RE. 1994 .
1	Vasi	Vasi	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	F	F	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Travisano	Travisano	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	M	M	_	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Lenski	Lenski	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	RE.	RE.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1994	1994	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3423
# text = Long-term experimental evolution in Escherichia coli .
1	Long-term	long	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	experimental	experimental	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	evolution	evolution	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	in	in	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
5	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	coli	coli	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3424
# text = II . Changes in life-history traits during adaptation to a seasonal environment .
1	II	ii	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	Changes	Changes	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	in	in	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	life-history	lice	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	traits	traire	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
7	during	during adaptation to a seasonal environment	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
8	adaptation	during adaptation to a seasonal environment	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
9	to	during adaptation to a seasonal environment	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
10	a	during adaptation to a seasonal environment	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
11	seasonal	during adaptation to a seasonal environment	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	environment	during adaptation to a seasonal environment	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3425
# text = Am .
1	Am	Am	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3426
# text = Nat .
1	Nat	Nat	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3427
# text = 144 :
1	144	144	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3428
# text = 432 - 456 .
1	432	432	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	432 - 456	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	456	456	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3429
# text = Walker KA , Atkins CL , Osuna R. 1999 .
1	Walker	walker	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	KA	KA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Atkins	Atkins	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	CL	CL	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Osuna	Osuna	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	R.	R.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1999	1999	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3430
# text = Functional determinants of the
1	Functional	functional determinants of the	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	determinants	functional determinants of the	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	of	functional determinants of the	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	the	functional determinants of the	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3431
# text = Escherichia coli fis promoter :
1	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	coli	coli	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	promoter	pro-	_+V	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	:	:	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3432
# text = roles of - 35 ,
1	roles	roles of	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	of	roles of	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	-	-	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	35	35	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3433
# text = - 10 , and transcription initiation regions in the response to stringent control and growth phase-dependent regulation .
1	-	-	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
2	10	10	NUM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	and	and	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	transcription	transcription	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	initiation	initiation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	regions	région	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	in	in	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	the	the response to stringent control and growth phase-dependent regulation	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
10	response	the response to stringent control and growth phase-dependent regulation	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
11	to	the response to stringent control and growth phase-dependent regulation	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
12	stringent	the response to stringent control and growth phase-dependent regulation	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
13	control	the response to stringent control and growth phase-dependent regulation	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
14	and	the response to stringent control and growth phase-dependent regulation	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
15	growth	the response to stringent control and growth phase-dependent regulation	NOM	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
16	phase-dependent	the response to stringent control and growth phase-dependent regulation	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	regulation	the response to stringent control and growth phase-dependent regulation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3434
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3435
# text = 181 :
1	181	181	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3436
# text = 1269 - 1280 .
1	1269	1269	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1269 - 1280	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1280	1280	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3437
# text = Walker KA , Mallik P , Pratt TS , Osuna R. 2004 .
1	Walker	walker	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	KA	KA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Mallik	Mallik	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	P	P	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Pratt	Pratt	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	TS	TS	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Osuna	Osuna	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	R.	R.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	2004	2004	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3438
# text = The Escherichia coli fis promoter is regulated by changes in the levels of its transcription initiation nucleotide CTP .
1	The	the escherichia coli fis promoter is regulated	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	coli	the escherichia coli fis promoter is regulated	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	fis	the escherichia coli fis promoter is regulated	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	promoter	the escherichia coli fis promoter is regulated	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	is	the escherichia coli fis promoter is regulated	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	regulated	the escherichia coli fis promoter is regulated	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	by	by	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	changes	changes	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	in	in	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
11	the	the levels of its	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
12	levels	the levels of its	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
13	of	the levels of its	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	its	the levels of its	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
15	transcription	transcription	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	initiation	initiation	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	nucleotide	nucléotide	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	CTP	CTP	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3439
# text = J. Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3440
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3441
# text = 279 :
1	279	279	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3442
# text = 50818 - 50828 .
1	50818	50818	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	50818 - 50828	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	50828	50828	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3443
# text = Wang Q , Mordukhova EA , Edwards AL , Rybenkov VV. 2006 .
1	Wang	wang	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Q	Q	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Mordukhova	Mordukhova	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	EA	EA	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	ea , edwards al	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Edwards	Edwards	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	AL	AL	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Rybenkov	Rybenkov	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
11	VV.	VV.	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	2006	2006	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3444
# text = Chromosome condensation in the absence of the non-SMC subunits of MukBEF .
1	Chromosome	chromosome	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	condensation	condensation	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	in	in	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	the	the absence of the non-smc subunits of mukbef	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
5	absence	the absence of the non-smc subunits of mukbef	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
6	of	the absence of the non-smc subunits of mukbef	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
7	the	the absence of the non-smc subunits of mukbef	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
8	non-SMC	the absence of the non-smc subunits of mukbef	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
9	subunits	the absence of the non-smc subunits of mukbef	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
10	of	the absence of the non-smc subunits of mukbef	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	MukBEF	MukBEF	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3445
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3446
# text = 188 :
1	188	188	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3447
# text = 4431 - 4441 .
1	4431	4431	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	4431 - 4441	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	4441	4441	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3448
# text = Weinstein-Fischer D , Elgrably-Weiss M , Altuvia S. 2000 .
1	Weinstein-Fischer	Weinstein-Fischer	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	D	D	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Elgrably-Weiss	Elgrably-Weiss	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	M	M	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Altuvia	Altuvia	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	S.	S.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2000	2000	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3449
# text = Escherichia coli response to hydrogen peroxide :
1	Escherichia	escherichia coli response to hydrogen peroxide	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	coli	escherichia coli response to hydrogen peroxide	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	response	escherichia coli response to hydrogen peroxide	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	to	escherichia coli response to hydrogen peroxide	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	hydrogen	escherichia coli response to hydrogen peroxide	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	peroxide	escherichia coli response to hydrogen peroxide	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	:	:	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3450
# text = a role for DNA supercoiling , topoisomerase I and Fis .
1	a	a role for dna supercoiling	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	role	a role for dna supercoiling	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	for	a role for dna supercoiling	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	DNA	DNA	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	supercoiling	a role for dna supercoiling	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	topoisomerase	topoisomerase i and fis	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
8	I	I	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
9	and	topoisomerase i and fis	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	Fis	Fis	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3451
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3452
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3453
# text = 35 :
1	35	35	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3454
# text = 1413 - 1420 .
1	1413	1413	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1413 - 1420	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1420	1420	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3455
# text = Weitao T , Nordstrom K , Dasgupta S. 1999 .
1	Weitao	Weitao	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	T	T	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Nordstrom	Nordstrom	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	K	K	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Dasgupta	Dasgupta	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	S.	S.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1999	1999	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3456
# text = Mutual suppression of mukB and seqA phenotypes might arise from their opposing influences on the Escherichia coli nucleoid structure .
1	Mutual	mutual suppression of mukb and seqa phenotypes might arise from their opposing influences on the escherichia coli nucleoid structure	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
2	suppression	mutual suppression of mukb and seqa phenotypes might arise from their opposing influences on the escherichia coli nucleoid structure	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
3	of	mutual suppression of mukb and seqa phenotypes might arise from their opposing influences on the escherichia coli nucleoid structure	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
4	mukB	mutual suppression of mukb and seqa phenotypes might arise from their opposing influences on the escherichia coli nucleoid structure	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
5	and	mutual suppression of mukb and seqa phenotypes might arise from their opposing influences on the escherichia coli nucleoid structure	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
6	seqA	mutual suppression of mukb and seqa phenotypes might arise from their opposing influences on the escherichia coli nucleoid structure	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
7	phenotypes	mutual suppression of mukb and seqa phenotypes might arise from their opposing influences on the escherichia coli nucleoid structure	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
8	might	mutual suppression of mukb and seqa phenotypes might arise from their opposing influences on the escherichia coli nucleoid structure	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
9	arise	mutual suppression of mukb and seqa phenotypes might arise from their opposing influences on the escherichia coli nucleoid structure	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
10	from	mutual suppression of mukb and seqa phenotypes might arise from their opposing influences on the escherichia coli nucleoid structure	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
11	their	mutual suppression of mukb and seqa phenotypes might arise from their opposing influences on the escherichia coli nucleoid structure	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
12	opposing	mutual suppression of mukb and seqa phenotypes might arise from their opposing influences on the escherichia coli nucleoid structure	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
13	influences	mutual suppression of mukb and seqa phenotypes might arise from their opposing influences on the escherichia coli nucleoid structure	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
14	on	mutual suppression of mukb and seqa phenotypes might arise from their opposing influences on the escherichia coli nucleoid structure	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
15	the	mutual suppression of mukb and seqa phenotypes might arise from their opposing influences on the escherichia coli nucleoid structure	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
16	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
17	coli	mutual suppression of mukb and seqa phenotypes might arise from their opposing influences on the escherichia coli nucleoid structure	NOM	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
18	nucleoid	mutual suppression of mukb and seqa phenotypes might arise from their opposing influences on the escherichia coli nucleoid structure	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	structure	mutual suppression of mukb and seqa phenotypes might arise from their opposing influences on the escherichia coli nucleoid structure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3457
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3458
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3459
# text = 34 :
1	34	34	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3460
# text = 157 - 168 .
1	157	157	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	157 - 168	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	168	168	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3461
# text = Weitao T , Nordstrom K , Dasgupta S. 2000 .
1	Weitao	Weitao	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	T	T	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Nordstrom	Nordstrom	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	K	K	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Dasgupta	Dasgupta	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	S.	S.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2000	2000	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3462
# text = Escherichia coli cell cycle control genes affect chromosome superhelicity .
1	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	coli	coli	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	cell	cell	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	cycle	cycle	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	control	contrôler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	genes	gêné	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	affect	affect	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	chromosome	chromosome	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	superhelicity	superhelicity	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3463
# text = EMBO Rep .
1	EMBO	EMBO	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Rep	Rep	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3464
# text = 1 :
1	1	1	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3465
# text = 494 - 499 .
1	494	494	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	494 - 499	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	499	499	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3466
# text = West SC. 1997 .
1	West	west	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	SC.	SC.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	1997	1997	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3467
# text = Processing of recombination intermediates by the
1	Processing	processing of recombination intermediates by the	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	of	processing of recombination intermediates by the	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	recombination	processing of recombination intermediates by the	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	intermediates	processing of recombination intermediates by the	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	by	processing of recombination intermediates by the	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	the	processing of recombination intermediates by the	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3468
# text = RuvABC proteins .
1	RuvABC	RuvABC	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	proteins	pro-	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3469
# text = Annu .
1	Annu	Annu	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3470
# text = Rev .
1	Rev	Rev	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3471
# text = Genet .
1	Genet	genet	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3472
# text = 31 :
1	31	31	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3473
# text = 213 - 244 .
1	213	213	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	213 - 244	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	244	244	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3474
# text = Wijker JE , Jensen PR , Snoep JL , Vaz GA , Guiral M , Jongsma AP , de Waal A , Hoving S , van
1	Wijker	Wijker	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	JE	JE	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	Jensen	Jensen	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	PR	PR	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
7	Snoep	Snoep	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	JL	JL	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
10	Vaz	Vaz	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	GA	GA	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
13	Guiral	Guiral	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	M	M	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
16	Jongsma	Jongsma	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	AP	AP	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
20	Waal	Waal	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	A	A	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
23	Hoving	Hoving	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	S	S	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	van	van	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3475
# text = Dooren S , van der Weijden CC. 1995 .
1	Dooren	Dooren	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	S	S	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
4	van	van	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	der	der	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	Weijden	Weijden	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	CC.	CC.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	1995	1995	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3476
# text = Energy , and DNA structure in the living cell .
1	Energy	energy	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	and	and dna	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	DNA	DNA	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	structure	structurer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	in	in	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	the	thé	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	living	living	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	cell	cell	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3477
# text = Biophys .
1	Biophys	Biophys	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3478
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3479
# text = 55 :
1	55	55	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3480
# text = 153 - 165 .
1	153	153	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	153 - 165	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	165	165	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3481
# text = Willenbrock H , Ussery DW. 2004 .
1	Willenbrock	Willenbrock	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	H	H	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Ussery	Ussery	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	DW.	DW.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2004	2004	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3482
# text = Chromatin architecture and gene expression in Escherichia coli .
1	Chromatin	chromatin architecture and gene	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	architecture	chromatin architecture and gene	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	and	chromatin architecture and gene	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	gene	chromatin architecture and gene	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	expression	expression	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	in	in	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	Escherichia	Escherichia	_	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	coli	coli	_	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3483
# text = Genome Biol .
1	Genome	génome	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3484
# text = 5 :
1	5	5	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3485
# text = 252 .
1	252	252	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3486
# text = Wilson RL , Libby SJ , Freet AM , Boddicker JD , Fahlen TF , Jones BD. 2001 .
1	Wilson	Wilson	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	RL	RL	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Libby	Libby	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	SJ	SJ	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Freet	Freet	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	AM	AM	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Boddicker	Boddicker	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	JD	JD	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Fahlen	Fahlen	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
14	TF	TF	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Jones	Jones	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	BD.	BD.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	2001	2001	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3487
# text = Fis , a DNA nucleoid-associated protein , is involved in Salmonella typhimurium SPI- 1 invasion gene expression .
1	Fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
3	a	avoir	VRB	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	DNA	DNA	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	nucleoid-associated	nucleoid-associated	VNF	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	protein	protéine	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
8	is	is involved in salmonella typhimurium spi-	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
9	involved	is involved in salmonella typhimurium spi-	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
10	in	is involved in salmonella typhimurium spi-	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
11	Salmonella	Salmonella	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
12	typhimurium	is involved in salmonella typhimurium spi-	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	SPI-	SPI-	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
14	1	1	NUM	_	_	1	spe	_	_	_	_	_
15	invasion	faire invasion	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
16	gene	gêne	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	expression	expression	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3488
# text = Mol .
1	Mol	mol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3489
# text = Microbiol .
1	Microbiol	microbiol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3490
# text = 39 :
1	39	39	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3491
# text = 79 - 88 .
1	79	79	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	-	79 - 88 .	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	88	88	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	.	79 - 88 .	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3492
# text = Wolf SG , Frenkiel D , Arad T , Finkel SE , Kolter R , Minsky A. 1999 .
1	Wolf	Wolf	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	SG	SG	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Frenkiel	Frenkiel	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	D	D	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Arad	Arad	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	T	T	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
10	Finkel	Finkel	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
11	SE	SE	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
13	Kolter	Kolter	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	R	R	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Minsky	Minsky	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
17	A.	A.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	1999	1999	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3493
# text = DNA protection by stress-induced stress-induced biocrystallization .
1	DNA	DNA	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	protection	protection	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	by	by	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	stress-induced	stress-induced	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	stress-induced	indu	A+V	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	biocrystallization	biocrystallization	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3494
# text = Nature
1	Nature	nature	ADV	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3495
# text = 400 :
1	400	400	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3496
# text = 83 - 85 .
1	83	83	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	-	83 - 85 .	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	85	85	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	.	83 - 85 .	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3497
# text = Woods R , Schneider D , Winkworth CL , Riley MA , Lenski RE. 2006 .
1	Woods	Woods	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	R	R	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Schneider	Schneider	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	D	D	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Winkworth	Winkworth	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	CL	CL	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Riley	Riley	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	MA	MA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Lenski	Lenski	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	RE.	RE.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	2006	2006	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3498
# text = Tests of parallel molecular evolution in a long-term experiment with Escherichia coli .
1	Tests	tests of parallel molecular	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	of	tests of parallel molecular	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
3	parallel	tests of parallel molecular	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	molecular	tests of parallel molecular	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	evolution	évolution	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	in	in	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	a	avoir	VRB	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	long-term	long-term experiment with escherichia coli	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
9	experiment	long-term experiment with escherichia coli	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
10	with	long-term experiment with escherichia coli	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
11	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	coli	long-term experiment with escherichia coli	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3499
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3500
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3501
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3502
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3503
# text = U.S.A 103 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	103	103	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3504
# text = 9107 - 9112 .
1	9107	9107	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	9107 - 9112	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	9112	9112	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3505
# text = Worcel A , Burgi E. 1972 .
1	Worcel	Worcel	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	A	A	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Burgi	Burgi	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	E.	E.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1972	1972	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3506
# text = On the structure of the folded chromosome of Escherichia coli .
1	On	on the structure of the folded chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	the	on the structure of the folded chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
3	structure	on the structure of the folded chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
4	of	on the structure of the folded chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
5	the	on the structure of the folded chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
6	folded	on the structure of the folded chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
7	chromosome	on the structure of the folded chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
8	of	on the structure of the folded chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
9	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	coli	on the structure of the folded chromosome of escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3507
# text = J. Mol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Mol	Mol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3508
# text = Biol .
1	Biol	biol	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3509
# text = 71 :
1	71	71	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3510
# text = 127 - 147 .
1	127	127	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	127 - 147	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	147	147	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3511
# text = Wu CW , Goldthwait DA. 1969 .
1	Wu	Wu	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	CW	CW	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Goldthwait	Goldthwait	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	DA.	DA.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1969	1969	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3512
# text = Studies of nucleotide binding to the ribonucleic acid polymerase by equilibrium dialysis .
1	Studies	studies of nucleotide binding to the ribonucleic acid polymerase by equilibrium dialysis	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	of	studies of nucleotide binding to the ribonucleic acid polymerase by equilibrium dialysis	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
3	nucleotide	studies of nucleotide binding to the ribonucleic acid polymerase by equilibrium dialysis	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
4	binding	studies of nucleotide binding to the ribonucleic acid polymerase by equilibrium dialysis	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
5	to	studies of nucleotide binding to the ribonucleic acid polymerase by equilibrium dialysis	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
6	the	studies of nucleotide binding to the ribonucleic acid polymerase by equilibrium dialysis	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	ribonucleic	studies of nucleotide binding to the ribonucleic acid polymerase by equilibrium dialysis	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	acid	studies of nucleotide binding to the ribonucleic acid polymerase by equilibrium dialysis	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	polymerase	studies of nucleotide binding to the ribonucleic acid polymerase by equilibrium dialysis	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	by	studies of nucleotide binding to the ribonucleic acid polymerase by equilibrium dialysis	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	equilibrium	studies of nucleotide binding to the ribonucleic acid polymerase by equilibrium dialysis	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	dialysis	studies of nucleotide binding to the ribonucleic acid polymerase by equilibrium dialysis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3513
# text = Biochemistry
1	Biochemistry	biochemistry	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3514
# text = 8 :
1	8	8	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3515
# text = 4450 - 4464 .
1	4450	4450	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	4450 - 4464	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	4464	4464	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3516
# text = Xu J , Johnson RC. 1995a .
1	Xu	Xu	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Johnson	Johnson	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	RC.	RC.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1995a	1995a	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3517
# text = aldB , an
1	aldB	aldB	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	an	an	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3518
# text = RpoS-dependent gene in Escherichia coli encoding an aldehyde dehydrogenase that is repressed by Fis and activated by Crp .
1	RpoS-dependent	rpos-dependent gene in escherichia coli encoding an aldehyde dehydrogenase that is repressed by fis and activated by crp	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
2	gene	rpos-dependent gene in escherichia coli encoding an aldehyde dehydrogenase that is repressed by fis and activated by crp	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
3	in	rpos-dependent gene in escherichia coli encoding an aldehyde dehydrogenase that is repressed by fis and activated by crp	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
4	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
5	coli	rpos-dependent gene in escherichia coli encoding an aldehyde dehydrogenase that is repressed by fis and activated by crp	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
6	encoding	rpos-dependent gene in escherichia coli encoding an aldehyde dehydrogenase that is repressed by fis and activated by crp	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
7	an	rpos-dependent gene in escherichia coli encoding an aldehyde dehydrogenase that is repressed by fis and activated by crp	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
8	aldehyde	rpos-dependent gene in escherichia coli encoding an aldehyde dehydrogenase that is repressed by fis and activated by crp	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
9	dehydrogenase	rpos-dependent gene in escherichia coli encoding an aldehyde dehydrogenase that is repressed by fis and activated by crp	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
10	that	rpos-dependent gene in escherichia coli encoding an aldehyde dehydrogenase that is repressed by fis and activated by crp	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
11	is	rpos-dependent gene in escherichia coli encoding an aldehyde dehydrogenase that is repressed by fis and activated by crp	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
12	repressed	rpos-dependent gene in escherichia coli encoding an aldehyde dehydrogenase that is repressed by fis and activated by crp	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
13	by	rpos-dependent gene in escherichia coli encoding an aldehyde dehydrogenase that is repressed by fis and activated by crp	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
14	Fis	Fis	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
15	and	rpos-dependent gene in escherichia coli encoding an aldehyde dehydrogenase that is repressed by fis and activated by crp	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
16	activated	rpos-dependent gene in escherichia coli encoding an aldehyde dehydrogenase that is repressed by fis and activated by crp	NOM	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
17	by	rpos-dependent gene in escherichia coli encoding an aldehyde dehydrogenase that is repressed by fis and activated by crp	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	Crp	Crp	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3519
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3520
# text = 177 :
1	177	177	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3521
# text = 3166 - 3175 .
1	3166	3166	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	3166 - 3175	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	3175	3175	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3522
# text = Xu J , Johnson RC. 1995b .
1	Xu	Xu	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Johnson	Johnson	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	RC.	RC.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1995b	1995b	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3523
# text = Identification of genes negatively regulated by Fis :
1	Identification	identification of genes negatively regulated by fis	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	of	identification of genes negatively regulated by fis	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	genes	identification of genes negatively regulated by fis	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	negatively	identification of genes negatively regulated by fis	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	regulated	identification of genes negatively regulated by fis	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	by	identification of genes negatively regulated by fis	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	Fis	Fis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	:	:	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3524
# text = Fis and RpoS comodulate growth-phase-dependent gene expression in Escherichia coli .
1	Fis	fis and rpos comodulate growth-phase-dependent gene	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	and	fis and rpos comodulate growth-phase-dependent gene	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	RpoS	RpoS	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	comodulate	fis and rpos comodulate growth-phase-dependent gene	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	growth-phase-dependent	fis and rpos comodulate growth-phase-dependent gene	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	gene	fis and rpos comodulate growth-phase-dependent gene	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	expression	expression	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	in	in	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	Escherichia	Escherichia	_	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	coli	coli	_	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3525
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3526
# text = 177 :
1	177	177	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3527
# text = 938 - 947 .
1	938	938	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	938 - 947	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	947	947	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3528
# text = Yamazoe M , Onogi T , Sunako Y , Niki H , Yamanaka K , Ichimura T , Hiraga S. 1999 .
1	Yamazoe	Yamazoe	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	M	M	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
4	Onogi	Onogi	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	T	T	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
7	Sunako	Sunako	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	Y	Y	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
10	Niki	Niki	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	H	H	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
13	Yamanaka	Yamanaka	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
14	K	K	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
16	Ichimura	Ichimura	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	T	T	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Hiraga	Hiraga	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
20	S.	S.	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	1999	1999	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3529
# text = Complex formation of MukB , MukE and MukF proteins involved in chromosome partitioning in Escherichia coli .
1	Complex	complex formation of mukb	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
2	formation	complex formation of mukb	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
3	of	complex formation of mukb	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	MukB	MukB	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
6	MukE	MukE	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
7	and	muke and mukf proteins involved	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
8	MukF	MukF	NOM	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
9	proteins	muke and mukf proteins involved	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	involved	muke and mukf proteins involved	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	in	in	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	chromosome	chromosome	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	partitioning	partition	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	in	in	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	coli	coli	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3530
# text = EMBO J .
1	EMBO	embo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3531
# text = 18 :
1	18	18	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3532
# text = 5873 - 5884 .
1	5873	5873	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	5873 - 5884	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	5884	5884	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3533
# text = Yang SW , Nash HA. 1995 .
1	Yang	Yang	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	SW	SW	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Nash	Nash	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	HA.	HA.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1995	1995	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3534
# text = Comparison of protein binding to DNA in vivo and in vitro :
1	Comparison	comparison of protein binding to dna	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
2	of	comparison of protein binding to dna	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
3	protein	comparison of protein binding to dna	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
4	binding	comparison of protein binding to dna	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
5	to	comparison of protein binding to dna	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	DNA	DNA	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
7	in	in	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	vivo	oui	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	and	and	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	in	in	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	vitro	vitrer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	:	:	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3535
# text = defining an effective intracellular target .
1	defining	défi	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	an	an	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	effective	effectif	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	intracellular	intra-	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	target	target	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3536
# text = EMBO J. 14 :
1	EMBO	embo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J.	J.	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	14	14	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3537
# text = 6292 - 6300 .
1	6292	6292	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	6292 - 6300	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	6300	6300	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3538
# text = Yang Y , Ames GF. 1988 .
1	Yang	yang	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Y	Y	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Ames	Ames	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	GF.	GF.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1988	1988	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3539
# text = DNA gyrase binds to the family of prokaryotic repetitive extragenic palindromic sequences .
1	DNA	dna gyrase binds to the family of prokaryotic repetitive extragenic palindromic sequences	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	gyrase	dna gyrase binds to the family of prokaryotic repetitive extragenic palindromic sequences	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
3	binds	dna gyrase binds to the family of prokaryotic repetitive extragenic palindromic sequences	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
4	to	dna gyrase binds to the family of prokaryotic repetitive extragenic palindromic sequences	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
5	the	dna gyrase binds to the family of prokaryotic repetitive extragenic palindromic sequences	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
6	family	dna gyrase binds to the family of prokaryotic repetitive extragenic palindromic sequences	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	of	dna gyrase binds to the family of prokaryotic repetitive extragenic palindromic sequences	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	prokaryotic	dna gyrase binds to the family of prokaryotic repetitive extragenic palindromic sequences	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	repetitive	dna gyrase binds to the family of prokaryotic repetitive extragenic palindromic sequences	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	extragenic	dna gyrase binds to the family of prokaryotic repetitive extragenic palindromic sequences	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	palindromic	dna gyrase binds to the family of prokaryotic repetitive extragenic palindromic sequences	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	sequences	dna gyrase binds to the family of prokaryotic repetitive extragenic palindromic sequences	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3540
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3541
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3542
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3543
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3544
# text = U.S.A
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3545
# text = 85 :
1	85	85	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3546
# text = 8850 - 8854 .
1	8850	8850	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	8850 - 8854	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	8854	8854	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3547
# text = Yoshida M , Kashiwagi K , Shigemasa A , Taniguchi S , Yamamoto K , Makinoshima H , Ishihama A , Igarashi K. 2004 .
1	Yoshida	yoshida	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	M	M	_	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
4	Kashiwagi	Kashiwagi	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	K	K	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
7	Shigemasa	Shigemasa	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	A	A	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
10	Taniguchi	Taniguchi	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	S	S	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
13	Yamamoto	Yamamoto	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	K	K	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
16	Makinoshima	Makinoshima	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	H	H	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
19	Ishihama	Ishihama	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
20	A	A	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
22	Igarashi	Igarashi	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
23	K.	K.	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
24	2004	2004	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3548
# text = A unifying model for the role of polyamines in bacterial cell growth , the polyamine modulon .
1	A	a unifying model for the role of	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	unifying	a unifying model for the role of	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	model	a unifying model for the role of	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	for	a unifying model for the role of	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	the	a unifying model for the role of	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	role	a unifying model for the role of	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	of	a unifying model for the role of	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	polyamines	polyamine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	in	in	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
10	bacterial	bacterial cell growth	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
11	cell	bacterial cell growth	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	growth	bacterial cell growth	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
14	the	the polyamine modulon	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
15	polyamine	the polyamine modulon	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	modulon	the polyamine modulon	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3549
# text = J. Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3550
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3551
# text = 279 :
1	279	279	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3552
# text = 46008 - 46013 .
1	46008	46008	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	46008 - 46013	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	46013	46013	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3553
# text = Yoshida T , Qin L , Egger LA , Inouye M. 2006 .
1	Yoshida	yoshida	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	T	T	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
4	Qin	Qin	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	L	L	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
7	Egger	Egger	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	LA	LA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
10	Inouye	Inouye	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	M.	monsieur	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	2006	2006	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3554
# text = Transcription regulation of ompF and ompC by a single transcription factor , OmpR. J. Biol .
1	Transcription	transcription regulation of ompf and	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	regulation	transcription regulation of ompf and	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
3	of	transcription regulation of ompf and	NOM	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
4	ompF	transcription regulation of ompf and	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	and	transcription regulation of ompf and	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	ompC	ompC	VPR	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	by	By	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	a	avoir	VRB	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	single	single	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	transcription	transcription	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	factor	factor	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	OmpR.	OmpR.	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
14	J.	J.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	Biol	Biol	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3555
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3556
# text = 281 :
1	281	281	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3557
# text = 17114 - 17123 .
1	17114	17114	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	17114 - 17123	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	17123	17123	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3558
# text = Yuan HS , Finkel SE , Feng JA , Kaczor-Grzeskowiak M , Johnson RC , Dickerson RE. 1991 .
1	Yuan	Yuan	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	HS	HS	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
4	Finkel	Finkel	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	SE	SE	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	Feng	Feng	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	JA	JA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
10	Kaczor-Grzeskowiak	Kaczor-Grzeskowiak	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	M	M	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Johnson	Johnson	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
14	RC	RC	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	Dickerson	Dickerson	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	RE.	RE.	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	1991	1991	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3559
# text = The molecular structure of wild-type and a mutant Fis :
1	The	the molecular structure of wild-type and	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
2	molecular	the molecular structure of wild-type and	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
3	structure	the molecular structure of wild-type and	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
4	of	the molecular structure of wild-type and	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
5	wild-type	the molecular structure of wild-type and	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	and	the molecular structure of wild-type and	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
7	a	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	mutant	mutant	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	Fis	Fis	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	:	:	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3560
# text = relationship between mutational changes and recombinational enhancer function or DNA binding .
1	relationship	relationship between mutational changes and recombinational enhancer function or dna binding	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	between	relationship between mutational changes and recombinational enhancer function or dna binding	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
3	mutational	relationship between mutational changes and recombinational enhancer function or dna binding	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
4	changes	relationship between mutational changes and recombinational enhancer function or dna binding	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
5	and	relationship between mutational changes and recombinational enhancer function or dna binding	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
6	recombinational	relationship between mutational changes and recombinational enhancer function or dna binding	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
7	enhancer	relationship between mutational changes and recombinational enhancer function or dna binding	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
8	function	relationship between mutational changes and recombinational enhancer function or dna binding	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
9	or	relationship between mutational changes and recombinational enhancer function or dna binding	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
10	DNA	DNA	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	binding	relationship between mutational changes and recombinational enhancer function or dna binding	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3561
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3562
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3563
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3564
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3565
# text = U.S.A 88 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	88	88	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3566
# text = 9558 - 9562 .
1	9558	9558	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	9558 - 9562	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	9562	9562	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3567
# text = Zacharias M , Goringer HU , Wagner R. 1992 .
1	Zacharias	Zacharias	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	M	M	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Goringer	Goringer	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	HU	HU	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Wagner	Wagner	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
8	R.	R.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1992	1992	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3568
# text = Analysis of the
1	Analysis	analysis of the	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	of	analysis of the	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	the	analysis of the	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3569
# text = Fis-dependent and Fis-independent transcription activation mechanisms of the Escherichia coli ribosomal RNA P1 promoter .
1	Fis-dependent	fis-dependent and fis-independent transcription activation mechanisms of the escherichia coli ribosomal rna p1 promoter	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
2	and	fis-dependent and fis-independent transcription activation mechanisms of the escherichia coli ribosomal rna p1 promoter	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
3	Fis-independent	Fis-independent	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
4	transcription	fis-dependent and fis-independent transcription activation mechanisms of the escherichia coli ribosomal rna p1 promoter	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
5	activation	fis-dependent and fis-independent transcription activation mechanisms of the escherichia coli ribosomal rna p1 promoter	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
6	mechanisms	fis-dependent and fis-independent transcription activation mechanisms of the escherichia coli ribosomal rna p1 promoter	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
7	of	fis-dependent and fis-independent transcription activation mechanisms of the escherichia coli ribosomal rna p1 promoter	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
8	the	fis-dependent and fis-independent transcription activation mechanisms of the escherichia coli ribosomal rna p1 promoter	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
9	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
10	coli	fis-dependent and fis-independent transcription activation mechanisms of the escherichia coli ribosomal rna p1 promoter	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
11	ribosomal	fis-dependent and fis-independent transcription activation mechanisms of the escherichia coli ribosomal rna p1 promoter	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
12	RNA	RNA	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
13	P1	P1	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	promoter	fis-dependent and fis-independent transcription activation mechanisms of the escherichia coli ribosomal rna p1 promoter	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3570
# text = Biochemistry
1	Biochemistry	biochemistry	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3571
# text = 31 :
1	31	31	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3572
# text = 2621 - 2628 .
1	2621	2621	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	2621 - 2628	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	2628	2628	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3573
# text = Zambrano MM , Siegele DA , Almiron M , Tormo A , Kolter R. 1993 .
1	Zambrano	zambrano	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	MM	MM	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Siegele	Siegele	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	DA	DA	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Almiron	Almiron	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	M	M	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Tormo	Tormo	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	A	A	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Kolter	Kolter	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	R.	R.	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	1993	1993	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3574
# text = Microbial competition :
1	Microbial	Microbial	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	competition	competition	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3575
# text = Escherichia coli mutants that take over stationary phase cultures .
1	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	coli	coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	mutants	mutant	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	that	that take over stationary phase cultures	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	take	that take over stationary phase cultures	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
6	over	that take over stationary phase cultures	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
7	stationary	that take over stationary phase cultures	NOM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
8	phase	that take over stationary phase cultures	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	cultures	that take over stationary phase cultures	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3576
# text = Science 259 :
1	Science	science	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	259	259	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3577
# text = 1757 - 1760 .
1	1757	1757	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1757 - 1760	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1760	1760	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3578
# text = Zechiedrich EL , Khodursky AB , Cozzarelli NR. 1997 .
1	Zechiedrich	Zechiedrich	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	EL	EL	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
4	Khodursky	Khodursky	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	AB	AB	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	NR.	NR.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	1997	1997	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3579
# text = Topoisomerase IV , not gyrase , decatenates products of site-specific recombination in Escherichia coli .
1	Topoisomerase	topoisomerase	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	IV	IV	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	not	nô	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	gyrase	gyrase	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
7	decatenates	decatenates products of site-specific recombination in escherichia coli	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
8	products	decatenates products of site-specific recombination in escherichia coli	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
9	of	decatenates products of site-specific recombination in escherichia coli	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
10	site-specific	decatenates products of site-specific recombination in escherichia coli	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
11	recombination	decatenates products of site-specific recombination in escherichia coli	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
12	in	decatenates products of site-specific recombination in escherichia coli	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
13	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	coli	decatenates products of site-specific recombination in escherichia coli	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3580
# text = Genes Dev .
1	Genes	gêne	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Dev	Dev	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3581
# text = 11 :
1	11	11	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3582
# text = 2580 - 2592 .
1	2580	2580	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	2580 - 2592	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	2592	2592	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3583
# text = Zechiedrich EL , Khodursky AB , Bachellier S , Schneider R , Chen D , Lilley DM , Cozzarelli
1	Zechiedrich	Zechiedrich	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	EL	EL	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Khodursky	Khodursky	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	AB	AB	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Bachellier	Bachellier	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	S	S	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Schneider	Schneider	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	R	R	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
13	Chen	Chen	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	D	D	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
16	Lilley	Lilley	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	DM	DM	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Cozzarelli	Cozzarelli	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3584
# text = NR. 2000 .
1	NR.	NR.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	2000	2000	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3585
# text = Roles of topoisomerases in maintaining steady-state DNA supercoiling in Escherichia coli .
1	Roles	roles of topoisomerases in maintaining steady-state dna supercoiling in escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	of	roles of topoisomerases in maintaining steady-state dna supercoiling in escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
3	topoisomerases	roles of topoisomerases in maintaining steady-state dna supercoiling in escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
4	in	roles of topoisomerases in maintaining steady-state dna supercoiling in escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
5	maintaining	roles of topoisomerases in maintaining steady-state dna supercoiling in escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
6	steady-state	roles of topoisomerases in maintaining steady-state dna supercoiling in escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
7	DNA	DNA	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
8	supercoiling	roles of topoisomerases in maintaining steady-state dna supercoiling in escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
9	in	roles of topoisomerases in maintaining steady-state dna supercoiling in escherichia coli	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
10	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	coli	roles of topoisomerases in maintaining steady-state dna supercoiling in escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3586
# text = J. Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3587
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3588
# text = 275 :
1	275	275	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3589
# text = 8103 - 8113 .
1	8103	8103	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	8103 - 8113	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	8113	8113	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3590
# text = Zhang A , Rimsky S , Reaban ME , Buc H , Belfort M. 1996 .
1	Zhang	Zhang	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	A	A	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Rimsky	Rimsky	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	S	S	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Reaban	Reaban	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	ME	ME	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Buc	Buc	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
11	H	H	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
13	Belfort	Belfort	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	M.	monsieur	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	1996	1996	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3591
# text = Escherichia coli protein analogs StpA and H-NS :
1	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	coli	coli	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	protein	protéiner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	analogs	analogs stpa and h-ns	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	StpA	StpA	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	and	analogs stpa and h-ns	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	H-NS	H-NS	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	:	:	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3592
# text = regulatory loops , similar and disparate effects on nucleic acid dynamics .
1	regulatory	réguler	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	loops	loup	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
4	similar	similar and disparate effects on nucleic acid dynamics	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
5	and	similar and disparate effects on nucleic acid dynamics	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
6	disparate	similar and disparate effects on nucleic acid dynamics	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
7	effects	similar and disparate effects on nucleic acid dynamics	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
8	on	similar and disparate effects on nucleic acid dynamics	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
9	nucleic	similar and disparate effects on nucleic acid dynamics	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
10	acid	similar and disparate effects on nucleic acid dynamics	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	dynamics	similar and disparate effects on nucleic acid dynamics	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3593
# text = EMBO J .
1	EMBO	embo	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	J	J	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3594
# text = 15 :
1	15	15	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3595
# text = 1340 - 1349 .
1	1340	1340	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	1340 - 1349	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	1349	1349	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3596
# text = Zhao G , Ceci P , Ilari A , Giangiacomo L , Laue TM , Chiancone E , Chasteen ND. 2002 .
1	Zhao	Zhao	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	G	G	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
4	Ceci	Ceci	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	P	P	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	Ilari	Ilari	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	A	A	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Giangiacomo	Giangiacomo	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
11	L	L	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
13	Laue	Laue	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	TM	TM	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
16	Chiancone	Chiancone	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	E	E	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	Chasteen	Chasteen	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
20	ND.	ND.	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	2002	2002	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3597
# text = Iron and hydrogen peroxide detoxification properties of DNA-binding protein from starved cells .
1	Iron	iron and hydrogen peroxide detoxification properties of dna-binding protein from starved cells	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	and	iron and hydrogen peroxide detoxification properties of dna-binding protein from starved cells	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
3	hydrogen	iron and hydrogen peroxide detoxification properties of dna-binding protein from starved cells	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
4	peroxide	iron and hydrogen peroxide detoxification properties of dna-binding protein from starved cells	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
5	detoxification	iron and hydrogen peroxide detoxification properties of dna-binding protein from starved cells	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
6	properties	iron and hydrogen peroxide detoxification properties of dna-binding protein from starved cells	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	of	iron and hydrogen peroxide detoxification properties of dna-binding protein from starved cells	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	DNA-binding	DNA-binding	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	protein	iron and hydrogen peroxide detoxification properties of dna-binding protein from starved cells	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	from	iron and hydrogen peroxide detoxification properties of dna-binding protein from starved cells	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	starved	iron and hydrogen peroxide detoxification properties of dna-binding protein from starved cells	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	cells	iron and hydrogen peroxide detoxification properties of dna-binding protein from starved cells	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3598
# text = A ferritin-like DNA-binding protein of Escherichia coli .
1	A	a ferritin-like dna-binding protein of escherichia coli	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	ferritin-like	a ferritin-like dna-binding protein of escherichia coli	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
3	DNA-binding	DNA-binding	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	protein	a ferritin-like dna-binding protein of escherichia coli	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	of	a ferritin-like dna-binding protein of escherichia coli	NOM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
6	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	coli	a ferritin-like dna-binding protein of escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3599
# text = J. Biol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Biol	Biol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3600
# text = Chem .
1	Chem	Chem	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3601
# text = 277 :
1	277	277	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3602
# text = 27689 - 27696 .
1	27689	27689	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	27689 - 27696	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	27696	27696	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3603
# text = Zhu Q , Pongpech P , DiGate RJ. 2001 .
1	Zhu	Zhu	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Q	Q	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Pongpech	Pongpech	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	P	P	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	DiGate	DiGate	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	RJ.	RJ.	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	2001	2001	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3604
# text = Type I topoisomerase activity is required for proper chromosomal segregation in Escherichia coli .
1	Type	type i topoisomerase activity is required for proper chromosomal segregation in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
2	I	I	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
3	topoisomerase	type i topoisomerase activity is required for proper chromosomal segregation in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
4	activity	type i topoisomerase activity is required for proper chromosomal segregation in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
5	is	type i topoisomerase activity is required for proper chromosomal segregation in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
6	required	type i topoisomerase activity is required for proper chromosomal segregation in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
7	for	type i topoisomerase activity is required for proper chromosomal segregation in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
8	proper	type i topoisomerase activity is required for proper chromosomal segregation in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
9	chromosomal	type i topoisomerase activity is required for proper chromosomal segregation in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
10	segregation	type i topoisomerase activity is required for proper chromosomal segregation in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
11	in	type i topoisomerase activity is required for proper chromosomal segregation in escherichia coli	NOM	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
12	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	coli	type i topoisomerase activity is required for proper chromosomal segregation in escherichia coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3605
# text = Proc .
1	Proc	Proc	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3606
# text = Natl .
1	Natl	Natl	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3607
# text = Acad .
1	Acad	Acad	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3608
# text = Sci .
1	Sci	Sci	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3609
# text = U.S.A 98 :
1	U.S.A	États-Unis d'Amérique	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	98	98	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3610
# text = 9766 - 9771 .
1	9766	9766	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	9766 - 9771	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	9771	9771	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3611
# text = Zinser ER , Kolter R. 1999 .
1	Zinser	Zinser	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	ER	ER	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Kolter	Kolter	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	R.	R.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	1999	1999	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3612
# text = Mutations enhancing amino acid catabolism confer a growth advantage in stationary phase .
1	Mutations	mutations enhancing amino acid catabolism confer a growth advantage in stationary phase	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	enhancing	mutations enhancing amino acid catabolism confer a growth advantage in stationary phase	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
3	amino	mutations enhancing amino acid catabolism confer a growth advantage in stationary phase	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
4	acid	mutations enhancing amino acid catabolism confer a growth advantage in stationary phase	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
5	catabolism	mutations enhancing amino acid catabolism confer a growth advantage in stationary phase	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
6	confer	mutations enhancing amino acid catabolism confer a growth advantage in stationary phase	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
7	a	mutations enhancing amino acid catabolism confer a growth advantage in stationary phase	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
8	growth	mutations enhancing amino acid catabolism confer a growth advantage in stationary phase	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
9	advantage	mutations enhancing amino acid catabolism confer a growth advantage in stationary phase	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
10	in	mutations enhancing amino acid catabolism confer a growth advantage in stationary phase	NOM	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
11	stationary	mutations enhancing amino acid catabolism confer a growth advantage in stationary phase	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	phase	mutations enhancing amino acid catabolism confer a growth advantage in stationary phase	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3613
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3614
# text = 181 :
1	181	181	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3615
# text = 5800 - 5807 .
1	5800	5800	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	5800 - 5807	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	5807	5807	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3616
# text = Zinser ER , Kolter R. 2000 .
1	Zinser	Zinser	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	ER	ER	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	Kolter	Kolter	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	R.	R.	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	2000	2000	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3617
# text = Prolonged stationary-phase incubation selects for lrp mutations in Escherichia coli K- 12 .
1	Prolonged	prolonged stationary-phase incubation selects for lrp	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	stationary-phase	prolonged stationary-phase incubation selects for lrp	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	incubation	prolonged stationary-phase incubation selects for lrp	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	selects	prolonged stationary-phase incubation selects for lrp	NOM	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	for	prolonged stationary-phase incubation selects for lrp	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	lrp	prolonged stationary-phase incubation selects for lrp	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	mutations	mutation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	in	in	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	Escherichia	Escherichia	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	coli	coli	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	K-	K-	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	12	12	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3618
# text = J. Bacteriol .
1	J.	J.	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	Bacteriol	Bacteriol	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3619
# text = 182 :
1	182	182	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3620
# text = 4361 - 4365 .
1	4361	4361	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	-	4361 - 4365	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	4365	4365	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3621
# text = Illustrations
1	Illustrations	illustration	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3622
# text = Figure 1 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3623
# text = Activité des différentes topoisomérases ( Corbett et Berger , 2004 )
1	Activité	activité	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	différentes	différent	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	topoisomérases	topoisomérase	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	(	(	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	Corbett	Corbett	NOM	_	_	4	parenth	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
8	Berger	Berger	NOM	_	_	6	para	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	2004	2004	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	)	)	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3624
# text = Les topoisomérases de type IA ( en jaune ) transfèrent un brin d'ADN à travers le second brin de l'hélice , modifiant le superenroulement ( Lk ) par étapes de 1 .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	topoisomérases	topoisomérase	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	type	type	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	IA	IA	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	(	(	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	en	en	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
8	jaune	jaune	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	)	)	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	transfèrent	transférer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	un	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	brin	brin	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	d'	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	ADN	ADN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	à	à travers	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	travers	à travers	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
17	le	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
18	second	second	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
19	brin	brin	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	l'	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	hélice	hélice	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	modifiant	modifier	VPR	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
25	le	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	superenroulement	super-	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	(	(	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
28	Lk	Lk	NOM	_	_	26	parenth	_	_	_	_	_
29	)	)	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
30	par	par	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
31	étapes	étape	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	1	1	NUM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3625
# text = Les topoisomérases de type IB ( en bleu ) sont capables de laisser le brin d'ADN clivé effectuer une rotation autour du brin non clivé , modifiant Lk de plusieurs unités , positivement ou négativement .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	topoisomérases	topoisomérase	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	type	type	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	IB	IB	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	(	(	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	en	en	PRE	_	_	2	parenth	_	_	_	_	_
8	bleu	bleu	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	)	)	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
10	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	capables	capable	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	laisser	laisser	VNF	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	le	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	brin	brin	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	d'	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	ADN	ADN	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	clivé	cliver	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	effectuer	effectuer	VNF	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
20	une	un	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	rotation	rotation	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	autour	autour de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	du	autour de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	brin	brin	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	non	non	ADV	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	clivé	cliver	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
28	modifiant	modifier	VPR	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
29	Lk	Lk	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	de	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	unités	unité	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
34	positivement	positivement	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
35	ou	ou	COO	_	_	36	mark	_	_	_	_	_
36	négativement	négativement	ADV	_	_	34	para	_	_	_	_	_
37	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3626
# text = Les topoisomérases de type II ( en vert ) transfèrent une hélice à travers une autre hélice , changeant Lk par étapes de 2 .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	topoisomérases	topoisomérase	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	type	type	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	II	II	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	(	(	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
7	en	en	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
8	vert	vert	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	)	)	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	transfèrent	transférer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	hélice	hélice	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	à	à travers	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	travers	à travers	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	une	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
16	autre	autre	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	hélice	hélice	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	changeant	changer	VPR	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
20	Lk	Lk	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	par	par	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	étapes	étape	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	2	2	NUM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3627
# text = Figure 2 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	2	2	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3628
# text = Mécanisme d'action d'une topoisomérase de type IIA ( Corbett et Berger , 2004 )
1	Mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	action	action	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	une	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	topoisomérase	topoisomérase	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	type	type	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	IIA	IIA	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	(	(	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	Corbett	Corbett	NOM	_	_	6	parenth	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	Berger	Berger	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	2004	2004	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	)	)	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3629
# text = Les différents domaines sont colorés comme suit :
1	Les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	différents	différent	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	domaines	domaine	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
4	sont	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	colorés	colorer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	comme	comme	CSU	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	suit	suivre	VRB	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	:	:	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3630
# text = en vert , le domaine 5Y-CAP , en rouge , le domaine toprim , en jaune , les domaines GHKL et transducteur , les hélices d'ADN étant matérialisées en rose ( hélice G ) et bleu ( hélice T ) .
1	en	en	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	vert	vert	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	domaine	domaine	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	5Y-CAP	5Y-CAP	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
8	en	en	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	rouge	rouge	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
11	le	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	domaine	domaine	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
13	toprim	top	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	en	en	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
16	jaune	jaune	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
18	les	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	domaines	domaine	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	GHKL	GHKL	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	transducteur	transducteur	NOM	_	_	19	para	_	_	_	_	_
23	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
24	les	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	hélices	hélice	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	d'	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	ADN	ADN	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	étant	être	VPR	_	_	29	aux	_	_	_	_	_
29	matérialisées	matérialiser	VPP	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
30	en	en	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	rose	rose	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	(	(	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
33	hélice	hélice	NOM	_	_	31	parenth	_	_	_	_	_
34	G	G	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	)	)	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
36	et	et	COO	_	_	37	mark	_	_	_	_	_
37	bleu	bleu	NOM	_	_	25	para	_	_	_	_	_
38	(	(	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
39	hélice	hélice	NOM	_	_	37	parenth	_	_	_	_	_
40	T	T	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	)	)	PUNC	_	_	39	punc	_	_	_	_	_
42	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3631
# text = Un premier segment d'ADN est d'abord lié ( hélice G ) puis l'entrée du deuxième entraîne la dimérisation des domaines GHKL .
1	Un	un	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	premier	premier	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	segment	segment	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	est	être	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
7	d'	d'abord	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
8	abord	d'abord	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	lié	lier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	(	(	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	hélice	hélice	NOM	_	_	9	parenth	_	_	_	_	_
12	G	G	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	)	)	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
14	puis	puis	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	entrée	entrée	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
17	du	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	deuxième	deuxième	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	entraîne	entraîner	VRB	_	_	9	para	_	_	_	_	_
20	la	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	dimérisation	dimérisation	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	des	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	domaines	domaine	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	GHKL	GHKL	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3632
# text = Les molécules d'ATP ( étoiles ) sont alors hydrolysées et le changement conformationnel qui s'en suit amène à la coupure de la première hélice d'ADN et au transfert de la seconde dans les « portes » ( bleu foncé ) , qui s'ouvrent enfin pour libérer l'hélice T .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	molécules	molécule	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	ATP	ATP	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	(	(	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	étoiles	étoile	NOM	_	_	4	parenth	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
8	sont	être	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
9	alors	alors	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	hydrolysées	hydrolyser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
12	le	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	changement	changement	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
14	conformationnel	conformation	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	qui	qui	PRQ	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
16	s'	s'	CLI	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
17	en	le	CLI	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	suit	suivre	VRB	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
19	amène	amener	VRB	_	_	10	para	_	_	_	_	_
20	à	à	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	coupure	coupure	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
25	première	premier	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	hélice	hélice	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
27	d'	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	ADN	ADN	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	et	et	COO	_	_	30	mark	_	_	_	_	_
30	au	à	PRE	_	_	27	para	_	_	_	_	_
31	transfert	transfert	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	la	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	seconde	second	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	dans	dans	PRE	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	les	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
37	«	«	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
38	portes	porte	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
39	»	»	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
40	(	(	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
41	bleu	bleu	NOM	_	_	38	parenth	_	_	_	_	_
42	foncé	foncé	ADJ	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	)	)	PUNC	_	_	41	punc	_	_	_	_	_
44	,	,	PUNC	_	_	47	punc	_	_	_	_	_
45	qui	qui	PRQ	_	_	47	subj	_	_	_	_	_
46	s'	s'	CLI	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
47	ouvrent	ouvrir	VRB	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
48	enfin	enfin	ADV	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	pour	pour	PRE	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	libérer	libérer	VNF	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
51	l'	le	DET	_	_	52	spe	_	_	_	_	_
52	hélice	hélice	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
53	T	T	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3633
# text = Figure 3 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	3	3	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3634
# text = Structure d'une Topo de type IA ( Corbett et Berger , 2004 )
1	Structure	structure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	une	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	Topo	Topo	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	type	type	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	IA	IA	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	(	(	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
9	Corbett	Corbett	NOM	_	_	6	parenth	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
11	Berger	Berger	NOM	_	_	9	para	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	2004	2004	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	)	)	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3635
# text = La structure de la TopoIII d'E. coli , très similaire à celle de la
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	structure	structure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	TopoIII	TopoIII	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	E.	E.	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	coli	coli	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
10	très	très	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	similaire	similaire	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	à	à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	celle	celui	PRQ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	la	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3636
# text = TopoI , est montrée ici .
1	TopoI	TopoI	NOM	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	montrée	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	ici	ici	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3637
# text = Les différents domaines conférant leur activité aux topoisomérases de type IA sont colorés comme suit :
1	Les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	différents	différent	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	domaines	domaine	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
4	conférant	conférer	VPR	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	leur	son	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	activité	activité	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	aux	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	topoisomérases	topoisomérase	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	type	type	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	IA	IA	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	sont	être	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	colorés	colorer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	comme	comme	CSU	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	suit	suivre	VRB	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	:	:	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3638
# text = en vert , le domain 5Y-CAP   ;
1	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
2	vert	vert	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	domain	domaine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	5Y-CAP	5Y-CAP	NUM	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	 	5y-cap  	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	;	;	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3639
# text = en bleu , le domaine de type CAP , similaire au 5Y-CAP mais sans la tyrosine catalytique et en rouge le domaine toprim .
1	en	en	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
2	bleu	bleu	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	domaine	domaine	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	type	type	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	CAP	CAP	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
10	similaire	similaire	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
11	au	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	5Y-CAP	5Y-CAP	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	mais	mais	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	sans	sans	PRE	_	_	11	para	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	tyrosine	tyrosine	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	catalytique	catalytique	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	en	en	PRE	_	_	17	para	_	_	_	_	_
20	rouge	rouge	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	le	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	domaine	domaine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	toprim	top	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3640
# text = L'enzyme adopte une forme toroïdale .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	enzyme	enzyme	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	adopte	adopter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	une	un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	forme	forme	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	toroïdale	toroïdal	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3641
# text = Figure 4 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	4	4	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3642
# text = Mécanisme d'action de la TopoI ( Perry et Mondragon , 2003 )
1	Mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	action	action	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	TopoI	TopoI	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	(	(	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
8	Perry	Perry	NOM	_	_	6	parenth	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	Mondragon	Mondragon	NOM	_	_	8	para	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	2003	2003	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	)	)	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3643
# text = Les différentes étapes du relâchement de l'ADN par la TopoI sont montrées ici .
1	Les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	différentes	différent	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	étapes	étape	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
4	du	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	relâchement	relâchement	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	ADN	ADN	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	TopoI	TopoI	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	sont	être	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	montrées	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	ici	ici	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3644
# text = L'enzyme est schématisée en gris avec le site d'interaction avec l'ADN en jaune et la double hélice d'ADN en bleu et rouge .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	enzyme	enzyme	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	schématisée	schématiser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	en	en	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	gris	gris	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	avec	avec	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	le	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	site	site	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	d'	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	interaction	interaction	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	avec	avec	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	ADN	ADN	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	en	en	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
16	jaune	jaune	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
18	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
19	double	double	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	hélice	hélice	NOM	_	_	9	para	_	_	_	_	_
21	d'	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	ADN	ADN	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	en	en	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
24	bleu	bleu	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
26	rouge	rouge	NOM	_	_	24	para	_	_	_	_	_
27	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3645
# text = Pour le détail des étapes , voir texte .
1	Pour	pour	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	le	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	détail	détail	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	des	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	étapes	étape	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	voir	voir	VNF	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	texte	texte	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3646
# text = Figure 5 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	5	5	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3647
# text = Modèle de Liu et Wang ( 1987 ) et boucles R ( Drolet , 2006 )
1	Modèle	modèle	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	Liu	Liu	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	Wang	Wang	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
6	(	(	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	1987	1987	NUM	_	_	1	parenth	_	_	_	_	_
8	)	)	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	boucles	boucle	NOM	_	_	1	para	_	_	_	_	_
11	R	R	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	Drolet	Drolet	NOM	_	_	10	parenth	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	2006	2006	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	)	)	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3648
# text = A . Modèle de Liu et Wang .
1	A	a	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	Modèle	Modèle	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	Liu	Liu	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	7	mark	_	_	_	_	_
7	Wang	Wang	NOM	_	_	5	para	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3649
# text = En ( a ) , une machinerie transcriptionnelle ( R ) , incluant l'ARN polymérase , l'ARN synthétisé et des protéines liées à cet ARN , est représentée , progressant suivant la direction de la flèche .
1	En	en	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	(	(	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	a	avoir	VRB	_	_	32	periph	_	_	_	_	_
4	)	)	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
6	une	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	machinerie	machinerie	NOM	_	_	30	subj	_	_	_	_	_
8	transcriptionnelle	transcriptionnel	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	(	(	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	R	R	NOM	_	_	7	parenth	_	_	_	_	_
11	)	)	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
13	incluant	inclure	VPR	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
15	ARN	ARN	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	polymérase	polymérase	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	ARN	ARN	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
20	synthétisé	synthétiser	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
22	des	un	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	protéines	protéine	NOM	_	_	19	para	_	_	_	_	_
24	liées	lier	VPP	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	à	à	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	cet	ce	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	ARN	ARN	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
29	est	être	VRB	_	_	30	aux	_	_	_	_	_
30	représentée	représenter	VPP	_	_	32	periph	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
32	progressant	progresser	VPR	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
33	suivant	suivant	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	la	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	direction	direction	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	de	de	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	la	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	flèche	flèche	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3650
# text = Les extrémités de l'ADN sont ancrées à une structure plus large schématisée par les barres verticales , représentant ainsi un domaine topologique . ( b ) Une autre vue de cette machinerie , schématisée comme un séparateur au sein de l'hélice d'ADN . ( c )
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	extrémités	extrémité	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	sont	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	ancrées	ancrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	une	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	structure	structure	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	plus	plus	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	large	large	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	schématisée	schématiser	VPP	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	par	par	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	les	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	barres	barre	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	verticales	vertical	ADJ	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
19	représentant	représenter	VPR	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
20	ainsi	ainsi	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	un	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	domaine	domaine	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	topologique	topologique	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
25	(	(	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	b	boulevard	NOM	_	_	7	parenth	_	_	_	_	_
27	)	)	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
28	Une	Une	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
29	autre	autre	ADJ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
30	vue	vue	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	cette	ce	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	machinerie	machinerie	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	,	,	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
35	schématisée	schématiser	VPP	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	comme	comme	PRE	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	un	un	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	séparateur	séparateur	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	au	au sein de	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	sein	au sein de	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	de	au sein de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	l'	le	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	hélice	hélice	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	d'	de	PRE	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	ADN	ADN	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
47	(	(	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_
48	c	cf	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
49	)	)	PUNC	_	_	48	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3651
# text = Quand R se déplace de gauche à droite , l'ADN devient superenroulé positivement en amont et superenroulé négativement en aval .
1	Quand	quand	CSU	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
2	R	R	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	se	se	CLI	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
4	déplace	déplacer	VRB	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	gauche	gauche	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	à	à droite	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	droite	à droite	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	ADN	ADN	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
12	devient	devenir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	superenroulé	super-	VPP	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	positivement	positivement	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	en	en	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	amont	amont	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	superenroulé	super-	VPP	_	_	13	para	_	_	_	_	_
19	négativement	négativement	ADV	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	en	en	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	aval	aval	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3652
# text = B . Schéma de formation de boucles R ( Drolet , 2006 ) .
1	B	b	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	Schéma	Schéma	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	formation	formation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	boucles	boucle	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	R	R	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	(	(	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Drolet	Drolet	NOM	_	_	7	parenth	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	2006	2006	NUM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	)	)	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3653
# text = Les boucles R peuvent apparaître dans certaines conditions ( ADN hyper enroulé , basse température ) .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	boucles	boucle	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	R	R	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	apparaître	apparaître	VNF	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	dans	dans	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	certaines	certain	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	conditions	condition	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	(	(	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	ADN	ADN	NOM	_	_	8	parenth	_	_	_	_	_
11	hyper	hyper	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	enroulé	enrouler	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
14	basse	bas	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	température	température	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	)	)	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3654
# text = Ces boucles sont formées par l'hybridation de l'ARN nouvellement synthétisé avec l'ADN matrice , et empêche ainsi la réhybridation de la double hélice d'ADN .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	boucles	boucle	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	formées	former	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	hybridation	hybridation	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	ARN	ARN	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	nouvellement	nouvellement	ADV	_	_	12	periph	_	_	_	_	_
12	synthétisé	synthétiser	VPP	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	avec	avec	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
15	ADN	ADN	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	matrice	matrice	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	empêche	empêcher	VRB	_	_	4	para	_	_	_	_	_
20	ainsi	ainsi	ADV	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	réhybridation	réhybridation	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
25	double	double	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	hélice	hélice	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
27	d'	de	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	ADN	ADN	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3655
# text = Ces structures peuvent soit empêcher la transcription en bloquant l'ARN polymérase , soit inhiber la traduction de nouvelles protéines par la dégradation de l'ARNm hybridé à l'ADN .
1	Ces	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	structures	structure	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	soit	soit	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	empêcher	empêcher	VNF	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	transcription	transcription	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	bloquant	bloquer	VPR	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
11	ARN	ARN	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	polymérase	polymérase	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
14	soit	soit	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	inhiber	inhiber	VNF	_	_	5	para	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	traduction	traduction	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	nouvelles	nouveau	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	protéines	protéine	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	par	par	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	dégradation	dégradation	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	l'	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	ARNm	ARNm	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	hybridé	hybrider	ADJ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	à	à	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
29	l'	le	DET	_	_	30	spe	_	_	_	_	_
30	ADN	ADN	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3656
# text = Figure 6 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	6	6	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3657
# text = Les différents domaines des topoisomérases de type IIA ( Schoeffler et Berger , 2005 )
1	Les	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	différents	différent	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	domaines	domaine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	des	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	topoisomérases	topoisomérase	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	type	type	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	IIA	IIA	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	(	(	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Schoeffler	Schoeffler	NOM	_	_	5	parenth	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	12	mark	_	_	_	_	_
12	Berger	Berger	NOM	_	_	10	para	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	2005	2005	NUM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	)	)	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3658
# text = Les domaines GHKL formant l'ATPase sont montrés en jaune avec en orange les domaines transducteurs ;
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	domaines	domaine	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	GHKL	GHKL	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	formant	former	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	ATPase	ATPase	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	montrés	montrer	VPP	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	en	en	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	jaune	jaune	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	avec	avec	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	en	en	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	orange	orange	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	domaines	domaine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	transducteurs	transducteur	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	;	;	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3659
# text = la «  porte  » est formée par deux domaines 5Y-CAP en vert , et les deux domaines toprim toprim aidant au clivage de l'ADN en rouge .
1	la	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	« 	«	_	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
3	porte	porte	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
4	 »	»	_	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
5	est	être	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	formée	former	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	par	par	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	deux	deux	NUM	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	domaines	domaine	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	5Y-CAP	5Y-CAP	NUM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	en	en	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	vert	vert	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	17	mark	_	_	_	_	_
15	les	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
16	deux	deux	NUM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
17	domaines	domaine	NOM	_	_	9	para	_	_	_	_	_
18	toprim	top	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	toprim	toprim	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	aidant	aidant	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	au	à	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
22	clivage	clivage	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	l'	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	ADN	ADN	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	en	en	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
27	rouge	rouge	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3660
# text = Les domaines formant les « C-gate » sont montrés en bleu foncé et les domaines C-terminaux en violet .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	domaines	domaine	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	formant	former	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	«	«	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	C-gate	C-gate	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	»	»	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	sont	être	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	montrés	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	en	en	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	bleu	bleu	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	foncé	foncé	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	domaines	domaine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	C-terminaux	C-terminaux	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	en	en	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	violet	violet	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3661
# text = Figure 7 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	7	7	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3662
# text = Mécanisme d'action des ToposII , ici de la gyrase
1	Mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	action	action	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	ToposII	ToposII	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
7	ici	ici	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	gyrase	gyrase	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3663
# text = ( 1 ) Un segment d'ADN se lie à la sous-unité GyrB ( en jaune ) .
1	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	1	1	NUM	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
3	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	Un	Un	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	segment	segment	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
6	d'	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	ADN	ADN	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	se	se	CLI	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	lie	lier	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	sous-unité	sous-	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	GyrB	GyrB	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	(	(	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	en	en	PRE	_	_	9	parenth	_	_	_	_	_
16	jaune	jaune	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	)	)	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3664
# text = Les domaines
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	domaines	domaine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3665
# text = C-terminaux des sous-unités GyrA ( en rouge ) le lient et l'enroulent de façon à présenter une des extrémités de la même hélice aux sous-unités GyrB ( segment T ) ( 2 , et vue de dessus ) .
1	C-terminaux	C-terminaux	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
2	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	sous-unités	sous-	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	GyrA	GyrA	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	(	(	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
6	en	en	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
7	rouge	rouge	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	)	)	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
9	le	le	CLI	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	lient	lier	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
12	l'	le	CLI	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	enroulent	enrouler	VRB	_	_	10	para	_	_	_	_	_
14	de	de façon à	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	façon	de façon à	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	à	de façon à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	présenter	présenter	VNF	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	une	un	PRQ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	des	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	extrémités	extrémité	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
23	même	même	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
24	hélice	hélice	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
25	aux	à	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	sous-unités	sous-	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	GyrB	GyrB	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	(	(	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	segment	segment	NOM	_	_	26	parenth	_	_	_	_	_
30	T	T	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	)	)	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
32	(	(	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
33	2	2	NUM	_	_	24	parenth	_	_	_	_	_
34	,	,	PUNC	_	_	36	punc	_	_	_	_	_
35	et	et	COO	_	_	36	mark	_	_	_	_	_
36	vue	vue	NOM	_	_	33	para	_	_	_	_	_
37	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	dessus	dessus	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	)	)	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
40	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3666
# text = Elle est capturée par la dimérisation des domaines ATPase ( étoile noire ) en conformation de supertour positif , et son passage dans le domaine N-terminal des sous-unités
1	Elle	elle	CLS	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	est	être	VRB	_	_	3	aux	_	_	_	_	_
3	capturée	capturer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	par	par	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	dimérisation	dimérisation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	des	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	domaines	domaine	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	ATPase	ATPase	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	(	(	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	étoile	étoile	NOM	_	_	8	parenth	_	_	_	_	_
12	noire	noir	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	)	)	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
14	en	en	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	conformation	conformation	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	supertour	super-	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	positif	positif	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
21	son	son	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	passage	passage	NOM	_	_	6	para	_	_	_	_	_
23	dans	dans	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	le	le	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	domaine	domaine	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	N-terminal	N-terminal	ADJ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	des	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	sous-unités	sous-	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3667
# text = GyrA ( en bleu ) induit la formation de 2 supertours négatifs ( 3 ) .
1	GyrA	GyrA	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
2	(	(	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
3	en	en	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
4	bleu	bleu	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	)	)	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	induit	induire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	formation	formation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	2	2	NUM	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	supertours	super-	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	négatifs	négatif	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	(	(	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	3	3	NUM	_	_	11	parenth	_	_	_	_	_
15	)	)	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3668
# text = Le segment G est ensuite libéré en même temps que deux molécules d'ADP et de Pi .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	segment	segment	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	G	G	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	est	être	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
5	ensuite	ensuite	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	libéré	libérer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	en	en	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	même	même	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	temps	temps	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	que	que	CSU	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	deux	deux	NUM	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	molécules	molécule	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	d'	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	ADP	ADP	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	de	de	PRE	_	_	13	para	_	_	_	_	_
17	Pi	Pi	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3669
# text = Figure
1	Figure	figurer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3670
# text = 8
1	8	8	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3671
# text = :
1	:	:	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3672
# text = Rôle de la sous-unité GyrA de la gyrase d'
1	Rôle	rôle	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	sous-unité	sous-	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	GyrA	GyrA	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	gyrase	gyrase	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	d'	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3673
# text = E . coli dans la modification de la superhélicité de l'ADN
1	E	e	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	coli	colis	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	dans	dans	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	modification	modification	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	ADN	ADN	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3674
# text = A . Les domaines N-terminaux d'un dimère de sous-unités GyrA ( résidus 30 à
1	A	a	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	Les	Les	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	domaines	domaine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	N-terminaux	N-terminaux	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	d'	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	un	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	dimère	dimère	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	sous-unités	sous-	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	GyrA	GyrA	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	(	(	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
13	résidus	résidu	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	30	30	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	à	à	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3675
# text = 522 ) sont montrés ici en bleu , et les domaines C-terminaux en rouge ( résidus 535 à 841 ) .
1	522	522	NUM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
3	sont	être	VRB	_	_	4	aux	_	_	_	_	_
4	montrés	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	ici	ici	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	en	en	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	bleu	bleu	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	domaines	domaine	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	C-terminaux	C-terminaux	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	en	en	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	rouge	rouge	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	(	(	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	résidus	résidu	NOM	_	_	14	parenth	_	_	_	_	_
17	535	535	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	à	à	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	841	841	NUM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	)	)	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3676
# text = La distance maximale séparant les domaines NTD et CTD est de 39 Å ;
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	distance	distance	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	maximale	maximal	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	séparant	séparer	VPR	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	domaines	domaine	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	NTD	NTD	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	CTD	CTD	NOM	_	_	7	para	_	_	_	_	_
10	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	39	39	NUM	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	Å	Å	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	;	;	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3677
# text = cette distance pourrait permettre la mobilité des extrémités C-terminales , entraînant le transfert de l'hélice T et la diminution du paramètre Lk par incréments de 2 .
1	cette	ce	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	distance	distance	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	permettre	permettre	VNF	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	mobilité	mobilité	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	des	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	extrémités	extrémité	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	C-terminales	C-terminales	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	entraînant	entraîner	VPR	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
12	le	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	transfert	transfert	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	hélice	hélice	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	T	T	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	diminution	diminution	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
21	du	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	paramètre	paramètre	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	Lk	Lk	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	par	par	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	incréments	incrément	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	2	2	NUM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3678
# text = B . Différence entre les CTD de GyrA de la gyrase ( à gauche , en bleu ) et les CTD de ParC de la TopoIV ( à droite , en bleu ) .
1	B	b	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	Différence	Différence	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	entre	entre	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	CTD	CTD	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	GyrA	GyrA	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	gyrase	gyrase	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	11	parenth	_	_	_	_	_
14	gauche	gauche	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
16	en	en	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	bleu	bleu	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	)	)	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
20	les	le	DET	_	_	21	spe	_	_	_	_	_
21	CTD	CTD	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	ParC	ParC	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	la	le	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	TopoIV	TopoIV	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	(	(	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
28	à	à	PRE	_	_	23	parenth	_	_	_	_	_
29	droite	droite	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	,	,	PUNC	_	_	31	punc	_	_	_	_	_
31	en	en	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	bleu	bleu	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	)	)	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3679
# text = Les sous-unités GyrB et ParE sont représentées en jaune , à gauche et à droite , respectivement .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	sous-unités	sous-	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	GyrB	GyrB	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
5	ParE	ParE	NOM	_	_	3	para	_	_	_	_	_
6	sont	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	représentées	représenter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	en	en	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	jaune	jaune	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	à	à gauche	PRE	_	_	9	para	_	_	_	_	_
12	gauche	à gauche	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	à	à droite	PRE	_	_	11	para	_	_	_	_	_
15	droite	à droite	ADV	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
17	respectivement	respectivement	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3680
# text = En ce qui concerne la gyrase ( à gauche ) , l'ADN est enroulé autour des CTD de GyrA , et un mouvement de l'un deux provoquerait le transfert de la double hélice T dans la cavité formée par les portes C. La fixation de l'ADN autour des CTD de ParC ( à droite ) serait moins forte , ou bien leur mouvement serait moins coordonné .
1	En	en	PRE	_	_	59	periph	_	_	_	_	_
2	ce	ce	PRQ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	qui	qui	PRQ	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
4	concerne	concerner	VRB	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	gyrase	gyrase	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	(	(	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
8	à	à gauche	PRE	_	_	4	parenth	_	_	_	_	_
9	gauche	à gauche	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	)	)	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	ADN	ADN	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
14	est	être	VRB	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
15	enroulé	enrouler	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
16	autour	autour de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	des	autour de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	CTD	CTD	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	de	de	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	GyrA	GyrA	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
23	un	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	mouvement	mouvement	NOM	_	_	29	subj	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	l'	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	un	un	PRQ	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	deux	deux	NUM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	provoquerait	provoquer	VRB	_	_	15	para	_	_	_	_	_
30	le	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	transfert	transfert	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	la	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
34	double	double	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
35	hélice	hélice	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
36	T	T	NOM	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	dans	dans	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
38	la	le	DET	_	_	39	spe	_	_	_	_	_
39	cavité	cavité	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	formée	former	VPP	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	par	par	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	les	le	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
43	portes	porte	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	C.	C.	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	La	La	DET	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
46	fixation	fixation	NOM	_	_	59	subj	_	_	_	_	_
47	de	de	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	l'	le	DET	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
49	ADN	ADN	NOM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	autour	autour de	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
51	des	autour de	PRE	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
52	CTD	CTD	NOM	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	de	de	PRE	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
54	ParC	ParC	NOM	_	_	53	dep	_	_	_	_	_
55	(	(	PUNC	_	_	59	punc	_	_	_	_	_
56	à	à droite	PRE	_	_	59	periph	_	_	_	_	_
57	droite	à droite	ADV	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
58	)	)	PUNC	_	_	59	punc	_	_	_	_	_
59	serait	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
60	moins	moins	ADV	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
61	forte	forte	ADV	_	_	59	dep	_	_	_	_	_
62	,	,	PUNC	_	_	69	punc	_	_	_	_	_
63	ou	ou bien	COO	_	_	69	mark	_	_	_	_	_
64	bien	ou bien	ADV	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
65	leur	son	DET	_	_	66	spe	_	_	_	_	_
66	mouvement	mouvement	NOM	_	_	69	subj	_	_	_	_	_
67	serait	être	VRB	_	_	69	aux	_	_	_	_	_
68	moins	moins	ADV	_	_	69	periph	_	_	_	_	_
69	coordonné	coordonner	VPP	_	_	59	para	_	_	_	_	_
70	.	.	PUNC	_	_	59	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3681
# text = Ils présentent néanmoins une double hélice courbée dont la conformation est prévalente dans les caténanes , qui forment le substrat majeur de la TopoIV ( Schoeffler et Berger , 2005 ) .
1	Ils	ils	CLS	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	présentent	présenter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	néanmoins	néanmoins	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	une	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	double	double	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	hélice	hélice	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
7	courbée	courber	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	dont	dont	PRQ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	conformation	conformation	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
11	est	être	VRB	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
12	prévalente	pré-	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	dans	dans	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	caténanes	caténaire	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	,	,	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
17	qui	qui	PRQ	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
18	forment	former	VRB	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	le	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	substrat	substrat	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	majeur	majeur	ADJ	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	la	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	TopoIV	TopoIV	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	(	(	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
26	Schoeffler	Schoeffler	NOM	_	_	24	parenth	_	_	_	_	_
27	et	et	COO	_	_	28	mark	_	_	_	_	_
28	Berger	Berger	NOM	_	_	26	para	_	_	_	_	_
29	,	,	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
30	2005	2005	NUM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
31	)	)	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
32	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3682
# text = Figure 9 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	9	9	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3683
# text = Effets sur l'ADN de la protéine H-NS
1	Effets	effet	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	sur	sur	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	ADN	ADN	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	protéine	protéine	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	H-NS	H-NS	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3684
# text = A gauche , modèles représentant les dimères de H-NS sous leur forme active .
1	A	à gauche	ADV	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	gauche	à gauche	ADV	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	modèles	modèle	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
5	représentant	représenter	VPR	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	dimères	dimère	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	H-NS	H-NS	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	sous	sous	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	leur	son	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	forme	forme	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	active	activer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3685
# text = Au centre , image par microscopie à force atomique montrant un plasmide incubé avec la protéine H-NS .
1	Au	à	PRE	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	centre	centre	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	image	imager	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	microscopie	microscopie	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	force	force	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	atomique	atomique	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	montrant	montrer	VPR	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
11	un	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	plasmide	plasmode	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	incubé	incuber	VPP	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	avec	avec	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	la	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	protéine	protéine	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	H-NS	H-NS	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3686
# text = A droite , différentes structures formées par H-NS fixée à l'ADN .
1	A	à	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	droite	droite	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	différentes	différent	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	structures	structure	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	formées	former	VPP	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	par	par	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	H-NS	H-NS	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	fixée	fixer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	ADN	ADN	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3687
# text = Figure
1	Figure	figurer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3688
# text = 10
1	10	10	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3689
# text = :
1	:	:	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3690
# text = Mécanisme de répression de la transcription par H-NS
1	Mécanisme	mécanisme	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	répression	répression	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	transcription	transcription	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	par	par	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	H-NS	H-NS	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3691
# text = L'ARN polymérase est représentée en bleu et H-NS en rouge . ( i ) Liaison de l'ARN polymérase sur un promoteur flanqué de régions courbées . ( ii )
1	L'	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	ARN	ARN	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	polymérase	polymérase	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
4	est	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	représentée	représenter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	bleu	bleu	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	H-NS	H-NS	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	rouge	rouge	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
13	(	id est	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	i	id est	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	)	id est	PUNC	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	Liaison	Liaison	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
19	ARN	ARN	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
20	polymérase	polymérase	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
21	sur	sur	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
22	un	un	DET	_	_	23	spe	_	_	_	_	_
23	promoteur	promoteur	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	flanqué	flanquer	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	régions	région	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	courbées	courber	VPP	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
28	.	.	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
29	(	(	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_
30	ii	if	NOM	_	_	27	parenth	_	_	_	_	_
31	)	)	PUNC	_	_	30	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3692
# text = Enroulement de l'ADN autour de l'ARN polymérase , ce qui rapproche les courbures intrinsèques de l'ADN . ( iii ) La fixation de plusieurs molécules de H-NS sur ses sites entraîne le blocage de l'ARN polymérase . ( iv ) Le complexe formé par H-NS est séparé par un changement de l'environnement ou l'intervention de facteurs de transcription .
1	Enroulement	enroulement	NOM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	ADN	ADN	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	autour	autour de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	de	autour de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
8	ARN	ARN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	polymérase	polymérase	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
11	ce	ce	PRQ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	qui	qui	PRQ	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
13	rapproche	rapprocher	VRB	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	les	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	courbures	courbure	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	intrinsèques	intrinsèque	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	l'	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	ADN	ADN	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
21	(	id est	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
22	iii	id est	COO	_	_	23	mark	_	_	_	_	_
23	)	id est	PUNC	_	_	34	mark	_	_	_	_	_
24	La	La	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	fixation	fixation	NOM	_	_	34	subj	_	_	_	_	_
26	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	plusieurs	plusieurs	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	molécules	molécule	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	H-NS	H-NS	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	sur	sur	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
32	ses	son	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	sites	site	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	entraîne	entraîner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
35	le	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	blocage	blocage	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	de	de	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
38	l'	le	DET	_	_	40	spe	_	_	_	_	_
39	ARN	ARN	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
40	polymérase	polymérase	NOM	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
41	.	.	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
42	(	(	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
43	iv	ive	NOM	_	_	51	periph	_	_	_	_	_
44	)	)	PUNC	_	_	43	punc	_	_	_	_	_
45	Le	Le	DET	_	_	46	spe	_	_	_	_	_
46	complexe	complexe	NOM	_	_	51	subj	_	_	_	_	_
47	formé	former	VPP	_	_	46	dep	_	_	_	_	_
48	par	par	PRE	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	H-NS	H-NS	NOM	_	_	48	dep	_	_	_	_	_
50	est	être	VRB	_	_	51	aux	_	_	_	_	_
51	séparé	séparer	VPP	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
52	par	par	PRE	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	un	un	DET	_	_	54	spe	_	_	_	_	_
54	changement	changement	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
55	de	de	PRE	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	l'	le	DET	_	_	57	spe	_	_	_	_	_
57	environnement	environnement	NOM	_	_	55	dep	_	_	_	_	_
58	ou	ou	COO	_	_	60	mark	_	_	_	_	_
59	l'	le	DET	_	_	60	spe	_	_	_	_	_
60	intervention	intervention	NOM	_	_	57	para	_	_	_	_	_
61	de	de	PRE	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
62	facteurs	facteur	NOM	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
63	de	de	PRE	_	_	62	dep	_	_	_	_	_
64	transcription	transcription	NOM	_	_	63	dep	_	_	_	_	_
65	.	.	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3693
# text = Figure 11 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	11	11	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3694
# text = Effet sur l'ADN des protéines courbant l'ADN
1	Effet	effet	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	sur	sur	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	ADN	ADN	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	des	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	protéines	protéine	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	courbant	courber	VPR	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	ADN	ADN	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3695
# text = A , IHF ;
1	A	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	IHF	IHF	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	;	;	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3696
# text = B , HU ;
1	B	B	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	HU	HU	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	;	;	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3697
# text = C , Fis .
1	C	C	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	Fis	Fis	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3698
# text = A gauche , modèles représentant les oligomères liés à l'ADN .
1	A	à	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	gauche	gauche	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	modèles	modèle	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	représentant	représenter	VPR	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	oligomères	oligomères	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	liés	lier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	ADN	ADN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3699
# text = Au centre , image par microscopie à force atomique , montrant un plasmide incubé avec la protéine .
1	Au	à	PRE	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	centre	centre	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	image	imager	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	microscopie	microscopie	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	force	force	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	atomique	atomique	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	montrant	montrer	VPR	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
12	un	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	plasmide	plasmode	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	incubé	incuber	VPP	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	avec	avec	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	la	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	protéine	protéine	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3700
# text = A droite , modèles de liaison des protéines ( en rouge ) à deux hélices d'ADN ( en bleu ) .
1	A	à droite	ADV	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	droite	à droite	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	modèles	modèle	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	liaison	liaison	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	des	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	protéines	protéine	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	(	(	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	en	en	PRE	_	_	4	parenth	_	_	_	_	_
11	rouge	rouge	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	)	)	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
14	deux	deux	NUM	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	hélices	hélice	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	d'	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	ADN	ADN	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	(	(	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	en	en	PRE	_	_	15	parenth	_	_	_	_	_
20	bleu	bleu	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	)	)	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3701
# text = Pour HU , on observe 2 formes de fixation à l'ADN :
1	Pour	pour	PRE	_	_	5	periph	_	_	_	_	_
2	HU	HU	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	on	on	CLS	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	observe	observer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	2	2	NUM	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	formes	forme	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	fixation	fixation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	ADN	ADN	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	:	:	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3702
# text = en faible concentration , HU courbe l'ADN  ;
1	en	en	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	faible	faible	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	concentration	concentration	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	HU	HU	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	courbe	courber	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	ADN	ADN	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	 ;	;	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3703
# text = à hautes concentrations , il forme des filaments rigides .
1	à	à	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	hautes	haut	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
3	concentrations	concentration	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
5	il	il	CLS	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	forme	former	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	des	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	filaments	filament	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	rigides	rigide	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3704
# text = Figure 12 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	12	12	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3705
# text = Effet antagoniste de HU et H-NS sur un plasmide ( Dame et Goosen , 2002 )
1	Effet	effet	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	antagoniste	antagoniste	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	HU	HU	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
6	H-NS	H-NS	NOM	_	_	4	para	_	_	_	_	_
7	sur	sur	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	un	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	plasmide	plasmode	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	(	(	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
11	Dame	Dame	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	Goosen	Goosen	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	2002	2002	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	)	)	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3706
# text = A gauche , le plasmide pUC 19 est incubé avec HU ( 1 dimère / 9 pb ) ;
1	A	à	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
2	gauche	gauche	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	plasmide	plasmode	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
6	pUC	pUC	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	19	19	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	est	être	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
9	incubé	incuber	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	avec	avec	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	HU	HU	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	(	(	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
13	1	1	NUM	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	dimère	dimère	NOM	_	_	11	parenth	_	_	_	_	_
15	/	ou	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
16	9	9	NUM	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	pb	problème	NOM	_	_	14	para	_	_	_	_	_
18	)	)	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
19	;	;	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3707
# text = au centre , le plasmide pUC 19 relâché  ;
1	au	à	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	centre	centre	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	plasmide	plasmode	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	pUC	pUC	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	19	19	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	relâché	relâcher	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	 ;	;	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3708
# text = à droite , le plasmide pUC 19 incubé avec H-NS ( 1 dimère / 12 pb ) .
1	à	à droite	PRE	_	_	6	periph	_	_	_	_	_
2	droite	à droite	ADV	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	plasmide	plasmode	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
6	pUC	pUC	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	19	19	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	incubé	incuber	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	avec	avec	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	H-NS	H-NS	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
12	1	1	NUM	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	dimère	dimère	NOM	_	_	10	parenth	_	_	_	_	_
14	/	ou	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
15	12	12	NUM	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	pb	problème	NOM	_	_	13	para	_	_	_	_	_
17	)	)	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3709
# text = Figure 13 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	13	13	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3710
# text = Protection de l'ADN par Dps
1	Protection	protection	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	ADN	ADN	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
6	Dps	Dps	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3711
# text = A gauche , modèle représentant les 12 monomères formant une sphère .
1	A	à	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	gauche	gauche	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	modèle	modèle	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	représentant	représenter	VPR	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	les	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
7	12	12	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	monomères	monomère	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	formant	former	VPR	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	une	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	sphère	sphère	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3712
# text = Au centre , image par microscopie à force atomique montrant de l'ADN incubé avec Dps .
1	Au	à	PRE	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	centre	centre	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	image	imager	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	microscopie	microscopie	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	force	force	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	atomique	atomique	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	montrant	montrer	VPR	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
11	de	de+le	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	l'	de+le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	ADN	ADN	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	incubé	incuber	VPP	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	avec	avec	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	Dps	Dps	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3713
# text = A droite , modèle de protection de l'ADN ( en rouge ) par des dodécamères associés entre eux ( en bleu ) .
1	A	à	PRE	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
2	droite	droite	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	modèle	modèle	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	protection	protection	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	ADN	ADN	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	(	(	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	en	en	PRE	_	_	4	parenth	_	_	_	_	_
12	rouge	rouge	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	)	)	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
14	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
15	des	un	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	dodécamères	do	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	associés	associer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	entre	entre	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	eux	lui	PRQ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	(	(	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	en	en	PRE	_	_	17	parenth	_	_	_	_	_
22	bleu	bleu	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	)	)	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
24	.	.	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3714
# text = Figure 14 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	14	14	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3715
# text = Effet de la protéine Fis sur la structure du nucléoïde et la transcription
1	Effet	effet	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	protéine	protéine	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	Fis	Fis	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	sur	sur	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	structure	structure	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	du	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	nucléoïde	nucléoïde	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	transcription	transcription	NOM	_	_	8	para	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3716
# text = ( Dorman et Deighan , 2003 )
1	(	(	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	Dorman	Dorman	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	4	mark	_	_	_	_	_
4	Deighan	Deighan	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	2003	2003	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	)	)	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3717
# text = Fis agit sur l'ADN à deux niveaux :
1	Fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	agit	agir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	sur	sur	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	l'	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	à	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	deux	deux	NUM	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	niveaux	niveau	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	:	:	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3718
# text = global ( sphères oranges ) , en favorisant la formation de domaines topologiques et de boucles , et local ( sphères vertes ) , en courbant l'ADN au niveau des promoteurs , ce qui favorise la transcription par interaction avec l'ARN polymérase .
1	global	global	ADJ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	(	(	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	sphères	sphère	NOM	_	_	1	parenth	_	_	_	_	_
4	oranges	orange	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	)	)	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
7	en	en	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
8	favorisant	favoriser	VPR	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	formation	formation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	domaines	domaine	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	topologiques	topologique	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	11	para	_	_	_	_	_
16	boucles	boucle	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	local	local	NOM	_	_	16	para	_	_	_	_	_
20	(	(	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	sphères	sphère	NOM	_	_	16	parenth	_	_	_	_	_
22	vertes	vert	ADJ	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	)	)	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	en	en	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
26	courbant	courber	VPR	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	l'	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	ADN	ADN	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
29	au	à	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
30	niveau	niveau	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	des	de	PRE	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	,	,	PUNC	_	_	34	punc	_	_	_	_	_
34	ce	ce	PRQ	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
35	qui	qui	PRQ	_	_	36	subj	_	_	_	_	_
36	favorise	favoriser	VRB	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	la	le	DET	_	_	38	spe	_	_	_	_	_
38	transcription	transcription	NOM	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	par	par	PRE	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
40	interaction	interaction	NOM	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	avec	avec	PRE	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
42	l'	le	DET	_	_	44	spe	_	_	_	_	_
43	ARN	ARN	NOM	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
44	polymérase	polymérase	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
45	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3719
# text = Figure 15 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	15	15	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3720
# text = Structure d'un dimère de Fis
1	Structure	structure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	un	un	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	dimère	dimère	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	Fis	Fis	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3721
# text = A . Modèle d'un dimère de Fis .
1	A	a	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	Modèle	Modèle	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	un	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	dimère	dimère	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	Fis	Fis	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3722
# text = Les structures des cristaux obtenus à partir de la protéine Fis sauvage ( résidus 26 à 98 ) et d'un mutant K36E ( résidus 10 à 25 ) ont été combinées pour donner un modèle plus complet .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	structures	structure	NOM	_	_	32	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	cristaux	cristal	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	obtenus	obtenir	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	à	à partir de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	partir	à partir de	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	à partir de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	protéine	protéine	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	Fis	Fis	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	sauvage	sauvage	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	(	(	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	résidus	résidu	NOM	_	_	10	parenth	_	_	_	_	_
15	26	26	NUM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	à	à	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	98	98	NUM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	)	)	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
20	d'	de	PRE	_	_	3	para	_	_	_	_	_
21	un	un	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	mutant	mutant	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	K36E	K36E	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	(	(	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	résidus	résidu	NOM	_	_	22	parenth	_	_	_	_	_
26	10	10	NUM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	à	à	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	25	25	NUM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	)	)	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
30	ont	avoir	VRB	_	_	31	aux	_	_	_	_	_
31	été	être	VPP	_	_	32	aux	_	_	_	_	_
32	combinées	combiner	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
33	pour	pour	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	donner	donner	VNF	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	un	un	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	modèle	modèle	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	plus	plus	ADV	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
38	complet	complet	ADJ	_	_	36	dep	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3723
# text = Les résidus 26 à 98 ( bleu et rouge plus clairs ) forment 4 hélices A à D ( résidus 26 à 98 ) et A'à D'( résidus 126 à 198 ) .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	résidus	résidu	NOM	_	_	13	subj	_	_	_	_	_
3	26	26	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	à	à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	98	98	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	(	(	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
7	bleu	bleu	ADJ	_	_	13	periph	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	rouge	rouge	ADJ	_	_	7	para	_	_	_	_	_
10	plus	plus	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	clairs	clair	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	)	)	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	forment	former	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	4	4	NUM	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	hélices	hélice	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	A	A	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	à	à	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
18	D	D	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	(	(	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	résidus	résidu	NOM	_	_	18	parenth	_	_	_	_	_
21	26	26	NUM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	à	à	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	98	98	NUM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	)	)	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
25	et	et	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
26	A'à	A'à	NOM	_	_	15	para	_	_	_	_	_
27	D'	D'	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	(	(	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	résidus	résidu	NOM	_	_	26	parenth	_	_	_	_	_
30	126	126	NUM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	à	à	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	198	198	NUM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	)	)	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3724
# text = Les résidus 10 à 25 forment deux feuillets ß arrangés en épingle à cheveux .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	résidus	résidu	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	10	10	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	à	à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	25	25	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	forment	former	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	deux	deux	NUM	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	feuillets	feuillet	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	ß	"	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	arrangés	arranger	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	en	en	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	épingle	épingle	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	à	à	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	cheveux	cheveu	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3725
# text = Les résidus 68 à 74 montrés sont ceux impliqués dans l'interaction avec l'ARN polymérase sur les promoteurs rr B P1 ou proP P2 .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	résidus	résidu	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	68	68	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	à	à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	74	74	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	montrés	montrer	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	ceux	celui	PRQ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	impliqués	impliquer	VPP	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	dans	dans	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	l'	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	interaction	interaction	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	avec	avec	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
15	ARN	ARN	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
16	polymérase	polymérase	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
17	sur	sur	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	les	le	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	rr	ra	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	B	B	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	P1	P1	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
23	ou	ou	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
24	proP	pro-	NOM	_	_	22	para	_	_	_	_	_
25	P2	P2	NOM	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3726
# text = B . Modèle représentant la surface de Fis en interaction avec l'ADN , courbé .
1	B	b	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	Modèle	Modèle	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
4	représentant	représenter	VPR	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	surface	surface	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	Fis	Fis	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	en	en	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
10	interaction	interaction	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	avec	avec	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	ADN	ADN	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
15	courbé	courber	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3727
# text = Les résidus 68 à 74 sont montrés en couleur .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	résidus	résidu	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	68	68	NUM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	à	à	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	74	74	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	sont	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
7	montrés	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	en	en	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	couleur	couleur	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3728
# text = Figure 16 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	16	16	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3729
# text = Régulation du promoteur de fis
1	Régulation	régulation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	du	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	promoteur	promoteur	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3730
# text = Les séquences encadrées sont les régions - 35 ,
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	séquences	séquence	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	encadrées	encadrer	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	régions	région	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	-	- 35	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
8	35	35	NUM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3731
# text = - 10 et le site majeur d'initiation de la transcription , au dessus duquel une flèche en gras souligne la force de ce site .
1	-	-	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
2	10	10	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	site	site	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
6	majeur	majeur	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	d'	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	initiation	initiation	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	la	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	transcription	transcription	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	au	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
14	dessus	dessus	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	duquel	de	P+PRO	_	_	20	periph	_	_	_	_	_
16	une	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	flèche	flèche	NOM	_	_	20	subj	_	_	_	_	_
18	en	en	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	gras	gras	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	souligne	souligner	VRB	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	force	force	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	ce	ce	DET	_	_	25	spe	_	_	_	_	_
25	site	site	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3732
# text = La séquence discriminatrice riche en G-C et la région riche en A sont soulignées ;
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	séquence	séquence	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
3	discriminatrice	discriminateur	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	riche	riche	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	en	en	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	G-C	G-C	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	région	région	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
10	riche	riche	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	en	en	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	A	A	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	sont	être	VRB	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	soulignées	souligner	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	;	;	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3733
# text = les bases marquées d'un point sont importantes pour l'activité du promoteur .
1	les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	bases	base	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	marquées	marquer	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	un	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	point	point	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	sont	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	importantes	important	ADJ	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	pour	pour	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	activité	activité	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	du	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	promoteur	promoteur	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3734
# text = Les flèches pleines indiquent les régions nécessaires à la régulation par la réponse stringente et au cours de la phase de croissance ;
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	flèches	flèche	NOM	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
3	pleines	plein	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	indiquent	indiquer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	régions	région	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	nécessaires	nécessaire	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	à	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	la	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	régulation	régulation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	par	par	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	la	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	réponse	réponse	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	stringente	astringent	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	et	et	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	au	à	PRE	_	_	8	para	_	_	_	_	_
17	cours	cours	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	de	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	la	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	phase	phase	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	de	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	croissance	croissance	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	;	;	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3735
# text = celles en pointillés indiquent des régions avec des effets mineurs dans l'un ou l'autre des processus .
1	celles	celui	PRQ	_	_	4	subj	_	_	_	_	_
2	en	en	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	pointillés	pointiller	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	indiquent	indiquer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	des	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	régions	région	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	avec	avec	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
8	des	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	effets	effet	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	mineurs	mineur	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	dans	dans	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	un	un	PRQ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	ou	ou	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
15	l'	l'autre	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	autre	l'autre	PRQ	_	_	13	para	_	_	_	_	_
17	des	de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	processus	processus	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3736
# text = La connexion avec la concentration en CTP est aussi mise en valeur .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	connexion	connexion	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	avec	avec	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	concentration	concentration	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	CTP	CTP	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	est	être	VRB	_	_	10	aux	_	_	_	_	_
9	aussi	aussi	ADV	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	mise	mettre	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	en	en	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	valeur	valeur	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3737
# text = Figure 17 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	17	17	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3738
# text = Complémentarité entre l'ARNr 16S et l'extrémité 5 'non traduite de l'ARNm fis
1	Complémentarité	complémentarité	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	entre	entre	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	l'	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	ARNr	ARNr	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	16S	16S	NUM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	et	et	COO	_	_	8	mark	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	extrémité	extrémité	NOM	_	_	4	para	_	_	_	_	_
9	5	5	NUM	_	_	16	subj	_	_	_	_	_
10	'	'	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
11	non	non	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	traduite	traduire	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	ARNm	ARNm	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	fis	faire	VRB	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3739
# text = Les conformations prédites de l'extrémité 3 'de l'ARNr 16S sont représentées en absence ou en présence de l'ARNm de fis ( en gris ) . Le codon d'initiation de la traduction est souligné . Une interaction particulièrement forte existe entre l'extrémité 3 'de l'ARNr 16S et l'ARNm de fis .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	conformations	conformation	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
3	prédites	prédire	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	extrémité	extrémité	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	3	3	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	'	'	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	l'	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	ARNr	ARNr	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	16S	16S	NUM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	sont	être	VRB	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	représentées	représenter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	en	en	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	absence	absence	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	ou	ou	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	en	en	PRE	_	_	15	para	_	_	_	_	_
19	présence	présence	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	de	de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	l'	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	ARNm	ARNm	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
25	(	(	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
26	en	en	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
27	gris	gris	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	)	)	PUNC	_	_	0	root	_	_	_	_	_
29	.	.	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
30	Le	Le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	codon	codon	NOM	_	_	38	subj	_	_	_	_	_
32	d'	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	initiation	initiation	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	la	le	DET	_	_	36	spe	_	_	_	_	_
36	traduction	traduction	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
37	est	être	VRB	_	_	38	aux	_	_	_	_	_
38	souligné	souligner	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
39	.	.	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
40	Une	Une	DET	_	_	41	spe	_	_	_	_	_
41	interaction	interaction	NOM	_	_	44	subj	_	_	_	_	_
42	particulièrement	particulièrement	ADV	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
43	forte	fort	ADJ	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
44	existe	exister	VRB	_	_	38	dep	_	_	_	_	_
45	entre	entre	PRE	_	_	44	dep	_	_	_	_	_
46	l'	le	DET	_	_	47	spe	_	_	_	_	_
47	extrémité	extrémité	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
48	3	3	NUM	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
49	'	'	PUNC	_	_	58	punc	_	_	_	_	_
50	de	de	PRE	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
51	l'	le	DET	_	_	52	spe	_	_	_	_	_
52	ARNr	ARNr	NOM	_	_	50	dep	_	_	_	_	_
53	16S	16S	NUM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
54	et	et	COO	_	_	56	mark	_	_	_	_	_
55	l'	le	DET	_	_	56	spe	_	_	_	_	_
56	ARNm	ARNm	NOM	_	_	52	para	_	_	_	_	_
57	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
58	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
59	.	.	PUNC	_	_	58	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3740
# text = Celle  -ci empêcherait , en absence de BipA , le démarrage de la traduction .
1	Celle	Celle	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
2	 -ci	 -ci	ADJ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	empêcherait	empêcher	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
5	en	en absence de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	absence	en absence de	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	de	en absence de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	BipA	BipA	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
10	le	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	démarrage	démarrage	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	la	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	traduction	traduction	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3741
# text = Figure 18 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	18	18	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3742
# text = Région promotrice de rrnB
1	Région	région	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	promotrice	promoteur	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	rrnB	rrnB	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3743
# text = Pour chacun des deux promoteurs , le + 1 de transcription , les boîtes - 10 et - 35 , les séquences en amont ( UP elements ) et les sites de fixation de Fis sont indiqués .
1	Pour	pour	PRE	_	_	37	periph	_	_	_	_	_
2	chacun	chacun	PRQ	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	deux	deux	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	promoteurs	promoteur	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	le	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	+	+ 1	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	1	1	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	transcription	transcription	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
13	les	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	boîtes	boîte	NOM	_	_	37	subj	_	_	_	_	_
15	-	- 10	PUNC	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	10	10	NUM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	et	et	COO	_	_	18	mark	_	_	_	_	_
18	-	- 35	PUNC	_	_	14	coord	_	_	_	_	_
19	35	35	NUM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
21	les	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	séquences	séquence	NOM	_	_	14	para	_	_	_	_	_
23	en	en	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	amont	amont	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	(	(	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
26	UP	UP	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
27	elements	elements	NOM	_	_	22	parenth	_	_	_	_	_
28	)	)	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
29	et	et	COO	_	_	31	mark	_	_	_	_	_
30	les	le	DET	_	_	31	spe	_	_	_	_	_
31	sites	site	NOM	_	_	22	para	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	fixation	fixation	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	de	de	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	Fis	Fis	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	sont	être	VRB	_	_	37	aux	_	_	_	_	_
37	indiqués	indiquer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
38	.	.	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3744
# text = Figure 19 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	19	19	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3745
# text = Modèle d'interaction de Fis avec l'ARN polymérase sur le promoteur rr B P1
1	Modèle	modèle	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	d'	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	interaction	interaction	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	Fis	Fis	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	avec	avec	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
8	ARN	ARN	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	polymérase	polymérase	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	sur	sur	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	le	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	promoteur	promoteur	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	rr	ra	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	B	B	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	P1	P1	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3746
# text = La transcription est majoritairement activée par la fixation de Fis sur le site I , centré à
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	transcription	transcription	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	est	est	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	majoritairement	majoritairement	ADV	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	activée	activer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	fixation	fixation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	Fis	Fis	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	sur	sur	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
12	le	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	site	site	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	I	I	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
16	centré	centré	NUM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
17	à	à	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3747
# text = - 71 . Les deux CTD des sous-unités & 206;& 177; se lient à l'ADN , l'un en contact avec Fis et l'autre sur l'élément en amont du promoteur ( UP ) .
1	-	-	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
2	71	71	NUM	_	_	11	periph	_	_	_	_	_
3	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	Les	Les	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	deux	deux	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	CTD	CTD	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
7	des	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	sous-unités	sous-	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	α	α	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	se	se	CLI	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	lient	lier	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
12	à	à	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	l'	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	ADN	ADN	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	un	un	PRQ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
18	en	en	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
19	contact	contact	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	avec	avec	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
21	Fis	Fis	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	24	mark	_	_	_	_	_
23	l'	l'autre	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	autre	l'autre	PRQ	_	_	21	para	_	_	_	_	_
25	sur	sur	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	l'	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	élément	élément	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
28	en	en	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	amont	amont	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	du	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
31	promoteur	promoteur	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	(	(	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
33	UP	UP	NOM	_	_	31	parenth	_	_	_	_	_
34	)	)	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3748
# text = Figure 20 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	20	20	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3749
# text = Système de recombinaison par Hin
1	Système	système	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	par	par	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	Hin	Hin	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3750
# text = Hin ( en gris ) se fixe aux sites de recombinaison hixL et hixR ( a ) , et Fis ( en jaune ) se lie aux deux domaines « enhancer » sur un substrat superenroulé ( b ) .
1	Hin	hin	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
2	(	(	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
3	en	en	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
4	gris	gris	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	)	)	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
6	se	se	CLI	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	fixe	fixer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	aux	à	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	sites	site	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	recombinaison	recombinaison	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	hixL	hixL	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	hixR	hixR	ADJ	_	_	12	para	_	_	_	_	_
15	(	(	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	a	avoir	_	_	_	9	parenth	_	_	_	_	_
17	)	)	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
18	,	,	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	26	mark	_	_	_	_	_
20	Fis	Fis	NOM	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
21	(	(	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
22	en	en	PRE	_	_	26	periph	_	_	_	_	_
23	jaune	jaune	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	)	)	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_
25	se	se	CLI	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
26	lie	lier	VRB	_	_	7	para	_	_	_	_	_
27	aux	à	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	deux	deux	NUM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
29	domaines	domaine	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	«	«	PUNC	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
31	enhancer	enhancer	CL+V	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
32	»	»	PUNC	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
33	sur	sur	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
34	un	un	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	substrat	substrat	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
36	superenroulé	super-	ADJ	_	_	35	dep	_	_	_	_	_
37	(	(	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
38	b	boulevard	NOM	_	_	35	parenth	_	_	_	_	_
39	)	)	PUNC	_	_	38	punc	_	_	_	_	_
40	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3751
# text = Le complexe d'inversion est assemblé avec l'aide de HU ( c ) .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	complexe	complexe	NOM	_	_	6	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	inversion	inversion	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	est	être	VRB	_	_	6	aux	_	_	_	_	_
6	assemblé	assembler	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	avec	avec	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	aide	aide	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	HU	HU	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	(	ce	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
13	c	ce	CLS	_	_	0	root	_	_	_	_	_
14	)	ce	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	13	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3752
# text = En d , le fragment d'ADN entre hixL et hixR a été inversé .
1	En	en	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	d	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	fragment	fragment	NOM	_	_	14	periph	_	_	_	_	_
6	d'	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ADN	ADN	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
8	entre	entre	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	hixL	hixL	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	et	et	COO	_	_	11	mark	_	_	_	_	_
11	hixR	hixR	NOM	_	_	9	para	_	_	_	_	_
12	a	avoir	VRB	_	_	13	aux	_	_	_	_	_
13	été	être	VPP	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	inversé	inverser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3753
# text = Figure 21 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	21	21	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3754
# text = Types de structures formées par MukB
1	Types	type	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	structures	structure	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	formées	former	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	par	par	PRE	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	MukB	MukB	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3755
# text = En haut , les deux formes prises par le dimère ( forme en V ou anneau ) sont montrées .
1	En	en	PRE	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
2	haut	haut	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	deux	deux	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	formes	forme	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
7	prises	prendre	VPP	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	par	par	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	le	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	dimère	dimère	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	(	(	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	forme	forme	NOM	_	_	6	parenth	_	_	_	_	_
13	en	en	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	V	V	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	ou	ou	COO	_	_	16	mark	_	_	_	_	_
16	anneau	anneau	NOM	_	_	14	para	_	_	_	_	_
17	)	)	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
18	sont	être	VRB	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
19	montrées	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3756
# text = Au milieu , la formation d'une fibre intermoléculaire , et en bas une structure en rosette sont schématisées .
1	Au	à	PRE	_	_	19	periph	_	_	_	_	_
2	milieu	milieu	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	formation	formation	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
6	d'	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	une	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	fibre	fibre	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	intermoléculaire	intermoléculaire	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	15	mark	_	_	_	_	_
12	en	en bas	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	bas	en bas	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	une	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	structure	structure	NOM	_	_	5	para	_	_	_	_	_
16	en	en	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	rosette	rosette	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	sont	être	VRB	_	_	19	aux	_	_	_	_	_
19	schématisées	schématiser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3757
# text = Un modèle de compaction de l'ADN ( en gris ) par les protéines de type SMC ( en bleu et jaune ) , est montré en bas à droite .
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	modèle	modèle	NOM	_	_	26	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	compaction	compaction	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	l'	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	ADN	ADN	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	(	(	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
9	en	en	PRE	_	_	2	parenth	_	_	_	_	_
10	gris	gris	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	)	)	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_
12	par	par	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
13	les	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	protéines	protéine	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	type	type	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	SMC	SMC	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	(	(	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
19	en	en	PRE	_	_	14	parenth	_	_	_	_	_
20	bleu	bleu	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	et	et	COO	_	_	22	mark	_	_	_	_	_
22	jaune	jaune	NOM	_	_	20	para	_	_	_	_	_
23	)	)	PUNC	_	_	19	punc	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
25	est	être	VRB	_	_	26	aux	_	_	_	_	_
26	montré	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
27	en	en bas	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	bas	en bas	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	à	à	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
30	droite	droite	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	26	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3758
# text = L'ADN , comme les protéines SMC , prend alors une structure de type rosette .
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	ADN	ADN	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_
4	comme	comme	PRE	_	_	9	periph	_	_	_	_	_
5	les	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	protéines	protéine	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	SMC	SMC	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	,	,	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
9	prend	prendre	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	alors	alors	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	structure	structure	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	type	type	ADJ	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
15	rosette	rosette	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3759
# text = Figure 22 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	22	22	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3760
# text = Système rapporteur sensible à la superhélicité de l'ADN
1	Système	système	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	rapporteur	rapporteur	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	sensible	sensible	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	à	à	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	la	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	l'	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	ADN	ADN	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3761
# text = Représentation de la cassette topologique utilisée dans cette étude .
1	Représentation	représentation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	la	le	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	cassette	cassette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	topologique	topologique	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	utilisée	utiliser	VPP	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	dans	dans	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	cette	ce	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	étude	étude	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3762
# text = L'« inducteur de superenroulement » , formé d'un promoteur inductible et du gène rapporteur uidA est situé en amont du « rapporteur de superhélicité » , formé d'un promoteur sensible au superenroulement , gyrA , fusionné à un second gène rapporteur , lacZ. Les deux éléments sont séparés par un terminateur fort de la transcription ( épingle à cheveux ) .
1	L'	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
2	«	«	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
3	inducteur	inducteur	NOM	_	_	51	periph	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	superenroulement	super-	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	»	»	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
7	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
8	formé	former	VPP	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
9	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	un	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	promoteur	promoteur	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	inductible	inductible	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
14	du	de	PRE	_	_	9	para	_	_	_	_	_
15	gène	gène	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	rapporteur	rapporteur	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	uidA	uidA	VPR	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	est	est	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	situé	situer	VPP	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	en	en amont de	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	amont	en amont de	DET	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	du	en amont de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	«	«	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
24	rapporteur	rapporteur	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	»	»	PUNC	_	_	24	punc	_	_	_	_	_
28	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
29	formé	former	VPP	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
30	d'	de	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	un	un	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	promoteur	promoteur	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	sensible	sensible	ADJ	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	au	à	PRE	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
35	superenroulement	super-	NOM	_	_	34	dep	_	_	_	_	_
36	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
37	gyrA	gyrA	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
38	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
39	fusionné	fusionner	VPP	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
40	à	à	PRE	_	_	39	dep	_	_	_	_	_
41	un	un	DET	_	_	43	spe	_	_	_	_	_
42	second	second	ADJ	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
43	gène	gène	NOM	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
44	rapporteur	rapporteur	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	,	,	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
46	lacZ.	lacZ.	ADV	_	_	51	periph	_	_	_	_	_
47	Les	Les	DET	_	_	49	spe	_	_	_	_	_
48	deux	deux	NUM	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
49	éléments	élément	NOM	_	_	51	subj	_	_	_	_	_
50	sont	être	VRB	_	_	51	aux	_	_	_	_	_
51	séparés	séparer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
52	par	par	PRE	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	un	un	DET	_	_	54	spe	_	_	_	_	_
54	terminateur	terminateur	NOM	_	_	52	dep	_	_	_	_	_
55	fort	fort	ADJ	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
56	de	de	PRE	_	_	54	dep	_	_	_	_	_
57	la	le	DET	_	_	58	spe	_	_	_	_	_
58	transcription	transcription	NOM	_	_	56	dep	_	_	_	_	_
59	(	(	PUNC	_	_	60	punc	_	_	_	_	_
60	épingle	épingle	NOM	_	_	58	parenth	_	_	_	_	_
61	à	à	PRE	_	_	60	dep	_	_	_	_	_
62	cheveux	cheveu	NOM	_	_	61	dep	_	_	_	_	_
63	)	)	PUNC	_	_	60	punc	_	_	_	_	_
64	.	.	PUNC	_	_	51	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3763
# text = Figure 23 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	23	23	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3764
# text = Modèle de compaction du chromosome par H-NS et Fis
1	Modèle	modèle	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	compaction	compaction	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	du	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
5	chromosome	chromosome	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	H-NS	H-NS	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
9	Fis	Fis	NOM	_	_	7	para	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3765
# text = A .  Modèle de condensation de l'ADN par H-NS .
1	A	avoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	. 	. 	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_
3	Modèle	Modèle	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	condensation	condensation	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	ADN	ADN	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	H-NS	H-NS	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3766
# text = Des dimères d'H-NS ( formes ovales ) se fixent et polymérisent sur une molécule d'ADN .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	dimères	dimère	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	H-NS	H-NS	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	(	(	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	formes	forme	NOM	_	_	2	parenth	_	_	_	_	_
7	ovales	ovale	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	)	)	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
9	se	se	CLI	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	fixent	fixer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	et	et	COO	_	_	12	mark	_	_	_	_	_
12	polymérisent	polymériser	VRB	_	_	10	para	_	_	_	_	_
13	sur	sur	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	une	un	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	molécule	molécule	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	d'	de	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	ADN	ADN	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3767
# text = Quand deux brins d'ADN portant des molécules d'H-NS sont suffisamment proches , les protéines peuvent interagir avec l'autre brin d'ADN , ou entre elles ( voir structure de la Figure
1	Quand	quand	CSU	_	_	17	periph	_	_	_	_	_
2	deux	deux	NUM	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	brins	brin	NOM	_	_	11	subj	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	ADN	ADN	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	portant	porter	VPR	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
7	des	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	molécules	molécule	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	d'	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	H-NS	H-NS	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	sont	être	VRB	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
12	suffisamment	suffisamment	ADV	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
13	proches	proche	ADJ	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
15	les	le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	protéines	protéine	NOM	_	_	17	subj	_	_	_	_	_
17	peuvent	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
18	interagir	interagir	VNF	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	avec	avec	PRE	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	l'	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
21	autre	autre	ADJ	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	brin	brin	NOM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	d'	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	ADN	ADN	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	,	,	PUNC	_	_	27	punc	_	_	_	_	_
26	ou	ou	COO	_	_	27	mark	_	_	_	_	_
27	entre	entre	PRE	_	_	23	para	_	_	_	_	_
28	elles	lui	PRQ	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	(	(	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
30	voir	voir	VNF	_	_	0	root	_	_	_	_	_
31	structure	structure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
32	de	de	PRE	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
33	la	le	DET	_	_	34	spe	_	_	_	_	_
34	Figure	Figure	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3768
# text = 9 ) , formant ainsi un pontage .
1	9	9	NUM	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	)	)	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	formant	former	VPR	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
5	ainsi	ainsi	ADV	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	un	un	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	pontage	pontage	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3769
# text = Cette réaction est coopérative , la formation des premiers pontages entraînant de nouvelles interactions dans les « bulles » laissées libres .
1	Cette	Cette	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
2	réaction	réaction	NOM	_	_	3	subj	_	_	_	_	_
3	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	coopérative	coopératif	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	,	,	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	formation	formation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
8	des	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	premiers	premier	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
10	pontages	pontage	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	entraînant	entraîner	VPR	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
13	nouvelles	nouveau	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	interactions	interaction	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	dans	dans	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
16	les	le	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
17	«	«	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	bulles	bulle	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
19	»	»	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
20	laissées	laisser	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	libres	libre	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
22	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3770
# text = L'oligomérisation de H-NS crée un second niveau de condensation ( en bas ) .
1	L'	le	NOM	_	_	2	det	_	_	_	_	_
2	oligomérisation	le	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	H-NS	H-NS	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	crée	créer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	un	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
7	second	second	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	niveau	niveau	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
9	de	de	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	condensation	condensation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	(	(	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
12	en	en bas	PRE	_	_	5	parenth	_	_	_	_	_
13	bas	en bas	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	)	)	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3771
# text = B . Modèle de réarrangement de l'ADN par Fis .
1	B	b	NOM	_	_	3	periph	_	_	_	_	_
2	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
3	Modèle	Modèle	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	réarrangement	réarrangement	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	ADN	ADN	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	Fis	Fis	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	.	.	PUNC	_	_	3	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3772
# text = La fixation et la courbure de l'ADN par des dimères de Fis ( en jaune ) facilitent les structures formant des branches et des boucles dans l'ADN .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fixation	fixation	NOM	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
3	et	et	COO	_	_	5	mark	_	_	_	_	_
4	la	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	courbure	courbure	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	l'	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	ADN	ADN	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
10	des	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	dimères	dimère	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	Fis	Fis	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	(	(	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
15	en	en	PRE	_	_	18	periph	_	_	_	_	_
16	jaune	jaune	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	)	)	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_
18	facilitent	faciliter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
19	les	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	structures	structure	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
21	formant	former	VPR	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	des	de	PRE	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	branches	branche	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
25	des	de	PRE	_	_	22	para	_	_	_	_	_
26	boucles	boucle	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	dans	dans	PRE	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	l'	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	ADN	ADN	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	.	.	PUNC	_	_	18	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3773
# text = Notons que cette réorganisation permet de rapprocher des sites à priori éloignés ( en bleu ) .
1	Notons	noter	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	que	que	CSU	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	cette	ce	DET	_	_	4	spe	_	_	_	_	_
4	réorganisation	réorganisation	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
5	permet	permettre	VRB	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	rapprocher	rapprocher	VNF	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	des	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	sites	site	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	à	a priori	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
11	priori	a priori	ADV	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	éloignés	éloigné	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
13	(	(	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
14	en	en	PRE	_	_	7	parenth	_	_	_	_	_
15	bleu	bleu	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	)	)	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
17	.	.	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3774
# text = Figure 24 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	24	24	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3775
# text = Structure des macrodomaines d'E. coli et leur réponse à la topologie de l'ADN ( Travers et Muskhelishvili , 2005 )
1	Structure	structure	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	macrodomaines	macro-	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	d'	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	E.	E.	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	coli	coli	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	et	et	COO	_	_	9	mark	_	_	_	_	_
8	leur	son	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	réponse	réponse	NOM	_	_	6	para	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	topologie	topologie	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	de	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	l'	le	DET	_	_	15	spe	_	_	_	_	_
15	ADN	ADN	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	(	(	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_
17	Travers	Travers	NOM	_	_	15	parenth	_	_	_	_	_
18	et	et	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
19	Muskhelishvili	Muskhelishvili	NOM	_	_	17	para	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
21	2005	2005	NUM	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	)	)	PUNC	_	_	17	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3776
# text = Les macrodomaines ( cercle interne ) sont représentés d'après Valens et al. ( 2004 ) :
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	macrodomaines	macro-	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	(	(	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
4	cercle	cercle	NOM	_	_	2	parenth	_	_	_	_	_
5	interne	interne	ADJ	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	)	)	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_
7	sont	être	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	représentés	représenter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	d'	d'après	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	après	d'après	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	Valens	Valens	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	al.	al.	ADV	_	_	8	para	_	_	_	_	_
14	(	(	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	2004	2004	NUM	_	_	8	parenth	_	_	_	_	_
16	)	)	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
17	:	:	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3777
# text = en vert , le macrodomaine entourant oriC   ( Ori , l'origine de réplication ) , en rouge , celui entourant ter ( Ter , le terminus de réplication ) , en bleu les autres domaines cartographiés , séparés du domaine de oriC par des régions moins définies , en pointillés .
1	en	en	PRE	_	_	7	periph	_	_	_	_	_
2	vert	vert	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	le	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	macrodomaine	macro-	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
6	entourant	entourer	VPR	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	oriC	oriC	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	 	 	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	(	(	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	Ori	Ori	NOM	_	_	7	parenth	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
12	l'	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	origine	origine	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
14	de	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	réplication	réplication	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	)	)	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
17	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
18	en	en	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
19	rouge	rouge	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
21	celui	celui	PRQ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
22	entourant	entourer	VPR	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	ter	ter	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	(	(	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
25	Ter	Ter	NOM	_	_	22	parenth	_	_	_	_	_
26	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
27	le	le	DET	_	_	28	spe	_	_	_	_	_
28	terminus	terminus	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	réplication	réplication	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	)	)	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
32	,	,	PUNC	_	_	37	punc	_	_	_	_	_
33	en	en	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
34	bleu	bleu	NOM	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
35	les	le	DET	_	_	37	spe	_	_	_	_	_
36	autres	autre	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
37	domaines	domaine	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
38	cartographiés	cartographier	ADJ	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
39	,	,	PUNC	_	_	40	punc	_	_	_	_	_
40	séparés	séparer	VPP	_	_	37	dep	_	_	_	_	_
41	du	de	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
42	domaine	domaine	NOM	_	_	41	dep	_	_	_	_	_
43	de	de	PRE	_	_	42	dep	_	_	_	_	_
44	oriC	oriC	NOM	_	_	43	dep	_	_	_	_	_
45	par	par	PRE	_	_	40	dep	_	_	_	_	_
46	des	un	DET	_	_	47	spe	_	_	_	_	_
47	régions	région	NOM	_	_	45	dep	_	_	_	_	_
48	moins	moins	ADV	_	_	49	periph	_	_	_	_	_
49	définies	définir	VPP	_	_	47	dep	_	_	_	_	_
50	,	,	PUNC	_	_	51	punc	_	_	_	_	_
51	en	en	PRE	_	_	49	dep	_	_	_	_	_
52	pointillés	pointiller	ADJ	_	_	51	dep	_	_	_	_	_
53	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3778
# text = Les régions de gènes dont la transcription répond globalement à la superhélicité sont montrées en dehors du chromosome ( s / h dependence ) .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	régions	région	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	gènes	gène	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	dont	dont	PRQ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	transcription	transcription	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
8	répond	répondre	VRB	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
9	globalement	globalement	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	à	à	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	la	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	sont	être	VRB	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	montrées	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	en	en dehors de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	dehors	en dehors de	DET	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	du	en dehors de	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	chromosome	chromosome	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	(	(	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
20	s	ssh	NOM	_	_	18	parenth	_	_	_	_	_
21	/	sur	PUNC	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
22	h	heure	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	dependence	dependence	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	)	)	PUNC	_	_	20	punc	_	_	_	_	_
25	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3779
# text = En vert , les gènes répondant à un superenroulement négatif ;
1	En	en	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	vert	vert	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_
4	les	le	DET	_	_	5	spe	_	_	_	_	_
5	gènes	gène	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	répondant	répondre	VPR	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	à	à	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	un	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	superenroulement	super-	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	négatif	négatif	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	;	;	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3780
# text = en rouge , ceux répondant à un relâchement .
1	en	en	PRE	_	_	4	periph	_	_	_	_	_
2	rouge	rouge	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	ceux	celui	PRQ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	répondant	répondre	VPR	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	à	à	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	un	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	relâchement	relâchement	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	.	.	PUNC	_	_	4	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3781
# text = Une région riche en sites de fixation de Fis proche de ter est montrée ( fis clusters ) , et celle d'activité transcriptionnelle intense en période de croissance rapide , en gris .
1	Une	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	région	région	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
3	riche	riche	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	en	en	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	sites	site	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	de	de	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	fixation	fixation	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	Fis	Fis	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	proche	proche	ADJ	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	ter	ter	ADV	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	est	être	VRB	_	_	14	aux	_	_	_	_	_
14	montrée	montrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	(	(	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
16	fis	faire	VRB	_	_	14	parenth	_	_	_	_	_
17	clusters	lustre	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	)	)	PUNC	_	_	16	punc	_	_	_	_	_
19	,	,	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
21	celle	celui	PRQ	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	d'	de	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	activité	activité	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	transcriptionnelle	transcriptionnel	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	intense	intense	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
26	en	en	PRE	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
27	période	période	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	de	de	PRE	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	croissance	croissance	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	rapide	rapide	ADJ	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	,	,	PUNC	_	_	32	punc	_	_	_	_	_
32	en	en	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
33	gris	gris	NOM	_	_	32	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	21	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3782
# text = Figure 25 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	25	25	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3783
# text = Réorganisation du chromosome en fonction des conditions de croissance ( Travers et Muskhelishvili , 2005 )
1	Réorganisation	réorganisation	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	du	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	chromosome	chromosome	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	en	en	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	fonction	fonction	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	des	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
7	conditions	condition	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	croissance	croissance	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	(	(	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
11	Travers	Travers	NOM	_	_	7	parenth	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	13	mark	_	_	_	_	_
13	Muskhelishvili	Muskhelishvili	NOM	_	_	11	para	_	_	_	_	_
14	,	,	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_
15	2005	2005	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
16	)	)	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3784
# text = Les structures du chromosome formées dans des cellules en phase exponentielle de croissance indiquent que l'organisation des boucles et des sites de transcription dépend fortement du taux de croissance de la cellule .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	structures	structure	NOM	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
3	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	chromosome	chromosome	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	formées	former	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
6	dans	dans	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	des	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	cellules	cellule	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	en	en	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	phase	phase	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	exponentielle	exponentiel	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	croissance	croissance	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	indiquent	indiquer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
15	que	que	CSU	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	l'	le	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	organisation	organisation	NOM	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
18	des	de	PRE	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	boucles	boucle	NOM	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
21	des	de	PRE	_	_	18	para	_	_	_	_	_
22	sites	site	NOM	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	transcription	transcription	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	dépend	dépendre	VRB	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
26	fortement	fortement	ADV	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	du	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	taux	taux	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	croissance	croissance	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	de	de	PRE	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
32	la	le	DET	_	_	33	spe	_	_	_	_	_
33	cellule	cellule	NOM	_	_	31	dep	_	_	_	_	_
34	.	.	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3785
# text = Dans ces conditions de croissance , la structure globale est une forme circulaire ouverte mais des connections intramoléculaires sont possibles , et celles  -ci dépendent fortement de l'environnement dans lequel se trouve la cellule .
1	Dans	dans	PRE	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
2	ces	ce	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	conditions	condition	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	croissance	croissance	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	la	le	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	structure	structure	NOM	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
9	globale	global	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	une	un	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	forme	forme	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	circulaire	circulaire	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	ouverte	ouvrir	ADJ	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	mais	mais	COO	_	_	19	mark	_	_	_	_	_
16	des	un	DET	_	_	17	spe	_	_	_	_	_
17	connections	connection	NOM	_	_	19	subj	_	_	_	_	_
18	intramoléculaires	intramoléculaire	ADJ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	sont	être	VRB	_	_	10	para	_	_	_	_	_
20	possibles	possible	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	,	,	PUNC	_	_	25	punc	_	_	_	_	_
22	et	et	COO	_	_	25	mark	_	_	_	_	_
23	celles	celui	PRQ	_	_	25	subj	_	_	_	_	_
24	 -ci	 -ci	ADJ	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	dépendent	dépendre	VRB	_	_	19	para	_	_	_	_	_
26	fortement	fortement	ADV	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	de	de	PRE	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	l'	le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	environnement	environnement	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	dans	dans	PRE	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
31	lequel	lequel	PRQ	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
32	se	se	CLI	_	_	33	dep	_	_	_	_	_
33	trouve	trouver	VRB	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
34	la	le	DET	_	_	35	spe	_	_	_	_	_
35	cellule	cellule	NOM	_	_	33	subj	_	_	_	_	_
36	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3786
# text = Les structures formées en phase stationnaire sont basées sur une visualisation en microscopie électronique .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	structures	structure	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	formées	former	VPP	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	en	en	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	phase	phase	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	sont	être	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	basées	baser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	sur	sur	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	une	un	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	visualisation	visualisation	NOM	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
12	en	en	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	microscopie	microscopie	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	électronique	électronique	ADJ	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3787
# text = En début de phase stationnaire , on observe des structures toroïdales , qui deviennent cristallines en phase stationnaire prolongée , notamment sous l'action de Dps ( voir paragraphe I.B. 1 ) .
1	En	en début de	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	début	en début de	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	de	en début de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	phase	phase	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
7	on	on	CLS	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
8	observe	observer	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	des	un	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	structures	structure	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	toroïdales	toroïdal	ADJ	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	,	,	PUNC	_	_	14	punc	_	_	_	_	_
13	qui	qui	PRQ	_	_	14	subj	_	_	_	_	_
14	deviennent	devenir	VRB	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
15	cristallines	cristallin	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	en	en	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	phase	phase	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	stationnaire	stationnaire	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	prolongée	prolonger	VPP	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	,	,	PUNC	_	_	22	punc	_	_	_	_	_
21	notamment	notamment	ADV	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
22	sous	sous	PRE	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
23	l'	le	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	action	action	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	Dps	Dps	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
27	(	(	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
28	voir	voir	VNF	_	_	24	parenth	_	_	_	_	_
29	paragraphe	paragraphe	NOM	_	_	28	dep	_	_	_	_	_
30	I.B.	I.B.	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	1	1	NUM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	)	)	PUNC	_	_	28	punc	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3788
# text = Figure 26 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	26	26	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3789
# text = Boucle de régulation homéostatique de la superhélicité de l'ADN
1	Boucle	boucle	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	de	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	régulation	régulation	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	homéostatique	homéostatique	ADJ	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	la	le	DET	_	_	7	spe	_	_	_	_	_
7	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	de	de	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	ADN	ADN	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3790
# text = Les effets positifs sont représentés par des flèches , les inhibitions par des lignes terminées par un trait perpendiculaire .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	effets	effet	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	positifs	positif	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	sont	être	VRB	_	_	5	aux	_	_	_	_	_
5	représentés	représenter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	des	un	DET	_	_	8	spe	_	_	_	_	_
8	flèches	flèche	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
9	,	,	PUNC	_	_	11	punc	_	_	_	_	_
10	les	le	DET	_	_	11	spe	_	_	_	_	_
11	inhibitions	inhibition	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
12	par	par	PRE	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	des	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	lignes	ligne	NOM	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
15	terminées	terminer	VPP	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	par	par	PRE	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	un	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	trait	trait	NOM	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
19	perpendiculaire	perpendiculaire	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	5	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3791
# text = Deux boucles d'autorégulation sont ainsi reliées .
1	Deux	deux	NUM	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	boucles	boucle	NOM	_	_	7	subj	_	_	_	_	_
3	d'	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	autorégulation	autorégulation	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	sont	être	VRB	_	_	7	aux	_	_	_	_	_
6	ainsi	ainsi	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	reliées	relier	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	7	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3792
# text = L'ajout de nutriments pourrait activer directement la gyrase en augmentant le rapport
1	L'	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	ajout	ajout	NOM	_	_	5	subj	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	nutriments	nutriment	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	pourrait	pouvoir	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	activer	activer	VNF	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	directement	directement	ADV	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	la	le	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	gyrase	gyrase	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	en	en	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
11	augmentant	augmenter	VPR	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	le	le	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	rapport	rapport	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3793
# text = [ ATP ] / [ ADP ] .
1	[	(	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
2	ATP	ATP	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	]	)	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
4	/	sur	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
5	[	(	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
6	ADP	ADP	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
7	]	)	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_
8	.	.	PUNC	_	_	6	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3794
# text = La transcription de fis est ainsi activée par l'augmentation de superhélicité , de la concentration en CTP et par la levée du contrôle stringent sur fisP. Voir texte pour les détails .
1	La	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	transcription	transcription	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	de	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
4	fis	faire	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
5	est	est	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
6	ainsi	ainsi	ADV	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
7	activée	activer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
8	par	par	PRE	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	l'	le	DET	_	_	10	spe	_	_	_	_	_
10	augmentation	augmentation	NOM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
11	de	de	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	superhélicité	superhélicité	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	,	,	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_
14	de	de+le	PRE	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
15	la	de+le	DET	_	_	16	spe	_	_	_	_	_
16	concentration	concentration	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
17	en	en	PRE	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
18	CTP	CTP	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	et	et	COO	_	_	20	mark	_	_	_	_	_
20	par	par	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
21	la	le	DET	_	_	0	root	_	_	_	_	_
22	levée	levée	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
23	du	de	PRE	_	_	0	root	_	_	_	_	_
24	contrôle	contrôle	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	stringent	astringent	ADJ	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	sur	sur	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	fisP.	fisP.	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	Voir	Voir	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
29	texte	texte	NOM	_	_	27	dep	_	_	_	_	_
30	pour	pour	PRE	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
31	les	le	DET	_	_	32	spe	_	_	_	_	_
32	détails	détail	NOM	_	_	30	dep	_	_	_	_	_
33	.	.	PUNC	_	_	23	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3795
# text = Figure 27 :
1	Figure	figurer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	27	27	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	:	:	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3796
# text = Détermination du fitness de clones évolués par des expériences de compétitions
1	Détermination	détermination	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
2	du	de	PRE	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	fitness	fine	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	clones	clone	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	évolués	évolué	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	par	par	PRE	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
8	des	un	DET	_	_	9	spe	_	_	_	_	_
9	expériences	expérience	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
10	de	de	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	compétitions	compétition	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3797
# text = Un clone évolué et l'ancêtre de marqueur Ara opposé sont adaptés pendant 24h au milieu dans lequel le fitness doit être déterminé , le plus souvent du DM25 .
1	Un	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	clone	clone	NOM	_	_	12	subj	_	_	_	_	_
3	évolué	évolué	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	et	et	COO	_	_	6	mark	_	_	_	_	_
5	l'	le	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	2	para	_	_	_	_	_
7	de	de	PRE	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
8	marqueur	marqueur	NOM	_	_	7	dep	_	_	_	_	_
9	Ara	Ara	NOM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
10	opposé	opposer	ADJ	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
11	sont	être	VRB	_	_	12	aux	_	_	_	_	_
12	adaptés	adapter	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
13	pendant	pendant	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	24h	24h	NUM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	au	à	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
16	milieu	milieu	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	dans	dans	PRE	_	_	23	periph	_	_	_	_	_
18	lequel	lequel	PRQ	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
19	le	le	DET	_	_	20	spe	_	_	_	_	_
20	fitness	fine	NOM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
21	doit	devoir	VRB	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
22	être	être	VNF	_	_	23	aux	_	_	_	_	_
23	déterminé	déterminer	VPP	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
24	,	,	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
25	le	le plus	DET	_	_	26	spe	_	_	_	_	_
26	plus	le plus	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
27	souvent	souvent	ADV	_	_	16	dep	_	_	_	_	_
28	du	de+le	DET	_	_	29	spe	_	_	_	_	_
29	DM25	DM25	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
30	.	.	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3798
# text = Des volumes identiques de ces cultures sont ensuite utilisés pour inoculer une même culture .
1	Des	un	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	volumes	volume	NOM	_	_	9	subj	_	_	_	_	_
3	identiques	identique	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	de	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	ces	ce	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
6	cultures	culture	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
7	sont	être	VRB	_	_	9	aux	_	_	_	_	_
8	ensuite	ensuite	ADV	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
9	utilisés	utiliser	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
10	pour	pour	PRE	_	_	9	dep	_	_	_	_	_
11	inoculer	inoculer	VNF	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	une	un	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
13	même	même	ADJ	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
14	culture	culture	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
15	.	.	PUNC	_	_	9	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3799
# text = A l'instant du mélange ( t = 0 ) , un prélèvement est effectué et une dilution adéquate est étalée sur un milieu contenant du tétrazolium et de l'arabinose ( TA ) .
1	A	A	NOM	_	_	15	periph	_	_	_	_	_
2	l'	le	DET	_	_	3	spe	_	_	_	_	_
3	instant	instant	NOM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
4	du	de	PRE	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	mélange	mélange	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	(	(	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
7	t	t	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
8	=	égaler	VRB	_	_	5	parenth	_	_	_	_	_
9	0	0	NUM	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	)	)	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
11	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
12	un	un	DET	_	_	13	spe	_	_	_	_	_
13	prélèvement	prélèvement	NOM	_	_	15	subj	_	_	_	_	_
14	est	être	VRB	_	_	15	aux	_	_	_	_	_
15	effectué	effectuer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
16	et	et	COO	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
17	une	un	DET	_	_	18	spe	_	_	_	_	_
18	dilution	dilution	NOM	_	_	21	subj	_	_	_	_	_
19	adéquate	adéquat	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	est	être	VRB	_	_	21	aux	_	_	_	_	_
21	étalée	étaler	VPP	_	_	15	para	_	_	_	_	_
22	sur	sur	PRE	_	_	21	dep	_	_	_	_	_
23	un	un	DET	_	_	24	spe	_	_	_	_	_
24	milieu	milieu	NOM	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
25	contenant	contenir	VPR	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
26	du	de	PRE	_	_	24	dep	_	_	_	_	_
27	tétrazolium	tétrazolium	NOM	_	_	26	dep	_	_	_	_	_
28	et	et	COO	_	_	29	mark	_	_	_	_	_
29	de	de	PRE	_	_	26	para	_	_	_	_	_
30	l'	le	NOM	_	_	31	det	_	_	_	_	_
31	arabinose	le	NOM	_	_	29	dep	_	_	_	_	_
32	(	(	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
33	TA	TA	NOM	_	_	31	parenth	_	_	_	_	_
34	)	)	PUNC	_	_	33	punc	_	_	_	_	_
35	.	.	PUNC	_	_	15	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3800
# text = Les clones des populations Ara + y apparaîtront roses , alors que ceux des populations Ara- y apparaîtront rouges .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	clones	clone	NOM	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	populations	population	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	Ara	Ara	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	+	-	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
7	y	le	CLI	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	apparaîtront	apparaître	VRB	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
9	roses	rose	ADJ	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
10	,	,	PUNC	_	_	12	punc	_	_	_	_	_
11	alors	alors que	CSU	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
12	que	alors que	CSU	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
13	ceux	celui	PRQ	_	_	18	subj	_	_	_	_	_
14	des	de	PRE	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	populations	population	NOM	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	Ara-	Ara-	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	y	le	CLI	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
18	apparaîtront	apparaître	VRB	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
19	rouges	rouge	ADJ	_	_	18	dep	_	_	_	_	_
20	.	.	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3801
# text = Après 24h , un deuxième prélèvement est effectué et étalé sur TA .
1	Après	après	PRE	_	_	8	periph	_	_	_	_	_
2	24h	24h	NUM	_	_	1	dep	_	_	_	_	_
3	,	,	PUNC	_	_	1	punc	_	_	_	_	_
4	un	un	DET	_	_	6	spe	_	_	_	_	_
5	deuxième	deuxième	NUM	_	_	6	dep	_	_	_	_	_
6	prélèvement	prélèvement	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
7	est	être	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
8	effectué	effectuer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	et	et	COO	_	_	10	mark	_	_	_	_	_
10	étalé	étaler	VPP	_	_	8	para	_	_	_	_	_
11	sur	sur	PRE	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
12	TA	TA	NOM	_	_	11	dep	_	_	_	_	_
13	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3802
# text = Les colonies des deux compétiteurs sont alors dénombrées ( D ) et le taux de croissance de chaque compétiteur calculé .
1	Les	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	colonies	colonie	NOM	_	_	8	subj	_	_	_	_	_
3	des	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	deux	deux	NUM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
5	compétiteurs	compétiteur	NOM	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
6	sont	être	VRB	_	_	8	aux	_	_	_	_	_
7	alors	alors	ADV	_	_	8	dep	_	_	_	_	_
8	dénombrées	dénombrer	VPP	_	_	0	root	_	_	_	_	_
9	(	(	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
10	D	D	NOM	_	_	8	parenth	_	_	_	_	_
11	)	)	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_
12	et	et	COO	_	_	14	mark	_	_	_	_	_
13	le	le	DET	_	_	14	spe	_	_	_	_	_
14	taux	taux	NOM	_	_	21	mark	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	croissance	croissance	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	chaque	chaque	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	compétiteur	compétiteur	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	calculé	calculer	ADJ	_	_	19	dep	_	_	_	_	_
21	.	.	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3803
# text = Le fitness W du clone évolué ( e ) est le rapport du taux de croissance de ce clone sur le taux de croissance de l'ancêtre ( a ) .
1	Le	le	DET	_	_	2	spe	_	_	_	_	_
2	fitness	fin	ADJ	_	_	10	subj	_	_	_	_	_
3	W	W	NOM	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	du	de	PRE	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
5	clone	clone	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	évolué	évolué	ADJ	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	(	(	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
8	e	eh	ADV	_	_	10	periph	_	_	_	_	_
9	)	)	PUNC	_	_	8	punc	_	_	_	_	_
10	est	être	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
11	le	le	DET	_	_	12	spe	_	_	_	_	_
12	rapport	rapport	NOM	_	_	10	dep	_	_	_	_	_
13	du	de	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
14	taux	taux	NOM	_	_	13	dep	_	_	_	_	_
15	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
16	croissance	croissance	NOM	_	_	15	dep	_	_	_	_	_
17	de	de	PRE	_	_	14	dep	_	_	_	_	_
18	ce	ce	DET	_	_	19	spe	_	_	_	_	_
19	clone	clone	NOM	_	_	17	dep	_	_	_	_	_
20	sur	sur	PRE	_	_	12	dep	_	_	_	_	_
21	le	le	DET	_	_	22	spe	_	_	_	_	_
22	taux	taux	NOM	_	_	20	dep	_	_	_	_	_
23	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
24	croissance	croissance	NOM	_	_	23	dep	_	_	_	_	_
25	de	de	PRE	_	_	22	dep	_	_	_	_	_
26	l'	le	DET	_	_	27	spe	_	_	_	_	_
27	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	25	dep	_	_	_	_	_
28	(	(	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
29	a	avoir	_	_	_	27	parenth	_	_	_	_	_
30	)	)	PUNC	_	_	29	punc	_	_	_	_	_
31	.	.	PUNC	_	_	10	punc	_	_	_	_	_

# sent_id = cefc-scientext-these_4_bio_crozat-3804
# text = Fitness clone évolué / clone ancêtre :
1	Fitness	Fitness	NOM	_	_	2	subj	_	_	_	_	_
2	clone	cloner	VRB	_	_	0	root	_	_	_	_	_
3	évolué	évolué	ADJ	_	_	2	dep	_	_	_	_	_
4	/	sur	PUNC	_	_	3	dep	_	_	_	_	_
5	clone	clone	NOM	_	_	4	dep	_	_	_	_	_
6	ancêtre	ancêtre	NOM	_	_	5	dep	_	_	_	_	_
7	:	:	PUNC	_	_	2	punc	_	_	_	_	_