# sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1 # text = Université Grenoble I - Université Joseph Fourier 1 Université université grenoble i NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Grenoble Grenoble NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 I I NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - - PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 Université Université NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 Joseph Joseph NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 Fourier Fourier NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2 # text = École doctorale de chimie et science du vivant 1 École école NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 doctorale doctoral ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 chimie chimie NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 6 science science NOM _ _ 4 para _ _ _ _ _ 7 du de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 vivant vivant NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3 # text = THÈSE 1 THÈSE thèse NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-4 # text = Pour l'obtention du grade de DOCTEUR DE L'UNIVERSITÉ DE GRENOBLE I 1 Pour pour PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 l' le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 obtention obtention NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 grade grade NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 DOCTEUR DOCTEUR NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 DE DE PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 L' L' DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 UNIVERSITÉ UNIVERSITÉ NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 DE DE PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 GRENOBLE GRENOBLE NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 I I NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-5 # text = Discipline : 1 Discipline discipliner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-6 # text = Biologie structurale 1 Biologie biologie NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 structurale structural ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-7 # text = La compaction de la chromatine au cours de la spermatogenèse Rôle des bromodomaines de la protéine Brdt 1 La là ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 compaction compaction VNF _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 chromatine chromatine NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 au au cours de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 cours au cours de NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de au cours de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 spermatogenèse spermatogenèse NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 Rôle Rôle NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 des un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 bromodomaines brome NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 protéine protéine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 Brdt Brdt NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-8 # text = Présentée et soutenue publiquement par 1 Présentée présenter ADJ _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 soutenue soutenir ADJ _ _ 1 para _ _ _ _ _ 4 publiquement publiquement ADV _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 par par NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-9 # text = Jeanne Morinière le 7 octobre 2008 1 Jeanne Jeanne NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Morinière Morinière NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 le le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 4 7 7 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 octobre 7 octobre 2008 NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 2008 2008 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-10 # text = Travaux effectués au Laboratoire Européen de Biologie Moléculaire de Grenoble 1 Travaux travail NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 effectués effectuer VPP _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 au à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 Laboratoire Laboratoire NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 Européen Européen NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 Biologie Biologie NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 Moléculaire Moléculaire ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 Grenoble Grenoble NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-11 # text = Devant le jury composé de : 1 Devant devant PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 le le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 jury jury NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 composé composé ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 : : PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-12 # text = Dr . 1 Dr Docteur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-13 # text = Robert Feil : 1 Robert Robert NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Feil Feil NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-14 # text = Rapporteur 1 Rapporteur rapporteur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-15 # text = Dr . 1 Dr Docteur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-16 # text = Marc Ruff : 1 Marc Marc NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Ruff Ruff NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-17 # text = Rapporteur 1 Rapporteur rapporteur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-18 # text = Dr . 1 Dr Docteur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-19 # text = Anne Houdusse : 1 Anne Anne NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Houdusse Houdusse NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-20 # text = Examinateur 1 Examinateur examinateur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-21 # text = Pr . 1 Pr pour PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-22 # text = Winfried Weissenhorn : 1 Winfried Winfried NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Weissenhorn Weissenhorn NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-23 # text = Examinateur 1 Examinateur examinateur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-24 # text = Dr . 1 Dr Docteur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-25 # text = Saadi Khochbin : 1 Saadi Saadi NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Khochbin Khochbin NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-26 # text = Examinateur dirigée par le 1 Examinateur examinateur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 dirigée dirigé ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 par par NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 le le _ _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-27 # text = Dr . 1 Dr Docteur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-28 # text = Christoph Müller 1 Christoph Christoph NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Müller Müller NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-29 # text = Table des matières 1 Table table NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 matières matière NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-30 # text = Préambule 6 1 Préambule préambule NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 6 6 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-31 # text = Introduction 8 1 Introduction introduction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 8 8 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-32 # text = A . Structures de la chromatine 8 1 A a NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Structures Structures VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 chromatine chromatine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 8 8 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-33 # text = I. Territoires fonctionnels 8 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Territoires Territoires NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 fonctionnels fonctionnel ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 8 8 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-34 # text = II . Le nucléofilament «  structure en collier de perles  » 8 1 II ii NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Le Le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 nucléofilament nucléé NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 5 «  «  PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 structure structurer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 en en PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 collier collier NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 perles perle NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11  »  » PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 8 8 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-35 # text = III . Structures d'ordre supérieur 14 1 III iii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Structures Structures VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ordre ordre NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 supérieur supérieur ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 14 14 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-36 # text = B . Dynamique de la structure chromatinienne 17 1 B b NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Dynamique Dynamique NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 structure structure NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 chromatinienne chromatinien ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 17 17 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-37 # text = I. Le remodelage ATP-dépendant 17 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Le Le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 remodelage remodelage NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ATP-dépendant ATP-dépendant N+V _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 17 17 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-38 # text = II . Modifications post-traductionnelles des histones 18 1 II ii NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Modifications Modifications NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 post-traductionnelles post-traductionnelles VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 des un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 histones histone NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 18 18 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-39 # text = III . Intégration de variants d'histones 20 1 III iii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Intégration Intégration NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 variants variant NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 d' de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 histones histone NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 20 20 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-40 # text = IV . Protéines de liaison 23 1 IV iv NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Protéines Protéines VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 liaison liaison NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 23 23 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-41 # text = C . Compaction de la chromatine pendant la spermiogenèse 24 1 C c NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Compaction Compaction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 chromatine chromatine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 pendant pendant PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 spermiogenèse spermiogenèse NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 24 24 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-42 # text = I. La spermatogenèse en bref 24 1 I. I. NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 La La NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 spermatogenèse spermatogenèse VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 en en bref PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 bref en bref NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 24 24 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-43 # text = II . Modifications de la chromatine au cours de la spermiogenèse 27 1 II ii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Modifications Modifications NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 chromatine chromatine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 au à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 cours cours NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 spermiogenèse spermiogenèse NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 27 27 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-44 # text = D . La protéine Brdt 32 1 D d NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 La La NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 protéine protéiner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 Brdt Brdt NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 32 32 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-45 # text = I. Fonctions 32 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Fonctions Fonctions NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 32 32 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-46 # text = II . Brdt appartient à la famille des protéines BET 33 1 II ii NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Brdt Brdt NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 appartient appartenir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 famille famille NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 protéines protéine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 BET BET NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 33 33 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-47 # text = E . Le bromodomaine  : 1 E e NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Le Le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 bromodomaine bromé NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5  : : PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-48 # text = structure et fonction 38 1 structure structure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 fonction fonction NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 4 38 38 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-49 # text = F . Déroulement du travail de thèse 41 1 F f NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Déroulement Déroulement NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 travail travail NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 thèse thèse NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 41 41 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-50 # text = Matériels et Méthodes 43 1 Matériels matériel NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 Méthodes Méthodes NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 4 43 43 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-51 # text = A . Production des protéines 43 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Production Production NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 protéines protéine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 43 43 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-52 # text = I. Clonage 43 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Clonage Clonage NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 43 43 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-53 # text = II . Expression 45 1 II ii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Expression Expression NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 45 45 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-54 # text = III . Purification 45 1 III iii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Purification Purification NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 45 45 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-55 # text = IV . Concentration et conservation 46 1 IV iv NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Concentration Concentration NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 conservation conservation NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 46 46 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-56 # text = B . Diffusion statique de lumière 47 1 B b NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Diffusion Diffusion NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 statique statique ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 lumière lumière NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 47 47 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-57 # text = C . Réticulation chimique 47 1 C c NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Réticulation Réticulation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 chimique chimique ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 47 47 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-58 # text = D . Microcalorimétrie 48 1 D d NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Microcalorimétrie Microcalorimétrie NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 48 48 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-59 # text = I. La calorimétrie à titration isotherme 48 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 La La DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 calorimétrie calorimétrie NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 titration titration NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 isotherme isotherme ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 48 48 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-60 # text = II . Mode opératoire 49 1 II ii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Mode Mode NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 opératoire opératoire ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 49 49 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-61 # text = E . Cristallographie aux rayons X 51 1 E e NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Cristallographie Cristallographie NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 aux à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 rayons rayons NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 X X ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 51 51 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-62 # text = I. Production des cristaux 51 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Production Production NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 cristaux cristal NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 51 51 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-63 # text = II . Quelques notions de cristallographie 53 1 II ii NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Quelques Quelques DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 notions notion NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 cristallographie cristallographie NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 53 53 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-64 # text = III . Collecte et traitement des données de diffraction 56 1 III iii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Collecte Collecte NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 traitement traitement NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 données donnée NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 diffraction diffraction NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 56 56 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-65 # text = IV . Affinement du modèle 59 1 IV iv NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Affinement Affinement NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 modèle modèle NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 59 59 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-66 # text = V. Validation du modèle moléculaire 61 1 V. verset NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Validation Validation NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 modèle modèle NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 61 61 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-67 # text = Résultats : 1 Résultats résultat NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-68 # text = Chapitre 1 1 Chapitre chapitrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 1 1 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-69 # text = Caractérisation biochimique des protéines ? 1 Caractérisation caractérisation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 biochimique biochimique ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 protéines protéine NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-70 # text = C-Brdt , BD1 et BD2 63 1 C-Brdt C-Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 BD1 BD1 NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 BD2 BD2 NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 63 63 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-71 # text = A . Analyse de la protéine ? 1 A avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 Analyse Analyse VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de+le PRE _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 5 la de+le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 protéine protéine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ? ? PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-72 # text = C-Brdt 63 1 C-Brdt C-Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 63 63 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-73 # text = I. Structure primaire 63 1 I. I. NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 Structure Structure VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 primaire primaire ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 63 63 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-74 # text = II . Comportement en solution 64 1 II ii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Comportement Comportement NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 en en PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 solution solution NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 64 64 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-75 # text = III . Recherche d'états oligomériques 64 1 III iii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Recherche Recherche VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 d' un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 états états NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 oligomériques oligomérique ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 64 64 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-76 # text = B . Analyse de la protéine BD1 66 1 B b NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Analyse Analyse VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 protéine protéine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 BD1 BD1 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 66 66 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-77 # text = I. Comportement en solution 66 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Comportement Comportement NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 en en PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 solution solution NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 66 66 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-78 # text = II . Recherche d'états oligomériques 67 1 II ii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Recherche Recherche VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 d' un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 états états NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 oligomériques oligomérique ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 67 67 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-79 # text = C . Analyse de la protéine BD2 69 1 C c NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Analyse Analyse VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 protéine protéine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 BD2 BD2 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 69 69 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-80 # text = D . Analyse du mélange des protéines BD1 et BD2 70 1 D d NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Analyse Analyse VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 du de+le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 mélange mélange NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 protéines protéine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 BD1 BD1 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 BD2 BD2 NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 11 70 70 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-81 # text = E . Analyse de la protéine BD1-K61Q 70 1 E e NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Analyse Analyse VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 protéine protéine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 BD1-K61Q BD1-K61Q NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 70 70 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-82 # text = Résultats : 1 Résultats résultat NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-83 # text = Chapitre 2 1 Chapitre chapitrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 2 2 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-84 # text = Quantification des affinités de Brdt vis à vis des différents états d'acétylation des queues N terminales des histones H3 et H4 71 1 Quantification quantification NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 affinités affinité NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 Brdt Brdt NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 vis vis NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 vis vis NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 des de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 différents différent ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 états états NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 d' de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 acétylation acétylation NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 des de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 queues queue NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 N N NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 terminales terminal ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 des de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 19 histones histone NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 H3 H3 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 22 H4 H4 NOM _ _ 20 para _ _ _ _ _ 23 71 71 NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-85 # text = A . Expériences préliminaires 71 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Expériences Expériences NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 préliminaires préliminaire ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 71 71 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-86 # text = I. Affinités de BD1 pour des peptides H4 courts 71 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Affinités Affinités NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 BD1 BD1 NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 pour pour PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 des un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 peptides peptide NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 H4 H4 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 courts court ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 71 71 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-87 # text = II . Affinités de BD2 pour des peptides H4 courts 72 1 II ii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Affinités Affinités NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD2 BD2 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 des un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 peptides peptide NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 H4 H4 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 courts court ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 72 72 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-88 # text = B . Affinités pour la queue N terminale de l'histone H4 72 1 B b NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Affinités Affinités NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 queue queue NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 N N NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 terminale terminal ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 histone histone NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 H4 H4 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 72 72 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-89 # text = I. Affinités pour un peptide H4 tétra-acétylé 73 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Affinités Affinités NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 pour pour PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 peptide peptide NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 H4 H4 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 73 73 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-90 # text = II . Affinités de BD1 des peptides H4 di-acétylés 75 1 II ii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Affinités Affinités NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD1 BD1 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 peptides peptide NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 H4 H4 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 di-acétylés di-acétylés NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 75 75 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-91 # text = III . Conclusion 75 1 III iii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Conclusion Conclusion NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 75 75 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-92 # text = C . Affinités pour la queue N terminale de l'histone H3 77 1 C c NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Affinités Affinités NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 queue queue NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 N N NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 terminale terminal ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 histone histone NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 H3 H3 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 77 77 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-93 # text = I. Affinités de BD1 et BD2 pour un peptide H3 tétra-acétylé 77 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Affinités Affinités NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 BD1 BD1 NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 6 BD2 BD2 NOM _ _ 4 para _ _ _ _ _ 7 pour pour PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 un un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 peptide peptide NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 H3 H3 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 77 77 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-94 # text = II . Affinités de BD2 pour des peptides H3 mono et di-acétylés 78 1 II ii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Affinités Affinités NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD2 BD2 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 des un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 peptides peptide NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 H3 H3 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 mono mono NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 di-acétylés di-acétylés NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 13 78 78 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-95 # text = D . Affinités de la protéine BD1-K61Q 78 1 D d NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Affinités Affinités NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 protéine protéine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 BD1-K61Q BD1-K61Q NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 78 78 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-96 # text = Résultats : 1 Résultats résultat NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-97 # text = Chapitre 3 1 Chapitre chapitrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 3 3 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-98 # text = Structures cristallographiques des bromodomaines de Brdt en complexe avec les queues d'histones H3 et H4 80 1 Structures structure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 cristallographiques cristallographique ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 des un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 bromodomaines brome NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 Brdt Brdt NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 en le CLI _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 complexe complexer VRB _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 9 avec avec PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 les le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 queues queue NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 d' de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 histones histone NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 H3 H3 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 16 H4 H4 NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 17 80 80 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-99 # text = A . Structure de BD1 en complexe avec un peptide acétylé mimant la queue N terminale de l'histone H4 80 1 A a NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Structure Structure NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD1 BD1 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 en le CLI _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 complexe complexer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 avec avec PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 un un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 peptide peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 acétylé acétyle NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 mimant mimer VPR _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 queue queue NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 N N NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 terminale terminal ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 histone histone NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 H4 H4 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 80 80 NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-100 # text = I. Cristallisation de BD1 en complexe avec les peptides H4 tétra-acétylé et H 4 -K 5 K 8 ac 80 1 I. I. NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 2 Cristallisation Cristallisation NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 BD1 BD1 NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 en en PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 complexe complexe NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 avec avec PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 peptides peptide NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 H4 H4 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 H H NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 14 4 4 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 5 5 NUM _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 K K NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 8 8 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 ac ace NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 80 80 NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-101 # text = II . Résolution des structures cristallographiques de BD1 en complexe avec les peptides H4 tétra-acétylé et H 4 -K 5 K 8 ac 83 1 II ii NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Résolution Résolution NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 structures structure NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 cristallographiques cristallographique ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 BD1 BD1 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 en le CLI _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 complexe complexer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 avec avec PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 peptides peptide NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 H4 H4 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 17 H H NOM _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 18 4 4 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 -K -K VRB _ _ 10 para _ _ _ _ _ 20 5 5 NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 K K NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 8 8 NUM _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 ac ace NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 83 83 NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-102 # text = III . Arrangement dans l'unité asymétrique 88 1 III iii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Arrangement Arrangement NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 dans dans PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 unité unité NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 asymétrique asymétrique ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 88 88 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-103 # text = IV . Architecture de BD1 90 1 IV iv NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Architecture Architecture VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD1 BD1 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 90 90 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-104 # text = V. Surfaces et interactions du complexe BD 1 / H 4 -K 5 K 8 ac 92 1 V. verset NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 2 Surfaces Surfaces NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 4 interactions interaction NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 5 du de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 complexe complexe NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 BD BD NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 1 1 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 / sur PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 10 H H NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 4 4 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 5 5 NUM _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 K K NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 8 8 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 ac ace NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 92 92 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-105 # text = B . Structure de BD2 en complexe avec plusieurs peptides acétylés . 1 B b NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Structure Structure NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD2 BD2 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 en le CLI _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 complexe complexer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 avec avec PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 plusieurs plusieurs DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 peptides peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 acétylés acétyle NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-106 # text = 98 1 98 98 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-107 # text = I. Cristallisation de BD2 en complexe avec des peptides H3 et H4 98 1 I. I. NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 2 Cristallisation Cristallisation NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 BD2 BD2 NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 en le CLI _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 complexe complexer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 avec avec PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 des un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 peptides peptide NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 H3 H3 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 H4 H4 NOM _ _ 10 para _ _ _ _ _ 13 98 98 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-108 # text = II . Résolution des structures de BD2 en complexe avec des peptides H3 et H4 99 1 II ii NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Résolution Résolution NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 structures structure NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 BD2 BD2 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 en le CLI _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 complexe complexer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 avec avec PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 des un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 peptides peptide NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 H3 H3 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 H4 H4 NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 16 99 99 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-109 # text = III . Structure de BD2 en complexe avec le peptide H 3 -K 18 ac 102 1 III iii NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Structure Structure NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD2 BD2 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 en le CLI _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 complexe complexer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 avec avec PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 le le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 peptide peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 H H NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 3 3 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 -K -K VPR _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 18 18 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 ac ace NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 102 102 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-110 # text = C . Analyse des structures tridimensionnelles des bromodomaines de Brdt 109 1 C c NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Analyse Analyse VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 des un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 structures structure NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 tridimensionnelles tridimensionnel ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 des un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 bromodomaines brome NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 Brdt Brdt NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 109 109 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-111 # text = I. Des structures de bromodomaine canoniques 109 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Des Des PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 structures structure NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 bromodomaine oromo NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 canoniques canonique ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 109 109 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-112 # text = II . Interactions avec le peptide acétylé 110 1 II ii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Interactions Interactions NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 avec avec PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 peptide peptide NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 acétylé acétyle NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 110 110 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-113 # text = III . Particularités de l'interaction de BD1 et du peptide H 4 -K 5 K 8 ac 114 1 III iii NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Particularités Particularités NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 interaction interaction NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 BD1 BD1 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 du de PRE _ _ 7 para _ _ _ _ _ 11 peptide peptide NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 H H NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 4 4 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 5 5 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 K K NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 8 8 NUM _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 ac ace NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 114 114 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-114 # text = IV . Particularités de l'interaction de BD2 et du peptide H 3 K 18 ac 116 1 IV iv NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Particularités Particularités NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 interaction interaction NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 BD2 BD2 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 du de PRE _ _ 7 para _ _ _ _ _ 11 peptide peptide NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 H H NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 3 3 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 K K NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 18 18 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 ac ace NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 17 116 116 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-115 # text = Discussion et perspectives 119 1 Discussion discussion NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 perspectives perspective NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 4 119 119 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-116 # text = A . Importance du premier bromodomaine de Brdt 119 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Importance Importance NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 premier premier ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 bromodomaine brome NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 Brdt Brdt NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 119 119 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-117 # text = I. Brdt reconnaît l'histone H4 via son premier bromodomaine 119 1 I. I. NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 Brdt Brdt NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 reconnaît reconnaître VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 histone histone NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 H4 H4 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 via via PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 son son DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 9 premier premier ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 bromodomaine brome NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 119 119 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-118 # text = II . Brdt-BD1 reconnaît spécifiquement le motif di-acétylé K 5 / K 8 ac de H4 120 1 II ii NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 reconnaît reconnaître VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 spécifiquement spécifiquement ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 le le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 motif motif NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 di-acétylé NUMBER-acétyle NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 K K NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 5 5 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 / sur PUNC _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 K K NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 8 8 NUM _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 ac ace NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 H4 H4 NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 120 120 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-119 # text = B . Le second bromodomaine de Brdt reconnaît la modification H 3 K 18 ac 120 1 B b NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Le Le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 4 second second ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 bromodomaine oromo NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 Brdt Brdt NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 reconnaît reconnaître VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 modification modification NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 H H NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 3 3 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 K K NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 14 18 18 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 ac ace NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 120 120 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-120 # text = C . Comparaison des affinités de Brdt avec celles des autres protéines de la famille BET 121 1 C c NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Comparaison Comparaison NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 affinités affinité NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 Brdt Brdt NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 avec avec PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 celles celui PRQ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 autres autre ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 protéines protéine NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 famille famille NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 BET BET NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 121 121 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-121 # text = D . Déterminants structuraux à l'origine de la spécificité des bromodomaines de Brdt 124 1 D d NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Déterminants Déterminants NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 structuraux structural ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 origine origine NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 spécificité spécificité NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 des un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 bromodomaines brome NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 Brdt Brdt NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 124 124 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-122 # text = I. Importance de la boucle BC 124 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Importance Importance NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 boucle boucle NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 BC BC NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 124 124 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-123 # text = II . BD2 et la di-acétylation 127 1 II ii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 BD2 BD2 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 di-acétylation di-acétylation NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 7 127 127 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-124 # text = III .  Recherche d'autres sites potentiels pour BD2 127 1 III iii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 .  .  PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Recherche Recherche VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 d' un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 autres autre ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 sites site NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 potentiels potentiel ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 pour pour PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 BD2 BD2 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 127 127 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-125 # text = E . Dimérisation 129 1 E e NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Dimérisation Dimérisation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 129 129 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-126 # text = I. Cas de Brdt et de ses homologues 129 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Cas Cas NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 Brdt Brdt NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 3 para _ _ _ _ _ 7 ses son DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 homologues homologue NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 129 129 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-127 # text = II . Des modes de dimérisation ? 1 II ii NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Des Des DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 modes mode NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 dimérisation dimérisation NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 ? ? PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-128 # text = 130 1 130 130 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-129 # text = F . La mutation K61Q 130 1 F f NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 La La DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 mutation mutation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 K61Q K61Q NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 130 130 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-130 # text = I. Effet in vitro sur l'affinité vis-à-vis de H3 et H4 130 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Effet Effet NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 in in vitro ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 vitro in vitro ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 sur sur PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 affinité affinité NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 vis-à-vis vis-à-vis de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de vis-à-vis de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 H3 H3 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 H4 H4 NOM _ _ 10 para _ _ _ _ _ 13 130 130 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-131 # text = II . Effets in vivo 131 1 II ii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Effets Effets NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 in in vivo ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 vivo in vivo ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 131 131 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-132 # text = III .  Apports de la structure tridimensionnelle de BD1 dans la compréhension des effets de la mutation K61Q 132 1 III iii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 .  .  PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Apports Apports NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 structure structure NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 tridimensionnelle tridimensionnel ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 BD1 BD1 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 compréhension compréhension NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 des de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 effets effet NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 mutation mutation NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 K61Q K61Q NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 132 132 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-133 # text = IV . Hypothèses : 1 IV iv NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Hypothèses Hypothèses NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 : : PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-134 # text = à la recherche d'un mécanisme d'auto-régulation de Brdt 133 1 à à PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 la le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 recherche recherche NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 un un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 mécanisme mécanisme NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 d' de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 auto-régulation auto- NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 Brdt Brdt NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 133 133 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-135 # text = V. Conclusion 134 1 V. verset NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Conclusion Conclusion NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 134 134 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-136 # text = G. Perspectives 135 1 G. G. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Perspectives Perspectives NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 135 135 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-137 # text = I. Le rôle des régions adjacentes 135 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Le Le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 rôle rôle NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 régions région NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 adjacentes adjacent ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 135 135 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-138 # text = II . Un dialogue entre les deux bromodomaines de Brdt  ? 1 II ii NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Un Un NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 dialogue dialoguer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 entre entre PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 7 deux deux NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 bromodomaines oromo NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 Brdt Brdt NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11  ? ? PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-139 # text = 136 1 136 136 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-140 # text = III . Brdt et la compaction de la chromatine 137 1 III iii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Brdt Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 compaction compaction NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 chromatine chromatine NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 137 137 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-141 # text = IV . Remarque sur le cas des homologues CBP / P 300 139 1 IV iv NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Remarque Remarque VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 sur sur PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 cas cas NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 des de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 homologues homologue NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 CBP CBP NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 / sur PUNC _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 P P NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 300 300 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 139 139 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-142 # text = Conclusion générale 141 1 Conclusion conclusion NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 générale général ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 141 141 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-143 # text = Bibliographie 142 1 Bibliographie bibliographie NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 142 142 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-144 # text = Annexes 153 1 Annexes annexe NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 153 153 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-145 # text = Annexe 1 : 1 Annexe annexer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 1 1 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-146 # text = Librairies utilisées pour définir le résidu acétyl-lysine 154 1 Librairies librairie NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 utilisées utiliser VPP _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 définir définir VNF _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 résidu résidu NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 acétyl-lysine acétyle-lysine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 154 154 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-147 # text = Annexe 2 : 1 Annexe annexer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 2 2 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-148 # text = Alignement de séquence des homologues de la famille BET 155 1 Alignement alignement NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 séquence séquence NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 homologues homologue NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 famille famille NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 BET BET NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 155 155 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-149 # text = Annexe 3 : 1 Annexe annexer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 3 3 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-150 # text = Structures et affinités de bromodomaines 157 1 Structures structure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 affinités affinité NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 bromodomaines brome NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 157 157 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-151 # text = Annexe 4 : 1 Annexe annexer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-152 # text = Résultats détaillés des mesures d'ITC 160 1 Résultats résultat NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 détaillés détaillé ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 mesures mesure NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 d' de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ITC ITC NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 160 160 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-153 # text = Annexe 5 : 1 Annexe annexer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 5 5 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-154 # text = La mutation K61Q de Brdt et l'infertilité masculine ( article soumis ) 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 mutation mutation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 K61Q K61Q NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 Brdt Brdt NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 7 l' le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 infertilité infertilité NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 9 masculine masculin ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 ( ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 article article NOM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 12 soumis soumettre ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-155 # text = 174 1 174 174 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-156 # text = Préambule 1 Préambule préambule NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-157 # text = Nous avons étudié les bromodomaines de la protéine Brdt . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 étudié étudier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 bromodomaines brome NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 protéine protéine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 Brdt Brdt NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-158 # text = Ils sont impliqués dans la compaction du génome qui a lieu au cours des dernières étapes de la spermatogenèse chez les vertébrés . 1 Ils ils CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 sont être VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 impliqués impliquer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 dans dans PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 compaction compaction NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 du de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 génome génome NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 qui qui PRQ _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 10 a avoir VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 lieu lieu NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 au au cours de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 13 cours au cours de DET _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 des au cours de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 dernières dernier ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 étapes étape NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 spermatogenèse spermatogenèse NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 chez chez PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 21 les le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 vertébrés vertébré NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-159 # text = Dans cette étude nous allons essayer d'avancer dans la compréhension de la fonction de la protéine . 1 Dans dans PRE _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 cette ce DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 étude étude NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 nous nous CLS _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 5 allons aller VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 essayer essayer VNF _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 d' de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 avancer avancer VNF _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 dans dans PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 compréhension compréhension NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 fonction fonction NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 protéine protéine NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-160 # text = Pour cela il nous faut passer en revue ce qui est connu des phénomènes de compaction de la chromatine et en particulier de la compaction qui se produit au cours de la spermatogenèse . 1 Pour pour PRE _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 cela cela PRQ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 il il CLS _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 4 nous le CLI _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 faut falloir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 passer passer VNF _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 en en PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 revue revue NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ce ce PRQ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 qui qui PRQ _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 11 est être VRB _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 12 connu connaître VPP _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 des de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 phénomènes phénomène NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 compaction compaction NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 chromatine chromatine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 en en PRE _ _ 15 para _ _ _ _ _ 22 particulier particulier NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 compaction compaction NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 qui qui PRQ _ _ 28 subj _ _ _ _ _ 27 se se CLI _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 28 produit produire VRB _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 29 au au cours de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 cours au cours de NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 de au cours de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 la le DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 spermatogenèse spermatogenèse NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-161 # text = Dans le noyau des cellules eucaryotes , l'ADN s'associe à des protéines pour former la chromatine . 1 Dans dans PRE _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 le le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 noyau noyau NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 cellules cellule NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 eucaryotes eucaryote ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 ADN ADN NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 10 s' s' CLI _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 associe associer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 à à PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 des un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 protéines protéine NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 pour pour PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 16 former former VNF _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 chromatine chromatine NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-162 # text = La quasi-totalité du génome , soit environ 35000 gènes répartis sur presque 2 mètres d'ADN chez l'humain , est ainsi compactée et organisée dans un noyau dont le diamètre avoisine les 10 µM. L'unité fondamentale de la chromatine est le nucléosome . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 quasi-totalité quasi- NOM _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 génome génome NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 6 soit soit COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 7 environ environ ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 8 35000 35000 NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 gènes gène NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 10 répartis répartir VPP _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 sur sur PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 presque presque ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 13 2 2 NUM _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 mètres mètre NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 d' de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 ADN ADN NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 chez chez PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 18 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 humain humain ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 21 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 ainsi ainsi ADV _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 compactée compactée ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 25 organisée organiser VPP _ _ 21 para _ _ _ _ _ 26 dans dans PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 un un DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 noyau noyau NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 dont dont PRQ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 30 le le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 diamètre diamètre NOM _ _ 32 subj _ _ _ _ _ 32 avoisine avoisiner VRB _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 33 les le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 10 10 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 µM. micro- NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 L' L' DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 unité unité NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 38 fondamentale fondamental ADJ _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 de de PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 la le DET _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 41 chromatine chromatine NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 est est NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 le le DET _ _ 44 spe _ _ _ _ _ 44 nucléosome nucléé NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 45 . . PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-163 # text = Il est formé par l'enroulement de l'ADN autour de protéines appelées histones . 1 Il il CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 formé former VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 par par PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 enroulement enroulement NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 ADN ADN NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 autour autour de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 11 de autour de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 protéines protéine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 appelées appeler ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 histones histone NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-164 # text = Sa répétition tout au long de l'ADN forme le nucléofilament qui constitue le premier niveau de compaction de l'ADN . 1 Sa son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 répétition répétition NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 tout tout au long de ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 au tout au long de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 long tout au long de NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de tout au long de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 l' le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 ADN ADN NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 forme former VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 le le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 nucléofilament nucléé NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 qui qui PRQ _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 13 constitue constituer VRB _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 le le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 15 premier premier ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 niveau niveau NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 compaction compaction NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 l' le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 ADN ADN NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-165 # text = Le nucléofilament peut adopter plusieurs niveaux d'organisation plus compacts , allant d'une fibre de 30 nm de diamètre au niveau de condensation le plus élevé atteint au sein du chromosome métaphasique . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 nucléofilament nucléé NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 peut pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 adopter adopter VNF _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 plusieurs plusieurs DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 niveaux niveau NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 d' de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 organisation organisation NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 plus plus ADV _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 compacts compact ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 allant aller VPR _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 13 d' de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 une un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 fibre fibre NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 30 30 NUM _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 nm minute NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 diamètre diamètre NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 au à PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 niveau niveau NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 condensation condensation NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 le le plus DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 plus le plus ADV _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 27 élevé élever ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 28 atteint atteindre VPP _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 29 au au sein de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 sein au sein de DET _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 du au sein de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 chromosome chromosome NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 métaphasique métaphasique ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-166 # text = Dans le cas de la spermatogenèse , la condensation finale de l'ADN est six fois plus forte que dans le cas des chromosomes mitotiques des cellules somatiques . 1 Dans dans PRE _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 2 le le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 cas cas NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 spermatogenèse spermatogenèse NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 condensation condensation NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 10 finale final ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 l' le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 ADN ADN NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 six six NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 fois fois NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 17 plus plus ADV _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 forte fort ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 19 que que CSU _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 dans dans PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 le le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 cas cas NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 des de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 chromosomes chromosome NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 mitotiques mitotique ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 des de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 cellules cellule NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 somatiques somatique ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-167 # text = Les histones subissent une acétylation massive avant d'être en grande partie remplacées par de petites protéines basiques appelées protéines de transition qui seront elles-même remplacées par d'autres protéines , les protamines . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 histones histone NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 subissent subir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 une un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 acétylation acétylation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 massive massif ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 avant avant de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 d' avant de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 être être VNF _ _ 13 aux _ _ _ _ _ 10 en en PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 11 grande grand ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 partie partie NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 remplacées remplacer VPP _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 14 par par PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de un DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 16 petites petit ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 protéines protéine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 basiques basique ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 appelées appeler ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 protéines protéine NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 transition transition NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 qui qui PRQ _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 24 seront être VRB _ _ 26 aux _ _ _ _ _ 25 elles-même lui-même PRQ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 26 remplacées remplacer VPP _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 27 par par PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 d' un DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 29 autres autre ADJ _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 30 protéines protéine NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 31 , , PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 32 les le DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 protamines pro- NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 34 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-168 # text = Ce phénomène est nécessaire pour permettre au spermatozoïde d'être le plus mobile possible et implique que la cellule puisse temporairement fonctionner sans l'ADN nucléaire . 1 Ce ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 phénomène phénomène NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 nécessaire nécessaire ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 permettre permettre VNF _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 au à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 spermatozoïde spermatozoïde NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 d' de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 être être VNF _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 12 plus plus ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 mobile mobile ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 possible possible ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 16 implique impliquer VRB _ _ 3 para _ _ _ _ _ 17 que que CSU _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 cellule cellule NOM _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 20 puisse pouvoir VRB _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 temporairement temporairement ADV _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 fonctionner fonctionner VNF _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 sans sans PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 l' le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 ADN ADN NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 nucléaire nucléaire ADJ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-169 # text = La protéine Brdt est impliquée dans les premières étapes de cette compaction , avant le remplacement des histones par des protéines de transition . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 protéine protéine NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 Brdt Brdt NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 est être VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 impliquée impliquer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 dans dans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 8 premières premier ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 étapes étape NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 cette ce DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 compaction compaction NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 avant avant PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 15 le le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 remplacement remplacement NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 des de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 histones histone NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 par par PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 des un DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 protéines protéine NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 transition transition NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-170 # text = Ce remodelage a comme substrat une chromatine de composition similaire à celle des cellules somatiques . 1 Ce ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 remodelage remodelage NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 comme comme PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 substrat substrat NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 une un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 chromatine chromatine NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 composition composition NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 similaire similaire ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 à à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 celle celui PRQ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 des de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 cellules cellule NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 somatiques somatique ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-171 # text = Les mécanismes impliqués doivent en conséquence être comparables à ceux observés dans les cellules somatiques . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 mécanismes mécanisme NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 impliqués impliquer ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 doivent devoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 en en PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 conséquence conséquence NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 être être VNF _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 comparables comparable ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 ceux celui PRQ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 observés observer VPP _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 dans dans PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 cellules cellule NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 somatiques somatique ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-172 # text = Dans l'introduction qui va suivre , nous étudierons la structure de la chromatine et sa dynamique . 1 Dans dans PRE _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 l' le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 introduction introduction NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 qui qui PRQ _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 5 va aller VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 suivre suivre VNF _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 8 nous nous CLS _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 9 étudierons étudier VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 structure structure NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 chromatine chromatine NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 16 sa son DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 dynamique dynamique NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-173 # text = Nous passerons ensuite en revue les facteurs susceptibles d'influer sur la compaction de la chromatine au cours de la spermatogenèse et nous examinerons la façon dont la protéine Brdt y est impliquée . 1 Nous nous CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 passerons passer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ensuite ensuite ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 en en PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 revue revue NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 facteurs facteur NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 susceptibles susceptible ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 d' de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 influer influer VNF _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 sur sur PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 compaction compaction NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 chromatine chromatine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 au au cours de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 18 cours au cours de NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 de au cours de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 spermatogenèse spermatogenèse NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 23 nous nous CLS _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 24 examinerons examiner VRB _ _ 2 para _ _ _ _ _ 25 la le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 façon façon NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 dont dont PRQ _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 28 la le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 protéine protéine NOM _ _ 33 subj _ _ _ _ _ 30 Brdt Brdt NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 y le CLI _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 32 est être VRB _ _ 33 aux _ _ _ _ _ 33 impliquée impliquer VPP _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 34 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-174 # text = Nous étudierons enfin les propriétés des bromodomaines . 1 Nous nous CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 étudierons étudier VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 enfin enfin ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 propriétés propriété NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 bromodomaines brome NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-175 # text = Partie I : 1 Partie partie NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 I I NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-176 # text = Introduction 1 Introduction introduction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-177 # text = Introduction 1 Introduction introduction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-178 # text = A . Structures de la chromatine 1 A a NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Structures Structures VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 chromatine chromatine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-179 # text = I. Territoires fonctionnels 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Territoires Territoires NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 fonctionnels fonctionnel ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-180 # text = Dans un noyau interphasique on peut observer par microscopie optique deux types de structures chromatiniennes : 1 Dans dans PRE _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 un un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 noyau noyau NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 interphasique interphasique ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 on on CLS _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 peut pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 observer observer VNF _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 par par PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 microscopie microscopie NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 optique optique ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 deux deux NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 types type NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 structures structure NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 chromatiniennes chromatinien ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 : : PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-181 # text = i . L'hétérochromatine , dense , est définie comme une structure qui ne change pas d'état de condensation au cours du cycle cellulaire . 1 i i NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 L' L' NOM _ _ 4 det _ _ _ _ _ 4 hétérochromatine le NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 dense dense ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 est être VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 définie définir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 comme comme PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 une un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 structure structure NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 qui qui PRQ _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 14 ne ne ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 change changer VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 pas pas ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 d' de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 état état NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 condensation condensation NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 au au cours de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 22 cours au cours de DET _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 du au cours de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 cycle cycle NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 cellulaire cellulaire ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-182 # text = Elle correspond à un état répressif vis à vis de la transcription ; 1 Elle elle CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 correspond correspondre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 à à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 état état NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 répressif répressif ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 vis vis NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 vis vis NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 transcription transcription NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 ; ; PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-183 # text = son niveau d'acétylation est faible . 1 son son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 niveau niveau NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 acétylation acétylation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 faible faible ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-184 # text = L'hétérochromatine est localisée principalement en périphérie du noyau et du nucléole . 1 L' le NOM _ _ 2 det _ _ _ _ _ 2 hétérochromatine le NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 localisée localiser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 principalement principalement ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 en en PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 périphérie périphérie NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 noyau noyau NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 du de PRE _ _ 8 para _ _ _ _ _ 12 nucléole nucléole NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-185 # text = On distingue l'hétérochromatine constitutive qui contient peu de gènes , formée principalement de séquences répétées et dont les plus grandes régions sont situées à proximité des centromères ( hétérochromatine péricentrique ) et des télomères , de l'hétérochromatine facultative qui contient des régions codantes , comme le chromosome X inactif chez la femelle des mammifères . 1 On on CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 distingue distinguer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 l' le NOM _ _ 4 det _ _ _ _ _ 4 hétérochromatine le NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 constitutive constitutif ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 qui qui PRQ _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 7 contient contenir VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 peu peu ADV _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 gènes gène NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 12 formée former VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 13 principalement principalement ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 séquences séquence NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 répétées répéter ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 18 dont dont PRQ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 19 les le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 20 plus plus ADV _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 grandes grand ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 22 régions région NOM _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 23 sont être VRB _ _ 24 aux _ _ _ _ _ 24 situées situer VPP _ _ 14 para _ _ _ _ _ 25 à à PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 proximité proximité NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 des de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 centromères centro- NUM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 ( ( PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 30 hétérochromatine herero NOM _ _ 28 parenth _ _ _ _ _ 31 péricentrique péricentrique ADJ _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 ) ) PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 33 et et COO _ _ 34 mark _ _ _ _ _ 34 des de PRE _ _ 27 para _ _ _ _ _ 35 télomères télomères NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 37 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 38 l' le NOM _ _ 39 det _ _ _ _ _ 39 hétérochromatine le NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 facultative facultatif ADJ _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 qui qui PRQ _ _ 42 subj _ _ _ _ _ 42 contient contenir VRB _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 43 des un DET _ _ 44 spe _ _ _ _ _ 44 régions région NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 45 codantes codant ADJ _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 , , PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 47 comme comme PRE _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 48 le le DET _ _ 49 spe _ _ _ _ _ 49 chromosome chromosome NOM _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 50 X X ADJ _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 51 inactif inactif ADJ _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 52 chez chez PRE _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 53 la le DET _ _ 54 spe _ _ _ _ _ 54 femelle femelle NOM _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 55 des de PRE _ _ 54 dep _ _ _ _ _ 56 mammifères mammifère NOM _ _ 55 dep _ _ _ _ _ 57 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-186 # text = ii . 1 ii if NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-187 # text = L'euchromatine , claire , est décondensée . 1 L' le NOM _ _ 2 det _ _ _ _ _ 2 euchromatine le NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 4 claire claire NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 6 est est NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 décondensée dé- ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-188 # text = Elle est répartie à l'intérieur du nucléoplasme et contient les régions actives du génome . 1 Elle elle CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 répartie répartir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 intérieur intérieur NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 du de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 nucléoplasme nucléoplasme NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 contient contenir VRB _ _ 3 para _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 régions région NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 actives actif ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 du de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 génome génome NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-189 # text = II . Le nucléofilament «  structure en collier de perles  » a . 1 II ii NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Le Le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 nucléofilament nucléé NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 5 «  «  PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 structure structure NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 en en PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 collier collier NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 perles perle NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11  »  » PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 12 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-190 # text = la fibre de 11 nm 1 la le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 fibre fibre NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 11 11 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 nm minute NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-191 # text = Le nucléofilament , encore appelé fibre de 11 nm à cause de son diamètre , forme par enroulement de l'ADN autour des octamères d'histones un collier dont les nucléosomes sont les perles . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 nucléofilament nucléé NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 encore encore ADV _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 5 appelé appeler VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 fibre fibre NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 11 11 NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 nm minute NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 à à cause de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 11 cause à cause de NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 de à cause de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 son son DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 diamètre diamètre NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 16 forme former VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 par par PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 enroulement enroulement NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 l' le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 ADN ADN NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 autour autour de ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 des de+le PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 octamères coter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 d' de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 histones histone NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 un un DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 collier collier NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 29 dont dont PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 30 les le _ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 31 nucléosomes nucléé NOM _ _ 32 subj _ _ _ _ _ 32 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 33 les le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 perles perle NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-192 # text = Environ 1 Environ environ ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-193 # text = 80   % de l'ADN nucléaire est engagé dans la formation des nucléosomes . 1 80 80 NUM _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2   80   ADJ _ _ 3 det _ _ _ _ _ 3 % pourcent NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 ADN ADN NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 nucléaire nucléaire ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 est est NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 9 engagé engager VPP _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 formation formation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 13 des de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 nucléosomes nucléé A+V _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-194 # text = Le nucléosome est composé d'une particule de coeur et d'une région de liaison ( ou région internucléosomale ) qui relie deux particules de coeur adjacentes . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 nucléosome nucléé NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 composé composer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 d' de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 une un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 particule particule NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 coeur coeur NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 d' de PRE _ _ 5 para _ _ _ _ _ 12 une un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 région région NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 liaison liaison NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 17 ou ou COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 18 région région NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 19 internucléosomale internucléosomale ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 21 qui qui PRQ _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 22 relie relier VRB _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 23 deux deux NUM _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 particules particule NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 coeur coeur NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 adjacentes adjacent ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-195 # text = La longueur de l'ADN internucléosomale varie selon les espèces et le type cellulaire de 10 à 115 paires de bases environ . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 longueur longueur NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 ADN ADN NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 internucléosomale internucléosomale ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 varie varier VRB _ _ 19 det _ _ _ _ _ 8 selon selon PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 espèces espèce NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 12 le le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 type type NOM _ _ 10 para _ _ _ _ _ 14 cellulaire cellulaire ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 10 10 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 17 à à PRE _ _ 15 para _ _ _ _ _ 18 115 115 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 paires paire NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 bases base NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 environ environ ADV _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-196 # text = Au total , cet ADN constitue les 1 Au à PRE _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 total total NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 cet ce DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 ADN ADN NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 constitue constituer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 les le CLI _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-197 # text = 20 % restants de l'ADN nucléaire . 1 20 20 NUM _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 % pourcent NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 restants restant ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 ADN ADN NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 nucléaire nucléaire ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-198 # text = Des histones particulières , appelées histones de liaison sont incorporées au niveau de ces régions de liaison . 1 Des de PRE _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 histones histone NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 particulières particulier ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 appelées appeler ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 histones histone NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 liaison liaison NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 sont être VRB _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 incorporées incorporer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 au à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 niveau niveau NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ces ce DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 régions région NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 liaison liaison NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-199 # text = b . le nucléosome 1 b b NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 le le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 nucléosome nucléé A+V _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-200 # text = La structure du nucléosome a été très conservée au cours de l'évolution . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structure structure NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 nucléosome nucléé NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 a avoir VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 été être VPP _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 7 très très ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 conservée conserver VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 au au cours de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 cours au cours de NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de au cours de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 l' le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 évolution évolution NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-201 # text = La structure cristallographique de sa particule de coeur a été déterminée pour plusieurs espèces à des résolutions allant jusqu'à 1 , 9 Å ( Chantalat et al. , 2003 ; Clapier et al. , 2008 ; Luger and Richmond , 1998b ; Tsunaka et al. , 2005 ; White et al. , 2001 ; Luger et al. , 1997 ) [ Figure 1 ] . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structure structure NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 cristallographique cristallographique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 sa son DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 particule particule NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 coeur coeur NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 a avoir VRB _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 été être VPP _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 déterminée déterminer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 pour pour PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 plusieurs plusieurs DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 espèces espèce NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 à à PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 des un DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 résolutions résolution NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 allant aller VPR _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 jusqu'à jusqu'à PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 1 1 NUM _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 21 , 1 , 9 PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 22 9 9 NUM _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 Å Å NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 24 ( ( PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 25 Chantalat Chantalat NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 27 al. al. NOM _ _ 25 para _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 62 punc _ _ _ _ _ 29 2003 2003 NUM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 ; ; PUNC _ _ 62 punc _ _ _ _ _ 31 Clapier Clapier NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 33 mark _ _ _ _ _ 33 al. al. NOM _ _ 31 para _ _ _ _ _ 34 , , PUNC _ _ 62 punc _ _ _ _ _ 35 2008 2008 NUM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 36 ; ; PUNC _ _ 62 punc _ _ _ _ _ 37 Luger Luger NOM _ _ 39 periph _ _ _ _ _ 38 and luger and richmond NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 39 Richmond Richmond NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 40 , , PUNC _ _ 62 punc _ _ _ _ _ 41 1998b 1998b NUM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 ; ; PUNC _ _ 62 punc _ _ _ _ _ 43 Tsunaka Tsunaka NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 44 et et COO _ _ 45 mark _ _ _ _ _ 45 al. al. NOM _ _ 43 para _ _ _ _ _ 46 , , PUNC _ _ 62 punc _ _ _ _ _ 47 2005 2005 NUM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 48 ; ; PUNC _ _ 62 punc _ _ _ _ _ 49 White White NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 50 et et COO _ _ 53 mark _ _ _ _ _ 51 al. al. ADV _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 52 , , PUNC _ _ 53 punc _ _ _ _ _ 53 2001 2001 NUM _ _ 49 para _ _ _ _ _ 54 ; ; PUNC _ _ 62 punc _ _ _ _ _ 55 Luger Luger VNF _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 56 et et COO _ _ 57 mark _ _ _ _ _ 57 al. al. ADV _ _ 55 para _ _ _ _ _ 58 , , PUNC _ _ 62 punc _ _ _ _ _ 59 1997 1997 NUM _ _ 55 dep _ _ _ _ _ 60 ) ) PUNC _ _ 59 punc _ _ _ _ _ 61 [ ( PUNC _ _ 62 punc _ _ _ _ _ 62 Figure Figure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 63 1 1 NUM _ _ 62 dep _ _ _ _ _ 64 ] ) PUNC _ _ 63 punc _ _ _ _ _ 65 . . PUNC _ _ 62 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-202 # text = Elle est composée de 146 paires de bases d'ADN faisant 1.65 tour autour d'un octamère protéique comprenant deux exemplaires de chacune des histones H3 , H4 , H2A et H2B. L'ADN est maintenu par 116 liaisons hydrogène directes avec les histones localisées en 14 endroits distincts de la particule ( Luger and Richmond , 1998b ) . 1 Elle elle CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 composée composer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 146 146 NUM _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 paires paire NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 bases base NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 d' de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 ADN ADN NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 faisant faire VPR _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 1.65 1.65 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 tour tour NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 autour autour de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 d' autour de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 un un PRQ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 octamère coter VRB _ _ 36 subj _ _ _ _ _ 18 protéique protéique ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 comprenant comprendre VPR _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 deux deux NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 exemplaires exemplaire NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 chacune chacun PRQ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 des de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 histones histone NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 H3 H3 NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 H4 H4 NOM _ _ 26 para _ _ _ _ _ 29 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 30 H2A H2A NOM _ _ 28 para _ _ _ _ _ 31 et et COO _ _ 32 mark _ _ _ _ _ 32 H2B. H2B. NOM _ _ 30 para _ _ _ _ _ 33 L' L' DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 ADN ADN PRQ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 35 est être VRB _ _ 36 aux _ _ _ _ _ 36 maintenu maintenir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 37 par par PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 116 116 NUM _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 liaisons liaison NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 hydrogène hydrogène NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 directes direct ADJ _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 avec avec PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 43 les le DET _ _ 44 spe _ _ _ _ _ 44 histones histone NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 45 localisées localiser VPP _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 en en PRE _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 14 14 NUM _ _ 48 spe _ _ _ _ _ 48 endroits endroit NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 49 distincts distinct ADJ _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 de de PRE _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 51 la le DET _ _ 52 spe _ _ _ _ _ 52 particule particule NOM _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 53 ( ( PUNC _ _ 58 punc _ _ _ _ _ 54 Luger Luger NOM _ _ 56 dep _ _ _ _ _ 55 and luger and richmond NOM _ _ 56 dep _ _ _ _ _ 56 Richmond Richmond NOM _ _ 52 parenth _ _ _ _ _ 57 , , PUNC _ _ 58 punc _ _ _ _ _ 58 1998b 1998b NUM _ _ 56 para _ _ _ _ _ 59 ) ) PUNC _ _ 58 punc _ _ _ _ _ 60 . . PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-203 # text = Les queues N terminales des histones , flexibles , ne sont pas définies dans la structure cristallographique , sauf celle de H4 qui établit une interaction avec un dimère H2A-H2B appartenant à un nucléosome voisin et se trouve ainsi stabilisée ( Luger and Richmond , 1998a ) . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 queues queue NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 3 N N NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 terminales terminal ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 histones histone NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 8 flexibles flexible ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 10 ne ne ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 11 sont être VRB _ _ 13 aux _ _ _ _ _ 12 pas pas ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 définies définir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 dans dans PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 structure structure NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 cristallographique cristallographique ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 sauf sauf PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 20 celle celui PRQ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 H4 H4 NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 qui qui PRQ _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 24 établit établir VRB _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 25 une un DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 interaction interaction NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 avec avec PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 28 un un DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 dimère dimère NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 H2A-H2B H2A-H2B NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 appartenant appartenir VPR _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 à à PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 un un DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 nucléosome nucléé NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 voisin voisin ADJ _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 et et COO _ _ 38 mark _ _ _ _ _ 37 se se CLI _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 38 trouve trouver VRB _ _ 24 para _ _ _ _ _ 39 ainsi ainsi ADV _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 stabilisée stabiliser VPP _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 ( ( PUNC _ _ 44 punc _ _ _ _ _ 42 Luger Luger NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 43 and luger and richmond NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 44 Richmond Richmond NOM _ _ 38 parenth _ _ _ _ _ 45 , , PUNC _ _ 46 punc _ _ _ _ _ 46 1998a 1998a NUM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 47 ) ) PUNC _ _ 44 punc _ _ _ _ _ 48 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-204 # text = Ces queues portent de nombreux sites de modifications post-traductionnelles dont la combinatoire transmet d'importantes informations épigénétiques . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 queues queue NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 portent porter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 nombreux nombreux ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 sites site NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 modifications modification NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 post-traductionnelles post-traductionnelles ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 dont dont PRQ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 combinatoire combinatoire NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 13 transmet transmettre VRB _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 14 d' un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 15 importantes important ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 informations information NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 épigénétiques épigénétique ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-205 # text = Plusieurs aspects de la structure du nucléosome sont intéressants à noter pour comprendre sa dynamique ( d'après Luger , 2006 ) : 1 Plusieurs plusieurs DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 aspects aspect NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 structure structure NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 du de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 nucléosome nucléé NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 intéressants intéressant ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 à à PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 noter noter VNF _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 pour pour PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 comprendre comprendre VNF _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 sa son DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 dynamique dynamique NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 d' d'après PRE _ _ 13 parenth _ _ _ _ _ 18 après d'après NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 Luger Luger NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 2006 2006 NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 ) ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 23 : : PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-206 # text = i . Le nucléosome présente un assemblage modulable dans lequel les deux dimères H2A / H2B peuvent être retirés sans que l'interaction de l'ADN et du tétramère ( H3-H4 ) 2 ne soit rompue . 1 i i NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Le Le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 nucléosome nucléé NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 5 présente présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 un un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 assemblage assemblage NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 modulable modulable ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 dans dans PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 10 lequel lequel PRQ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 12 deux deux NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 dimères dimère NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 14 H2A H2A NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 / ou PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 H2B H2B NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 17 peuvent pouvoir VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 18 être être VNF _ _ 19 aux _ _ _ _ _ 19 retirés retirer VPP _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 sans sans que CSU _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 que sans que CSU _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 22 l' le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 interaction interaction NOM _ _ 36 subj _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 l' le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 ADN ADN NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 28 du de PRE _ _ 24 para _ _ _ _ _ 29 tétramère tétramère NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 ( ( PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 31 H3-H4 H3-H4 NOM _ _ 29 parenth _ _ _ _ _ 32 ) ) PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 33 2 2 NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 34 ne ne ADV _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 35 soit être VRB _ _ 36 aux _ _ _ _ _ 36 rompue rompre VPP _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-207 # text = Cela reflète le mode d'assemblage in vivo et in vitro de la particule . 1 Cela cela PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 reflète refléter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 le le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 mode mode NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 d' de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 assemblage assemblage NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 in in vivo ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 vivo in vivo ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 10 in in vitro ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 vitro in vitro ADV _ _ 8 para _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 particule particule NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-208 # text = ii . 1 ii if NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-209 # text = La surface du nucléosome est très principalement constituée par l'octamère d'histone et présente un relief électrostatique varié 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 surface surface NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 nucléosome nucléé NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 très très ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 principalement principalement ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 constituée constitué ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 par par NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 l' l'octamère NOM _ _ 11 det _ _ _ _ _ 11 octamère l'octamère NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 d' de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 histone histone NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 présente présente NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 16 un un DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 relief relief NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 18 électrostatique électrostatique ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 varié varier ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-210 # text = ( Chakravarthy et al. , 2005b ) . 1 ( ( PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 2 Chakravarthy Chakravarthy NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2005b 2005b NUM _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-211 # text = Cette surface est impliquée dans des interactions entre nucléosomes qui conditionnent la formation de structures chromatiniennes d'ordre supérieur . 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 surface surface NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 est est NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 impliquée impliquer VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 dans dans PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 des un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 interactions interaction NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 entre entre PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 nucléosomes nucléé A+V _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 qui qui PRQ _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 11 conditionnent conditionner VRB _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 formation formation NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 structures structure NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 chromatiniennes chromatinien ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 d' de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 ordre ordre NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 supérieur supérieur ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-212 # text = L'assemblage et le désassemblage des nucléosomes impliquent des protéines appelées chaperonnes qui prennent en charge les dimères d'histone . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 assemblage assemblage NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 4 le le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 désassemblage désassemblage NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 nucléosomes nucléé NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 impliquent impliquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 des un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 protéines protéine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 appelées appeler ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 chaperonnes chaperonner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 qui qui PRQ _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 14 prennent prendre VRB _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 15 en en PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 charge charge NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 les le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 dimères dimère NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 19 d' de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 histone histone NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-213 # text = L'insertion de variants d'histone implique des chaperonnes spécifiques . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 insertion insertion NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 variants variant NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 d' de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 histone histone NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 implique impliquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 des de+le PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 chaperonnes chaperonner NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 spécifiques spécifique ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-214 # text = Certaines propriétés du nucléosome sont importantes pour son assemblage et son désassemblage : 1 Certaines certain ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 propriétés propriété NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 nucléosome nucléé NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 importantes important ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 pour pour PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 son son DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 assemblage assemblage NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 11 son son DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 désassemblage désassemblage NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 13 : : PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-215 # text = i . Le tétramère ( H3-H4 ) 2 organise les 80 paires de bases centrales de l'ADN , alors que les ~ 40   pb latérales sont fixées plus faiblement par les dimères H2A-H2B , avec seulement une petite contribution de l'histone H3 . 1 i i NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Le Le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 tétramère tétramère NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 5 ( ( PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 H3-H4 H3-H4 NOM _ _ 4 parenth _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 8 2 2 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 organise organiser VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 11 80 80 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 paires paire NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 bases base NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 centrales central NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 l' le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 ADN ADN NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 20 alors alors que CSU _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 que alors que CSU _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 22 les le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 23 ~ environ ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 24 40 40 NUM _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25   40   ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 26 pb problème NOM _ _ 28 subj _ _ _ _ _ 27 latérales latéral ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 sont être VRB _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 29 fixées fixé ADJ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 plus plus ADV _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 31 faiblement faiblement ADV _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 32 par par PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 33 les le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 dimères dimère NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 H2A-H2B H2A-H2B NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 37 avec avec PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 38 seulement seulement ADV _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 39 une un DET _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 40 petite petit ADJ _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 41 contribution contribution NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 42 de de PRE _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 l' le DET _ _ 44 spe _ _ _ _ _ 44 histone histone NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 45 H3 H3 NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-216 # text = ii . 1 ii if NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-217 # text = Le dimère ( H2A-H2B ) établit avec le tétramère ( H3-H4 ) 2 des contacts étroits qui ne sont cependant pas suffisants pour stabiliser l'association des complexes en absence d'ADN ( Park and 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 dimère dimère NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 H2A-H2B H2A-H2B NOM _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 établit établir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 avec avec PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 tétramère tétramère NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 ( ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 H3-H4 H3-H4 NOM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 12 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 13 2 2 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 14 des de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 contacts contact NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 étroits étroit ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 qui qui PRQ _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 18 ne ne ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 sont être VRB _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 20 cependant cependant ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 pas pas ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 suffisants suffisant ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 23 pour pour PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 24 stabiliser stabiliser VNF _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 l' le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 association association NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 des de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 complexes complexe NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 en en PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 30 absence absence NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 d' de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 ADN ADN NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 ( ( PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 34 Park Park NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 35 and park and NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-218 # text = Luger , 2008 ) . 1 Luger luger VNF _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 2008 2008 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ) ) PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-219 # text = iii . 1 iii ici ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-220 # text = Étant donné l'association étroite des dimères ( H2A-H2B ) et ( H3-H4 ) , il est très probable que ces complexes soient les unités de bases utilisées lors de l'assemblage et du désassemblage des nucléosomes . 1 Étant étant donné PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 donné étant donné PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 3 l' le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 association association NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 étroite étroit ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 des un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 dimères dimère ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 H2A-H2B H2A-H2B NOM _ _ 7 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 37 mark _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 H3-H4 H3-H4 NOM _ _ 11 parenth _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 16 il il CLS _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 17 est être VRB _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 18 très très ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 probable probable ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 que que CSU _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 ces ce DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 complexes complexe NOM _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 23 soient être VRB _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 24 les le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 unités unité NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 bases base NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 utilisées utiliser VPP _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 29 lors lors de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 de lors de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 l' le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 assemblage assemblage NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 et et COO _ _ 34 mark _ _ _ _ _ 34 du de PRE _ _ 30 para _ _ _ _ _ 35 désassemblage désassemblage NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 des un DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 nucléosomes nucléé A+V _ _ 7 para _ _ _ _ _ 38 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-221 # text = L'analyse de la stoechiométrie du complexe formé par la chaperonne ASF et les histones H3 et H4 révèle d'ailleurs que c'est un dimère de ( H3-H4 ) qui est pris en charge ( English et al. , 2005 ) . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 analyse analyse NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 stoechiométrie stoechiométrie NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 du de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 complexe complexe NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 formé former VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 par par PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la la NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 chaperonne chaperonner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 ASF ASF NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 14 les le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 histones histone NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 16 H3 H3 NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 18 H4 H4 NOM _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 19 révèle révéler VRB _ _ 11 para _ _ _ _ _ 20 d' d'ailleurs PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 ailleurs d'ailleurs NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 que que CSU _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 23 c' ce CLS _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 24 est être VRB _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 un un DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 dimère dimère NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 28 ( ( PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 29 H3-H4 H3-H4 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 30 ) ) PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 31 qui qui PRQ _ _ 32 subj _ _ _ _ _ 32 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 33 pris prendre ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 34 en en PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 charge charge NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 ( ( PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 37 English English NOM _ _ 35 parenth _ _ _ _ _ 38 et et COO _ _ 41 mark _ _ _ _ _ 39 al. al. ADV _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 , , PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 41 2005 2005 NUM _ _ 37 para _ _ _ _ _ 42 ) ) PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 43 . . PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-222 # text = L'assemblage des nucléosomes procède par une étape de dépôt des dimères ( H3-H4 ) sur l'ADN suivie par une étape de dépôt des dimères 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 assemblage assemblage NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 nucléosomes nucléé NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 procède procéder VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 une un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 étape étape NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 dépôt dépôt NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 des de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 dimères dimère NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ( ( PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 H3-H4 H3-H4 NOM _ _ 12 parenth _ _ _ _ _ 15 ) ) PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 16 sur sur PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 17 l' le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 ADN ADN NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 suivie suivre VPP _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 par par PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 une un DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 étape étape NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 dépôt dépôt NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 des de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 dimères dimère NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-223 # text = ( H2A-H2B ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 H2A-H2B H2A-H2B NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-224 # text = Cet assemblage peut être déstabilisé de deux façons : 1 Cet ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 assemblage assemblage NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 peut pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 être être VNF _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 déstabilisé déstabiliser VPP _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 deux deux NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 façons façon NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 : : PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-225 # text = en modifiant l'interface entre les dimères ( H2A-H2B ) et le tétramère 1 en en PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 modifiant modifier VPR _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 l' le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 interface interface NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 entre entre PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 dimères dimère NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 H2A-H2B H2A-H2B NOM _ _ 7 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 12 le le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 tétramère tétramère NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-226 # text = ( H3-H4 ) 2 ou bien en modifiant l'interface entre les histones et l'ADN . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 H3-H4 H3-H4 NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 2 2 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 ou ou bien COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 6 bien ou bien ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 en en PRE _ _ 4 para _ _ _ _ _ 8 modifiant modifier VPR _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 interface interface NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 entre entre PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 histones histone NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 15 l' le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 ADN ADN NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-227 # text = c . Les histones i . 1 c c NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Les Les DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 histones histone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 i if NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-228 # text = Les histones de coeur 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 histones histone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 coeur coeur NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-229 # text = Les histones qui forment l'octamère du nucléosome sont appelées histones de coeur . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 histones histone NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 qui qui PRQ _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 forment former VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 l' l'octamère NOM _ _ 6 det _ _ _ _ _ 6 octamère l'octamère NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 du de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 nucléosome nucléé NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 appelées appeler ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 histones histone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 coeur coeur NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-230 # text = Ce sont les histones H2A , H2B , H3 et H4 . 1 Ce ce CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 les le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 histones histone NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 H2A H2A NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 H2B H2B NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 H3 H3 NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 H4 H4 NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-231 # text = Ces petites protéines basiques sont très conservées au cours de l'évolution . 1 Ces ce DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 petites petit ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 protéines protéine NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 4 basiques basique ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 sont être VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 6 très très ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 conservées conserver VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 au au cours de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 cours au cours de NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de au cours de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 l' le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 évolution évolution NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-232 # text = Elles se composent d'un domaine central globulaire et d'extrémités N et C terminales non structurées . 1 Elles elles CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 se se CLI _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 composent composer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 un un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 domaine domaine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 central central NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 globulaire globulaire ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 d' de PRE _ _ 8 para _ _ _ _ _ 11 extrémités extrémité NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 N N NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 C C NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 15 terminales terminal ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 non non ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 structurées structurer ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-233 # text = Il existe des formes variables de ces histones qui donnent à la chromatine des propriétés particulières . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 existe exister VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 des un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 formes forme NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 variables variable ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ces ce DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 histones histone NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 qui qui PRQ _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 10 donnent donner VRB _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 à à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 chromatine chromatine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 des de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 propriétés propriété NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 particulières particulier ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-234 # text = Nous examinerons plus loin les propriétés de ces variants . 1 Nous nous CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 examinerons examiner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 plus plus ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 loin loin ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 propriétés propriété NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 ces ce DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 variants variant NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-235 # text = La région la plus conservée des histones est leur domaine central , structuré en un motif appelé « histone fold » qui comprend trois hélices séparées par deux boucles ( Arents et al. , 1991 ) et qui permet la formation des dimères H2A-H2B et H3-H4 [ Figure 2 ] . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 région région NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 4 plus plus ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 conservée conservé ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 histones histone NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 leur son DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 domaine domaine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 central central NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 structuré structurer VPP _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 en en PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 un un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 motif motif NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 appelé appeler ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 « « PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 histone histone NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 fold fond NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 » » PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 22 qui qui PRQ _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 23 comprend comprendre VRB _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 24 trois trois NUM _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 hélices hélice NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 séparées séparer VPP _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 par par PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 deux deux NUM _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 boucles boucle NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 ( ( PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 31 Arents Arents NOM _ _ 29 parenth _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 35 mark _ _ _ _ _ 33 al. al. ADV _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 , , PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 35 1991 1991 NUM _ _ 31 para _ _ _ _ _ 36 ) ) PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 37 et et COO _ _ 39 mark _ _ _ _ _ 38 qui qui PRQ _ _ 39 subj _ _ _ _ _ 39 permet permettre VRB _ _ 23 para _ _ _ _ _ 40 la le DET _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 41 formation formation NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 des de PRE _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 dimères dimère NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 H2A-H2B H2A-H2B NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 et et COO _ _ 46 mark _ _ _ _ _ 46 H3-H4 H3-H4 NOM _ _ 44 para _ _ _ _ _ 47 [ ( PUNC _ _ 48 punc _ _ _ _ _ 48 Figure Figure NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 49 2 2 NUM _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 ] ) PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 51 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-236 # text = Les extrémités N et C terminales des histones , appelées queues , sont plus variables que les domaines centraux et sont dépourvues de structure secondaire . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 extrémités extrémité NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 3 N N NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 C C NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 6 terminales terminal ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 histones histone NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 10 appelées appeler ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 queues queue NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 13 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 plus plus ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 variables variable ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 que que CSU _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 les le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 domaines domaine NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 centraux central NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 21 sont être VRB _ _ 22 aux _ _ _ _ _ 22 dépourvues dépourvoir VPP _ _ 13 para _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 structure structure NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 secondaire secondaire ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-237 # text = Elles sont particulièrement riches en résidus lysine et arginine . 1 Elles elles CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 particulièrement particulièrement ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 riches riche ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 en en PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 résidus résidu NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 lysine lysine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 9 arginine arminien ADJ _ _ 4 para _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-238 # text = L'hypothèse la plus intuitive est que ces résidus chargés positivement établissent des interactions avec les phosphates de l'ADN , chargés négativement , et stabilisent ainsi la position de celui -ci sur le nucléosome . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 hypothèse hypothèse NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 4 plus plus ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 intuitive intuitif ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 que que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 ces ce DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 résidus résidu NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 10 chargés charger ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 positivement positivement ADV _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 établissent établir VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 13 des un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 interactions interaction NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 avec avec PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 phosphates phosphate NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 l' le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 ADN ADN NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 22 chargés charger ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 23 négativement négativement ADV _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 25 et et COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 26 stabilisent stabiliser VRB _ _ 12 para _ _ _ _ _ 27 ainsi ainsi ADV _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 la le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 position position NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 30 de de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 celui celui PRQ _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 -ci -ci ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 sur sur PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 34 le le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 nucléosome nucléé NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-239 # text = Il a en effet été montré que les queues des histones influencent l'accessibilité de l'ADN nucléosomal ( Lee et al. , 1993 ) . 1 Il il CLS _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 2 a avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 3 en en effet PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 4 effet en effet NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 été être VPP _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 que que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 queues queue NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 histones histone NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 influencent influencer VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 13 l' le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 accessibilité accessibilité NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 l' le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 ADN ADN NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 nucléosomal nucléosomal ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 Lee Lee NOM _ _ 17 parenth _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 22 al. al. ADV _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 1993 1993 NUM _ _ 20 para _ _ _ _ _ 25 ) ) PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-240 # text = Mais il est prédit que leur effet sur la respiration de la particule est faible ( Mutskov et al. , 1998 1 Mais mais COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 2 il il CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 prédit prédire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 que que CSU _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 leur son DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 effet effet NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 8 sur sur PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 respiration respiration NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 particule particule NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 est être VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 15 faible faible ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 17 Mutskov Mutskov NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 19 al. al. NOM _ _ 17 para _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 1998 1998 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-241 # text = ; Polach et al. , 2000 ) . 1 ; ; PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 2 Polach Polach NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 6 2000 2000 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-242 # text = Les queues des histones sont la cible de nombreuses modifications post-traductionnelles dont nous allons voir l'importance pour la fonction de la chromatine . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 queues queue NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 histones histone NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 cible cible NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 nombreuses nombreux ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 modifications modification NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 post-traductionnelles post-traductionnelles ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 dont dont PRQ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 13 nous nous CLS _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 14 allons aller VRB _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 15 voir voir VNF _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 l' le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 importance importance NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 pour pour PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 fonction fonction NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 la le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 chromatine chromatine NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-243 # text = ii . 1 ii if NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-244 # text = Les histones internucléosomales ou histones de liaison 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 histones histone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 internucléosomales internucléosomales ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ou ou COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 histones histone NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 liaison liaison NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-245 # text = L'histone canonique H1 ou un de ses variants peut s'associer avec la région de l'ADN qui lie deux nucléosomes adjacents . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 histone histone NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 3 canonique canonique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 H1 H1 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 ou ou COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 6 un un PRQ _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 ses son DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 variants variant NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 peut pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 s' s' CLI _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 associer associer VNF _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 avec avec PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 région région NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 l' le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 ADN ADN NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 qui qui PRQ _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 20 lie lier VRB _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 21 deux deux NUM _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 nucléosomes nucléé NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 adjacents adjacent ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-246 # text = Ces histones ne présentent pas d'homologie structurale avec les histones de l'octamère et doivent leur nom au fait qu'elles sont associées in vivo avec les nucléosomes dans un rapport stoechiométrique 1 : 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 histones histone NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 ne ne ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 présentent présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 pas pas ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 d' un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 homologie homologie NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 structurale structural ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 avec avec PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 les le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 histones histone NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de+le ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 l' de+le NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 octamère de+le NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 16 doivent devoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 leur son DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 nom nom NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 au à PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 fait fait NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 qu' que CSU _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 elles elles CLS _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 23 sont être VRB _ _ 24 aux _ _ _ _ _ 24 associées associer VPP _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 25 in in vivo ADV _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 26 vivo in vivo ADV _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 avec avec ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ 28 les le _ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 29 nucléosomes nucléé A+V _ _ 0 root _ _ _ _ _ 30 dans dans PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 31 un un DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 rapport rapport NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 stoechiométrique stoechiométrique ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 1 1 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 35 : : PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-247 # text = 1 . La structure de H1 présente trois domaines  : 1 1 1 NUM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 La La DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 structure structure NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 H1 H1 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 présente présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 trois trois NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 domaines domaine NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10  : : PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-248 # text = deux extrémités N et C terminales non structurées sujettes à plusieurs modifications post-traductionnelles ( Godde and Ura , 2008 ) et une partie centrale , globulaire et conservée , dont la structure en « wing-hélice » à été déterminée pour la première fois en 1987 pour le variant héritrocitaire de poulet H5 ( Clore et al. , 1987 ) [ Figure 3 ] . 1 deux deux NUM _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 extrémités extrémité NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 N N NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 C C NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 6 terminales terminal ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 non non ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 structurées structurer ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 9 sujettes surjeter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 à à PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 plusieurs plusieurs DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 modifications modification NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 post-traductionnelles post-traductionnelles ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 15 Godde Godde NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 and godde and ura NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 Ura Ura NOM _ _ 12 parenth _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 19 2008 2008 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 ) ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 22 une un DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 partie partie NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 24 centrale central NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 globulaire globulaire ADJ _ _ 24 para _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 28 conservée conserver ADJ _ _ 26 para _ _ _ _ _ 29 , , PUNC _ _ 61 punc _ _ _ _ _ 30 dont dont PRQ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 31 la le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 structure structure NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 33 en en PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 « « PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 35 wing-hélice ping-hélice NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 » » PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 37 à à PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 38 été été NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 déterminée déterminer VPP _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 40 pour pour PRE _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 la le DET _ _ 43 spe _ _ _ _ _ 42 première premier ADJ _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 43 fois fois NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 44 en en PRE _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 45 1987 1987 NUM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 pour pour PRE _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 47 le le DET _ _ 48 spe _ _ _ _ _ 48 variant variant NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 49 héritrocitaire héritrocitaire ADJ _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 de de PRE _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 51 poulet poulet NOM _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 52 H5 H5 NOM _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 53 ( ( PUNC _ _ 54 punc _ _ _ _ _ 54 Clore Clore NOM _ _ 51 parenth _ _ _ _ _ 55 et et COO _ _ 58 mark _ _ _ _ _ 56 al. al. ADV _ _ 55 dep _ _ _ _ _ 57 , , PUNC _ _ 58 punc _ _ _ _ _ 58 1987 1987 NUM _ _ 54 para _ _ _ _ _ 59 ) ) PUNC _ _ 54 punc _ _ _ _ _ 60 [ ( PUNC _ _ 61 punc _ _ _ _ _ 61 Figure Figure NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 62 3 3 NUM _ _ 61 dep _ _ _ _ _ 63 ] ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 64 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-249 # text = Récemment les sites d'interactions de l'histone H 1 ° avec le nucléosome ont été déterminés par une analyse de mutagenèse dirigée 1 Récemment récemment ADV _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 2 les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 sites site NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 interactions interaction NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 l' le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 histone histone NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 H H NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 1 1 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 ° degré NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 avec avec PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 le le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 nucléosome nucléé NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 ont avoir VRB _ _ 16 aux _ _ _ _ _ 16 été être VPP _ _ 17 aux _ _ _ _ _ 17 déterminés déterminer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 par par PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 une un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 analyse analyse NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 mutagenèse muter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 dirigée diriger ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-250 # text = ( Brown et al. , 2006 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Brown Brown NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2006 2006 NUM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-251 # text = Cela a permis aux auteurs d'élaborer un modèle de l'interaction de l'histone de liaison avec le nucléosome [ Figure 1 Cela cela PRQ _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 a avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 permis permettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 aux à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 auteurs auteur NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 élaborer élaborer VNF _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 un un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 modèle modèle NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 l' le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 interaction interaction NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 l' le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 histone histone NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 liaison liaison NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 avec avec PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 le le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 nucléosome nucléé NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 [ ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 Figure Figure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-252 # text = 3 ] . 1 3 3 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ] ] PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-253 # text = In vitro l'histone H1 stabilise le nucléosome en stabilisant sa respiration et en rendant son glissement plus difficile ( Pennings et al. , 1994 ; Varga-Weisz et al. , 1995 ) . 1 In in vitro ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 vitro in vitro ADV _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 l' le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 histone histone NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 5 H1 H1 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 stabilise stabiliser VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 nucléosome nucléé NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 en en PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 stabilisant stabiliser VPR _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 sa son DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 respiration respiration NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 en en PRE _ _ 9 para _ _ _ _ _ 15 rendant rendre VPR _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 son son DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 glissement glissement NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 plus plus ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 difficile difficile ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 21 Pennings Pennings NOM _ _ 25 periph _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 23 al. al. NOM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 25 1994 1994 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 ; ; PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 Varga-Weisz Varga-Weisz NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 et et COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 29 al. al. ADV _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 31 1995 1995 NUM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 32 ) ) PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-254 # text = L'histone de liaison influence également le degré de compaction de la chromatine ( Thoma et al. , 1979 ; Thoma et al. , 1983 ) . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 histone histone NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 liaison liaison NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 influence influencer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 également également ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 degré degré NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 compaction compaction NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 chromatine chromatine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 Thoma Thoma NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 17 al. al. ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 1979 1979 NUM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 20 ; ; PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 21 Thoma Thoma NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 23 al. al. NOM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 1983 1983 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 26 ) ) PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-255 # text = Son retrait conduit à la décompaction 1 Son son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 retrait retrait NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 conduit conduire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le NOM _ _ 6 det _ _ _ _ _ 6 décompaction le NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-256 # text = ( Fan et al. , 2005 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Fan Fan NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2005 2005 NUM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-257 # text = A l'inverse , elle prévient également la formation de structures compactes telles que celle des chromosomes mitotiques ( Khochbin , 2001 ) . 1 A à PRE _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 l' le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 inverse inverse NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 elle elle CLS _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 prévient prévenir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 également également ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 formation formation NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 structures structure NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 compactes compact ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 telles tel ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 que que CSU _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 celle celui PRQ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 des de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 chromosomes chromosome NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 mitotiques mitotique ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 Khochbin Khochbin NOM _ _ 17 parenth _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 2001 2001 NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-258 # text = III . Structures d'ordre supérieur 1 III iii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Structures Structures VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ordre ordre NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 supérieur supérieur ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-259 # text = On parle d'ordre supérieur pour la compaction de la chromatine lorsque des structures se forment par repliement de la structure en « collier de perles » [ Figure 4 ] . 1 On on CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 parle parler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ordre ordre NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 supérieur supérieur ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 compaction compaction NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 chromatine chromatine NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 lorsque lorsque CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 13 des un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 structures structure NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 15 se se CLI _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 forment former VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 17 par par PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 repliement repliement NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 structure structure NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 en en PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 « « PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 collier collier NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 perles perle NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 » » PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 28 [ ( PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 29 Figure Figure NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 30 4 4 NUM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 ] ) PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-260 # text = Ces structures peuvent être perturbées par des variations de charges au niveau de la surface de l'octamère d'histone ou sur des queues des histones ou encore par l'ajout d'autres protéines à la structure de la chromatine . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structures structure NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 peuvent pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 être être VNF _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 perturbées perturber VPP _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 des un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 variations variation NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 charges charge NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 au à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 niveau niveau NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 surface surface NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de+le ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 l' de+le NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 octamère de+le NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 d' de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 histone histone NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 ou ou COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 22 sur sur PRE _ _ 19 para _ _ _ _ _ 23 des un DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 queues queue NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 des de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 histones histone NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 ou ou encore COO _ _ 29 mark _ _ _ _ _ 28 encore ou encore ADV _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 par par NOM _ _ 18 para _ _ _ _ _ 30 l' le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 ajout ajout NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 32 d' de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 autres autre ADJ _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 34 protéines protéine NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 à à PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 la le DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 structure structure NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 de de PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 la le DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 chromatine chromatine NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-261 # text = a . La fibre de 30 nm 1 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 La La DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 fibre fibre NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 30 30 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 nm minute NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-262 # text = Une fibre de 30 nm de diamètre se forme par enroulement du nucléofilament ( Tremethick , 2007 ) pour une revue sur la fibre de 30 nm ) . 1 Une un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 fibre fibre NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 30 30 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 nm minute NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 diamètre diamètre NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 se se CLI _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 forme former VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 par par PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 enroulement enroulement NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 du de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 nucléofilament nucléé NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ( ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 15 Tremethick Tremethick NOM _ _ 13 parenth _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 17 2007 2007 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 19 pour pour PRE _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 20 une un DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 revue revue NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 sur sur PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 fibre fibre NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 30 30 NUM _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 nm minute NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 ) ) PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-263 # text = Pour cette fibre , deux modèles sont actuellement discutés : 1 Pour pour PRE _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 cette ce DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 fibre fibre NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 deux deux NUM _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 modèles modèle NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 7 sont être VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 8 actuellement actuellement ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 discutés discuter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 : : PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-264 # text = l'un est issu d'observations par microscopie électronique sur des nucléofilaments de longue taille et contenant l'histone H1 . 1 l' l'un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 un l'un PRQ _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 issu issu ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 d' de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 observations observation NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 par par PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 microscopie microscopie NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 électronique électronique ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 sur sur PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 des un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 nucléofilaments nucléé NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 longue long ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 taille taille NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 contenant contenir VPR _ _ 13 para _ _ _ _ _ 18 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 histone histone NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 H1 H1 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-265 # text = Il propose une structure en solénoïde ( hélice à un point de départ ) 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 propose proposer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 une un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 structure structure NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 en en PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 solénoïde solénoïde NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 hélice hélice NOM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 9 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 un un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 point point NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 départ départ NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-266 # text = ( Robinson et al. , 2006 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Robinson Robinson NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2006 2006 NUM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-267 # text = L'autre provient de l'observation de la structure cristallographique à 9 Å d'une fibre contenant 4 nucléosomes ( Schalch et al. , 2005 ) et de données de réticulation chimique sur une fibre de 12 nucléosomes ( obtenues par le même laboratoire ) ( Dorigo et al. , 2004 ) . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 autre autre PRQ _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 provient provenir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 observation observation NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 structure structure NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 cristallographique cristallographique ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 à à PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 9 9 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 Å Å NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 d' de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 15 une un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 fibre fibre NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 contenant contenir VPR _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 4 4 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 nucléosomes nucléé A+_ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 Schalch Schalch NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 23 al. al. ADV _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 2005 2005 NUM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 26 ) ) PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 29 données donnée NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 de de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 réticulation réticulation NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 chimique chimique ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 sur sur PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 une un DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 fibre fibre NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 de de PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 12 12 NUM _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 nucléosomes nucléé NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 ( ( PUNC _ _ 40 punc _ _ _ _ _ 40 obtenues obtenir VPP _ _ 38 parenth _ _ _ _ _ 41 par par PRE _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 le le DET _ _ 44 spe _ _ _ _ _ 43 même même ADJ _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 44 laboratoire laboratoire NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 45 ) ) PUNC _ _ 40 punc _ _ _ _ _ 46 ( ( PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 47 Dorigo Dorigo NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 48 et et COO _ _ 51 mark _ _ _ _ _ 49 al. al. ADV _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 , , PUNC _ _ 51 punc _ _ _ _ _ 51 2004 2004 NUM _ _ 47 para _ _ _ _ _ 52 ) ) PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 53 . . PUNC _ _ 52 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-268 # text = Il propose une hélice en zig-zag à deux points de départ [ Figure 5 ] . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 propose proposer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 une un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 hélice hélice NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 en en PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 zig-zag zig NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 à à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 deux deux NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 points point NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 départ départ NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 [ ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Figure Figure NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 14 5 5 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 ] ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-269 # text = Le modèle du solénoïde est soutenu par le fait que le diamètre de la fibre n'augmente pas linéairement avec la longueur de l'ADN de liaison et par plusieurs résultats de modélisation par dynamique moléculaire ( Beard and 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 modèle modèle NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 solénoïde solénoïde NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 est être VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 soutenu soutenir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 par par PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 fait fait NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 que que CSU _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 diamètre diamètre NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 fibre fibre NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 n' ne ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 augmente augmenter VRB _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 18 pas pas ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 linéairement linéairement ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 avec avec PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 la le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 longueur longueur NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 l' le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 ADN ADN NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 27 liaison liaison NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 et et COO _ _ 29 mark _ _ _ _ _ 29 par par PRE _ _ 7 para _ _ _ _ _ 30 plusieurs plusieurs DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 résultats résultat NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 de de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 modélisation modélisation NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 par par PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 dynamique dynamique NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 ( ( PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 38 Beard Beard NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 39 and beard and NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-270 # text = Schlick , 2001 ; 1 Schlick Schlick NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 2001 2001 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ; ; PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-271 # text = Katritch et al. , 2000 ) . 1 Katritch Katritch NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 al. al. NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2000 2000 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-272 # text = Les auteurs de ce modèle proposent que la divergence entre les théories vient du fait que , contrairement aux fibres observées par microscopie électronique , la fibre observée par cristallographie est courte et ne contient pas l'histone de liaison H1 . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 auteurs auteur NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ce ce DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 modèle modèle NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 proposent proposer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 que que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 divergence divergence NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 10 entre entre PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 théories théorie NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 vient venir VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 14 du de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 fait fait NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 que que CSU _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 18 contrairement contrairement ADV _ _ 31 periph _ _ _ _ _ 19 aux à PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 fibres fibre NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 observées observer VPP _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 par par PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 microscopie microscopie NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 électronique électronique ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 26 la le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 fibre fibre NOM _ _ 31 subj _ _ _ _ _ 28 observée observer VPP _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 par par PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 cristallographie cristallographie NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 est être VRB _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 32 courte court ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 et et COO _ _ 35 mark _ _ _ _ _ 34 ne ne ADV _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 35 contient contenir VRB _ _ 31 para _ _ _ _ _ 36 pas pas ADV _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 l' le DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 histone histone NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 39 de de PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 liaison liaison NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 H1 H1 NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 42 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-273 # text = Ils font l'hypothèse que les deux structures co-existent dans le noyau et correspondent à différents états fonctionnels de la chromatine . ( Robinson and Rhodes , 2006 ) . 1 Ils ils CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 font faire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 l' le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 hypothèse hypothèse NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 que que CSU _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 7 deux deux NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 structures structure NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 9 co-existent co- VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 noyau noyau NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 correspondent correspondre VRB _ _ 9 para _ _ _ _ _ 15 à à PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 différents différent DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 états états NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 fonctionnels fonctionnel ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 chromatine chromatine NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 24 Robinson Robinson NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 25 and robinson and rhodes NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 26 Rhodes Rhodes NOM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 2006 2006 NUM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 ) ) PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-274 # text = Nous avons vu que la fibre de 30 nm est stabilisée par l'histone de liaison H1 / H5 . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 vu voir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 que que CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 fibre fibre NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 30 30 NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 nm minute NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 est être VRB _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 stabilisée stabiliser VPP _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 12 par par PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 l' le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 histone histone NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 liaison liaison NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 H1 H1 NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 / / PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 H5 H5 NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-275 # text = Elle dépend également des interactions entre nucléosomes adjacents . 1 Elle elle CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 dépend dépendre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 également également ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 interactions interaction NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 entre entre PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 nucléosomes nucléé NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 adjacents adjacent ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-276 # text = Notamment d'une interaction entre les résidus 1 Notamment notamment ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 d' de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 une un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 interaction interaction NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 entre entre PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 résidus résidu NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-277 # text = 14   à 25 de la queue N terminale de l'histone H4 avec une région chargée négativement portée par le dimère H2A-H2B d'un nucléosome adjacent . 1 14 14 NUM _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2   14   PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 à à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 25 25 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 queue queue NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 N N NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 terminale terminal ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 l' le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 histone histone NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 H4 H4 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 avec avec PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 une un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 région région NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 chargée charger ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 négativement négativement ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 portée porter VPP _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 par par PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 le le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 dimère dimère NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 H2A-H2B H2A-H2B NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 d' de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 un un DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 nucléosome nucléé NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 adjacent adjacent ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-278 # text = L'importance de cette interaction avait été présentie à cause de son existence dans la structure cristalline du nucléosome 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 importance importance NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 cette ce DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 interaction interaction NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 avait avoir VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 été être VPP _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 présentie pré- VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 à à cause de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 cause à cause de NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de à cause de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 son son DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 existence existence NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 dans dans PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 structure structure NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 cristalline cristallin ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 du de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 nucléosome nucléé NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-279 # text = ( Luger and Richmond , 1998a ; Luger et al. , 1997 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 2 Luger Luger NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 3 and luger and richmond NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Richmond Richmond NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 6 1998a 1998a NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ; ; PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 Luger Luger NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 al. al. NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 1997 1997 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-280 # text = Elle a été confirmée par des analyses de réticulation chimique ( Dorigo et al. , 2004 ) qui montrent que les résidus 14 à 19 de H4 sont essentiels à la compaction . 1 Elle elle CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 a avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 été être VPP _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 confirmée confirmer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 par par PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 des un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 analyses analyse NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 réticulation réticulation NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 chimique chimique ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 Dorigo Dorigo NOM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 14 al. al. ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 2004 2004 NUM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 17 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 18 qui qui PRQ _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 19 montrent montrer VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 20 que que CSU _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 les le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 résidus résidu NOM _ _ 28 subj _ _ _ _ _ 23 14 14 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 à à PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 19 19 NUM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 H4 H4 NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 sont être VRB _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 29 essentiels essentiel ADJ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 à à PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 la le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 compaction compaction NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-281 # text = Il a de plus été montré que la simple acétylation de la lysine 16 de H4 , comme la délétion de la queue H4 , empêche la formation de la fibre de 30 nm alors que les résidus 1 à 13 de H4 n'influent pas sur cette compaction ( Shogren-Knaak et al. , 2006 ) . 1 Il il CLS _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 2 a avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 3 de de plus PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 4 plus de plus NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 été être VPP _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 que que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 9 simple simple ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 acétylation acétylation NOM _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 lysine lysine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 16 16 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 H4 H4 NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 18 comme comme PRE _ _ 26 periph _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 délétion délétion NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 la le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 queue queue NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 H4 H4 NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 26 empêche empêcher VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 27 la le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 formation formation NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 la le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 fibre fibre NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 de de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 30 30 NUM _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 nm minute NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 alors alors que CSU _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 36 que alors que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 37 les le DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 résidus résidu NOM _ _ 45 subj _ _ _ _ _ 39 1 1 NUM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 à à PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 13 13 NUM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 de de PRE _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 H4 H4 NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 n' ne ADV _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 45 influent influer VRB _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 46 pas pas ADV _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 sur sur PRE _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 48 cette ce DET _ _ 49 spe _ _ _ _ _ 49 compaction compaction NOM _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 50 ( ( PUNC _ _ 51 punc _ _ _ _ _ 51 Shogren-Knaak Shogren-Knaak NOM _ _ 49 parenth _ _ _ _ _ 52 et et COO _ _ 55 mark _ _ _ _ _ 53 al. al. ADV _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 54 , , PUNC _ _ 55 punc _ _ _ _ _ 55 2006 2006 NUM _ _ 51 para _ _ _ _ _ 56 ) ) PUNC _ _ 51 punc _ _ _ _ _ 57 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-282 # text = Une étude récente suggère que c'est la neutralisation de la région acide portée par le dimère H2A-H2B plus que le lien créé par l'interaction avec la queue H4 qui favorise la formation de structures d'ordre supérieur ( Chodaparambil et al. , 2007 ) . 1 Une un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 étude étude NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 récente récent ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 suggère suggérer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 que que CSU _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 c' ce CLS _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 7 est être VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 neutralisation neutralisation NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 région région NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 acide acide ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 portée porter VPP _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 15 par par PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 le le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 dimère dimère NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 H2A-H2B H2A-H2B NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 plus plus ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 20 que que CSU _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 21 le le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 lien lien NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 créé créer VPP _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 par par PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 l' le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 interaction interaction NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 avec avec PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 28 la le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 queue queue NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 H4 H4 NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 qui qui PRQ _ _ 32 subj _ _ _ _ _ 32 favorise favoriser VRB _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 33 la le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 formation formation NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 de de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 structures structure NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 d' de PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 ordre ordre NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 supérieur supérieur ADJ _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 ( ( PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 41 Chodaparambil Chodaparambil NOM _ _ 36 parenth _ _ _ _ _ 42 et et COO _ _ 45 mark _ _ _ _ _ 43 al. al. ADV _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 45 2007 2007 NUM _ _ 41 para _ _ _ _ _ 46 ) ) PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 47 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-283 # text = Il a de plus été montré que cette région acide peut servir de surface d'interaction pour la protéine LANA du virus KSHV ( Barbera et al. , 2006 ) . 1 Il il CLS _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 2 a avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 3 de de plus PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 4 plus de plus NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 été être VPP _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 que que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 cette ce DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 région région NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 10 acide acide ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 peut pouvoir VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 servir servir VNF _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 surface surface NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 d' de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 interaction interaction NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 pour pour PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 protéine protéine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 LANA LANA NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 du de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 virus virus NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 KSHV KSHV NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 ( ( PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 Barbera Barbera NOM _ _ 22 parenth _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 29 mark _ _ _ _ _ 27 al. al. ADV _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 29 2006 2006 NUM _ _ 25 para _ _ _ _ _ 30 ) ) PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-284 # text = b . Repliements de la fibre de 30 nm 1 b b NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Repliements Repliements NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 fibre fibre NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 30 30 NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 nm minute NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-285 # text = Les fibres de 30 nm peuvent subir des compactions supplémentaires pour former des fibres allant de 60 à 300 nm . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 fibres fibre NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 30 30 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 nm minute NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 peuvent pouvoir VRB _ _ 20 det _ _ _ _ _ 7 subir subir VNF _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 des un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 compactions compactions NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 supplémentaires supplémentaire ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 pour pour PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 former former VNF _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 des un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 fibres fibre NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 allant aller VPR _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 60 60 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 18 à à PRE _ _ 16 para _ _ _ _ _ 19 300 300 NUM _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 nm minute NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-286 # text = Pour atteindre la compaction des chromosomes mitotiques , des boucles de 50 000 à 1 Pour pour PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 atteindre atteindre VNF _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 compaction compaction NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 des de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 chromosomes chromosome NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 mitotiques mitotique ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 9 des un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 boucles boucle NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 50 50 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 000 000 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 à à PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-287 # text = 100   000 bases se forment dans la fibre de 30   nm et sont fixées par des protéines qui forment le squelette du chromosome . 1 100 100 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2   100   000 NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 000 000 NUM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 4 bases base NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 se se CLI _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 forment former VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 dans dans PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 fibre fibre NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 30 30 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12   30   DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 nm minute NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 15 sont être VRB _ _ 16 aux _ _ _ _ _ 16 fixées fixer VPP _ _ 6 para _ _ _ _ _ 17 par par PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 des un DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 protéines protéine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 qui qui PRQ _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 21 forment former VRB _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 le le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 squelette squelette NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 du de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 chromosome chromosome NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-288 # text = La structure du chromosome pourrait être formée par trois repliements successifs : 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structure structure NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 chromosome chromosome NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 être être VNF _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 formée former VPP _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 par par PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 trois trois NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 repliements repliement NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 successifs successif ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 : : PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-289 # text = une fibre de 60 - 80   nm s'enroulerait pour former une fibre de 100 - 130   nm qui s'enroulerait encore pour former la structure de 200 - 300   nm de large observée en métaphase ( voir la revue Belmont , 2006 ) . 1 une un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 fibre fibre NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 60 60 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 5 - 60 - 80   PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 6 80 80 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7   60 - 80   DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 nm minute NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 s' s' CLI _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 enroulerait enrouler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 pour pour PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 former former VNF _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 une un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 fibre fibre NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 100 100 NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 17 - 100 - 130   PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 18 130 130 NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19   100 - 130   NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 20 nm minute NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 qui qui PRQ _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 22 s' s' CLI _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 23 enroulerait enrouler VRB _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 24 encore encore ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 pour pour PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 former former VNF _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 la le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 structure structure NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 200 200 NUM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 31 - 200 - 300   PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 32 300 300 NUM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 33   200 - 300   NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 34 nm minute NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 de de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 36 large large NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 observée observer VPP _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 38 en en PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 métaphase métaphase NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 ( ( PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 41 voir voir VNF _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 42 la le DET _ _ 43 spe _ _ _ _ _ 43 revue revue NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 44 Belmont Belmont NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 , , PUNC _ _ 46 punc _ _ _ _ _ 46 2006 2006 NUM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 47 ) ) PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 48 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-290 # text = La structure précise de ces formes compactes de la chromatine n'est pas connue . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structure structure NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 3 précise précis ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 ces ce DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 formes forme NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 compactes compact ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 chromatine chromatine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 n' ne ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 12 est être VRB _ _ 14 aux _ _ _ _ _ 13 pas pas ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 connue connaître VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-291 # text = Mais la formation de structures compactes a notamment été attribuée à des protéines ayant un rôle architectural , qui se comportent comme des agents de réticulation entre nucléosomes 1 Mais mais COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 2 la le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 formation formation NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 structures structure NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 compactes compact ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 a avoir VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 8 notamment notamment ADV _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 9 été être VPP _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 attribuée attribuer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 à à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 des un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 protéines protéine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 ayant avoir VPR _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 un un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 rôle rôle NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 architectural architectural ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 19 qui qui PRQ _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 20 se se CLI _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 comportent comporter VRB _ _ 28 subj _ _ _ _ _ 22 comme comme PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 des un DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 agents agent NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 réticulation réticulation NOM _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 27 entre entre PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 nucléosomes nucléé A+V _ _ 27 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-292 # text = ( McBryant et al. , 2006 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 McBryant McBryant NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2006 2006 NUM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-293 # text = Les facteurs de remodelage ATP-dépendant pourraient également être impliqués . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 facteurs facteur NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 remodelage remodelage NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ATP-dépendant ATP-dépendant NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 pourraient pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 également également ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 être être VNF _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 impliqués impliquer VPP _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-294 # text = B . Dynamique de la structure chromatinienne 1 B b NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Dynamique Dynamique NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 structure structure NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 chromatinienne chromatinien ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-295 # text = Grâce aux MPT et aux domaines de reconnaissance des MPT , la chromatine est capable de recruter de façon spatio-temporelle précise les facteurs qui assurent son remodelage : 1 Grâce grâce à PRE _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 2 aux grâce à PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 MPT MPT NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 aux à PRE _ _ 1 para _ _ _ _ _ 6 domaines domaine NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 des de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 MPT MPT NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 chromatine chromatine NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 14 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 capable capable ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 recruter recruter VNF _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 façon façon NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 spatio-temporelle spatio-temporel ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 précise précis ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 les le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 facteurs facteur NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 24 qui qui PRQ _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 25 assurent assurer VRB _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 son son DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 remodelage remodelage NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 : : PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-296 # text = facteurs de remodelage ATP-dépendant , chaperonnes qui assurent le remplacement des histones canoniques par des variants , enzymes responsables de l'ajout ou du retrait d'une MPT ... 1 facteurs facteur NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 remodelage remodelage NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ATP-dépendant ATP-dépendant N+V _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 6 chaperonnes chaperonner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 qui qui PRQ _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 assurent assurer VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 le le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 remplacement remplacement NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 des de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 histones histone NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 canoniques canonique ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 par par PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 des un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 variants variant NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 enzymes enzyme NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 19 responsables responsable ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 l' le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 ajout ajout NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 ou ou COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 24 du de PRE _ _ 20 para _ _ _ _ _ 25 retrait retrait NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 d' de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 une un DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 MPT MPT NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 ... ... PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-297 # text = On peut distinguer deux types de modifications qui affectent la structure de la chromatine : 1 On on CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 peut pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 distinguer distinguer VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 deux deux NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 types type NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 modifications modification NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 qui qui PRQ _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 9 affectent affecter VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 structure structure NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 chromatine chromatine NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 : : PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-298 # text = i . Celles qui modifient le relief électrostatique du nucléosome . 1 i i NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Celles Celles NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 qui qui PRQ _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 5 modifient modifier VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 le le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 relief relief NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 électrostatique électrostatique ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 du de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 nucléosome nucléé NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-299 # text = Elles influencent les interactions du nucléosome et de l'ADN , les interactions entre nucléosomes et les interactions avec les autres protéines . 1 Elles elles CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 influencent influencer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 les le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 interactions interaction NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 du de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 nucléosome nucléé NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 5 para _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 ADN ADN NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 12 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 interactions interaction NOM _ _ 4 para _ _ _ _ _ 14 entre entre PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 nucléosomes nucléé NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 17 les le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 interactions interaction NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 19 avec avec PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 les le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 21 autres autre ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 22 protéines protéine NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-300 # text = Cela suppose que les nucléosomes soient accessibles aux machineries responsables de ces modifications . 1 Cela cela PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 suppose supposer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 nucléosomes nucléé NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 soient être VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 accessibles accessible ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 aux à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 machineries machinerie NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 responsables responsable ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 ces ce DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 modifications modification NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-301 # text = Elles sont donc probablement réduites dans les régions où la chromatine est très compacte . 1 Elles elles CLS _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 sont être VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 3 donc donc ADV _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 probablement probablement ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 réduites réduire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 dans dans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 régions région NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 où où PRQ _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 chromatine chromatine NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 12 est être VRB _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 très très ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 compacte compact ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-302 # text = Il s'agit principalement des modifications post-traductionnelles et de l'intégration de variants d'histone . 1 Il il CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 s' s' CLI _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 agit agir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 principalement principalement ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 modifications modification NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 post-traductionnelles post-traductionnelles ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 5 para _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 intégration intégration NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 variants variant NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 d' de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 histone histone NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-303 # text = ii . 1 ii if NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-304 # text = Celles qui impliquent une action extérieure . 1 Celles celles NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 qui qui PRQ _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 impliquent impliquer VRB _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 une un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 action action NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 extérieure extérieur ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-305 # text = Il s'agit des complexes de remodelage ATP-dépendant ou des protéines de liaison ayant un rôle architectural . 1 Il il CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 s' s' CLI _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 agit agir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 complexes complexe NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 remodelage remodelage NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 ATP-dépendant ATP-dépendant NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 ou ou COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 4 para _ _ _ _ _ 11 protéines protéine NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 liaison liaison NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ayant avoir VPR _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 un un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 rôle rôle NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 architectural architectural ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-306 # text = Ce type d'intervention modifie la structure de la chromatine sans modifier sa composition initiale . 1 Ce ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 type type NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 intervention intervention NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 modifie modifier VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 structure structure NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 chromatine chromatine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 sans sans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 modifier modifier VNF _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 sa son DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 composition composition NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 initiale initial ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-307 # text = I. Le remodelage ATP-dépendant 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Le Le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 remodelage remodelage NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ATP-dépendant ATP-dépendant N+V _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-308 # text = Les complexes ATP-dépendant de remodelage de la chromatine contiennent une sous-unité catalytique qui permet de les classer en cinq familles chez les organismes eucaryotes ( Swi / Snf , Iswi , NURD / Mi 2 / CHD , Ino 80 et SWR1 ) et au moins une autre sous-unité . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 complexes complexe NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 ATP-dépendant ATP-dépendant N+V _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 remodelage remodelage NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 chromatine chromatine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 contiennent contenir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 une un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 sous-unité sous- NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 catalytique catalytique ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 qui qui PRQ _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 14 permet permettre VRB _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 les le CLI _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 classer classer VNF _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 en en PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 cinq cinq NUM _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 familles famille NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 chez chez PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 22 les le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 organismes organisme NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 eucaryotes eucaryote ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 ( ( PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 Swi Swi NOM _ _ 23 parenth _ _ _ _ _ 27 / sur PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 28 Snf Snf NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 30 Iswi Iswi NOM _ _ 28 para _ _ _ _ _ 31 , , PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 32 NURD NURD NOM _ _ 30 para _ _ _ _ _ 33 / ou PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 34 Mi Mi NOM _ _ 30 para _ _ _ _ _ 35 2 2 NUM _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 36 / 2 / chd PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 37 CHD CHD ADJ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 38 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 39 Ino Ino NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 40 80 80 NUM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 et et COO _ _ 42 mark _ _ _ _ _ 42 SWR1 SWR1 NOM _ _ 39 para _ _ _ _ _ 43 ) ) PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 44 et et COO _ _ 49 mark _ _ _ _ _ 45 au à+le PRE _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 moins au moins NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 une un DET _ _ 49 spe _ _ _ _ _ 48 autre autre ADJ _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 49 sous-unité sous- NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 50 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-309 # text = Ils portent des domaines de reconnaissance des MPT ( bromodomaine , PHD finger , chromodomaine ) et d'autres domaines conservés de fonctions encore inconnues . 1 Ils ils CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 portent porter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 des un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 domaines domaine NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 des de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 MPT MPT NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 bromodomaine brome NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 12 PHD PHD NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 finger figer VNF _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 15 chromodomaine chromo NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 ) ) PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 18 d' un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 19 autres autre ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 domaines domaine NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 conservés conservé ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 fonctions fonction NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 encore encore ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 inconnues inconnu ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-310 # text = Ils sont responsables de plusieurs types de modifications de la structure chromatinienne : 1 Ils ils CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 responsables responsable ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 plusieurs plusieurs DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 types type NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 modifications modification NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 structure structure NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 chromatinienne chromatinien ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 : : PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-311 # text = glissement des nucléosomes , désorganisation de l 'espacement des nucléosomes au niveau des promoteurs , assemblage des nucléosomes et organisation des particules de façon régulière sur le nucléofilament ( voir les revues Becker and Hörz , 2002 ; Choudhary and 1 glissement glissement NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 nucléosomes nucléé NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 5 désorganisation désorganisation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 l le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 8 ' ' PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 9 espacement espacement NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 nucléosomes nucléé NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 au à PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 niveau niveau NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 des de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 promoteurs promoteur NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 17 assemblage assemblage NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 19 nucléosomes nucléé NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 organisation organisation NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 22 des de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 23 particules particule NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 façon façon NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 régulière régulier ADJ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 sur sur PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 le le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 nucléofilament nucléé NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 ( ( PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 31 voir voir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 32 les le DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 revues revue NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 34 Becker Becker NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 35 and becker and hörz NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 36 Hörz Hörz NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 37 , , PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 38 2002 2002 NUM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 39 ; ; PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 40 Choudhary Choudhary NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 41 and choudhary and NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-312 # text = Varga-Weisz , 2007 ; 1 Varga-Weisz Varga-Weisz NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 2007 2007 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ; ; PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-313 # text = Smith and Peterson , 2005 ) . 1 Smith smith and peterson NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 and smith and peterson NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 Peterson Peterson NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2005 2005 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-314 # text = Les complexes de la famille Iswi et Swi / Snf catalysent par exemple le glissement de l'ADN sur l'octamère d'histone par un mécanisme similaire dans lequel une boucle d'ADN est soustraite à l'interaction des histones et se propage autour de la particule ( Strohner et al. , 2005 ; Zhang et al. , 2006 ; Zofall et al. , 2006 ) . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 complexes complexe NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 famille famille NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 Iswi Iswi NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 8 Swi Swi NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 9 / ou PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 Snf Snf NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 11 catalysent catalyser VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 par par exemple PRE _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 13 exemple par exemple ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 le le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 glissement glissement NOM _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 l' le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 ADN ADN NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 sur sur ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 l' l'octamère NOM _ _ 21 det _ _ _ _ _ 21 octamère l'octamère NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 d' de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 histone histone NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 par par PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 un un DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 mécanisme mécanisme NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 similaire similaire ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 dans dans PRE _ _ 35 periph _ _ _ _ _ 29 lequel lequel PRQ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 une un DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 boucle boucle NOM _ _ 35 subj _ _ _ _ _ 32 d' de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 ADN ADN NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 est être VRB _ _ 35 aux _ _ _ _ _ 35 soustraite soustraire VPP _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 36 à à PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 l' le DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 interaction interaction NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 des de PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 histones histone NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 et et COO _ _ 43 mark _ _ _ _ _ 42 se se CLI _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 43 propage propager VRB _ _ 35 para _ _ _ _ _ 44 autour autour ADV _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 de de+le PRE _ _ 43 subj _ _ _ _ _ 46 la de+le DET _ _ 47 spe _ _ _ _ _ 47 particule particule NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 48 ( ( PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 49 Strohner Strohner NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 50 et et COO _ _ 51 mark _ _ _ _ _ 51 al. al. NOM _ _ 49 para _ _ _ _ _ 52 , , PUNC _ _ 61 punc _ _ _ _ _ 53 2005 2005 NUM _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 54 ; ; PUNC _ _ 61 punc _ _ _ _ _ 55 Zhang Zhang NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 56 et et COO _ _ 57 mark _ _ _ _ _ 57 al. al. NOM _ _ 55 para _ _ _ _ _ 58 , , PUNC _ _ 61 punc _ _ _ _ _ 59 2006 2006 NUM _ _ 57 dep _ _ _ _ _ 60 ; ; PUNC _ _ 61 punc _ _ _ _ _ 61 Zofall Zofall NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 62 et et COO _ _ 63 mark _ _ _ _ _ 63 al. al. NOM _ _ 61 para _ _ _ _ _ 64 , , PUNC _ _ 65 punc _ _ _ _ _ 65 2006 2006 NUM _ _ 61 dep _ _ _ _ _ 66 ) ) PUNC _ _ 65 punc _ _ _ _ _ 67 . . PUNC _ _ 61 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-315 # text = Les complexes de remodelage ATP-dépendant coopèrent à l'occasion avec des chaperons d'histones ( Angelov et al. , 2006 ; Lorch et al. , 2006 ; Walfridsson et al. , 2007 ) ou possèdent eux-mêmes une activité de chaperonne ( Loyola et al. , 2001 ) . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 complexes complexe NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 remodelage remodelage NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ATP-dépendant ATP-dépendant NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 coopèrent coopérer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 à à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 occasion occasion NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 avec avec PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 des un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 chaperons chaperon NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 d' de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 histones histone NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 ( ( PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 16 Angelov Angelov NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 18 al. al. NOM _ _ 16 para _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 2006 2006 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 ; ; PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 Lorch Lorch NOM _ _ 26 periph _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 24 al. al. NOM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 26 2006 2006 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 27 ; ; PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 Walfridsson Walfridsson NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 et et COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 30 al. al. NOM _ _ 28 para _ _ _ _ _ 31 , , PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 32 2007 2007 NUM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 33 ) ) PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 34 ou ou COO _ _ 35 mark _ _ _ _ _ 35 possèdent posséder VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 36 eux-mêmes lui-même PRQ _ _ 35 subj _ _ _ _ _ 37 une un DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 activité activité NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 39 de de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 40 chaperonne chaperonner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 41 ( ( PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 42 Loyola Loyola NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 43 et et COO _ _ 44 mark _ _ _ _ _ 44 al. al. NOM _ _ 42 para _ _ _ _ _ 45 , , PUNC _ _ 46 punc _ _ _ _ _ 46 2001 2001 NUM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 47 ) ) PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 48 . . PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-316 # text = De plus , plusieurs observations semblent indiquer que ces complexes sont impliqués dans la régulation des structures chromatiniennes d'ordre supérieur ( Maier et al. , 2008a ; Maier et al. , 2008b ) . 1 De de plus PRE _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 plus de plus NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 plusieurs plusieurs DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 observations observation NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 semblent sembler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 indiquer indiquer VNF _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 que que CSU _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ces ce DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 complexes complexe NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 11 sont être VRB _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 12 impliqués impliquer VPP _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 dans dans PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 régulation régulation NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 des de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 structures structure NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 chromatiniennes chromatinien ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 d' de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 ordre ordre NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 supérieur supérieur ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 23 Maier Maier NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 25 al. al. ADV _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 2008a 2008a NUM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 28 ; ; PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 29 Maier Maier NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 30 et et COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 31 al. al. NOM _ _ 29 para _ _ _ _ _ 32 , , PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 33 2008b 2008b NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 34 ) ) PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-317 # text = II . Modifications post-traductionnelles des histones ( MPT ) 1 II ii NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Modifications Modifications NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 post-traductionnelles post-traductionnelles VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 des un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 histones histone NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 MPT MPT NOM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-318 # text = a . Généralités 1 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Généralités Généralités NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-319 # text = Les histones portent de nombreux sites de modifications post-traductionnelles . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 histones histone NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 portent porter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 nombreux nombreux ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 sites site NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 modifications modification NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 post-traductionnelles post-traductionnelles ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-320 # text = Celles -ci participent à la régulation de la compaction et de l'accessibilité de la chromatine . 1 Celles celles NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 -ci -ci ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 participent participer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 régulation régulation NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 compaction compaction NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 7 para _ _ _ _ _ 12 l' le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 accessibilité accessibilité NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 chromatine chromatine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-321 # text = Elles assurent également le recrutement sur la chromatine de protéines spécifiques de façon spatio-temporelle précise . 1 Elles elles CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 assurent assurer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 également également ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 le le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 recrutement recrutement NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 sur sur PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 chromatine chromatine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 protéines protéine NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 spécifiques spécifique ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 façon façon NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 spatio-temporelle spatio-temporel ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 précise précis ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-322 # text = Les histones peuvent être mono , di ou tri-méthylés sur les lysines et les arginines , acétylées sur les lysines , phosphorylées sur les sérines , les thréonines et les tyrosines , sumoylées sur les lysines , ubiquitinées sur les lysines , ADP ribosylées sur les glutamates ; 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 histones histone NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 peuvent pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 être être VNF _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 mono mono NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 di di PRQ _ _ 5 para _ _ _ _ _ 8 ou ou COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 9 tri-méthylés tri-méthyle NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 10 sur sur PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 lysines lysine NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 14 les le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 arginines arminien ADJ _ _ 12 para _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 17 acétylées acétyle NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 sur sur PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 les le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 lysines lysine NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 22 phosphorylées phosphorylées NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 sur sur PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 les le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 sérines sérine NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 27 les le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 thréonines thréonine NOM _ _ 25 para _ _ _ _ _ 29 et et COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 30 les le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 tyrosines tyrosine NOM _ _ 28 para _ _ _ _ _ 32 , , PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 33 sumoylées surmouler VPP _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 sur sur PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 les le DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 lysines lysine NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 , , PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 38 ubiquitinées ubiquité N+V _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 39 sur sur PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 les le DET _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 41 lysines lysine NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 , , PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 43 ADP ADP NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 44 ribosylées ribouler VPP _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 sur sur PRE _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 les le DET _ _ 47 spe _ _ _ _ _ 47 glutamates glutamate NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 48 ; ; PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-323 # text = les arginines peuvent être déiminées , les prolines peuvent subir une isomérisation [ Figure   6 ] ( voir la revue Kouzarides , 2007 ) . 1 les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 arginines arminien ADJ _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 peuvent pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 être être VNF _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 déiminées déminer VPP _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 prolines pro- NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 9 peuvent pouvoir VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 10 subir subir VNF _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 une un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 isomérisation isomérisation NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 [ ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 14 Figure Figure NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15     6 DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 6 6 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 ] ) PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 18 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 19 voir voir VNF _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 revue revue NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 Kouzarides Kouzarides NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 2007 2007 NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 25 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-324 # text = Les queues des histones de coeur , très accessibles , portent l'essentiel des sites de modification connues à ce jour [ Figure 7 ] mais elle peuvent aussi toucher les domaines centraux des histones 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 queues queue NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 histones histone NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 coeur coeur NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 8 très très ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 accessibles accessible ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 11 portent porter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 l' le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 essentiel essentiel NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 des de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 sites site NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 modification modification NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 connues connu ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 à à PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 ce ce DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 jour jour NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 [ ( PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 23 Figure Figure NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 24 7 7 NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 ] ) PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 26 mais mais COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 27 elle lui PRQ _ _ 15 para _ _ _ _ _ 28 peuvent pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 29 aussi aussi ADV _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 30 toucher toucher VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 31 les le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 domaines domaine NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 33 centraux central NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 des de PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 histones histone NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-325 # text = ( Cosgrove , 2007 ) et les histones de liaison ( Godde and Ura , 2008 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Cosgrove Cosgrove NOM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 2007 2007 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 histones histone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 liaison liaison NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 12 Godde Godde NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 13 and godde and ura NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 Ura Ura NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 16 2008 2008 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 ) ) PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-326 # text = L'identification des enzymes responsables de ces modifications a énormément progressé ces dix dernières années . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 identification identification NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 enzymes enzyme NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 responsables responsable ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ces ce DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 modifications modification NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 a avoir VRB _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 10 énormément énormément ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 progressé progresser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 ces ce DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 13 dix dix NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 14 dernières dernier ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 années année NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-327 # text = Des enzymes responsables du dépôt et du retrait ont été identifiées pour chacune d'elles ( sauf pour le retrait de la méthylation des arginines qui est pourtant observé ) . 1 Des un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 enzymes enzyme NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 responsables responsable ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 dépôt dépôt NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 du de PRE _ _ 4 para _ _ _ _ _ 8 retrait retrait NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ont avoir VRB _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 été être VPP _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 identifiées identifier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 pour pour PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 chacune chacun PRQ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 d' de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 elles lui PRQ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 sauf sauf PRE _ _ 11 parenth _ _ _ _ _ 18 pour pour PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 le le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 retrait retrait NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 la le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 méthylation méthylation NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 des de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 arginines arminien ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 qui qui PRQ _ _ 29 subj _ _ _ _ _ 27 est être VRB _ _ 29 aux _ _ _ _ _ 28 pourtant pourtant ADV _ _ 29 periph _ _ _ _ _ 29 observé observer VPP _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 30 ) ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-328 # text = Ainsi , les MTP sont toutes réversibles et dynamiques . 1 Ainsi ainsi ADV _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 les le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 MTP MTP NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 5 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 toutes tout PRQ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 réversibles réversible ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 9 dynamiques dynamique ADJ _ _ 7 para _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-329 # text = L'acétylation est régulée par l'équilibre qui existe entre l'acétylation et la désacétylation , catalysées respectivement par les histones acétyl-transférases à partir de l'acétyl-coenzymeA et les histones désacétylases . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 acétylation acétylation NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 régulée réguler VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 par par PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 équilibre équilibre NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 qui qui PRQ _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 9 existe exister VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 entre entre PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 l' le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 acétylation acétylation NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 désacétylation désacétylation NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 catalysées catalyser VPP _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 18 respectivement respectivement ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 par par PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 les le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 histones histone NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 acétyl-transférases acétyle-transférase NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 à à partir de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 24 partir à partir de NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 de à partir de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 l' le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 acétyl-coenzymeA acétyl-coenzymeA NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 et et COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 29 les le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 histones histone NOM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 31 désacétylases désacétylases ADJ _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-330 # text = Une demi-vie de l'ordre de la minute a été mesurée pour un tel équilibre . 1 Une un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 demi-vie demi- NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 ordre ordre NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 minute minute NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 a avoir VRB _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 été être VPP _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 mesurée mesurer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 pour pour PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 un un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 14 tel tel ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 équilibre équilibre NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-331 # text = Les acétyl-transférases ont une spécificité réduite puisqu'elles modifient plusieurs lysines différentes . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 acétyl-transférases acétyle-transférase NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 ont avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 une un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 spécificité spécificité NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 réduite réduit ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 puisqu' puisque CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 elles elles CLS _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 9 modifient modifier VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 plusieurs plusieurs DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 lysines lysine NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 différentes différent ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-332 # text = Elles peuvent être divisées en trois familles ( GNAT , MYST et CBP / P 300 ) selon leurs identités de séquence ( Sterner and 1 Elles elles CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 peuvent pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 être être VNF _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 divisées diviser VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 en en PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 trois trois NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 familles famille NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 9 GNAT GNAT NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 MYST MYST NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 CBP CBP NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 14 / / PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 15 P P NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 16 300 300 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 18 selon selon PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 19 leurs son DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 identités identité NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 séquence séquence NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 24 Sterner Sterner NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 and sterner and NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-333 # text = Berger , 2000 ) . 1 Berger berger NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 2000 2000 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ) ) PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-334 # text = Les MPT affectent la charge et l'encombrement stérique des résidus ( cas de l'acétylation et de la phosphorylation en particulier ) . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 MPT MPT NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 affectent affecter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 charge charge NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 7 l' le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 encombrement encombrement NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 9 stérique stérique ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 résidus résidu NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 cas cas NOM _ _ 11 parenth _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 l' le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 acétylation acétylation NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 14 para _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 phosphorylation phosphorylation NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 en en PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 particulier particulier NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-335 # text = Dans les domaines centraux des histones , elles pourraient altérer les interactions avec l'ADN et ainsi réguler la mobilité du nucléosomes 1 Dans dans PRE _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 domaines domaine NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 centraux central NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 histones histone NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 8 elles elles CLS _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 9 pourraient pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 altérer altérer VNF _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 interactions interaction NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 avec avec PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 l' le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 ADN ADN NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 17 ainsi ainsi ADV _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 18 réguler réguler VNF _ _ 10 para _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 mobilité mobilité NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 du de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 nucléosomes nucléé NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-336 # text = ( Cosgrove , 2007 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 2 Cosgrove Cosgrove NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 2007 2007 NUM _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-337 # text = L'acétylation d'une lysine du domaine de coeur de H3 ( K56 ) a d'ailleurs été récemment identifiée ( Han et al. , 2007 ) . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 acétylation acétylation NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 une un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 lysine lysine NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 du de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 domaine domaine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 coeur coeur NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 H3 H3 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 K56 K56 NOM _ _ 11 parenth _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 a avoir VRB _ _ 18 aux _ _ _ _ _ 16 d' d'ailleurs PRE _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 17 ailleurs d'ailleurs NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 été être VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 récemment récemment ADV _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 identifiée identifier ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 ( ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 Han Han NOM _ _ 18 parenth _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 24 al. al. NOM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 2007 2007 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 27 ) ) PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-338 # text = Cette lysine fait face au sillon majeur de l'ADN et son acétylation affecte probablement l'interaction avec l'ADN . 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 lysine lysine NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 fait faire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 face face à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 au face à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 sillon sillon NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 majeur majeur ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 ADN ADN NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 12 son son DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 acétylation acétylation NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 14 affecte affecter VRB _ _ 3 para _ _ _ _ _ 15 probablement probablement ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 l' le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 interaction interaction NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 avec avec PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 19 l' le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 ADN ADN NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-339 # text = De même , les interactions qu'établissent les queues des histones avec l'ADN ou les nucléosomes adjacents sont inévitablement modifiées par les changements électrostatiques induits par les MPT . 1 De de même PRE _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 2 même de même NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 interactions interaction NOM _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 6 qu' que PRQ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 établissent établir VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 queues queue NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 histones histone NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 avec avec PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 13 l' le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 ADN ADN NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 ou ou COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 nucléosomes nucléé NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 18 adjacents adjacent ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 sont être VRB _ _ 21 aux _ _ _ _ _ 20 inévitablement inévitablement ADV _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 modifiées modifier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 par par PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 les le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 changements changement NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 électrostatiques électrostatique ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 induits induire VPP _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 par par PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 les le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 MPT MPT NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-340 # text = Ainsi , il a été montré que l'hyperacétylation empêche la formation de la fibre de 30 nm ( Tse et al. , 1998 ) et qu'elle réduit les interactions entre les queues des histones et l'ADN ( Mutskov et al. , 1998 ) . 1 Ainsi ainsi ADV _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 il il CLS _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 4 a avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 été être VPP _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 que que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 hyperacétylation hyperacétylation NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 10 empêche empêcher VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 formation formation NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 fibre fibre NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 30 30 NUM _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 nm minute NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 Tse Tse NOM _ _ 15 parenth _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 22 al. al. ADV _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 1998 1998 NUM _ _ 20 para _ _ _ _ _ 25 ) ) PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 27 qu' que CSU _ _ 7 para _ _ _ _ _ 28 elle elle CLS _ _ 29 subj _ _ _ _ _ 29 réduit réduire VRB _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 les le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 interactions interaction NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 entre entre PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 les le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 queues queue NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 des de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 histones histone NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 et et COO _ _ 39 mark _ _ _ _ _ 38 l' le DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 ADN ADN NOM _ _ 34 para _ _ _ _ _ 40 ( ( PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 41 Mutskov Mutskov NOM _ _ 39 parenth _ _ _ _ _ 42 et et COO _ _ 45 mark _ _ _ _ _ 43 al. al. ADV _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 45 1998 1998 NUM _ _ 41 para _ _ _ _ _ 46 ) ) PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 47 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-341 # text = La lysine 16 de H4 semble avoir un statut particulier . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 lysine lysine NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 16 16 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 H4 H4 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 semble sembler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 avoir avoir VNF _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 un un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 statut statut NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 particulier particulier ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-342 # text = La région de H4 qui la contient ( résidus 14 - 19 ) est essentielle à la formation de la fibre de 30 nm ( Dorigo et al. , 2004 ) et , de façon spectaculaire , sa seule acétylation est capable d'inhiber la formation de cette fibre ( Shogren-Knaak et al. , 2006 ) . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 région région NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 H4 H4 NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 qui qui PRQ _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 6 la le CLI _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 contient contenir VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 résidus résidu NOM _ _ 7 parenth _ _ _ _ _ 10 14 14 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 11 - 14 - 19 PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 19 19 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 14 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 essentielle essentiel ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 à à PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 formation formation NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 fibre fibre NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 30 30 NUM _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 nm minute NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 ( ( PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 Dorigo Dorigo NOM _ _ 21 parenth _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 28 al. al. ADV _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 30 2004 2004 NUM _ _ 26 para _ _ _ _ _ 31 ) ) PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 41 mark _ _ _ _ _ 33 , , PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 34 de de PRE _ _ 41 periph _ _ _ _ _ 35 façon façon NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 spectaculaire spectaculaire ADJ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 , , PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 38 sa son DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 39 seule seul ADJ _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 40 acétylation acétylation NOM _ _ 41 subj _ _ _ _ _ 41 est être VRB _ _ 14 para _ _ _ _ _ 42 capable capable ADJ _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 d' de PRE _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 inhiber inhiber VNF _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 la le DET _ _ 46 spe _ _ _ _ _ 46 formation formation NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 47 de de PRE _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 cette ce DET _ _ 49 spe _ _ _ _ _ 49 fibre fibre NOM _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 50 ( ( PUNC _ _ 51 punc _ _ _ _ _ 51 Shogren-Knaak Shogren-Knaak NOM _ _ 49 parenth _ _ _ _ _ 52 et et COO _ _ 55 mark _ _ _ _ _ 53 al. al. ADV _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 54 , , PUNC _ _ 55 punc _ _ _ _ _ 55 2006 2006 NUM _ _ 51 para _ _ _ _ _ 56 ) ) PUNC _ _ 51 punc _ _ _ _ _ 57 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-343 # text = D'autre part son acétylation apparaît comme un marqueur garant de la conservation des frontières entre l'hétérochromatine et l'euchromatine ( Ladurner et al. , 2003 ) . 1 D' d'autre part ADV _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 autre d'autre part ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 part d'autre part NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 son son DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 acétylation acétylation NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 apparaît apparaître VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 comme comme PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 un un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 marqueur marqueur NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 garant garant ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 conservation conservation NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 des de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 frontières frontière NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 entre entre PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 l' le NOM _ _ 18 det _ _ _ _ _ 18 hétérochromatine le NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 20 l' le NOM _ _ 21 det _ _ _ _ _ 21 euchromatine le NOM _ _ 18 para _ _ _ _ _ 22 ( ( PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 Ladurner Ladurner NOM _ _ 18 parenth _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 25 al. al. ADV _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 2003 2003 NUM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 28 ) ) PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-344 # text = Enfin , il a été montré que l'abolition de l'acétylation sur les lysines de la queue H4 ( par mutation des lysines 5 , 8 , 12 et 16 ) induit une réduction de la transcription selon un mode graduel et non spécifique en ce qui concerne les lysines 5 , 8 et 12 alors que l'abolition de l'acétylation de la lysine 16 touche des gènes particuliers ( Dion et al. , 2005 ) . 1 Enfin enfin ADV _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 il il CLS _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 4 a avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 été être VPP _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 que que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 abolition abolition NOM _ _ 33 subj _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 l' le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 acétylation acétylation NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 sur sur PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 les le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 lysines lysine NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 queue queue NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 H4 H4 NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 par par PRE _ _ 18 parenth _ _ _ _ _ 22 mutation mutation NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 des de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 lysines lysine NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 5 5 NUM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 27 8 8 NUM _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 28 , 8 , 12 PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 29 12 12 NUM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 30 et et COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 31 16 16 NUM _ _ 29 para _ _ _ _ _ 32 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 33 induit induire VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 34 une un DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 réduction réduction NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 de de PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 la le DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 transcription transcription NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 selon selon PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 40 un un DET _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 41 mode mode NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 graduel graduel ADJ _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 et et COO _ _ 45 mark _ _ _ _ _ 44 non non ADV _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 45 spécifique spécifique ADJ _ _ 42 para _ _ _ _ _ 46 en en PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 47 ce ce PRQ _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 qui qui PRQ _ _ 49 subj _ _ _ _ _ 49 concerne concerner VRB _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 50 les le DET _ _ 51 spe _ _ _ _ _ 51 lysines lysine NOM _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 52 5 5 NUM _ _ 54 spe _ _ _ _ _ 53 , 5 , 8 PUNC _ _ 56 punc _ _ _ _ _ 54 8 8 NUM _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 55 et et COO _ _ 56 mark _ _ _ _ _ 56 12 12 NUM _ _ 51 para _ _ _ _ _ 57 alors alors que CSU _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 58 que alors que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 59 l' le DET _ _ 60 spe _ _ _ _ _ 60 abolition abolition NOM _ _ 68 subj _ _ _ _ _ 61 de de PRE _ _ 60 dep _ _ _ _ _ 62 l' le DET _ _ 63 spe _ _ _ _ _ 63 acétylation acétylation NOM _ _ 61 dep _ _ _ _ _ 64 de de PRE _ _ 63 dep _ _ _ _ _ 65 la le DET _ _ 66 spe _ _ _ _ _ 66 lysine lysine NOM _ _ 64 dep _ _ _ _ _ 67 16 16 NUM _ _ 66 dep _ _ _ _ _ 68 touche toucher VRB _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 69 des un DET _ _ 70 spe _ _ _ _ _ 70 gènes gène NOM _ _ 68 dep _ _ _ _ _ 71 particuliers particulier ADJ _ _ 70 dep _ _ _ _ _ 72 ( ( PUNC _ _ 73 punc _ _ _ _ _ 73 Dion Dion NOM _ _ 70 parenth _ _ _ _ _ 74 et et COO _ _ 77 mark _ _ _ _ _ 75 al. al. ADV _ _ 74 dep _ _ _ _ _ 76 , , PUNC _ _ 77 punc _ _ _ _ _ 77 2005 2005 NUM _ _ 73 para _ _ _ _ _ 78 ) ) PUNC _ _ 73 punc _ _ _ _ _ 79 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-345 # text = Cependant la fonction principale des MTP réside probablement dans le recrutement de protéines ou de complexes protéiques spécifiques en un endroit et à un moment défini . 1 Cependant cependant ADV _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 la le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 fonction fonction NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 4 principale principal ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 MTP MTP NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 réside résider VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 probablement probablement ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 dans dans PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 le le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 recrutement recrutement NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 protéines protéine NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ou ou COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 12 para _ _ _ _ _ 16 complexes complexe NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 protéiques protéique ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 spécifiques spécifique ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 en en PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 20 un un DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 endroit endroit NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 23 à à PRE _ _ 19 para _ _ _ _ _ 24 un un DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 moment moment NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 défini définir ADJ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-346 # text = Des modules de lecture des MPT ( bromodomaine , PHD finger , chromodomaine , WD40 , ... ) capables de discriminer la modification et son contexte [ Figure 6 ] sont en effet présents dans la structure d'un grand nombre de protéines impliquées dans le contrôle des fonctions de la chromatine telles que les acétyl-transférases , les déméthylases ou les complexes ATP-dépendant de remodelage de la chromatine ( voir la revue Taverna et al. , 2007 ) . 1 Des un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 modules module NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 lecture lecture NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 des de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 MPT MPT NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 8 bromodomaine brome NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 PHD PHD NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 finger linger VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 13 chromodomaine chromo NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 15 WD40 WD40 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 17 ... ... PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 capables capable ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 discriminer discriminer VNF _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 la le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 modification modification NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 25 son son DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 contexte contexte NOM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 27 [ ( PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 28 Figure Figure NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 6 6 NUM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 ] ) PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 31 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 32 en en effet PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 effet en effet NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 présents présent ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 35 dans dans PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 la le DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 structure structure NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 d' de PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 un un DET _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 40 grand grand ADJ _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 41 nombre nombre NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 42 de de PRE _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 protéines protéine NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 impliquées impliquer VPP _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 dans dans PRE _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 le le DET _ _ 47 spe _ _ _ _ _ 47 contrôle contrôle NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 48 des de PRE _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 49 fonctions fonction NOM _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 de de PRE _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 51 la le DET _ _ 52 spe _ _ _ _ _ 52 chromatine chromatine NOM _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 53 telles tel ADJ _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 54 que que CSU _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 55 les le DET _ _ 56 spe _ _ _ _ _ 56 acétyl-transférases acétyle NOM _ _ 54 dep _ _ _ _ _ 57 , , PUNC _ _ 59 punc _ _ _ _ _ 58 les le DET _ _ 59 spe _ _ _ _ _ 59 déméthylases déméthylase NOM _ _ 56 para _ _ _ _ _ 60 ou ou COO _ _ 62 mark _ _ _ _ _ 61 les le DET _ _ 62 spe _ _ _ _ _ 62 complexes complexe NOM _ _ 59 para _ _ _ _ _ 63 ATP-dépendant ATP-dépendant N+V _ _ 62 dep _ _ _ _ _ 64 de de PRE _ _ 63 dep _ _ _ _ _ 65 remodelage remodelage NOM _ _ 64 dep _ _ _ _ _ 66 de de PRE _ _ 65 dep _ _ _ _ _ 67 la le DET _ _ 68 spe _ _ _ _ _ 68 chromatine chromatine NOM _ _ 66 dep _ _ _ _ _ 69 ( ( PUNC _ _ 70 punc _ _ _ _ _ 70 voir voir VNF _ _ 63 parenth _ _ _ _ _ 71 la le DET _ _ 72 spe _ _ _ _ _ 72 revue revue NOM _ _ 70 dep _ _ _ _ _ 73 Taverna Taverna NOM _ _ 72 dep _ _ _ _ _ 74 et et COO _ _ 75 mark _ _ _ _ _ 75 al. al. NOM _ _ 72 para _ _ _ _ _ 76 , , PUNC _ _ 77 punc _ _ _ _ _ 77 2007 2007 NUM _ _ 70 dep _ _ _ _ _ 78 ) ) PUNC _ _ 70 punc _ _ _ _ _ 79 . . PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-347 # text = Ces domaines constituent les modules de lecture d'un code constitué par les différentes combinaisons de MTP des histones et qu'il est convenu d'appeller le code histone ( Strahl and Allis , 2000 ) . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 domaines domaine NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 constituent constituer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 modules module NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 lecture lecture NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 d' de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 un un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 code code NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 constitué constituer VPP _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 par par PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 14 différentes différent ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 combinaisons combinaison NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 MTP MTP NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 des de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 histones histone NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 21 qu' que PRQ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 22 il il CLS _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 23 est être VRB _ _ 18 para _ _ _ _ _ 24 convenu convenu ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 d' de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 26 appeller appeler VNF _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 le le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 code code NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 histone histone NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 ( ( PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 31 Strahl Strahl NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 32 and strahl and allis NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 33 Allis Allis NOM _ _ 28 parenth _ _ _ _ _ 34 , , PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 35 2000 2000 NUM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 ) ) PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-348 # text = III . Intégration de variants d'histones 1 III iii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Intégration Intégration NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 variants variant NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 d' de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 histones histone NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-349 # text = Contrairement aux histones canoniques , l'expression des variants d'histones n'est pas limitée à la phase S du cycle cellulaire . 1 Contrairement contrairement ADV _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 2 aux à PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 histones histone NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 canoniques canonique ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 expression expression NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 8 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 variants variant NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 d' de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 histones histone NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 n' ne ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 13 est être VRB _ _ 15 aux _ _ _ _ _ 14 pas pas ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 limitée limiter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 à à PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 phase phase NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 S S NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 du de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 cycle cycle NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 cellulaire cellulaire ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-350 # text = Des variants d'histones pour H1 , H2A , H2B et H3 ont été identifiés chez la plupart des organismes eucaryotes . 1 Des un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 variants variant NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 histones histone NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 H1 H1 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 H2A H2A NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 H2B H2B NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 H3 H3 NOM _ _ 10 para _ _ _ _ _ 13 ont avoir VRB _ _ 14 aux _ _ _ _ _ 14 été être VPP _ _ 15 aux _ _ _ _ _ 15 identifiés identifier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 chez chez PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 plupart plupart NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 des de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 organismes organisme NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 eucaryotes eucaryote ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-351 # text = Aucun variant n'a été identifié pour 1 Aucun aucun DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 variant variant NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 n' ne ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 4 a avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 été être VPP _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 identifié identifier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 pour pour PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-352 # text = H4 . 1 H4 H4 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-353 # text = Certains sont exprimés dans tous les types cellulaires , ils sont dits ubiquitaires [ Tableau 1 ] . 1 Certains certains PRQ _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 sont être VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 exprimés exprimer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 dans dans PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 tous tout ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 types type NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 cellulaires cellulaire ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 10 ils ils CLS _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 11 sont être VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 12 dits dire ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ubiquitaires ubiquitaire ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 [ ( PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 Tableau Tableau NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 16 1 1 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 ] ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-354 # text = D'autres ont une expression tissu-spécifique . 1 D' un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 autres autre ADJ _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 ont avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 une un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 expression expression NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 tissu-spécifique tissu ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-355 # text = Nous étudierons les variants spécifiques du testicule au chapitre concernant la spermatogenèse . 1 Nous nous CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 étudierons étudier VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 les le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 variants variant NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 spécifiques spécifique ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 du de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 testicule testicule NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 au à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 chapitre chapitre NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 concernant concerner VPR _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 spermatogenèse spermatogenèse ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-356 # text = Tableau 1 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 1 1 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-357 # text = Variants d'histone ubiquitaires identifiés à ce jour 1 Variants variant NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 d' de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 histone histone NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ubiquitaires ubiquitaire ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 identifiés identifier VPP _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 ce ce DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 jour jour NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-358 # text = Les variants ont des degrés d'identité de séquence variables , forte dans le cas de H2A. X ( 82 % ) et H3 . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 variants variant NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 ont avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 des un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 degrés degré NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 d' de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 identité identité NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 séquence séquence NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 variables variable ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 forte fort ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 13 dans dans PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 le le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 cas cas NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 H2A. H2A. NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 X X ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 20 82 82 NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 % pourcent NOM _ _ 17 parenth _ _ _ _ _ 22 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 24 H3 H3 NOM _ _ 17 para _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-359 # text = 3 ( 96   % ) , faible dans le cas de H2A.Bbd ( 40     % )  ; 1 3 3 NUM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 96 96 NUM _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4   96   DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 % pourcent NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 8 faible faible ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 dans dans PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 le le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 cas cas NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 H2A.Bbd H2A.Bbd NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ( ( PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 15 40 40 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16   40   DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 17     ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 % pourcent NOM _ _ 13 parenth _ _ _ _ _ 19 ) ) PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 20  ; ; PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-360 # text = les identités de séquence des autres variants se situent autour de 60   % ( Luger , 2006 ) . 1 les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 identités identité NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 séquence séquence NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 des de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 autres autre ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 variants variant NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 se se CLI _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 situent situer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 autour autour de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de autour de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 60 60 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13   60   DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 % pourcent NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 ( ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 Luger Luger VNF _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 2006 2006 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 ) ) PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-361 # text = La séquence des variants est en général plus conservée encore que celle des histones canoniques , ce qui témoigne de l'importance de leurs fonctions . ( voir les revues Bernstein and Hake , 2006 ; Henikoff and Ahmad , 2005 ; Kamakaka and Biggins , 2005 ) . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 séquence séquence NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 variants variant NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 en en général PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 général en général NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 plus plus ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 conservée conserver ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 encore encore ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 que que CSU _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 celle celui PRQ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 des de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 histones histone NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 canoniques canonique ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 17 ce ce PRQ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 18 qui qui PRQ _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 19 témoigne témoigner VRB _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 l' le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 importance importance NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 leurs son DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 fonctions fonction NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 27 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 28 voir voir VNF _ _ 0 root _ _ _ _ _ 29 les le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 revues revue NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 Bernstein Bernstein NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 32 and bernstein and hake NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 33 Hake Hake NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 34 , , PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 35 2006 2006 NUM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 36 ; ; PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 37 Henikoff Henikoff NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 38 and henikoff and ahmad NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 39 Ahmad Ahmad NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 40 , , PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 41 2005 2005 NUM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 42 ; ; PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 43 Kamakaka Kamakaka NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 44 and kamakaka and biggins NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 45 Biggins Biggins NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 46 , , PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 47 2005 2005 NUM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 48 ) ) PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 49 . . PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-362 # text = Les différences existant entre les séquences des histones canoniques et celles des variants entraînent des modifications de la surface de l'octamère . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 différences différence NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 3 existant exister VPR _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 entre entre PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 séquences séquence NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 des de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 histones histone NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 canoniques canonique ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 celles celui PRQ _ _ 6 para _ _ _ _ _ 12 des de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 variants variant NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 entraînent entraîner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 des un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 modifications modification NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 surface surface NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 de de+le ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 l' de+le NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 22 octamère de+le NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-363 # text = La stabilisation de l'ADN du nucléosome peut ainsi être modifiée . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 stabilisation stabilisation NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 ADN ADN NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 nucléosome nucléé NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 peut pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 ainsi ainsi ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 être être VNF _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 modifiée modifier VPP _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-364 # text = Cela a notamment été mis en évidence pour H2A.Z ( Park et al. , 2004 ) et H2A.Bbd . 1 Cela cela PRQ _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 a avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 3 notamment notamment ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 été être VPP _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 mis mettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 en en PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 évidence évidence NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 pour pour PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 H2A.Z H2A.Z NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 ( ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 Park Park NOM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 13 al. al. ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 2004 2004 NUM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 16 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 18 H2A.Bbd H2A.Bbd NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-365 # text = Cette déstabilisation pourrait se traduire in vivo par un désassemblage du nucléosome plus ou moins facile , comme cela a été mis en évidence pour H2A.Z. La modification de la surface de l'octamère peut également avoir des conséquences sur les interactions entre nucléosomes et donc sur la formation de structures compactes de la chromatine , c'est le cas pour H2A.Z ( Fan et al. , 2004 ) . 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 déstabilisation déstabilisation NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 se se CLI _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 traduire traduire VNF _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 in in vivo ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 vivo in vivo ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 un un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 désassemblage désassemblage NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 du de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 nucléosome nucléé NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 plus plus ou moins ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 14 ou plus ou moins COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 moins plus ou moins NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 16 facile facile ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 18 comme comme CSU _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 19 cela cela PRQ _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 20 a avoir VRB _ _ 21 aux _ _ _ _ _ 21 été être VPP _ _ 22 aux _ _ _ _ _ 22 mis mettre VPP _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 23 en en PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 évidence évidence NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 pour pour PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 26 H2A.Z. H2A.Z. NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 La La DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 modification modification NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 la le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 surface surface NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 de de+le ADV _ _ 35 subj _ _ _ _ _ 33 l' de+le NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 34 octamère de+le NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 peut pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 36 également également ADV _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 avoir avoir VNF _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 des de PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 conséquences conséquence NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 sur sur PRE _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 les le DET _ _ 42 spe _ _ _ _ _ 42 interactions interaction NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 43 entre entre PRE _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 nucléosomes nucléé NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 et et COO _ _ 48 mark _ _ _ _ _ 46 donc donc ADV _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 sur sur ADJ _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 48 la la NOM _ _ 44 para _ _ _ _ _ 49 formation formation NOM _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 de de PRE _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 51 structures structure NOM _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 52 compactes compact ADJ _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 53 de de PRE _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 54 la le DET _ _ 55 spe _ _ _ _ _ 55 chromatine chromatine NOM _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 56 , , PUNC _ _ 58 punc _ _ _ _ _ 57 c' ce CLS _ _ 58 subj _ _ _ _ _ 58 est être VRB _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 59 le le DET _ _ 60 spe _ _ _ _ _ 60 cas cas NOM _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 61 pour pour PRE _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 62 H2A.Z H2A.Z NOM _ _ 61 dep _ _ _ _ _ 63 ( ( PUNC _ _ 64 punc _ _ _ _ _ 64 Fan Fan NOM _ _ 62 parenth _ _ _ _ _ 65 et et COO _ _ 66 mark _ _ _ _ _ 66 al. al. NOM _ _ 64 para _ _ _ _ _ 67 , , PUNC _ _ 68 punc _ _ _ _ _ 68 2004 2004 NUM _ _ 64 dep _ _ _ _ _ 69 ) ) PUNC _ _ 64 punc _ _ _ _ _ 70 . . PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-366 # text = Les variants des histones sont également impliqués dans la régulation du glissement et du remodelage ATP-dépendant des nucléosomes ( Flaus et al. , 2004 ; Santisteban et al. , 2000 ) . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 variants variant NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 histones histone NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 sont être VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 6 également également ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 impliqués impliquer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 dans dans PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 régulation régulation NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 du de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 glissement glissement NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 du de PRE _ _ 11 para _ _ _ _ _ 15 remodelage remodelage NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 ATP-dépendant ATP-dépendant N+V _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 des de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 nucléosomes nucléé NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 20 Flaus Flaus NOM _ _ 24 periph _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 22 al. al. NOM _ _ 20 para _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 24 2004 2004 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 ; ; PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 Santisteban Santisteban NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 28 al. al. ADV _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 30 2000 2000 NUM _ _ 26 para _ _ _ _ _ 31 ) ) PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-367 # text = Enfin les variations de séquence , notamment au niveau de leurs extrémités N et C terminales , en modifiant les sites de modification post-traductionnelles , sont susceptibles de modifier le code histone porté par les nucléosomes . 1 Enfin enfin ADV _ _ 26 periph _ _ _ _ _ 2 les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 variations variation NOM _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 séquence séquence NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 7 notamment notamment ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 au à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 niveau niveau NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 leurs son DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 extrémités extrémité NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 N N NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 C C NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 16 terminales terminal ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 18 en en PRE _ _ 26 periph _ _ _ _ _ 19 modifiant modifier VPR _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 les le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 sites site NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 modification modification NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 post-traductionnelles post-traductionnelles ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 26 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 27 susceptibles susceptible ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 modifier modifier VNF _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 le le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 code code NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 histone histone NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 porté porter VPP _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 par par PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 les le DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 nucléosomes nucléé NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-368 # text = L'insertion des variants d'histone dans les nucléosomes implique des chaperonnes probablement spécifiques ( Kusch and Workman , 2007 ) , comme c'est le cas pour H2A.Z ( Luk et al. , 2007 ) . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 insertion insertion NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 variants variant NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 d' de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 histone histone NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 dans dans PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 nucléosomes nucléé NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 implique impliquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 des de+le PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 chaperonnes chaperonner NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 probablement probablement ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 spécifiques spécifique ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 ( ( PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 16 Kusch Kusch NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 17 and kusch and workman NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 Workman Workman NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 20 2007 2007 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 ) ) PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 comme comme CSU _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 c' ce CLS _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 25 est être VRB _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 le le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 cas cas NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 pour pour PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 29 H2A.Z H2A.Z NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 ( ( PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 31 Luk Luk NOM _ _ 29 parenth _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 33 mark _ _ _ _ _ 33 al. al. NOM _ _ 31 para _ _ _ _ _ 34 , , PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 35 2007 2007 NUM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 36 ) ) PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-369 # text = a . Variants de H2A 1 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Variants Variants NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 H2A H2A NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-370 # text = Les variants de H2A participent à la constitution de structures chromatiniennes dont les propriétés sont particulières ( voir les revues ( Boulard et al. , 2007 ; Chakravarthy et al. , 2004 ) ) : 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 variants variant NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 H2A H2A NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 participent participer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 constitution constitution NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 structures structure NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 chromatiniennes chromatinien ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 dont dont PRQ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 propriétés propriété NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 15 sont être VRB _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 16 particulières particulier ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 ( ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 18 voir voir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 les le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 revues revue NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 ( ( PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 22 Boulard Boulard NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 24 al. al. NOM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 26 2007 2007 NUM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 ; ; PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 28 Chakravarthy Chakravarthy NOM _ _ 22 parenth _ _ _ _ _ 29 et et COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 30 al. al. NOM _ _ 28 para _ _ _ _ _ 31 , , PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 32 2004 2004 NUM _ _ 30 para _ _ _ _ _ 33 ) ) PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 34 ) ) PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 35 : : PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-371 # text = H2A. X a un rôle de senseur des cassures doubles brins de l'ADN qui implique sa phosphorylation ( Redon et al. , 2002 ; Stucki et al. , 2005 ) . 1 H2A. H2A. NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 X X ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 rôle rôle NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 senseur senseur NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 cassures cassure NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 doubles double ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 brins brin NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 l' le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 ADN ADN NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 qui qui PRQ _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 16 implique impliquer VRB _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 sa son DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 phosphorylation phosphorylation NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 20 Redon Redon NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 22 al. al. ADV _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 2002 2002 NUM _ _ 20 para _ _ _ _ _ 25 ; ; PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 26 Stucki Stucki NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 28 al. al. NOM _ _ 26 para _ _ _ _ _ 29 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 30 2005 2005 NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 31 ) ) PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-372 # text = MacroH 2A participe à la constitution de la chromatine du chromosome X inactif des cellules de mammifère ( Costanzi and Pehrson , 1998 ) . 1 MacroH macro NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 2A 2A NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 participe participer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 constitution constitution NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 chromatine chromatine NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 du de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 chromosome chromosome NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 X X ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 inactif inactif ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 des de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 cellules cellule NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 mammifère mammifère NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ( ( PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 19 Costanzi Costanzi NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 20 and costanzi and pehrson NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 Pehrson Pehrson NOM _ _ 15 parenth _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 1998 1998 NUM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 24 ) ) PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-373 # text = Il possède une fonction de répression de la transcription probablement due à l'inhibition du remodelage de la chromatine ( Angelov et al. , 2003 ; Doyen et al. , 2006 ) . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 possède posséder VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 une un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 fonction fonction NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 répression répression NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 transcription transcription NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 probablement probablement ADV _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 11 due devoir VPP _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 à à PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 l' le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 inhibition inhibition NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 du de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 remodelage remodelage NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 chromatine chromatine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 21 Angelov Angelov NOM _ _ 25 periph _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 23 al. al. NOM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 25 2003 2003 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 ; ; PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 27 Doyen Doyen NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 et et COO _ _ 29 mark _ _ _ _ _ 29 al. al. NOM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 30 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 31 2006 2006 NUM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 32 ) ) PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-374 # text = Ce variant contient un domaine additionnel ( le domaine Macro ) qui constitue environ les deux tiers de la protéine . 1 Ce ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 variant variant NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 contient contenir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 domaine domaine NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 additionnel additionnel ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 domaine domaine NOM _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 10 Macro Macro NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 12 qui qui PRQ _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 13 constitue constituer VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 environ environ ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 15 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 16 deux deux NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 tiers tiers NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 protéine protéine NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-375 # text = MacroH 2A pourrait réguler l'ADP ribosylation de l'ADN grâce à une activité catalytique portée par son domaine Macro 1 MacroH macro NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 2A 2A NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 réguler réguler VNF _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 ADP ADP NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ribosylation ribosylation ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 ADN ADN NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 grâce grâce à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 à grâce à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 13 une un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 activité activité NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 catalytique catalytique ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 portée porter VPP _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 par par PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 son son DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 domaine domaine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 Macro Macro NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-376 # text = ( Kustatscher et al. , 2005 ; Ladurner , 2003 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Kustatscher Kustatscher NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 6 2005 2005 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ; ; PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 Ladurner Ladurner NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 2003 2003 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 ) ) PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-377 # text = La structure du domaine 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structure structure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 domaine domaine NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-378 # text = Macro et celle d'un nucléosome contenant le domaine central de MacroH 2A ont été résolues ( Chakravarthy et al. , 2005a ) . 1 Macro macro NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 celle celui PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 un un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 nucléosome nucléé NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 contenant contenir VPR _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 domaine domaine NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 central central NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 MacroH MacroH NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 2A 2A NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 14 ont avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 été être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 résolues résoudre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 ( ( PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 Chakravarthy Chakravarthy NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 20 al. al. NOM _ _ 18 para _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 2005a 2005a NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-379 # text = Elles montrent que la particule de coeur du nucléosome est très similaire à celle d'un nucléosome classique . 1 Elles elles CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 montrent montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 particule particule NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 coeur coeur NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 nucléosome nucléé NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 est être VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 11 très très ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 similaire similaire ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 celle celui PRQ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 d' de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 un un DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 nucléosome nucléé NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 classique classique ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-380 # text = La même étude montre que le domaine 1 La le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 même même ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 étude étude NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 que que? PRQ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 le le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 domaine domaine NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-381 # text = Macro pourrait servir à recruter des protéines ayant une activité histone désacétylase . 1 Macro macro NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 servir servir VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 recruter recruter VNF _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 des un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 protéines protéine NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 ayant avoir VPR _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 une un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 activité activité NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 histone histone NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 désacétylase désacétylase ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-382 # text = H2A.Z est impliqué dans une série de fonctions différentes , voire contradictoires ( Zlatanova and Thakar , 2008 ) . 1 H2A.Z H2A.Z NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 impliqué impliquer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 dans dans PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 une un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 série série NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 fonctions fonction NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 différentes différent ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 11 voire voire COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 contradictoires contradictoire ADJ _ _ 9 para _ _ _ _ _ 13 ( ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 14 Zlatanova Zlatanova NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 15 and zlatanova and thakar NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 Thakar Thakar NOM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 2008 2008 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 ) ) PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-383 # text = Le variant participe notamment à l'assemblage de la chromatine des centromères ( Greaves et al. , 2007 ) . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 variant variant NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 participe participer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 notamment notamment ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 assemblage assemblage NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 chromatine chromatine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 des de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 centromères centro- NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ( ( PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 Greaves Greaves NOM _ _ 12 parenth _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 16 al. al. ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 2007 2007 NUM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 19 ) ) PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-384 # text = La structure d'un nucléosome contenant ce variant a été résolue et révèle que la structure de la particule de coeur du nucléosome est très conservée malgré la divergence des séquences du variant et de H2A ( Suto et al. , 2000 ) . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structure structure NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 nucléosome nucléé NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 contenant contenir VPR _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 ce ce DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 variant variant NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 a avoir VRB _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 été être VPP _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 résolue résoudre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 révèle révéler VRB _ _ 11 para _ _ _ _ _ 14 que que CSU _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 structure structure NOM _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 particule particule NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 21 coeur coeur NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 du de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 23 nucléosome nucléé NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 est être VRB _ _ 26 aux _ _ _ _ _ 25 très très ADV _ _ 26 periph _ _ _ _ _ 26 conservée conserver VPP _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 27 malgré malgré PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 la le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 divergence divergence NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 des de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 séquences séquence NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 du de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 variant variant NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 et et COO _ _ 35 mark _ _ _ _ _ 35 de de PRE _ _ 32 para _ _ _ _ _ 36 H2A H2A NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 ( ( PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 38 Suto Suto NOM _ _ 36 parenth _ _ _ _ _ 39 et et COO _ _ 42 mark _ _ _ _ _ 40 al. al. ADV _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 , , PUNC _ _ 42 punc _ _ _ _ _ 42 2000 2000 NUM _ _ 38 para _ _ _ _ _ 43 ) ) PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 44 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-385 # text = Toutes les interactions entre l'histone et l'ADN sont conservées . 1 Toutes tout ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 interactions interaction NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 4 entre entre PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 histone histone NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 ADN ADN NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 10 sont être VRB _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 conservées conserver VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-386 # text = La différence majeure consiste en l'élargissement par deux résidus d'une région acide de la surface du nucléosome . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 différence différence NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 majeure majeur ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 consiste consister VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 en en PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 élargissement élargissement NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 par par PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 deux deux NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 résidus résidu NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 d' de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 une un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 région région NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 acide acide ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 surface surface NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 du de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 nucléosome nucléé NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-387 # text = Cette région est impliquée chez H2A dans une interaction avec la queue de l'histoneH 4 ( Dorigo et al. , 2004 ) . 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 région région NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 impliquée impliquer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 chez chez PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 H2A H2A NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 dans dans PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 une un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 interaction interaction NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 avec avec PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 queue queue NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 l' le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 15 histoneH histoneH ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 4 4 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 ( ( PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 Dorigo Dorigo NOM _ _ 16 parenth _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 20 al. al. ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 2004 2004 NUM _ _ 18 para _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-388 # text = De façon très intéressante , la capacité du variant d'induire in vitro ( en présence de la protéine HP1 ) la formation de la fibre de 30 nm dépend de ces deux résidus qui étendent la région acide ( Fan et al. , 2004 ) . 1 De de PRE _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 2 façon façon NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 très très ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 intéressante intéressant ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 capacité capacité NOM _ _ 30 subj _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 variant variant NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 d' de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 induire induire VNF _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 in in vitro ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 vitro in vitro ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 ( ( PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 en en PRE _ _ 11 parenth _ _ _ _ _ 16 présence présence NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 protéine protéine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 HP1 HP1 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 ) ) PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 22 la le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 formation formation NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 la le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 fibre fibre NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 30 30 NUM _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 nm minute NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 dépend dépendre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 31 de de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 ces ce DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 33 deux deux NUM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 34 résidus résidu NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 35 qui qui PRQ _ _ 36 subj _ _ _ _ _ 36 étendent étendre VRB _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 la le DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 région région NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 acide acide ADJ _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 ( ( PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 41 Fan Fan NOM _ _ 38 parenth _ _ _ _ _ 42 et et COO _ _ 45 mark _ _ _ _ _ 43 al. al. ADV _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 45 2004 2004 NUM _ _ 41 para _ _ _ _ _ 46 ) ) PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 47 . . PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-389 # text = H2A.Bbd diminue la stabilité du nucléosome ( Gautier et al. , 2004 ) . 1 H2A.Bbd H2A.Bbd NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 diminue diminuer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 stabilité stabilité NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 du de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 nucléosome nucléé NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 Gautier Gautier NOM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 10 al. al. ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 2004 2004 NUM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-390 # text = Son intégration produit des structures chromatiniennes plus étendues et incapables de former une fibre de 30 nm . 1 Son son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 intégration intégration NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 produit produire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 des un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 structures structure NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 chromatiniennes chromatinien ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 plus plus ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 étendues étendre ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 incapables incapable ADJ _ _ 8 para _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 former former VNF _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 une un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 fibre fibre NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 30 30 NUM _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 nm minute NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-391 # text = Cela pourrait être expliqué par l'absence chez ce variant de la région acide impliquée dans l'interaction entre H2A et la queue H4 ( Zhou et al. , 2007 ) . 1 Cela cela PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 être être VNF _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 expliqué expliquer VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 par par PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 absence absence NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 chez chez PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ce ce DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 variant variant NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 région région NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 acide acide ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 impliquée impliquer VPP _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 dans dans PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 l' le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 interaction interaction NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 entre entre PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 H2A H2A NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 22 la le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 queue queue NOM _ _ 20 para _ _ _ _ _ 24 H4 H4 NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 ( ( PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 Zhou Zhou NOM _ _ 23 parenth _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 28 al. al. ADV _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 30 2007 2007 NUM _ _ 26 para _ _ _ _ _ 31 ) ) PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-392 # text = b . Variants de H3 1 b b NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Variants Variants NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 H3 H3 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-393 # text = CENP-A est un déterminant majeur des régions centromériques dont il pourrait déterminer l'identité ( Sullivan and Karpen , 2001 ) . 1 CENP-A CENP-A NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 un un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 déterminant déterminant NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 majeur majeur ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 régions région NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 centromériques centromérique NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 dont dont PRQ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 10 il il CLS _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 11 pourrait pouvoir VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 déterminer déterminer VNF _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 l' le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 identité identité NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 ( ( PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 16 Sullivan Sullivan NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 17 and sullivan and karpen NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 Karpen Karpen NOM _ _ 14 parenth _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 2001 2001 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 ) ) PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-394 # text = Son extrémité N terminale est très différente de celle des autres histones H3 et porte probablement un code histone particulier . 1 Son son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 extrémité extrémité NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 N N NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 terminale terminal ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 très très ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 différente différent ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 celle celui PRQ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 autres autre ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 histones histone NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 H3 H3 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 porte porter VRB _ _ 5 para _ _ _ _ _ 16 probablement probablement ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 un un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 code code NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 histone histone NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 particulier particulier ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-395 # text = Les variants H3 . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 variants variant NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 H3 H3 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-396 # text = 1 , H3 . 1 1 1 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 H3 H3 NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-397 # text = 2 , H3 . 1 2 2 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 H3 H3 NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-398 # text = 3 ne diffèrent de H3 que par quelques acides-aminés . 1 3 3 NUM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 ne ne ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 diffèrent différer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 H3 H3 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 que que ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 par par PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 quelques quelque DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 acides-aminés acide ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-399 # text = H3 . 1 H3 H3 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-400 # text = 3 a été identifiée comme une histone de remplacement enrichie en MTP associées à l'activation de la transcription alors que H3 . 1 3 3 NUM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 a avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 été être VPP _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 identifiée identifier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 comme comme PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 une un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 histone histone NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 remplacement remplacement NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 enrichie enrichir VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 en en PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 MTP MTP NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 associées associer VPP _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 à à PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 l' le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 activation activation NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 transcription transcription NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 alors alors que CSU _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 que alors que CSU _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 22 H3 H3 NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-401 # text = 2 est enrichie en MTP associées à la répression de la transcription ( Hake and Allis , 2006 ) . 1 2 2 NUM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 enrichie enrichir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 en en PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 MTP MTP NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 associées associer VPP _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 à à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 répression répression NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 transcription transcription NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 ( ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 14 Hake Hake NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 15 and hake and allis NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 Allis Allis NOM _ _ 12 parenth _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 2006 2006 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 ) ) PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-402 # text = IV . Protéines de liaison 1 IV iv NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Protéines Protéines VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 liaison liaison NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-403 # text = La capacité d'induire la formation de structures compactes de la chromatine a été mise en évidence pour un certain nombre de protéines . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 capacité capacité NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 induire induire VNF _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 formation formation NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 structures structure NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 compactes compact ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 chromatine chromatine NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 a avoir VRB _ _ 14 aux _ _ _ _ _ 14 été être VPP _ _ 15 aux _ _ _ _ _ 15 mise mettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 en en PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 évidence évidence NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 pour pour PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 un un DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 20 certain certain ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 nombre nombre NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 protéines protéine NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-404 # text = L'histone de liaison H1 peut être considérée comme l'une d'entre elles puisqu'elle induit la formation de la fibre de 30 nm in vitro ( Woodcock , 2006 ) . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 histone histone NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 liaison liaison NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 H1 H1 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 peut pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 être être VNF _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 considérée considérer VPP _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 comme comme PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 l' l'un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 une l'un PRQ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 d' d'entre PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 entre d'entre NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 elles lui PRQ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 puisqu' puisque CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 16 elle elle CLS _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 17 induit induire VRB _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 formation formation NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 la le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 fibre fibre NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 30 30 NUM _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 nm minute NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 in in vitro ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 27 vitro in vitro ADJ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 ( ( PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 29 Woodcock Woodcock NOM _ _ 22 parenth _ _ _ _ _ 30 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 31 2006 2006 NUM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 ) ) PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-405 # text = D'autres protéines , moins abondantes que l'histone H1 agissent comme agent de réticulation et permettent l'assemblage de structures d'ordre supérieur particulières [ Figure 8 ] ( McBryant et al. , 2006 ) . 1 D' un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 autres autre ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 protéines protéine NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 moins moins ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 abondantes abondant ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 que que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 histone histone NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 H1 H1 NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 11 agissent agir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 comme comme PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 agent agent NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 réticulation réticulation NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 permettent permettre VRB _ _ 11 para _ _ _ _ _ 18 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 assemblage assemblage NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 structures structure NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 d' de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 ordre ordre NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 supérieur supérieur ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 particulières particulier ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 [ ( PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 27 Figure Figure NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 28 8 8 NUM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 ] ) PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 30 ( ( PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 31 McBryant McBryant NOM _ _ 19 parenth _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 35 mark _ _ _ _ _ 33 al. al. ADV _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 , , PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 35 2006 2006 NUM _ _ 31 para _ _ _ _ _ 36 ) ) PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-406 # text = Ce sont les protéines : 1 Ce ce CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 les le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 protéines protéine NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 : : PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-407 # text = HP1 ( Heterochromatin-associated Protein 1 ) de drosophile et ses homologues qui forment des dimères en solution ( Nielsen et al. , 2001 ) . 1 HP1 HP1 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 3 Heterochromatin-associated Heterochromatin-associated NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Protein Protein NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 5 1 1 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 drosophile drosophile NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 10 ses son DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 homologues homologue NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 12 qui qui PRQ _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 13 forment former VRB _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 des un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 dimères dimère NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 en en PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 solution solution NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ( ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 Nielsen Nielsen NOM _ _ 17 parenth _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 21 al. al. ADV _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 2001 2001 NUM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 24 ) ) PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-408 # text = Elles possèdent notamment un chromodomaine qui fixe la modification 1 Elles elles CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 possèdent posséder VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 notamment notamment ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 chromodomaine chromo NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 qui qui PRQ _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 7 fixe fixer VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 modification modification NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-409 # text = H 3 K 9 me ( Thiru et al. , 2004 ) . 1 H heure _ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 3 3 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 K K NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 9 9 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 me me CLI _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 Thiru Thiru NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 9 al. al. NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 2004 2004 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-410 # text = HP1 se lie préférentiellement à la chromatine contenant le variant H2A.Z ( Fan et al. , 2004 ) . 1 HP1 HP1 NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 se se CLI _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 lie lier VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 préférentiellement préférentiellement ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 chromatine chromatine NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 contenant contenir VPR _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 le le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 variant variant NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 H2A.Z H2A.Z NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Fan Fan NOM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 al. al. NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 2004 2004 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-411 # text = Les complexes PcG ( Polycomb Group protein ) sont impliqués dans le maintien de l'état silencieux de certains gènes . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 complexes complexe NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 3 PcG PcG NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 5 Polycomb Polycomb NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 6 Group Group NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 protein protein NOM _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 9 sont être VRB _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 impliqués impliquer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 dans dans PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 le le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 maintien maintien NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 l' le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 état état NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 silencieux silencieux ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 certains certain DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 gènes gène NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-412 # text = Polycomb comporte un chromodomaine qui reconnaît la modification H 3 -K 27 me 3 ( Fischle et al. , 2003 ) . 1 Polycomb Polycomb NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 comporte comporte NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 un un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 chromodomaine chromo NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 qui qui PRQ _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 reconnaît reconnaître VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 modification modification NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 H H NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 3 3 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 -K -K ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 27 27 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 me me CLI _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 3 3 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 ( ( PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 Fischle Fischle NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 18 al. al. NOM _ _ 16 para _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 2003 2003 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 ) ) PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-413 # text = La compaction de la chromatine provoquée par le complexe PRC1 peut être visualisée par microscopie électronique ( Francis et al. , 2004 ) . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 compaction compaction NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 chromatine chromatine NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 provoquée provoquer VPP _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 par par PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 complexe complexe NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 PRC1 PRC1 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 peut pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 être être VNF _ _ 13 aux _ _ _ _ _ 13 visualisée visualiser VPP _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 par par PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 microscopie microscopie NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 électronique électronique ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 ( ( PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 Francis Francis NOM _ _ 15 parenth _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 20 al. al. ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 2004 2004 NUM _ _ 18 para _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-414 # text = Cette étude permet de conclure que PRC1 porte au moins deux sites d'interaction avec les nucléosomes . 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 étude étude NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 permet permettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 conclure conclure VNF _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 que que CSU _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 PRC1 PRC1 NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 porte porter VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 au à+le PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 moins au moins NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 deux deux NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 sites site NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 d' de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 interaction interaction NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 avec avec PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 nucléosomes nucléé NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-415 # text = La protéine MENT ( Myeloid and Erythroid Nuclear Termination stage specific protein ) aviaire interagit avec l'ADN par l'intermédiaire de domaines particuliers pour former des interactions entre nucléofilaments 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 protéine protéine NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 3 MENT MENT NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 5 Myeloid Myeloid NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 6 and myeloid and erythroid nuclear termination stage specific NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 7 Erythroid Erythroid NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 8 Nuclear Nuclear NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 9 Termination Termination NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 10 stage myeloid and erythroid nuclear termination stage specific NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 specific myeloid and erythroid nuclear termination stage specific NOM _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 12 protein protéine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 14 aviaire aviaire ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 15 interagit interagir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 avec avec PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 l' le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 ADN ADN NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 par par PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 20 l' le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 intermédiaire intermédiaire NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 domaines domaine NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 particuliers particulier ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 pour pour PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 26 former former VNF _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 des un DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 interactions interaction NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 entre entre PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 nucléofilaments nucléé NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-416 # text = ( Springhetti et al. , 2003 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Springhetti Springhetti NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2003 2003 NUM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-417 # text = MeCP 2 ( Methyl-CpG binding protein 2 ) se lie au dinucléotides CpG methylés de l'ADN . 1 MeCP MeCP NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 2 2 2 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 4 Methyl-CpG Methyl-CpG NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 5 binding binding NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 protein protein NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 7 2 2 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 9 se se CLI _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 lie lier VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 au au ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 dinucléotides dinucléotides ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 13 CpG CpG NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 methylés methylés NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 l' le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 ADN ADN NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-418 # text = Elle est capable de recruter des histones désacétylases , d'induire une répression locale de la transcription et provoque une forte compaction de la chromatine ( Young et al. , 2005 ) . 1 Elle elle CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 capable capable ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 recruter recruter VNF _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 des un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 histones histone NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 désacétylases désacétylases ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 10 d' de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 induire induire VNF _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 une un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 répression répression NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 locale local ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 transcription transcription NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 19 provoque provoquer VRB _ _ 2 para _ _ _ _ _ 20 une un DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 21 forte fort ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 22 compaction compaction NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 chromatine chromatine NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 ( ( PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 Young Young NOM _ _ 25 parenth _ _ _ _ _ 28 et et COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 29 al. al. ADV _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 31 2005 2005 NUM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 32 ) ) PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-419 # text = C . Compaction de la chromatine pendant la spermiogenèse 1 C c NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Compaction Compaction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 chromatine chromatine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 pendant pendant PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 spermiogenèse spermiogenèse NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-420 # text = I. La spermatogenèse en bref 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 La La DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 spermatogenèse spermatogenèse NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 en en PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 bref bref NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-421 # text = La spermatogenèse est le procédé par lequel sont produits les gamètes mâles ( les spermatozoïdes ) . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 spermatogenèse spermatogenèse NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 le le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 procédé procédé NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 par par PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 7 lequel lequel PRQ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 sont être VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 produits produire VPP _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 les le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 gamètes gamète NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 12 mâles mâle ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ( ( PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 14 les le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 spermatozoïdes spermatozoïde NOM _ _ 11 parenth _ _ _ _ _ 16 ) ) PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-422 # text = Les étapes successives se font de l'épithélium des tubes séminifères vers leur lumière où sont libérés les spermatozoïdes 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 étapes étape NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 successives successif ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 se se CLI _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 font faire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 l' le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 épithélium épithélium NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 des de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 tubes tube NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 séminifères somnifère NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 vers vers PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 13 leur son DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 lumière lumière NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 où où PRQ _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 16 sont être VRB _ _ 17 aux _ _ _ _ _ 17 libérés libérer VPP _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 les le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 spermatozoïdes spermatozoïde NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-423 # text = [ Figure 9 ] . 1 [ ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Figure Figure VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 9 9 NUM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 4 ] ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 5 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-424 # text = Ils vont ensuite terminer leur maturation dans l'épididyme . 1 Ils ils CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 vont aller VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ensuite ensuite ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 terminer terminer VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 leur son DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 maturation maturation NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 dans dans PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 épididyme épididyme NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-425 # text = Les cellules germinales souches , appelées spermatogonies , sont localisées à proximité de l'épithélium séminifère . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 cellules cellule NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 3 germinales germinal ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 souches souche NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 6 appelées appeler ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 spermatogonies spermatogonie NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 9 sont être VRB _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 localisées localiser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 à à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 proximité proximité NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 l' le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 épithélium épithélium NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 séminifère somnifère NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-426 # text = Les spermatogonies de type A prolifèrent par mitose afin d'assurer leur renouvellement et certaines se différencient en spermatogonies de type B. Les spermatogonies de type B sont caractérisées par plusieurs nucléoles et une forte activité transcriptionnelle , permettant de synthétiser les protéines nécessaires à l'étape de méiose qui va suivre . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 spermatogonies spermatogonie NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 type type NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 A A NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 prolifèrent proliférer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 par par PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 mitose mitose NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 afin afin de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 d' afin de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 assurer assurer VNF _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 leur son DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 renouvellement renouvellement NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 15 certaines certains PRQ _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 16 se se CLI _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 différencient différencier VRB _ _ 6 para _ _ _ _ _ 18 en en PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 spermatogonies spermatogonie NOM _ _ 29 subj _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 type type ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 22 B. B. NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 Les Les DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 spermatogonies spermatogonie NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 type type NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 B B NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 sont être VRB _ _ 29 aux _ _ _ _ _ 29 caractérisées caractériser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 30 par par PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 plusieurs plusieurs DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 nucléoles nucléole NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 et et COO _ _ 36 mark _ _ _ _ _ 34 une un DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 35 forte fort ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 36 activité activité NOM _ _ 32 para _ _ _ _ _ 37 transcriptionnelle transcriptionnel ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 , , PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 39 permettant permettre VPR _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 40 de de PRE _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 synthétiser synthétiser VNF _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 les le DET _ _ 43 spe _ _ _ _ _ 43 protéines protéine NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 44 nécessaires nécessaire ADJ _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 à à PRE _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 l' le DET _ _ 47 spe _ _ _ _ _ 47 étape étape NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 48 de de PRE _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 49 méiose méiose NOM _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 qui qui PRQ _ _ 51 subj _ _ _ _ _ 51 va aller VRB _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 52 suivre suivre VNF _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 53 . . PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-427 # text = Les divisions de méiose produisent quatre cellules haploïdes , appelé spermatides à partir d'une cellule diploïde . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 divisions division NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 méiose méiose NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 produisent produire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 quatre quatre NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 cellules cellule NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 haploïdes haploïde ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 appelé appeler VPP _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 11 spermatides spermatide NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 à à partir de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 partir à partir de NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 d' à partir de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 une un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 cellule cellule NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 diploïde diploïde ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-428 # text = La prophase de la première division méiotique est très longue , elle commence par la duplication de l'ADN et se termine par la ségrégation des chromosomes homologues dans les spermatocytes secondaires , par conséquent haploïdes . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 prophase prophase NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 première premier ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 division division NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 méiotique méiotique ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 très très ADV _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 longue long ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 12 elle elle CLS _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 13 commence commencer VRB _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 14 par par PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 duplication duplication NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 ADN ADN NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 21 se se CLI _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 22 termine terminer VRB _ _ 13 para _ _ _ _ _ 23 par par PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 ségrégation ségrégation NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 des de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 chromosomes chromosome NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 homologues homologue ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 dans dans PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 30 les le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 spermatocytes spermatocyte NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 secondaires secondaire ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 34 par par conséquent PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 35 conséquent par conséquent ADV _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 haploïdes haploïde ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-429 # text = Les spermatocytes secondaires traversent ensuite une interphase très courte , sans répliquer leur ADN et subissent alors une division de mitose conventionnelle , avec séparation des chromatides soeurs de chaque chromosome . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 spermatocytes spermatocyte NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 secondaires secondaire ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 traversent traverser VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 ensuite ensuite ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 une un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 interphase interphase NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 très très ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 courte court ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 11 sans sans ADV _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 12 répliquer répliquer VNF _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 13 leur son DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 ADN ADN NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 16 subissent subir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 alors alors ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 une un DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 division division NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 mitose mitose NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 conventionnelle conventionnel ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 avec avec PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 25 séparation séparation NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 des de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 chromatides chromatides ADJ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 28 soeurs soeur NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 chaque chaque DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 chromosome chromosome NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-430 # text = Cette division donne naissance aux spermatides . 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 division division NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 donne donner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 naissance naissance NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 aux à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 spermatides spermatide NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-431 # text = Commence alors la phase de différenciation terminale appelée spermiogenèse qui s'achève par la libération des spermatozoïdes dans la lumière du tube séminifère . 1 Commence commencer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 alors alors ADV _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 phase phase NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 différenciation différenciation NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 terminale terminal ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 appelée appeler ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 spermiogenèse spermiogenèse ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 qui qui PRQ _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 11 s' s' CLI _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 achève achever VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 13 par par PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 libération libération NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 des de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 spermatozoïdes spermatozoïde NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 dans dans PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 lumière lumière NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 du de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 tube tube NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 séminifère somnifère NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-432 # text = Tout au long de la spermatogenèse , il existe entre les cellules en voie de différenciation des ponts cytoplasmiques permettant la diffusion des molécules . 1 Tout tout au long de ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 au tout au long de PRE _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 3 long tout au long de NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de tout au long de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 spermatogenèse spermatogenèse NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 8 il il CLS _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 9 existe exister VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 entre entre PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 cellules cellule NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 en en PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 voie voie NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 différenciation différenciation NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 des de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ponts pont NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 cytoplasmiques cytoplasmique ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 permettant permettre VPR _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 la le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 diffusion diffusion NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 des de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 molécules molécule NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-433 # text = Trois transformations majeures s'opèrent au cours de la spermiogenèse : 1 Trois trois NUM _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 transformations transformation NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 majeures majeur ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 s' s' CLI _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 opèrent opérer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 au au cours de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 cours au cours de NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de au cours de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 spermiogenèse spermiogenèse NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 : : PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-434 # text = i . l'appareil de Golgi se différencie en granules à fonction semblable à celle des lysosomes qui donneront naissance à l'acrosome . 1 i i NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 l' le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 appareil appareil NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 Golgi Golgi NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 se se CLI _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 différencie différencier VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 en en PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 granules granule NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 fonction fonction NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 semblable semblable ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 à à PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 celle celui PRQ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 des de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 lysosomes lysosome NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 qui qui PRQ _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 19 donneront donner VRB _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 naissance naissance NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 à à PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 l' le NOM _ _ 23 det _ _ _ _ _ 23 acrosome le NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-435 # text = ii . 1 ii if NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-436 # text = Le flagelle se forme et l'excès de cytoplasme est évacué sous forme de corps résiduels . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 flagelle flagelle NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 se se CLI _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 forme former VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 excès excès NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 cytoplasme cytoplasme NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 est être VRB _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 évacué évacuer VPP _ _ 4 para _ _ _ _ _ 12 sous sous PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 forme forme NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 corps corps NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 résiduels résiduel ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-437 # text = iii . 1 iii ici ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-438 # text = La dernière transformation concerne la compaction de la chromatine : 1 La le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 dernière dernier ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 transformation transformation NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 concerne concerner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 compaction compaction NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 chromatine chromatine NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 : : PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-439 # text = c'est elle qui va nous intéresser . 1 c' ce CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 elle lui PRQ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 qui qui PRQ _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 5 va aller VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 nous le CLI _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 intéresser intéresser VNF _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-440 # text = Au cours de la spermiogenèse , le noyau des spermatides s'allonge et la chromatine se condense en une structure très compacte . 1 Au à PRE _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 cours cours NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 spermiogenèse spermiogenèse NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 noyau noyau NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 9 des de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 spermatides spermatide NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 s' s' CLI _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 allonge allonger VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 chromatine chromatine NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 16 se se CLI _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 condense condenser VRB _ _ 12 para _ _ _ _ _ 18 en en PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 une un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 structure structure NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 très très ADV _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 22 compacte compact ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-441 # text = Ce phénomène a été observé dans la plupart des espèces étudiées . 1 Ce ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 phénomène phénomène NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 a avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 été être VPP _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 observé observer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 dans dans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 plupart plupart NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 des de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 espèces espèce NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 étudiées étudier ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-442 # text = Le début du remodelage coïncide avec une hyperacétylation des histones de coeur ; 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 début début NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 remodelage remodelage NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 coïncide coïncider VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 avec avec PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 une un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 hyperacétylation hyperacétylation NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 des de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 histones histone NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 coeur coeur NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ; ; PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-443 # text = celle -ci sera suivie d'une disparition quasi totale des histones 1 celle celui PRQ _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 -ci -ci ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 sera être VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 suivie suivre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 d' de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 une un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 disparition disparition NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 quasi quasi ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 totale total ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 histones histone NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-444 # text = ( Hazzouri et al. , 2000 ; Meistrich et al. , 1992 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Hazzouri Hazzouri NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2000 2000 NUM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 ; ; PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 8 Meistrich Meistrich NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 al. al. NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 1992 1992 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-445 # text = Elles seront remplacées par de petites protéines basiques , spécifiques des testicules , appelées protéines de transition ( TP1 / 2 ) ( Meistrich et al. , 2003 ) . 1 Elles elles CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 seront être VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 remplacées remplacer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 par par PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 6 petites petit ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 protéines protéine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 basiques basique ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 10 spécifiques spécifique ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 des de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 testicules testicule NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 appelées appeler VPP _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 15 protéines protéine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 transition transition NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ( ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 TP1 TP1 NOM _ _ 17 parenth _ _ _ _ _ 20 / / PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 21 2 2 NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 ) ) PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 Meistrich Meistrich NOM _ _ 15 parenth _ _ _ _ _ 25 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 26 al. al. ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 2003 2003 NUM _ _ 24 para _ _ _ _ _ 29 ) ) PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-446 # text = Les protéines de transition seront elles-mêmes remplacées par des protéines spécifiques du liquide séminal appelées protamines ( Lewis et al. , 2003 ) . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 protéines protéine NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 transition transition NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 seront être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 elles-mêmes lui-même PRQ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 remplacées remplacer ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 par par PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 des un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 protéines protéine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 spécifiques spécifique ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 du de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 liquide liquide NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 séminal séminal ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 appelées appeler ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 16 protamines pro- ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 ( ( PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 Lewis Lewis NOM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 20 al. al. ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 2003 2003 NUM _ _ 18 para _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-447 # text = L'invalidation des gènes TP1 / 2 chez la souris n'affecte pas les premières étapes de la condensation de la chromatine ( Shirley et al. , 2004 ; Zhao et al. , 2004 ) . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 invalidation invalidation NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 gènes gène NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 TP1 TP1 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 / sur PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 7 2 2 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 chez chez PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 souris souris NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 n' ne ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 affecte affecter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 pas pas ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 les le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 15 premières premier ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 étapes étape NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 condensation condensation NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 la le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 chromatine chromatine NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 24 Shirley Shirley NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 26 al. al. ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 2004 2004 NUM _ _ 24 para _ _ _ _ _ 29 ; ; PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 30 Zhao Zhao NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 31 et et COO _ _ 32 mark _ _ _ _ _ 32 al. al. NOM _ _ 30 para _ _ _ _ _ 33 , , PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 34 2004 2004 NUM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 35 ) ) PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 36 . . PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-448 # text = Celles -ci semblent être largement dépendantes de la protéine Brdt ( Govin et al. , 2006 ) . 1 Celles celles NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 -ci -ci ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 semblent sembler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 être être VNF _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 largement largement ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 dépendantes dépendant ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 protéine protéine NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 Brdt Brdt NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 Govin Govin NOM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 14 al. al. ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 2006 2006 NUM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 17 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-449 # text = II . Modifications de la chromatine au cours de la spermiogenèse 1 II ii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Modifications Modifications NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 chromatine chromatine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 au à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 cours cours NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 spermiogenèse spermiogenèse NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-450 # text = Nous allons étudier principalement les modifications ayant lieu au cours de la spermiogenèse [ Figure 10 ] et qui sont donc susceptibles d'intéresser la compaction de la chromatine à laquelle participe la protéine Brdt . 1 Nous nous CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 allons aller VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 étudier étudier VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 principalement principalement ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 modifications modification NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 ayant avoir VPR _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 lieu lieu NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 au au cours de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 10 cours au cours de NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de au cours de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 spermiogenèse spermiogenèse NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 [ ( PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 15 Figure Figure NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 10 10 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 ] ) PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 18 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 19 qui qui PRQ _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 20 sont être VRB _ _ 11 para _ _ _ _ _ 21 donc donc ADV _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 susceptibles susceptible ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 d' de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 intéresser intéresser VNF _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 la le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 compaction compaction NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 la le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 chromatine chromatine NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 à à PRE _ _ 32 periph _ _ _ _ _ 31 laquelle lequel PRQ _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 participe participer VRB _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 33 la le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 protéine protéine NOM _ _ 32 subj _ _ _ _ _ 35 Brdt Brdt NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-451 # text = Pour une description plus complète de ces phénomènes , voir les revues ( Caron et al. , 2005 ; Govin et al. , 2004 ) . 1 Pour pour PRE _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 une un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 description description NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 plus plus ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 complète complet ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 ces ce DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 phénomènes phénomène NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 10 voir voir VNF _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 revues revue NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 Caron Caron NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 16 al. al. NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 18 2005 2005 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 ; ; PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 20 Govin Govin NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 22 al. al. NOM _ _ 20 para _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 2004 2004 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 25 ) ) PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-452 # text = a . Intégration de variants d'histone 1 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Intégration Intégration NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 variants variant NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 d' de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 histone histone NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-453 # text = La chromatine qui sert de substrat au remplacement des histones et à la compaction qui suit contient une grande variété de variants d'histones . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 chromatine chromatine NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 3 qui qui PRQ _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 sert servir VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 substrat substrat NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 au à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 remplacement remplacement NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 des de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 histones histone NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 à à PRE _ _ 7 para _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 compaction compaction NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 qui qui PRQ _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 16 suit suivre VRB _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 contient contenir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 une un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 19 grande grand ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 variété variété NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 variants variant NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 d' de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 histones histone NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-454 # text = Certains sont spécifiques du testicule et d'autres sont ubiquitaires ( Govin et al. , 2004 ; Govin et al. , 2007 ) [ Tableau 2 ] . 1 Certains certains PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 spécifiques spécifique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 testicule testicule NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 7 d' un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 autres autre ADJ _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 9 sont être VRB _ _ 2 para _ _ _ _ _ 10 ubiquitaires ubiquitaire ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 12 Govin Govin NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 al. al. NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 16 2004 2004 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 ; ; PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 18 Govin Govin NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 20 al. al. NOM _ _ 18 para _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 22 2007 2007 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 24 [ ( PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 Tableau Tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 2 2 NUM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 ] ) PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-455 # text = Les variants ubiquitaires , dont la présence correspond aux phases de méiose et aux premiers stades de la spermiogenèse ne sont probablement pas directement impliqués dans le phénomène de compaction des stades tardifs . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 variants variant NOM _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 3 ubiquitaires ubiquitaire ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 5 dont dont PRQ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 présence présence NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 correspond correspondre VRB _ _ 3 para _ _ _ _ _ 9 aux à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 phases phase NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 méiose méiose NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 aux à PRE _ _ 8 para _ _ _ _ _ 15 premiers premier ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 stades stade NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 spermiogenèse spermiogenèse NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 ne ne ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 21 sont être VRB _ _ 25 aux _ _ _ _ _ 22 probablement probablement ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 23 pas pas ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 24 directement directement ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 impliqués impliquer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 dans dans PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 le le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 phénomène phénomène NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 compaction compaction VNF _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 des un DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 stades stade NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 tardifs tardif ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 . . PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-456 # text = Nous allons nous limiter à examiner la fonction possible des variants spécifiques . 1 Nous lui PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 allons aller VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 nous nous CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 4 limiter limiter VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 examiner examiner VNF _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 fonction fonction NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 possible possible ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 variants variant NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 spécifiques spécifique ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-457 # text = Tableau 2 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 2 2 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-458 # text = Variants d'histone identifiés chez le rat ou la souris ( chez l'homme ) 1 Variants variant NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 d' de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 histone histone NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 identifiés identifier VPP _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 chez chez PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 le le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 rat rat NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 ou ou COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 souris souris NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 chez chez PRE _ _ 4 parenth _ _ _ _ _ 13 l' le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 homme homme NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-459 # text = i . Variants des histones de liaison 1 i i NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Variants Variants NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 histones histone NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 liaison liaison NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-460 # text = Le variant H 1t est détecté du stade des spermatocytes à celui des spermatides rondes à allongées . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 variant variant NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 H H NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 1t 1t NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 est être VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 détecté détecter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 du de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 stade stade NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 des de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 spermatocytes spermatocyte NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 à à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 celui celui PRQ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 des de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 spermatides spermatide NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 rondes ronde NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 à à PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 allongées allonger ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-461 # text = Il constitue dans ces cellules jusqu'à 55 % des histones de liaison totales ( Drabent et al. , 1996 ; Steger et al. , 1998 ) . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 constitue constituer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 dans dans PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ces ce DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 cellules cellule NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 jusqu'à jusqu'à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 55 55 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 % pourcent NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 des de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 histones histone NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 liaison liaison NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 totales total ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 Drabent Drabent NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 17 al. al. ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 1996 1996 NUM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 20 ; ; PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 Steger Steger NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 23 al. al. ADV _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 1998 1998 NUM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 26 ) ) PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-462 # text = Des données expérimentales in vitro montrent que H 1t est moins fortement associé aux nucléosomes et qu'il a des capacités de condensation de la chromatine amoindries par rapport aux autres types d'histones de liaison présentes chez le rat ( De 1 Des un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 données donnée NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 expérimentales expérimental ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 in in vitro ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 vitro in vitro ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 montrent montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 que que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 H H NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 9 1t 1t NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 est être VRB _ _ 13 aux _ _ _ _ _ 11 moins moins ADV _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 12 fortement fortement ADV _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 13 associé associer VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 14 aux à PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 nucléosomes nucléé NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 qu' que CSU _ _ 7 para _ _ _ _ _ 18 il il CLS _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 19 a avoir VRB _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 des un DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 capacités capacité NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 condensation condensation NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 la le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 chromatine chromatine NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 amoindries amoindrir ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 par par PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 29 rapport rapport NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 aux à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 31 autres autre ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 32 types type NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 d' de PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 histones histone NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 de de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 liaison liaison NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 présentes présent ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 chez chez PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 39 le le DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 rat rat NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 ( ( PUNC _ _ 40 punc _ _ _ _ _ 42 De De PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-463 # text = Lucia et al. , 1994 ; 1 Lucia lucia NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 3 al. al. ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 1994 1994 NUM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 6 ; ; PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-464 # text = Khadake and Rao , 1995 ) . 1 Khadake khadake and rao NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 and khadake and rao NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 Rao Rao NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 1995 1995 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-465 # text = Cela suggère que ce variant puisse faciliter la décompaction de la chromatine pour améliorer son accès à d'autres facteurs de remodelage . 1 Cela cela PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 suggère suggérer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ce ce DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 variant variant NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 puisse pouvoir VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 faciliter faciliter VNF _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le NOM _ _ 9 det _ _ _ _ _ 9 décompaction le NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 chromatine chromatine NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 pour pour PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 14 améliorer améliorer VNF _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 son son DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 accès accès NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 à à PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 d' un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 19 autres autre ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 facteurs facteur NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 remodelage remodelage NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-466 # text = Contrairement à H 1t , les variants HILS1 et H 1 t 2 sont exclusivement présents pendant la spermiogenèse . 1 Contrairement contrairement ADV _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 2 à à PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 H H NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 1t 1t NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 variants variant NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 8 HILS1 HILS1 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 H H NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 11 1 1 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 t tome NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 13 2 2 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 exclusivement exclusivement ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 présents présent ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 pendant pendant PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 spermiogenèse spermiogenèse NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-467 # text = H 1 t 2 est détecté à partir du stade des spermatides rondes jusqu'au stade des spermatides condensées . 1 H heure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 1 1 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 t tome NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 4 2 2 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 est être VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 détecté détecter VPP _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 à à partir de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 partir à partir de DET _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 du à partir de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 stade stade NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 des de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 spermatides spermatide NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 rondes ronde NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 jusqu'au jusqu'à PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 stade stade NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 des de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 spermatides spermatide NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 condensées condenser ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-468 # text = Il est localisé dans la partie apicale du noyau ( sous l'acrosome ) ( Martianov et al. , 2005 ) . 1 Il il CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 localisé localiser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 dans dans PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 partie partie NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 apicale apical ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 noyau noyau NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 ( ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 sous sous PRE _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 12 l' le NOM _ _ 13 det _ _ _ _ _ 13 acrosome le NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 15 ( ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 Martianov Martianov NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 18 al. al. ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 2005 2005 NUM _ _ 16 para _ _ _ _ _ 21 ) ) PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-469 # text = Le variant HILS1 a été exclusivement détecté dans les spermatides en condensation ( stades 9 à 15 ) ( Yan et al. , 2003 ) . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 variant variant NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 HILS1 HILS1 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 a avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 été être VPP _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 6 exclusivement exclusivement ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 détecté détecter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 dans dans PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 spermatides spermatide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 en en PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 condensation condensation NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ( ( PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 stades stade NOM _ _ 12 parenth _ _ _ _ _ 15 9 9 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 à à PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 15 15 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 Yan Yan NOM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 22 al. al. ADV _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 2003 2003 NUM _ _ 20 para _ _ _ _ _ 25 ) ) PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-470 # text = Les auteurs de cette étude proposent qu'il soit impliqué dans la compaction de la chromatine dont les histones ont déjà été remplacées par des protéines de transition . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 auteurs auteur NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 cette ce DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 étude étude NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 proposent proposer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 qu' que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 il il CLS _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 9 soit être VRB _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 impliqué impliquer VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 dans dans PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 compaction compaction NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 chromatine chromatine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 dont dont PRQ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 18 les le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 histones histone NOM _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 20 ont avoir VRB _ _ 22 aux _ _ _ _ _ 21 déjà déjà ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 22 été être VPP _ _ 23 aux _ _ _ _ _ 23 remplacées remplacer VPP _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 24 par par PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 des un DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 protéines protéine NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 transition transition NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-471 # text = ii . 1 ii if NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-472 # text = Variants des histones de coeur 1 Variants variant NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 histones histone NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 coeur coeur NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-473 # text = Variants de H2A 1 Variants variant NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 H2A H2A NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-474 # text = Les queues N terminales des variants H2AL1 et H2AL2 sont sujettes à de nombreuses variations . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 queues queue NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 3 N N NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 terminales terminal ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 variants variant NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 H2AL1 H2AL1 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 9 H2AL2 H2AL2 NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 10 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 sujettes sucette NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 à à PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 de un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 14 nombreuses nombreux ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 variations variation NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-475 # text = Elles sont plus réduites dans le cas de TH2A. Dans les deux cas les modifications touchent des résidus porteurs de MTP ou des résidus adjacents . 1 Elles elles CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 plus plus NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 4 réduites réduire VPP _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 dans dans PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 le le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 cas cas NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 TH2A. TH2A. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 Dans Dans PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 12 deux deux NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 cas cas NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 les le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 modifications modification NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 touchent toucher VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 des un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 résidus résidu NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 porteurs porteur ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 MTP MTP NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 ou ou COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 23 des de PRE _ _ 20 para _ _ _ _ _ 24 résidus résidu NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 adjacents adjacent ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-476 # text = Elles influencent donc potentiellement des fonctions importantes . 1 Elles elles CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 influencent influencer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 donc donc ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 potentiellement potentiellement ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 des un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 fonctions fonction NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 importantes important ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-477 # text = Les variants de H2A présentent de plus plusieurs mutations dans leur domaines centraux et C terminaux . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 variants variant NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 H2A H2A NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 présentent présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 de de plus PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 plus de plus NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 plusieurs plusieurs DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 mutations mutation NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 leur son DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 domaines domaine NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 centraux central NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 C C NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 16 terminaux terminal ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-478 # text = La région C terminale chargée négativement , connue pour être impliquée dans l'interaction avec la queue H4 et la formation de structures chromatiniennes d'ordre supérieur , est d'ailleurs concernée puisqu'elle est quasiment absente chez H2AL1 / L2 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 région région NOM _ _ 32 subj _ _ _ _ _ 3 C C NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 terminale terminal ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 chargée charger ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 négativement négativement ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 8 connue connaître VPP _ _ 32 periph _ _ _ _ _ 9 pour pour PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 être être VNF _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 impliquée impliquer VPP _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 dans dans PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 l' le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 interaction interaction NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 avec avec PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 queue queue NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 H4 H4 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 formation formation NOM _ _ 17 para _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 structures structure NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 chromatiniennes chromatinien ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 d' de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 ordre ordre NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 supérieur supérieur ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 29 est être VRB _ _ 32 aux _ _ _ _ _ 30 d' d'ailleurs PRE _ _ 32 periph _ _ _ _ _ 31 ailleurs d'ailleurs NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 concernée concerner VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 33 puisqu' puisque CSU _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 elle elle CLS _ _ 35 subj _ _ _ _ _ 35 est être VRB _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 quasiment quasiment ADV _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 absente absent ADJ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 chez chez PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 39 H2AL1 H2AL1 NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 / ou PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 41 L2 L2 NOM _ _ 39 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-479 # text = [ Figure   11 ] . 1 [ ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Figure Figure VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3     11 DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 11 11 NUM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 5 ] ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-480 # text = Ces variants ont été identifiés principalement dans les zones péricentriques des spermatides condensées et dans les spermatozoïdes . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 variants variant NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 ont avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 été être VPP _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 identifiés identifier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 principalement principalement ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 dans dans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 zones zone NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 péricentriques péricentriques ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 des de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 spermatides spermatide NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 condensées condenser ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 dans dans PRE _ _ 7 para _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 spermatozoïdes spermatozoïde NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-481 # text = Ils dimérisent préférentiellement avec le variant 1 Ils ils CLS _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 dimérisent dimérisent NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 préférentiellement préférentiellement ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 avec avec PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 variant variant NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-482 # text = TH2B et forment , par association avec le tétramère ( H3-H4 ) 2 , des nucléosomes peu stables ( Govin et al , 2007 ) . 1 TH2B TH2B NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 forment former VRB _ _ 1 para _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 5 par par PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 association association NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 avec avec PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 tétramère tétramère NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 ( ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 H3-H4 H3-H4 NOM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 12 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 13 2 2 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 des de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 nucléosomes nucléé NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 peu peu ADV _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 stables stable ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 20 Govin Govin NOM _ _ 16 parenth _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 22 al al ADJ _ _ 16 para _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 2007 2007 NUM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 25 ) ) PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-483 # text = Variants de H2B 1 Variants variant NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 H2B H2B NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-484 # text = Les variants de H2B sont assez conservés dans leurs parties centrales et C terminales . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 variants variant NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 H2B H2B NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 sont être VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 6 assez assez ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 conservés conserver VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 dans dans PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 leurs son DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 parties partie NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 centrales central NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 C C NOM _ _ 10 para _ _ _ _ _ 14 terminales terminal ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-485 # text = Les queues N terminales sont en revanche très variables . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 queues queue NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 N N NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 terminales terminal ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 en en revanche PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 revanche en revanche NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 très très ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 variables variable ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-486 # text = TH2B est la forme la plus abondante de l'histone H2B dans les spermatides rondes et allongées , elle disparaîtra progressivement jusqu'à n'être plus détectée dans les spermatozoïdes ( Govin et al. , 2007 ; van Roijen et al. , 1998 ) . 1 TH2B TH2B NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 forme forme NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 6 plus plus ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 abondante abondant ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 histone histone NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 H2B H2B NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 dans dans PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 spermatides spermatide NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 rondes rond ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 allongées allonger ADJ _ _ 15 para _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 19 elle elle CLS _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 20 disparaîtra disparaître VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 21 progressivement progressivement ADV _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 jusqu'à jusqu'à PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 n' ne ADV _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 24 être être VNF _ _ 26 aux _ _ _ _ _ 25 plus plus ADV _ _ 26 periph _ _ _ _ _ 26 détectée détecter VPP _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 27 dans dans PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 les le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 spermatozoïdes spermatozoïde NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 ( ( PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 31 Govin Govin NOM _ _ 35 periph _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 33 mark _ _ _ _ _ 33 al. al. NOM _ _ 31 para _ _ _ _ _ 34 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 35 2007 2007 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 36 ; ; PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 37 van van NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 Roijen Roijen NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 et et COO _ _ 42 mark _ _ _ _ _ 40 al. al. ADV _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 , , PUNC _ _ 42 punc _ _ _ _ _ 42 1998 1998 NUM _ _ 37 para _ _ _ _ _ 43 ) ) PUNC _ _ 42 punc _ _ _ _ _ 44 . . PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-487 # text = Sa fonction est inconnue . 1 Sa son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 fonction fonction NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 inconnue inconnu ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-488 # text = Contrairement à elle , TSH2B , son homologue chez l'homme est détectée dans les spermatozoïdes matures et pourrait être impliquée dans les premières étapes du développement de l'oeuf ( Singleton et al. , 2007 ) . 1 Contrairement contrairement ADV _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 2 à à PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 elle lui PRQ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 TSH2B TSH2B NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 7 son son DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 homologue homologue NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 9 chez chez PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 homme homme NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 est être VRB _ _ 13 aux _ _ _ _ _ 13 détectée détecter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 dans dans PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 les le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 spermatozoïdes spermatozoïde NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 matures mature ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 19 pourrait pouvoir VRB _ _ 13 para _ _ _ _ _ 20 être être VNF _ _ 21 aux _ _ _ _ _ 21 impliquée impliquer VPP _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 dans dans PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 les le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 24 premières premier ADJ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 étapes étape NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 26 du de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 développement développement NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 l' le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 oeuf oeuf NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 ( ( PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 32 Singleton Singleton NOM _ _ 30 parenth _ _ _ _ _ 33 et et COO _ _ 36 mark _ _ _ _ _ 34 al. al. ADV _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 36 2007 2007 NUM _ _ 32 para _ _ _ _ _ 37 ) ) PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 38 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-489 # text = H2BFWT est un variant spécifique du testicule identifié chez l'homme . 1 H2BFWT H2BFWT NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 un un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 variant variant NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 spécifique spécifique ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 du de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 testicule testicule NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 identifié identifier VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 chez chez PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 homme homme NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-490 # text = Il pourrait être associé aux régions télomériques ( Churikov et al. , 2004 ) . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 être être VNF _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 associé associer VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 aux à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 régions région NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 télomériques télomérique ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Churikov Churikov NOM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 11 al. al. ADV _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 2004 2004 NUM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-491 # text = Sa présence n'affecte pas la stabilité des nucléosomes . 1 Sa son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 présence présence NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 n' ne ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 affecte affecter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 pas pas ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 stabilité stabilité NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 nucléosomes nucléé NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-492 # text = Il est en revanche incapable de recruter des facteurs de condensation et de participer à l'assemblage des chromosomes mitotiques ( Boulard et al. , 2006 ) . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 en en revanche PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 revanche en revanche NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 incapable incapable ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 recruter recruter VNF _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 des un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 facteurs facteur NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 condensation condensation NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 6 para _ _ _ _ _ 14 participer participer VNF _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 à à PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 l' le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 assemblage assemblage NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 des de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 chromosomes chromosome NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 mitotiques mitotique ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 ( ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 Boulard Boulard NOM _ _ 19 parenth _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 24 al. al. ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 2006 2006 NUM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 27 ) ) PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-493 # text = H2BFWT pourrait être un marqueur épigénétique important pour l'identité des régions télomériques . 1 H2BFWT H2BFWT NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 être être VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 marqueur marqueur NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 épigénétique épigénétique ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 important important ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 identité identité NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 des de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 régions région NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 télomériques télomérique ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-494 # text = Sa partie N terminale est extrêmement différente de celle de H2B. De façon générale il présente une similarité faible avec H2B et TH2B ou 1 Sa son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 partie partie NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 N N NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 terminale terminal ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 extrêmement extrêmement ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 différente différent ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 celle celui PRQ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 H2B. H2B. NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 De De PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 façon façon NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 générale général ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 il il CLS _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 16 présente présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 une un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 similarité similarité NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 faible faible ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 avec avec PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 H2B H2B NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 23 TH2B TH2B NOM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 24 ou ou COO _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-495 # text = TSH2B . 1 TSH2B TSH2B NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-496 # text = Au contraire des variants de H2A , l'incorporation de TSH2B et H2BFWT dans des nucléosomes ne modifie pas la stabilité de ceux -ci ( Boulard et al. , 2006 ; Li et al. , 2005 ) . 1 Au à PRE _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 2 contraire contraire NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 variants variant NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 H2A H2A NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 incorporation incorporation NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 TSH2B TSH2B NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 H2BFWT H2BFWT NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 14 dans dans PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 15 des un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 nucléosomes nucléé NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 ne ne ADV _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 modifie modifier VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 pas pas ADV _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 stabilité stabilité NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 ceux celui PRQ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 -ci -ci ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 ( ( PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 26 Boulard Boulard NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 28 al. al. NOM _ _ 26 para _ _ _ _ _ 29 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 30 2006 2006 NUM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 ; ; PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 32 Li Li NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 33 et et COO _ _ 34 mark _ _ _ _ _ 34 al. al. NOM _ _ 32 para _ _ _ _ _ 35 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 36 2005 2005 NUM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 37 ) ) PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 38 . . PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-497 # text = Le variant H2BL1 a été identifié exclusivement dans les spermatides condensées et reste présent , contrairement à TH2B , dans les spermatozoïdes matures ( Govin et al. , 2007 ) . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 variant variant NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 H2BL1 H2BL1 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 été été NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 identifié identifier VPP _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 exclusivement exclusivement ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 dans dans PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 spermatides spermatide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 condensées condensé ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 reste reste NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 14 présent présent ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 16 contrairement contrairement ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 17 à à PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 TH2B TH2B NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 dans dans PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 21 les le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 spermatozoïdes spermatozoïde NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 matures mature ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 ( ( PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 Govin Govin NOM _ _ 22 parenth _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 29 mark _ _ _ _ _ 27 al. al. ADV _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 29 2007 2007 NUM _ _ 25 para _ _ _ _ _ 30 ) ) PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-498 # text = Ce variant pourrait remplacer TH2B dans les stades tardifs de la spermatogenèse . 1 Ce ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 variant variant NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 remplacer remplacer VNF _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 TH2B TH2B NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 dans dans PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 stades stade NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 tardifs tardif ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 spermatogenèse spermatogenèse NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-499 # text = Variant de H3 1 Variant variant NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 H3 H3 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-500 # text = H 3t est peu différent de H3 . 1 H heure NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 3t 3t NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 peu peu ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 différent différent ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 H3 H3 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-501 # text = Sa queue N terminale est notamment conservée à l'exception de la mutation A24V. Il apparaît dans les spermatides condensées ( stades 12 - 16 ) où il pourrait remplacer H3 pour faire disparaître la tri-métylation H3K9 ( Govin et al. , 2007 ) . 1 Sa son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 queue queue NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 N N NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 terminale terminale NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 5 est est NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 notamment notamment ADV _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 7 conservée conserver VPP _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 exception exception NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 mutation mutation NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 A24V. A24V. NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 Il Il NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 apparaît apparaître VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 dans dans PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 les le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 spermatides spermatide NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 condensées condensé ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 ( ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 stades stade NOM _ _ 19 parenth _ _ _ _ _ 23 12 12 NUM _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 24 - 12 - 16 PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 16 16 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 26 ) ) PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 27 où où PRQ _ _ 29 periph _ _ _ _ _ 28 il il CLS _ _ 29 subj _ _ _ _ _ 29 pourrait pouvoir VRB _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 30 remplacer remplacer VNF _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 H3 H3 NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 pour pour PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 faire faire VNF _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 disparaître disparaître VNF _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 la le DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 tri-métylation tri-méthylation NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 H3K9 H3K9 NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 ( ( PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 39 Govin Govin NOM _ _ 36 parenth _ _ _ _ _ 40 et et COO _ _ 43 mark _ _ _ _ _ 41 al. al. ADV _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 , , PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 43 2007 2007 NUM _ _ 39 para _ _ _ _ _ 44 ) ) PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 45 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-502 # text = b . Modifications post-traductionnelles 1 b b NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Modifications Modifications NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 post-traductionnelles post-traductionnelles ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-503 # text = Nous allons particulièrement nous intéresser aux modifications qui touchent la chromatine des cellules post-méiotiques . 1 Nous lui PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 allons aller VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 particulièrement particulièrement ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 nous nous CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 5 intéresser intéresser VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 aux à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 modifications modification NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 qui qui PRQ _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 9 touchent toucher VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 chromatine chromatine NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 des de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 cellules cellule NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 post-méiotiques post-méiotiques ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-504 # text = Celles -ci sont potentiellement impliquées dans le phénomène de compaction de la chromatine qui a lieu au cours des phases terminales de la spermiogenèse ( stades 12 à 16 ) qui implique Brdt [ Figure 10 ] . 1 Celles celles NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 -ci -ci ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 sont être VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 4 potentiellement potentiellement ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 impliquées impliquer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 dans dans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 phénomène phénomène NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 compaction compaction NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 chromatine chromatine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 qui qui PRQ _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 15 a avoir VRB _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 lieu lieu NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 au au cours de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 18 cours au cours de DET _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 des au cours de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 phases phase NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 terminales terminal ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 spermiogenèse spermiogenèse NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 ( ( PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 stades stade NOM _ _ 24 parenth _ _ _ _ _ 27 12 12 NUM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 à à PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 16 16 NUM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 ) ) PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 31 qui qui PRQ _ _ 32 subj _ _ _ _ _ 32 implique impliquer VRB _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 33 Brdt Brdt NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 [ ( PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 35 Figure Figure NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 10 10 NUM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 ] ) PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 38 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-505 # text = i . Acétylation 1 i i NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Acétylation Acétylation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-506 # text = Chez plusieurs espèces il se produit au cours de la spermiogenèse une vague d'acétylation qui précède le remplacement des histones ( Govin et al. , 2004 ) . 1 Chez chez PRE _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 plusieurs plusieurs DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 espèces espèce NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 il il CLS _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 5 se se CLI _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 produit produire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 au au cours de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 cours au cours de NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de au cours de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 spermiogenèse spermiogenèse NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 une un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 vague vague NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 14 d' de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 acétylation acétylation NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 qui qui PRQ _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 17 précède précéder VRB _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 le le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 remplacement remplacement NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 des de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 histones histone NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 ( ( PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 Govin Govin NOM _ _ 21 parenth _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 25 al. al. ADV _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 2004 2004 NUM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 28 ) ) PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-507 # text = L'acétylation survient de façon indépendante d'une activité de réplication ou de transcription et semble plutôt être liée au remplacement des histones qui la suit . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 acétylation acétylation NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 survient survenir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 façon façon NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 indépendante indépendant ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 d' de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 une un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 activité activité NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 réplication réplication NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 ou ou COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 7 para _ _ _ _ _ 14 transcription transcription NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 16 semble sembler VRB _ _ 3 para _ _ _ _ _ 17 plutôt plutôt ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 être être VNF _ _ 19 aux _ _ _ _ _ 19 liée lier VPP _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 au à PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 remplacement remplacement NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 des de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 histones histone NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 qui qui PRQ _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 25 la le CLI _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 26 suit suivre VRB _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-508 # text = En effet les histones ne sont pas remplacées dans les espèces chez lesquelles la chromatine ne subit pas d'hyperacétylation ( Kennedy and Davies , 1981 ) . 1 En en effet PRE _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 effet en effet NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 les le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 histones histone NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 5 ne ne ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 6 sont être VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 7 pas pas ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 remplacées remplacer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 dans dans PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 les le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 espèces espèce NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 chez chez PRE _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 13 lesquelles lequel PRQ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 chromatine chromatine NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 16 ne ne ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 subit subir VRB _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 18 pas pas ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 d' de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 20 hyperacétylation hyperacétylation NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 ( ( PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 22 Kennedy Kennedy NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 23 and kennedy and davies NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 24 Davies Davies NOM _ _ 20 parenth _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 1981 1981 NUM _ _ 24 para _ _ _ _ _ 27 ) ) PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-509 # text = Des études in vitro suggèrent que l'acétylation des histones pourrait faciliter leur remplacement par des protamines ( Oliva et al. , 1987 ) . 1 Des un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 études étude NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 in in vitro ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 vitro in vitro ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 suggèrent suggérer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 que que CSU _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 l' le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 acétylation acétylation NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 9 des de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 histones histone NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 pourrait pouvoir VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 12 faciliter faciliter VNF _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 leur son DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 remplacement remplacement NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 par par PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 des un DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 protamines pro- NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 ( ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 Oliva Oliva NOM _ _ 17 parenth _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 21 al. al. ADV _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 1987 1987 NUM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 24 ) ) PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-510 # text = Il a été montré que l'histone H4 est fortement acétylée au cours des stades 9 à 12 chez le rat ( Meistrich et al. , 1992 ) et au cours des stades 9 à 11 chez la souris ( Hazzouri et al. , 2000 ) . 1 Il il CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 a avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 été être VPP _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 que que CSU _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 histone histone NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 8 H4 H4 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 est être VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 fortement fortement ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 acétylée acétyle NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 au à PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 cours cours NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 des de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 stades stade NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 9 9 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 à à PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 12 12 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 chez chez PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 le le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 rat rat NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 ( ( PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 Meistrich Meistrich NOM _ _ 21 parenth _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 25 al. al. ADV _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 1992 1992 NUM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 28 ) ) PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 29 et et COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 30 au à PRE _ _ 12 para _ _ _ _ _ 31 cours cours NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 des de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 stades stade NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 9 9 NUM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 à à PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 11 11 NUM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 chez chez PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 la le DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 souris souris NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 ( ( PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 41 Hazzouri Hazzouri NOM _ _ 36 parenth _ _ _ _ _ 42 et et COO _ _ 45 mark _ _ _ _ _ 43 al. al. ADV _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 45 2000 2000 NUM _ _ 41 para _ _ _ _ _ 46 ) ) PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 47 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-511 # text = Par fractionnement des différents types de spermatides , une étude montre que les histones de coeur sont principalement acétylées sur H4 et H2A et que l'acétylation de H4 touche les lysines K5 , K8 et K12 mais pas 1 Par par PRE _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 fractionnement fractionnement NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 différents différent ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 types type NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 spermatides spermatide NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 9 une un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 étude étude NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 11 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 que que CSU _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 histones histone NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 coeur coeur NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 sont être VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 18 principalement principalement ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 acétylées acétyle NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 sur sur PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 H4 H4 NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 23 H2A H2A NOM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 25 que que CSU _ _ 12 para _ _ _ _ _ 26 l' le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 acétylation acétylation NOM _ _ 30 subj _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 H4 H4 NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 touche toucher VRB _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 31 les le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 lysines lysine NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 K5 K5 NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 , , PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 35 K8 K8 NOM _ _ 33 para _ _ _ _ _ 36 et et COO _ _ 37 mark _ _ _ _ _ 37 K12 K12 NOM _ _ 35 para _ _ _ _ _ 38 mais mais COO _ _ 39 mark _ _ _ _ _ 39 pas pas NOM _ _ 32 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-512 # text = K16 ( Govin et al. , 2006 ) . 1 K16 K16 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 Govin Govin NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 5 al. al. ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 2006 2006 NUM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-513 # text = La dynamique de l'acétylation de H4 a été suivie dans les spermatides grâce à la technique d'immunofluorescence en utilisant un anticorps spécifique de la queue H4 tétra-acétylée : 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 dynamique dynamique NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 acétylation acétylation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 H4 H4 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 a avoir VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 été être VPP _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 suivie suivre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 dans dans PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 spermatides spermatide NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 grâce grâce à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 15 à grâce à PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 technique technique NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 d' de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 immunofluorescence immunofluorescence NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 en en PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 21 utilisant utiliser VPR _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 un un DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 anticorps anticorps NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 spécifique spécifique ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 la le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 queue queue NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 H4 H4 NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 tétra-acétylée tétra-acétyle NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 : : PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-514 # text = Les spermatides rondes ( stades 2 - 6 ) sont peu colorées par l'anticorps . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 spermatides spermatide NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 3 rondes rond ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 stades stade NOM _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 6 2 2 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 7 - 2 - 6 PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 6 6 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 10 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 peu peu ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 colorées coloré ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 par par PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 l' le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 anticorps anticorps NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-515 # text = Dans les spermatides en cours d'élongation ( stade 8 ) , l'acétylation de H4 augmente , elle est distribuée de façon homogène dans l'ensemble du noyau . 1 Dans dans PRE _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 2 les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 spermatides spermatide NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 en en PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 cours cours NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 d' de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 élongation élongation NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 stade stade NOM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 10 8 8 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 13 l' le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 acétylation acétylation NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 H4 H4 NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 augmente augmenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 19 elle elle CLS _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 20 est être VRB _ _ 21 aux _ _ _ _ _ 21 distribuée distribuer VPP _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 façon façon NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 homogène homogène ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 dans dans PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 26 l' le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 ensemble ensemble NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 du de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 noyau noyau NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-516 # text = Au stades 1 Au à PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 stades stade NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-517 # text = 9 - 10 , le signal diminue , sauf dans un domaine central qui s'avère correspondre à la chromatine constitutive péricentrique . 1 9 9 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 - 9 - 10 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 10 10 NUM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 signal signal NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 7 diminue diminuer VRB _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 9 sauf sauf PRE _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 un un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 domaine domaine NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 central central NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 qui qui PRQ _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 15 s' s' CLI _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 avère avérer VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 17 correspondre correspondre VNF _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 à à PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 chromatine chromatine NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 constitutive constitutif ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 péricentrique péricentrique ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-518 # text = Au stade 1 Au à PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 stade stade NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-519 # text = 11 , l'acétylation de H4 a complètement disparu ( Govin et al. , 2007 ) . 1 11 11 NUM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 l' le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 acétylation acétylation NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 H4 H4 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 a avoir VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 8 complètement complètement ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 disparu disparaître VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 ( ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 Govin Govin NOM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 13 al. al. ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 2007 2007 NUM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 16 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-520 # text = ii . 1 ii if NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-521 # text = Autres modifications post-trascriptionnelles potentiellement impliquées 1 Autres autre ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 modifications modification NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 post-trascriptionnelles post-trascriptionnelles ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 potentiellement potentiellement ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 impliquées impliquer ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-522 # text = Des formes ubiquitinées des histone H2A , H2A.Z , H2B , H3 , TH3 sont détectées chez le rat dans les spermatides allongées ( Baarends et al. , 1999 ; Chen et al. , 1998 ) . 1 Des de PRE _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 2 formes forme NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 ubiquitinées ubiquité N+V _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 histone histone NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 H2A H2A NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 8 H2A.Z H2A.Z NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 H2B H2B NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 12 H3 H3 NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 TH3 TH3 NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 15 sont être VRB _ _ 16 aux _ _ _ _ _ 16 détectées détecter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 chez chez PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 le le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 rat rat NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 dans dans PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 21 les le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 spermatides spermatide NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 allongées allongé ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 ( ( PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 25 Baarends Baarends NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 29 mark _ _ _ _ _ 27 al. al. ADV _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 29 1999 1999 NUM _ _ 25 para _ _ _ _ _ 30 ; ; PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 31 Chen Chen NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 33 mark _ _ _ _ _ 33 al. al. NOM _ _ 31 para _ _ _ _ _ 34 , , PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 35 1998 1998 NUM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 36 ) ) PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-523 # text = Cette ubiquitination pourrait être impliquée dans le phénomène de dégradation des histones observé à la fin de la spermiogenèse . 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 ubiquitination ubiquitination NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 être être VNF _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 impliquée impliquer VPP _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 dans dans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 phénomène phénomène NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 dégradation dégradation NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 des de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 histones histone NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 observé observer VPP _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 14 à à PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 fin fin NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 spermiogenèse spermiogenèse NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-524 # text = Une autre voie de dégradation , associée à l'acétylation des histones est également étudiée . 1 Une un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 autre autre ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 voie voie NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 dégradation dégradation NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 associée associer VPP _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 acétylation acétylation NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 des de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 histones histone NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 est est NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 également également ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 étudiée étudier ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-525 # text = La phosphorylation de la sérine 1 de H4 , a été identifiée dans les gamètes mâles en voie différenciation chez la levure , la drosophile et la souris . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 phosphorylation phosphorylation NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 sérine sérine NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 1 1 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 H4 H4 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 10 a avoir VRB _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 été être VPP _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 12 identifiée identifier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 dans dans PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 les le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 gamètes gamète NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 mâles mâle ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 en en PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 18 voie voie NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 différenciation différenciation NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 chez chez PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 21 la le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 levure levure NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 drosophile drosophile NOM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 27 la le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 souris souris NOM _ _ 25 para _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-526 # text = Sa présence est détectée chez la souris pendant les phases post-méiotiques et disparaît au début de l'allongement des spermatides à un stade qui correspond à l'hyper-acétylation des histones ( Thèse J. Govin , 2006 ) . 1 Sa son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 présence présence NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 détectée détecter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 chez chez PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 souris souris NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 pendant pendant PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 phases phase NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 post-méiotiques post-méiotiques ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 disparaît disparaître VRB _ _ 4 para _ _ _ _ _ 14 au à PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 début début NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 l' le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 allongement allongement NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 des de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 spermatides spermatide NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 à à PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 un un DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 stade stade NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 qui qui PRQ _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 25 correspond correspondre VRB _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 à à PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 l' le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 hyper-acétylation hyper- NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 des de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 histones histone NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 ( ( PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 32 Thèse Thèse NOM _ _ 30 parenth _ _ _ _ _ 33 J. J. NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 Govin Govin NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 36 2006 2006 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 37 ) ) PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 38 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-527 # text = Chez la levure , en l'absence de cette modification , la compaction de la chromatine est réduite et le volume du noyau est augmenté ( Krishnamoorthy et al. , 2006 ) . 1 Chez chez PRE _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 2 la le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 levure levure NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 en en PRE _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 absence absence NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 cette ce DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 modification modification NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 compaction compaction NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 chromatine chromatine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 est être VRB _ _ 18 aux _ _ _ _ _ 18 réduite réduire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 20 le le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 volume volume NOM _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 22 du de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 noyau noyau NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 est être VRB _ _ 25 aux _ _ _ _ _ 25 augmenté augmenter VPP _ _ 18 para _ _ _ _ _ 26 ( ( PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 Krishnamoorthy Krishnamoorthy NOM _ _ 25 parenth _ _ _ _ _ 28 et et COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 29 al. al. ADV _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 31 2006 2006 NUM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 32 ) ) PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-528 # text = Ainsi , la modification H4S1P semble être impliquée dans la compaction de la chromatine qui a lieu au cours de la spermatogenèse . 1 Ainsi ainsi ADV _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 modification modification NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 5 H4S1P H4S1P NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 semble sembler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 être être VNF _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 impliquée impliquer VPP _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 dans dans PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 compaction compaction NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 chromatine chromatine NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 qui qui PRQ _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 16 a avoir VRB _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 lieu lieu NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 au au cours de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 19 cours au cours de NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 de au cours de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 la le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 spermatogenèse spermatogenèse NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-529 # text = Aucune explication directe n'a été publiée à ce jour sur la façon dont cette modification intervient . 1 Aucune aucun DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 explication explication NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 directe direct ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 n' ne ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 5 a avoir VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 été être VPP _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 publiée publier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ce ce DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 jour jour NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 sur sur PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 façon façon NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 dont dont PRQ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 15 cette ce DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 modification modification NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 17 intervient intervenir VRB _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-530 # text = Cependant H4S1P inhibe in vitro l'activité histone acétyl-transférase des enzymes EsaI et NuA 4 1 Cependant cependant ADV _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 H4S1P H4S1P NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 inhibe inhiber VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 in in vitro ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 vitro in vitro ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 activité activité NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 histone histone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 acétyl-transférase acétyle-transférase NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 enzymes enzyme NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 EsaI EsaI NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 NuA NuA NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 15 4 4 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-531 # text = ( Utley et al. , 2005 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Utley Utley NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2005 2005 NUM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-532 # text = Ce qui laisse supposer que cette phosphorylation régule l'acétylation de H4 dans les spermatides . 1 Ce ce PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 qui qui PRQ _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 laisse laisser VRB _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 supposer supposer VNF _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 que que CSU _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 cette ce DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 phosphorylation phosphorylation NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 régule réguler VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 acétylation acétylation NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 H4 H4 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 dans dans PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 14 les le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 spermatides spermatide NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-533 # text = D . La protéine Brdt 1 D d NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 La La NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 protéine protéiner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 Brdt Brdt NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-534 # text = I. Fonctions 1 I. I. NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 Fonctions Fonctions NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-535 # text = Brdt est une protéine spécifiquement exprimée dans les testicules ( Shang et al. , 2004 ) et dans les ovocytes ( Paillisson et al. , 2007 ) . 1 Brdt Brdt NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 une un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 protéine protéine NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 spécifiquement spécifiquement ADV _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 6 exprimée exprimer VPP _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 dans dans PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 testicules testicule NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 ( ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 Shang Shang NOM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 13 al. al. ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 2004 2004 NUM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 16 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 18 dans dans PRE _ _ 7 para _ _ _ _ _ 19 les le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 ovocytes ovocyte NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 ( ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 Paillisson Paillisson NOM _ _ 20 parenth _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 24 al. al. ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 2007 2007 NUM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 27 ) ) PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-536 # text = Dans les cellules germinales mâles , son ARN messager est détecté dans les spermatocytes et dans les spermatides allongées ( Govin et al. , 2006 ) . 1 Dans dans PRE _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 cellules cellule NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 germinales germinal ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 mâles mâle ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 7 son son DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 8 ARN ARN NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 messager messager NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 10 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 détecté détecter ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 dans dans PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 spermatocytes spermatocyte NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 16 dans dans PRE _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 17 les le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 spermatides spermatide NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 allongées allonger VPP _ _ 11 para _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 Govin Govin NOM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 23 al. al. ADV _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 2006 2006 NUM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 26 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-537 # text = La protéine appartient à la famille des protéines BET . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 protéine protéine NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 appartient appartenir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 famille famille NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 des de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 protéines protéine NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 BET BET NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-538 # text = Ces protéines comportent toutes dans leurs parties N terminales deux bromodomaines séparés par une région de liaison ( longue de 100 résidus environ dans le cas de Brdt ) . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 protéines protéine NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 comportent comporter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 toutes tout PRQ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 dans dans PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 leurs son DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 parties partie NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 N N NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 terminales terminal ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 deux deux NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 bromodomaines brome NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 12 séparés séparer VPP _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 par par PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 une un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 région région NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 liaison liaison NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ( ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 longue longue NOM _ _ 15 parenth _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 100 100 NUM _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 résidus résidu NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 environ environ ADV _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 dans dans PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 25 le le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 cas cas NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 Brdt Brdt NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 ) ) PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-539 # text = Son expression dans les spermatides au moment de la compaction de la chromatine et la présence de deux bromodomaines dans sa séquence primaire ont incité l'équipe de S. Kochbin à étudier la fonction de cette protéine encore inconnue . 1 Son son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 expression expression NOM _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 3 dans dans PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 spermatides spermatide NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 au au moment de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 moment au moment de NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de au moment de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 compaction compaction NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 chromatine chromatine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 présence présence NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 deux deux NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 bromodomaines brome NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 dans dans PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 21 sa son DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 séquence séquence NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 primaire primaire ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 ont avoir VRB _ _ 25 aux _ _ _ _ _ 25 incité inciter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 l' le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 équipe équipe NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 S. S. NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 Kochbin Kochbin NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 à à PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 32 étudier étudier VNF _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 la le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 fonction fonction NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 de de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 cette ce DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 protéine protéine NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 encore encore ADV _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 39 inconnue inconnu ADJ _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 . . PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-540 # text = L'équipe a montré par immunofluorescence que la partie N terminale de la protéine contenant les deux bromodomaines et leurs régions adjacentes ( ? C-Brdt , résidus 1 à 440 ) est capable d'induire la compaction de la chromatine acétylée lorsqu'elle est surexprimée dans des cellules somatiques . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 équipe équipe NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 a avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 par par PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 immunofluorescence immunofluorescence NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 que que? PRQ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 partie partie NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 N N NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 terminale terminal ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 protéine protéine NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 contenant contenir VPR _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 17 deux deux NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 bromodomaines oromo NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 20 leurs son DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 régions région NOM _ _ 18 para _ _ _ _ _ 22 adjacentes adjacent ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 24 ? ? PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 25 C-Brdt C-Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 27 résidus résidu NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 1 1 NUM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 à à PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 440 440 NUM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 ) ) PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 32 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 33 capable capable ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 d' de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 induire induire VNF _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 la le DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 compaction compaction NOM _ _ 32 subj _ _ _ _ _ 38 de de PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 la le DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 chromatine chromatine NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 acétylée acétyle NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 lorsqu' lorsque CSU _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 43 elle elle CLS _ _ 45 subj _ _ _ _ _ 44 est être VRB _ _ 45 aux _ _ _ _ _ 45 surexprimée sur- VPP _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 46 dans dans PRE _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 des un DET _ _ 48 spe _ _ _ _ _ 48 cellules cellule NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 49 somatiques somatique ADJ _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 . . PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-541 # text = Cette capacité est conservée lorsque des noyaux purifiés sont incubés avec la protéine . 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 capacité capacité NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 conservée conserver VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 lorsque lorsque CSU _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 des un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 noyaux noyau NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 8 purifiés purifier ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 sont être VRB _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 incubés incuber VPP _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 11 avec avec PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 protéine protéine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-542 # text = La compaction induite est dépendante de l'acétylation de la chromatine et de l'intégrité des deux bromodomaines ( avec une abolition de la compaction plus drastique pour les mutants dont BD1 a été inactivé ) et de leurs régions adjacentes ( résidus 1 - 13 et 392 - 443 ) mais indépendante de la présence d'ATP . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 compaction compaction NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 induite induire ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 dépendante dépendant ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 l' le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 acétylation acétylation NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 chromatine chromatine NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 9 para _ _ _ _ _ 14 l' le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 intégrité intégrité NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 des de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 deux deux NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 bromodomaines brome NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 avec avec PRE _ _ 15 parenth _ _ _ _ _ 21 une un DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 abolition abolition NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 compaction compaction NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 plus plus ADV _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 27 drastique drastique ADJ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 pour pour PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 29 les le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 mutants mutant NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 dont dont PRQ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 32 BD1 BD1 NOM _ _ 35 subj _ _ _ _ _ 33 a avoir VRB _ _ 34 aux _ _ _ _ _ 34 été être VPP _ _ 35 aux _ _ _ _ _ 35 inactivé inactiver VPP _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 36 ) ) PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 37 et et COO _ _ 38 mark _ _ _ _ _ 38 de de PRE _ _ 6 para _ _ _ _ _ 39 leurs son DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 régions région NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 adjacentes adjacent ADJ _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 ( ( PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 43 résidus résidu NOM _ _ 40 parenth _ _ _ _ _ 44 1 1 NUM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 - 1 - 13 PUNC _ _ 44 punc _ _ _ _ _ 46 13 13 NUM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 47 et et COO _ _ 48 mark _ _ _ _ _ 48 392 392 NUM _ _ 43 para _ _ _ _ _ 49 - 392 - 443 PUNC _ _ 48 punc _ _ _ _ _ 50 443 443 NUM _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 51 ) ) PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 52 mais mais COO _ _ 53 mark _ _ _ _ _ 53 indépendante indépendant NOM _ _ 40 para _ _ _ _ _ 54 de de PRE _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 55 la le DET _ _ 56 spe _ _ _ _ _ 56 présence présence NOM _ _ 54 dep _ _ _ _ _ 57 d' de PRE _ _ 56 dep _ _ _ _ _ 58 ATP ATP NOM _ _ 57 dep _ _ _ _ _ 59 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-543 # text = Enfin , cette étude montre par co-purification que la partie N terminale de la protéine ( ? C- Brdt ) se lie à la queue tétra-acétylée de l'histone H4 et que l'inactivation de l'un ou l'autre des bromodomaines est suffisant pour abolir cette interaction 1 Enfin enfin ADV _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 cette ce DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 étude étude NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 5 montre montrer VRB _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 6 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 co-purification co- NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 que que? PRQ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 partie partie NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 N N NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 terminale terminal ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 protéine protéine NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 17 ? ? PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 18 C- C- NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 Brdt Brdt NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 ) ) PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 21 se se CLI _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 lie lier VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 à à PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 queue queue NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 tétra-acétylée tétra-acétyle NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 l' le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 histone histone NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 H4 H4 NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 et et COO _ _ 43 mark _ _ _ _ _ 32 que que PRQ _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 33 l' le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 inactivation inactivation NOM _ _ 43 subj _ _ _ _ _ 35 de de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 l' le DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 un un PRQ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 ou ou COO _ _ 40 mark _ _ _ _ _ 39 l' l'autre DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 autre l'autre PRQ _ _ 37 para _ _ _ _ _ 41 des de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 42 bromodomaines bromé NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 est être VRB _ _ 27 para _ _ _ _ _ 44 suffisant suffisant ADJ _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 pour pour PRE _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 abolir abolir VNF _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 cette ce DET _ _ 48 spe _ _ _ _ _ 48 interaction interaction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-544 # text = ( Pivot-Pajot et al. , 2003 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Pivot-Pajot Pivot-Pajot NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2003 2003 NUM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-545 # text = Des études complémentaires par immunofluorescence montrent que la présence de Brdt et de l'hyperacétylation de H4 suivent parfaitement la même évolution spatio-temporelle . 1 Des un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 études étude NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 complémentaires complémentaire ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 par par PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 immunofluorescence immunofluorescence NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 montrent montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 que que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 présence présence NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 Brdt Brdt NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 13 de de+le PRE _ _ 9 para _ _ _ _ _ 14 l' de+le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 hyperacétylation hyperacétylation NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 H4 H4 NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 suivent suivre VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 19 parfaitement parfaitement ADV _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 21 même même ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 22 évolution évolution NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 23 spatio-temporelle spatio-temporel ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-546 # text = Le signal lumineux correspondant à 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 signal signal NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 lumineux lumineux ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 correspondant correspondant ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-547 # text = Brdt est faible dans les spermatides rondes , il est très intense dans les spermatides en début d'allongement puis diminue mais persiste plus longement dans les régions péricentriques où subsiste également l'acétylation . 1 Brdt Brdt NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 faible faible ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 dans dans PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 spermatides spermatide NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 rondes ronde NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 9 il il CLS _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 10 est être VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 11 très très ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 intense intense ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 dans dans PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 les le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 spermatides spermatide NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 en en début de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 17 début en début de NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 d' en début de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 allongement allongement NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 puis puis COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 diminue diminuer VRB _ _ 10 para _ _ _ _ _ 22 mais mais COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 23 persiste persister VRB _ _ 21 para _ _ _ _ _ 24 plus plus ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 longement longuement ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 dans dans PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 27 les le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 régions région NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 péricentriques péricentriques ADJ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 où où PRQ _ _ 31 periph _ _ _ _ _ 31 subsiste subsister VRB _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 32 également également ADV _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 l' le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 acétylation acétylation NOM _ _ 31 subj _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-548 # text = L'évolution de l'acétylation de H4 , détaillée dans le paragraphe précédent , est parfaitement similaire ( Govin et al. , 2007 ; Govin et al. , 2006 ) . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 évolution évolution NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 acétylation acétylation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 H4 H4 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 9 détaillée détailler VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 paragraphe paragraphe NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 précédent précédent ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 15 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 parfaitement parfaitement ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 similaire similaire ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 19 Govin Govin NOM _ _ 23 periph _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 al. al. NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 23 2007 2007 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 ; ; PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 25 Govin Govin NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 27 al. al. NOM _ _ 25 para _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 29 2006 2006 NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 30 ) ) PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-549 # text = Brdt est également capable d'induire le relargage de l'histone de liaison 1 Brdt Brdt NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 également également ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 capable capable ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 d' de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 induire induire VNF _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 relargage relargage NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 histone histone NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 liaison liaison NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-550 # text = H1 ( Govin et al. , 2006 ) connue pour empêcher la formation de structures compactes de la chromatines ( Khochbin , 2001 ) . 1 H1 H1 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 Govin Govin NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 5 al. al. ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 2006 2006 NUM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 9 connue connaître VPP _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 pour pour PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 empêcher empêcher VNF _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 formation formation NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 structures structure NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 compactes compact ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 de de+le PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 18 la de+le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 chromatines chromatine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 Khochbin Khochbin NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 2001 2001 NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-551 # text = On peut noter que ce relargage pourrait aussi être facilité par l'acétylation des histones 1 On on CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 peut pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 noter noter VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 que que CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ce ce DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 relargage relargage NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 7 pourrait pouvoir VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 aussi aussi ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 être être VNF _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 facilité faciliter VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 par par PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 l' le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 acétylation acétylation NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 des de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 histones histone NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-552 # text = ( Misteli et al. , 2000 ; Perry and Annunziato , 1989 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Misteli Misteli NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2000 2000 NUM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 ; ; PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 8 Perry Perry NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 9 and perry and annunziato NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 Annunziato Annunziato NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 1989 1989 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-553 # text = Cette observation laisse envisager que Brdt soit impliqué dans l'incorporation du variant 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 observation observation NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 laisse laisser VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 envisager envisager VNF _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 que que CSU _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 Brdt Brdt NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 7 soit être VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 impliqué impliquer VPP _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 dans dans PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 incorporation incorporation NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 du de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 variant variant NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-554 # text = HILS1 de l'histone H1 . 1 HILS1 HILS1 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 l' le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 histone histone NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 H1 H1 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-555 # text = Ce variant est spécifiquement exprimé dans les spermatides en condensation . 1 Ce ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 variant variant NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 4 spécifiquement spécifiquement ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 exprimé exprimer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 dans dans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 spermatides spermatide NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 en en PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 condensation condensation NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-556 # text = Enfin , Brdt co-localise avec les régions péricentriques de la chromatine . 1 Enfin enfin ADV _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Brdt Brdt NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 co-localise co- VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 avec avec PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 régions région NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 péricentriques péricentriques ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 chromatine chromatine NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-557 # text = Dans ces régions les histones ne sont pas remplacées par les protéines de transition et l'hyperacétylation de H4 persiste jusqu'à des stades tardifs de la spermiogenèse . 1 Dans dans PRE _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 ces ce DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 régions région NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 histones histone NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 6 ne ne ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 7 sont être VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 8 pas pas ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 remplacées remplacer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 par par PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 protéines protéine NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 transition transition NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 16 l' le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 hyperacétylation hyperacétylation NOM _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 H4 H4 NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 persiste persister VRB _ _ 9 para _ _ _ _ _ 21 jusqu'à jusqu'à PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 des un DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 stades stade NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 tardifs tardif ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 la le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 spermiogenèse spermiogenèse NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-558 # text = Brdt pourrait être impliqué dans la protection de l'acétylation ainsi que dans la conservation des histones dans ces régions ( Govin et al. , 2007 ) . 1 Brdt Brdt NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 être être VNF _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 impliqué impliquer VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 dans dans PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 protection protection NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 acétylation acétylation NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 ainsi ainsi que COO _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 que ainsi que COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 dans dans PRE _ _ 5 para _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 conservation conservation NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 des de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 histones histone NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 dans dans PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 19 ces ce DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 régions région NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 ( ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 Govin Govin NOM _ _ 20 parenth _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 24 al. al. ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 2007 2007 NUM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 27 ) ) PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-559 # text = L'importance fonctionnelle de Brdt et de son premier bromodomaine en particulier pour le bon déroulement de la spermiogenèse a été mise en évidence par plusieurs études différentes : 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 importance importance NOM _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 3 fonctionnelle fonctionnel ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 Brdt Brdt NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 4 para _ _ _ _ _ 8 son son DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 9 premier premier ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 bromodomaine brome NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 en en particulier PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 12 particulier en particulier NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 pour pour PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 le le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 15 bon bon ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 déroulement déroulement NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 spermiogenèse spermiogenèse NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 a avoir VRB _ _ 21 aux _ _ _ _ _ 21 été être VPP _ _ 22 aux _ _ _ _ _ 22 mise mettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 en en PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 évidence évidence NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 par par PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 26 plusieurs plusieurs DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 études étude NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 différentes différent ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 : : PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-560 # text = i . L'inactivation de BD1 a un effet plus prononcé sur la compaction de la chromatine que celle de BD2 ( Pivot-Pajot et al. , 2003 ) . 1 i i NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 L' L' DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 inactivation inactivation NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 BD1 BD1 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 un un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 effet effet NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 plus plus ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 prononcé prononcer VPP _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 sur sur PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 compaction compaction NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 chromatine chromatine NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 que que CSU _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 19 celle celui PRQ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 BD2 BD2 NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 ( ( PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 Pivot-Pajot Pivot-Pajot NOM _ _ 21 parenth _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 25 al. al. ADV _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 2003 2003 NUM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 28 ) ) PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-561 # text = ii . 1 ii if NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-562 # text = Chez l'homme , un polymorphisme de séquence qui entraîne une mutation dans le premier bromodomaine de Brdt ( mutation K62Q de BD1 ) a été identifié à l'état homozygote uniquement chez des individus infertiles . 1 Chez chez PRE _ _ 27 periph _ _ _ _ _ 2 l' le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 homme homme NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 un un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 polymorphisme polymorphisme NOM _ _ 27 subj _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 séquence séquence NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 qui qui PRQ _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 10 entraîne entraîner VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 une un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 mutation mutation NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 dans dans PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 le le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 15 premier premier ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 bromodomaine brome NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 Brdt Brdt NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 mutation mutation NOM _ _ 18 parenth _ _ _ _ _ 21 K62Q K62Q NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 BD1 BD1 NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 ) ) PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 25 a avoir VRB _ _ 26 aux _ _ _ _ _ 26 été être VPP _ _ 27 aux _ _ _ _ _ 27 identifié identifier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 28 à à PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 l' le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 état état NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 homozygote homo- NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 uniquement uniquement ADV _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 chez chez PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 34 des un DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 individus individu NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 infertiles infertile ADJ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-563 # text = Cette mutation affecte la stabilité de l'association de Brdt et de la chromatine acétylée ( Rousseau et al. , article soumis ) . 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 mutation mutation NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 affecte affecter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 stabilité stabilité NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 l' le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 association association NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 Brdt Brdt NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 9 para _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 chromatine chromatine NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 acétylée acétyle NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 Rousseau Rousseau NOM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 18 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 19 al. al. NOM _ _ 17 para _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 article article NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 soumis soumettre ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-564 # text = iii . 1 iii ici ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-565 # text = L'inactivation du premier bromodomaine de Brdt chez la souris provoque une stérilité chez les individus touchés et la production de spermatides de morphologie anormale à partir du stade 9 de la spermiogenèse . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 inactivation inactivation NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 premier premier ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 bromodomaine brome NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 Brdt Brdt NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 chez chez PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 souris souris NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 provoque provoquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 une un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 stérilité stérilité NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 chez chez PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 les le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 individus individu NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 touchés toucher ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 production production NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 spermatides spermatide NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 morphologie morphologie NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 anormale anormal ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 à à partir de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 27 partir à partir de DET _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 du à partir de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 stade stade NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 9 9 NUM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 de de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 la le DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 spermiogenèse spermiogenèse NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-566 # text = La mutation provoque également une augmentation de la quantité du variant H 1t dans les spermatides ( Shang et al. , 2007 ) . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 mutation mutation NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 provoque provoquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 également également ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 une un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 augmentation augmentation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 quantité quantité NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 du de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 variant variant NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 H H NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 1t 1t NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 dans dans PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 15 les le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 spermatides spermatide NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 ( ( PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 Shang Shang NOM _ _ 16 parenth _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 20 al. al. ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 2007 2007 NUM _ _ 18 para _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-567 # text = II . Brdt appartient à la famille des protéines BET 1 II ii NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Brdt Brdt NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 appartient appartenir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 famille famille NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 protéines protéine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 BET BET NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-568 # text = a . Structure primaire 1 a a NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Structure Structure VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 primaire primaire ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-569 # text = La famille des protéines BET ( Bromodomain and Extra-Terminal ) comprend Brdt , Brd 2 , Brd 3 et Brd 4 chez les mammifères , la protéine Fsh identifiée chez la drosophile , et les protéines Bdf 1 et Bdf 2 chez la levure . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 famille famille NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 protéines protéine NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BET BET NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 Bromodomain Bromodomain NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 8 and bromodomain and extra-terminal NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 Extra-Terminal Extra-Terminal NOM _ _ 4 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 comprend comprendre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 Brdt Brdt NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 14 Brd Brd NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 2 2 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 17 Brd Brd NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 18 3 3 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 20 Brd Brd NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 21 4 4 NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 chez chez PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 23 les le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 mammifères mammifère NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 26 la le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 protéine protéine NOM _ _ 24 para _ _ _ _ _ 28 Fsh Fsh NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 identifiée identifier VPP _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 chez chez PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 la le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 drosophile drosophile NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 34 et et COO _ _ 36 mark _ _ _ _ _ 35 les le DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 protéines protéine NOM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 37 Bdf Bdf NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 1 1 NUM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 et et COO _ _ 40 mark _ _ _ _ _ 40 Bdf Bdf NOM _ _ 36 para _ _ _ _ _ 41 2 2 NUM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 chez chez PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 43 la le DET _ _ 44 spe _ _ _ _ _ 44 levure levure NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 45 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-570 # text = Contrairement à Brdt qui est exprimé spécifiquement dans les testicules et les ovaires , Brd 2 , Brd 3 et Brd 4 sont exprimés de façon ubiquitaire ( Shang et al. , 2004 ) . 1 Contrairement contrairement ADV _ _ 24 periph _ _ _ _ _ 2 à à PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 Brdt Brdt NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 qui qui PRQ _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 5 est être VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 exprimé exprimer VPP _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 spécifiquement spécifiquement ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 dans dans PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 testicules testicule NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 12 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 ovaires ovaire NOM _ _ 10 para _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 15 Brd Brd NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 2 2 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 18 Brd Brd NOM _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 19 3 3 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 Brd Brd NOM _ _ 18 para _ _ _ _ _ 22 4 4 NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 sont être VRB _ _ 24 aux _ _ _ _ _ 24 exprimés exprimer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 façon façon NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 ubiquitaire ubiquitaire ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 ( ( PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 29 Shang Shang NOM _ _ 26 parenth _ _ _ _ _ 30 et et COO _ _ 33 mark _ _ _ _ _ 31 al. al. ADV _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 , , PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 33 2004 2004 NUM _ _ 29 para _ _ _ _ _ 34 ) ) PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-571 # text = Brdt est l'homologue le plus éloigné ( environ 47 % d'identité de séquence avec ses paralogues Brd 2 , Brd 3 et Brd 4 ) . 1 Brdt Brdt NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 l' le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 homologue homologue NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 le le plus DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 plus le plus ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 éloigné éloigner ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 9 environ environ ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 10 47 47 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 % pourcent NOM _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 12 d' de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 identité identité NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 séquence séquence NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 avec avec PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 ses son DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 paralogues paralogue NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 Brd Brd NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 2 2 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 Brd Brd NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 23 3 3 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 25 Brd Brd NOM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 26 4 4 NUM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-572 # text = Brd 2 et Brd 3 sont les plus proches ( environ 60 % d ''identité de séquence ) 1 Brd Brd NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 2 2 2 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 4 Brd Brd NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 5 3 3 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 8 plus plus ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 proches proche ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 environ environ ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 12 60 60 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 % pourcent NOM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 14 d de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 '' '' PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 identité identité NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 séquence séquence NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-573 # text = ( Paillisson   et   al. ,   2007 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 2 Paillisson Paillisson NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3     ADJ _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5     NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 6 al. al. ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 8     2007 DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 2007 2007 NUM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-574 # text = Les protéines BET présentent sept domaines conservés : 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 protéines protéine NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 BET BET NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 présentent présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 sept sept NUM _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 domaines domaine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 conservés conserver ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 : : PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-575 # text = deux bromodomaines ( BD1 et BD2 ) -   séparés par une région dont la longueur varie de 120 résidus pour Brdt à 170 résidus pour Brd 4   - , un domaine 1 deux deux NUM _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 bromodomaines oromo NOM _ _ 33 periph _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 BD1 BD1 NOM _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 6 BD2 BD2 NOM _ _ 4 para _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 - - PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 9     ADV _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 séparés séparer ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 11 par par PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 une un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 région région NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 dont dont PRQ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 longueur longueur NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 17 varie varier VRB _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 120 120 NUM _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 résidus résidu NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 pour pour PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 22 Brdt Brdt NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 à à PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 24 170 170 NUM _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 résidus résidu NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 pour pour PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 27 Brd Brd NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 4 4 NUM _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29   4   ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 - - PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 31 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 32 un un DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 domaine domaine NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-576 # text = ET ( extra-terminal ) , un motif A situé entre BD1 et BD2 , un motif B situé après BD2 , un domaine SEED riche en résidus sérine , aspartate et glutamate , enfin un domaine CTM à l'extrémité C terminale présent chez Brd 4 , Brdt et Fsh ( Florence et Faller , 2001 ; Paillisson et al. , 2007 ; Wu et Chiang , 2007 ) [ Figure 12 et alignements des séquences de ces domaines en annexe 3 ] . 1 ET ET NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 extra-terminal extra- NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 71 punc _ _ _ _ _ 6 un un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 motif motif NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 A A NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 situé situer VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 entre entre PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 BD1 BD1 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 BD2 BD2 NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 71 punc _ _ _ _ _ 15 un un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 motif motif NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 17 B B NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 situé situer VPP _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 après après PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 BD2 BD2 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 71 punc _ _ _ _ _ 22 un un DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 domaine domaine NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 24 SEED SEED NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 riche riche ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 en en PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 résidus résidu NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 sérine sérine NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 30 aspartate aspartame NOM _ _ 28 para _ _ _ _ _ 31 et et COO _ _ 32 mark _ _ _ _ _ 32 glutamate glutamate NOM _ _ 30 para _ _ _ _ _ 33 , , PUNC _ _ 71 punc _ _ _ _ _ 34 enfin enfin ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 35 un un DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 domaine domaine NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 37 CTM CTM NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 à à PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 l' le DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 extrémité extrémité NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 C C NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 terminale terminal ADJ _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 43 présent présent ADJ _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 44 chez chez PRE _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 45 Brd Brd NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 4 4 NUM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 , , PUNC _ _ 71 punc _ _ _ _ _ 48 Brdt Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 49 et et COO _ _ 50 mark _ _ _ _ _ 50 Fsh Fsh NOM _ _ 48 para _ _ _ _ _ 51 ( ( PUNC _ _ 50 punc _ _ _ _ _ 52 Florence Florence NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 53 et et COO _ _ 54 mark _ _ _ _ _ 54 Faller Faller NOM _ _ 52 para _ _ _ _ _ 55 , , PUNC _ _ 71 punc _ _ _ _ _ 56 2001 2001 NUM _ _ 54 dep _ _ _ _ _ 57 ; ; PUNC _ _ 71 punc _ _ _ _ _ 58 Paillisson Paillisson NOM _ _ 62 periph _ _ _ _ _ 59 et et COO _ _ 60 mark _ _ _ _ _ 60 al. al. NOM _ _ 58 para _ _ _ _ _ 61 , , PUNC _ _ 58 punc _ _ _ _ _ 62 2007 2007 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 63 ; ; PUNC _ _ 71 punc _ _ _ _ _ 64 Wu Wu NOM _ _ 62 dep _ _ _ _ _ 65 et et COO _ _ 66 mark _ _ _ _ _ 66 Chiang Chiang NOM _ _ 64 para _ _ _ _ _ 67 , , PUNC _ _ 71 punc _ _ _ _ _ 68 2007 2007 NUM _ _ 62 dep _ _ _ _ _ 69 ) ) PUNC _ _ 68 punc _ _ _ _ _ 70 [ ( PUNC _ _ 71 punc _ _ _ _ _ 71 Figure Figure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 72 12 12 NUM _ _ 71 dep _ _ _ _ _ 73 et et COO _ _ 74 mark _ _ _ _ _ 74 alignements alignement NOM _ _ 71 para _ _ _ _ _ 75 des de PRE _ _ 74 dep _ _ _ _ _ 76 séquences séquence NOM _ _ 75 dep _ _ _ _ _ 77 de de PRE _ _ 76 dep _ _ _ _ _ 78 ces ce DET _ _ 79 spe _ _ _ _ _ 79 domaines domaine NOM _ _ 77 dep _ _ _ _ _ 80 en en PRE _ _ 79 dep _ _ _ _ _ 81 annexe annexe NOM _ _ 80 dep _ _ _ _ _ 82 3 3 NUM _ _ 81 dep _ _ _ _ _ 83 ] ) PUNC _ _ 82 punc _ _ _ _ _ 84 . . PUNC _ _ 71 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-577 # text = Les bromodomaines paralogues sont très conservés ( 71 à 88 % d'identité de séquence ) , alors que les bromodomaines d'une même protéine ont seulement environ 44 % d'identité . 1 Les les bromodomaines paralogues DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 bromodomaines les bromodomaines paralogues NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 paralogues les bromodomaines paralogues NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 4 sont être VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 5 très très ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 conservés conserver VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 71 71 NUM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 9 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 88 88 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 % pourcent NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 d' de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 identité identité NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 séquence séquence NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 18 alors alors que CSU _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 que alors que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 20 les le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 bromodomaines oromo NOM _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 22 d' de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 une un DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 24 même même ADJ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 protéine protéine NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 26 ont avoir VRB _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 27 seulement seulement ADV _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 environ environ ADV _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 29 44 44 NUM _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 % pourcent NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 31 d' de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 identité identité NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-578 # text = Le domaine ET est le plus conservé avec 80 à 89 % d'identité ( Paillisson et al. , 2007 ) . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 domaine domaine NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 ET ET NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 est être VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 5 le le plus DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 plus le plus ADV _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 7 conservé conserver VPP _ _ 12 det _ _ _ _ _ 8 avec avec PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 80 80 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 10 à à PRE _ _ 8 para _ _ _ _ _ 11 89 89 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 % pourcent NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 d' de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 identité identité NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 ( ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 Paillisson Paillisson NOM _ _ 12 parenth _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 18 al. al. ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 2007 2007 NUM _ _ 16 para _ _ _ _ _ 21 ) ) PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-579 # text = Nous allons voir que les domaines ET , SEED et CTM assurent des interactions avec d'autres protéines . 1 Nous nous CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 allons aller VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 voir voir VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 que que CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 domaines domaine NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 7 ET ET NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 SEED SEED NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 CTM CTM NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 12 assurent assurer VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 13 des un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 interactions interaction NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 avec avec PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 d' un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 17 autres autre ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 protéines protéine NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-580 # text = b . Aperçu des fonctions des protéines de la famille BET 1 b b NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Aperçu Aperçu VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 fonctions fonction NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 protéines protéine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 famille famille NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 BET BET NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-581 # text = Contrairement à Brdt , Brd 2 et Brd 4 sont des gènes essentiels . 1 Contrairement contrairement ADV _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 à à PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 Brdt Brdt NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 Brd Brd NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 6 2 2 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 8 Brd Brd NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 9 4 4 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 des un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 gènes gène NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 essentiels essentiel ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-582 # text = Leur mutation chez la souris conduit à une mortalité embryonnaire 1 Leur son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 mutation mutation NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 chez chez PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 souris souris NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 conduit conduire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 à à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 une un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 mortalité mortalité NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 embryonnaire embryonnaire ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-583 # text = ( Houzelstein et al. , 2002 ; Shang et al. , 2007 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Houzelstein Houzelstein NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 6 2002 2002 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ; ; PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 8 Shang Shang NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 al. al. NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 2007 2007 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-584 # text = Brd 2 et Brd 4 sont principalement associées à l'euchromatine ( Denis et al. , 2000 ; Mattsson et al. , 2002 ) . 1 Brd Brd NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 2 2 2 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 4 Brd Brd NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 5 4 4 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 sont être VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 7 principalement principalement ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 associées associer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 l' le NOM _ _ 11 det _ _ _ _ _ 11 euchromatine le NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 13 Denis Denis NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 15 al. al. ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 2000 2000 NUM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 18 ; ; PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 19 Mattsson Mattsson NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 al. al. NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 2002 2002 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 24 ) ) PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-585 # text = Brdt , Brd 2 , Brd 3 et Brd 4 restent associées avec la chromatine lors de la compaction qui a lieu pendant la mitose ( Dey et al. , 2003 ; Dey et al. , 2000 ; Kanno et al. , 2004 ; Pivot-Pajot et al. , 2003 ) . 1 Brdt Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 Brd Brd NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 2 2 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 6 Brd Brd NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 3 3 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 9 Brd Brd NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 10 4 4 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 restent rester VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 associées associer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 avec avec PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 chromatine chromatine NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 lors lors de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 17 de lors de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 compaction compaction NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 qui qui PRQ _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 21 a avoir VRB _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 lieu lieu NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 pendant pendant PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 mitose mitose NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 ( ( PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 27 Dey Dey NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 28 et et COO _ _ 29 mark _ _ _ _ _ 29 al. al. NOM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 30 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 31 2003 2003 NUM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 32 ; ; PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 33 Dey Dey NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 34 et et COO _ _ 35 mark _ _ _ _ _ 35 al. al. NOM _ _ 33 para _ _ _ _ _ 36 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 37 2000 2000 NUM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 38 ; ; PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 39 Kanno Kanno NOM _ _ 43 periph _ _ _ _ _ 40 et et COO _ _ 41 mark _ _ _ _ _ 41 al. al. NOM _ _ 39 para _ _ _ _ _ 42 , , PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 43 2004 2004 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 44 ; ; PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 45 Pivot-Pajot Pivot-Pajot NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 46 et et COO _ _ 47 mark _ _ _ _ _ 47 al. al. NOM _ _ 45 para _ _ _ _ _ 48 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 49 2003 2003 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 50 ) ) PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 51 . . PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-586 # text = Cela indique que ces protéines pourraient être impliquées dans un phénomène de mémoire cellulaire . 1 Cela cela PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 indique indiquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ces ce DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 protéines protéine NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 pourraient pouvoir VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 être être VNF _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 impliquées impliquer VPP _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 dans dans PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 un un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 phénomène phénomène NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 mémoire mémoire NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 cellulaire cellulaire ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-587 # text = Brd 2 , Brd 3 et Brd 4 sont impliquées dans la régulation de la transcription . 1 Brd Brd NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 2 2 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Brd Brd NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 5 3 3 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 Brd Brd NOM _ _ 4 para _ _ _ _ _ 8 4 4 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 sont être VRB _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 impliquées impliquer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 dans dans PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 régulation régulation NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 transcription transcription NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-588 # text = Brd 2 ( anciennement RING3 ) s'associe avec le complexe activateur de la transcription E2F-1 et participe ainsi à l'activation des promoteurs de plusieurs gènes régulateurs du cycle cellulaire ( Dey et al. , 2000 ) . 1 Brd Brd NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 2 2 2 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 4 anciennement anciennement ADV _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 RING3 RING3 NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 7 s' s' CLI _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 associe associer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 avec avec PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 le le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 11 complexe complexe ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 activateur activateur NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 transcription transcription NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 E2F-1 E2F-1 NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 18 participe participer VRB _ _ 8 para _ _ _ _ _ 19 ainsi ainsi ADV _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 à à PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 l' le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 activation activation NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 des de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 promoteurs promoteur NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 plusieurs plusieurs DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 gènes gène NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 régulateurs régulateur ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 du de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 cycle cycle NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 cellulaire cellulaire ADJ _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 ( ( PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 33 Dey Dey NOM _ _ 24 parenth _ _ _ _ _ 34 et et COO _ _ 37 mark _ _ _ _ _ 35 al. al. ADV _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 37 2000 2000 NUM _ _ 33 para _ _ _ _ _ 38 ) ) PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 39 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-589 # text = La protéine s'associe également à 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 protéine protéine NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 s' s' CLI _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 associe associer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 également également ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-590 # text = E2F-2 ( Denis et al. , 2006 ) , TBP dont elle assure l'insertion dans le complexe E2F ( Peng et al. , 2007 ) et avec la grande sous-unité de la 1 E2F-2 E2F-2 NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 Denis Denis NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 5 al. al. ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 2006 2006 NUM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 10 TBP TBP NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 11 dont dont PRQ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 elle lui PRQ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 assure assurer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 l' le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 insertion insertion NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 dans dans PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 le le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 complexe complexe NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 E2F E2F NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 Peng Peng NOM _ _ 18 parenth _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 23 al. al. ADV _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 25 2007 2007 NUM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 26 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 28 avec avec PRE _ _ 13 para _ _ _ _ _ 29 la le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 30 grande grand ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 31 sous-unité sous- NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 32 de de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 la la NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-591 # text = RNA polymérase II ( Crowley et al. , 2002 ) . 1 RNA RNA NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 polymérase polymérase NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 II II ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Crowley Crowley NOM _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 7 al. al. ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 2002 2002 NUM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-592 # text = La région contenant de domaine SEED de Brd 2 est essentielle pour l'interaction avec E2F- 1 et E2F- 2 ( Denis et al. , 2000 ) . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 région région NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 3 contenant contenir VPR _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 domaine domaine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 SEED SEED NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 Brd Brd NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 2 2 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 essentielle essentiel ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 pour pour PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 l' le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 interaction interaction NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 avec avec PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 E2F- E2F- DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 1 1 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 19 E2F- E2F- DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 2 2 NUM _ _ 17 para _ _ _ _ _ 21 ( ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 Denis Denis NOM _ _ 20 parenth _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 24 al. al. ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 2000 2000 NUM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 27 ) ) PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-593 # text = Brd 4 s'associe avec plusieurs complexes de régulation de la transcription , dont le complexe 1 Brd Brd NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 s' s' CLI _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 associe associer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 avec avec PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 plusieurs plusieurs DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 complexes complexe NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 régulation régulation NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 transcription transcription NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 14 dont dont PRQ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 15 le le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 complexe complexe NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-594 # text = Mediator ( Wu et al. , 2003 ) et la forme activatrice du complexe 1 Mediator médiator NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 Wu Wu NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 5 al. al. ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 7 2003 2003 NUM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 10 la le CLI _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 forme former VRB _ _ 1 para _ _ _ _ _ 12 activatrice activateur ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 du de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 complexe complexe NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-595 # text = P-TEFb ( Yang et al. , 2008 ) . 1 P-TEFb page NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 Yang Yang NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 al. al. NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 2008 2008 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-596 # text = Sa présence induit une augmentation de la transcription de certains gènes et stimule celle associée au promoteur HIV- 1 ( Yang et al. , 2005 ) . 1 Sa son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 présence présence NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 induit induire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 une un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 augmentation augmentation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 transcription transcription NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 certains certain DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 gènes gène NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 stimule stimuler VRB _ _ 3 para _ _ _ _ _ 14 celle celui PRQ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 associée associer VPP _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 au à PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 promoteur promoteur NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 HIV- HIV- NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 1 1 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 Yang Yang NOM _ _ 17 parenth _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 23 al. al. ADV _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 2005 2005 NUM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 26 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-597 # text = D'autre part , Brd 4 fait partie d'un complexe de répression de la transcription utilisé par les virus HPV ( Human PapillomaViruses ) ( Wu et al. , 2006 ) . 1 D' d'autre part ADV _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 autre d'autre part ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 part d'autre part NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 Brd Brd NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 6 4 4 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 fait faire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 partie partie NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 d' de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 un un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 complexe complexe NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 répression répression NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 transcription transcription NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 utilisé utiliser VPP _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 18 par par PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 les le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 virus virus NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 HPV HPV NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 ( ( PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 23 Human Human NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 24 PapillomaViruses PapillomaViruses NOM _ _ 20 parenth _ _ _ _ _ 25 ) ) PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 26 ( ( PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 Wu Wu NOM _ _ 11 parenth _ _ _ _ _ 28 et et COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 29 al. al. ADV _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 31 2006 2006 NUM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 32 ) ) PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-598 # text = Une étude a montré récemment que la reconnaissance de la chromatine hyper-acétylée sur H4 et H3 par Brd 2 et Brd 3 a lieu dans des régions occupées par des gènes transcrits et que les protéines ont la propriété d'activer la transcription par la RNA polymérase II ( LeRoy et al. , 2008 ) . 1 Une un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 étude étude NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 a avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 récemment récemment ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 que que CSU _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 chromatine chromatine NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 hyper-acétylée hyper-acétylée ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 sur sur PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 14 H4 H4 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 16 H3 H3 NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 17 par par PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 18 Brd Brd NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 2 2 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 Brd Brd NOM _ _ 18 para _ _ _ _ _ 22 3 3 NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 a avoir VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 24 lieu lieu NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 dans dans PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 des un DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 régions région NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 occupées occuper VPP _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 par par PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 des un DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 gènes gène NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 transcrits transcrire ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 et et COO _ _ 34 mark _ _ _ _ _ 34 que que CSU _ _ 6 para _ _ _ _ _ 35 les le DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 protéines protéine NOM _ _ 37 subj _ _ _ _ _ 37 ont avoir VRB _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 38 la le DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 propriété propriété NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 d' de PRE _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 activer activer VNF _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 la le DET _ _ 43 spe _ _ _ _ _ 43 transcription transcription NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 44 par par PRE _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 la le DET _ _ 47 spe _ _ _ _ _ 46 RNA RNA NOM _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 47 polymérase polymérase NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 48 II II ADJ _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 49 ( ( PUNC _ _ 50 punc _ _ _ _ _ 50 LeRoy LeRoy NOM _ _ 47 parenth _ _ _ _ _ 51 et et COO _ _ 54 mark _ _ _ _ _ 52 al. al. ADV _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 53 , , PUNC _ _ 54 punc _ _ _ _ _ 54 2008 2008 NUM _ _ 50 para _ _ _ _ _ 55 ) ) PUNC _ _ 50 punc _ _ _ _ _ 56 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-599 # text = Ces observations indiquent que les protéines Brd 2 , Brd 3 et Brd 4 sont de véritables co-facteurs transcriptionnels . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 observations observation NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 indiquent indiquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 que que CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 protéines protéine NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 7 Brd Brd NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 2 2 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 10 Brd Brd NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 11 3 3 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 Brd Brd NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 14 4 4 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 sont être VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 véritables véritable ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 co-facteurs co- NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 transcriptionnels transcription NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-600 # text = Brd 2 et Brd 4 sont impliquées dans la ségrégation de génomes viraux . 1 Brd Brd NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 2 2 2 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 4 Brd Brd NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 5 4 4 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 sont être VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 impliquées impliquer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 dans dans PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 ségrégation ségrégation NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 génomes génome NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 viraux viral ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-601 # text = Brd 2 et Brd 4 s'associent avec la protéine LANA ( LAtent Nuclear 1 Brd Brd NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 2 2 2 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 4 Brd Brd NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 5 4 4 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 s' s' CLI _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 associent associer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 avec avec PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 protéine protéine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 LANA LANA NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 13 LAtent LAtent NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 Nuclear Nuclear NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-602 # text = Antigen ) du virus KSHV ( Kaposi's Sarcoma-associated HerpesVirus ) 1 Antigen Antti NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 virus virus NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 KSHV KSHV NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ( ( PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 Kaposi's Kaposi's NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 8 Sarcoma-associated Sarcoma-associated NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 HerpesVirus HerpesVirus NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-603 # text = ( Ottinger et al. , 2006 ; Platt et al. , 1999 ; You et al. , 2006 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Ottinger Ottinger NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 6 2006 2006 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ; ; PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 Platt Platt ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 al. al. ADV _ _ 8 para _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 12 1999 1999 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 ; ; PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 14 You You NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 16 al. al. NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 2006 2006 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 19 ) ) PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-604 # text = Brd 4 interagit également avec la protéine E2 du virus HPV ( Wu et al. , 2006 ) et permet ainsi l'attachement des virus aux chromosomes mitotiques et leur transmission aux cellules filles . 1 Brd Brd NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 interagit interagir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 également également ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 avec avec PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 protéine protéine NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 E2 E2 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 du de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 virus virus NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 HPV HPV NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Wu Wu NOM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 al. al. NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 17 2006 2006 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 20 permet permettre VRB _ _ 3 para _ _ _ _ _ 21 ainsi ainsi ADV _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 l' le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 attachement attachement NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 24 des de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 virus virus NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 aux à PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 chromosomes chromosome NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 mitotiques mitotique ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 et et COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 30 leur son DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 transmission transmission NOM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 32 aux à PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 cellules cellule NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 filles fille ADJ _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-605 # text = Le domaine CTM a été identifié comme étant responsable de cette interaction pour 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 domaine domaine NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 CTM CTM NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 a avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 été être VPP _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 identifié identifier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 comme comme PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 étant étant NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 responsable responsable ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 cette ce DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 interaction interaction NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 pour pour PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-606 # text = Brd 4 . 1 Brd Brd NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-607 # text = La structure cristallographique à 1 , 6 Å de la partie N termiale du virus HPV en complexe avec les 20 résidus de Brd 4 impliqués montre un domaine CTM replié en hélice ? ( Abbate et al. , 2006 ) . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structure structure NOM _ _ 27 subj _ _ _ _ _ 3 cristallographique cristallographique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 à à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 1 1 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 6 , 1 , 6 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 6 6 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 Å Å NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 partie partie NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 N N NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 termiale termial ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 15 virus virus NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 HPV HPV NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 en en PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 complexe complexe NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 avec avec PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 les le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 21 20 20 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 22 résidus résidu NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 Brd Brd NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 4 4 NUM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 impliqués impliquer ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 27 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 28 un un DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 domaine domaine NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 CTM CTM NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 replié replier VPP _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 en en PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 hélice hélice NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 ? ? PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 35 ( ( PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 36 Abbate Abbate NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 37 et et COO _ _ 40 mark _ _ _ _ _ 38 al. al. ADV _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 , , PUNC _ _ 40 punc _ _ _ _ _ 40 2006 2006 NUM _ _ 36 para _ _ _ _ _ 41 ) ) PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 42 . . PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-608 # text = Le domaine ET de Brd 4 semble quant à lui servir de domaine d'interaction pour la protéine LANA de KSHV . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 domaine domaine NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 ET ET NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 Brd Brd NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 4 4 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 semble sembler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 quant quant à PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 à quant à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 lui lui PRQ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 servir servir VNF _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 domaine domaine NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 d' de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 interaction interaction NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 pour pour PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 protéine protéine NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 LANA LANA NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 KSHV KSHV NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-609 # text = Sa structure a été déposée récemment dans la Protéine Data Bank [ PDB 2 JNS ] et montre une structure globulaire faite de trois hélices ? 1 Sa son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structure structure NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 a avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 été être VPP _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 déposée déposer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 récemment récemment ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 dans dans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 Protéine Protéine NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 Data Data NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 Bank Bank NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 [ ( PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 13 PDB PDB NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 2 2 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 JNS JNS NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 ] ) PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 18 montre montrer VRB _ _ 5 para _ _ _ _ _ 19 une un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 structure structure NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 globulaire globulaire ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 faite faire ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 24 trois trois NUM _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 hélices hélice NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 ? ? PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-610 # text = et d'une boucle tout à fait compatible avec une telle fonction . 1 et et COO _ _ 2 mark _ _ _ _ _ 2 d' de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 une un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 boucle boucle NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 tout tout à fait NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 6 à tout à fait PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 fait tout à fait ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 compatible compatible ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 avec avec PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 une un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 11 telle tel ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 fonction fonction NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-611 # text = Brd 2 et Brd 3 ont une activité de chaperon vis à vis des histones . 1 Brd Brd NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 2 2 2 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 4 Brd Brd NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 5 3 3 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ont avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 une un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 activité activité NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 chaperon chaperon NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 vis vis NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 à à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 vis vis NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 des de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 histones histone NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-612 # text = Brd 2 et Brd 3 rendent possible la transcription dans une fibre contenant des nucléosomes acétylés et Brd 2 provoque l'assemblage de nucléosomes sur un brin d'ADN nu à partir d'une fibre de quelques nucléosomes et de nucléosomes désassemblés ( LeRoy et al. , 2008 ) . 1 Brd Brd NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 2 2 2 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 4 Brd Brd NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 5 3 3 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 rendent rendre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 possible possible ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 transcription transcription NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 une un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 fibre fibre NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 contenant contenir VPR _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 des un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 nucléosomes nucléé NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 acétylés acétyle NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 18 Brd Brd NOM _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 19 2 2 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 provoque provoquer VRB _ _ 6 para _ _ _ _ _ 21 l' le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 assemblage assemblage NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 nucléosomes nucléé NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 sur sur PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 un un DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 brin brin NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 d' de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 ADN ADN NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 nu nu ADJ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 à à partir de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 32 partir à partir de NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 d' à partir de PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 une un DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 fibre fibre NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 de de PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 quelques quelque ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 nucléosomes nucléé NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 et et COO _ _ 40 mark _ _ _ _ _ 40 de de PRE _ _ 38 para _ _ _ _ _ 41 nucléosomes nucléé A+_ _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 désassemblés désassembler VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 43 ( ( PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 44 LeRoy LeRoy NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 45 et et COO _ _ 48 mark _ _ _ _ _ 46 al. al. ADV _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 , , PUNC _ _ 48 punc _ _ _ _ _ 48 2008 2008 NUM _ _ 44 para _ _ _ _ _ 49 ) ) PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 50 . . PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-613 # text = Bdf 1 prévient la propagation de l'hétérochromatine . 1 Bdf Bdf NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 1 1 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 prévient prévenir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 propagation propagation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 l' le NOM _ _ 8 det _ _ _ _ _ 8 hétérochromatine le NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-614 # text = La protéine Bdf 1 de levure , similaire à la protéine Brd 4 des mammifères , entre en compétition avec Sir ( Silent information regulator ) pour la fixation de la queue acétylée de l'histone H4 et empêche sa fixation aux zones frontières entre l'euchromatine et l'hétérochromatine 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 protéine protéine NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 3 Bdf Bdf NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 1 1 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 levure levure NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 8 similaire similaire ADJ _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 9 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 protéine protéine NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 Brd Brd NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 4 4 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 des de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 mammifères mammifère NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 17 entre entrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 en en PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 compétition compétition NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 avec avec PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 Sir Sir NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 ( ( PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 23 Silent Silent NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 24 information information NOM _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 25 regulator réguler VRB _ _ 17 parenth _ _ _ _ _ 26 ) ) PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 27 pour pour PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 28 la le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 fixation fixation NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 de de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 la le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 queue queue NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 acétylée acétyle NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 de de PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 l' le DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 histone histone NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 H4 H4 NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 et et COO _ _ 39 mark _ _ _ _ _ 39 empêche empêcher VRB _ _ 17 para _ _ _ _ _ 40 sa son DET _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 41 fixation fixation NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 aux à PRE _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 zones zone NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 frontières frontière NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 entre entre PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 46 l' l'euchromatine NOM _ _ 47 det _ _ _ _ _ 47 euchromatine l'euchromatine NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 48 et et COO _ _ 49 mark _ _ _ _ _ 49 l' le NOM _ _ 50 det _ _ _ _ _ 50 hétérochromatine le NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-615 # text = ( Ladurner et al. , 2003 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Ladurner Ladurner NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2003 2003 NUM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-616 # text = Cette fonction dépendante de l'acétylation est corrélée avec le recrutement du complexe de remodelage de la chromatine Swr 1 qui permet l'insertion du variant H2A.Z de l'histone 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 fonction fonction NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 dépendante dépendant ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 acétylation acétylation NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 est être VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 corrélée corréler VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 avec avec PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 le le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 recrutement recrutement NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 du de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 complexe complexe NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 remodelage remodelage NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 chromatine chromatine NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 Swr Swr NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 1 1 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 qui qui PRQ _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 22 permet permettre VRB _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 23 l' le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 insertion insertion NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 du de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 variant variant NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 H2A.Z H2A.Z NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 l' le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 histone histone NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-617 # text = H2A dans ces régions ( Kobor et al. , 2004 ; Krogan et al. , 2003 ; Mizuguchi et al. , 2004 ) . 1 H2A H2A NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 dans dans PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 ces ce DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 régions région NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 Kobor Kobor NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 8 al. al. NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 10 2004 2004 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 ; ; PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 12 Krogan Krogan NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 al. al. NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 16 2003 2003 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 ; ; PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 18 Mizuguchi Mizuguchi NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 20 al. al. NOM _ _ 18 para _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 2004 2004 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-618 # text = Bdf 1 régule également l'expression de plusieurs gènes et interagit via son domaine ET avec la sous-unité 1 Bdf Bdf NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 1 1 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 régule réguler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 également également ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 expression expression NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 plusieurs plusieurs DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 gènes gène NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 interagit interagir VRB _ _ 3 para _ _ _ _ _ 12 via via PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 son son DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 domaine domaine NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 ET ET NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 avec avec PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 sous-unité sous- NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-619 # text = TAF7 du facteur de transcription TFIID ( Matangkasombut et al. , 2000 ) . 1 TAF7 TAF7 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 du de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 facteur facteur NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 transcription transcription NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 TFIID TFIID NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 Matangkasombut Matangkasombut NOM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 10 al. al. ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 2000 2000 NUM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-620 # text = En conclusion , les protéines BET possèdent un grand nombre de fonctions liées à l'organisation de la chromatine qui passent par des interactions variées avec d'autres protéines . 1 En en PRE _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 conclusion conclusion NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 protéines protéine NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 6 BET BET NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 possèdent posséder VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 un un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 9 grand grand ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 nombre nombre NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 fonctions fonction NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 liées lier VPP _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 à à PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 l' le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 organisation organisation NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 chromatine chromatine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 qui qui PRQ _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 21 passent passer VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 22 par par PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 des un DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 interactions interaction NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 variées varier VPP _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 avec avec PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 d' un DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 28 autres autre ADJ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 29 protéines protéine NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-621 # text = Les domaines ET , SEED et CTM sont impliqués dans ces interactions protéine-protéine . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 domaines domaine NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 ET ET NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 SEED SEED NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 CTM CTM NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 8 sont être VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 impliqués impliquer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 ces ce DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 interactions interaction NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 protéine-protéine protéine-protéine NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-622 # text = c . Spécificités vis à vis de l'acétylation des histones 1 c c NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Spécificités Spécificités NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 vis vivre VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 vis vis NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 acétylation acétylation NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 histones histone NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-623 # text = Les fonctions évoquées plus haut dépendent pour la plupart de l'acétylation de la chromatine . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 fonctions fonction NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 évoquées évoquer ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 plus plus ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 haut haut ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 dépendent dépendre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 pour pour PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 plupart plupart NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 l' le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 acétylation acétylation NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 chromatine chromatine NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-624 # text = Nous allons résumer ici les informations disponibles concernant les bromodomaines très conservés de ces protéines . 1 Nous nous CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 allons aller VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 résumer résumer VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ici ici ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 informations information NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 disponibles disponible ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 concernant concerner VPR _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 bromodomaines brome NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 très très ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 conservés conserver ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 ces ce DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 protéines protéine NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-625 # text = Il apparaît entre les bromdomaines , même des proches homologues Brd 2 , Brd 3 et Brd 4 des différences de spécificité . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 apparaît apparaître VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 entre entre PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 bromdomaines brou NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 même même ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 proches proche ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 homologues homologue NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 Brd Brd NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 2 2 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 Brd Brd NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 15 3 3 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 Brd Brd NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 18 4 4 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 des de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 différences différence NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 spécificité spécificité NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-626 # text = La diversité des techniques utilisées rend cependant la comparaison délicate . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 diversité diversité NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 techniques technique NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 utilisées utiliser ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 rend rendre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 cependant cependant ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 comparaison comparaison NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 délicate délicat ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-627 # text = i . Brd 2 1 i i NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Brd Brd NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 2 2 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-628 # text = Kanno et ses collègues ( 2004 ) ont montré in vivo par FRET que Brd 2 interagit préférentiellement avec la queue N terminale de l'histone 1 Kanno Kanno NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 3 ses son DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 collègues collègue NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 5 ( ( PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2004 2004 NUM _ _ 4 parenth _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 8 ont avoir VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 in in vivo ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 vivo in vivo ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 par par PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 FRET FRET NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 que que CSU _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 15 Brd Brd NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 16 2 2 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 interagit interagir VRB _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 préférentiellement préférentiellement ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 avec avec PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 queue queue NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 N N NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 terminale terminal ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 25 l' le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 histone histone NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-629 # text = H4 tétra-acétylée . 1 H4 H4 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 tétra-acétylée tétra-acétyle NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-630 # text = Cette interaction est abolie par la mutation des lysines K12 et K5 de la queue H4 en glycine . 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 interaction interaction NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 abolie abolir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 par par PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 mutation mutation NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 lysines lysine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 K12 K12 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 K5 K5 NOM _ _ 10 para _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 queue queue NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 H4 H4 NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 en en PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 18 glycine glycine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-631 # text = Elle est réduite si ce sont les lysines K8 et K16 qui sont mutées . 1 Elle elle CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 réduite réduire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 si si CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ce ce CLS _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 sont être VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 lysines lysine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 K8 K8 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 K16 K16 NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 12 qui qui PRQ _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 13 sont être VRB _ _ 14 aux _ _ _ _ _ 14 mutées muter VPP _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-632 # text = Dans la même étude , ils montrent par une expérience de co-purification que Brd 2 présente pour le peptide H 4 -K 12 ac une forte affinité . 1 Dans dans PRE _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 3 même même ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 étude étude NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 6 ils ils CLS _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 7 montrent montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 par par PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 une un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 expérience expérience NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 co-purification co- NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 que que PRQ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 14 Brd Brd NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 15 2 2 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 présente présenter VRB _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 17 pour pour PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 le le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 peptide peptide NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 H H NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 4 4 NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 -K -K VPR _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 23 12 12 NUM _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 ac ace NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 une un DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 26 forte fort ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 27 affinité affinité NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-633 # text = La reconnaissance de la mono-acétylation H 4 -K 12 ac est ensuite confirmée in vivo par la disparition du FRET entre Brd 2 et un nucléosome portant la mutation 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 mono-acétylation mono- NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 H H NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 4 4 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 -K -K VPR _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 12 12 NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 ac ace NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 est être VRB _ _ 13 aux _ _ _ _ _ 12 ensuite ensuite ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 confirmée confirmer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 in in vivo ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 vivo in vivo ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 par par PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 disparition disparition NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 du de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 FRET FRET NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 entre entre PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 Brd Brd NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 2 2 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 25 un un DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 nucléosome nucléé NOM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 27 portant porter VPR _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 la le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 mutation mutation NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-634 # text = K12R sur l'histone H4 mais pas entre Brd 2 et un nucléosome portant la mutation H4-K5R. Ils montrent ensuite que Brd 2 ne présente pas d'affinité pour la queue H3 acétylée . 1 K12R K12R NOM _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 2 sur sur PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 l' le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 histone histone NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 H4 H4 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 mais mais COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 7 pas pas ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 entre entre PRE _ _ 2 para _ _ _ _ _ 9 Brd Brd NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 2 2 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 12 un un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 nucléosome nucléé NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 14 portant porter VPR _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 mutation mutation NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 H4-K5R. H4-K5R. NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 Ils Ils NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 montrent montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 ensuite ensuite ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 que que CSU _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 Brd Brd NOM _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 23 2 2 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 ne ne ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 présente présenter VRB _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 26 pas pas ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 d' de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 affinité affinité NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 pour pour PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 30 la le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 queue queue NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 32 H3 H3 NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 acétylée acétylée NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 . . PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-635 # text = De plus l'inactivation de l'un ou l'autre des bromodomaines entraîne une réduction significative 1 De de plus PRE _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 2 plus de plus NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 l' le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 inactivation inactivation NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 un un PRQ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 ou ou COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 9 l' l'autre DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 autre l'autre PRQ _ _ 7 para _ _ _ _ _ 11 des un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 bromodomaines oromo NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 13 entraîne entraîner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 une un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 réduction réduction NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 significative significatif ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-636 # text = ( 50 %   environ ) de l'interaction pour H4 , quel que soit le bromodomaine touché ( Kanno et al. , 2004 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 2 50 50 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 % pourcent NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 4     ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 environ environ ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 interaction interaction NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 pour pour PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 H4 H4 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 quel quel? ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 que que PRQ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 soit être VRB _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 le le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 bromodomaine bromé NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 18 touché toucher ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 Kanno Kanno NOM _ _ 17 parenth _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 22 al. al. ADV _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 2004 2004 NUM _ _ 20 para _ _ _ _ _ 25 ) ) PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-637 # text = La structure cristallographique du premier bromodomaine de Brd 2 met en évidence un dimère dans l'unité asymétrique qui semble exister en solution . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structure structure NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 3 cristallographique cristallographique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 premier premier ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 bromodomaine brome NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 Brd Brd NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 2 2 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 met mettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 en en PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 évidence évidence NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 un un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 dimère dimère NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 15 dans dans PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 16 l' le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 unité unité NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 asymétrique asymétrique ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 qui qui PRQ _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 20 semble sembler VRB _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 exister exister VNF _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 en en PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 23 solution solution NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-638 # text = La mutation des résidus responsables de la formation du dimère résulte à une perte de l'affinité de Brd 2 -BD1 pour le peptide 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 mutation mutation NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 résidus résidu NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 responsables responsable ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 formation formation NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 du de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 dimère dimère NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 résulte résulter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 à à PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 une un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 perte perte NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 l' le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 affinité affinité NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 Brd Brd NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 2 2 NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 -BD1 -BD1 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 pour pour PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 23 le le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 peptide peptide NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-639 # text = H 4 -K 12 ac ( Nakamura et al. , 2007 ) . 1 H heure NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 12 12 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 ac ace NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 ( ( PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 Nakamura Nakamura NOM _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 9 al. Al NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 2007 2007 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 ) ) PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-640 # text = La structure du second bromodomaine de la protéine ( Brd 2 -BD2 ) a également été résolue par RMN ( Huang et al. , 2007 ) . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structure structure NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 second second ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 bromodomaine brome NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 protéine protéine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 ( ( PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 Brd Brd NOM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 11 2 2 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 -BD2 -BD2 ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 14 a avoir VRB _ _ 16 aux _ _ _ _ _ 15 également également ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 été être VPP _ _ 17 aux _ _ _ _ _ 17 résolue résoudre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 par par PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 RMN RMN NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 Huang Huang NOM _ _ 19 parenth _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 23 al. al. ADV _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 2007 2007 NUM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 26 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-641 # text = La perturbation chimique induite par la titration des peptides H 4 -K 8 ac , H 4 -K 12 ac , H 2B -K 5 ac montre que H 4 -K 12 ac est préférentiellement reconnu par 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 perturbation perturbation NOM _ _ 27 periph _ _ _ _ _ 3 chimique chimique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 induite induire VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 par par PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 titration titration NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 peptides peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 H H NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 4 4 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 -K -K VPR _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 8 8 NUM _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 ac ace NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 16 H H NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 4 4 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 -K -K VPR _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 12 12 NUM _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 ac ace NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 22 H H NOM _ _ 27 subj _ _ _ _ _ 23 2B 2B NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 -K -K VPR _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 5 5 NUM _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 ac ace NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 28 que que CSU _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 H H NOM _ _ 36 subj _ _ _ _ _ 30 4 4 NUM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 -K -K VPR _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 12 12 NUM _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 ac ace NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 est être VRB _ _ 36 aux _ _ _ _ _ 35 préférentiellement préférentiellement ADV _ _ 36 periph _ _ _ _ _ 36 reconnu reconnaître VPP _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 37 par par NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-642 # text = Brd 2 -BD2 parmi ces peptides ( Kd ~ 2 , 9 mM ) . 1 Brd Brd NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 2 2 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 -BD2 -BD2 NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 parmi parmi PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 ces ce DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 peptides peptide NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 Kd Kd NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 9 ~ environ ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 10 2 2 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 11 , 2 , 9 PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 12 9 9 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 mM millimètre NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-643 # text = ii . 1 ii if NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-644 # text = Brd 3 1 Brd Brd NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 3 3 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-645 # text = Une étude a montré récemment que l'activation de la transcription induite par la reconnaissance de la chromatine hyper-acétylée sur H4 et H3 par Brd 2 et Brd 3 était inhibée par la présence des peptides 1 Une un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 étude étude NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 a avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 récemment récemment ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 que que CSU _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 l' le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 activation activation NOM _ _ 31 subj _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 transcription transcription NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 induite induire VPP _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 par par PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 chromatine chromatine NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 hyper-acétylée hyper-acétylée ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 sur sur PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 21 H4 H4 NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 23 H3 H3 NOM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 24 par par PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 25 Brd Brd NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 2 2 NUM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 28 Brd Brd NOM _ _ 25 para _ _ _ _ _ 29 3 3 NUM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 était être VRB _ _ 31 aux _ _ _ _ _ 31 inhibée inhiber VPP _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 32 par par PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 la le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 présence présence NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 des de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 peptides peptide NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-646 # text = H 4 -K 5 ac et H 4 -K 12 ac . 1 H heure NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 5 5 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 ac ace NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 7 H H NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 8 4 4 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 -K -K VRB _ _ 3 para _ _ _ _ _ 10 12 12 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 ac ace NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-647 # text = Témoignant d'une divergence de fonction entre les proches homologues Brd 2 et Brd 3 , l'inactivation de Brd 3 par l'un ou l'autre des peptides est équivalente alors que le peptide 1 Témoignant témoigner VPR _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 2 d' de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 une un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 divergence divergence NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 fonction fonction NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 entre entre PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 9 proches proche ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 homologues homologue NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 Brd Brd NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 2 2 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 Brd Brd NOM _ _ 10 para _ _ _ _ _ 15 3 3 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 17 l' le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 inactivation inactivation NOM _ _ 30 subj _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 Brd Brd NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 3 3 NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 par par PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 23 l' le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 un un PRQ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 ou ou COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 26 l' le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 autre autre PRQ _ _ 24 para _ _ _ _ _ 28 des de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 peptides peptide NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 31 équivalente équivalent ADJ _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 alors alors que CSU _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 33 que alors que CSU _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 34 le le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 peptide peptide NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-648 # text = H 4 -K 12 ac a un effet plus important que H 4 -K 5 ac sur l'activité de Brd 2 ( LeRoy et al. , 2008 ) . 1 H heure NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -K -K VPR _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 12 12 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 ac ace NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 un un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 effet effet NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 plus plus ADV _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 important important ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 que que CSU _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 H H NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 4 4 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 -K -K VPR _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 5 5 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 ac ace NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 sur sur PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 activité activité NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 Brd Brd NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 2 2 NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 LeRoy LeRoy NOM _ _ 21 parenth _ _ _ _ _ 25 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 26 al. al. ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 2008 2008 NUM _ _ 24 para _ _ _ _ _ 29 ) ) PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-649 # text = iii . 1 iii ici ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-650 # text = Brd 4 1 Brd Brd NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-651 # text = Dey et ses collègues ( 2003 ) ont montré par co-purification que Brd 4 interagit avec les peptides H4 tétra-acétylés , avec le peptide di-acétylé H 4 -K 5 K 12 ac et dans une moindre mesure avec le peptide 1 Dey Dey NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 3 ses son DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 collègues collègue NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 5 ( ( PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2003 2003 NUM _ _ 4 parenth _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 8 ont avoir VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 par par PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 co-purification co- NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 que que CSU _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 Brd Brd NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 14 4 4 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 interagit interagir VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 avec avec PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 les le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 peptides peptide NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 H4 H4 NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 tétra-acétylés tétra-acétyle NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 avec avec PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 23 le le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 peptide peptide NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 di-acétylé NUMBER-acétyle NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 H H NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 4 4 NUM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 28 -K -K VPR _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 29 5 5 NUM _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 K K NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 12 12 NUM _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 ac ace NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 et et COO _ _ 34 mark _ _ _ _ _ 34 dans dans PRE _ _ 28 para _ _ _ _ _ 35 une un DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 36 moindre moindre ADJ _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 37 mesure mesure NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 38 avec avec PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 le le DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 peptide peptide NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-652 # text = H 4 -K 8 K 12 ac mais pas avec les peptides H4 mono-acétylés sur les lysines K8 , K12 ou K16 . 1 H heure NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 8 8 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 K K NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 12 12 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 ac ace NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 mais mais COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 9 pas pas ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 avec avec PRE _ _ 3 para _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 peptides peptide NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 H4 H4 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 mono-acétylés mono- NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 sur sur PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 lysines lysine NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 K8 K8 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 K12 K12 NOM _ _ 18 para _ _ _ _ _ 21 ou ou COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 22 K16 K16 NOM _ _ 20 para _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-653 # text = Par ailleurs , contrairement à Brd 2 et Brdt , Brd 4 montre une affinité pour les peptides H3 di-acétylés sur les lysines K9 et K14 et mono-acétylés sur la lysine K14 ( affinité légèrement plus faible ) ( Dey et al. , 2003 ) . 1 Par par ailleurs PRE _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 2 ailleurs par ailleurs ADV _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 contrairement contrairement ADV _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 Brd Brd NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 2 2 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 9 Brdt Brdt NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 11 Brd Brd NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 12 4 4 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 une un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 affinité affinité NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 pour pour PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 les le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 peptides peptide NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 H3 H3 NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 di-acétylés NUMBER-acétyle NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 sur sur PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 22 les le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 lysines lysine NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 K9 K9 NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 et et COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 26 K14 K14 NOM _ _ 24 para _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 28 mono-acétylés mono- NOM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 29 sur sur PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 la le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 lysine lysine NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 K14 K14 NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 ( ( PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 34 affinité affinité NOM _ _ 31 parenth _ _ _ _ _ 35 légèrement légèrement ADV _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 36 plus plus ADV _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 37 faible faible ADJ _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 38 ) ) PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 39 ( ( PUNC _ _ 40 punc _ _ _ _ _ 40 Dey Dey NOM _ _ 28 parenth _ _ _ _ _ 41 et et COO _ _ 42 mark _ _ _ _ _ 42 al. al. NOM _ _ 40 para _ _ _ _ _ 43 , , PUNC _ _ 44 punc _ _ _ _ _ 44 2003 2003 NUM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 45 ) ) PUNC _ _ 40 punc _ _ _ _ _ 46 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-654 # text = Récemment la structure de Brd 4 -BD2 a été obtenue par RMN . 1 Récemment récemment ADV _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 la le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 structure structure NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 Brd Brd NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 4 4 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 -BD2 -BD2 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 a avoir VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 été être VPP _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 obtenue obtenir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 par par PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 RMN RMN NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-655 # text = La perturbation chimique induite par la titration des peptides H 4 -K 5 ac , H 4 -K 12 ac , H 4 -K 5 K 12 ac et H 3 -K 9 K 14 ac dans des solutions de BD1 ou BD2 indique que les bromodomaines lient les peptides H3 et H4 di-acétylés avec des affinités similaires . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 perturbation perturbation NOM _ _ 44 periph _ _ _ _ _ 3 chimique chimique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 induite induire VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 par par PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 titration titration NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 peptides peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 H H NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 4 4 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 -K -K VPR _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 5 5 NUM _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 ac ace NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 16 H H NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 4 4 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 12 12 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 ac ac NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 22 H H NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 4 4 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 5 5 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 K K NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 27 12 12 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 28 ac ac ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 29 et et COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 30 H H NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 31 3 3 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 32 -K -K ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 33 9 9 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 34 K K NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 35 14 14 NUM _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 ac ace NOM _ _ 44 subj _ _ _ _ _ 37 dans dans PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 des un DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 solutions solution NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 de de PRE _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 BD1 BD1 NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 ou ou COO _ _ 43 mark _ _ _ _ _ 43 BD2 BD2 NOM _ _ 41 para _ _ _ _ _ 44 indique indiquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 45 que que CSU _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 les le DET _ _ 47 spe _ _ _ _ _ 47 bromodomaines brome NOM _ _ 48 subj _ _ _ _ _ 48 lient lier VRB _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 49 les le DET _ _ 50 spe _ _ _ _ _ 50 peptides peptide NOM _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 51 H3 H3 NOM _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 52 et et COO _ _ 53 mark _ _ _ _ _ 53 H4 H4 NOM _ _ 51 para _ _ _ _ _ 54 di-acétylés di-acétylés NOM _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 55 avec avec PRE _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 56 des un DET _ _ 57 spe _ _ _ _ _ 57 affinités affinité NOM _ _ 55 dep _ _ _ _ _ 58 similaires similaire ADJ _ _ 57 dep _ _ _ _ _ 59 . . PUNC _ _ 44 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-656 # text = Les affinités de BD1 et BD2 vis à vis des peptides H 4 -K 5 ac , H 4 -K 12 ac ont été déterminées et sont respectivement égales à 0 , 8 et 0 , 6 mM pour BD1 et 1 , 0 et 1 , 3 mM pour BD2 ( Liu et al. , 2008 ) . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 affinités affinité NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 BD1 BD1 NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 6 BD2 BD2 NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 vis vivre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 vis vis NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 peptides peptide NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 H H NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 4 4 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 -K -K VPR _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 5 5 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 ac ace NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 18 H H NOM _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 19 4 4 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 -K -K VPR _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 12 12 NUM _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 ac ace NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 ont avoir VRB _ _ 24 aux _ _ _ _ _ 24 été être VPP _ _ 25 aux _ _ _ _ _ 25 déterminées déterminer VPP _ _ 7 para _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 27 sont être VRB _ _ 25 para _ _ _ _ _ 28 respectivement respectivement ADV _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 égales égal ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 à à PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 0 0 NUM _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 32 , 0 , 8 PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 33 8 8 NUM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 34 et et COO _ _ 38 mark _ _ _ _ _ 35 0 0 NUM _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 36 , 0 , 6 PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 37 6 6 NUM _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 mM millimètre NOM _ _ 33 para _ _ _ _ _ 39 pour pour PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 BD1 BD1 NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 et et COO _ _ 44 mark _ _ _ _ _ 42 1 1 NUM _ _ 44 spe _ _ _ _ _ 43 , 1 , 0 PUNC _ _ 44 punc _ _ _ _ _ 44 0 0 NUM _ _ 40 para _ _ _ _ _ 45 et et COO _ _ 49 mark _ _ _ _ _ 46 1 1 NUM _ _ 48 spe _ _ _ _ _ 47 , 1 , 3 PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 48 3 3 NUM _ _ 49 spe _ _ _ _ _ 49 mM millimètre NOM _ _ 44 para _ _ _ _ _ 50 pour pour PRE _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 51 BD2 BD2 NOM _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 52 ( ( PUNC _ _ 53 punc _ _ _ _ _ 53 Liu Liu NOM _ _ 51 parenth _ _ _ _ _ 54 et et COO _ _ 57 mark _ _ _ _ _ 55 al. al. ADV _ _ 54 dep _ _ _ _ _ 56 , , PUNC _ _ 57 punc _ _ _ _ _ 57 2008 2008 NUM _ _ 53 para _ _ _ _ _ 58 ) ) PUNC _ _ 53 punc _ _ _ _ _ 59 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-657 # text = iv . 1 iv ive NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-658 # text = Bdf 1 1 Bdf Bdf NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 1 1 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-659 # text = Bdf 1 reconnaît un peptide H4 tétra-acétylé avec une forte affinité 1 Bdf Bdf NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 1 1 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 reconnaît reconnaître VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 peptide peptide NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 H4 H4 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 avec avec PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 une un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 10 forte fort ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 affinité affinité NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-660 # text = ( 8 , 4 µM ) et un peptide H3 tétra-acétylé ou di-acétylé sur les lysines K14 et K18 avec une affinité legèrement plus faible ( 14   µM pour H 3 -K 14 K 18 ac ) ( Ladurner et al. , 2003 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 2 8 8 NUM _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 3 , 8 , 4 PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 4 4 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 µM micro- NOM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 46 mark _ _ _ _ _ 8 un un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 peptide peptide NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 H3 H3 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 ou ou COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 di-acétylé di-acétylé NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 14 sur sur PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 les le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 lysines lysine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 K14 K14 NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 19 K18 K18 NOM _ _ 17 para _ _ _ _ _ 20 avec avec PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 21 une un DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 affinité affinité NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 legèrement légèrement ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 24 plus plus ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 faible faible ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 26 ( ( PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 27 14 14 NUM _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28   14   DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 µM micro- NOM _ _ 22 parenth _ _ _ _ _ 30 pour pour PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 H H NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 3 3 NUM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 -K -K VPR _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 14 14 NUM _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 K K NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 18 18 NUM _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 ac ace NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 ) ) PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 39 ( ( PUNC _ _ 40 punc _ _ _ _ _ 40 Ladurner Ladurner NOM _ _ 16 parenth _ _ _ _ _ 41 et et COO _ _ 42 mark _ _ _ _ _ 42 al. Al NOM _ _ 40 para _ _ _ _ _ 43 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 44 2003 2003 NUM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 45 ) ) PUNC _ _ 40 punc _ _ _ _ _ 46 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-661 # text = Bdf 1 se lie spécifiquement à la chromatine hyperacétylée sur H3 et H4 mais non-acétylée sur la lysine K16 de H4 des gènes transcrits 1 Bdf Bdf NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 1 1 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 se se CLI _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 lie lier VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 spécifiquement spécifiquement ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 chromatine chromatine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 hyperacétylée hyperacétylée ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 sur sur PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 H3 H3 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 H4 H4 NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 14 mais mais COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 15 non-acétylée non-acétylée ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 sur sur PRE _ _ 10 para _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 lysine lysine NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 K16 K16 NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 H4 H4 NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 des de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 gènes gène NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 transcrits transcrire ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-662 # text = ( Kurdistani et al. , 2004 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Kurdistani Kurdistani NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2004 2004 NUM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-663 # text = Contrairement à lui , le très proche homologue Bdf 2 lie l'histone H4 sans discrimination vis à vis de son état d'acétylation ( Matangkasombut and Buratowski , 2003 ) . 1 Contrairement contrairement ADV _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 à à PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 lui lui PRQ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 6 très très ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 proche proche ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 homologue homologue NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 9 Bdf Bdf NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 2 2 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 lie lier VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 l' le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 histone histone NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 H4 H4 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 sans sans PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 16 discrimination discrimination NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 vis vis NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 à à PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 vis vis NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 son son DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 état état NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 d' de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 acétylation acétylation NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 ( ( PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 26 Matangkasombut Matangkasombut NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 27 and matangkasombut and buratowski NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 28 Buratowski Buratowski NOM _ _ 22 parenth _ _ _ _ _ 29 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 30 2003 2003 NUM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 ) ) PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-664 # text = E . Le bromodomaine  : 1 E e NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Le Le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 bromodomaine bromé NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5  : : PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-665 # text = structure et fonction 1 structure structure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 fonction fonction NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-666 # text = Le bromodomaine est un module de 110 acides-aminés environ . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 bromodomaine bromé NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 module module NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 110 110 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 acides-aminés acide ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 environ environ ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-667 # text = Son repliement est très conservé . 1 Son son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 repliement repliement NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 4 très très ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 conservé conserver VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-668 # text = Il est constitué par l'empilement de 4 hélices en un tonneau qui présente à une de ses extrémités les parties N et C terminales de la chaîne peptidique et à l'autre extrémité les boucles ZA et BC 1 Il il CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 constitué constituer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 par par PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 empilement empilement NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 4 4 NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 hélices hélice NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 en en PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 11 un un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 tonneau tonneau NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 qui qui PRQ _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 14 présente présenter VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 à à PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 une un PRQ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ses son DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 extrémités extrémité NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 les le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 parties partie NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 22 N N NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 24 C C NOM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 25 terminales terminal ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 27 la le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 chaîne chaîne NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 peptidique peptidique ADJ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 et et COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 31 à à PRE _ _ 26 para _ _ _ _ _ 32 l' le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 33 autre autre ADJ _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 34 extrémité extrémité NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 35 les le DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 boucles boucle NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 37 ZA ZA NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 et et COO _ _ 39 mark _ _ _ _ _ 39 BC BC NOM _ _ 37 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-669 # text = [ Figure   13 ] ( Jeanmougin et al. , 1997 ) . 1 [ ( PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 2 Figure Figure NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 3     13 DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 13 13 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 ] ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 6 ( ( PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 Jeanmougin Jeanmougin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 9 al. al. ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 1997 1997 NUM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 12 ) ) PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-670 # text = Ce repliement fait du bromodomaine un module indépendant et permet l'existence de séries de bromodomaines placés les uns à côté des autres . 1 Ce ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 repliement repliement NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 fait faire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 bromodomaine bromé NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 un un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 module module NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 indépendant indépendant ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 permet permettre VRB _ _ 3 para _ _ _ _ _ 11 l' le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 existence existence NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 séries série NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 bromodomaines oromo NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 placés placer ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 les le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 uns un PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 à à PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 côté côté NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 des de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 autres autre ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-671 # text = Les bromodomaines sont des modules de liaison des lysines acétylées . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 bromodomaines oromo NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 des un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 modules module NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 liaison liaison NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 lysines lysine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 acétylées acétyle NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-672 # text = Ils sont capables de discriminer un site d'acélylation grâce aux résidus adjacents à l'acétyl-lysine . 1 Ils ils CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 capables capable ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 discriminer discriminer VNF _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 un un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 site site NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 d' de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 acélylation acélylation NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 grâce grâce à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 11 aux grâce à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 résidus résidu NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 adjacents adjacent ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 l' le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 acétyl-lysine acétyle-lysine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-673 # text = L'adaptation de chaque bromodomaine à son ligand se fait grâce aux boucles ZA et BC de séquences variables qui portent le site de fixation du peptide acétylé ( Mujtaba et al. , 2007 ; Zeng and Zhou , 2002 ) . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 adaptation adaptation NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 chaque chaque DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 bromodomaine oromo NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 son son DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 ligand ligand NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 se se CLI _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 fait faire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 grâce grâce à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 aux grâce à PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 boucles boucle NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 ZA ZA NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 16 BC BC NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 séquences séquence NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 variables variable ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 qui qui PRQ _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 21 portent porter VRB _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 le le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 site site NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 fixation fixation NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 du de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 peptide peptide NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 acétylé acétyle NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 ( ( PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 30 Mujtaba Mujtaba NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 31 et et COO _ _ 32 mark _ _ _ _ _ 32 al. al. NOM _ _ 30 para _ _ _ _ _ 33 , , PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 34 2007 2007 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 ; ; PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 36 Zeng Zeng NOM _ _ 38 periph _ _ _ _ _ 37 and zeng and zhou NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 38 Zhou Zhou NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 39 , , PUNC _ _ 40 punc _ _ _ _ _ 40 2002 2002 NUM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 ) ) PUNC _ _ 40 punc _ _ _ _ _ 42 . . PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-674 # text = Ils sont présents dans de nombreuses protéines associées à la chromatine , telles que des histones acétyl-transférases ou des complexes de remodelage de la chromatine ( Yang , 2004 ) . 1 Ils ils CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 présents présent ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 dans dans PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 6 nombreuses nombreux ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 protéines protéine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 associées associer VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 chromatine chromatine NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 telles tel ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 14 que que CSU _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 des un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 histones histone NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 acétyl-transférases acétyle-transférase NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ou ou COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 19 des un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 complexes complexe NOM _ _ 16 para _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 remodelage remodelage NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 chromatine chromatine NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 ( ( PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 Yang Yang NOM _ _ 25 parenth _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 29 2004 2004 NUM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 ) ) PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-675 # text = Les affinités mesurées jusqu'ici entre les bromodomaines et les peptides reconnus sont relativement faibles comparées à une affinité de type antigénique ou même d'une reconnaissance enzyme-substrat . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 affinités affinité NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 3 mesurées mesurer VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 jusqu'ici jusqu'ici ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 entre entre PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 bromodomaines brome NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 peptides peptide NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 11 reconnus reconnaître ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 relativement relativement ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 faibles faible NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 comparées comparer VPP _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 à à PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 une un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 affinité affinité NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 type type NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 antigénique antigénique ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 ou ou COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 23 même même ADV _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 d' de PRE _ _ 19 para _ _ _ _ _ 25 une un DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 enzyme-substrat enzyme-substrat NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-676 # text = Elle varie de quelques milli-molaires à quelques micro-molaires . 1 Elle elle CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 varie varier VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 quelques quelque DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 milli-molaires mi- NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 quelques quelque DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 micro-molaires micro- NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-677 # text = L'ordre du micro-molaire semble définir une interaction spécifique entre un bromodomaine et un peptide acétylé [ Annexe 4A ] . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 ordre ordre NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 micro-molaire micro- NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 semble sembler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 définir définir VNF _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 une un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 interaction interaction NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 spécifique spécifique ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 entre entre PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 un un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 bromodomaine oromo NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 14 un un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 peptide peptide NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 16 acétylé acétyle NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 [ ( PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 Annexe Annexe NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 4A 4A NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 ] ) PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-678 # text = Les bromodomaines peuvent être seuls , associés par deux ou associés à d'autres domaines de reconnaissance d'une MTP ( à un PHD finger par exemple ) . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 bromodomaines oromo NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 peuvent pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 être être VNF _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 seuls seul ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 associés associer VPP _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 par par PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 deux deux NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 ou ou COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 associés associer VPP _ _ 7 para _ _ _ _ _ 12 à à PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 d' un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 14 autres autre ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 domaines domaine NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 d' de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 une un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 MTP MTP NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 ( ( PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 22 à à PRE _ _ 25 periph _ _ _ _ _ 23 un un DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 PHD PHD NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 finger figer VNF _ _ 20 parenth _ _ _ _ _ 26 par par exemple PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 exemple par exemple ADV _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 ) ) PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-679 # text = Par exemple , la protéine Pb 1 porte six bromodomaines adjacents dont les spécificités vis à vis des sites d'acétylation de l'histone H3 sont toutes différentes . 1 Par par exemple PRE _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 exemple par exemple ADV _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 protéine protéine NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 6 Pb Pb NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 1 1 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 porte porter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 six six NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 bromodomaines brome NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 adjacents adjacent ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 dont dont PRQ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 spécificités spécificité NOM _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 15 vis vis NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 à à PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 vis vis NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 des de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 sites site NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 d' de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 acétylation acétylation NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 l' le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 histone histone NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 H3 H3 NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 sont être VRB _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 27 toutes tout DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 différentes différent ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-680 # text = Plus fréquemment , on trouve un tandem de bromodomaines . 1 Plus plus ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 fréquemment fréquemment ADV _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 on on CLS _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 5 trouve trouver VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 un un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 tandem tandem NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 bromodomaines brome NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-681 # text = C'est le cas chez les protéines TAFII250 et yRsc 4 . 1 C' ce CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 le le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 cas cas NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 chez chez PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 protéines protéine NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 TAFII250 TAFII250 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 yRsc yRsc NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 11 4 4 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-682 # text = Les structures cristallographiques de ces tandems révèlent que chaque bromodomaine interagit largement avec l'autre pour former un module ou les deux sites de fixation se trouvent l'un à côté de l'autre ( Jacobson et al. , 2000 ; VanDemark et al. , 2007 ) . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structures structure NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 cristallographiques cristallographique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 ces ce DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 tandems tandem NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 révèlent révéler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 que que CSU _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 chaque chaque DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 bromodomaine bromé NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 11 interagit interagir VRB _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 largement largement ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 avec avec PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 l' le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 autre autre PRQ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 pour pour PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 17 former former VNF _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 un un DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 module module NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 ou ou COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 21 les le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 22 deux deux NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 23 sites site NOM _ _ 27 subj _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 fixation fixation NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 se se CLI _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 27 trouvent trouver VRB _ _ 11 para _ _ _ _ _ 28 l' le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 un un PRQ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 à à côté de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 31 côté à côté de NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 de à côté de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 l' le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 autre autre PRQ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 ( ( PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 36 Jacobson Jacobson NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 37 et et COO _ _ 40 mark _ _ _ _ _ 38 al. al. ADV _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 , , PUNC _ _ 40 punc _ _ _ _ _ 40 2000 2000 NUM _ _ 36 para _ _ _ _ _ 41 ; ; PUNC _ _ 46 punc _ _ _ _ _ 42 VanDemark VanDemark NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 43 et et COO _ _ 44 mark _ _ _ _ _ 44 al. al. NOM _ _ 42 para _ _ _ _ _ 45 , , PUNC _ _ 46 punc _ _ _ _ _ 46 2007 2007 NUM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 47 ) ) PUNC _ _ 46 punc _ _ _ _ _ 48 . . PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-683 # text = D'autres modes ne sont pas exclus . 1 D' un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 autres autre ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 modes mode NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 4 ne ne ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 5 sont être VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 6 pas pas ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 exclus exclure VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-684 # text = Dans le cas des protéines BET par exemple , les bromodomaines sont séparés par une longue région , prédite pour être largement non structurée . 1 Dans dans PRE _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 2 le le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 cas cas NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 protéines protéine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 BET BET NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 exemple exemple NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 10 les le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 bromodomaines brome NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 12 sont être VRB _ _ 13 aux _ _ _ _ _ 13 séparés séparer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 par par PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 une un DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 16 longue long ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 région région NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 prédite prédire VPP _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 pour pour PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 être être VNF _ _ 24 aux _ _ _ _ _ 22 largement largement ADV _ _ 24 periph _ _ _ _ _ 23 non non ADV _ _ 24 periph _ _ _ _ _ 24 structurée structurer VPP _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-685 # text = Il est donc probable que , dans ce cas , les deux bromodomaines soient indépendants l'un de l'autre . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 donc donc ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 probable probable ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 7 dans dans PRE _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 8 ce ce DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 cas cas NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 12 deux deux NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 bromodomaines oromo NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 14 soient être VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 15 indépendants indépendant ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 l' l'un DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 un l'un PRQ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 l' le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 autre autre PRQ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-686 # text = Une unique étude a permis de décrire pour la première fois le repliement du domaine , de mettre en évidence sa capacité d'interagir spécifiquement avec une lysine acétylée ( Dhalluin et al. , 1999 ) . 1 Une un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 unique unique ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 étude étude NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 4 a avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 permis permettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 décrire décrire VNF _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 pour pour PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 10 première premier ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 fois fois NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 le le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 repliement repliement NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 14 du de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 domaine domaine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 mettre mettre VNF _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 en en PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 évidence évidence NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 sa son DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 capacité capacité NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 23 d' de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 interagir interagir VNF _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 spécifiquement spécifiquement ADV _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 avec avec PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 une un DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 lysine lysine NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 acétylée acétyle NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 ( ( PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 31 Dhalluin Dhalluin NOM _ _ 28 parenth _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 35 mark _ _ _ _ _ 33 al. al. ADV _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 , , PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 35 1999 1999 NUM _ _ 31 para _ _ _ _ _ 36 ) ) PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-687 # text = Les auteurs ont déterminé par RMN la structure atomique du bromodomaine de P / CAF et ont mesuré ses affinités pour différents peptides acétylés . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 auteurs auteur NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 ont avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 déterminé déterminer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 par par PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 RMN RMN NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 structure structure NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 atomique atomique ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 du de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 bromodomaine bromé NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 P P NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 / ou PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 15 CAF CAF NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 17 ont avoir VRB _ _ 18 aux _ _ _ _ _ 18 mesuré mesurer VPP _ _ 4 para _ _ _ _ _ 19 ses son DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 affinités affinité NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 pour pour PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 différents différent DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 peptides peptide NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 acétylés acétyle NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-688 # text = Ils ont ensuite montré l'importance des résidus V752 , Y760 , Y802 et Y809 pour l'interaction avec le peptide . 1 Ils ils CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 ont avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 3 ensuite ensuite ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 importance importance NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 des de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 résidus résidu NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 V752 V752 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 Y760 Y760 NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Y802 Y802 NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 Y809 Y809 NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 16 pour pour PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 17 l' le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 interaction interaction NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 avec avec PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 le le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 peptide peptide NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-689 # text = Depuis , de nombreuses autres structures de bromodomaines ont été déterminées par RMN ou par cristallographie aux rayons 1 Depuis depuis ADV _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 de un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 4 nombreuses nombreux ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 5 autres autre ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 structures structure NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 bromodomaines brome NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ont avoir VRB _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 été être VPP _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 déterminées déterminer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 par par PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 RMN RMN NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ou ou COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 par par PRE _ _ 12 para _ _ _ _ _ 16 cristallographie cristallographie NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 aux à PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 rayons rayons NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-690 # text = X. Les structures d'environ 25 bromodomaines différents sont actuellement disponibles [ Annexe 4B ] . 1 X. X. NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 2 Les Les DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 structures structure NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 environ environ ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 6 25 25 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 bromodomaines brome NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 différents différent ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 actuellement actuellement ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 disponibles disponible ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 [ ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Annexe Annexe NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 14 4B 4B NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 ] ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-691 # text = L'analyse de celles des bromodomaines de Brd 2 , Brd 3 , Brd 4 et Brdt-BD1 montre que leurs structures sont très similaires puisqu'elles présentent des r . 1 L' le CLI _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 analyse analyser VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 celles celui PRQ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 des un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 bromodomaines brome NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 Brd Brd NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 2 2 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 11 Brd Brd NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 3 3 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 14 Brd Brd NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 15 4 4 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 18 montre montrer VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 19 que que CSU _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 leurs son DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 structures structure NOM _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 22 sont être VRB _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 23 très très ADV _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 24 similaires similaire ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 puisqu' puisque CSU _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 26 elles elles CLS _ _ 27 subj _ _ _ _ _ 27 présentent présenter VRB _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 des un DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 r gramme NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-692 # text = m . s . 1 m Monsieur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 s ssh NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-693 # text = d ( déviations moyennes ) sur les C ? 1 d de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 déviations déviation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 moyennes moyen ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 sur sur PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 C C NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 ? ? PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-694 # text = allant de 0 , 3 à 0 , 6 Å environ . 1 allant allant NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 0 0 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 4 , 0 , 3 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 3 3 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 0 0 NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 8 , 0 , 6 PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 9 6 6 NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 Å Å NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 environ environ ADV _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-695 # text = Il existe relativement peu de structures qui permettent de visualiser l'interaction entre le bromodomaine et un peptide acétylé . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 existe exister VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 relativement relativement ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 peu peu ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 structures structure NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 qui qui PRQ _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 permettent permettre VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 visualiser visualiser VNF _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 l' le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 interaction interaction NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 entre entre PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 le le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 bromodomaine oromo NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 17 un un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 peptide peptide NOM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 19 acétylé acétyle NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-696 # text = Seules les structures en complexe des bromodomaines de la protéine de levure GCN5 ( Owen et al. , 2000 ) , celles des protéines humaines P / CAF 1 Seules seul ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 structures structure NOM _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 4 en en PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 complexe complexe NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 bromodomaines brome NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 protéine protéine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 levure levure NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 GCN5 GCN5 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 ( ( PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 Owen Owen NOM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 17 al. al. ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 2000 2000 NUM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 20 ) ) PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 22 celles celui PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 des de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 protéines protéine NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 humaines humain ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 P P NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 / ou PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 CAF CAF NOM _ _ 26 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-697 # text = ( Mujtaba et al. , 2002 ; Zeng et al. , 2008 ) et CBP ( Mujtaba et al. , 2004 ; Zeng et al. , 2008 ) et du double bromodomaine de la protéine de levure Rsc 4 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Mujtaba Mujtaba NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 6 2002 2002 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ; ; PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 8 Zeng Zeng NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 al. al. NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 12 2008 2008 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 CBP CBP NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 17 Mujtaba Mujtaba NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 19 al. al. NOM _ _ 17 para _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 21 2004 2004 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 22 ; ; PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 23 Zeng Zeng NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 25 al. al. NOM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 27 2008 2008 NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 28 ) ) PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 29 et et COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 30 du de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 31 double double ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 32 bromodomaine oromo NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 de de PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 la le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 protéine protéine NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 de de PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 levure levure NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 Rsc Rsc NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 4 4 NUM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-698 # text = ( VanDemark et al. , 2007 ) ont été publiées . 1 ( ( PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 2 VanDemark VanDemark NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2007 2007 NUM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 8 ont avoir VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 été être VPP _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 publiées publier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-699 # text = La structure du complexe yGCN 5 / H 4 acK 16 montre pour la première fois les détails structuraux de l'interaction entre la lysine acétylée et la cavité hydrophobe . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structure structure NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 complexe complexe NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 yGCN yGCN VPR _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 5 5 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 / sur PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 8 H H NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 4 4 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 acK acK ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 16 16 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 pour pour PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 15 première premier ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 fois fois NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 les le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 détails détail NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 19 structuraux structural ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 l' le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 interaction interaction NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 entre entre PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 lysine lysine NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 acétylée acétyle NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 29 mark _ _ _ _ _ 28 la le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 cavité cavité NOM _ _ 25 para _ _ _ _ _ 30 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-700 # text = Elle met notamment en évidence l'existence d'une liaison hydrogène entre le groupe acétyle de la lysine reconnue et une asparagine ( N407 ) conservée chez la grande majorité des bromodomaines . 1 Elle elle CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 met mettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 notamment notamment ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 en en PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 évidence évidence NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 existence existence NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 d' de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 une un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 liaison liaison NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 hydrogène hydrogène NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 entre entre PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 le le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 groupe groupe NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 acétyle acétyle NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 lysine lysine NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 reconnue reconnaître ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 21 une un DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 asparagine asparagine NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 N407 N407 NOM _ _ 22 parenth _ _ _ _ _ 25 ) ) PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 26 conservée conserver VPP _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 27 chez chez PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 la le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 29 grande grand ADJ _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 30 majorité majorité NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 31 des un DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 bromodomaines brome NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-701 # text = Ces quatre complexes montrent qu'il existe , outre la reconnaissance de la lysine acétylée , des interactions entre les boucles ZA et BC de séquences très variables et les résidus adjacents à la lysine acétylée . 1 Ces ce DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 quatre quatre NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 complexes complexe NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 montrent montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 qu' que CSU _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 il il CLS _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 7 existe exister VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 outre outre PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 lysine lysine NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 acétylée acétyle NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 17 des un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 interactions interaction NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 19 entre entre PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 les le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 boucles boucle NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 ZA ZA NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 24 BC BC NOM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 26 séquences séquence NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 très très ADV _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 28 variables variable ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 et et COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 30 les le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 résidus résidu NOM _ _ 24 para _ _ _ _ _ 32 adjacents adjacent ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 à à PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 la le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 lysine lysine NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 acétylée acétyle NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-702 # text = Ces interactions permettent de toute évidence aux bromodomaines d'acquérir une spécificité vis à vis des différents sites d'acétylation . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 interactions interaction NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 permettent permettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 toute tout DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 évidence évidence NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 aux à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 bromodomaines brome NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 10 acquérir acquérir VNF _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 une un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 spécificité spécificité NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 vis vis NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 vis vis NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 des de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 différents différent ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 sites site NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 d' de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 acétylation acétylation NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-703 # text = Le site de liaison de la lysine acétylée est formé par une cavité qui existe avant la fixation du ligand . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 site site NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 liaison liaison NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 lysine lysine NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 acétylée acétyle NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 est être VRB _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 formé former VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 par par PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 une un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 cavité cavité NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 qui qui PRQ _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 15 existe exister VRB _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 avant avant PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 fixation fixation NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 du de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 ligand ligand NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-704 # text = Cela fait de lui une cible potentielle pour de petites molécules bloquant l'interaction entre le bromodomaine et son ligand . 1 Cela cela PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 fait faire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 lui lui PRQ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 une un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 cible cible NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 potentielle potentiel ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 9 de un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 10 petites petit ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 molécules molécule NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 bloquant bloquer VPR _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 l' le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 interaction interaction NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 entre entre PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 le le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 bromodomaine oromo NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 19 son son DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 ligand ligand NOM _ _ 17 para _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-705 # text = Ainsi des inhibiteurs sélectifs de l'interaction entre le bromodomaine de P / CAF et le peptide HIV- 1 Tat-K 50 ac ( Zeng et al. , 2005 ) et de l'interaction entre CBP et le peptide P 53 -K 382 ac ( Sachchidanand et al. , 2006 ) ont été développés . 1 Ainsi ainsi ADV _ _ 53 periph _ _ _ _ _ 2 des un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 inhibiteurs inhibiteur NOM _ _ 53 subj _ _ _ _ _ 4 sélectifs sélectif ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 interaction interaction NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 entre entre PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 le le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 bromodomaine bromé NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 P P NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 / sur PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 14 CAF CAF NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 16 le le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 peptide peptide NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 18 HIV- HIV- NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 1 1 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 Tat-K Tat-K NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 50 50 NUM _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 ac ace NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 Zeng Zeng NOM _ _ 12 parenth _ _ _ _ _ 25 et et COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 26 al. Al NOM _ _ 24 para _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 28 2005 2005 NUM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 ) ) PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 30 et et COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 31 de de PRE _ _ 5 para _ _ _ _ _ 32 l' le DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 interaction interaction NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 entre entre PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 CBP CBP NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 et et COO _ _ 38 mark _ _ _ _ _ 37 le le DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 peptide peptide NOM _ _ 35 para _ _ _ _ _ 39 P P NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 53 53 NUM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 -K -K VPR _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 42 382 382 NUM _ _ 43 spe _ _ _ _ _ 43 ac ace NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 44 ( ( PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 45 Sachchidanand Sachchidanand NOM _ _ 43 parenth _ _ _ _ _ 46 et et COO _ _ 49 mark _ _ _ _ _ 47 al. al. ADV _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 49 2006 2006 NUM _ _ 45 para _ _ _ _ _ 50 ) ) PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 51 ont avoir VRB _ _ 52 aux _ _ _ _ _ 52 été être VPP _ _ 53 aux _ _ _ _ _ 53 développés développer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 54 . . PUNC _ _ 53 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-706 # text = Ces molécules se fixent à l'entrée de la cavité , principalement en contact avec des résidus variables de la boucles ZA . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 molécules molécule NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 se se CLI _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 fixent fixer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 entrée entrée NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 cavité cavité NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 12 principalement principalement ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 en en PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 14 contact contact NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 avec avec PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 des un DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 résidus résidu NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 variables variable ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 de de+le PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 la de+le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 boucles boucle NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 ZA ZA NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-707 # text = Cela leur permet d'être spécifiques de l'un ou l'autre des bromodomaines . 1 Cela cela PRQ _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 leur le CLI _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 permet permettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 être être VNF _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 spécifiques spécifique ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 un un PRQ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 ou ou COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 11 l' l'autre DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 autre l'autre PRQ _ _ 9 para _ _ _ _ _ 13 des un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 bromodomaines oromo NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-708 # text = F . Déroulement du travail de thèse 1 F f NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Déroulement Déroulement NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 travail travail NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 thèse thèse NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-709 # text = Le projet a débuté suite à la cristallisation de Brdt-BD2 en complexe avec le peptide H 4 -K 12 ac et au constat que ce peptide ne montrait pas d'affinité mesurable par ITC pour Brdt-BD2 . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 projet projet NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 a avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 débuté débuter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 suite suite à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 à suite à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 cristallisation cristallisation NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 Brdt-BD2 Brdt-BD2 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 en en PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 complexe complexe NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 avec avec PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 14 le le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 peptide peptide NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 H H NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 4 4 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 -K -K VPR _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 12 12 NUM _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 ac ace NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 22 au à PRE _ _ 13 para _ _ _ _ _ 23 constat constat NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 que que CSU _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 ce ce DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 peptide peptide NOM _ _ 28 subj _ _ _ _ _ 27 ne ne ADV _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 28 montrait montrer VRB _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 29 pas pas ADV _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 d' de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 affinité affinité NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 mesurable mesurable ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 par par PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 ITC ITC NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 pour pour PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 36 Brdt-BD2 Brdt-BD2 NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-710 # text = Nous avons ensuite entrepris d'identifier la spécificité de chacun des bromodomaines de Brdt pour les queues 1 Nous nous CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 3 ensuite ensuite ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 entrepris entreprendre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 d' de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 identifier identifier VNF _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 spécificité spécificité NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 chacun chacun PRQ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 des un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 bromodomaines brome NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 Brdt Brdt NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 pour pour PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 queues queue NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-711 # text = N terminales acétylées des histones H4 et H3 . 1 N numéro NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 terminales terminal ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 acétylées acétyle NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 histones histone NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 H4 H4 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 8 H3 H3 NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-712 # text = Nous avons également déterminé l'impact de la mutation de K61Q de BD1 sur la fixation de son ligand . 1 Nous nous CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 3 également également ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 déterminé déterminer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 impact impact NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 mutation mutation NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 K61Q K61Q NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 BD1 BD1 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 sur sur PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 fixation fixation NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 son son DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 ligand ligand NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-713 # text = Ces travaux se sont accompagnés de la résolution par cristallographie aux rayons 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 travaux travail NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 se se CLI _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 sont être VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 accompagnés accompagner VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 résolution résolution NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 par par PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 cristallographie cristallographie NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 aux à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 rayons rayons NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-714 # text = X des structures de Brdt-BD1 et Brdt-BD2 en complexe avec différents peptides acétylés . 1 X x PRQ _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 2 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 structures structure NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 Brdt-BD2 Brdt-BD2 NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 8 en le CLI _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 complexe complexer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 avec avec PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 différents différent DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 peptides peptide NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 acétylés acétyle NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-715 # text = Partie II : 1 Partie partie NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 II II ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-716 # text = Matériels et Méthodes 1 Matériels matériel NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 Méthodes Méthodes NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-717 # text = Matériels et Méthodes 1 Matériels matériel NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 Méthodes Méthodes NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-718 # text = A . Production des protéines 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Production Production NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 protéines protéine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-719 # text = I. Clonage 1 I. I. NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 Clonage Clonage NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-720 # text = Les protéines ? 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 protéines protéine NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ? ? PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-721 # text = CBrdt , BD1 , BD2 et BD1-K62Q [ Tableau 3 ] dérivent de l'ADNc de la protéine Brdt de souris ( référence GenBank : AF019085 ) fourni par nos collaborateurs . 1 CBrdt CBrdt NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 BD1 BD1 NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 BD2 BD2 NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 BD1-K62Q BD1-K62Q NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 8 [ ( PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 9 Tableau Tableau NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 3 3 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 ] ) PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 12 dérivent dériver VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 l' le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 ADNc ADNc NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 protéine protéine NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 Brdt Brdt NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 souris souris NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 23 référence référence NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 GenBank GenBank NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 : : PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 26 AF019085 AF019085 NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 27 ) ) PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 28 fourni fournir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 29 par par PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 nos son DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 collaborateurs collaborateur NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-722 # text = Le clonage des fragments codants pour les protéines 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 clonage clonage NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 fragments fragment NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 codants codant ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 pour pour PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 protéines protéine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-723 # text = ? 1 ? ? PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-724 # text = CBrdt et BD2 a été réalisé par M. Soler dans un vecteur d'expression conçu dans le cadre d'un projet de cristallisation à haut débit . 1 CBrdt CBrdt NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 BD2 BD2 NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 4 a avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 été être VPP _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 réalisé réaliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 par par PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 M. monsieur NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 Soler Soler NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 un un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 vecteur vecteur NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 d' de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 expression expression NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 conçu concevoir VPP _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 dans dans PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 le le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 cadre cadre NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 d' de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 un un DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 projet projet NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 cristallisation cristallisation NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 à à PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 haut haut ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 26 débit débit NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-725 # text = Ce vecteur ( pHAR 1201 ) permet d'obtenir les protéines en fusion avec une queue de six histidines , clivable grâce à la présence d'un site de reconnaissance pour la protéase TEV ( Tobaco Each Virus ) . 1 Ce ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 vecteur vecteur NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 pHAR pHAR NOM _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 5 1201 1201 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 7 permet permettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 d' de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 obtenir obtenir VNF _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 les le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 protéines protéine NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 en en PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 fusion fusion NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 avec avec PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 15 une un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 queue queue NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 six six NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 histidines histidine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 clivable clivable ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 22 grâce grâce à PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 23 à grâce à PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 présence présence NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 d' de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 un un DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 site site NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 pour pour PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 32 la le DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 protéase protéase NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 TEV TEV NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 ( tev ( tobaco each virus ) PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 36 Tobaco Tobaco NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 37 Each Each NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 38 Virus Virus NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 39 ) tev ( tobaco each virus ) PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 40 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-726 # text = Les protéines 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 protéines protéine NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-727 # text = BD1 et BD1-K62Q ont été obtenues par l'amplification des résidus indiqués dans le tableau 3 . 1 BD1 BD1 NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 BD1-K62Q BD1-K62Q NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 4 ont avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 été être VPP _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 obtenues obtenir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 par par PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 amplification amplification NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 résidus résidu NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 indiqués indiquer VPP _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 dans dans PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 le le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 tableau tableau NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 3 3 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-728 # text = Les oligonucléotides utilisés pour les réactions de PCR ( Polymerisation Chain Reaction ) sont indiqués dans le tableau 4 . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 oligonucléotides oligonucléotides NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 3 utilisés utiliser VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 réactions réaction NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 PCR PCR NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ( pcr ( polymerisation chain reaction ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 10 Polymerisation Polymerisation NOM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 11 Chain Chain NOM _ _ 10 para _ _ _ _ _ 12 Reaction Reaction NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 13 ) pcr ( polymerisation chain reaction ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 sont être VRB _ _ 15 aux _ _ _ _ _ 15 indiqués indiquer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 dans dans PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 le le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 tableau tableau NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 4 4 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-729 # text = Chaque insert a été digéré par l'enzyme de restriction BsaI , NcoI ou FatI en 5 'et Acc 65I en 3 'et inséré dans un vecteur pETM 11 préalablement linéarisé par la digestion des enzymes NcoI et Acc 65I . 1 Chaque chaque ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 insert in- _+V _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 été être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 digéré digérer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 l' le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 enzyme enzyme NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 restriction restriction NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 BsaI BsaI NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 NcoI NcoI NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 14 ou ou COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 FatI FatI NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 16 en en PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 17 5 5 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ' ' PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 20 Acc Acc NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 21 65I 65I NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 en en PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 23 3 3 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 ' ' PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 25 et et COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 26 inséré insérer VPP _ _ 5 para _ _ _ _ _ 27 dans dans PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 un un DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 vecteur vecteur NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 pETM pETM ADJ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 11 11 NUM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 préalablement préalablement ADV _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 33 linéarisé linéarisé ADJ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 34 par par PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 35 la le DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 digestion digestion NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 des de PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 enzymes enzyme NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 NcoI NcoI NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 et et COO _ _ 41 mark _ _ _ _ _ 41 Acc Acc NOM _ _ 39 para _ _ _ _ _ 42 65I 65I NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 43 . . PUNC _ _ 42 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-730 # text = Les protéines de fusion obtenues possèdent une étiquette six histidines clivable par la protéase TEV . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 protéines protéine NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 fusion fusion NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 obtenues obtenir ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 possèdent posséder VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 une un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 étiquette étiquette NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 six six NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 histidines histidine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 clivable clivable ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 par par PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 protéase protéase NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 TEV TEV NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-731 # text = Tableau 3 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 3 3 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-732 # text = Constructions de Brdt utilisées pendant la thèse 1 Constructions construction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 Brdt Brdt NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 utilisées utiliser VPP _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 pendant pendant PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 thèse thèse NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-733 # text = Tableau 4 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-734 # text = Oligonucléotides utilisés pour les clonages de BD1 1 Oligonucléotides Oligonucléotides NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 utilisés utiliser VPP _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 clonages clonage NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 BD1 BD1 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-735 # text = II . Expression 1 II ii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Expression Expression NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-736 # text = La protéine ? 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 protéine protéine NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ? ? PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-737 # text = CBrdt a été produite par des cellules bactériennes BL21-AI 1 CBrdt CBrdt NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 a avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 été être VPP _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 produite produire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 par par PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 des un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 cellules cellule NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 bactériennes bactérien ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 BL21-AI BL21-AI NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-738 # text = ( Arabinose Induicible ) dont l'induction a été réalisée par l'ajout de 2 % d'arabinose dans le milieu de culture et mise en culture pendant une nuit à 18 °C. Les protéines BD1 , BD2 et BD1-K62Q ont été produites par des bactéries BL21-DE3 après induction par 0 , 4 mM d'IPTG et mise en culture à 18 - 25 °C pendant une nuit . 1 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 2 Arabinose Arabinose NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 Induicible Induicible NOM _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 4 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 dont dont PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 induction induction NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 8 a avoir VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 été être VPP _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 réalisée réaliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 par par PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 l' le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 ajout ajout NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 2 2 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 % pourcent NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 d' de ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 arabinose de NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 dans dans PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 20 le le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 milieu milieu NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 culture culture NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 25 mise mettre VPP _ _ 22 para _ _ _ _ _ 26 en en PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 culture culture NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 pendant pendant PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 29 une un DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 nuit nuit NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 à à PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 32 18 18 NUM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 °C. °C. VPR _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 Les Les DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 protéines protéine NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 BD1 BD1 NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 , , PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 38 BD2 BD2 NOM _ _ 43 subj _ _ _ _ _ 39 et et COO _ _ 40 mark _ _ _ _ _ 40 BD1-K62Q BD1-K62Q NOM _ _ 38 para _ _ _ _ _ 41 ont avoir VRB _ _ 42 aux _ _ _ _ _ 42 été être VPP _ _ 43 aux _ _ _ _ _ 43 produites produire VPP _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 44 par par PRE _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 des un DET _ _ 46 spe _ _ _ _ _ 46 bactéries bactérie NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 47 BL21-DE3 BL21-DE3 NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 après après PRE _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 49 induction induction NOM _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 par par PRE _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 51 0 0 NUM _ _ 53 spe _ _ _ _ _ 52 , 0 , 4 PUNC _ _ 51 punc _ _ _ _ _ 53 4 4 NUM _ _ 54 spe _ _ _ _ _ 54 mM millimètre NOM _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 55 d' de PRE _ _ 54 dep _ _ _ _ _ 56 IPTG IPTG NOM _ _ 55 dep _ _ _ _ _ 57 et et COO _ _ 58 mark _ _ _ _ _ 58 mise mettre VPP _ _ 55 para _ _ _ _ _ 59 en en PRE _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 60 culture culture NOM _ _ 59 dep _ _ _ _ _ 61 à à PRE _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 62 18 18 NUM _ _ 64 spe _ _ _ _ _ 63 - 18 - 25 PUNC _ _ 64 punc _ _ _ _ _ 64 25 25 NUM _ _ 65 spe _ _ _ _ _ 65 °C degré NOM _ _ 61 dep _ _ _ _ _ 66 pendant pendant PRE _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 67 une un DET _ _ 68 spe _ _ _ _ _ 68 nuit nuit NOM _ _ 66 dep _ _ _ _ _ 69 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-739 # text = III . Purification 1 III iii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Purification Purification NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-740 # text = Les protéines ont été purifiées selon le même protocole , comprenant 6 étapes : 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 protéines protéine NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 ont avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 été être VPP _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 purifiées purifier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 selon selon PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 8 même même ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 protocole protocole NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 comprenant comprendre VPR _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 6 6 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 étapes étape NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 : : PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-741 # text = 1 . Lyse des cellules par sonication ; 1 1 1 NUM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Lyse Lyse NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 cellules cellule NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 sonication sonication NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 ; ; PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-742 # text = ultracentrifugation ( 30 minutes à 20 1 ultracentrifugation ultracentrifugation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 30 30 NUM _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 minutes minute NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 20 20 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-743 # text = 000 g ) ; 1 000 000 NUM _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 g gramme NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 ; ; PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-744 # text = récupération du surnageant 1 récupération récupération NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 du de+le PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 surnageant surnager NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-745 # text = 2 . Première purification d'affinité sur des colonnes de sépharose couplée à du nickel ou du cobalt & 226;& 128;& 147; Lavage abondant & 226;& 128;& 147; Elution par un gradient d'imidazole 1 2 2 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Première Première ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 purification purification NOM _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 5 d' de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 affinité affinité NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 sur sur PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 des un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 colonnes colonne NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 sépharose sépharose NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 couplée coupler VPP _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 du de+le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 nickel nickel NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 ou ou COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 du de PRE _ _ 10 para _ _ _ _ _ 18 cobalt cobalt NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 – – ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 Lavage Lavage NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 abondant abondant ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 – – VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 Elution Elution NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 par par PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 un un DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 gradient gradient NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 d' de ADV _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 imidazole de NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-746 # text = 3 . Elimination de l'imidazole et clivage de la queue six histidines par ajout de la protéase TEV dans l'éluat et mise en dialyse pendant une nuit 1 3 3 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Elimination Elimination NOM _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le NOM _ _ 6 det _ _ _ _ _ 6 imidazole le NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 8 clivage clivage NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 queue queue NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 six six NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 histidines histidine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 par par PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 ajout ajout NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 protéase protéase NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 TEV TEV NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 dans dans PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 l' le D+N+V _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 22 éluat le PRO+N+V _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 24 mise miser VRB _ _ 22 para _ _ _ _ _ 25 en en PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 dialyse dialyse NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 pendant pendant PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 28 une un DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 nuit nuit NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-747 # text = 4 . Seconde purification d'affinité pour éliminer les protéines non clivées et la protéase ( qui porte une queue six histidines ) & 226;& 128;& 147; récupération directe de l'éluat ou suite à un léger gradient d'imidazole 1 4 4 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Seconde Seconde ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 purification purification NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 d' de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 affinité affinité NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 pour pour PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 éliminer éliminer VNF _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 protéines protéine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 non non ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 clivées cliver ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 protéase protéase NOM _ _ 10 para _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 17 qui qui PRQ _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 18 porte porter VRB _ _ 15 parenth _ _ _ _ _ 19 une un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 queue queue NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 six six NUM _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 histidines histidine NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 24 – – ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 récupération récupération NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 directe direct ADJ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 l' le D+N+V _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 29 éluat le PRO+N+V _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 ou ou COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 31 suite suite NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 32 à à PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 un un DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 34 léger léger ADJ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 35 gradient gradient NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 36 d' de ADV _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 imidazole de NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-748 # text = 5 . Chromatographie d'exclusion sur gel par chromatographie liquide de haute pression & 226;& 128;& 147; récupération du pic correspondant à la protéine pure 1 5 5 NUM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Chromatographie Chromatographie NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 exclusion exclusion NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 sur sur PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 gel gel NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 par par PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 chromatographie chromatographie NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 liquide liquider VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 haute haut ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 pression pression NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 – – ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 récupération récupération NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 du de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 pic pic NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 correspondant correspondre VPR _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 à à PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 protéine protéine NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 pure pur ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-749 # text = Vue la grande quantité de protéine necessaire pour les expériences de microcalorimètrie et de cristallographie ( plusieurs dizaines de mg ) , nous avons utilisé des moyens permettant une automatisation importante . 1 Vue voir VPP _ _ 25 periph _ _ _ _ _ 2 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 3 grande grand ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 quantité quantité NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 protéine protéine NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 necessaire necessaire ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 pour pour PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 expériences expérience NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 microcalorimètrie microcalorimétrie NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 11 para _ _ _ _ _ 15 cristallographie cristallographie NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 17 plusieurs plusieurs DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 dizaines dizaine NOM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 mg milligramme NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 ) ) PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 23 nous nous CLS _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 24 avons avoir VRB _ _ 25 aux _ _ _ _ _ 25 utilisé utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 des un DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 moyens moyens NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 permettant permettre VPR _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 une un DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 automatisation automatisation NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 importante important ADJ _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-750 # text = Les purifications d'affinité ont été réalisées sur des colonnes à forte capacité de fixation HiTrap ( Amersham ) chélatées avec du nickel ou du cobalt en utilisant le système de chromatographie à basse pression 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 purifications purification NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 affinité affinité NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ont avoir VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 été être VPP _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 réalisées réaliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 sur sur PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 des un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 colonnes colonne NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 à à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 forte fort ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 capacité capacité NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 fixation fixation NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 16 HiTrap HiTrap NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 ( ( PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 Amersham Amersham NOM _ _ 15 parenth _ _ _ _ _ 19 ) ) PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 20 chélatées Che NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 21 avec avec PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 22 du de+le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 nickel nickel NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 ou ou COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 25 du de PRE _ _ 21 para _ _ _ _ _ 26 cobalt cobalt NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 en en PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 28 utilisant utiliser VPR _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 le le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 système système NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 de de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 chromatographie chromatographie NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 à à PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 basse bas ADJ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 35 pression pression NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-751 # text = AKTAprime . 1 AKTAprime AKTAprime NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-752 # text = Celui -ci permet de réaliser l'injection du lysat sur la colonne , les lavages , la réalisation du gradient d'imidazole et la collection de l'éluat par fractions de façon automatique tout en suivant l'évolution de la densité optique à 280 nm . 1 Celui celui PRQ _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 -ci -ci ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 permet permettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 réaliser réaliser VNF _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 injection injection NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 lysat lysat NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 sur sur PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 colonne colonne NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 14 les le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 lavages lavage NOM _ _ 28 subj _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 réalisation réalisation NOM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 19 du de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 gradient gradient NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 d' de ADV _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 imidazole de NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 collection collection NOM _ _ 18 para _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 l' le D+N+V _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 28 éluat le PRO+N+V _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 29 par par PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 fractions fraction NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 de de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 façon façon NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 automatique automatique ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 tout tout ADJ _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 en en PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 36 suivant suivre VPR _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 l' le DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 évolution évolution NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 de de PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 la le DET _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 41 densité densité NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 optique optique ADJ _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 à à PRE _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 44 280 280 NUM _ _ 45 spe _ _ _ _ _ 45 nm minute NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 46 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-753 # text = La chomatographie d'exclusion de taille a été réalisée sur des colonnes Superdex 75 ( pour 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 chomatographie chomatographie NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 exclusion exclusion NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 taille taille NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 a avoir VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 été être VPP _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 réalisée réaliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 sur sur PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 des un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 colonnes colonne NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 Superdex Superdex NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 75 75 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 ( ( PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 16 pour pour PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-754 # text = BD1 et BD2 ) ou Superdex 200 ( pour ? CBrdt ) en utilisant un système à haute pression Aktapurifier permettant de réaliser une vingtaine de cycles d'injection / élution sur la colonne et de collecter les fractions correspondant au pic de protéine de façon automatique . 1 BD1 BD1 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 BD2 BD2 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 ou ou COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 6 Superdex Superdex NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 7 200 200 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 9 pour pour PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 ? ? PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 CBrdt CBrdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 13 en le CLI _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 utilisant utiliser VPR _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 un un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 système système NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 à à PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 haute haut ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 pression pression NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 Aktapurifier Aktapurifier NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 permettant permettre VPR _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 réaliser réaliser VNF _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 une un DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 vingtaine vingtaine NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 cycles cycle NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 d' de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 injection injection NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 / / PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 31 élution élution NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 32 sur sur PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 la le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 colonne colonne NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 et et COO _ _ 36 mark _ _ _ _ _ 36 de de PRE _ _ 31 para _ _ _ _ _ 37 collecter collecter VNF _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 les le DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 fractions fraction NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 correspondant correspondre VPR _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 au à PRE _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 pic pic NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 de de PRE _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 protéine protéine NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 de de PRE _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 façon façon NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 automatique automatique ADJ _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 . . PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-755 # text = Pour limiter les dégagements de chaleur dus à la dilution de la solution tampon lors des expériences d'ITC , les solutions tampon ne contiennent pas de Tris et le DTT est eliminé lors de l'étape de chromatographie d'exclusion . 1 Pour pour PRE _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 limiter limiter VNF _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 les le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 dégagements dégagement NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 chaleur chaleur NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 dus devoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 dilution dilution NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de+le PRE _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 12 la de+le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 solution solution NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 tampon tampon NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 lors lors de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 16 des lors de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 expériences expérience NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 d' de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 ITC ITC NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 21 les le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 solutions solution NOM _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 23 tampon tampon NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 ne ne ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 contiennent contenir VRB _ _ 7 para _ _ _ _ _ 26 pas pas ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 de un DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 Tris Tris NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 29 et et COO _ _ 33 mark _ _ _ _ _ 30 le le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 DTT DTT NOM _ _ 33 subj _ _ _ _ _ 32 est être VRB _ _ 33 aux _ _ _ _ _ 33 eliminé éliminer VPP _ _ 25 para _ _ _ _ _ 34 lors lors de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 de lors de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 l' le DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 étape étape NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 de de PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 chromatographie chromatographie NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 d' de PRE _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 exclusion exclusion NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-756 # text = La composition des solutions tampons est indiquée ci-dessous [ Tableau 5 ] . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 composition composition NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 solutions solution NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 tampons tampon NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 est être VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 indiquée indiquer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 ci-dessous ci-dessous ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 [ ( PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 Tableau Tableau NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 5 5 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 ] ) PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-757 # text = Tableau 5 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 5 5 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-758 # text = Composition des solutions tampon utilisées lors de la purification des protéines . 1 Composition composition NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 solutions solution NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 tampon tampon NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 utilisées utiliser VPP _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 lors lors de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de lors de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 purification purification NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 protéines protéine NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-759 # text = IV . Concentration et conservation 1 IV iv NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Concentration Concentration NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 conservation conservation NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-760 # text = Les protéines pures ont été concentrées par centrifugation sur membrane de cellulose jusqu'à une concentration voisine de 40 mg / mL puis congelées par immersion dans un bain d'azote liquide . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 protéines protéine NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 pures pur ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ont avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 été être VPP _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 concentrées concentrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 par par PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 centrifugation centrifugation NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 sur sur PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 membrane membrane NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 cellulose cellulose NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 jusqu'à jusqu'à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 14 une un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 concentration concentration NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 voisine voisin ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 40 40 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 mg milligramme NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 / ou PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 21 mL millilitre NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 22 puis puis COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 23 congelées congeler VPP _ _ 6 para _ _ _ _ _ 24 par par PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 immersion immersion NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 dans dans PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 27 un un DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 bain bain NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 d' de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 azote azote NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 liquide liquide ADJ _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-761 # text = L'intégrité des protéines après congélation a été vérifiée par diffusion dynamique de lumière et par le maintien de la capacité de BD2 à cristalliser . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 intégrité intégrité NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 protéines protéine NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 après après PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 congélation congélation NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 a avoir VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 été être VPP _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 vérifiée vérifier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 par par PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 diffusion diffusion NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 dynamique dynamique ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 lumière lumière NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 16 par par PRE _ _ 13 para _ _ _ _ _ 17 le le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 maintien maintien NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 capacité capacité NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 BD2 BD2 NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 à à PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 25 cristalliser cristalliser VNF _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-762 # text = B . Diffusion statique de lumière 1 B b NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Diffusion Diffusion NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 statique statique ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 lumière lumière NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-763 # text = Pour étudier l'état oligomèrique des protéines nous avons utilisé une technique couplant la diffusion statique de lumière à angles multiples 1 Pour pour PRE _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 étudier étudier VNF _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 l' le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 état état NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 oligomèrique oligomèrique ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 protéines protéine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 nous nous CLS _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 9 avons avoir VRB _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 utilisé utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 une un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 technique technique ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 couplant coupler VPR _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 diffusion diffusion NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 statique statique ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 lumière lumière NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 à à PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 angles angle NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 multiples multiple ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-764 # text = ( MALLS ) et la chromatographie d'exclusion à haute pression . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 MALLS MALLS NOM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 chromatographie chromatographie NOM _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 7 d' de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 exclusion exclusion NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 haute haut ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 pression pression NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-765 # text = En premier lieu , la chromatographie d'exclusion permet de séparer les molécules selon leur volume hydrodynamique . 1 En en PRE _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 premier premier ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 lieu lieu NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 chromatographie chromatographie NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 7 d' de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 exclusion exclusion NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 permet permettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 séparer séparer VNF _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 molécules molécule NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 selon selon PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 leur son DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 volume volume NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 hydrodynamique hydrodynamique ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-766 # text = Ensuite la diffusion statique de lumière qui utilise le fait que l'intensité de la lumière diffusée par une solution est directement proportionnelle à la masse moléculaire moyenne de l'ensemble de ses composants permet de déterminer la masse moléculaire absolue des molécules de chaque pic ( Wyatt , 1993 ) . 1 Ensuite ensuite ADV _ _ 35 periph _ _ _ _ _ 2 la le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 diffusion diffusion NOM _ _ 35 subj _ _ _ _ _ 4 statique statique ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 lumière lumière NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 qui qui PRQ _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 utilise utiliser VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 le le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 fait fait NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 que que CSU _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 l' le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 intensité intensité NOM _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 lumière lumière NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 diffusée diffuser VPP _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 par par PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 une un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 solution solution NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 est être VRB _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 22 directement directement ADV _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 proportionnelle proportionnel ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 à à PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 la le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 masse masse NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 moyenne moyen ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 30 l' le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 ensemble ensemble NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 de de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 ses son DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 composants composant NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 permet permettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 36 de de PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 déterminer déterminer VNF _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 la le DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 masse masse NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 absolue absolu ADJ _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 des de PRE _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 43 molécules molécule NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 de de PRE _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 chaque chaque DET _ _ 46 spe _ _ _ _ _ 46 pic pic NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 47 ( ( PUNC _ _ 48 punc _ _ _ _ _ 48 Wyatt Wyatt NOM _ _ 43 parenth _ _ _ _ _ 49 , , PUNC _ _ 50 punc _ _ _ _ _ 50 1993 1993 NUM _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 51 ) ) PUNC _ _ 48 punc _ _ _ _ _ 52 . . PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-767 # text = Nous avons pour cela utilisé une colonne de chromatographie d'exclusion de taille couplée à un réfractomètre . 1 Nous nous CLS _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 3 pour pour PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 cela cela PRQ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 utilisé utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 une un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 colonne colonne NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 chromatographie chromatographie NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 d' de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 exclusion exclusion NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 taille taille NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 couplée coupler VPP _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 à à PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 un un DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 réfractomètre réfractomètre NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-768 # text = Les expériences de MALLS sur BD1 et BD2 ont été réalisées avec les constructions BD 1 SI- 2 et BD 2 A 12 dans un tampon constitué de 20 mM Tris pH 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 expériences expérience NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 MALLS MALLS NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 sur sur PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 BD1 BD1 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 8 BD2 BD2 NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 9 ont avoir VRB _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 été être VPP _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 réalisées réaliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 avec avec PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 constructions construction NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 BD BD NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 1 1 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 SI- SI- NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 2 2 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 20 BD BD NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 21 2 2 NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 A A PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 23 12 12 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 dans dans PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 25 un un DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 tampon tampon NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 constitué constituer ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 20 20 NUM _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 mM millimètre NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 Tris Tris NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 pH pH NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-769 # text = 8 , 0 , 250 mM NaCl , 1   mM DTT . 1 8 8 NUM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 0 0 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 4 , 0 , 250 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 250 250 NUM _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 mM millimètre NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 NaCl NaCl NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 9 1 1 NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10   1   DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 mM mM NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 DTT DTT NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-770 # text = Les expériences sur ? 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 expériences expérience NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 sur sur ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ? ? PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-771 # text = CBrdt ont été réalisées avec la construction SP6 à 8 mg / mL dans un tampon contenant 100 mM NaCl et 10 mM Hepes pH 8 , 0 . 1 CBrdt CBrdt NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 ont avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 été être VPP _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 réalisées réaliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 avec avec PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 construction construction NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 SP6 SP6 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 à à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 8 8 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 mg milligramme NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 / sur PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 13 mL millilitre NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 dans dans PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 15 un un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 tampon tampon NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 contenant contenir VPR _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 100 100 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 mM millimètre NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 NaCl NaCl NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 22 10 10 NUM _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 mM millimètre NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 24 Hepes Hepes NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 pH pH NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 8 8 NUM _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 27 , 8 , 0 PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 28 0 0 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-772 # text = C . Réticulation chimique 1 C c NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Réticulation Réticulation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 chimique chimique ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-773 # text = Le principe de la réticulation chimique est de créer un lien covalent entre deux groupements fonctionnels d'une molécule biologique par l'intermédiaire d'un agent réticulant . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 principe principe NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 réticulation réticulation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 chimique chimique ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 est est NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 créer créer VNF _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 un un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 lien lien NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 covalent co- VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 entre entre PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 deux deux NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 groupements groupement NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 fonctionnels fonctionnel ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 d' de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 une un DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 molécule molécule NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 biologique biologique ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 par par PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 l' le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 intermédiaire intermédiaire NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 d' de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 un un DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 agent agent NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 réticulant articuler VPR _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-774 # text = L'agent réticulant est caractérisé par ses groupements fonctionnels ( qui vont réaliser le lien covalent ) et par la longueur de la chaîne carbonée qui sépare les groupements fonctionnels . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 agent agent NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 réticulant articuler VPR _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 est être VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 caractérisé caractériser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 ses son DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 groupements groupement NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 fonctionnels fonctionnel ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 ( ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 11 qui qui PRQ _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 12 vont aller VRB _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 13 réaliser réaliser VNF _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 le le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 lien lien NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 covalent co- VRB _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 17 ) ) PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 18 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 19 par par PRE _ _ 6 para _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 longueur longueur NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 chaîne chaîne NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 carbonée carboné ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 qui qui PRQ _ _ 27 subj _ _ _ _ _ 27 sépare séparer VRB _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 28 les le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 groupements groupement NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 fonctionnels fonctionnel ADJ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-775 # text = Nous avons utilisé le sulfo-EGS [ Figure 14 ] dont les deux groupements réactifs , espacés de 16 Å , réagissent sur la fonction amine terminale et sur les amines ? 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 utilisé utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 le le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 sulfo-EGS Sulo NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 [ ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 7 Figure Figure NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 14 14 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ] ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 10 dont dont PRQ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 12 deux deux NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 groupements groupement NOM _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 14 réactifs réactif ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 16 espacés espacer VPP _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 16 16 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 Å Å NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 21 réagissent réagir VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 22 sur sur PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 fonction fonction NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 amine amine NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 terminale terminal ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 28 sur sur PRE _ _ 22 para _ _ _ _ _ 29 les le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 amines amine NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 ? ? PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-776 # text = des lysines pour former une liaison amide . 1 des de PRE _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 lysines lysine NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 former former VNF _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 une un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 liaison liaison NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 amide amide NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-777 # text = Des ponts intermoléculaires sont formés entre molécules voisines en interaction . 1 Des un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 ponts pont NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 intermoléculaires intermoléculaire ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 sont être VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 formés former VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 entre entre PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 molécules molécule NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 voisines voisin ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 en en PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 interaction interaction NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-778 # text = Les expériences ont été réalisées avec les protéines BD1 ( SII- 1 ) , BD2 ( A12 ) et ? 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 expériences expérience NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 ont avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 été être VPP _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 réalisées réaliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 avec avec PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 protéines protéine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 BD1 BD1 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 ( ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 SII- SII- NOM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 12 1 1 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 15 BD2 BD2 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 A12 A12 NOM _ _ 15 parenth _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 ? ? PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-779 # text = CBrdt ( SP6 ) dans leurs tampons de gel filtration [ Tableau 5 ] . 1 CBrdt CBrdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 SP6 SP6 NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 dans dans PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 leurs son DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 tampons tampon NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 gel gel NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 filtration filtration NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 [ ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 Tableau Tableau NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 13 5 5 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ] ) PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-780 # text = Une solution stock d'EGS à 50 mM a été réalisée dans du DMSO et diluée dans de l'eau pour obtenir un gradient de concentration . 1 Une un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 solution solution NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 stock stock NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 EGS EGS NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 50 50 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 mM millimètre NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 a avoir VRB _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 été être VPP _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 réalisée réaliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 dans dans PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 du de+le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 DMSO DMSO NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 16 diluée diluer VPP _ _ 11 para _ _ _ _ _ 17 dans dans PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 de de+le PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 l' de+le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 eau eau NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 pour pour PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 22 obtenir obtenir VNF _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 un un DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 gradient gradient NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 concentration concentration NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-781 # text = 1 µL de chaque dilution a été ajouté à 9 µL de solution de protéine . 1 1 1 NUM _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 µL micro- NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 chaque chaque DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 dilution dilution NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 a avoir VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 été être VPP _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 ajouté ajouter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 9 9 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 µL micro- NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 solution solution NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 protéine protéine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-782 # text = La réaction est arrêtée après 20 minutes par ajout de 1 µL de Tris 1M. Les échantillons ont été analysés par migration électrophorétique sur gel SDS-PAGE . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 réaction réaction NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 3 est est NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 arrêtée arrêter VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 après après PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 20 20 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 minutes minutes NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 par par PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 ajout ajout NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 1 1 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 µL micro- NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 Tris Tris NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 1M. 1M. NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 Les Les DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 échantillons échantillon NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 ont avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 été été NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 analysés analyser VPP _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 par par PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 migration migration NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 électrophorétique électrophorétique ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 sur sur PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 25 gel gel NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 SDS-PAGE SDS-PAGE NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-783 # text = D . Microcalorimétrie 1 D d NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Microcalorimétrie Microcalorimétrie NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-784 # text = Pour comparer les interactions entre un bromodomaine et différents peptides acétylés nous avions principalement le choix entre les techniques suivantes : 1 Pour pour PRE _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 2 comparer comparer VNF _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 les le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 interactions interaction NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 entre entre PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 un un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 bromodomaine oromo NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 9 différents différent DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 peptides peptide NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 11 acétylés acétyle NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 nous nous CLS _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 13 avions avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 principalement principalement ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 le le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 choix choix NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 entre entre PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 les le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 techniques technique NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 suivantes suivant ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 : : PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-785 # text = résonance magnétique nucléaire , résonance plasmonique de surface , microcalorimétrie ( calorimétrie à titration isotherme ) , dépolarisation de fluorescence . 1 résonance résonance NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 magnétique magnétique ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 nucléaire nucléaire ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 5 résonance résonance NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 plasmonique plasmonique ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 surface surface NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 10 microcalorimétrie microcalorimétrie NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 calorimétrie calorimétrie NOM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 13 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 titration titration NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 isotherme isotherme ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 dépolarisation dépolarisation NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 fluorescence fluorescence NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-786 # text = Nous avons choisi la calorimétrie à titration isotherme car elle permet de quantifier précisément des interactions dont les constantes d'affinités varient de 102 à 109 M et que nous disposions d'un appareil sur place . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 choisi choisir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 calorimétrie calorimétrie NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 titration titration NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 isotherme isotherme ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 car car COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 10 elle elle CLS _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 11 permet permettre VRB _ _ 3 para _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 quantifier quantifier VNF _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 précisément précisément ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 des un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 interactions interaction NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 dont dont PRQ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 18 les le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 constantes constante NOM _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 20 d' de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 affinités affinité NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 varient varier VRB _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 102 102 NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 à à PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 26 109 109 NUM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 M M _ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 28 et et COO _ _ 29 mark _ _ _ _ _ 29 que que CSU _ _ 0 root _ _ _ _ _ 30 nous nous CLS _ _ 0 root _ _ _ _ _ 31 disposions disposer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 32 d' de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 33 un un DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 appareil appareil NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 sur sur PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 place place NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-787 # text = La technique nécessite cependant de grandes quantités de protéine et de ligand . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 technique technique NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 nécessite nécessiter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 cependant cependant ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 6 grandes grand ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 quantités quantité NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 protéine protéine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 8 para _ _ _ _ _ 12 ligand ligand NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-788 # text = Elle est aussi relativement longue ( environ quatre heures par expérience ) . 1 Elle elle CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 aussi aussi ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 relativement relativement ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 longue long ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 environ environ ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 8 quatre quatre NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 heures heure NOM _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 10 par par PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 expérience expérience NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-789 # text = Si on considère le nombre d'expériences que nous avons finalement réalisées , une étape préliminaire de criblage aurait pu être utile pour éliminer les peptides n'ayant pas ou peu d'affinité . 1 Si si CSU _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 2 on on CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 considère considérer VRB _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 le le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 nombre nombre NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 d' de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 expériences expérience NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 que que PRQ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 9 nous nous CLS _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 10 avons avoir VRB _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 11 finalement finalement ADV _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 12 réalisées réaliser VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 14 une un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 étape étape NOM _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 16 préliminaire préliminaire ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 criblage criblage NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 aurait avoir VRB _ _ 20 aux _ _ _ _ _ 20 pu pouvoir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 être être VNF _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 utile utile ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 pour pour PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 éliminer éliminer VNF _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 les le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 peptides peptide NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 n' ne ADV _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 28 ayant avoir VPR _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 pas pas ADV _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 ou ou COO _ _ 26 para _ _ _ _ _ 31 peu peu de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 32 d' peu de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 affinité affinité NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 . . PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-790 # text = I. La calorimétrie à titration isotherme 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 La La DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 calorimétrie calorimétrie NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 titration titration NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 isotherme isotherme ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-791 # text = La calorimétrie à titration isotherme est une méthode très rigoureuse pour caractériser les interactions protéine-ligand puisque la protéine ne subit aucune modification et que les paramètres de la liaison : 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 calorimétrie calorimétrie NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 à à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 titration titration NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 isotherme isotherme ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 une un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 méthode méthode NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 très très ADV _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 rigoureuse rigoureux ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 pour pour PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 12 caractériser caractériser VNF _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 interactions interaction NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 protéine-ligand protéine-ligand NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 puisque puisque CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 protéine protéine NOM _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 19 ne ne ADV _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 subit subir VRB _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 21 aucune aucun DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 modification modification NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 24 que que CSU _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 les le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 paramètres paramètre NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 la le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 liaison liaison NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 : : PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-792 # text = n ( stoechiométrie ) , ? 1 n numéro NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 stoechiométrie stoechiométrie NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 6 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-793 # text = H ( enthalpie de liaison ) et Ka ( constante d'association ) sont déduits directement de la chaleur de réaction enregistrée ( Jelesarov and Bosshard , 1999 ; Pierce et al. , 1999 ) . 1 H heure NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 enthalpie enthalpie NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 liaison liaison NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 8 Ka Ka NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 9 ( ( PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 constante constante NOM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 11 d' de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 association association NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 14 sont être VRB _ _ 15 aux _ _ _ _ _ 15 déduits déduire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 directement directement ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 chaleur chaleur NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 réaction réaction NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 enregistrée enregistrer ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 24 Jelesarov Jelesarov NOM _ _ 26 periph _ _ _ _ _ 25 and jelesarov and bosshard NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 26 Bosshard Bosshard NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 28 1999 1999 NUM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 ; ; PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 30 Pierce Pierce NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 31 et et COO _ _ 34 mark _ _ _ _ _ 32 al. al. ADV _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 , , PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 34 1999 1999 NUM _ _ 30 para _ _ _ _ _ 35 ) ) PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 36 . . PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-794 # text = Au cours de l'expérience , une seringue contenant le ligand ( le peptide ) est titré dans une cellule contenant la solution de macromolécule ( la protéine ) et cela à température constante . 1 Au à PRE _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 2 cours cours NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 expérience expérience NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 7 une un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 seringue seringue NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 9 contenant contenir VPR _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 le le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 ligand ligand NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 13 le le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 peptide peptide NOM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 15 ) ) PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 16 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 titré titrer ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 dans dans PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 une un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 cellule cellule NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 contenant contenir VPR _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 la le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 solution solution NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 macromolécule macro- NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 ( ( PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 27 la le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 protéine protéine NOM _ _ 23 parenth _ _ _ _ _ 29 ) ) PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 30 et et COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 31 cela cela PRQ _ _ 23 para _ _ _ _ _ 32 à à PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 33 température température NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 constante constant ADJ _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-795 # text = Lorsque le peptide est injecté dans la cellule , les deux matériaux interagissent et de la chaleur est émise ou absorbée , en proportion directe avec la quantité de liaison . 1 Lorsque lorsque CSU _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 2 le le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 peptide peptide NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 4 est être VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 injecté injecter VPP _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 dans dans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 cellule cellule NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 10 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 11 deux deux NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 matériaux matériaux NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 13 interagissent interagir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 15 de de+le PRE _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 16 la de+le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 chaleur chaleur NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 est être VRB _ _ 19 aux _ _ _ _ _ 19 émise émettre VPP _ _ 13 para _ _ _ _ _ 20 ou ou COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 absorbée absorber VPP _ _ 19 para _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 en en PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 proportion proportion NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 directe direct ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 avec avec PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 la le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 quantité quantité NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 liaison liaison NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-796 # text = Cela permet de déduire les paramètres expérimentaux de la liaison à partir d'une expérience unique . 1 Cela cela PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 permet permettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 déduire déduire VNF _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 paramètres paramètre NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 expérimentaux expérimental ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 liaison liaison NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 à à partir de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 12 partir à partir de NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 d' à partir de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 une un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 expérience expérience NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 unique unique ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-797 # text = Il faut tout de même noter que dans ce cas l'hypothèse est faite que ces paramètres expérimentaux observés ne sont pas biaisés par des réactions associées telles que des échanges de protons , des changements de conformation , des réactions de dimérisation ou de dénaturation . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 faut falloir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 tout tout de même NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 de tout de même PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 même tout de même ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 noter noter VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 que que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 dans dans PRE _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 9 ce ce DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 cas cas NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 l' le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 hypothèse hypothèse NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 13 est être VRB _ _ 14 aux _ _ _ _ _ 14 faite faire VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 15 que que CSU _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 ces ce DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 paramètres paramètre NOM _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 18 expérimentaux expérimental ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 observés observer ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 ne ne ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 21 sont être VRB _ _ 23 aux _ _ _ _ _ 22 pas pas ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 23 biaisés biaiser VPP _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 24 par par PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 des un DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 réactions réaction NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 associées associer ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 telles tel ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 que que CSU _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 des un DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 échanges échange NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 de de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 protons proton NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 , , PUNC _ _ 40 punc _ _ _ _ _ 35 des un DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 changements changement NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 37 de de PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 conformation conformation NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 , , PUNC _ _ 40 punc _ _ _ _ _ 40 des de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 41 réactions réaction NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 de de PRE _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 dimérisation dimérisation NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 ou ou COO _ _ 45 mark _ _ _ _ _ 45 de de PRE _ _ 42 para _ _ _ _ _ 46 dénaturation dénaturation NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-798 # text = Dans le calorimètre , des cellules jumelles sont placées dans un environnement adiabatique . 1 Dans dans PRE _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 le le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 calorimètre calorimètre NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 des un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 cellules cellule NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 7 jumelles jumeau ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 sont être VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 placées placer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 un un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 environnement environnement NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 adiabatique adiabatique ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-799 # text = Un appareil thermoélectrique mesure la différence de température entre les cellules et un deuxième appareil mesure la différence de température entre les cellules et l'enceinte 1 Un un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 appareil appareil NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 thermoélectrique thermoélectrique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 mesure mesurer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 différence différence NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 température température NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 entre entre PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 les le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 cellules cellule NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 13 un un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 14 deuxième deuxième NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 appareil appareil NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 16 mesure mesurer VRB _ _ 4 para _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 différence différence NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 température température NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 entre entre PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 les le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 cellules cellule NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 25 l' le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 enceinte enceinte NOM _ _ 23 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-800 # text = [ Figure   15 ] . 1 [ ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Figure Figure VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3     15 DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 15 15 NUM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 5 ] ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-801 # text = Les réactions chimiques donnent lieu à un dégagement ( ou à une consommation ) de chaleur . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 réactions réaction NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 chimiques chimique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 donnent donner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 lieu lieu NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 un un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 dégagement dégagement NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 ( ( PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 10 ou ou COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 à à PRE _ _ 6 para _ _ _ _ _ 12 une un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 consommation consommation NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 16 chaleur chaleur NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-802 # text = La différence de température entre cette la cellule expérimentale et la cellule de référence est maintenue constante . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 différence différence NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 température température NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 entre entrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 cette ce PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 cellule cellule NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 9 expérimentale expérimental ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 cellule cellule NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 référence référence NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 maintenue maintenir ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 constante constant ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-803 # text = La quantité de courant électrique nécessaire pour maintenir cette différence constante au cours du temps est une mesure de la quantité de chaleur échangée lors de la réaction . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 quantité quantité NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 courant courant NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 électrique électrique ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 nécessaire nécessaire ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 pour pour PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 maintenir maintenir VNF _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 cette ce DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 différence différence NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 constante constant ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 au au cours de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 cours au cours de DET _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 du au cours de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 temps temps NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 une un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 mesure mesure NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 quantité quantité NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 chaleur chaleur NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 échangée échanger VPP _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 25 lors lors de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 de lors de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 la le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 réaction réaction NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-804 # text = La présentation classique des données d'une expérience ( voir les figures d'ITC en annexe ) donne dans un panneau supérieur les variations de ce courant électrique et dans un panneau inférieur son intégration au cours du temps , normalisée par la quantité de peptide injecté , en fonction du rapport molaire peptide / protéine . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 présentation présentation NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 3 classique classique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 données donnée NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 d' de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 une un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 expérience expérience NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 ( ( PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 10 voir voir VNF _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 figures figure NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 d' de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ITC ITC NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 en en PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 16 annexe annexe NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 ) ) PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 donne donner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 dans dans PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 un un DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 panneau panneau NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 supérieur supérieur ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 les le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 variations variation NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 ce ce DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 courant courant NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 électrique électrique ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 et et COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 30 dans dans PRE _ _ 49 mark _ _ _ _ _ 31 un un DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 panneau panneau NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 inférieur inférieur ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 son son DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 intégration intégration NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 36 au à PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 cours cours NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 du de PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 temps temps NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 41 normalisée normaliser VPP _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 42 par par PRE _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 la le DET _ _ 44 spe _ _ _ _ _ 44 quantité quantité NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 45 de de PRE _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 peptide peptide NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 injecté injecter ADJ _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 49 en en PRE _ _ 25 para _ _ _ _ _ 50 fonction fonction NOM _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 51 du de PRE _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 52 rapport rapport NOM _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 53 molaire molaire NOM _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 54 peptide peptide NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 55 / ou PUNC _ _ 56 punc _ _ _ _ _ 56 protéine protéine NOM _ _ 54 para _ _ _ _ _ 57 . . PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-805 # text = II . Mode opératoire 1 II ii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Mode Mode NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 opératoire opératoire ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-806 # text = Les expériences ont été réalisées à 25 °C avec un micro-calorimètre VP-ITC 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 expériences expérience NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 ont avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 été être VPP _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 réalisées réaliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 25 25 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 °C degré NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 avec avec PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 un un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 micro-calorimètre micro- NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 VP-ITC VP-ITC NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-807 # text = ( MicroCal ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 MicroCal MicroCal ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-808 # text = Nous avons utilisé les paramètres de liaison observés pour comparer les affinités de ? 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 utilisé utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 paramètres paramètre NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 liaison liaison NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 observés observer VPP _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 pour pour PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 comparer comparer VNF _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 affinités affinité NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 ? ? PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-809 # text = C-Brdt , BD1 , BD2 et BD1-K61Q vis-à-vis de différents peptides . 1 C-Brdt C-Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 BD1 BD1 NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 BD2 BD2 NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 BD1-K61Q BD1-K61Q NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 8 vis-à-vis vis-à-vis de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 9 de vis-à-vis de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 différents différent DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 peptides peptide NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-810 # text = Les solutions de peptides ont été injectées dans la cellule expérimentale contenant 1 , 7 mL de solution de protéine sous agitation . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 solutions solution NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 peptides peptide NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ont avoir VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 été être VPP _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 injectées injecter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 dans dans PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 cellule cellule NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 expérimentale expérimental ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 contenant contenir VPR _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 1 1 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 14 , 1 , 7 PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 7 7 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 mL millilitre NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 solution solution NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 protéine protéine NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 sous sous PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 22 agitation agitation NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-811 # text = Une expérience classique consiste en une série de 40 à 50 injections de 5 µL chacune et espacées de périodes de 300 s pour laisser le système atteindre son équilibre . 1 Une un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 expérience expérience NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 classique classique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 consiste consister VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 en en PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 une un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 série série NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 40 40 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 50 50 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 injections injection NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 5 5 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 µL micro- VPR _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 chacune chacun PRQ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 18 espacées espacer VPP _ _ 12 para _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 périodes période NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 300 300 NUM _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 s ssh NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 pour pour PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 25 laisser laisser VNF _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 le le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 système système NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 atteindre atteindre VNF _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 29 son son DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 équilibre équilibre NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-812 # text = Pour minimiser les échanges de chaleur dus aux échanges de protons dans la solution tampon nous avons utilisé un composé dont l'enthalpie d'ionisation est faible . 1 Pour pour PRE _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 minimiser minimiser VNF _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 les le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 échanges échange NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 chaleur chaleur NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 dus devoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 aux à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 échanges échange NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 protons proton NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 dans dans PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 solution solution NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 tampon tampon NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 nous lui PRQ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 17 avons avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 utilisé utiliser VPP _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 un un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 composé composé NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 dont dont PRQ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 22 l' le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 enthalpie enthalpie NOM _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 24 d' de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 ionisation ionisation NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 est être VRB _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 27 faible faible ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-813 # text = En effet de très faibles variations de pH entre la solution injectée et la solution présente dans la cellule peuvent provoquer de forts dégagements de chaleur si le tampon utilisé possède une enthalpie d'ionisation élevée . 1 En en effet PRE _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 2 effet en effet NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 de un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 4 très très ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 faibles faible ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 variations variation NOM _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 pH pH NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 entre entre PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 solution solution NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 injectée injecter ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 solution solution NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 16 présente présent ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 dans dans PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 cellule cellule NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 peuvent pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 provoquer provoquer VNF _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 de un DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 23 forts fort ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 24 dégagements dégagement NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 chaleur chaleur NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 si si CSU _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 28 le le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 tampon tampon NOM _ _ 31 subj _ _ _ _ _ 30 utilisé utiliser ADJ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 possède posséder VRB _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 32 une un DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 enthalpie enthalpie NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 d' de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 ionisation ionisation NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 élevée élevé ADJ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-814 # text = C'est par exemple le cas du Tris 1 C' ce CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 par par exemple PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 exemple par exemple ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 cas cas NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 du de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 Tris Tris NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-815 # text = ( DHionisation = 11 , 4 kcal / mol ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 DHionisation DHionisation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 11 11 NUM _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 , 11 , 4 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 4 4 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 kcal kcal ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 / / PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 mol mou ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-816 # text = Nous n'avons pas utilisé le phosphate qui présente pourtant une des enthalpies les plus faibles ( DHionisation 1 Nous nous CLS _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 n' ne ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 3 avons avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 4 pas pas ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 utilisé utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 le le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 phosphate phosphate NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 qui qui PRQ _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 9 présente présenter VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 pourtant pourtant ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 une un PRQ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 des de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 enthalpies enthalpie NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 les le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 15 plus plus ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 faibles faible ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 ( ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 18 DHionisation DHionisation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-817 # text = = 0 , 9 kcal / mol ) car nous pensions qu'il pouvait entrer en compétition avec le groupe acétyle du peptide pour la fixation au bromodomaine . 1 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 0 0 NUM _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 3 , 0 , 9 PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 4 9 9 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 kcal kcal ADJ _ _ 1 subj _ _ _ _ _ 6 / ou PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 7 mol mou ADJ _ _ 5 para _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 car car COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 10 nous nous CLS _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 11 pensions penser VRB _ _ 1 para _ _ _ _ _ 12 qu' que CSU _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 il il CLS _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 14 pouvait pouvoir VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 entrer entrer VNF _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 en en PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 compétition compétition NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 avec avec PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 le le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 groupe groupe NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 acétyle acétyle NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 du de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 peptide peptide NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 pour pour PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 la le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 fixation fixation NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 au à PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 bromodomaine bromé NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-818 # text = Nous avons utilisé l'Hepes ( DHionisation = 5 , 7 kcal / mol ) qui reste un tampon acceptable pour l'ITC . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 utilisé utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 Hepes Hepes NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 7 DHionisation DHionisation NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 = égaler VRB _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 9 5 5 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 10 , 5 , 7 PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 7 7 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 kcal kcal ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 / / PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 14 mol mou ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 16 qui qui PRQ _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 17 reste rester VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 18 un un DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 tampon tampon NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 acceptable acceptable ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 pour pour PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 22 l' le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 ITC ITC NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-819 # text = Pour réduire la différence de pH entre la solution de peptide injectée et celle de protéine : ( i ) les peptides ont été traités avec du carbonate d'hydrogène pour éliminer l'acide trifluorique utilisé lors de leurs purification ; 1 Pour pour PRE _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 réduire réduire VNF _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 différence différence NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 pH pH NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 entre entrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 solution solution NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 peptide peptide NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 injectée injecter ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 celle celui PRQ _ _ 9 para _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 protéine protéine NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 : : PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 ( id est PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 i id est COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 20 ) id est PUNC _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 21 les le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 peptides peptide NOM _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 23 ont avoir VRB _ _ 24 aux _ _ _ _ _ 24 été être VPP _ _ 25 aux _ _ _ _ _ 25 traités traiter VPP _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 26 avec avec PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 du de+le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 carbonate carbonate NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 d' de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 hydrogène hydrogène NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 pour pour PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 32 éliminer éliminer VNF _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 l' le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 acide acide NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 trifluorique trifluorique ADJ _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 utilisé utiliser VPP _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 lors lors de PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 de lors de PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 leurs leurs NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 purification purification NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 ; ; PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-820 # text = ( ii ) Les peptides lyophilisés ont été dissouts dans la solution tampon utilisée pour purifier la protéine . 1 ( id est PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 ii id est COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 3 ) id est PUNC _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 4 Les Les DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 peptides peptide NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 6 lyophilisés lyophiliser ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 ont avoir VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 été être VPP _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 dissouts dissoudre VPP _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 solution solution NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 tampon tampon NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 utilisée utiliser VPP _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 pour pour PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 purifier purifier VNF _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 protéine protéine NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-821 # text = Enfin , pour mesurer la chaleur dégagée par la réaction de dilution du peptide , nous avons réalisé une expérience de titration du peptide dans la solution tampon seule . 1 Enfin enfin ADV _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 pour pour PRE _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 4 mesurer mesurer VNF _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 chaleur chaleur NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 dégagée dégager VPP _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 par par PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 réaction réaction NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 dilution dilution NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 du de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 peptide peptide NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 16 nous nous CLS _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 17 avons avoir VRB _ _ 18 aux _ _ _ _ _ 18 réalisé réaliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 une un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 expérience expérience NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 titration titration NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 du de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 peptide peptide NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 dans dans PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 26 la le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 solution solution NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 tampon tampon NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 seule seul ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-822 # text = Pour chaque expérience , le signal de cette expérience de dilution du peptide a été soustrait aux données . 1 Pour pour PRE _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 2 chaque chaque DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 expérience expérience NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 signal signal NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 cette ce DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 expérience expérience NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 dilution dilution NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 du de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 peptide peptide NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 a avoir VRB _ _ 15 aux _ _ _ _ _ 15 été être VPP _ _ 16 aux _ _ _ _ _ 16 soustrait soustraire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 aux à PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 données donnée NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-823 # text = Les données ont été analysées avec le programme ORIGIN ( MicroCal ) . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 données donnée NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 ont avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 été être VPP _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 analysées analyser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 avec avec PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 programme programme NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 ORIGIN ORIGIN NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 ( ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 MicroCal MicroCal NOM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 12 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-824 # text = L'affinement des paramètres de la liaison : 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 affinement affinement NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 paramètres paramètre NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 liaison liaison NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 : : PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-825 # text = Ka ( constante d'affinité , Ka = 1 / Kd ) , DH ( enthalpie de liaison ) , et n ( stoechiométrie ) a été réalisé par cycles itératifs de minimisation d'un résiduel par la méthode des moindres carrés . 1 Ka ka NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 3 constante constante NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 affinité affinité NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 7 Ka Ka NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 = égaler VRB _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 9 1 1 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 / sur PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 11 Kd Kd NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 14 DH DH NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 15 ( ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 enthalpie enthalpie NOM _ _ 14 parenth _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 liaison liaison NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 ) ) PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 22 n numéro NOM _ _ 28 subj _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 stoechiométrie stoechiométrie NOM _ _ 22 parenth _ _ _ _ _ 25 ) ) PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 26 a avoir VRB _ _ 27 aux _ _ _ _ _ 27 été être VPP _ _ 28 aux _ _ _ _ _ 28 réalisé réaliser VPP _ _ 1 para _ _ _ _ _ 29 par par PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 cycles cycle NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 itératifs itératif ADJ _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 de de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 minimisation minimisation NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 d' de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 un un DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 résiduel résiduel ADJ _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 par par PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 la le DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 méthode méthode NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 des de PRE _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 moindres moindre ADJ _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 42 carrés carré NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 43 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-826 # text = La cohérence du modèle par rapport aux données est mesurée par la valeur de ? 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 cohérence cohérence NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 modèle modèle NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 par par PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 rapport rapport NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 aux à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 données donnée NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 est être VRB _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 mesurée mesurer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 par par PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 valeur valeur NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 ? ? PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-827 # text = 2 . 1 2 2 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-828 # text = Nous avons utilisé un modèle considérant un seul site de fixation par molécule . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 utilisé utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 modèle modèle NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 considérant considérant PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 un un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 8 seul seul ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 site site NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 fixation fixation NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 par par PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 molécule molécule NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-829 # text = Les expériences ont été réalisées deux fois au minimum . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 expériences expérience NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 ont avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 été être VPP _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 réalisées réaliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 deux deux NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 fois fois NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 au à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 minimum minimum NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-830 # text = Dans le cas de l'affinement des données de ? 1 Dans dans PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 le le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 cas cas NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 affinement affinement NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 des de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 données donnée NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 ? ? PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-831 # text = C-Brdt , nous devions choisir entre utiliser un modèle à un site , à deux sites indépendants ou à deux sites coopératifs car la protéine porte deux sites de fixation . 1 C-Brdt C-Brdt NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 nous nous CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 devions devoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 choisir choisir VNF _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 entre entre PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 utiliser utiliser VNF _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 un un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 modèle modèle NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 à à PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 un un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 site site NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 à à PRE _ _ 10 para _ _ _ _ _ 15 deux deux NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 sites site NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 indépendants indépendant ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ou ou COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 19 à à PRE _ _ 14 para _ _ _ _ _ 20 deux deux NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 sites site NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 coopératifs coopératif ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 car car COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 protéine protéine NOM _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 26 porte porter VRB _ _ 5 para _ _ _ _ _ 27 deux deux NUM _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 sites site NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 fixation fixation NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-832 # text = Le modèle à un site de fixation est le seul pour lequel les erreurs sur les paramètres de la liaison sont acceptables . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 modèle modèle NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 à à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 site site NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 fixation fixation NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 le le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 seul seul ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 pour pour PRE _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 12 lequel lequel PRQ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 erreurs erreur NOM _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 15 sur sur PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 paramètres paramètre NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 liaison liaison NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 sont être VRB _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 22 acceptables acceptable ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-833 # text = C'est donc celui que nous avons utilisé . 1 C' ce CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 donc donc ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 celui celui PRQ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 que que PRQ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 6 nous nous CLS _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 7 avons avoir VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 utilisé utiliser VPP _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-834 # text = Les peptides ont été synthétisés par le laboratoire Peptide Speciality 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 peptides peptide NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 ont avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 été être VPP _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 synthétisés synthétiser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 laboratoire laboratoire NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 Peptide Peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 Speciality Speciality NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-835 # text = Laboratories ( Heidelberg ) . 1 Laboratories Laboratories NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 Heidelberg Heidelberg NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-836 # text = Les solutions de peptides utilisées ont été obtenues en dissolvant les peptides lyophilisés dans la solution tampon utilisée pour la purification de la protéine . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 solutions solution NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 peptides peptide NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 utilisées utiliser ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 ont avoir VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 été être VPP _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 obtenues obtenir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 en en PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 dissolvant dissoudre VPR _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 peptides peptide NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 lyophilisés lyophiliser VPP _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 dans dans PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 solution solution NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 tampon tampon NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 utilisée utiliser VPP _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 pour pour PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 purification purification NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 protéine protéine NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-837 # text = La concentration ( de 1 , 9 mM et 5 , 6 mM ) a été déterminée par analyse d'acide-aminé ( réalisées par 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 concentration concentration NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 5 1 1 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 6 , 1 , 9 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 9 9 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 mM millimètre NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 10 5 5 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 11 , 5 , 6 PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 12 6 6 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 mM millimètre NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 15 a avoir VRB _ _ 16 aux _ _ _ _ _ 16 été être VPP _ _ 17 aux _ _ _ _ _ 17 déterminée déterminer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 par par PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 analyse analyse NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 d' de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 acide-aminé acide ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 23 réalisées réaliser ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 par par PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-838 # text = J.P . Andrieux à l'IBS ) . 1 J.P j.p NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Andrieux Andrieux NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 IBS IBS NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-839 # text = Les échantillons de protéines ont été obtenus en diluant la solution stock de protéine dans son tampon de purification . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 échantillons échantillon NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 protéines protéine NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ont avoir VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 été être VPP _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 obtenus obtenir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 en en PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 diluant diluer VPR _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 solution solution NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 stock stock NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 protéine protéine NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 dans dans PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 16 son son DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 tampon tampon NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 purification purification NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-840 # text = La concentration ( entre 0.05 et 0.16 mM ) a été déterminée par mesure de l'absorbance à 280 nm en utilisant un coefficient d'extinction déterminé expérimentalement par analyse d'acide-aminé ( réalisées par J.P. Andrieux à l'IBS ) . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 concentration concentration NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 4 entre entre PRE _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 5 0.05 0.05 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 0.16 0.16 NUM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 8 mM mM ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 10 a avoir VRB _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 été être VPP _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 12 déterminée déterminer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 par par PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 mesure mesure NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 l' le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 absorbance absorbance NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 à à PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 280 280 NUM _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 nm minute NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 en en PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 22 utilisant utiliser VPR _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 un un DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 coefficient coefficient NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 d' de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 extinction extinction NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 déterminé déterminer VPP _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 28 expérimentalement expérimentalement ADV _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 par par PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 analyse analyse NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 d' de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 acide-aminé acide ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 ( ( PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 34 réalisées réaliser VPP _ _ 30 parenth _ _ _ _ _ 35 par par PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 J.P. J.P. NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 Andrieux Andrieux NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 à à PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 39 l' le DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 IBS IBS NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 ) ) PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 42 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-841 # text = E . Cristallographie aux rayons X 1 E e NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Cristallographie Cristallographie NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 aux à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 rayons rayons NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 X X ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-842 # text = I. Production des cristaux 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Production Production NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 cristaux cristal NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-843 # text = a . La cristallogénèse 1 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 La La ADV _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 cristallogénèse cristal NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-844 # text = La cristallisation est une transition de phase au cours de laquelle la molécule passe d'un état de soluté à un état de phase solide , le cristal . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 cristallisation cristallisation NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 une un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 transition transition NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 phase phase NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 au au cours de PRE _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 9 cours au cours de NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de au cours de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 laquelle lequel PRQ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 molécule molécule NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 14 passe passer VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 15 d' de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 un un DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 état état NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 soluté soluté NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 à à PRE _ _ 15 para _ _ _ _ _ 21 un un DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 état état NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 phase phase NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 solide solide ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 27 le le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 cristal cristal NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-845 # text = Le comportement d'une molécule en fonction des variations de son environnement ( pH , force ionique , température , pression ... ) peut être décrit sous forme d'un diagramme de phases dans lequel la courbe de solubilité définit la limite entre la phase soluble et la phase solide ( le cristal ou le précipité ) . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 comportement comportement NOM _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 une un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 molécule molécule NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 en en PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 fonction fonction NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 variations variation NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 son son DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 environnement environnement NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 14 pH pH NOM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 force force NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 17 ionique ionique ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 température température NOM _ _ 17 para _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 pression pression NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 22 ... ... PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 24 peut pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 être être VNF _ _ 26 aux _ _ _ _ _ 26 décrit décrire VPP _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 sous sous PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 forme forme NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 d' de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 un un DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 diagramme diagramme NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 de de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 phases phase NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 dans dans PRE _ _ 40 periph _ _ _ _ _ 35 lequel lequel PRQ _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 la le DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 courbe courbe NOM _ _ 40 subj _ _ _ _ _ 38 de de PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 solubilité solubilité NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 définit définir VRB _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 41 la le DET _ _ 42 spe _ _ _ _ _ 42 limite limite NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 43 entre entre PRE _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 la le DET _ _ 45 spe _ _ _ _ _ 45 phase phase NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 46 soluble soluble ADJ _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 et et COO _ _ 49 mark _ _ _ _ _ 48 la le DET _ _ 49 spe _ _ _ _ _ 49 phase phase NOM _ _ 45 para _ _ _ _ _ 50 solide solide ADJ _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 51 ( ( PUNC _ _ 53 punc _ _ _ _ _ 52 le le DET _ _ 53 spe _ _ _ _ _ 53 cristal cristal NOM _ _ 45 parenth _ _ _ _ _ 54 ou ou COO _ _ 56 mark _ _ _ _ _ 55 le le DET _ _ 56 spe _ _ _ _ _ 56 précipité précipité NOM _ _ 53 para _ _ _ _ _ 57 ) ) PUNC _ _ 53 punc _ _ _ _ _ 58 . . PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-846 # text = Au niveau de cette courbe , les deux états sont en équilibre thermodynamique , au-delà de cette courbe la solution est dite sur-saturée . 1 Au à PRE _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 2 niveau niveau NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 cette ce DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 courbe courbe ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 8 deux deux NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 états états NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 10 sont être VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 11 en en PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 équilibre équilibre NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 thermodynamique thermodynamique NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 15 au-delà au-delà ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 17 cette ce DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 courbe courbe NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 solution solution NOM _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 21 est être VRB _ _ 22 aux _ _ _ _ _ 22 dite dire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 sur-saturée sur- VPP _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-847 # text = La sursaturation constitue la force motrice qui conduit à l'initiation de la cristallisation , la nucléation . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 sursaturation sursaturation NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 constitue constituer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 force force NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 motrice moteur ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 qui qui PRQ _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 conduit conduire VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 initiation initiation NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 cristallisation cristallisation NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 nucléation nucléation NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-848 # text = La croissance du cristal s'opère ensuite à partir de chaque noyau tant que l'état de sursaturation est maintenu . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 croissance croissance NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 cristal cristal NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 s' s' CLI _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 opère opérer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 ensuite ensuite ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 à à partir de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 partir à partir de NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de à partir de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 chaque chaque DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 noyau noyau NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 tant tant que CSU _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 que tant que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 15 l' le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 état état NOM _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 sursaturation sursaturation NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 est être VRB _ _ 20 aux _ _ _ _ _ 20 maintenu maintenir VPP _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-849 # text = Aucun moyen théorique ne permet de prévoir les conditions qui mèneront la protéine à cristalliser . 1 Aucun aucun DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 moyen moyen NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 théorique théorique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ne ne ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 permet permettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 prévoir prévoir VNF _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 conditions condition NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 qui qui PRQ _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 11 mèneront mener VRB _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 protéine protéine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 à à PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 cristalliser cristalliser VNF _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-850 # text = Le criblage d'un grand nombre de conditions différentes est souvent utilisé . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 criblage criblage NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 grand grand ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 nombre nombre NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 conditions condition NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 différentes différent ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 est être VRB _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 11 souvent souvent ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 utilisé utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-851 # text = Ce criblage robotisé permet l'obtention de cristaux de petite taille ( de l'ordre de 0 , 01 mm ) , de micro-cristaux ou de simples transitions de phases . 1 Ce ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 criblage criblage NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 robotisé robotiser ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 permet permettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 obtention obtention NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 cristaux cristal NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 petite petit ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 taille taille NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 de de l'ordre de PRE _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 14 l' de l'ordre de DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 ordre de l'ordre de NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de l'ordre de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 0 0 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 18 , 0 , 01 PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 19 01 01 NUM _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 mm millimètre NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 21 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 7 para _ _ _ _ _ 24 micro-cristaux micro- NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 ou ou COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 23 para _ _ _ _ _ 27 simples simple ADJ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 28 transitions transition NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 phases phase NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-852 # text = Les cristaux éventuellement obtenus lors de cette étape , même très petits , peuvent être utilisés directement sur des lignes au rayonnement adapté ( microfocus ) mais sont plus sensibles aux dommages dus aux radiations . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 cristaux cristal NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 3 éventuellement éventuellement ADV _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 4 obtenus obtenir VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 lors lors de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de lors de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 cette ce DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 étape étape NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 10 même même ADJ _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 11 très très ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 petits petit ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 14 peuvent pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 être être VNF _ _ 16 aux _ _ _ _ _ 16 utilisés utiliser VPP _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 directement directement ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 sur sur PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 des un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 lignes ligne NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 au à PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 rayonnement rayonnement NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 adapté adapté ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 ( ( PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 microfocus micro- NOM _ _ 22 parenth _ _ _ _ _ 26 ) ) PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 27 mais mais COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 28 sont être VRB _ _ 16 para _ _ _ _ _ 29 plus plus ADV _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 30 sensibles sensible ADJ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 aux à PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 dommages dommage NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 dus devoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 34 aux à PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 35 radiations radiation NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 . . PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-853 # text = Ainsi , il est souvent nécessaire de reproduire ou d'améliorer la taille des cristaux obtenu lors du criblage . 1 Ainsi ainsi ADV _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 il il CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 souvent souvent ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 nécessaire nécessaire NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 reproduire reproduire VNF _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ou ou COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 d' de PRE _ _ 7 para _ _ _ _ _ 11 améliorer améliorer VNF _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 taille taille NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 des de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 cristaux cristal NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 obtenu obtenir VPP _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 17 lors lors de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 du lors de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 criblage criblage NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-854 # text = b . Criblage des conditions de cristallisation 1 b b NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Criblage Criblage NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 conditions condition NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 cristallisation cristallisation NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-855 # text = Le laboratoire de cristallisation à haut débit de l'EMBL réalise en routine le criblage de 576 conditions différentes pour chaque échantillon . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 laboratoire laboratoire NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 cristallisation cristallisation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 haut haut ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 débit débit NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 EMBL EMBL NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 réalise réaliser VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 en en PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 routine routine NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 le le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 criblage criblage NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 576 576 NUM _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 conditions condition NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 différentes différent ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 pour pour PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 21 chaque chaque DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 échantillon échantillon NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-856 # text = Un robot de cristallisation ( Cartesian PixSys 4200 ) mélange 100 nL de protéine et de 100 nL de solution de cristallisation . 1 Un un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 robot robot NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 cristallisation cristallisation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ( ( PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 Cartesian Cartesian NOM _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 7 PixSys PixSys NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 4200 4200 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 10 mélange mélanger VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 100 100 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 nL nL NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 protéine protéine NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 13 para _ _ _ _ _ 17 100 100 NUM _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 nL nL NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 solution solution NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 cristallisation cristallisation NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-857 # text = Les gouttes assises sont ensuite mises à équilibrer par diffusion de vapeur à 20 °C ou 4 °C. Nous avons testé pour chaque échantillon les conditions de cristallisation proposées commercialement par Hampton Research dans les Crystal screen I 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 gouttes goutte NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 assises asseoir ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 sont être VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 5 ensuite ensuite ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 mises mettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 à à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 équilibrer équilibrer VNF _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 par par PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 diffusion diffusion NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 vapeur vapeur NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 20 20 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 °C degré NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 ou ou COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 17 4 4 NUM _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 °C. °C. NOM _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 19 Nous Nous CLI _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 20 avons avoir VRB _ _ 21 aux _ _ _ _ _ 21 testé tester VPP _ _ 6 para _ _ _ _ _ 22 pour pour PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 chaque chaque DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 échantillon échantillon NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 les le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 conditions condition NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 cristallisation cristallisation NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 proposées proposer VPP _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 30 commercialement commercialement ADV _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 par par PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 Hampton Hampton NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 33 Research Research NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 dans dans PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 35 les le DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 36 Crystal Crystal NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 37 screen screen NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 38 I I NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-858 # text = Les boîtes ont ensuite été stockées à 20 °C dans un robot qui prend une photo des gouttes après 24h , 72h , 1 semaine , 2 semaines puis chaque mois . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 boîtes boîte NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 ont avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 4 ensuite ensuite ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 5 été être VPP _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 stockées stocker VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 à à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 20 20 NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 °C degré NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 un un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 robot robot NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 qui qui PRQ _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 14 prend prendre VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 une un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 photo photo NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 des de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 gouttes goutte NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 après après PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 20 24h 24h NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 22 72h 72h NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 24 1 1 NUM _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 semaine semaine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 27 2 2 NUM _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 semaines semaine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 29 puis puis COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 30 chaque chaque DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 mois mois NOM _ _ 28 para _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-859 # text = c . Affinement des conditions de cristallisation 1 c c NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Affinement Affinement NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 conditions condition NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 cristallisation cristallisation NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-860 # text = L'affinement a été réalisé par la technique de cristallisation dite de la goutte suspendue dans laquelle le mélange de 1 à 2 ? 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 affinement affinement NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 a avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 été être VPP _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 réalisé réaliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 technique technique NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 cristallisation cristallisation NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 dite dire VPP _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 goutte goutte NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 suspendue suspendre VPP _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 dans dans PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 laquelle lequel PRQ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 le le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 mélange mélange NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 1 1 NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 à à PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 23 2 2 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 ? ? PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-861 # text = l de protéine est mélangé à 1 à 2 ? 1 l le _ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 de un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 protéine protéine NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 4 est être VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 mélangé mélanger VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 1 1 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 2 2 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 ? ? PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-862 # text = de la solution de cristallisation et mis à équilibrer au dessus d'un réservoir contenant 0 , 8 à 1 mL de la solution de cristallisation . 1 de de PRE _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 2 la le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 solution solution NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 cristallisation cristallisation NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 mis mettre VPP _ _ 4 para _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 équilibrer équilibrer VNF _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 au à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 dessus dessus NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 d' de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 un un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 réservoir réservoir NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 contenant contenir VPR _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 0 0 NUM _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 17 , 0 , 8 PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 18 8 8 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 à à PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 1 1 NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 mL millilitre NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 solution solution NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 cristallisation cristallisation NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-863 # text = Au cours de l'équilibration par diffusion de vapeur les composés volatiles de la goutte et du réservoir se répartissent de façon que les tensions de vapeur à la surface des deux compartiments soient identiques . 1 Au à PRE _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 2 cours cours NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 équilibration équilibration NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 diffusion diffusion NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 vapeur vapeur NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 11 composés composé ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 volatiles volatile NOM _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 goutte goutte NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 du de PRE _ _ 13 para _ _ _ _ _ 18 réservoir réservoir NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 se se CLI _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 répartissent répartir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 de de façon que PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 façon de façon que NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 que de façon que CSU _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 les le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 tensions tension NOM _ _ 34 subj _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 vapeur vapeur NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 à à PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 29 la le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 surface surface NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 des de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 deux deux NUM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 33 compartiments compartiment NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 soient être VRB _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 35 identiques identique ADJ _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 . . PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-864 # text = Ce processus concentre l'agent cristallisant et la protéine dans la goutte et la conduit éventuellement à cristalliser . 1 Ce ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 processus processus NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 concentre concentrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 agent agent NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 cristallisant cristallisant ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 protéine protéine NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 goutte goutte NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 14 la le CLI _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 conduit conduire VRB _ _ 3 para _ _ _ _ _ 16 éventuellement éventuellement ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 à à PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 cristalliser cristalliser VNF _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-865 # text = Pour améliorer les cristaux de nombreuses techniques peuvent être utilisées . 1 Pour pour PRE _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 améliorer améliorer VNF _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 les le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 cristaux cristal NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 nombreuses nombreux ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 techniques technique NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 peuvent pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 être être VNF _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 utilisées utiliser VPP _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-866 # text = Pour réduire la fréquence de nucléation , nous avons fait varier le rapport entre la protéine et la solution de cristallisation dans la goutte ( variation de la cinétique au sein du diagramme de phase ) . 1 Pour pour PRE _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 réduire réduire VNF _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 fréquence fréquence NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 nucléation nucléation NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 8 nous nous CLS _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 9 avons avoir VRB _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 fait faire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 varier varier VNF _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 le le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 rapport rapport NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 entre entre PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 protéine protéine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 solution solution NOM _ _ 16 para _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 cristallisation cristallisation NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 dans dans PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 goutte goutte NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 ( ( PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 variation variation NOM _ _ 24 parenth _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 la le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 cinétique cinétique NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 au au sein de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 31 sein au sein de DET _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 du au sein de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 diagramme diagramme NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 de de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 phase phase NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 ) ) PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-867 # text = Nous avons également eu recours à l'ensemencement et au micro-ensemencement d'une goutte a l'état sur-saturé par des débris de cristaux . 1 Nous nous CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 3 également également ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 eu avoir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 recours recours NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 l' le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 ensemencement ensemencement NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 10 au à PRE _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 11 micro-ensemencement micro- NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 d' de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 une un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 goutte goutte NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 a avoir VRB _ _ 4 para _ _ _ _ _ 16 l' le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 état état NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 sur-saturé sur- VPP _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 par par PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 des un DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 débris débris NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 cristaux cristal NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-868 # text = d . Protection du cristal 1 d d NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Protection Protection NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 cristal cristal NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-869 # text = Pour éviter les dommages de la radiation dus à la formation de radicaux libres lors de l'exposition au rayons X , les cristaux sont congelés dans l'azote liquide . 1 Pour pour PRE _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 éviter éviter VNF _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 les le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 dommages dommage NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 radiation radiation NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 dus devoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 formation formation NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 radicaux radical NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 libres libre ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 lors lors de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 16 de lors de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 l' le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 exposition exposition NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 au à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 20 rayons rayons NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 X X ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 23 les le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 cristaux cristal NOM _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 25 sont être VRB _ _ 26 aux _ _ _ _ _ 26 congelés congeler VPP _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 27 dans dans PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 l' le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 azote azote NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 liquide liquide ADJ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-870 # text = Pour éviter que l'eau contenue dans le cristal ne forme de glace , les cristaux sont passés dans un bain de solution de cryoprotection . 1 Pour pour PRE _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 2 éviter éviter VNF _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 eau eau NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 6 contenue contenir VPP _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 dans dans PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 cristal cristal NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 ne ne ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 forme former VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 glace glace NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 15 les le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 cristaux cristal NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 17 sont être VRB _ _ 18 aux _ _ _ _ _ 18 passés passer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 dans dans PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 un un DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 bain bain NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 solution solution NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 cryoprotection cryoprotection NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-871 # text = Nous avons utilisé de 15 à 30 % de PEG400 ou de glycérol dans la solution de cristallisation . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 utilisé utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 15 15 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 8 det _ _ _ _ _ 7 30 30 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 % pourcent NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 PEG400 PEG400 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 ou ou COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 9 para _ _ _ _ _ 13 glycérol glycérol NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 dans dans PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 solution solution NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 cristallisation cristallisation NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-872 # text = II . Quelques notions de cristallographie 1 II ii NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Quelques Quelques DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 notions notion NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 cristallographie cristallographie NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-873 # text = a . Le cristal 1 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Le Le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 cristal cristal NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-874 # text = Le cristal est un agencement périodique de molécules . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 cristal cristal NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 agencement agencement NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 périodique périodique ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 molécules molécule NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-875 # text = La plus petite unité à partir de laquelle on peut reconstituer le cristal par des opérations de translation est la maille cristalline , elle peut appartenir à un système triclinique , monoclinique , orthorhombique , tétragonal , hexagonal ou cubique selon sa géométrie . 1 La le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 2 plus plus ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 petite petit ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 unité unité NOM _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 5 à à partir de PRE _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 6 partir à partir de NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de à partir de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 laquelle lequel PRQ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 on on CLS _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 10 peut pouvoir VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 reconstituer reconstituer VNF _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 le le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 cristal cristal NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 par par PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 des un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 opérations opération NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 translation translation NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 maille maille NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 cristalline cristallin ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 24 elle elle CLS _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 25 peut pouvoir VRB _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 26 appartenir appartenir VNF _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 à à PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 un un DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 système système NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 triclinique triclinique ADJ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 , , PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 32 monoclinique monoclinique ADJ _ _ 30 para _ _ _ _ _ 33 , , PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 34 orthorhombique orthorhombique ADJ _ _ 32 para _ _ _ _ _ 35 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 36 tétragonal tétragonal ADJ _ _ 34 para _ _ _ _ _ 37 , , PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 38 hexagonal hexagonal ADJ _ _ 36 para _ _ _ _ _ 39 ou ou COO _ _ 40 mark _ _ _ _ _ 40 cubique cubique ADJ _ _ 38 para _ _ _ _ _ 41 selon selon PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 42 sa son DET _ _ 43 spe _ _ _ _ _ 43 géométrie géométrie NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 44 . . PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-876 # text = L'unité asymétrique est le plus petit élément à partir duquel duquel on peut reconstituer le cristal par un certain nombre d'opérations de symétrie ( rotation et translation ) définies par le groupe d'espace du cristal . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 unité unité NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 asymétrique asymétrique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 6 plus plus ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 petit petit ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 élément élément NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 à à partir de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 10 partir à partir de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 duquel à partir de PRE _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 12 duquel lequel PRQ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 on on CLS _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 14 peut pouvoir VRB _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 15 reconstituer reconstituer VNF _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 le le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 cristal cristal NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 par par PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 un un DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 20 certain certain ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 nombre nombre NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 d' de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 opérations opération NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 symétrie symétrie NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 ( ( PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 rotation rotation NOM _ _ 23 parenth _ _ _ _ _ 28 et et COO _ _ 29 mark _ _ _ _ _ 29 translation translation NOM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 30 ) ) PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 31 définies définir VPP _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 32 par par PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 le le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 groupe groupe NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 d' de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 espace espace NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 du de PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 cristal cristal NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-877 # text = Il existe 65 groupes d'espaces différents pour un cristal de protéine . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 existe exister VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 65 65 NUM _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 groupes groupe NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 d' de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 espaces espace NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 différents différent ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 9 un un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 cristal cristal NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 protéine protéine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-878 # text = L'unité asymétrique peut contenir une ou plusieurs molécules ( ou complexes ) , qui seront alors liées par une relation de symétrie non cristallographique . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 unité unité NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 asymétrique asymétrique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 peut pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 contenir contenir VNF _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 une un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 7 ou ou COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 8 plusieurs plusieurs DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 9 molécules molécule NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 ou ou COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 complexes complexe NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 15 qui qui PRQ _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 16 seront être VRB _ _ 18 aux _ _ _ _ _ 17 alors alors ADV _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 18 liées lier VPP _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 19 par par PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 une un DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 relation relation NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 symétrie symétrie NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 non non ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 cristallographique cristallographique ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-879 # text = Le cristal peut être représenté comme le produit de convolution d'un motif ( la macromolécule ) par un réseau ( caractérisé par la maille et le groupe d'espace du cristal ) , appelé réseau réel d'axes ( a , b , c ) . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 cristal cristal NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 peut pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 être être VNF _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 représenté représenter VPP _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 comme comme PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 produit produit NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 convolution convolution NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 d' de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 un un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 motif motif NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 ( ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 macromolécule macro- NOM _ _ 13 parenth _ _ _ _ _ 17 ) ) PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 18 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 19 un un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 réseau réseau NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 ( ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 caractérisé caractériser VPP _ _ 20 parenth _ _ _ _ _ 23 par par PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 maille maille NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 27 le le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 groupe groupe NOM _ _ 25 para _ _ _ _ _ 29 d' de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 espace espace NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 du de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 32 cristal cristal NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 ) ) PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 34 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 35 appelé appeler ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 36 réseau réseau NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 réel réel ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 d' de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 39 axes axe NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 ( ( PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 41 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 42 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 43 b boulevard NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 44 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 45 c cf PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 46 ) ) PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 47 . . PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-880 # text = Le motif est répété à chaque noeud du réseau suivant les symétries du groupe d'espace . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 motif motif NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 répété répéter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 chaque chaque DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 noeud noeud NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 réseau réseau NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 suivant suivant PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 symétries symétrie NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 du de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 groupe groupe NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 d' de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 espace espace NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-881 # text = La cohésion du cristal est assuré par des liaisons de Van der Waals , des ponts salins et des liaisons hydrogène . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 cohésion cohésion NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 cristal cristal NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 assuré assuré NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 des un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 liaisons liaison NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 Van Van NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 der der ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 Waals Waals NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 des de PRE _ _ 10 para _ _ _ _ _ 16 ponts pont NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 salins salin NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 19 des de PRE _ _ 15 para _ _ _ _ _ 20 liaisons liaison NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 hydrogène hydrogène NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-882 # text = L'empilement des éléments constitutifs du cristal n'est jamais parfait , on parle de la mosaïcité d'un cristal pour traduire ces défauts . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 empilement empilement NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 éléments élément NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 constitutifs constitutif ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 du de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 cristal cristal NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 n' ne ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 jamais jamais ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 parfait parfait ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 13 on on CLS _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 14 parle parler VRB _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 la le NOM _ _ 17 det _ _ _ _ _ 17 mosaïcité le NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 d' de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 un un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 cristal cristal NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 pour pour PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 22 traduire traduire VNF _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 ces ce DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 défauts défaut NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-883 # text = Les espaces ménagés entre les macromolécules sont comblés par des molécules de solvant ( eau , ions , tampon ... ) , qui représentent en général 40 à 70 % du volume cristallin , ce qui confère aux cristaux de protéine leur grande fragilité . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 espaces espace NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 ménagés ménager VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 entre entre PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 macromolécules macro- NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 sont être VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 comblés combler VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 par par PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 des un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 molécules molécule NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 solvant solvant NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ( ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 15 eau eau NOM _ _ 11 parenth _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 ions ion NOM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 tampon tampon NOM _ _ 17 para _ _ _ _ _ 20 ... ... PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 21 ) ) PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 23 qui qui PRQ _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 24 représentent représenter VRB _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 25 en en PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 général général NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 40 40 NUM _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 28 à à PRE _ _ 30 det _ _ _ _ _ 29 70 70 NUM _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 % pourcent NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 31 du de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 volume volume NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 cristallin cristallin ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 , , PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 35 ce ce PRQ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 36 qui qui PRQ _ _ 37 subj _ _ _ _ _ 37 confère conférer VRB _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 aux à PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 cristaux cristal NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 de de PRE _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 protéine protéine NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 leur son DET _ _ 44 spe _ _ _ _ _ 43 grande grand ADJ _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 44 fragilité fragilité NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 45 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-884 # text = b . La diffraction 1 b b NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 La La DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 diffraction diffraction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-885 # text = Les rayons X sont des ondes planes monochromatiques de courte longueur d'onde ( ? = 100 - 0 , 1 Å ) . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 rayons rayons NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 X X ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 des un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 ondes onde NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 planes plan ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 monochromatiques monochromatique ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 courte court ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 longueur longueur NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 d' de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 onde onde NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 ? ? PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 16 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 100 100 NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 18 - 100 - 0 , 1 PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 19 0 0 NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 20 , 100 - 0 , 1 PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 21 1 1 NUM _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 Å Å ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-886 # text = La diffraction est le résultat de l'interférence entre les rayons X diffusés par l'arrangement périodique des macromolécules qui constituent le cristal . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 diffraction diffraction NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 le le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 résultat résultat NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 l' le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 interférence interférence NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 entre entre PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 les le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 rayons rayons NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 X X ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 diffusés diffuser VPP _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 par par PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 l' le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 arrangement arrangement NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 périodique périodique ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 des de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 macromolécules macro- NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 qui qui PRQ _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 21 constituent constituer VRB _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 le le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 cristal cristal NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-887 # text = La répétition des motifs dans le cristal permet l'amplification du signal . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 répétition répétition NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 motifs motif NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 dans dans PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 le le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 cristal cristal NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 permet permettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 amplification amplification NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 du de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 signal signal NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-888 # text = Les rayons X interagissent avec les atomes du cristal et sont diffusés mais seules les ondes qui diffusent en phase ont entre elles des interférences positives et donneront un signal , c'est la condition de diffraction . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 rayons rayons NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 X X ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 interagissent interagir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 avec avec PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 atomes atome NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 cristal cristal NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 11 sont être VRB _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 12 diffusés diffuser VPP _ _ 4 para _ _ _ _ _ 13 mais mais COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 14 seules seul ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 15 les le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 ondes onde NOM _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 17 qui qui PRQ _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 18 diffusent diffuser VRB _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 en en PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 phase phase NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 ont avoir VRB _ _ 12 para _ _ _ _ _ 22 entre entre PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 elles lui PRQ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 des un DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 interférences interférence NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 26 positives positif ADJ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 28 donneront donner VRB _ _ 21 para _ _ _ _ _ 29 un un DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 signal signal NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 , , PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 32 c' ce CLS _ _ 33 subj _ _ _ _ _ 33 est être VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 34 la le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 condition condition NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 de de PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 diffraction diffraction NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-889 # text = Seuls les éléments qui appartiennent à la famille de plans parallèles , espacés de d = ? / 2 sin ? ( ? : angle d'incidence du faisceau de rayon X ) ont des interférences positives . 1 Seuls seul ADJ _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 éléments élément NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 qui qui PRQ _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 5 appartiennent appartenir VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 famille famille NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 plans plans NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 parallèles parallèle ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 13 espacés espacer ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 de de PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 15 d de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 ? ? PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 18 / sur PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 19 2 2 NUM _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 sin sein NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 ? ? PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 22 ( ( PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 ? ? PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 24 : : PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 25 angle angle NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 d' de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 incidence incidence NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 du de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 29 faisceau faisceau NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 de de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 rayon rayon NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 X X ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 ) ) PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 34 ont avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 35 des un DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 interférences interférence NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 37 positives positif ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 . . PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-890 # text = Cette condition de diffraction pour un cristal est connue sous le nom de Loi de Bragg 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 condition condition NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 diffraction diffraction NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 pour pour PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 un un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 cristal cristal NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 est être VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 connue connaître VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 sous sous PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 nom nom NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 Loi Loi NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 Bragg Bragg NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-891 # text = [ Figure   16 ] et s'écrit alors N. ? = 2 . 1 [ ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 2 Figure Figure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3     16 DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 16 16 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 ] ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 7 s' s' CLI _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 écrit écrire VRB _ _ 2 para _ _ _ _ _ 9 alors alors ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 N. N. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 ? ? PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 12 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 2 2 NUM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-892 # text = d . sin ? ( N :   nombre entier , d : distance entre les plans qui diffractent , ? : angle d'incidence du faisceau de rayon X ) . 1 d de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 sin sain ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 ? ? PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 ( ( PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 N N NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 : : PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 8     NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 9 nombre nombrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 entier entier NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 12 d de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 : : PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 14 distance distancer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 entre entre PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 plans plans NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 qui qui PRQ _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 19 diffractent diffracter VRB _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 21 ? ? PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 22 : : PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 angle angle NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 d' de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 incidence incidence NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 du de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 27 faisceau faisceau NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 rayon rayon NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 X X ADJ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 ) ) PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-893 # text = La famille de plans qui diffracte est appelée famille de plans réticulaires , elle est caractérisée par ses indices de Miller ( h , k , l ) signifiant le nombre de fois que les plans divisent la maille selon ses 3 directions ( a , b , c ) . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 famille famille NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 plans plans NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 qui qui PRQ _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 diffracte diffracter VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 est être VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 appelée appeler VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 famille famille NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 plans plans NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 réticulaires réticulaire ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 14 elle elle CLS _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 15 est être VRB _ _ 16 aux _ _ _ _ _ 16 caractérisée caractériser VPP _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 17 par par PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ses son DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 indices indice NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 Miller Miller NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 23 h heure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 25 k gramme NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 27 l le _ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 28 ) ) PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 29 signifiant signifier VPR _ _ 0 root _ _ _ _ _ 30 le le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 nombre nombre NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 de de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 fois fois NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 que que PRQ _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 35 les le DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 plans plans NOM _ _ 37 subj _ _ _ _ _ 37 divisent diviser VRB _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 38 la le DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 maille maille NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 40 selon selon PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 41 ses son DET _ _ 43 spe _ _ _ _ _ 42 3 3 NUM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 43 directions direction NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 44 ( ( PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 45 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 46 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 47 b boulevard NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 48 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 49 c cf PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 50 ) ) PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 51 . . PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-894 # text = La Loi de Bragg montre que pour un angle d'incidence ? 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 Loi Loi NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 Bragg Bragg NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 que que ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 pour pour PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 un un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 angle angle NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 d' de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 incidence incidence NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 ? ? PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-895 # text = donné , seul un nombre limité de familles de plans diffracte . 1 donné donner VPP _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 seul seul ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 nombre nombre NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 6 limité limité ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 familles famille NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 plans plans NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 diffracte diffracter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-896 # text = Pour amener toutes les familles de plans à diffracter , il faut donc faire varier l'angle d'incidence . 1 Pour pour PRE _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 amener amener VNF _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 toutes tout ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 familles famille NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 plans plans NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 9 diffracter diffracter VNF _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 11 il il CLS _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 12 faut falloir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 donc donc ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 faire faire VNF _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 varier varier VNF _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 l' le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 angle angle NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 d' de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 incidence incidence NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-897 # text = En pratique le cristal est monté sur une tête goniométrique qui permet sa rotation dans le faisceau . 1 En en PRE _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 pratique pratique NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 le le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 cristal cristal NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 5 est être VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 monté monter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 sur sur PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 une un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 tête tête NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 goniométrique goniométrique ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 qui qui PRQ _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 12 permet permettre VRB _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 sa son DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 rotation rotation NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 dans dans PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 le le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 faisceau faisceau NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-898 # text = En général , une image est enregistrée tout les 0 , 5 ° à 1 ° jusqu'à ce qu'un jeu de données complet soit enregistré , au bout de 180 ° pour les cristaux de la plus basse symétrie ( P1 ) . 1 En en général PRE _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 général en général NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 une un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 image image NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 est est NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 enregistrée enregistrer ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 tout tout ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 10 0 0 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 11 , 0 , 5 PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 12 5 5 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 ° degré NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 à à PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 1 1 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 ° degré NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 jusqu'à jusqu'à ce que CSU _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 18 ce jusqu'à ce que CSU _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 qu' jusqu'à ce que CSU _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 20 un un DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 jeu jeu NOM _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 données donnée NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 complet complet ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 25 soit être VRB _ _ 26 aux _ _ _ _ _ 26 enregistré enregistrer VPP _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 au au bout de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 bout au bout de NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 de au bout de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 180 180 NUM _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 ° degré NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 pour pour PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 les le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 cristaux cristal NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 de de PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 la le DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 38 plus plus ADV _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 39 basse bas ADJ _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 40 symétrie symétrie NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 41 ( ( PUNC _ _ 42 punc _ _ _ _ _ 42 P1 P1 NOM _ _ 35 parenth _ _ _ _ _ 43 ) ) PUNC _ _ 42 punc _ _ _ _ _ 44 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-899 # text = La loi de Bragg montre également que la résolution ( d ) est théoriquement limitée par la seule longueur d'onde . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 loi loi NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 Bragg Bragg NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 également également ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 que que? PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 résolution résolution NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 ( un PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 d un _ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 ) un PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 13 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 théoriquement théoriquement ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 limitée limité ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 par par PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 18 seule seul ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 longueur longueur NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 d' de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 onde onde NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-900 # text = C'est pourquoi le rayonnement doit avoir une longueur d'onde du même ordre de grandeur que les distances interatomiques , c'est à dire de l'ordre de 1 , 5 Å pour pouvoir résoudre des atomes . 1 C' ce CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 pourquoi pourquoi? ADV _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 le le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 rayonnement rayonnement NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 doit devoir VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 avoir avoir VNF _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 une un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 longueur longueur NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 d' de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 onde onde NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 du de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 même même ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 ordre ordre NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 grandeur grandeur NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 que que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 18 les le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 distances distance NOM _ _ 23 periph _ _ _ _ _ 20 interatomiques interatomique ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 22 c' ce CLS _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 23 est être VRB _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 24 à à PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 dire dire VNF _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 de de l'ordre de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 27 l' de l'ordre de DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 ordre de l'ordre de NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 de de l'ordre de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 30 1 1 NUM _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 31 , 1 , 5 PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 32 5 5 NUM _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 Å Å NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 34 pour pour PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 35 pouvoir pouvoir VNF _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 résoudre résoudre VNF _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 des un DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 atomes atome NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-901 # text = La densité électronique appartenant aux plans d'indices h , k , l du réseau réel produit une onde diffractée d'amplitude ( \|F\| ) et de phase ( ? ) . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 densité densité NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 3 électronique électronique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 appartenant appartenir VPR _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 aux à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 plans plans NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 d' de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 indices indice NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 h heure NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 11 k gramme NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 13 l le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 du de+le NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 15 réseau réseau NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 réel réel ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 produit produire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 une un DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 onde onde NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 diffractée diffracter ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 d' de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 amplitude amplitude NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 \|F\| \|F\| NOM _ _ 22 parenth _ _ _ _ _ 25 ) ) PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 21 para _ _ _ _ _ 28 phase phase NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 ( ( PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 30 ? ? PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 31 ) ) PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-902 # text = Cette onde est entièrement définie par son facteur de structure d'expression simplifiée F = \|F\|.ei ? ( F : vecteur F ) . 1 Cette ce DET _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 onde onde NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 est est NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 entièrement entièrement ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 définie définir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 son son DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 facteur facteur NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 structure structure NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 d' de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 expression expression NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 simplifiée simplifier ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 F F NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 \|F\|.ei \|F\|.ei ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 ? ? PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 18 ( ( PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 F F NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 : : PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 vecteur vecteur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 F F NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-903 # text = On peut passer de la densité au facteur de structure et vice-versa par une opération mathématique , la transformation de Fourier . 1 On on CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 peut pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 passer passer VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 densité densité NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 au à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 facteur facteur NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 structure structure NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 12 vice-versa vice-versa ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 par par PRE _ _ 9 para _ _ _ _ _ 14 une un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 opération opération NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 mathématique mathématique ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 transformation transformation NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 Fourier Fourier NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-904 # text = c . L'image 1 c c NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 L' L' NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 image imager VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-905 # text = Les clichés de diffraction sont enregistrés sur un écran CCD ( 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 clichés cliché NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 diffraction diffraction NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 sont être VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 enregistrés enregistrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 sur sur PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 un un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 écran écran NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 CCD CCD NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-906 # text = Coupled Device ) en quelques secondes . 1 Coupled Coupled NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Device Device NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 en en PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 quelques quelque DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 secondes second ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-907 # text = L'intensité de la réflexion est directement proportionnelle au carré de l'amplitude de l'onde 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 intensité intensité NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 réflexion réflexion NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 directement directement ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 proportionnelle proportionnel ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 au à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 carré carré NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 l' le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 amplitude amplitude NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 l' le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 onde onde NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-908 # text = ( I   ~   \|F\| 2 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 2 I I NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3     ADJ _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 4 ~ environ ADV _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 5     VPR _ _ 4 para _ _ _ _ _ 6 \|F\| \|F\| ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 2 2 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-909 # text = Les réflexions ( ou taches ) de coordonnées ( h , k , l ) forment un réseau appelé réseau réciproque [ Figure 17 ] qui peut être considéré comme la représentation de la transformée de Fourier du volume du cristal qui diffracte . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 réflexions réflexion NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 ou ou COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 taches tache NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 coordonnées coordonnée NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ( ( PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 h heure NOM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 12 k k ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 14 l l ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 15 ) ) PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 16 forment former VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 un un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 réseau réseau NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 appelé appeler ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 réseau réseau NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 réciproque réciproque ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 [ ( PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 23 Figure Figure NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 24 17 17 NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 ] ) PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 26 qui qui PRQ _ _ 27 subj _ _ _ _ _ 27 peut pouvoir VRB _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 28 être être VNF _ _ 29 aux _ _ _ _ _ 29 considéré considérer VPP _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 comme comme PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 la le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 représentation représentation NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 de de PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 la le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 transformée transformée NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 de de PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 Fourier Fourier NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 du de PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 39 volume volume NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 du de PRE _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 cristal cristal NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 qui qui PRQ _ _ 43 subj _ _ _ _ _ 43 diffracte diffracter VRB _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 44 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-910 # text = La loi de Bragg et l'expression de la position de la réflexion sur l'image en fonction de l'angle ? 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 loi loi NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 Bragg Bragg NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 expression expression NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 position position NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 réflexion réflexion NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 sur sur ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 l' le CLI _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 image imager VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 en en PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 fonction fonction NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 l' le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 angle angle NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 ? ? PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-911 # text = permettent d'établir une relation simple entre la position d'un point dans le réseau réciproque et la distance entre les plans qui diffractent  : 1 permettent permettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 d' de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 établir établir VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 une un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 relation relation NOM _ _ 1 subj _ _ _ _ _ 6 simple simple ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 entre entre PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 position position NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 d' de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 un un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 point point NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 dans dans PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 14 le le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 réseau réseau NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 réciproque réciproque ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 distance distance NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 20 entre entre PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 les le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 plans plans NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 qui qui PRQ _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 24 diffractent diffracter VRB _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25  : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-912 # text = d = ? / 2 sin ( Arctan ( x / D ) / 2 ) avec D : 1 d de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ? ? PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 / sur PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 2 2 NUM _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 sin sein NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 8 Arctan Arctan NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 ( ( PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 x ex NOM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 11 / sur PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 12 D D NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 14 / ou PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 2 2 NUM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 16 ) ) PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 17 avec avec PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 18 D D NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 : : PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-913 # text = distance cristal-détecteur et X : 1 distance distancer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 cristal-détecteur cristal-détecteur NOM _ _ 1 subj _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 4 X X NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 5 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-914 # text = distance de la tache au centre de l'image . 1 distance distancer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 tache tache NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 au au centre de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 centre au centre de NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de au centre de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 image image NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-915 # text = On voit que les dimensions du réseau réciproque sont inversement proportionnelles à celles du réseau réel , ce qui explique notamment que l'information de haute résolution se trouve à la périphérie de l'image . 1 On on CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 voit voir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 dimensions dimension NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 6 du de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 réseau réseau NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 réciproque réciproque ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 sont être VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 10 inversement inversement ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 proportionnelles proportionnel ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 à à PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 celles celui PRQ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 du de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 réseau réseau NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 réel réel ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 ce ce PRQ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 19 qui qui PRQ _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 20 explique expliquer VRB _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 notamment notamment ADV _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 que que CSU _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 l' le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 information information NOM _ _ 29 subj _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 haute haut ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 27 résolution résolution NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 se se CLI _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 29 trouve trouver VRB _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 30 à à PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 la le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 périphérie périphérie NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 de de PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 l' le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 image image NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-916 # text = d . Le problème des phases 1 d d NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Le Le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 problème problème NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 des de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 phases phase NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-917 # text = Le problème majeur de la cristallographie des macromolécules tient dans la perte d'information des phases des ondes diffractées . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 problème problème NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 majeur majeur ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 cristallographie cristallographie NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 macromolécules macro- NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 tient tenir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 perte perte NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 d' de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 information information NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 des de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 phases phase NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 des de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ondes onde NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 diffractées diffracter ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-918 # text = Seules les intensités des faisceaux diffractés sont enregistrées et l'information de déphasage des ondes les unes par rapport aux autres est perdue . 1 Seules seul ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 intensités intensité NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 faisceaux faisceaux NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 diffractés diffracter ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 sont être VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 enregistrées enregistrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 information information NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 déphasage déphasage NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 des un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 ondes onde NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 unes une NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 par par PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 rapport rapport NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 aux à PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 autres autre ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 22 est est NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 perdue perdre ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-919 # text = Les détecteurs n'ont pas la capacité technique d'enregistrer cette information temporelle pourtant essentielle pour définir le facteur de structure qui permet de calculer la densité atomique . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 détecteurs détecteur NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 n' ne ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 ont avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 pas pas ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 capacité capacité NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 technique technique ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 d' de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 enregistrer enregistrer VNF _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 cette ce DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 information information NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 temporelle temporel ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 pourtant pourtant ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 essentielle essentiel ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 pour pour PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 17 définir définir VNF _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 le le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 facteur facteur NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 structure structure NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 qui qui PRQ _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 23 permet permettre VRB _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 calculer calculer VNF _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 la le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 densité densité NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 atomique atomique ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-920 # text = Le problème des phases peut être résolu de manière expérimentale par l'utilisation de la diffusion anomale et la résolution d'une sous-structure ou par la technique du remplacement moléculaire . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 problème problème NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 phases phase NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 peut pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 être être VNF _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 résolu résoudre VPP _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 manière manière NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 expérimentale expérimental ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 par par PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 l' le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 utilisation utilisation NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 diffusion diffusion NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 anomale anomal ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 résolution résolution NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 21 d' de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 une un DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 sous-structure sous- NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 ou ou COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 25 par par PRE _ _ 21 para _ _ _ _ _ 26 la le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 technique technique NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 du de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 remplacement remplacement NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-921 # text = Les méthodes faisant appel à la diffusion anomale supposent que la protéine contient des atomes de fort poids moléculaire ( S , Se , métaux lourds ) qui auront été introduits par trempage des cristaux ou au moment de l'expression de la protéine . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 méthodes méthode NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 faisant faire VPR _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 appel appel NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 diffusion diffusion NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 anomale anomal ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 supposent supposer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 que que CSU _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 protéine protéine NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 13 contient contenir VRB _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 des de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 atomes atome NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 fort fort ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 poids poids NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 21 S S NOM _ _ 13 parenth _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 Se Se NOM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 25 métaux métal NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 lourds lourd ADJ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 ) ) PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 28 qui qui PRQ _ _ 31 subj _ _ _ _ _ 29 auront avoir VRB _ _ 30 aux _ _ _ _ _ 30 été être VPP _ _ 31 aux _ _ _ _ _ 31 introduits introduire VPP _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 32 par par PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 trempage trempage NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 des de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 cristaux cristal NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 ou ou COO _ _ 37 mark _ _ _ _ _ 37 au à PRE _ _ 34 para _ _ _ _ _ 38 moment moment NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 de de PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 l' le DET _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 41 expression expression NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 de de PRE _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 la le DET _ _ 44 spe _ _ _ _ _ 44 protéine protéine NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 45 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-922 # text = Ces méthodes ( MIR , MAD , SAD , SIRAS ... ) sont plus compliquées à mettre en oeuvre puisque la position des atomes lourds doit être connue avant de pouvoir déterminer celle du reste des atomes de la protéine . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 méthodes méthode NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 4 MIR MIR NOM _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 MAD MAD NOM _ _ 4 para _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 SAD SAD NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 SIRAS SIRAS NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 11 ... ... PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 12 ) ) PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 13 sont être VRB _ _ 15 aux _ _ _ _ _ 14 plus plus ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 compliquées compliquer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 à à PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 mettre mettre VNF _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 en en PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 oeuvre oeuvre NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 puisque puisque CSU _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 21 la le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 position position NOM _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 23 des de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 atomes atome NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 lourds lourd ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 doit devoir VRB _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 27 être être VNF _ _ 28 aux _ _ _ _ _ 28 connue connaître VPP _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 avant avant de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 de avant de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 pouvoir pouvoir VNF _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 déterminer déterminer VNF _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 celle celui PRQ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 du de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 reste reste NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 des de PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 atomes atome NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 de de PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 la le DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 protéine protéine NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-923 # text = La technique du remplacement moléculaire ne nécessite qu'un seul jeu de données et s'appuie sur le modèle d'une structure proche pour résoudre le problème des phases . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 technique technique NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 remplacement remplacement NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ne ne ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 nécessite nécessiter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 qu' que ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 un un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 10 seul seul ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 jeu jeu NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 données donnée NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 15 s' s' CLI _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 appuie appuyer VRB _ _ 7 para _ _ _ _ _ 17 sur sur PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 le le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 modèle modèle NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 d' de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 une un DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 structure structure NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 proche proche ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 pour pour PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 25 résoudre résoudre VNF _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 le le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 problème problème NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 des de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 phases phase NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-924 # text = III . Collecte et traitement des données de diffraction 1 III iii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Collecte Collecte NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 traitement traitement NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 données donnée NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 diffraction diffraction NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-925 # text = a . Collecte des données 1 a a NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Collecte Collecte VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 des un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 données donné ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-926 # text = Nous avons utilisé le rayonnement synchrotron de l'ESRF avec des longueurs d'onde voisines de 1 Å. La ligne microfocus ID 23 -eh 2 a notamment permis d'irradier des volumes différents d'un même cristal affin de reconstituer un jeu de données complet et de qualité satisfaisante . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 utilisé utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 le le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 rayonnement rayonnement NOM _ _ 28 subj _ _ _ _ _ 6 synchrotron synchrotron NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 ESRF ESRF NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 avec avec PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 11 des un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 longueurs longueur NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 d' de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 onde onde NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 voisines voisin ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 17 1 1 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 Å. Å. VPR _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 La La DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 ligne ligne NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 microfocus micro- NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 ID ID NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 23 23 NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 24 -eh eh ADV _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 25 2 2 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 26 a avoir VRB _ _ 28 aux _ _ _ _ _ 27 notamment notamment ADV _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 28 permis permettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 29 d' de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 irradier irradier VNF _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 des un DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 volumes volume NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 différents différent ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 d' de PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 un un DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 36 même même ADJ _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 37 cristal cristal NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 38 affin affin ADJ _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 de de PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 reconstituer reconstituer VNF _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 un un DET _ _ 42 spe _ _ _ _ _ 42 jeu jeu NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 43 de de PRE _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 données donnée NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 complet complet NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 et et COO _ _ 47 mark _ _ _ _ _ 47 de de PRE _ _ 43 para _ _ _ _ _ 48 qualité qualité NOM _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 49 satisfaisante satisfaisant ADJ _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 . . PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-927 # text = Le chargement automatique des cristaux ( sample-changer ) a permis de tester la diffraction de plusieurs cristaux avant d'effectuer la collecte . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 chargement chargement NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 automatique automatique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 cristaux cristal NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ( ( PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 sample-changer semple N+V _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 9 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 permis permis NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 tester tester VNF _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 diffraction diffraction NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 plusieurs plusieurs DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 cristaux cristal NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 avant avant de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 19 d' avant de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 effectuer effectuer VNF _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 la le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 collecte collecte NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-928 # text = b . Intégration et mise à l'échelle 1 b b NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Intégration Intégration NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 mise mise NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 l' le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 échelle échelle NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-929 # text = On appelle intégration la démarche allant du jeu d'images de diffraction jusqu'au fichier contenant les réflexions indexées par les entiers h , k , l et mesurées par les amplitudes et leurs écarts-types associés . 1 On on CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 appelle appeler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 intégration intégration NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 démarche démarche NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 allant aller VPR _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 du de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 jeu jeu NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 d' de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 images image NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 diffraction diffraction NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 jusqu'au jusqu'à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 14 fichier fichier NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 contenant contenir VPR _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 réflexions réflexion NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 indexées indexer VPP _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 par par PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 les le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 21 entiers entier ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 22 h heure NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 24 k gramme NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 26 l le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 et et NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 28 mesurées mesurer VPP _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 par par PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 les le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 amplitudes amplitude NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 34 mark _ _ _ _ _ 33 leurs son DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 écarts-types écart-type NOM _ _ 31 para _ _ _ _ _ 35 associés associer ADJ _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-930 # text = Ce traitement est effectué de manière automatisé et comporte plusieurs étapes détaillées ci-dessous . 1 Ce ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 traitement traitement NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 effectué effectuer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 manière manière NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 automatisé automatiser ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 9 comporte comporter VRB _ _ 4 para _ _ _ _ _ 10 plusieurs plusieurs DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 étapes étape NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 détaillées détaillé ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ci-dessous ci-dessous ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-931 # text = Nous avons utilisé les programmes MOSFLM ( Leslie , 2006 ) et SCALLA de la suite CCP4 ( Collaborative Computational Project , 1994 ) ou la suite 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 utilisé utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 programmes programme NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 MOSFLM MOSFLM NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 Leslie Leslie NOM _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 10 2006 2006 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 SCALLA SCALLA NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 suite suite NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 CCP4 CCP4 NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 19 Collaborative Collaborative ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 20 Computational Computational NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 Project Project NOM _ _ 16 parenth _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 23 1994 1994 NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 25 ou ou COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 26 la le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 suite suite NOM _ _ 16 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-932 # text = XDS / XSCALE ( Kabsch , 1993 ) suivant les cas . 1 XDS XDS NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 / sur PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 XSCALE XSCALE NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Kabsch Kabsch NOM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 1993 1993 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 9 suivant suivant PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 les le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 cas cas NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-933 # text = i . Détermination de la maille et du groupe d'espace 1 i i NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Détermination Détermination NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 maille maille NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 4 para _ _ _ _ _ 9 groupe groupe NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 d' de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 espace espace NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-934 # text = Cette première étape de l'intégration est effectuée avec un algorithme d'auto-indexation . 1 Cette ce DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 première premier ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 étape étape NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 intégration intégration NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 est être VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 effectuée effectuer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 avec avec PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 un un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 algorithme algorithme NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 d' de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 auto-indexation auto- NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-935 # text = Des pics correspondant aux taches de diffraction sont mesurés sur une ou plusieurs images . 1 Des un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 pics pic NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 correspondant correspondre VPR _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 aux à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 taches tache NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 diffraction diffraction NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 sont être VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 mesurés mesurer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 sur sur PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 une un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 12 ou ou COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 13 plusieurs plusieurs DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 14 images image NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-936 # text = Une liste de vecteurs entre pics est ensuite écrite . 1 Une un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 liste liste NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 vecteurs vecteur NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 entre entre PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 pics pic NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 est être VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 8 ensuite ensuite ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 écrite écrire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-937 # text = Les pics correspondent à des noeuds du réseau réciproque . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 pics pic NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 correspondent correspondre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 des un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 noeuds noeud NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 du de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 réseau réseau NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 réciproque réciproque ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-938 # text = L'auto-indexation va donc déterminer trois vecteurs non-coplanaires et le plus petit module permettant de rendre compte de la liste de pics . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 auto-indexation auto- NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 va aller VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 donc donc ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 déterminer déterminer VNF _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 trois trois NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 vecteurs vecteur NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 non-coplanaires non- ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 10 le le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 11 plus plus ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 petit petit ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 module module NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 14 permettant permettre VPR _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 rendre rendre VNF _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 compte compte NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 liste liste NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 pics pic NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-939 # text = Le réseau réel est ensuite estimé , celui -ci impose un choix de groupes d'espace limité . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 réseau réseau NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 réel réel ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 est être VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 5 ensuite ensuite ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 estimé estimer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 8 celui celui PRQ _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 9 -ci -ci ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 impose imposer VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 un un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 choix choix NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 groupes groupe NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 d' de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 espace espace NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 limité limité ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-940 # text = Cependant des ambiguïtés peuvent demeurer quant aux axes hélicoïdaux et à leur sens . 1 Cependant cependant ADV _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 des un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 ambiguïtés ambiguïté NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 peuvent pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 demeurer demeurer VNF _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 quant quant à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 aux quant à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 axes axe NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 hélicoïdaux hélicoïdal ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 à à PRE _ _ 7 para _ _ _ _ _ 12 leur son DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 sens sens NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-941 # text = Ces ambiguïtés ne peuvent être vraiment résolues que pendant l'étape de résolution de la structure . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 ambiguïtés ambiguïté NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 ne ne ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 peuvent pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 être être VNF _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 6 vraiment vraiment ADV _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 7 résolues résoudre VPP _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 que que ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 pendant pendant PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 étape étape NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 résolution résolution NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 structure structure NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-942 # text = ii . 1 ii if NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-943 # text = Indexation , intégration et correction des intensités 1 Indexation indexation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 intégration intégration NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 correction correction NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 intensités intensité NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-944 # text = Ces étapes sont réalisées avec les programmes MOSFLM ou XDS . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 étapes étape NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 sont être VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 réalisées réaliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 avec avec PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 programmes programme NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 MOSFLM MOSFLM NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ou ou COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 XDS XDS NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-945 # text = Les données sont indexées image par image en affinant un certain nombre de paramètres comme la distance cristal-détecteur , la position du centre du détecteur , l'orientation du cristal , les paramètres de maille etc. Les profils de diffraction prédits sont ajustés aux taches observées . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 données donnée NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 indexées indexer ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 image image NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 par par PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 image image NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 en en PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 affinant affiner VPR _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 un un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 11 certain certain ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 nombre nombre NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 paramètres paramètre NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 comme comme CSU _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 distance distance NOM _ _ 42 subj _ _ _ _ _ 18 cristal-détecteur cristal-détecteur NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 position position NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 22 du de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 centre centre NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 du de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 détecteur détecteur NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 27 l' le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 orientation orientation NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 29 du de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 30 cristal cristal NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 32 les le DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 paramètres paramètre NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 34 de de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 maille maille NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 etc. etc. ADV _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 37 Les Les DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 profils profil NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 39 de de PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 diffraction diffraction NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 prédits prédire ADJ _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 42 sont être VRB _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 43 ajustés ajuster VPP _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 44 aux à PRE _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 taches tache NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 observées observer ADJ _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-946 # text = Chaque tache est alors indexée en h , k et l . 1 Chaque chaque DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 tache tache NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 4 alors alors ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 indexée indexer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 en en PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 h heure NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 9 k gramme NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 l le _ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-947 # text = Dans le même temps , l'intensité de la tache de diffraction est mesurée en appliquant un masque autour de la tache . 1 Dans dans PRE _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 2 le le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 3 même même ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 temps temps NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 intensité intensité NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 tache tache NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 diffraction diffraction NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 est être VRB _ _ 14 aux _ _ _ _ _ 14 mesurée mesurer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 en en PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 appliquant appliquer VPR _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 un un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 masque masque NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 autour autour de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 de autour de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 la le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 tache tache NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-948 # text = La couronne interne délimite la surface à intégrer et la couronne externe permet d'estimer le bruit de fond à retrancher de l'intensité intégrée . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 couronne couronne NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 interne interne ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 délimite délimiter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 surface surface NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 à à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 intégrer intégrer VNF _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 couronne couronne NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 12 externe externe ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 permet permettre VRB _ _ 4 para _ _ _ _ _ 14 d' de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 estimer estimer VNF _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 le le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 bruit bruit NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 fond fond NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 à à PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 retrancher retrancher VNF _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 l' le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 intensité intensité NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 intégrée intégrer ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-949 # text = Chaque tache est donc corrigée du bruit de fond et l'ajustement des masques pour les taches doit être optimal afin de maximiser le rapport signal / bruit . 1 Chaque chaque DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 tache tache NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 4 donc donc ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 corrigée corriger VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 du de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 bruit bruit NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 fond fond NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 11 l' le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 ajustement ajustement NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 13 des de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 masques masque NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 pour pour PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 taches tache NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 doit devoir VRB _ _ 5 para _ _ _ _ _ 19 être être VNF _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 optimal optimal ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 afin afin de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 de afin de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 maximiser maximiser VNF _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 le le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 rapport rapport NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 signal signal NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 / sur PUNC _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 bruit bruit NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-950 # text = Différentes corrections sont également appliquées comme la correction cinématique de Lorentz tenant compte du passage différentiel des noeuds du réseau réciproque en position de diffraction : 1 Différentes différent DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 corrections correction NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 sont être VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 4 également également ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 appliquées appliquer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 comme comme PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 correction correction NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 cinématique cinématique ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 Lorentz Lorentz NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 tenant tenir VPR _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 compte compte NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 du de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 passage passage NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 différentiel différentiel ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 des de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 noeuds noeud NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 du de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 réseau réseau NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 réciproque réciproque ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 en en PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 position position NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 diffraction diffraction NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 : : PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-951 # text = un noeud proche de l'axe de rotation sera en position de diffraction plus longtemps qu'un noeud éloigné . 1 un un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 noeud noeud NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 proche proche ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 axe axe NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 rotation rotation NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 sera être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 en en PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 position position NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 diffraction diffraction NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 plus plus ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 longtemps longtemps ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 16 qu' que CSU _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 un un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 noeud noeud NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 éloigné éloigner ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-952 # text = iii . 1 iii ici ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-953 # text = Mise à l'échelle et réduction du jeu de données 1 Mise mettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 à à PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 l' le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 échelle échelle NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 6 réduction réduction NOM _ _ 4 para _ _ _ _ _ 7 du de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 jeu jeu NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 données donnée NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-954 # text = L'ensemble des images intégrées sont mises à l'échelle afin de constituer un jeu de données complet . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 ensemble ensemble NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 images image NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 intégrées intégrer ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 sont être VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 mises mettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 échelle échelle NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 afin afin de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 de afin de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 constituer constituer VNF _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 un un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 jeu jeu NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 données donnée NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 complet complet ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-955 # text = Chaque image diffère par la dose de rayons X reçue et par la baisse du pouvoir de diffraction du cristal . 1 Chaque chaque DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 image image NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 diffère différer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 par par PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 dose dose NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 rayons rayons NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 X X ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 reçue recevoir ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 par par PRE _ _ 4 para _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 baisse baisse NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 du de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 pouvoir pouvoir NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 diffraction diffraction NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 du de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 cristal cristal NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-956 # text = Le jeu de données mis à l'échelle est ensuite moyenné sur les réflexions équivalentes par symétrie ou collectées plusieurs fois . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 jeu jeu NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 données donnée NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 mis mettre VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 l' le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 échelle échelle NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 est être VRB _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 10 ensuite ensuite ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 moyenné moyenner VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 sur sur PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 réflexions réflexion NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 équivalentes équivalent ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 par par PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 symétrie symétrie NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ou ou COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 19 collectées collecter VPP _ _ 11 para _ _ _ _ _ 20 plusieurs plusieurs DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 fois fois NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-957 # text = Cette étape est réalisée par le programme SCALA ou XSCALE . 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 étape étape NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 réalisée réaliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 par par PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 le le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 programme programme NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 SCALA SCALA NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ou ou COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 XSCALE XSCALE NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-958 # text = Les données moyennées sur les réflexions équivalentes par symétrie peuvent ensuite être réduites à l'unité asymétrique . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 données donnée NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 3 moyennées moyenner VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 sur sur PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 réflexions réflexion NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 équivalentes équivalent ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 par par PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 symétrie symétrie NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 peuvent pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 ensuite ensuite ADV _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 être être VNF _ _ 13 aux _ _ _ _ _ 13 réduites réduire VPP _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 à à PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 l' le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 unité unité NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 asymétrique asymétrique ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-959 # text = Dans SCALA , la qualité du jeu de données peut être estimée par les valeurs des Rsym entre les réflexions équivalentes sur l'ensemble du jeu de données et par le rapport signal / bruit I / sI. où Ii ( h ) est la i-ème mesure et < I ( h ) > la moyenne pondérée de toutes les mesures Ii ( h ) des réflexions équivalentes . 1 Dans dans PRE _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 SCALA SCALA NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 qualité qualité NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 6 du de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 jeu jeu NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 données donnée NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 peut pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 être être VNF _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 12 estimée estimer VPP _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 par par PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 les le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 valeurs valeur NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 des de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 Rsym Rsym NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 entre entre PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 les le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 réflexions réflexion NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 équivalentes équivalent ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 sur sur PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 l' le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 ensemble ensemble NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 du de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 jeu jeu NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 données donnée NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 et et COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 30 par par PRE _ _ 13 para _ _ _ _ _ 31 le le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 rapport rapport NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 signal signal NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 / sur PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 35 bruit bruit NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 I I NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 / sur PUNC _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 38 sI. sI. NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 où où PRQ _ _ 44 periph _ _ _ _ _ 40 Ii Ii NOM _ _ 44 subj _ _ _ _ _ 41 ( ( PUNC _ _ 42 punc _ _ _ _ _ 42 h heure NOM _ _ 40 parenth _ _ _ _ _ 43 ) ) PUNC _ _ 42 punc _ _ _ _ _ 44 est être VRB _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 45 la la NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 i-ème id est C+V _ _ 44 para _ _ _ _ _ 47 mesure mesure NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 et et COO _ _ 49 mark _ _ _ _ _ 49 < < NOM _ _ 47 para _ _ _ _ _ 50 I I NOM _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 51 ( ( PUNC _ _ 52 punc _ _ _ _ _ 52 h heure NOM _ _ 47 parenth _ _ _ _ _ 53 ) ) PUNC _ _ 52 punc _ _ _ _ _ 54 > > VPR _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 55 la le DET _ _ 56 spe _ _ _ _ _ 56 moyenne moyenne NOM _ _ 54 dep _ _ _ _ _ 57 pondérée pondérer ADJ _ _ 56 dep _ _ _ _ _ 58 de de PRE _ _ 56 dep _ _ _ _ _ 59 toutes tout ADJ _ _ 61 dep _ _ _ _ _ 60 les le DET _ _ 61 spe _ _ _ _ _ 61 mesures mesure NOM _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 62 Ii Ii NOM _ _ 61 dep _ _ _ _ _ 63 ( ( PUNC _ _ 64 punc _ _ _ _ _ 64 h heure NOM _ _ 61 parenth _ _ _ _ _ 65 ) ) PUNC _ _ 64 punc _ _ _ _ _ 66 des de PRE _ _ 61 dep _ _ _ _ _ 67 réflexions réflexion NOM _ _ 66 dep _ _ _ _ _ 68 équivalentes équivalent ADJ _ _ 67 dep _ _ _ _ _ 69 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-960 # text = XSCALE utilise un autre critère , le c 2 , où Ii ( h ) est la i-ème mesure , < I ( h ) > la moyenne pondérée de toutes les mesures Ii ( h ) des réflexions équivalentes , E est l'erreur du modèle et N est un facteur corrigeant la corrélation entre I et < i > . 1 XSCALE XSCALE NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 utilise utiliser VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 4 autre autre ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 critère critère NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 7 le le _ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 c ce DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 2 2 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 11 où où PRQ _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 12 Ii Ii NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 13 ( ( PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 h heure NOM _ _ 12 parenth _ _ _ _ _ 15 ) ) PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 16 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 la la NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 i-ème id est C+V _ _ 16 para _ _ _ _ _ 19 mesure mesure NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 21 < < NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 I I NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 h heure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 ) ) PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 > > VPR _ _ 0 root _ _ _ _ _ 27 la le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 moyenne moyenne NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 pondérée pondérer ADJ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 de de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 toutes tout ADJ _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 32 les le DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 mesures mesure NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 34 Ii Ii NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 ( ( PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 36 h heure NOM _ _ 33 parenth _ _ _ _ _ 37 ) ) PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 38 des de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 39 réflexions réflexion NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 équivalentes équivalent ADJ _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 , , PUNC _ _ 55 punc _ _ _ _ _ 42 E E NOM _ _ 43 subj _ _ _ _ _ 43 est être VRB _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 44 l' le DET _ _ 45 spe _ _ _ _ _ 45 erreur erreur NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 46 du de PRE _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 modèle modèle NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 et et COO _ _ 50 mark _ _ _ _ _ 49 N N NOM _ _ 50 subj _ _ _ _ _ 50 est être VRB _ _ 43 para _ _ _ _ _ 51 un un DET _ _ 52 spe _ _ _ _ _ 52 facteur facteur NOM _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 53 corrigeant corriger VPR _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 54 la le DET _ _ 55 spe _ _ _ _ _ 55 corrélation corrélation NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 56 entre entre PRE _ _ 55 dep _ _ _ _ _ 57 I I NOM _ _ 56 dep _ _ _ _ _ 58 et et COO _ _ 59 mark _ _ _ _ _ 59 < < NOM _ _ 57 para _ _ _ _ _ 60 i id est COO _ _ 61 mark _ _ _ _ _ 61 > > NOM _ _ 59 para _ _ _ _ _ 62 . . PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-961 # text = Enfin , les amplitudes sont calculées à partir des intensités avec le programme TRUNCATE . 1 Enfin enfin ADV _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 les le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 amplitudes amplitude NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 5 sont être VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 calculées calculer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 à à partir de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 partir à partir de DET _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 des à partir de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 intensités intensité NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 avec avec PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 12 le le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 programme programme NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 TRUNCATE TRUNCATE NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-962 # text = Il faut tenir compte à cette étape des intensités des réflexions faibles qui peuvent avoir été estimées négatives lors de la correction du bruit de fond . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 faut falloir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 tenir tenir VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 compte compte NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 cette ce DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 étape étape NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 intensités intensité NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 réflexions réflexion NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 faibles faible ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 qui qui PRQ _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 14 peuvent pouvoir VRB _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 avoir avoir VNF _ _ 16 aux _ _ _ _ _ 16 été être VPP _ _ 17 aux _ _ _ _ _ 17 estimées estimer VPP _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 négatives négatif ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 lors lors de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 de lors de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 la le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 correction correction NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 du de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 bruit bruit NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 fond fond NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-963 # text = c . Remplacement moléculaire 1 c c NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Remplacement Remplacement NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-964 # text = Il faut pour pouvoir utiliser cette technique disposer d'une structure proche déjà résolue . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 faut falloir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 pouvoir pouvoir VNF _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 utiliser utiliser VNF _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 cette ce DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 technique technique NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 disposer disposer VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 9 d' de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 une un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 structure structure NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 proche proche ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 déjà déjà ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 résolue résoudre ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-965 # text = On fixe en général la limite au-dessous de laquelle le remplacement moléculaire n'est plus possible à 25 - 30 % d'identité de séquences . 1 On on CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 fixe fixer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 en en général PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 général en général NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 limite limite NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 au-dessous au-dessous de PRE _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 8 de au-dessous de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 laquelle lequel PRQ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 le le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 remplacement remplacement NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 12 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 n' ne ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 est être VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 15 plus plus ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 possible possible ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 à à PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 25 25 NUM _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 19 - 25 - 30 PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 30 30 NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 % pourcent NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 22 d' de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 identité identité NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 séquences séquence NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-966 # text = La technique , initiée par Rossman et Blow en 1962 est de plus en plus communément utilisée avec l'accroissement des structures disponibles dans les banques de données . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 technique technique ADJ _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 initiée initier ADJ _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 5 par par PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 Rossman Rossman NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 8 Blow Blow NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 9 en en PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 10 1962 1962 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 est être VRB _ _ 17 aux _ _ _ _ _ 12 de de plus en plus ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 13 plus de plus en plus ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 en de plus en plus PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 plus de plus en plus ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 communément communément ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 utilisée utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 avec avec PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 l' le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 accroissement accroissement NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 des de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 structures structure NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 disponibles disponible ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 dans dans PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 25 les le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 banques banque NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 données donnée NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-967 # text = Son principe repose sur l'utilisation des phases de la structure connue et placée dans la même orientation que la structure à déterminer , en combinaison avec les amplitudes obtenues expérimentalement pour calculer une première carte de densité . 1 Son son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 principe principe NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 repose reposer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 sur sur PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 utilisation utilisation NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 des de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 phases phase NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 structure structure NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 connue connaître ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 placée placer VPP _ _ 12 para _ _ _ _ _ 15 dans dans PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 17 même même ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 orientation orientation NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 que que CSU _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 structure structure NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 à à PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 déterminer déterminer VNF _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 en en PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 combinaison combinaison NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 avec avec PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 les le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 amplitudes amplitude NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 obtenues obtenir VPP _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 expérimentalement expérimentalement ADV _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 pour pour PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 calculer calculer VNF _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 une un DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 35 première premier ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 36 carte carte NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 37 de de PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 densité densité NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-968 # text = Nous avons utilisé pour cela les programme AMORE ( Navaza , 1994 ) et MolRep de la suite CCP4 ( Collaborative Computational Project , 1994 ) . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 utilisé utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 cela cela PRQ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 programme programme NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 AMORE AMORE NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ( ( PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 Navaza Navaza NOM _ _ 7 parenth _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 12 1994 1994 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 MolRep MolRep NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 suite suite NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 CCP4 CCP4 NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 21 Collaborative Collaborative ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 22 Computational Computational NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 23 Project Project NOM _ _ 15 parenth _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 1994 1994 NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 ) ) PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-969 # text = Les deux programmes procèdent de façon similaire . 1 Les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 deux deux NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 programmes programme NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 procèdent procéder VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 façon façon NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 similaire similaire ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-970 # text = Pour superposer au mieux le modèle et la structure à déterminer , le modèle subit d'abord une rotation puis une translation . 1 Pour pour PRE _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 2 superposer superposer VNF _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 au à+le PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 mieux au mieux ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 modèle modèle NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 structure structure NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 10 à à PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 déterminer déterminer VNF _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 13 le le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 modèle modèle NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 15 subit subir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 d' d'abord PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 abord d'abord NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 une un DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 rotation rotation NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 20 puis puis COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 21 une un DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 translation translation NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-971 # text = La fonction de rotation évalue , en fonction de l'orientation du modèle par rapport à celle de la structure à déterminer , l'accord entre les vecteurs interatomiques . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 fonction fonction NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 rotation rotation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 évalue évaluer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 7 en en PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 fonction fonction NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 orientation orientation NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 du de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 modèle modèle NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 par par PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 rapport rapport NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 à à PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 celle celui PRQ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 structure structure NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 à à PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 déterminer déterminer VNF _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 24 l' le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 accord accord NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 26 entre entre PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 les le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 vecteurs vecteur NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 interatomiques interatomique ADJ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-972 # text = Ces vecteurs sont obtenus par la fonction de Patterson de type « Self-Patterson » . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 vecteurs vecteur NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 sont être VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 obtenus obtenir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 par par PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 fonction fonction NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 Patterson Patterson NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 type type NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 « « PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Self-Patterson Self-Patterson NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 » » PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-973 # text = Si plusieurs molécules existent dans l'unité asymétrique et qu'elles n'ont pas la même orientation ( symétries non cristallographiques ) , alors la fonction de rotation aura plusieurs solutions . 1 Si si CSU _ _ 29 periph _ _ _ _ _ 2 plusieurs plusieurs DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 molécules molécule NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 existent exister VRB _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 dans dans PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 unité unité NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 asymétrique asymétrique ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 qu' que CSU _ _ 1 para _ _ _ _ _ 11 elles elles CLS _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 12 n' ne ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 ont avoir VRB _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 pas pas ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 16 même même ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 orientation orientation NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 ( ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 symétries symétrie NOM _ _ 17 parenth _ _ _ _ _ 20 non non ADV _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 cristallographiques cristallographique ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 ) ) PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 24 alors alors ADV _ _ 29 periph _ _ _ _ _ 25 la le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 fonction fonction NOM _ _ 29 subj _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 rotation rotation NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 aura avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 30 plusieurs plusieurs DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 solutions solution NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-974 # text = le modèle est ensuite positionné dans la maille par une opération de translation . 1 le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 modèle modèle NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 4 ensuite ensuite ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 positionné positionner VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 dans dans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 maille maille NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 par par PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 une un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 opération opération NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 translation translation NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-975 # text = Une fonction de translation compare les vecteurs intermoléculaires de la structure connue et inconnue pour différentes positions du modèle . 1 Une un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 fonction fonction NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 translation translation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 compare comparer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 vecteurs vecteur NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 intermoléculaires intermoléculaire ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 structure structure NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 connue connu ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 inconnue inconnu ADJ _ _ 12 para _ _ _ _ _ 15 pour pour PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 16 différentes différent DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 positions position NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 du de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 modèle modèle NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-976 # text = Ces vecteurs sont obtenus par la fonction de Patterson de type 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 vecteurs vecteur NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 sont être VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 obtenus obtenir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 par par PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 fonction fonction NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 Patterson Patterson NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 type type NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-977 # text = «  Cross-Patterson  » . 1 «  « _ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 Cross-Patterson Cross-Patterson NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3  » » _ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-978 # text = La qualité des solutions est estimée par la valeur des coefficients C ( corrélation ) et R ( différence ) calculée à partir des amplitudes des facteurs de structure du modèle et de la structure à déterminer . 1 La là ADV _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 qualité qualité NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 solutions solution NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 est être VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 estimée estimer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 par par PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 valeur valeur NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 coefficients coefficient NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 C C NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ( ( PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 corrélation corrélation NOM _ _ 11 parenth _ _ _ _ _ 15 ) ) PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 R R NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 18 ( ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 différence différence NOM _ _ 17 parenth _ _ _ _ _ 20 ) ) PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 21 calculée calculer VPP _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 22 à à partir de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 partir à partir de DET _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 des à partir de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 amplitudes amplitude NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 des de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 facteurs facteur NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 structure structure NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 du de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 modèle modèle NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 33 mark _ _ _ _ _ 33 de de PRE _ _ 28 para _ _ _ _ _ 34 la le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 structure structure NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 à à PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 déterminer déterminer VNF _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-979 # text = L'examen de l'empilement cristallin du modèle permet également de vérifier que la solution est acceptable . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 examen examen NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 empilement empilement NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 cristallin cristallin ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 du de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 modèle modèle NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 permet permettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 également également ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 vérifier vérifier VNF _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 que que CSU _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 solution solution NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 16 est être VRB _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 acceptable acceptable ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-980 # text = IV . Affinement du modèle 1 IV iv NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Affinement Affinement NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 modèle modèle NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-981 # text = Une fois que la première carte de densité est obtenue à partir du modèle issu du remplacement moléculaire commence le processus d'affinement cristallographique . 1 Une une fois PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 fois une fois PRE _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 3 que que? PRQ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 première premier ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 carte carte NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 densité densité NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 est être VRB _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 obtenue obtenir VPP _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 11 à à partir de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 partir à partir de DET _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 du à partir de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 modèle modèle NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 issu issu ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 du de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 remplacement remplacement NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 commence commencer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 le le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 processus processus NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 d' de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 affinement affinement NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 cristallographique cristallographique ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-982 # text = Il vise à optimiser le modèle moléculaire , c'est-à-dire à modifier par une procédure mathématique et des interventions manuelles , ses paramètres ( coordonnées des atomes , facteurs B , ajout de molécules d'ea , ... ) de façon à rendre compte le mieux possible des mesures expérimentales . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 vise viser VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 à à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 optimiser optimiser VNF _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 modèle modèle NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 9 c' c'est-à-dire COO _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 est-à-dire c'est-à-dire COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 à à PRE _ _ 3 para _ _ _ _ _ 12 modifier modifier VNF _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 par par PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 une un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 procédure procédure NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 mathématique mathématique ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 18 des de PRE _ _ 15 para _ _ _ _ _ 19 interventions intervention NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 manuelles manuel ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 22 ses son DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 paramètres paramètre NOM _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 24 ( ( PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 coordonnées coordonnée NOM _ _ 23 parenth _ _ _ _ _ 26 des de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 atomes atome NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 29 facteurs facteur NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 B B NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 32 ajout ajout NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 33 de de PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 molécules molécule NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 d' de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 ea eh ADV _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 38 ... ... PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 39 ) ) PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 40 de de façon à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 41 façon de façon à NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 à de façon à PRE _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 rendre rendre VNF _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 44 compte compte NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 le le mieux DET _ _ 46 spe _ _ _ _ _ 46 mieux le mieux ADV _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 47 possible possible ADJ _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 48 des un DET _ _ 49 spe _ _ _ _ _ 49 mesures mesure NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 50 expérimentales expérimental ADJ _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 51 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-983 # text = Du fait du grand nombre de paramètres variables , l'affinement est limité par le rapport du nombre d'observations sur le nombre de paramètres et ne converge de manière satisfaisante que si le nombre d'observations est supérieur au nombre de paramètres . 1 Du de+le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 fait fait NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 grand grand ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 nombre nombre NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 paramètres paramètre NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 variables variable ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 affinement affinement NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 12 est être VRB _ _ 13 aux _ _ _ _ _ 13 limité limiter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 par par PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 le le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 rapport rapport NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 du de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 nombre nombre NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 d' de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 observations observation NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 sur sur PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 22 le le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 nombre nombre NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 paramètres paramètre NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 27 ne ne ADV _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 28 converge converger VRB _ _ 13 para _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 manière manière NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 satisfaisante satisfaisant ADJ _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 que que ADV _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 33 si si CSU _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 34 le le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 nombre nombre NOM _ _ 38 subj _ _ _ _ _ 36 d' de PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 observations observation NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 est être VRB _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 39 supérieur supérieur ADJ _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 au à PRE _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 nombre nombre NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 de de PRE _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 paramètres paramètre NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-984 # text = Les paramètres sont en général au nombre de 4 par atome ( x , y , z , B ) . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 paramètres paramètre NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 en en général PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 général en général NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 au à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 nombre nombre NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 4 4 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 par par PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 atome atome NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 13 x ex NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 15 y le CLI _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 z heure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 B B NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 ) ) PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-985 # text = En règle générale , ces 4 paramètres peuvent être affinés si les cristaux diffractent au moins jusqu'à 2 , 5 Å. Il faut donc , dans la plupart des cas , soit augmenter le nombre d'observations ( affinement restreint ) , soit diminuer le nombre de paramètres , en en fixant certains par exemple ( affinement contraint ) . 1 En en PRE _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 règle règle NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 générale général ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 ces ce DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 6 4 4 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 paramètres paramètre NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 peuvent pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 être être VNF _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 affinés affiner VPP _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 si si CSU _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 cristaux cristal NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 14 diffractent diffracter VRB _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 au à+le PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 moins au moins NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 jusqu'à jusqu'à PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 2 2 NUM _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 19 , 2 , 5 PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 20 5 5 NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 Å. Å. NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 22 Il Il CLS _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 23 faut falloir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 donc donc ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 26 dans dans PRE _ _ 33 periph _ _ _ _ _ 27 la le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 plupart plupart NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 des de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 cas cas NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 32 soit soit COO _ _ 43 mark _ _ _ _ _ 33 augmenter augmenter VNF _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 34 le le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 nombre nombre NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 d' de PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 observations observation NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 ( ( PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 39 affinement affinement NOM _ _ 37 parenth _ _ _ _ _ 40 restreint restreindre ADJ _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 ) ) PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 42 , , PUNC _ _ 44 punc _ _ _ _ _ 43 soit soit COO _ _ 44 mark _ _ _ _ _ 44 diminuer diminuer VNF _ _ 33 para _ _ _ _ _ 45 le le DET _ _ 46 spe _ _ _ _ _ 46 nombre nombre NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 47 de de PRE _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 paramètres paramètre NOM _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 49 , , PUNC _ _ 51 punc _ _ _ _ _ 50 en en PUNC _ _ 51 punc _ _ _ _ _ 51 en en PRE _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 52 fixant fixer VPR _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 53 certains certains PRQ _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 54 par par exemple PRE _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 55 exemple par exemple ADV _ _ 54 dep _ _ _ _ _ 56 ( ( PUNC _ _ 58 punc _ _ _ _ _ 57 affinement affinement ADV _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 58 contraint contraindre ADJ _ _ 52 parenth _ _ _ _ _ 59 ) ) PUNC _ _ 58 punc _ _ _ _ _ 60 . . PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-986 # text = Les méthodes utilisées ensuite pour réaliser la convergence peuvent être divisées en deux groupes : 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 méthodes méthode NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 utilisées utiliser VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ensuite ensuite ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 réaliser réaliser VNF _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 convergence convergence NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 peuvent pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 être être VNF _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 divisées diviser VPP _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 en en PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 deux deux NUM _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 groupes groupe NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 : : PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-987 # text = celles qui utilisent la dynamique moléculaire et les autres , regroupées sous le terme de techniques par minimisation . 1 celles celui PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 qui qui PRQ _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 utilisent utiliser VRB _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 dynamique dynamique NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 8 les l'autre DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 autres l'autre PRQ _ _ 5 para _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 regroupées regrouper VPP _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 sous sous PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 le le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 terme terme NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 techniques technique NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 par par PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 18 minimisation minimisation NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-988 # text = a . Affinement par minimisation 1 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Affinement Affinement NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 par par PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 minimisation minimisation NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-989 # text = Les techniques de minimisation utilisaient initialement la minimisation d'une fonction cible traduisant la différence entre le modèle et les données ( d'où leurs noms ) . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 techniques technique NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 minimisation minimisation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 utilisaient utiliser VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 initialement initialement ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 minimisation minimisation NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 d' de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 une un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 fonction fonction NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 cible cible NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 traduisant traduire VPR _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 différence différence NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 entre entre PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 le le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 modèle modèle NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 20 les le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 données donnée NOM _ _ 18 para _ _ _ _ _ 22 ( ( PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 d' d'où PRE _ _ 13 parenth _ _ _ _ _ 24 où d'où NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 leurs son DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 noms nom NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 27 ) ) PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-990 # text = Mais la technique statistique du maximum de vraisemblance , plus performante , remplace la minimisation du résiduel dans la plupart des programmes récents . 1 Mais mais COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 2 la le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 technique technique NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 4 statistique statistique ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 du de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 maximum maximum NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 vraisemblance vraisemblance NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 10 plus plus ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 performante performant ADJ _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 13 remplace remplacer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 minimisation minimisation NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 du de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 résiduel résiduel ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 dans dans PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 plupart plupart NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 des de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 programmes programme NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 récents récent ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-991 # text = La technique d'affinement restreint ajoute des restrictions en apportant une information externe de stéréochimie . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 technique technique NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 affinement affinement NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 restreint restreindre ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ajoute ajouter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 des un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 restrictions restriction NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 en en PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 apportant apporter VPR _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 une un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 information information NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 externe externe ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 stéréochimie stéréochimie NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-992 # text = Les angles et les longueurs de liaison sont connus pour les petites molécules de même que plusieurs autres critères portant sur les angles dièdres propres et impropres . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 angles angle NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 longueurs longueur NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 liaison liaison NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 sont être VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 connus connaître VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 pour pour PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 12 petites petit ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 molécules molécule NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 de de même que PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 15 même de même que NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 que de même que CSU _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 plusieurs plusieurs DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 18 autres autre ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 critères critère NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 portant porter VPR _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 sur sur PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 les le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 angles angle NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 dièdres dièdre ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 propres propre ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 27 impropres impropre ADJ _ _ 25 para _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-993 # text = Dans le modèle , ces valeurs ne doivent pas trop s'écarter des valeurs standards et ces écarts constituent des observations supplémentaires . 1 Dans dans PRE _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 le le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 modèle modèle NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 ces ce DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 valeurs valeur NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 7 ne ne ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 doivent devoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 pas pas ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 trop trop ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 s' s' CLI _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 écarter écarter VNF _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 des un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 valeurs valeur NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 standards standard NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 17 ces ce DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 écarts écart NOM _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 19 constituent constituer VRB _ _ 12 para _ _ _ _ _ 20 des un DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 observations observation NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 supplémentaires supplémentaire ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-994 # text = La technique d'affinement contraint consiste à réduire le nombre des paramètres affinés en imposant des contraintes géométriques . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 technique technique NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 affinement affinement NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 contraint contraindre ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 consiste consister VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 à à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 réduire réduire VNF _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 le le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 nombre nombre NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 des de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 paramètres paramètre NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 affinés affiner ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 en en PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 15 imposant imposer VPR _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 des un DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 contraintes contrainte NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 géométriques géométrique ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-995 # text = C'est par exemple le cas de l'affinement en « corps rigide » qui affine la position de l'ensemble de la chaîne ( ou de la région ) définie comme corps rigide sans flexibilité interne . 1 C' ce CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 par par exemple PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 exemple par exemple ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 cas cas NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 affinement affinement NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 en en PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 « « PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 12 corps corps NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 rigide rigide ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 » » PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 qui qui PRQ _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 16 affine affiner VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 position position NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 l' le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 ensemble ensemble NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 chaîne chaîne NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 ( ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 26 ou ou COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 22 para _ _ _ _ _ 28 la le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 région région NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 ) ) PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 31 définie définir VPP _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 32 comme comme PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 corps corps NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 rigide rigide ADJ _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 sans sans PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 flexibilité flexibilité NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 interne interne ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-996 # text = La technique de minimisation d'énergie minimise une pseudo-énergie potentielle qui est l'énergie potentielle de la molécule complétée par un terme de rayons X. Les termes d'énergie peuvent être considérés comme des restrictions qui s'ajoutent aux paramètres à affiner . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 technique technique NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 minimisation minimisation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 d' de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 énergie énergie NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 minimise minimiser VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 une un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 pseudo-énergie pseudo- NOM _ _ 30 subj _ _ _ _ _ 10 potentielle potentiel ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 qui qui PRQ _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 12 est être VRB _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 l' le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 énergie énergie NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 potentielle potentiel ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 molécule molécule NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 complétée compléter VPP _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 par par PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 un un DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 terme terme NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 rayons rayons NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 X. X. NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 Les Les DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 termes terme NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 28 d' de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 énergie énergie NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 peuvent pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 31 être être VNF _ _ 32 aux _ _ _ _ _ 32 considérés considérer VPP _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 comme comme PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 des un DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 restrictions restriction NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 qui qui PRQ _ _ 38 subj _ _ _ _ _ 37 s' s' CLI _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 38 ajoutent ajouter VRB _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 39 aux à PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 paramètres paramètre NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 à à PRE _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 affiner affiner VNF _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 . . PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-997 # text = b . Affinement par dynamique moléculaire 1 b b NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Affinement Affinement NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 par par PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 dynamique dynamique NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-998 # text = Les méthodes utilisant la dynamique moléculaire , le recuit simulé ( simulated annealing ) ou les méthodes aléatoires de Monte Carlo peuvent explorer un espace de solutions plus vaste , elles ont un rayon de convergence plus grand . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 méthodes méthode NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 utilisant utiliser VPR _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 dynamique dynamique NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 recuit recuit NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 10 simulé simuler ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 12 simulated simuler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 annealing anneler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 ou ou COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 méthodes méthode NOM _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 18 aléatoires aléatoire ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 Monte Monte NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 Carlo Carlo NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 peuvent pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 explorer explorer VNF _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 un un DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 espace espace NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 solutions solution NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 plus plus ADV _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 29 vaste vaste ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 , , PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 31 elles elles CLS _ _ 32 subj _ _ _ _ _ 32 ont avoir VRB _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 33 un un DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 rayon rayon NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 de de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 convergence convergence NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 plus plus ADV _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 38 grand grand ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 39 . . PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-999 # text = Au lieu de minimiser l'énergie potentielle comme c'est le cas pour l'affinement par minimisation d'énergie , on calcule en chaque atome la force dérivée de ce potentiel et on applique à chaque atome un déplacement qui résulte de cette force et d'une vitesse initiale ( attribuée aléatoirement aux atomes ) . 1 Au au lieu de PRE _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 2 lieu au lieu de NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 de au lieu de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 minimiser minimiser VNF _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 énergie énergie NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 potentielle potentiel ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 comme comme CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 c' ce CLS _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 10 est être VRB _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 cas cas NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 pour pour PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 l' le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 affinement affinement NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 par par PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 minimisation minimisation NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 d' de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 énergie énergie NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 21 on on CLS _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 22 calcule calculer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 en en PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 chaque chaque DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 atome atome NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 la le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 force force NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 28 dérivée dériver VPP _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 ce ce DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 potentiel potentiel NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 34 mark _ _ _ _ _ 33 on on CLS _ _ 34 subj _ _ _ _ _ 34 applique appliquer VRB _ _ 22 para _ _ _ _ _ 35 à à PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 chaque chaque DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 atome atome NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 un un DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 déplacement déplacement NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 40 qui qui PRQ _ _ 41 subj _ _ _ _ _ 41 résulte résulter VRB _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 de de PRE _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 cette ce DET _ _ 44 spe _ _ _ _ _ 44 force force NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 45 et et COO _ _ 46 mark _ _ _ _ _ 46 d' de PRE _ _ 42 para _ _ _ _ _ 47 une un DET _ _ 48 spe _ _ _ _ _ 48 vitesse vitesse NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 49 initiale initial ADJ _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 ( ( PUNC _ _ 51 punc _ _ _ _ _ 51 attribuée attribuer VPP _ _ 48 parenth _ _ _ _ _ 52 aléatoirement aléatoirement ADV _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 53 aux à PRE _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 54 atomes atome NOM _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 55 ) ) PUNC _ _ 51 punc _ _ _ _ _ 56 . . PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1000 # text = Cette énergie cinétique permet au système de franchir des barrières énergétiques de l'ordre son énergie cinétique . 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 énergie énergie NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 cinétique cinétique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 permet permettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 au à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 système système NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 franchir franchir VNF _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 des un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 barrières barrière NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 énergétiques énergétique ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 l' le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 ordre ordre NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 son son DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 énergie énergie NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 17 cinétique cinétique ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1001 # text = Cela évite que l'affinement reste bloqué dans un minimum secondaire . 1 Cela cela PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 évite éviter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 affinement affinement NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 reste rester VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 bloqué bloquer VPP _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 dans dans PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 un un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 10 minimum minimum ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 secondaire secondaire NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1002 # text = La technique du recuit simulé part d'une température initiale élevée 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 technique technique ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 recuit recuire ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 5 simulé simuler ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 part part NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 d' de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 une un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 température température NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 initiale initial ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 élevée élevé ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1003 # text = ( 2500 à 3500   K ) et refroidit lentement le système . 1 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 2 2500 2500 NUM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 3 à à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 3500 3500 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5   3500   DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 K K NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 9 refroidit refroidir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 lentement lentement ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 système système NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1004 # text = Elle est capable de déplacer automatiquement des chaînes latérales de plus de 2 Å ou de retourner des liaisons peptidiques . 1 Elle elle CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 capable capable ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 déplacer déplacer VNF _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 automatiquement automatiquement ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 des un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 chaînes chaîne NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 latérales latéral ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 plus plus ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 2 2 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 Å Å ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 ou ou COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 4 para _ _ _ _ _ 17 retourner retourner VNF _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 des un DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 liaisons liaison NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 peptidiques peptidique ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1005 # text = Cela permet de réduire considérablement les interventions manuelles et le nombre d'étapes d'affinement . 1 Cela cela PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 permet permettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 réduire réduire VNF _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 considérablement considérablement ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 interventions intervention NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 manuelles manuel ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 10 le le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 nombre nombre NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 12 d' de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 étapes étape NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 d' de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 affinement affinement NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1006 # text = c . Stratégie employée 1 c c NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Stratégie Stratégie NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 employée employer VPP _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1007 # text = Le modèle obtenu par le remplacement moléculaire a tout d'abord été affiné en considérerant chaque molécule de l'unité asymétrique comme un corps rigide avec le programme MolRep . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 modèle modèle NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 obtenu obtenir VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 par par PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 remplacement remplacement NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 tout tout ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 10 d' un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 abord abord NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 12 été été NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 affiné affiner ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 en le CLI _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 considérerant considérer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 chaque chaque DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 molécule molécule NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 l' le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 unité unité NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 asymétrique asymétrique ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 comme comme PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 un un DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 corps corps NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 rigide rigide ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 avec avec PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 le le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 programme programme NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 MolRep MolRep NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1008 # text = Ensuite nous avons alterné les étapes de dynamique moléculaire , d'affinement par minimisation d'énergie et d'affinement des facteurs B avec le programme CNS 1 Ensuite ensuite ADV _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 nous nous CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 avons avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 alterné alterner VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 étapes étape NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 dynamique dynamique NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 d' de PRE _ _ 7 para _ _ _ _ _ 12 affinement affinement NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 par par PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 minimisation minimisation NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 d' de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 énergie énergie NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 18 d' de PRE _ _ 11 para _ _ _ _ _ 19 affinement affinement NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 des de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 facteurs facteur NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 B B NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 avec avec PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 le le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 programme programme NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 CNS CNS NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1009 # text = ( Brünger et al. , 1998 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Brünger Brünger NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 1998 1998 NUM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1010 # text = Des contraintes de symétrie non cristallographique ont été utilisées entre les deux molécules de protéines et les deux molécules de peptide de l'unité asymétrique . 1 Des un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 contraintes contrainte NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 symétrie symétrie NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 non non ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 cristallographique cristallographique ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ont avoir VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 été être VPP _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 utilisées utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 entre entre PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 12 deux deux NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 molécules molécule NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 protéines protéine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 17 les le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 18 deux deux NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 molécules molécule NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 peptide peptide NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 l' le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 unité unité NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 asymétrique asymétrique ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1011 # text = Pour l'affinement du résidu acétyl-lysine , les librairies de CNS décrivant les paramètres concernant les angles et les liaisons ont été complétées ( Annexe 1 ) . 1 Pour pour PRE _ _ 23 periph _ _ _ _ _ 2 l' le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 affinement affinement NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 résidu résidu NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 acétyl-lysine acétyle-lysine NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 librairies librairie NOM _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 CNS CNS NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 décrivant décrire VPR _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 paramètres paramètre NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 concernant concerner VPR _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 angles angle NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 19 les le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 liaisons liaison NOM _ _ 17 para _ _ _ _ _ 21 ont avoir VRB _ _ 22 aux _ _ _ _ _ 22 été être VPP _ _ 23 aux _ _ _ _ _ 23 complétées compléter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 ( ( PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 Annexe Annexe ADJ _ _ 23 parenth _ _ _ _ _ 26 1 1 NUM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 ) ) PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1012 # text = Le remplacement des chaînes latérales du modèle par celles de la structure réelle , l'ajout des molécules d'eau , la construction du peptide ont été réalisés manuellement , guidés par les cartes de densité , avec le programme COOT ( Emsley et Cowtan , 2004 ) . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 remplacement remplacement NOM _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 chaînes chaîne NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 latérales latéral ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 du de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 modèle modèle NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 par par PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 celles celui PRQ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 structure structure NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 réelle réel ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 15 l' le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 ajout ajout NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 17 des de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 molécules molécule NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 d' de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 eau eau NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 22 la le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 construction construction NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 24 du de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 25 peptide peptide NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 ont avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 27 été été NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 réalisés réaliser VPP _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 manuellement manuellement ADV _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 , , PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 31 guidés guider ADJ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 32 par par PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 les le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 cartes carte NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 de de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 densité densité NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 , , PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 38 avec avec PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 39 le le DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 programme programme NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 COOT COOT NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 42 ( ( PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 43 Emsley Emsley NOM _ _ 41 parenth _ _ _ _ _ 44 et et COO _ _ 45 mark _ _ _ _ _ 45 Cowtan Cowtan NOM _ _ 43 para _ _ _ _ _ 46 , , PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 47 2004 2004 NUM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 48 ) ) PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 49 . . PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1013 # text = V. Validation du modèle moléculaire 1 V. verset NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Validation Validation NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 modèle modèle NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1014 # text = Le processus d'affinement est suivi par les facteurs R et Rfree dont la diminution concomitante indique une amélioration globale du modèle sans modélisation de bruit de fond . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 processus processus NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 affinement affinement NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 est être VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 suivi suivre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 par par PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 facteurs facteur NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 R R NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 Rfree Rfree NOM _ _ 10 para _ _ _ _ _ 13 dont dont PRQ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 diminution diminution NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 16 concomitante concomitant ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 indique indiquer VRB _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 18 une un DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 amélioration amélioration NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 globale global ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 du de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 modèle modèle NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 sans sans PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 modélisation modélisation NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 bruit bruit NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 fond fond NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1015 # text = La méthode de validation croisée écarte de l'affinement 5 - 10 % des données qui serviront à calculer le facteur 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 méthode méthode NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 validation validation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 croisée croisé ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 écarte écarter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 affinement affinement NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 5 5 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 11 - 5 - 10 PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 10 10 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 % pourcent NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 14 des de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 données donnée NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 qui qui PRQ _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 17 serviront servir VRB _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 à à PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 calculer calculer VNF _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 le le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 facteur facteur NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1016 # text = Rfree ce qui permet une estimation objective du protocole d'affinement 1 Rfree Rfree NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ce ce PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 qui qui PRQ _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 permet permettre VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 une un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 estimation estimation NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 objective objectif ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 protocole protocole NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 d' de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 affinement affinement NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1017 # text = ( Brünger , 1993 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 2 Brünger Brünger NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 1993 1993 NUM _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1018 # text = La géométrie des liaisons covalentes , les planarités , les angles dièdres avec notamment le diagramme de Ramachandran , les interactions non covalentes , les liaisons hydrogène , les ponts disulfures , la stéréochimie , ont été analysés et comparés à celles de structures bien définies de même résolution par le programme PROCHECK 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 géométrie géométrie NOM _ _ 27 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 liaisons liaison NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 covalentes bivalent ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 planarités planarité NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 10 les le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 angles angle NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 12 dièdres dièdre ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 avec avec PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 notamment notamment ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 15 le le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 diagramme diagramme NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 Ramachandran Ramachandran NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 20 les le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 interactions interaction NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 non non ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 23 covalentes bivalent ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 25 les le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 liaisons liaison NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 27 hydrogène hydrogéner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 29 les le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 ponts pont NOM _ _ 38 subj _ _ _ _ _ 31 disulfures bisulfure NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 33 la le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 stéréochimie stéréochimie NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 35 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 36 ont avoir VRB _ _ 37 aux _ _ _ _ _ 37 été être VPP _ _ 38 aux _ _ _ _ _ 38 analysés analyser VPP _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 39 et et COO _ _ 40 mark _ _ _ _ _ 40 comparés comparer VPP _ _ 38 para _ _ _ _ _ 41 à à PRE _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 celles celui PRQ _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 de de PRE _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 structures structure NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 bien bien ADV _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 46 définies définir ADJ _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 47 de de PRE _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 48 même même ADJ _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 49 résolution résolution NOM _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 50 par par PRE _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 51 le le DET _ _ 52 spe _ _ _ _ _ 52 programme programme NOM _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 53 PROCHECK PROCHECK NOM _ _ 52 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1019 # text = ( Laskowski et al. , 1993 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Laskowski Laskowski NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 1993 1993 NUM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1020 # text = Partie III : 1 Partie partie NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 III III ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1021 # text = Résultats 1 Résultats résultat NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1022 # text = Résultats : 1 Résultats résultat NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1023 # text = Chapitre 1 1 Chapitre chapitrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 1 1 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1024 # text = Caractérisation biochimique des protéines ? 1 Caractérisation caractérisation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 biochimique biochimique ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 protéines protéine NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1025 # text = C-Brdt , BD1 et BD2 1 C-Brdt C-Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 BD1 BD1 NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 BD2 BD2 NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1026 # text = A . Analyse de la protéine ? 1 A avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 Analyse Analyse VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de+le PRE _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 5 la de+le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 protéine protéine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ? ? PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1027 # text = C-Brdt 1 C-Brdt C-Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1028 # text = I. Structure primaire 1 I. I. NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 Structure Structure VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 primaire primaire ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1029 # text = La protéine ? 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 protéine protéine NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ? ? PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1030 # text = C-Brdt comprend les résidus 2 à 442 de la protéine Brdt de souris . 1 C-Brdt C-Brdt NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 comprend comprendre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 les le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 résidus résidu NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 2 2 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 442 442 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 protéine protéine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 Brdt Brdt NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 souris souris NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1031 # text = Son poids moléculaire théorique est de 50 kDa et son pH isoélectrique théorique est égal à 6 , 8 . 1 Son son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 poids poids NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 théorique théorique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 50 50 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 kDa kDa NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 10 son son DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 pH pH NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 12 isoélectrique isoélectrique ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 théorique théorique ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 est être VRB _ _ 5 para _ _ _ _ _ 15 égal égal ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 à à PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 6 6 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 18 , 6 , 8 PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 19 8 8 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1032 # text = Elle est constituée par deux bromodomaines nommés BD1 ( résidus 29 à 124 ) et BD2 ( résidus 264 à 1 Elle elle CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 constituée constituer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 par par PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 deux deux NUM _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 bromodomaines oromo NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 nommés nommer ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 BD1 BD1 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 ( ( PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 résidus résidu NOM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 11 29 29 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 à à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 124 124 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 16 BD2 BD2 NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 17 ( ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 18 résidus résidu NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 264 264 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 à à PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1033 # text = 368 ) entre lesquels se place une région longue de 130 résidus . 1 368 368 NUM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 entre entrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 lesquels lequel PRQ _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 5 se se CLI _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 place placer VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 une un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 région région NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 longue long ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 130 130 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 résidus résidu NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1034 # text = Cette région charnière apparaît peu structurée par l'analyse de sa structure primaire . 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 région région NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 charnière charnière NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 apparaît apparaître VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 peu peu ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 structurée structurer ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 par par PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 analyse analyse NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 sa son DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 structure structure NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 primaire primaire ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1035 # text = Elle est caractérisée par l'absence quasi totale de prédictions de structures secondaires et des probabilités de désordre importantes . 1 Elle elle CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 caractérisée caractériser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 par par PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 absence absence NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 quasi quasi ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 totale total ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 prédictions prédiction NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 structures structure NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 secondaires secondaire ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 des de PRE _ _ 9 para _ _ _ _ _ 16 probabilités probabilité NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 désordre désordre NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 importantes important ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1036 # text = Une région moins désordonnée existe probablement dans la partie centrale de la protéine . 1 Une un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 région région NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 moins moins ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 désordonnée désordonner ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 existe exister VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 probablement probablement ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 dans dans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 partie partie NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 centrale central NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 protéine protéine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1037 # text = Quatre résidus 1 Quatre quatre NUM _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résidus résidu NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1038 # text = ( 181 - 184 ) sont en effet prédits organisés en hélice ? 1 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 2 181 181 NUM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 3 - 181 - 184 PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 184 184 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 6 sont être VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 7 en en effet PRE _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 8 effet en effet NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 prédits prédire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 organisés organiser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 en en PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 hélice hélice NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ? ? PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1039 # text = et ont des probabilités de désordre plus basses que le reste de la région . 1 et et COO _ _ 2 mark _ _ _ _ _ 2 ont avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 des un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 probabilités probabilité NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 désordre désordre NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 plus plus ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 basses bas ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 que que CSU _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 le le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 reste reste NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 région région NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1040 # text = Ces probabilités restent cependant plus hautes que dans les régions occupées par les bromodomaines . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 probabilités probabilité NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 restent rester VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 cependant cependant ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 plus plus ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 hautes haut ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 que que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 dans dans PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 régions région NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 occupées occuper VPP _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 par par PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 bromodomaines brome NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1041 # text = Les régions N et C terminales ( avant 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 régions région NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 N N NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 C C NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 6 terminales terminal ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 8 avant avant PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1042 # text = BD1 et après BD2 ) sont très probablement désordonnées . 1 BD1 BD1 NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 3 après après ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 BD2 BD2 NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 6 sont être VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 7 très très ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 probablement probablement ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 désordonnées désordonner VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1043 # text = II . Comportement en solution 1 II ii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Comportement Comportement NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 en en PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 solution solution NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1044 # text = La protéine s'est avérée soluble et facilement purifiable selon le protocole indiqué précédemment avec un rendement global après concentration de l'ordre de 10 mg / L de culture . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 protéine protéine NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 s' s' CLI _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 est être VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 avérée avérer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 soluble soluble ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 8 facilement facilement ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 purifiable purifiable ADJ _ _ 6 para _ _ _ _ _ 10 selon selon PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 protocole protocole NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 indiqué indiquer VPP _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 précédemment précédemment ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 avec avec PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 un un DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 rendement rendement NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 global global ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 après après PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 concentration concentration NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 l' le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 ordre ordre NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 25 10 10 NUM _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 mg milligramme NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 / sur PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 28 L L NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 30 culture culture NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1045 # text = La protéine est pourtant partiellement instable puisqu'elle subit une précipitation lors de son passage de 4 °C à température ambiante . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 protéine protéine NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 pourtant pourtant ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 partiellement partiellement ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 instable instable ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 puisqu' puisque CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 elle elle CLS _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 9 subit subir VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 une un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 précipitation précipitation NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 lors lors ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 son son DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 passage passage NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 4 4 NUM _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 °C degré NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 à à PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 température température NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 ambiante ambiant ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1046 # text = La précipitation est réversible en une heure environ . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 précipitation précipitation NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 réversible réversible ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 en en PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 une un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 heure heure NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 environ environ ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1047 # text = L'analyse de la solution par diffusion statique de lumière a montré que la solution de protéine après sa renaturation présente les mêmes propriétés ( rayon hydrodynamique , monodispersité , absence d'agrégat ) que la solution avant précipitation . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 analyse analyse NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 solution solution NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 diffusion diffusion NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 statique statique ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 lumière lumière NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 montré montrer VPP _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 que que CSU _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 solution solution NOM _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 protéine protéine NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 après après PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 sa son DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 renaturation renaturation NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 présente présenter VRB _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 22 les le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 23 mêmes même ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 24 propriétés propriété NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 25 ( ( PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 26 rayon rayon NOM _ _ 24 parenth _ _ _ _ _ 27 hydrodynamique hydrodynamique ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 29 monodispersité monodispersité NOM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 30 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 31 absence absence NOM _ _ 29 para _ _ _ _ _ 32 d' de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 agrégat agrégat NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 ) ) PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 35 que que? PRQ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 36 la le DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 solution solution NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 38 avant avant PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 précipitation précipitation NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 . . PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1048 # text = III . Recherche d'états oligomériques 1 III iii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Recherche Recherche VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 d' un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 états états NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 oligomériques oligomérique ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1049 # text = Pour les expériences de microcalorimétrie , il était important de connaître l'état oligomérique de la protéine en solution , en présence ou en absence de son ligand principal , le peptide H4 tétra-acétylé . 1 Pour pour PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 2 les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 expériences expérience NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 microcalorimétrie microcalorimétrie NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 7 il il CLS _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 était être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 important important ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 connaître connaître VNF _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 l' le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 état état NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 oligomérique oligomérique ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 protéine protéine NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 en en PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 19 solution solution NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 en en PRE _ _ 18 para _ _ _ _ _ 22 présence présence NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 ou ou COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 24 en en PRE _ _ 21 para _ _ _ _ _ 25 absence absence NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 son son DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 ligand ligand NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 principal principal ADJ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 , , PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 31 le le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 peptide peptide NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 33 H4 H4 NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1050 # text = La masse moléculaire et la polydispersité des espèces présentes dans une solution de ? 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 masse masse NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 polydispersité polydispersité NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 des de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 espèces espèce NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 présentes présent ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 une un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 solution solution NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 ? ? PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1051 # text = C-Brdt à 8 mg / mL en présence et en absence du peptide H 4 - 4 ac ( dans un rapport 1 : 8 ) ont été déterminées par diffusion statique de lumière . 1 C-Brdt C-Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 à à PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 8 8 NUM _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 mg milligramme NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 / sur PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 6 mL millilitre NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 en en PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 présence présence NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 en en PRE _ _ 7 para _ _ _ _ _ 11 absence absence NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 du de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 peptide peptide NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 H H NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 4 4 NUM _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 16 - 4 - 4 PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 4 4 NUM _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 ac ace NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 20 dans dans PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 un un DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 rapport rapport NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 1 1 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 : : PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 25 8 8 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 ) ) PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 27 ont avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 28 été être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 29 déterminées déterminer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 30 par par PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 31 diffusion diffusion NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 statique statique ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 de de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 lumière lumière NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1052 # text = Quel que soit la présence ou l'absence du peptide , les résultats indiquent que la protéine est un monomère de masse moléculaire 50 kDa et que la solution est monodisperse [ Figure 18 ] . 1 Quel quel? ADJ _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 2 que que PRQ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 soit être VRB _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 présence présence NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 6 ou ou COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 7 l' le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 absence absence NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 9 du de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 peptide peptide NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 12 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 résultats résultat NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 14 indiquent indiquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 que que CSU _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 protéine protéine NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 18 est être VRB _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 un un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 monomère monomère ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 masse masse NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 50 50 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 kDa kDa ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 27 que que CSU _ _ 15 para _ _ _ _ _ 28 la le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 solution solution NOM _ _ 31 subj _ _ _ _ _ 30 est est NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 monodisperse mono- VRB _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 32 [ ( PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 33 Figure Figure NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 18 18 NUM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 ] ) PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 36 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1053 # text = D'autre part , la réaction de réticulation chimique à l'EGS réalisée sur un mélange de la protéine et du peptide H4 tétra-acétylé dans un rapport 1 : 10 ne provoque pas l'apparition de structures de taille supérieure à celles existant dans la solution native [ Figure 19 ] . 1 D' d'autre part DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 autre d'autre part ADV _ _ 32 periph _ _ _ _ _ 3 part d'autre part NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 réaction réaction NOM _ _ 32 subj _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 réticulation réticulation NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 chimique chimique ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 l' le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 EGS EGS NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 réalisée réaliser VPP _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 sur sur PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 un un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 mélange mélange NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 protéine protéine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 du de PRE _ _ 17 para _ _ _ _ _ 22 peptide peptide NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 H4 H4 NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 dans dans PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 26 un un DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 rapport rapport NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 1 1 NUM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 29 : 1 : 10 PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 30 10 10 NUM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 31 ne ne ADV _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 32 provoque provoquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 33 pas pas ADV _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 l' le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 apparition apparition NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 36 de de PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 structures structure NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 de de PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 taille taille NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 supérieure supérieur ADJ _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 à à PRE _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 celles celui PRQ _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 existant exister VPR _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 dans dans PRE _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 la le DET _ _ 46 spe _ _ _ _ _ 46 solution solution NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 47 native natif ADJ _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 [ ( PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 49 Figure Figure NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 50 19 19 NUM _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 51 ] ) PUNC _ _ 46 punc _ _ _ _ _ 52 . . PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1054 # text = L'analyse par spectrométrie de masse ( MALDI-TOF ) des échantillons ayant subi la réaction de couplage indique la présence de protéines aux masses 50 796 , 51 148 , 54 355 , 57 269 Da . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 analyse analyse NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 3 par par PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 spectrométrie spectrométrie NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 masse masse NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 MALDI-TOF MALDI-TOF NOM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 11 échantillons échantillon NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 ayant avoir VPR _ _ 13 aux _ _ _ _ _ 13 subi subir VPP _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 réaction réaction NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 couplage couplage NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 indique indiquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 présence présence NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 protéines protéine NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 aux à PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 masses masse NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 50 50 NUM _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 26 796 796 NUM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 27 , 50 796 , 51 148 , 54 355 , 57 269 PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 28 51 51 NUM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 29 148 148 NUM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 30 , 50 796 , 51 148 , 54 355 , 57 269 PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 31 54 54 NUM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 32 355 355 NUM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 33 , 50 796 , 51 148 , 54 355 , 57 269 PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 34 57 57 NUM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 35 269 269 NUM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 36 Da Da NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1055 # text = Ces résultats sont incompatibles avec l'existence de formes multimériques de la protéine dans la solution et confirment ceux obtenus par diffusion statique de lumière . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résultats résultat NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 incompatibles incompatible ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 avec avec PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 existence existence NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 formes forme NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 multimériques multimériques ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 protéine protéine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 dans dans PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 solution solution NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 18 confirment confirmer VRB _ _ 3 para _ _ _ _ _ 19 ceux celui PRQ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 obtenus obtenir VPP _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 par par PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 diffusion diffusion NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 statique statique ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 lumière lumière NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1056 # text = B . Analyse de la protéine BD1 1 B b NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Analyse Analyse VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de+le PRE _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 5 la de+le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 protéine protéine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 BD1 BD1 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1057 # text = Les différentes constructions de BD1 utilisées présentent un poids moléculaire compris entre 14 , 1 et 15 , 8 kDa et un pH isoélectrique compris entre 9 , 0 et 9 , 2 . 1 Les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 différentes différent ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 constructions construction NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD1 BD1 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 utilisées utiliser ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 présentent présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 un un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 poids poids NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 compris comprendre VPP _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 entre entre PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 14 14 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 14 , 14 , 1 PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 1 1 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 17 15 15 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 18 , 15 , 8 PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 8 8 NUM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 20 kDa kDa ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 22 un un DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 pH pH NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 24 isoélectrique isoélectrique ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 compris comprendre VPP _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 entre entre PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 9 9 NUM _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 28 , 9 , 0 PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 29 0 0 NUM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 30 et et COO _ _ 33 mark _ _ _ _ _ 31 9 9 NUM _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 32 , 9 , 2 PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 33 2 2 NUM _ _ 29 para _ _ _ _ _ 34 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1058 # text = I. Comportement en solution 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Comportement Comportement NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 en en PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 solution solution NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1059 # text = Le comportement en solution des protéines de la première série de clonages montre que les résidus 22 à 28 de l'extrémité N terminale interviennent dans la stabilisation du domaine [ Tableau 6 ] . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 comportement comportement NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 3 en en PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 solution solution NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 des de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 protéines protéine NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 9 première premier ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 série série NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 clonages clonage NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 que que CSU _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 les le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 résidus résidu NOM _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 17 22 22 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 à à PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 28 28 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 l' le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 extrémité extrémité NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 N N NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 terminale terminal ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 interviennent intervenir VRB _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 26 dans dans PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 la le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 stabilisation stabilisation NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 du de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 domaine domaine NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 [ ( PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 32 Tableau Tableau NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 6 6 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 ] ) PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1060 # text = La protéine SI- 3 débutant au résidu 28 est insoluble bien que la première hélice du domaine ne débute qu'au résidu 29 dans la structure que nous avons résolue . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 protéine protéine NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 SI- SI- NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 3 3 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 débutant débutant NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 au à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 résidu résidu NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 28 28 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 insoluble insoluble ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 bien bien que CSU _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 que bien que CSU _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 14 première premier ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 hélice hélice NOM _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 16 du de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 domaine domaine NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ne ne ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 débute débuter VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 20 qu' que ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 au à PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 résidu résidu NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 29 29 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 dans dans PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 25 la le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 structure structure NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 que que PRQ _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 28 nous nous CLS _ _ 30 subj _ _ _ _ _ 29 avons avoir VRB _ _ 30 aux _ _ _ _ _ 30 résolue résoudre VPP _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1061 # text = Nous verrons que ces résidus chapeautent la région charnière entre les boucles B et C et stabilisent par des interactions avec les hélices B et C la structure du bromodomaine . 1 Nous nous CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 verrons voir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ces ce DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 résidus résidu NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 chapeautent chapeauter VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 région région NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 charnière charnière NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 entre entre PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 boucles boucle NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 B B NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 C C NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 stabilisent stabiliser VRB _ _ 6 para _ _ _ _ _ 18 par par PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 des un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 interactions interaction NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 avec avec PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 22 les le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 hélices hélice NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 B B NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 et et COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 26 C C NOM _ _ 24 para _ _ _ _ _ 27 la le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 structure structure NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 29 du de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 bromodomaine bromé NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1062 # text = La deuxième série de clonage montre que les résidus 142 à 150 de l'extrémité C terminale stabilisent eux aussi la structure du bromodomaine puisque la protéine SII- 4 à haute concentration précipite lorsqu'elle est amenée à température ambiante alors que la protéine SII- 5 reste stable dans les mêmes conditions [ Tableau 6 ] . 1 La le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 deuxième deuxième NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 série série NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 clonage clonage NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 que que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 résidus résidu NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 10 142 142 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 à à PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 150 150 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 l' le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 extrémité extrémité NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 C C NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 terminale terminal ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 stabilisent stabiliser VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 19 eux lui PRQ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 aussi aussi ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 la le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 structure structure NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 23 du de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 bromodomaine oromo NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 puisque puisque CSU _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 26 la le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 protéine protéine NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 SII- SII- NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 4 4 NUM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 à à PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 31 haute haut ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 32 concentration concentration NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 précipite précipiter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 34 lorsqu' lorsque CSU _ _ 0 root _ _ _ _ _ 35 elle elle CLS _ _ 37 subj _ _ _ _ _ 36 est être VRB _ _ 37 aux _ _ _ _ _ 37 amenée amener VPP _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 38 à à PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 température température NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 ambiante ambiant ADJ _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 alors alors que CSU _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 42 que alors que CSU _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 43 la le DET _ _ 44 spe _ _ _ _ _ 44 protéine protéine NOM _ _ 47 subj _ _ _ _ _ 45 SII- SII- NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 5 5 NUM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 47 reste rester VRB _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 48 stable stable ADJ _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 49 dans dans PRE _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 50 les le DET _ _ 52 spe _ _ _ _ _ 51 mêmes même ADJ _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 52 conditions condition NOM _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 53 [ ( PUNC _ _ 54 punc _ _ _ _ _ 54 Tableau Tableau NOM _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 55 6 6 NUM _ _ 54 dep _ _ _ _ _ 56 ] ) PUNC _ _ 52 punc _ _ _ _ _ 57 . . PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1063 # text = Les protéines sont produites avec un bon rendement ( 7 , 5 à 16 , 6 mg / L de culture ) sauf SII- 3 pour laquelle la faible production obtenue tient peut être à un problème lors de la mise en culture des bactéries ou lors de la purification . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 protéines protéine NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 sont être VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 produites produire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 avec avec PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 un un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 7 bon bon ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 rendement rendement NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 10 7 7 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 11 , 7 , 5 PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 12 5 5 NUM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 13 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 16 16 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 15 , 16 , 6 PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 16 6 6 NUM _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 mg milligramme NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 / sur PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 19 L L NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 21 culture culture NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 23 sauf sauf PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 24 SII- SII- NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 3 3 NUM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 pour pour PRE _ _ 32 periph _ _ _ _ _ 27 laquelle lequel PRQ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 la le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 29 faible faible ADJ _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 30 production production NOM _ _ 32 subj _ _ _ _ _ 31 obtenue obtenir ADJ _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 tient tenir VRB _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 33 peut pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 34 être être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 35 à à PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 36 un un DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 problème problème NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 lors lors ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ 39 de de+le PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 40 la de+le DET _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 41 mise mise NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 en en PRE _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 culture culture NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 des de PRE _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 45 bactéries bactérie NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 ou ou COO _ _ 44 para _ _ _ _ _ 47 lors lors de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 48 de lors de PRE _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 49 la le DET _ _ 50 spe _ _ _ _ _ 50 purification purification NOM _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 51 . . PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1064 # text = Ces protéines ont été utilisées pour réaliser les essais de cristallogénèse et les expériences de microcalorimétrie . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 protéines protéine NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 ont avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 été être VPP _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 utilisées utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 pour pour PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 réaliser réaliser VNF _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 essais essai NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 cristallogénèse cristal NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 expériences expérience NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 microcalorimétrie microcalorimétrie NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1065 # text = La troisième série de clonage [ Tableau 6 ] a été utilisée exclusivement pour la cristallographie . 1 La le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 troisième troisième NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 série série NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 clonage clonage NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 [ ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 7 Tableau Tableau NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 6 6 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ] ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 10 a avoir VRB _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 été être VPP _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 12 utilisée utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 exclusivement exclusivement ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 pour pour PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 cristallographie cristallographie NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1066 # text = Tableau 6 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 6 6 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1067 # text = Comportement en solution des différentes constructions de la protéine BD1 1 Comportement comportement NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 en en PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 solution solution NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 différentes différent ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 constructions construction NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 protéine protéine NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 BD1 BD1 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1068 # text = II . Recherche d'états oligomériques 1 II ii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Recherche Recherche VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 d' un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 états états NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 oligomériques oligomérique ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1069 # text = Une expérience de diffusion statique de lumière couplée à la chromatographie d'exclusion a été réalisée sur BD1 SI- 2 de poids moléculaire théorique 13 , 7 kDa . 1 Une un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 expérience expérience NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 diffusion diffusion NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 statique statique ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 lumière lumière NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 couplée coupler VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 chromatographie chromatographie NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 d' de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 exclusion exclusion NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 a avoir VRB _ _ 15 aux _ _ _ _ _ 15 été être VPP _ _ 16 aux _ _ _ _ _ 16 réalisée réaliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 sur sur PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 BD1 BD1 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 SI- SI- NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 2 2 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 poids poids NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 théorique théorique ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 25 13 13 NUM _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 26 , 13 , 7 PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 27 7 7 NUM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 28 kDa kDa ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1070 # text = L'instabilité de la protéine à température ambiante provoque sa répartition sur un grand volume d'élution et une erreur importante sur la mesure de son poids moléculaire [ Figure 20 ] . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 instabilité instabilité NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 protéine protéine NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 température température NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 ambiante ambiant ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 provoque provoquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 sa son DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 répartition répartition NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 sur sur PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 un un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 14 grand grand ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 volume volume NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 d' de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 élution élution NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 19 une un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 erreur erreur NOM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 21 importante important ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 sur sur PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 mesure mesure NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 son son DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 poids poids NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 [ ( PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 30 Figure Figure NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 31 20 20 NUM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 ] ) PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1071 # text = Cependant le poids moléculaire déterminé 1 Cependant cependant ADV _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 le le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 poids poids NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 déterminé déterminer ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1072 # text = ( 13 , 3 + / - 0 , 4 kDa ) indique que la protéine doit être monomérique dans les conditions de l'expérience . 1 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 2 13 13 NUM _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 3 , 13 , 3 PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 3 3 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 5 + + / - 0 , 4 DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 6 / + / - 0 , 4 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 - + / - 0 , 4 PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 8 0 0 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 9 , + / - 0 , 4 PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 4 4 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 kDa kDa NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 12 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 indique indiquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 que que CSU _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 protéine protéine NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 17 doit devoir VRB _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 être être VNF _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 monomérique monomérique ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 dans dans PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 21 les le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 conditions condition NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 l' le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 expérience expérience NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1073 # text = Nous n'avons pas observé de variation dans le poids moléculaire de BD1 ni en présence de BD2 ni en présence de BD2 et du peptide H4 tétra-acétylé . 1 Nous nous CLS _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 n' ne ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 3 avons avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 4 pas pas ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 observé observer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 variation variation NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 dans dans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 le le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 poids poids NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 BD1 BD1 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ni ni COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 en en PRE _ _ 12 para _ _ _ _ _ 16 présence présence NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 BD2 BD2 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 ni ni COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 20 en en PRE _ _ 15 para _ _ _ _ _ 21 présence présence NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 BD2 BD2 NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 25 du de PRE _ _ 22 para _ _ _ _ _ 26 peptide peptide NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 H4 H4 NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1074 # text = D'autre part des expériences de réticulation chimique sur une solution de BD1 montrent qu'aucune structure oligomérique ne se forme en présence ou en absence du peptide H4 tétra-acétylé 1 D' d'autre part ADV _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 2 autre d'autre part ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 part d'autre part NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 des un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 expériences expérience NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 réticulation réticulation NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 chimique chimique ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 sur sur PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 une un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 solution solution NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 BD1 BD1 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 montrent montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 qu' que CSU _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 aucune aucun DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 structure structure NOM _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 18 oligomérique oligomérique ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 ne ne ADV _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 20 se se CLI _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 forme former VRB _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 22 en en PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 présence présence NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 ou ou COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 25 en en PRE _ _ 22 para _ _ _ _ _ 26 absence absence NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 du de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 peptide peptide NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 H4 H4 NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1075 # text = [ Figure   21 ] . 1 [ ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Figure Figure VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3     21 DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 21 21 NUM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 5 ] ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1076 # text = Nous pouvons observer dans le cas des expériences sur le mélange BD 1 / H 4 - 4 ac le dédoublement de la bande correspondant à 1 Nous nous CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 pouvons pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 observer observer VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 dans dans PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 cas cas NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 des de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 expériences expérience NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 sur sur PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 le le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 mélange mélange NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 BD BD NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 1 1 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 / sur PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 15 H H NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 4 4 NUM _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 17 - 4 - 4 PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 4 4 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 ac ace NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 20 le le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 dédoublement dédoublement NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 bande bande NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 correspondant correspondant ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 à à PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1077 # text = BD1 . 1 BD1 BD1 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1078 # text = Cette seconde espèce de poids moléculaire légèrement supérieure correspond sans doute au complexe qui se forme entre le bromodomaine et le peptide . 1 Cette ce DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 seconde second ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 espèce espèce NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 poids poids NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 légèrement légèrement ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 supérieure supérieur ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 correspond correspondre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 sans sans doute PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 doute sans doute ADV _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 au à PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 complexe complexe NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 qui qui PRQ _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 15 se se CLI _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 forme former VRB _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 entre entre PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 le le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 bromodomaine oromo NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 21 le le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 peptide peptide NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1079 # text = C . Analyse de la protéine BD2 1 C c NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Analyse Analyse VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de+le PRE _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 5 la de+le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 protéine protéine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 BD2 BD2 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1080 # text = La protéine BD2 ( clone A12 ) présente un pH isoélectrique égal à 6 , 05 . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 protéine protéine NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 BD2 BD2 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 clone clone NOM _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 6 A12 A12 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 8 présente présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 un un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 pH pH NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 isoélectrique isoélectrique ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 égal égal ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 6 6 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 15 , 6 , 05 PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 16 05 05 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1081 # text = Son poids moléculaire théorique est de 14 , 9 kDa . 1 Son son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 poids poids NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 théorique théorique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 14 14 NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 8 , 14 , 9 PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 9 9 9 NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 kDa kDa NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1082 # text = Elle est très soluble et stable en solution . 1 Elle elle CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 très très ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 soluble soluble ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 6 stable stable ADJ _ _ 4 para _ _ _ _ _ 7 en en PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 solution solution NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1083 # text = La production après purification et concentration est de 22 mg / L de culture environ . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 production production NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 après après PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 purification purification NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 6 concentration concentration NOM _ _ 4 para _ _ _ _ _ 7 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 22 22 NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 mg milligramme NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 / / PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 L L NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 culture culture NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 environ environ ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1084 # text = Une expérience de réticulation chimique [ Figure 22 ] montre que le domaine est monomérique en solution et qu'il ne se produit pas de dimérisation en présence du peptide H4 tétra-acétylé . 1 Une un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 expérience expérience NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 réticulation réticulation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 chimique chimique ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 [ ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 7 Figure Figure NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 22 22 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ] ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 10 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 que que CSU _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 le le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 domaine domaine NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 14 est être VRB _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 monomérique monomérique ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 en en PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 solution solution NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 19 qu' que CSU _ _ 11 para _ _ _ _ _ 20 il il CLS _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 21 ne ne ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 22 se se CLI _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 23 produit produire VRB _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 24 pas pas ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 dimérisation dimérisation NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 en en PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 28 présence présence NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 du de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 peptide peptide NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 H4 H4 NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1085 # text = Ces résultats sont en accords avec ceux obtenus par diffusion statique de lumière , où le poids moléculaire déterminé pour 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résultats résultat NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 en en PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 accords accord NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 avec avec PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 ceux celui PRQ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 obtenus obtenir VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 par par PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 diffusion diffusion NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 statique statique ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 lumière lumière NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 15 où où? ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 le le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 poids poids NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 18 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 déterminé déterminer VPP _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 pour pour PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1086 # text = BD2 est de 15 + / - 0 , 1 kDa . 1 BD2 BD2 NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 15 15 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 5 + + / - 0 , 1 DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 6 / + / - 0 , 1 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 - + / - 0 , 1 PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 8 0 0 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 9 , + / - 0 , 1 PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 1 1 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 kDa kDa NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1087 # text = D . Analyse du mélange des protéines BD1 et BD2 1 D d NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Analyse Analyse VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 du de+le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 mélange mélange NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 protéines protéine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 BD1 BD1 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 BD2 BD2 NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1088 # text = Par ailleurs aucune structure dimérique n'a été observée lorsque les domaines BD1 et BD2 sont mélangés , en présence ou en absence du peptide 1 Par par ailleurs PRE _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 ailleurs par ailleurs ADV _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 aucune aucun DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 structure structure NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 5 dimérique dimérique ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 n' ne ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 7 a avoir VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 été être VPP _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 observée observer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 lorsque lorsque CSU _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 domaines domaine NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 13 BD1 BD1 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 BD2 BD2 NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 16 sont être VRB _ _ 17 aux _ _ _ _ _ 17 mélangés mélanger VPP _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 en en PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 présence présence NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 ou ou COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 22 en en PRE _ _ 19 para _ _ _ _ _ 23 absence absence NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 du de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 peptide peptide NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1089 # text = H4 tétra-acétylé , ni par réticulation chimique [ Figure 23 ] ni par diffusion statique de lumière [ Figure 20 ] . 1 H4 H4 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 4 ni ni COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 par par NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 6 réticulation réticulation NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 chimique chimique ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 [ ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 9 Figure Figure NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 23 23 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 ] ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 12 ni ni COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 par par NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 14 diffusion diffusion NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 statique statique ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 lumière lumière NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 [ ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 Figure Figure NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 20 20 NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 ] ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1090 # text = E . Analyse de la protéine BD1-K61Q 1 E e NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Analyse Analyse VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de+le PRE _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 5 la de+le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 protéine protéine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 BD1-K61Q BD1-K61Q NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1091 # text = Le comportement de la protéine BD1-K61Q ( clone Q61 - 2 ) en solution est similaire à celui de BD1 . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 comportement comportement NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 protéine protéine NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 BD1-K61Q BD1-K61Q NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 clone clone NOM _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 9 Q61 Q61 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 - - PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 11 2 2 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 13 en en PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 14 solution solution NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 similaire similaire ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 à à PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 celui celui PRQ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 BD1 BD1 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1092 # text = La protéine est très soluble à 4 °C ou à basse concentration ( ~ 5 mg / mL ) , mais précipite si une solution à haute concentration ( ~ 40 mg / mL ) est portée à température ambiante . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 protéine protéine NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 très très ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 soluble soluble ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 4 4 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 °C degré NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 ou ou COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 à à PRE _ _ 6 para _ _ _ _ _ 11 basse bas ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 concentration concentration NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 ( ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 14 ~ environ ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 15 5 5 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 mg milligramme NOM _ _ 12 parenth _ _ _ _ _ 17 / / PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 18 mL mL ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 ) ) PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 21 mais mais COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 22 précipite précipiter VRB _ _ 3 para _ _ _ _ _ 23 si si CSU _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 une un DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 solution solution NOM _ _ 37 subj _ _ _ _ _ 26 à à PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 haute haut ADJ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 28 concentration concentration NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 ( ( PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 30 ~ environ ADV _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 31 40 40 NUM _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 mg milligramme NOM _ _ 25 parenth _ _ _ _ _ 33 / / PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 34 mL mL ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 ) ) PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 36 est être VRB _ _ 37 aux _ _ _ _ _ 37 portée porter VPP _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 38 à à PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 température température NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 ambiante ambiant ADJ _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1093 # text = Nous avons obtenu par litre de culture environ 13 mg de protéine pure et après concentration . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 obtenu obtenir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 par par PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 litre litre NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 culture culture NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 environ environ ADV _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 9 13 13 NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 mg milligramme NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 protéine protéine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 pure pur ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 après après PRE _ _ 13 para _ _ _ _ _ 16 concentration concentration NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1094 # text = Résultats : 1 Résultats résultat NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1095 # text = Chapitre 2 1 Chapitre chapitrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 2 2 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1096 # text = Quantification des affinités de Brdt vis à vis des différents états d'acétylation des queues N terminales des histones H3 et H4 1 Quantification quantification NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 affinités affinité NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 Brdt Brdt NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 vis vis NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 à à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 vis vis NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 des de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 différents différent ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 états états NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 d' de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 acétylation acétylation NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 des de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 queues queue NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 N N NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 terminales terminal ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 des de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 19 histones histone NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 H3 H3 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 22 H4 H4 NOM _ _ 20 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1097 # text = A . Expériences préliminaires 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Expériences Expériences NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 préliminaires préliminaire ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1098 # text = Nous avons tout d'abord examiné l'affinité des bromodomaines 1 et 2 de Brdt pour des peptides courts ( 10 résidus ) mimant la queue N terminale de l'histone H4 mono-acétylée de souris sur les lysines 5 , 8 , 12 ou 16 1 Nous nous CLS _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 3 tout tout d'abord NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 d' tout d'abord PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 abord tout d'abord ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 examiné examiner VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 l' le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 affinité affinité NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 des de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 bromodomaines brome NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 1 1 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 2 2 NUM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 Brdt Brdt NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 pour pour PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 17 des un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 peptides peptide NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 courts court ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 21 10 10 NUM _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 résidus résidu NOM _ _ 18 parenth _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 24 mimant mimer VPR _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 25 la le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 queue queue NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 N N NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 terminale terminal ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 30 l' le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 histone histone NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 H4 H4 NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 mono-acétylée mono-acétylée ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 de de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 35 souris souris NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 sur sur PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 les le DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 lysines lysine NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 5 5 NUM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 41 8 8 NUM _ _ 43 spe _ _ _ _ _ 42 , 8 , 12 PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 43 12 12 NUM _ _ 38 para _ _ _ _ _ 44 ou ou COO _ _ 45 mark _ _ _ _ _ 45 16 16 NUM _ _ 43 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1099 # text = [ Tableau 7 ] . 1 [ ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Tableau Tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 7 7 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ] ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 5 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1100 # text = Tableau 7 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 7 7 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1101 # text = Peptides H4 courts 1 Peptides peptide NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 H4 H4 NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 courts court ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1102 # text = I. Affinités de BD1 pour des peptides H4 courts 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Affinités Affinités NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 BD1 BD1 NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 pour pour PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 des un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 peptides peptide NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 H4 H4 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 courts court ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1103 # text = La titration des peptides sH 4 -K 5 ac et sH 4 -K 8 ac dans une solution de BD1 produit un dégagement de chaleur caractéristique d'une réaction de fixation [ Annexe 2A ] . 1 La le DET _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 2 titration titration NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 4 peptides peptide NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 5 sH sH ADJ _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 6 4 4 NUM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 7 -K -K ADJ _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 8 5 5 NUM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 9 ac ac NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 11 sH sh NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 12 4 4 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 8 8 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 ac ace NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 dans dans PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 une un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 solution solution NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 BD1 BD1 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 produit produire ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 un un DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 dégagement dégagement NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 chaleur chaleur NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 caractéristique caractéristique ADJ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 d' de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 une un DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 réaction réaction NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 de de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 fixation fixation NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 [ ( PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 33 Annexe Annexe NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 2A 2A NUM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 ] ) PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 36 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1104 # text = Cependant il n'a pas été possible de déterminer les paramètres thermodynamiques de l'interaction . 1 Cependant cependant ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 2 il il CLS _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 n' ne ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 4 a avoir VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 5 pas pas ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 été être VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 possible possible ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 déterminer déterminer VNF _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 les le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 paramètres paramètre NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 thermodynamiques thermodynamique NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 l' le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 interaction interaction NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1105 # text = En fixant le nombre de sites égal à un ( n = 1 ) pour réduire le nombre des paramètres à affiner , il est tout de même possible d'obtenir une convergence des autres paramètres ( Ka et ? H ) . 1 En en PRE _ _ 25 periph _ _ _ _ _ 2 fixant fixer VPR _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 le le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 nombre nombre NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 sites site NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 égal égal ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 un un PRQ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 11 n numéro NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 12 = égaler VRB _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 13 1 1 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 15 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 16 réduire réduire VNF _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 le le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 nombre nombre NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 des de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 paramètres paramètre NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 à à PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 22 affiner affiner VNF _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 24 il il CLS _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 25 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 tout tout de même NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 27 de tout de même PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 même tout de même ADV _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 possible possible ADJ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 30 d' de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 obtenir obtenir VNF _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 une un DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 convergence convergence NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 des de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 autres autre ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 36 paramètres paramètre NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 ( ( PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 38 Ka Ka NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 39 et et COO _ _ 0 root _ _ _ _ _ 40 ? ? PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 41 H H NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 42 ) ) PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 43 . . PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1106 # text = L'affinité déterminée de BD1 pour ces peptides est alors de l'ordre du milli-molaire . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 affinité affinité NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 déterminée déterminer ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 BD1 BD1 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 ces ce DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 peptides peptide NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 alors alors ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de l'ordre de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 l' de l'ordre de DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 ordre de l'ordre de DET _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 du de l'ordre de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 milli-molaire mi- NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1107 # text = La réaction de titration des peptides sH 4 -K 12 ac et sH 4 -K 16 ac produit un signal en partie endothermique et dont le profil ne correspond pas à une réaction d'interaction entre un bromodomaine et un peptide acétylé [ Annexe 4A ] . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 réaction réaction NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 titration titration NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 des de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 peptides peptide NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 sH sH VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 4 4 NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 -K -K NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 12 12 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 ac ac ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 13 sH sh NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 14 4 4 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 -K -K VPR _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 16 16 NUM _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 ac ace NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 produit produire VRB _ _ 7 para _ _ _ _ _ 19 un un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 signal signal NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 en en PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 partie partie NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 endothermique endothermique ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 29 mark _ _ _ _ _ 25 dont dont PRQ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 26 le le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 profil profil NOM _ _ 29 subj _ _ _ _ _ 28 ne ne ADV _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 29 correspond correspondre VRB _ _ 21 para _ _ _ _ _ 30 pas pas ADV _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 à à PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 une un DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 réaction réaction NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 d' de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 interaction interaction NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 entre entre PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 un un DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 bromodomaine oromo NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 et et COO _ _ 41 mark _ _ _ _ _ 40 un un DET _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 41 peptide peptide NOM _ _ 38 para _ _ _ _ _ 42 acétylé acétyle NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 [ ( PUNC _ _ 44 punc _ _ _ _ _ 44 Annexe Annexe NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 45 4A 4A NUM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 ] ) PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 47 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1108 # text = Ces expériences indiquent qu'il existe entre 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 expériences expérience NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 indiquent indiquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 qu' que CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 il il CLS _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 existe exister VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 entre entre PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1109 # text = BD1 et les peptides H4 courts mono-acétylés sur les lysines 5 et 8 une affinité faible non quantifiable par ITC . 1 BD1 BD1 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 3 les le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 peptides peptide NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 5 H4 H4 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 courts court ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 mono-acétylés mono- NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 sur sur PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 lysines lysine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 5 5 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 8 8 NUM _ _ 10 para _ _ _ _ _ 14 une un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 affinité affinité NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 16 faible faible ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 non non ADV _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 quantifiable quantifiable ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 par par PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 20 ITC ITC NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1110 # text = II . Affinités de BD2 pour des peptides H4 courts 1 II ii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Affinités Affinités NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD2 BD2 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 des un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 peptides peptide NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 H4 H4 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 courts court ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1111 # text = L'affinité de BD2 vis à vis des peptides sH 4 -K 5 ac , sH 4 -K 8 ac et sH 4 -K 12 ac a également été mesurée [ Annexe 4B ] . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 affinité affinité NOM _ _ 30 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 BD2 BD2 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 vis vis NOM _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 7 vis vis NOM _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 8 des de PRE _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 9 peptides peptide NOM _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 10 sH sH ADJ _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 11 4 4 NUM _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 12 -K -K ADJ _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 13 5 5 NUM _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 14 ac ac NOM _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 16 sH sh NOM _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 17 4 4 NUM _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 18 -K -K ADJ _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 19 8 8 NUM _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 20 ac ac ADJ _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 22 sH sh NOM _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 23 4 4 NUM _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 24 -K -K NOM _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 25 12 12 NUM _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 26 ac ace NOM _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 27 a avoir VRB _ _ 29 aux _ _ _ _ _ 28 également également ADV _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 29 été être VPP _ _ 30 aux _ _ _ _ _ 30 mesurée mesurer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 31 [ ( PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 32 Annexe Annexe ADJ _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 4B 4B NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 ] ) PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1112 # text = Nous n'avons pas détecté d'affinité significative pour ces peptides . 1 Nous nous CLS _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 n' ne ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 3 avons avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 4 pas pas ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 détecté détecter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 d' de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 affinité affinité NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 significative significatif ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 pour pour PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 ces ce DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 peptides peptide NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1113 # text = En particulier , BD2 n'a pas montré d'affinité pour le peptide sH 4 acK 12 avec lequel il avait pourtant co-cristallisé . 1 En en PRE _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 particulier particulier NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 BD2 BD2 NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 5 n' ne ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 6 a avoir VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 7 pas pas ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 d' de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 affinité affinité NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 pour pour PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 le le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 peptide peptide NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 sH sH ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 4 4 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 acK acK NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 17 12 12 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 avec avec PRE _ _ 23 periph _ _ _ _ _ 19 lequel lequel PRQ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 il il CLS _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 21 avait avoir VRB _ _ 23 aux _ _ _ _ _ 22 pourtant pourtant ADV _ _ 23 periph _ _ _ _ _ 23 co-cristallisé co- VPP _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1114 # text = Nous verrons dans le chapitre 4 comment la structure cristallographique du complexe BD 2 / H 4 -K 12 ac peut expliquer cela . 1 Nous nous CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 verrons voir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 dans dans PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 le le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 chapitre chapitre NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 4 4 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 comment comment? ADV _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 structure structure NOM _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 10 cristallographique cristallographique ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 du de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 complexe complexe NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 BD BD NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 2 2 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 / sur PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 16 H H NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 4 4 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 -K -K VPR _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 12 12 NUM _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 ac ace NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 peut pouvoir VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 22 expliquer expliquer VNF _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 cela cela PRQ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1115 # text = B . Affinités pour la queue N terminale de l'histone H4 1 B b NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Affinités Affinités NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 queue queue NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 N N NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 terminale terminal ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 histone histone NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 H4 H4 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1116 # text = Nous avons ensuite examiné l'interaction de BD1 et BD2 avec l'histone H4 tétra-acétylée ou di-acétylée sur les lysines K5 , K8 , K12 et K16 . 1 Nous nous CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 3 ensuite ensuite ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 examiné examiner VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 interaction interaction NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 BD1 BD1 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 BD2 BD2 NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 11 avec avec PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 12 l' le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 histone histone NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 H4 H4 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 tétra-acétylée tétra-acétyle NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 ou ou COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 di-acétylée di-acétylée NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 18 sur sur PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 les le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 lysines lysine NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 K5 K5 NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 K8 K8 NOM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 K12 K12 NOM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 27 K16 K16 NOM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1117 # text = Nous avons pour cela utilisé des peptides longs ( 20 résidus ) mimant la queue 1 Nous nous CLS _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 3 pour pour PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 cela cela PRQ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 utilisé utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 des un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 peptides peptide NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 longs long ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ( ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 10 20 20 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 résidus résidu NOM _ _ 7 parenth _ _ _ _ _ 12 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 13 mimant mimer VPR _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 queue queue NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1118 # text = N terminale de l'histone H4 de souris [ Tableau 8 ] . 1 N numéro NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 terminale terminale NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 histone histone NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 H4 H4 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 souris souris NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 [ ( PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 Tableau Tableau NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 8 8 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 ] ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1119 # text = Tableau 8 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 8 8 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1120 # text = Peptides H4 longs 1 Peptides peptide NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 H4 H4 NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 longs long ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1121 # text = I. Affinités pour un peptide H4 tétra-acétylé 1 I. I. NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 Affinités Affinités NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 peptide peptide NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 H4 H4 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1122 # text = a . ? 1 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1123 # text = C-Brdt 1 C-Brdt C-Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1124 # text = L'interaction de la partie N terminale de Brdt ( ? C-Brdt ) et du peptide H4 tétra-acétylé est largement exothermique . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 interaction interaction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 partie partie NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 N N NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 terminale terminal ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 9 Brdt Brdt NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 ? ? PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 12 C-Brdt C-Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 du de+le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 peptide peptide NOM _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 17 H4 H4 NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 largement largement ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 exothermique exothermique ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1125 # text = Elle est caractéristique d'une réaction de fixation d'un peptide acétylé par un bromodomaine [ Annexe 4D et Figure 24 ] . 1 Elle elle CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 caractéristique caractéristique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 une un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 réaction réaction NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 fixation fixation NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 d' de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 un un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 peptide peptide NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 acétylé acétyle NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 par par PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 un un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 bromodomaine oromo NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 [ ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 Annexe Annexe NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 4D 4D NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 20 Figure Figure NOM _ _ 17 para _ _ _ _ _ 21 24 24 NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 ] ) PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1126 # text = La titration du peptide dans la solution tampon produit un signal endothermique constant . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 titration titration NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 peptide peptide NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 dans dans PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 solution solution NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 tampon tampon NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 produit produire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 un un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 signal signal NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 endothermique endothermique ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 constant constant ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1127 # text = Nous avons soustrait sa régression linéaire aux données de la fixation . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 soustrait soustraire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 sa son DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 régression régression NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 linéaire linéaire ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 aux à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 données donnée NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 fixation fixation NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1128 # text = Les paramètres moyens issus de la répétition de quatre expériences indiquent une stoechiométrie de 1 : 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 paramètres paramètre NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 moyens moyen ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 issus issu ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 répétition répétition NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 quatre quatre NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 expériences expérience NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 indiquent indiquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 une un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 stoechiométrie stoechiométrie NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 1 1 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 : : PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1129 # text = 1 entre le peptide et la protéine et une constante de dissociation ( Kd ) égale à 11 , 4 µM . 1 1 1 NUM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 2 entre entre PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 le le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 peptide peptide NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 protéine protéine NOM _ _ 4 para _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 9 une un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 constante constante NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 dissociation dissociation NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ( ( PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 Kd Kd NOM _ _ 7 parenth _ _ _ _ _ 15 ) ) PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 16 égale égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 à à PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 11 11 NUM _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 19 , 11 , 4 PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 20 4 4 NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 µM micro- NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1130 # text = b . BD1 1 b b NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 BD1 BD1 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1131 # text = La titration du peptide H 4 - 4 ac dans la solution de BD1 produit un dégagement de chaleur important [ Annexe 4C et Figure 24 ] . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 titration titration NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 peptide peptide NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 H H NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 4 4 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 - 4 - 4 PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 8 4 4 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 ac ac ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 solution solution NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 BD1 BD1 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 produit produire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 un un DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 dégagement dégagement NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 chaleur chaleur NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 important important ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 [ ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 Annexe Annexe VRB _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 23 4C 4C NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 25 Figure Figure NOM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 26 24 24 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 27 ] ) PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1132 # text = La régression linéaire du signal de la dilution du peptide a été soustraite aux données de la réaction de fixation . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 régression régression NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 3 linéaire linéaire ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 signal signal NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 dilution dilution NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 du de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 peptide peptide NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 a avoir VRB _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 12 été être VPP _ _ 13 aux _ _ _ _ _ 13 soustraite soustraire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 aux à PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 données donnée NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 réaction réaction NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 fixation fixation NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1133 # text = Les paramètres moyens issus de la répétition de quatre expériences permettent de déterminer un Kd de 28 ? 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 paramètres paramètre NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 moyens moyen ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 issus issu ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 répétition répétition NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 quatre quatre NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 expériences expérience NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 permettent permettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 déterminer déterminer VNF _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 un un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 Kd Kd NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 28 28 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ? ? PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1134 # text = M et une stoechiométrie de 1 : 1 M Monsieur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 une un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 stoechiométrie stoechiométrie NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 1 1 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 : : PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1135 # text = 1 entre le peptide H 4 - 4 ac et BD1 . 1 1 1 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 entre entre PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 le le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 peptide peptide NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 H H NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 4 4 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 7 - 4 - 4 PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 4 4 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 ac ac ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 BD1 BD1 NOM _ _ 4 para _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1136 # text = Cette affinité est environ deux fois plus forte que celle observée pour ? 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 affinité affinité NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 environ environ ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 5 deux deux NUM _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 fois fois NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 plus plus ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 forte fort ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 que que CSU _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 celle celui PRQ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 observée observer VPP _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 pour pour PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ? ? PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1137 # text = C- Brdt . 1 C- ce CLS _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Brdt Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1138 # text = Aucun échange de chaleur significatif n'a été enregistré pour la titration d'un peptide non acétylé dans une solution de BD1 . 1 Aucun aucun DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 échange échange NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 chaleur chaleur NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 significatif significatif ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 n' ne ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 7 a avoir VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 été être VPP _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 enregistré enregistrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 pour pour PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 titration titration NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 d' de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 un un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 peptide peptide NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 non non NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 acétylé acétyle NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 dans dans PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 19 une un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 solution solution NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 BD1 BD1 NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1139 # text = Cela confirme que l'interaction est spécifique vis à vis de l'acétylation . 1 Cela cela PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 confirme confirmer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 interaction interaction NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 est être VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 spécifique spécifique ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 vis vis NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 vis vis NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 l' le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 acétylation acétylation NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1140 # text = c . BD2 1 c c NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 BD2 BD2 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1141 # text = La titration du peptide H4 tétra-acétylé dans une solution de BD2 produit un dégagement de chaleur faible [ Annexe 4D et Figure 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 titration titration NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 peptide peptide NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 H4 H4 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 dans dans PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 une un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 solution solution NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 BD2 BD2 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 produit produire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 un un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 dégagement dégagement NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 chaleur chaleur NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 faible faible ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 [ ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 Annexe Annexe NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 4D 4D NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 22 Figure Figure NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1142 # text = 24 ] . 1 24 24 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ] ] PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1143 # text = La réaction de dilution du peptide dans la solution tampon est au contraire exothermique . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 réaction réaction NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 dilution dilution NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 du de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 peptide peptide NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 dans dans PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 solution solution NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 tampon tampon NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 au à+le PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 contraire au contraire NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 exothermique exothermique ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1144 # text = Même après la soustraction de ce signal , il n'a pas été possible de déterminer les paramètres de l'interaction . 1 Même même ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 après après PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 soustraction soustraction NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ce ce DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 signal signal NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 9 il il CLS _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 10 n' ne ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 11 a avoir VRB _ _ 13 aux _ _ _ _ _ 12 pas pas ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 été être VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 possible possible ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 déterminer déterminer VNF _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 les le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 paramètres paramètre NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 l' le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 interaction interaction NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1145 # text = En fixant le nombre de sites égal à un ( n = 1 ) , la convergence des paramètres peut cependant être obtenue . 1 En en PRE _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 2 fixant fixer VPR _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 le le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 nombre nombre NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 sites site NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 égal égal ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 un un PRQ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 11 n numéro NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 12 = égaler VRB _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 13 1 1 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 convergence convergence NOM _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 18 des de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 paramètres paramètre NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 peut pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 cependant cependant ADV _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 être être VNF _ _ 23 aux _ _ _ _ _ 23 obtenue obtenir VPP _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1146 # text = L'affinité ainsi déterminée est de l'ordre du milli-molaire . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 affinité affinité NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 ainsi ainsi ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 déterminée déterminer ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 de de l'ordre de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 l' de l'ordre de DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 ordre de l'ordre de DET _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 du de l'ordre de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 milli-molaire mi- NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1147 # text = d . Conclusion 1 d d NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Conclusion Conclusion NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1148 # text = Il apparaît ainsi que l'interaction entre la partie N terminale de Brdt et la queue N terminale acétylée de l'histone H4 est réalisée par l'intermédiaire du premier bromodomaine BD1 et que cette interaction dépend de l'acétylation des lysines . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 apparaît apparaître VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ainsi ainsi ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 que que? PRQ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 interaction interaction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 entre entre PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 partie partie NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 N N NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 terminale terminal ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 Brdt Brdt NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 queue queue NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 17 N N NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 terminale terminal ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 acétylée acétyle NOM _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 l' le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 histone histone NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 H4 H4 NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 réalisée réaliser ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 par par PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 l' le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 intermédiaire intermédiaire NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 du de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 premier premier ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 31 bromodomaine brome NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 BD1 BD1 NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 et et COO _ _ 34 mark _ _ _ _ _ 34 que que CSU _ _ 0 root _ _ _ _ _ 35 cette ce DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 interaction interaction NOM _ _ 37 subj _ _ _ _ _ 37 dépend dépendre VRB _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 38 de de PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 l' le DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 acétylation acétylation NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 des de PRE _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 lysines lysine NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 . . PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1149 # text = II . Affinités de BD1 des peptides H4 di-acétylés 1 II ii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Affinités Affinités NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD1 BD1 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 peptides peptide NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 H4 H4 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 di-acétylés NUMBER-acétyle NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1150 # text = Pour aller plus loin dans l'identification du motif reconnu par Brdt , nous avons mesuré l'affinité de BD1 pour différents peptides mimant la queue N terminale de l'histone H4 di-acétylée [ Tableau 8 ] . 1 Pour pour PRE _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 2 aller aller VNF _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 plus aller plus loin NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 loin aller plus loin NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 dans dans PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 identification identification NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 motif motif NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 reconnu reconnaître VPP _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 par par PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 Brdt Brdt NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 14 nous nous CLS _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 15 avons avoir VRB _ _ 16 aux _ _ _ _ _ 16 mesuré mesurer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 l' le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 affinité affinité NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 BD1 BD1 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 pour pour PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 22 différents différent DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 peptides peptide NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 mimant mimer VPR _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 la le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 queue queue NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 N N NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 terminale terminal ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 30 l' le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 histone histone NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 H4 H4 NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 di-acétylée NUMBER-acétyle NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 [ ( PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 35 Tableau Tableau NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 36 8 8 NUM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 ] ) PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 38 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1151 # text = Quatre des cinq peptides testés ont montré un signal significatif après la soustraction de celui de la dilution du peptide . 1 Quatre quatre NUM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 2 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 cinq cinq NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 peptides peptide NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 testés tester ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ont avoir VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 un un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 signal signal NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 significatif significatif ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 après après PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 soustraction soustraction NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 celui celui PRQ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 dilution dilution NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 du de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 peptide peptide NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1152 # text = L'interaction la plus forte est mesurée pour le peptide H 4 -K 5 K 8 ac 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 interaction interaction NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 4 plus plus ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 forte fort ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 est être VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 mesurée mesurer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 pour pour PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 le le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 peptide peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 H H NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 4 4 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 -K -K VPR _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 5 5 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 K K NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 8 8 NUM _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 ac ace NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1153 # text = ( Kd = 21 , 9   µM ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Kd Kd NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 21 21 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 5 , 21 , 9   PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 9 9 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7   21 , 9   DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 µM micro- NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1154 # text = Les affinités déterminées pour les autres peptides di-acétylés sont 6 à 15 fois plus faibles ( 117 µM pour 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 affinités affinité NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 déterminées déterminer VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 6 autres autre ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 peptides peptide NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 di-acétylés NUMBER-acétyle NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 6 6 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 11 à à PRE _ _ 13 det _ _ _ _ _ 12 15 15 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 fois fois NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 plus plus ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 faibles faible ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 17 117 117 NUM _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 µM micro- NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 pour pour PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1155 # text = H 4 -K 12 K 16 ac ; 1 H heure NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 12 12 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 K K NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 16 16 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 ac ace NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 ; ; PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1156 # text =   193   µM pour H 4 -K 8 K 12 ac et 340   µM pour H 4 -K 5 K 12 ac ) 1     193   DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 193 193 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3     193   DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 µM micro- NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 5 pour pour PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 H H NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 4 4 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 8 8 NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 K K NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 12 12 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 ac ace NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 14 340 340 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15   340   DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 µM micro- NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 17 pour pour PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 18 H H NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 4 4 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 -K -K VPR _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 5 5 NUM _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 K K NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 12 12 NUM _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 ac ace NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1157 # text = [ Figure 24 et Annexe   4E et 4F ] sauf pour le peptide H 4 -K 8 / K 16 ac , qui présente une affinité trop faible pour être mesurée [ Figure 25 et Annexe   2G ] . 1 [ ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 2 Figure Figure NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 3 24 24 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 Annexe Annexe NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6     4e DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 4E 4E NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 9 4F 4F NUM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 10 ] ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 11 sauf sauf PRE _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 12 pour pour PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 le le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 peptide peptide NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 H H NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 4 4 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 8 8 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 / / PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 K K NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 16 16 NUM _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 ac ace NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 24 qui qui PRQ _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 25 présente présenter VRB _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 26 une un DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 affinité affinité NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 trop trop ADV _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 29 faible faible ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 pour pour PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 être être VNF _ _ 32 aux _ _ _ _ _ 32 mesurée mesurer VPP _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 [ ( PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 34 Figure Figure NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 35 25 25 NUM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 et et COO _ _ 37 mark _ _ _ _ _ 37 Annexe Annexe NOM _ _ 34 para _ _ _ _ _ 38     2g DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 2G 2G NUM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 ] ) PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 41 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1158 # text = Ainsi BD1 fixe H 4 -K 5 / K 8 ac presque aussi bien que le peptide H4 tétra-acétylé . 1 Ainsi ainsi ADV _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 BD1 BD1 NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 fixe fixer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 H H NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 4 4 NUM _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 -K -K NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 5 5 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 / sur PUNC _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 K K NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 8 8 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 ac ace NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 presque presque NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 aussi aussi ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 bien bien ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 que que CSU _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 le le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 peptide peptide NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 H4 H4 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1159 # text = De façon surprenante , les résultats préliminaires , obtenus avec des peptides courts et mono-acétylés , n'avaient pas permis de détecter d'interaction entre BD1 et les peptides sH 4 -K 5 ac et sH 4 -K 8 ac . 1 De de PRE _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 2 façon façon NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 surprenante surprenant ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 résultats résultat NOM _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 7 préliminaires préliminaire ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 9 obtenus obtenir VPP _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 avec avec PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 des un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 peptides peptide NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 courts court ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 mono-acétylés mono- NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 17 n' ne ADV _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 18 avaient avoir VRB _ _ 20 aux _ _ _ _ _ 19 pas pas ADV _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 permis permettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 détecter détecter VNF _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 d' de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 interaction interaction NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 entre entre PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 BD1 BD1 NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 29 mark _ _ _ _ _ 28 les le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 peptides peptide NOM _ _ 26 para _ _ _ _ _ 30 sH sH VPR _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 4 4 NUM _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 -K -K NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 5 5 NUM _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 ac ace NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 35 et et COO _ _ 38 mark _ _ _ _ _ 36 sH sh NOM _ _ 38 subj _ _ _ _ _ 37 4 4 NUM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 -K -K VRB _ _ 20 para _ _ _ _ _ 39 8 8 NUM _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 ac ace NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 . . PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1160 # text = De plus nous avons vu que BD1 n'a pas d'affinité pour le peptide H4 non acétylé . 1 De de plus PRE _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 plus de plus NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 nous nous CLS _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 4 avons avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 vu voir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 que que CSU _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 BD1 BD1 NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 8 n' ne ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 a avoir VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 pas pas ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 d' de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 affinité affinité NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 pour pour PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 le le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 peptide peptide NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 H4 H4 NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 non non NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 acétylé acétyle NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1161 # text = Cela indique que BD1 a besoin pour fixer le peptide H4 que celui -ci soit au moins di-acétylé . 1 Cela cela PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 indique indiquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 BD1 BD1 NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 5 a avoir VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 besoin besoin NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 pour pour PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 fixer fixer VNF _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 le le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 peptide peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 H4 H4 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 que que CSU _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 13 celui celui PRQ _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 14 -ci -ci ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 soit être VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 au à+le PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 17 moins au moins NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 di-acétylé di-acétylé NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1162 # text = Nous avons tout de même vérifié que le domaine ne montre pas d'affinité pour les peptides H4 long 1 Nous nous CLS _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 3 tout tout de même NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 de tout de même PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 même tout de même ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 vérifié vérifier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 que que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 domaine domaine NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 10 ne ne ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 montre montrer VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 pas pas ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 d' de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 affinité affinité NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 pour pour PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 peptides peptide NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 18 H4 H4 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 long long ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1163 # text = ( 20 mers ) mono-acétylés sur les lysines K5 ou K8 . 1 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 2 20 20 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 mers mer NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 mono-acétylés mono- NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 sur sur PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 lysines lysine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 K5 K5 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 ou ou COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 K8 K8 NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1164 # text = Le signal obtenu suite à la titration de ces peptides est trop faible pour permettre la détermination des paramètres de l'interaction . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 signal signal NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 obtenu obtenir VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 suite suite à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 à suite à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 titration titration NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ces ce DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 peptides peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 trop trop ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 faible faible ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 pour pour PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 permettre permettre VNF _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 détermination détermination NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 des de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 paramètres paramètre NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 l' le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 interaction interaction NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1165 # text = Après la soustraction du signal de la dilution du peptide et en fixant le nombre de sites égal à 1 , l'affinité obtenue est de l'ordre de 1 mM pour H 4 -acK 5 et de l'ordre de 10 mM pour H 4 -acK 8 [ Figure 25 et Annexe 4G ] . 1 Après après PRE _ _ 25 periph _ _ _ _ _ 2 la le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 soustraction soustraction NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 signal signal NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 dilution dilution NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 du de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 peptide peptide NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 en en PRE _ _ 9 para _ _ _ _ _ 13 fixant fixer VPR _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 le le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 nombre nombre NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 sites site NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 égal égal ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 à à PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 1 1 NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 22 l' le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 affinité affinité NOM _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 24 obtenue obtenir ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 de de l'ordre de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 l' de l'ordre de DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 ordre de l'ordre de NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 de de l'ordre de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 1 1 NUM _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 mM millimètre NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 pour pour PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 33 H H NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 4 4 NUM _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 -acK -acK NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 5 5 NUM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 et et COO _ _ 38 mark _ _ _ _ _ 38 de de l'ordre de PRE _ _ 32 para _ _ _ _ _ 39 l' de l'ordre de DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 ordre de l'ordre de NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 de de l'ordre de PRE _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 10 10 NUM _ _ 43 spe _ _ _ _ _ 43 mM millimètre NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 44 pour pour PRE _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 H H NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 4 4 NUM _ _ 47 spe _ _ _ _ _ 47 -acK -acK NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 48 8 8 NUM _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 49 [ ( PUNC _ _ 50 punc _ _ _ _ _ 50 Figure Figure NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 51 25 25 NUM _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 52 et et COO _ _ 53 mark _ _ _ _ _ 53 Annexe Annexe NOM _ _ 50 para _ _ _ _ _ 54 4G 4G NUM _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 55 ] ) PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 56 . . PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1166 # text = III . Conclusion 1 III iii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Conclusion Conclusion NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1167 # text = La di-acétylation apparaît ainsi comme le motif minimum essentiel à l'établissement d'une interaction entre BD1 et le peptide H4 . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 di-acétylation acétylation NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 apparaît apparaître VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 ainsi ainsi ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 comme comme PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 le le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 motif motif NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 minimum minimum ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 essentiel essentiel ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 à à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 l' le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 établissement établissement NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 d' de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 une un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 interaction interaction NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 entre entre PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 BD1 BD1 NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 19 le le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 peptide peptide NOM _ _ 17 para _ _ _ _ _ 21 H4 H4 NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1168 # text = La di-acétylation K 5 / K 8 ac étant préférentiellement reconnue . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 di-acétylation acétylation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 K K NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 5 5 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 / sur PUNC _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 K K NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 8 8 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 ac ace NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 étant être VPR _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 10 préférentiellement préférentiellement ADV _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 11 reconnue reconnaître VPP _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1169 # text = Le classement des peptides selon leurs affinités montre que l'affinité décroît quand la distance entre les deux lysines acétylées augmente 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 classement classement NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 peptides peptide NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 selon selon PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 leurs son DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 affinités affinité NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 que que CSU _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 affinité affinité NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 12 décroît décroître VRB _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 quand quand CSU _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 distance distance NOM _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 16 entre entre PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 les le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 18 deux deux NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 lysines lysine NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 acétylées acétyle NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 augmente augmenter VRB _ _ 13 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1170 # text = ( K 5 / K 8 ac > K 12 / K 16 ac ? K 8 / K 12 ac > K 5 / K 12 ac > K 8 / K 16 ac ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 K K NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 5 5 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 / sur PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 5 K K NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 8 8 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 ac ace NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 > > VPR _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 K K NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 12 12 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 / sur PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 12 K K NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 16 16 NUM _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 ac ace NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 ? ? PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 16 K K NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 8 8 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 / ou PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 19 K K NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 12 12 NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 ac ace NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 > > VPR _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 K K NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 5 5 NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 / sur PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 26 K K NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 12 12 NUM _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 ac ace NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 > > ADJ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 K K NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 31 8 8 NUM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 / sur PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 33 K K NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 16 16 NUM _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 ac ace NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 36 ) ) PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1171 # text = C . Affinités pour la queue N terminale de l'histone H3 1 C c NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Affinités Affinités NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 queue queue NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 N N NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 terminale terminal ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 histone histone NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 H3 H3 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1172 # text = Nous avons ensuite examiné l'interaction des bromodomaines de Brdt avec la queue acétylée de l'histone H3 . 1 Nous nous CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 3 ensuite ensuite ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 examiné examiner VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 interaction interaction NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 des de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 bromodomaines brome NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 Brdt Brdt NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 avec avec PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 queue queue NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 acétylée acétyle NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 l' le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 histone histone NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 H3 H3 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1173 # text = Nous avons pour cela utilisé une collection de peptides longs ( 23 résidus ) mimant la queue N terminale de l'histone H3 de souris [ Tableau 9 ] . 1 Nous nous CLS _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 3 pour pour PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 cela cela PRQ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 utilisé utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 une un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 collection collection NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 peptides peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 longs long ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 12 23 23 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 résidus résidu NOM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 mimant mimer VPR _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 queue queue NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 N N NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 terminale terminal ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 l' le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 histone histone NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 H3 H3 NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 souris souris NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 [ ( PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 Tableau Tableau NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 9 9 NUM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 ] ) PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1174 # text = Tableau 9 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 9 9 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1175 # text = Peptides H3 longs 1 Peptides peptide NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 H3 H3 NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 longs long ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1176 # text = I. Affinités de BD1 et BD2 pour un peptide H3 tétra-acétylé 1 I. I. NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 Affinités Affinités NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 BD1 BD1 NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 6 BD2 BD2 NOM _ _ 4 para _ _ _ _ _ 7 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 un un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 peptide peptide NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 H3 H3 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1177 # text = Les domaines BD1 et BD2 montrent après soustraction du signal de la dilution du peptide , des affinités pour le peptide H3 tétra-acétylé respectivement égales à 390 µM et 214 µM et des stoechiométries de 1 : 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 domaines domaine NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 BD1 BD1 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 BD2 BD2 NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 montrent montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 après après PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 soustraction soustraction NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 du de+le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 signal signal NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 dilution dilution NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 du de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 peptide peptide NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 des de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 18 affinités affinité NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 pour pour PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 le le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 peptide peptide NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 H3 H3 NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 respectivement respectivement ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 égales égal ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 26 à à PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 390 390 NUM _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 µM micro- NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 et et COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 30 214 214 NUM _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 µM micro- NOM _ _ 28 para _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 33 mark _ _ _ _ _ 33 des de PRE _ _ 26 para _ _ _ _ _ 34 stoechiométries stoechiométrie NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 de de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 1 1 NUM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 : : PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1178 # text = 1 entre le peptide et la protéine [ Annexe   4H ] . 1 1 1 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 entre entre PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 le le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 peptide peptide NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 protéine protéine NOM _ _ 4 para _ _ _ _ _ 8 [ ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Annexe Annexe NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10     4h NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 4H 4H NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 ] ) PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1179 # text = En comparaison , l'affinité de BD1 pour la queue H4 est environ dix fois supérieure . 1 En en comparaison PRE _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 comparaison en comparaison NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 affinité affinité NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 BD1 BD1 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 pour pour PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 queue queue NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 H4 H4 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 environ environ ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 14 dix dix NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 fois fois NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 supérieure supérieur ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1180 # text = BD2 en revanche reconnaît préférentiellement la queue H3 tétra-acétylée mais n'interagit pas avec H4 tétra-acétylé . 1 BD2 BD2 NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 en en PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 revanche revanche NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 reconnaît reconnaître VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 préférentiellement préférentiellement ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 queue queue NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 H3 H3 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 tétra-acétylée tétra-acétyle NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 10 mais mais COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 11 n' ne ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 interagit interagir VRB _ _ 4 para _ _ _ _ _ 13 pas pas ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 avec avec PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 H4 H4 NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1181 # text = Aucun échange de chaleur ne résulte de la réaction contrôle de titration du peptide H3 non acétylé dans une solution de BD2 . 1 Aucun aucun DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 échange échange NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 chaleur chaleur NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ne ne ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 résulte résulter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 réaction réaction NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 contrôle contrôle NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 titration titration NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 du de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 peptide peptide NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 H3 H3 NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 non non NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 acétylé acétyle NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 dans dans PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 19 une un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 solution solution NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 BD2 BD2 NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1182 # text = Cela indique que l'interaction de BD2 et de la queue N terminale de H3 est spécifique vis-à-vis de l'acétylation [ Figure 27 ] . 1 Cela cela PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 indique indiquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 interaction interaction NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 BD2 BD2 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 6 para _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 queue queue NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 N N NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 terminale terminal ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 15 H3 H3 NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 est être VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 17 spécifique spécifique ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 vis-à-vis vis-à-vis de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 de vis-à-vis de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 l' le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 acétylation acétylation NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 [ ( PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 Figure Figure NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 27 27 NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 ] ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1183 # text = II . Affinités de BD2 pour des peptides H3 mono et di-acétylés 1 II ii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Affinités Affinités NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD2 BD2 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 des un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 peptides peptide NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 H3 H3 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 mono mono NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 di-acétylés di-acétylés NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1184 # text = Pour déterminer précisément le motif d'acétylation reconnu par BD2 sur la queue de l'histone H3 , nous avons procédé à des expériences similaires en utilisant des peptides mono et di-acétylés . 1 Pour pour PRE _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 2 déterminer déterminer VNF _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 précisément précisément ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 le le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 motif motif NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 d' de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 acétylation acétylation NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 reconnu reconnaître VPP _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 par par PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 BD2 BD2 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 sur sur PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 queue queue NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 l' le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 histone histone NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 H3 H3 NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 19 nous nous CLS _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 20 avons avoir VRB _ _ 21 aux _ _ _ _ _ 21 procédé procéder VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 à à PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 des un DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 expériences expérience NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 similaires similaire ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 en en PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 27 utilisant utiliser VPR _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 des un DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 peptides peptide NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 mono mono NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 et et COO _ _ 32 mark _ _ _ _ _ 32 di-acétylés di-acétylés NOM _ _ 29 para _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1185 # text = Les expériences de titration des peptides H3 diacétylés sur les lysines 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 expériences expérience NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 titration titration NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 des de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 peptides peptide NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 H3 H3 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 diacétylés didactyle ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 sur sur PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 les le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 lysines lysine NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1186 # text = K14 / K23 ou K9 / K14 , et mono-acétylés sur K14 ou K23 n'ont pas permis de déterminer les paramètres d'une interaction [ Annexe 4I ] . 1 K14 K14 NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 2 / sur PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 3 K23 K23 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ou ou COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 K9 K9 NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 / ou PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 7 K14 K14 NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 mono-acétylés mono- NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 11 sur sur PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 K14 K14 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ou ou COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 K23 K23 NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 15 n' ne ADV _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 16 ont avoir VRB _ _ 18 aux _ _ _ _ _ 17 pas pas ADV _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 permis permettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 déterminer déterminer VNF _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 les le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 paramètres paramètre NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 d' de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 une un DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 interaction interaction NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 [ ( PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 Annexe Annexe NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 4I 4I NUM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 ] ) PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1187 # text = Il existe cependant un dégagement de chaleur associé à l'injection des peptides H 3 -K 9 / K 14 ac et H 3 -K 14 / K 23 ac qui ne peut pas être expliqué par la seule réaction de dilution du peptide . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 existe exister VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 cependant cependant ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 dégagement dégagement NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 chaleur chaleur NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 associé associer VPP _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 injection injection NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 des de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 peptides peptide NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 H H NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 3 3 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 -K -K VPR _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 9 9 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 / sur PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 19 K K NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 14 14 NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 ac ac NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 23 H H NOM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 24 3 3 NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 -K -K VPR _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 26 14 14 NUM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 / sur PUNC _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 K K NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 23 23 NUM _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 ac ace NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 qui qui PRQ _ _ 33 subj _ _ _ _ _ 32 ne ne ADV _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 33 peut pouvoir VRB _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 34 pas pas ADV _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 être être VNF _ _ 36 aux _ _ _ _ _ 36 expliqué expliquer VPP _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 37 par par PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 la le DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 39 seule seul ADJ _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 40 réaction réaction NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 41 de de PRE _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 dilution dilution NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 du de PRE _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 peptide peptide NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1188 # text = Même en fixant le nombre de sites égal à un , il n'a pas été possible d'obtenir de solution satisfaisante à l'affinement des paramètres de la liaison . 1 Même même ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 2 en le CLI _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 fixant fixer VPR _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 4 le le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 nombre nombre NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 sites site NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 égal égal ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 un un PRQ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 12 il il CLS _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 13 n' ne ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 14 a avoir VRB _ _ 16 aux _ _ _ _ _ 15 pas pas ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 été être VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 possible possible ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 d' de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 obtenir obtenir VNF _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 solution solution NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 satisfaisante satisfaisant ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 à à PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 24 l' le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 affinement affinement NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 des de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 paramètres paramètre NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 la le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 liaison liaison NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1189 # text = L'affinité de BD2 pour ces peptides doit en conséquence être supérieure à 1 mM . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 affinité affinité NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 BD2 BD2 NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 ces ce DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 peptides peptide NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 doit devoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 en en conséquence PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 conséquence en conséquence NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 être être VNF _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 supérieure supérieur ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 1 1 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 mM millimètre NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1190 # text = En revanche , nous avons pu déterminer l'affinité de BD2 pour les peptides H 3 -K 18 ac , H 3 -K 9 / K 18 ac et H 3 -K 14 / K 18 ac ( Kd respectivement égaux à 251 µM , 519 µM et 217 µM ) [ Annexe 4J et 4K ] . 1 En en revanche PRE _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 revanche en revanche NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 nous nous CLS _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 5 avons avoir VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 pu pouvoir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 déterminer déterminer VNF _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 affinité affinité NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 BD2 BD2 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 pour pour PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 14 peptides peptide NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 15 H H NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 16 3 3 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 17 -K -K ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 18 18 18 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 19 ac ac ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 53 punc _ _ _ _ _ 21 H H NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 22 3 3 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 23 -K -K ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 24 9 9 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 25 / sur PUNC _ _ 53 punc _ _ _ _ _ 26 K K NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 27 18 18 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 28 ac ac NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 29 et et COO _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 30 H H NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 31 3 3 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 32 -K -K VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 33 14 14 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 34 / sur PUNC _ _ 53 punc _ _ _ _ _ 35 K K NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 36 18 18 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 37 ac ace NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 38 ( ( PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 39 Kd Kd NOM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 40 respectivement respectivement ADV _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 41 égaux égal ADJ _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 à à PRE _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 251 251 NUM _ _ 44 spe _ _ _ _ _ 44 µM micro- NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 45 , , PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 46 519 519 NUM _ _ 47 spe _ _ _ _ _ 47 µM micro- NOM _ _ 44 para _ _ _ _ _ 48 et et COO _ _ 50 mark _ _ _ _ _ 49 217 217 NUM _ _ 50 spe _ _ _ _ _ 50 µM micro- NOM _ _ 47 para _ _ _ _ _ 51 ) ) PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 52 [ ( PUNC _ _ 53 punc _ _ _ _ _ 53 Annexe Annexe NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 54 4J 4J NUM _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 55 et et COO _ _ 56 mark _ _ _ _ _ 56 4K 4K NUM _ _ 53 para _ _ _ _ _ 57 ] ) PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 58 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1191 # text = Ces affinités sont comparables entre elles et similaires à celle observée pour le peptide H3 tétra-acétylé ( 214 µM ) [ Figure 27 ] . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 affinités affinité NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 comparables comparable ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 entre entre PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 elles lui PRQ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 8 similaires similaire ADJ _ _ 4 para _ _ _ _ _ 9 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 10 celle celui PRQ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 observée observer VPP _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 pour pour PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 le le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 peptide peptide NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 H3 H3 NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 ( ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 18 214 214 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 µM micro- NOM _ _ 14 parenth _ _ _ _ _ 20 ) ) PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 21 [ ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 Figure Figure NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 23 27 27 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 ] ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1192 # text = Il semble donc que le motif minimum nécessaire à l'interaction de BD2 et de la queue N terminale de l'histone H3 soit l'acétylation de la lysine K18 . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 semble sembler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 donc donc ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 motif motif NOM _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 7 minimum minimum ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 nécessaire nécessaire ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 interaction interaction NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 BD2 BD2 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 12 para _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 queue queue NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 N N NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 terminale terminal ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 l' le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 histone histone NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 H3 H3 NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 soit être VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 25 l' le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 acétylation acétylation NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 la le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 lysine lysine NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 K18 K18 NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1193 # text = D . Affinités de la protéine BD1-K61Q 1 D d NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Affinités Affinités NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 protéine protéine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 BD1-K61Q BD1-K61Q NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1194 # text = Les résultats obtenus pour la protéine BD1 portant la mutation K61Q ressemblent à ceux obtenus pour la protéine sauvage . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résultats résultat NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 3 obtenus obtenir VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 protéine protéine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 BD1 BD1 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 portant porter VPR _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 mutation mutation NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 K61Q K61Q NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 ressemblent ressembler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ceux celui PRQ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 obtenus obtenir VPP _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 pour pour PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 protéine protéine NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 sauvage sauvage ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1195 # text = BD1-K61Q fixe le peptide H3 tétra-acétylé avec une affinité 18 fois plus faible 1 BD1-K61Q BD1-K61Q NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 fixe fixer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 le le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 peptide peptide NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 H3 H3 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 avec avec PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 une un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 affinité affinité NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 18 18 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 fois fois NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 plus plus ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 faible faible ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1196 # text = ( Kd = 275   µM ) par rapport aux peptides H4 tétra-acétylé et H 4 -K 5 / K 8 ac , pour lesquels il présente des affinités similaires ( 15 , 7   µM et 14 , 9   µM ) . 1 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 2 Kd Kd NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 = égaler VRB _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 4 275 275 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5   275   DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 µM micro- NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 8 par par rapport à PRE _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 9 rapport par rapport à DET _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 aux par rapport à PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 peptides peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 H4 H4 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 H H NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 16 4 4 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 5 5 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 / / PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 K K NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 8 8 NUM _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 ac ace NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 24 pour pour PRE _ _ 27 periph _ _ _ _ _ 25 lesquels lequel PRQ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 il il CLS _ _ 27 subj _ _ _ _ _ 27 présente présenter VRB _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 28 des un DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 affinités affinité NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 similaires similaire ADJ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 ( ( PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 32 15 15 NUM _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 33 , 15 , 7   PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 34 7 7 NUM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 35   15 , 7   DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 µM micro- NOM _ _ 29 parenth _ _ _ _ _ 37 et et COO _ _ 42 mark _ _ _ _ _ 38 14 14 NUM _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 39 , 14 , 9   PUNC _ _ 42 punc _ _ _ _ _ 40 9 9 NUM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 41   14 , 9   DET _ _ 42 spe _ _ _ _ _ 42 µM micro- NOM _ _ 36 para _ _ _ _ _ 43 ) ) PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 44 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1197 # text = Son affinité pour les peptides H4 mono-acétylés sur les lysines K5 et K8 est trop faible pour être mesurée [ Annexes 4L et 4M ] . 1 Son son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 affinité affinité NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 3 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 peptides peptide NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 H4 H4 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 mono-acétylés mono- NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 sur sur PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 lysines lysine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 K5 K5 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 K8 K8 NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 14 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 trop trop ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 faible faible ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 pour pour PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 être être VNF _ _ 19 aux _ _ _ _ _ 19 mesurée mesurer VPP _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 [ ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 Annexes Annexes ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 4L 4L NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 24 4M 4M NUM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 25 ] ) PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1198 # text = Ainsi , le mutant BD1-K61Q présente une spécificité vis des queues N terminale de H3 et H4 similaire à celle de la protéine BD1 sauvage . 1 Ainsi ainsi ADV _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 le le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 mutant mutant NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 5 BD1-K61Q BD1-K61Q NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 présente présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 une un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 spécificité spécificité NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 vis vis NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 queues queue NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 N N NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 terminale terminal ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 15 H3 H3 NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 H4 H4 NOM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 18 similaire similaire ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 19 à à PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 celle celui PRQ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 la le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 protéine protéine NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 BD1 BD1 NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 sauvage sauvage ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1199 # text = La mutation K61Q entraîne même une légère augmentation globale des affinités mesurées pour H3 et H4 ( de 21 µM à 15 µM pour H 4 - 4 ac et de 390 µM à 275 µM pour H 3 - 4 ac ) . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 mutation mutation NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 K61Q K61Q NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 entraîne entraîner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 même même ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 une un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 7 légère léger ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 augmentation augmentation NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 globale global ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 affinités affinité NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 mesurées mesurer VPP _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 pour pour PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 H3 H3 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 16 H4 H4 NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 17 ( ( PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 19 21 21 NUM _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 µM micro- NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 à à PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 15 15 NUM _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 µM micro- NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 pour pour PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 H H NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 4 4 NUM _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 27 - 4 - 4 PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 4 4 NUM _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 ac ace NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 30 et et COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 31 de de PRE _ _ 24 para _ _ _ _ _ 32 390 390 NUM _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 µM micro- NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 à à PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 275 275 NUM _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 µM micro- NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 pour pour PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 H H NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 3 3 NUM _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 40 - 3 - 4 PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 41 4 4 NUM _ _ 42 spe _ _ _ _ _ 42 ac ace NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 43 ) ) PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 44 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1200 # text = Ce qui entraîne chez la protéine Brdt-K61Q une diminution de la différence qui existait entre les affinités de BD1 et BD2 vis-à-vis de la queue N terminale tétra-acétylée de H3 ( 275 µM pour BD1 et 214 µM pour BD2 chez le mutant contre 390 µM pour BD1 et 214 µM pur BD2 chez la protéine sauvage ) . 1 Ce ce PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 qui qui PRQ _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 entraîne entraîner VRB _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 chez chez PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 protéine protéine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 Brdt-K61Q Brdt-K61Q NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 une un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 diminution diminution NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 différence différence NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 qui qui PRQ _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 14 existait exister VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 entre entre PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 affinités affinité NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 BD1 BD1 NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 BD2 BD2 NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 22 vis-à-vis vis-à-vis de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 23 de vis-à-vis de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 queue queue NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 N N NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 terminale terminale NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 28 tétra-acétylée tétra NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 H3 H3 NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 ( ( PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 32 275 275 NUM _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 µM micro- NOM _ _ 30 parenth _ _ _ _ _ 34 pour pour PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 BD1 BD1 NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 et et COO _ _ 38 mark _ _ _ _ _ 37 214 214 NUM _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 µM micro- NOM _ _ 35 para _ _ _ _ _ 39 pour pour PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 BD2 BD2 NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 chez chez PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 42 le le DET _ _ 43 spe _ _ _ _ _ 43 mutant mutant NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 44 contre contre PRE _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 390 390 NUM _ _ 46 spe _ _ _ _ _ 46 µM micro- NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 47 pour pour PRE _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 BD1 BD1 NOM _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 49 et et COO _ _ 51 mark _ _ _ _ _ 50 214 214 NUM _ _ 51 spe _ _ _ _ _ 51 µM micro- NOM _ _ 48 para _ _ _ _ _ 52 pur pur ADJ _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 53 BD2 BD2 NOM _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 54 chez chez PRE _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 55 la le DET _ _ 56 spe _ _ _ _ _ 56 protéine protéine NOM _ _ 54 dep _ _ _ _ _ 57 sauvage sauvage ADJ _ _ 56 dep _ _ _ _ _ 58 ) ) PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 59 . . PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1201 # text = Résultats : 1 Résultats résultat NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1202 # text = Chapitre 3 1 Chapitre chapitrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 3 3 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1203 # text = Structures cristallographiques des bromodomaines de Brdt en complexe avec les queues d'histones H3 et H4 1 Structures structure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 cristallographiques cristallographique ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 des un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 bromodomaines brome NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 Brdt Brdt NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 en le CLI _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 complexe complexer VRB _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 9 avec avec PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 les le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 queues queue NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 d' de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 histones histone NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 H3 H3 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 16 H4 H4 NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1204 # text = A . Structure de BD1 en complexe avec un peptide acétylé mimant la queue N terminale de l'histone H4 1 A a NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Structure Structure NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD1 BD1 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 en le CLI _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 complexe complexer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 avec avec PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 un un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 peptide peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 acétylé acétyle NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 mimant mimer VPR _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 queue queue NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 N N NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 terminale terminal ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 histone histone NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 H4 H4 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1205 # text = I. Cristallisation de BD1 en complexe avec les peptides H4 tétra-acétylé et H 4 -K 5 K 8 ac 1 I. I. NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 2 Cristallisation Cristallisation NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 BD1 BD1 NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 en en PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 complexe complexe NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 avec avec PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 peptides peptide NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 H4 H4 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 H H NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 14 4 4 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 5 5 NUM _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 K K NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 8 8 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 ac ace NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1206 # text = Pour obtenir une protéine soluble et stable à 20 °C , qui cristallise et dont les cristaux soient de qualité suffisante , nous avons testé 1 Pour pour PRE _ _ 25 periph _ _ _ _ _ 2 obtenir obtenir VNF _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 une un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 protéine protéine NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 soluble soluble ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 stable stable ADJ _ _ 5 para _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 9 20 20 NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 °C degré NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 12 qui qui PRQ _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 13 cristallise cristalliser VRB _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 15 dont dont PRQ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 cristaux cristal NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 18 soient être VRB _ _ 13 para _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 qualité qualité NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 suffisante suffisant ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 23 nous nous CLS _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 24 avons avoir VRB _ _ 25 aux _ _ _ _ _ 25 testé tester VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1207 # text = 10 clones différents de BD1 [ Tableau   10 ] . 1 10 10 NUM _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 clones clone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 différents différent ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 BD1 BD1 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 [ ( PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 Tableau Tableau NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8     10 DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 10 10 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 ] ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1208 # text = La construction initiale 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 construction construction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 initiale initial ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1209 # text = A11 , issue d'un projet de cristallisation à haut débit , n'avait pas permis d'obtenir de cristaux . 1 A11 A11 NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 issue issue NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 un un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 projet projet NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 cristallisation cristallisation NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 haut haut ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 débit débit NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 13 n' ne ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 14 avait avoir VRB _ _ 16 aux _ _ _ _ _ 15 pas pas ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 permis permettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 d' de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 obtenir obtenir VNF _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 cristaux cristal NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1210 # text = Les bornes de la première série de clones ( SI ) ont été choisies d'après une estimation du début et de la fin du domaine réalisée par l'alignement de la séquence primaire du domaine avec celles d'autres bromodomaines . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 bornes borne NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 première premier ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 série série NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 clones clone NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ( ( PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 SI SI ADV _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 11 ) ) PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 12 ont avoir VRB _ _ 13 aux _ _ _ _ _ 13 été être VPP _ _ 14 aux _ _ _ _ _ 14 choisies choisir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 d' d'après PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 après d'après NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 une un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 estimation estimation NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 du de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 début début NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 19 para _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 fin fin NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 du de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 domaine domaine NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 réalisée réaliser VPP _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 28 par par PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 l' le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 alignement alignement NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 de de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 la le DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 séquence séquence NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 primaire primaire ADJ _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 du de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 domaine domaine NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 avec avec PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 celles celui PRQ _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 d' de PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 autres autre ADJ _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 41 bromodomaines brome NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1211 # text = La structure des bromodomaines de Gcn 5 ( Owen et al. , 2000 ) , PCAF ( Mujtaba et al. , 2002 ) , CBP ( Mujtaba et al. , 2004 ) , TAFII250 ( Jacobson et al. , 2000 ) et Brdt-BD2 ( nos données ) étant connue , nous avons pu en déduire approximativement les limites du domaine . 1 La le CLI _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 structure structurer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 des un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 bromodomaines brome NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 Gcn Gcn NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 5 5 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Owen Owen NOM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 11 al. al. ADV _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 2000 2000 NUM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 53 punc _ _ _ _ _ 16 PCAF PCAF NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 17 ( ( PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 Mujtaba Mujtaba NOM _ _ 16 parenth _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 20 al. al. ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 2002 2002 NUM _ _ 18 para _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 CBP CBP NOM _ _ 16 para _ _ _ _ _ 26 ( ( PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 Mujtaba Mujtaba NOM _ _ 25 parenth _ _ _ _ _ 28 et et COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 29 al. al. ADV _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 31 2004 2004 NUM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 32 ) ) PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 33 , , PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 34 TAFII250 TAFII250 NOM _ _ 31 para _ _ _ _ _ 35 ( ( PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 36 Jacobson Jacobson NOM _ _ 34 parenth _ _ _ _ _ 37 et et COO _ _ 40 mark _ _ _ _ _ 38 al. al. ADV _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 , , PUNC _ _ 40 punc _ _ _ _ _ 40 2000 2000 NUM _ _ 36 para _ _ _ _ _ 41 ) ) PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 42 et et COO _ _ 43 mark _ _ _ _ _ 43 Brdt-BD2 Brdt-BD2 NOM _ _ 40 para _ _ _ _ _ 44 ( ( PUNC _ _ 46 punc _ _ _ _ _ 45 nos son DET _ _ 46 spe _ _ _ _ _ 46 données donnée NOM _ _ 43 parenth _ _ _ _ _ 47 ) ) PUNC _ _ 46 punc _ _ _ _ _ 48 étant être VPR _ _ 49 aux _ _ _ _ _ 49 connue connaître VPP _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 50 , , PUNC _ _ 53 punc _ _ _ _ _ 51 nous nous CLS _ _ 53 subj _ _ _ _ _ 52 avons avoir VRB _ _ 53 aux _ _ _ _ _ 53 pu pouvoir VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 54 en le CLI _ _ 55 dep _ _ _ _ _ 55 déduire déduire VNF _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 56 approximativement approximativement ADV _ _ 55 dep _ _ _ _ _ 57 les le DET _ _ 58 spe _ _ _ _ _ 58 limites limite NOM _ _ 55 dep _ _ _ _ _ 59 du de PRE _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 60 domaine domaine NOM _ _ 59 dep _ _ _ _ _ 61 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1212 # text = Nous avons utilisé ces limites comme bornes pour nos constructions . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 utilisé utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 ces ce DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 limites limite NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 comme comme PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 bornes borne NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 nos son DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 constructions construction NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1213 # text = La construction 28 - 136 s'est avérée insoluble , la construction 25 - 136 partiellement soluble mais instable . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 construction construction NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 28 28 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 - 28 - 136 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 136 136 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 s' s' CLI _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 est être VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 avérée avérer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 insoluble insoluble ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 construction construction NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 25 25 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 14 - 25 - 136 PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 136 136 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 partiellement partiellement ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 soluble soluble ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 18 mais mais COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 19 instable instable ADJ _ _ 17 para _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1214 # text = Seule la construction 22 - 136 s'est avérée soluble et stable à haute concentration ( environ 30 mg / mL ) . 1 Seule seul ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 la le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 construction construction NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 4 22 22 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 - 22 - 136 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 136 136 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 s' s' CLI _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 8 est être VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 avérée avérer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 soluble soluble ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 stable stable ADJ _ _ 10 para _ _ _ _ _ 13 à à PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 14 haute haut ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 concentration concentration NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 17 environ environ ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 18 30 30 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 mg milligramme NOM _ _ 15 parenth _ _ _ _ _ 20 / sur PUNC _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 mL millilitre NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 ) ) PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1215 # text = Cette construction n'ayant pas cristallisé , une seconde série de clonages à été réalisée . 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 construction construction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 n' ne ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 4 ayant avoir VPR _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 5 pas pas ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 cristallisé cristalliser VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 8 une un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 9 seconde second ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 série série NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 clonages clonage NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 été été NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 réalisée réaliser ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1216 # text = Pour la seconde série de clonages , nous nous sommes appuyé sur une modélisation de la structure du domaine , prenant comme modèle la structure de l'homologue Brd 2 BD1 [ PDB : 1XOJ ] récemment cristallisé 1 Pour pour PRE _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 3 seconde second ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 série série NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 clonages clonage NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 8 nous nous CLS _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 9 nous nous CLI _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 10 sommes être VRB _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 appuyé appuyer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 sur sur PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 une un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 modélisation modélisation NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 structure structure NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 du de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 domaine domaine NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 21 prenant prendre VPR _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 comme comme PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 modèle modèle NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 structure structure NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 l' le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 homologue homologue NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 Brd Brd NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 2 2 NUM _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 BD1 BD1 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 32 [ ( PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 33 PDB PDB NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 34 : : PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 35 1XOJ 1XOJ NUM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 ] ) PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 37 récemment récemment ADV _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 38 cristallisé cristalliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1217 # text = ( Nakamura et al. , 2007 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Nakamura Nakamura NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2007 2007 NUM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1218 # text = Les bornes E17 ou K23 ont été retenues pour l'extrémité N terminale et K142 , Q150 ou A154 à l'extrémité C terminale . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 bornes borne NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 E17 E17 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ou ou COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 K23 K23 NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 ont avoir VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 été être VPP _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 retenues retenir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 pour pour PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 extrémité extrémité NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 N N NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 terminale terminal ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 K142 K142 NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 Q150 Q150 NOM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 18 ou ou COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 19 A154 A154 NOM _ _ 17 para _ _ _ _ _ 20 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 21 l' le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 extrémité extrémité NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 C C NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 terminale terminal ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1219 # text = Tableau 10 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 10 10 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1220 # text = Clones de BD1 réalisés pour la cristallisation 1 Clones clone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 BD1 BD1 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 réalisés réaliser VPP _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 pour pour PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 cristallisation cristallisation NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1221 # text = De ces six constructions , cinq ont été testées . 1 De de PRE _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 ces ce DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 3 six six NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 constructions construction NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 6 cinq cinq NUM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 7 ont avoir VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 été être VPP _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 testées tester VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1222 # text = La construction 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 construction construction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1223 # text = 23 - 150 a permis d'obtenir des cristaux du domaine en complexe avec le peptide H4 tétra-acétylé ( 20 résidus ) . 1 23 23 NUM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 - 23 - 150 PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 150 150 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 a avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 permis permettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 d' de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 obtenir obtenir VNF _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 des un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 cristaux cristal NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 du de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 domaine domaine NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 en en PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 13 complexe complexe NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 avec avec PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 15 le le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 peptide peptide NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 H4 H4 NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 20 20 20 NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 résidus résidu NOM _ _ 16 parenth _ _ _ _ _ 22 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1224 # text = Ces cristaux ont été reproduits manuellement en utilisant un mélange contenant 20 mg / mL de protéine et soit le peptide H4 tétra-acétylé soit le peptide 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 cristaux cristal NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 ont avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 été être VPP _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 reproduits reproduire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 manuellement manuellement ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 en en PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 utilisant utiliser VPR _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 un un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 mélange mélange NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 contenant contenir VPR _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 20 20 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 mg milligramme NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 / sur PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 15 mL millilitre NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 protéine protéine NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 19 soit être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 le le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 peptide peptide NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 H4 H4 NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 soit soit COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 25 le le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 peptide peptide NOM _ _ 21 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1225 # text = H 4 -K 5 K 8 ac ( 20 résidus ) . 1 H heure NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 5 5 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 K K NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 8 8 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 ac ace NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 9 20 20 NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 résidus résidu NOM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 11 ) ) PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1226 # text = Le rapport entre la protéine et le peptide varie de 1 : 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 rapport rapport NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 entre entre PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 protéine protéine NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 peptide peptide NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 9 varie varier VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 1 1 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 : : PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1227 # text = 2 à 1 : 1 2 2 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 à à PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 1 1 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1228 # text = 5 . Les cristaux , de forme rhomboédrique et pouvant atteindre 300 µm x 300 µm x 100 µm ont été obtenus en 2 à 3 jours dans plusieurs conditions contenant de 1 , 1 à 1 , 2 M K2HPO4 et 0 , 02 à 1 5 5 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Les Les DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 cristaux cristal NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 46 punc _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 forme forme NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 rhomboédrique rhomboédrique ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 pouvant pouvoir VPR _ _ 8 para _ _ _ _ _ 11 atteindre atteindre VNF _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 300 300 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 µm micro- NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 x ex NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 300 300 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 µm micro- NOM _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 17 x ex NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 100 100 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 µm micro- NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 ont avoir VRB _ _ 21 aux _ _ _ _ _ 21 été être VPP _ _ 22 aux _ _ _ _ _ 22 obtenus obtenir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 en en PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 2 2 NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 à à PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 26 3 3 NUM _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 jours jour NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 dans dans PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 29 plusieurs plusieurs DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 conditions condition NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 contenant contenir VPR _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 de de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 1 1 NUM _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 34 , 1 , 1 PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 35 1 1 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 36 à à PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 37 1 1 NUM _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 38 , 1 , 2 PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 39 2 2 NUM _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 M M NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 41 K2HPO4 K2HPO4 NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 et et COO _ _ 45 mark _ _ _ _ _ 43 0 0 NUM _ _ 45 spe _ _ _ _ _ 44 , 0 , 02 PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 45 02 02 NUM _ _ 40 para _ _ _ _ _ 46 à à PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1229 # text = 0 , 2 M NaH 2 PO 4 . 1 0 0 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 , 0 , 2 PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 2 2 NUM _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 M M NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 NaH NaH NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 2 2 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 PO PO NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 4 4 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1230 # text = Cependant , malgré la variation des conditions de congélation , leur diffraction n'a pas permis d'obtenir de jeu de données dont la résolution dépasse 6 Å. Les cristaux , montés dans un capillaire contenant la solution mère , ont été exposés aux rayons X sans congélation . 1 Cependant cependant ADV _ _ 43 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 malgré malgré PRE _ _ 43 periph _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 variation variation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 conditions condition NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 congélation congélation NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 11 leur son DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 diffraction diffraction NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 13 n' ne ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 14 a avoir VRB _ _ 16 aux _ _ _ _ _ 15 pas pas ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 permis permettre VPP _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 17 d' de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 obtenir obtenir VNF _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 jeu jeu NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 données donnée NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 dont dont PRQ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 résolution résolution NOM _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 26 dépasse dépasser VRB _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 27 6 6 NUM _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 Å. Å. NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 Les Les DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 cristaux cristal NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 31 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 32 montés monter VPP _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 dans dans PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 un un DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 capillaire capillaire NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 contenant contenir VPR _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 la le DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 solution solution NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 mère mère NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 41 ont avoir VRB _ _ 42 aux _ _ _ _ _ 42 été être VPP _ _ 43 aux _ _ _ _ _ 43 exposés exposer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 44 aux à PRE _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 rayons rayons NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 X X ADJ _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 sans sans PRE _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 48 congélation congélation NOM _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 49 . . PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1231 # text = Les images obtenues étant similaires à celles obtenues après congélation , nous avons conclu qu'ils présentaient un désordre intrinsèque , indépendant d'une éventuelle dégradation due à la congélation , qui explique leur mauvaise diffraction . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 images image NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 3 obtenues obtenir ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 étant être VPR _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 similaires similaire ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 celles celui PRQ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 obtenues obtenir VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 après après PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 congélation congélation NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 12 nous nous CLS _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 13 avons avoir VRB _ _ 14 aux _ _ _ _ _ 14 conclu conclure VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 qu' que CSU _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 ils ils CLS _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 17 présentaient présenter VRB _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 un un DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 désordre désordre NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 intrinsèque intrinsèque ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 indépendant indépendant NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 23 d' de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 une un DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 25 éventuelle éventuel ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 26 dégradation dégradation NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 27 due devoir VPP _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 à à PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 la le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 congélation congélation NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 , , PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 32 qui qui PRQ _ _ 33 subj _ _ _ _ _ 33 explique expliquer VRB _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 34 leur son DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 35 mauvaise mauvais ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 36 diffraction diffraction NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1232 # text = Attestant d'une structure cristalline peu stable , on observe que les cristaux commencent à se dissoudre après une semaine environ . 1 Attestant attester VPR _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 d' de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 une un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 structure structure NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 cristalline cristallin ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 peu peu ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 stable stable ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 9 on on CLS _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 10 observe observer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 que que CSU _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 cristaux cristal NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 14 commencent commencer VRB _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 à à PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 se se CLI _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 dissoudre dissoudre VNF _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 après après PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 une un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 semaine semaine NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 environ environ ADV _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1233 # text = Pour tenter d'améliorer la diffraction nous avons sans résultat déshydraté les cristaux par bain prolongé dans le cryoprotectant . 1 Pour pour PRE _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 tenter tenter VNF _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 améliorer améliorer VNF _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 diffraction diffraction NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 nous nous CLS _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 8 avons avoir VRB _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 9 sans sans PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 10 résultat résultat NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 déshydraté déshydrater VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 cristaux cristal NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 par par PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 bain bain NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 prolongé prolonger VPP _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 dans dans PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 le le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 cryoprotectant cryoprotectant NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1234 # text = Nous avons également reproduit ces cristaux en ajoutant 5 à 10 % d'éthylène glycol dans la condition de cristallisation . 1 Nous nous CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 3 également également ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 reproduit reproduire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 ces ce DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 cristaux cristal NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 en en PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 ajoutant ajouter VPR _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 5 5 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 10 à à PRE _ _ 12 det _ _ _ _ _ 11 10 10 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 % pourcent NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 d' de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 éthylène éthylène NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 glycol glycol NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 dans dans PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 condition condition NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 cristallisation cristallisation NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1235 # text = Les cristaux ont vu leur croissance ralentie : 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 cristaux cristal NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 ont avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 vu voir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 leur son DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 croissance croissance NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ralentie ralentir VPP _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 : : PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1236 # text = une semaine environ au lieu des 2 - 3 jours sans additif . 1 une un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 semaine semaine NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 environ environ ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 au au lieu de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 lieu au lieu de DET _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 des au lieu de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 2 2 NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 8 - 2 - 3 PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 3 3 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 jours jours NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 sans sans PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 additif additif NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1237 # text = Ils ont également commencé à se dégrader plus tardivement . 1 Ils ils CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 ont avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 3 également également ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 commencé commencer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 se se CLI _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 dégrader dégrader VNF _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 plus plus ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 tardivement tardivement ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1238 # text = Cependant leur diffraction n'a pas connu d'amélioration notable . 1 Cependant cependant ADV _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 leur son DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 diffraction diffraction NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 4 n' ne ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 5 a avoir VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 6 pas pas ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 connu connaître VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 d' de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 amélioration amélioration NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 notable notable ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1239 # text = Dans une troisième série de clonage nous avons utilisé les bornes 1 Dans dans PRE _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 une un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 3 troisième troisième NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 série série NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 clonage clonage NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 nous nous CLS _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 8 avons avoir VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 utilisé utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 les le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 bornes borne NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1240 # text = 12 - 136 et 17 - 136 , bornes utilisées pour cristalliser Brd 4 [ pdb : 2OSS ] et Brd 3 [ pdb : 2NXB ] , deux structures récemment publiées dans la banque de données PDB . 1 12 12 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 - 12 - 136 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 136 136 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 17 17 NUM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 - 17 - 136 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 136 136 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 9 bornes borne NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 utilisées utiliser VPP _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 pour pour PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 cristalliser cristalliser VNF _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 Brd Brd NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 4 4 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 15 [ ( PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 16 pdb pub NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 : : PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 18 2OSS 2OSS NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 ] ) PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 Brd Brd NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 3 3 NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 [ ( PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 24 pdb pendant PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 : : PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 26 2NXB 2NXB NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 27 ] ) PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 29 deux deux NUM _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 structures structure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 31 récemment récemment ADV _ _ 32 periph _ _ _ _ _ 32 publiées publier VPP _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 dans dans PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 la le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 banque banque NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 de de PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 données donnée NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 PDB PDB NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 . . PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1241 # text = Un cristal rhomboédrique d'environ 150 µm de long [ Figure 27A ] a été obtenu au robot de cristallisation pour le domaine 12 - 136 à une concentration de 15 mg / ml en mélange avec le peptide H4 tétra-acétylé ( 20 résidus ) dans un rapport 1 : 1 Un un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 cristal cristal NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 3 rhomboédrique rhomboédrique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 environ environ ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 6 150 150 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 µm micro- NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 long long NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 [ ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 11 Figure Figure NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 27A 27A NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ] ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 14 a avoir VRB _ _ 15 aux _ _ _ _ _ 15 été être VPP _ _ 16 aux _ _ _ _ _ 16 obtenu obtenir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 au à PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 robot robot NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 cristallisation cristallisation NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 pour pour PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 le le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 domaine domaine NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 12 12 NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 - 12 - 136 PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 26 136 136 NUM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 à à PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 28 une un DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 concentration concentration NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 de de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 15 15 NUM _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 mg milligramme NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 / ou PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 34 ml millilitre NOM _ _ 32 para _ _ _ _ _ 35 en en PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 36 mélange mélange NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 avec avec PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 38 le le DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 peptide peptide NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 H4 H4 NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 ( ( PUNC _ _ 44 punc _ _ _ _ _ 43 20 20 NUM _ _ 44 spe _ _ _ _ _ 44 résidus résidu NOM _ _ 39 parenth _ _ _ _ _ 45 ) ) PUNC _ _ 44 punc _ _ _ _ _ 46 dans dans PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 47 un un DET _ _ 48 spe _ _ _ _ _ 48 rapport rapport NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 49 1 1 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 50 : : PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1242 # text = 1 , 7 dans la condition 2 , 4   M ammonium sulfate , 0 , 1   M MES pH 6 . 1 1 1 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 , 1 , 7 PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 7 7 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 dans dans PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 condition condition NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 2 2 NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 8 , 2 , 4   PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 9 4 4 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10   2 , 4   NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 M M NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 12 ammonium ammonium NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 sulfate sulfater VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 15 0 0 NUM _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 16 , 0 , 1   PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 17 1 1 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18   0 , 1   DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 M M NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 20 MES MES DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 pH pH NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 6 6 NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1243 # text = Ce cristal a été congelé dans l'azote liquide après un bain dans une solution de cryoprotection ( 2 , 4 M ammonium sulfate , 0 , 1 M MES pH 6 , 0 , 30 % glycerol ) . 1 Ce ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 cristal cristal NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 a avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 été être VPP _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 congelé congeler VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 dans dans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 l' le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 azote azote NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 liquide liquide ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 après après PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 11 un un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 bain bain NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 dans dans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 une un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 solution solution NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 cryoprotection cryoprotection NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 19 2 2 NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 20 , 2 , 4 PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 21 4 4 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 M M NOM _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 23 ammonium ammonium NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 sulfate sulfater VRB _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 26 0 0 NUM _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 27 , 0 , 1 PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 28 1 1 NUM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 29 M M NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 30 MES MES DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 31 pH pH NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 6 6 NUM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 33 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 34 0 0 NUM _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 35 , 0 , 30 PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 36 30 30 NUM _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 % pourcent NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 38 glycerol glycérol NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 ) ) PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 40 . . PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1244 # text = Bien que les images de diffraction indiquent un désordre interne important [ Figure 27B ] , ces cristaux ont permis d'obtenir un jeu de données à 2 , 63 Å de résolution . 1 Bien bien que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 que bien que CSU _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 3 les le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 images image NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 diffraction diffraction NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 indiquent indiquer VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 un un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 désordre désordre NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 interne interne ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 important important ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 [ ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 13 Figure Figure NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 14 27B 27B NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 ] ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 17 ces ce DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 cristaux cristal NOM _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 19 ont avoir VRB _ _ 20 aux _ _ _ _ _ 20 permis permettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 d' de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 obtenir obtenir VNF _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 un un DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 jeu jeu NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 données donnée NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 à à PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 28 2 2 NUM _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 29 , 2 , 63 PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 30 63 63 NUM _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 Å Å NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 32 de de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 résolution résolution NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 . . PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1245 # text = Pour améliorer la résolution , nous avons cherché à obtenir d'autres cristaux en criblant les 96 conditions contenant toutes de l'ammonium sulfate du screen « Nextal amonium sulfate » . 1 Pour pour PRE _ _ 24 periph _ _ _ _ _ 2 améliorer améliorer VNF _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 résolution résolution NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 6 nous nous CLS _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 7 avons avoir VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 cherché chercher VPP _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 obtenir obtenir VNF _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 d' un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 12 autres autre ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 cristaux cristal NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 en en PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 15 criblant cribler VPR _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 17 96 96 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 conditions condition NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 contenant contenir VPR _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 toutes tout PRQ _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 l' le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 ammonium ammonium NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 sulfate sulfater VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 du de+le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 screen Seren NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 « « PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 28 Nextal Nextal NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 29 amonium amonium NOM _ _ 30 subj _ _ _ _ _ 30 sulfate sulfater VRB _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 31 » » PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1246 # text = Des cristaux ont été obtenus pour les domaines 12 - 136 et 17 - 136 en mélange avec les peptides H 4 -K 5 K 8 ac long ( 20 résidus ) et H 4 -K 5 K 8 ac court ( 16 résidus ) dans des rapports molaires allant de 1 : 1 Des de PRE _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 cristaux cristal NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 ont avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 été être VPP _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 obtenus obtenir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 pour pour PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 domaines domaine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 12 12 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 - 12 - 136 PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 136 136 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 17 17 NUM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 14 - 17 - 136 PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 136 136 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 en en PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 17 mélange mélange NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 avec avec PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 19 les le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 peptides peptide NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 H H NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 4 4 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 23 -K -K VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 24 5 5 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 25 K K NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 26 8 8 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 27 ac ace NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 28 long long NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 29 ( ( PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 30 20 20 NUM _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 31 résidus résidu NOM _ _ 30 para _ _ _ _ _ 32 ) ) PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 33 et et COO _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 34 H H NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 35 4 4 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 36 -K -K ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 37 5 5 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 38 K K NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 39 8 8 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 40 ac ace NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 41 court court ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 42 ( ( PUNC _ _ 44 punc _ _ _ _ _ 43 16 16 NUM _ _ 41 para _ _ _ _ _ 44 résidus résidu NOM _ _ 43 para _ _ _ _ _ 45 ) ) PUNC _ _ 44 punc _ _ _ _ _ 46 dans dans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 47 des un DET _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 48 rapports rapport NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 49 molaires molaire NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 50 allant allant ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 51 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 52 1 1 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 53 : : PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1247 # text = 2 à 1 : 20 entre la protéine et le peptide . 1 2 2 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 à à PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 1 1 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 : 1 : 20 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 20 20 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 entre entre PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 protéine protéine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 10 le le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 peptide peptide NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1248 # text = Une vingtaine de conditions différentes ont mené à la cristallisation . 1 Une un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 vingtaine vingtaine NUM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 conditions condition NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 différentes différent ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ont avoir VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 mené mener VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 cristallisation cristallisation NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1249 # text = La diffraction des cristaux les plus prometteurs a été testée aux rayons X sur la ligne microfocus ID 23 -eh 2 . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 diffraction diffraction NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 cristaux cristal NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 6 plus plus ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 prometteurs prometteur ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 a avoir VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 été être VPP _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 testée tester VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 aux à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 rayons rayons NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 X X ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 sur sur PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 ligne ligne NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 microfocus micro- NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ID ID NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 23 23 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 -eh eh ADV _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 2 2 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1250 # text = Un de ces cristaux , obtenu avec la construction 17 - 136 à une concentration de 15 mg / mL en mélange avec le peptide H 4 -K 5 K 8 ac ( 20 résidus ) dans un rapport molaire 1 : 20 , dans la condition 2 , 4 M ammonium sulfate , 0 , 1 M Hepes pH 7 [ figure 28A ] , congelé dans 2 , 4 M ammonium sulfate , 0 , 1 M Hepes pH 7 , 30 % glycérol , a permis de collecter sur la ligne microfocus ID23 - 2 un jeu de données allant jusqu'à 2 , 37 Å malgré une diffraction faible et la présence de plusieurs réseaux superposés [ Figure 28B ] . 1 Un un PRQ _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 ces ce DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 cristaux cristal NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 6 obtenu obtenir VPP _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 7 avec avec PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 construction construction NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 17 17 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 11 - 17 - 136 PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 136 136 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 à à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 14 une un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 concentration concentration NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 15 15 NUM _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 mg milligramme NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 / / PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 20 mL mL VNF _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 en en PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 mélange mélange NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 avec avec PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 24 le le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 peptide peptide NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 H H NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 4 4 NUM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 -K -K VPR _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 29 5 5 NUM _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 K K NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 8 8 NUM _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 ac ace NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 33 ( ( PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 34 20 20 NUM _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 résidus résidu NOM _ _ 32 parenth _ _ _ _ _ 36 ) ) PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 37 dans dans PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 38 un un DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 rapport rapport NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 molaire molaire NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 41 1 1 NUM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 42 : 1 : 20 PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 43 20 20 NUM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 44 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 45 dans dans PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 46 la le DET _ _ 47 spe _ _ _ _ _ 47 condition condition NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 48 2 2 NUM _ _ 50 spe _ _ _ _ _ 49 , 2 , 4 PUNC _ _ 48 punc _ _ _ _ _ 50 4 4 NUM _ _ 51 spe _ _ _ _ _ 51 M M NOM _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 52 ammonium ammonium NOM _ _ 53 subj _ _ _ _ _ 53 sulfate sulfater VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 54 , , PUNC _ _ 55 punc _ _ _ _ _ 55 0 0 NUM _ _ 57 spe _ _ _ _ _ 56 , 0 , 1 PUNC _ _ 55 punc _ _ _ _ _ 57 1 1 NUM _ _ 58 spe _ _ _ _ _ 58 M M NOM _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 59 Hepes Hepes NOM _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 60 pH pH NOM _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 61 7 7 NUM _ _ 60 dep _ _ _ _ _ 62 [ ( PUNC _ _ 63 punc _ _ _ _ _ 63 figure figure NOM _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 64 28A 28A NUM _ _ 63 dep _ _ _ _ _ 65 ] ) PUNC _ _ 66 punc _ _ _ _ _ 66 , , PUNC _ _ 67 punc _ _ _ _ _ 67 congelé congelé NOM _ _ 74 subj _ _ _ _ _ 68 dans dans PRE _ _ 67 dep _ _ _ _ _ 69 2 2 NUM _ _ 71 spe _ _ _ _ _ 70 , 2 , 4 PUNC _ _ 69 punc _ _ _ _ _ 71 4 4 NUM _ _ 72 spe _ _ _ _ _ 72 M M NOM _ _ 68 dep _ _ _ _ _ 73 ammonium ammonium NOM _ _ 72 dep _ _ _ _ _ 74 sulfate sulfater VRB _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 75 , , PUNC _ _ 76 punc _ _ _ _ _ 76 0 0 NUM _ _ 78 spe _ _ _ _ _ 77 , 0 , 1 PUNC _ _ 76 punc _ _ _ _ _ 78 1 1 NUM _ _ 79 spe _ _ _ _ _ 79 M M NOM _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 80 Hepes Hepes NOM _ _ 79 dep _ _ _ _ _ 81 pH pH NOM _ _ 79 dep _ _ _ _ _ 82 7 7 NUM _ _ 84 spe _ _ _ _ _ 83 , 7 , 30 PUNC _ _ 82 punc _ _ _ _ _ 84 30 30 NUM _ _ 85 spe _ _ _ _ _ 85 % pourcent NOM _ _ 79 dep _ _ _ _ _ 86 glycérol glycérol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 87 , , PUNC _ _ 88 punc _ _ _ _ _ 88 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 89 permis permis NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 90 de de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 91 collecter collecter VNF _ _ 90 dep _ _ _ _ _ 92 sur sur PRE _ _ 91 dep _ _ _ _ _ 93 la le DET _ _ 94 spe _ _ _ _ _ 94 ligne ligne NOM _ _ 92 dep _ _ _ _ _ 95 microfocus micro- NOM _ _ 94 dep _ _ _ _ _ 96 ID23 ID23 NOM _ _ 94 dep _ _ _ _ _ 97 - - 2 PUNC _ _ 91 punc _ _ _ _ _ 98 2 2 NUM _ _ 97 dep _ _ _ _ _ 99 un un DET _ _ 100 spe _ _ _ _ _ 100 jeu jeu NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 101 de de PRE _ _ 100 dep _ _ _ _ _ 102 données donnée NOM _ _ 101 dep _ _ _ _ _ 103 allant aller VPR _ _ 102 dep _ _ _ _ _ 104 jusqu'à jusqu'à PRE _ _ 103 dep _ _ _ _ _ 105 2 2 NUM _ _ 107 spe _ _ _ _ _ 106 , 2 , 37 PUNC _ _ 105 punc _ _ _ _ _ 107 37 37 NUM _ _ 108 spe _ _ _ _ _ 108 Å Å NOM _ _ 104 dep _ _ _ _ _ 109 malgré malgré PRE _ _ 103 dep _ _ _ _ _ 110 une un DET _ _ 111 spe _ _ _ _ _ 111 diffraction diffraction NOM _ _ 109 dep _ _ _ _ _ 112 faible faible ADJ _ _ 111 dep _ _ _ _ _ 113 et et COO _ _ 115 mark _ _ _ _ _ 114 la le DET _ _ 115 spe _ _ _ _ _ 115 présence présence NOM _ _ 111 para _ _ _ _ _ 116 de de PRE _ _ 115 dep _ _ _ _ _ 117 plusieurs plusieurs DET _ _ 118 spe _ _ _ _ _ 118 réseaux réseau NOM _ _ 116 dep _ _ _ _ _ 119 superposés superposer ADJ _ _ 118 dep _ _ _ _ _ 120 [ ( PUNC _ _ 121 punc _ _ _ _ _ 121 Figure Figure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 122 28B 28B NUM _ _ 121 dep _ _ _ _ _ 123 ] ) PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 124 . . PUNC _ _ 123 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1251 # text = II . Résolution des structures cristallographiques de BD1 en complexe avec les peptides H4 tétra-acétylé et H 4 -K 5 K 8 ac a . 1 II ii NOM _ _ 24 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Résolution Résolution NOM _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 structures structure NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 cristallographiques cristallographique ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 BD1 BD1 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 en en PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 complexe complexe NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 avec avec PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 peptides peptide NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 H4 H4 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 H H NOM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 18 4 4 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 -K -K VPR _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 5 5 NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 K K NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 8 8 NUM _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 ac ace NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1252 # text = Structure de BD1 en complexe avec le peptide H4 tétra-acétylé 1 Structure structure NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 BD1 BD1 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 en le CLI _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 complexe complexer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 avec avec PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 peptide peptide NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 H4 H4 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1253 # text = Un jeu de données à 2 , 63 Å a été collecté à L'ESRF ( 1 Un un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 jeu jeu NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 données donnée NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 2 2 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 7 , 2 , 63 PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 8 63 63 NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 Å Å NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 a avoir VRB _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 été être VPP _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 12 collecté collecter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 L' L' DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 ESRF ESRF NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1254 # text = Synchrotron Radiation Facility ) sur la ligne microfocus ID 23 -eh 2 . 1 Synchrotron synchrotron NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Radiation Radiation NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 Facility Facility NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 sur sur PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 ligne ligne NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 microfocus micro- NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ID ID NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 23 23 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 -eh eh ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 2 2 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1255 # text = Les données ont été intégrées et mises à l'échelle avec la suite de programmes XDS / XSCALE ( Kabsch , 1993 ) . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 données donnée NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 ont avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 été être VPP _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 intégrées intégrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 mises mettre VPP _ _ 5 para _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 échelle échelle NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 avec avec PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 suite suite NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 programmes programme NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 XDS XDS NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 / ou PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 XSCALE XSCALE NOM _ _ 16 para _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 Kabsch Kabsch NOM _ _ 15 parenth _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 1993 1993 NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1256 # text = Les valeurs statistiques du jeu de données sont indiquées ci-dessous [ Tableau 11 ] . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 valeurs valeur NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 statistiques statistique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 jeu jeu NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 données donnée NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 sont être VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 indiquées indiquer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 ci-dessous ci-dessous ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 [ ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 Tableau Tableau NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 11 11 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ] ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1257 # text = Tableau 11 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 11 11 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1258 # text = Statistiques des données cristallographiques . 1 Statistiques statistique NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 données donnée NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 cristallographiques cristallographique ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1259 # text = La structure a été résolue par la technique du remplacement moléculaire à l'aide du programme MolRep de la suite CCP4 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structure structure NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 a avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 été être VPP _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 résolue résoudre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 technique technique NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 du de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 remplacement remplacement NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 à à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 l' le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 aide aide NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 du de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 programme programme NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 MolRep MolRep NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 suite suite NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 CCP4 CCP4 NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1260 # text = ( Collaborative Computational Project , 1994 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 2 Collaborative Collaborative NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 Computational Computational NOM _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 4 Project Project NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 1994 1994 NUM _ _ 4 para _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1261 # text = La structure tridimensionnelle de l'homologue Brd 4 [ PDB 2 OOS ] a été utilisée comme modèle . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structure structure NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 3 tridimensionnelle tridimensionnel ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 homologue homologue NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 Brd Brd NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 4 4 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 [ ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 10 PDB PDB NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 11 2 2 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 OOS OOS NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 ] ) PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 14 a avoir VRB _ _ 15 aux _ _ _ _ _ 15 été être VPP _ _ 16 aux _ _ _ _ _ 16 utilisée utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 comme comme PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 modèle modèle NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1262 # text = Deux solutions ont été obtenues ( facteur R = 0 , 572 et 0 , 576 ) . 1 Deux deux NUM _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 solutions solution NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 ont avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 été être VPP _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 obtenues obtenir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 facteur facteur NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 8 R R NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 = égaler VRB _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 10 0 0 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 11 , 0 , 572 PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 12 572 572 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 14 0 0 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 15 , 0 , 576 PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 576 576 NUM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 17 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1263 # text = Ce qui est cohérent avec le résultat du calcul de l'état d'hydratation du cristal selon Matthews qui indique que l'unité asymétrique contient le plus probablement 2 molécules , avec un pourcentage d'hydratation de 52 , 6 % [ Tableau 12 ] . 1 Ce ce PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 qui qui PRQ _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 cohérent cohérent ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 avec avec PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 le le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 résultat résultat NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 calcul calcul NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 l' le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 état état NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 d' de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 hydratation hydratation NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 du de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 cristal cristal NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 selon selon PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 Matthews Matthews NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 qui qui PRQ _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 20 indique indiquer VRB _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 21 que que CSU _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 l' le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 unité unité NOM _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 24 asymétrique asymétrique ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 contient contenir VRB _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 26 le le plus DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 plus le plus ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 probablement probablement ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 29 2 2 NUM _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 molécules molécule NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 31 , , PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 32 avec avec PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 33 un un DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 pourcentage pourcentage NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 d' de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 hydratation hydratation NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 de de PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 52 52 NUM _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 39 , 52 , 6 PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 40 6 6 NUM _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 41 % pourcent NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 42 [ ( PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 43 Tableau Tableau NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 44 12 12 NUM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 ] ) PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 46 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1264 # text = Tableau 12 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 12 12 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1265 # text = Calcul du coefficient de Matthews ( Mcoef. = V / M.Z avec V : volume de la maille , M : masse moléculaire de la protéine et Z : nombre de molécules dans la maille ) . 1 Calcul calcul NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 du de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 coefficient coefficient NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 Matthews Matthews NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 Mcoef. Mcoef. NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 V V PRQ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 / sur PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 11 M.Z M.Z NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 avec avec PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 V V PRQ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 : : PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 15 volume volume NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 maille maille NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 M M NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 21 : : PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 masse masse NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 la le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 protéine protéine NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 28 Z Z NOM _ _ 26 para _ _ _ _ _ 29 : : PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 30 nombre nombre NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 31 de de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 molécules molécule NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 dans dans PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 34 la le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 maille maille NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 ) ) PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1266 # text = Dimensions de la maille orthorhombique : 1 Dimensions dimension NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 maille maille NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 orthorhombique orthorhombique ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1267 # text = a = 49.4 Å = 60.2 = 60.2 = 98.1 Å ? = ? = 1 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 49.4 49.4 NUM _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 Å Å NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 5 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 60.2 60.2 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 60.2 60.2 NUM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 9 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 98.1 98.1 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 Å Å NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 ? ? PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 13 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 ? ? PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1268 # text = ? = 90 ° , MW = 14.2 Kda 1 ? ? PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 90 90 NUM _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 ° degré NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 6 MW MW NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 7 = égaler VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 14.2 14.2 NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 Kda Kda NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1269 # text = Pour déterminer le groupe d'espace , le remplacement moléculaire a été réalisé dans tous les groupes d'espaces orthorhombiques . 1 Pour pour PRE _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 2 déterminer déterminer VNF _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 le le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 groupe groupe NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 d' de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 espace espace NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 remplacement remplacement NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 10 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 a avoir VRB _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 12 été être VPP _ _ 13 aux _ _ _ _ _ 13 réalisé réaliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 dans dans PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 tous tout ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 groupes groupe NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 d' de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 espaces espace NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 orthorhombiques orthorhombiques ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1270 # text = Après comparaison des résultats , le groupe P212121 a été choisi car il donne clairement la meilleure solution . 1 Après après PRE _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 comparaison comparaison NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 résultats résultat NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 6 le le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 groupe groupe NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 8 P212121 P212121 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 a avoir VRB _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 été être VPP _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 choisi choisir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 car car COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 13 il il CLS _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 14 donne donner VRB _ _ 11 para _ _ _ _ _ 15 clairement clairement ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 17 meilleure meilleur ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 solution solution NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1271 # text = Un premier affinement constitué de 20 cycles d'affinement où chaque monomère est considéré comme un corps rigide avec le programme 1 Un un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 premier premier ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 affinement affinement NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 constitué constituer ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 20 20 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 cycles cycle NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 d' de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 affinement affinement NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 où où PRQ _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 11 chaque chaque DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 monomère monomère NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 13 est être VRB _ _ 14 aux _ _ _ _ _ 14 considéré considérer VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 15 comme comme PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 un un DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 corps corps NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 rigide rigide ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 avec avec PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 20 le le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 programme programme NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1272 # text = MolRep de la suite CCP4 , suivi de 10 cycles d'affinement restreint avec le programme Refmac ( Murshudov et al. , 1997 ) , aboutit à un modèle dont les facteurs R et Rfree sont respectivement égaux à 1 MolRep MolRep NOM _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 2 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 suite suite NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 CCP4 CCP4 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 7 suivi suivre VPP _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 10 10 NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 cycles cycle NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 d' de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 affinement affinement NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 restreint restreindre ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 avec avec PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 15 le le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 programme programme NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 Refmac Refmac NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ( ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 Murshudov Murshudov NOM _ _ 16 parenth _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 21 al. al. ADV _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 1997 1997 NUM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 24 ) ) PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 26 aboutit aboutir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 27 à à PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 un un DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 modèle modèle NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 dont dont PRQ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 31 les le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 facteurs facteur NOM _ _ 36 subj _ _ _ _ _ 33 R R NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 et et COO _ _ 35 mark _ _ _ _ _ 35 Rfree Rfree NOM _ _ 33 para _ _ _ _ _ 36 sont être VRB _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 37 respectivement respectivement ADV _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 égaux égal ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 à à PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1273 # text = 0 , 287 et 0 , 388 . 1 0 0 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 , 0 , 287 PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 287 287 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 5 0 0 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 6 , 0 , 388 PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 388 388 NUM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1274 # text = Le calcul des cartes associées au modèle indique clairement la présence d'une densité atomique continue dans le site de liaison du bromodomaine [ Figure 29 ] . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 calcul calcul NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 cartes carte NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 associées associer VPP _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 au à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 modèle modèle NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 indique indiquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 clairement clairement ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 présence présence NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 d' de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 une un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 densité densité NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 atomique atomique ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 continue continu ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 dans dans PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 18 le le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 site site NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 liaison liaison NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 du de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 23 bromodomaine bromé NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 [ ( PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 Figure Figure NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 29 29 NUM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 ] ) PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1275 # text = Nous avons poursuivi cet affinement avant la construction du peptide . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 poursuivi poursuivre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 cet ce DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 affinement affinement NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 avant avant PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 construction construction NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 du de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 peptide peptide NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1276 # text = Il a été constitué de cycles de calculs avec le programme CNS 1 Il il CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 a avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 été être VPP _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 constitué constituer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 cycles cycle NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 calculs calcul NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 avec avec PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 10 le le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 programme programme NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 CNS CNS NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1277 # text = ( Brünger et al. , 1998 ) et de modifications manuelles du modèle réalisées avec le programme COOT ( Emsley and Cowtan , 2004 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Brünger Brünger NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 1998 1998 NUM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 6 para _ _ _ _ _ 10 modifications modification NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 manuelles manuel ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 du de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 modèle modèle NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 réalisées réaliser VPP _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 15 avec avec PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 le le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 programme programme NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 COOT COOT NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 20 Emsley Emsley NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 21 and emsley and cowtan NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 22 Cowtan Cowtan NOM _ _ 17 parenth _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 2004 2004 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 ) ) PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1278 # text = Chaque phase calcul porte sur l'affinement de la géométrie ( incluant des contraintes de symétrie non cristallographique entre les deux monomères ) et de l'affinement des facteurs B . 1 Chaque chaque DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 phase phase NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 calcul calcul NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 porte porter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 sur sur PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 affinement affinement NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 géométrie géométrie NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 incluant inclure VPR _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 13 des un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 contraintes contrainte NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 symétrie symétrie NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 non non ADV _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 cristallographique cristallographique ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 entre entre PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 les le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 21 deux deux NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 22 monomères monomère NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 5 para _ _ _ _ _ 26 l' le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 affinement affinement NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 des de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 facteurs facteur NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 B B NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1279 # text = La densité obtenue a permis de placer facilement les deux résidus acétyl-lysine mais compte tenu du fait que le peptide porte 4 acéty-lysines 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 densité densité NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 obtenue obtenir ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 a avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 permis permettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 placer placer VNF _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 facilement facilement ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 10 deux deux NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 résidus résidu NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 acétyl-lysine acétyle-lysine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 mais mais COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 compte compte tenu de PRE _ _ 5 para _ _ _ _ _ 15 tenu compte tenu de A+D _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 du compte tenu de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 fait fait NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 que que CSU _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 le le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 peptide peptide NOM _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 21 porte porter VRB _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 4 4 NUM _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 acéty-lysines ace NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1280 # text = Il n'est pas exclu que nous observions la densité moyenne de plusieurs modes de liaison . 1 Il il CLS _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 n' ne ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 4 pas pas ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 exclu exclure VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 que que CSU _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 nous nous CLS _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 observions observer VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 densité densité NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 moyenne moyen ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 plusieurs plusieurs DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 modes mode NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 liaison liaison NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1281 # text = Cependant il existe pour la leucine L10 une densité bien visible qui nous a fait privilégier les séquences K ( ac ) GGK ( ac ) G ( molécule 1 ) et AGK ( ac ) GGK ( ac ) G ( molécule 2 ) où les acétyl-lysines 5 et 8 occupent le site de fixation . 1 Cependant cependant ADV _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 il il CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 existe exister VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 leucine leucine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 L10 L10 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 une un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 densité densité NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 10 bien bien ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 visible visible ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 qui qui PRQ _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 13 nous le CLI _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 14 a avoir VRB _ _ 15 aux _ _ _ _ _ 15 fait faire VPP _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 16 privilégier privilégier VNF _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 les le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 séquences séquence NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 K K NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 ac ac ADJ _ _ 18 parenth _ _ _ _ _ 22 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 23 GGK GGK NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 24 ( ( PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 ac ace NOM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 26 ) ) PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 27 G G NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 28 ( ( PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 29 molécule molécule NOM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 30 1 1 NUM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 ) ) PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 33 mark _ _ _ _ _ 33 AGK AGK NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 34 ( ( PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 35 ac ace NOM _ _ 33 parenth _ _ _ _ _ 36 ) ) PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 37 GGK GGK NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 38 ( ( PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 39 ac ace NOM _ _ 37 para _ _ _ _ _ 40 ) ) PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 41 G G NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 42 ( ( PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 43 molécule molécule NOM _ _ 41 para _ _ _ _ _ 44 2 2 NUM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 ) ) PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 46 où où PRQ _ _ 52 periph _ _ _ _ _ 47 les le DET _ _ 48 spe _ _ _ _ _ 48 acétyl-lysines acétyle-lysine NOM _ _ 52 subj _ _ _ _ _ 49 5 5 NUM _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 et et COO _ _ 51 mark _ _ _ _ _ 51 8 8 NUM _ _ 48 para _ _ _ _ _ 52 occupent occuper VRB _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 53 le le DET _ _ 54 spe _ _ _ _ _ 54 site site NOM _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 55 de de PRE _ _ 54 dep _ _ _ _ _ 56 fixation fixation NOM _ _ 55 dep _ _ _ _ _ 57 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1282 # text = Ceci est en accord avec les résultats d'ITC qui indiquent que BD1 présente pour le peptide di-acétylé H 4 -acK 5 , 8 la meilleure affinité . 1 Ceci ceci PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 en en accord avec PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 accord en accord avec NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 avec en accord avec PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 résultats résultat NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 d' de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ITC ITC NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 qui qui PRQ _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 11 indiquent indiquer VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 que que CSU _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 BD1 BD1 NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 14 présente présenter VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 pour pour PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 le le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 peptide peptide NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 di-acétylé di-acétylé NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 19 H H NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 4 4 NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 -acK -acK NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 22 5 5 NUM _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 23 , 5 , 8 PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 24 8 8 NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 25 la le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 26 meilleure meilleur ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 27 affinité affinité NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1283 # text = Structure de BD1 en complexe avec le peptide H 4 -acK 5 , 8 1 Structure structure NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 BD1 BD1 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 en le CLI _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 complexe complexer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 avec avec PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 peptide peptide NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 H H NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 4 4 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 -acK -acK ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 5 5 NUM _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 13 , 5 , 8 PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 8 8 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1284 # text = Pour lever le doute sur l'assignation de la séquence du peptide nous avons résolu la structure de BD1 en complexe avec un peptide mimant la queue de l'histone H4 uniquement acétylé sur les lysines 5 et 8 1 Pour pour PRE _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 2 lever lever VNF _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 le le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 doute doute NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 sur sur PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 assignation assignation NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 séquence séquence NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 du de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 peptide peptide NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 nous nous CLS _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 14 avons avoir VRB _ _ 15 aux _ _ _ _ _ 15 résolu résoudre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 structure structure NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 BD1 BD1 NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 en en PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 complexe complexe NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 avec avec PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 un un DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 peptide peptide NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 mimant mimer VPR _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 la le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 queue queue NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 l' le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 histone histone NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 H4 H4 NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 uniquement uniquement ADV _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 33 acétylé acétyle NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 34 sur sur PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 les le DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 lysines lysine NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 5 5 NUM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 et et COO _ _ 39 mark _ _ _ _ _ 39 8 8 NUM _ _ 33 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1285 # text = ( H 4 -acK 5 , 8 , 20 mers ) . 1 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 2 H H NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 4 4 NUM _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 -acK -acK NOM _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 5 5 5 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 7 8 8 NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 8 , 8 , 20 PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 9 20 20 NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 mers mer NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 11 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1286 # text = Un jeu de données à 2 , 37 Å a été obtenu sur la ligne microfocus 1 Un un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 jeu jeu NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 données donnée NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 2 2 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 7 , 2 , 37 PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 8 37 37 NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 Å Å NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 a avoir VRB _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 été être VPP _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 12 obtenu obtenir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 sur sur PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 ligne ligne NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 microfocus micro- NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1287 # text = ID 23 -eh 2 de l'ESRF . 1 ID ID NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 23 23 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -eh eh ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 2 2 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 ESRF ESRF NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1288 # text = Les cristaux présentaient une mauvaise diffraction : 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 cristaux cristal NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 présentaient présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 une un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 mauvaise mauvais ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 diffraction diffraction NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 : : PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1289 # text = diffraction circulaire au centre du cristal , diffraction faible , plusieurs réseaux superposés , perte rapide de diffraction . 1 diffraction diffraction NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 circulaire circulaire ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 au au centre de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 centre au centre de NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 du au centre de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 cristal cristal NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 8 diffraction diffraction NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 faible faible ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 11 plusieurs plusieurs DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 réseaux réseau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 superposés superposer ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 perte perte NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 rapide rapide ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 diffraction diffraction NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1290 # text = Plusieurs séries d'images complémentaires ont été collectées en irradiant différents volumes à la périphérie du cristal . 1 Plusieurs plusieurs DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 séries série NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 images image NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 complémentaires complémentaire ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ont avoir VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 été être VPP _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 collectées collecter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 en en PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 irradiant irradier VPR _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 différents différent DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 volumes volume NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 périphérie périphérie NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 du de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 cristal cristal NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1291 # text = De ces images a été conservé le plus petit nombre nécessaire pour obtenir des statistiques satisfaisantes lors de l'intégration et de la mise à l'échelle réalisées avec XDS et XSCALE . 1 De de PRE _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 ces ce DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 images image NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 a avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 été être VPP _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 conservé conserver VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 8 plus plus ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 petit petit ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 nombre nombre NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 11 nécessaire nécessaire ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 pour pour PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 13 obtenir obtenir VNF _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 des un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 statistiques statistique NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 satisfaisantes satisfaisant ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 lors lors de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 de lors de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 l' le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 intégration intégration NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 18 para _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 mise mise NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 à à PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 l' le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 échelle échelle NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 réalisées réaliser VPP _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 29 avec avec PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 XDS XDS NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 et et COO _ _ 32 mark _ _ _ _ _ 32 XSCALE XSCALE NOM _ _ 30 para _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1292 # text = Le choix des images ainsi fait , les dimensions de la maille ont été recalculées en tenant compte des résultats obtenus pour chaque série d'images et la mise à l'échelle a été recalculée avec ces nouvelles dimensions . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 choix choix NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 images image NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ainsi ainsi ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 fait faire ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 dimensions dimension NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 maille maille NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 ont avoir VRB _ _ 14 aux _ _ _ _ _ 14 été être VPP _ _ 15 aux _ _ _ _ _ 15 recalculées recalculer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 en en PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 tenant tenir VPR _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 compte compte NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 des de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 résultats résultat NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 obtenus obtenir VPP _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 pour pour PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 chaque chaque DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 série série NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 d' de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 images image NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 35 mark _ _ _ _ _ 28 la le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 mise mise NOM _ _ 35 subj _ _ _ _ _ 30 à à PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 l' le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 échelle échelle NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 a avoir VRB _ _ 34 aux _ _ _ _ _ 34 été être VPP _ _ 35 aux _ _ _ _ _ 35 recalculée recalculer VPP _ _ 15 para _ _ _ _ _ 36 avec avec PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 ces ce DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 38 nouvelles nouveau ADJ _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 39 dimensions dimension NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 40 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1293 # text = Les statistiques finales sont indiquées dans le tableau ci-dessus [ Tableau 11 ] . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 statistiques statistique NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 finales final ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 sont être VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 indiquées indiquer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 dans dans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 tableau tableau NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 ci-dessus ci-dessus ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 [ ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 Tableau Tableau NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 11 11 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ] ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1294 # text = Pour résoudre la structure , nous avons utilisé les phases de la structure de BD1 obtenue précédemment , dont les résidus 12 à 16 , les molécules d'eau et les peptides ont été supprimés . 1 Pour pour PRE _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 résoudre résoudre VNF _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 structure structure NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 6 nous nous CLS _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 7 avons avoir VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 utilisé utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 phases phase NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 structure structure NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 BD1 BD1 NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 obtenue obtenir ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 précédemment précédemment ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 19 dont dont PRQ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 20 les le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 résidus résidu NOM _ _ 35 subj _ _ _ _ _ 22 12 12 NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 à à PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 16 16 NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 26 les le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 molécules molécule NOM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 28 d' de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 eau eau NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 et et COO _ _ 32 mark _ _ _ _ _ 31 les le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 peptides peptide NOM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 33 ont avoir VRB _ _ 34 aux _ _ _ _ _ 34 été être VPP _ _ 35 aux _ _ _ _ _ 35 supprimés supprimer VPP _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 36 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1295 # text = Après un premier affinement constitué de 20 cycles d'affinement comme corps rigide à 1 Après après PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 un un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 3 premier premier ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 affinement affinement NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 constitué constituer ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 20 20 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 cycles cycle NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 d' de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 affinement affinement NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 comme comme PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 corps corps NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 rigide rigide ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 à à PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1296 # text = 4 Å , 10 cycles d'affinement comme corps rigide à 2 , 7 Å et 10 cycles d'affinement restreint , les facteurs R et Rfree étaient respectivement égaux à 0 , 257 et 0 , 320 . 1 4 4 NUM _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 Å Å NOM _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 4 10 10 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 cycles cycle NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 6 d' de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 affinement affinement NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 comme comme PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 corps corps NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 rigide rigide ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 à à PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 2 2 NUM _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 13 , 2 , 7 PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 14 7 7 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 Å Å NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 17 10 10 NUM _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 cycles cycle NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 19 d' de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 affinement affinement NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 restreint restreindre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 23 les le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 facteurs facteur NOM _ _ 28 subj _ _ _ _ _ 25 R R NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 27 Rfree Rfree NOM _ _ 25 para _ _ _ _ _ 28 étaient être VRB _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 29 respectivement respectivement ADV _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 égaux égal ADJ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 à à PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 0 0 NUM _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 33 , 0 , 257 PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 34 257 257 NUM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 35 et et COO _ _ 38 mark _ _ _ _ _ 36 0 0 NUM _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 37 , 0 , 320 PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 38 320 320 NUM _ _ 34 para _ _ _ _ _ 39 . . PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1297 # text = Une densité continue indiquait clairement la présence du peptide dans le site actif de chaque monomère [ figure 30 ] . 1 Une un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 densité densité NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 continue continu ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 indiquait indiquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 clairement clairement ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 présence présence NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 peptide peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 site site NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 actif actif ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 chaque chaque DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 monomère monomère NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 [ ( PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 figure figure NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 30 30 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 ] ) PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1298 # text = La densité des deux acétyl-lysines et de la leucine 10 de la chaîne B étant bien visibles , nous avons en premier lieu construit le peptide avec l'AcK 5 dans le site principal . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 densité densité NOM _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 deux deux NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 acétyl-lysines acétyle-lysine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 3 para _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 leucine leucine NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 10 10 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 chaîne chaîne NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 B B NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 étant être VPR _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 bien bien ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 visibles visible ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 19 nous nous CLS _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 20 avons avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 en en PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 premier premier ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 23 lieu lieu NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 construit construire ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 le le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 peptide peptide NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 27 avec avec PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 28 l' le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 AcK AcK NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 5 5 NUM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 dans dans PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 32 le le DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 site site NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 principal principal ADJ _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1299 # text = Les facteurs R et Rfree du modèle final sont respectivement égaux à 0 , 204 et 0 , 248 . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 facteurs facteur NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 R R NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 Rfree Rfree NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 modèle modèle NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 final final ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 respectivement respectivement ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 égaux égal ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 à à PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 0 0 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 14 , 0 , 204 PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 204 204 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 17 0 0 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 18 , 0 , 248 PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 248 248 NUM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1300 # text = Pour vérifier que la direction choisie était la bonne , le peptide a été construit avec l'acK 8 dans le site principal . 1 Pour pour PRE _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 2 vérifier vérifier VNF _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 direction direction NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 6 choisie choisir ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 était être VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 bonne bon ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 peptide peptide NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 13 a avoir VRB _ _ 14 aux _ _ _ _ _ 14 été être VPP _ _ 15 aux _ _ _ _ _ 15 construit construire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 avec avec PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 l' le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 acK acK NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 8 8 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 dans dans PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 21 le le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 site site NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 principal principal ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1301 # text = Reflétant une plus grande divergence entre la densité et le modèle , les facteurs R et Rfree sont moins bons ( respectivement égaux à 0 , 219 et 0 , 280 ) . 1 Reflétant refléter VPR _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 2 une un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 3 plus plus ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 grande grand ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 divergence divergence NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 entre entre PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 densité densité NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 10 le le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 modèle modèle NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 facteurs facteur NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 15 R R NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 Rfree Rfree NOM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 18 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 moins moins ADV _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 bons bon ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 ( ( PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 22 respectivement respectivement ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 23 égaux égal ADJ _ _ 18 parenth _ _ _ _ _ 24 à à PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 0 0 NUM _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 26 , 0 , 219 PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 27 219 219 NUM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 28 et et COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 29 0 0 NUM _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 30 , 0 , 280 PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 31 280 280 NUM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 32 ) ) PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1302 # text = Ces résultats confirment la direction du peptide avec l'acK 5 qui occupe le site principal . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résultats résultat NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 confirment confirmer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 direction direction NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 du de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 peptide peptide NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 avec avec PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 acK acK NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 5 5 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 qui qui PRQ _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 13 occupe occuper VRB _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 le le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 site site NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 principal principal ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1303 # text = III . Arrangement dans l'unité asymétrique 1 III iii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Arrangement Arrangement NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 dans dans PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 unité unité NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 asymétrique asymétrique ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1304 # text = La structure de BD1 en complexe avec le peptide H4 tétra-acétylé et celle en complexe avec le peptide H 4 -K 5 K 8 ac sont parfaitement superposables et présentent un r . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structure structure NOM _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 BD1 BD1 NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 en en PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 complexe complexe NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 avec avec PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 peptide peptide NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 H4 H4 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 celle celui PRQ _ _ 2 para _ _ _ _ _ 14 en en PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 complexe complexe NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 avec avec PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 le le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 peptide peptide NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 H H NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 4 4 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 -K -K VPR _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 5 5 NUM _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 K K NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 8 8 NUM _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 ac ace NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 27 parfaitement parfaitement ADV _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 28 superposables superposable ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 et et COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 30 présentent présenter VRB _ _ 26 para _ _ _ _ _ 31 un un DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 r gramme NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1305 # text = m . s . 1 m Monsieur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 s ssh NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1306 # text = d entre C ? 1 d d'entre PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 entre d'entre PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 C C NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1307 # text = pour 220   atomes ( résidus 27 - 136 des chaînes A et B ) égal à 0.25 Å [ Figure   31 ] . 1 pour pour PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 2 220 220 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3   220   DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 atomes atome NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 ( ( PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 résidus résidu NOM _ _ 4 parenth _ _ _ _ _ 7 27 27 NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 8 - 27 - 136 PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 136 136 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 chaînes chaîne NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 A A NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 B B NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 15 ) ) PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 16 égal égal ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 à à PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 0.25 0.25 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 Å Å ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 [ ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 Figure Figure NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22     31 DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 31 31 NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 ] ) PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1308 # text = Dans les deux cas chaque unité asymétrique contient deux molécules de BD1 formant un dimère dont les molécules A et B sont superposables avec un r . 1 Dans dans PRE _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 les le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 3 deux deux NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 cas cas NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 chaque chaque DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 unité unité NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 7 asymétrique asymétrique ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 contient contenir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 deux deux NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 molécules molécule NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 BD1 BD1 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 formant former VPR _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 un un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 dimère dimère NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 dont dont PRQ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 17 les le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 molécules molécule NOM _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 19 A A NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 B B NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 22 sont être VRB _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 23 superposables superposable ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 avec avec PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 un un DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 r gramme NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1309 # text = m . s . 1 m Monsieur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 s ssh NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1310 # text = d entre C ? 1 d d'entre PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 entre d'entre PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 C C NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1311 # text = pour 110 atomes ( résidus 27 à 136 ) égal à 0 , 26 1 pour pour PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 2 110 110 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 atomes atome NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 résidus résidu NOM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 27 27 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 à à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 136 136 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 10 égal égal ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 à à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 0 0 NUM _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 13 , 0 , 26 PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 26 26 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1312 # text = Å. Un peptide est présent dans chaque site de liaison des bromodomaines A et B. Ils forment respectivement les chaînes Q et P . 1 Å. Å. ADV _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 2 Un Un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 peptide peptide NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 4 est est NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 présent présent ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 dans dans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 chaque chaque DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 site site NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 liaison liaison NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 des un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 bromodomaines brome NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 13 A A NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 15 B. B. NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 Ils Ils NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 17 forment former VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 respectivement respectivement ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 les le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 chaînes chaîne NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 Q Q NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 23 P P NOM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1313 # text = Le tableau 13 résume la composition des chaînes protéiques présentes dans les deux structures . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 tableau tableau NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 13 13 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 résume résumer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 composition composition NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 des de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 chaînes chaîne NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 protéiques protéique ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 présentes présent ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 dans dans PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 12 les le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 13 deux deux NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 structures structure NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1314 # text = Tableau 13 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 13 13 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1315 # text = Constitution des chaînes présentes dans les structures cristallographiques 1 Constitution constitution NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 chaînes chaîne NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 présentes présent ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 dans dans PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 structures structure NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 cristallographiques cristallographique ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1316 # text = Les peptides P et Q sont superposables avec un r . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 peptides peptide NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 P P NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 Q Q NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 6 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 superposables superposable ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 avec avec PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 un un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 r gramme NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1317 # text = m . s . 1 m Monsieur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 s ssh NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1318 # text = d entre C ? 1 d d'entre PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 entre d'entre PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 C C NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1319 # text = pour 1 pour pour NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1320 # text = 8 résidus ( résidus 5 à 8 , molécules P et Q ) de 0 , 49 Å. Au delà des résidus 5 à 8 , des divergences apparaissent entre les chemins suivis par les peptides P et Q [ Figure 31 ] . 1 8 8 NUM _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résidus résidu NOM _ _ 29 periph _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 résidus résidu NOM _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 5 5 5 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 8 8 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 9 molécules molécule NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 P P NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 Q Q NOM _ _ 10 para _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 15 0 0 NUM _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 16 , 0 , 49 PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 17 49 49 NUM _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 Å. page NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 19 Au Au NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 delà de ADV _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 des de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 résidus résidu NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 5 5 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 à à PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 8 8 NUM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 27 des un DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 divergences divergence NOM _ _ 29 subj _ _ _ _ _ 29 apparaissent apparaître VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 30 entre entre PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 les le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 chemins chemin NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 suivis suivre VPP _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 par par PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 les le DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 peptides peptide NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 P P NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 et et COO _ _ 39 mark _ _ _ _ _ 39 Q Q NOM _ _ 37 para _ _ _ _ _ 40 [ ( PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 41 Figure Figure NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 42 31 31 NUM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 ] ) PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 44 . . PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1321 # text = Il existe probablement pour les résidus en dehors du site de liaison une grande flexibilité qui peut expliquer la divergence des chaînes et la disparition de la densité . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 existe exister VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 probablement probablement ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 résidus résidu NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 en en dehors de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 dehors en dehors de DET _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 du en dehors de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 site site NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 liaison liaison NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 une un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 14 grande grand ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 flexibilité flexibilité NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 16 qui qui PRQ _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 17 peut pouvoir VRB _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 expliquer expliquer VNF _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 divergence divergence NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 des de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 chaînes chaîne NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 disparition disparition NOM _ _ 20 para _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 la le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 densité densité NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1322 # text = Dans le cas de la structure de BD1 en complexe avec le peptide 1 Dans dans PRE _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 le le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 cas cas NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 de de+le PRE _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 5 la de+le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 structure structure NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 BD1 BD1 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 en le CLI _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 complexe complexer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 avec avec PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 le le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 peptide peptide NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1323 # text = H 4 -K 5 K 8 ac , un peptide supplémentaire ( chaîne R ) a été construit . 1 H heure NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -K -K VPR _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 5 5 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 K K NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 8 8 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 ac ace NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 9 un un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 peptide peptide NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 11 supplémentaire supplémentaire ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 chaîne chaîne NOM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 14 R R NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 16 a avoir VRB _ _ 17 aux _ _ _ _ _ 17 été être VPP _ _ 18 aux _ _ _ _ _ 18 construit construire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1324 # text = Il correspond très probablement aux résidus Ala- 2 et Met- 1 ( venant du vecteur de clonage ) et Glu 17 , Tyr 18 ( premiers résidus de la construction ) . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 correspond correspondre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 très très ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 probablement probablement ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 aux à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 résidus résidu NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 Ala- Ala- NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 2 2 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 Met- Met- NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 11 1 1 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 venant venir VPR _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 14 du de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 vecteur vecteur NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 clonage clonage NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 20 Glu Glu NOM _ _ 10 para _ _ _ _ _ 21 17 17 NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 23 Tyr Tyr NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 24 18 18 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 25 ( ( PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 26 premiers premier ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 27 résidus résidu NOM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 la le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 construction construction NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 ) ) PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1325 # text = Ces résidus sont visibles dans le cas de la molécule 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résidus résidu NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 visibles visible ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 dans dans PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 le le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 cas cas NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 molécule molécule NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1326 # text = B mais la densité n'a pas permis d'assigner la séquence exacte . 1 B B NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 2 mais mais COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 densité densité NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 5 n' ne ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 6 a avoir VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 7 pas pas ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 permis permettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 d' de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 assigner assigner VNF _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 séquence séquence NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 exacte exact ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1327 # text = Le peptide occupe la même place que les résidus 15 à 18 de BD1 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 peptide peptide NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 occupe occuper VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 même même ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 place place NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 que que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 résidus résidu NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 15 15 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 12 18 18 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 BD1 BD1 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1328 # text = ( 12 - 136 ) , à l'interface entre la molécule B et une molécule A appartenant à une unité asymétrique voisine [ Figure 32 ] . 1 ( ( PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 2 12 12 NUM _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 3 - 12 - 136 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 136 136 NUM _ _ 23 periph _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 7 à à PRE _ _ 23 periph _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 interface interface NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 entre entre PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 molécule molécule NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 B B NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 15 une un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 molécule molécule NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 17 A A NOM _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 18 appartenant appartenir VPR _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 à à PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 une un DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 unité unité NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 asymétrique asymétrique ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 voisine voisiner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 [ ( PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 Figure Figure NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 32 32 NUM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 ] ) PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1329 # text = Le fait qu'il existe pour ces 4 résidus une densité alors que les résidus 19 à 26 suivant ne sont pas définis ( ou le sont mal ) confirme le fait que cette partie N terminale de la protéine participe à la constitution de l'interface et se trouve ainsi stabilisée . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 fait fait NOM _ _ 30 subj _ _ _ _ _ 3 qu' que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 il il CLS _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 5 existe exister VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 pour pour PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 ces ce DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 8 4 4 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 résidus résidu NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 une un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 densité densité NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 alors alors que CSU _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 que alors que CSU _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 les le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 résidus résidu NOM _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 16 19 19 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 à à PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 26 26 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 suivant suivant NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 ne ne ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 21 sont être VRB _ _ 23 aux _ _ _ _ _ 22 pas pas ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 23 définis définir VPP _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 24 ( ( PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 25 ou ou COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 26 le le CLI _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 27 sont être VRB _ _ 23 para _ _ _ _ _ 28 mal mal ADV _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 ) ) PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 30 confirme confirmer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 31 le le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 fait fait NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 que que CSU _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 cette ce DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 partie partie NOM _ _ 41 subj _ _ _ _ _ 36 N N NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 terminale terminal ADJ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 de de PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 39 la le DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 protéine protéine NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 participe participer VRB _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 42 à à PRE _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 la le DET _ _ 44 spe _ _ _ _ _ 44 constitution constitution NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 45 de de PRE _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 l' le DET _ _ 47 spe _ _ _ _ _ 47 interface interface NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 48 et et COO _ _ 50 mark _ _ _ _ _ 49 se se CLI _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 50 trouve trouver VRB _ _ 41 para _ _ _ _ _ 51 ainsi ainsi ADV _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 52 stabilisée stabiliser ADJ _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 53 . . PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1330 # text = La présence d'un peptide à cet endroit conditionne probablement la formation de l'empilement cristallin tel que nous l'observons . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 présence présence NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 peptide peptide NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 cet ce DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 endroit endroit NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 conditionne conditionner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 probablement probablement ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 formation formation NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 l' le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 empilement empilement NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 cristallin cristallin ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 tel tel ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 que que CSU _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 19 nous nous CLS _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 20 l' le CLI _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 observons observer VRB _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1331 # text = Nous avons observé lors de la purification des protéines que les résidus 22 à 27 confèrent à BD1 une meilleure stabilité . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 observé observer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 lors lors de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de lors de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 purification purification NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 protéines protéine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 que que PRQ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 résidus résidu NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 13 22 22 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 27 27 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 confèrent conférer VRB _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 17 à à PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 BD1 BD1 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 une un DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 20 meilleure meilleur ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 stabilité stabilité NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1332 # text = Cette partie de la molécule forme une boucle qui chapeaute le bromodomaine 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 partie partie NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 molécule molécule NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 forme former VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 une un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 boucle boucle NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 qui qui PRQ _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 10 chapeaute chapeauter VRB _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 bromodomaine oromo NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1333 # text = [ Figure 33 ] . 1 [ ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Figure Figure VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 33 33 NUM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 4 ] ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 5 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1334 # text = La lysine K23 établit une liaison hydrogène avec la chaîne latérale du résidu Y86 de la région située entre les boucles 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 lysine lysine NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 K23 K23 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 établit établir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 une un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 liaison liaison NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 hydrogène hydrogène NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 avec avec PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 chaîne chaîne NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 latérale latéral ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 du de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 résidu résidu NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 Y86 Y86 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 région région NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 située situer VPP _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 entre entre PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 les le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 boucles boucle NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1335 # text = B et C et un pont salin avec l'acide glutamique E92 de la boucle C , le résidu R26 forme une liaison hydrogène avec la chaîne latérale du résidu Y87 de la boucle entre les hélices B et C , et la thréonine 1 B B NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 C C NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 5 un un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 pont pont NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 7 salin salin NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 avec avec PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 acide acide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 glutamique glutamique ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 E92 E92 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 boucle boucle NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 C C NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 18 le le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 résidu résidu NOM _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 20 R26 R26 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 forme former VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 une un DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 liaison liaison NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 hydrogène hydrogène NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 avec avec PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 26 la le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 chaîne chaîne NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 latérale latéral ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 du de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 résidu résidu NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 Y87 Y87 NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 de de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 la le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 boucle boucle NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 entre entre PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 les le DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 hélices hélice NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 B B NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 et et COO _ _ 40 mark _ _ _ _ _ 40 C C NOM _ _ 38 para _ _ _ _ _ 41 , , PUNC _ _ 44 punc _ _ _ _ _ 42 et et COO _ _ 44 mark _ _ _ _ _ 43 la le DET _ _ 44 spe _ _ _ _ _ 44 thréonine thréonine NOM _ _ 37 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1336 # text = T28 établit une liaison ionique avec la glutamine Q134 de l'extrémité C terminale de la seconde molécule du dimère . 1 T28 T28 NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 établit établir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 une un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 liaison liaison NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 ionique ionique ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 avec avec PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 8 glutamine glutamique ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 Q134 Q134 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 l' le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 extrémité extrémité NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 C C NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 terminale terminal ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 17 seconde second ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 molécule molécule NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 du de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 dimère dimère NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1337 # text = Cet ensemble d'interactions rigidifie très probablement le repliement du bromodomaine et peut expliquer que les protéines BD1 qui commencent aux résidus 25 et 28 soient respectivement instable et insoluble . 1 Cet ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 ensemble ensemble NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 interactions interaction NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 rigidifie rigidifier VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 très très ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 probablement probablement ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 repliement repliement NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 du de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 bromodomaine oromo NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 peut pouvoir VRB _ _ 5 para _ _ _ _ _ 14 expliquer expliquer VNF _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 que que CSU _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 protéines protéine NOM _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 18 BD1 BD1 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 qui qui PRQ _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 20 commencent commencer VRB _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 aux à PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 résidus résidu NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 25 25 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 25 28 28 NUM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 26 soient être VRB _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 27 respectivement respectivement ADV _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 instable instable ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 29 et et COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 30 insoluble insoluble ADJ _ _ 28 para _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1338 # text = IV . Architecture de BD1 1 IV iv NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Architecture Architecture VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD1 BD1 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1339 # text = BD1 présente un repliement classique de bromodomaine , exclusivement constitué d'hélices , de tours et de boucles . 1 BD1 BD1 NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 présente présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 un un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 repliement repliement NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 classique classique ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 bromodomaine oromo NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 9 exclusivement exclusivement ADV _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 10 constitué constituer VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 d' de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 hélices hélice NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 11 para _ _ _ _ _ 15 tours tour NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 14 para _ _ _ _ _ 18 boucles boucle NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1340 # text = L'assignement des structures secondaires par le programme DSSP ( Kabsch , 1983 ) indique cinq hélices alpha : ? 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 assignement assignement NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 structures structure NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 secondaires secondaire ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 par par PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 programme programme NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 DSSP DSSP NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 ( ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 Kabsch Kabsch NOM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 13 1983 1983 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 15 indique indiquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 cinq cinq NUM _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 hélices hélice NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 alpha alpha ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 : : PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 20 ? ? PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1341 # text = Z ( résidus 29 - 44 ) , ? 1 Z Z NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 résidus résidu NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 29 29 NUM _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 - 29 - 44 PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 44 44 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 9 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1342 # text = A'( résidus 65 - 68 ) , ? 1 A' a- _ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 3 résidus résidu NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 65 65 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 - 65 - 68 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 68 68 NUM _ _ 4 parenth _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 ? ? PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1343 # text = A ( résidus 75 - 83 ) , ? 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 résidus résidu NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 75 75 NUM _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 - 75 - 83 PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 83 83 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 9 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1344 # text = B ( résidus 90 - 107 ) , ? 1 B B NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 résidus résidu NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 90 90 NUM _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 - 90 - 107 PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 107 107 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 9 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1345 # text = C ( résidus 113 - 124 ) et une hélice 310 : ? 1 C C NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 résidus résidu NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 113 113 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 - 113 - 124 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 124 124 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 9 une un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 hélice hélice NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 11 310 310 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 13 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1346 # text = Z'( résidus 49 - 51 ) . 1 Z' Z' NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 résidus résidu NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 49 49 NUM _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 - 49 - 51 PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 51 51 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1347 # text = Ces hélices sont identiques chez les deux molécules du dimère . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 hélices hélice NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 identiques identique ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 chez chez PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 7 deux deux NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 molécules molécule NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 du de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 dimère dimère NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1348 # text = Les hélices Z , A , B et C sont empilées et forment le coeur allongé du domaine . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 hélices hélice NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 Z Z NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 A A NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 B B NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 9 C C NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 10 sont être VRB _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 empilées empiler VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 forment former VRB _ _ 11 para _ _ _ _ _ 14 le le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 coeur coeur NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 allongé allonger ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 du de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 domaine domaine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1349 # text = Les extrémités N et C terminales de la chaîne protéique sont rassemblées d'un côté . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 extrémités extrémité NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 3 N N NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 C C NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 6 terminales terminal ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 chaîne chaîne NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 protéique protéique ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 sont être VRB _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 12 rassemblées rassembler VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 d' de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 un un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 côté côté NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1350 # text = A l'opposé , les boucles ZA ( résidus 45 - 74 ) et BC ( résidus 108 - 112 ) forment le site de liaison du peptide [ Figure 34 ] . 1 A à PRE _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 2 l' le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 opposé opposé NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 boucles boucle NOM _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 7 ZA ZA NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 résidus résidu NOM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 10 45 45 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 11 - 45 - 74 PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 74 74 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 BC BC NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 résidus résidu NOM _ _ 15 parenth _ _ _ _ _ 18 108 108 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 - 108 - 112 PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 20 112 112 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 ) ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 22 forment former VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 le le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 site site NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 liaison liaison NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 du de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 peptide peptide NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 [ ( PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 30 Figure Figure NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 34 34 NUM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 ] ) PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1351 # text = Une troisième structure en hélice notée ? 1 Une un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 troisième troisième NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 structure structure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 en en PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 hélice hélice NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 notée noter ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 ? ? PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1352 # text = D est assignée pour les résidus 57 à 60 de la boucle ZA par le programme de calcul de structure secondaire 1 D de PRE _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 est est NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 assignée assigner VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 résidus résidu NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 57 57 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 60 60 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 boucle boucle NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 ZA ZA NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 par par PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 le le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 programme programme NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 calcul calcul NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 structure structure NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 secondaire secondaire ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1353 # text = DSS de PyMol . 1 DSS dss NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 PyMol PyMol NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1354 # text = Cette hélice implique une insertion de résidus propre à la famille des protéines BET . 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 hélice hélice NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 implique impliquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 une un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 insertion insertion NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 résidus résidu NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 propre propre ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 famille famille NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 des de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 protéines protéine NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 BET BET NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1355 # text = Elle est présente chez Brd 2 -BD2 1 Elle elle CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 présente présent ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 chez chez PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 Brd Brd NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 2 2 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 -BD2 -BD2 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1356 # text = ( Huang et al. , 2007 ) , Brd 4 -BD2 [ PDB : 2OUO ] et Brd 2 -BD1 1 ( ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 2 Huang Huang NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2007 2007 NUM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 9 Brd Brd NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 10 4 4 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 -BD2 -BD2 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 [ ( PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 13 PDB PDB NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 : : PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 15 2OUO 2OUO NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 ] ) PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 18 Brd Brd NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 2 2 NUM _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 -BD1 -BD1 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1357 # text = ( Nakamura et al. , 2007 ) chez qui elle présente les caractéristiques d'une hélice ? ( 4 , 4 résidus par tour , diamètre réduit de 2 , 8A , ( Rajashankar and Ramakumar , 1996 ) ) . 1 ( ( PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 2 Nakamura Nakamura NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2007 2007 NUM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 8 chez chez PRE _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 9 qui quiAcc? PRQ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 elle elle CLS _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 11 présente présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 caractéristiques caractéristique NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 d' de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 une un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 hélice hélice NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 ? ? PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 18 ( ( PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 4 4 NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 20 , 4 , 4 PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 21 4 4 NUM _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 résidus résidu NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 par par PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 tour tour NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 diamètre diamètre NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 réduit réduire ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 2 2 NUM _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 30 , 2 , 8a PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 31 8A 8A NUM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 32 , , PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 33 ( ( PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 34 Rajashankar Rajashankar NOM _ _ 36 periph _ _ _ _ _ 35 and rajashankar and ramakumar NOM _ _ 36 parenth _ _ _ _ _ 36 Ramakumar Ramakumar NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 37 , , PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 38 1996 1996 NUM _ _ 36 para _ _ _ _ _ 39 ) ) PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 40 ) ) PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 41 . . PUNC _ _ 40 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1358 # text = V. Surfaces et interactions du complexe BD 1 / H 4 -K 5 K 8 ac 1 V. verset NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 2 Surfaces Surfaces NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 4 interactions interaction NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 5 du de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 complexe complexe NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 BD BD NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 1 1 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 / sur PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 10 H H NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 4 4 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 5 5 NUM _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 K K NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 8 8 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 ac ace NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1359 # text = a . La surface de BD1 1 a a NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 La La NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 surface surfacer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 BD1 BD1 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1360 # text = Le calcul des charges électrostatiques existant à la surface de BD1 a été réalisé en appliquant la fonction de potentiels 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 calcul calcul NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 charges charge NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 électrostatiques électrostatique ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 existant exister VPR _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 à à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 surface surface NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 BD1 BD1 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 a avoir VRB _ _ 13 aux _ _ _ _ _ 13 été être VPP _ _ 14 aux _ _ _ _ _ 14 réalisé réaliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 en en PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 appliquant appliquer VPR _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 fonction fonction NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 potentiels potentiel NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1361 # text = «  Amber  » à tous les atomes de BD1 en utilisant le logiciel APBS 1 «  « _ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 Amber Amber NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3  » » _ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 à à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 tous tout ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 atomes atome NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 BD1 BD1 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 en en PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 11 utilisant utiliser VPR _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 le le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 logiciel logiciel NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 APBS APBS NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1362 # text = George Lerner ) . 1 George George NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Lerner Lerner NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1363 # text = Il met en évidence la polarité du bromodomaine , avec une face électronégative qui forme dans le cristal l'interface du dimère et une face électropositive , tournée dans le cristal vers le solvant [ Figure 35 ] . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 met mettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 en en PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 évidence évidence NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 polarité polarité NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 du de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 bromodomaine bromé NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 avec avec PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 11 une un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 face face NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 électronégative électronégatif ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 qui qui PRQ _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 15 forme former VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 dans dans PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 le le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 cristal cristal NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 l' le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 interface interface NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 21 du de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 dimère dimère NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 24 une un DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 face face NOM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 26 électropositive électropositif ADJ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 tournée tourner VPP _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 29 dans dans PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 le le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 cristal cristal NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 vers vers PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 le le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 solvant solvant NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 [ ( PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 36 Figure Figure NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 35 35 NUM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 ] ) PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 39 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1364 # text = b . Interaction entre les molécules A et B du dimère 1 b b NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Interaction Interaction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 entre entre PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 molécules molécule NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 A A NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 9 B B NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 10 du de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 dimère dimère NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1365 # text = L'interface entre les molécules A et B occupe environ 18 % de la surface accessible au solvant de chaque monomère avec une surface d'interaction de 1280 A2 . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 interface interface NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 entre entre PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 molécules molécule NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 A A NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 8 B B NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 9 occupe occuper VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 environ environ ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 11 18 18 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 % pourcent NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 surface surface NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 accessible accessible ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 au à PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 solvant solvant NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 chaque chaque DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 monomère monomère NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 avec avec PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 23 une un DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 surface surface NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 d' de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 interaction interaction NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 28 1280 1280 NUM _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 A2 A2 NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1366 # text = D'après l'analyse de PISA 1 D' d'après PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 après d'après NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 l' le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 analyse analyse NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 PISA PISA NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1367 # text = ( Krissinel and Henrick , 2007 ) , un outil d'analyse des interfaces et de prédiction des éventuelles structures quaternaires proposé par l'Institut Européen de Bioinformatique , les résidus constituant l'interface sont : 1 ( ( PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 2 Krissinel Krissinel NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 3 and krissinel and henrick NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Henrick Henrick NOM _ _ 35 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 2007 2007 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 9 un un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 outil outil NOM _ _ 35 periph _ _ _ _ _ 11 d' de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 analyse analyse NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 des de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 interfaces interface NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 13 para _ _ _ _ _ 17 prédiction prédiction NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 des de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 éventuelles éventuel ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 structures structure NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 quaternaires quaternaire ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 proposé proposer VPP _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 23 par par PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 l' le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 Institut Institut NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 Européen Européen NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 Bioinformatique Bioinformatique NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 30 les le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 résidus résidu NOM _ _ 35 subj _ _ _ _ _ 32 constituant constituer VPR _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 l' le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 interface interface NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 36 : : PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1368 # text = Sur l'ensemble de ces résidus , 13 sont de nature hydrophobe , soit 1 Sur Sur NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 2 l' le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 ensemble ensemble NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ces ce DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 résidus résidu NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 8 13 13 NUM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 9 sont être VRB _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 nature nature NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 14 soit être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1369 # text = 43 , 3 % de la totalité . 1 43 43 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 , 43 , 3 PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 3 3 NUM _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 % pourcent NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 totalité totalité NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1370 # text = Entre les deux molécules s'établissent 14 liaisons hydrogène [ Tableau 14 ] . 1 Entre entre PRE _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 les le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 3 deux deux NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 molécules molécule NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 s' s' CLI _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 établissent établir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 14 14 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 liaisons liaison NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 9 hydrogène hydrogène NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 [ ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 Tableau Tableau NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 14 14 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ] ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1371 # text = Aucune interaction ionique ( ponts salins ) ni autre liaison de plus haute énergie n'est observée . 1 Aucune aucun DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 interaction interaction NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 3 ionique ionique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 ponts pont NOM _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 6 salins salin NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 8 ni ni COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 9 autre autre ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 liaison liaison NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 plus plus ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 haute haut ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 énergie énergie NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 n' ne ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 est être VRB _ _ 17 aux _ _ _ _ _ 17 observée observer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1372 # text = Globalement l'interaction est donc stabilisée par des forces hydrophobes et des liaisons polaires de faible énergie . 1 Globalement globalement ADV _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 l' le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 interaction interaction NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 4 est être VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 5 donc donc ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 stabilisée stabiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 par par PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 des un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 forces force NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 hydrophobes hydrophobe ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 des de PRE _ _ 7 para _ _ _ _ _ 13 liaisons liaison NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 polaires polaire ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 faible faible ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 énergie énergie NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1373 # text = Avec un gain d'énergie libre de solvatation ( ? G = - 8 , 1 kcal / mol ) associé à la formation du complexe , PISA conclut que le dimère 1 Avec avec PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 un un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 gain gain NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 énergie énergie NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 libre libre ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 solvatation solvatation NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 11 G G NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 - - 8 , 1 PUNC _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 14 8 8 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 15 , - 8 , 1 PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 16 1 1 NUM _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 kcal kcal ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 / ou PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 mol mou ADJ _ _ 17 para _ _ _ _ _ 20 ) ) PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 21 associé associer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 à à PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 formation formation NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 du de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 complexe complexe NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 28 PISA PISA NOM _ _ 29 subj _ _ _ _ _ 29 conclut conclure VRB _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 30 que que? PRQ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 le le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 dimère dimère ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1374 # text = AB doit être stable en solution . 1 AB ab NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 doit devoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 être être VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 stable stable ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 en en PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 solution solution NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1375 # text = Cependant nous n'avons pas pu observer cette dimérisiation expérimentalement . 1 Cependant cependant ADV _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 nous nous CLS _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 n' ne ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 4 avons avoir VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 5 pas pas ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 pu pouvoir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 observer observer VNF _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 cette ce DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 dimérisiation dimérisiation NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 expérimentalement expérimentalement ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1376 # text = Tableau 14 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 14 14 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1377 # text = Liaisons hydrogène entre les molécules A et B 1 Liaisons liaison NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 hydrogène hydrogène NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 entre entre PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 molécules molécule NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 A A NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 8 B B NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1378 # text = c . Interaction entre BD1 et le peptide i . 1 c c NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Interaction Interaction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 entre entre PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD1 BD1 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 peptide peptide NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 9 i if NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1379 # text = Interaction entre la molécule B et le peptide P 1 Interaction interaction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 entre entre PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 molécule molécule NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 B B NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 peptide peptide NOM _ _ 4 para _ _ _ _ _ 9 P P NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1380 # text = Avec 498 A2 , l'interface entre la molécule B et le peptide 1 Avec avec PRE _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 498 498 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 A2 A2 NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 l' le CLI _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 interface interfacer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 entre entre PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 molécule molécule NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 B B NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 12 le le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 peptide peptide NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1381 # text = H 4 -K 5 K 8 ac représente 6 , 9 % de la surface accessible au solvant du bromodomaine et 50 % de celle du peptide . 1 H heure NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -K -K VPR _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 5 5 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 K K NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 8 8 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 ac ace NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 représente représenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 6 6 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 10 , 6 , 9 PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 9 9 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 % pourcent NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 surface surface NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 accessible accessible ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 au à PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 solvant solvant NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 du de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 bromodomaine oromo NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 22 50 50 NUM _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 % pourcent NOM _ _ 20 para _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 celle celui PRQ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 du de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 peptide peptide NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1382 # text = Le site de fixation des acétyl-lysines est essentiellement hydrophobe . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 site site NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 fixation fixation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 des de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 acétyl-lysines acétyle-lysine NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 essentiellement essentiellement ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1383 # text = Il est formé en surface par un sillon constitué par les résidus W49 , P50 , I114 , M117 et L60 dans lequel se place la chaîne latérale de l'acK 8 [ Figure 36 ] . 1 Il il CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 formé former VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 en en PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 surface surface NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 par par PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 un un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 sillon sillon NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 constitué constituer VPP _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 par par PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 résidus résidu NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 W49 W49 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 P50 P50 NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 I114 I114 NOM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 M117 M117 NOM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 L60 L60 NOM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 22 dans dans PRE _ _ 25 periph _ _ _ _ _ 23 lequel lequel PRQ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 se se CLI _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 place placer VRB _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 26 la le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 chaîne chaîne NOM _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 28 latérale latéral ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 l' le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 31 acK acK ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 32 8 8 NUM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 33 [ ( PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 34 Figure Figure NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 36 36 NUM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 ] ) PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1384 # text = Il existe dans cette partie un réseau de liaisons hydrogène liant le carbonyle du groupe acétyle de l'acK 8 , une molécule d'eau ( W6 ) , l'amine du groupe acétyle de l'acK 5 et le carbonyle de la proline 50 [ Figure 38 ] . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 existe exister VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 dans dans PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 cette ce DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 partie partie NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 un un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 réseau réseau NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 liaisons liaison NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 hydrogène hydrogène NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 liant lier VPR _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 le le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 carbonyle carbonyle NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 du de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 groupe groupe NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 acétyle acétyle NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 acK acK NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 8 8 NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 22 une un DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 molécule molécule NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 24 d' de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 eau eau NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 ( ( PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 W6 W6 NOM _ _ 25 parenth _ _ _ _ _ 28 ) ) PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 29 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 30 l' le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 amine amine NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 32 du de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 groupe groupe NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 acétyle acétyle NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 de de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 36 l' le DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 acK acK NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 5 5 NUM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 et et COO _ _ 41 mark _ _ _ _ _ 40 le le DET _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 41 carbonyle carbonyle NOM _ _ 37 para _ _ _ _ _ 42 de de PRE _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 la le DET _ _ 44 spe _ _ _ _ _ 44 proline pro- NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 45 50 50 NUM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 [ ( PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 47 Figure Figure NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 48 38 38 NUM _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 49 ] ) PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 50 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1385 # text = Le site est ensuite constitué d'une cavité dont les dimensions avoisinent 12 Å de long et 5 Å de large [ Figure 37 ] . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 site site NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 4 ensuite ensuite ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 constitué constituer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 d' de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 une un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 cavité cavité NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 dont dont PRQ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 10 les le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 dimensions dimension NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 12 avoisinent avoisiner VRB _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 12 12 NUM _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 Å Å NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 long long NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 18 5 5 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 Å Å NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 large large NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 [ ( PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 Figure Figure NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 37 37 NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 ] ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1386 # text = La première partie de la cavité est formée par les résidus I114 , N108 , Y107 , P50 , F51 , Q53 , P54 , V55 , L60 , L62 et Y65 [ Figure 36 ] . 1 La là ADV _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 première premier NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 3 partie partie NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 6 cavité cavité NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 7 est être VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 formée former VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 par par PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 les le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 résidus résidu NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 I114 I114 NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 N108 N108 NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 Y107 Y107 NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 P50 P50 NOM _ _ 16 para _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 F51 F51 NOM _ _ 18 para _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 Q53 Q53 NOM _ _ 20 para _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 P54 P54 NOM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 V55 V55 NOM _ _ 24 para _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 L60 L60 NOM _ _ 26 para _ _ _ _ _ 29 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 30 L62 L62 NOM _ _ 28 para _ _ _ _ _ 31 et et COO _ _ 32 mark _ _ _ _ _ 32 Y65 Y65 NOM _ _ 30 para _ _ _ _ _ 33 [ ( PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 34 Figure Figure NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 35 36 36 NUM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 ] ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1387 # text = Elle est occupée par la chaîne latérale de l'acK 5 qui établit une liaison hydrogène avec l'amine de l'asparagine 108 via son groupe carbonyle . 1 Elle elle CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 occupée occuper VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 par par PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 chaîne chaîne NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 latérale latéral ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 acK acK NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 5 5 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 qui qui PRQ _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 13 établit établir VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 14 une un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 liaison liaison NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 hydrogène hydrogène NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 avec avec PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 amine amine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 l' le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 asparagine asparagine NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 108 108 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 via via PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 25 son son DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 groupe groupe NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 carbonyle carbonyle ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1388 # text = La partie profonde de la cavité est ensuite occupée par cinq molécules d'eau qui forment un important réseau de liaisons hydrogène auquel participe l'acK 5 . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 partie partie NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 profonde profond ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 cavité cavité NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 est être VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 8 ensuite ensuite ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 occupée occuper VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 par par PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 cinq cinq NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 molécules molécule NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 d' de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 eau eau NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 qui qui PRQ _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 16 forment former VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 17 un un DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 18 important important ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 réseau réseau NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 liaisons liaison NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 hydrogène hydrogène NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 auquel à P+PRO _ _ 24 periph _ _ _ _ _ 24 participe participer VRB _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 25 l' le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 acK acK NOM _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 27 5 5 NUM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1389 # text = Ce réseau implique le groupe carbonyle de l'acétyle de l'acK 5 , les cinq molécules d'eau et les résidus Y65 , C104 , N103 , M73 , M100 et Q53 1 Ce ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 réseau réseau NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 implique impliquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 le le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 groupe groupe NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 carbonyle carbonyle ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 acétyle acétyle NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 l' le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 acK acK NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 5 5 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 15 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 16 cinq cinq NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 molécules molécule NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 18 d' de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 eau eau NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 21 les le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 résidus résidu NOM _ _ 17 para _ _ _ _ _ 23 Y65 Y65 NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 C104 C104 NOM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 N103 N103 NOM _ _ 25 para _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 29 M73 M73 NOM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 30 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 31 M100 M100 NOM _ _ 29 para _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 33 mark _ _ _ _ _ 33 Q53 Q53 NOM _ _ 31 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1390 # text = [ Figure   38 ] . 1 [ ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Figure Figure VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3     38 DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 38 38 NUM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 5 ] ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1391 # text = Les résidus P54 , Y66 , I69 , P72 et D74 participent également à la constitution du fond de la cavité . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résidus résidu NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 3 P54 P54 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Y66 Y66 NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 I69 I69 NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 P72 P72 NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 D74 D74 NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 12 participent participer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 également également ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 constitution constitution NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 du de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 fond fond NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 cavité cavité NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1392 # text = La chaîne principale du peptide se place au contact d'une surface électropositive constituée par les résidus D64 , Y107 , N108 , G111 , D112 et D113 formant un demi-cercle autour du site de fixation des acétyl-lysines . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 chaîne chaîne NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 principale principal ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 peptide peptide NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 se se CLI _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 place placer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 au à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 contact contact NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 d' de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 une un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 surface surface NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 électropositive électropositif ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 constituée constituer VPP _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 par par PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 résidus résidu NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 D64 D64 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 Y107 Y107 NOM _ _ 18 para _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 N108 N108 NOM _ _ 20 para _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 G111 G111 NOM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 D112 D112 NOM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 28 D113 D113 NOM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 29 formant former VPR _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 30 un un DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 demi-cercle demi-cercle NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 autour autour ADV _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 33 du de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 site site NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 de de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 fixation fixation NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 des un DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 acétyl-lysines acétyle-lysine NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 39 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1393 # text = Dans sa partie N terminale le peptide n'établit pas d'interaction directe avec le bromodomaine . 1 Dans dans PRE _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 sa son DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 partie partie NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 N N NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 terminale terminal ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 le le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 peptide peptide NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 8 n' ne ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 établit établir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 pas pas ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 d' de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 interaction interaction NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 directe direct ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 avec avec PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 15 le le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 bromodomaine oromo NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1394 # text = Les amines des liaisons peptidiques des résidus G4 , acK 5 et G6 se placent cependant en regard du groupe acide de l'acide aspartique D112 [ Figure 36 ] . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 amines amine NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 liaisons liaison NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 peptidiques peptidique ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 résidus résidu NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 G4 G4 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 10 acK acK ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 5 5 NUM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 G6 G6 NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 14 se se CLI _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 placent placer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 cependant cependant ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 en en PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 regard regard NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 du de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 groupe groupe NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 acide acide ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 l' le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 acide acide NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 aspartique aspartique ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 D112 D112 NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 [ ( PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 Figure Figure NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 29 36 36 NUM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 ] ) PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1395 # text = C'est par l'intermédiaire de deux molécules d'eau ( W92 et W108 ) que l'amine de l'acK 5 et le carbonyle de la glycine 6 forment des liaisons hydrogène avec les chaînes latérales des résidus 1 C' ce CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 par par PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 intermédiaire intermédiaire NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 deux deux NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 molécules molécule NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 d' de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 eau eau NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 W92 W92 NOM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 W108 W108 NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 15 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 16 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 17 l' le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 amine amine NOM _ _ 30 subj _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 l' le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 acK acK NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 5 5 NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 24 le le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 carbonyle carbonyle NOM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 la le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 glycine glycine NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 6 6 NUM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 forment former VRB _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 31 des un DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 liaisons liaison NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 hydrogène hydrogène NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 avec avec PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 35 les le DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 chaînes chaîne NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 latérales latéral ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 des de PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 résidus résidu NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1396 # text = D112 et N108 et avec les chaînes principales des résidus I114 et D113 [ Figure 38 ] . 1 D112 D112 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 N108 N108 NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 avec avec PRE _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 chaînes chaîne NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 principales principal ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 résidus résidu NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 I114 I114 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 D113 D113 NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 14 [ ( PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 Figure Figure NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 16 38 38 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 ] ) PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1397 # text = La partie C terminale du peptide vient ensuite s'enrouler autour du relief électronégatif que forme le groupe acide de l'aspartate D113 [ Figure 36 ] . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 partie partie NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 C C NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 terminale terminal ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 peptide peptide NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 vient venir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 ensuite ensuite ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 s' s' CLI _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 enrouler enrouler VNF _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 autour autour de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 du autour de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 relief relief NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 électronégatif électronégatif ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 que que PRQ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 forme former VRB _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 le le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 groupe groupe NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 19 acide acide ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 l' le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 aspartate aspartame NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 D113 D113 NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 [ ( PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 Figure Figure NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 26 36 36 NUM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 ] ) PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1398 # text = L'amine de la liaison peptidique de l'acK 8 , celui de la glycine G9 et celui de la leucine L10 forment des liaisons hydrogène avec ce groupe acide [ Figure 38 ] . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 amine amine NOM _ _ 23 periph _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 liaison liaison NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 peptidique peptidique ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 acK acK NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 8 8 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 12 celui celui PRQ _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 glycine glycine NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 G9 G9 NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 18 celui celui PRQ _ _ 12 para _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 leucine leucine NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 L10 L10 NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 forment former VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 des un DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 liaisons liaison NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 hydrogène hydrogène NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 avec avec PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 28 ce ce DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 groupe groupe NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 acide acide ADJ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 [ ( PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 32 Figure Figure NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 33 38 38 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 ] ) PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1399 # text = La chaîne latérale de la leucine L10 s'enfouit dans un site hydrophobe constitué par les résidus F47 , V116 et M117 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 chaîne chaîne NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 latérale latéral ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 leucine leucine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 L10 L10 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 s' s' CLI _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 enfouit enfouir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 un un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 site site NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 constitué constituer VPP _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 par par PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 résidus résidu NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 F47 F47 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 V116 V116 NOM _ _ 18 para _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 22 M117 M117 NOM _ _ 20 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1400 # text = [ Figure   36 ] . 1 [ ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Figure Figure VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3     36 DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 36 36 NUM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 5 ] ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1401 # text = Ainsi le peptide est stabilisé uniquement par des interactions polaires et hydrophobes . 1 Ainsi ainsi ADV _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 le le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 peptide peptide NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 4 est être VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 stabilisé stabiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 uniquement uniquement ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 des un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 interactions interaction NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 polaires polaire ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 hydrophobes hydrophobe ADJ _ _ 10 para _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1402 # text = Cependant , avec un gain d'énergie libre de solvatation ( ? G = - 9 , 8 kcal / mol ) associé à la formation du complexe BP , PISA conclut que le complexe BP est stable en solution , ce que nous avons pu observer et quantifier expérimentalement . 1 Cependant cependant ADV _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 avec avec PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 gain gain NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 d' de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 énergie énergie NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 libre libre ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 solvatation solvatation NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 12 ? ? PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 13 G G NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 - - 9 , 8 PUNC _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 16 9 9 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 17 , - 9 , 8 PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 18 8 8 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 kcal kcal ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 / ou PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 mol mou ADJ _ _ 19 para _ _ _ _ _ 22 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 23 associé associer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 à à PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 la le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 formation formation NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 du de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 complexe complexe NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 BP BP NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 31 PISA PISA NOM _ _ 32 subj _ _ _ _ _ 32 conclut conclure VRB _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 33 que que CSU _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 le le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 complexe complexe NOM _ _ 37 subj _ _ _ _ _ 36 BP BP NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 est être VRB _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 38 stable stable ADJ _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 en en PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 solution solution NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 42 ce ce PRQ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 43 que que PRQ _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 44 nous nous CLS _ _ 46 subj _ _ _ _ _ 45 avons avoir VRB _ _ 46 aux _ _ _ _ _ 46 pu pouvoir VPP _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 47 observer observer VNF _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 et et COO _ _ 49 mark _ _ _ _ _ 49 quantifier quantifier VNF _ _ 0 root _ _ _ _ _ 50 expérimentalement expérimentalement ADV _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 51 . . PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1403 # text = ii . 1 ii if NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1404 # text = Interaction entre la molécule A et le peptide Q 1 Interaction interaction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 entre entre PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 molécule molécule NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 A A NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 peptide peptide NOM _ _ 4 para _ _ _ _ _ 9 Q Q NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1405 # text = L'interface et les interactions entre la molécule A et le peptide 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 interface interface NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 interactions interaction NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 6 entre entre PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 molécule molécule NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 A A NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 peptide peptide NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1406 # text = Q sont très similaires à celles qui existent entre la molécule B et le peptide P. L'interface de 498 Å 2 , implique les mêmes résidus que pour la molécule B plus P63 , E64 , M100 mais n'implique pas les résidus F47 et V116 . 1 Q Q NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 très très ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 similaires similaire ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 celles celui PRQ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 qui qui PRQ _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 existent exister VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 entre entre PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 molécule molécule NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 B B NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 14 le le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 peptide peptide NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 16 P. P. NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 L' L' DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 interface interface NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 498 498 NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 Å Å NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 2 2 NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 implique impliquer VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 25 les le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 26 mêmes même ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 27 résidus résidu NOM _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 28 que que CSU _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 pour pour PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 la le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 molécule molécule NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 B B NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 plus plus COO _ _ 34 mark _ _ _ _ _ 34 P63 P63 NOM _ _ 32 para _ _ _ _ _ 35 , , PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 36 E64 E64 NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 37 , , PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 38 M100 M100 NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 39 mais mais COO _ _ 41 mark _ _ _ _ _ 40 n' ne ADV _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 41 implique impliquer VRB _ _ 24 para _ _ _ _ _ 42 pas pas ADV _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 les le DET _ _ 44 spe _ _ _ _ _ 44 résidus résidu NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 45 F47 F47 NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 et et COO _ _ 47 mark _ _ _ _ _ 47 V116 V116 NOM _ _ 45 para _ _ _ _ _ 48 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1407 # text = Jusqu'au résidu G9 , le peptide est parfaitement superposable au peptide P et présente les mêmes interactions que lui . 1 Jusqu'au jusqu'à PRE _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 résidu résidu NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 G9 G9 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 peptide peptide NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 7 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 parfaitement parfaitement ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 superposable superposable ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 au à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 peptide peptide NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 P P NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 présente présenter VRB _ _ 7 para _ _ _ _ _ 15 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 16 mêmes même ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 interactions interaction NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 que que CSU _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 lui lui PRQ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1408 # text = Cependant le peptide Q compte dans sa partie N terminale un résidu visible de plus , l'arginine R3 , qui établi des liaisons hydrogène avec les résidus N36 et Q32 d'une molécule symétrique . 1 Cependant cependant ADV _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 le le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 peptide peptide NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 4 Q Q NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 compte compter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 dans dans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 sa son DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 partie partie NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 N N NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 terminale terminal ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 un un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 résidu résidu NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 13 visible visible ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 plus plus ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 17 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 18 arginine arminien ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 R3 R3 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 qui quiComp? PRQ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 établi établir VPP _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 des de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 liaisons liaison NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 hydrogène hydrogène NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 avec avec PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 27 les le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 résidus résidu NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 N36 N36 NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 et et COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 31 Q32 Q32 NOM _ _ 29 para _ _ _ _ _ 32 d' de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 33 une un DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 molécule molécule NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 symétrique symétrique ADJ _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1409 # text = Le peptide Q présente également une conformation différente à son extrémité C terminale . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 peptide peptide NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 Q Q NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 présente présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 également également ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 une un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 conformation conformation NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 différente différent ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 10 son son DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 extrémité extrémité NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 C C NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 terminale terminal ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1410 # text = En effet le site hydrophobe dans lequel se loge la leucine L10 du peptide P se trouve ici occupé par la valine V58 d'une molécule symétrique . 1 En en effet PRE _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 2 effet en effet NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 le le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 site site NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 5 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 dans dans PRE _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 7 lequel lequel PRQ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 se se CLI _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 loge loger VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 leucine leucine NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 12 L10 L10 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 du de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 peptide peptide NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 P P NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 se se CLI _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 trouve trouver VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 ici ici ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 occupé occuper VPP _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 par par PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 la le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 valine valine NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 V58 V58 NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 d' de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 une un DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 molécule molécule NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 symétrique symétrique ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1411 # text = Un changement de conformation de la glycine G9 permet à la chaîne Q d'obliquer à angle droit par rapport au chemin suivi par la chaîne P. La leucine L10 vient dans ce cas se stabiliser au contact d'une molécule symétrique . 1 Un un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 changement changement NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 conformation conformation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 glycine glycine NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 G9 G9 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 permet permettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 à à PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 chaîne chaîne NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 Q Q NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 d' de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 15 obliquer obliquer VNF _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 à à PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 angle angle NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 droit droit ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 par par rapport à PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 20 rapport par rapport à DET _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 au par rapport à PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 chemin chemin NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 23 suivi suivre VPP _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 par par PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 la le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 chaîne chaîne NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 P. P. NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 La La DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 leucine leucine NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 30 L10 L10 NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 vient venir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 32 dans dans ce cas ADV _ _ 36 periph _ _ _ _ _ 33 ce dans ce cas DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 cas dans ce cas NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 se se CLI _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 36 stabiliser stabiliser VNF _ _ 0 root _ _ _ _ _ 37 au à PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 contact contact NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 d' de PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 une un DET _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 41 molécule molécule NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 symétrique symétrique ADJ _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 . . PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1412 # text = Cette dernière conformation ne reflète probablement pas une situation physiologique . 1 Cette ce DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 dernière dernier ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 conformation conformation NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 4 ne ne ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 reflète refléter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 probablement probablement ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 pas pas ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 une un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 situation situation NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 physiologique physiologique ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1413 # text = Elle ne sera donc pas discutée en détail . 1 Elle elle CLS _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 2 ne ne ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 3 sera être VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 4 donc donc ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 pas pas ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 discutée discuter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 en en PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 détail détail NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1414 # text = Avec un gain d'énergie libre de solvatation ( ? G = - 7 , 5 kcal / mol ) associé à la formation du complexe , le serveur PISA conclut que le complexe AQ est stable en solution . 1 Avec avec PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 un un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 gain gain NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 énergie énergie NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 libre libre ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 solvatation solvatation NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 11 G G NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 - - 7 , 5 PUNC _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 14 7 7 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 15 , - 7 , 5 PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 16 5 5 NUM _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 kcal kcal ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 / ou PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 mol mou ADJ _ _ 17 para _ _ _ _ _ 20 ) ) PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 21 associé associer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 à à PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 formation formation NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 du de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 complexe complexe NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 28 le le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 serveur serveur NOM _ _ 31 subj _ _ _ _ _ 30 PISA PISA NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 conclut conclure VRB _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 32 que que CSU _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 le le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 complexe complexe NOM _ _ 36 subj _ _ _ _ _ 35 AQ AQ NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 est être VRB _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 37 stable stable ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 en en PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 solution solution NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 . . PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1415 # text = B . Structure de BD2 en complexe avec plusieurs peptides acétylés . 1 B b NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Structure Structure NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD2 BD2 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 en le CLI _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 complexe complexer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 avec avec PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 plusieurs plusieurs DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 peptides peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 acétylés acétyle NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1416 # text = Les premières structures de BD2 et du complexe BD 2 / H 4 -K 12 ac ont été obtenues par M. Soler dans le cadre d'un projet de cristallisation à haut débit . 1 Les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 premières premier ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 structures structure NOM _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD2 BD2 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 du de PRE _ _ 4 para _ _ _ _ _ 8 complexe complexe NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 BD BD NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 2 2 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 / sur PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 12 H H NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 4 4 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 -K -K VPR _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 12 12 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 ac ace NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 ont avoir VRB _ _ 18 aux _ _ _ _ _ 18 été être VPP _ _ 19 aux _ _ _ _ _ 19 obtenues obtenir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 par par PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 M. monsieur NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 Soler Soler NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 dans dans PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 24 le le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 cadre cadre NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 d' de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 un un DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 projet projet NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 cristallisation cristallisation NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 à à PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 haut haut ADJ _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 33 débit débit NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 . . PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1417 # text = Le clone A12 issu de ce projet , codant pour les résidus 275 à 382 , a ensuite été utilisé pour améliorer les cristaux du domaine en complexe avec le peptide H 4 -K 12 ac et pour les co-cristallisations de BD2 avec les peptides H 4 -K 5 ac , H 4 -K 8 ac , H 4 -K 16 ac , H3 tétra-acétylé tétra-acétylé et H 3 -K 18 ac [ Tableau 15 ] . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 clone clone NOM _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 3 A12 A12 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 issu issu ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 ce ce DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 projet projet NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 9 codant coder VPR _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 pour pour PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 résidus résidu NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 275 275 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 382 382 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 17 a avoir VRB _ _ 19 aux _ _ _ _ _ 18 ensuite ensuite ADV _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 19 été être VPP _ _ 20 aux _ _ _ _ _ 20 utilisé utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 pour pour PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 améliorer améliorer VNF _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 les le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 cristaux cristal NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 du de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 domaine domaine NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 en en PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 28 complexe complexe NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 avec avec PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 30 le le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 peptide peptide NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 H H NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 4 4 NUM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 -K -K VPR _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 35 12 12 NUM _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 ac ace NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 et et COO _ _ 38 mark _ _ _ _ _ 38 pour pour PRE _ _ 29 para _ _ _ _ _ 39 les le DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 co-cristallisations co- NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 de de PRE _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 BD2 BD2 NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 avec avec PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 44 les le DET _ _ 45 spe _ _ _ _ _ 45 peptides peptide NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 46 H H NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 4 4 NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 48 -K -K ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 49 5 5 NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 50 ac ac ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 51 , , PUNC _ _ 75 punc _ _ _ _ _ 52 H H NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 53 4 4 NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 54 -K -K ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 55 8 8 NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 56 ac ac NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 57 , , PUNC _ _ 75 punc _ _ _ _ _ 58 H H NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 59 4 4 NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 60 -K -K ADV _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 61 16 16 NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 62 ac ace NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 63 , , PUNC _ _ 75 punc _ _ _ _ _ 64 H3 H3 NOM _ _ 65 dep _ _ _ _ _ 65 tétra-acétylé tétra-acétylé NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 66 tétra-acétylé acétyle NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 67 et et COO _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 68 H H NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 69 3 3 NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 70 -K -K ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 71 18 18 NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 72 ac ac ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 73 [ ( PUNC _ _ 75 punc _ _ _ _ _ 74 Tableau Tableau NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 75 15 15 NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 76 ] ) PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 77 . . PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1418 # text = Tableau 15 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 15 15 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1419 # text = Séquence des peptides utilisés pour les co-cristallisations 1 Séquence séquence NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 peptides peptide NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 utilisés utiliser VPP _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 pour pour PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 co-cristallisations co- NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1420 # text = Seules les structures de BD2 en complexe avec les peptides H 4 -K 12 ac et H 3 -K 18 ac s'avèrent contenir le peptide et présenter pour lui une densité susceptible d'être interprétée . 1 Seules seul ADJ _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 structures structure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD2 BD2 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 en en PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 complexe complexe NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 avec avec PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 peptides peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 H H NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 4 4 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 -K -K NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 12 12 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 ac ac ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 H H NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 18 3 3 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 -K -K VPR _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 18 18 NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 ac ace NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 s' s' CLI _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 avèrent avérer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 contenir contenir VNF _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 le le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 peptide peptide NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 28 présenter présenter VNF _ _ 24 para _ _ _ _ _ 29 pour pour PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 lui lui PRQ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 une un DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 densité densité NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 33 susceptible susceptible ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 d' de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 être être VNF _ _ 36 aux _ _ _ _ _ 36 interprétée interpréter VPP _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1421 # text = Nous présenterons dans ce chapitre la structure de BD2 en complexe avec 1 Nous nous CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 présenterons présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 dans dans PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ce ce DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 chapitre chapitre NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 structure structure NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 BD2 BD2 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 en en PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 11 complexe complexe NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 avec avec ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1422 # text = H 3 -K 18 ac car c'est celle qui correspond le plus probablement au complexe physiologique . 1 H heure NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 3 3 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 18 18 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 ac ace NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 car car COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 7 c' ce CLS _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 est être VRB _ _ 3 para _ _ _ _ _ 9 celle celui PRQ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 qui qui PRQ _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 11 correspond correspondre VRB _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 le le plus DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 plus le plus ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 probablement probablement ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 au à PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 16 complexe complexe NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 physiologique physiologique ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1423 # text = Nous n'avons en effet pas pu mesurer d'affinité entre BD2 et l'histone H4 en solution . 1 Nous nous CLS _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 2 n' ne ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 3 avons avoir VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 4 en en effet PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 5 effet en effet NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 pas pas ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 pu pouvoir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 mesurer mesurer VNF _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 d' de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 affinité affinité NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 entre entre PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 BD2 BD2 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 14 l' le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 histone histone NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 16 H4 H4 NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 en en PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 18 solution solution NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1424 # text = La structure en complexe avec H 4 -acK 12 sera décrite dans la discussion . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structure structure NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 en en PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 complexe complexe NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 avec avec PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 H H NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 4 4 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 -acK -acK NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 12 12 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 sera être VRB _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 décrite décrire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 dans dans PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 discussion discussion NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1425 # text = I. Cristallisation de BD2 en complexe avec des peptides H3 et H4 1 I. I. NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 2 Cristallisation Cristallisation NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 BD2 BD2 NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 en le CLI _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 complexe complexer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 avec avec PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 des un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 peptides peptide NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 H3 H3 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 H4 H4 NOM _ _ 10 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1426 # text = Le domaine BD2 seul ou en complexe avec un peptide acétylé cristallise dans de nombreuses conditions différentes . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 domaine domaine NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 3 BD2 BD2 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 seul seul ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 ou ou COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 6 en en PRE _ _ 4 para _ _ _ _ _ 7 complexe complexe NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 avec avec PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 un un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 peptide peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 acétylé acétyle NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 cristallise cristalliser VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 dans dans PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 de un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 15 nombreuses nombreux ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 conditions condition NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 différentes différent ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1427 # text = A chaque criblage des six fois 96 conditions de cristallisation , nous avons obtenu des cristaux dans une soixantaine de conditions sur lesquelles une dizaine ont permis d'obtenir des cristaux de taille satisfaisante . 1 A à PRE _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 2 chaque chaque DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 criblage criblage NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 six six NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 fois fois NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 96 96 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 conditions condition NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 cristallisation cristallisation NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 12 nous nous CLS _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 13 avons avoir VRB _ _ 14 aux _ _ _ _ _ 14 obtenu obtenir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 des un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 cristaux cristal NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 dans dans PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 une un DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 soixantaine soixantaine PRQ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 conditions condition NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 sur sur PRE _ _ 27 periph _ _ _ _ _ 23 lesquelles lequel PRQ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 une un DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 dizaine dizaine NOM _ _ 27 subj _ _ _ _ _ 26 ont avoir VRB _ _ 27 aux _ _ _ _ _ 27 permis permettre VPP _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 28 d' de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 obtenir obtenir VNF _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 des un DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 cristaux cristal NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 de de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 taille taille NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 satisfaisante satisfaisant ADJ _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1428 # text = Les cristaux les plus prometteurs ont été cryogénisés dans l'azote liquide après un passage dans une solution de cryoprotection de composition identique à la solution mère additionnée de 15 à 30 % de glycérol . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 cristaux cristal NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 4 plus plus ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 prometteurs prometteur ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 ont avoir VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 été être VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 cryogénisés cryogénisés VNF _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 dans dans PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 azote azote NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 liquide liquide ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 après après PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 14 un un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 passage passage NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 dans dans PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 une un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 solution solution NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 cryoprotection cryoprotection NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 composition composition NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 identique identique ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 à à PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 la le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 solution solution NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 mère mère NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 additionnée additionné ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 de un DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 15 15 NUM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 31 à à PRE _ _ 33 det _ _ _ _ _ 32 30 30 NUM _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 % pourcent NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 34 de de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 glycérol glycérol NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1429 # text = Les cristaux choisis pour collecter ont été obtenus dans des conditions similaires , indiquées dans le tableau ci-dessous [ Tableau 16 ] . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 cristaux cristal NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 choisis choisir VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 collecter collecter VNF _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ont avoir VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 été être VPP _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 obtenus obtenir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 dans dans PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 des un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 conditions condition NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 similaires similaire ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 indiquées indiquer VPP _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 dans dans PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 le le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 tableau tableau NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 ci-dessous ci-dessous ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 [ ( PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 Tableau Tableau NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 16 16 NUM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 ] ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1430 # text = Tableau 16 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 16 16 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1431 # text = Conditions de cristallisation de BD2 et de ses complexes 1 Conditions condition NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 cristallisation cristallisation NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD2 BD2 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 4 para _ _ _ _ _ 8 ses son DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 complexes complexe NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1432 # text = II . Résolution des structures de BD2 en complexe avec des peptides H3 et H4 1 II ii NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Résolution Résolution NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 structures structure NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 BD2 BD2 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 en le CLI _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 complexe complexer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 avec avec PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 des un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 peptides peptide NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 H3 H3 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 H4 H4 NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1433 # text = Pour les structures en complexe avec les peptides H 4 -K 5 ac , H 4 -K 8 ac , H 4 -K 12 ac et H 4 -K 16 ac , l'intégration des données et la mise à l'échelle ont été réalisées avec les programmes Mosflm ( Leslie , 2006 ) et Scala de la suite CCP4 ( Collaborative Computational 1 Pour pour PRE _ _ 45 periph _ _ _ _ _ 2 les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 structures structure NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 en en PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 complexe complexe NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 avec avec PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 peptides peptide NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 H H NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 4 4 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 -K -K VPR _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 5 5 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 ac ace NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 15 H H NOM _ _ 45 subj _ _ _ _ _ 16 4 4 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 -K -K ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 8 8 NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 ac ac NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 21 H H NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 4 4 NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 23 -K -K NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 12 12 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 ac ac ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 27 H H NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 28 4 4 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 29 -K -K ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 30 16 16 NUM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 31 ac ac NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 32 , , PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 33 l' le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 intégration intégration NOM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 35 des de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 données donnée NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 et et COO _ _ 39 mark _ _ _ _ _ 38 la le DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 mise mise NOM _ _ 34 para _ _ _ _ _ 40 à à PRE _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 l' le DET _ _ 42 spe _ _ _ _ _ 42 échelle échelle NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 43 ont avoir VRB _ _ 44 aux _ _ _ _ _ 44 été être VPP _ _ 45 aux _ _ _ _ _ 45 réalisées réaliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 46 avec avec PRE _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 les le DET _ _ 48 spe _ _ _ _ _ 48 programmes programme NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 49 Mosflm Mosflm NOM _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 ( ( PUNC _ _ 51 punc _ _ _ _ _ 51 Leslie Leslie NOM _ _ 48 parenth _ _ _ _ _ 52 , , PUNC _ _ 56 punc _ _ _ _ _ 53 2006 2006 NUM _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 54 ) ) PUNC _ _ 51 punc _ _ _ _ _ 55 et et COO _ _ 56 mark _ _ _ _ _ 56 Scala Scala NOM _ _ 48 para _ _ _ _ _ 57 de de PRE _ _ 56 dep _ _ _ _ _ 58 la le DET _ _ 59 spe _ _ _ _ _ 59 suite suite NOM _ _ 57 dep _ _ _ _ _ 60 CCP4 CCP4 NOM _ _ 59 dep _ _ _ _ _ 61 ( ( PUNC _ _ 60 punc _ _ _ _ _ 62 Collaborative Collaborative ADJ _ _ 63 dep _ _ _ _ _ 63 Computational Computational NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1434 # text = Project , 1994 ) . 1 Project Project NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 1994 1994 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ) ) PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1435 # text = Pour les structures en complexe avec H 3 -K 18 ac et H3 tétra-acétylé nous avons utilisé pour le traitement des données les programmes XDS et XSCALE ( Kabsch W. , 1993 ) . 1 Pour pour PRE _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 2 les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 structures structure NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 en en PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 complexe complexe NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 avec avec PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 H H NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 3 3 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 -K -K VPR _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 18 18 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 ac ace NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 H3 H3 NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 14 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 15 nous le CLI _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 avons avoir VRB _ _ 17 aux _ _ _ _ _ 17 utilisé utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 pour pour PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 le le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 traitement traitement NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 des de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 données donnée NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 les le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 programmes programme NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 25 XDS XDS NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 27 XSCALE XSCALE NOM _ _ 25 para _ _ _ _ _ 28 ( ( PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 29 Kabsch Kabsch NOM _ _ 24 parenth _ _ _ _ _ 30 W. W. NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 , , PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 32 1993 1993 NUM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 33 ) ) PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 34 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1436 # text = Les groupes d'espace et les paramètres de maille des cristaux sont résumés dans le tableau ci-dessous [ Tableau 17 ] . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 groupes groupe NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 espace espace NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 paramètres paramètre NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 maille maille NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 cristaux cristal NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 sont être VRB _ _ 13 aux _ _ _ _ _ 13 résumés résumer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 dans dans PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 le le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 tableau tableau NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 ci-dessous ci-dessous ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 [ ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 Tableau Tableau NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 17 17 NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 ] ) PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1437 # text = Les structures ont été déterminées par la technique du remplacement moléculaire avec le programme MolRep en utilisant comme modèle de départ la structure de BD2 sans ligand . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structures structure NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 ont avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 été être VPP _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 déterminées déterminer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 technique technique NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 du de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 remplacement remplacement NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 avec avec PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 le le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 programme programme NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 MolRep MolRep NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 en en PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 17 utilisant utiliser VPR _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 comme comme PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 modèle modèle NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 départ départ NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 la le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 structure structure NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 BD2 BD2 NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 sans sans PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 27 ligand ligand NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1438 # text = A chaque fois , deux molécules par unité asymétrique ont été trouvées . 1 A à PRE _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 chaque chaque DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 fois fois NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 deux deux NUM _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 molécules molécule NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 7 par par PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 unité unité NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 asymétrique asymétrique ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 ont avoir VRB _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 été être VPP _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 12 trouvées trouver VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1439 # text = A l'issue du remplacement moléculaire les modèles ont été affinés avec MolRep en considérant chaque monomère comme un corps rigide . 1 A à PRE _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 l' le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 issue issue NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 remplacement remplacement NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 modèles modèle NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 9 ont avoir VRB _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 été être VPP _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 affinés affiner VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 avec avec PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 MolRep MolRep NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 en en PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 considérant considérer VPR _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 chaque chaque DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 monomère monomère NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 comme comme PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 un un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 corps corps NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 rigide rigide ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1440 # text = Les cartes de densité atomique calculées à ce stade indiquent clairement la présence d'un peptide dans le site de fixation de BD2 dans le cas des cristallisations avec les peptides H 4 -K 12 ac , H3 tétra-acétylé et H 3 -K 18 ac . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 cartes carte NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 densité densité NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 atomique atomique ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 calculées calculer VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 à à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 ce ce DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 stade stade NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 indiquent indiquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 clairement clairement ADV _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 présence présence NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 d' de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 un un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 peptide peptide NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 dans dans PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 18 le le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 site site NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 fixation fixation NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 BD2 BD2 NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 dans dans PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 25 le le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 cas cas NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 des de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 cristallisations cristallisation NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 avec avec PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 les le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 peptides peptide NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 H H NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 4 4 NUM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 -K -K VPR _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 35 12 12 NUM _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 ac ace NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 , , PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 38 H3 H3 NOM _ _ 43 subj _ _ _ _ _ 39 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 et et COO _ _ 41 mark _ _ _ _ _ 41 H H NOM _ _ 39 para _ _ _ _ _ 42 3 3 NUM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 -K -K VRB _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 44 18 18 NUM _ _ 45 spe _ _ _ _ _ 45 ac ace NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 46 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1441 # text = Dans le cas du complexe avec le peptide H3 tétra-acétylé , la résolution ne permet pas d'assigner la séquence du peptide qui occupe le site actif . 1 Dans dans PRE _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 2 le le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 cas cas NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 complexe complexe NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 avec avec PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 peptide peptide NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 H3 H3 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 résolution résolution NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 14 ne ne ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 permet permettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 pas pas ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 d' de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 assigner assigner VNF _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 séquence séquence NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 du de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 peptide peptide NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 qui qui PRQ _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 24 occupe occuper VRB _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 le le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 site site NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 actif actif ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1442 # text = En effet seuls 5 résidus sont visibles sur les 1 En en effet PRE _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 effet en effet NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 seuls seul ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 5 5 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 résidus résidu NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 visibles visible ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 sur sur ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 les le _ _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1443 # text = 23 que compte le peptide . 1 23 23 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 que que PRQ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 compte compter VRB _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 le le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 peptide peptide NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1444 # text = Mais si nous superposons cette densité à celle obtenue pour le complexe avec le peptide H 3 -K 18 ac il est facile de constater que celles -ci correspondent très probablement aux mêmes résidus . 1 Mais mais ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 si si CSU _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 nous nous CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 superposons superposer VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 cette ce DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 densité densité NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 à à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 celle celui PRQ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 obtenue obtenir VPP _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 pour pour PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 complexe complexe NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 avec avec PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 14 le le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 peptide peptide NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 H H NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 3 3 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 -K -K VPR _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 18 18 NUM _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 ac ace NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 il il CLS _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 22 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 facile facile ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 constater constater VNF _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 que que CSU _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 celles celui PRQ _ _ 29 subj _ _ _ _ _ 28 -ci -ci ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 correspondent correspondre VRB _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 30 très très ADV _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 31 probablement probablement ADV _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 aux à PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 33 mêmes même ADJ _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 34 résidus résidu NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1445 # text = Cela confirme la préférence de BD2 pour une acétylation de l'histone H3 en position K18 . 1 Cela cela PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 confirme confirmer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 préférence préférence NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 BD2 BD2 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 une un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 acétylation acétylation NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 l' le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 histone histone NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 H3 H3 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 en en PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 position position NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 K18 K18 NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1446 # text = Dans le cas des co-cristallisations avec les peptides H 4 -K 5 ac , H 4 -K 8 ac et H 4 -K 16 ac , nous observons dans le site de fixation une densité atomique positive non continue mais celle -ci est réduite à ce qui correspondrait à la présence de la chaîne latérale de la lysine acétylée . 1 Dans dans PRE _ _ 28 periph _ _ _ _ _ 2 le le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 cas cas NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 co-cristallisations co- NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 avec avec PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 peptides peptide NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 H H NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 4 4 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 -K -K VPR _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 5 5 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 ac ace NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 15 H H NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 4 4 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 -K -K VPR _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 8 8 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 ac ace NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 H H NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 22 4 4 NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 -K -K VPR _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 16 16 NUM _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 ac ace NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 27 nous lui PRQ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 28 observons observer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 29 dans dans PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 le le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 site site NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 de de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 fixation fixation NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 une un DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 densité densité NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 36 atomique atomique ADJ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 positive positif ADJ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 non non ADV _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 39 continue continu ADJ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 40 mais mais COO _ _ 44 mark _ _ _ _ _ 41 celle celui PRQ _ _ 44 subj _ _ _ _ _ 42 -ci -ci ADJ _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 est être VRB _ _ 44 aux _ _ _ _ _ 44 réduite réduire VPP _ _ 28 para _ _ _ _ _ 45 à à PRE _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 ce ce PRQ _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 qui qui PRQ _ _ 48 subj _ _ _ _ _ 48 correspondrait correspondre VRB _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 49 à à PRE _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 la le DET _ _ 51 spe _ _ _ _ _ 51 présence présence NOM _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 52 de de PRE _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 53 la le DET _ _ 54 spe _ _ _ _ _ 54 chaîne chaîne NOM _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 55 latérale latéral ADJ _ _ 54 dep _ _ _ _ _ 56 de de PRE _ _ 54 dep _ _ _ _ _ 57 la le DET _ _ 58 spe _ _ _ _ _ 58 lysine lysine NOM _ _ 56 dep _ _ _ _ _ 59 acétylée acétyle NOM _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 60 . . PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1447 # text = Il pourrait aussi bien s'agir de molécules d'eau venant remplir la cavité hydrophobe du site de fixation . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 aussi aussi bien ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 bien aussi bien ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 s' s' CLI _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 agir agir VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 molécules molécule NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 d' de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 eau eau NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 venant venir VPR _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 remplir remplir VNF _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 cavité cavité NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 du de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 site site NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 fixation fixation NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1448 # text = Le groupe d'espace de ces structures , identique à celui de la structure de BD2 sans ligand , et différent de celui des structures de BD2 contenant un peptide , semble indiquer que le peptide est absent . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 groupe groupe NOM _ _ 32 subj _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 espace espace NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ces ce DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 structures structure NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 9 identique identique ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 10 à à PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 celui celui PRQ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 structure structure NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 BD2 BD2 NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 sans sans PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 ligand ligand NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 différent différent NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 celui celui PRQ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 des de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 structures structure NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 BD2 BD2 NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 contenant contenir VPR _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 29 un un DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 peptide peptide NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 32 semble sembler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 33 indiquer indiquer VNF _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 que que CSU _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 le le DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 peptide peptide NOM _ _ 37 subj _ _ _ _ _ 37 est être VRB _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 38 absent absent ADJ _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 . . PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1449 # text = Tableau 17 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 17 17 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1450 # text = Principales caractéristiques des cristaux de BD2 . 1 Principales principal ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 caractéristiques caractéristique NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 cristaux cristal NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 BD2 BD2 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1451 # text = L'affinement de la géométrie et des facteurs B des modèles a été mené en utilisant le programme CNS ( Brünger et al. , 1998 ) . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 affinement affinement NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 géométrie géométrie NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 des de PRE _ _ 3 para _ _ _ _ _ 8 facteurs facteur NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 B B NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 modèles modèle NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 a avoir VRB _ _ 13 aux _ _ _ _ _ 13 été être VPP _ _ 14 aux _ _ _ _ _ 14 mené mener VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 en en PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 utilisant utiliser VPR _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 le le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 programme programme NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 CNS CNS NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 Brünger Brünger NOM _ _ 18 parenth _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 23 al. al. ADV _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 1998 1998 NUM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 26 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1452 # text = Il a été réalisé en alternance avec les étapes de modifications manuelles en utilisant le programme COOT ( Emsley et Cowtan , 2004 ) , et complété par des étapes de dynamique moléculaire ou recuit simulé en utilisant le programme CNS . 1 Il il CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 a avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 été être VPP _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 réalisé réaliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 en en PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 alternance alternance NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 avec avec PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 étapes étape NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 modifications modification NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 manuelles manuel ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 en en PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 14 utilisant utiliser VPR _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 le le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 programme programme NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 COOT COOT NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ( ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 Emsley Emsley NOM _ _ 16 parenth _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 Cowtan Cowtan NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 23 2004 2004 NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 ) ) PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 27 complété compléter VPP _ _ 13 para _ _ _ _ _ 28 par par PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 des un DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 étapes étape NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 de de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 dynamique dynamique NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 moléculaire moléculaire ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 ou ou COO _ _ 35 mark _ _ _ _ _ 35 recuit recuit NOM _ _ 32 para _ _ _ _ _ 36 simulé simuler ADJ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 en en PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 utilisant utiliser VPR _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 le le DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 programme programme NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 CNS CNS NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1453 # text = La géométrie a été vérifiée par le programme Procheck de la suite CCP4 . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 géométrie géométrie NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 a avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 été être VPP _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 vérifiée vérifier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 programme programme NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 Procheck Procheck NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 suite suite NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 CCP4 CCP4 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1454 # text = Les statistiques de la collecte des données et de l'affinement des modèles de BD2 et de ses complexes avec les peptides H 4 -K 12 ac et H 3 -K 18 ac sont présentées dans le tableau ci-dessous [ Tableau 18 ] . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 statistiques statistique NOM _ _ 35 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 collecte collecte NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 données donnée NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 6 para _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 affinement affinement NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 des de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 modèles modèle NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 BD2 BD2 NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 14 para _ _ _ _ _ 18 ses son DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 complexes complexe NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 avec avec PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 les le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 peptides peptide NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 H H NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 4 4 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 -K -K VPR _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 26 12 12 NUM _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 ac ace NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 et et COO _ _ 29 mark _ _ _ _ _ 29 H H NOM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 30 3 3 NUM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 -K -K VPR _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 18 18 NUM _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 ac ace NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 sont être VRB _ _ 35 aux _ _ _ _ _ 35 présentées présenter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 36 dans dans PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 le le DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 tableau tableau NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 ci-dessous ci-dessous ADV _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 [ ( PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 41 Tableau Tableau NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 42 18 18 NUM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 ] ) PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 44 . . PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1455 # text = Tableau 18 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 18 18 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1456 # text = Statistiques des données cristallographiques . 1 Statistiques statistique NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 données donnée NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 cristallographiques cristallographique ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1457 # text = III . Structure de BD2 en complexe avec le peptide H 3 -K 18 ac 1 III iii NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Structure Structure NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD2 BD2 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 en le CLI _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 complexe complexer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 avec avec PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 le le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 peptide peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 H H NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 3 3 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 -K -K VPR _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 18 18 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 ac ace NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1458 # text = a . Structure globale et arrangement dans l'unité asymétrique 1 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Structure Structure NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 globale global ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 6 arrangement arrangement NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 7 dans dans PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 unité unité NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 asymétrique asymétrique ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1459 # text = Les deux molécules de l'unité asymétrique forment un dimère dont les sites de fixation se trouvent à l'opposé l'un de l'autre 1 Les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 deux deux NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 molécules molécule NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 unité unité NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 asymétrique asymétrique ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 forment former VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 un un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 dimère dimère NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 dont dont PRQ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 12 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 sites site NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 fixation fixation NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 se se CLI _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 trouvent trouver VRB _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 18 à à PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 l' le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 opposé opposé NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 l' le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 un un PRQ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 l' l'autre DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 autre l'autre PRQ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1460 # text = [ Figure   39 ] . 1 [ ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Figure Figure VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3     39 DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 39 39 NUM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 5 ] ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1461 # text = Chaque monomère lie un peptide H 3 -K 18 ac , représentés par les chaînes X et Y. Les deux molécules du dimère montrent un repliement parfaitement similaire , y compris dans les régions flexibles des boucles ZA et BC . 1 Chaque chaque DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 monomère monomère NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 lie lier VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 peptide peptide NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 H H NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 3 3 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 -K -K VPR _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 18 18 NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 ac ace NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 12 représentés représenter ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 13 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 les le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 chaînes chaîne NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 X X ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 18 Y. Y. NOM _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 19 Les Les DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 20 deux deux NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 molécules molécule NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 du de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 dimère dimère NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 montrent montrer VRB _ _ 3 para _ _ _ _ _ 25 un un DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 repliement repliement NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 parfaitement parfaitement ADV _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 28 similaire similaire ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 30 y y compris PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 31 compris y compris PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 32 dans dans PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 les le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 régions région NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 flexibles flexible ADJ _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 des de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 boucles boucle NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 ZA ZA NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 et et COO _ _ 40 mark _ _ _ _ _ 40 BC BC NOM _ _ 38 para _ _ _ _ _ 41 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1462 # text = Les monomères sont superposables avec un r . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 monomères monomère NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 superposables superposable ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 avec avec PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 un un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 r gramme NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1463 # text = m . s . 1 m Monsieur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 s ssh NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1464 # text = d ( déviation moyenne ) sur les 112 C ? 1 d de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 déviation déviation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 moyenne moyen ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 sur sur PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 8 112 112 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 C C NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 ? ? PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1465 # text = des résidus 265 à 376 égal à 0 , 35 Å et un r . 1 des un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résidus résidu NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 265 265 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 à à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 376 376 NUM _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 égal égal NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 à à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 0 0 NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 9 , 0 , 35 PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 35 35 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 Å Å NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 13 un un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 r gramme NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1466 # text = m . s . 1 m Monsieur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 s ssh NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1467 # text = d sur les 6 C ? 1 d de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 sur sur PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 4 6 6 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 C C NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1468 # text = des résidus 16 à 21 des peptides X et Y égal à 0 , 30 Å. Le peptide Y présente à ses extrémités N et C terminales respectivement un et deux résidus supplémentaires définis par rapport au peptide X [ Tableau   19 ] . 1 des de PRE _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 2 résidus résidu NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 16 16 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 à à PRE _ _ 1 para _ _ _ _ _ 5 21 21 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 peptides peptide NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 X X ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 Y Y NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 11 égal égal ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 à à PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 0 0 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 14 , 0 , 30 PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 30 30 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 Å. Å. VPR _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 Le Le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 peptide peptide NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 Y Y NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 présente présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 à à PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 ses son DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 extrémités extrémité NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 N N NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 et et COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 26 C C NOM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 27 terminales terminal ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 respectivement respectivement ADV _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 29 un un PRQ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 30 et et COO _ _ 32 mark _ _ _ _ _ 31 deux deux NUM _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 résidus résidu NOM _ _ 29 para _ _ _ _ _ 33 supplémentaires supplémentaire ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 définis définir VPP _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 par par rapport à PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 rapport par rapport à DET _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 au par rapport à PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 peptide peptide NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 39 X X ADJ _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 [ ( PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 41 Tableau Tableau NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 42     19 DET _ _ 43 spe _ _ _ _ _ 43 19 19 NUM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 44 ] ) PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 45 . . PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1469 # text = Tableau 19 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 19 19 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1470 # text = Résidus définis dans la structure du complexe 1 Résidus résidu NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 définis définir VPP _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 dans dans PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 structure structure NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 du de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 complexe complexe NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1471 # text = BD2 : 1 BD2 BD2 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1472 # text = H 3 -acK 18 1 H heure NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 3 3 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -acK -acK VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 18 18 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1473 # text = L'architecture de BD2 est celle d'un bromodomaine classique constitué des 4 hélices alpha principales [ ? 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 architecture architecture NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 BD2 BD2 NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 celle celui PRQ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 d' de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 un un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 bromodomaine oromo NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 classique classique ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 constitué constitué ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 des de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 13 4 4 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 hélices hélice NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 alpha alpha ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 principales principal ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 [ ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 18 ? ? PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1474 # text = Z ( résidus 264 - 289 ) , ? 1 Z Z NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 résidus résidu NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 264 264 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 - 264 - 289 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 289 289 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 9 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1475 # text = A ( res 318 - 326 ) , ? 1 A A NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 3 res res ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 318 318 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 5 - 318 - 326 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 326 326 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 9 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1476 # text = B ( res . 333 - 343 ) , ? 1 B boulevard NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 3 res ré NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 333 333 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 - 333 - 343 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 343 343 NUM _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 ? ? PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1477 # text = C ( res . 352 - 368 ) ] qui forment un bras rigide et de deux boucles ZA et BC qui forment le site de fixation du peptide . 1 C cf PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 3 res ré NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 352 352 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 - 352 - 368 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 368 368 NUM _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 9 ] ] PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 10 qui quiNom? PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 forment former VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 un un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 bras bras NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 rigide rigide ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 14 para _ _ _ _ _ 17 deux deux NUM _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 boucles boucle NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 ZA ZA NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 BC BC NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 22 qui qui PRQ _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 23 forment former VRB _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 24 le le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 site site NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 fixation fixation NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 du de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 peptide peptide NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1478 # text = La longue boucle ZA ( résidus 1 La le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 longue long ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 boucle boucle NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 ZA ZA NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 résidus résidu NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1479 # text = 289 - 318 ) contient elle-même 3 hélices secondaires  :  ? 1 289 289 NUM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 - 289 - 318 PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 318 318 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 contient contenir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 elle-même lui-même PRQ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 3 3 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 hélices hélice NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 secondaires secondaire ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10  : : PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 11  ? ? PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1480 # text = Z'( 285 - 296 ) , ? 1 Z' Z' NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 285 285 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 - 285 - 296 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 296 296 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 8 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1481 # text = D ( res . 300 - 304 ) et ? 1 D de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 3 res ré NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 300 300 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 - 300 - 304 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 304 304 NUM _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 ? ? PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1482 # text = A'( 308 - 311 ) . 1 A' A' NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 308 308 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 - 308 - 311 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 311 311 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1483 # text = La boucle 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 boucle boucle NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1484 # text = BC ( résidus 343 - 352 ) est beaucoup plus courte . 1 BC BC NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 résidus résidu NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 343 343 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 - 343 - 352 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 352 352 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 8 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 beaucoup beaucoup ADV _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 plus plus ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 courte court ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1485 # text = Le calcul des potentiels électrostatiques existant à la surface de BD2 en appliquant la fonction de Amber à tous les atomes avec le programme APBS implémenté dans Pymol ( W. L. DeLano. , 2002 ) met en évidence une surface électronégative constituée par les résidus exposés allant de la seconde partie de la boucle ZA jusqu'au milieu de l'hélice ? 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 calcul calcul NOM _ _ 36 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 potentiels potentiel NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 électrostatiques électrostatique ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 existant exister VPR _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 à à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 surface surface NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 BD2 BD2 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 en en PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 13 appliquant appliquer VPR _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 fonction fonction NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 Amber Amber NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 à à PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 tous tout ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 20 les le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 atomes atome NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 avec avec PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 le le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 programme programme NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 APBS APBS NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 implémenté implémenter VPP _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 dans dans PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 Pymol Pymol NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 ( ( PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 30 W. W. NOM _ _ 36 periph _ _ _ _ _ 31 L. L. NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 DeLano. DeLano. NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 34 2002 2002 NUM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 35 ) ) PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 36 met mettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 37 en en PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 évidence évidence NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 une un DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 surface surface NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 41 électronégative électronégatif ADJ _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 constituée constituer VPP _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 43 par par PRE _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 les le DET _ _ 45 spe _ _ _ _ _ 45 résidus résidu NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 46 exposés exposer ADJ _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 allant aller VPR _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 48 de de PRE _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 49 la le DET _ _ 51 spe _ _ _ _ _ 50 seconde second ADJ _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 51 partie partie NOM _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 52 de de PRE _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 53 la le DET _ _ 54 spe _ _ _ _ _ 54 boucle boucle NOM _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 55 ZA ZA NOM _ _ 54 dep _ _ _ _ _ 56 jusqu'au jusqu'à PRE _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 57 milieu milieu NOM _ _ 56 dep _ _ _ _ _ 58 de de PRE _ _ 57 dep _ _ _ _ _ 59 l' le DET _ _ 60 spe _ _ _ _ _ 60 hélice hélice NOM _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 61 ? ? PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1486 # text = B. BD1 présente également une large région chargée positivement mais celle -ci concerne la surface de l'hélice ? 1 B. B. NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 BD1 BD1 NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 présente présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 également également ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 une un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 6 large large ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 région région NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 chargée charger ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 positivement positivement ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 mais mais COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 11 celle celui PRQ _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 12 -ci -ci ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 concerne concerner VRB _ _ 3 para _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 surface surface NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 l' le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 hélice hélice NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 ? ? PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1487 # text = A et celle de la partie centrale des hélices ? 1 A à PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 celle celui PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 partie partie NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 centrale central NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 des de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 hélices hélice NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 ? ? PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1488 # text = B et ? 1 B B NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ? ? PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1489 # text = C . 1 C C NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1490 # text = Cette surface constitue l'interface entre les deux molécules du dimère dans les cristaux de BD1 alors que dans le cas de BD2 l'interface du dimère apparaît peu chargée [ Figure 40 ] . 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 surface surface NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 constitue constituer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 interface interface NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 entre entre PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 8 deux deux NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 molécules molécule NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 du de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 dimère dimère NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 dans dans PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 cristaux cristal NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 BD1 BD1 NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 alors alors que CSU _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 que alors que CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 19 dans dans PRE _ _ 28 periph _ _ _ _ _ 20 le le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 cas cas NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 BD2 BD2 NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 l' le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 interface interface NOM _ _ 28 subj _ _ _ _ _ 26 du de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 dimère dimère NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 apparaît apparaître VRB _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 29 peu peu ADV _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 chargée charger ADJ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 [ ( PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 32 Figure Figure NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 33 40 40 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 ] ) PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1491 # text = La superposition des structures de BD2 , du complexe BD 2 / H 3 -K 18 ac et du complexe BD 2 / H 4 -K 12 ac montre que seule la boucle ZA subit un changement de conformation suite à la fixation du peptide . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 superposition superposition NOM _ _ 29 periph _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 structures structure NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 BD2 BD2 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 8 du de+le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 complexe complexe NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 BD BD NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 2 2 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 / / PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 13 H H NOM _ _ 26 periph _ _ _ _ _ 14 3 3 NUM _ _ 26 periph _ _ _ _ _ 15 -K -K ADJ _ _ 26 periph _ _ _ _ _ 16 18 18 NUM _ _ 26 periph _ _ _ _ _ 17 ac ac ADJ _ _ 26 periph _ _ _ _ _ 18 et et COO _ _ 26 periph _ _ _ _ _ 19 du de+le DET _ _ 26 periph _ _ _ _ _ 20 complexe complexe ADJ _ _ 26 periph _ _ _ _ _ 21 BD BD NOM _ _ 26 periph _ _ _ _ _ 22 2 2 NUM _ _ 26 periph _ _ _ _ _ 23 / / PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 24 H H NOM _ _ 26 periph _ _ _ _ _ 25 4 4 NUM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 26 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 27 12 12 NUM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 ac ace NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 montre montrer VRB _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 30 que que CSU _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 seule seul ADJ _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 32 la le DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 boucle boucle NOM _ _ 35 subj _ _ _ _ _ 34 ZA ZA NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 subit subir VRB _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 36 un un DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 changement changement NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 de de PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 conformation conformation NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 suite suite à PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 41 à suite à PRE _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 la le DET _ _ 43 spe _ _ _ _ _ 43 fixation fixation NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 44 du de PRE _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 peptide peptide NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 . . PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1492 # text = Ces changements de conformation illustrent bien le rôle d'adaptation au substrat joué par la boucle ZA . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 changements changement NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 conformation conformation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 illustrent illustrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 bien bien ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 rôle rôle NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 d' de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 adaptation adaptation NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 au à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 substrat substrat NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 joué jouer VPP _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 par par PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 boucle boucle NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 ZA ZA NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1493 # text = En revanche , aucun changement ne survient dans la boucle BC suite à la fixation des peptides [ Figure 41 ] . 1 En en PRE _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 revanche revanche NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 aucun aucun DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 changement changement NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 6 ne ne ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 survient survenir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 dans dans PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 boucle boucle NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 BC BC NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 suite suite à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 13 à suite à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 fixation fixation NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 des de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 peptides peptide NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 [ ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 Figure Figure NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 41 41 NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 ] ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1494 # text = La flexibilité de la seconde partie de la boucle ZA est encore mise en évidence par l'examen des facteurs B de ses atomes , plus élevés que ceux des atomes de la boucle BC et du corps du bromodomaine [ Figure 42 ] . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 flexibilité flexibilité NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 seconde second ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 partie partie NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 boucle boucle NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 ZA ZA NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 encore encore ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 mise mise NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 en en PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 évidence évidence NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 par par PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 l' le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 examen examen NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 des de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 facteurs facteur NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 B B NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 ses son DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 atomes atome NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 26 plus plus ADV _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 27 élevés élevé ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 28 que que CSU _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 ceux celui PRQ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 des de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 atomes atome NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 de de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 la le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 boucle boucle NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 BC BC NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 et et COO _ _ 37 mark _ _ _ _ _ 37 du de PRE _ _ 32 para _ _ _ _ _ 38 corps corps NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 du de PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 bromodomaine bromé NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 [ ( PUNC _ _ 42 punc _ _ _ _ _ 42 Figure Figure NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 43 42 42 NUM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 ] ) PUNC _ _ 40 punc _ _ _ _ _ 45 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1495 # text = b . Interaction entre les deux molécules du dimère 1 b b NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Interaction Interaction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 entre entre PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 6 deux deux NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 molécules molécule NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 dimère dimère NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1496 # text = Avec 933 Å 2 , la surface d'interaction entre les deux molécules du dimère représente environ 13 % de la surface totale de BD2 . 1 Avec avec PRE _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 2 933 933 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 Å Å NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 2 2 NUM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 surface surface NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 8 d' de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 interaction interaction NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 entre entre PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 12 deux deux NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 molécules molécule NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 du de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 dimère dimère NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 représente représenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 environ environ ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 18 13 13 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 % pourcent NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 la le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 surface surface NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 totale total ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 BD2 BD2 NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1497 # text = 20 ] . 1 20 20 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ] ] PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1498 # text = Avec un gain d'énergie libre associé à la formation du dimère de - 5 , 5 kcal / M le service PISA ( Krissinel et Henrick , 2007 ) proposé par l'EBI conclut que le dimère ne doit pas être stable en solution . 1 Avec avec PRE _ _ 35 periph _ _ _ _ _ 2 un un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 gain gain NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 énergie énergie NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 libre libre ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 associé associer VPP _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 formation formation NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 du de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 dimère dimère NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 - - 5 , 5 PUNC _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 15 5 5 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 , - 5 , 5 PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 17 5 5 NUM _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 kcal kcal ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 19 / sur PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 20 M M NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 le le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 service service NOM _ _ 35 subj _ _ _ _ _ 23 PISA PISA NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 ( ( PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 Krissinel Krissinel NOM _ _ 22 parenth _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 27 Henrick Henrick NOM _ _ 25 para _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 29 2007 2007 NUM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 ) ) PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 31 proposé proposer VPP _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 32 par par PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 l' le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 EBI EBI NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 conclut conclure VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 36 que que CSU _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 le le DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 dimère dimère NOM _ _ 40 subj _ _ _ _ _ 39 ne ne ADV _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 40 doit devoir VRB _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 41 pas pas ADV _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 être être VNF _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 43 stable stable ADJ _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 en en PRE _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 45 solution solution NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 . . PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1499 # text = En accord avec cette prédiction , nous n'avons pas observé de dimérisation expérimentalement . 1 En en accord avec PRE _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 accord en accord avec NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 avec en accord avec PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 cette ce DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 prédiction prédiction NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 7 nous nous CLS _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 8 n' ne ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 9 avons avoir VRB _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 10 pas pas ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 observé observer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 dimérisation dimérisation NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 expérimentalement expérimentalement ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1500 # text = Tableau 20 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 20 20 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1501 # text = Liaisons hydrogène et ioniques entre les molécules A et B 1 Liaisons liaison NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 hydrogène hydrogène NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 4 ioniques ionique NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 5 entre entre PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 molécules molécule NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 A A NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 B B NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1502 # text = c . Interaction entre BD2 et le peptide H 3 -K 18 ac 1 c c NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Interaction Interaction NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 4 entre entre PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD2 BD2 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 peptide peptide NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 9 H H NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 3 3 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 18 18 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 ac ace NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1503 # text = Bien que nous observions pour les chaînes latérales des résidus 1 Bien bien ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 que que CSU _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 nous nous CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 observions observer VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 pour pour PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 chaînes chaîne NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 latérales latéral ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 résidus résidu NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1504 # text = R17 et acK 18 des rotamères différents , l'interaction entre la molécule A et le peptide X est tout à fait similaire à celle qui existe entre la molécule B et le peptide Y [ Figure 41 ] . 1 R17 R17 NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 acK acK NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 4 18 18 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 des un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 rotamères rot ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 différents différent ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 interaction interaction NOM _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 11 entre entre PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 molécule molécule NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 A A NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 16 le le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 peptide peptide NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 18 X X ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 tout tout à fait NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 21 à tout à fait PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 fait tout à fait ADV _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 similaire similaire ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 24 à à PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 celle celui PRQ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 qui qui PRQ _ _ 27 subj _ _ _ _ _ 27 existe exister VRB _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 entre entre PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 la le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 molécule molécule NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 B B NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 34 mark _ _ _ _ _ 33 le le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 peptide peptide NOM _ _ 30 para _ _ _ _ _ 35 Y Y NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 [ ( PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 37 Figure Figure NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 38 41 41 NUM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 ] ) PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 40 . . PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1505 # text = Le peptide Y présente à ses extrémités N et C terminales respectivement un et deux résidus définis supplémentaires par rapport au peptide X et des facteurs B plus bas . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 peptide peptide NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 Y Y NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 présente présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ses son DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 extrémités extrémité NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 N N NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 C C NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 11 terminales terminal ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 respectivement respectivement ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 un un PRQ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 15 deux deux NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 résidus résidu NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 17 définis définir ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 supplémentaires supplémentaire ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 par par PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 rapport rapport NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 au à PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 peptide peptide NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 X X ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 25 des de PRE _ _ 21 para _ _ _ _ _ 26 facteurs facteur NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 B B NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 plus plus ADV _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 29 bas bas ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1506 # text = C'est pourquoi nous allons utiliser le modèle du complexe que forment les molécules B et Y pour discuter de l'interaction de BD2 et de H 3 -acK 18 . 1 C' ce CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 pourquoi pourquoi? ADV _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 nous nous CLS _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 5 allons aller VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 utiliser utiliser VNF _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 modèle modèle NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 du de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 complexe complexe NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 que que PRQ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 forment former VRB _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 molécules molécule NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 15 B B NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 Y Y NOM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 18 pour pour PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 19 discuter discuter VNF _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 l' le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 interaction interaction NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 BD2 BD2 NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 et et COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 23 para _ _ _ _ _ 27 H H NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 3 3 NUM _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 -acK -acK NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 18 18 NUM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1507 # text = Avec environ 560 Å 2 , la surface d'interaction de BD2 et du peptide H 3 -K 18 ac représente 43 % de la surface totale accessible au solvant du peptide et 7 % de celle de BD2 . 1 Avec avec PRE _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 2 environ environ ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 3 560 560 NUM _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 Å Å NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 2 2 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 surface surface NOM _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 9 d' de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 interaction interaction NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 BD2 BD2 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 du de PRE _ _ 11 para _ _ _ _ _ 15 peptide peptide NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 H H NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 3 3 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 -K -K VPR _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 18 18 NUM _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 ac ace NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 représente représenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 43 43 NUM _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 % pourcent NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 la le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 surface surface NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 totale total ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 accessible accessible ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 29 au à PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 solvant solvant NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 du de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 peptide peptide NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 et et COO _ _ 35 mark _ _ _ _ _ 34 7 7 NUM _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 % pourcent NOM _ _ 32 para _ _ _ _ _ 36 de de PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 celle celui PRQ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 de de PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 BD2 BD2 NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 . . PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1508 # text = Elle est formée sur BD2 par les résidus W292 , P293 , F294 , V298 , L303 , G304 , L305 , H306 , N307 et Y308 de la boucle ZA , M343 et C347 de l'hélice ? 1 Elle elle CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 formée former VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 sur sur PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD2 BD2 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 par par PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 résidus résidu NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 W292 W292 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 P293 P293 NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 F294 F294 NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 V298 V298 NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 L303 L303 NOM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 G304 G304 NOM _ _ 17 para _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 L305 L305 NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 H306 H306 NOM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 N307 N307 NOM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 27 Y308 Y308 NOM _ _ 25 para _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 29 la le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 boucle boucle NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 ZA ZA NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 , , PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 33 M343 M343 NOM _ _ 31 para _ _ _ _ _ 34 et et COO _ _ 35 mark _ _ _ _ _ 35 C347 C347 NOM _ _ 33 para _ _ _ _ _ 36 de de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 37 l' le DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 hélice hélice NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 ? ? PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1509 # text = A , Y350 , N351 , P352 , D354 , H355 , G356 et V357 de la boucle BC et M360 de la boucle ? 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 Y350 Y350 NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 N351 N351 NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 P352 P352 NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 D354 D354 NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 H355 H355 NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 G356 G356 NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 V357 V357 NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 boucle boucle NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 BC BC NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 M360 M360 NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 boucle boucle NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1510 # text = C et par l'ensemble des résidus du peptide excepté par l'alanine A15 . 1 C C NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 par par PRE _ _ 1 para _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 ensemble ensemble NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 résidus résidu NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 peptide peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 excepté excepter VPP _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 par par PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 l' le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 alanine alanine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 A15 A15 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1511 # text = Le peptide est stabilisé par 4 liaisons hydrogène , un pont salin 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 peptide peptide NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 stabilisé stabiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 par par PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 4 4 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 liaisons liaison NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 hydrogène hydrogène NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 10 un un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 pont pont NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 salin salin NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1512 # text = [ Tableau   21 ] et plusieurs interactions hydrophobes . 1 [ ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 2 Tableau Tableau NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 3     21 DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 21 21 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 ] ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 7 plusieurs plusieurs DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 interactions interaction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 hydrophobes hydrophobe ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1513 # text = Avec un gain d'énergie libre de solvatation égal à - 8 , 3 kcal / M le service 1 Avec avec PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 un un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 gain gain NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 énergie énergie NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 libre libre ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 solvatation solvatation NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 égal égal ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 10 à à PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 - - 8 , 3 PUNC _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 12 8 8 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 13 , - 8 , 3 PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 3 3 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 kcal kcal ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 16 / sur PUNC _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 M M NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 le le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 19 service service NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1514 # text = PISA ( Krissinel and Henrick , 2007 ) prédit que le dimère doit être stable en solution . 1 PISA PISA NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 Krissinel Krissinel NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and krissinel and henrick NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Henrick Henrick NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 7 2007 2007 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 9 prédit prédire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 que que CSU _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 dimère dimère NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 13 doit devoir VRB _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 être être VNF _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 stable stable ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 en en PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 solution solution NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1515 # text = Tableau 21 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 21 21 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1516 # text = Liaisons polaires et ioniques entre le peptide 1 Liaisons liaison NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 polaires polaire ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 4 ioniques ionique ADJ _ _ 2 para _ _ _ _ _ 5 entre entre PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 le le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 peptide peptide NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1517 # text = H 3 -acK 18 et BD2 1 H heure NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 3 3 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -acK -acK VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 18 18 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 6 BD2 BD2 NOM _ _ 4 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1518 # text = La chaîne latérale de la lysine acétylée acK 18 s'engage dans la cavité hydrophobe du site de fixation formée à cet endroit par les résidus P293 , F294 , N296 , P297 , V298 , Y300 L 303 , L305 , Y308 , N351 , V357 . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 chaîne chaîne NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 latérale latéral ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 lysine lysine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 acétylée acétyle NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 acK acK ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 18 18 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 s' s' CLI _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 engage engager VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 dans dans PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 cavité cavité NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 du de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 site site NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 fixation fixation NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 formée former VPP _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 à à PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 cet ce DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 endroit endroit NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 par par PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 25 les le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 résidus résidu NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 P293 P293 NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 29 F294 F294 NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 30 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 31 N296 N296 NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 32 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 33 P297 P297 NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 34 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 35 V298 V298 NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 36 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 37 Y300 Y300 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 38 L L NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 303 303 NUM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 , , PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 41 L305 L305 NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 42 , , PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 43 Y308 Y308 NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 44 , , PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 45 N351 N351 NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 46 , , PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 47 V357 V357 NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 48 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1519 # text = Une liaison hydrogène s'établit entre le groupe carbonyle du groupement acétyle porté par la lysine acK 18 et l'amine de l'asparagine N351 . 1 Une un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 liaison liaison NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 hydrogène hydrogène NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 s' s' CLI _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 établit établir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 entre entre PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 groupe groupe NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 carbonyle carbonyle ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 du de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 groupement groupement NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 acétyle acétyle NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 porté porter VPP _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 par par PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 lysine lysine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 acK acK ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 18 18 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 20 l' le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 amine amine NOM _ _ 16 para _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 l' le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 asparagine asparagine NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 N351 N351 NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1520 # text = La partie profonde de la cavité est occupée par un réseau de liaisons hydrogène très comparable à celui observé dans le site de fixation de BD1 . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 partie partie NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 profonde profond ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 cavité cavité NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 est être VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 occupée occuper VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 par par PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 un un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 réseau réseau NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 liaisons liaison NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 hydrogène hydrogène NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 très très ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 comparable comparable ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 à à PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 celui celui PRQ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 observé observer VPP _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 dans dans PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 le le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 site site NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 fixation fixation NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 BD1 BD1 NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1521 # text = Il implique l'amine et le carbonyle de la chaîne latérale de la lysine acétylée , l'hydroxyle de Y308 , l'amine de N346 et les chaînes principales des résidus P293 , N296 , V298 , M316 et M343 bordant la cavité [ Figure 43 ] . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 implique impliquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 l' le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 amine amine NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 6 le le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 carbonyle carbonyle NOM _ _ 4 para _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 chaîne chaîne NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 latérale latéral ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 lysine lysine NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 acétylée acétyle NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 17 l' le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 hydroxyle hydroxyle NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 Y308 Y308 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 22 l' le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 amine amine NOM _ _ 18 para _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 N346 N346 NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 27 les le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 chaînes chaîne NOM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 29 principales principal ADJ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 des de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 résidus résidu NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 P293 P293 NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 , , PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 34 N296 N296 NOM _ _ 32 para _ _ _ _ _ 35 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 36 V298 V298 NOM _ _ 34 para _ _ _ _ _ 37 , , PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 38 M316 M316 NOM _ _ 36 para _ _ _ _ _ 39 et et COO _ _ 40 mark _ _ _ _ _ 40 M343 M343 NOM _ _ 38 para _ _ _ _ _ 41 bordant border VPR _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 42 la le DET _ _ 43 spe _ _ _ _ _ 43 cavité cavité NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 44 [ ( PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 45 Figure Figure NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 46 43 43 NUM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 ] ) PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 48 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1522 # text = Les résidus P297 , Y309 , I312 , P315 et D317 participent également à la constitution de la partie profonde de la cavité . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résidus résidu NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 3 P297 P297 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Y309 Y309 NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 I312 I312 NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 P315 P315 NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 D317 D317 NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 12 participent participer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 également également ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 constitution constitution NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 partie partie NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 profonde profond ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 la le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 cavité cavité NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1523 # text = A la surface du site de fixation , par son extrémité N terminale , le peptide établit une interaction hydrophobe entre le cycle de la proline P16 et le cycle de l'histidine H306 [ Figure 44 ] . 1 A à PRE _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 2 la le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 surface surface NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 site site NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 fixation fixation NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 9 par par PRE _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 10 son son DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 extrémité extrémité NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 N N NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 terminale terminal ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 15 le le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 peptide peptide NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 17 établit établir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 une un DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 interaction interaction NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 entre entre PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 le le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 cycle cycle NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 la le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 proline pro- NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 P16 P16 NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 et et COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 29 le le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 cycle cycle NOM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 31 de de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 l' le DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 histidine histidine NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 H306 H306 NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 [ ( PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 36 Figure Figure NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 37 44 44 NUM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 ] ) PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 39 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1524 # text = Le carboxyle de la chaîne principale de la proline P16 participe ensuite à un réseau de liaisons hydrogène via une molécule d'eau avec les chaînes latérales de l'asparagine N307 et de la tyrosine Y350 . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 carboxyle carboxyle NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 chaîne chaîne NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 principale principal ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 proline pro- NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 P16 P16 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 participe participer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 ensuite ensuite ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 à à PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 un un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 réseau réseau NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 liaisons liaison NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 hydrogène hydrogène NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 via via PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 20 une un DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 molécule molécule NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 d' de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 eau eau NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 avec avec PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 25 les le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 chaînes chaîne NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 latérales latéral ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 l' le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 asparagine asparagine NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 N307 N307 NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 33 mark _ _ _ _ _ 33 de de PRE _ _ 28 para _ _ _ _ _ 34 la le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 tyrosine tyrosine NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 Y350 Y350 NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1525 # text = Dans la partie centrale du peptide , l'asparagine 1 Dans dans PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 2 la le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 partie partie NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 centrale central NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 du de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 peptide peptide NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 asparagine asparagine NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1526 # text = R17 établit une interaction ionique avec le groupe acide de l'aspartate D354 . 1 R17 R17 NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 établit établir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 une un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 interaction interaction NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 ionique ionique ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 avec avec PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 groupe groupe NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 acide acide ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 l' le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 aspartate aspartame NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 D354 D354 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1527 # text = La chaîne principale de la lysine acétylée acK 18 établit des liaisons polaires par son carboxyle avec l'histidine H355 et par son amine via une molécule d'eau avec l'asparagine N351 . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 chaîne chaîne NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 3 principale principal ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 lysine lysine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 acétylée acétyle NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 acK acK ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 18 18 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 établit établir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 des un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 liaisons liaison NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 polaires polaire ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 par par PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 son son DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 carboxyle carboxyle NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 avec avec PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 histidine histidine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 H355 H355 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 22 par par PRE _ _ 14 para _ _ _ _ _ 23 son son DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 amine amine NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 via via PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 une un DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 molécule molécule NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 d' de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 eau eau NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 avec avec PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 31 l' le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 asparagine asparagine NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 N351 N351 NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1528 # text = La glutamine Q19 n'établit aucun contact avec 1 La le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 glutamine glutamique ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 Q19 Q19 NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 4 n' ne ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 établit établir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 aucun aucun DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 contact contact NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 avec avec ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1529 # text = BD2 . 1 BD2 BD2 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1530 # text = La leucine L20 se place dans un site hydrophobe constitué par les résidus W292 , P293 , E356 , V357 , M360 . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 leucine leucine NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 L20 L20 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 se se CLI _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 place placer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 dans dans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 un un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 site site NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 constitué constituer VPP _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 par par PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 résidus résidu NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 W292 W292 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 16 P293 P293 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 18 E356 E356 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 20 V357 V357 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 M360 M360 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1531 # text = L'alanine A21 et la thréonine T22 se placent en regard de la surface hydrophobe formée par la phénylalanine W292 et la méthionine M360 [ Figure 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 alanine alanine NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 A21 A21 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 thréonine thréonine NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 T22 T22 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 se se CLI _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 placent placer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 en en regard de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 regard en regard de NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 de en regard de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 surface surface NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 formée former VPP _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 par par PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 phénylalanine phénylalanine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 W292 W292 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 22 la le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 méthionine méthionine NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 24 M360 M360 NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 [ ( PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 Figure Figure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1532 # text = 44 ] . 1 44 44 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ] ] PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1533 # text = C . Analyse des structures tridimensionnelles des bromodomaines de Brdt 1 C c NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Analyse Analyse VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 des un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 structures structure NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 tridimensionnelles tridimensionnel ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 des un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 bromodomaines brome NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 Brdt Brdt NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1534 # text = I. Des structures de bromodomaine canoniques 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Des Des PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 structures structure NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 bromodomaine oromo NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 canoniques canonique ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1535 # text = La structure générale de BD1 est tout à fait comparable à celle de BD2 et à celle des bromodomaines pour lesquels nous disposons d'une structure [ Tableau 22 ] . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structure structure NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 générale général ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 BD1 BD1 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 tout tout ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 fait fait NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 comparable comparable ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 à à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 celle celui PRQ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 BD2 BD2 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 16 à à PRE _ _ 8 para _ _ _ _ _ 17 celle celui PRQ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 des un DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 bromodomaines brome NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 20 pour pour PRE _ _ 23 periph _ _ _ _ _ 21 lesquels lequel PRQ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 nous nous CLS _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 23 disposons disposer VRB _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 24 d' de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 une un DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 structure structure NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 [ ( PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 Tableau Tableau NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 22 22 NUM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 ] ) PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1536 # text = Les principales variations sont , comme attendu , localisées dans les boucles ZA et BC [ Figure 45 ] . 1 Les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 principales principal ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 variations variation NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 4 sont être VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 6 comme comme PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 7 attendu attendu NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 localisées localiser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 boucles boucle NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 ZA ZA NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 BC BC NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 16 [ ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 Figure Figure NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 18 45 45 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 ] ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1537 # text = On remarque notamment une insertion importante dans la boucle ZA du second bromodomaine de Rsc 4 . 1 On on CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 remarque remarquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 notamment notamment ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 une un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 insertion insertion NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 importante important ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 dans dans PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 boucle boucle NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 ZA ZA NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 du de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 second second ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 bromodomaine oromo NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 Rsc Rsc NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 4 4 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1538 # text = Tableau 22 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 22 22 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1539 # text = Principales structures de bromodomaines connues utilisées pour la superposition . 1 Principales principal ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 structures structure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 bromodomaines brome NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 connues connaître ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 utilisées utiliser VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 pour pour PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 superposition superposition NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1540 # text = II . Interactions avec le peptide acétylé 1 II ii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Interactions Interactions NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 avec avec PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 peptide peptide NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 acétylé acétyle NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1541 # text = Nous avons observé que les sites de fixation des peptides sont constitués d'une cavité hydrophobe qui constitue le site de fixation de l'acK 5 de H4 et de l'acK 18 de H3 , d'un site hydrophobe secondaire dans lequel se place l'acK 8 de H4 et la leucine L20 de H3 , et de résidus de surface qui entrent en interaction avec les résidus adjacents aux lysines acétylées . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 observé observer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 que que CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 sites site NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 fixation fixation NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 des de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 peptides peptide NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 sont être VRB _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 12 constitués constituer VPP _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 13 d' de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 une un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 cavité cavité NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 qui qui PRQ _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 18 constitue constituer VRB _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 le le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 site site NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 fixation fixation NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 l' le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 acK acK NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 5 5 NUM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 H4 H4 NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 et et COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 30 de de PRE _ _ 23 para _ _ _ _ _ 31 l' le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 acK acK NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 18 18 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 de de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 H3 H3 NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 , , PUNC _ _ 59 punc _ _ _ _ _ 37 d' de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 38 un un DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 site site NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 secondaire secondaire ADJ _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 dans dans PRE _ _ 45 periph _ _ _ _ _ 43 lequel lequel PRQ _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 se se CLI _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 45 place placer VRB _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 46 l' le DET _ _ 47 spe _ _ _ _ _ 47 acK acK NOM _ _ 45 subj _ _ _ _ _ 48 8 8 NUM _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 49 de de PRE _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 H4 H4 NOM _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 51 et et COO _ _ 53 mark _ _ _ _ _ 52 la le DET _ _ 53 spe _ _ _ _ _ 53 leucine leucine NOM _ _ 50 para _ _ _ _ _ 54 L20 L20 NOM _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 55 de de PRE _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 56 H3 H3 NOM _ _ 55 dep _ _ _ _ _ 57 , , PUNC _ _ 59 punc _ _ _ _ _ 58 et et COO _ _ 59 mark _ _ _ _ _ 59 de de PRE _ _ 13 para _ _ _ _ _ 60 résidus résidu NOM _ _ 59 dep _ _ _ _ _ 61 de de PRE _ _ 60 dep _ _ _ _ _ 62 surface surface NOM _ _ 61 dep _ _ _ _ _ 63 qui qui PRQ _ _ 64 subj _ _ _ _ _ 64 entrent entrer VRB _ _ 60 dep _ _ _ _ _ 65 en en PRE _ _ 64 dep _ _ _ _ _ 66 interaction interaction NOM _ _ 65 dep _ _ _ _ _ 67 avec avec PRE _ _ 64 dep _ _ _ _ _ 68 les le DET _ _ 69 spe _ _ _ _ _ 69 résidus résidu NOM _ _ 67 dep _ _ _ _ _ 70 adjacents adjacent ADJ _ _ 69 dep _ _ _ _ _ 71 aux à PRE _ _ 69 dep _ _ _ _ _ 72 lysines lysine NOM _ _ 71 dep _ _ _ _ _ 73 acétylées acétyle NOM _ _ 72 dep _ _ _ _ _ 74 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1542 # text = a . L'interaction avec l'acétyl-lysine qui occupe la cavité principale est très conservée 1 a a NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 L' L' DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 interaction interaction NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 5 avec avec PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 acétyl-lysine acétyle-lysine NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 qui qui PRQ _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 9 occupe occuper VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 cavité cavité NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 principale principal ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 est être VRB _ _ 15 aux _ _ _ _ _ 14 très très ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 conservée conserver VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1543 # text = La cavité du site de fixation est observée chez tous les bromodomaines dont la structure a été résolue . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 cavité cavité NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 site site NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 fixation fixation NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 est être VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 observée observer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 chez chez PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 tous tout ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 bromodomaines brome NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 dont dont PRQ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 structure structure NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 16 a avoir VRB _ _ 17 aux _ _ _ _ _ 17 été être VPP _ _ 18 aux _ _ _ _ _ 18 résolue résoudre VPP _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1544 # text = Les résidus F51 , Y65 , P72 , N103 et N108 de BD1 et leurs équivalents chez les autres bromodomaines sont essentiels à la constitution de la cavité et sont conservés à l'identique . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résidus résidu NOM _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 3 F51 F51 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Y65 Y65 NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 P72 P72 NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 N103 N103 NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 N108 N108 NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 13 BD1 BD1 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 15 leurs son DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 équivalents équivalent NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 17 chez chez PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 les le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 19 autres autre ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 bromodomaines oromo NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 essentiels essentiel ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 à à PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 constitution constitution NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 la le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 cavité cavité NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 et et COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 30 sont être VRB _ _ 31 aux _ _ _ _ _ 31 conservés conserver VPP _ _ 21 para _ _ _ _ _ 32 à à PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 l' le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 identique identique NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1545 # text = Par contre la position de la lysine acétylée est différente dans les complexes PCAF / Tat 1 Par par contre PRE _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 contre par contre ADV _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 position position NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 lysine lysine NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 acétylée acétyle NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 différente différent ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 dans dans PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 complexes complexe NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 PCAF PCAF NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 / ou PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 Tat Tat NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1546 # text = ( Mujtaba et al. , 2002 ) et CBP /   P 53 ( Mujtaba et al. , 2004 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Mujtaba Mujtaba NOM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 4 al. al. ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2002 2002 NUM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 9 CBP CBP NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 / ou PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11     ADV _ _ 9 para _ _ _ _ _ 12 P P NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 53 53 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ( ( PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 Mujtaba Mujtaba NOM _ _ 12 parenth _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 17 al. al. ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 2004 2004 NUM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 20 ) ) PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1547 # text = La liaison hydrogène qui s'établit entre le groupe carbonyle de l'acétyle de la lysine et une asparagine de la cavité ( N108 chez 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 liaison liaison NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 hydrogène hydrogène NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 qui qui PRQ _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 5 s' s' CLI _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 établit établir VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 entre entre PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 groupe groupe NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 carbonyle carbonyle ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 l' le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 acétyle acétyle NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 lysine lysine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 18 une un DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 asparagine asparagine NOM _ _ 16 para _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 la le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 cavité cavité NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 24 N108 N108 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 chez chez PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1548 # text = BD1 ) est conservée chez l'ensemble de ces complexes sauf pour 1 BD1 BD1 NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 conservée conserver VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 chez chez PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 ensemble ensemble NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ces ce DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 complexes complexe NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 sauf sauf PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 12 pour pour PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1549 # text = Rsc 4 -BD 1 / Rsc 4 -K 25 ac ( à cause de la position en CIS de l'acK 25 ) , CBP / P 53 et PCAF / Tat . 1 Rsc Rsc NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -BD -bd NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 1 1 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 / sur PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 6 Rsc Rsc NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 4 4 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 25 25 NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 ac ace NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 à à cause de PRE _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 13 cause à cause de NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 de à cause de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 position position NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 en en PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 CIS CIS NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 l' le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 acK haïk NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 25 25 NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 CBP CBP NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 26 / sur PUNC _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 P P NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 53 53 NUM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 et et COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 30 PCAF PCAF NOM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 31 / ou PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 32 Tat Tat NOM _ _ 30 para _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1550 # text = L'asparagine impliquée dans cette liaison est conservée chez environ 86 % des séquences disponibles dans les banques de données ( y compris chez les bromodomaines de CBP et PCAF ) . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 asparagine asparagine NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 impliquée impliquer VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 dans dans PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 cette ce DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 liaison liaison NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 est être VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 conservée conserver VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 chez chez PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 environ environ ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 11 86 86 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 % pourcent NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 des de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 séquences séquence NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 disponibles disponible ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 dans dans PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 17 les le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 banques banque NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 données donnée NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 ( ( PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 22 y y compris PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 23 compris y compris PRE _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 24 chez chez PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 les le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 bromodomaines brome NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 CBP CBP NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 et et COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 30 PCAF PCAF NOM _ _ 28 para _ _ _ _ _ 31 ) ) PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1551 # text = Récemment les auteurs des complexes CBP / P53 et PCAF / Tat ont publié de nouveaux résultats qui montrent l'existence de cette liaison hydrogène pour des complexes de CBP et PCAF avec des queues des histones H3 et H4 acétylées ( Zeng et al. , 2008 ) . 1 Récemment récemment ADV _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 2 les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 auteurs auteur NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 complexes complexe NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 CBP CBP NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 / ou PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 8 P53 P53 NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 PCAF PCAF NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 11 / ou PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 Tat Tat NOM _ _ 10 para _ _ _ _ _ 13 ont avoir VRB _ _ 14 aux _ _ _ _ _ 14 publié publier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 de un DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 16 nouveaux nouveau ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 résultats résultat NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 qui qui PRQ _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 19 montrent montrer VRB _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 l' le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 existence existence NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 cette ce DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 liaison liaison NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 hydrogène hydrogène NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 pour pour PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 27 des un DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 complexes complexe NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 CBP CBP NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 et et COO _ _ 32 mark _ _ _ _ _ 32 PCAF PCAF NOM _ _ 30 para _ _ _ _ _ 33 avec avec PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 34 des un DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 queues queue NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 des de PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 histones histone NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 H3 H3 NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 et et COO _ _ 41 mark _ _ _ _ _ 40 H4 H4 NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 41 acétylées acétylées NOM _ _ 38 para _ _ _ _ _ 42 ( ( PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 43 Zeng Zeng NOM _ _ 37 parenth _ _ _ _ _ 44 et et COO _ _ 47 mark _ _ _ _ _ 45 al. al. ADV _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 , , PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 47 2008 2008 NUM _ _ 43 para _ _ _ _ _ 48 ) ) PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 49 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1552 # text = Il semble donc que cette liaison hydrogène soit conservée , du moins chez les bromodomaines qui possèdent l'asparagine équivalente à 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 semble sembler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 donc donc ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 cette ce DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 liaison liaison NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 7 hydrogène hydrogène NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 soit être VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 conservée conserver VPP _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 11 du du moins PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 12 moins du moins NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 chez chez PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 14 les le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 bromodomaines bromé NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 qui qui PRQ _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 17 possèdent posséder VRB _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 asparagine asparagine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 équivalente équivalent ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 à à PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1553 # text = N108 de Brdt-BD1 . 1 N108 N108 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1554 # text = Le réseau de liaisons hydrogène qui occupe le fond de la cavité et participe à la stabilisation de la lysine acétylée est lui aussi conservé chez Brdt-BD 1 / H 4 -K 5 K 8 ac , Brdt-BD 2 / H 3 -K 18 ac , Brdt-BD 2 / H 4 -K 12 ac , Gcn 5 / H 4 -K 16 ac et les récents complexes de PCAF et CBP . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 réseau réseau NOM _ _ 32 periph _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 liaisons liaison NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 hydrogène hydrogène NOM _ _ 32 periph _ _ _ _ _ 6 qui qui PRQ _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 7 occupe occuper VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 fond fond NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 cavité cavité NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 14 participe participe NOM _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 15 à à PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 stabilisation stabilisation NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 lysine lysine NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 acétylée acétyle NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 est être VRB _ _ 7 para _ _ _ _ _ 23 lui lui PRQ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 aussi aussi ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 conservé conserver ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 26 chez chez PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 27 Brdt-BD Brdt-BD NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 1 1 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 29 / sur PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 30 H H NOM _ _ 32 periph _ _ _ _ _ 31 4 4 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 32 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 33 5 5 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 K K NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 8 8 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 36 ac ac ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 37 , , PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 38 Brdt-BD Brdt-BD NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 39 2 2 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 40 / / PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 41 H H NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 42 3 3 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 43 -K -K ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 44 18 18 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 45 ac ac NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 46 , , PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 47 Brdt-BD Brdt-BD NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 48 2 2 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 49 / ou PUNC _ _ 50 punc _ _ _ _ _ 50 H H NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 51 4 4 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 52 -K -K VRB _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 53 12 12 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 54 ac ac ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 55 , , PUNC _ _ 56 punc _ _ _ _ _ 56 Gcn Gcn NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 57 5 5 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 58 / sur PUNC _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 59 H H NOM _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 60 4 4 NUM _ _ 59 dep _ _ _ _ _ 61 -K -K VPR _ _ 60 dep _ _ _ _ _ 62 16 16 NUM _ _ 63 spe _ _ _ _ _ 63 ac ace NOM _ _ 61 dep _ _ _ _ _ 64 et et COO _ _ 67 mark _ _ _ _ _ 65 les le DET _ _ 67 spe _ _ _ _ _ 66 récents récent ADJ _ _ 67 dep _ _ _ _ _ 67 complexes complexe NOM _ _ 63 para _ _ _ _ _ 68 de de PRE _ _ 67 dep _ _ _ _ _ 69 PCAF PCAF NOM _ _ 68 dep _ _ _ _ _ 70 et et COO _ _ 71 mark _ _ _ _ _ 71 CBP CBP NOM _ _ 69 para _ _ _ _ _ 72 . . PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1555 # text = b . Un nouveau mode de reconnaissance d'une double acétylation par un unique bromodomaine 1 b b NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Un Un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 4 nouveau nouveau ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 mode mode NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 d' de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 une un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 10 double double ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 acétylation acétylation NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 par par PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 un un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 14 unique unique ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 bromodomaine oromo NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1556 # text = Nos avons montré que Brdt-BD1 a besoin pour établir une interaction significative de la présence d'une di-acétylation de la queue H4 . 1 Nos Nos NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 que que CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 a avoir VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 besoin besoin NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 pour pour PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 établir établir VNF _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 une un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 interaction interaction NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 significative significatif ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 présence présence NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 d' de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 une un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 di-acétylation di-acétylation NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 queue queue NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 H4 H4 NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1557 # text = L'affinité de BD1 pour les peptides H4 di-acetylés diminue avec l'allongement de la région qui sépare les deux lysines acétylées ( K 5 / K 8 = 22 µM > K 12 / K 16 = 116 µM ? K 8 / K 12 = 192 µM 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 affinité affinité NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 BD1 BD1 NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 peptides peptide NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 H4 H4 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 di-acetylés NUMBER-acétyle NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 diminue diminuer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 avec avec PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 l' le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 allongement allongement NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 région région NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 qui qui PRQ _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 18 sépare séparer VRB _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 les le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 20 deux deux NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 lysines lysine NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 acétylées acétyle NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 24 K K NOM _ _ 29 subj _ _ _ _ _ 25 5 5 NUM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 / sur PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 27 K K NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 8 8 NUM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 30 22 22 NUM _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 µM micro- NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 > > ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 K K NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 12 12 NUM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 35 / ou PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 36 K K NOM _ _ 38 subj _ _ _ _ _ 37 16 16 NUM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 = égaler VRB _ _ 29 para _ _ _ _ _ 39 116 116 NUM _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 µM micro- NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 ? ? PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 42 K K NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 43 8 8 NUM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 / sur PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 45 K K NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 12 12 NUM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 48 192 192 NUM _ _ 49 spe _ _ _ _ _ 49 µM micro- NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1558 # text = > K 5 / K 12 = 340   µM > K 8 / K 16 > 103   µM ) . 1 > > NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 2 K K NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 5 5 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 / sur PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 K K NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 12 12 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 340 340 NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9   340   DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 µM micro- NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 > > ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 K K NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 8 8 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 / sur PUNC _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 15 K K NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 16 16 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 > > VPR _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 103 103 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19   103   DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 µM micro- NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 ) ) PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1559 # text = Nous avons déterminé la structure cristallographique de BD1 en complexe avec le peptide 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 déterminé déterminer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 structure structure NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 cristallographique cristallographique ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 BD1 BD1 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 en en PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 10 complexe complexe NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 avec avec PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 12 le le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 peptide peptide NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1560 # text = H 4 -K 5 K 8 ac . 1 H heure NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 5 5 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 K K NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 8 8 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 ac ace NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1561 # text = Celle -ci révèle un mode nouveau de reconnaissance entre un bromodomaine et un peptide acétylé . 1 Celle Celle NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 -ci -ci ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 révèle révéler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 mode mode NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 nouveau nouveau ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 entre entre PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 un un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 bromodomaine oromo NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 13 un un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 peptide peptide NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 15 acétylé acétyle NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1562 # text = Dans cette structure , les deux lysines acétylées K 5 ac et K 8 ac s'enfouissent dans la même cavité hydrophobe du site de fixation . 1 Dans dans PRE _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 2 cette ce DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 structure structure NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 6 deux deux NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 lysines lysine NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 8 acétylées acétyle NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 K K NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 5 5 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 ac ac ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 K K NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 14 8 8 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 ac ace NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 16 s' s' CLI _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 enfouissent enfouir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 dans dans PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 20 même même ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 cavité cavité NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 du de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 site site NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 fixation fixation NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1563 # text = Il est possible que l'éloignement des lysines acétylées joue un rôle important dans la diminution de l'affinité mesurée pour les autres peptides di-acétylés . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 possible possible ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 éloignement éloignement NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 7 des de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 lysines lysine NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 acétylées acétyle NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 joue jouer VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 un un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 rôle rôle NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 important important ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 dans dans PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 diminution diminution NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 affinité affinité NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 mesurée mesurer VPP _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 pour pour PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 les le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 23 autres autre ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 24 peptides peptide NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 25 di-acétylés NUMBER-acétyle NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1564 # text = L'enfouissement de la seconde lysine acétylée pourrait devenir difficile , voir impossible quand la longueur de la région qui sépare les deux acétyl-lysine augmente . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 enfouissement enfouissement NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 seconde second ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 lysine lysine NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 acétylée acétyle NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 devenir devenir VNF _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 difficile difficile ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 voir voir VNF _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 impossible impossible ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 quand quand CSU _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 longueur longueur NOM _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 région région NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 qui qui PRQ _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 21 sépare séparer VRB _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 les le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 deux deux NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 acétyl-lysine acétyle-lysine NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 augmente augmenter VRB _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1565 # text = Ainsi , la façon dont l'interaction avec un peptide di-acétylé sur les lysines 5 et 12 peut se faire n'est pas évidente à déduire de la structure en complexe avec H 4 -K 5 K 8 ac . 1 Ainsi ainsi ADV _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 façon façon NOM _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 5 dont dont PRQ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 interaction interaction NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 8 avec avec PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 un un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 peptide peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 di-acétylé NUMBER-acétyle NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 sur sur PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 lysines lysine NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 5 5 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 12 12 NUM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 18 peut pouvoir VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 19 se se CLI _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 faire faire VNF _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 n' ne ADV _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 22 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 pas pas ADV _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 évidente évident ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 à à PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 déduire déduire VNF _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 la le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 structure structure NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 en en PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 complexe complexe NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 avec avec PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 33 H H NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 4 4 NUM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 -K -K VPR _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 5 5 NUM _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 K K NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 8 8 NUM _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 ac ace NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 40 . . PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1566 # text = Il semble difficile que le peptide puisse adopter une conformation qui permette aux deux acétyl-lysines , séparées par 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 semble sembler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 difficile difficile ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 peptide peptide NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 7 puisse pouvoir VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 adopter adopter VNF _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 une un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 conformation conformation NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 qui qui PRQ _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 12 permette permettre VRB _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 aux à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 deux deux NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 acétyl-lysines acétyle-lysine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 17 séparées séparer ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 par par NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1567 # text = 6 résidus , de se placer dans le site hydrophobe de façon comparable aux acétyl-lysines 5 et 8 qui ont seulement 2 glycines entre elles . 1 6 6 NUM _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résidus résidu NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 se se CLI _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 placer placer VNF _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 dans dans PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 site site NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 façon façon NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 comparable comparable ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 aux à PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 acétyl-lysines acétyle-lysine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 5 5 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 18 8 8 NUM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 19 qui qui PRQ _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 20 ont avoir VRB _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 21 seulement seulement ADV _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 2 2 NUM _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 glycines glycine NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 24 entre entre PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 elles lui PRQ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1568 # text = c . Des interactions variables avec le reste du peptide 1 c c NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Des Des DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 interactions interaction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 variables variable ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 avec avec PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 reste reste NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 du de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 peptide peptide NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1569 # text = Le peptide H 4 -K 16 ac présente une surface complémentaire à celle du sillon que forme le site de fixation du bromodomaine de Gcn 5 mais sa chaîne principale établit une seule liaison hydrogène directe avec la protéine . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 peptide peptide NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 H H NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 4 4 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 -K -K VPR _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 16 16 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 ac ace NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 présente présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 une un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 surface surface NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 complémentaire complémentaire ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 celle celui PRQ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 du de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 sillon sillon NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 que que PRQ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 forme former VRB _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 le le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 site site NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 fixation fixation NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 du de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 bromodomaine bromé NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 Gcn Gcn NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 5 5 NUM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 mais mais COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 28 sa son DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 chaîne chaîne NOM _ _ 31 subj _ _ _ _ _ 30 principale principal ADJ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 établit établir VRB _ _ 8 para _ _ _ _ _ 32 une un DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 33 seule seul ADJ _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 34 liaison liaison NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 35 hydrogène hydrogène NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 directe direct ADJ _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 avec avec PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 38 la le DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 protéine protéine NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1570 # text = La spécificité pour la séquence adjacente à la lysine acétylée vient de la liaison des chaînes latérales des résidus en K + 2 ( R17 ) et K + 3 ( H18 ) par rapport à la lysine acétylée ( Hudson et al. , 2000 ) . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 spécificité spécificité NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 séquence séquence NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 adjacente adjacent ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 à à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 lysine lysine NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 acétylée acétyle NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 vient venir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 liaison liaison NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 des de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 chaînes chaîne NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 latérales latéral ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 des de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 résidus résidu NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 en en PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 K K NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 + + 2 PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 2 2 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 ( ( PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 R17 R17 NOM _ _ 16 parenth _ _ _ _ _ 26 ) ) PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 28 K K NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 29 + + 3 PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 3 3 NUM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 ( ( PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 32 H18 H18 NOM _ _ 28 parenth _ _ _ _ _ 33 ) ) PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 34 par par rapport à PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 35 rapport par rapport à NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 à par rapport à PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 la le DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 lysine lysine NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 39 acétylée acétyle NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 ( ( PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 41 Hudson Hudson NOM _ _ 38 parenth _ _ _ _ _ 42 et et COO _ _ 45 mark _ _ _ _ _ 43 al. al. ADV _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 45 2000 2000 NUM _ _ 41 para _ _ _ _ _ 46 ) ) PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 47 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1571 # text = L'étude des structures de PCAF et CBP en complexe avec des peptides acétylés H3 et H4 permet aux auteurs de prédire que les peptides qui seront reconnus avec la meilleure affinité par PCAF sont ceux qui présentent un résidu hydrophobe en K + 2 et un résidu chargé ou aromatique en K + 3 alors que ceux reconnus préférentiellement par CBP devront avoir un résidu hydrophobe en 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 étude étude NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 structures structure NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 PCAF PCAF NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 8 CBP CBP NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 9 en en PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 10 complexe complexe NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 avec avec PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 des un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 peptides peptide NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 acétylés acétyle NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 H3 H3 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 H4 H4 NOM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 18 permet permettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 aux à PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 auteurs auteur NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 prédire prédire VNF _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 que que CSU _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 les le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 peptides peptide NOM _ _ 35 subj _ _ _ _ _ 26 qui qui PRQ _ _ 28 subj _ _ _ _ _ 27 seront être VRB _ _ 28 aux _ _ _ _ _ 28 reconnus reconnaître VPP _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 29 avec avec PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 la le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 31 meilleure meilleur ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 32 affinité affinité NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 33 par par PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 PCAF PCAF NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 sont être VRB _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 36 ceux celui PRQ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 qui qui PRQ _ _ 38 subj _ _ _ _ _ 38 présentent présenter VRB _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 un un DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 résidu résidu NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 en en PRE _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 43 K K NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 + + 2 PRE _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 45 2 2 NUM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 et et COO _ _ 48 mark _ _ _ _ _ 47 un un DET _ _ 48 spe _ _ _ _ _ 48 résidu résidu NOM _ _ 40 para _ _ _ _ _ 49 chargé charger ADJ _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 ou ou COO _ _ 51 mark _ _ _ _ _ 51 aromatique aromatique ADJ _ _ 49 para _ _ _ _ _ 52 en en PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 53 K K NOM _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 54 + + 3 PRE _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 55 3 3 NUM _ _ 54 dep _ _ _ _ _ 56 alors alors que CSU _ _ 57 dep _ _ _ _ _ 57 que alors que CSU _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 58 ceux celui PRQ _ _ 63 subj _ _ _ _ _ 59 reconnus reconnaître VPP _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 60 préférentiellement préférentiellement ADV _ _ 59 dep _ _ _ _ _ 61 par par PRE _ _ 59 dep _ _ _ _ _ 62 CBP CBP NOM _ _ 61 dep _ _ _ _ _ 63 devront devoir VRB _ _ 57 dep _ _ _ _ _ 64 avoir avoir VNF _ _ 63 dep _ _ _ _ _ 65 un un DET _ _ 66 spe _ _ _ _ _ 66 résidu résidu NOM _ _ 64 dep _ _ _ _ _ 67 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 66 dep _ _ _ _ _ 68 en en PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1572 # text = K + 1 et K + 2 , un résidu chargé positivement en K- 1 , et un résidu aromatique en K- 2 ( Mujtaba et al. , 2007 ; Zeng et al. , 2008 ) . 1 K K NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 + + 1 PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 1 1 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 K K NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 6 + + 2 PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 2 2 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 9 un un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 résidu résidu NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 chargé charger VPP _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 positivement positivement ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 en en PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 K- K- NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 1 1 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 18 un un DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 résidu résidu NOM _ _ 10 para _ _ _ _ _ 20 aromatique aromatique ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 en en PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 K- K- NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 2 2 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 ( ( PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 25 Mujtaba Mujtaba NOM _ _ 29 periph _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 27 al. al. NOM _ _ 25 para _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 29 2007 2007 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 30 ; ; PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 31 Zeng Zeng NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 33 mark _ _ _ _ _ 33 al. al. NOM _ _ 31 para _ _ _ _ _ 34 , , PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 35 2008 2008 NUM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 36 ) ) PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1573 # text = Nous avons vu que Brdt-BD1 interagit principalement avec les résidus en K + 3 ( AcK 8 ) et K + 5 ( L10 ) et que Brdt-BD2 établit ses interactions principales avec le peptide en K- 2 ( P16 ) , K- 1 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 vu voir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 que que CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 interagit interagir VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 principalement principalement ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 avec avec PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 résidus résidu NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 en en PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 K K NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 + + 3 PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 3 3 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 ( ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 AcK AcK NOM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 17 8 8 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 20 K K NOM _ _ 10 para _ _ _ _ _ 21 + + 5 PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 5 5 NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 L10 L10 NOM _ _ 20 parenth _ _ _ _ _ 25 ) ) PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 27 que que CSU _ _ 4 para _ _ _ _ _ 28 Brdt-BD2 Brdt-BD2 NOM _ _ 29 subj _ _ _ _ _ 29 établit établir VRB _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 ses son DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 interactions interaction NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 principales principal ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 avec avec PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 34 le le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 peptide peptide NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 en en PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 K- K- NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 2 2 NUM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 ( ( PUNC _ _ 40 punc _ _ _ _ _ 40 P16 P16 NOM _ _ 37 parenth _ _ _ _ _ 41 ) ) PUNC _ _ 40 punc _ _ _ _ _ 42 , , PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 43 K- K- NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 44 1 1 NUM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1574 # text = ( R17 ) , et K + 2 ( L20 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 R17 R17 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 6 K K NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 + plus ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 2 2 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 ( ( PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 L20 L20 NOM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 11 ) ) PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1575 # text = Dans ces cinq cas , les résidus du peptide qui sont reconnus entourent la lysine acétylée , s'éloignant d'elle au plus de cinq acides-aminés . 1 Dans dans PRE _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 2 ces ce DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 3 cinq cinq NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 cas cas NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 résidus résidu NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 peptide peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 qui qui PRQ _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 11 sont être VRB _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 12 reconnus reconnaître VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 13 entourent entourer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 lysine lysine NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 acétylée acétyle NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 18 s' s' CLI _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 éloignant éloigner VPR _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 20 d' de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 elle lui PRQ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 au à+le PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 23 plus au plus NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 25 cinq cinq NUM _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 acides-aminés acide ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1576 # text = La reconnaissance implique les boucles ZA et BC ( de séquences très variables ) sans qu'il soit possible de dégager une position préférentiellement impliquée dans l'interaction avec le peptide . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 implique impliquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 boucles boucle NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 ZA ZA NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 8 BC BC NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 9 ( ( PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 11 séquences séquence NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 très très ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 variables variable ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 15 sans sans que CSU _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 qu' sans que CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 17 il il CLS _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 18 soit être VRB _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 possible possible ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 dégager dégager VNF _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 une un DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 position position NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 préférentiellement préférentiellement ADV _ _ 25 periph _ _ _ _ _ 25 impliquée impliquer VPP _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 dans dans PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 l' le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 interaction interaction NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 avec avec PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 30 le le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 peptide peptide NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1577 # text = La flexibilité de ces boucles permet probablement à chaque bromodomaine de s'adapter à son substrat . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 flexibilité flexibilité NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ces ce DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 boucles boucle NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 permet permettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 probablement probablement ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 chaque chaque DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 bromodomaine bromé NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 12 s' s' CLI _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 adapter adapter VNF _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 à à PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 son son DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 substrat substrat NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1578 # text = d . Un chemin similaire à la surface du site 1 d d NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Un Un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 chemin chemin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 similaire similaire ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 surface surface NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 du de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 site site NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1579 # text = Pour autant les chemins suivis par les peptides H 4 -K 5 K 8 ac , H 3 -K 18 ac , H 4 -K 16 ac et Rsc 4 -K 25 ac à la surface de leurs sites de fixation sont comparables . 1 Pour pour autant PRE _ _ 42 periph _ _ _ _ _ 2 autant pour autant ADV _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 les le DET _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 4 chemins chemin NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 5 suivis suivi NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 6 par par PRE _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 8 peptides peptide NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 9 H H NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 10 4 4 NUM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 11 -K -K ADJ _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 12 5 5 NUM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 13 K K NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 14 8 8 NUM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 15 ac ac ADJ _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 17 H H NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 18 3 3 NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 18 18 NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 ac ac NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 23 H H NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 24 4 4 NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 25 -K -K VRB _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 26 16 16 NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 27 ac ac NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 28 et et COO _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 29 Rsc Rsc NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 30 4 4 NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 31 -K -K ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 32 25 25 NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 33 ac ace NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 34 à à PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 35 la le DET _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 36 surface surface NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 37 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 38 leurs leurs NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 39 sites site NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 40 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 41 fixation fixation NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 42 sont être VRB _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 43 comparables comparable ADJ _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 . . PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1580 # text = Ils empruntent tous un sillon principalement formé par l'asparagine très conservée ( qui forme avec la lysine acétylée une liaison hydrogène ) et par le résidu qui la précède ( le plus souvent une tyrosine : chez Brdt-BD1 , Brdt-BD2 , yGcn 5 , yRsc 4 -BD1 ou une phénylalanine : chez yRsc 4 -BD2 par exemple ) . 1 Ils ils CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 empruntent emprunter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 tous tout PRQ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 sillon sillon NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 principalement principalement ADV _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 7 formé former VPP _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 par par PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 asparagine asparagine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 très très ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 conservée conserver ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 ( ( PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 14 qui qui PRQ _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 15 forme former VRB _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 16 avec avec PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 lysine lysine NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 acétylée acétyle NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 une un DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 liaison liaison NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 22 hydrogène hydrogène NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 25 par par PRE _ _ 8 para _ _ _ _ _ 26 le le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 résidu résidu NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 qui qui PRQ _ _ 30 subj _ _ _ _ _ 29 la le CLI _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 30 précède précéder VRB _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 31 ( ( PUNC _ _ 58 punc _ _ _ _ _ 32 le le DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 33 plus plus COO _ _ 36 mark _ _ _ _ _ 34 souvent souvent ADV _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 une un DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 36 tyrosine tyrosine NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 37 : : PUNC _ _ 46 punc _ _ _ _ _ 38 chez chez PRE _ _ 46 periph _ _ _ _ _ 39 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 , , PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 41 Brdt-BD2 Brdt-BD2 NOM _ _ 46 subj _ _ _ _ _ 42 , , PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 43 yGcn yGcn NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 44 5 5 NUM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 , , PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 46 yRsc yRsc VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 47 4 4 NUM _ _ 48 spe _ _ _ _ _ 48 -BD1 -BD1 NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 49 ou ou COO _ _ 51 mark _ _ _ _ _ 50 une un DET _ _ 51 spe _ _ _ _ _ 51 phénylalanine phénylalanine NOM _ _ 48 para _ _ _ _ _ 52 : : PUNC _ _ 57 punc _ _ _ _ _ 53 chez chez PRE _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 54 yRsc yRsc ADV _ _ 55 dep _ _ _ _ _ 55 4 4 NUM _ _ 56 spe _ _ _ _ _ 56 -BD2 -BD2 NOM _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 57 par par exemple PRE _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 58 exemple par exemple ADV _ _ 57 parenth _ _ _ _ _ 59 ) ) PUNC _ _ 58 punc _ _ _ _ _ 60 . . PUNC _ _ 46 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1581 # text = L'orientation de la chaîne peptidique de H 4 -K 5 K 8 ac , celle de H 3 -K 18 ac et celle de Brd 2 -BD 1 / H 4 -K 12 ac 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 orientation orientation NOM _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 chaîne chaîne NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 peptidique peptidique ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 H H NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 4 4 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 -K -K VPR _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 5 5 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 K K NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 8 8 NUM _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 ac ac NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 16 celle celui PRQ _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 H H NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 3 3 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 18 18 NUM _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 ac ace NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 24 celle celui PRQ _ _ 22 para _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 Brd Brd NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 2 2 NUM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 -BD -bd NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 1 1 NUM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 30 / sur PUNC _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 31 H H NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 4 4 NUM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 -K -K VPR _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 12 12 NUM _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 ac ace NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1582 # text = [ PDB : 2DVQ ] sont les mêmes , elle est opposée à celle des peptides 1 [ ( PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 2 PDB PDB NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 4 2DVQ 2DVQ NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 ] ) PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 mêmes même ADJ _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 10 elle elle CLS _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 11 est être VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 12 opposée opposer VPP _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 celle celui PRQ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 des de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 peptides peptide NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1583 # text = H 4 -K 16 ac et Rsc 4 -K 25 ac [ Figure 47 ] . 1 H heure NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 16 16 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 ac ace NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 7 Rsc Rsc NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 8 4 4 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 -K -K VRB _ _ 3 para _ _ _ _ _ 10 25 25 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 ac ace NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 [ ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Figure Figure NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 47 47 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 ] ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1584 # text = Le peptide H 4 -K 12 ac dans la structure en complexe avec Brdt-BD2 emprunte un chemin perpendiculaire par rapport à celui que nous venons de décrire . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 peptide peptide NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 3 H H NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 4 4 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 -K -K VPR _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 12 12 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 ac ace NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 dans dans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 structure structure NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 en en PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 complexe complexe NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 avec avec PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 Brdt-BD2 Brdt-BD2 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 emprunte emprunter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 un un DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 chemin chemin NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 perpendiculaire perpendiculaire ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 par par rapport à PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 20 rapport par rapport à NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 à par rapport à PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 celui celui PRQ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 23 que que PRQ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 24 nous nous CLS _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 25 venons venir VRB _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 décrire décrire VNF _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1585 # text = Ce peptide ne présentait pas pour BD2 d'affinité mesurable par 1 Ce ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 peptide peptide NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 ne ne ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 présentait présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 pas pas ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 pour pour PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 BD2 BD2 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 d' de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 affinité affinité NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 mesurable mesurable ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 par par NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1586 # text = ITC . 1 ITC itc NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1587 # text = Il est probable que ce chemin alternatif soit du à une affinité très basse pour BD2 . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 probable probable ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 ce ce DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 chemin chemin NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 7 alternatif alternatif ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 soit être VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 du de+le PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 à à PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 une un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 affinité affinité NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 très très ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 basse bas ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 pour pour PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 BD2 BD2 NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1588 # text = La lysine acétylée acK 12 se place de façon similaire aux autres lysines acétylées mais le reste de la chaîne est très peu stabilisé par le bromodomaine . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 lysine lysine NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 acétylée acétyle NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 acK acK ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 12 12 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 se se CLI _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 place placer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 façon façon NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 similaire similaire ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 aux à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 autres autre ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 lysines lysine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 acétylées acétyle NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 mais mais COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 16 le le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 reste reste NOM _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 chaîne chaîne NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 est être VRB _ _ 24 aux _ _ _ _ _ 22 très très ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 23 peu peu ADV _ _ 24 periph _ _ _ _ _ 24 stabilisé stabiliser VPP _ _ 7 para _ _ _ _ _ 25 par par PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 le le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 bromodomaine bromé NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1589 # text = Il est probable que ce chemin alternatif soit dû à une interaction non spécifique avec le bromodomaine . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 probable probable ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 ce ce DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 chemin chemin NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 7 alternatif alternatif ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 soit être VRB _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 dû devoir VPP _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 10 à à PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 une un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 interaction interaction NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 non non ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 spécifique spécifique ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 avec avec PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 16 le le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 bromodomaine oromo NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1590 # text = De même le peptide H 4 -K 20 ac qui est considéré comme non spécifique car il présente pour P / CAF une affinité faible par rapport à d'autres peptides ( Zeng et al. , 2008 ) ne passe pas dans le sillon de l'asparagine conservée . 1 De de même PRE _ _ 40 periph _ _ _ _ _ 2 même de même NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 le le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 peptide peptide NOM _ _ 40 subj _ _ _ _ _ 5 H H NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 4 4 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 -K -K VPR _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 20 20 NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 ac ace NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 qui qui PRQ _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 11 est être VRB _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 12 considéré considérer VPP _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 comme comme PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 non non ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 spécifique spécifique ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 car car COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 17 il il CLS _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 18 présente présenter VRB _ _ 12 para _ _ _ _ _ 19 pour pour PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 P P NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 / ou PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 CAF CAF NOM _ _ 20 para _ _ _ _ _ 23 une un DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 affinité affinité NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 25 faible faible ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 par par rapport à PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 27 rapport par rapport à NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 à par rapport à PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 d' un DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 30 autres autre ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 31 peptides peptide NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 32 ( ( PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 33 Zeng Zeng NOM _ _ 31 parenth _ _ _ _ _ 34 et et COO _ _ 37 mark _ _ _ _ _ 35 al. al. ADV _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 37 2008 2008 NUM _ _ 33 para _ _ _ _ _ 38 ) ) PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 39 ne ne ADV _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 40 passe passer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 41 pas pas ADV _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 dans dans PRE _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 43 le le DET _ _ 44 spe _ _ _ _ _ 44 sillon sillon NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 45 de de PRE _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 l' le DET _ _ 47 spe _ _ _ _ _ 47 asparagine asparagine NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 48 conservée conserver ADJ _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 49 . . PUNC _ _ 40 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1591 # text = III . Particularités de l'interaction de BD1 et du peptide 1 III iii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Particularités Particularités NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 interaction interaction NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 BD1 BD1 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 du de PRE _ _ 7 para _ _ _ _ _ 11 peptide peptide NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1592 # text = H 4 -K 5 K 8 ac 1 H heure NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 5 5 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 K K NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 8 8 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 ac ace NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1593 # text = a . La cavité hydrophobe 1 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 La La DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 cavité cavité NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1594 # text = Les résidus P50 , F51 , V55 , L60 , L62 , Y65 , Y107 , N108 , I114 de BD1 constituent la cavité du site de fixation occupé par l'AcK 5 . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résidus résidu NOM _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 3 P50 P50 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 5 F51 F51 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 7 V55 V55 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 9 L60 L60 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 11 L62 L62 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 13 Y65 Y65 NOM _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 Y107 Y107 NOM _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 17 N108 N108 NOM _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 19 I114 I114 NOM _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 BD1 BD1 NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 constituent constituer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 cavité cavité NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 du de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 site site NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 fixation fixation NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 occupé occuper VPP _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 30 par par PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 l' le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 AcK AcK NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 5 5 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 . . PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1595 # text = Excepté la leucine L60 et l'isoleucine I114 , ils sont conservés ( identiques ou similaires ) parmi les bromodomaines de structure connue [ Figure 49 ] . 1 Excepté excepté PRE _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 la le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 leucine leucine NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 L60 L60 NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 isoleucine isoleucine NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 8 I114 I114 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 10 ils ils CLS _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 11 sont être VRB _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 12 conservés conserver VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 ( ( PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 identiques identique ADJ _ _ 12 parenth _ _ _ _ _ 15 ou ou COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 16 similaires similaire ADJ _ _ 14 para _ _ _ _ _ 17 ) ) PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 18 parmi parmi PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 19 les le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 bromodomaines brome NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 structure structure NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 connue connu ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 [ ( PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 Figure Figure NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 26 49 49 NUM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 ] ) PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1596 # text = La leucine L60 appartient à une l'insertion de 2 acides-aminés , commune aux protéines de la famille BET et aux bromodomaines de CBP et P300 mais absente des bromodomaines de Gcn 5 , Rsc 4 , TafII 250 , PCAF , Brg 1 , Brd 7 et ACF1 . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 leucine leucine NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 L60 L60 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 appartient appartenir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 une un PRQ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 l' le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 insertion insertion NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 2 2 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 acides-aminés acide ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 13 commune commun ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 14 aux à PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 protéines protéine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 famille famille NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 BET BET NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 aux à PRE _ _ 14 para _ _ _ _ _ 22 bromodomaines oromo NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 CBP CBP NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 et et COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 26 P300 P300 NOM _ _ 24 para _ _ _ _ _ 27 mais mais COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 28 absente absent ADJ _ _ 23 para _ _ _ _ _ 29 des de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 30 bromodomaines brome NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 de de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 Gcn Gcn NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 5 5 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 , , PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 35 Rsc Rsc NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 36 4 4 NUM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 , , PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 38 TafII TafII NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 39 250 250 NUM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 , , PUNC _ _ 46 punc _ _ _ _ _ 41 PCAF PCAF NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 42 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 43 Brg Brg NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 44 1 1 NUM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 46 Brd Brd NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 47 7 7 NUM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 et et COO _ _ 49 mark _ _ _ _ _ 49 ACF1 ACF1 NOM _ _ 41 para _ _ _ _ _ 50 . . PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1597 # text = La présence ce cette insertion a pour effet de resserrer l'entrée de la cavité . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 présence présence NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ce ce CLS _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 cette ce DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 insertion insertion NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 pour pour PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 effet effet NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 resserrer resserrer VNF _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 l' le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 entrée entrée NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 cavité cavité NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1598 # text = b . Le second site hydrophobe 1 b b NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Le Le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 4 second second ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 site site NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1599 # text = L'isoleucine I114 se trouve sur le côté opposé de la cavité et constitue principalement la surface du site de fixation de la seconde lysine acétylée acK 8 . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 isoleucine isoleucine NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 I114 I114 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 se se CLI _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 trouve trouver VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 sur sur PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 côté côté NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 opposé opposer VPP _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 cavité cavité NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 constitue constituer VRB _ _ 5 para _ _ _ _ _ 15 principalement principalement ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 surface surface NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 du de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 site site NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 fixation fixation NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 24 seconde second ADJ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 lysine lysine NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 26 acétylée acétyle NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 acK acK ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 8 8 NUM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1600 # text = A cette position on trouve soit une isoleucine ( BD1 des protéines BET , Rsc 4 -BD1 , Rsc 4 -BD2 , Brg 1 et ACF1 ) , soit une valine ( BD2 des protéines BET , hCBP , hP 300 ) soit une leucine ( hTAFII 250 -BD1 ) soit une tyrosine ( hTAFII 250 -BD2 , yGcn 5 , hPCAF , hBrd 7 ) . 1 A à PRE _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 cette ce DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 position position NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 on on CLS _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 5 trouve trouver VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 soit soit COO _ _ 51 mark _ _ _ _ _ 7 une un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 isoleucine isoleucine NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 ( ( PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 BD1 BD1 NOM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 11 des de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 protéines protéine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 BET BET NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 15 Rsc Rsc NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 4 4 NUM _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 -BD1 -BD1 NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 Rsc Rsc NOM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 20 4 4 NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 -BD2 -BD2 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 Brg Brg NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 24 1 1 NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 et et COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 26 ACF1 ACF1 NOM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 27 ) ) PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 29 soit soit COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 30 une un DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 valine valine NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 32 ( ( PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 33 BD2 BD2 NOM _ _ 31 parenth _ _ _ _ _ 34 des de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 protéines protéine NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 BET BET NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 38 hCBP hCBP ADJ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 39 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 40 hP hP ADJ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 41 300 300 NUM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 ) ) PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 43 soit soit COO _ _ 45 mark _ _ _ _ _ 44 une un DET _ _ 45 spe _ _ _ _ _ 45 leucine leucine NOM _ _ 31 para _ _ _ _ _ 46 ( ( PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 47 hTAFII hTAFII VPR _ _ 45 parenth _ _ _ _ _ 48 250 250 NUM _ _ 49 spe _ _ _ _ _ 49 -BD1 -BD1 NOM _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 50 ) ) PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 51 soit soit COO _ _ 53 mark _ _ _ _ _ 52 une un DET _ _ 53 spe _ _ _ _ _ 53 tyrosine tyrosine NOM _ _ 45 para _ _ _ _ _ 54 ( ( PUNC _ _ 55 punc _ _ _ _ _ 55 hTAFII hTAFII VPR _ _ 53 parenth _ _ _ _ _ 56 250 250 NUM _ _ 57 spe _ _ _ _ _ 57 -BD2 -BD2 NOM _ _ 55 dep _ _ _ _ _ 58 , , PUNC _ _ 59 punc _ _ _ _ _ 59 yGcn yGcn NOM _ _ 57 dep _ _ _ _ _ 60 5 5 NUM _ _ 59 dep _ _ _ _ _ 61 , , PUNC _ _ 64 punc _ _ _ _ _ 62 hPCAF hPCAF ADJ _ _ 59 dep _ _ _ _ _ 63 , , PUNC _ _ 64 punc _ _ _ _ _ 64 hBrd hBrd ADJ _ _ 59 dep _ _ _ _ _ 65 7 7 NUM _ _ 64 dep _ _ _ _ _ 66 ) ) PUNC _ _ 55 punc _ _ _ _ _ 67 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1601 # text = La substitution de l'isoleucine par une leucine ou une valine ne provoque pas de changement important ni du relief ni du potentiel électrostatique de la surface . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 substitution substitution NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 isoleucine isoleucine NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 une un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 leucine leucine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 ou ou COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 10 une un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 valine valine NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 12 ne ne ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 provoque provoquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 pas pas ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 changement changement NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 important important ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ni ni COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 19 du de PRE _ _ 15 para _ _ _ _ _ 20 relief relief NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 ni ni COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 22 du de PRE _ _ 19 para _ _ _ _ _ 23 potentiel potentiel NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 électrostatique électrostatique ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 la le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 surface surface NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1602 # text = Par contre , la substitution du résidu par une tyrosine provoque un encombrement stérique important . 1 Par par contre PRE _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 contre par contre ADV _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 substitution substitution NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 6 du de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 résidu résidu NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 par par PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 une un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 tyrosine tyrosine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 provoque provoquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 un un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 encombrement encombrement NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 stérique stérique ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 important important ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1603 # text = La superposition des structures de Brdt-BD1 en complexe avec le peptide H 4 -K 5 K 8 ac et de celle du bromodomaine de Gcn 5 [ PDB : 1E6I ] qui présente une tyrosine à cette position montre que la fixation de la première lysine acétylée n'est pas gênée mais que celle de la seconde lysine acétylée devient impossible [ Figure 48 ] . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 superposition superposition NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 structures structure NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 en en PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 complexe complexe NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 avec avec PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 le le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 peptide peptide NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 H H NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 4 4 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 5 5 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 K K NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 8 8 NUM _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 ac ace NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 14 para _ _ _ _ _ 21 celle celui PRQ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 du de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 bromodomaine oromo NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 Gcn Gcn NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 5 5 NUM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 [ ( PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 28 PDB PDB NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 29 : : PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 30 1E6I 1E6I NUM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 ] ) PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 32 qui qui PRQ _ _ 33 subj _ _ _ _ _ 33 présente présenter VRB _ _ 39 subj _ _ _ _ _ 34 une un DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 tyrosine tyrosine NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 à à PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 cette ce DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 position position NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 40 que que CSU _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 la le DET _ _ 42 spe _ _ _ _ _ 42 fixation fixation NOM _ _ 51 subj _ _ _ _ _ 43 de de PRE _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 la le DET _ _ 46 spe _ _ _ _ _ 45 première premier ADJ _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 46 lysine lysine NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 47 acétylée acétyle NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 n' ne ADV _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 49 est être VRB _ _ 51 aux _ _ _ _ _ 50 pas pas ADV _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 51 gênée gêner VPP _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 52 mais mais COO _ _ 53 mark _ _ _ _ _ 53 que que CSU _ _ 40 para _ _ _ _ _ 54 celle celui PRQ _ _ 60 subj _ _ _ _ _ 55 de de PRE _ _ 54 dep _ _ _ _ _ 56 la le DET _ _ 58 spe _ _ _ _ _ 57 seconde second ADJ _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 58 lysine lysine NOM _ _ 55 dep _ _ _ _ _ 59 acétylée acétyle NOM _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 60 devient devenir VRB _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 61 impossible impossible ADJ _ _ 60 dep _ _ _ _ _ 62 [ ( PUNC _ _ 63 punc _ _ _ _ _ 63 Figure Figure NOM _ _ 60 dep _ _ _ _ _ 64 48 48 NUM _ _ 63 dep _ _ _ _ _ 65 ] ) PUNC _ _ 60 punc _ _ _ _ _ 66 . . PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1604 # text = Les autres résidus ( W49 et M117 ) qui constituent le site de l'acK 8 sont variables sauf chez les bromodomaines BD1 et BD2 de la famille BET . 1 Les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 autres autre ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 résidus résidu NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 W49 W49 NOM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 M117 M117 NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 9 qui qui PRQ _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 10 constituent constituer VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 site site NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 l' le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 acK acK NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 8 8 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 variables variable ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 sauf sauf PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 chez chez PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 les le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 bromodomaines brome NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 BD1 BD1 NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 25 BD2 BD2 NOM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 27 la le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 famille famille NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 BET BET NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1605 # text = c . Le sillon du peptide 1 c c NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Le Le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 sillon sillon NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 du de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 peptide peptide NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1606 # text = Les résidus qui forment la couronne électropositive et ceux qui forment le site hydrophobe de la leucine L10 sont variables chez les bromodomaines étudiés sauf au sein des domaines BD1 des protéines de la famille BET chez qui les principaux résidus impliqués dans l'interaction avec le peptide H 4 -K 5 K 8 ac sont conservés . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résidus résidu NOM _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 3 qui qui PRQ _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 forment former VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 couronne couronne NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 électropositive électropositif ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 9 ceux celui PRQ _ _ 6 para _ _ _ _ _ 10 qui qui PRQ _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 11 forment former VRB _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 le le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 site site NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 leucine leucine NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 L10 L10 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 variables variable NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 chez chez PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 les le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 bromodomaines brome NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 étudiés étudier VPP _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 sauf sauf PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 au au sein de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 sein au sein de DET _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 des au sein de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 domaines domaine NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 BD1 BD1 NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 des de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 protéines protéine NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 de de PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 la le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 famille famille NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 BET BET NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 chez chez PRE _ _ 57 periph _ _ _ _ _ 38 qui qui PRQ _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 les le DET _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 40 principaux principal ADJ _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 41 résidus résidu NOM _ _ 57 subj _ _ _ _ _ 42 impliqués impliquer VPP _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 dans dans PRE _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 l' le DET _ _ 45 spe _ _ _ _ _ 45 interaction interaction NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 46 avec avec PRE _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 47 le le DET _ _ 48 spe _ _ _ _ _ 48 peptide peptide NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 49 H H NOM _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 4 4 NUM _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 51 -K -K VPR _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 52 5 5 NUM _ _ 53 spe _ _ _ _ _ 53 K K NOM _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 54 8 8 NUM _ _ 55 spe _ _ _ _ _ 55 ac ace NOM _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 56 sont être VRB _ _ 57 aux _ _ _ _ _ 57 conservés conserver VPP _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 58 . . PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1607 # text = De plus aucune des variations de séquence entre ces bromodomaines ne semble pouvoir affecter la liaison du peptide soit parce que le résidu est trop éloigné du site soit parce qu'il s'agit d'un remplacement par un résidu de même nature . 1 De de plus PRE _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 plus de plus NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 aucune aucun PRQ _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 variations variation NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 séquence séquence NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 entre entre PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ces ce DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 bromodomaines brome NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 ne ne ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 semble sembler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 pouvoir pouvoir VNF _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 affecter affecter VNF _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 liaison liaison NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 du de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 peptide peptide NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 soit soit COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 20 parce parce que CSU _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 que parce que CSU _ _ 17 para _ _ _ _ _ 22 le le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 résidu résidu NOM _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 24 est être VRB _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 25 trop trop ADV _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 26 éloigné éloigné ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 du de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 site site NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 soit soit COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 30 parce parce que CSU _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 31 qu' parce que CSU _ _ 21 para _ _ _ _ _ 32 il il CLS _ _ 34 subj _ _ _ _ _ 33 s' s' CLI _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 34 agit agir VRB _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 35 d' de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 un un DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 remplacement remplacement NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 par par PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 un un DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 résidu résidu NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 de de même PRE _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 42 même de même NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 nature nature ADJ _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 44 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1608 # text = La seule variation de séquence touchant un résidu situé à proximité du site de fixation ( mais qui n'établit pas d'interaction avec le peptide ) se trouve à la position G111 . 1 La le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 seule seul ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 variation variation NOM _ _ 29 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 séquence séquence NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 touchant toucher VPR _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 un un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 résidu résidu NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 situé situer VPP _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 à à PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 proximité proximité NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 du de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 site site NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 fixation fixation NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 17 mais mais COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 18 qui qui PRQ _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 19 n' ne ADV _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 établit établir VRB _ _ 14 para _ _ _ _ _ 21 pas pas ADV _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 d' de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 interaction interaction NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 avec avec PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 25 le le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 peptide peptide NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 ) ) PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 28 se se CLI _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 29 trouve trouver VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 30 à à PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 la le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 position position NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 G111 G111 NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 . . PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1609 # text = Ce résidu est situé dans la boucle BC , nous allons voir l'importance de celle -ci pour l'établissement de la différence de spécificité entre 1 Ce ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résidu résidu NOM _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 3 est est NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 situé situer VPP _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 dans dans PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 boucle boucle NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 BC BC NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 10 nous nous CLS _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 11 allons aller VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 12 voir voir VNF _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 l' le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 importance importance NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 celle celui PRQ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 -ci -ci ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 pour pour PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 19 l' le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 établissement établissement NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 22 la le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 différence différence NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 spécificité spécificité NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 entre entrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1610 # text = Brdt-BD1 et Brdt-BD2 . 1 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 Brdt-BD2 Brdt-BD2 NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1611 # text = On trouve à cette position une thréonine chez Brd 2 -BD1 et Brd 3 -BD1 et une glycine chez Brd 4 -BD1 . 1 On on CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 trouve trouver VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 à à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 cette ce DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 position position NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 une un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 thréonine thréonine NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 chez chez PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 9 Brd Brd NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 2 2 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 -BD1 -BD1 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 Brd Brd NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 14 3 3 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 -BD1 -BD1 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 17 une un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 glycine glycine NOM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 19 chez chez PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 Brd Brd NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 4 4 NUM _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 -BD1 -BD1 NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1612 # text = IV . Particularités de l'interaction de BD2 et du peptide H 3 K 18 ac 1 IV iv NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Particularités Particularités NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 interaction interaction NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 BD2 BD2 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 du de PRE _ _ 7 para _ _ _ _ _ 11 peptide peptide NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 H H NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 3 3 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 K K NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 18 18 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 ac ace NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1613 # text = Comme pour BD1 , les principaux résidus qui constituent le site de fixation de l'acK 18 sont conservés chez l'ensemble des bromodomaines de structure connue , à l'exception de la leucine L303 et de la valine V357 . 1 Comme comme COO _ _ 2 mark _ _ _ _ _ 2 pour pour PRE _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 3 BD1 BD1 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 6 principaux principal ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 résidus résidu NOM _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 8 qui qui PRQ _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 9 constituent constituer VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 le le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 site site NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 fixation fixation NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 l' le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 acK acK NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 18 18 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 sont être VRB _ _ 19 aux _ _ _ _ _ 19 conservés conserver VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 chez chez PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 l' le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 ensemble ensemble NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 des de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 bromodomaines brome NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 structure structure NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 connue connaître VPP _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 29 à à PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 l' le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 exception exception NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 de de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 la le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 leucine leucine NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 L303 L303 NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 et et COO _ _ 37 mark _ _ _ _ _ 37 de de PRE _ _ 32 para _ _ _ _ _ 38 la le DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 valine valine NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 V357 V357 NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 . . PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1614 # text = Ces deux résidus sont variables sauf chez les domaines 1 Ces ce DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 deux deux NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 résidus résidu NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 variables variable ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 sauf sauf PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 chez chez PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 domaines domaine NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1615 # text = BD2 des protéines de la famille BET . 1 BD2 BD2 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 protéines protéine NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 famille famille NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 BET BET NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1616 # text = Il s'agit de la leucine L303 qui appartient à l'insertion de la boucle ZA caractéristique de la famille BET et de la valine V357 qui constitue le second site hydrophobe du site de fixation . 1 Il il CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 s' s' CLI _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 agit agir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 leucine leucine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 L303 L303 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 qui qui PRQ _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 9 appartient appartenir VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 à à PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 l' le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 insertion insertion NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 boucle boucle NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 ZA ZA NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 caractéristique caractéristique ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 famille famille NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 BET BET NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 18 para _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 valine valine NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 V357 V357 NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 qui qui PRQ _ _ 28 subj _ _ _ _ _ 28 constitue constituer VRB _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 29 le le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 30 second second ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 31 site site NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 32 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 du de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 site site NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 de de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 fixation fixation NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1617 # text = Les résidus impliqués dans l'interaction avec le reste du peptide - en particulier l'aspartate D357 qui établit une liaison ionique avec la chaîne latérale de l'arginine R17 - sont variables , sauf chez les domaines BD2 de Brd 2 , Brd 3 et Brd 4 . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résidus résidu NOM _ _ 32 subj _ _ _ _ _ 3 impliqués impliquer VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 dans dans PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 interaction interaction NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 avec avec PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 reste reste NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 du de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 peptide peptide NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 - - PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 13 en en particulier PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 14 particulier en particulier NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 l' le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 aspartate aspartame NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 17 D357 D357 NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 qui qui PRQ _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 19 établit établir VRB _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 une un DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 liaison liaison NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 ionique ionique ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 avec avec PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 chaîne chaîne NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 latérale latéral ADJ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 l' le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 29 arginine arminien ADJ _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 30 R17 R17 NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 31 - - PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 32 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 33 variables variable ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 , , PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 35 sauf sauf PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 36 chez chez PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 les le DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 domaines domaine NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 BD2 BD2 NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 de de PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 Brd Brd NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 2 2 NUM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 , , PUNC _ _ 44 punc _ _ _ _ _ 44 Brd Brd NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 45 3 3 NUM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 et et COO _ _ 47 mark _ _ _ _ _ 47 Brd Brd NOM _ _ 44 para _ _ _ _ _ 48 4 4 NUM _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 49 . . PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1618 # text = Au sein des domaines BD2 des protéines de la famille BET , les principaux résidus impliqués dans l'interaction avec le peptide H 3 -K 18 ac sont conservés à l'identique . 1 Au au sein de PRE _ _ 29 periph _ _ _ _ _ 2 sein au sein de DET _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 des au sein de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 domaines domaine NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD2 BD2 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 protéines protéine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 famille famille NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 BET BET NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 14 principaux principal ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 résidus résidu NOM _ _ 29 subj _ _ _ _ _ 16 impliqués impliquer VPP _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 dans dans PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 interaction interaction NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 avec avec PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 21 le le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 peptide peptide NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 H H NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 3 3 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 -K -K VPR _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 26 18 18 NUM _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 ac ace NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 sont être VRB _ _ 29 aux _ _ _ _ _ 29 conservés conserver VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 30 à à PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 l' le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 identique identique NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1619 # text = On note deux positions qui subissent un changement dont une est située dans la boucle BC . 1 On on CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 note noter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 deux deux NUM _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 positions position NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 qui qui PRQ _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 subissent subir VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 un un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 changement changement NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 dont dont PRQ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 une un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 est est NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 située situer VPP _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 dans dans PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 boucle boucle NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 BC BC NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1620 # text = A cette position , le glutamate E355 de Brdt-BD2 est substitué par un aspartate chez Brd 2 alors que le glutamate est conservé chez Brd 3 et Brd 4 . 1 A à PRE _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 cette ce DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 position position NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 glutamate glutamate NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 7 E355 E355 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 Brdt-BD2 Brdt-BD2 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 est être VRB _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 substitué substituer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 par par PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 un un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 aspartate aspartame NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 chez chez PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 Brd Brd NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 2 2 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 18 alors alors que CSU _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 que alors que CSU _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 20 le le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 glutamate glutamate NOM _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 22 est être VRB _ _ 23 aux _ _ _ _ _ 23 conservé conserver VPP _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 24 chez chez PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 Brd Brd NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 3 3 NUM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 28 Brd Brd NOM _ _ 25 para _ _ _ _ _ 29 4 4 NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1621 # text = Il est donc probable que la spécificité de Brdt-BD2 vis à vis du peptide H 3 -K 18 ac soit conservée au moins chez Brd 3 et Brd 4 . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 donc donc ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 probable probable ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 spécificité spécificité NOM _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 Brdt-BD2 Brdt-BD2 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 vis vis NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 à à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 vis vis NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 du de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 peptide peptide NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 H H NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 3 3 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 -K -K VPR _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 18 18 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 ac ace NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 soit être VRB _ _ 21 aux _ _ _ _ _ 21 conservée conserver VPP _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 22 au à+le PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 moins au moins NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 chez chez PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 25 Brd Brd NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 3 3 NUM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 28 Brd Brd NOM _ _ 25 para _ _ _ _ _ 29 4 4 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1622 # text = En accord avec cela , il a été montré que Brd 2 ne présente pas d'affinité pour l'histone H3 acétylée ( Kanno et al. , 2004 ) alors que Brd 4 reconnaît le peptide 1 En en accord avec PRE _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 accord en accord avec NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 avec en accord avec PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 cela cela PRQ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 6 il il CLS _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 7 a avoir VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 été être VPP _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 que que CSU _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 Brd Brd NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 12 2 2 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ne ne ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 présente présenter VRB _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 15 pas pas ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 d' de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 affinité affinité NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 pour pour PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 19 l' le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 histone histone NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 21 H3 H3 NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 acétylée acétylée NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 Kanno Kanno NOM _ _ 20 parenth _ _ _ _ _ 25 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 26 al. al. ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 2004 2004 NUM _ _ 24 para _ _ _ _ _ 29 ) ) PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 30 alors alors que CSU _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 31 que alors que CSU _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 32 Brd Brd NOM _ _ 34 subj _ _ _ _ _ 33 4 4 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 reconnaît reconnaître VRB _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 35 le le DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 peptide peptide NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1623 # text = H 3 -K 9 / K 14 ac avec une affinité similaire au peptide H 4 -K 5 / K 12 ac ( Dey et al. , 2003 ; Liu et al. , 2008 ) . 1 H heure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 3 3 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -K -K VPR _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 9 9 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 / sur PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 6 K K NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 14 14 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 ac ace NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 avec avec PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 une un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 affinité affinité NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 similaire similaire ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 au à PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 peptide peptide NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 H H NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 4 4 NUM _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 -K -K NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 5 5 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 / sur PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 20 K K NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 12 12 NUM _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 ac ace NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 24 Dey Dey NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 et et COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 26 al. Al NOM _ _ 24 para _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 28 2003 2003 NUM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 29 ; ; PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 30 Liu Liu NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 31 et et COO _ _ 32 mark _ _ _ _ _ 32 al. al. NOM _ _ 30 para _ _ _ _ _ 33 , , PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 34 2008 2008 NUM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 35 ) ) PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 36 . . PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1624 # text = Partie IV : 1 Partie partie NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 IV IV ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1625 # text = Discussion et perspectives 1 Discussion discussion NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 perspectives perspective NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1626 # text = Discussion et perspectives 1 Discussion discussion NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 perspectives perspective NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1627 # text = A . Importance du premier bromodomaine de Brdt 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Importance Importance NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 premier premier ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 bromodomaine brome NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 Brdt Brdt NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1628 # text = I. Brdt reconnaît l'histone H4 via son premier bromodomaine 1 I. I. NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 Brdt Brdt NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 reconnaît reconnaître VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 histone histone NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 H4 H4 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 via via PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 son son DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 9 premier premier ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 bromodomaine bromé NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1629 # text = Nous avons montré que l'affinité du premier bromodomaine de Brdt pour une queue N terminale synthétique de l'histone H4 tétra-acétylée tétra-acétylée est quasiment aussi forte que celle de l'ensemble de la partie N terminale de Brdt ( ? C-Brdt ) contenant les deux bromodomaines et leurs régions adjacentes ( respectivement 11 , 4 µM et 28 µM ) . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 que que CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 affinité affinité NOM _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 7 du de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 premier premier ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 bromodomaine brome NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 Brdt Brdt NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 pour pour PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 13 une un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 queue queue NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 N N NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 terminale terminal ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 synthétique synthétique ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 19 l' le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 histone histone NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 H4 H4 NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 tétra-acétylée tétra-acétylée NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 tétra-acétylée acétyle NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 24 est être VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 25 quasiment quasiment ADV _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 aussi aussi ADV _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 27 forte fort ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 28 que que CSU _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 celle celui PRQ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 de de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 l' le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 ensemble ensemble NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 de de PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 la le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 partie partie NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 N N NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 terminale terminal ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 de de PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 Brdt Brdt NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 ( ( PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 41 ? ? PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 42 C-Brdt C-Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 43 ) ) PUNC _ _ 42 punc _ _ _ _ _ 44 contenant contenir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 45 les le DET _ _ 47 spe _ _ _ _ _ 46 deux deux NUM _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 47 bromodomaines oromo NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 48 et et COO _ _ 50 mark _ _ _ _ _ 49 leurs son DET _ _ 50 spe _ _ _ _ _ 50 régions région NOM _ _ 47 para _ _ _ _ _ 51 adjacentes adjacent ADJ _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 52 ( ( PUNC _ _ 57 punc _ _ _ _ _ 53 respectivement respectivement ADV _ _ 57 dep _ _ _ _ _ 54 11 11 NUM _ _ 56 spe _ _ _ _ _ 55 , 11 , 4 PUNC _ _ 54 punc _ _ _ _ _ 56 4 4 NUM _ _ 57 spe _ _ _ _ _ 57 µM micro- NOM _ _ 50 parenth _ _ _ _ _ 58 et et COO _ _ 60 mark _ _ _ _ _ 59 28 28 NUM _ _ 60 spe _ _ _ _ _ 60 µM micro- NOM _ _ 57 para _ _ _ _ _ 61 ) ) PUNC _ _ 57 punc _ _ _ _ _ 62 . . PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1630 # text = Ces résultats sont en accord avec ceux obtenus par Pivot-Pajot et ses collègues , qui montrent que ? 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résultats résultat NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 sont être VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 4 en en accord avec PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 5 accord en accord avec NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 avec en accord avec PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 ceux celui PRQ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 obtenus obtenir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 par par PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 Pivot-Pajot Pivot-Pajot NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 12 ses son DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 collègues collègue NOM _ _ 10 para _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 15 qui qui PRQ _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 16 montrent montrer VRB _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 que que? PRQ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ? ? PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1631 # text = C-Brdt est co-purifié avec un peptide H4 tétra-acétylé mais que la co-purification n'a pas lieu si BD1 est inactivé ( Pivot-Pajot et al. , 2003 ) . 1 C-Brdt C-Brdt NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 co-purifié co- VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 avec avec PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 un un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 peptide peptide NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 H4 H4 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 mais mais ADV _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 que que CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 co-purification co- NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 13 n' ne ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 a avoir VRB _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 15 pas pas ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 lieu lieu NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 si si CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 18 BD1 BD1 NOM _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 19 est être VRB _ _ 20 aux _ _ _ _ _ 20 inactivé inactiver VPP _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 ( ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 Pivot-Pajot Pivot-Pajot NOM _ _ 20 parenth _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 24 al. al. ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 2003 2003 NUM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 27 ) ) PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1632 # text = Confortant la spécificité de BD1 pour la queue H4 , le domaine n'a pas montré d'affinité pour un peptide mimant la queue N terminale de l'histone H3 tétra-acétylée . 1 Confortant conforter VPR _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 2 la le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 spécificité spécificité NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD1 BD1 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 pour pour PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 queue queue NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 H4 H4 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 domaine domaine NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 13 n' ne ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 14 a avoir VRB _ _ 16 aux _ _ _ _ _ 15 pas pas ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 d' de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 affinité affinité NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 pour pour PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 un un DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 peptide peptide NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 mimant mimer VPR _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 queue queue NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 25 N N NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 terminale terminal ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 28 l' le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 histone histone NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 H3 H3 NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 tétra-acétylée tétra-acétyle NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1633 # text = La constante de dissociation pour la liaison du peptide H4 tétra-acétylé tétra-acétylé est comparable à celle déterminée pour la liaison du double bromodomaine de TAFII250 pour différents peptides H4 acétylés ou à celle du double bromodomaine de Bdf 1 pour les peptides H4 tétra-acétylés et H 3 -K 14 ac / K 18 ac [ Tableau 23 ] . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 constante constante NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 dissociation dissociation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 liaison liaison NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 peptide peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 H4 H4 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 tétra-acétylé tétra-acétylé NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 tétra-acétylé acétyle NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 comparable comparable ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 à à PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 celle celui PRQ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 déterminée déterminer ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 pour pour PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 liaison liaison NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 du de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 double double ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 23 bromodomaine oromo NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 TAFII250 TAFII250 NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 pour pour PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 27 différents différent DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 peptides peptide NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 H4 H4 NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 acétylés acétyle NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 ou ou COO _ _ 32 mark _ _ _ _ _ 32 à à PRE _ _ 26 para _ _ _ _ _ 33 celle celui PRQ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 du de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 double double ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 36 bromodomaine oromo NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 de de PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 Bdf Bdf NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 1 1 NUM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 pour pour PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 les le DET _ _ 42 spe _ _ _ _ _ 42 peptides peptide NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 43 H4 H4 NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 tétra-acétylés tétra NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 45 et et COO _ _ 46 mark _ _ _ _ _ 46 H H NOM _ _ 44 para _ _ _ _ _ 47 3 3 NUM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 -K -K VPR _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 49 14 14 NUM _ _ 50 spe _ _ _ _ _ 50 ac ace NOM _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 51 / sur PUNC _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 52 K K NOM _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 53 18 18 NUM _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 54 ac ac ADJ _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 55 [ ( PUNC _ _ 56 punc _ _ _ _ _ 56 Tableau Tableau NOM _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 57 23 23 NUM _ _ 56 dep _ _ _ _ _ 58 ] ) PUNC _ _ 52 punc _ _ _ _ _ 59 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1634 # text = Ainsi Brdt et Bdf 1 qui sont homologues et appartiennent tout les deux à la famille des protéines BET , pourraient avoir la même spécificité . 1 Ainsi ainsi CSU _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 2 Brdt Brdt NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 4 Bdf Bdf NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 5 1 1 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 qui qui PRQ _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 7 sont être VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 homologues homologuer VRB _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 appartiennent appartenir VRB _ _ 8 para _ _ _ _ _ 11 tout tout ADV _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 deux deux NUM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 14 à à PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 famille famille NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 des de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 protéines protéine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 BET BET NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 21 pourraient pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 avoir avoir VNF _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 24 même même ADJ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 spécificité spécificité NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1635 # text = Cependant , dans leur étude , 1 Cependant cependant ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 dans dans PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 leur son DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 étude étude NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1636 # text = A . Ladurner et ses collègues déterminent l'affinité de la protéine entière mais non celles des domaines BD1 et BD2 de façon indépendante . 1 A a NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Ladurner Ladurner NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 5 ses son DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 collègues collègue NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 7 déterminent déterminer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 affinité affinité NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 protéine protéine NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 entière entier ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 mais mais COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 15 non non ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 celles celui PRQ _ _ 12 para _ _ _ _ _ 17 des de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 domaines domaine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 BD1 BD1 NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 BD2 BD2 NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 23 façon façon NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 indépendante indépendant ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1637 # text = Tableau 23 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 23 23 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1638 # text = Affinités comparables à celles de Brdt-BD1 1 Affinités affinité NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 comparables comparable ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 à à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 celles celui PRQ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1639 # text = Nos résultats confirment l'association de Brdt et de l'histone H4 acétylée observé in-vivo par J. Govin et ses collègues . 1 Nos son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résultats résultat NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 confirment confirmer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 association association NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 Brdt Brdt NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 6 para _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 histone histone NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 H4 H4 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 acétylée acétylée NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 observé observer VPP _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 15 in-vivo in- ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 par par PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 J. J. NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 Govin Govin NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 20 ses son DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 collègues collègue NOM _ _ 17 para _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1640 # text = Ceux -ci ont montré que dans les spermatides la chromatine subit , avant sa compaction , une vague d'acétylation qui touche les histones H4 ( sur les lysines 5 , 8 et 12 ) et H2A et que Brdt est associé à ces régions hyperacétylées ( Govin et al. , 2006 ) . 1 Ceux celui PRQ _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 -ci -ci ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 ont avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 que que CSU _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 dans dans PRE _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 spermatides spermatide NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 chromatine chromatine NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 11 subit subir VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 13 avant avant PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 sa son DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 compaction compaction NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 17 une un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 vague vague NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 19 d' de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 acétylation acétylation NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 qui qui PRQ _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 22 touche toucher VRB _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 23 les le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 histones histone NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 H4 H4 NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 ( ( PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 sur sur PRE _ _ 24 parenth _ _ _ _ _ 28 les le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 lysines lysine NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 5 5 NUM _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 31 , 5 , 8 PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 32 8 8 NUM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 33 et et COO _ _ 34 mark _ _ _ _ _ 34 12 12 NUM _ _ 29 para _ _ _ _ _ 35 ) ) PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 36 et et COO _ _ 37 mark _ _ _ _ _ 37 H2A H2A NOM _ _ 24 para _ _ _ _ _ 38 et et COO _ _ 39 mark _ _ _ _ _ 39 que que CSU _ _ 5 para _ _ _ _ _ 40 Brdt Brdt NOM _ _ 42 subj _ _ _ _ _ 41 est être VRB _ _ 42 aux _ _ _ _ _ 42 associé associer VPP _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 43 à à PRE _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 ces ce DET _ _ 45 spe _ _ _ _ _ 45 régions région NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 46 hyperacétylées hyperacétylées ADJ _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 ( ( PUNC _ _ 48 punc _ _ _ _ _ 48 Govin Govin NOM _ _ 45 parenth _ _ _ _ _ 49 et et COO _ _ 52 mark _ _ _ _ _ 50 al. al. ADV _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 51 , , PUNC _ _ 52 punc _ _ _ _ _ 52 2006 2006 NUM _ _ 48 para _ _ _ _ _ 53 ) ) PUNC _ _ 48 punc _ _ _ _ _ 54 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1641 # text = L'importance de BD1 est encore mise en évidence par une étude qui montre que dans une souris dont seul le premier bromodomaine a été inactivé , le nombre des spermatides dont la chromatine est condensée chute considérablement et que leur morphologie est sévèrement altérée ( Shang et al. , 2007 ) . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 importance importance NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 BD1 BD1 NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 est être VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 6 encore encore ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 mise mettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 en en PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 évidence évidence NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 par par PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 une un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 étude étude NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 qui qui PRQ _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 14 montre montrer VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 que que CSU _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 dans dans PRE _ _ 37 periph _ _ _ _ _ 17 une un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 souris souris NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 dont dont PRQ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 20 seul seul ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 21 le le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 22 premier premier ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 23 bromodomaine brome NOM _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 24 a avoir VRB _ _ 25 aux _ _ _ _ _ 25 été être VPP _ _ 26 aux _ _ _ _ _ 26 inactivé inactiver VPP _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 40 punc _ _ _ _ _ 28 le le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 nombre nombre NOM _ _ 37 subj _ _ _ _ _ 30 des de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 spermatides spermatide NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 dont dont PRQ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 33 la le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 chromatine chromatine NOM _ _ 36 subj _ _ _ _ _ 35 est être VRB _ _ 36 aux _ _ _ _ _ 36 condensée condenser VPP _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 37 chute chuter VRB _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 38 considérablement considérablement ADV _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 et et COO _ _ 40 mark _ _ _ _ _ 40 que que CSU _ _ 15 para _ _ _ _ _ 41 leur son DET _ _ 42 spe _ _ _ _ _ 42 morphologie morphologie NOM _ _ 45 subj _ _ _ _ _ 43 est être VRB _ _ 45 aux _ _ _ _ _ 44 sévèrement sévèrement ADV _ _ 45 periph _ _ _ _ _ 45 altérée altérer VPP _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 46 ( ( PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 47 Shang Shang NOM _ _ 12 parenth _ _ _ _ _ 48 et et COO _ _ 51 mark _ _ _ _ _ 49 al. al. ADV _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 , , PUNC _ _ 51 punc _ _ _ _ _ 51 2007 2007 NUM _ _ 47 para _ _ _ _ _ 52 ) ) PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 53 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1642 # text = II . Brdt-BD1 reconnaît spécifiquement le motif di-acétylé K 5 / K 8 ac de H4 1 II ii NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 reconnaît reconnaître VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 spécifiquement spécifiquement ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 le le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 motif motif NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 di-acétylé NUMBER-acétyle NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 K K NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 5 5 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 / sur PUNC _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 K K NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 8 8 NUM _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 ac ace NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 H4 H4 NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1643 # text = Nous avons identifié les déterminants nécessaires et suffisants à la reconnaissance du peptide H4 tétra-acétylé par Brdt-BD1 . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 identifié identifier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 déterminants déterminant NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 nécessaires nécessaire ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 8 suffisants suffisant ADJ _ _ 6 para _ _ _ _ _ 9 à à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 du de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 peptide peptide NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 H4 H4 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 par par PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1644 # text = Nos résultats montrent que BD1 a besoin , pour établir une interaction significative , de la présence d'une di-acétylation de la queue H4 et qu'il ne montre pas d'affinité comparable pour les peptides H4 mono-acétylés . 1 Nos son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résultats résultat NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 montrent montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 que que CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD1 BD1 NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 a avoir VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 besoin besoin NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 9 pour pour PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 établir établir VNF _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 une un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 interaction interaction NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 significative significatif ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 présence présence NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 d' de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 une un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 di-acétylation di-acétylation NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 la le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 queue queue NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 H4 H4 NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 et et COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 26 qu' que CSU _ _ 4 para _ _ _ _ _ 27 il il CLS _ _ 29 subj _ _ _ _ _ 28 ne ne ADV _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 29 montre montrer VRB _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 30 pas pas de DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 31 d' pas de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 affinité affinité NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 33 comparable comparable ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 pour pour PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 les le DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 peptides peptide NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 H4 H4 NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 mono-acétylés mono- NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1645 # text = BD1 reconnaît préférentiellement la di-acétylation des lysines K5 / K8 de H4 avec une affinité qui souligne la spécificité de l'interaction . 1 BD1 BD1 NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 reconnaît reconnaître VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 préférentiellement préférentiellement ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 di-acétylation NUMBER-acétylation NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 lysines lysine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 K5 K5 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 / / PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 K8 K8 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 H4 H4 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 avec avec PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 une un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 affinité affinité NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 qui qui PRQ _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 17 souligne souligner VRB _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 spécificité spécificité NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 l' le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 interaction interaction NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1646 # text = Ces résultats sont cohérents avec l'état hyperacétylé de l'histone H4 dans les spermatides allongés et la détection majoritaire de l'acétylation des lysines 5 , 8 et 12 ( Govin et al. , 2006 ) . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résultats résultat NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 cohérents cohérent ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 avec avec PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 état état NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 hyperacétylé hyper- NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 histone histone NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 H4 H4 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 dans dans PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 les le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 spermatides spermatide NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 allongés allonger ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 détection détection NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 20 majoritaire majoritaire ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 l' le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 acétylation acétylation NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 des de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 lysines lysine NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 5 5 NUM _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 27 , 5 , 8 PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 28 8 8 NUM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 29 et et COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 30 12 12 NUM _ _ 28 para _ _ _ _ _ 31 ( ( PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 32 Govin Govin NOM _ _ 25 parenth _ _ _ _ _ 33 et et COO _ _ 36 mark _ _ _ _ _ 34 al. al. ADV _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 36 2006 2006 NUM _ _ 32 para _ _ _ _ _ 37 ) ) PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 38 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1647 # text = B . Le second bromodomaine de Brdt reconnaît la modification H 3 K 18 ac 1 B b NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Le Le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 4 second second ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 bromodomaine oromo NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 Brdt Brdt NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 reconnaît reconnaître VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 modification modification NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 H H NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 3 3 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 K K NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 14 18 18 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 ac ace NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1648 # text = Le second bromodomaine de Brdt présente une affinité pour la queue de l'histone H3 tétra-acétylée ( Kd = 214 µM ) et ne montre pas d'affinité significative pour la queue H4 acétylée . 1 Le le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 second second ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 bromodomaine oromo NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 Brdt Brdt NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 présente présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 une un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 affinité affinité NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 pour pour PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 queue queue NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 l' le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 histone histone NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 H3 H3 NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 tétra-acétylée tétra-acétyle NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 ( ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 18 Kd Kd NOM _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 19 = égaler VRB _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 20 214 214 NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 µM micro- NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 ) ) PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 24 ne ne ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 montre montrer VRB _ _ 6 para _ _ _ _ _ 26 pas pas ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 d' de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 affinité affinité NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 significative significatif ADJ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 pour pour PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 31 la le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 queue queue NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 H4 H4 NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 acétylée acétylée NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1649 # text = Bien que dix fois plus faible que celle de BD1 pour la queue H4 , cette affinité a pu être mesurée pour plusieurs peptides différents portant une acétylation de la lysine K18 . 1 Bien bien que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 que bien que CSU _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 3 dix dix NUM _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 fois fois NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 plus plus ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 faible faible ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 que que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 celle celui PRQ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 BD1 BD1 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 pour pour PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 queue queue NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 H4 H4 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 16 cette ce DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 affinité affinité NOM _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 18 a avoir VRB _ _ 19 aux _ _ _ _ _ 19 pu pouvoir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 être être VNF _ _ 21 aux _ _ _ _ _ 21 mesurée mesurer VPP _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 pour pour PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 plusieurs plusieurs DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 peptides peptide NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 différents différent ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 portant porter VPR _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 une un DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 acétylation acétylation NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 la le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 lysine lysine NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 K18 K18 NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1650 # text = Une seule acétylation est suffisante pour induire une reconnaissance similaire à celle observée pour le peptide H3 tetra-acétylé . 1 Une un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 seule seul ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 acétylation acétylation NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 suffisante suffisant ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 pour pour PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 induire induire VNF _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 une un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 similaire similaire ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 à à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 celle celui PRQ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 observée observer VPP _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 pour pour PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 le le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 peptide peptide NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 H3 H3 NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 tetra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1651 # text = L'affinité observée est comparable à celle du bromodomaine de Gcn 5 pour différents peptides mono-acétylés ( Kd ~ 900 µM ) ( Hudson et al. , 2000 ) , à celle de P / CAF pour 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 affinité affinité NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 observée observer ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 comparable comparable ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 à à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 celle celui PRQ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 bromodomaine bromé NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 Gcn Gcn NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 5 5 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 pour pour PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 14 différents différent DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 peptides peptide NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 mono-acétylés mono- NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 ( ( PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 Kd Kd NOM _ _ 4 parenth _ _ _ _ _ 19 ~ environ ADV _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 20 900 900 NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 µM micro- NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 ) ) PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 Hudson Hudson NOM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 25 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 26 al. al. ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 2000 2000 NUM _ _ 24 para _ _ _ _ _ 29 ) ) PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 30 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 31 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 32 celle celui PRQ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 de de PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 P P NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 / ou PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 36 CAF CAF NOM _ _ 34 para _ _ _ _ _ 37 pour pour PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1652 # text = H 4 -K 8 ac ( Kd = 346 µM ) ( Dhalluin et al. , 1999 ) ou à celles mesurées entre les bromodomaines de CBP et P / CAF et différents peptides H3 et H4 mono-acétylés 1 H heure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -K -K VPR _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 8 8 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 ac ace NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 7 Kd Kd NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 = égaler VRB _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 9 346 346 NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 µM micro- NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Dhalluin Dhalluin NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 15 al. al. ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 1999 1999 NUM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 19 ou ou COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 20 à à PRE _ _ 1 para _ _ _ _ _ 21 celles celui PRQ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 mesurées mesurer VPP _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 entre entre PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 les le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 bromodomaines brome NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 CBP CBP NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 et et COO _ _ 29 mark _ _ _ _ _ 29 P P NOM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 30 / ou PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 31 CAF CAF NOM _ _ 29 para _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 34 mark _ _ _ _ _ 33 différents différent DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 peptides peptide NOM _ _ 25 para _ _ _ _ _ 35 H3 H3 NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 et et COO _ _ 37 mark _ _ _ _ _ 37 H4 H4 NOM _ _ 35 para _ _ _ _ _ 38 mono-acétylés mono- NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1653 # text = ( Kd entre 128 et 402 µM ) ( Zeng and Zhou , 2008 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 2 Kd Kd NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 3 entre entre PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 128 128 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 6 402 402 NUM _ _ 4 para _ _ _ _ _ 7 µM micro- NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 9 ( ( PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 10 Zeng Zeng NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 11 and zeng and zhou NOM _ _ 12 parenth _ _ _ _ _ 12 Zhou Zhou NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 2008 2008 NUM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 15 ) ) PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1654 # text = L'affinité de Brdt pour un peptide H3 acétylé est partagée par Brd 4 ( Dey et al. , 2003 ) et Bdf 1 . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 affinité affinité NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 Brdt Brdt NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 un un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 peptide peptide NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 H3 H3 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 acétylé acétylé NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 est être VRB _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 partagée partager VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 par par PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 Brd Brd NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 4 4 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 ( ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 Dey Dey NOM _ _ 13 parenth _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 18 al. al. ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 2003 2003 NUM _ _ 16 para _ _ _ _ _ 21 ) ) PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 23 Bdf Bdf NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 24 1 1 NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1655 # text = Ce dernier montre une forte affinité pour un peptide di-acétylé sur les lysines 1 Ce ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 dernier dernier ADJ _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 une un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 forte fort ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 affinité affinité NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 un un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 peptide peptide NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 di-acétylé NUMBER-acétyle NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 sur sur PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 lysines lysine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1656 # text = K14 et K18 ( Kd ~ 14 µM ) ( Ladurner et al. , 2003 ) . 1 K14 K14 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 K18 K18 NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Kd Kd NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 6 ~ environ ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 14 14 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 µM micro- NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 10 ( ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 Ladurner Ladurner NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 13 al. al. ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 2003 2003 NUM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 16 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1657 # text = Soulignant encore une fois la différence fonctionnelle entre Brdt et Brd 2 , Brd 2 ne présente pas d'affinité pour la queue H 3 ( Kanno et al. , 2004 ) . 1 Soulignant souligner VPR _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 2 encore encore ADV _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 une une fois DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 fois une fois PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 différence différence NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 fonctionnelle fonctionnel ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 entre entre PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 Brdt Brdt NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 Brd Brd NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 12 2 2 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 14 Brd Brd NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 15 2 2 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 ne ne ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 présente présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 pas pas ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 d' de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 affinité affinité NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 pour pour PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 22 la le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 queue queue NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 24 H H NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 3 3 NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 ( ( PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 Kanno Kanno NOM _ _ 23 parenth _ _ _ _ _ 28 et et COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 29 al. al. ADV _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 , , PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 31 2004 2004 NUM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 32 ) ) PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1658 # text = Compte tenu de l'affinité relativement faible de Brdt-BD2 pour H 3 K 18 ac , nous pouvons envisager que ce ne soit pas là son substrat le plus important du point de vue physiologique . 1 Compte compte tenu de ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 tenu compte tenu de PRE _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 3 de compte tenu de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 affinité affinité NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 relativement relativement ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 faible faible ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 Brdt-BD2 Brdt-BD2 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 pour pour PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 11 H H NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 3 3 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 K K NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 18 18 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 ac ace NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 17 nous nous CLS _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 18 pouvons pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 envisager envisager VNF _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 que que CSU _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 ce ce CLS _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 22 ne ne ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 23 soit être VRB _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 24 pas pas ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 là là ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 son son DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 substrat substrat NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 28 le le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 29 plus plus ADV _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 30 important important ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 31 du de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 32 point point NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 de de PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 vue vue NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 physiologique physiologique ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 36 . . PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1659 # text = Cependant la sélectivité de l'interaction pour la lysine acétylée H 3 K 18 ac indique que BD2 reconnaît préférentiellement cette région . 1 Cependant cependant ADV _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 2 la le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 sélectivité sélectivité NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 interaction interaction NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 pour pour PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 lysine lysine NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 acétylée acétyle NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 H H NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 3 3 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 K K NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 14 18 18 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 15 ac ac ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 16 indique indiquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 que que CSU _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 BD2 BD2 NOM _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 19 reconnaît reconnaître VRB _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 préférentiellement préférentiellement ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 cette ce DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 région région NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1660 # text = Nous verrons comment la structure tridimensionnelle du complexe BD 2 / H 3 -K 18 ac peut aider à définir les déterminants de cette sélectivité . 1 Nous nous CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 verrons voir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 comment comment? ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 structure structure NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 tridimensionnelle tridimensionnel ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 du de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 complexe complexe NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 BD BD NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 2 2 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 / ou PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 12 H H NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 13 3 3 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 -K -K VPR _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 18 18 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 ac ace NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 peut pouvoir VRB _ _ 2 para _ _ _ _ _ 18 aider aider VNF _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 à à PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 définir définir VNF _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 les le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 déterminants déterminant NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 cette ce DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 sélectivité sélectivité NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1661 # text = C . Comparaison des affinités de Brdt avec celles des autres protéines de la famille BET 1 C c NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Comparaison Comparaison NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 affinités affinité NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 Brdt Brdt NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 avec avec PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 celles celui PRQ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 autres autre ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 protéines protéine NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 famille famille NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 BET BET NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1662 # text = Nous avons vu au chapitre précédent que la conservation des séquences des domaines BD1 de la famille BET est telle que , si le mode de fixation des peptides était identique , il est très probable que la capacité de fixer le peptide H 4 -K 5 K 8 ac observée pour Brdt soit conservée . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 vu voir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 au à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 chapitre chapitre NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 précédent précédent ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 que que CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 conservation conservation NOM _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 séquences séquence NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 des de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 domaines domaine NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 BD1 BD1 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 famille famille NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 BET BET NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 est être VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 20 telle tel ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 que que CSU _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 23 si si CSU _ _ 34 periph _ _ _ _ _ 24 le le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 mode mode NOM _ _ 30 subj _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 fixation fixation NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 des de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 peptides peptide NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 était être VRB _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 31 identique identique ADJ _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 33 il il CLS _ _ 34 subj _ _ _ _ _ 34 est être VRB _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 35 très très ADV _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 36 probable probable ADJ _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 que que CSU _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 38 la le DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 capacité capacité NOM _ _ 55 subj _ _ _ _ _ 40 de de PRE _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 fixer fixer VNF _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 le le DET _ _ 43 spe _ _ _ _ _ 43 peptide peptide NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 44 H H NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 4 4 NUM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 46 -K -K VPR _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 47 5 5 NUM _ _ 48 spe _ _ _ _ _ 48 K K NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 49 8 8 NUM _ _ 50 spe _ _ _ _ _ 50 ac ace NOM _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 51 observée observer VPP _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 52 pour pour PRE _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 53 Brdt Brdt NOM _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 54 soit être VRB _ _ 55 aux _ _ _ _ _ 55 conservée conserver VPP _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 56 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1663 # text = Des études concernant les protéines Brd 2 , Brd 3 , Brd 4 , Bdf 1 et Bdf 2 montrent d'ailleurs que la reconnaissance de l'histone H4 est probablement un caractère commun à toutes les protéines de la famille BET ( voir l'introduction ) . 1 Des de PRE _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 2 études étude NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 concernant concerner VPR _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 protéines protéine NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 Brd Brd NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 2 2 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 9 Brd Brd NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 3 3 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 12 Brd Brd NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 13 4 4 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 15 Bdf Bdf NOM _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 16 1 1 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 18 Bdf Bdf NOM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 19 2 2 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 montrent montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 d' d'ailleurs PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 ailleurs d'ailleurs NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 que que CSU _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 30 subj _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 l' le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 histone histone NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 H4 H4 NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 est être VRB _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 31 probablement probablement ADV _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 un un DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 caractère caractère NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 34 commun commun ADJ _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 à à PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 toutes tout ADJ _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 37 les le DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 protéines protéine NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 39 de de PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 la le DET _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 41 famille famille NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 BET BET NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 ( ( PUNC _ _ 44 punc _ _ _ _ _ 44 voir voir VNF _ _ 20 parenth _ _ _ _ _ 45 l' le DET _ _ 46 spe _ _ _ _ _ 46 introduction introduction NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 47 ) ) PUNC _ _ 44 punc _ _ _ _ _ 48 . . PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1664 # text = Cependant les lysines acétylées précisément reconnues par chacun des bromodomaines de Brd 3 , Brd 4 , Bdf 1 et Bdf 2 restent à identifier . 1 Cependant cependant ADV _ _ 23 periph _ _ _ _ _ 2 les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 lysines lysine NOM _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 4 acétylées acétyle NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 précisément précisément ADV _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 6 reconnues reconnaître VPP _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 par par PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 chacun chacun PRQ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 des un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 bromodomaines brome NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 Brd Brd NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 3 3 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 15 Brd Brd NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 4 4 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 18 Bdf Bdf NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 19 1 1 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 Bdf Bdf NOM _ _ 10 para _ _ _ _ _ 22 2 2 NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 restent rester VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 à à PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 identifier identifier VNF _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1665 # text = a . Brd 4 1 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Brd Brd NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 4 4 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1666 # text = De façon identique à Brdt , le domaine BD1 de Brd 4 porte une glycine à l'une des deux positions variables de la boucle BC ( voir le chapitre 3 des résultats ) . 1 De de PRE _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 2 façon façon NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 identique identique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 Brdt Brdt NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 domaine domaine NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 9 BD1 BD1 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 Brd Brd NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 4 4 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 porte porter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 une un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 glycine glycine NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 à à PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 l' l'un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 une l'un PRQ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 des de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 deux deux NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 positions position NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 variables variable ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 boucle boucle NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 BC BC NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 ( ( PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 voir voir VNF _ _ 13 parenth _ _ _ _ _ 29 le le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 chapitre chapitre NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 3 3 NUM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 des de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 résultats résultat NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 ) ) PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1667 # text = Une étude montre que Brd 4 possède la capacité de fixer un peptide di-acétylé H 4 -K 5 K 12 ac mais pas H 4 -K 12 ac ( le peptide H 4 -K 5 K 8 ac n'a pas été testé dans cette étude ) ( Dey et al. , 2003 ) . 1 Une un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 étude étude NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 que que CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 Brd Brd NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 6 4 4 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 possède posséder VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 capacité capacité NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 fixer fixer VNF _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 un un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 peptide peptide NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 di-acétylé NUMBER-acétyle NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 H H NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 4 4 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 -K -K VPR _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 5 5 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 K K NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 12 12 NUM _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 ac ac NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 mais mais COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 23 pas pas ADV _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 H H NOM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 25 4 4 NUM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 -K -K VPR _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 12 12 NUM _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 ac ace NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 ( ( PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 30 le le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 peptide peptide NOM _ _ 43 subj _ _ _ _ _ 32 H H NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 4 4 NUM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 -K -K VPR _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 35 5 5 NUM _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 K K NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 8 8 NUM _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 ac ace NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 n' ne ADV _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 40 a avoir VRB _ _ 42 aux _ _ _ _ _ 41 pas pas ADV _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 42 été être VPP _ _ 43 aux _ _ _ _ _ 43 testé tester VPP _ _ 19 parenth _ _ _ _ _ 44 dans dans PRE _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 cette ce DET _ _ 46 spe _ _ _ _ _ 46 étude étude NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 47 ) ) PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 48 ( ( PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 49 Dey Dey NOM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 50 et et COO _ _ 51 mark _ _ _ _ _ 51 al. Al NOM _ _ 49 para _ _ _ _ _ 52 , , PUNC _ _ 53 punc _ _ _ _ _ 53 2003 2003 NUM _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 54 ) ) PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 55 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1668 # text = Ces affinités sont comparables à celles de Brdt puisque nous avons montré que bien qu'avec un affinité faible , le peptide H 4 -K 5 K 12 ac est également fixé par 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 affinités affinité NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 comparables comparable ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 celles celui PRQ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 Brdt Brdt NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 puisque puisque CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 10 nous nous CLS _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 11 avons avoir VRB _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 12 montré montrer VPP _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 que que CSU _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 bien bien que CSU _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 qu' bien que CSU _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 16 avec avec PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 un un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 affinité affinité NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 faible faible ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 21 le le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 peptide peptide NOM _ _ 30 subj _ _ _ _ _ 23 H H NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 4 4 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 -K -K VPR _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 26 5 5 NUM _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 K K NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 12 12 NUM _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 ac ace NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 est être VRB _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 31 également également ADV _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 fixé fixé NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 par par NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1669 # text = Brdt-BD1 . 1 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1670 # text = Il est donc envisageable que Brd 4 -BD1 et Brdt-BD1 partagent la même spécificité . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 donc donc ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 envisageable envisageable ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 Brd Brd NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 7 4 4 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 -BD1 -BD1 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 11 partagent partager VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 13 même même ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 spécificité spécificité NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1671 # text = b . Brd 2 1 b b NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Brd Brd NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 2 2 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1672 # text = Le cas Brd 2 est le mieux étudié . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 cas cas NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 Brd Brd NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 2 2 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 est être VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 6 le le mieux DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 mieux le mieux ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 étudié étudier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1673 # text = Il a été montré : 1 Il il CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 a avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 été être VPP _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 : : PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1674 # text = i . in-vivo par FRET que la protéine reconnaît spécifiquement l'histone H4 acétylée sur la lysine K   12 et que l'inactivation de l'un de ses deux bromodomaine provoque la réduction du transfert de fluorescence observée pour la protéine sauvage de 50 % environ ( Kanno   et   al. ,   2004 ) . 1 i i NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 in-vivo in- ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 par par PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 FRET FRET NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 que que CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 protéine protéine NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 9 reconnaît reconnaître VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 spécifiquement spécifiquement ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 l' le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 histone histone NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 H4 H4 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 acétylée acétylée NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 sur sur PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 lysine lysine NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 K K NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19     12 DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 12 12 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 22 que que CSU _ _ 6 para _ _ _ _ _ 23 l' le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 inactivation inactivation NOM _ _ 32 subj _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 l' le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 un un PRQ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 ses son DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 deux deux NUM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 bromodomaine oromo NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 provoque provoquer VRB _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 33 la le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 réduction réduction NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 du de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 transfert transfert NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 de de PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 fluorescence fluorescence NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 observée observer VPP _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 40 pour pour PRE _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 la le DET _ _ 42 spe _ _ _ _ _ 42 protéine protéine NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 43 sauvage sauvage ADJ _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 de de PRE _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 45 50 50 NUM _ _ 46 spe _ _ _ _ _ 46 % pourcent NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 47 environ environ ADV _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 ( ( PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 49 Kanno Kanno NOM _ _ 42 parenth _ _ _ _ _ 50     ADJ _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 51 et et COO _ _ 52 mark _ _ _ _ _ 52     NOM _ _ 49 para _ _ _ _ _ 53 al. al. ADJ _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 54 , , PUNC _ _ 56 punc _ _ _ _ _ 55     2004 DET _ _ 56 spe _ _ _ _ _ 56 2004 2004 NUM _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 57 ) ) PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 58 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1675 # text = ii . 1 ii if NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1676 # text = que son premier bromodomaine Brd 2 -BD1 forme in-vivo et in-vitro un dimère en solution et que l'intégrité de ce dimère conditionne la fixation du peptide H 4 -K 12 ac ( Nakamura et al. , 2007 ) . 1 que que CSU _ _ 30 subj _ _ _ _ _ 2 son son DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 3 premier premier ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 bromodomaine bromé NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 5 Brd Brd NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 2 2 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 -BD1 -BD1 ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 forme former VRB _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 9 in-vivo in- ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 in-vitro in- VRB _ _ 8 para _ _ _ _ _ 12 un un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 dimère dimère NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 en en PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 solution solution NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 que que CSU _ _ 1 para _ _ _ _ _ 18 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 intégrité intégrité NOM _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 ce ce DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 dimère dimère NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 conditionne conditionner VRB _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 fixation fixation NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 du de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 peptide peptide NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 H H NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 4 4 NUM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 31 12 12 NUM _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 ac ace NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 ( ( PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 34 Nakamura Nakamura NOM _ _ 32 parenth _ _ _ _ _ 35 et et COO _ _ 36 mark _ _ _ _ _ 36 al. Al NOM _ _ 34 para _ _ _ _ _ 37 , , PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 38 2007 2007 NUM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 ) ) PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 40 . . PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1677 # text = Les auteurs de cette étude proposent que le site acide qui est formé à l'interface des deux molécules sert à fixer un résidu basique de la queue H4 ( K8 , K16 ou 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 auteurs auteur NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 cette ce DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 étude étude NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 proposent proposer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 que que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 site site NOM _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 10 acide acide ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 qui qui PRQ _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 12 est être VRB _ _ 13 aux _ _ _ _ _ 13 formé former VPP _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 14 à à PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 l' le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 interface interface NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 des de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 deux deux NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 molécules molécule NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 sert servir VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 21 à à PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 fixer fixer VNF _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 un un DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 résidu résidu NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 basique basique ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 la le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 queue queue NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 H4 H4 NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 ( ( PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 31 K8 K8 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 32 , , PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 33 K16 K16 NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 ou ou COO _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1678 # text = R17 par exemple ) et que le dimère fixe peut-être les queues N terminales de deux histones H4 . 1 R17 R17 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 par par PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 exemple exemple NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 6 que que PRQ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 dimère dimère NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 9 fixe fixer VRB _ _ 2 para _ _ _ _ _ 10 peut-être peut-être ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 queues queue NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 13 N N NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 terminales terminal ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 deux deux NUM _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 histones histone NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 H4 H4 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1679 # text = iii . 1 iii ici ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1680 # text = que son second bromodomaine Brd 2 -BD2 reconnaît parmi les peptides 1 que que? PRQ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 2 son son DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 3 second second ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 bromodomaine oromo NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 5 Brd Brd NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 2 2 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 -BD2 -BD2 ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 reconnaît reconnaître VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 parmi parmi PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 les le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 peptides peptide NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1681 # text = H 2B -K 5 ac , H 4 -K 8 ac et H 4 -K 12 ac préférentiellement H 4 -K 12 ac ( Kd~ 2 , 9 mM ) et qu'il se trouve in-vitro sous forme monomèrique en solution ( Huang et al. , 2007 ) . 1 H heure NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 2B 2B NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 5 5 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ac ac NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 7 H H NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 4 4 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 -K -K VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 10 8 8 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 11 ac ac ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 13 H H NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 14 4 4 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 15 -K -K NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 16 12 12 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 17 ac ace NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 18 préférentiellement préférentiellement ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 19 H H NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 20 4 4 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 21 -K -K VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 22 12 12 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 23 ac ac NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 24 ( ( PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 25 Kd~ Kd~ NOM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 26 2 2 NUM _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 27 , 2 , 9 PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 9 9 NUM _ _ 26 para _ _ _ _ _ 29 mM mM ADV _ _ 28 para _ _ _ _ _ 30 ) ) PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 31 et et COO _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 32 qu' que PRQ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 33 il il CLS _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 34 se se CLI _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 35 trouve trouver VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 36 in-vitro in- VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 37 sous sous PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 38 forme forme NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 monomèrique monomèrique ADJ _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 en en PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 solution solution NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 ( ( PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 43 Huang Huang NOM _ _ 41 parenth _ _ _ _ _ 44 et et COO _ _ 47 mark _ _ _ _ _ 45 al. al. ADV _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 , , PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 47 2007 2007 NUM _ _ 43 para _ _ _ _ _ 48 ) ) PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 49 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1682 # text = iv . 1 iv ive NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1683 # text = Plusieurs structures en complexe avec des peptides H4 acétylés sur la lysine 12 sont disponibles dans la PDB ( PDB : 2DVQ , 2DVR , 2DVS ) . 1 Plusieurs plusieurs DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structures structure NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 3 en en PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 complexe complexe NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 avec avec PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 des un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 peptides peptide NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 H4 H4 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 acétylés acétylés NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 sur sur PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 lysine lysine NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 12 12 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 disponibles disponible ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 dans dans PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 PDB PDB NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 20 PDB PDB NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 : : PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 22 2DVQ 2DVQ NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 24 2DVR 2DVR NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 2DVS 2DVS NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 27 ) ) PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1684 # text = L'analyse de l'une d'elle , un complexe entre Brd 2 -BD1 et un peptide 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 analyse analyse NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 l' l'un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 une l'un PRQ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 d' de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 elle lui PRQ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 9 un un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 complexe complexe NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 11 entre entre PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 Brd Brd NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 2 2 NUM _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 -BD1 -BD1 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 16 un un DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 peptide peptide NOM _ _ 10 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1685 # text = H 4 -K 12 ac dont les résidus 1 à 15 sont visibles [ PDB : 2DVQ ] indique que le peptide prend à la surface du site un chemin légèrement différent de celui du peptide H4 dans le cas du complexe avec Brdt ( comparer les peptides rouge et vert clair sur la Figure 47 ) . 1 H heure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -K -K VPR _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 12 12 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 ac ace NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 dont dont PRQ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 résidus résidu NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 9 1 1 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 15 15 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 sont être VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 13 visibles visible ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 [ ( PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 15 PDB PDB NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 : : PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 17 2DVQ 2DVQ NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 ] ) PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 19 indique indiquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 que que? PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 le le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 peptide peptide NOM _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 23 prend prendre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 à à PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 la le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 surface surface NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 du de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 site site NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 un un DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 chemin chemin NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 31 légèrement légèrement ADV _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 32 différent différent ADJ _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 de de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 34 celui celui PRQ _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 du de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 peptide peptide NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 H4 H4 NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 dans dans PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 39 le le DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 cas cas NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 du de PRE _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 complexe complexe ADJ _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 avec avec PRE _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 Brdt Brdt NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 ( ( PUNC _ _ 46 punc _ _ _ _ _ 46 comparer comparer VNF _ _ 42 parenth _ _ _ _ _ 47 les le DET _ _ 48 spe _ _ _ _ _ 48 peptides peptide NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 49 rouge rouge NOM _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 et et COO _ _ 51 mark _ _ _ _ _ 51 vert vert NOM _ _ 48 para _ _ _ _ _ 52 clair clair ADJ _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 53 sur sur PRE _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 54 la le DET _ _ 55 spe _ _ _ _ _ 55 Figure Figure NOM _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 56 47 47 NUM _ _ 55 dep _ _ _ _ _ 57 ) ) PUNC _ _ 46 punc _ _ _ _ _ 58 . . PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1686 # text = Dans cette structure 1 Dans dans PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 cette ce DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 structure structure NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1687 # text = Brd 2 -BD1 forme un dimère qui fixe deux peptides H 4 -K 12 ac . 1 Brd Brd NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 2 2 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 -BD1 -BD1 NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 forme former VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 un un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 dimère dimère NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 qui qui PRQ _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 fixe fixer VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 deux deux NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 peptides peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 H H NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 4 4 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 -K -K VPR _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 12 12 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 ac ace NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1688 # text = Le premier peptide place sa lysine acétylée acK 12 dans le site de fixation classique d'un des bromodomaine et sa lysine K8 se place effectivement dans le site acide formé à l'interface du dimère . 1 Le le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 premier premier ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 peptide peptide NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 place placer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 sa son DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 lysine lysine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 acétylée acétyle NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 acK acK ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 12 12 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 site site NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 fixation fixation NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 classique classique ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 d' de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 un un PRQ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 des de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 bromodomaine oromo NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 21 sa son DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 lysine lysine NOM _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 23 K8 K8 NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 se se CLI _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 place placer VRB _ _ 4 para _ _ _ _ _ 26 effectivement effectivement ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 dans dans PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 le le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 site site NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 acide acide ADJ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 formé former ADJ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 à à PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 33 l' le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 interface interface NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 du de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 dimère dimère NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1689 # text = Le site hydrophobe de la seconde molécule du dimère est occupé par la lysine acétylée K 12 ac du second peptide . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 site site NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 6 seconde second ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 molécule molécule NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 dimère dimère NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 est être VRB _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 occupé occuper VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 par par PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 lysine lysine NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 acétylée acétyle NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 K K NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 12 12 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 18 ac ace NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 du de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 second second ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 peptide peptide NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1690 # text = Aucune liaison ionique ne s'établit entre le peptide 1 Aucune aucun DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 liaison liaison NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 ionique ionique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ne ne ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 5 s' s' CLI _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 établit établir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 entre entre PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 peptide peptide NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1691 # text = H 4 -K 12 ac et Brd 2 -BD1 . 1 H heure NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 12 12 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 ac ace NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 Brd Brd NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 8 2 2 NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 -BD1 -BD1 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1692 # text = Le peptide est stabilisé par l'interaction hydrophobe de la lysine acétylée , des liaisons hydrogène avec la chaîne principale du peptide et avec la chaîne latérale de la lysine K8 . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 peptide peptide NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 stabilisé stabiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 par par PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 interaction interaction NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 lysine lysine NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 acétylée acétyle NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 15 liaisons liaison NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 hydrogène hydrogène NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 avec avec PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 chaîne chaîne NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 principale principal ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 du de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 peptide peptide NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 24 avec avec PRE _ _ 17 para _ _ _ _ _ 25 la le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 chaîne chaîne NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 latérale latéral ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 la le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 lysine lysine NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 K8 K8 NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1693 # text = Nous avons essayé de savoir si un seul peptide di-acétylé en K5 / K12 pouvait occuper ces trois sites . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 essayé essayer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 savoir savoir VNF _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 si si CSU _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 un un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 8 seul seul ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 peptide peptide NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 10 di-acétylé NUMBER-acétyle NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 en en PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 K5 K5 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 / ou PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 K12 K12 NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 15 pouvait pouvoir VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 16 occuper occuper VNF _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 ces ce DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 18 trois trois NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 sites site NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1694 # text = La distance entre le site de la lysine 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 distance distance NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 entre entre PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 le le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 site site NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 lysine lysine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1695 # text = 8 et le second site de fixation est égal à environ 13 Å ( mesure entre les 1 8 8 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 le le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 4 second second ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 site site NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 fixation fixation NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 égal égal ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 à à PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 environ environ ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 12 13 13 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 Å Å NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 mesure mesure NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 16 entre entrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 les le CLI _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1696 # text = C ? 1 C C NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1697 # text = des résidus K8 et K 12 ac ) . 1 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 2 résidus résidu NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 K8 K8 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 K K NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 12 12 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 ac ace NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1698 # text = La distance entre les C ? 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 distance distance NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 entre entre PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 C C NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 ? ? PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1699 # text = des résidus Kac 5 et Kac 8 du peptide H 4 -K 5 / K 8 ac dans la structure en complexe avec 1 des de PRE _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 résidus résidu NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 Kac Kac NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 5 5 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 6 Kac Kac NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 7 8 8 NUM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 peptide peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 H H NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 4 4 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 5 5 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 / sur PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 15 K K NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 8 8 NUM _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 ac ace NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 dans dans PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 structure structure NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 en en PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 complexe complexe NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 avec avec ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1700 # text = Brdt-BD1 est égale à 8 , 5 Å environ . 1 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 égale égal ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 8 8 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 6 , 8 , 5 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 5 5 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 Å Å NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 environ environ ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1701 # text = La distance entre le site acide et le second site hydrophobe est donc un peu longue . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 distance distance NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 3 entre entre PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 le le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 site site NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 acide acide ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 9 second second ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 site site NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 11 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 donc donc ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 un un peu ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 peu un peu ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 longue long ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1702 # text = Mais compte tenu que la distance parcourue par la chaîne peptidique des résidus Kac 5 à Kac 8 est extensible en fonction de la conformation des glycines qui la composent et que le chemin suivi à la surface du dimère peut varier légèrement , il en envisageable que le dimère puisse fixer le peptide 1 Mais maïs NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 compte compte NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 tenu tenir ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 que que PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 distance distance NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 parcourue parcourir VPP _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 par par PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 chaîne chaîne NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 peptidique peptidique ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 des de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 résidus résidu NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 Kac Kac NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 5 5 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 à à PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 Kac Kac NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 8 8 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 est est NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 extensible extensible ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 en en PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 22 fonction fonction NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 conformation conformation NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 des de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 glycines glycine NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 qui qui PRQ _ _ 30 subj _ _ _ _ _ 29 la le CLI _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 30 composent composer VRB _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 31 et et COO _ _ 41 mark _ _ _ _ _ 32 que que PRQ _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 33 le le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 chemin chemin NOM _ _ 41 subj _ _ _ _ _ 35 suivi suivre ADJ _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 à à PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 la le DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 surface surface NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 du de PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 dimère dimère NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 peut pouvoir VRB _ _ 30 para _ _ _ _ _ 42 varier varier VNF _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 légèrement légèrement ADV _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 , , PUNC _ _ 51 punc _ _ _ _ _ 45 il il CLS _ _ 0 root _ _ _ _ _ 46 en en PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 47 envisageable envisageable ADJ _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 48 que queComp? PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 49 le le DET _ _ 50 spe _ _ _ _ _ 50 dimère dimère ADJ _ _ 51 subj _ _ _ _ _ 51 puisse pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 52 fixer fixer VNF _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 53 le le DET _ _ 54 spe _ _ _ _ _ 54 peptide peptide NOM _ _ 52 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1703 # text = H 4 -K 5 / K 12 ac en enfouissant les deux lysines acétylées dans chacun de ses sites hydrophobes et la lysine K8 dans le site acide de l'interface . 1 H heure NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 5 5 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 / / PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 K K NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 12 12 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 ac ace NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 en le CLI _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 enfouissant enfouir VPR _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 12 deux deux NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 lysines lysine NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 acétylées acétyle NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 dans dans PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 16 chacun chacun PRQ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ses son DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 sites site NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 hydrophobes hydrophobe ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 22 la le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 lysine lysine NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 24 K8 K8 NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 dans dans PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 le le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 site site NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 acide acide ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 l' le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 interface interface NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1704 # text = Quoi qu'il en soit , il semble qu'il existe entre Brdt et Brd 2 une différence de spécificité puisque Brd 2 reconnaît spécifiquement le peptide mono-acétylé H 4 -K 12 ac alors que Brdt a besoin d'une double acétylation de l'histone H4 . 1 Quoi quoi? PRQ _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 qu' que PRQ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 3 il il CLS _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 4 en le CLI _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 soit être VRB _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 7 il il CLS _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 semble sembler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 qu' que CSU _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 il il CLS _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 11 existe exister VRB _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 entre entre PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 Brdt Brdt NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 Brd Brd NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 16 2 2 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 une un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 différence différence NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 spécificité spécificité NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 puisque puisque CSU _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 22 Brd Brd NOM _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 23 2 2 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 reconnaît reconnaître VRB _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 25 spécifiquement spécifiquement ADV _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 le le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 peptide peptide NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 28 mono-acétylé mono- NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 H H NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 4 4 NUM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 31 -K -K VPR _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 32 12 12 NUM _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 ac ace NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 alors alors que CSU _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 35 que alors que CSU _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 36 Brdt Brdt NOM _ _ 37 subj _ _ _ _ _ 37 a avoir VRB _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 besoin besoin NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 d' de PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 une un DET _ _ 42 spe _ _ _ _ _ 41 double double ADJ _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 42 acétylation acétylation NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 43 de de PRE _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 l' le DET _ _ 45 spe _ _ _ _ _ 45 histone histone NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 46 H4 H4 NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1705 # text = Il apparaît aussi que Brd 2 -BD1 forme un dimère en solution alors que nous avons montré que ce n'est pas le cas pour Brdt-BD1 . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 apparaît apparaître VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 aussi aussi ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 Brd Brd NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 6 2 2 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 -BD1 -BD1 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 forme former VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 un un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 dimère dimère NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 en en PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 solution solution NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 alors alors que CSU _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 que alors que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 15 nous nous CLS _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 16 avons avoir VRB _ _ 17 aux _ _ _ _ _ 17 montré montrer VPP _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 que que CSU _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 ce ce CLS _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 20 n' ne ADV _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 est être VRB _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 pas pas ADV _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 le le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 cas cas NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 25 pour pour PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1706 # text = Les différences importantes de fonction existant entre les deux protéines peuvent expliquer cela . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 différences différence NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 importantes important ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 fonction fonction NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 existant exister VPR _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 entre entre PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 9 deux deux NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 protéines protéine NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 peuvent pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 expliquer expliquer VNF _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 cela cela PRQ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1707 # text = Alors que Brd 2 est exprimée dans tout les tissus , Brdt est exprimée spécifiquement dans les testicules ( Shang et al. , 2004 ) . 1 Alors alors que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 que alors que CSU _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 3 Brd Brd NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 2 2 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 est est NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 exprimée exprimer VPP _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 dans dans PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 tout tout PRQ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 tissus tissu NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 12 Brdt Brdt NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 13 est être VRB _ _ 14 aux _ _ _ _ _ 14 exprimée exprimer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 spécifiquement spécifiquement ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 dans dans PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 les le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 testicules testicule NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 Shang Shang NOM _ _ 18 parenth _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 22 al. al. ADV _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 2004 2004 NUM _ _ 20 para _ _ _ _ _ 25 ) ) PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1708 # text = Brd 2 est associée à l'euchromatine mais largement exclue de l'hétérochromatine ( Crowley et al. , 2002 ; Denis et al. , 2000 ; Mattsson et al. , 2002 ) , au contraire Brdt s'associe avec l'hétérochromatine ( Govin et al. , 2006 ) . 1 Brd Brd NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 2 2 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 est est NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 associée associer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 l' le NOM _ _ 7 det _ _ _ _ _ 7 euchromatine le NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 mais mais COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 9 largement largement ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 exclue exclu NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 l' le NOM _ _ 13 det _ _ _ _ _ 13 hétérochromatine le NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 Crowley Crowley NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 19 mark _ _ _ _ _ 17 al. al. ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 2002 2002 NUM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 20 ; ; PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 21 Denis Denis NOM _ _ 25 periph _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 23 al. al. NOM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 25 2000 2000 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 ; ; PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 27 Mattsson Mattsson NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 et et COO _ _ 29 mark _ _ _ _ _ 29 al. al. NOM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 30 , , PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 31 2002 2002 NUM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 32 ) ) PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 33 , , PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 34 au à+le PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 35 contraire au contraire ADV _ _ 38 periph _ _ _ _ _ 36 Brdt Brdt NOM _ _ 38 subj _ _ _ _ _ 37 s' s' CLI _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 38 associe associer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 39 avec avec PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 l' le NOM _ _ 41 det _ _ _ _ _ 41 hétérochromatine le NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 ( ( PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 43 Govin Govin NOM _ _ 41 parenth _ _ _ _ _ 44 et et COO _ _ 45 mark _ _ _ _ _ 45 al. al. NOM _ _ 43 para _ _ _ _ _ 46 , , PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 47 2006 2006 NUM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 48 ) ) PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 49 . . PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1709 # text = Brd 2 est capable d'activer la transcription de plusieurs promoteurs alors que Brdt intervient dans un phénomène de compaction de la chromatine ( LeRoy et al. , 2008 ; Pivot-Pajot et al. , 2003 ) . 1 Brd Brd NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 2 2 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 est est NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 capable capable ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 d' de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 activer activer VNF _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 transcription transcription NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 plusieurs plusieurs DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 promoteurs promoteur NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 alors alors que CSU _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 que alors que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 14 Brdt Brdt NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 15 intervient intervenir VRB _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 dans dans PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 un un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 phénomène phénomène NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 compaction compaction NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 la le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 chromatine chromatine NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 ( ( PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 25 LeRoy LeRoy NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 29 mark _ _ _ _ _ 27 al. al. ADV _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 29 2008 2008 NUM _ _ 25 para _ _ _ _ _ 30 ; ; PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 31 Pivot-Pajot Pivot-Pajot NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 33 mark _ _ _ _ _ 33 al. al. NOM _ _ 31 para _ _ _ _ _ 34 , , PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 35 2003 2003 NUM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 36 ) ) PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1710 # text = Il se pourrait aussi que la différence des spécificité observée s'explique par la différence des techniques utilisées ( le FRET dans le cas Brd 2 et l'ITC dans le cas de Brdt ) et le fait que les peptides testés ne soient pas exactement les mêmes ( par exemple le peptide H 4 -K 5 K 8 ac n'a pas été testé dans l'étude de Brd 2 ) . 1 Il il CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 se se CLI _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 aussi aussi ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 que que CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 différence différence NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 8 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 spécificité spécificité NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 observée observer ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 s' s' CLI _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 explique expliquer VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 13 par par PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 différence différence NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 des de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 techniques technique NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 utilisées utiliser ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 20 le le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 FRET FRET NOM _ _ 17 parenth _ _ _ _ _ 22 dans dans PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 le le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 cas cas NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 Brd Brd NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 2 2 NUM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 29 mark _ _ _ _ _ 28 l' le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 ITC ITC NOM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 30 dans dans PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 31 le le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 cas cas NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 de de PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 Brdt Brdt NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 36 et et COO _ _ 38 mark _ _ _ _ _ 37 le le DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 fait fait NOM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 39 que que CSU _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 les le DET _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 41 peptides peptide NOM _ _ 44 subj _ _ _ _ _ 42 testés tester ADJ _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 ne ne ADV _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 44 soient être VRB _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 45 pas pas ADV _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 exactement exactement ADV _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 47 les le DET _ _ 48 spe _ _ _ _ _ 48 mêmes même ADJ _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 49 ( ( PUNC _ _ 65 punc _ _ _ _ _ 50 par par exemple PRE _ _ 65 periph _ _ _ _ _ 51 exemple par exemple ADV _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 52 le le DET _ _ 53 spe _ _ _ _ _ 53 peptide peptide NOM _ _ 65 subj _ _ _ _ _ 54 H H NOM _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 55 4 4 NUM _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 56 -K -K VPR _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 57 5 5 NUM _ _ 58 spe _ _ _ _ _ 58 K K NOM _ _ 56 dep _ _ _ _ _ 59 8 8 NUM _ _ 60 spe _ _ _ _ _ 60 ac ac NOM _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 61 n' ne ADV _ _ 65 dep _ _ _ _ _ 62 a avoir VRB _ _ 64 aux _ _ _ _ _ 63 pas pas ADV _ _ 65 dep _ _ _ _ _ 64 été être VPP _ _ 65 aux _ _ _ _ _ 65 testé tester VPP _ _ 48 parenth _ _ _ _ _ 66 dans dans PRE _ _ 65 dep _ _ _ _ _ 67 l' le DET _ _ 68 spe _ _ _ _ _ 68 étude étude NOM _ _ 66 dep _ _ _ _ _ 69 de de PRE _ _ 68 dep _ _ _ _ _ 70 Brd Brd NOM _ _ 69 dep _ _ _ _ _ 71 2 2 NUM _ _ 65 dep _ _ _ _ _ 72 ) ) PUNC _ _ 65 punc _ _ _ _ _ 73 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1711 # text = D . Déterminants structuraux à l'origine de la spécificité des bromodomaines de Brdt 1 D d NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Déterminants Déterminants NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 structuraux structural ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 origine origine NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 spécificité spécificité NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 des un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 bromodomaines brome NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 Brdt Brdt NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1712 # text = I. Importance de la boucle BC 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Importance Importance NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 boucle boucle NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 BC BC NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1713 # text = a . Analyse structurale par la comparaison des structures de BD1 et BD2 1 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Analyse Analyse NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 structurale structural ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 par par PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 comparaison comparaison NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 structures structure NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 BD1 BD1 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 BD2 BD2 NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1714 # text = Nous avons observé pour BD1 un mode de liaison faisant intervenir la fixation de deux acétyl-lysines . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 observé observer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD1 BD1 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 un un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 mode mode NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 liaison liaison NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 faisant faire VPR _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 intervenir intervenir VNF _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 fixation fixation NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 deux deux NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 acétyl-lysines acétyle-lysine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1715 # text = La discrimination du peptide et le choix de H4 en particulier est principalement gouvernée par la capacité de la chaîne peptidique à établir des interactions hydrophobes par l'intermédiaire de la deuxième acétylation AcK 8 1 La le DET _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 2 discrimination discrimination NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 3 du de PRE _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 4 peptide peptide NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 6 le le DET _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 7 choix choix NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 9 H4 H4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 10 en en PRE _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 11 particulier particulier NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 12 est être VRB _ _ 14 aux _ _ _ _ _ 13 principalement principalement ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 gouvernée gouverner VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 par par PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 capacité capacité NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 chaîne chaîne NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 peptidique peptidique ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 à à PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 établir établir VNF _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 des un DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 interactions interaction NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 hydrophobes hydrophobe ADJ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 par par PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 l' le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 intermédiaire intermédiaire NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 de de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 la le DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 32 deuxième deuxième NUM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 33 acétylation acétylation NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 34 AcK AcK NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 8 8 NUM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1716 # text = ( K + 3 ) et de la leucine L10 ( K + 5 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 2 K K NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 + + 3 PRE _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 4 3 3 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 2 para _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 leucine leucine NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 L10 L10 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 K K NOM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 13 + + 5 PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 5 5 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1717 # text = Dans le cas de BD2 , la discrimination du peptide passe par une liaison ionique avec l'arginine R17 ( K- 1 ) et des interactions hydrophobes avec la leucine 1 Dans dans PRE _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 le le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 cas cas NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD2 BD2 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 discrimination discrimination NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 9 du de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 peptide peptide NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 passe passer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 par par PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 une un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 liaison liaison NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 ionique ionique ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 avec avec PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 17 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 18 arginine arminien ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 R17 R17 NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 K- K- NOM _ _ 19 parenth _ _ _ _ _ 22 1 1 NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 25 des de PRE _ _ 16 para _ _ _ _ _ 26 interactions interaction NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 hydrophobes hydrophobe ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 avec avec PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 la le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 leucine leucine NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1718 # text = L20 ( K + 2 ) , l'alanine 21 ( K + 3 ) et la thréonine T22 ( K + 4 ) mais aussi avec la proline P16 ( K- 2 ) . 1 L20 L20 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 K K NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 + + 2 PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 2 2 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 alanine alanine NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 10 21 21 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 K K NOM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 13 + + 3 PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 3 3 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 thréonine thréonine NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 19 T22 T22 NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 K K NOM _ _ 18 parenth _ _ _ _ _ 22 + + 4 PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 4 4 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 25 mais mais COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 26 aussi aussi ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 avec avec PRE _ _ 18 para _ _ _ _ _ 28 la le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 proline pro- NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 P16 P16 NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 ( ( PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 32 K- K- NOM _ _ 29 parenth _ _ _ _ _ 33 2 2 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 ) ) PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1719 # text = Pourtant la cavité principale ainsi que le site hydrophobe secondaire sont conservés chez BD1 et BD2 . 1 Pourtant pourtant ADV _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 la le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 cavité cavité NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 4 principale principal ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ainsi ainsi que COO _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 que ainsi que COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 site site NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 9 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 secondaire secondaire ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 sont être VRB _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 12 conservés conserver VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 chez chez PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 BD1 BD1 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 16 mark _ _ _ _ _ 16 BD2 BD2 NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1720 # text = Les majeures différences entre les sites de fixation se réduisent à trois substitutions adjacentes portées par la boucle BC . 1 Les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 majeures majeur ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 différences différence NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 4 entre entre PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 sites site NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 fixation fixation NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 se se CLI _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 réduisent réduire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 à à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 trois trois NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 substitutions substitution NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 adjacentes adjacent ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 portées porter VPP _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 par par PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 boucle boucle NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 BC BC NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1721 # text = Aux résidus G111 , D112 et D113 de BD1 se substituent les résidus D354 , E355 et H356 de BD2 . 1 Aux à PRE _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 résidus résidu NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 G111 G111 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 D112 D112 NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 D113 D113 NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 9 BD1 BD1 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 se se CLI _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 substituent substituer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 résidus résidu NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 14 D354 D354 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 E355 E355 NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 18 H356 H356 NOM _ _ 16 para _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 20 BD2 BD2 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1722 # text = Les acides D112 et D113 de BD1 ( qui constituent une surface d'interaction pour la chaîne principale du peptide H4 ) sont remplacés par un glutamate et une histidine chez BD2 . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 acides acide NOM _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 3 D112 D112 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 D113 D113 NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 BD1 BD1 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 9 qui qui PRQ _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 10 constituent constituer VRB _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 11 une un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 surface surface NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 d' de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 interaction interaction NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 pour pour PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 chaîne chaîne NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 principale principal ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 du de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 peptide peptide NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 H4 H4 NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 ) ) PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 23 sont être VRB _ _ 24 aux _ _ _ _ _ 24 remplacés remplacer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 par par PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 un un DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 glutamate glutamate NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 et et COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 29 une un DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 histidine histidine NOM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 31 chez chez PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 BD2 BD2 NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1723 # text = Cela entraîne un encombrement stérique qui empêcherait le passage de la chaîne du peptide H 4 . 1 Cela cela PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 entraîne entraîner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 un un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 encombrement encombrement NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 stérique stérique ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 qui qui PRQ _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 7 empêcherait empêcher VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 passage passage NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 chaîne chaîne NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 du de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 peptide peptide NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 H H NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 4 4 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1724 # text = Dans le site de BD2 , le peptide H3 emprunte ainsi un chemin plus en surface qui semble incompatible avec la fixation d'une seconde lysine acétylée 1 Dans dans PRE _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 le le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 site site NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD2 BD2 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 peptide peptide NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 9 H3 H3 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 emprunte emprunter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 ainsi ainsi ADV _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 un un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 chemin chemin NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 plus plus ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 en en PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 surface surface NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 qui qui PRQ _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 18 semble sembler VRB _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 19 incompatible incompatible ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 avec avec PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 la le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 fixation fixation NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 d' de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 une un DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 25 seconde second ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 26 lysine lysine NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 27 acétylée acétyle NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1725 # text = [ Figure   50 ] . 1 [ ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Figure Figure VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3     50 DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 50 50 NUM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 5 ] ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1726 # text = Enfin , la substitution de l'aspartate D354 de BD2 par la glycine G111 chez BD1 fait que la liaison ionique qui existe entre l'arginine R17 du peptide H3 et le résidu D354 de BD2 ne pourrait s'établir dans le cas d'un complexe BD1 / H3 . 1 Enfin enfin ADV _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 substitution substitution NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 aspartate aspartame NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 D354 D354 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 BD2 BD2 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 par par PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 glycine glycine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 G111 G111 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 chez chez PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 BD1 BD1 NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 fait faire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 que que CSU _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 liaison liaison NOM _ _ 38 subj _ _ _ _ _ 21 ionique ionique ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 qui qui PRQ _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 23 existe exister VRB _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 24 entre entre PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 l' le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 26 arginine arminien ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 27 R17 R17 NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 28 du de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 peptide peptide NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 H3 H3 NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 et et COO _ _ 33 mark _ _ _ _ _ 32 le le DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 résidu résidu NOM _ _ 29 para _ _ _ _ _ 34 D354 D354 NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 de de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 BD2 BD2 NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 ne ne ADV _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 38 pourrait pouvoir VRB _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 39 s' s' CLI _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 40 établir établir VNF _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 dans dans PRE _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 le le DET _ _ 43 spe _ _ _ _ _ 43 cas cas NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 44 d' de PRE _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 un un DET _ _ 46 spe _ _ _ _ _ 46 complexe complexe NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 47 BD1 BD1 NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 / ou PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 49 H3 H3 NOM _ _ 47 para _ _ _ _ _ 50 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1727 # text = Nous avons pourtant mesuré pour les domaines BD1 et BD2 des affinités comparables vis à vis du peptide 1 Nous nous CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 3 pourtant pourtant ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 mesuré mesurer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 pour pour PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 domaines domaine NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 BD1 BD1 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 BD2 BD2 NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 11 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 affinités affinité NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 comparables comparable ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 vis vis NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 vis vis NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 du de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 peptide peptide NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1728 # text = H3 tetra-acétylé . 1 H3 H3 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 tetra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1729 # text = Il est possible que BD1 compense la perte de la liaison ionique par sa capacité à fixer une seconde lysine acétylée . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 possible possible ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 BD1 BD1 NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 compense compenser VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 perte perte NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 liaison liaison NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 ionique ionique ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 par par PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 sa son DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 capacité capacité NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 à à PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 fixer fixer VNF _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 une un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 19 seconde second ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 lysine lysine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 acétylée acétyle NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1730 # text = b . Importance de la boucle BC pour la spécificité de BD1 1 b b NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Importance Importance NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 boucle boucle NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 BC BC NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 pour pour PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 spécificité spécificité NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 BD1 BD1 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1731 # text = Dans le but de vérifier l'importance des résidus de la boucle BC des bromodomaines BD1 et BD2 pour la reconnaissance du ligand , nous avons conçu un mutant de la protéine BD1 ( BD 1 mutBC ) dont la boucle 1 Dans dans le but de PRE _ _ 27 periph _ _ _ _ _ 2 le dans le but de DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 but dans le but de NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 de dans le but de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 vérifier vérifier VNF _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 importance importance NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 résidus résidu NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 boucle boucle NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 BC BC NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 des de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 bromodomaines brome NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 BD1 BD1 NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 18 BD2 BD2 NOM _ _ 16 para _ _ _ _ _ 19 pour pour PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 du de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 ligand ligand NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 25 nous nous CLS _ _ 27 subj _ _ _ _ _ 26 avons avoir VRB _ _ 27 aux _ _ _ _ _ 27 conçu concevoir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 28 un un DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 mutant mutant NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 de de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 la le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 protéine protéine NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 BD1 BD1 NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 ( ( PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 35 BD BD NOM _ _ 32 parenth _ _ _ _ _ 36 1 1 NUM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 mutBC mutBC ADJ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 ) ) PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 39 dont dont PRQ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 40 la le DET _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 41 boucle boucle NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1732 # text = BC ( résidus K109 , T110 , G111 , D112 , D113 et I114 ) serait remplacée par celle de BD2 ( résidus P352 , P353 , D354 , H355 , E356 et V357 ) . 1 BC BC NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 résidus résidu NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 K109 K109 NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 T110 T110 NOM _ _ 4 para _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 G111 G111 NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 D112 D112 NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 D113 D113 NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 I114 I114 NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 15 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 16 serait être VRB _ _ 17 aux _ _ _ _ _ 17 remplacée remplacer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 par par PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 celle celui PRQ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 BD2 BD2 NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 ( ( PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 résidus résidu NOM _ _ 21 parenth _ _ _ _ _ 24 P352 P352 NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 P353 P353 NOM _ _ 24 para _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 D354 D354 NOM _ _ 26 para _ _ _ _ _ 29 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 30 H355 H355 NOM _ _ 28 para _ _ _ _ _ 31 , , PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 32 E356 E356 NOM _ _ 30 para _ _ _ _ _ 33 et et COO _ _ 34 mark _ _ _ _ _ 34 V357 V357 NOM _ _ 30 para _ _ _ _ _ 35 ) ) PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 36 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1733 # text = Les affinités la protéine BD 1 mutBC pour les peptides H 4 -K 5 ac , H 4 -K 5 K 8 ac et H 3 -K 18 ac ont été mesurées par ITC [ Tableau 24 ] . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 affinités affinité NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 protéine protéine NOM _ _ 32 subj _ _ _ _ _ 5 BD BD NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 1 1 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 mutBC mutBC VPR _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 pour pour PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 peptides peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 H H NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 4 4 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 -K -K ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 5 5 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 ac ac ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 17 H H NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 4 4 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 5 5 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 K K NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 8 8 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 ac ac ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 25 H H NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 3 3 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 27 -K -K ADV _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 28 18 18 NUM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 29 ac ace NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 30 ont avoir VRB _ _ 31 aux _ _ _ _ _ 31 été être VPP _ _ 32 aux _ _ _ _ _ 32 mesurées mesurer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 33 par par PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 ITC ITC NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 [ ( PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 36 Tableau Tableau NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 24 24 NUM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 ] ) PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 39 . . PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1734 # text = Elles montrent que la sélectivité du mutant vis-à-vis de la diacétylation est réduite plus de 9 fois par rapport à celle du domaine BD1 ( 1010 / 195 par rapport à > 1000 / 22 ) . 1 Elles elles CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 montrent montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 sélectivité sélectivité NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 6 du de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 mutant mutant NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 vis-à-vis vis-à-vis de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de vis-à-vis de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la laid NOM _ _ 11 det _ _ _ _ _ 11 diacétylation laid NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 est être VRB _ _ 13 aux _ _ _ _ _ 13 réduite réduire VPP _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 14 plus plus ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 9 9 NUM _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 fois fois NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 par par rapport à PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 19 rapport par rapport à NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 à par rapport à PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 celle celui PRQ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 du de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 domaine domaine NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 BD1 BD1 NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 ( ( PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 26 1010 1010 NUM _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 27 / 1010 / 195 PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 28 195 195 NUM _ _ 23 parenth _ _ _ _ _ 29 par par rapport à PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 rapport par rapport à NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 à par rapport à PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 > > VNF _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 33 1000 1000 NUM _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 34 / 1000 / 22 PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 35 22 22 NUM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 36 ) ) PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1735 # text = Ce qui représente une perte de fonction significative . 1 Ce ce PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 qui qui PRQ _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 représente représenter VRB _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 une un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 perte perte NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 fonction fonction NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 significative significatif ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1736 # text = Par ailleurs , l'affinité du mutant pour le peptide 1 Par par ailleurs PRE _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 ailleurs par ailleurs ADV _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 affinité affinité NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 du de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 mutant mutant NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 pour pour PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 le le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 peptide peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1737 # text = H 3 -K 18 ac est similaire à celle des domaines BD1 et BD2 sauvages ( respectivement 360 , 390 et 251 µM ) . 1 H heure NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 2 3 3 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -K -K VPR _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 18 18 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 ac ace NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 similaire similaire ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 celle celui PRQ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 domaines domaine NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 BD1 BD1 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 BD2 BD2 NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 15 sauvages sauvage ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 17 respectivement respectivement ADV _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 18 360 360 NUM _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 19 , 360 , 390 PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 20 390 390 NUM _ _ 11 parenth _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 22 251 251 NUM _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 µM micro- NOM _ _ 20 para _ _ _ _ _ 24 ) ) PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1738 # text = Nous n'avons pas déterminé l'affinité de BD1 le peptide H 3 -K 18 ac mono-acétylé mais il serait intéressant de le faire pour savoir si cela représente un gain de fonction pour BD1 . 1 Nous nous CLS _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 n' ne ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 3 avons avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 4 pas pas ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 déterminé déterminer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 affinité affinité NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 BD1 BD1 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 le le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 peptide peptide NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 H H NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 3 3 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 -K -K VPR _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 18 18 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 ac ace NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 mono-acétylé mono- NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 mais mais COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 19 il il CLS _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 20 serait être VRB _ _ 5 para _ _ _ _ _ 21 intéressant intéressant ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 le le CLI _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 24 faire faire VNF _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 pour pour PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 savoir savoir VNF _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 si si CSU _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 cela cela PRQ _ _ 29 subj _ _ _ _ _ 29 représente représenter VRB _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 un un DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 gain gain NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 de de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 fonction fonction NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 pour pour PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 35 BD1 BD1 NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1739 # text = Tableau 24 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 24 24 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1740 # text = Comparaison des affinités de BD1 et du mutant 1 Comparaison comparaison NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 affinités affinité NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD1 BD1 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 du de PRE _ _ 2 para _ _ _ _ _ 8 mutant mutant NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1741 # text = BD 1 mutBC 1 BD bd NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 1 1 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 mutBC mutBC NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1742 # text = c . Importance de la boucle BC in-vivo 1 c c NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Importance Importance NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 boucle boucle NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 BC BC NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 in-vivo in- VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1743 # text = S. Kochbin et ses collègues ont réalisé les mêmes mutations sur la protéine ? 1 S. S. NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 2 Kochbin Kochbin NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 4 ses son DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 collègues collègue NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 6 ont avoir VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 réalisé réaliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 9 mêmes même ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 mutations mutation NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 sur sur PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 protéine protéine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 ? ? PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1744 # text = C-Brdt couplée à la GFP ( ? C-Brdt-BD 1 mut 2 ) et ont étudié par recouvrement de fluorescence après blanchiment ( FRAP ) sa mobilité dans un noyau dont la chromatine est hyperacétylée . 1 C-Brdt C-Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 couplée coupler VPP _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 à à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 GFP GFP NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 8 C-Brdt-BD C-Brdt-BD NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 1 1 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 mut mouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 2 2 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 ont avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 étudié étudier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 par par PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 recouvrement recouvrement NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 fluorescence fluorescence NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 après après PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 21 blanchiment blanchiment NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 ( ( PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 FRAP FRAP NOM _ _ 21 parenth _ _ _ _ _ 24 ) ) PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 25 sa son DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 mobilité mobilité NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 27 dans dans PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 un un DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 noyau noyau NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 dont dont PRQ _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 31 la le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 chromatine chromatine NOM _ _ 33 subj _ _ _ _ _ 33 est être VRB _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 34 hyperacétylée hyperacétylée ADJ _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1745 # text = On observe un recouvrement de fluorescence pour le mutant beaucoup plus rapide que pour la protéine sauvage [ Figure 51 ] . 1 On on CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 observe observer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 un un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 recouvrement recouvrement NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 fluorescence fluorescence NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 mutant mutant NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 beaucoup beaucoup ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 plus plus ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 rapide rapide ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 que que CSU _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 pour pour PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 protéine protéine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 sauvage sauvage ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 [ ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 Figure Figure NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 51 51 NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 ] ) PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1746 # text = Cette mobilité accrue indique que l'association du mutant à la chromatine est fortement diminuée et confirme l'importance de la boucle BC de BD1 pour la fixation de la chromatine hyperacétylée . 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 mobilité mobilité NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 accrue accru ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 indique indiquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 que que CSU _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 association association NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 mutant mutant NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 à à PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 chromatine chromatine NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 est être VRB _ _ 15 aux _ _ _ _ _ 14 fortement fortement ADV _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 15 diminuée diminuer VPP _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 confirme confirmer VRB _ _ 15 para _ _ _ _ _ 18 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 importance importance NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 la le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 boucle boucle NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 BC BC NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 BD1 BD1 NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 pour pour PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 27 la le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 fixation fixation NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 la le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 chromatine chromatine NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 hyperacétylée hyperacétylée ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1747 # text = II . BD2 et la di-acétylation 1 II ii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 BD2 BD2 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 di-acétylation di-acétylation NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1748 # text = La superposition des complexes de Brdt-BD 1 / H 4 -K 5 K 8 ac et Brdt-BD 2 / H 3 -K 18 ac montre que la leucine L20 du peptide H3 occupe le site hydrophobe de l'acK 8 du peptide H4 . 1 La le DET _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 superposition superposition NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 4 complexes complexe ADJ _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 6 Brdt-BD Brdt-BD NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 7 1 1 NUM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 8 / / PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 9 H H NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 10 4 4 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 5 5 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 K K NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 8 8 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 ac ac ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 17 Brdt-BD Brdt-BD NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 18 2 2 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 19 / / PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 20 H H NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 21 3 3 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 22 -K -K VRB _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 23 18 18 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 24 ac ace NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 25 montre montrer VRB _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 26 que que CSU _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 la le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 leucine leucine NOM _ _ 33 subj _ _ _ _ _ 29 L20 L20 NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 du de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 peptide peptide NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 H3 H3 NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 occupe occuper VRB _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 34 le le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 site site NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 de de PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 l' le DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 acK acK NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 8 8 NUM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 du de PRE _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 peptide peptide NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 H4 H4 NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1749 # text = [ Figure 50 ] . 1 [ ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Figure Figure VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 50 50 NUM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 4 ] ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 5 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1750 # text = On peut alors se demander si BD2 , comme BD1 , est capable de fixer une di-acétylation . 1 On on CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 peut pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 alors alors ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 se se CLI _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 demander demander VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 si si CSU _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 BD2 BD2 NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 9 comme comme PRE _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 10 BD1 BD1 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 12 est être VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 13 capable capable ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 fixer fixer VNF _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 une un DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 di-acétylation di-acétylation NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1751 # text = Par ITC nous avons montré que les affinités de BD2 pour H3 tétra-acétylé , H 3 -K 18 ac , H 3 -K 18 K 23 ac et H 3 -K 14 K 18 ac sont similaires . 1 Par par PRE _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 ITC ITC NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 nous nous CLS _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 4 avons avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 que que CSU _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 affinités affinité NOM _ _ 36 subj _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 BD2 BD2 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 11 pour pour NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 H3 H3 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 13 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 15 H H NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 16 3 3 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 17 -K -K VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 18 18 18 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 19 ac ac NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 21 H H NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 22 3 3 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 23 -K -K ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 24 18 18 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 25 K K NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 26 23 23 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 27 ac ac NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 28 et et COO _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 29 H H NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 30 3 3 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 31 -K -K VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 32 14 14 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 33 K K NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 34 18 18 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 35 ac ace NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 36 sont être VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 37 similaires similaire ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1752 # text = Ce qui indique que la di-acétylation n'est pas nécessaire et même qu'elle n'améliore pas l'affinité pour le peptide . 1 Ce ce PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 qui qui PRQ _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 indique indiquer VRB _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 que que CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 di-acétylation acétylation NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 7 n' ne ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 est être VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 pas pas ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 nécessaire nécessaire ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 et et même COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 12 même et même ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 qu' que CSU _ _ 4 para _ _ _ _ _ 14 elle elle CLS _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 15 n' ne ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 améliore améliorer VRB _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 pas pas ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 affinité affinité NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 pour pour PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 le le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 peptide peptide NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1753 # text = De plus , l'examen du complexe BD 2 / H 3 -K 18 ac suggère que la possibilité de fixer une lysine acétylée supplémentaire dans le site hydrophobe secondaire de BD2 est improbable à cause de l'encombrement stérique de la boucle BC . 1 De de plus PRE _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 2 plus de plus NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 examen examen NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 6 du de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 complexe complexe NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 BD BD NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 2 2 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 / sur PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 11 H H NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 3 3 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 -K -K VPR _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 18 18 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 ac ace NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 suggère suggérer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 que que CSU _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 possibilité possibilité NOM _ _ 33 subj _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 fixer fixer VNF _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 une un DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 lysine lysine NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 acétylée acétyle NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 supplémentaire supplémentaire ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 dans dans PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 27 le le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 site site NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 secondaire secondaire ADJ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 de de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 32 BD2 BD2 NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 est être VRB _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 34 improbable improbable ADJ _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 à à cause de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 cause à cause de NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 de à cause de PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 l' le DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 encombrement encombrement NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 stérique stérique ADJ _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 de de PRE _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 la le DET _ _ 43 spe _ _ _ _ _ 43 boucle boucle NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 44 BC BC NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1754 # text = Nous n'avons d'ailleurs pas mesuré d'affinité pour le peptide H4 tétra-acétylé qui porte le motif K ( ac ) xxxK ( ac ) R. Ce motif aurait la possibilité d'établir une liaison ionique avec le résidu D354 de façon comparable au peptide H 3 -K 18 ac et présente une double acétylation . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 n' ne ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 avons avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 d' d'ailleurs PRE _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 5 ailleurs d'ailleurs NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 pas pas NOM _ _ 30 subj _ _ _ _ _ 7 mesuré mesurer VPP _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 d' de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 affinité affinité NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 pour pour PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 peptide peptide NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 H4 H4 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 qui qui PRQ _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 16 porte porter VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 17 le le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 motif motif NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 K K NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 ac ac ADJ _ _ 18 parenth _ _ _ _ _ 22 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 23 xxxK xxxK ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 24 ( ( PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 ac ace NOM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 26 ) ) PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 27 R. R. NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 28 Ce Ce DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 motif motif NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 30 aurait avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 31 la le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 32 possibilité possibilité NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 d' de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 34 établir établir VNF _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 une un DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 liaison liaison NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 ionique ionique ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 avec avec PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 39 le le DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 résidu résidu NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 D354 D354 NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 de de PRE _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 43 façon façon NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 comparable comparable ADJ _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 au à PRE _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 peptide peptide NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 H H NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 3 3 NUM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 49 -K -K VPR _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 50 18 18 NUM _ _ 51 spe _ _ _ _ _ 51 ac ace NOM _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 52 et et COO _ _ 53 mark _ _ _ _ _ 53 présente présente NOM _ _ 51 para _ _ _ _ _ 54 une un DET _ _ 56 spe _ _ _ _ _ 55 double double ADJ _ _ 56 dep _ _ _ _ _ 56 acétylation acétylation NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 57 . . PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1755 # text = Le fait que nous n'ayons pas mesuré d'affinité pour ce motif indique également que la liaison ionique ( entre le résidu R17 de H3 et BD2 ) et l'interaction hydrophobe ( entre le résidu K 18 ac de H3 et BD2 ) et ne sont pas suffisants pour expliquer l'affinité mesurée pour les peptides H3 acétylés sur la lysine K18 . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 fait fait NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 nous nous CLS _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 5 n' ne ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 6 ayons avoir VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 7 pas pas ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 mesuré mesurer VPP _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 d' un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 affinité affinité NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 pour pour PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 ce ce DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 motif motif NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 indique indiquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 également également ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 que que? PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 liaison liaison NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 ionique ionique ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 entre entre PRE _ _ 18 parenth _ _ _ _ _ 22 le le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 résidu résidu NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 R17 R17 NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 H3 H3 NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 28 BD2 BD2 NOM _ _ 26 para _ _ _ _ _ 29 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 30 et et COO _ _ 32 mark _ _ _ _ _ 31 l' le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 interaction interaction NOM _ _ 18 para _ _ _ _ _ 33 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 ( ( PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 35 entre entre PRE _ _ 32 parenth _ _ _ _ _ 36 le le DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 résidu résidu NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 K K NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 18 18 NUM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 ac ac ADJ _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 41 de de PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 42 H3 H3 NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 et et COO _ _ 44 mark _ _ _ _ _ 44 BD2 BD2 NOM _ _ 42 para _ _ _ _ _ 45 ) ) PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 46 et et COO _ _ 47 mark _ _ _ _ _ 47 ne ne ADV _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 48 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 49 pas pas ADV _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 suffisants suffisant ADJ _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 51 pour pour PRE _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 52 expliquer expliquer VNF _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 53 l' le DET _ _ 54 spe _ _ _ _ _ 54 affinité affinité NOM _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 55 mesurée mesurer VPP _ _ 54 dep _ _ _ _ _ 56 pour pour PRE _ _ 55 dep _ _ _ _ _ 57 les le DET _ _ 58 spe _ _ _ _ _ 58 peptides peptide NOM _ _ 56 dep _ _ _ _ _ 59 H3 H3 NOM _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 60 acétylés acétyle NOM _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 61 sur sur PRE _ _ 55 dep _ _ _ _ _ 62 la le DET _ _ 63 spe _ _ _ _ _ 63 lysine lysine NOM _ _ 61 dep _ _ _ _ _ 64 K18 K18 NOM _ _ 63 dep _ _ _ _ _ 65 . . PUNC _ _ 48 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1756 # text = Cela souligne l'importance des interactions hydrophobes de BD2 avec les résidus P16 , A21 et T22 de H3 qui viennent compléter la liaison ionique avec l'arginine R17 et l'interaction avec la lysine acétylée K 12 ac . 1 Cela cela PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 souligne souligner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 l' le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 importance importance NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 des de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 interactions interaction NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 hydrophobes hydrophobe ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 BD2 BD2 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 avec avec PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 résidus résidu NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 P16 P16 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 A21 A21 NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 T22 T22 NOM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 19 H3 H3 NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 qui qui PRQ _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 21 viennent venir VRB _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 compléter compléter VNF _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 liaison liaison NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 ionique ionique ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 avec avec PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 27 l' le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 28 arginine arminien ADJ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 29 R17 R17 NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 30 et et COO _ _ 32 mark _ _ _ _ _ 31 l' le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 interaction interaction NOM _ _ 29 para _ _ _ _ _ 33 avec avec PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 la le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 lysine lysine NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 acétylée acétyle NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 K K NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 12 12 NUM _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 ac ace NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 40 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1757 # text = Que nous n'ayons pas observé d'affinité pour ce motif indique également que la présence d'une seconde acétylation n'est pas importante pour la reconnaissance du peptide par BD2 . 1 Que que CSU _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 2 nous nous CLS _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 n' ne ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 4 ayons avoir VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 5 pas pas ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 observé observer VPP _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 d' de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 affinité affinité NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 pour pour PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 ce ce DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 motif motif NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 indique indiquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 également également ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 que que CSU _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 présence présence NOM _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 17 d' de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 une un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 19 seconde second ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 acétylation acétylation NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 n' ne ADV _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 22 est être VRB _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 23 pas pas ADV _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 importante important ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 pour pour PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 26 la le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 du de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 peptide peptide NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 par par PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 BD2 BD2 NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1758 # text = III .  Recherche d'autres sites potentiels pour BD2 1 III iii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 .  .  PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Recherche Recherche VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 d' un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 autres autre ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 sites site NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 potentiels potentiel ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 pour pour PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 BD2 BD2 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1759 # text = Brdt-BD2 a montré une sélectivité pour le motif 15APRK ( ac ) QLAT22 de H3 . 1 Brdt-BD2 Brdt-BD2 NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 a avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 une un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 sélectivité sélectivité NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 pour pour PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 motif motif NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 15APRK 15APRK NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 ( ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 ac ac ADJ _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 12 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 13 QLAT22 QLAT22 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 15 H3 H3 NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1760 # text = La recherche d'un autre site dont les caractéristiques électrostatiques et stériques sont similaires permet notamment de constater que la queue 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 recherche recherche NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 autre autre ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 site site NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 dont dont PRQ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 caractéristiques caractéristique NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 10 électrostatiques électrostatique ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 stériques stérique ADJ _ _ 10 para _ _ _ _ _ 13 sont être VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 14 similaires similaire ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 permet permettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 notamment notamment ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 constater constater VNF _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 que que ADV _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 queue queue NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1761 # text = H2A porte autour de sa lysine K5 ( 2GRGKQGGK9 ) une région dont les propriétés stéréochimiques semblent compatibles avec la reconnaissance par BD2 . 1 H2A H2A NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 porte porter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 autour autour de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de autour de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 sa son DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 lysine lysine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 K5 K5 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 2GRGKQGGK9 2GRGKQGGK9 NUM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 une un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 région région NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 13 dont dont PRQ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 14 les le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 propriétés propriété NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 16 stéréochimiques stéréochimique ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 semblent sembler VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 18 compatibles compatible ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 avec avec PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 par par PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 BD2 BD2 NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1762 # text = Un modèle d'une telle interaction montre que l'interaction ionique entre l'arginine en K- 1 est remplacée par une interaction similaire avec l'arginine en K- 2 du peptide H2A et qu'une liaison ionique supplémentaire et possible avec la lysine K9 [ Figure 52 ] . 1 Un un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 modèle modèle NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 une un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 telle tel ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 interaction interaction NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 que que CSU _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 interaction interaction NOM _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 11 ionique ionique ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 entre entre PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 l' le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 arginine arminien ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 en en PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 K- K- NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 1 1 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 est être VRB _ _ 19 aux _ _ _ _ _ 19 remplacée remplacer VPP _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 20 par par PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 une un DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 interaction interaction NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 similaire similaire ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 avec avec PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 25 l' le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 arginine arminien ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 en en PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 28 K- K- NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 2 2 NUM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 du de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 peptide peptide NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 H2A H2A NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 et et COO _ _ 34 mark _ _ _ _ _ 34 qu' que CSU _ _ 0 root _ _ _ _ _ 35 une un DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 liaison liaison NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 37 ionique ionique ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 supplémentaire supplémentaire ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 et et COO _ _ 40 mark _ _ _ _ _ 40 possible possible ADJ _ _ 38 para _ _ _ _ _ 41 avec avec PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 42 la le DET _ _ 43 spe _ _ _ _ _ 43 lysine lysine NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 44 K9 K9 NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 [ ( PUNC _ _ 46 punc _ _ _ _ _ 46 Figure Figure NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 47 52 52 NUM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 ] ) PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 49 . . PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1763 # text = Les interactions hydrophobes qui se faisaient avec les résidus P16 , A21 et T22 de H3 sont remplacées par d'autres interactions hydrophobes avec les glycines G2 , G7 et G8 . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 interactions interaction NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 3 hydrophobes hydrophobe ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 qui qui PRQ _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 5 se se CLI _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 faisaient faire VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 avec avec PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 résidus résidu NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 P16 P16 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 A21 A21 NOM _ _ 10 para _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 T22 T22 NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 16 H3 H3 NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 sont être VRB _ _ 18 aux _ _ _ _ _ 18 remplacées remplacer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 par par PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 d' un DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 21 autres autre ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 22 interactions interaction NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 23 hydrophobes hydrophobe ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 avec avec PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 25 les le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 glycines glycine NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 G2 G2 NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 29 G7 G7 NOM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 30 et et COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 31 G8 G8 NOM _ _ 29 para _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1764 # text = En accord avec un tel modèle , il a été montré que les lysines les plus touchées par l'hyperacétylation des histones qui se produit dans les spermatides sont les lysines K5 , K8 et K12 d'H 4 et la lysine K5 d'H 2A ( Govin et al. , 2006 ) . 1 En en accord avec PRE _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 accord en accord avec NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 avec en accord avec PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 tel tel ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 modèle modèle NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 8 il il CLS _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 9 a avoir VRB _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 été être VPP _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 que que CSU _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 lysines lysine NOM _ _ 29 subj _ _ _ _ _ 15 les le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 16 plus plus ADV _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 17 touchées toucher VPP _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 par par PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 l' le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 hyperacétylation hyperacétylation NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 des de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 histones histone NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 qui qui PRQ _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 24 se se CLI _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 produit produire VRB _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 26 dans dans PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 les le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 spermatides spermatide NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 sont être VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 30 les le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 lysines lysine NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 K5 K5 NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 , , PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 34 K8 K8 NOM _ _ 32 para _ _ _ _ _ 35 et et COO _ _ 36 mark _ _ _ _ _ 36 K12 K12 NOM _ _ 34 para _ _ _ _ _ 37 d' de PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 38 H H NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 4 4 NUM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 et et COO _ _ 42 mark _ _ _ _ _ 41 la le DET _ _ 42 spe _ _ _ _ _ 42 lysine lysine NOM _ _ 38 para _ _ _ _ _ 43 K5 K5 NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 d' de PRE _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 45 H H NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 2A 2A NUM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 ( ( PUNC _ _ 48 punc _ _ _ _ _ 48 Govin Govin NOM _ _ 45 parenth _ _ _ _ _ 49 et et COO _ _ 52 mark _ _ _ _ _ 50 al. al. ADV _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 51 , , PUNC _ _ 52 punc _ _ _ _ _ 52 2006 2006 NUM _ _ 48 para _ _ _ _ _ 53 ) ) PUNC _ _ 48 punc _ _ _ _ _ 54 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1765 # text = D'autres sites pourraient éventuellement être reconnus par BD2 , tels que les lysines K23 ( 18YINTKKSGRL27 ) ou K61 ( 58AVKLKLPDY65 ) de la protéine elle-même . 1 D' un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 autres autre ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 sites site NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 pourraient pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 éventuellement éventuellement ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 être être VNF _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 reconnus reconnaître VPP _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 par par PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 BD2 BD2 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 tels tel ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 que que CSU _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 lysines lysine NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 K23 K23 NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 18YINTKKSGRL27 18YINTKKSGRL27 NUM _ _ 14 parenth _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 19 ou ou COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 20 K61 K61 NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 21 ( ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 58AVKLKLPDY65 58AVKLKLPDY65 NUM _ _ 20 parenth _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 25 la le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 protéine protéine NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 elle-même lui-même PRQ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1766 # text = Cependant aucun phénomène d'acétyalation de Brdt n'a été rapporté à ce jour et nous avons vu la fragilité des hypothèses concernant la prédiction d'une reconnaissance entre un bromodomaine et un peptide . 1 Cependant cependant ADV _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 aucun aucun DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 phénomène phénomène NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 acétyalation acétyalation NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 Brdt Brdt NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 n' ne ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 9 a avoir VRB _ _ 10 aux _ _ _ _ _ 10 été être VPP _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 11 rapporté rapporter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 à à PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ce ce DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 jour jour NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 16 nous nous CLS _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 17 avons avoir VRB _ _ 18 aux _ _ _ _ _ 18 vu voir VPP _ _ 11 para _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 fragilité fragilité NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 des de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 hypothèses hypothèse NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 concernant concerner VPR _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 prédiction prédiction NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 d' de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 une un DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 entre entre PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 un un DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 bromodomaine oromo NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 34 mark _ _ _ _ _ 33 un un DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 peptide peptide NOM _ _ 31 para _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1767 # text = E . Dimérisation 1 E e NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Dimérisation Dimérisation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1768 # text = I. Cas de Brdt et de ses homologues 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Cas Cas NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 Brdt Brdt NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 3 para _ _ _ _ _ 7 ses son DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 homologues homologue NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1769 # text = La question de la dimérisation de BD1 et BD2 , sous forme homo ou hétéro-dimérique , se pose d'autant plus fortement que les protéines ont cristallisé sous forme de dimère et qu'il a été montré que l'homologue 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 question question NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 dimérisation dimérisation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 BD1 BD1 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 9 BD2 BD2 NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 11 sous sous PRE _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 12 forme forme NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 homo homo ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ou ou COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 hétéro-dimérique herero ADJ _ _ 13 para _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 17 se se CLI _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 pose poser VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 d' de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 autant autant ADV _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 21 plus plus ADV _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 22 fortement fortement ADV _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 23 que que CSU _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 les le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 protéines protéine NOM _ _ 27 subj _ _ _ _ _ 26 ont avoir VRB _ _ 27 aux _ _ _ _ _ 27 cristallisé cristalliser VPP _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 28 sous sous PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 forme forme NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 de de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 dimère dimère NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 36 mark _ _ _ _ _ 33 qu' que PRQ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 34 il il CLS _ _ 36 subj _ _ _ _ _ 35 a avoir VRB _ _ 36 aux _ _ _ _ _ 36 été être VPP _ _ 30 para _ _ _ _ _ 37 montré montrer ADJ _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 38 que que? PRQ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 39 l' le DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 homologue homologue NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1770 # text = Brd 2 -BD1 se trouve sous forme de dimère en solution ( Nakamura et al. , 2007 ) . 1 Brd Brd NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 2 2 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 -BD1 -BD1 NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 se se CLI _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 trouve trouver VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 sous sous PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 forme forme NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 dimère dimère NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 en en PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 11 solution solution NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Nakamura Nakamura NOM _ _ 11 parenth _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 15 al. al. ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 2007 2007 NUM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1771 # text = Cependant nous n'avons pas observé de dimérisation de ? 1 Cependant cependant ADV _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 nous nous CLS _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 n' ne ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 4 avons avoir VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 5 pas pas ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 observé observer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 de un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 dimérisation dimérisation NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 ? ? PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1772 # text = C-Brdt in-vitro , en présence ou en absence du peptide H4 tétra-acétylé . 1 C-Brdt C-Brdt NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 in-vitro in- VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 en en PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 présence présence NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ou ou COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 en en PRE _ _ 4 para _ _ _ _ _ 8 absence absence NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 du de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 peptide peptide NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 H4 H4 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1773 # text = Le tableau 25 illustre le fait que les dimères observés en cristallographie ne sont pas forcément observés en solution ( cas de Brdt-BD1 et BD2 et de Brd 2 -BD2 ) . 1 Le le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 tableau tableau NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 25 25 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 illustre illustrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 fait fait NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 que que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 dimères dimère NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 10 observés observer VPP _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 en en PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 cristallographie cristallographie NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ne ne ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 14 sont être VRB _ _ 17 aux _ _ _ _ _ 15 pas pas ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 forcément forcément ADV _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 17 observés observer VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 18 en en PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 solution solution NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 cas cas NOM _ _ 19 parenth _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 25 BD2 BD2 NOM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 22 para _ _ _ _ _ 28 Brd Brd NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 2 2 NUM _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 -BD2 -BD2 NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1774 # text = L'analyse de PISA , un outil informatique de prédiction et d'analyse des structures quaternaires à partir de la structure cristallographique proposé par l'EBI ( Krissinel and Henrick , 2007 ) est en accord avec les résultats expérimentaux dans le cas de Brd 2 -BD1 , Brd 2 -BD2 et Brdt-BD2 mais pas de Brdt-BD1 . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 analyse analyse NOM _ _ 34 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 PISA PISA NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 6 un un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 outil outil NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 informatique informatique ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 prédiction prédiction NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 d' de PRE _ _ 9 para _ _ _ _ _ 13 analyse analyse NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 des de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 structures structure NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 quaternaires quaternaire ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 à à partir de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 partir à partir de NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 de à partir de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 structure structure NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 cristallographique cristallographique ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 proposé proposer VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 24 par par PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 l' le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 EBI EBI NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 ( ( PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 28 Krissinel Krissinel NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 29 and krissinel and henrick NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 30 Henrick Henrick NOM _ _ 26 parenth _ _ _ _ _ 31 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 32 2007 2007 NUM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 ) ) PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 34 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 35 en en accord avec PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 accord en accord avec NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 avec en accord avec PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 les le DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 résultats résultat NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 40 expérimentaux expérimental ADJ _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 dans dans PRE _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 le le DET _ _ 43 spe _ _ _ _ _ 43 cas cas NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 44 de de PRE _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 Brd Brd NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 2 2 NUM _ _ 47 spe _ _ _ _ _ 47 -BD1 -BD1 NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 48 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 49 Brd Brd NOM _ _ 45 para _ _ _ _ _ 50 2 2 NUM _ _ 51 spe _ _ _ _ _ 51 -BD2 -BD2 NOM _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 52 et et COO _ _ 53 mark _ _ _ _ _ 53 Brdt-BD2 Brdt-BD2 NOM _ _ 49 para _ _ _ _ _ 54 mais mais COO _ _ 56 mark _ _ _ _ _ 55 pas pas ADV _ _ 54 dep _ _ _ _ _ 56 de de PRE _ _ 44 para _ _ _ _ _ 57 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 56 dep _ _ _ _ _ 58 . . PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1775 # text = Il serait intéressant de comparer le comportement en solution de chaque homologue en utilisant la même technique et les mêmes conditions expérimentales ( de force ionique notamment ) pour pouvoir conclure à une éventuelle dimérisation des domaines BD1 mais pas BD2 des protéines de la famille BET . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 serait être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 intéressant intéressant ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 comparer comparer VNF _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 le le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 comportement comportement NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 en en PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 solution solution NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 chaque chaque DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 homologue homologue NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 en en PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 utilisant utiliser VPR _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 16 même même ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 technique technique NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 19 les le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 20 mêmes même ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 conditions condition NOM _ _ 17 para _ _ _ _ _ 22 expérimentales expérimental ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 21 parenth _ _ _ _ _ 25 force force DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 ionique ionique NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 notamment notamment ADV _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 ) ) PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 29 pour pour PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 30 pouvoir pouvoir VNF _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 conclure conclure VNF _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 à à PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 une un DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 34 éventuelle éventuel ADJ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 35 dimérisation dimérisation NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 36 des de PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 domaines domaine NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 BD1 BD1 NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 mais mais COO _ _ 41 mark _ _ _ _ _ 40 pas pas ADV _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 BD2 BD2 NOM _ _ 38 para _ _ _ _ _ 42 des de PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 43 protéines protéine NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 de de PRE _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 la le DET _ _ 46 spe _ _ _ _ _ 46 famille famille NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 47 BET BET NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1776 # text = Tableau 25 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 25 25 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1777 # text = Comportement oligomérique des bromodomaines BD1 et BD2 chez les homologues Brd 2 , Brd 3 et Brd 4 . 1 Comportement comportement NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 oligomérique oligomérique ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 bromodomaines brome NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD1 BD1 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 BD2 BD2 NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 8 chez chez PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 homologues homologue NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 Brd Brd NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 2 2 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 Brd Brd NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 15 3 3 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 Brd Brd NOM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 18 4 4 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1778 # text = II . Des modes de dimérisation ? 1 II ii NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Des Des DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 modes mode NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 dimérisation dimérisation NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 ? ? PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1779 # text = La superposition des dimères cristallographiques des bromodomaines 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 superposition superposition NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 dimères dimère NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 cristallographiques cristallographique ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 bromodomaines brome NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1780 # text = Brdt-BD1 , Brd 2 -BD1 , Brdt-BD2 , Brd 2 -BD2 et Brd 3 -BD2 montre que les dimères se sont pas parfaitement superposables ( sauf dans le cas de Brdt-BD2 et Brd 3 -BD2 ) . 1 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 Brd Brd NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 2 2 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 -BD1 -BD1 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 Brdt-BD2 Brdt-BD2 NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 9 Brd Brd NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 10 2 2 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 -BD2 -BD2 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 Brd Brd NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 14 3 3 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 -BD2 -BD2 ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 que que? PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 les le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 dimères dimère ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 se se CLI _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 pas pas ADV _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 parfaitement parfaitement ADV _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 24 superposables superposable ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 ( ( PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 sauf sauf PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 27 dans dans PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 le le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 cas cas NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 de de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 Brdt-BD2 Brdt-BD2 NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 33 mark _ _ _ _ _ 33 Brd Brd NOM _ _ 31 para _ _ _ _ _ 34 3 3 NUM _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 -BD2 -BD2 NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 36 ) ) PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1781 # text = Ils peuvent se classer en deux catégories : 1 Ils ils CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 peuvent pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 se se CLI _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 classer classer VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 en en PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 deux deux NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 catégories catégorie NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 : : PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1782 # text = dans la première les sites de fixation du peptide acétylé se placent côte à côte ( cas de Brdt-BD1 et de Brd 2 -BD1 ) , dans la seconde les sites se placent à l'opposé l'un de l'autre ( cas de Brdt-BD2 , Brd 2 -BD2 et Brd 3 -BD2 ) . 1 dans dans PRE _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 la le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 première première NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 sites site NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 fixation fixation NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 peptide peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 acétylé acétyle NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 se se CLI _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 placent placer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 côte côte NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 côte côte NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 cas cas NOM _ _ 15 parenth _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 18 para _ _ _ _ _ 22 Brd Brd NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 2 2 NUM _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 -BD1 -BD1 NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 ) ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ 27 dans dans PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 28 la le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 seconde second NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 les le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 sites site NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 32 se se CLI _ _ 0 root _ _ _ _ _ 33 placent placer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 34 à à PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 35 l' le DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 opposé opposé NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 l' le DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 un un PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 39 de de PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 l' le DET _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 41 autre autre PRQ _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 ( ( PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 43 cas cas NOM _ _ 41 parenth _ _ _ _ _ 44 de de PRE _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 Brdt-BD2 Brdt-BD2 NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 , , PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 47 Brd Brd NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 48 2 2 NUM _ _ 49 spe _ _ _ _ _ 49 -BD2 -BD2 NOM _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 50 et et COO _ _ 51 mark _ _ _ _ _ 51 Brd Brd NOM _ _ 47 para _ _ _ _ _ 52 3 3 NUM _ _ 53 spe _ _ _ _ _ 53 -BD2 -BD2 NOM _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 54 ) ) PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 55 . . PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1783 # text = Malgré ces différences l'analyse des résidus impliqués dans la dimérisation indique qu'ils appartiennent aux mêmes régions des bromodomaines ( hélice B , hélice C , boucle BC et extrémité C terminale ) , dans le cas des domaines BD1 comme dans celui des domaines BD2 . 1 Malgré malgré PRE _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 ces ce DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 différences différence NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 analyse analyse NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 6 des de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 résidus résidu NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 impliqués impliquer VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 dans dans PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 dimérisation dimérisation NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 indique indiquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 qu' que CSU _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ils ils CLS _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 15 appartiennent appartenir VRB _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 aux à PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 mêmes même ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 régions région NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 des de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 bromodomaines oromo NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 ( ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 hélice hélice NOM _ _ 20 parenth _ _ _ _ _ 23 B B NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 hélice hélice NOM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 26 C C NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 boucle boucle NOM _ _ 25 para _ _ _ _ _ 29 BC BC NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 et et COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 31 extrémité extrémité NOM _ _ 28 para _ _ _ _ _ 32 C C NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 terminale terminal ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 ) ) PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 35 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 36 dans dans PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 37 le le DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 38 cas cas NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 des de PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 domaines domaine NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 BD1 BD1 NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 comme comme PRE _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 43 dans dans PRE _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 celui celui PRQ _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 des de PRE _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 domaines domaine NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 BD2 BD2 NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1784 # text = De plus , les résidus précisément impliqués sont en grande partie les mêmes pour chaque homologue . 1 De de plus PRE _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 plus de plus NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 résidus résidu NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 6 précisément précisément ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 impliqués impliquer ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 en en PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 grande grand ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 partie partie NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 les le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 mêmes même NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 14 pour pour PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 15 chaque chaque DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 homologue homologue NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1785 # text = La similarité des modes de dimérisation peut être expliquée par la très forte conservation de séquences entre les domaines hétérologues BD1 ou 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 similarité similarité NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 modes mode NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 dimérisation dimérisation NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 peut pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 être être VNF _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 expliquée expliquer VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 par par PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 12 très très ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 forte fort ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 conservation conservation NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 séquences séquence NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 entre entre PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 les le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 domaines domaine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 hétérologues hétérologue ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 BD1 BD1 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 ou ou COO _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1786 # text = BD2 dont découlent les propriétés électrostatiques qui dirigent la cristallisation . 1 BD2 BD2 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 dont dont PRQ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 découlent découler VRB _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 les le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 propriétés propriété NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 6 électrostatiques électrostatique ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 qui qui PRQ _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 dirigent diriger VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 cristallisation cristallisation NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1787 # text = F . La mutation K61Q 1 F f NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 La La DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 mutation mutation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 K61Q K61Q NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1788 # text = La mutation K61Q a été mise en évidence chez l'homme . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 mutation mutation NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 K61Q K61Q NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 a avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 été être VPP _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 mise mettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 en en PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 évidence évidence NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 chez chez PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 homme homme NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1789 # text = Elle est due à un polymorphisme de séquence qui entraîne la mutation de la lysine K61 du premier bromodomaine de Brdt en une glutamine . 1 Elle elle CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 due devoir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 à à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 un un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 polymorphisme polymorphisme NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 séquence séquence NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 qui qui PRQ _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 10 entraîne entraîner VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 mutation mutation NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 lysine lysine NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 K61 K61 NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 du de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 premier premier ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 bromodomaine brome NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 Brdt Brdt NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 en en PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 23 une un DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 glutamine glutamique ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1790 # text = Cette mutation est probablement impliquée dans certaines infertilités masculines puisque ce polymorphisme a été identifié , à l'état homozygote , uniquement chez des individus infertiles ( Rousseau et al , article soumis , annexe 5 ) . 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 mutation mutation NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 4 probablement probablement ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 impliquée impliquer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 dans dans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 certaines certain DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 infertilités infertilité NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 masculines masculin ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 puisque puisque CSU _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 11 ce ce DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 polymorphisme polymorphisme NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 13 a avoir VRB _ _ 14 aux _ _ _ _ _ 14 été être VPP _ _ 15 aux _ _ _ _ _ 15 identifié identifier VPP _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 17 à à PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 état état NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 homozygote homo- NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 22 uniquement uniquement ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 23 chez chez PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 24 des un DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 individus individu NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 infertiles infertile ADJ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 ( ( PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 Rousseau Rousseau NOM _ _ 15 parenth _ _ _ _ _ 29 et et COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 30 al al ADJ _ _ 15 para _ _ _ _ _ 31 , , PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 32 article article NOM _ _ 30 para _ _ _ _ _ 33 soumis soumettre ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 , , PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 35 annexe annexe NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 36 5 5 NUM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 ) ) PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 38 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1791 # text = I. Effet in vitro sur l'affinité vis-à-vis de H3 et H4 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Effet Effet NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 in in vitro ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 vitro in vitro ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 sur sur PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 affinité affinité NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 vis-à-vis vis-à-vis de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de vis-à-vis de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 H3 H3 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 H4 H4 NOM _ _ 10 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1792 # text = La mutation K61Q du premier bromodomaine n'entraîne pas de changement majeur dans les propriétés d'association de BD1 avec les histones H3 et H4 ; 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 mutation mutation NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 K61Q K61Q NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 premier premier ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 bromodomaine brome NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 n' ne ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 entraîne entraîner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 pas pas ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 changement changement NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 majeur majeur ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 dans dans PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 14 les le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 propriétés propriété NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 d' de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 association association NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 BD1 BD1 NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 avec avec PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 21 les le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 histones histone NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 H3 H3 NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 25 H4 H4 NOM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 26 ; ; PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1793 # text = on note même une légère augmentation globale de l'affinité par rapport au domaine sauvage [ Tableau   26 ] . 1 on on CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 note noter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 même même ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 une un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 légère léger ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 augmentation augmentation NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 globale global ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 affinité affinité NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 par par rapport à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 12 rapport par rapport à DET _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 au par rapport à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 domaine domaine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 sauvage sauvage ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 [ ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 Tableau Tableau NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18     26 DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 26 26 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 ] ) PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1794 # text = Tableau 26 : 1 Tableau tableau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 26 26 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1795 # text = Comparaison des affinités de BD1 et du mutant BD1-K61Q 1 Comparaison comparaison NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 affinités affinité NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BD1 BD1 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 du de PRE _ _ 2 para _ _ _ _ _ 8 mutant mutant NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 BD1-K61Q BD1-K61Q NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1796 # text = Ces résultats sont en accord avec des résultats de co-purification obtenus par nos collaborateurs qui montrent que l'association du mutant et de la queue H4 tétra-acétylée tétra-acétylée résiste mieux à une augmentation de la force ionique que celle de la protéine sauvage et que l'inactivation de BD2 n'influence pas cette interaction ( S. Rousseau , résultats non publiés ) [ Figure 53 ] . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résultats résultat NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 sont être VRB _ _ 11 aux _ _ _ _ _ 4 en en accord avec PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 5 accord en accord avec NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 avec en accord avec PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 des un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 résultats résultat NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 co-purification co- NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 obtenus obtenir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 par par PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 nos son DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 collaborateurs collaborateur NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 qui qui PRQ _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 16 montrent montrer VRB _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 que que CSU _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 association association NOM _ _ 29 subj _ _ _ _ _ 20 du de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 mutant mutant NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 20 para _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 queue queue NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 H4 H4 NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 tétra-acétylée tétra-acétylée NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 tétra-acétylée acétyle NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 29 résiste résister VRB _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 30 mieux plus ADV _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 à à PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 une un DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 augmentation augmentation NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 de de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 la le DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 force force NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 ionique ionique ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 que que CSU _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 39 celle celui PRQ _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 de de PRE _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 la le DET _ _ 42 spe _ _ _ _ _ 42 protéine protéine NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 43 sauvage sauvage ADJ _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 et et COO _ _ 45 mark _ _ _ _ _ 45 que que CSU _ _ 17 para _ _ _ _ _ 46 l' le DET _ _ 47 spe _ _ _ _ _ 47 inactivation inactivation NOM _ _ 51 subj _ _ _ _ _ 48 de de PRE _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 49 BD2 BD2 NOM _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 n' ne ADV _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 51 influence influencer VRB _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 52 pas pas ADV _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 53 cette ce DET _ _ 54 spe _ _ _ _ _ 54 interaction interaction NOM _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 55 ( ( PUNC _ _ 56 punc _ _ _ _ _ 56 S. S. NOM _ _ 54 parenth _ _ _ _ _ 57 Rousseau Rousseau NOM _ _ 56 dep _ _ _ _ _ 58 , , PUNC _ _ 64 punc _ _ _ _ _ 59 résultats résultat NOM _ _ 56 dep _ _ _ _ _ 60 non non ADV _ _ 61 dep _ _ _ _ _ 61 publiés publier ADJ _ _ 59 dep _ _ _ _ _ 62 ) ) PUNC _ _ 56 punc _ _ _ _ _ 63 [ ( PUNC _ _ 64 punc _ _ _ _ _ 64 Figure Figure NOM _ _ 54 dep _ _ _ _ _ 65 53 53 NUM _ _ 64 dep _ _ _ _ _ 66 ] ) PUNC _ _ 54 punc _ _ _ _ _ 67 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1797 # text = II . Effets in vivo 1 II ii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Effets Effets NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 in in vivo ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 vivo in vivo ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1798 # text = a . Effet sur l'association à la chromatine 1 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Effet Effet NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 sur sur PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 association association NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 à à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 chromatine chromatine NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1799 # text = S. Rousseau et ses collègues ont montré par des expériences de recouvrement de fluorescence après blanchiment ( FRAP ) que l'association du mutant ? 1 S. s. rousseau NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 2 Rousseau Rousseau NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 4 ses son DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 collègues collègue NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 6 ont avoir VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 par par PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 des un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 expériences expérience NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 recouvrement recouvrement NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 fluorescence fluorescence NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 après après PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 16 blanchiment blanchiment NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 ( ( PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 FRAP FRAP NOM _ _ 16 parenth _ _ _ _ _ 19 ) ) PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 20 que que? PRQ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 21 l' le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 association association NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 du de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 mutant mutant NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 ? ? PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1800 # text = C-Brdt-K61Q ( partie N terminale de Brdt comprenant les deux bromodomaines et leurs régions adjacentes ) à la chromatine acétylée est significativement réduite par rapport celle de la protéine sauvage ( Rousseaux et al. , article soumis , annexe 5 ) . 1 C-Brdt-K61Q C-Brdt-K61Q NOM _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 partie partie NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 N N NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 terminale terminal ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 Brdt Brdt NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 comprenant comprendre VPR _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 10 deux deux NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 bromodomaines oromo NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 13 leurs son DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 régions région NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 15 adjacentes adjacent ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 17 à à PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 chromatine chromatine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 acétylée acétyle NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 est être VRB _ _ 23 aux _ _ _ _ _ 22 significativement significativement ADV _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 23 réduite réduire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 par par PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 rapport rapport NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 celle celui PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 la le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 protéine protéine NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 sauvage sauvage ADJ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 ( ( PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 32 Rousseaux Rousseaux NOM _ _ 29 parenth _ _ _ _ _ 33 et et COO _ _ 34 mark _ _ _ _ _ 34 al. al. NOM _ _ 32 para _ _ _ _ _ 35 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 36 article article NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 soumis soumettre ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 , , PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 39 annexe annexe ADJ _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 5 5 NUM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 ) ) PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 42 . . PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1801 # text = b . Effet sur la compaction de la chromatine 1 b b NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Effet Effet NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 sur sur PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 compaction compaction NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 chromatine chromatine NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1802 # text = La même équipe a montré que la compaction de la chromatine induite par Brdt dans des cellules de mammifère traitées à la TSA ( un inhibiteur des histones désacétylases ) est perturbée dans le cas du mutant ? 1 La le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 même même ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 équipe équipe NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 4 a avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 que que CSU _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 compaction compaction NOM _ _ 32 subj _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 chromatine chromatine NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 induite induire VPP _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 par par PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 Brdt Brdt NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 dans dans PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 des un DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 cellules cellule NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 mammifère mammifère NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 traitées traiter VPP _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 à à PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 la le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 TSA TSA NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 ( ( PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 25 un un DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 inhibiteur inhibiteur NOM _ _ 23 parenth _ _ _ _ _ 27 des de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 histones histone NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 désacétylases désacétylases ADJ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 ) ) PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 31 est être VRB _ _ 32 aux _ _ _ _ _ 32 perturbée perturber VPP _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 33 dans dans PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 le le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 cas cas NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 du de PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 mutant mutant NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 ? ? PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1803 # text = C-Brdt-K61Q [ Figure 54 ] . 1 C-Brdt-K61Q C-Brdt-K61Q NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 [ ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 Figure Figure NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 54 54 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ] ) PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1804 # text = III .  Apports de la structure tridimensionnelle de BD1 dans la compréhension des effets de la mutation K61Q 1 III iii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 .  .  PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Apports Apports NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 structure structure NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 tridimensionnelle tridimensionnel ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 BD1 BD1 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 compréhension compréhension NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 des de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 effets effet NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 mutation mutation NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 K61Q K61Q NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1805 # text = La structure de BD1 en complexe avec le peptide H 4 -K 5 K 8 ac montre que la lysine K61 est située dans la boucle ZA de façon très exposée au solvant mais ne contacte pas le peptide [ Figure 55 ] . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structure structure NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 BD1 BD1 NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 5 en en PRE _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 6 complexe complexe NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 7 avec avec PRE _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 9 peptide peptide NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 10 H H NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 11 4 4 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 5 5 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 K K NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 8 8 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 ac ace NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 17 montre montrer VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 18 que que CSU _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 lysine lysine NOM _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 21 K61 K61 NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 est être VRB _ _ 23 aux _ _ _ _ _ 23 située situer VPP _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 24 dans dans PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 la le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 boucle boucle NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 ZA ZA NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 façon façon NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 très très ADV _ _ 31 periph _ _ _ _ _ 31 exposée exposer VPP _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 32 au à PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 solvant solvant NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 mais mais COO _ _ 36 mark _ _ _ _ _ 35 ne ne ADV _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 36 contacte contacter VRB _ _ 23 para _ _ _ _ _ 37 pas pas ADV _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 le le DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 peptide peptide NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 40 [ ( PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 41 Figure Figure NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 55 55 NUM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 ] ) PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 44 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1806 # text = La plus courte distance entre la lysine et le peptide et de de 6 , 7 Å . 1 La le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 2 plus plus ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 courte court ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 distance distance NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 entre entre PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 lysine lysine NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 9 le le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 peptide peptide NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 12 de de PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 5 para _ _ _ _ _ 14 6 6 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 15 , 6 , 7 PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 16 7 7 NUM _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 Å Å NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1807 # text = Nous ne pouvons pas exclure la possibilité que la lysine interagisse avec l'extrémité N terminale de l'histone H4 qui n'est pas définie ( résidus R3 , G2 et S1 ) . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 ne ne ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 pouvons pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 pas pas ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 exclure exclure VNF _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 possibilité possibilité NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 que que CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 lysine lysine NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 11 interagisse interagir VRB _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 avec avec PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 l' le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 extrémité extrémité NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 N N NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 terminale terminal ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 histone histone NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 H4 H4 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 qui qui PRQ _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 22 n' ne ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 23 est être VRB _ _ 25 aux _ _ _ _ _ 24 pas pas ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 définie définir VPP _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 26 ( ( PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 résidus résidu NOM _ _ 25 parenth _ _ _ _ _ 28 R3 R3 NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 30 G2 G2 NOM _ _ 28 para _ _ _ _ _ 31 et et COO _ _ 32 mark _ _ _ _ _ 32 S1 S1 NOM _ _ 30 para _ _ _ _ _ 33 ) ) PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 34 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1808 # text = Cependant le peptide se trouve dans un sillon électropositif qu'il devrait quitter pour se diriger vers la lysine K61 . 1 Cependant cependant ADV _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 le le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 peptide peptide NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 4 se se CLI _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 trouve trouver VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 dans dans PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 un un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 sillon sillon NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 électropositif électropositif ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 qu' que PRQ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 11 il il CLS _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 12 devrait devoir VRB _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 quitter quitter VNF _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 pour pour PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 se se CLI _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 diriger diriger VNF _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 vers vers PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 lysine lysine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 K61 K61 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1809 # text = Cette hypothèse semble peu probable . 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 hypothèse hypothèse NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 semble sembler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 peu peu ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 probable probable ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1810 # text = Ainsi , la structure de BD1 en complexe avec le peptide H4 montre que la lysine K61 ne contacte probablement pas la queue H4 directement . 1 Ainsi ainsi ADV _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 structure structure NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 BD1 BD1 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 en en PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 complexe complexe NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 avec avec PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 le le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 peptide peptide NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 H4 H4 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 que que CSU _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 lysine lysine NOM _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 17 K61 K61 NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ne ne ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 contacte contacter VRB _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 20 probablement probablement ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 pas pas ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 la le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 queue queue NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 24 H4 H4 NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 directement directement ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1811 # text = Cela expliquerait que nous n'avons pas mesuré de modification majeure dans l'affinité du mutant BD1-K61Q pour les peptides H3 et H4 . 1 Cela cela PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 expliquerait expliquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 nous nous CLS _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 5 n' ne ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 6 avons avoir VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 7 pas pas ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 mesuré mesurer VPP _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 modification modification NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 majeure majeur ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 dans dans PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 l' le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 affinité affinité NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 du de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 mutant mutant NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 BD1-K61Q BD1-K61Q NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 pour pour PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 19 les le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 peptides peptide NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 H3 H3 NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 23 H4 H4 NOM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1812 # text = Une hypothèse possible serait que la lysine établisse une interaction avec l'ADN du nucléosome sous-jacent . 1 Une un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 hypothèse hypothèse NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 possible possible ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 serait être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 que que CSU _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 lysine lysine NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 établisse établir VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 une un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 interaction interaction NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 avec avec PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 l' le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 ADN ADN NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 du de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 nucléosome nucléé NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 sous-jacent sous-jacent ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1813 # text = La lysine adjacente K59 et la lysine K109 , située sur la boucle BC sur le côté opposé du site de fixation , pourraient participer à une telle interaction . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 lysine lysine NOM _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 3 adjacente adjacent ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 K59 K59 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 lysine lysine NOM _ _ 2 para _ _ _ _ _ 8 K109 K109 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 10 située situer VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 sur sur PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 boucle boucle NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 BC BC NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 sur sur PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 16 le le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 côté côté NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 opposé opposer ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 du de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 site site NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 fixation fixation NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 24 pourraient pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 participer participer VNF _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 à à PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 une un DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 28 telle tel ADJ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 29 interaction interaction NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1814 # text = Cela aurait pour effet de renforcer l'association de Brdt à la chromatine . 1 Cela cela PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 aurait avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 effet effet NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 renforcer renforcer VNF _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 l' le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 association association NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 Brdt Brdt NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 à à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 chromatine chromatine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1815 # text = En donnant un point d'ancrage sur le nucléosome la liberté de mouvement de Brdt par rapport à celui -ci serait réduite par rapport à une situation où Brdt fixerait uniquement la queue flexible de l'histone H4 . 1 En en PRE _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 2 donnant donnant ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 un un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 point point NOM _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 5 d' de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ancrage ancrage NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 sur sur PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 nucléosome nucléé NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 liberté liberté NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 mouvement mouvement NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 Brdt Brdt NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 par par rapport à PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 rapport par rapport à NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 à par rapport à PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 celui celui PRQ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 -ci -ci ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 serait être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 réduite réduit ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 par par rapport à PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 24 rapport par rapport à PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 à par rapport à PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 26 une un DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 situation situation NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 où où PRQ _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 29 Brdt Brdt NOM _ _ 30 subj _ _ _ _ _ 30 fixerait fixer VRB _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 31 uniquement uniquement ADV _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 la le DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 queue queue NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 34 flexible flexible ADJ _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 de de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 l' le DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 histone histone NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 H4 H4 NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 . . PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1816 # text = Cette interaction orienterait ainsi la protéine de façon moins aléatoire . 1 Cette ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 interaction interaction NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 orienterait orienter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 ainsi ainsi ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 protéine protéine NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 façon façon NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 moins moins ADV _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 aléatoire aléatoire ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1817 # text = IV . Hypothèses : 1 IV iv NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Hypothèses Hypothèses NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 : : PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1818 # text = à la recherche d'un mécanisme d'auto-régulation de Brdt 1 à à PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 la le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 recherche recherche NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 un un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 mécanisme mécanisme NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 d' de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 auto-régulation auto- NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 Brdt Brdt NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1819 # text = La proximité de la lysine K61 et du site de fixation permet d'envisager que BD1 puisse fixer sa propre lysine K61 acétylée suite à un réarrangement de la boucle ZA . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 proximité proximité NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 lysine lysine NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 K61 K61 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 3 para _ _ _ _ _ 9 site site NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 fixation fixation NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 permet permettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 d' de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 envisager envisager VNF _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 que que CSU _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 BD1 BD1 NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 17 puisse pouvoir VRB _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 fixer fixer VNF _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 sa son DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 20 propre propre ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 lysine lysine NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 K61 K61 NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 23 acétylée acétylée NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 suite suite à PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 25 à suite à PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 un un DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 réarrangement réarrangement NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 la le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 boucle boucle NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 ZA ZA NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1820 # text = Il est en effet possible de modéliser une conformation de la boucle ZA dans laquelle l'amine de la chaîne latérale de la lysine K 61 occupe la même position que celle de la lysine K 5 ac dans la structure de BD1 en complexe avec le peptide H 4 -K 5 K 8 ac [ Figure 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 en en effet PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 effet en effet NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 possible possible ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 modéliser modéliser VNF _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 une un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 conformation conformation NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 boucle boucle NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 ZA ZA NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 dans dans PRE _ _ 27 periph _ _ _ _ _ 15 laquelle lequel PRQ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 l' le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 amine amine NOM _ _ 27 subj _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 chaîne chaîne NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 latérale latéral ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 lysine lysine NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 K K NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 61 61 NUM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 occupe occuper VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 28 la le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 29 même même ADJ _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 30 position position NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 31 que que PRQ _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 32 celle celui PRQ _ _ 38 subj _ _ _ _ _ 33 de de PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 la le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 lysine lysine NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 K K NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 5 5 NUM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 ac ac VRB _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 39 dans dans PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 la le DET _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 41 structure structure NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 de de PRE _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 BD1 BD1 NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 en en PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 45 complexe complexe NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 avec avec PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 47 le le DET _ _ 48 spe _ _ _ _ _ 48 peptide peptide NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 49 H H NOM _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 4 4 NUM _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 51 -K -K VPR _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 52 5 5 NUM _ _ 53 spe _ _ _ _ _ 53 K K NOM _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 54 8 8 NUM _ _ 55 spe _ _ _ _ _ 55 ac ac NOM _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 56 [ ( PUNC _ _ 57 punc _ _ _ _ _ 57 Figure Figure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1821 # text = 56A ] . 1 56A 56A NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ] ] PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1822 # text = Une autre possibilité de reconnaissance de la lysine K61 par BD1 passe par la formation d'une structure symétrique entre deux bromodomaines 1 Une un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 autre autre ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 possibilité possibilité NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 lysine lysine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 K61 K61 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 par par PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 BD1 BD1 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 passe passer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 par par PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 formation formation NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 d' de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 une un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 structure structure NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 symétrique symétrique ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 entre entre PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 deux deux NUM _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 bromodomaines brome NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1823 # text = BD1 , chacune des molécules fixant la lysine K 61 ac de l'autre [ Figure 1 BD1 BD1 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 3 chacune chacun PRQ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 molécules molécule NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 fixant fixer VPR _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 lysine lysine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 K K NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 61 61 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 ac ace NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 l' le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 autre autre PRQ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 [ ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 Figure Figure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1824 # text = 56B ] . 1 56B 56B NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ] ] PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1825 # text = Les caractéristiques stéréochimiques de la région qui entoure la lysine 61 paraissent de plus être compatibles avec une reconnaissance par BD1 telle que nous l'avons analysée d'après la structure avec le peptide H 4 -K 5 / K 8 ac . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 caractéristiques caractéristique NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 3 stéréochimiques stéréochimique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 région région NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 qui qui PRQ _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 entoure entourer VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 lysine lysine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 61 61 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 paraissent paraître VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 de de plus PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 plus de plus NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 être être VNF _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 compatibles compatible ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 avec avec PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 18 une un DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 par par PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 BD1 BD1 NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 telle tel ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 que que PRQ _ _ 27 periph _ _ _ _ _ 24 nous nous CLS _ _ 27 subj _ _ _ _ _ 25 l' le CLI _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 26 avons avoir VRB _ _ 27 aux _ _ _ _ _ 27 analysée analyser VPP _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 28 d' d'après PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 après d'après NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 la le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 structure structure NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 32 avec avec PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 le le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 peptide peptide NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 H H NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 4 4 NUM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 -K -K VPR _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 38 5 5 NUM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 / sur PUNC _ _ 42 punc _ _ _ _ _ 40 K K NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 8 8 NUM _ _ 42 spe _ _ _ _ _ 42 ac ace NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 43 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1826 # text = La séquence AVKLKLP des résidus 57 à 63 comporte en effet deux lysines qui pourraient être acétylées et qui sont séparées par une leucine ( au lieu de deux glycines dans le peptide H 4 -K 5 / K 8 ac ) et entourées de résidus hydrophobes ( comme dans le cas du peptide 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 séquence séquence NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 3 AVKLKLP AVKLKLP NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 résidus résidu NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 57 57 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 à à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 63 63 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 comporte comporter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 en en effet PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 effet en effet NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 deux deux NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 lysines lysine NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 14 qui qui PRQ _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 15 pourraient pouvoir VRB _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 être être VNF _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 acétylées acétyle NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 19 qui qui PRQ _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 20 sont être VRB _ _ 21 aux _ _ _ _ _ 21 séparées séparer VPP _ _ 16 para _ _ _ _ _ 22 par par PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 une un DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 leucine leucine NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 ( ( PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 au au lieu de PRE _ _ 21 parenth _ _ _ _ _ 27 lieu au lieu de NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 de au lieu de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 deux deux NUM _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 glycines glycine NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 dans dans PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 le le DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 peptide peptide NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 H H NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 4 4 NUM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 -K -K VPR _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 37 5 5 NUM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 / sur PUNC _ _ 44 punc _ _ _ _ _ 39 K K NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 8 8 NUM _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 41 ac ace NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 ) ) PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 43 et et COO _ _ 44 mark _ _ _ _ _ 44 entourées entourer VPP _ _ 21 para _ _ _ _ _ 45 de de PRE _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 résidus résidu NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 hydrophobes hydrophobe ADJ _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 ( ( PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 49 comme comme PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 50 dans dans PRE _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 51 le le DET _ _ 52 spe _ _ _ _ _ 52 cas cas NOM _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 53 du de PRE _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 54 peptide peptide NOM _ _ 53 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1827 # text = H 4 -K 5 / K 8 ac ) . 1 H heure NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 5 5 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 / sur PUNC _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 K K NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 8 8 NUM _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 ac ace NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1828 # text = V. Conclusion 1 V. verset NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Conclusion Conclusion NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1829 # text = La mutation K62Q de Brdt-BD1 est associée chez l'homme à l'infertilité masculine ( S. Rousseau , article soumis ) . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 mutation mutation NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 K62Q K62Q NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 est être VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 associée associer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 chez chez PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 homme homme NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 à à PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 l' le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 infertilité infertilité NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 masculine masculin ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 ( ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 S. S. NOM _ _ 7 parenth _ _ _ _ _ 17 Rousseau Rousseau NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 article article NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 soumis soumettre ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 ) ) PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1830 # text = Un alignement de séquences montre que ce résidu est variable même au sein des protéines de la famille BET . 1 Un un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 alignement alignement NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 séquences séquence NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 que que CSU _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 ce ce DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 résidu résidu NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 9 est être VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 variable variable ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 même même ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 au au sein de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 13 sein au sein de DET _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 des au sein de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 protéines protéine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 famille famille NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 BET BET NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1831 # text = Cela conforte l'hypothèse de l'implication de cette lysine dans une fonction spécifique de Brdt , telle que la compaction de la chromatine observée pendant la spermiogénese . 1 Cela cela PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 conforte conforter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 l' le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 hypothèse hypothèse NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 implication implication NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 cette ce DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 lysine lysine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 dans dans PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 12 une un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 fonction fonction NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 spécifique spécifique ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 Brdt Brdt NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 telle tel ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 que que CSU _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 compaction compaction ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 chromatine chromatine NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 observée observer VPP _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 pendant pendant PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 la le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 spermiogénese spermiogénese NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1832 # text = Il existe ainsi une contradiction apparente entre les résultats in-vivo et in-vitro . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 existe exister VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ainsi ainsi ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 une un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 contradiction contradiction NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 apparente apparent ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 entre entre PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 résultats résultat NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 in-vivo in- ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 11 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 12 in-vitro in- VRB _ _ 2 para _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1833 # text = Alors qu'in-vitro l'affinité du mutant pour les queues N terminales H3 et H4 tétra-acétylées est légèrement accrue , l'association à la chromatine in-vivo est déstabilisée Cette contradiction peut être expliquée par l'hypothèse selon laquelle les lysines K61 , K59 et K109 interagissent avec l'ADN du nucléosome et stabilisent ainsi l'association de Brdt-BD1 à la chromatine . 1 Alors alors que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 qu' alors que CSU _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 in-vitro in- VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 affinité affinité NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 6 du de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 mutant mutant NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 queues queue NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 N N NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 terminales terminal ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 H3 H3 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 H4 H4 NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 16 tétra-acétylées tétra NOM _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 17 est être VRB _ _ 19 aux _ _ _ _ _ 18 légèrement légèrement ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 accrue accroître VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 56 punc _ _ _ _ _ 21 l' le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 association association NOM _ _ 27 subj _ _ _ _ _ 23 à à PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 chromatine chromatine NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 in-vivo in- ADJ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 est être VRB _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 28 déstabilisée déstabiliser ADJ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 29 Cette Cette NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 contradiction contradiction NOM _ _ 31 subj _ _ _ _ _ 31 peut pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 32 être être VNF _ _ 33 aux _ _ _ _ _ 33 expliquée expliquer VPP _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 par par PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 l' le DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 hypothèse hypothèse NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 selon selon PRE _ _ 46 periph _ _ _ _ _ 38 laquelle lequel PRQ _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 les le DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 lysines lysine NOM _ _ 46 subj _ _ _ _ _ 41 K61 K61 NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 , , PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 43 K59 K59 NOM _ _ 41 para _ _ _ _ _ 44 et et COO _ _ 45 mark _ _ _ _ _ 45 K109 K109 NOM _ _ 43 para _ _ _ _ _ 46 interagissent interagir VRB _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 47 avec avec PRE _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 l' le DET _ _ 49 spe _ _ _ _ _ 49 ADN ADN NOM _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 50 du de PRE _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 51 nucléosome nucléé NOM _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 52 et et COO _ _ 53 mark _ _ _ _ _ 53 stabilisent stabiliser VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 54 ainsi ainsi CSU _ _ 0 root _ _ _ _ _ 55 l' le DET _ _ 56 spe _ _ _ _ _ 56 association association NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 57 de de PRE _ _ 56 dep _ _ _ _ _ 58 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 57 dep _ _ _ _ _ 59 à à PRE _ _ 56 dep _ _ _ _ _ 60 la le DET _ _ 61 spe _ _ _ _ _ 61 chromatine chromatine NOM _ _ 59 dep _ _ _ _ _ 62 . . PUNC _ _ 56 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1834 # text = Lors des expériences d'ITC utilisant uniquement des peptides mimant les queues acétylées des histones , nous n'avons pas considéré l'interaction avec l'ADN dans nos mesures . 1 Lors lors de PRE _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 2 des lors de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 expériences expérience NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ITC ITC NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 utilisant utiliser VPR _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 uniquement uniquement ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 des un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 peptides peptide NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 mimant mimer VPR _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 queues queue NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 acétylées acétyle NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 des de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 histones histone NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 17 nous nous CLS _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 18 n' ne ADV _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 19 avons avoir VRB _ _ 21 aux _ _ _ _ _ 20 pas pas ADV _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 considéré considérer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 l' le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 interaction interaction NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 avec avec PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 l' le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 ADN ADN NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 dans dans PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 28 nos son DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 mesures mesure NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1835 # text = Une telle hypothèse confère à Brdt-BD1 un rôle structural d'orientation et de stabilisation de la protéine par rapport au nucléosome . 1 Une un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 telle tel ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 hypothèse hypothèse NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 confère conférer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 à à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 un un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 rôle rôle NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 structural structural ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 d' de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 orientation orientation NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 10 para _ _ _ _ _ 14 stabilisation stabilisation NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 protéine protéine NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 par par rapport à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 19 rapport par rapport à DET _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 au par rapport à PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 nucléosome nucléé NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1836 # text = La déstabilisation induite par la mutation K61Q pourrait ainsi compromettre le recrutement de facteurs impliqués dans le remodelage de la chromatine . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 déstabilisation déstabilisation NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 induite induire VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 par par PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 mutation mutation NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 K61Q K61Q NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 ainsi ainsi ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 compromettre compromettre VNF _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 recrutement recrutement NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 facteurs facteur NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 impliqués impliquer VPP _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 dans dans PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 le le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 remodelage remodelage NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 chromatine chromatine NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1837 # text = De même , le désordre induit dans l'orientation de Brdt à la surface des nucléosomes pourrait empêcher des interactions jouant un rôle structural dans la compaction . 1 De de même PRE _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 2 même de même NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 le le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 désordre désordre NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 6 induit induire VPP _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 dans dans PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 l' le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 orientation orientation NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 Brdt Brdt NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 à à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 surface surface NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 des de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 nucléosomes nucléé NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 empêcher empêcher VNF _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 des un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 interactions interaction NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 jouant jouer VPR _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 un un DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 rôle rôle NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 structural structural ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 dans dans PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 26 la le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 compaction compaction NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1838 # text = Dans l'ensemble , cela pourrait expliquer que l'inactivation de BD1 abolisse totalement la compaction de la chromatine induite par Brdt alors que l'effet de l'inactivation de BD2 est moins drastique ( Pivot-Pajot et al. , 2003 ) . 1 Dans dans PRE _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 l' le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 ensemble ensemble NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 cela cela PRQ _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 expliquer expliquer VNF _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 que que CSU _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 inactivation inactivation NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 BD1 BD1 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 abolisse abolir VRB _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 14 totalement totalement ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 compaction compaction NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 chromatine chromatine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 induite induire VPP _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 par par PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 Brdt Brdt NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 alors alors que CSU _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 24 que alors que CSU _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 25 l' le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 effet effet NOM _ _ 32 subj _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 l' le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 inactivation inactivation NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 de de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 BD2 BD2 NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 est être VRB _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 33 moins moins ADV _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 34 drastique drastique ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 ( ( PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 36 Pivot-Pajot Pivot-Pajot NOM _ _ 16 parenth _ _ _ _ _ 37 et et COO _ _ 40 mark _ _ _ _ _ 38 al. al. ADV _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 , , PUNC _ _ 40 punc _ _ _ _ _ 40 2003 2003 NUM _ _ 36 para _ _ _ _ _ 41 ) ) PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 42 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1839 # text = G. Perspectives 1 G. G. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Perspectives Perspectives NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1840 # text = I. Le rôle des régions adjacentes 1 I. I. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Le Le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 rôle rôle NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 régions région NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 adjacentes adjacent ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1841 # text = Pivot-Pajot ses collègues ont montré que la délétion des résidus 1 à 13 ou des résidus 392 à 443 abolit l'activité de remodelage de la chromatine de ? 1 Pivot-Pajot pivot-pajot NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 ses son DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 collègues collègue NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ont avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 que que CSU _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 délétion délétion NOM _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 9 des de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 résidus résidu NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 1 1 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 13 13 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ou ou COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 des de PRE _ _ 12 para _ _ _ _ _ 16 résidus résidu NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 392 392 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 à à PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 443 443 NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 abolit abolir VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 21 l' le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 activité activité NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 remodelage remodelage NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 la le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 chromatine chromatine NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 29 ? ? PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1842 # text = C-Brdt . 1 C-Brdt C-Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1843 # text = Il ont également montré que la protéine exprimée en cellule de mammifère porte dans cette partie C terminale une phosphorylation dont l'absence n'est pas à l'origine de la perte de fonction puisque la protéine exprimée dans un système bactérien est également capable d'induire la compaction de la chromatine ( Pivot-Pajot et al. , 2003 ) . 1 Il il CLS _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ont avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 également également ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 montré montrer ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 que queComp? PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 protéine protéine NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 8 exprimée exprimer VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 en en PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 cellule cellule NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 mammifère mammifère NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 porte porter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 dans dans PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 cette ce DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 partie partie NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 C C NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 terminale terminal ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 une un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 phosphorylation phosphorylation NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 21 dont dont PRQ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 22 l' le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 absence absence NOM _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 24 n' ne ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 est être VRB _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 26 pas pas ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 à à PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 l' le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 origine origine NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 de de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 la le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 perte perte NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 de de PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 fonction fonction NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 puisque puisque CSU _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 36 la le DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 protéine protéine NOM _ _ 43 subj _ _ _ _ _ 38 exprimée exprimer VPP _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 dans dans PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 un un DET _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 41 système système NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 bactérien bactérien ADJ _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 est être VRB _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 44 également également ADV _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 capable capable ADJ _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 46 d' de PRE _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 induire induire VNF _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 la le DET _ _ 49 spe _ _ _ _ _ 49 compaction compaction NOM _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 50 de de PRE _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 51 la le DET _ _ 52 spe _ _ _ _ _ 52 chromatine chromatine NOM _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 53 ( ( PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 54 Pivot-Pajot Pivot-Pajot NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 55 et et COO _ _ 56 mark _ _ _ _ _ 56 al. al. NOM _ _ 54 para _ _ _ _ _ 57 , , PUNC _ _ 58 punc _ _ _ _ _ 58 2003 2003 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 59 ) ) PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 60 . . PUNC _ _ 59 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1844 # text = Nous avons observé que l'extrémité N terminale de Brdt ( résidus 12 à 27 ) est essentielle à sa cristallisation et que ces résidus chapeautent le bromodomaine puis forment une hélice qui vient se placer parallèlement aux hélices A et B , avant de passer à la surface de la boucle ZA . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 observé observer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 que que CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 extrémité extrémité NOM _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 7 N N NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 terminale terminal ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 Brdt Brdt NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 résidus résidu NOM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 13 12 12 NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 27 27 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 17 est être VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 18 essentielle essentiel ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 à à PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 sa son DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 cristallisation cristallisation NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 23 que que CSU _ _ 4 para _ _ _ _ _ 24 ces ce DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 résidus résidu NOM _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 26 chapeautent chapeauter VRB _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 27 le le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 bromodomaine bromé NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 puis puis COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 30 forment former VRB _ _ 26 para _ _ _ _ _ 31 une un DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 hélice hélice NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 qui qui PRQ _ _ 34 subj _ _ _ _ _ 34 vient venir VRB _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 se se CLI _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 36 placer placer VNF _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 parallèlement parallèlement ADV _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 aux à PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 hélices hélice NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 A A NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 et et COO _ _ 42 mark _ _ _ _ _ 42 B B NOM _ _ 40 para _ _ _ _ _ 43 , , PUNC _ _ 44 punc _ _ _ _ _ 44 avant avant de PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 45 de avant de PRE _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 passer passer VNF _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 à à PRE _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 la le DET _ _ 49 spe _ _ _ _ _ 49 surface surface NOM _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 50 de de PRE _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 51 la le DET _ _ 52 spe _ _ _ _ _ 52 boucle boucle NOM _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 53 ZA ZA NOM _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 54 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1845 # text = Une conformation similaire est observée pour les structures cristallographiques de Brd 3 -BD1 [ PDB-2NXB ] et Brd 4 -BD1 [ PDB-2OSS ] 1 Une un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 conformation conformation NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 similaire similaire ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 est être VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 observée observer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 pour pour PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 structures structure NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 cristallographiques cristallographique ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 Brd Brd NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 3 3 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 -BD1 -BD1 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 [ ( PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 15 PDB-2NXB PDB-2NXB NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 ] ) PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 18 Brd Brd NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 19 4 4 NUM _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 -BD1 -BD1 NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 [ ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 PDB-2OSS PDB-2OSS NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 23 ] ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1846 # text = [ Figure 57 ] . 1 [ ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 Figure Figure VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 57 57 NUM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 4 ] ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 5 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1847 # text = Nous avons aussi pu constater que les résidus 22 à 25 de Brdt-BD1 étaient importants pour la stabilité de la protéine en solution et qu'ils stabilisaient probablement le repliement du bromodomaine . 1 Nous nous CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 3 aussi aussi ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 pu pouvoir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 constater constater VNF _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 que que CSU _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 résidus résidu NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 9 22 22 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 à à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 25 25 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 étaient être VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 15 importants important ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 pour pour PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 stabilité stabilité NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 protéine protéine NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 en en PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 solution solution NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 25 qu' que CSU _ _ 6 para _ _ _ _ _ 26 ils ils CLS _ _ 27 subj _ _ _ _ _ 27 stabilisaient stabiliser VRB _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 probablement probablement ADV _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 le le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 repliement repliement NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 31 du de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 bromodomaine bromé NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1848 # text = Cependant le rôle dans le remodelage de la chromatine des résidus 1 à 13 , manquants dans notre structure et celui de la partie C terminale de la protéine reste à élucider . 1 Cependant cependant ADV _ _ 30 periph _ _ _ _ _ 2 le le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 rôle rôle NOM _ _ 30 subj _ _ _ _ _ 4 dans dans PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 remodelage remodelage NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 chromatine chromatine NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 résidus résidu NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 1 1 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 à à PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 13 13 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 16 manquants manquant NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 dans dans PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 notre son DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 structure structure NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 celui celui PRQ _ _ 19 para _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 partie partie NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 C C NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 terminale terminal ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 28 la le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 protéine protéine NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 reste rester VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 31 à à PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 élucider élucider VNF _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1849 # text = II . Un dialogue entre les deux bromodomaines de Brdt  ? 1 II ii NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Un Un NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 dialogue dialoguer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 entre entre PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 7 deux deux NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 bromodomaines oromo NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 Brdt Brdt NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11  ? ? PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1850 # text = Nos expériences d'ITC ont permis d'attribuer l'affinité de Brdt pour la queue de l'histone H4 tétra-acétylée à son premier bromodomaine . 1 Nos son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 expériences expérience NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ITC ITC NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ont avoir VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 permis permettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 d' de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 attribuer attribuer VNF _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 affinité affinité NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 Brdt Brdt NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 pour pour PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 queue queue NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 l' le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 histone histone NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 H4 H4 NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 tétra-acétylée tétra-acétyle NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 à à PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 son son DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 23 premier premier ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 24 bromodomaine brome NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1851 # text = En effet l'affinité de BD2 pour un peptide H4 tétra-acétylé est négligeable 1 En en effet PRE _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 effet en effet NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 l' le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 affinité affinité NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 BD2 BD2 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 pour pour PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 un un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 peptide peptide NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 H4 H4 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 négligeable négligeable ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1852 # text = ( Kd > 103 M ) devant celle de la partie N terminale de Brdt ( ? C-Brdt , qui contient les deux bromodomaines et leurs régions adjacentes ) ou devant celle de Brdt-BD1 ( Kd respectivement égaux à 14 µM et 28 µM ) . 1 ( ( PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 2 Kd Kd NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 3 > > VPR _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 103 103 NUM _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 M M NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 devant devoir VPR _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 celle celui PRQ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 partie partie NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 N N NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 terminale terminal ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 Brdt Brdt NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 17 ? ? PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 18 C-Brdt C-Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 20 qui qui PRQ _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 21 contient contenir VRB _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 les le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 23 deux deux NUM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 24 bromodomaines oromo NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 25 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 26 leurs son DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 régions région NOM _ _ 24 para _ _ _ _ _ 28 adjacentes adjacent ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 ) ) PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 30 ou ou COO _ _ 31 mark _ _ _ _ _ 31 devant devoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 32 celle celui PRQ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 33 de de PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 ( ( PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 36 Kd Kd NOM _ _ 34 parenth _ _ _ _ _ 37 respectivement respectivement ADV _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 38 égaux égal ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 39 à à PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 14 14 NUM _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 41 µM micro- NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 et et COO _ _ 44 mark _ _ _ _ _ 43 28 28 NUM _ _ 44 spe _ _ _ _ _ 44 µM micro- NOM _ _ 41 para _ _ _ _ _ 45 ) ) PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 46 . . PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1853 # text = Des résultats similaires ont été obtenus par co-purification in-vitro des protéines BD1 et BD2 recombinantes avec un peptide H4 tétra-acétylé ( S . 1 Des un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résultats résultat NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 similaires similaire ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ont avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 été être VPP _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 obtenus obtenir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 par par PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 co-purification co- NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 in-vitro in- ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 protéines protéine NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 BD1 BD1 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 et et COO _ _ 14 mark _ _ _ _ _ 14 BD2 BD2 NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 15 recombinantes recombinante ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 16 avec avec PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 17 un un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 peptide peptide NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 H4 H4 NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 ( ( PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 22 S S NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1854 # text = Khochbin et al. , résultats non publiés ) . 1 Khochbin Khochbin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 3 al. al. ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 résultats résultat NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 6 non non ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 publiés publier ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1855 # text = Dans cette expérience , BD1 se fixe au peptide H4 acétylé alors que BD2 n'est pas observé . 1 Dans dans PRE _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 cette ce DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 expérience expérience NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 BD1 BD1 NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 6 se se CLI _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 fixe fixer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 au à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 peptide peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 H4 H4 NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 acétylé acétylé NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 alors alors que CSU _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 que alors que CSU _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 14 BD2 BD2 NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 15 n' ne ADV _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 16 est être VRB _ _ 18 aux _ _ _ _ _ 17 pas pas ADV _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 observé observer VPP _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1856 # text = Pourtant une expérience montre que si on exprime la protéine ? 1 Pourtant pourtant ADV _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 une un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 expérience expérience NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 que que CSU _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 si si ADV _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 7 on on CLS _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 exprime exprimer VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 protéine protéine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 ? ? PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1857 # text = C-Brdt dans des cellules de mammifère , la protéine présente dans l'extrait cellulaire co-purifie avec un peptide H4 tétra-acétylé et que cette co-purification est abolie dans le cas des protéines ? 1 C-Brdt C-Brdt NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 2 dans dans PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 des un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 cellules cellule NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 mammifère mammifère NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 protéine protéine NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 10 présente présent ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 dans dans PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 l' le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 extrait extrait NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 cellulaire cellulaire ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 co-purifie co- VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 avec avec PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 un un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 peptide peptide NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 H4 H4 NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 22 que que PRQ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 23 cette ce DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 co-purification co- NOM _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 25 est être VRB _ _ 16 para _ _ _ _ _ 26 abolie abolir ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 27 dans dans PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 le le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 cas cas NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 des de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 protéines protéine NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 ? ? PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1858 # text = C-Brdt dont BD1 ou BD2 ont été inactivés . ( Pivot-Pajot et al. , 2003 ) . 1 C-Brdt C-Brdt NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 2 dont dont PRQ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 BD1 BD1 NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ou ou COO _ _ 5 mark _ _ _ _ _ 5 BD2 BD2 NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 ont avoir VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 été être VPP _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 inactivés inactiver VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 ( ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 Pivot-Pajot Pivot-Pajot NOM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 13 al. al. ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 2003 2003 NUM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 16 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1859 # text = Cela paraît contredire l'absence d'affinité entre BD2 et le peptide H4 tétra-acétylé observée par ITC et co-purification in-vitro et semble indiquer que l'interaction de Brdt et de l'histone H4 hyperacétylée peut être régulée in-vivo et que cette régulation implique BD2 . 1 Cela cela PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 paraît paraître VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 contredire contredire VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 absence absence NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 d' de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 affinité affinité NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 entre entre PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 BD2 BD2 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 peptide peptide NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 13 H4 H4 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 tétra-acétylé tétra-acétyle NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 observée observer VPP _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 16 par par PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 ITC ITC NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 et et COO _ _ 20 mark _ _ _ _ _ 19 co-purification co- NOM _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 20 in-vitro in- VRB _ _ 2 para _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 22 semble sembler VRB _ _ 20 para _ _ _ _ _ 23 indiquer indiquer VNF _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 que que CSU _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 l' le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 interaction interaction NOM _ _ 35 subj _ _ _ _ _ 27 de de PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 Brdt Brdt NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 et et COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 30 de de PRE _ _ 27 para _ _ _ _ _ 31 l' le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 histone histone NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 H4 H4 NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 hyperacétylée hyperacétylée ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 peut pouvoir VRB _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 36 être être VNF _ _ 37 aux _ _ _ _ _ 37 régulée réguler VPP _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 in-vivo in- ADV _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 et et COO _ _ 40 mark _ _ _ _ _ 40 que que CSU _ _ 24 para _ _ _ _ _ 41 cette ce DET _ _ 42 spe _ _ _ _ _ 42 régulation régulation NOM _ _ 43 subj _ _ _ _ _ 43 implique impliquer VRB _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 44 BD2 BD2 NOM _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1860 # text = Plusieurs hypothèses peuvent être formulées : ( i ) La présence d'une modification post-traductionnelle de Brdt régule une interaction entre BD1 et BD2 qui influence l'interaction de Brdt-BD1 et de l'histone H4 hyperacétylée ( un autre facteur occupe / cache le site de fixation de BD1 dans le cas ou BD2 est inactivé ) ( ii ) La présence des régions adjacentes aux bromodomaines ( extrémité N et C terminales et partie reliant les deux bromodomaines ) modifie le comportement de BD1 quand BD2 est inactif . ( iii ) BD2 présente une affinité résiduelle pour H4 tétra-acétylé tétra-acétylé suffisante pour que sa disparition fasse passer l'interaction de DeltaC-Brdt et du peptide H4 sous le seuil de détection du western-blot ( peu probable ) . 1 Plusieurs plusieurs DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 hypothèses hypothèse NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 peuvent pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 être être VNF _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 formulées formuler VPP _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 : : PUNC _ _ 108 punc _ _ _ _ _ 7 ( id est PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 i id est COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 9 ) id est PUNC _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 La La DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 présence présence NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 12 d' de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 une un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 modification modification NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 post-traductionnelle post-traductionnelle ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 Brdt Brdt NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 régule réguler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 une un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 interaction interaction NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 entre entre PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 BD1 BD1 NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 24 BD2 BD2 NOM _ _ 22 para _ _ _ _ _ 25 qui qui PRQ _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 26 influence influencer VRB _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 27 l' le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 interaction interaction NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 de de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 et et COO _ _ 32 mark _ _ _ _ _ 32 de de PRE _ _ 29 para _ _ _ _ _ 33 l' le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 histone histone NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 H4 H4 NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 hyperacétylée hyperacétylée ADJ _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 ( ( PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 38 un un DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 39 autre autre ADJ _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 40 facteur facteur NOM _ _ 41 subj _ _ _ _ _ 41 occupe occuper VRB _ _ 28 parenth _ _ _ _ _ 42 / sur PUNC _ _ 56 punc _ _ _ _ _ 43 cache cache NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 le le DET _ _ 45 spe _ _ _ _ _ 45 site site NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 46 de de PRE _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 fixation fixation NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 de de PRE _ _ 47 dep _ _ _ _ _ 49 BD1 BD1 NOM _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 dans dans PRE _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 51 le le DET _ _ 52 spe _ _ _ _ _ 52 cas cas NOM _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 53 ou ou COO _ _ 56 mark _ _ _ _ _ 54 BD2 BD2 NOM _ _ 56 subj _ _ _ _ _ 55 est être VRB _ _ 56 aux _ _ _ _ _ 56 inactivé inactiver VPP _ _ 41 para _ _ _ _ _ 57 ) ) PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 58 ( ( PUNC _ _ 59 punc _ _ _ _ _ 59 ii if NOM _ _ 56 para _ _ _ _ _ 60 ) ) PUNC _ _ 59 punc _ _ _ _ _ 61 La La DET _ _ 62 spe _ _ _ _ _ 62 présence présence NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 63 des de PRE _ _ 62 dep _ _ _ _ _ 64 régions région NOM _ _ 63 dep _ _ _ _ _ 65 adjacentes adjacent ADJ _ _ 64 dep _ _ _ _ _ 66 aux à PRE _ _ 64 dep _ _ _ _ _ 67 bromodomaines oromo NOM _ _ 66 dep _ _ _ _ _ 68 ( ( PUNC _ _ 78 punc _ _ _ _ _ 69 extrémité extrémité NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 70 N N NOM _ _ 69 dep _ _ _ _ _ 71 et et COO _ _ 72 mark _ _ _ _ _ 72 C C NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 73 terminales terminale NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 74 et et COO _ _ 75 mark _ _ _ _ _ 75 partie partie NOM _ _ 73 para _ _ _ _ _ 76 reliant relier VPR _ _ 75 dep _ _ _ _ _ 77 les le DET _ _ 79 spe _ _ _ _ _ 78 deux deux NUM _ _ 79 parenth _ _ _ _ _ 79 bromodomaines brome NOM _ _ 76 dep _ _ _ _ _ 80 ) ) PUNC _ _ 78 punc _ _ _ _ _ 81 modifie modifier VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 82 le le DET _ _ 83 spe _ _ _ _ _ 83 comportement comportement NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 84 de de PRE _ _ 83 dep _ _ _ _ _ 85 BD1 BD1 NOM _ _ 84 dep _ _ _ _ _ 86 quand quand CSU _ _ 0 root _ _ _ _ _ 87 BD2 BD2 NOM _ _ 88 subj _ _ _ _ _ 88 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 89 inactif inactif ADJ _ _ 88 dep _ _ _ _ _ 90 . . PUNC _ _ 88 punc _ _ _ _ _ 91 ( ( PUNC _ _ 92 punc _ _ _ _ _ 92 iii ici ADV _ _ 95 periph _ _ _ _ _ 93 ) ) PUNC _ _ 92 punc _ _ _ _ _ 94 BD2 BD2 NOM _ _ 95 subj _ _ _ _ _ 95 présente présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 96 une un DET _ _ 97 spe _ _ _ _ _ 97 affinité affinité NOM _ _ 95 dep _ _ _ _ _ 98 résiduelle résiduel ADJ _ _ 97 dep _ _ _ _ _ 99 pour pour PRE _ _ 95 dep _ _ _ _ _ 100 H4 H4 NOM _ _ 101 dep _ _ _ _ _ 101 tétra-acétylé tétra-acétylé NOM _ _ 99 dep _ _ _ _ _ 102 tétra-acétylé acétyle NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 103 suffisante suffisant ADJ _ _ 102 dep _ _ _ _ _ 104 pour pour PRE _ _ 103 dep _ _ _ _ _ 105 que que? PRQ _ _ 104 dep _ _ _ _ _ 106 sa son DET _ _ 107 spe _ _ _ _ _ 107 disparition disparition NOM _ _ 108 subj _ _ _ _ _ 108 fasse faire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 109 passer passer VNF _ _ 108 dep _ _ _ _ _ 110 l' le DET _ _ 111 spe _ _ _ _ _ 111 interaction interaction NOM _ _ 109 dep _ _ _ _ _ 112 de de PRE _ _ 111 dep _ _ _ _ _ 113 DeltaC-Brdt DeltaC-Brdt NOM _ _ 112 dep _ _ _ _ _ 114 et et COO _ _ 115 mark _ _ _ _ _ 115 du de PRE _ _ 112 para _ _ _ _ _ 116 peptide peptide NOM _ _ 115 dep _ _ _ _ _ 117 H4 H4 NOM _ _ 116 dep _ _ _ _ _ 118 sous sous PRE _ _ 109 dep _ _ _ _ _ 119 le le DET _ _ 120 spe _ _ _ _ _ 120 seuil seuil NOM _ _ 118 dep _ _ _ _ _ 121 de de PRE _ _ 120 dep _ _ _ _ _ 122 détection détection NOM _ _ 121 dep _ _ _ _ _ 123 du de PRE _ _ 122 dep _ _ _ _ _ 124 western-blot western-blog NOM _ _ 123 dep _ _ _ _ _ 125 ( ( PUNC _ _ 127 punc _ _ _ _ _ 126 peu peu ADV _ _ 127 dep _ _ _ _ _ 127 probable probable ADJ _ _ 124 parenth _ _ _ _ _ 128 ) ) PUNC _ _ 127 punc _ _ _ _ _ 129 . . PUNC _ _ 108 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1861 # text = Un phénomène d'auto-régulation a récemment été rapporté pour Rsc 4 , un facteur de remodelage de la chromatine impliqué dans l'activation de la transcription . 1 Un un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 phénomène phénomène NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 3 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 auto-régulation auto- NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 a avoir VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 6 récemment récemment ADV _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 été être VPP _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 rapporté rapporter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 pour pour PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 Rsc Rsc NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 4 4 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 13 un un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 facteur facteur NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 remodelage remodelage NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 la le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 chromatine chromatine NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 impliqué impliquer VPP _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 21 dans dans PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 l' le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 activation activation NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 la le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 transcription transcription NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1862 # text = Cette protéine contient un double bromodomaine dont le premier reconnaît une lysine acétylée située a l'extrémité N terminale de lui-même , entraînant l'inhibition de l'interaction du second bromodomaine et de son ligand ( H 3 -acK 14 ) ( VanDemark et al. , 2007 ) . 1 Cette Cette NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 protéine protéine NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 contient contenir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 5 double double ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 bromodomaine oromo NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 dont dont PRQ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 premier premier ADJ _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 10 reconnaît reconnaître VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 une un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 lysine lysine NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 acétylée acétyle NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 située situer ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 l' le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 extrémité extrémité NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 N N NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 terminale terminal ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 lui-même lui-même PRQ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 entraînant entraîner VPR _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 24 l' le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 inhibition inhibition NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 l' le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 interaction interaction NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 du de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 30 second second ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 31 bromodomaine brome NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 et et COO _ _ 33 mark _ _ _ _ _ 33 de de PRE _ _ 29 para _ _ _ _ _ 34 son son DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 ligand ligand NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 ( ( PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 37 H H NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 38 3 3 NUM _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 -acK -acK NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 14 14 NUM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 ) ) PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 42 ( ( PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 43 VanDemark VanDemark NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 44 et et COO _ _ 47 mark _ _ _ _ _ 45 al. al. ADV _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 , , PUNC _ _ 47 punc _ _ _ _ _ 47 2007 2007 NUM _ _ 43 para _ _ _ _ _ 48 ) ) PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 49 . . PUNC _ _ 48 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1863 # text = Cependant il s'agit là d'une inhibition d'un bromodomaine sur l'autre alors que , dans le cas de Brdt , il semble s'agir de l'activation de BD1 par BD2 . 1 Cependant cependant ADV _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 il il CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 s' s' CLI _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 agit agir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 là là ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 d' de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 une un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 inhibition inhibition NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 d' de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 un un DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 bromodomaine bromé NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 sur sur PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 l' le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 autre autre PRQ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 alors alors que CSU _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 que alors que CSU _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 18 dans dans PRE _ _ 25 periph _ _ _ _ _ 19 le le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 cas cas NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 Brdt Brdt NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 24 il il CLS _ _ 25 subj _ _ _ _ _ 25 semble sembler VRB _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 26 s' s' CLI _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 27 agir agir VNF _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 l' le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 activation activation NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 de de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 BD1 BD1 NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 par par PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 34 BD2 BD2 NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1864 # text = L'existence éventuelle d'un mécanisme de régulation entre les deux bromodomaines de Brdt reste donc à éclaircir . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 existence existence NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 3 éventuelle éventuel ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 un un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 mécanisme mécanisme NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 régulation régulation NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 entre entre PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 les le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 11 deux deux NUM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 bromodomaines oromo NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 Brdt Brdt NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 reste rester VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 donc donc ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 à à PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 éclaircir éclaircir VNF _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1865 # text = Un modèle qui expliquerait les résultats de co-purification sur la protéine exprimée en système eucaryote pourrait être que la lysine K61 subit in-vivo une acétylation si elle n'est pas protégée par la partie N terminale de Brdt ou par BD2 . 1 Un un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 modèle modèle NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 3 qui qui PRQ _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 expliquerait expliquer VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 résultats résultat NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 co-purification co- NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 sur sur PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 protéine protéine NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 exprimée exprimer VPP _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 en en PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 système système NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 eucaryote eucaryote ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 être être VNF _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 que que CSU _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 lysine lysine NOM _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 21 K61 K61 NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 subit subir VRB _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 23 in-vivo in- ADV _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 une un DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 acétylation acétylation NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 26 si si CSU _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 27 elle elle CLS _ _ 31 subj _ _ _ _ _ 28 n' ne ADV _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 29 est être VRB _ _ 31 aux _ _ _ _ _ 30 pas pas ADV _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 31 protégée protéger VPP _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 32 par par PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 la le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 partie partie NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 N N NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 terminale terminal ADJ _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 de de PRE _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 38 Brdt Brdt NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 ou ou COO _ _ 40 mark _ _ _ _ _ 40 par par PRE _ _ 37 para _ _ _ _ _ 41 BD2 BD2 NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1866 # text = Cette acétylation empêcherait l'association de BD1 à la chromatine soit parce que l'ADN chargé négativement repousse l'acétyle soit parce que la lysine acétylée occupe le site actif de BD1 . 1 Cette Cette NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 acétylation acétylation NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 empêcherait empêcher VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 association association NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 BD1 BD1 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 chromatine chromatine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 soit soit COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 12 parce parce que CSU _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 que parce que CSU _ _ 8 para _ _ _ _ _ 14 l' le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 ADN ADN NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 16 chargé charger ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 négativement négativement ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 repousse repousser VRB _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 19 l' le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 acétyle acétyle NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 soit soit COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 22 parce parce que CSU _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 23 que parce que CSU _ _ 13 para _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 lysine lysine NOM _ _ 27 subj _ _ _ _ _ 26 acétylée acétyle NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 occupe occuper VRB _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 28 le le DET _ _ 29 spe _ _ _ _ _ 29 site site NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 actif actif ADJ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 de de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 BD1 BD1 NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1867 # text = III . Brdt et la compaction de la chromatine 1 III iii NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Brdt Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 et et COO _ _ 6 mark _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 compaction compaction NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 chromatine chromatine NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1868 # text = Pivot-Pajot et ses collègues ont montré que Brdt est capable d'induire la compaction de la chromatine dans des cellules de mammifère dont la chromatine est hyperacétylée . 1 Pivot-Pajot Pivot-Pajot NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 3 ses son DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 collègues collègue NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 5 ont avoir VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 que que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 Brdt Brdt NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 9 est être VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 capable capable ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 d' de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 induire induire VNF _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 compaction compaction NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 chromatine chromatine NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 dans dans PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 19 des un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 cellules cellule NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 mammifère mammifère NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 dont dont PRQ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 chromatine chromatine NOM _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 26 est être VRB _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 27 hyperacétylée hyperacétylée ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1869 # text = Nous avons montré in-vitro que les bromodomaines de Brdt étaient capables de discriminer les différents états d'acétylation des queues H4 et H3 . 1 Nous nous CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 montré montrer ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 in-vitro in- ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 bromodomaines oromo NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 Brdt Brdt NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 étaient être VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 11 capables capable ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 discriminer discriminer VNF _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 les le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 15 différents différent ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 états états NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 d' de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 acétylation acétylation NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 des de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 queues queue NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 H4 H4 NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 et et COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 23 H3 H3 NOM _ _ 21 para _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1870 # text = Il est très probable que la capacité de BD1 d'interagir spécifiquement avec la queue acétylée de H4 soit conservé in-vivo . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 très très ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 probable probable ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 capacité capacité NOM _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 BD1 BD1 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 d' de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 interagir interagir VNF _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 spécifiquement spécifiquement ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 avec avec PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 queue queue NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 acétylée acétyle NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 H4 H4 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 soit être VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 20 conservé conserver ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 21 in-vivo in- ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1871 # text = Le second bromodomaine de Brdt montre in-vitro une préférence pour la lysine acétylée K18 de H3 mais l'affinité relativement faible mesurée peut faire penser qu'il existe in-vivo d'autres ligands pour BD2 . 1 Le le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 second second ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 bromodomaine brome NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 Brdt Brdt NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 montre montre NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 in-vitro in- VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 une un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 préférence préférence NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 pour pour PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 lysine lysine NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 acétylée acétyle NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 K18 K18 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 H3 H3 NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 mais mais COO _ _ 23 mark _ _ _ _ _ 18 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 affinité affinité NOM _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 20 relativement relativement ADV _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 faible faible ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 mesurée mesurer ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 23 peut pouvoir VRB _ _ 7 para _ _ _ _ _ 24 faire faire VNF _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 penser penser VNF _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 qu' que CSU _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 il il CLS _ _ 28 subj _ _ _ _ _ 28 existe exister VRB _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 in-vivo in- ADV _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 d' un DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 31 autres autre ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 32 ligands ligand NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 33 pour pour PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 34 BD2 BD2 NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1872 # text = Nous avons fait l'hypothèse que la région de la lysine K 5 ac de la queue de l'histone H2A pouvait convenir . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 fait faire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 hypothèse hypothèse NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 que que CSU _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 région région NOM _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 lysine lysine NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 K K NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 5 5 NUM _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 ac ace NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 queue queue NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 l' le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 histone histone NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 H2A H2A NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 pouvait pouvoir VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 23 convenir convenir VNF _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1873 # text = Brdt pourrait être impliqué dans la compaction de la chromatine de différentes façons . 1 Brdt Brdt NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 être être VNF _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 impliqué impliquer VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 dans dans PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 compaction compaction NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 chromatine chromatine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 différentes différent DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 façons façon NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1874 # text = a . Une fonction de chaperonne  ? 1 a a NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Une Une DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 fonction fonction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 chaperonne chaperonner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7  ? ? PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1875 # text = Brdt pourrait agir comme protéine chaperonne . 1 Brdt Brdt NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 agir agir VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 comme comme CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 protéine protéine NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 chaperonne chaperonner VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1876 # text = Allant dans ce sens , il a été montré que Brdt est capable d'induire le relargage de l'histone de liaison H1 des zones de la chromatine où il induit une compaction ( Govin et al. , 2006 ) . 1 Allant aller VPR _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 dans dans PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 ce ce DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 sens sens NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 6 il il CLS _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 7 a avoir VRB _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 été être VPP _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 montré montrer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 que que CSU _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 Brdt Brdt NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 12 est être VRB _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 capable capable ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 d' de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 induire induire VNF _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 le le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 relargage relargage NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 l' le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 histone histone NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 liaison liaison NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 H1 H1 NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 des de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 zones zone NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 la le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 chromatine chromatine NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 où où PRQ _ _ 31 periph _ _ _ _ _ 30 il il CLS _ _ 31 subj _ _ _ _ _ 31 induit induire VRB _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 32 une un DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 compaction compaction NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 ( ( PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 35 Govin Govin NOM _ _ 33 parenth _ _ _ _ _ 36 et et COO _ _ 39 mark _ _ _ _ _ 37 al. al. ADV _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 , , PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 39 2006 2006 NUM _ _ 35 para _ _ _ _ _ 40 ) ) PUNC _ _ 35 punc _ _ _ _ _ 41 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1877 # text = Il est donc envisageable que Brdt soit responsable du remplacement des histones de liaison H1 de type somatique par les variants spécifiques du testicule H 1t et Hils ou de l'incorporation d'autres variants d'histones . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 donc donc ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 envisageable envisageable ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 Brdt Brdt NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 7 soit être VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 responsable responsable ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 du de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 remplacement remplacement NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 des de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 histones histone NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 liaison liaison NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 H1 H1 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 17 type type NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 somatique somatique ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 par par PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 les le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 variants variant NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 spécifiques spécifique ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 du de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 testicule testicule NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 H H NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 1t 1t NUM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 28 Hils Hils NOM _ _ 24 para _ _ _ _ _ 29 ou ou COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 30 de de PRE _ _ 23 para _ _ _ _ _ 31 l' le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 incorporation incorporation NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 d' de PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 autres autre ADJ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 35 variants variant NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 d' de PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 histones histone NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1878 # text = Confortant cette hypothèse , une fonction de chaperonne a récemment été mise en évidence pour les homologues Brd 2 et Brd 3 ( LeRoy et al. , 2008 ) . 1 Confortant conforter VPR _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 cette ce DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 hypothèse hypothèse NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 une un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 fonction fonction NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 chaperonne chaperonner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 récemment récemment ADV _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 été être VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 mise mettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 en en PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 évidence évidence NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 pour pour PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 homologues homologue NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 Brd Brd NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 2 2 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 Brd Brd NOM _ _ 17 para _ _ _ _ _ 22 3 3 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 LeRoy LeRoy NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 et et COO _ _ 26 mark _ _ _ _ _ 26 al. al. NOM _ _ 24 para _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 2008 2008 NUM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 ) ) PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1879 # text = b . Une fonction architecturale  ? 1 b b NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Une Une DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 fonction fonction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 architecturale architectural ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6  ? ? PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1880 # text = Brdt pourrait avoir un rôle structural direct par la stabilisation d'une structure chromatinienne compacte . 1 Brdt Brdt NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 avoir avoir VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 rôle rôle NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 structural structural ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 direct direct ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 stabilisation stabilisation NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 d' de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 une un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 structure structure NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 chromatinienne chromatinien ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 compacte compact ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1881 # text = Cela implique que Brdt interagisse avec plusieurs nucléosomes adjacents . 1 Cela cela PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 implique impliquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 Brdt Brdt NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 5 interagisse interagir VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 avec avec PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 plusieurs plusieurs DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 nucléosomes nucléé NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 adjacents adjacent ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1882 # text = Il serait alors logique que chacun des bromodomaines de Brdt reconnaisse un nucléosome différent . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 serait être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 alors alors ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 logique logique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 chacun chacun PRQ _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 7 des un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 bromodomaines brome NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 Brdt Brdt NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 reconnaisse reconnaître VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 un un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 nucléosome nucléé NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 différent différent ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1883 # text = Une telle fonction de réticulation a été décrite pour plusieurs protéines telles que des protéines du groupe polycomb , les protéines 1 Une un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 telle tel ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 fonction fonction NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 réticulation réticulation NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 a avoir VRB _ _ 7 aux _ _ _ _ _ 7 été être VPP _ _ 8 aux _ _ _ _ _ 8 décrite décrire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 pour pour PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 plusieurs plusieurs DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 protéines protéine NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 telles tel ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 que que CSU _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 des un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 protéines protéine NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 du de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 groupe groupe NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 polycomb poly- NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 20 les le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 protéines protéine NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1884 # text = Methyl-CpG binding protein 2 ( MeCP 2 ) , Myeloid and erythroid nuclear termination stage specific protein ( MENT ) et SIR 3 Pp ( McBryant et al. , 2006 ) ou encore pour la protéine L3MBT1 de la famille des protéines MBT ( Malignant Brain Tumor ) qui est capable d'induire la compaction de la chromatine selon un mode direct dépendant de la méthyaltion ( Trojer et Reinberg , 2008 ) . 1 Methyl-CpG Methyl-CpG NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 binding binding NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 protein protein NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 4 2 2 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ( ( PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 MeCP MeCP NOM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 7 2 2 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 10 Myeloid Myeloid NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 11 and myeloid and erythroid nuclear termination stage specific NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 12 erythroid myeloid and erythroid nuclear termination stage specific NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 13 nuclear myeloid and erythroid nuclear termination stage specific NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 14 termination myeloid and erythroid nuclear termination stage specific NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 15 stage myeloid and erythroid nuclear termination stage specific NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 specific myeloid and erythroid nuclear termination stage specific NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 protein protein ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ( ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 MENT MENT NOM _ _ 16 parenth _ _ _ _ _ 20 ) ) PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 36 mark _ _ _ _ _ 22 SIR SIR NOM _ _ 36 subj _ _ _ _ _ 23 3 3 NUM _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 Pp Pp NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 ( ( PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 McBryant McBryant NOM _ _ 24 parenth _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 30 mark _ _ _ _ _ 28 al. al. ADV _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 30 2006 2006 NUM _ _ 26 para _ _ _ _ _ 31 ) ) PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 32 ou ou COO _ _ 34 mark _ _ _ _ _ 33 encore encore ADV _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 pour pour NOM _ _ 24 para _ _ _ _ _ 35 la la NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 protéine protéiner VRB _ _ 16 para _ _ _ _ _ 37 L3MBT1 L3MBT1 NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 de de PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 la le DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 famille famille NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 des de PRE _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 protéines protéine NOM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 MBT MBT NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 ( mbt ( malignant brain tumor ) PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 45 Malignant Malignant NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 46 Brain Brain NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 47 Tumor Tumor NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 48 ) mbt ( malignant brain tumor ) PUNC _ _ 43 punc _ _ _ _ _ 49 qui qui PRQ _ _ 50 subj _ _ _ _ _ 50 est être VRB _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 51 capable capable ADJ _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 52 d' de PRE _ _ 51 dep _ _ _ _ _ 53 induire induire VNF _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 54 la le DET _ _ 55 spe _ _ _ _ _ 55 compaction compaction NOM _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 56 de de PRE _ _ 55 dep _ _ _ _ _ 57 la le DET _ _ 58 spe _ _ _ _ _ 58 chromatine chromatine NOM _ _ 56 dep _ _ _ _ _ 59 selon selon PRE _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 60 un un DET _ _ 61 spe _ _ _ _ _ 61 mode mode NOM _ _ 59 dep _ _ _ _ _ 62 direct direct ADJ _ _ 61 dep _ _ _ _ _ 63 dépendant dépendre VPR _ _ 61 dep _ _ _ _ _ 64 de de PRE _ _ 63 dep _ _ _ _ _ 65 la le DET _ _ 66 spe _ _ _ _ _ 66 méthyaltion méthylation NOM _ _ 64 dep _ _ _ _ _ 67 ( ( PUNC _ _ 68 punc _ _ _ _ _ 68 Trojer Trojer NOM _ _ 66 parenth _ _ _ _ _ 69 et et COO _ _ 70 mark _ _ _ _ _ 70 Reinberg Reinberg NOM _ _ 68 para _ _ _ _ _ 71 , , PUNC _ _ 72 punc _ _ _ _ _ 72 2008 2008 NUM _ _ 70 dep _ _ _ _ _ 73 ) ) PUNC _ _ 68 punc _ _ _ _ _ 74 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1885 # text = Hormis la fixation des lysines acétylées par les bromodomaines de Brdt , d'autres interactions pourraient être impliquées . 1 Hormis hormis PRE _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 2 la le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 fixation fixation NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 lysines lysine NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 acétylées acétyle NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 par par PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 bromodomaines brome NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 Brdt Brdt NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 13 d' un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 14 autres autre ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 interactions interaction NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 16 pourraient pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 être être VNF _ _ 18 aux _ _ _ _ _ 18 impliquées impliquer VPP _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1886 # text = Les lysines 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 lysines lysine NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1887 # text = K61 et K59 pourraient contacter l'ADN des nucléosomes et orienter 1 K61 K61 NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 K59 K59 NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 4 pourraient pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 contacter contacter VNF _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 ADN ADN NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 nucléosomes nucléé NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 orienter orienter VNF _ _ 5 para _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1888 # text = Brdt par rapport à ceux -ci . 1 Brdt Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 par par rapport à PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 rapport par rapport à NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 à par rapport à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ceux celui PRQ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 -ci -ci ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1889 # text = La face nettement basique que possède 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 face face NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 nettement nettement ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 basique basique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 que que CSU _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 possède posséder VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1890 # text = BD1 pourrait servir de surface d'interaction ( avec l'ADN par exemple ) . 1 BD1 BD1 NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 servir servir VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 surface surface NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 d' de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 interaction interaction NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 9 avec avec PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 10 l' le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 ADN ADN NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 par par PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 exemple exemple NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1891 # text = La face acide de BD1 pourrait également être impliquée dans des interactions importantes . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 face face NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 acide acide ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 BD1 BD1 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 également également ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 être être VNF _ _ 9 aux _ _ _ _ _ 9 impliquée impliquer VPP _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 des un DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 interactions interaction NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 importantes important ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1892 # text = Enfin , les régions adjacentes aux bromodomaines , indispensables à la compaction induite par Brdt pourraient établir des contacts importants pour une éventuelle fonction architecturale de Brdt . 1 Enfin enfin ADV _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 les le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 régions région NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 5 adjacentes adjacent ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 aux à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 bromodomaines bromé NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 9 indispensables indispensable ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 à à PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 12 compaction compaction ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 induite induire ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 par par NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 15 Brdt Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 pourraient pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 établir établir VNF _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 des un DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 contacts contact NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 importants important ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 pour pour PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 22 une un DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 23 éventuelle éventuel ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 24 fonction fonction NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 25 architecturale architectural ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 Brdt Brdt NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1893 # text = c . Un lien avec les variants de l'histone H 2A   ? 1 c c NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Un Un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 lien lien NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 avec avec PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 variants variant NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 histone histone NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 H H NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 2A 2A NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13   2a   NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 ? ? PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1894 # text = Il est intéressant de noter que le dimère H2A / H2B porte une région acide qui sert de surface d'interaction pour la queue de l'histone 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 intéressant intéressant ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 noter noter VNF _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 que que CSU _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 le le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 dimère dimère NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 9 H2A H2A NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 / ou PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 H2B H2B NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 12 porte porter VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 13 une un DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 région région NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 acide acide ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 qui qui PRQ _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 17 sert servir VRB _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 surface surface NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 d' de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 interaction interaction NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 pour pour PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 queue queue NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 l' le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 histone histone NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1895 # text = H4 . 1 H4 H4 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1896 # text = Cette surface est impliquée dans la stabilisation de la fibre de 30 nm et dans l'établissement de structures compactes d'ordre supérieur . 1 Cette Cette NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 surface surface NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 impliquée impliquer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 dans dans PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 stabilisation stabilisation NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 fibre fibre NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 30 30 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 nm minute NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 dans dans PRE _ _ 11 para _ _ _ _ _ 16 l' le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 établissement établissement NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 structures structure NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 compactes compact ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 d' de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 ordre ordre NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 supérieur supérieur ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1897 # text = Il semble que ce soit la neutralisation de celle -ci qui conditionne la compaction de la chromatine ( voir l'introduction ) . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 semble sembler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 que que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 ce ce CLS _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 5 soit être VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 neutralisation neutralisation NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 celle celui PRQ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 -ci -ci ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 qui qui PRQ _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 12 conditionne conditionner VRB _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 compaction compaction NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 chromatine chromatine NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 ( ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 voir voir VNF _ _ 12 parenth _ _ _ _ _ 20 l' le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 introduction introduction NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 ) ) PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1898 # text = Cette région basique est également utilisée par le récepteur nucléaire LANA de l'herpesvirus KSHV qui assure sa transmission aux cellules filles en s'attachant aux chromosomes mitotiques . 1 Cette Cette NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 région région NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 3 basique basique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 est être VRB _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 5 également également ADV _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 utilisée utiliser VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 par par PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 récepteur récepteur NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 nucléaire nucléaire ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 LANA LANA NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de+le ADV _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 l' de+le NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 herpesvirus de+le NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 KSHV KSHV NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 qui qui PRQ _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 17 assure assurer VRB _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 18 sa son DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 transmission transmission NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 aux à PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 cellules cellule NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 filles fille ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 en en PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 24 s' s' CLI _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 attachant attacher VPR _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 aux à PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 chromosomes chromosome NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 mitotiques mitotique ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1899 # text = La structure cristallographique d'un complexe entre un nucléosome et le peptide LANA montre que celui -ci se place au contact de la région acide de façon similaire à la queue H4 . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structure structure NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 3 cristallographique cristallographique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 un un DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 complexe complexe NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 entre entre PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 un un DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 nucléosome nucléé NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 12 mark _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 peptide peptide NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 13 LANA LANA NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 que que CSU _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 celui celui PRQ _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 17 -ci -ci ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 se se CLI _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 place placer VRB _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 20 au à PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 21 contact contact NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 région région NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 acide acide ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 façon façon NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 similaire similaire ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 à à PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 la le DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 31 queue queue NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 H4 H4 NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1900 # text = Au cours de la spermiogenèse , les variants H2AL1 , H2AL2 et H2BL1 des histones H2A et H2B sont incorporés aux nucléosomes et provoquent in-vitro la déstabilisation de ceux -ci ( Govin et al. , 2007 ) . 1 Au à PRE _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 2 cours cours NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 spermiogenèse spermiogenèse NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 7 les le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 variants variant NOM _ _ 20 subj _ _ _ _ _ 9 H2AL1 H2AL1 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 H2AL2 H2AL2 NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 H2BL1 H2BL1 NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 14 des de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 15 histones histone NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 H2A H2A NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 18 H2B H2B NOM _ _ 16 para _ _ _ _ _ 19 sont être VRB _ _ 20 aux _ _ _ _ _ 20 incorporés incorporer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 aux à PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 nucléosomes nucléé NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 et et COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 24 provoquent provoquer VRB _ _ 20 para _ _ _ _ _ 25 in-vitro in- VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 la le DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 déstabilisation déstabilisation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 ceux celui PRQ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 -ci -ci ADJ _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 ( ( PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 32 Govin Govin NOM _ _ 27 parenth _ _ _ _ _ 33 et et COO _ _ 36 mark _ _ _ _ _ 34 al. al. ADV _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 36 2007 2007 NUM _ _ 32 para _ _ _ _ _ 37 ) ) PUNC _ _ 32 punc _ _ _ _ _ 38 . . PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1901 # text = Nous avons vu que H2AL1 et H2AL2 ont une région acide réduite ( Figure 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 vu voir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 que que CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 H2AL1 H2AL1 NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 7 mark _ _ _ _ _ 7 H2AL2 H2AL2 NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 8 ont avoir VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 une un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 région région NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 acide acide ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 réduite réduire ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 Figure Figure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1902 # text = 11 ) . 1 11 11 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ) ) PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1903 # text = Ces variants pourraient ainsi être impliqués dans le phénomène de compaction de la chromatine . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 variants variant NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 pourraient pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 ainsi ainsi ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 être être VNF _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 impliqués impliquer VPP _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 dans dans PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 le le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 phénomène phénomène NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 compaction compaction NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 chromatine chromatine NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1904 # text = Soit en altérant la stabilité des nucléosomes et en facilitant le remplacement des histones par les protéines de transition , soit en facilitant la compaction de la chromatine grâce à la disparition partielle de la région acide , soit en servant de surface d'interaction pour des protéines spécifiques 1 Soit soit COO _ _ 2 mark _ _ _ _ _ 2 en en PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 altérant altérer VPR _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 stabilité stabilité NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 des de+le PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 nucléosomes nucléé NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 9 en le CLI _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 facilitant faciliter VPR _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 remplacement remplacement NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 des de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 histones histone NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 par par PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 les le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 protéines protéine NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 transition transition NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 21 soit soit COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 22 en en PRE _ _ 15 para _ _ _ _ _ 23 facilitant faciliter VPR _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 compaction compaction NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 la le DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 chromatine chromatine NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 grâce grâce à PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 30 à grâce à PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 la le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 disparition disparition NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 33 partielle partiel ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 de de PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 la le DET _ _ 36 spe _ _ _ _ _ 36 région région NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 acide acide ADJ _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 , , PUNC _ _ 40 punc _ _ _ _ _ 39 soit soit COO _ _ 40 mark _ _ _ _ _ 40 en en PRE _ _ 34 para _ _ _ _ _ 41 servant servant NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 de de PRE _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 surface surface NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 d' de PRE _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 interaction interaction NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 pour pour PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 47 des un DET _ _ 48 spe _ _ _ _ _ 48 protéines protéine NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 49 spécifiques spécifique ADJ _ _ 48 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1905 # text = ( Brdt par exemple ) . 1 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 2 Brdt Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 par par exemple PRE _ _ 2 parenth _ _ _ _ _ 4 exemple par exemple ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1906 # text = IV . Remarque sur le cas des homologues CBP / P 300 1 IV iv NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Remarque Remarque VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 sur sur PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 cas cas NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 des de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 homologues homologue NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 CBP CBP NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 / sur PUNC _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 P P NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 300 300 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1907 # text = Il a été récemment été montré que les bromodomaines des proches homologues P300 et CBP ont des préférences différentes vis à vis de l'état d'acétylation de la protéine MyoD. P300 présente une affinité accrue pour le peptide di-acétylé MyoD-ac K99 / K102 par rapport aux peptides mono-acétylés sur K99 ou sur K102 . 1 Il il CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 a avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 été être VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 récemment récemment ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 été été NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 montré montrer ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 que que CSU _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 bromodomaines brome NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 10 des de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 proches proche NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 homologues homologue ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 P300 P300 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 CBP CBP NOM _ _ 13 para _ _ _ _ _ 16 ont avoir VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 17 des de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 préférences préférence NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 différentes différent ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 vis vis NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 à à PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 vis vis NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 l' le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 état état NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 d' de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 acétylation acétylation NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 de de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 la le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 protéine protéine NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 MyoD. MyoD. NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 P300 P300 NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 présente présent ADJ _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 34 une un DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 affinité affinité NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 36 accrue accru ADJ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 pour pour PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 le le DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 peptide peptide NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 di-acétylé NUMBER-acétyle NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 MyoD-ac MyoD-ac NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 K99 K99 DET _ _ 44 spe _ _ _ _ _ 43 / k99 / k102 PUNC _ _ 42 punc _ _ _ _ _ 44 K102 K102 ADJ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 45 par par rapport à PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 46 rapport par rapport à DET _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 aux par rapport à PRE _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 peptides peptide NOM _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 49 mono-acétylés mono- NOM _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 50 sur sur PRE _ _ 48 dep _ _ _ _ _ 51 K99 K99 NOM _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 52 ou ou COO _ _ 53 mark _ _ _ _ _ 53 sur sur PRE _ _ 50 para _ _ _ _ _ 54 K102 K102 NOM _ _ 53 dep _ _ _ _ _ 55 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1908 # text = Par contre la lysine K99 est suffisante pour la fixation de CBP ( Wei et al. , 2008 ) . 1 Par par contre PRE _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 contre par contre ADV _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 lysine lysine NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 5 K99 K99 NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 suffisante suffisant ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 pour pour PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 fixation fixation NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 CBP CBP NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 ( ( PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 Wei Wei NOM _ _ 12 parenth _ _ _ _ _ 15 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 16 al. al. ADV _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 2008 2008 NUM _ _ 14 para _ _ _ _ _ 19 ) ) PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1909 # text = Seuls 4 résidus diffèrent entre les bromodomaines de CBP et P 300 : 1 Seuls seul ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 résidus résidu NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 diffèrent différer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 entre entre PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 les le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 bromodomaines brome NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 CBP CBP NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 P P NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 12 300 300 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 : : PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1910 # text = ce sont les mutations 1 ce ce CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 les le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 mutations mutation NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1911 # text = N1132-S1096 à l'extrémité de la boucle ZA , V1158-I1122 dans le centre de l'hélice A , F1178-Y1142 à l'extrémité de la boucle BC et A1185-S1146 au début de l'hélice C . 1 N1132-S1096 N1132-S1096 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 à à PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 l' le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 extrémité extrémité NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 boucle boucle NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 ZA ZA NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 V1158-I1122 V1158-I1122 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 dans dans PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 le le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 centre centre NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 l' le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 hélice hélice NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 A A NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 F1178-Y1142 F1178-Y1142 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 20 à à PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 l' le DET _ _ 22 spe _ _ _ _ _ 22 extrémité extrémité NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 boucle boucle NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 BC BC NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 et et COO _ _ 28 mark _ _ _ _ _ 28 A1185-S1146 A1185-S1146 NOM _ _ 26 para _ _ _ _ _ 29 au à PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 30 début début NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 de de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 l' le DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 hélice hélice NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 C C NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1912 # text = Les résidus critiques pour la liaison de Brdt-BD1 et du peptide H 4 -K 5 K 8 ac sont W50 , P51 , I114 , M117 . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 résidus résidu NOM _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 3 critiques critique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 liaison liaison NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 Brdt-BD1 Brdt-BD1 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 du de PRE _ _ 7 para _ _ _ _ _ 11 peptide peptide NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 H H NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 4 4 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 -K -K VPR _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 5 5 NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 K K NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 8 8 NUM _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 ac ac NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 sont être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 W50 W50 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 22 P51 P51 NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 24 I114 I114 NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 M117 M117 NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1913 # text = L'alignement des séquences de Brdt , CBP et P300 indique que les résidus aux positions correspondantes chez CBP et P300 sont respectivement L , P , V , F et L , P , V , Y. Les résidus F1178 de CBP et Y1142 de P300 sont placés dans la boucle BC impliquée dans la sélectivité de BD1 . 1 L' le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 alignement alignement NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 séquences séquence NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 Brdt Brdt NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 CBP CBP NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 9 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 10 P300 P300 NOM _ _ 8 para _ _ _ _ _ 11 indique indiquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 que que CSU _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 les le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 résidus résidu NOM _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 15 aux à PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 positions position NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 correspondantes correspondant ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 chez chez PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 CBP CBP NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 P300 P300 NOM _ _ 19 para _ _ _ _ _ 22 sont être VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 23 respectivement respectivement ADV _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 L L NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 26 P P NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 V V PRQ _ _ 24 para _ _ _ _ _ 29 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 30 F F NOM _ _ 28 para _ _ _ _ _ 31 et et COO _ _ 32 mark _ _ _ _ _ 32 L L NOM _ _ 30 para _ _ _ _ _ 33 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 34 P P NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 36 V V ADJ _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 , , PUNC _ _ 49 punc _ _ _ _ _ 38 Y. Y. NOM _ _ 49 subj _ _ _ _ _ 39 Les Les DET _ _ 40 spe _ _ _ _ _ 40 résidus résidu NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 41 F1178 F1178 NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 de de PRE _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 43 CBP CBP NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 et et COO _ _ 45 mark _ _ _ _ _ 45 Y1142 Y1142 NOM _ _ 43 para _ _ _ _ _ 46 de de PRE _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 47 P300 P300 NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 sont être VRB _ _ 49 aux _ _ _ _ _ 49 placés placer VPP _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 50 dans dans PRE _ _ 49 dep _ _ _ _ _ 51 la le DET _ _ 52 spe _ _ _ _ _ 52 boucle boucle NOM _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 53 BC BC NOM _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 54 impliquée impliquer VPP _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 55 dans dans PRE _ _ 54 dep _ _ _ _ _ 56 la le DET _ _ 57 spe _ _ _ _ _ 57 sélectivité sélectivité NOM _ _ 55 dep _ _ _ _ _ 58 de de PRE _ _ 57 dep _ _ _ _ _ 59 BD1 BD1 NOM _ _ 58 dep _ _ _ _ _ 60 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1914 # text = La superposition des structures de Brdt-BD 1 / H 4 -K 5 K 8 ac et du bromodomaine de CBP [ PDB-2RNY ] montre qu'aucun encombrement stérique flagrant n'empêche la fixation de la seconde lysine acétylée dans le site de fixation du bromodomaine de CBP . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 superposition superposition NOM _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 structures structure NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 Brdt-BD Brdt-BD NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 1 1 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 / sur PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 9 H H NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 4 4 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 -K -K VPR _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 5 5 NUM _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 K K NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 8 8 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 ac ace NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 du de PRE _ _ 8 para _ _ _ _ _ 18 bromodomaine bromé NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 CBP CBP NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 [ ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 22 PDB-2RNY PDB-2RNY NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 ] ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 24 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 qu' que CSU _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 aucun aucun DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 encombrement encombrement NOM _ _ 31 subj _ _ _ _ _ 28 stérique stérique ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 flagrant flagrant ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 n' ne ADV _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 31 empêche empêcher VRB _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 32 la le DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 fixation fixation NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 de de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 la le DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 36 seconde second ADJ _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 37 lysine lysine NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 38 acétylée acétyle NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 dans dans PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 40 le le DET _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 41 site site NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 de de PRE _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 fixation fixation NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 44 du de PRE _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 bromodomaine bromé NOM _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 de de PRE _ _ 45 dep _ _ _ _ _ 47 CBP CBP NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 48 . . PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1915 # text = La modélisation de la mutation F1178Y qui remplace la phénylalanine F1178 de CBP par une tyrosine comme c'est le cas chez P300 ( Y1142 ) montre qu'une liaison hydrogène entre la tyrosine et le résidu X du peptide H4 di-acétylé est possible alors qu'elle ne l'était pas avec la phénylalanine de CBP . 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 modélisation modélisation NOM _ _ 27 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 mutation mutation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 F1178Y F1178Y NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 qui qui PRQ _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 8 remplace remplacer VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 phénylalanine phénylalanine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 F1178 F1178 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 CBP CBP NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 par par PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 15 une un DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 tyrosine tyrosine NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 comme comme CSU _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 c' ce CLS _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 19 est être VRB _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 le le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 cas cas NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 chez chez PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 23 P300 P300 NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 ( ( PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 Y1142 Y1142 NOM _ _ 23 parenth _ _ _ _ _ 26 ) ) PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 27 montre montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 28 qu' que CSU _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 une un DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 liaison liaison NOM _ _ 31 subj _ _ _ _ _ 31 hydrogène hydrogéner VRB _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 32 entre entre PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 la le DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 tyrosine tyrosine NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 et et COO _ _ 43 mark _ _ _ _ _ 36 le le DET _ _ 37 spe _ _ _ _ _ 37 résidu résidu NOM _ _ 43 subj _ _ _ _ _ 38 X X ADJ _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 du de PRE _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 peptide peptide NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 H4 H4 NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 42 di-acétylé NUMBER-acétyle NOM _ _ 40 dep _ _ _ _ _ 43 est être VRB _ _ 31 para _ _ _ _ _ 44 possible possible ADJ _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 45 alors alors que CSU _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 46 qu' alors que CSU _ _ 43 dep _ _ _ _ _ 47 elle elle CLS _ _ 50 subj _ _ _ _ _ 48 ne ne ADV _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 49 l' le CLI _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 50 était être VRB _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 51 pas pas ADV _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 52 avec avec PRE _ _ 50 dep _ _ _ _ _ 53 la le DET _ _ 54 spe _ _ _ _ _ 54 phénylalanine phénylalanine NOM _ _ 52 dep _ _ _ _ _ 55 de de PRE _ _ 54 dep _ _ _ _ _ 56 CBP CBP NOM _ _ 55 dep _ _ _ _ _ 57 . . PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1916 # text = Cette liaison hydrogène pourrait expliquer que , contrairement au bromodomaine de CBP , celui de P300 reconnaisse préférentiellement un peptide di-acétylé . 1 Cette cette NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 liaison liaison NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 hydrogène hydrogène NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 expliquer expliquer VNF _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 que que CSU _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 8 contrairement contrairement ADV _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 9 au à PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 bromodomaine bromé NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 CBP CBP NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 14 celui celui PRQ _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 P300 P300 NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 reconnaisse reconnaître VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 18 préférentiellement préférentiellement ADV _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 un un DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 peptide peptide NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 21 di-acétylé di-acétylé NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1917 # text = Conclusion générale 1 Conclusion conclusion NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 générale général ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1918 # text = Ce travail a permis de déterminer la spécificité de chacun des bromodomaines de Brdt vis à vis des queues N terminales acétylées des histones H4 et H3 . 1 Ce ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 travail travail NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 a avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 permis permettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 déterminer déterminer VNF _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 spécificité spécificité NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 chacun chacun PRQ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 des de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 bromodomaines oromo NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 Brdt Brdt NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 vis vis NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 17 vis vis NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 des de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 queues queue NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 N N NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 terminales terminal ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 acétylées acétyle NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 des de PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 histones histone NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 H4 H4 NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 et et COO _ _ 27 mark _ _ _ _ _ 27 H3 H3 NOM _ _ 25 para _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1919 # text = BD1 présente pour un peptide H4 di-acétylé sur les lysines K5 et K8 une affinité qui témoigne de la spécificité de l'interaction ( Kd~ 20 µM ) alors que BD2 montre une spécificité plus réduite pour des peptides H 3 -K 18 ac ( Kd~ 250 µM ) . 1 BD1 BD1 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 présente présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 peptide peptide NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 H4 H4 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 di-acétylé NUMBER-acétyle NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 sur sur PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 les le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 lysines lysine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 K5 K5 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 K8 K8 NOM _ _ 11 para _ _ _ _ _ 14 une un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 affinité affinité NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 16 qui qui PRQ _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 17 témoigne témoigner VRB _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 la le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 spécificité spécificité NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 l' le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 interaction interaction NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 ( ( PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 Kd~ Kd~ NOM _ _ 23 parenth _ _ _ _ _ 26 20 20 NUM _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 µM micro- NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 ) ) PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 29 alors alors que CSU _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 30 que alors que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 31 BD2 BD2 NOM _ _ 32 subj _ _ _ _ _ 32 montre montrer VRB _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 une un DET _ _ 34 spe _ _ _ _ _ 34 spécificité spécificité NOM _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 35 plus plus ADV _ _ 36 periph _ _ _ _ _ 36 réduite réduire VPP _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 37 pour pour PRE _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 des un DET _ _ 39 spe _ _ _ _ _ 39 peptides peptide NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 40 H H NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 3 3 NUM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 -K -K VPR _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 43 18 18 NUM _ _ 44 spe _ _ _ _ _ 44 ac ace NOM _ _ 42 dep _ _ _ _ _ 45 ( ( PUNC _ _ 46 punc _ _ _ _ _ 46 Kd~ Kd~ NOM _ _ 42 parenth _ _ _ _ _ 47 250 250 NUM _ _ 48 spe _ _ _ _ _ 48 µM micro- NOM _ _ 46 dep _ _ _ _ _ 49 ) ) PUNC _ _ 46 punc _ _ _ _ _ 50 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1920 # text = Les structures cristallographiques des complexes de BD1 et BD2 et de ces peptides ont permis de définir les déterminants structuraux de la sélectivité des bromodomaines de Brdt . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structures structure NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 3 cristallographiques cristallographique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 complexes complexe NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 BD1 BD1 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 9 BD2 BD2 NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 6 para _ _ _ _ _ 12 ces ce DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 peptides peptide NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 ont avoir VRB _ _ 15 aux _ _ _ _ _ 15 permis permettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 définir définir VNF _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 les le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 déterminants déterminant NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 structuraux structural ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 la le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 sélectivité sélectivité NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 des un DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 bromodomaines brome NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 Brdt Brdt NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1921 # text = Nous avons également étudié l'effet de la mutation de la lysine K61 en glutamine sur les affinités de BD1 . 1 Nous nous CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 3 également également ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 étudié étudier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 effet effet NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 mutation mutation NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 lysine lysine NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 K61 K61 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 en en ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 glutamine en NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 sur sur PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 les le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 affinités affinité NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 BD1 BD1 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1922 # text = Cette mutation est impliquée chez l'humain dans des cas d'infertilité masculine et provoque la destabilisation de l'association de Brdt à la chromatine . 1 Cette Cette NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 mutation mutation NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 est être VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 impliquée impliquer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 chez chez PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 l' le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 humain humain ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 dans dans PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 des un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 cas cas NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 d' de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 infertilité infertilité NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 masculine masculin ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 et et COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 provoque provoquer VRB _ _ 4 para _ _ _ _ _ 16 la le DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 destabilisation destabilisation NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 l' le DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 association association NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 de de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 Brdt Brdt NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 à à PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 24 la le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 chromatine chromatine NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1923 # text = Nos données montrent que les affinités de BD1 ne sont pas modifiées . 1 Nos son DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 données donnée NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 montrent montrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 que que CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 affinités affinité NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 BD1 BD1 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 ne ne ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 10 sont être VRB _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 11 pas pas ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 modifiées modifier VPP _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1924 # text = Par contre la structure cristallographique du complexe BD 1 / H 4 K 5 K 8 ac indique que la lysine K61 pourrait être impliquée dans une interaction entre 1 Par par PRE _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 2 contre contre PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 structure structure NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 cristallographique cristallographique ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 du de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 complexe complexe NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 BD BD NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 1 1 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 / / PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 11 H H NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 12 4 4 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 K K NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 5 5 NUM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 15 K K NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 16 8 8 NUM _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 ac ace NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 18 indique indiquer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 que que CSU _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 lysine lysine NOM _ _ 23 subj _ _ _ _ _ 22 K61 K61 NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 pourrait pouvoir VRB _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 24 être être VNF _ _ 25 aux _ _ _ _ _ 25 impliquée impliquer VPP _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 dans dans PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 une un DET _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 interaction interaction NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 entre entre PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1925 # text = Brdt et l'ADN . 1 Brdt Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 4 mark _ _ _ _ _ 3 l' le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 ADN ADN NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 5 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1926 # text = BD1 aurait ainsi une fonction d'orientation et de stabilisation de Brdt sur les nucléosomes . 1 BD1 BD1 NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 aurait avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ainsi ainsi CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 une un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 fonction fonction NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 6 d' de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 orientation orientation NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 9 de un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 stabilisation stabilisation NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 Brdt Brdt NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 sur sur PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 les le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 nucléosomes nucléé A+V _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1927 # text = Cela pourrait expliquer l'importance particulière de BD1 pour la fonction de Brdt . 1 Cela cela PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 pourrait pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 expliquer expliquer VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 l' le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 importance importance NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 particulière particulier ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 BD1 BD1 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 pour pour PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 fonction fonction NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 Brdt Brdt NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1928 # text = Un modèle de la compaction de la chromatine par Brdt reste à élaborer . 1 Un un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 modèle modèle NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 compaction compaction NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 chromatine chromatine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 par par PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 Brdt Brdt NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 reste rester VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 à à PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 élaborer élaborer VNF _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1929 # text = Il faudrait notamment savoir si la queue N terminale de l'histone H3 est le substrat physiologique de BD2 ou si celui -ci fixe un autre site ( H 2A -K 5 ac par exemple ) . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 faudrait falloir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 notamment notamment ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 savoir savoir VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 si si CSU _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 queue queue NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 8 N N NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 terminale terminal ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 l' le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 histone histone NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 H3 H3 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 est être VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 15 le le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 substrat substrat NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 physiologique physiologique ADJ _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 BD2 BD2 NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 ou ou COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 21 si si CSU _ _ 18 para _ _ _ _ _ 22 celui celui PRQ _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 23 -ci -ci ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 fixe fixer VRB _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 25 un un DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 26 autre autre ADJ _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 27 site site NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 28 ( ( PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 29 H H NOM _ _ 27 parenth _ _ _ _ _ 30 2A 2A NUM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 -K -K VPR _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 5 5 NUM _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 ac ace NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 par par exemple PRE _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 35 exemple par exemple ADV _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 ) ) PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1930 # text = Il faudrait ensuite savoir si BD1 et BD2 interagissent avec le même nucléosome ou avec deux nucléosomes différents . 1 Il il CLS _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 faudrait falloir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ensuite ensuite ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 savoir savoir VNF _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 si si CSU _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 BD1 BD1 NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 8 BD2 BD2 NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 9 interagissent interagir VRB _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 avec avec PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 le le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 12 même même ADV _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 nucléosome nucléé NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 ou ou COO _ _ 15 mark _ _ _ _ _ 15 avec avec PRE _ _ 10 para _ _ _ _ _ 16 deux deux NUM _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 nucléosomes nucléé NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 différents différent ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1931 # text = Au vu de la composition de la protéine Brdt et des fonctions de ses homologues il semble assez probable que 1 Au au vu de PRE _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 2 vu au vu de NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 de au vu de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 composition composition NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 protéine protéine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 Brdt Brdt NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 et et COO _ _ 11 mark _ _ _ _ _ 11 des de PRE _ _ 6 para _ _ _ _ _ 12 fonctions fonction NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ses son DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 homologues homologue NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 il il CLS _ _ 17 subj _ _ _ _ _ 17 semble sembler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 assez assez ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 probable probable ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 que que? PRQ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1932 # text = Brdt ait un rôle architectural de protéine de liaison . 1 Brdt Brdt NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 ait avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 un un DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 rôle rôle NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 architectural architectural ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 protéine protéine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 liaison liaison NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1933 # text = Dans ce cas il serait logique que chacun des bromodomaines lient un nucléosome différent . 1 Dans dans PRE _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 ce ce DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 cas cas NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 il il CLS _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 5 serait être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 logique logique ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 que que CSU _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 chacun chacun PRQ _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 9 des de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 bromodomaines brome NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 lient lier VRB _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 un un DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 nucléosome nucléé NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 différent différent ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1934 # text = Cela reste à déterminer . 1 Cela cela PRQ _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 reste rester VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 à à PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 déterminer déterminer VNF _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1935 # text = Enfin , nous avons mis en évidence un nouveau mode de reconnaissance entre un bromodomaine et un peptide di-acétylé . 1 Enfin enfin ADV _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 nous nous CLS _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 4 avons avoir VRB _ _ 5 aux _ _ _ _ _ 5 mis mettre VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 en en PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 évidence évidence NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 un un DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 9 nouveau nouveau ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 mode mode NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 entre entre PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 un un DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 bromodomaine oromo NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 18 mark _ _ _ _ _ 17 un un DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 peptide peptide NOM _ _ 15 para _ _ _ _ _ 19 di-acétylé NUMBER-acétyle NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1936 # text = La structure cristallographique du complexe BD 1 / H 4 -K 5 K 8 ac montre que les deux acétyl-lysines K 5 ac et K 8 ac se placent ensemble dans le site de fixation hydrophobe de BD1 . 1 La là ADV _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 structure structurer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 cristallographique cristallographique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 complexe complexe NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 BD BD NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 1 1 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 / sur PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 9 H H NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 10 4 4 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 11 -K -K ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 12 5 5 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 13 K K NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 14 8 8 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 15 ac ace NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 16 montre montre NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 17 que que PRQ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 18 les le DET _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 19 deux deux NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 20 acétyl-lysines acétyle-lysine NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 21 K K NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 22 5 5 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 23 ac ac VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 24 et et COO _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 25 K K NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 26 8 8 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 27 ac ace NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 28 se se CLI _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 29 placent placer VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 30 ensemble ensemble ADV _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 dans dans PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 32 le le DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 site site NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 de de PRE _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 fixation fixation NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 37 de de PRE _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 38 BD1 BD1 NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 39 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1937 # text = Ce mode de liaison est probablement partagé par d'autres bromodomaines . 1 Ce ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 mode mode NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 liaison liaison NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 est être VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 probablement probablement ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 partagé partager ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 par par NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 9 d' de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 autres autre ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 bromodomaines brome NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1938 # text = Ces données ajoutent un degré de complexité supplémentaire au code histone lié à l'acétylation puisque le bromodomaine était jusque là considéré comme un module de liaison d'une seule lysine acétylée . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 données donnée NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 ajoutent ajouter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 un un DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 degré degré NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 complexité complexité NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 supplémentaire supplémentaire ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 au à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 code code NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 histone histone NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 lié lier VPP _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 à à PRE _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 l' le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 acétylation acétylation NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 puisque puisque CSU _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 17 le le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 bromodomaine oromo NOM _ _ 22 subj _ _ _ _ _ 19 était être VRB _ _ 22 aux _ _ _ _ _ 20 jusque jusque ADV _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 21 là là ADV _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 22 considéré considérer VPP _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 23 comme comme PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 un un DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 module module NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 liaison liaison NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 d' de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 29 une un DET _ _ 31 spe _ _ _ _ _ 30 seule seul ADJ _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 31 lysine lysine NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 32 acétylée acétyle NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1939 # text = De nombreuses études pourraient être reconsidérées à la lumière de cette nouvelle définition du bromodomaine . 1 De un DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 2 nombreuses nombreux ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 études étude NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 pourraient pouvoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 être être VNF _ _ 6 aux _ _ _ _ _ 6 reconsidérées reconsidérer VPP _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 à à PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 lumière lumière NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 de de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 cette ce DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 12 nouvelle nouveau ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 définition définition NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 du de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 bromodomaine bromé NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1940 # text = Bibliographie 1 Bibliographie bibliographie NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1941 # text = Abbate , EA. , Voitenleitner , 1 Abbate Abbate NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 EA. EA. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Voitenleitner Voitenleitner NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1942 # text = C . and Botchan , MR. ( 2006 ) . 1 C c NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 and and botchan NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Botchan Botchan NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 MR. MR. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 2006 2006 NUM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1943 # text = Structure of the papillomavirus DNA-tethering complex E2 : 1 Structure structure of the papillomavirus dna-tethering complex e2 NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 of structure of the papillomavirus dna-tethering complex e2 NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 3 the structure of the papillomavirus dna-tethering complex e2 NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 4 papillomavirus structure of the papillomavirus dna-tethering complex e2 NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 5 DNA-tethering DNA-tethering NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 6 complex structure of the papillomavirus dna-tethering complex e2 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 E2 E2 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 : : PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1944 # text = Brd 4 and a peptide that ablates HPV chromosomal association . 1 Brd Brd NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 and and NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 peptide peptide NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 that that ablates hpv chromosomal association NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 7 ablates that ablates hpv chromosomal association NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 8 HPV HPV NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 9 chromosomal that ablates hpv chromosomal association NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 association that ablates hpv chromosomal association NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1945 # text = Mol . 1 Mol Mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1946 # text = Cell 24 , 877 - 889 . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 24 24 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 877 877 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 877 - 889 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 889 889 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1947 # text = Angelov , 1 Angelov Angelov NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1948 # text = D . , Bondarenko , VA. , Almagro , S. , Menoni , H. , Mongélard , 1 D d NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Bondarenko Bondarenko NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 VA. VA. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Almagro Almagro NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 10 S. S. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 12 Menoni Menoni NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 14 H. H. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 Mongélard Mongélard NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1949 # text = F . , Hans , 1 F f NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Hans Hans NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1950 # text = F . , Mietton , 1 F f NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Mietton Mietton NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1951 # text = F . , Studitsky , VM. , Hamiche , 1 F f NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Studitsky Studitsky NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 VM. VM. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 Hamiche Hamiche NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1952 # text = A . , Dimitrov , S. and Bouvet , P. ( 2006 ) . 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Dimitrov Dimitrov NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 6 S. S. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and s. and bouvet NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Bouvet Bouvet NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 10 P. P. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 2006 2006 NUM _ _ 4 parenth _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1953 # text = Nucleolin is a histone chaperone with FACT-like activity and assists remodeling of nucleosomes . 1 Nucleolin nucleolin is a histone chaperone with fact-like activity and assists remodeling of nucleosomes NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 2 is nucleolin is a histone chaperone with fact-like activity and assists remodeling of nucleosomes NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 3 a nucleolin is a histone chaperone with fact-like activity and assists remodeling of nucleosomes NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 4 histone nucleolin is a histone chaperone with fact-like activity and assists remodeling of nucleosomes NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 5 chaperone nucleolin is a histone chaperone with fact-like activity and assists remodeling of nucleosomes NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 6 with nucleolin is a histone chaperone with fact-like activity and assists remodeling of nucleosomes NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 7 FACT-like FACT-like NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 8 activity nucleolin is a histone chaperone with fact-like activity and assists remodeling of nucleosomes NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 9 and nucleolin is a histone chaperone with fact-like activity and assists remodeling of nucleosomes NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 10 assists nucleolin is a histone chaperone with fact-like activity and assists remodeling of nucleosomes NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 11 remodeling nucleolin is a histone chaperone with fact-like activity and assists remodeling of nucleosomes NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 12 of nucleolin is a histone chaperone with fact-like activity and assists remodeling of nucleosomes NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 nucleosomes nucleolin is a histone chaperone with fact-like activity and assists remodeling of nucleosomes NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1954 # text = EMBO J. 25 , 1669 - 1679 . 1 EMBO embo NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 25 25 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 1669 1669 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 - 1669 - 1679 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 1679 1679 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1955 # text = Angelov , 1 Angelov Angelov NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1956 # text = D . , Molla , 1 D d NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Molla Molla NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1957 # text = A . , Perche , P. , Hans , 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 4 Perche Perche NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 P. P. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 Hans Hans NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1958 # text = F . , Côté , J. , Khochbin , S. , Bouvet , P. and Dimitrov , S. ( 2003 ) . 1 F f NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Côté Côté NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 8 Khochbin Khochbin NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 10 S. S. NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 12 Bouvet Bouvet NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 14 P. P. NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 15 and p. and dimitrov NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 Dimitrov Dimitrov NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 18 S. S. NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 2003 2003 NUM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 21 ) ) PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1959 # text = The histone variant macroH 2A interferes with transcription factor binding and SWI / SNF nucleosome remodeling . 1 The thé NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 histone histone NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 variant variant NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 macroH macro- ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 2A 2A NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 interferes interférer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 with dire ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 transcription transcription NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 factor factor NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 binding binding and swi / snf nucleosome remodeling NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 11 and binding and swi / snf nucleosome remodeling NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 12 SWI SWI NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 13 / binding and swi / snf nucleosome remodeling PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 SNF SNF NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 15 nucleosome binding and swi / snf nucleosome remodeling NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 remodeling binding and swi / snf nucleosome remodeling NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1960 # text = Mol . 1 Mol Mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1961 # text = Cell 11 , 1033 - 1041 . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 11 11 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 1033 1033 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 1033 - 1041 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 1041 1041 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1962 # text = Arents , G. , Burlingame , RW. , Wang , BC. , Love , WE. and Moudrianakis , EN . 1 Arents Arents NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 G. G. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 Burlingame Burlingame NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 7 RW. RW. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 9 Wang Wang NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 11 BC. BC. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 13 Love Love VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 15 WE. WE. NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 and we. and moudrianakis NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 Moudrianakis Moudrianakis NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 EN EN NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1963 # text = ( 1991 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 1991 1991 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1964 # text = The nucleosomal core histone octamer at 3.1 A resolution : 1 The the nucleosomal NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 nucleosomal the nucleosomal NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 core core NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 histone histone NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 octamer coter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 at avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 3.1 3.1 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 A A PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 resolution résolution NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 : : PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1965 # text = a tripartite protein assembly and a left-handed superhelix . 1 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 tripartite tripartite ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 protein protéine NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 assembly assembly and a left-handed superhelix NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 5 and assembly and a left-handed superhelix NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 6 a assembly and a left-handed superhelix NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 left-handed assembly and a left-handed superhelix NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 superhelix assembly and a left-handed superhelix NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1966 # text = Proc . 1 Proc Proc NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1967 # text = Natl . 1 Natl Natl NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1968 # text = Acad . 1 Acad Acad NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1969 # text = Sci . 1 Sci Sci NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1970 # text = U.S.A . 88 , 10148 - 10152 . 1 U.S.A u.s.a NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 88 88 NUM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 10148 10148 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 - 10148 - 10152 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 10152 10152 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1971 # text = Baarends , WM. , Hoogerbrugge , JW. , Roest , HP. , Ooms , M. , Vreeburg , J. , Hoeijmakers , JH. and Grootegoed , JA. ( 1999 ) . 1 Baarends Baarends NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 3 WM. WM. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 5 Hoogerbrugge Hoogerbrugge NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 JW. JW. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 9 Roest Roest NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 HP. HP. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Ooms Ooms NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 15 M. monsieur NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 17 Vreeburg Vreeburg NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 19 J. J. NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 21 Hoeijmakers Hoeijmakers NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 23 JH. JH. NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 24 and jh. and grootegoed NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 Grootegoed Grootegoed NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 27 JA. JA. NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 28 ( ( PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 29 1999 1999 NUM _ _ 13 parenth _ _ _ _ _ 30 ) ) PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1972 # text = Histone ubiquitination and chromatin remodeling in mouse spermatogenesis . 1 Histone histone ubiquitination and chromatin NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 ubiquitination histone ubiquitination and chromatin NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 3 and histone ubiquitination and chromatin NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 chromatin histone ubiquitination and chromatin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 remodeling re- NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 6 in in ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 mouse mousser VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 spermatogenesis spermatogenesis ADV _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1973 # text = Dev . 1 Dev Dev NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1974 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1975 # text = 207 , 322 - 333 . 1 207 207 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 322 322 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 322 - 333 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 333 333 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1976 # text = Baker , NA. , Sept , 1 Baker baker NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 NA. NA. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Sept Sept NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1977 # text = D . , Joseph , S. , Holst , MJ. and McCammon , JA. ( 2001 ) . 1 D d NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Joseph Joseph NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 S. S. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Holst Holst NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 10 MJ. MJ. NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 11 and mj. and mccammon NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 McCammon McCammon NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 14 JA. JA. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 15 ( ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 2001 2001 NUM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 17 ) ) PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1978 # text = Electrostatics of nanosystems : 1 Electrostatics electrostatics of nanosystems NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 of electrostatics of nanosystems NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 nanosystems electrostatics of nanosystems NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 : : PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1979 # text = application to microtubules and the ribosome . 1 application application to microtubules and the ribosome NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 to application to microtubules and the ribosome NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 microtubules application to microtubules and the ribosome NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 and application to microtubules and the ribosome NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 the application to microtubules and the ribosome NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 ribosome application to microtubules and the ribosome NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1980 # text = Proc . 1 Proc Proc NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1981 # text = Natl . 1 Natl Natl NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1982 # text = Acad . 1 Acad Acad NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1983 # text = Sci . 1 Sci Sci NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1984 # text = U.S.A . 98 , 10037 - 10041 . 1 U.S.A u.s.a NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 98 98 NUM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 10037 10037 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 - 10037 - 10041 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 10041 10041 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1985 # text = Barbera , AJ. , Chodaparambil , JV. , Kelley-Clarke , 1 Barbera barber VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 3 AJ. AJ. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 5 Chodaparambil Chodaparambil NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 JV. JV. NOM _ _ 1 subj _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Kelley-Clarke Kelley-Clarke NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1986 # text = B . , Joukov , V. , Walter , JC. , Luger , K. and Kaye , KM. ( 2006 ) . 1 B b NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Joukov Joukov NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 V. V. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Walter Walter NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 JC. JC. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 12 Luger Luger VNF _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 14 K. K. NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 15 and k. and kaye NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 Kaye Kaye NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 KM. KM. NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 2006 2006 NUM _ _ 18 parenth _ _ _ _ _ 21 ) ) PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1987 # text = The nucleosomal surface as a docking station for Kaposi's sarcoma herpesvirus LANA . 1 The the nucleosomal NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 nucleosomal the nucleosomal NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 surface surface NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 4 as as NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 a avoir VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 docking docking station for kaposi's sarcoma herpesvirus lana NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 7 station docking station for kaposi's sarcoma herpesvirus lana NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 8 for docking station for kaposi's sarcoma herpesvirus lana NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 9 Kaposi's Kaposi's NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 10 sarcoma docking station for kaposi's sarcoma herpesvirus lana NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 11 herpesvirus docking station for kaposi's sarcoma herpesvirus lana NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 LANA LANA NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1988 # text = Science 311 , 856 - 861 . 1 Science science NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 311 311 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 856 856 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 856 - 861 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 861 861 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1989 # text = Beard , DA. and Schlick , T. ( 2001 ) . 1 Beard Beard NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 DA. DA. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and da. and schlick NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Schlick Schlick NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 T. T. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 2001 2001 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1990 # text = Computational modeling predicts the structure and dynamics of chromatin fiber . 1 Computational computational modeling predicts the structure and dynamics of chromatin fiber NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 modeling computational modeling predicts the structure and dynamics of chromatin fiber NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 3 predicts computational modeling predicts the structure and dynamics of chromatin fiber NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 4 the computational modeling predicts the structure and dynamics of chromatin fiber NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 structure computational modeling predicts the structure and dynamics of chromatin fiber NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 6 and computational modeling predicts the structure and dynamics of chromatin fiber NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 7 dynamics computational modeling predicts the structure and dynamics of chromatin fiber NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 8 of computational modeling predicts the structure and dynamics of chromatin fiber NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 9 chromatin computational modeling predicts the structure and dynamics of chromatin fiber NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 fiber computational modeling predicts the structure and dynamics of chromatin fiber NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1991 # text = Structure 9 , 105 - 114 . 1 Structure structure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 9 9 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 105 105 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 105 - 114 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 114 114 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1992 # text = Becker , PB. and Hörz , W. ( 2002 ) . 1 Becker becker NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 PB. PB. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and pb. and hörz NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Hörz Hörz NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 W. W. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 2002 2002 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1993 # text = ATP-dependent nucleosome remodeling . 1 ATP-dependent ATP-dependent NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 nucleosome nucléé NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 remodeling re- NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1994 # text = Annu . 1 Annu Annu NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1995 # text = Rev . 1 Rev Rev NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1996 # text = Biochem . 1 Biochem Biochem NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1997 # text = 71 , 247 - 273 . 1 71 71 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 247 247 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 247 - 273 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 273 273 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1998 # text = Belmont , AS. ( 2006 ) . 1 Belmont belmont NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 AS. AS. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2006 2006 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-1999 # text = Mitotic chromosome structure and condensation . 1 Mitotic Mitotic NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 chromosome chromosome NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 structure structurer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 and and ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 condensation condensation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2000 # text = Curr . 1 Curr Curr NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2001 # text = Opin . 1 Opin Opin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2002 # text = Cell Biol . 1 Cell Cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Biol Biol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2003 # text = 18 , 632 - 638 . 1 18 18 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 632 632 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 632 - 638 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 638 638 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2004 # text = Bernstein , 1 Bernstein bernstein NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2005 # text = E . and Hake , SB. ( 2006 ) . 1 E e NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 and and hake NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Hake Hake NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 SB. SB. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 2006 2006 NUM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2006 # text = The nucleosome : 1 The the nucleosome NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 nucleosome the nucleosome NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2007 # text = a little variation goes a long way . 1 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 little liter ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 variation variation NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 4 goes goes NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 long long ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 way gay ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2008 # text = Biochem . 1 Biochem Biochem NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2009 # text = Cell Biol . 1 Cell Cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Biol Biol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2010 # text = 84 , 505 - 517 . 1 84 84 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 505 505 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 505 - 517 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 517 517 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2011 # text = Boulard , M. , Bouvet , P. , Kundu , TK. and Dimitrov , S. ( 2007 ) . 1 Boulard boulard NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 5 Bouvet Bouvet NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 P. P. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Kundu Kundu NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 11 TK. TK. NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 12 and tk. and dimitrov NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 Dimitrov Dimitrov NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 15 S. S. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 2007 2007 NUM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2012 # text = Histone variant nucleosomes : 1 Histone histone NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 variant variant NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 nucleosomes nucléé A+V _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 : : PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2013 # text = structure , function and implication in disease . 1 structure structure NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 function function and NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 and function and NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 implication implication NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 in in ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 disease disease NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2014 # text = Subcell . 1 Subcell Subcell ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2015 # text = Biochem . 1 Biochem Biochem NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2016 # text = 41 , 1 41 41 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2017 # text = 71 - 89 . 1 71 71 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 - 71 - 89 . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 89 89 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 . 71 - 89 . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2018 # text = Boulard , M. , Gautier , T. , Mbele , GO. , Gerson , V. , Hamiche , 1 Boulard Boulard NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 3 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 5 Gautier Gautier NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 7 T. T. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 9 Mbele Mbele NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 11 GO. GO. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 13 Gerson Gerson NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 15 V. V. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 Hamiche Hamiche NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2019 # text = A . , Angelov , 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Angelov Angelov NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2020 # text = D . , Bouvet , P. and Dimitrov , S. ( 2006 ) . 1 D d NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Bouvet Bouvet NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 P. P. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and p. and dimitrov NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Dimitrov Dimitrov NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 S. S. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 2006 2006 NUM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2021 # text = The NH2 tail of the novel histone variant H2BFWT exhibits properties distinct from conventional H2B with respect to the assembly of mitotic chromosomes . 1 The the nh2 tail of the novel NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 NH2 NH2 NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 tail the nh2 tail of the novel NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 of the nh2 tail of the novel NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 the the nh2 tail of the novel NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 novel the nh2 tail of the novel NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 histone histone NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 variant varier VPR _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 H2BFWT H2BFWT NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 10 exhibits h2bfwt exhibits properties NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 properties h2bfwt exhibits properties NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 distinct distinct ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 from frou NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 conventional conventional ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 H2B H2B NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 with dire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 respect respect NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 to to the assembly of mitotic chromosomes NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 19 the to the assembly of mitotic chromosomes NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 20 assembly to the assembly of mitotic chromosomes NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 21 of to the assembly of mitotic chromosomes NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 22 mitotic to the assembly of mitotic chromosomes NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 23 chromosomes to the assembly of mitotic chromosomes NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2022 # text = Mol . 1 Mol Mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2023 # text = Cell . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2024 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2025 # text = 26 , 1518 - 1526 . 1 26 26 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 1518 1518 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 1518 - 1526 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 1526 1526 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2026 # text = Brown , DT. , Izard , T. and Misteli , T. ( 2006 ) . 1 Brown brown NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 3 DT. DT. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 5 Izard Izard NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 7 T. T. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 8 and t. and misteli NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 Misteli Misteli NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 T. T. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 2006 2006 NUM _ _ 11 parenth _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2027 # text = Mapping the interaction surface of linker histone H1 ( 0 ) with the nucleosome of native chromatin in vivo . 1 Mapping mapping the interaction surface of linker histone h1 NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 the mapping the interaction surface of linker histone h1 NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 3 interaction mapping the interaction surface of linker histone h1 NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 4 surface mapping the interaction surface of linker histone h1 NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 of mapping the interaction surface of linker histone h1 NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 6 linker mapping the interaction surface of linker histone h1 NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 7 histone mapping the interaction surface of linker histone h1 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 H1 H1 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 ( ( PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 0 0 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 11 ) ) PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 12 with dire ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 13 the the nucleosome of native chromatin in vivo NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 14 nucleosome the nucleosome of native chromatin in vivo NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 15 of the nucleosome of native chromatin in vivo NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 16 native the nucleosome of native chromatin in vivo NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 17 chromatin the nucleosome of native chromatin in vivo NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 18 in the nucleosome of native chromatin in vivo NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 vivo the nucleosome of native chromatin in vivo NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2028 # text = Nat . 1 Nat Nat NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2029 # text = Struct . 1 Struct Struct NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2030 # text = Mol . 1 Mol Mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2031 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2032 # text = 13 , 250 - 255 . 1 13 13 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 250 250 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 250 - 255 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 255 255 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2033 # text = Brünger , AT. ( 1993 ) . 1 Brünger Brünger NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 AT. AT. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 1993 1993 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2034 # text = Assessment of phase accuracy by cross validation : 1 Assessment assessment of phase accuracy NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 of assessment of phase accuracy NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 3 phase assessment of phase accuracy NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 accuracy assessment of phase accuracy NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 by by NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 cross cross NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 validation validation NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 : : PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2035 # text = the free R value . 1 the thé NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 free fret NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 R R VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 4 value valoir VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2036 # text = Methods and applications . 1 Methods methods and NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 and methods and NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 applications application NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2037 # text = Acta Crystallogr . 1 Acta Acta NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Crystallogr Crystallogr NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2038 # text = D Biol . 1 D D NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Biol Biol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2039 # text = Crystallogr . 1 Crystallogr Crystallogr NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2040 # text = 49 , 1 49 49 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2041 # text = 24 - 36 . 1 24 24 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 - 24 - 36 . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 36 36 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 . 24 - 36 . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2042 # text = Crystallography 1 Crystallography Crystallography NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2043 # text = & NMR system : 1 & et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 2 NMR NMR NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 system system NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2044 # text = A new software suite for macromolecular structure determination .. 1 A a new software suite for macromolecular structure determination .. NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 new a new software suite for macromolecular structure determination .. NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 3 software a new software suite for macromolecular structure determination .. NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 4 suite a new software suite for macromolecular structure determination .. NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 5 for a new software suite for macromolecular structure determination .. NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 6 macromolecular a new software suite for macromolecular structure determination .. NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 7 structure a new software suite for macromolecular structure determination .. NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 8 determination a new software suite for macromolecular structure determination .. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 .. a new software suite for macromolecular structure determination .. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2045 # text = Acta Crystallogr . 1 Acta Acta NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Crystallogr Crystallogr NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2046 # text = D Biol . 1 D D NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Biol Biol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2047 # text = Crystallogr . 1 Crystallogr Crystallogr NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2048 # text = 54 , 905 - 921 . 1 54 54 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 905 905 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 905 - 921 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 921 921 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2049 # text = Caron , 1 Caron Caron NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2050 # text = C . , Govin , J. , Rousseaux , S. and Khochbin , S. ( 2005 ) . 1 C c NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Govin Govin NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 J. J. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Rousseaux Rousseaux NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 10 S. S. NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 11 and s. and khochbin NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 Khochbin Khochbin NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 14 S. S. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 15 ( ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 2005 2005 NUM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 17 ) ) PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2051 # text = How to pack the genome for a safe trip . 1 How how to pack the genome for a safe trip NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 to how to pack the genome for a safe trip NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 3 pack how to pack the genome for a safe trip NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 4 the how to pack the genome for a safe trip NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 5 genome how to pack the genome for a safe trip NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 6 for how to pack the genome for a safe trip NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 7 a how to pack the genome for a safe trip NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 8 safe how to pack the genome for a safe trip NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 trip how to pack the genome for a safe trip NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2052 # text = Prog . 1 Prog pro NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2053 # text = Mol . 1 Mol Mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2054 # text = Subcell . 1 Subcell Subcell ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2055 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2056 # text = 38 , 1 38 38 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2057 # text = 65 - 89 . 1 65 65 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 - 65 - 89 . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 89 89 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 . 65 - 89 . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2058 # text = Chakravarthy , S. , Bao , Y. , Roberts , VA. , Tremethick , 1 Chakravarthy Chakravarthy NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 3 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 5 Bao Bao NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 Y. Y. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 9 Roberts Roberts NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 VA. VA. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Tremethick Tremethick NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2059 # text = D . and Luger , K . 1 D d NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 and and luger NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Luger Luger NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 K K NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2060 # text = ( 2004 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 2004 2004 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2061 # text = Structural characterization of histone H2A variants . 1 Structural structural characterization of histone h2a variants NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 characterization structural characterization of histone h2a variants NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 of structural characterization of histone h2a variants NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 histone structural characterization of histone h2a variants NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 H2A H2A NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 variants structural characterization of histone h2a variants NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2062 # text = Cold Spring 1 Cold Cold NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Spring Spring NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2063 # text = Harb . 1 Harb Harb NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2064 # text = Symp . 1 Symp Symp NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2065 # text = Quant . 1 Quant Quant NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2066 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2067 # text = 69 , 227 - 234 . 1 69 69 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 227 227 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 227 - 234 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 234 234 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2068 # text = Chakravarthy , S. , Gundimella , SKY . , Caron , 1 Chakravarthy Chakravarthy NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 3 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 5 Gundimella Gundimella NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 7 SKY SKY NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 Caron Caron NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2069 # text = C . , Perche , P. , Pehrson , JR. , Khochbin , S. and Luger , K. ( 2005a ) . 1 C c NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Perche Perche NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 P. P. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 8 Pehrson Pehrson NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 10 JR. JR. NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 12 Khochbin Khochbin NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 14 S. S. NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 15 and s. and luger NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 Luger Luger NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 18 K. K. NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 2005a 2005a NUM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 21 ) ) PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2070 # text = Structural characterization of the histone variant macroH 2A . 1 Structural structural characterization of the NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 characterization structural characterization of the NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 3 of structural characterization of the NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 the structural characterization of the NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 histone histone NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 variant varier VPR _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 macroH macro- ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 2A 2A NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2071 # text = Mol . 1 Mol Mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2072 # text = Cell . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2073 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2074 # text = 25 , 7616 - 7624 . 1 25 25 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 7616 7616 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 7616 - 7624 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 7624 7624 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2075 # text = Chakravarthy , S. , Park , Y. , Chodaparambil , J. , Edayathumangalam , RS. and 1 Chakravarthy Chakravarthy NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 3 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 5 Park Park NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 Y. Y. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 9 Chodaparambil Chodaparambil NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 11 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 13 Edayathumangalam Edayathumangalam NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 15 RS. RS. NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 and rs. and NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2076 # text = Luger , K. ( 2005b ) . 1 Luger luger NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 K. K. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2005b 2005b NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2077 # text = Structure and dynamic properties of nucleosome core particles . 1 Structure structure and dynamic properties of nucleosome core particles NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 and structure and dynamic properties of nucleosome core particles NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 3 dynamic structure and dynamic properties of nucleosome core particles NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 4 properties structure and dynamic properties of nucleosome core particles NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 of structure and dynamic properties of nucleosome core particles NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 6 nucleosome structure and dynamic properties of nucleosome core particles NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 7 core structure and dynamic properties of nucleosome core particles NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 particles structure and dynamic properties of nucleosome core particles NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2078 # text = FEBS Lett . 1 FEBS FEBS NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Lett Lett NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2079 # text = 579 , 895 - 898 . 1 579 579 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 895 895 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 895 - 898 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 898 898 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2080 # text = Chantalat , L. , Nicholson , JM. , Lambert , SJ. , Reid , AJ. , Donovan , MJ. , Reynolds , CD. , Wood , CM. and Baldwin , JP. ( 2003 ) . 1 Chantalat Chantalat NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 3 L. L. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 5 Nicholson Nicholson NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 7 JM. JM. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 9 Lambert Lambert NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 11 SJ. SJ. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 13 Reid Reid NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 15 AJ. AJ. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 17 Donovan Donovan NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 19 MJ. MJ. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 21 Reynolds Reynolds NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 23 CD. CD. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 Wood Wood NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 27 CM. CM. NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 28 and cm. and baldwin NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 29 Baldwin Baldwin NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 30 , , PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 31 JP. JP. NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 32 ( ( PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 33 2003 2003 NUM _ _ 25 parenth _ _ _ _ _ 34 ) ) PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2081 # text = Structure of the histone-core octamer in KCl / phosphate crystals at 2.15 A resolution . 1 Structure structure of the histone-core octamer in kcl NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 2 of structure of the histone-core octamer in kcl NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 3 the structure of the histone-core octamer in kcl NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 4 histone-core structure of the histone-core octamer in kcl NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 5 octamer structure of the histone-core octamer in kcl NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 6 in structure of the histone-core octamer in kcl NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 KCl KCl NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 8 / / PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 9 phosphate phosphate NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 10 crystals crystals NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 at avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 2.15 2.15 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 A A NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 resolution résolution NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2082 # text = Acta 1 Acta Acta NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2083 # text = Crystallogr . 1 Crystallogr Crystallogr NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2084 # text = D Biol . 1 D D NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Biol Biol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2085 # text = Crystallogr . 1 Crystallogr Crystallogr NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2086 # text = 59 , 1395 - 1407 . 1 59 59 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 1395 1395 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 1395 - 1407 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 1407 1407 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2087 # text = Chen , HY. , Sun , JM. , Zhang , Y. , Davie , JR. and Meistrich , ML. ( 1998 ) . 1 Chen Chen NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 3 HY. HY. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 5 Sun Sun NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 JM. JM. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 9 Zhang Zhang NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 Y. Y. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Davie Davie NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 15 JR. JR. NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 and jr. and meistrich NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 Meistrich Meistrich NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 19 ML. ML. NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 1998 1998 NUM _ _ 13 parenth _ _ _ _ _ 22 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2088 # text = Ubiquitination of histone H3 in elongating spermatids of rat testes . 1 Ubiquitination ubiquitination of histone h3 in elongating spermatids of rat testes NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 of ubiquitination of histone h3 in elongating spermatids of rat testes NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 3 histone ubiquitination of histone h3 in elongating spermatids of rat testes NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 4 H3 H3 NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 in ubiquitination of histone h3 in elongating spermatids of rat testes NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 6 elongating ubiquitination of histone h3 in elongating spermatids of rat testes NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 7 spermatids ubiquitination of histone h3 in elongating spermatids of rat testes NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 8 of ubiquitination of histone h3 in elongating spermatids of rat testes NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 9 rat ubiquitination of histone h3 in elongating spermatids of rat testes NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 testes ubiquitination of histone h3 in elongating spermatids of rat testes NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2089 # text = J . 1 J J NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2090 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2091 # text = Chem . 1 Chem Chem NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2092 # text = 273 , 13165 - 13169 . 1 273 273 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 13165 13165 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 13165 - 13169 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 13169 13169 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2093 # text = Chodaparambil , JV. , Barbera , AJ. , Lu , X. , Kaye , KM. , Hansen , JC. and 1 Chodaparambil Chodaparambil NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 JV. JV. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 Barbera Barbera VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 7 AJ. AJ. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 9 Lu Lu ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 11 X. X. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 13 Kaye Kaye NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 15 KM. KM. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 17 Hansen Hansen NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 19 JC. JC. NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 and jc. and NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2094 # text = Luger , K. ( 2007 ) . 1 Luger luger NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 K. K. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2007 2007 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2095 # text = A charged and contoured surface on the nucleosome regulates chromatin compaction . 1 A a charged and contoured surface on the nucleosome regulates chromatin compaction NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 charged a charged and contoured surface on the nucleosome regulates chromatin compaction NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 3 and a charged and contoured surface on the nucleosome regulates chromatin compaction NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 4 contoured a charged and contoured surface on the nucleosome regulates chromatin compaction NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 5 surface a charged and contoured surface on the nucleosome regulates chromatin compaction NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 6 on a charged and contoured surface on the nucleosome regulates chromatin compaction NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 7 the a charged and contoured surface on the nucleosome regulates chromatin compaction NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 8 nucleosome a charged and contoured surface on the nucleosome regulates chromatin compaction NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 9 regulates a charged and contoured surface on the nucleosome regulates chromatin compaction NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 10 chromatin a charged and contoured surface on the nucleosome regulates chromatin compaction NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 compaction a charged and contoured surface on the nucleosome regulates chromatin compaction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2096 # text = Nat . 1 Nat Nat NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2097 # text = Struct . 1 Struct Struct NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2098 # text = Mol . 1 Mol Mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2099 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2100 # text = 14 , 1105 - 1107 . 1 14 14 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 1105 1105 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 1105 - 1107 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 1107 1107 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2101 # text = Choudhary , P. and Varga-Weisz , P. ( 2007 ) . 1 Choudhary Choudhary NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 P. P. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and p. and varga-weisz NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Varga-Weisz Varga-Weisz NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 P. P. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 2007 2007 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2102 # text = ATP-dependent chromatin remodelling : 1 ATP-dependent atp-dependent chromatin remodelling NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 chromatin atp-dependent chromatin remodelling NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 remodelling atp-dependent chromatin remodelling NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 : : PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2103 # text = action and reaction . 1 action action NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 and and ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 reaction réaction NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2104 # text = Subcell . 1 Subcell Subcell ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2105 # text = Biochem . 1 Biochem Biochem NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2106 # text = 41 , 1 41 41 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2107 # text = 29 - 43 . 1 29 29 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 - 29 - 43 . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 43 43 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 . 29 - 43 . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2108 # text = Churikov , 1 Churikov Churikov NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2109 # text = D . , Siino , J. , Svetlova , M. , Zhang , K. , Gineitis , 1 D d NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Siino Siino NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 J. J. NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 8 Svetlova Svetlova NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 M. monsieur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 12 Zhang Zhang NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 14 K. K. NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 Gineitis Gineitis NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2110 # text = A . , Morton 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Morton Morton NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2111 # text = Bradbury , 1 Bradbury bradbury NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2112 # text = E . and Zalensky , 1 E e . and zalensky NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . e . and zalensky PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 and e . and zalensky NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Zalensky Zalensky NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2113 # text = A . ( 2004 ) . 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 2004 2004 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2114 # text = Novel human testis-specific histone 1 Novel novel NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 human humer ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 testis-specific testis-specific ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 histone histone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2115 # text = H2B encoded by the interrupted gene on the X chromosome . 1 H2B h2b encoded by the interrupted gene on the x chromosome NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 encoded h2b encoded by the interrupted gene on the x chromosome NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 3 by h2b encoded by the interrupted gene on the x chromosome NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 4 the h2b encoded by the interrupted gene on the x chromosome NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 interrupted h2b encoded by the interrupted gene on the x chromosome NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 6 gene h2b encoded by the interrupted gene on the x chromosome NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 7 on h2b encoded by the interrupted gene on the x chromosome NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 8 the h2b encoded by the interrupted gene on the x chromosome NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 9 X X NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 chromosome h2b encoded by the interrupted gene on the x chromosome NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2116 # text = Genomics 84 , 745 - 756 . 1 Genomics Genomics NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 84 84 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 745 745 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 745 - 756 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 756 756 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2117 # text = Clapier , CR. , Chakravarthy , S. , Petosa , 1 Clapier clapier NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 CR. CR. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 5 Chakravarthy Chakravarthy NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Petosa Petosa NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2118 # text = C . , Fernández-Tornero , 1 C c NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Fernández-Tornero Fernández-Tornero NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2119 # text = C . , Luger , K. and Müller , CW. ( 2008 ) . 1 C c NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Luger Luger NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 K. K. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and k. and müller NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Müller Müller NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 CW. CW. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 2008 2008 NUM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2120 # text = Structure of the Drosophila nucleosome core particle highlights evolutionary constraints on the H2A-H2B histone dimer . 1 Structure structure of the drosophila nucleosome core particle highlights evolutionary constraints on the h2a-h2b histone dimer NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 2 of structure of the drosophila nucleosome core particle highlights evolutionary constraints on the h2a-h2b histone dimer NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 3 the structure of the drosophila nucleosome core particle highlights evolutionary constraints on the h2a-h2b histone dimer NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 4 Drosophila Drosophila NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 5 nucleosome structure of the drosophila nucleosome core particle highlights evolutionary constraints on the h2a-h2b histone dimer NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 6 core structure of the drosophila nucleosome core particle highlights evolutionary constraints on the h2a-h2b histone dimer NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 7 particle structure of the drosophila nucleosome core particle highlights evolutionary constraints on the h2a-h2b histone dimer NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 8 highlights structure of the drosophila nucleosome core particle highlights evolutionary constraints on the h2a-h2b histone dimer NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 9 evolutionary structure of the drosophila nucleosome core particle highlights evolutionary constraints on the h2a-h2b histone dimer NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 10 constraints structure of the drosophila nucleosome core particle highlights evolutionary constraints on the h2a-h2b histone dimer NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 11 on structure of the drosophila nucleosome core particle highlights evolutionary constraints on the h2a-h2b histone dimer NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 12 the structure of the drosophila nucleosome core particle highlights evolutionary constraints on the h2a-h2b histone dimer NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 13 H2A-H2B H2A-H2B NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 14 histone structure of the drosophila nucleosome core particle highlights evolutionary constraints on the h2a-h2b histone dimer NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 dimer structure of the drosophila nucleosome core particle highlights evolutionary constraints on the h2a-h2b histone dimer NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2121 # text = Proteins 71 , 1 Proteins Proteins NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 71 71 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2122 # text = 1 - 7 . 1 1 1 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 - 1 - 7 . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 7 7 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 . 1 - 7 . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2123 # text = Clore , GM. , Gronenborn , AM. , Nilges , M. , Sukumaran , DK. and Zarbock , J . 1 Clore clore VNF _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 3 GM. GM. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 5 Gronenborn Gronenborn NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 AM. AM. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 9 Nilges Nilges NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Sukumaran Sukumaran NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 15 DK. DK. NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 and dk. and zarbock NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 Zarbock Zarbock NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 J J NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2124 # text = ( 1987 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 1987 1987 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2125 # text = The polypeptide fold of the globular domain of histone H5 in solution . 1 The the polypeptide fold of the globular domain of histone h5 in solution NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 polypeptide the polypeptide fold of the globular domain of histone h5 in solution NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 3 fold the polypeptide fold of the globular domain of histone h5 in solution NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 4 of the polypeptide fold of the globular domain of histone h5 in solution NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 5 the the polypeptide fold of the globular domain of histone h5 in solution NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 6 globular the polypeptide fold of the globular domain of histone h5 in solution NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 7 domain the polypeptide fold of the globular domain of histone h5 in solution NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 8 of the polypeptide fold of the globular domain of histone h5 in solution NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 9 histone the polypeptide fold of the globular domain of histone h5 in solution NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 10 H5 H5 NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 11 in the polypeptide fold of the globular domain of histone h5 in solution NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 solution the polypeptide fold of the globular domain of histone h5 in solution NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2126 # text = A study using nuclear magnetic resonance , distance geometry and restrained molecular dynamics . 1 A a study using nuclear magnetic resonance NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 study a study using nuclear magnetic resonance NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 using a study using nuclear magnetic resonance NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 nuclear a study using nuclear magnetic resonance NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 magnetic a study using nuclear magnetic resonance NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 resonance a study using nuclear magnetic resonance NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 8 distance distance geometry and restrained molecular dynamics NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 9 geometry distance geometry and restrained molecular dynamics NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 10 and distance geometry and restrained molecular dynamics NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 11 restrained distance geometry and restrained molecular dynamics NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 12 molecular distance geometry and restrained molecular dynamics NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 dynamics distance geometry and restrained molecular dynamics NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2127 # text = EMBO J. 6 , 1833 - 1842 . 1 EMBO embo NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 6 6 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 1833 1833 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 - 1833 - 1842 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 1842 1842 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2128 # text = Collaborative Computational Project , N4 . ( 1994 ) . 1 Collaborative collaborative NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Computational Computational NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 Project Project NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 5 N4 N4 NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 1994 1994 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2129 # text = The CCP4 Suite : 1 The the ccp4 suite NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 CCP4 CCP4 NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 Suite Suite NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 : : PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2130 # text = Programs for Protein Crystallography . 1 Programs programs for protein crystallography NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 for programs for protein crystallography NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 3 Protein Protein NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Crystallography Crystallography NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2131 # text = Acta Cryst . 1 Acta Acta NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Cryst Cryst NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2132 # text = D50 , 760 - 763 . 1 D50 D50 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 760 760 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 760 - 763 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 763 763 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2133 # text = Cosgrove , MS. ( 2007 ) . 1 Cosgrove Cosgrove NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 MS. MS. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2007 2007 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2134 # text = Histone proteomics and the epigenetic regulation of nucleosome mobility . 1 Histone histone proteomics and the epigenetic regulation of nucleosome mobility NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 proteomics histone proteomics and the epigenetic regulation of nucleosome mobility NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 3 and histone proteomics and the epigenetic regulation of nucleosome mobility NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 4 the histone proteomics and the epigenetic regulation of nucleosome mobility NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 5 epigenetic histone proteomics and the epigenetic regulation of nucleosome mobility NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 6 regulation histone proteomics and the epigenetic regulation of nucleosome mobility NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 7 of histone proteomics and the epigenetic regulation of nucleosome mobility NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 8 nucleosome histone proteomics and the epigenetic regulation of nucleosome mobility NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 mobility histone proteomics and the epigenetic regulation of nucleosome mobility NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2135 # text = Expert Rev Proteomics 4 , 465 - 478 . 1 Expert expert NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Rev Rev NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 Proteomics Proteomics NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 465 465 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 - 465 - 478 PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 8 478 478 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2136 # text = Costanzi , 1 Costanzi Costanzi NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2137 # text = C . and Pehrson , JR. ( 1998 ) . 1 C c NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 and and pehrson NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Pehrson Pehrson NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 JR. JR. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 1998 1998 NUM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2138 # text = Histone macroH 2 A 1 is concentrated in the inactive X chromosome of female mammals . 1 Histone histone NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 2 macroH macro- VPR _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 2 2 NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 4 A A NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 5 1 1 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 6 is a 1 is concentrated in the NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 7 concentrated a 1 is concentrated in the NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 8 in a 1 is concentrated in the NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 the a 1 is concentrated in the NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 10 inactive inactiver VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 X X DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 chromosome chromosome NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 of of female mammals NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 14 female of female mammals NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 mammals of female mammals NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2139 # text = Nature 393 , 599 - 601 . 1 Nature nature NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 393 393 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 599 599 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 599 - 601 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 601 601 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2140 # text = Crowley , TE. , Kaine , EM. , Yoshida , M. , Nandi , 1 Crowley crowley NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 3 TE. TE. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 5 Kaine Kaine NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 7 EM. EM. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 9 Yoshida Yoshida NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Nandi Nandi NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2141 # text = A . and Wolgemuth , DJ . 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 and and wolgemuth NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Wolgemuth Wolgemuth NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 DJ DJ NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2142 # text = ( 2002 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 2002 2002 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2143 # text = Reproductive cycle regulation of nuclear import , euchromatic localization , and association with components of Pol II mediator of a mammalian double-bromodomain protein . 1 Reproductive Reproductif ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 cycle cycle NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 regulation regulation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 of off ADV _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 nuclear nucléaire ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 import import NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 8 euchromatic euchromatic NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 localization localization NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 11 and and ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 association association NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 13 with dire ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 components components of pol ii mediator of a mammalian double-bromodomain protein NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 15 of components of pol ii mediator of a mammalian double-bromodomain protein NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 16 Pol Pol NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 17 II II NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 18 mediator components of pol ii mediator of a mammalian double-bromodomain protein NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 19 of components of pol ii mediator of a mammalian double-bromodomain protein NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 20 a components of pol ii mediator of a mammalian double-bromodomain protein NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 21 mammalian components of pol ii mediator of a mammalian double-bromodomain protein NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 22 double-bromodomain components of pol ii mediator of a mammalian double-bromodomain protein NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 23 protein components of pol ii mediator of a mammalian double-bromodomain protein NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2144 # text = Mol . 1 Mol Mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2145 # text = Endocrinol . 1 Endocrinol Endocrinol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2146 # text = 16 , 1727 - 1737 . 1 16 16 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 1727 1727 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 1727 - 1737 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 1737 1737 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2147 # text = De Lucia , 1 De un DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 Lucia Lucia NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2148 # text = F . , Faraone-Mennella , MR. , D'Erme , M. , Quesada , P. , Caiafa , P. and Farina , 1 F f NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Faraone-Mennella Faraone-Mennella NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 MR. MR. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 D' D' PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 Erme Erme NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 11 M. monsieur NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 13 Quesada Quesada NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 15 P. P. NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 17 Caiafa Caiafa NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 19 P. P. NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 20 and p. and farina NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 Farina Farina NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2149 # text = B . ( 1994 ) . 1 B b NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 1994 1994 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2150 # text = Histone-induced condensation of rat testis chromatin : 1 Histone-induced histone-induced condensation of rat testis chromatin NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 condensation histone-induced condensation of rat testis chromatin NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 of histone-induced condensation of rat testis chromatin NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 rat histone-induced condensation of rat testis chromatin NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 testis histone-induced condensation of rat testis chromatin NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 chromatin histone-induced condensation of rat testis chromatin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 : : PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2151 # text = testis-specific H 1t versus somatic H1 variants . 1 testis-specific testis-specific VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 H H NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 1t 1t NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 versus vs PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 somatic soma NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 H1 H1 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 variants variants NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2152 # text = Biochem . 1 Biochem Biochem NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2153 # text = Biophys . 1 Biophys Biophys NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2154 # text = Res . 1 Res ré NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2155 # text = Commun . 1 Commun commun ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2156 # text = 198 , 1 198 198 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2157 # text = 32 - 39 . 1 32 32 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 - 32 - 39 . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 39 39 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 . 32 - 39 . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2158 # text = Denis , GV. , McComb , ME. , Faller , DV. , Sinha , 1 Denis Denis NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 GV. GV. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 McComb McComb NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 ME. ME. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 9 Faller Faller NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 DV. DV. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Sinha Sinha NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2159 # text = A . , Romesser , PB. and 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Romesser Romesser NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 6 PB. PB. NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 and pb. and NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2160 # text = Costello , CE. ( 2006 ) . 1 Costello costello NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 CE. CE. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2006 2006 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2161 # text = Identification of transcription complexes that contain the double bromodomain protein Brd 2 and chromatin remodeling machines . 1 Identification identification of transcription complexes that contain the double bromodomain protein brd 2 and chromatin remodeling machines NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 2 of identification of transcription complexes that contain the double bromodomain protein brd 2 and chromatin remodeling machines NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 3 transcription identification of transcription complexes that contain the double bromodomain protein brd 2 and chromatin remodeling machines NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 4 complexes identification of transcription complexes that contain the double bromodomain protein brd 2 and chromatin remodeling machines NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 5 that identification of transcription complexes that contain the double bromodomain protein brd 2 and chromatin remodeling machines NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 6 contain identification of transcription complexes that contain the double bromodomain protein brd 2 and chromatin remodeling machines NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 7 the identification of transcription complexes that contain the double bromodomain protein brd 2 and chromatin remodeling machines NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 8 double identification of transcription complexes that contain the double bromodomain protein brd 2 and chromatin remodeling machines NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 9 bromodomain identification of transcription complexes that contain the double bromodomain protein brd 2 and chromatin remodeling machines NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 10 protein identification of transcription complexes that contain the double bromodomain protein brd 2 and chromatin remodeling machines NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 11 Brd Brd NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 12 2 2 NUM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 13 and identification of transcription complexes that contain the double bromodomain protein brd 2 and chromatin remodeling machines NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 14 chromatin identification of transcription complexes that contain the double bromodomain protein brd 2 and chromatin remodeling machines NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 15 remodeling identification of transcription complexes that contain the double bromodomain protein brd 2 and chromatin remodeling machines NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 machines identification of transcription complexes that contain the double bromodomain protein brd 2 and chromatin remodeling machines NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2162 # text = J . 1 J J NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2163 # text = Proteome Res . 1 Proteome Proteome NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Res Res NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2164 # text = 5 , 502 - 511 . 1 5 5 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 502 502 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 502 - 511 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 511 511 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2165 # text = Denis , GV. , Vaziri , 1 Denis Denis NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 GV. GV. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Vaziri Vaziri NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2166 # text = C . , Guo , N. and Faller , DV. ( 2000 ) . 1 C c NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Guo Guo NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 N. N. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and n. and faller NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Faller Faller NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 DV. DV. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 2000 2000 NUM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2167 # text = RING3 kinase transactivates promoters of cell cycle regulatory genes through E2F. Cell 1 RING3 ring3 kinase transactivates promoters of cell cycle regulatory genes through e2f. cell NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 kinase ring3 kinase transactivates promoters of cell cycle regulatory genes through e2f. cell NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 3 transactivates ring3 kinase transactivates promoters of cell cycle regulatory genes through e2f. cell NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 4 promoters ring3 kinase transactivates promoters of cell cycle regulatory genes through e2f. cell NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 5 of ring3 kinase transactivates promoters of cell cycle regulatory genes through e2f. cell NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 6 cell ring3 kinase transactivates promoters of cell cycle regulatory genes through e2f. cell NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 7 cycle ring3 kinase transactivates promoters of cell cycle regulatory genes through e2f. cell NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 8 regulatory ring3 kinase transactivates promoters of cell cycle regulatory genes through e2f. cell NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 9 genes ring3 kinase transactivates promoters of cell cycle regulatory genes through e2f. cell NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 10 through ring3 kinase transactivates promoters of cell cycle regulatory genes through e2f. cell NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 11 E2F. E2F. NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 Cell Cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2168 # text = Growth Differ . 1 Growth Growth NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Differ Differ NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2169 # text = 11 , 417 - 424 . 1 11 11 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 417 417 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 417 - 424 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 424 424 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2170 # text = Dey , 1 Dey dey NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2171 # text = A . , Chitsaz , 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Chitsaz Chitsaz NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2172 # text = F . , Abbasi , 1 F f NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Abbasi Abbasi NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2173 # text = A . , Misteli , T. and Ozato , K. ( 2003 ) . 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 4 Misteli Misteli NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 6 T. T. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and t. and ozato NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Ozato Ozato NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 K. K. NOM _ _ 1 subj _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 2003 2003 NUM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2174 # text = The double bromodomain protein Brd 4 binds to acetylated chromatin during interphase and mitosis .. 1 The the double bromodomain protein brd 4 binds to acetylated chromatin during interphase and mitosis .. NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 2 double the double bromodomain protein brd 4 binds to acetylated chromatin during interphase and mitosis .. NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 3 bromodomain the double bromodomain protein brd 4 binds to acetylated chromatin during interphase and mitosis .. NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 4 protein the double bromodomain protein brd 4 binds to acetylated chromatin during interphase and mitosis .. NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 5 Brd Brd NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 6 4 4 NUM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 7 binds the double bromodomain protein brd 4 binds to acetylated chromatin during interphase and mitosis .. NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 8 to the double bromodomain protein brd 4 binds to acetylated chromatin during interphase and mitosis .. NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 9 acetylated the double bromodomain protein brd 4 binds to acetylated chromatin during interphase and mitosis .. NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 10 chromatin the double bromodomain protein brd 4 binds to acetylated chromatin during interphase and mitosis .. NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 11 during the double bromodomain protein brd 4 binds to acetylated chromatin during interphase and mitosis .. NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 12 interphase the double bromodomain protein brd 4 binds to acetylated chromatin during interphase and mitosis .. NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 13 and the double bromodomain protein brd 4 binds to acetylated chromatin during interphase and mitosis .. NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 14 mitosis the double bromodomain protein brd 4 binds to acetylated chromatin during interphase and mitosis .. NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 .. the double bromodomain protein brd 4 binds to acetylated chromatin during interphase and mitosis .. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2175 # text = Proc . 1 Proc Proc NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2176 # text = Natl . 1 Natl Natl NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2177 # text = Acad . 1 Acad Acad NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2178 # text = Sci . 1 Sci Sci NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2179 # text = U.S.A . 100 , 8758 - 8763 . 1 U.S.A u.s.a NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 100 100 NUM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 8758 8758 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 - 8758 - 8763 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 8763 8763 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2180 # text = Dey , 1 Dey dey NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2181 # text = A . , Ellenberg , J. , Farina , 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 4 Ellenberg Ellenberg NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 J. J. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Farina Farina VRB _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2182 # text = A . , Coleman , AE. , Maruyama , T. , Sciortino , S. , Lippincott-Schwartz , J. and Ozato , K. ( 2000 ) . 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 4 Coleman Coleman NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 6 AE. AE. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 8 Maruyama Maruyama NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 10 T. T. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 12 Sciortino Sciortino NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 14 S. S. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 16 Lippincott-Schwartz Lippincott-Schwartz NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 18 J. J. NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 19 and j. and ozato NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 Ozato Ozato NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 K. K. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 2000 2000 NUM _ _ 22 parenth _ _ _ _ _ 25 ) ) PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2183 # text = A bromodomain protein , MCAP , associates with mitotic chromosomes and affects G ( 2 ) -to-M transition . 1 A avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 2 bromodomain bromodomain ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 protein protein VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 5 MCAP MCAP NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 7 associates associates with mitotic chromosomes and affects g NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 8 with associates with mitotic chromosomes and affects g NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 9 mitotic associates with mitotic chromosomes and affects g NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 10 chromosomes associates with mitotic chromosomes and affects g NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 11 and associates with mitotic chromosomes and affects g NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 12 affects associates with mitotic chromosomes and affects g NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 G G NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 ( ( 2 ) PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 2 2 NUM _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 16 ) ( 2 ) PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 17 -to-M top-Monsieur NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 18 transition transition NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2184 # text = Mol . 1 Mol Mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2185 # text = Cell . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2186 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2187 # text = 20 , 6537 - 6549 . 1 20 20 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 6537 6537 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 6537 - 6549 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 6549 6549 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2188 # text = Dhalluin , 1 Dhalluin Dhalluin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2189 # text = C . , Carlson , JE. , Zeng , L. , He , 1 C c NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Carlson Carlson NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 JE. JE. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Zeng Zeng NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 10 L. L. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 He He NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2190 # text = C . , Aggarwal , AK. and Zhou , MM . 1 C c NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Aggarwal Aggarwal NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 AK. AK. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and ak. and zhou NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Zhou Zhou NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 MM MM NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2191 # text = ( 1999 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 1999 1999 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2192 # text = Structure and ligand of a histone acetyltransferase bromodomain .. 1 Structure structure and ligand of a histone acetyltransferase bromodomain .. NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 and structure and ligand of a histone acetyltransferase bromodomain .. NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 3 ligand structure and ligand of a histone acetyltransferase bromodomain .. NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 4 of structure and ligand of a histone acetyltransferase bromodomain .. NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 5 a structure and ligand of a histone acetyltransferase bromodomain .. NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 6 histone structure and ligand of a histone acetyltransferase bromodomain .. NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 7 acetyltransferase structure and ligand of a histone acetyltransferase bromodomain .. NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 8 bromodomain structure and ligand of a histone acetyltransferase bromodomain .. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 .. structure and ligand of a histone acetyltransferase bromodomain .. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2193 # text = Nature 399 , 491 - 496 . 1 Nature nature NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 399 399 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 491 491 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 491 - 496 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 496 496 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2194 # text = Dion , MF. , Altschuler , SJ. , Wu , LF. and Rando , OJ. ( 2005 ) . 1 Dion dion NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 MF. MF. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 5 Altschuler Altschuler NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 7 SJ. SJ. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 9 Wu Wu NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 11 LF. LF. NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 12 and lf. and rando NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 Rando Rando NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 15 OJ. OJ. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 2005 2005 NUM _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2195 # text = Genomic characterization reveals a simple histone H4 acetylation code . 1 Genomic genomic characterization reveals NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 characterization genomic characterization reveals NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 reveals genomic characterization reveals NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 a avoir VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 simple simple ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 histone histone NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 H4 H4 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 acetylation acetylation NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 code code NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2196 # text = Proc . 1 Proc Proc NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2197 # text = Natl . 1 Natl Natl NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2198 # text = Acad . 1 Acad Acad NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2199 # text = Sci . 1 Sci Sci NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2200 # text = U.S.A . 102 , 5501 - 5506 . 1 U.S.A u.s.a NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 102 102 NUM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 5501 5501 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 - 5501 - 5506 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 5506 5506 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2201 # text = Dorigo , 1 Dorigo Dorigo NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2202 # text = B . , Schalch , T. , Kulangara , 1 B b NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Schalch Schalch NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 T. T. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 Kulangara Kulangara NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2203 # text = A . , Duda , S. , Schroeder , RR. and 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 4 Duda Duda NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 6 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 8 Schroeder Schroeder NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 10 RR. RR. NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 and rr. and NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2204 # text = Richmond , TJ. ( 2004 ) . 1 Richmond richmond NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 TJ. TJ. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2004 2004 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2205 # text = Nucleosome arrays reveal the two-start organization of the chromatin fiber . 1 Nucleosome nucleosome arrays reveal the two-start organization of the chromatin fiber NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 arrays nucleosome arrays reveal the two-start organization of the chromatin fiber NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 3 reveal nucleosome arrays reveal the two-start organization of the chromatin fiber NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 4 the nucleosome arrays reveal the two-start organization of the chromatin fiber NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 two-start nucleosome arrays reveal the two-start organization of the chromatin fiber NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 6 organization nucleosome arrays reveal the two-start organization of the chromatin fiber NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 7 of nucleosome arrays reveal the two-start organization of the chromatin fiber NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 8 the nucleosome arrays reveal the two-start organization of the chromatin fiber NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 9 chromatin nucleosome arrays reveal the two-start organization of the chromatin fiber NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 fiber nucleosome arrays reveal the two-start organization of the chromatin fiber NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2206 # text = Science 306 , 1571 - 1573 . 1 Science science NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 306 306 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 1571 1571 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 1571 - 1573 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 1573 1573 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2207 # text = Doyen , 1 Doyen doyen NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2208 # text = C . , An , W. , Angelov , 1 C c NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 An An NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 W. W. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 Angelov Angelov NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2209 # text = D . , Bondarenko , V. , Mietton , 1 D d NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Bondarenko Bondarenko NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 V. V. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 Mietton Mietton NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2210 # text = F . , Studitsky , VM. , Hamiche , 1 F f NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Studitsky Studitsky NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 VM. VM. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 Hamiche Hamiche NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2211 # text = A . , Roeder , RG. , Bouvet , P. and Dimitrov , S. ( 2006 ) . 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 4 Roeder Roeder NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 6 RG. RG. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 8 Bouvet Bouvet NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 10 P. P. NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 11 and p. and dimitrov NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 Dimitrov Dimitrov NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 14 S. S. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 15 ( ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 2006 2006 NUM _ _ 4 parenth _ _ _ _ _ 17 ) ) PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2212 # text = Mechanism of polymerase II transcription repression by the histone variant macroH 2A . 1 Mechanism mechanism of polymerase NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 of mechanism of polymerase NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 polymerase mechanism of polymerase NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 II II ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 transcription transcription NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 repression répression NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 by by NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 the the NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 histone histone NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 variant varier VPR _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 macroH macro- ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 2A 2A NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2213 # text = Mol . 1 Mol Mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2214 # text = Cell . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2215 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2216 # text = 26 , 1156 - 1164 . 1 26 26 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 1156 1156 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 1156 - 1164 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 1164 1164 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2217 # text = Drabent , 1 Drabent Drabent NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2218 # text = B . , Bode , 1 B b NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Bode Bode NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2219 # text = C . , Bramlage , 1 C c NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Bramlage Bramlage NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2220 # text = B . and Doenecke , 1 B b . and doenecke NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . b . and doenecke PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 and b . and doenecke NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Doenecke Doenecke NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2221 # text = D . ( 1996 ) . 1 D d NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 1996 1996 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2222 # text = Expression of the mouse testicular histone gene H 1t during spermatogenesis . 1 Expression expression of the mouse testicular histone gene h 1t during spermatogenesis NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 of expression of the mouse testicular histone gene h 1t during spermatogenesis NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 3 the expression of the mouse testicular histone gene h 1t during spermatogenesis NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 4 mouse expression of the mouse testicular histone gene h 1t during spermatogenesis NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 5 testicular expression of the mouse testicular histone gene h 1t during spermatogenesis NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 6 histone expression of the mouse testicular histone gene h 1t during spermatogenesis NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 7 gene expression of the mouse testicular histone gene h 1t during spermatogenesis NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 8 H H NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 9 1t 1t NUM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 10 during expression of the mouse testicular histone gene h 1t during spermatogenesis NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 spermatogenesis expression of the mouse testicular histone gene h 1t during spermatogenesis NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2223 # text = Histochem . 1 Histochem Histochem NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2224 # text = Cell Biol . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Biol Biol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2225 # text = 106 , 247 - 251 . 1 106 106 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 247 247 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 247 - 251 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 251 251 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2226 # text = Emsley , P. and Cowtan , K. ( 2004 ) . 1 Emsley Emsley NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 P. P. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and p. and cowtan NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Cowtan Cowtan NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 K. K. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 2004 2004 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2227 # text = Coot : 1 Coot Coot NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2228 # text = model-building tools for molecular graphics .. 1 model-building model-building tools for molecular graphics .. NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 tools model-building tools for molecular graphics .. NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 for model-building tools for molecular graphics .. NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 molecular model-building tools for molecular graphics .. NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 graphics model-building tools for molecular graphics .. NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 .. model-building tools for molecular graphics .. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2229 # text = Acta Crystallographica Section D 60 , 2126-- . 1 Acta acter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Crystallographica Crystallographica NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 Section Section NOM _ _ 1 subj _ _ _ _ _ 4 D D NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 60 60 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 2126-- 2126-- NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2230 # text = English , CM. , Maluf , NK. , Tripet , 1 English english NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 CM. CM. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 5 Maluf Maluf NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 NK. NK. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Tripet Tripet NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2231 # text = B . , Churchill , MEA . 1 B b NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Churchill Churchill NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 MEA MEA NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2232 # text = and Tyler , JK . 1 and and tyler NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 Tyler Tyler NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 JK JK NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2233 # text = ( 2005 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 2005 2005 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2234 # text = ASF1 binds to a heterodimer of histones H3 and H4 : 1 ASF1 asf1 binds to a heterodimer of histones h3 and h4 NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 binds asf1 binds to a heterodimer of histones h3 and h4 NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 3 to asf1 binds to a heterodimer of histones h3 and h4 NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 4 a asf1 binds to a heterodimer of histones h3 and h4 NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 heterodimer asf1 binds to a heterodimer of histones h3 and h4 NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 6 of asf1 binds to a heterodimer of histones h3 and h4 NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 7 histones asf1 binds to a heterodimer of histones h3 and h4 NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 8 H3 H3 NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 9 and asf1 binds to a heterodimer of histones h3 and h4 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 H4 H4 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 : : PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2235 # text = a two-step mechanism for the assembly of the H3-H4 heterotetramer on DNA . 1 a a two-step mechanism for the assembly of the h3-h4 heterotetramer on dna NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 two-step a two-step mechanism for the assembly of the h3-h4 heterotetramer on dna NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 3 mechanism a two-step mechanism for the assembly of the h3-h4 heterotetramer on dna NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 4 for a two-step mechanism for the assembly of the h3-h4 heterotetramer on dna NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 5 the a two-step mechanism for the assembly of the h3-h4 heterotetramer on dna NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 6 assembly a two-step mechanism for the assembly of the h3-h4 heterotetramer on dna NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 7 of a two-step mechanism for the assembly of the h3-h4 heterotetramer on dna NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 8 the a two-step mechanism for the assembly of the h3-h4 heterotetramer on dna NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 9 H3-H4 H3-H4 NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 10 heterotetramer a two-step mechanism for the assembly of the h3-h4 heterotetramer on dna NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 11 on a two-step mechanism for the assembly of the h3-h4 heterotetramer on dna NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 DNA DNA NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2236 # text = Biochemistry 1 Biochemistry biochemistry NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2237 # text = 44 , 13673 - 13682 . 1 44 44 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 13673 13673 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 13673 - 13682 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 13682 13682 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2238 # text = Fan , JY. , Rangasamy , 1 Fan fan NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 JY. JY. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Rangasamy Rangasamy NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2239 # text = D . , Luger , K. and Tremethick , DJ. ( 2004 ) . 1 D d NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Luger Luger NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 K. K. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and k. and tremethick NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Tremethick Tremethick NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 DJ. DJ. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 2004 2004 NUM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2240 # text = H2A.Z alters the nucleosome surface to promote HP 1 alpha-mediated chromatin fiber folding . 1 H2A.Z h2a.z alters the nucleosome surface to promote hp 1 alpha-mediated chromatin fiber folding NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 2 alters h2a.z alters the nucleosome surface to promote hp 1 alpha-mediated chromatin fiber folding NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 3 the h2a.z alters the nucleosome surface to promote hp 1 alpha-mediated chromatin fiber folding NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 4 nucleosome h2a.z alters the nucleosome surface to promote hp 1 alpha-mediated chromatin fiber folding NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 5 surface h2a.z alters the nucleosome surface to promote hp 1 alpha-mediated chromatin fiber folding NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 6 to h2a.z alters the nucleosome surface to promote hp 1 alpha-mediated chromatin fiber folding NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 7 promote h2a.z alters the nucleosome surface to promote hp 1 alpha-mediated chromatin fiber folding NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 8 HP HP NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 9 1 1 NUM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 10 alpha-mediated h2a.z alters the nucleosome surface to promote hp 1 alpha-mediated chromatin fiber folding NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 11 chromatin h2a.z alters the nucleosome surface to promote hp 1 alpha-mediated chromatin fiber folding NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 12 fiber h2a.z alters the nucleosome surface to promote hp 1 alpha-mediated chromatin fiber folding NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 folding h2a.z alters the nucleosome surface to promote hp 1 alpha-mediated chromatin fiber folding NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2241 # text = Mol . 1 Mol Mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2242 # text = Cell 16 , 655 - 661 . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 16 16 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 655 655 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 655 - 661 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 661 661 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2243 # text = Fan , Y. , Nikitina , T. , Zhao , J. , Fleury , TJ. , Bhattacharyya , R. , Bouhassira , EE. , Stein , 1 Fan fan NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 3 Y. Y. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 5 Nikitina Nikitina NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 7 T. T. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 9 Zhao Zhao NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 11 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 13 Fleury Fleury NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 15 TJ. TJ. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 17 Bhattacharyya Bhattacharyya NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 19 R. R. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 21 Bouhassira Bouhassira NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 23 EE. EE. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 Stein Stein NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2244 # text = A . , Woodcock , CL. and Skoultchi , AI. ( 2005 ) . 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Woodcock Woodcock NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 6 CL. CL. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and cl. and skoultchi NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Skoultchi Skoultchi NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 10 AI. AI. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 2005 2005 NUM _ _ 4 parenth _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2245 # text = Histone 1 Histone histone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2246 # text = H1 depletion in mammals alters global chromatin structure but causes specific changes in gene regulation . 1 H1 h1 depletion in mammals alters global chromatin NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 depletion h1 depletion in mammals alters global chromatin NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 3 in h1 depletion in mammals alters global chromatin NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 4 mammals h1 depletion in mammals alters global chromatin NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 5 alters h1 depletion in mammals alters global chromatin NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 6 global h1 depletion in mammals alters global chromatin NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 chromatin h1 depletion in mammals alters global chromatin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 structure structure NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 but but NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 10 causes cause NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 specific spécifier VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 changes change NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 in in ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 gene gêne NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 regulation regulation NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2247 # text = Cell 123 , 1199 - 1212 . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 123 123 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 1199 1199 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 1199 - 1212 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 1212 1212 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2248 # text = Fischle , W. , Wang , Y. , Jacobs , SA. , Kim , Y. , Allis , CD. and 1 Fischle Fischle NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 3 W. W. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 5 Wang Wang NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 7 Y. Y. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 9 Jacobs Jacobs NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 11 SA. SA. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 13 Kim Kim NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 15 Y. Y. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 17 Allis Allis NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 19 CD. CD. NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 and cd. and NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2249 # text = Khorasanizadeh , S. ( 2003 ) . 1 Khorasanizadeh Khorasanizadeh NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2003 2003 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2250 # text = Molecular basis for the discrimination of repressive methyl-lysine marks in histone H3 by Polycomb and HP1 chromodomains . 1 Molecular molecular basis for the discrimination of repressive methyl-lysine NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 basis molecular basis for the discrimination of repressive methyl-lysine NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 3 for molecular basis for the discrimination of repressive methyl-lysine NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 4 the molecular basis for the discrimination of repressive methyl-lysine NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 discrimination molecular basis for the discrimination of repressive methyl-lysine NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 6 of molecular basis for the discrimination of repressive methyl-lysine NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 7 repressive molecular basis for the discrimination of repressive methyl-lysine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 methyl-lysine molecular basis for the discrimination of repressive methyl-lysine NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 marks mark NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 in in ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 histone histone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 H3 H3 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 13 by h3 by polycomb and hp1 chromodomains NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 14 Polycomb Polycomb NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 15 and h3 by polycomb and hp1 chromodomains NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 HP1 HP1 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 chromodomains h3 by polycomb and hp1 chromodomains NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2251 # text = Genes Dev . 1 Genes gêne NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Dev Dev NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2252 # text = 17 , 1870 - 1881 . 1 17 17 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 1870 1870 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 1870 - 1881 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 1881 1881 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2253 # text = Flaus , 1 Flaus Flaus NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2254 # text = A . , Rencurel , 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Rencurel Rencurel NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2255 # text = C . , Ferreira , H. , Wiechens , N. and Owen-Hughes , T . 1 C c NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Ferreira Ferreira NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 H. H. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Wiechens Wiechens NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 10 N. N. NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 11 and n. and owen-hughes NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 Owen-Hughes Owen-Hughes NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 T T NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2256 # text = ( 2004 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 2004 2004 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2257 # text = Sin mutations alter inherent nucleosome mobility . 1 Sin Sin NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 mutations mutations NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 alter alter NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 4 inherent inherent NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 5 nucleosome nucleosome NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 mobility mobility NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2258 # text = EMBO J. 23 , 343 - 353 . 1 EMBO embo NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 23 23 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 343 343 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 - 343 - 353 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 353 353 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2259 # text = Florence , 1 Florence florence NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2260 # text = B . and Faller , DV. ( 2001 ) . 1 B b NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 and and faller NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Faller Faller NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 DV. DV. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 2001 2001 NUM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2261 # text = You : 1 You You NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2262 # text = a novel family of transcriptional regulators . 1 a a novel family of transcriptional regulators NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 novel a novel family of transcriptional regulators NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 family a novel family of transcriptional regulators NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 of a novel family of transcriptional regulators NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 transcriptional a novel family of transcriptional regulators NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 regulators a novel family of transcriptional regulators NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2263 # text = Front . 1 Front front NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2264 # text = Biosci . 1 Biosci Biosci NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2265 # text = 6 , D1008 - 18 . 1 6 6 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 D1008 D1008 NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - - 18 PUNC _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 18 18 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2266 # text = Francis , NJ. , Kingston , RE. and Woodcock , CL. ( 2004 ) . 1 Francis francis NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 NJ. NJ. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Kingston Kingston NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 RE. RE. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 8 and re. and woodcock NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 Woodcock Woodcock NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 CL. CL. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 2004 2004 NUM _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2267 # text = Chromatin compaction by a polycomb group protein complex . 1 Chromatin Chromatin NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 compaction compaction ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 by By NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 polycomb poly- NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 6 group groupe NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 protein protéiner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 complex complexe ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2268 # text = Science 306 , 1574 - 1577 . 1 Science science NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 306 306 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 1574 1574 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 1574 - 1577 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 1577 1577 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2269 # text = Gautier , T. , Abbott , DW. , Molla , 1 Gautier gautier NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 T. T. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 5 Abbott Abbott NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 DW. DW. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Molla Molla NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2270 # text = A . , Verdel , 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Verdel Verdel NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2271 # text = A . , Ausio , J. and Dimitrov , S. ( 2004 ) . 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Ausio Ausio NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 6 J. J. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and j. and dimitrov NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Dimitrov Dimitrov NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 10 S. S. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 2004 2004 NUM _ _ 4 parenth _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2272 # text = Histone variant H 2 ABbd confers lower stability to the nucleosome . 1 Histone histone variant h 2 abbd confers lower stability to the nucleosome NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 variant histone variant h 2 abbd confers lower stability to the nucleosome NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 3 H H NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 4 2 2 NUM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 5 ABbd ABbd NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 6 confers histone variant h 2 abbd confers lower stability to the nucleosome NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 7 lower histone variant h 2 abbd confers lower stability to the nucleosome NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 8 stability histone variant h 2 abbd confers lower stability to the nucleosome NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 9 to histone variant h 2 abbd confers lower stability to the nucleosome NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 10 the histone variant h 2 abbd confers lower stability to the nucleosome NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 nucleosome histone variant h 2 abbd confers lower stability to the nucleosome NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2273 # text = EMBO Rep . 1 EMBO EMBO NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Rep Rep NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2274 # text = 5 , 715 - 720 . 1 5 5 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 715 715 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 715 - 720 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 720 720 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2275 # text = Godde , JS. and Ura , K. ( 2008 ) . 1 Godde godde NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 JS. JS. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and js. and ura NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Ura Ura NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 K. K. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 2008 2008 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2276 # text = Cracking the enigmatic linker histone code . 1 Cracking cracking the enigmatic linker histone code NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 the cracking the enigmatic linker histone code NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 enigmatic cracking the enigmatic linker histone code NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 linker cracking the enigmatic linker histone code NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 histone cracking the enigmatic linker histone code NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 code cracking the enigmatic linker histone code NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2277 # text = J Biochem 143 , 287 - 293 . 1 J J NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Biochem Biochem NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 143 143 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 287 287 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 - 287 - 293 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 293 293 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2278 # text = Govin , J. , Caron , 1 Govin Govin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Caron Caron NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2279 # text = C . , Lestrat , 1 C c NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Lestrat Lestrat NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2280 # text = C . , Rousseaux , S. and Khochbin , S. ( 2004 ) . 1 C c NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Rousseaux Rousseaux NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 S. S. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and s. and khochbin NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Khochbin Khochbin NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 S. S. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 2004 2004 NUM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2281 # text = The role of histones in chromatin remodelling during mammalian spermiogenesis . 1 The the role of histones in chromatin remodelling during mammalian spermiogenesis NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 role the role of histones in chromatin remodelling during mammalian spermiogenesis NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 3 of the role of histones in chromatin remodelling during mammalian spermiogenesis NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 4 histones the role of histones in chromatin remodelling during mammalian spermiogenesis NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 in the role of histones in chromatin remodelling during mammalian spermiogenesis NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 6 chromatin the role of histones in chromatin remodelling during mammalian spermiogenesis NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 7 remodelling the role of histones in chromatin remodelling during mammalian spermiogenesis NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 8 during the role of histones in chromatin remodelling during mammalian spermiogenesis NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 9 mammalian the role of histones in chromatin remodelling during mammalian spermiogenesis NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 spermiogenesis the role of histones in chromatin remodelling during mammalian spermiogenesis NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2282 # text = Eur . 1 Eur heur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2283 # text = J. Biochem . 1 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Biochem Biochem NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2284 # text = 271 , 3459 - 3469 . 1 271 271 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 3459 3459 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 3459 - 3469 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 3469 3469 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2285 # text = Govin , J. , Escoffier , 1 Govin Govin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Escoffier Escoffier NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2286 # text = E . , Rousseaux , S. , Kuhn , L. , Ferro , M. , Thévenon , J. , Catena , R. , Davidson , I. , Garin , J. , Khochbin , S. and Caron , 1 E e NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Rousseaux Rousseaux NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 S. S. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Kuhn Kuhn NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 L. L. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 12 Ferro Ferro NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 14 M. monsieur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 16 Thévenon Thévenon NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 18 J. J. NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 20 Catena Catena NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 22 R. R. NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 24 Davidson Davidson NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 26 I. I. NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 28 Garin Garin NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 29 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 30 J. J. NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 31 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 32 Khochbin Khochbin NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 33 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 34 S. S. NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 35 and s. and caron NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 36 Caron Caron NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 37 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2287 # text = C . ( 2007 ) . 1 C c NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 2007 2007 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2288 # text = Pericentric heterochromatin reprogramming by new histone variants during mouse spermiogenesis . 1 Pericentric pericentric heterochromatin NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 heterochromatin pericentric heterochromatin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 reprogramming re- VPR _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 by By NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 new news NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 histone histone NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 variants variant NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 during during mouse spermiogenesis NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 9 mouse during mouse spermiogenesis NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 spermiogenesis during mouse spermiogenesis NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2289 # text = J. Cell Biol . 1 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Cell Cell ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 Biol Biol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2290 # text = 176 , 283 - 294 . 1 176 176 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 283 283 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 283 - 294 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 294 294 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2291 # text = Govin Jérôme . 1 Govin Govin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Jérôme Jérôme NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2292 # text = Réorganisation de l'épigénome au cours de la spermiogénèse . 1 Réorganisation réorganisation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 l' le NOM _ _ 4 det _ _ _ _ _ 4 épigénome le NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 au à PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 cours cours NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 spermiogénèse spermiogénèse NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2293 # text = 311p . 1 311p 311p NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2294 # text = Thèse : 1 Thèse thèse NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2295 # text = Biologie : 1 Biologie biologie NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2296 # text = Grenoble 1 : 1 Grenoble grenoble NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 1 1 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2297 # text = 2006 1 2006 2006 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2298 # text = Govin , J. , Lestrat , 1 Govin Govin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Lestrat Lestrat NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2299 # text = C . , Caron , 1 C c NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Caron Caron NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2300 # text = C . , Pivot-Pajot , 1 C c NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Pivot-Pajot Pivot-Pajot NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2301 # text = C . , Rousseaux , S. and 1 C c NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Rousseaux Rousseaux NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 S. S. NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 and s. and NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2302 # text = Khochbin , S. ( 2006 ) . 1 Khochbin Khochbin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2006 2006 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2303 # text = Histone acetylation-mediated chromatin compaction during mouse spermatogenesis .. 1 Histone histone acetylation-mediated chromatin compaction during mouse spermatogenesis .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 acetylation-mediated histone acetylation-mediated chromatin compaction during mouse spermatogenesis .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 3 chromatin histone acetylation-mediated chromatin compaction during mouse spermatogenesis .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 4 compaction histone acetylation-mediated chromatin compaction during mouse spermatogenesis .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 during histone acetylation-mediated chromatin compaction during mouse spermatogenesis .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 6 mouse histone acetylation-mediated chromatin compaction during mouse spermatogenesis .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 7 spermatogenesis histone acetylation-mediated chromatin compaction during mouse spermatogenesis .. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 .. histone acetylation-mediated chromatin compaction during mouse spermatogenesis .. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2304 # text = Ernst Schering Res . 1 Ernst Ernst NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Schering Schering NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 Res Res NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2305 # text = Found . 1 Found Found NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2306 # text = Workshop , 155 - 172 . 1 Workshop workshop NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 155 155 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 155 - 172 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 172 172 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2307 # text = Greaves , IK. , Rangasamy , 1 Greaves Greaves NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 IK. IK. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Rangasamy Rangasamy NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2308 # text = D . , Ridgway , P. and Tremethick , DJ. ( 2007 ) . 1 D d NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Ridgway Ridgway NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 P. P. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and p. and tremethick NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Tremethick Tremethick NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 DJ. DJ. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 2007 2007 NUM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2309 # text = H2A.Z contributes to the unique 3D structure of the centromere . 1 H2A.Z h2a.z contributes to the NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 contributes h2a.z contributes to the NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 3 to h2a.z contributes to the NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 the h2a.z contributes to the NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 5 unique unique ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 3D 3D NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 structure structurer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 of of the NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 the of the NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 centromere centro- NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2310 # text = Proc . 1 Proc Proc NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2311 # text = Natl . 1 Natl Natl NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2312 # text = Acad . 1 Acad Acad NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2313 # text = Sci . 1 Sci Sci NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2314 # text = U.S.A . 104 , 525 - 530 . 1 U.S.A u.s.a NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 104 104 NUM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 525 525 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 - 525 - 530 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 530 530 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2315 # text = Hake , SB. and Allis , CD. ( 2006 ) . 1 Hake Hake NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 SB. SB. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and sb. and allis NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Allis Allis NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 CD. CD. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 2006 2006 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2316 # text = Histone H3 variants and their potential role in indexing mammalian genomes : 1 Histone histone h3 variants and their potential role in indexing mammalian genomes NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 H3 H3 NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 3 variants histone h3 variants and their potential role in indexing mammalian genomes NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 4 and histone h3 variants and their potential role in indexing mammalian genomes NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 5 their histone h3 variants and their potential role in indexing mammalian genomes NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 6 potential histone h3 variants and their potential role in indexing mammalian genomes NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 7 role histone h3 variants and their potential role in indexing mammalian genomes NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 8 in histone h3 variants and their potential role in indexing mammalian genomes NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 9 indexing histone h3 variants and their potential role in indexing mammalian genomes NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 10 mammalian histone h3 variants and their potential role in indexing mammalian genomes NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 genomes histone h3 variants and their potential role in indexing mammalian genomes NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 : : PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2317 # text = the " H3 barcode hypothesis " . 1 the thé NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 " " PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 H3 H3 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 barcode h3 barcode hypothesis NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 hypothesis h3 barcode hypothesis NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 " " PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2318 # text = Proc . 1 Proc Proc NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2319 # text = Natl . 1 Natl Natl NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2320 # text = Acad . 1 Acad Acad NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2321 # text = Sci . 1 Sci Sci NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2322 # text = U.S.A . 103 , 6428 - 6435 . 1 U.S.A u.s.a NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 103 103 NUM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 6428 6428 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 - 6428 - 6435 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 6435 6435 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2323 # text = Han , J. , Zhou , H. , Li , Z. , Xu , R. and Zhang , Z. ( 2007 ) . 1 Han han NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 3 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 5 Zhou Zhou NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 H. H. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 9 Li Li NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 Z. Z. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Xu Xu NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 15 R. R. NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 and r. and zhang NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 Zhang Zhang NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 19 Z. Z. NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 2007 2007 NUM _ _ 13 parenth _ _ _ _ _ 22 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2324 # text = Acetylation of lysine 56 of histone H3 catalyzed by RTT109 and regulated by ASF1 is required for replisome integrity . 1 Acetylation acetylation of lysine 56 of histone h3 catalyzed by rtt109 and regulated by asf1 is required for replisome integrity NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 2 of acetylation of lysine 56 of histone h3 catalyzed by rtt109 and regulated by asf1 is required for replisome integrity NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 3 lysine acetylation of lysine 56 of histone h3 catalyzed by rtt109 and regulated by asf1 is required for replisome integrity NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 4 56 56 NUM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 5 of acetylation of lysine 56 of histone h3 catalyzed by rtt109 and regulated by asf1 is required for replisome integrity NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 6 histone acetylation of lysine 56 of histone h3 catalyzed by rtt109 and regulated by asf1 is required for replisome integrity NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 7 H3 H3 NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 8 catalyzed acetylation of lysine 56 of histone h3 catalyzed by rtt109 and regulated by asf1 is required for replisome integrity NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 9 by acetylation of lysine 56 of histone h3 catalyzed by rtt109 and regulated by asf1 is required for replisome integrity NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 10 RTT109 RTT109 NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 11 and acetylation of lysine 56 of histone h3 catalyzed by rtt109 and regulated by asf1 is required for replisome integrity NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 12 regulated acetylation of lysine 56 of histone h3 catalyzed by rtt109 and regulated by asf1 is required for replisome integrity NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 13 by acetylation of lysine 56 of histone h3 catalyzed by rtt109 and regulated by asf1 is required for replisome integrity NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 14 ASF1 ASF1 NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 15 is acetylation of lysine 56 of histone h3 catalyzed by rtt109 and regulated by asf1 is required for replisome integrity NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 16 required acetylation of lysine 56 of histone h3 catalyzed by rtt109 and regulated by asf1 is required for replisome integrity NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 17 for acetylation of lysine 56 of histone h3 catalyzed by rtt109 and regulated by asf1 is required for replisome integrity NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 18 replisome acetylation of lysine 56 of histone h3 catalyzed by rtt109 and regulated by asf1 is required for replisome integrity NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 integrity acetylation of lysine 56 of histone h3 catalyzed by rtt109 and regulated by asf1 is required for replisome integrity NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2325 # text = J. Biol . 1 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Biol Biol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2326 # text = Chem . 1 Chem Chem NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2327 # text = 282 , 28587 - 28596 . 1 282 282 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 28587 28587 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 28587 - 28596 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 28596 28596 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2328 # text = Hazzouri , M. , Pivot-Pajot , 1 Hazzouri Hazzouri NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Pivot-Pajot Pivot-Pajot NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2329 # text = C . , Faure , AK. , Usson , Y. , Pelletier , R. , Sèle , 1 C c NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Faure Faure NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 AK. AK. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Usson Usson NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 10 Y. Y. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 12 Pelletier Pelletier NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 14 R. R. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 Sèle Sèle NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2330 # text = B . , Khochbin , S. and Rousseaux , S. ( 2000 ) . 1 B b NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Khochbin Khochbin NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 S. S. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and s. and rousseaux NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Rousseaux Rousseaux NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 S. S. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 2000 2000 NUM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2331 # text = Regulated hyperacetylation of core histones during mouse spermatogenesis : 1 Regulated regulated hyperacetylation of core histones during mouse spermatogenesis NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 hyperacetylation regulated hyperacetylation of core histones during mouse spermatogenesis NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 3 of regulated hyperacetylation of core histones during mouse spermatogenesis NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 4 core regulated hyperacetylation of core histones during mouse spermatogenesis NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 histones regulated hyperacetylation of core histones during mouse spermatogenesis NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 6 during regulated hyperacetylation of core histones during mouse spermatogenesis NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 7 mouse regulated hyperacetylation of core histones during mouse spermatogenesis NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 spermatogenesis regulated hyperacetylation of core histones during mouse spermatogenesis NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 : : PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2332 # text = involvement of histone deacetylases . 1 involvement involvement of histone deacetylases NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 of involvement of histone deacetylases NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 3 histone involvement of histone deacetylases NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 deacetylases involvement of histone deacetylases NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2333 # text = Eur . 1 Eur heur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2334 # text = J. Cell Biol . 1 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Cell Cell ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 Biol Biol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2335 # text = 79 , 950 - 960 . 1 79 79 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 950 950 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 950 - 960 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 960 960 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2336 # text = Henikoff , S. and Ahmad , K. ( 2005 ) . 1 Henikoff Henikoff NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 S. S. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and s. and ahmad NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Ahmad Ahmad NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 K. K. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 2005 2005 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2337 # text = Assembly of variant histones into chromatin . 1 Assembly assembly of variant histones into chromatin NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 of assembly of variant histones into chromatin NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 variant assembly of variant histones into chromatin NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 histones assembly of variant histones into chromatin NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 into assembly of variant histones into chromatin NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 chromatin assembly of variant histones into chromatin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2338 # text = Annu . 1 Annu Annu NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2339 # text = Rev . 1 Rev Rev NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2340 # text = Cell Dev . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Dev Dev NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2341 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2342 # text = 21 , 133 - 153 . 1 21 21 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 133 133 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 133 - 153 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 153 153 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2343 # text = Houzelstein , 1 Houzelstein Houzelstein NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2344 # text = D . , Bullock , SL. , Lynch , DE. , Grigorieva , EF. , Wilson , VA. and Beddington , RSP . ( 2002 ) . 1 D d NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Bullock Bullock NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 SL. SL. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Lynch Lynch NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 DE. DE. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 12 Grigorieva Grigorieva NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 14 EF. EF. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 16 Wilson Wilson NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 18 VA. VA. NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 19 and va. and beddington NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 Beddington Beddington NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 22 RSP RSP NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 24 ( ( PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 2002 2002 NUM _ _ 16 parenth _ _ _ _ _ 26 ) ) PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2345 # text = Growth and early postimplantation defects in mice deficient for the bromodomain-containing protein Brd 4 . 1 Growth growth and early postimplantation defects in mice deficient for the bromodomain-containing protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 2 and growth and early postimplantation defects in mice deficient for the bromodomain-containing protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 3 early growth and early postimplantation defects in mice deficient for the bromodomain-containing protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 4 postimplantation growth and early postimplantation defects in mice deficient for the bromodomain-containing protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 5 defects growth and early postimplantation defects in mice deficient for the bromodomain-containing protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 6 in growth and early postimplantation defects in mice deficient for the bromodomain-containing protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 7 mice growth and early postimplantation defects in mice deficient for the bromodomain-containing protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 8 deficient growth and early postimplantation defects in mice deficient for the bromodomain-containing protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 9 for growth and early postimplantation defects in mice deficient for the bromodomain-containing protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 10 the growth and early postimplantation defects in mice deficient for the bromodomain-containing protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 11 bromodomain-containing growth and early postimplantation defects in mice deficient for the bromodomain-containing protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 12 protein growth and early postimplantation defects in mice deficient for the bromodomain-containing protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 13 Brd Brd NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 4 4 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2346 # text = Mol . 1 Mol Mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2347 # text = Cell . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2348 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2349 # text = 22 , 3794 - 3802 . 1 22 22 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 3794 3794 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 3794 - 3802 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 3802 3802 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2350 # text = Huang , H. , Zhang , J. , Shen , W. , Wang , X. , Wu , J. , Wu , J. and Shi , Y . 1 Huang Huang NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 3 H. H. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 5 Zhang Zhang NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 7 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 9 Shen Shen NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 11 W. W. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 13 Wang Wang NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 15 X. X. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 17 Wu Wu NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 19 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 21 Wu Wu NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 23 J. J. NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 24 and j. and shi NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 Shi Shi NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 Y Y NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 28 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2351 # text = ( 2007 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 2007 2007 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2352 # text = Solution structure of the second bromodomain of Brd 2 and its specific interaction with acetylated histone tails .. 1 Solution solution structure of the second bromodomain of brd 2 and its specific NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 structure solution structure of the second bromodomain of brd 2 and its specific NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 3 of solution structure of the second bromodomain of brd 2 and its specific NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 4 the solution structure of the second bromodomain of brd 2 and its specific NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 5 second solution structure of the second bromodomain of brd 2 and its specific NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 6 bromodomain solution structure of the second bromodomain of brd 2 and its specific NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 7 of solution structure of the second bromodomain of brd 2 and its specific NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 8 Brd Brd NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 9 2 2 NUM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 10 and solution structure of the second bromodomain of brd 2 and its specific NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 11 its solution structure of the second bromodomain of brd 2 and its specific NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 specific solution structure of the second bromodomain of brd 2 and its specific NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 interaction interaction NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 with dire ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 acetylated acetylated histone tails .. NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 16 histone acetylated histone tails .. NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 17 tails acetylated histone tails .. NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 .. acetylated histone tails .. NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2353 # text = BMC Struct . 1 BMC bmc NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Struct Struct NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2354 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2355 # text = 7 , 1 7 7 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2356 # text = 57 . 1 57 57 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2357 # text = Hudson , BP. , Martinez-Yamout , MA. , Dyson , HJ. and Wright , PE. ( 2000 ) . 1 Hudson hudson NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 BP. BP. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 5 Martinez-Yamout Martinez-Yamout NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 MA. MA. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Dyson Dyson NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 11 HJ. HJ. NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 12 and hj. and wright NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 Wright Wright NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 15 PE. PE. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 2000 2000 NUM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2358 # text = Solution structure and acetyl-lysine binding activity of the GCN5 bromodomain .. 1 Solution solution structure and acetyl-lysine binding activity of the gcn5 bromodomain .. NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 structure solution structure and acetyl-lysine binding activity of the gcn5 bromodomain .. NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 3 and solution structure and acetyl-lysine binding activity of the gcn5 bromodomain .. NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 4 acetyl-lysine solution structure and acetyl-lysine binding activity of the gcn5 bromodomain .. NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 5 binding solution structure and acetyl-lysine binding activity of the gcn5 bromodomain .. NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 6 activity solution structure and acetyl-lysine binding activity of the gcn5 bromodomain .. NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 7 of solution structure and acetyl-lysine binding activity of the gcn5 bromodomain .. NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 8 the solution structure and acetyl-lysine binding activity of the gcn5 bromodomain .. NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 9 GCN5 GCN5 NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 10 bromodomain solution structure and acetyl-lysine binding activity of the gcn5 bromodomain .. NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 .. solution structure and acetyl-lysine binding activity of the gcn5 bromodomain .. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2359 # text = J. Mol . 1 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Mol Mol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2360 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2361 # text = 304 , 355 - 370 . 1 304 304 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 355 355 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 355 - 370 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 370 370 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2362 # text = Jacobson , RH. , Ladurner , AG. , King , DS. and Tjian , R. ( 2000 ) . 1 Jacobson jacobson NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 RH. RH. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 5 Ladurner Ladurner NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 AG. AG. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 King King NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 11 DS. DS. NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 12 and ds. and tjian NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 Tjian Tjian NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 15 R. R. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 2000 2000 NUM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2363 # text = Structure and function of a human TAFII250 double bromodomain module .. 1 Structure structure and function of a human tafii250 double bromodomain module .. NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 and structure and function of a human tafii250 double bromodomain module .. NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 3 function structure and function of a human tafii250 double bromodomain module .. NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 4 of structure and function of a human tafii250 double bromodomain module .. NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 5 a structure and function of a human tafii250 double bromodomain module .. NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 6 human structure and function of a human tafii250 double bromodomain module .. NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 7 TAFII250 TAFII250 NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 8 double structure and function of a human tafii250 double bromodomain module .. NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 9 bromodomain structure and function of a human tafii250 double bromodomain module .. NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 10 module structure and function of a human tafii250 double bromodomain module .. NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 .. structure and function of a human tafii250 double bromodomain module .. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2364 # text = Science 288 , 1422 - 1425 . 1 Science science NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 288 288 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 1422 1422 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 1422 - 1425 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 1425 1425 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2365 # text = Jeanmougin , 1 Jeanmougin Jeanmougin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2366 # text = F . , Wurtz , JM. , Le Douarin , 1 F f NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Wurtz Wurtz NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 JM. JM. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 8 Le Le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 Douarin Douarin NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2367 # text = B . , Chambon , P. and Losson , R . 1 B b NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Chambon Chambon NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 P. P. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and p. and losson NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Losson Losson NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 R R NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2368 # text = ( 1997 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 1997 1997 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2369 # text = The bromodomain revisited .. 1 The the bromodomain revisited .. NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 bromodomain the bromodomain revisited .. NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 3 revisited the bromodomain revisited .. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 .. the bromodomain revisited .. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2370 # text = Trends Biochem . 1 Trends trend NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Biochem Biochem NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2371 # text = Sci . 1 Sci Sci NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2372 # text = 22 , 151 - 153 . 1 22 22 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 151 151 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 151 - 153 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 153 153 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2373 # text = Jelesarov , I. and Bosshard , HR. ( 1999 ) . 1 Jelesarov Jelesarov NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 I. I. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and i. and bosshard NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Bosshard Bosshard NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 HR. HR. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 1999 1999 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2374 # text = Isothermal titration calorimetry and differential scanning calorimetry as complementary tools to investigate the energetics of biomolecular recognition . 1 Isothermal isothermal titration calorimetry and differential scanning calorimetry as complementary tools to investigate the energetics of biomolecular recognition NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 2 titration isothermal titration calorimetry and differential scanning calorimetry as complementary tools to investigate the energetics of biomolecular recognition NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 3 calorimetry isothermal titration calorimetry and differential scanning calorimetry as complementary tools to investigate the energetics of biomolecular recognition NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 4 and isothermal titration calorimetry and differential scanning calorimetry as complementary tools to investigate the energetics of biomolecular recognition NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 5 differential isothermal titration calorimetry and differential scanning calorimetry as complementary tools to investigate the energetics of biomolecular recognition NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 6 scanning isothermal titration calorimetry and differential scanning calorimetry as complementary tools to investigate the energetics of biomolecular recognition NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 7 calorimetry isothermal titration calorimetry and differential scanning calorimetry as complementary tools to investigate the energetics of biomolecular recognition NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 8 as isothermal titration calorimetry and differential scanning calorimetry as complementary tools to investigate the energetics of biomolecular recognition NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 9 complementary isothermal titration calorimetry and differential scanning calorimetry as complementary tools to investigate the energetics of biomolecular recognition NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 10 tools isothermal titration calorimetry and differential scanning calorimetry as complementary tools to investigate the energetics of biomolecular recognition NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 11 to isothermal titration calorimetry and differential scanning calorimetry as complementary tools to investigate the energetics of biomolecular recognition NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 12 investigate isothermal titration calorimetry and differential scanning calorimetry as complementary tools to investigate the energetics of biomolecular recognition NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 13 the isothermal titration calorimetry and differential scanning calorimetry as complementary tools to investigate the energetics of biomolecular recognition NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 14 energetics isothermal titration calorimetry and differential scanning calorimetry as complementary tools to investigate the energetics of biomolecular recognition NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 15 of isothermal titration calorimetry and differential scanning calorimetry as complementary tools to investigate the energetics of biomolecular recognition NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 16 biomolecular isothermal titration calorimetry and differential scanning calorimetry as complementary tools to investigate the energetics of biomolecular recognition NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 recognition isothermal titration calorimetry and differential scanning calorimetry as complementary tools to investigate the energetics of biomolecular recognition NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2375 # text = J. Mol . 1 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Mol Mol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2376 # text = Recognit . 1 Recognit Recognit NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2377 # text = 12 , 1 12 12 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2378 # text = 3 - 18 . 1 3 3 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 - 3 - 18 . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 18 18 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 . 3 - 18 . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2379 # text = Kabsch W. ( 1993 ) . 1 Kabsch Kabsch NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 W. W. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 1993 1993 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2380 # text = Automatic processing of rotation diffraction data from crystals of initially unknown symmetry and cell constants . 1 Automatic automatiser VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 processing processing NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 of off ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 rotation rotation NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 5 diffraction diffraction NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 data dater VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 from frou NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 crystals crystals of initially unknown symmetry and cell constants NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 9 of crystals of initially unknown symmetry and cell constants NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 10 initially crystals of initially unknown symmetry and cell constants NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 11 unknown crystals of initially unknown symmetry and cell constants NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 12 symmetry crystals of initially unknown symmetry and cell constants NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 13 and crystals of initially unknown symmetry and cell constants NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 14 cell crystals of initially unknown symmetry and cell constants NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 constants crystals of initially unknown symmetry and cell constants NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2381 # text = Journal of 1 Journal journal of NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 of journal of NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2382 # text = Applied Crystallography 26 , 795-- . 1 Applied Applied NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Crystallography Crystallography NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 26 26 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 795-- 795-- NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2383 # text = Kabsch , W. ( 1983 ) . 1 Kabsch Kabsch NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 W. W. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 1983 1983 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2384 # text = Dictionary of protein secondary structure : 1 Dictionary dictionary of protein secondary structure NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 of dictionary of protein secondary structure NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 3 protein dictionary of protein secondary structure NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 secondary dictionary of protein secondary structure NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 structure dictionary of protein secondary structure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 : : PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2385 # text = pattern recognition of hydrogen-bonded and geometrical features .. 1 pattern pattern recognition of hydrogen-bonded and geometrical features .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 recognition pattern recognition of hydrogen-bonded and geometrical features .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 3 of pattern recognition of hydrogen-bonded and geometrical features .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 4 hydrogen-bonded pattern recognition of hydrogen-bonded and geometrical features .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 and pattern recognition of hydrogen-bonded and geometrical features .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 6 geometrical pattern recognition of hydrogen-bonded and geometrical features .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 7 features pattern recognition of hydrogen-bonded and geometrical features .. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 .. pattern recognition of hydrogen-bonded and geometrical features .. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2386 # text = Biopolymers 1 Biopolymers Biopolymers NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2387 # text = 22 ( 12 ) , 2577 - 2637 . 1 22 22 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 12 12 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2577 2577 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 - 2577 - 2637 PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 8 2637 2637 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2388 # text = Kamakaka , RT. and Biggins , S. ( 2005 ) . 1 Kamakaka Kamakaka NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 RT. RT. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and rt. and biggins NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Biggins Biggins NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 2005 2005 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2389 # text = Histone variants : 1 Histone histone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 variants variant NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2390 # text = deviants ? . 1 deviants déviant NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2391 # text = Genes 1 Genes genes NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2392 # text = Dev . 1 Dev Dev NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2393 # text = 19 , 295 - 310 . 1 19 19 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 295 295 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 295 - 310 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 310 310 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2394 # text = Kanno , T. , Kanno , Y. , Siegel , RM. , Jang , MK. , Lenardo , MJ. and Ozato , K . 1 Kanno kanno NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 3 T. T. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 5 Kanno Kanno NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 7 Y. Y. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 9 Siegel Siegel NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 11 RM. RM. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 13 Jang Jang NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 15 MK. MK. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 17 Lenardo Lenardo NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 19 MJ. MJ. NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 20 and mj. and ozato NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 Ozato Ozato NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 K K NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2395 # text = ( 2004 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 2004 2004 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2396 # text = Selective recognition of acetylated histones by bromodomain proteins visualized in living cells .. 1 Selective selective recognition of acetylated histones by bromodomain proteins visualized in living cells .. NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 2 recognition selective recognition of acetylated histones by bromodomain proteins visualized in living cells .. NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 3 of selective recognition of acetylated histones by bromodomain proteins visualized in living cells .. NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 4 acetylated selective recognition of acetylated histones by bromodomain proteins visualized in living cells .. NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 5 histones selective recognition of acetylated histones by bromodomain proteins visualized in living cells .. NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 6 by selective recognition of acetylated histones by bromodomain proteins visualized in living cells .. NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 7 bromodomain selective recognition of acetylated histones by bromodomain proteins visualized in living cells .. NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 8 proteins selective recognition of acetylated histones by bromodomain proteins visualized in living cells .. NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 9 visualized selective recognition of acetylated histones by bromodomain proteins visualized in living cells .. NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 10 in selective recognition of acetylated histones by bromodomain proteins visualized in living cells .. NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 11 living selective recognition of acetylated histones by bromodomain proteins visualized in living cells .. NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 12 cells selective recognition of acetylated histones by bromodomain proteins visualized in living cells .. NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 .. selective recognition of acetylated histones by bromodomain proteins visualized in living cells .. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2397 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2398 # text = Cell 13 , 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 13 13 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2399 # text = 33 - 43 . 1 33 33 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 - 33 - 43 . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 43 43 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 . 33 - 43 . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2400 # text = Katritch , V. , Bustamante , 1 Katritch Katritch NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 V. V. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Bustamante Bustamante NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2401 # text = C . and Olson , WK. ( 2000 ) . 1 C c NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 and and olson NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Olson Olson NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 WK. WK. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 2000 2000 NUM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2402 # text = Pulling chromatin fibers : 1 Pulling pulling chromatin fibers NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 chromatin pulling chromatin fibers NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 fibers pulling chromatin fibers NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 : : PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2403 # text = computer simulations of direct physical micromanipulations . 1 computer computer VNF _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 simulations simulation NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 of off ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 direct direct ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 physical physical ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 micromanipulations micromanipulation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2404 # text = J. Mol . 1 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Mol Mol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2405 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2406 # text = 295 , 1 295 295 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2407 # text = 29 - 40 . 1 29 29 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 - 29 - 40 . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 40 40 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 . 29 - 40 . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2408 # text = Kennedy , BP. and Davies , PL. ( 1981 ) . 1 Kennedy kennedy NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 BP. BP. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and bp. and davies NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Davies Davies NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 PL. PL. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 1981 1981 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2409 # text = Phosphorylation of a group of high molecular weight basic nuclear proteins during spermatogenesis in the winter flounder . 1 Phosphorylation phosphorylation of a group of high molecular weight NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 2 of phosphorylation of a group of high molecular weight NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 3 a phosphorylation of a group of high molecular weight NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 4 group phosphorylation of a group of high molecular weight NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 5 of phosphorylation of a group of high molecular weight NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 6 high phosphorylation of a group of high molecular weight NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 molecular phosphorylation of a group of high molecular weight NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 weight phosphorylation of a group of high molecular weight NOM _ _ 11 subj _ _ _ _ _ 9 basic basic NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 nuclear nucléaire ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 proteins pro- VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 during during spermatogenesis in the winter flounder NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 13 spermatogenesis during spermatogenesis in the winter flounder NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 14 in during spermatogenesis in the winter flounder NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 15 the during spermatogenesis in the winter flounder NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 winter during spermatogenesis in the winter flounder NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 flounder during spermatogenesis in the winter flounder NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2410 # text = J. Biol . 1 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Biol Biol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2411 # text = Chem . 1 Chem Chem NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2412 # text = 256 , 9254 - 9259 . 1 256 256 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 9254 9254 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 9254 - 9259 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 9259 9259 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2413 # text = Khadake , JR. and Rao , MR. ( 1995 ) . 1 Khadake Khadake NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 3 JR. JR. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and jr. and rao NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Rao Rao NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 MR. MR. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 1995 1995 NUM _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2414 # text = DNA- and chromatin-condensing properties of rat testes H 1a and H 1t compared to those of rat liver H 1 bdec ; 1 DNA- dna- and chromatin-condensing properties of rat testes h 1a and h 1t compared to those of rat liver h 1 bdec NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 2 and dna- and chromatin-condensing properties of rat testes h 1a and h 1t compared to those of rat liver h 1 bdec NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 3 chromatin-condensing dna- and chromatin-condensing properties of rat testes h 1a and h 1t compared to those of rat liver h 1 bdec NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 4 properties dna- and chromatin-condensing properties of rat testes h 1a and h 1t compared to those of rat liver h 1 bdec NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 5 of dna- and chromatin-condensing properties of rat testes h 1a and h 1t compared to those of rat liver h 1 bdec NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 6 rat dna- and chromatin-condensing properties of rat testes h 1a and h 1t compared to those of rat liver h 1 bdec NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 7 testes dna- and chromatin-condensing properties of rat testes h 1a and h 1t compared to those of rat liver h 1 bdec NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 8 H H NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 9 1a 1a NUM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 10 and dna- and chromatin-condensing properties of rat testes h 1a and h 1t compared to those of rat liver h 1 bdec NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 11 H H NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 12 1t 1t NUM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 13 compared dna- and chromatin-condensing properties of rat testes h 1a and h 1t compared to those of rat liver h 1 bdec NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 14 to dna- and chromatin-condensing properties of rat testes h 1a and h 1t compared to those of rat liver h 1 bdec NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 15 those dna- and chromatin-condensing properties of rat testes h 1a and h 1t compared to those of rat liver h 1 bdec NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 16 of dna- and chromatin-condensing properties of rat testes h 1a and h 1t compared to those of rat liver h 1 bdec NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 17 rat dna- and chromatin-condensing properties of rat testes h 1a and h 1t compared to those of rat liver h 1 bdec NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 18 liver dna- and chromatin-condensing properties of rat testes h 1a and h 1t compared to those of rat liver h 1 bdec NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 19 H H NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 20 1 1 NUM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 bdec dna- and chromatin-condensing properties of rat testes h 1a and h 1t compared to those of rat liver h 1 bdec NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 ; ; PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2415 # text = H 1t is a poor condenser of chromatin . 1 H h 1t is a poor condenser of chromatin NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 1t 1t NUM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 3 is h 1t is a poor condenser of chromatin NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 4 a h 1t is a poor condenser of chromatin NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 poor h 1t is a poor condenser of chromatin NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 6 condenser h 1t is a poor condenser of chromatin NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 7 of h 1t is a poor condenser of chromatin NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 chromatin h 1t is a poor condenser of chromatin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2416 # text = Biochemistry 34 , 15792 - 15801 . 1 Biochemistry biochemistry NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 34 34 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 15792 15792 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 15792 - 15801 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 15801 15801 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2417 # text = Khochbin , S. ( 2001 ) . 1 Khochbin Khochbin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2001 2001 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2418 # text = Histone H1 diversity : 1 Histone histone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 H1 H1 NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 diversity diversité NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2419 # text = bridging regulatory signals to linker histone function . 1 bridging bridging regulatory signals to linker histone function NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 regulatory bridging regulatory signals to linker histone function NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 3 signals bridging regulatory signals to linker histone function NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 4 to bridging regulatory signals to linker histone function NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 5 linker bridging regulatory signals to linker histone function NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 6 histone bridging regulatory signals to linker histone function NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 function bridging regulatory signals to linker histone function NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2420 # text = Gene 271 , 1 Gene gêner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 271 271 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2421 # text = 1 - 12 . 1 1 1 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 - 1 - 12 . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 12 12 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 . 1 - 12 . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2422 # text = Khorasanizadeh , S. ( 2004 ) . 1 Khorasanizadeh Khorasanizadeh NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2004 2004 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2423 # text = The nucleosome : 1 The the nucleosome NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 nucleosome the nucleosome NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2424 # text = from genomic organization to genomic regulation . 1 from frou NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 genomic génomique NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 organization organization NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 to top NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 genomic génomique NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 regulation regulation NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2425 # text = Cell 116 , 259 - 272 . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 116 116 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 259 259 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 259 - 272 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 272 272 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2426 # text = Kobor , MS. , Venkatasubrahmanyam , S. , Meneghini , MD. , Gin , JW. , Jennings , JL. , Link , AJ. , Madhani , HD. and Rine , J. ( 2004 ) . 1 Kobor Kobor NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 3 MS. MS. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 5 Venkatasubrahmanyam Venkatasubrahmanyam NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 7 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 9 Meneghini Meneghini NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 11 MD. MD. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 13 Gin Gin NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 15 JW. JW. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 17 Jennings Jennings NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 19 JL. JL. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 21 Link Link NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 23 AJ. AJ. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 Madhani Madhani NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 27 HD. HD. NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 28 and hd. and rine NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 29 Rine Rine NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 30 , , PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 31 J. J. NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 32 ( ( PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 33 2004 2004 NUM _ _ 25 parenth _ _ _ _ _ 34 ) ) PUNC _ _ 33 punc _ _ _ _ _ 35 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2427 # text = A protein complex containing the conserved Swi 2 / Snf 2 -related ATPase Swr 1p deposits histone variant H2A.Z into euchromatin . 1 A a protein complex containing the conserved swi NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 2 protein a protein complex containing the conserved swi NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 3 complex a protein complex containing the conserved swi NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 4 containing a protein complex containing the conserved swi NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 5 the a protein complex containing the conserved swi NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 6 conserved a protein complex containing the conserved swi NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 Swi Swi NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 8 2 2 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 / sur PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 10 Snf Snf NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 2 2 NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 -related -related VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 ATPase ATPase NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 Swr Swr NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 1p 1p NUM _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 deposits dépose NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 histone histone NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 variant varier VPR _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 H2A.Z H2A.Z NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 20 into h2a.z into euchromatin NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 euchromatin h2a.z into euchromatin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2428 # text = PLoS Biol . 1 PLoS PLoS NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Biol Biol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2429 # text = 2 , E131 . 1 2 2 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 E131 E131 NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2430 # text = Kouzarides , T. ( 2007 ) . 1 Kouzarides Kouzarides NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 T. T. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2007 2007 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2431 # text = Chromatin modifications and their function . 1 Chromatin chromatin modifications and their function NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 modifications chromatin modifications and their function NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 3 and chromatin modifications and their function NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 their chromatin modifications and their function NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 function chromatin modifications and their function NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2432 # text = Cell 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2433 # text = 128 , 693 - 705 . 1 128 128 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 693 693 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 693 - 705 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 705 705 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2434 # text = Krishnamoorthy , T. , Chen , X. , Govin , J. , Cheung , WL. , Dorsey , J. , Schindler , K. , Winter , 1 Krishnamoorthy Krishnamoorthy NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 3 T. T. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 5 Chen Chen NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 7 X. X. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 9 Govin Govin NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 11 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 13 Cheung Cheung NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 15 WL. WL. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 17 Dorsey Dorsey NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 19 J. J. NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 21 Schindler Schindler NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 23 K. K. NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 Winter Winter NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2435 # text = E . , Allis , CD. , Guacci , V. , Khochbin , S. , Fuller , MT. and Berger , SL. ( 2006 ) . 1 E e NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Allis Allis NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 CD. CD. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Guacci Guacci NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 V. V. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 12 Khochbin Khochbin NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 14 S. S. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 16 Fuller Fuller NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 18 MT. MT. NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 19 and mt. and berger NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 Berger Berger NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 22 SL. SL. NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 2006 2006 NUM _ _ 16 parenth _ _ _ _ _ 25 ) ) PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2436 # text = Phosphorylation of histone H4 Ser 1 regulates sporulation in yeast and is conserved in fly and mouse spermatogenesis . 1 Phosphorylation phosphorylation of histone h4 ser 1 regulates NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 of phosphorylation of histone h4 ser 1 regulates NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 3 histone phosphorylation of histone h4 ser 1 regulates NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 4 H4 H4 NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 5 Ser Ser NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 6 1 1 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 regulates phosphorylation of histone h4 ser 1 regulates NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 sporulation sporulation NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 in in ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 yeast yeast and is conserved in fly and mouse spermatogenesis NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 11 and yeast and is conserved in fly and mouse spermatogenesis NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 12 is yeast and is conserved in fly and mouse spermatogenesis NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 13 conserved yeast and is conserved in fly and mouse spermatogenesis NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 14 in yeast and is conserved in fly and mouse spermatogenesis NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 15 fly yeast and is conserved in fly and mouse spermatogenesis NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 16 and yeast and is conserved in fly and mouse spermatogenesis NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 17 mouse yeast and is conserved in fly and mouse spermatogenesis NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 spermatogenesis yeast and is conserved in fly and mouse spermatogenesis NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2437 # text = Genes Dev . 1 Genes gêne NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Dev Dev NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2438 # text = 20 , 2580 - 2592 . 1 20 20 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 2580 2580 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 2580 - 2592 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 2592 2592 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2439 # text = Krissinel , 1 Krissinel Krissinel NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2440 # text = E . and Henrick , K. ( 2007 ) . 1 E e NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 and and henrick NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Henrick Henrick NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 K. K. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 2007 2007 NUM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2441 # text = Inference of macromolecular assemblies from crystalline state .. 1 Inference inference of macromolecular assemblies from crystalline state .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 of inference of macromolecular assemblies from crystalline state .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 3 macromolecular inference of macromolecular assemblies from crystalline state .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 4 assemblies inference of macromolecular assemblies from crystalline state .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 from inference of macromolecular assemblies from crystalline state .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 6 crystalline inference of macromolecular assemblies from crystalline state .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 7 state inference of macromolecular assemblies from crystalline state .. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 .. inference of macromolecular assemblies from crystalline state .. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2442 # text = J. Mol . 1 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Mol Mol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2443 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2444 # text = 372 , 774 - 797 . 1 372 372 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 774 774 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 774 - 797 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 797 797 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2445 # text = Krogan , NJ. , Kim , M. , Tong , 1 Krogan Krogan NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 3 NJ. NJ. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 5 Kim Kim NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Tong Tong NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2446 # text = A . , Golshani , 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Golshani Golshani NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2447 # text = A . , Cagney , G. , Canadien , V. , Richards , DP. , Beattie , BK. , Emili , 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 4 Cagney Cagney NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 6 G. G. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 8 Canadien Canadien NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 10 V. V. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 Richards Richards NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 14 DP. DP. NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 16 Beattie Beattie NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 18 BK. BK. NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 Emili Emili NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2448 # text = A . , Boone , 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Boone Boone NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2449 # text = C . , Shilatifard , 1 C c NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Shilatifard Shilatifard NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2450 # text = A . , Buratowski , S. and Greenblatt , J. ( 2003 ) . 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Buratowski Buratowski NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 6 S. S. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and s. and greenblatt NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Greenblatt Greenblatt NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 10 J. J. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 2003 2003 NUM _ _ 4 parenth _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2451 # text = Methylation of histone H3 by Set 2 in Saccharomyces cerevisiae is linked to transcriptional elongation by RNA polymerase II . 1 Methylation methylation of histone h3 by set NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 of methylation of histone h3 by set NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 histone methylation of histone h3 by set NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 H3 H3 NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 by methylation of histone h3 by set NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 Set Set NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 2 2 NUM _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 8 in in ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 9 Saccharomyces Saccharomyces NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 10 cerevisiae saccharomyces cerevisiae is linked to transcriptional elongation by rna polymerase ii NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 11 is saccharomyces cerevisiae is linked to transcriptional elongation by rna polymerase ii NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 12 linked saccharomyces cerevisiae is linked to transcriptional elongation by rna polymerase ii NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 13 to saccharomyces cerevisiae is linked to transcriptional elongation by rna polymerase ii NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 14 transcriptional saccharomyces cerevisiae is linked to transcriptional elongation by rna polymerase ii NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 15 elongation saccharomyces cerevisiae is linked to transcriptional elongation by rna polymerase ii NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 16 by saccharomyces cerevisiae is linked to transcriptional elongation by rna polymerase ii NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 17 RNA RNA NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 18 polymerase saccharomyces cerevisiae is linked to transcriptional elongation by rna polymerase ii NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 II II NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2452 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2453 # text = Cell . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2454 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2455 # text = 23 , 4207 - 4218 . 1 23 23 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 4207 4207 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 4207 - 4218 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 4218 4218 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2456 # text = Kurdistani , SK. , Tavazoie , S. and Grunstein , M. ( 2004 ) . 1 Kurdistani Kurdistani NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 3 SK. SK. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 5 Tavazoie Tavazoie NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 7 S. S. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 8 and s. and grunstein NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 Grunstein Grunstein NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 2004 2004 NUM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2457 # text = Mapping global histone acetylation patterns to gene expression . 1 Mapping Mapping NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 global global ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 histone histone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 acetylation acetylation patterns to gene expression NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 5 patterns acetylation patterns to gene expression NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 6 to acetylation patterns to gene expression NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 gene acetylation patterns to gene expression NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 expression acetylation patterns to gene expression NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2458 # text = Cell 117 , 721 - 733 . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 117 117 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 721 721 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 721 - 733 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 733 733 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2459 # text = Kusch , T. and Workman , JL. ( 2007 ) . 1 Kusch Kusch NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 T. T. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and t. and workman NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Workman Workman NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 JL. JL. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 2007 2007 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2460 # text = Histone variants and complexes involved in their exchange . 1 Histone histone variants and complexes involved in their exchange NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 variants histone variants and complexes involved in their exchange NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 3 and histone variants and complexes involved in their exchange NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 4 complexes histone variants and complexes involved in their exchange NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 involved histone variants and complexes involved in their exchange NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 6 in histone variants and complexes involved in their exchange NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 7 their histone variants and complexes involved in their exchange NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 exchange histone variants and complexes involved in their exchange NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2461 # text = Subcell . 1 Subcell Subcell ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2462 # text = Biochem . 1 Biochem Biochem NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2463 # text = 41 , 91 - 109 . 1 41 41 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 91 91 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 91 - 109 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 109 109 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2464 # text = Kustatscher , G. , Hothorn , M. , Pugieux , 1 Kustatscher Kustatscher NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 3 G. G. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 5 Hothorn Hothorn NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Pugieux Pugieux NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2465 # text = C . , Scheffzek , K. and Ladurner , AG . 1 C c NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Scheffzek Scheffzek NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 K. K. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and k. and ladurner NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Ladurner Ladurner NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 AG AG NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2466 # text = ( 2005 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 2005 2005 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2467 # text = Splicing regulates NAD metabolite binding to histone macroH 2A . 1 Splicing splicing regulates nad metabolite binding to NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 regulates splicing regulates nad metabolite binding to NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 NAD NAD NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 metabolite splicing regulates nad metabolite binding to NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 binding splicing regulates nad metabolite binding to NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 to splicing regulates nad metabolite binding to NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 histone histone NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 macroH macro- VPR _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 2A 2A NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2468 # text = Nat . 1 Nat Nat NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2469 # text = Struct . 1 Struct Struct NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2470 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2471 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2472 # text = 12 , 624 - 625 . 1 12 12 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 624 624 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 624 - 625 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 625 625 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2473 # text = Ladurner , AG. ( 2003 ) . 1 Ladurner Ladurner NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 AG. AG. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2003 2003 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2474 # text = Inactivating chromosomes : 1 Inactivating Inactivating NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 chromosomes chromosomes NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2475 # text = a macro domain that minimizes transcription . 1 a a macro domain that minimizes transcription NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 macro a macro domain that minimizes transcription NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 domain a macro domain that minimizes transcription NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 that a macro domain that minimizes transcription NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 minimizes a macro domain that minimizes transcription NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 transcription a macro domain that minimizes transcription NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2476 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2477 # text = Cell 12 , 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 12 12 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2478 # text = 1 - 3 . 1 1 1 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 - 1 - 3 . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 3 3 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 . 1 - 3 . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2479 # text = Ladurner , AG. , Inouye , 1 Ladurner Ladurner NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 AG. AG. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Inouye Inouye NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2480 # text = C . , Jain , R. and Tjian , R. ( 2003 ) . 1 C c NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Jain Jain NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 R. R. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and r. and tjian NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Tjian Tjian NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 R. R. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 2003 2003 NUM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2481 # text = Bromodomains mediate an acetyl-histone encoded antisilencing function at heterochromatin boundaries . 1 Bromodomains bromodomains mediate an acetyl-histone encoded antisilencing function at heterochromatin boundaries NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 mediate bromodomains mediate an acetyl-histone encoded antisilencing function at heterochromatin boundaries NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 3 an bromodomains mediate an acetyl-histone encoded antisilencing function at heterochromatin boundaries NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 4 acetyl-histone bromodomains mediate an acetyl-histone encoded antisilencing function at heterochromatin boundaries NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 encoded bromodomains mediate an acetyl-histone encoded antisilencing function at heterochromatin boundaries NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 6 antisilencing bromodomains mediate an acetyl-histone encoded antisilencing function at heterochromatin boundaries NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 7 function bromodomains mediate an acetyl-histone encoded antisilencing function at heterochromatin boundaries NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 8 at bromodomains mediate an acetyl-histone encoded antisilencing function at heterochromatin boundaries NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 9 heterochromatin bromodomains mediate an acetyl-histone encoded antisilencing function at heterochromatin boundaries NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 boundaries bromodomains mediate an acetyl-histone encoded antisilencing function at heterochromatin boundaries NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2482 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2483 # text = Cell 11 , 365 - 376 . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 11 11 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 365 365 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 365 - 376 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 376 376 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2484 # text = Laskowski , R. , MacArthur , M. , Moss , 1 Laskowski Laskowski NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 3 R. R. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 5 MacArthur MacArthur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Moss Moss NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2485 # text = D . and Thornton , J. ( 1993 ) . 1 D d NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 and and thornton NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Thornton Thornton NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 1993 1993 NUM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2486 # text = Procheck : 1 Procheck Procheck NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2487 # text = a program to check the stereochemical quality of protein structures .. 1 a a program to check the stereochemical quality of NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 2 program a program to check the stereochemical quality of NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 3 to a program to check the stereochemical quality of NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 4 check a program to check the stereochemical quality of NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 5 the a program to check the stereochemical quality of NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 6 stereochemical a program to check the stereochemical quality of NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 quality a program to check the stereochemical quality of NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 of a program to check the stereochemical quality of NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 9 protein protéine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 structures structurer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 .. ... PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2488 # text = J . 1 J J NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2489 # text = Appl . 1 Appl Appl NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2490 # text = Cryst 26 , 283 - 291 . 1 Cryst Cryst NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 26 26 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 283 283 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 283 - 291 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 291 291 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2491 # text = Lee , DY. , Hayes , JJ. , Pruss , 1 Lee lee NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 DY. DY. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 5 Hayes Hayes NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 JJ. JJ. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Pruss Pruss NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2492 # text = D . and Wolffe , AP. ( 1993 ) . 1 D d NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 and and wolffe NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Wolffe Wolffe NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 AP. AP. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 1993 1993 NUM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2493 # text = A positive for histone acetylation in transcription factor access to nucleosomal DNA . 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 positive positif ADJ _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 3 for for histone acetylation NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 histone for histone acetylation NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 acetylation for histone acetylation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 in in ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 transcription transcription NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 factor factor NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 access accès NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 to to nucleosomal dna NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 11 nucleosomal to nucleosomal dna NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 DNA DNA NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2494 # text = Cell 72 , 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 72 72 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2495 # text = 73 - 84 . 1 73 73 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 - 73 - 84 . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 84 84 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 . 73 - 84 . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2496 # text = LeRoy , G. , Rickards , 1 LeRoy leroy NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 G. G. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Rickards Rickards NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2497 # text = B . and Flint , SJ. ( 2008 ) . 1 B b NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 and and flint NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Flint Flint NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 SJ. SJ. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 2008 2008 NUM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2498 # text = The double bromodomain proteins Brd 2 and Brd 3 couple histone acetylation to transcription . 1 The the double bromodomain proteins brd 2 and brd NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 double the double bromodomain proteins brd 2 and brd NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 3 bromodomain the double bromodomain proteins brd 2 and brd NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 4 proteins the double bromodomain proteins brd 2 and brd NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 Brd Brd NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 6 2 2 NUM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 7 and the double bromodomain proteins brd 2 and brd NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Brd Brd NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 3 3 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 couple couple NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 histone histone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 acetylation acetylation to NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 to acetylation to NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 transcription transcription NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2499 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2500 # text = Cell 30 , 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 30 30 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2501 # text = 51 - 60 . 1 51 51 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 - 51 - 60 . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 60 60 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 . 51 - 60 . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2502 # text = Leslie , AGW . ( 2006 ) . 1 Leslie leslie NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 3 AGW AGW NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 ( ( PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2006 2006 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2503 # text = The integration of macromolecular diffraction data .. 1 The the integration of macromolecular NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 integration the integration of macromolecular NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 3 of the integration of macromolecular NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 macromolecular the integration of macromolecular NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 5 diffraction diffraction NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 data dater VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 .. ... PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2504 # text = Acta Crystallogr . 1 Acta Acta NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Crystallogr Crystallogr NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2505 # text = D Biol . 1 D D NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Biol Biol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2506 # text = Crystallogr . 1 Crystallogr Crystallogr NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2507 # text = 62 , 1 62 62 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2508 # text = 48 - 57 . 1 48 48 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 - 48 - 57 . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 57 57 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 . 48 - 57 . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2509 # text = Lewis , JD. , Song , Y. , de Jong , ME. , Bagha , SM. and Ausió , J. ( 2003 ) . 1 Lewis lewis NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 3 JD. JD. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 5 Song Song NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 7 Y. Y. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 Jong Jong NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 12 ME. ME. NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 Bagha Bagha NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 16 SM. SM. NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 17 and sm. and ausió NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 Ausió Ausió NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 20 J. J. NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 21 ( ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 2003 2003 NUM _ _ 14 parenth _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2510 # text = A walk though vertebrate and invertebrate protamines . 1 A a walk though vertebrate and invertebrate protamines NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 walk a walk though vertebrate and invertebrate protamines NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 3 though a walk though vertebrate and invertebrate protamines NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 4 vertebrate a walk though vertebrate and invertebrate protamines NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 5 and a walk though vertebrate and invertebrate protamines NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 6 invertebrate a walk though vertebrate and invertebrate protamines NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 protamines a walk though vertebrate and invertebrate protamines NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2511 # text = Chromosoma 111 , 473 - 482 . 1 Chromosoma Chromosoma NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 111 111 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 473 473 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 473 - 482 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 482 482 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2512 # text = Li , 1 Li Li NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2513 # text = A . , Maffey , AH. , Abbott , WD. , Conde e Silva , N. , Prunell , 1 A a NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Maffey Maffey NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 AH. AH. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Abbott Abbott NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 WD. WD. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 12 Conde Conde NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 e e VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 Silva Silva NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 16 N. N. NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 Prunell Prunell NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2514 # text = A . , Siino , J. , Churikov , 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 4 Siino Siino NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 6 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 Churikov Churikov NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2515 # text = D . , Zalensky , AO. and Ausió , J. ( 2005 ) . 1 D d NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Zalensky Zalensky NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 AO. AO. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and ao. and ausió NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Ausió Ausió NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 2005 2005 NUM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2516 # text = Characterization of nucleosomes consisting of the human testis / sperm-specific histone H2B variant ( hTSH 2B ) . 1 Characterization characterization of nucleosomes consisting of the human testis / sperm-specific histone h2b NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 of characterization of nucleosomes consisting of the human testis / sperm-specific histone h2b NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 3 nucleosomes characterization of nucleosomes consisting of the human testis / sperm-specific histone h2b NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 4 consisting characterization of nucleosomes consisting of the human testis / sperm-specific histone h2b NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 5 of characterization of nucleosomes consisting of the human testis / sperm-specific histone h2b NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 6 the characterization of nucleosomes consisting of the human testis / sperm-specific histone h2b NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 7 human characterization of nucleosomes consisting of the human testis / sperm-specific histone h2b NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 8 testis characterization of nucleosomes consisting of the human testis / sperm-specific histone h2b NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 9 / characterization of nucleosomes consisting of the human testis / sperm-specific histone h2b PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 sperm-specific characterization of nucleosomes consisting of the human testis / sperm-specific histone h2b NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 11 histone characterization of nucleosomes consisting of the human testis / sperm-specific histone h2b NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 H2B H2B NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 variant varier VPR _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 ( ( PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 hTSH hTSH ADJ _ _ 12 parenth _ _ _ _ _ 16 2B 2B NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 ) ) PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2517 # text = Biochemistry 44 , 2529 - 2535 . 1 Biochemistry biochemistry NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 44 44 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 2529 2529 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 2529 - 2535 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 2535 2535 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2518 # text = Liu , Y. , Wang , X. , Zhang , J. , Huang , H. , Ding , 1 Liu Liu NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 3 Y. Y. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 5 Wang Wang NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 7 X. X. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 9 Zhang Zhang NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 11 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 13 Huang Huang NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 15 H. H. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 Ding Ding NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2519 # text = B . , Wu , J. and Shi , Y . 1 B b NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Wu Wu NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 J. J. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and j. and shi NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Shi Shi NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 Y Y NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2520 # text = ( 2008 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 2008 2008 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2521 # text = Structural basis and binding properties of the second bromodomain of 1 Structural structural basis and binding properties of the second bromodomain of NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 basis structural basis and binding properties of the second bromodomain of NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 3 and structural basis and binding properties of the second bromodomain of NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 4 binding structural basis and binding properties of the second bromodomain of NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 properties structural basis and binding properties of the second bromodomain of NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 6 of structural basis and binding properties of the second bromodomain of NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 7 the structural basis and binding properties of the second bromodomain of NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 8 second structural basis and binding properties of the second bromodomain of NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 9 bromodomain structural basis and binding properties of the second bromodomain of NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 of structural basis and binding properties of the second bromodomain of NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2522 # text = Biochemistry 47 , 6403 - 6417 . 1 Biochemistry biochemistry NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 47 47 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 6403 6403 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 6403 - 6417 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 6417 6417 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2523 # text = Lorch , Y. , Maier-Davis , 1 Lorch lorch NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 Y. Y. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Maier-Davis Maier-Davis NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2524 # text = B . and Kornberg , RD. ( 2006 ) . 1 B b . and kornberg NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . b . and kornberg PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 and b . and kornberg NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Kornberg Kornberg NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 RD. RD. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 2006 2006 NUM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2525 # text = Chromatin remodeling remodeling by nucleosome disassembly in vitro . 1 Chromatin Chromatin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 remodeling re- NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 remodeling remodeling NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 by by NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 nucleosome nucléé NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 disassembly désassembler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 in in vitro ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 vitro in vitro ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2526 # text = Proc . 1 Proc Proc NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2527 # text = Natl . 1 Natl Natl NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2528 # text = Acad . 1 Acad Acad NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2529 # text = Sci . 1 Sci Sci NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2530 # text = U.S.A . 103 , 3090 - 3093 . 1 U.S.A u.s.a NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 103 103 NUM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 3090 3090 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 - 3090 - 3093 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 3093 3093 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2531 # text = Loyola , 1 Loyola loyola NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2532 # text = A . , LeRoy , G. , Wang , YH. and Reinberg , 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 4 LeRoy LeRoy NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 6 G. G. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 8 Wang Wang NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 10 YH. YH. NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 11 and yh. and reinberg NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 Reinberg Reinberg NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2533 # text = D . ( 2001 ) . 1 D d NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 2001 2001 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2534 # text = Reconstitution of recombinant chromatin establishes a requirement for histone-tail modifications during chromatin assembly and transcription . 1 Reconstitution reconstitution of recombinant chromatin establishes a requirement for histone-tail modifications during chromatin assembly and transcription NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 2 of reconstitution of recombinant chromatin establishes a requirement for histone-tail modifications during chromatin assembly and transcription NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 3 recombinant reconstitution of recombinant chromatin establishes a requirement for histone-tail modifications during chromatin assembly and transcription NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 4 chromatin reconstitution of recombinant chromatin establishes a requirement for histone-tail modifications during chromatin assembly and transcription NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 5 establishes reconstitution of recombinant chromatin establishes a requirement for histone-tail modifications during chromatin assembly and transcription NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 6 a reconstitution of recombinant chromatin establishes a requirement for histone-tail modifications during chromatin assembly and transcription NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 7 requirement reconstitution of recombinant chromatin establishes a requirement for histone-tail modifications during chromatin assembly and transcription NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 8 for reconstitution of recombinant chromatin establishes a requirement for histone-tail modifications during chromatin assembly and transcription NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 9 histone-tail reconstitution of recombinant chromatin establishes a requirement for histone-tail modifications during chromatin assembly and transcription NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 10 modifications reconstitution of recombinant chromatin establishes a requirement for histone-tail modifications during chromatin assembly and transcription NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 11 during reconstitution of recombinant chromatin establishes a requirement for histone-tail modifications during chromatin assembly and transcription NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 12 chromatin reconstitution of recombinant chromatin establishes a requirement for histone-tail modifications during chromatin assembly and transcription NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 13 assembly reconstitution of recombinant chromatin establishes a requirement for histone-tail modifications during chromatin assembly and transcription NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 14 and reconstitution of recombinant chromatin establishes a requirement for histone-tail modifications during chromatin assembly and transcription NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 transcription reconstitution of recombinant chromatin establishes a requirement for histone-tail modifications during chromatin assembly and transcription NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2535 # text = Genes Dev . 1 Genes gêne NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Dev Dev NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2536 # text = 15 , 2837 - 2851 . 1 15 15 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 2837 2837 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 2837 - 2851 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 2851 2851 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2537 # text = Luger , K. ( 2006 ) . 1 Luger luger NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 K. K. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2006 2006 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2538 # text = Dynamic nucleosomes . 1 Dynamic Dynamic NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 nucleosomes nucléé A+_ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2539 # text = Chromosome Res . 1 Chromosome chromosome NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Res Res NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2540 # text = 14 , 1 14 14 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2541 # text = 5 - 16 . 1 5 5 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 - 5 - 16 . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 16 16 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 . 5 - 16 . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2542 # text = Luger , K. and Richmond , TJ. ( 1998a ) . 1 Luger luger VNF _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 3 K. K. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and k. and richmond NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Richmond Richmond NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 TJ. TJ. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 1998a 1998a NUM _ _ 7 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2543 # text = The histone tails of the nucleosome . 1 The the histone tails of the nucleosome NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 histone the histone tails of the nucleosome NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 tails the histone tails of the nucleosome NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 of the histone tails of the nucleosome NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 the the histone tails of the nucleosome NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 nucleosome the histone tails of the nucleosome NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2544 # text = Curr . 1 Curr Curr NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2545 # text = Opin . 1 Opin Opin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2546 # text = Genet . 1 Genet genet NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2547 # text = Dev . 1 Dev Dev NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2548 # text = 8 , 140 - 146 . 1 8 8 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 140 140 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 140 - 146 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 146 146 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2549 # text = Luger , K. and Richmond , TJ. ( 1998b ) . 1 Luger luger VNF _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 3 K. K. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and k. and richmond NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Richmond Richmond NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 TJ. TJ. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 1998b 1998b NUM _ _ 7 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2550 # text = DNA binding within the nucleosome core . 1 DNA dna binding within the nucleosome core NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 binding dna binding within the nucleosome core NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 within dna binding within the nucleosome core NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 the dna binding within the nucleosome core NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 nucleosome dna binding within the nucleosome core NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 core dna binding within the nucleosome core NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2551 # text = Curr . 1 Curr Curr NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2552 # text = Opin . 1 Opin Opin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2553 # text = Struct . 1 Struct Struct NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2554 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2555 # text = 8 , 1 8 8 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2556 # text = 33 - 40 . 1 33 33 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 - 33 - 40 . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 40 40 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 . 33 - 40 . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2557 # text = Luger , K. , Mäder , AW. , Richmond , RK. , Sargent , DF. and Richmond , TJ . 1 Luger luger VNF _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 3 K. K. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 5 Mäder Mäder NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 AW. AW. NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 9 Richmond Richmond NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 RK. RK. NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Sargent Sargent NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 15 DF. DF. NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 and df. and richmond NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 Richmond Richmond NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 TJ TJ NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2558 # text = ( 1997 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 1997 1997 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2559 # text = Crystal structure of the nucleosome core particle at 2.8 A resolution . 1 Crystal crystal structure of the nucleosome NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 2 structure crystal structure of the nucleosome NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 3 of crystal structure of the nucleosome NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 the crystal structure of the nucleosome NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 nucleosome crystal structure of the nucleosome NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 6 core core NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 particle partial ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 at avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 2.8 2.8 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 A A PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 resolution résolution NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2560 # text = Nature 389 , 251 - 260 . 1 Nature nature NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 389 389 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 251 251 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 251 - 260 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 260 260 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2561 # text = Luk , 1 Luk Luk NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2562 # text = E . , Vu , N. , Patteson , K. , Mizuguchi , G. , Wu , W. , Ranjan , 1 E e NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Vu Vu NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 N. N. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Patteson Patteson NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 K. K. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 12 Mizuguchi Mizuguchi NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 14 G. G. NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 16 Wu Wu NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 18 W. W. NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 Ranjan Ranjan NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2563 # text = A . , Backus , J. , Sen , S. , Lewis , M. , Bai , Y. and Wu , 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 4 Backus Backus NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 6 J. J. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 8 Sen Sen NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 10 S. S. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 12 Lewis Lewis NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 16 Bai Bai ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 18 Y. Y. NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 19 and y. and wu NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 Wu Wu NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2564 # text = C . ( 2007 ) . 1 C c NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 2007 2007 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2565 # text = Chz 1 , a nuclear chaperone for histone H2AZ . 1 Chz Chz NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 1 1 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 4 a a nuclear chaperone for histone h2az NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 5 nuclear a nuclear chaperone for histone h2az NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 6 chaperone a nuclear chaperone for histone h2az NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 7 for a nuclear chaperone for histone h2az NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 8 histone a nuclear chaperone for histone h2az NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 H2AZ H2AZ NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2566 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2567 # text = Cell 25 , 357 - 368 . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 25 25 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 357 357 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 357 - 368 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 368 368 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2568 # text = Maier , VK. , Chioda , M. and Becker , PB. ( 2008a ) . 1 Maier maier NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 VK. VK. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Chioda Chioda NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 M. monsieur NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 8 and m. and becker NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 Becker Becker NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 PB. PB. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 2008a 2008a NUM _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2569 # text = ATP-dependent chromatosome remodeling . 1 ATP-dependent ATP-dependent NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 chromatosome chromatosome NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 remodeling re- NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2570 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2571 # text = Chem . 1 Chem Chem NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2572 # text = 389 , 345 - 352 . 1 389 389 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 345 345 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 345 - 352 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 352 352 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2573 # text = Maier , VK. , Chioda , M. , Rhodes , 1 Maier maier NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 3 VK. VK. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 5 Chioda Chioda NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Rhodes Rhodes NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2574 # text = D . and Becker , PB. ( 2008b ) . 1 D d NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 and and becker NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Becker Becker NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 PB. PB. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 2008b 2008b NUM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2575 # text = ACF catalyses chromatosome movements in chromatin fibres . 1 ACF acf catalyses chromatosome movements in chromatin fibres NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 catalyses acf catalyses chromatosome movements in chromatin fibres NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 3 chromatosome acf catalyses chromatosome movements in chromatin fibres NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 4 movements acf catalyses chromatosome movements in chromatin fibres NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 5 in acf catalyses chromatosome movements in chromatin fibres NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 6 chromatin acf catalyses chromatosome movements in chromatin fibres NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 fibres acf catalyses chromatosome movements in chromatin fibres NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2576 # text = EMBO J. 27 , 817 - 826 . 1 EMBO embo NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 27 27 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 817 817 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 - 817 - 826 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 826 826 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2577 # text = Martianov , I. , Brancorsini , S. , Catena , R. , Gansmuller , 1 Martianov Martianov NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 3 I. I. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 5 Brancorsini Brancorsini NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 9 Catena Catena NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 R. R. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Gansmuller Gansmuller NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2578 # text = A . , Kotaja , N. , Parvinen , M. , Sassone-Corsi , P. and Davidson , I. ( 2005 ) . 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 4 Kotaja Kotaja NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 6 N. N. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 8 Parvinen Parvinen NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 10 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 Sassone-Corsi Sassone-Corsi NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 14 P. P. NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 15 and p. and davidson NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 Davidson Davidson NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 18 I. I. NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 2005 2005 NUM _ _ 12 parenth _ _ _ _ _ 21 ) ) PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2579 # text = Polar nuclear localization of H1T2 , a histone H1 variant , required for spermatid elongation and DNA condensation during spermiogenesis . 1 Polar polar nuclear localization of h1t2 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 2 nuclear polar nuclear localization of h1t2 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 3 localization polar nuclear localization of h1t2 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 of polar nuclear localization of h1t2 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 H1T2 H1T2 NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 histone histone NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 H1 H1 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 variant varier VPR _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 12 required required for spermatid elongation and dna condensation during spermiogenesis NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 13 for required for spermatid elongation and dna condensation during spermiogenesis NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 14 spermatid required for spermatid elongation and dna condensation during spermiogenesis NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 15 elongation required for spermatid elongation and dna condensation during spermiogenesis NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 16 and required for spermatid elongation and dna condensation during spermiogenesis NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 17 DNA DNA NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 18 condensation required for spermatid elongation and dna condensation during spermiogenesis NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 19 during required for spermatid elongation and dna condensation during spermiogenesis NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 spermiogenesis required for spermatid elongation and dna condensation during spermiogenesis NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2580 # text = Proc . 1 Proc Proc NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2581 # text = Natl . 1 Natl Natl NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2582 # text = Acad . 1 Acad Acad NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2583 # text = Sci . 1 Sci Sci NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2584 # text = U.S.A . 102 , 2808 - 2813 . 1 U.S.A u.s.a NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 102 102 NUM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 2808 2808 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 - 2808 - 2813 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 2813 2813 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2585 # text = Matangkasombut , O. and Buratowski , S. ( 2003 ) . 1 Matangkasombut Matangkasombut NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 O. O. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and o. and buratowski NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Buratowski Buratowski NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 2003 2003 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2586 # text = Different sensitivities of bromodomain factors 1 and 2 to histone H4 acetylation . 1 Different different sensitivities of bromodomain factors 1 and 2 to histone h4 acetylation NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 sensitivities different sensitivities of bromodomain factors 1 and 2 to histone h4 acetylation NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 3 of different sensitivities of bromodomain factors 1 and 2 to histone h4 acetylation NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 4 bromodomain different sensitivities of bromodomain factors 1 and 2 to histone h4 acetylation NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 5 factors different sensitivities of bromodomain factors 1 and 2 to histone h4 acetylation NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 6 1 1 NUM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 7 and different sensitivities of bromodomain factors 1 and 2 to histone h4 acetylation NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 8 2 2 NUM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 9 to different sensitivities of bromodomain factors 1 and 2 to histone h4 acetylation NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 10 histone different sensitivities of bromodomain factors 1 and 2 to histone h4 acetylation NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 11 H4 H4 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 acetylation different sensitivities of bromodomain factors 1 and 2 to histone h4 acetylation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2587 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2588 # text = Cell 11 , 353 - 363 . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 11 11 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 353 353 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 353 - 363 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 363 363 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2589 # text = Matangkasombut , O. , Buratowski , RM. , Swilling , NW. and Buratowski , S . 1 Matangkasombut Matangkasombut NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 O. O. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 5 Buratowski Buratowski NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 7 RM. RM. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 9 Swilling Swilling NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 11 NW. NW. NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 12 and nw. and buratowski NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 Buratowski Buratowski NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 S S NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2590 # text = ( 2000 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 2000 2000 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2591 # text = Bromodomain factor 1 corresponds to a missing piece of yeast TFIID . 1 Bromodomain Bromodomain NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 factor factor NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 3 1 1 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 corresponds correspondre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 to to a missing piece of yeast tfiid NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 6 a to a missing piece of yeast tfiid NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 7 missing to a missing piece of yeast tfiid NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 8 piece to a missing piece of yeast tfiid NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 9 of to a missing piece of yeast tfiid NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 10 yeast to a missing piece of yeast tfiid NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 TFIID TFIID NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2592 # text = Genes Dev . 1 Genes gêne NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Dev Dev NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2593 # text = 14 , 951 - 962 . 1 14 14 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 951 951 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 951 - 962 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 962 962 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2594 # text = Mattsson , K. , Kiss , 1 Mattsson Mattsson NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 K. K. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Kiss Kiss NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2595 # text = C . , Platt , GM. , Simpson , GR. , Kashuba , 1 C c NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Platt Platt ADV _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 GM. GM. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 8 Simpson Simpson NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 10 GR. GR. NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 Kashuba Kashuba NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2596 # text = E . , Klein , G. , Schulz , TF. and Szekely , L. ( 2002 ) . 1 E e NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Klein Klein NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 G. G. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Schulz Schulz NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 10 TF. TF. NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 11 and tf. and szekely NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 Szekely Szekely NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 14 L. L. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 15 ( ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 2002 2002 NUM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 17 ) ) PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2597 # text = Latent nuclear antigen of Kaposi's sarcoma herpesvirus / human herpesvirus- 8 induces and relocates RING3 to nuclear heterochromatin regions . 1 Latent latent ADJ _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 nuclear nucléaire ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 antigen anti- NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 of of kaposi's sarcoma herpesvirus NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 5 Kaposi's Kaposi's NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 6 sarcoma of kaposi's sarcoma herpesvirus NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 herpesvirus of kaposi's sarcoma herpesvirus NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 / ou PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 9 human humer VPR _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 herpesvirus- herpe NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 8 8 NUM _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 induces in- NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 and and relocates ring3 to nuclear heterochromatin regions NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 14 relocates and relocates ring3 to nuclear heterochromatin regions NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 15 RING3 RING3 NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 16 to and relocates ring3 to nuclear heterochromatin regions NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 17 nuclear and relocates ring3 to nuclear heterochromatin regions NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 18 heterochromatin and relocates ring3 to nuclear heterochromatin regions NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 regions and relocates ring3 to nuclear heterochromatin regions NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2598 # text = J. Gen . 1 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Gen Gen NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2599 # text = Virol . 1 Virol Virol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2600 # text = 83 , 179 - 188 . 1 83 83 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 179 179 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 179 - 188 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 188 188 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2601 # text = McBryant , SJ. , Adams , VH. and Hansen , JC. ( 2006 ) . 1 McBryant McBryant NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 SJ. SJ. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Adams Adams NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 VH. VH. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 8 and vh. and hansen NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 Hansen Hansen NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 JC. JC. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 2006 2006 NUM _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2602 # text = Chromatin architectural proteins . 1 Chromatin Chromatin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 architectural architectural ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 proteins pro- VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2603 # text = Chromosome Res . 1 Chromosome chromosome NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Res Res NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2604 # text = 14 , 1 14 14 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2605 # text = 39 - 51 . 1 39 39 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 - 39 - 51 . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 51 51 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 . 39 - 51 . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2606 # text = Meistrich , ML. , Mohapatra , 1 Meistrich Meistrich NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 ML. ML. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Mohapatra Mohapatra NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2607 # text = B . , Shirley , CR. and Zhao , M. ( 2003 ) . 1 B b NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Shirley Shirley NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 CR. CR. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and cr. and zhao NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Zhao Zhao NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 M. monsieur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 2003 2003 NUM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2608 # text = Roles of transition nuclear proteins in spermiogenesis . 1 Roles roles of NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 of roles of NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 transition transition NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 nuclear nucléaire ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 proteins pro- VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 in in ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 spermiogenesis spermiogenesis ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2609 # text = Chromosoma 111 , 483 - 488 . 1 Chromosoma Chromosoma NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 111 111 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 483 483 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 483 - 488 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 488 488 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2610 # text = Meistrich , ML. , Trostle-Weige , PK. , Lin , R. , Bhatnagar , YM. and Allis , CD . 1 Meistrich Meistrich NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 3 ML. ML. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 5 Trostle-Weige Trostle-Weige NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 PK. PK. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 9 Lin Lin NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 R. R. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Bhatnagar Bhatnagar NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 15 YM. YM. NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 and ym. and allis NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 Allis Allis NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 CD CD NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2611 # text = ( 1992 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 1992 1992 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2612 # text = Highly acetylated H4 is associated with histone displacement in rat spermatids . 1 Highly highly acetylated h4 is associated NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 acetylated highly acetylated h4 is associated NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 3 H4 H4 NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 is highly acetylated h4 is associated NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 associated highly acetylated h4 is associated NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 with bit NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 7 histone histone NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 displacement dire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 in in ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 rat rat NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 spermatids spermatie NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2613 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2614 # text = Reprod . 1 Reprod Re NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2615 # text = Dev . 1 Dev Dev NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2616 # text = 31 , 170 - 181 . 1 31 31 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 170 170 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 170 - 181 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 181 181 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2617 # text = Misteli , T. , Gunjan , 1 Misteli Misteli NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 T. T. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Gunjan Gunjan NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2618 # text = A . , Hock , R. , Bustin , M. and Brown , DT. ( 2000 ) . 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 4 Hock Hock NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 6 R. R. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 8 Bustin Bustin NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 10 M. monsieur NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 11 and m. and brown NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 Brown Brown NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 14 DT. DT. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 15 ( ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 2000 2000 NUM _ _ 4 parenth _ _ _ _ _ 17 ) ) PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2619 # text = Dynamic binding of histone H1 to chromatin in living cells . 1 Dynamic dynamic binding of histone h1 to chromatin NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 binding dynamic binding of histone h1 to chromatin NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 3 of dynamic binding of histone h1 to chromatin NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 4 histone dynamic binding of histone h1 to chromatin NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 5 H1 H1 NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 6 to dynamic binding of histone h1 to chromatin NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 chromatin dynamic binding of histone h1 to chromatin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 in in ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 living living NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 cells cell ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2620 # text = Nature 408 , 877 - 881 . 1 Nature nature NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 408 408 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 877 877 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 877 - 881 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 881 881 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2621 # text = Mizuguchi , G. , Shen , X. , Landry , J. , Wu , W. , Sen , S. and Wu , 1 Mizuguchi Mizuguchi NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 3 G. G. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 5 Shen Shen NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 7 X. X. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 9 Landry Landry NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 11 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 13 Wu Wu NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 15 W. W. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 17 Sen Sen NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 19 S. S. NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 20 and s. and wu NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 Wu Wu NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2622 # text = C . ( 2004 ) . 1 C c NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 2004 2004 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2623 # text = ATP-driven exchange of histone H2AZ variant catalyzed by SWR1 chromatin remodeling complex . 1 ATP-driven atp-driven exchange of histone h2az variant catalyzed by swr1 chromatin remodeling complex NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 exchange atp-driven exchange of histone h2az variant catalyzed by swr1 chromatin remodeling complex NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 3 of atp-driven exchange of histone h2az variant catalyzed by swr1 chromatin remodeling complex NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 4 histone atp-driven exchange of histone h2az variant catalyzed by swr1 chromatin remodeling complex NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 5 H2AZ H2AZ NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 6 variant atp-driven exchange of histone h2az variant catalyzed by swr1 chromatin remodeling complex NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 7 catalyzed atp-driven exchange of histone h2az variant catalyzed by swr1 chromatin remodeling complex NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 8 by atp-driven exchange of histone h2az variant catalyzed by swr1 chromatin remodeling complex NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 9 SWR1 SWR1 NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 10 chromatin atp-driven exchange of histone h2az variant catalyzed by swr1 chromatin remodeling complex NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 11 remodeling atp-driven exchange of histone h2az variant catalyzed by swr1 chromatin remodeling complex NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 complex atp-driven exchange of histone h2az variant catalyzed by swr1 chromatin remodeling complex NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2624 # text = Science 303 , 343 - 348 . 1 Science science NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 303 303 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 343 343 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 343 - 348 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 348 348 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2625 # text = Mujtaba , S. , He , Y. , Zeng , L. , Farooq , 1 Mujtaba Mujtaba NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 3 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 5 He He NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 Y. Y. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 9 Zeng Zeng NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 L. L. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Farooq Farooq NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2626 # text = A . , Carlson , JE. , Ott , M. , Verdin , 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 4 Carlson Carlson NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 6 JE. JE. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 8 Ott Ott NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 Verdin Verdin NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2627 # text = E . and Zhou , M. ( 2002 ) . 1 E e NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 and and zhou NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Zhou Zhou NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 M. monsieur NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 2002 2002 NUM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2628 # text = Structural basis of lysine-acetylated HIV- 1 Tat recognition by PCAF bromodomain .. 1 Structural structural basis of lysine-acetylated hiv- 1 tat NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 basis structural basis of lysine-acetylated hiv- 1 tat NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 3 of structural basis of lysine-acetylated hiv- 1 tat NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 4 lysine-acetylated structural basis of lysine-acetylated hiv- 1 tat NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 5 HIV- HIV- NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 6 1 1 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 Tat Tat NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 recognition recognition NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 by By NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 PCAF PCAF NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 11 bromodomain pcaf bromodomain .. NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 .. pcaf bromodomain .. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2629 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2630 # text = Cell 9 , 575 - 586 . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 9 9 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 575 575 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 575 - 586 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 586 586 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2631 # text = Mujtaba , S. , He , Y. , Zeng , L. , Yan , S. , Plotnikova , O. , Sachchidanand , Sanchez , R. , Zeleznik-Le , NJ. , Ronai , Z. and Zhou , M. ( 2004 ) . 1 Mujtaba Mujtaba NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 3 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 5 He He NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 7 Y. Y. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 9 Zeng Zeng NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 11 L. L. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 13 Yan Yan NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 15 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 17 Plotnikova Plotnikova NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 19 O. O. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 21 Sachchidanand Sachchidanand NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 23 Sanchez Sanchez NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 25 R. R. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 27 Zeleznik-Le Zeleznik-Le NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 29 NJ. NJ. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 30 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 31 Ronai Ronai NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 32 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 33 Z. Z. NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 34 and z. and zhou NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 35 Zhou Zhou NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 36 , , PUNC _ _ 37 punc _ _ _ _ _ 37 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 38 ( ( PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 39 2004 2004 NUM _ _ 37 parenth _ _ _ _ _ 40 ) ) PUNC _ _ 39 punc _ _ _ _ _ 41 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2632 # text = Structural mechanism of the bromodomain of the coactivator CBP in p 53 transcriptional activation .. 1 Structural structural mechanism of the bromodomain of the coactivator cbp NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 mechanism structural mechanism of the bromodomain of the coactivator cbp NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 3 of structural mechanism of the bromodomain of the coactivator cbp NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 4 the structural mechanism of the bromodomain of the coactivator cbp NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 5 bromodomain structural mechanism of the bromodomain of the coactivator cbp NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 6 of structural mechanism of the bromodomain of the coactivator cbp NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 7 the structural mechanism of the bromodomain of the coactivator cbp NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 8 coactivator structural mechanism of the bromodomain of the coactivator cbp NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 CBP CBP NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 in in ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 p page NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 53 53 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 13 transcriptional transcriptional activation .. NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 14 activation transcriptional activation .. NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 .. transcriptional activation .. NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2633 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2634 # text = Cell 13 , 251 - 263 . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 13 13 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 251 251 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 251 - 263 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 263 263 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2635 # text = Mujtaba , S. , Zeng , L. and Zhou , M. ( 2007 ) . 1 Mujtaba Mujtaba NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 3 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 5 Zeng Zeng NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 7 L. L. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 8 and l. and zhou NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 Zhou Zhou NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 2007 2007 NUM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2636 # text = Structure and acetyl-lysine recognition of the bromodomain .. 1 Structure structure and acetyl-lysine recognition of the bromodomain .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 and structure and acetyl-lysine recognition of the bromodomain .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 3 acetyl-lysine structure and acetyl-lysine recognition of the bromodomain .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 4 recognition structure and acetyl-lysine recognition of the bromodomain .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 of structure and acetyl-lysine recognition of the bromodomain .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 6 the structure and acetyl-lysine recognition of the bromodomain .. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 7 bromodomain structure and acetyl-lysine recognition of the bromodomain .. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 .. structure and acetyl-lysine recognition of the bromodomain .. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2637 # text = Oncogene 26 , 5521 - 5527 . 1 Oncogene oncogene NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 26 26 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 5521 5521 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 5521 - 5527 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 5527 5527 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2638 # text = Murshudov , GN. , Vagin , AA. and Dodson E J ( 1997 ) . 1 Murshudov Murshudov NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 GN. GN. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Vagin Vagin NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 7 AA. AA. NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 8 and aa. and dodson e j NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 9 Dodson Dodson NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 10 E E NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 J J NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 1997 1997 NUM _ _ 11 parenth _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2639 # text = Refinement of 1 Refinement refinement of NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 of refinement of NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2640 # text = Macromolecular Structures by the Maximum-Likelihood Method . 1 Macromolecular macromolecular structures by the maximum-likelihood method NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 Structures Structures NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 by macromolecular structures by the maximum-likelihood method NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 the macromolecular structures by the maximum-likelihood method NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 Maximum-Likelihood Maximum-Likelihood NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 Method Method NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2641 # text = Acta Cryst . 1 Acta Acta NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Cryst Cryst NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2642 # text = D53 , 240 - 255 . 1 D53 D53 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 240 240 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 240 - 255 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 255 255 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2643 # text = Mutskov , V. , Gerber , 1 Mutskov Mutskov NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 V. V. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Gerber Gerber NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2644 # text = D . , Angelov , 1 D d NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Angelov Angelov NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2645 # text = D . , Ausio , J. , Workman , J. and Dimitrov , S. ( 1998 ) . 1 D d NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Ausio Ausio NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 J. J. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Workman Workman NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 10 J. J. NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 11 and j. and dimitrov NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 Dimitrov Dimitrov NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 14 S. S. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 15 ( ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 1998 1998 NUM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 17 ) ) PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2646 # text = Persistent interactions of core histone tails with nucleosomal 1 Persistent persister VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 interactions interaction NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 of off ADV _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 core core NOM _ _ 1 subj _ _ _ _ _ 5 histone histone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 tails tails with nucleosomal NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 with tails with nucleosomal NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 nucleosomal tails with nucleosomal NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2647 # text = DNA following acetylation and transcription factor binding . 1 DNA dna following acetylation and NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 following dna following acetylation and NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 3 acetylation dna following acetylation and NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 and dna following acetylation and NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 transcription transcription NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 factor factor NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 binding binding NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2648 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2649 # text = Cell . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2650 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2651 # text = 18 , 6293 - 6304 . 1 18 18 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 6293 6293 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 6293 - 6304 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 6304 6304 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2652 # text = Nakamura , Y. , Umehara , T. , Nakano , K. , Jang , MK. , Shirouzu , M. , Morita , S. , Uda-Tochio , H. , Hamana , H. , Terada , T. , Adachi , N. , Matsumoto , T. , Tanaka , 1 Nakamura nakamura NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 3 Y. Y. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 5 Umehara Umehara NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 7 T. T. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 9 Nakano Nakano NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 11 K. K. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 13 Jang Jang NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 15 MK. MK. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 17 Shirouzu Shirouzu NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 19 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 21 Morita Morita NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 23 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 25 Uda-Tochio Uda-Tochio NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 27 H. H. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 29 Hamana Hamana NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 30 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 31 H. H. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 32 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 33 Terada Terada NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 34 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 35 T. T. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 36 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 37 Adachi Adachi NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 38 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 39 N. N. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 40 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 41 Matsumoto Matsumoto NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 42 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 43 T. T. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 44 , , PUNC _ _ 45 punc _ _ _ _ _ 45 Tanaka Tanaka NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 46 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2653 # text = A . , Horikoshi , M. , Ozato , K. , Padmanabhan , 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 4 Horikoshi Horikoshi NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 8 Ozato Ozato NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 10 K. K. NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 Padmanabhan Padmanabhan NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2654 # text = B . and Yokoyama , S . 1 B b NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 and and yokoyama NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Yokoyama Yokoyama NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 S S NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2655 # text = ( 2007 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 2007 2007 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2656 # text = Crystal structure of the human BRD2 bromodomain : 1 Crystal crystal structure of the human brd2 bromodomain NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 structure crystal structure of the human brd2 bromodomain NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 3 of crystal structure of the human brd2 bromodomain NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 4 the crystal structure of the human brd2 bromodomain NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 5 human crystal structure of the human brd2 bromodomain NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 6 BRD2 BRD2 NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 bromodomain crystal structure of the human brd2 bromodomain NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 : : PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2657 # text = insights into dimerization and recognition of acetylated histone H4 .. 1 insights insights into dimerization and recognition of acetylated histone h4 .. NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 into insights into dimerization and recognition of acetylated histone h4 .. NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 3 dimerization insights into dimerization and recognition of acetylated histone h4 .. NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 4 and insights into dimerization and recognition of acetylated histone h4 .. NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 recognition insights into dimerization and recognition of acetylated histone h4 .. NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 6 of insights into dimerization and recognition of acetylated histone h4 .. NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 7 acetylated insights into dimerization and recognition of acetylated histone h4 .. NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 8 histone insights into dimerization and recognition of acetylated histone h4 .. NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 9 H4 H4 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 .. insights into dimerization and recognition of acetylated histone h4 .. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2658 # text = J. Biol . 1 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Biol Biol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2659 # text = Chem . 1 Chem Chem NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2660 # text = 282 , 4193 - 4201 . 1 282 282 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 4193 4193 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 4193 - 4201 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 4201 4201 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2661 # text = Navaza , J. ( 1994 ) . . 1 Navaza Navaza NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 1994 1994 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2662 # text = Acta Cryst A50 , 157 - 163 . 1 Acta acter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Cryst Cryst NOM _ _ 1 subj _ _ _ _ _ 3 A50 A50 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 157 157 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 - 157 - 163 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 163 163 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2663 # text = Nielsen , AL. , Oulad-Abdelghani , M. , Ortiz , JA. , Remboutsika , 1 Nielsen nielsen NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 3 AL. AL. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 5 Oulad-Abdelghani Oulad-Abdelghani NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 9 Ortiz Ortiz NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 JA. JA. NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Remboutsika Remboutsika NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2664 # text = E . , Chambon , P. and Losson , R. ( 2001 ) . 1 E e NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Chambon Chambon NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 P. P. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and p. and losson NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Losson Losson NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 R. R. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 2001 2001 NUM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2665 # text = Heterochromatin formation in mammalian cells : 1 Heterochromatin Heterochromatin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 formation formation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 in in ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 mammalian mamma ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 cells cell ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 : : PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2666 # text = interaction between histones and HP1 proteins . 1 interaction interaction between histones and hp1 proteins NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 between interaction between histones and hp1 proteins NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 histones interaction between histones and hp1 proteins NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 and interaction between histones and hp1 proteins NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 HP1 HP1 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 proteins interaction between histones and hp1 proteins NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2667 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2668 # text = Cell 7 , 729 - 739 . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 7 7 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 729 729 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 729 - 739 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 739 739 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2669 # text = Oliva , R. , Bazett-Jones , 1 Oliva oliva NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 R. R. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Bazett-Jones Bazett-Jones NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2670 # text = D . , Mezquita , 1 D d NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Mezquita Mezquita NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2671 # text = C . and Dixon , GH. ( 1987 ) . 1 C c NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 and and dixon NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Dixon Dixon NUM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 GH. GH. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 1987 1987 NUM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2672 # text = Factors affecting nucleosome disassembly by protamines in vitro . 1 Factors factors affecting nucleosome disassembly by protamines in vitro NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 affecting factors affecting nucleosome disassembly by protamines in vitro NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 3 nucleosome factors affecting nucleosome disassembly by protamines in vitro NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 4 disassembly factors affecting nucleosome disassembly by protamines in vitro NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 by factors affecting nucleosome disassembly by protamines in vitro NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 6 protamines factors affecting nucleosome disassembly by protamines in vitro NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 7 in factors affecting nucleosome disassembly by protamines in vitro NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 vitro factors affecting nucleosome disassembly by protamines in vitro NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2673 # text = Histone hyperacetylation and chromatin structure , time dependence , and the size of the sperm nuclear proteins . 1 Histone histone hyperacetylation and chromatin structure NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 hyperacetylation histone hyperacetylation and chromatin structure NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 3 and histone hyperacetylation and chromatin structure NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 chromatin histone hyperacetylation and chromatin structure NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 structure histone hyperacetylation and chromatin structure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 time cime NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 dependence dependence NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 10 and and the size of the sperm nuclear proteins NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 11 the and the size of the sperm nuclear proteins NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 12 size and the size of the sperm nuclear proteins NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 13 of and the size of the sperm nuclear proteins NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 14 the and the size of the sperm nuclear proteins NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 15 sperm and the size of the sperm nuclear proteins NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 nuclear and the size of the sperm nuclear proteins NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 proteins and the size of the sperm nuclear proteins NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2674 # text = J. Biol . 1 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Biol Biol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2675 # text = Chem . 1 Chem Chem NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2676 # text = 262 , 17016 - 17025 . 1 262 262 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 17016 17016 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 17016 - 17025 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 17025 17025 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2677 # text = Ottinger , M. , Christalla , T. , Nathan , K. , Brinkmann , MM. , Viejo-Borbolla , 1 Ottinger ottinger NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 3 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 5 Christalla Christalla NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 7 T. T. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 9 Nathan Nathan NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 11 K. K. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 13 Brinkmann Brinkmann NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 MM. MM. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 Viejo-Borbolla Viejo-Borbolla NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2678 # text = A . and Schulz , TF. ( 2006 ) . 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 and and schulz NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Schulz Schulz NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 TF. TF. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 2006 2006 NUM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2679 # text = Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus LANA- 1 interacts with the short variant of BRD4 and releases cells from a BRD4- and 1 Kaposi's kaposi's sarcoma-associated herpesvirus lana- 1 interacts with the short variant of brd4 and releases cells from a brd4- and NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 2 sarcoma-associated kaposi's sarcoma-associated herpesvirus lana- 1 interacts with the short variant of brd4 and releases cells from a brd4- and NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 3 herpesvirus kaposi's sarcoma-associated herpesvirus lana- 1 interacts with the short variant of brd4 and releases cells from a brd4- and NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 4 LANA- LANA- NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 5 1 1 NUM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 6 interacts kaposi's sarcoma-associated herpesvirus lana- 1 interacts with the short variant of brd4 and releases cells from a brd4- and NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 7 with kaposi's sarcoma-associated herpesvirus lana- 1 interacts with the short variant of brd4 and releases cells from a brd4- and NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 8 the kaposi's sarcoma-associated herpesvirus lana- 1 interacts with the short variant of brd4 and releases cells from a brd4- and NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 9 short kaposi's sarcoma-associated herpesvirus lana- 1 interacts with the short variant of brd4 and releases cells from a brd4- and NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 10 variant kaposi's sarcoma-associated herpesvirus lana- 1 interacts with the short variant of brd4 and releases cells from a brd4- and NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 11 of kaposi's sarcoma-associated herpesvirus lana- 1 interacts with the short variant of brd4 and releases cells from a brd4- and NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 12 BRD4 BRD4 NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 13 and kaposi's sarcoma-associated herpesvirus lana- 1 interacts with the short variant of brd4 and releases cells from a brd4- and NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 14 releases kaposi's sarcoma-associated herpesvirus lana- 1 interacts with the short variant of brd4 and releases cells from a brd4- and NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 15 cells kaposi's sarcoma-associated herpesvirus lana- 1 interacts with the short variant of brd4 and releases cells from a brd4- and NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 16 from kaposi's sarcoma-associated herpesvirus lana- 1 interacts with the short variant of brd4 and releases cells from a brd4- and NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 17 a kaposi's sarcoma-associated herpesvirus lana- 1 interacts with the short variant of brd4 and releases cells from a brd4- and NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 18 BRD4- BRD4- NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 and kaposi's sarcoma-associated herpesvirus lana- 1 interacts with the short variant of brd4 and releases cells from a brd4- and NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2680 # text = BRD 2 / RING 3 -induced G1 cell cycle arrest . 1 BRD BRD NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 2 2 2 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 / sur PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 RING RING NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 3 3 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 -induced indu A+V _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 G1 G1 NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 cell cell ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 cycle cycle NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 arrest arrest NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2681 # text = J. Virol . 1 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Virol Virol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2682 # text = 80 , 10772 - 10786 . 1 80 80 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 10772 10772 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 10772 - 10786 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 10786 10786 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2683 # text = Owen , DJ. , Ornaghi , P. , Yang , JC. , Lowe , N. , Evans , PR. , Ballario , P. , Neuhaus , 1 Owen owen NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 DJ. DJ. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Ornaghi Ornaghi NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 7 P. P. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 9 Yang Yang NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 11 JC. JC. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 13 Lowe Lowe NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 15 N. N. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 17 Evans Evans NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 19 PR. PR. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 21 Ballario Ballario NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 23 P. P. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 Neuhaus Neuhaus NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2684 # text = D . , Filetici , P. and Travers , AA. ( 2000 ) . 1 D d NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Filetici Filetici NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 P. P. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and p. and travers NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Travers Travers NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 AA. AA. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 2000 2000 NUM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2685 # text = The structural basis for the recognition of acetylated histone H4 by the bromodomain of histone acetyltransferase gcn 5p .. 1 The the structural basis for the recognition of acetylated histone h4 by the bromodomain of histone acetyltransferase gcn 5p .. NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 2 structural the structural basis for the recognition of acetylated histone h4 by the bromodomain of histone acetyltransferase gcn 5p .. NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 3 basis the structural basis for the recognition of acetylated histone h4 by the bromodomain of histone acetyltransferase gcn 5p .. NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 4 for the structural basis for the recognition of acetylated histone h4 by the bromodomain of histone acetyltransferase gcn 5p .. NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 5 the the structural basis for the recognition of acetylated histone h4 by the bromodomain of histone acetyltransferase gcn 5p .. NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 6 recognition the structural basis for the recognition of acetylated histone h4 by the bromodomain of histone acetyltransferase gcn 5p .. NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 7 of the structural basis for the recognition of acetylated histone h4 by the bromodomain of histone acetyltransferase gcn 5p .. NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 8 acetylated the structural basis for the recognition of acetylated histone h4 by the bromodomain of histone acetyltransferase gcn 5p .. NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 9 histone the structural basis for the recognition of acetylated histone h4 by the bromodomain of histone acetyltransferase gcn 5p .. NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 10 H4 H4 NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 11 by the structural basis for the recognition of acetylated histone h4 by the bromodomain of histone acetyltransferase gcn 5p .. NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 12 the the structural basis for the recognition of acetylated histone h4 by the bromodomain of histone acetyltransferase gcn 5p .. NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 13 bromodomain the structural basis for the recognition of acetylated histone h4 by the bromodomain of histone acetyltransferase gcn 5p .. NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 14 of the structural basis for the recognition of acetylated histone h4 by the bromodomain of histone acetyltransferase gcn 5p .. NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 15 histone the structural basis for the recognition of acetylated histone h4 by the bromodomain of histone acetyltransferase gcn 5p .. NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 16 acetyltransferase the structural basis for the recognition of acetylated histone h4 by the bromodomain of histone acetyltransferase gcn 5p .. NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 17 gcn the structural basis for the recognition of acetylated histone h4 by the bromodomain of histone acetyltransferase gcn 5p .. NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 18 5p 5p NUM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 .. the structural basis for the recognition of acetylated histone h4 by the bromodomain of histone acetyltransferase gcn 5p .. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2686 # text = EMBO J. 19 , 6141 - 6149 . 1 EMBO embo NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 19 19 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 6141 6141 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 - 6141 - 6149 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 6149 6149 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2687 # text = Paillisson , 1 Paillisson Paillisson NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2688 # text = A . , Levasseur , 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Levasseur Levasseur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2689 # text = A . , Gouret , P. , Callebaut , I. , Bontoux , M. , Pontarotti , P. and Monget , P. ( 2007 ) . 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 4 Gouret Gouret ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 6 P. P. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 8 Callebaut Callebaut NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 10 I. I. NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 12 Bontoux Bontoux NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 14 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 16 Pontarotti Pontarotti NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 18 P. P. NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 19 and p. and monget NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 Monget Monget NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 P. P. NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 23 ( ( PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 24 2007 2007 NUM _ _ 22 parenth _ _ _ _ _ 25 ) ) PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2690 # text = Bromodomain testis-specific protein is expressed in mouse oocyte and evolves faster than its ubiquitously expressed paralogs BRD2 , 1 Bromodomain bromodomain testis-specific protein is expressed NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 testis-specific bromodomain testis-specific protein is expressed NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 3 protein bromodomain testis-specific protein is expressed NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 is bromodomain testis-specific protein is expressed NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 expressed bromodomain testis-specific protein is expressed NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 in in ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 mouse mousse NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 oocyte oocyte NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 and and evolves faster than its ubiquitously expressed paralogs brd2 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 10 evolves and evolves faster than its ubiquitously expressed paralogs brd2 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 11 faster and evolves faster than its ubiquitously expressed paralogs brd2 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 12 than and evolves faster than its ubiquitously expressed paralogs brd2 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 13 its and evolves faster than its ubiquitously expressed paralogs brd2 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 14 ubiquitously and evolves faster than its ubiquitously expressed paralogs brd2 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 15 expressed and evolves faster than its ubiquitously expressed paralogs brd2 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 paralogs and evolves faster than its ubiquitously expressed paralogs brd2 NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 BRD2 BRD2 NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2691 # text = - 3 , and - 4 .. 1 - - PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 2 3 3 NUM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 and and VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 - - 4 PUNC _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 4 4 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 .. ... PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2692 # text = Genomics 89 , 215 - 223 . 1 Genomics Genomics NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 89 89 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 215 215 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 215 - 223 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 223 223 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2693 # text = Park , Y. and Luger , K. ( 2008 ) . 1 Park park NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 Y. Y. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and y. and luger NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Luger Luger NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 K. K. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 2008 2008 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2694 # text = Histone chaperones in nucleosome eviction and histone exchange . 1 Histone histone chaperones in nucleosome eviction and histone exchange NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 chaperones histone chaperones in nucleosome eviction and histone exchange NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 3 in histone chaperones in nucleosome eviction and histone exchange NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 4 nucleosome histone chaperones in nucleosome eviction and histone exchange NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 eviction histone chaperones in nucleosome eviction and histone exchange NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 6 and histone chaperones in nucleosome eviction and histone exchange NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 7 histone histone chaperones in nucleosome eviction and histone exchange NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 exchange histone chaperones in nucleosome eviction and histone exchange NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2695 # text = Curr . 1 Curr Curr NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2696 # text = Opin . 1 Opin Opin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2697 # text = Struct . 1 Struct Struct NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2698 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2699 # text = 18 , 282 - 289 . 1 18 18 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 282 282 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 282 - 289 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 289 289 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2700 # text = Park , Y. , Dyer , PN. , Tremethick , DJ. and Luger , K. ( 2004 ) . 1 Park park NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 Y. Y. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 5 Dyer Dyer NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 PN. PN. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Tremethick Tremethick NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 11 DJ. DJ. NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 12 and dj. and luger NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 Luger Luger NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 15 K. K. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 2004 2004 NUM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2701 # text = A new fluorescence resonance energy transfer approach demonstrates that the histone variant H2AZ stabilizes the histone octamer within the nucleosome . 1 A a new fluorescence resonance energy transfer approach demonstrates that the histone variant h2az stabilizes the histone octamer within the nucleosome NOM _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 2 new a new fluorescence resonance energy transfer approach demonstrates that the histone variant h2az stabilizes the histone octamer within the nucleosome NOM _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 3 fluorescence a new fluorescence resonance energy transfer approach demonstrates that the histone variant h2az stabilizes the histone octamer within the nucleosome NOM _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 4 resonance a new fluorescence resonance energy transfer approach demonstrates that the histone variant h2az stabilizes the histone octamer within the nucleosome NOM _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 5 energy a new fluorescence resonance energy transfer approach demonstrates that the histone variant h2az stabilizes the histone octamer within the nucleosome NOM _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 6 transfer a new fluorescence resonance energy transfer approach demonstrates that the histone variant h2az stabilizes the histone octamer within the nucleosome NOM _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 7 approach a new fluorescence resonance energy transfer approach demonstrates that the histone variant h2az stabilizes the histone octamer within the nucleosome NOM _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 8 demonstrates a new fluorescence resonance energy transfer approach demonstrates that the histone variant h2az stabilizes the histone octamer within the nucleosome NOM _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 9 that a new fluorescence resonance energy transfer approach demonstrates that the histone variant h2az stabilizes the histone octamer within the nucleosome NOM _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 10 the a new fluorescence resonance energy transfer approach demonstrates that the histone variant h2az stabilizes the histone octamer within the nucleosome NOM _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 11 histone a new fluorescence resonance energy transfer approach demonstrates that the histone variant h2az stabilizes the histone octamer within the nucleosome NOM _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 12 variant a new fluorescence resonance energy transfer approach demonstrates that the histone variant h2az stabilizes the histone octamer within the nucleosome NOM _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 13 H2AZ H2AZ NOM _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 14 stabilizes a new fluorescence resonance energy transfer approach demonstrates that the histone variant h2az stabilizes the histone octamer within the nucleosome NOM _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 15 the a new fluorescence resonance energy transfer approach demonstrates that the histone variant h2az stabilizes the histone octamer within the nucleosome NOM _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 16 histone a new fluorescence resonance energy transfer approach demonstrates that the histone variant h2az stabilizes the histone octamer within the nucleosome NOM _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 17 octamer a new fluorescence resonance energy transfer approach demonstrates that the histone variant h2az stabilizes the histone octamer within the nucleosome NOM _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 18 within a new fluorescence resonance energy transfer approach demonstrates that the histone variant h2az stabilizes the histone octamer within the nucleosome NOM _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 19 the a new fluorescence resonance energy transfer approach demonstrates that the histone variant h2az stabilizes the histone octamer within the nucleosome NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 nucleosome a new fluorescence resonance energy transfer approach demonstrates that the histone variant h2az stabilizes the histone octamer within the nucleosome NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2702 # text = J. Biol . 1 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Biol Biol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2703 # text = Chem . 1 Chem Chem NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2704 # text = 279 , 24274 - 24282 . 1 279 279 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 24274 24274 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 24274 - 24282 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 24282 24282 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2705 # text = Peng , J. , Dong , W. , Chen , L. , Zou , T. , Qi , Y. and Liu , Y. ( 2007 ) . 1 Peng peng NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 3 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 5 Dong Dong NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 7 W. W. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 9 Chen Chen NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 11 L. L. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 13 Zou Zou NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 15 T. T. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 Qi Qi NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 19 Y. Y. NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 20 and y. and liu NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 Liu Liu NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 23 Y. Y. NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 24 ( ( PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 2007 2007 NUM _ _ 17 parenth _ _ _ _ _ 26 ) ) PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2706 # text = Brd 2 is a TBP-associated protein and recruits TBP into E2F-1 transcriptional complex in response to serum stimulation . 1 Brd brd 2 is a tbp-associated protein and recruits tbp into e2f-1 transcriptional complex in response to serum stimulation NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 2 2 2 NUM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 3 is brd 2 is a tbp-associated protein and recruits tbp into e2f-1 transcriptional complex in response to serum stimulation NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 4 a brd 2 is a tbp-associated protein and recruits tbp into e2f-1 transcriptional complex in response to serum stimulation NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 5 TBP-associated TBP-associated NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 6 protein brd 2 is a tbp-associated protein and recruits tbp into e2f-1 transcriptional complex in response to serum stimulation NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 7 and brd 2 is a tbp-associated protein and recruits tbp into e2f-1 transcriptional complex in response to serum stimulation NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 8 recruits brd 2 is a tbp-associated protein and recruits tbp into e2f-1 transcriptional complex in response to serum stimulation NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 9 TBP TBP NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 10 into brd 2 is a tbp-associated protein and recruits tbp into e2f-1 transcriptional complex in response to serum stimulation NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 11 E2F-1 E2F-1 NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 12 transcriptional brd 2 is a tbp-associated protein and recruits tbp into e2f-1 transcriptional complex in response to serum stimulation NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 13 complex brd 2 is a tbp-associated protein and recruits tbp into e2f-1 transcriptional complex in response to serum stimulation NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 14 in brd 2 is a tbp-associated protein and recruits tbp into e2f-1 transcriptional complex in response to serum stimulation NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 15 response brd 2 is a tbp-associated protein and recruits tbp into e2f-1 transcriptional complex in response to serum stimulation NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 16 to brd 2 is a tbp-associated protein and recruits tbp into e2f-1 transcriptional complex in response to serum stimulation NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 17 serum brd 2 is a tbp-associated protein and recruits tbp into e2f-1 transcriptional complex in response to serum stimulation NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 stimulation brd 2 is a tbp-associated protein and recruits tbp into e2f-1 transcriptional complex in response to serum stimulation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2707 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2708 # text = Cell . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2709 # text = Biochem . 1 Biochem Biochem NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2710 # text = 294 , 1 294 294 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2711 # text = 45 - 54 . 1 45 45 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 - 45 - 54 . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 54 54 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 . 45 - 54 . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2712 # text = Pennings , S. , Meersseman , G. and Bradbury , EM. ( 1994 ) . 1 Pennings Pennings NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Meersseman Meersseman NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 G. G. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 8 and g. and bradbury NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 Bradbury Bradbury NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 EM. EM. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 1994 1994 NUM _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2713 # text = Linker histones H1 and H5 prevent the mobility of positioned nucleosomes . 1 Linker linker histones h1 and h5 prevent the mobility of positioned nucleosomes NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 histones linker histones h1 and h5 prevent the mobility of positioned nucleosomes NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 3 H1 H1 NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 4 and linker histones h1 and h5 prevent the mobility of positioned nucleosomes NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 5 H5 H5 NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 6 prevent linker histones h1 and h5 prevent the mobility of positioned nucleosomes NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 7 the linker histones h1 and h5 prevent the mobility of positioned nucleosomes NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 8 mobility linker histones h1 and h5 prevent the mobility of positioned nucleosomes NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 9 of linker histones h1 and h5 prevent the mobility of positioned nucleosomes NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 10 positioned linker histones h1 and h5 prevent the mobility of positioned nucleosomes NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 nucleosomes linker histones h1 and h5 prevent the mobility of positioned nucleosomes NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2714 # text = Proc . 1 Proc Proc NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2715 # text = Natl . 1 Natl Natl NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2716 # text = Acad . 1 Acad Acad NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2717 # text = Sci . 1 Sci Sci NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2718 # text = U.S.A . 91 , 10275 - 10279 . 1 U.S.A u.s.a NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 91 91 NUM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 10275 10275 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 - 10275 - 10279 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 10279 10279 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2719 # text = Perry , CA. and Annunziato , AT. ( 1989 ) . 1 Perry perry NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 CA. CA. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and ca. and annunziato NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Annunziato Annunziato NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 AT. AT. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 1989 1989 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2720 # text = Influence of histone acetylation on the solubility , H1 content and DNase I sensitivity of newly assembled chromatin . 1 Influence influence of histone acetylation on the solubility NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 of influence of histone acetylation on the solubility NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 3 histone influence of histone acetylation on the solubility NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 4 acetylation influence of histone acetylation on the solubility NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 5 on influence of histone acetylation on the solubility NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 6 the influence of histone acetylation on the solubility NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 solubility influence of histone acetylation on the solubility NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 9 H1 H1 NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 10 content h1 content and dnase i sensitivity of newly assembled chromatin NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 11 and h1 content and dnase i sensitivity of newly assembled chromatin NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 12 DNase DNase NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 13 I I NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 14 sensitivity h1 content and dnase i sensitivity of newly assembled chromatin NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 15 of h1 content and dnase i sensitivity of newly assembled chromatin NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 16 newly h1 content and dnase i sensitivity of newly assembled chromatin NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 17 assembled h1 content and dnase i sensitivity of newly assembled chromatin NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 chromatin h1 content and dnase i sensitivity of newly assembled chromatin NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2721 # text = Nucleic Acids Res . 1 Nucleic Nucleic NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Acids Acids NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 Res Res NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2722 # text = 17 , 4275 - 4291 . 1 17 17 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 4275 4275 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 4275 - 4291 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 4291 4291 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2723 # text = Pierce , MM. , Raman , CS. and Nall , BT. ( 1999 ) . 1 Pierce pierce NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 MM. MM. _ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Raman Raman NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 CS. CS. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 8 and cs. and nall NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 Nall Nall NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 BT. BT. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 1999 1999 NUM _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2724 # text = Isothermal titration calorimetry of protein-protein interactions . 1 Isothermal isothermal titration calorimetry of protein-protein interactions NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 titration isothermal titration calorimetry of protein-protein interactions NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 calorimetry isothermal titration calorimetry of protein-protein interactions NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 of isothermal titration calorimetry of protein-protein interactions NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 protein-protein isothermal titration calorimetry of protein-protein interactions NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 interactions isothermal titration calorimetry of protein-protein interactions NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2725 # text = Methods 19 , 213 - 221 . 1 Methods Methods NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 19 19 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 213 213 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 213 - 221 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 221 221 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2726 # text = Pivot-Pajot , 1 Pivot-Pajot Pivot-Pajot NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2727 # text = C . , Caron , 1 C c NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Caron Caron NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2728 # text = C . , Govin , J. , Vion , 1 C c NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Govin Govin NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 Vion Vion NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2729 # text = A . , Rousseaux , S. and 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Rousseaux Rousseaux NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 6 S. S. NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 and s. and NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2730 # text = Khochbin , S. ( 2003 ) . 1 Khochbin Khochbin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2003 2003 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2731 # text = Acetylation-dependent chromatin reorganization by BRDT , a testis-specific bromodomain-containing protein .. 1 Acetylation-dependent Acetylation-dependent NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 chromatin chromatin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 reorganization reorganization NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 by by NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 BRDT BRDT NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 7 a a testis-specific bromodomain-containing protein .. NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 8 testis-specific a testis-specific bromodomain-containing protein .. NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 9 bromodomain-containing a testis-specific bromodomain-containing protein .. NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 10 protein a testis-specific bromodomain-containing protein .. NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 .. a testis-specific bromodomain-containing protein .. NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2732 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2733 # text = Cell . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2734 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2735 # text = 23 , 5354 - 5365 . 1 23 23 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 5354 5354 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 5354 - 5365 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 5365 5365 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2736 # text = Platt , GM. , Simpson , GR. , Mittnacht , S. and Schulz , TF. ( 1999 ) . 1 Platt Platt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 GM. GM. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 5 Simpson Simpson NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 GR. GR. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Mittnacht Mittnacht NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 11 S. S. NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 12 and s. and schulz NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 Schulz Schulz NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 15 TF. TF. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 1999 1999 NUM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2737 # text = Latent nuclear antigen of Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus interacts with 1 Latent latent ADJ _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 nuclear nucléaire ADJ _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 3 antigen anti- ADJ _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 4 of of kaposi's sarcoma-associated herpesvirus interacts with NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 5 Kaposi's Kaposi's NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 6 sarcoma-associated of kaposi's sarcoma-associated herpesvirus interacts with NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 7 herpesvirus of kaposi's sarcoma-associated herpesvirus interacts with NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 8 interacts of kaposi's sarcoma-associated herpesvirus interacts with NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 with of kaposi's sarcoma-associated herpesvirus interacts with NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2738 # text = RING3 , a homolog of the Drosophila female sterile homeotic ( fsh ) gene . 1 RING3 RING3 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ 3 a a homolog of the drosophila female sterile homeotic ( fsh ) gene NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 4 homolog a homolog of the drosophila female sterile homeotic ( fsh ) gene NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 5 of a homolog of the drosophila female sterile homeotic ( fsh ) gene NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 6 the a homolog of the drosophila female sterile homeotic ( fsh ) gene NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 7 Drosophila Drosophila NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 8 female a homolog of the drosophila female sterile homeotic ( fsh ) gene NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 9 sterile a homolog of the drosophila female sterile homeotic ( fsh ) gene NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 10 homeotic a homolog of the drosophila female sterile homeotic ( fsh ) gene NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 11 ( a homolog of the drosophila female sterile homeotic ( fsh ) gene PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 fsh a homolog of the drosophila female sterile homeotic ( fsh ) gene NOM _ _ 14 parenth _ _ _ _ _ 13 ) a homolog of the drosophila female sterile homeotic ( fsh ) gene PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 gene a homolog of the drosophila female sterile homeotic ( fsh ) gene NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2739 # text = J . 1 J J NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2740 # text = Virol . 1 Virol Virol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2741 # text = 73 , 9789 - 9795 . 1 73 73 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 9789 9789 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 9789 - 9795 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 9795 9795 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2742 # text = Polach , KJ. , Lowary , PT. and Widom , J. ( 2000 ) . 1 Polach Polach NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 KJ. KJ. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Lowary Lowary NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 PT. PT. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 8 and pt. and widom NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 Widom Widom NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 J. J. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 2000 2000 NUM _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2743 # text = Effects of core histone tail domains on the equilibrium constants for dynamic DNA site accessibility in nucleosomes . 1 Effects effects of core histone tail domains on the equilibrium constants for dynamic dna site accessibility in nucleosomes NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 2 of effects of core histone tail domains on the equilibrium constants for dynamic dna site accessibility in nucleosomes NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 3 core effects of core histone tail domains on the equilibrium constants for dynamic dna site accessibility in nucleosomes NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 4 histone effects of core histone tail domains on the equilibrium constants for dynamic dna site accessibility in nucleosomes NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 5 tail effects of core histone tail domains on the equilibrium constants for dynamic dna site accessibility in nucleosomes NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 6 domains effects of core histone tail domains on the equilibrium constants for dynamic dna site accessibility in nucleosomes NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 7 on effects of core histone tail domains on the equilibrium constants for dynamic dna site accessibility in nucleosomes NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 8 the effects of core histone tail domains on the equilibrium constants for dynamic dna site accessibility in nucleosomes NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 9 equilibrium effects of core histone tail domains on the equilibrium constants for dynamic dna site accessibility in nucleosomes NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 10 constants effects of core histone tail domains on the equilibrium constants for dynamic dna site accessibility in nucleosomes NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 11 for effects of core histone tail domains on the equilibrium constants for dynamic dna site accessibility in nucleosomes NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 12 dynamic effects of core histone tail domains on the equilibrium constants for dynamic dna site accessibility in nucleosomes NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 13 DNA DNA NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 14 site effects of core histone tail domains on the equilibrium constants for dynamic dna site accessibility in nucleosomes NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 15 accessibility effects of core histone tail domains on the equilibrium constants for dynamic dna site accessibility in nucleosomes NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 16 in effects of core histone tail domains on the equilibrium constants for dynamic dna site accessibility in nucleosomes NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 nucleosomes effects of core histone tail domains on the equilibrium constants for dynamic dna site accessibility in nucleosomes NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2744 # text = J. Mol . 1 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Mol Mol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2745 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2746 # text = 298 , 211 - 223 . 1 298 298 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 211 211 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 211 - 223 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 223 223 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2747 # text = Rajashankar , KR. and Ramakumar , S. ( 1996 ) . 1 Rajashankar Rajashankar NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 KR. KR. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and kr. and ramakumar NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Ramakumar Ramakumar NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 1996 1996 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2748 # text = Pi-turns in proteins and peptides : 1 Pi-turns pi ADJ _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 in in ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 proteins pro- VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 and and ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 peptides peptide NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 : : PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2749 # text = Classification , conformation , occurrence , hydration and sequence . 1 Classification classification NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 conformation conformation NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 occurrence occurrence NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 hydration hydration and sequence NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 8 and hydration and sequence NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 sequence hydration and sequence NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2750 # text = Protein Sci . 1 Protein Protein NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Sci Sci NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2751 # text = 5 , 932 - 946 . 1 5 5 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 932 932 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 932 - 946 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 946 946 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2752 # text = Redon , 1 Redon redon NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2753 # text = C . , Pilch , 1 C c NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Pilch Pilch NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2754 # text = D . , Rogakou , 1 D d NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Rogakou Rogakou NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2755 # text = E . , Sedelnikova , O. , Newrock , K. and 1 E e NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Sedelnikova Sedelnikova NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 O. O. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Newrock Newrock NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 10 K. K. NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 and k. and NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2756 # text = Bonner , W. ( 2002 ) . 1 Bonner Bonner NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 W. W. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2002 2002 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2757 # text = Histone H2A variants H2AX and H2AZ . 1 Histone histone h2a variants h2ax and h2az NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 H2A H2A NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 variants histone h2a variants h2ax and h2az NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 H2AX H2AX NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 and histone h2a variants h2ax and h2az NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 H2AZ H2AZ NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2758 # text = Curr . 1 Curr Curr NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2759 # text = Opin . 1 Opin Opin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2760 # text = Genet . 1 Genet genet NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2761 # text = Dev . 1 Dev Dev NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2762 # text = 12 , 162 - 169 . 1 12 12 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 162 162 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 162 - 169 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 169 169 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2763 # text = Robinson , PJJ . 1 Robinson robinson NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 PJJ PJJ NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2764 # text = and Rhodes , 1 and and rhodes NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 Rhodes Rhodes NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2765 # text = D . ( 2006 ) . 1 D d NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 2006 2006 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2766 # text = Structure of the '30 nm'chromatin fibre : a key role for the linker histone . Curr . Opin . Struct . Biol . 16 , 336 - 343 . 1 Structure structure of the NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 of structure of the NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 the structure of the NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 ' ' PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 5 30 30 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 6 nm'chromatin nm'chromatin ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 fibre fibre NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 : : PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 a avoir VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 10 key hey INT _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 role rôle NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 for for the linker histone NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 13 the for the linker histone NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 14 linker for the linker histone NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 histone for the linker histone NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 17 Curr Curr NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 19 Opin Opin NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 21 Struct Struct NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 23 Biol Biol NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 25 16 16 NUM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 336 336 NUM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 28 - 336 - 343 PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 29 343 343 NUM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2767 # text = Robinson , PJJ . , Fairall , L. , Huynh , VAT . 1 Robinson robinson NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 3 PJJ PJJ NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 6 Fairall Fairall NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 8 L. L. NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 10 Huynh Huynh NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 VAT VAT NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2768 # text = and Rhodes , 1 and and rhodes NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 Rhodes Rhodes NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2769 # text = D . ( 2006 ) . 1 D d NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 2006 2006 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2770 # text = EM measurements define the dimensions of the " 30- nm " chromatin fiber : 1 EM em measurements define the dimensions of the NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 measurements em measurements define the dimensions of the NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 3 define em measurements define the dimensions of the NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 4 the em measurements define the dimensions of the NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 5 dimensions em measurements define the dimensions of the NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 6 of em measurements define the dimensions of the NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 the em measurements define the dimensions of the NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 " " PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 9 30- 30- NUM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 nm minute NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 " " PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ 12 chromatin chromatine NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 fiber fibre NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 : : PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2771 # text = evidence for a compact , interdigitated structure . 1 evidence evidence for NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 for evidence for NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 compact compact ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 6 interdigitated interdigital ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 structure structure NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2772 # text = Proc . 1 Proc Proc NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2773 # text = Natl . 1 Natl Natl NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2774 # text = Acad . 1 Acad Acad NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2775 # text = Sci . 1 Sci Sci NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2776 # text = U.S.A . 103 , 6506 - 6511 . 1 U.S.A u.s.a NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 103 103 NUM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 6506 6506 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 - 6506 - 6511 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 6511 6511 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2777 # text = Sachchidanand , Resnick-Silverman , L. , Yan , S. , Mutjaba , S. , Liu , W. , Zeng , L. , Manfredi , JJ. and Zhou , M. ( 2006 ) . 1 Sachchidanand Sachchidanand NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 3 Resnick-Silverman Resnick-Silverman NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 5 L. L. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 7 Yan Yan NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 9 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 11 Mutjaba Mutjaba NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 13 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 15 Liu Liu NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 17 W. W. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 19 Zeng Zeng NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 21 L. L. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 23 Manfredi Manfredi NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 25 JJ. JJ. NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 26 and jj. and zhou NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 27 Zhou Zhou NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 29 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 30 ( ( PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 31 2006 2006 NUM _ _ 29 parenth _ _ _ _ _ 32 ) ) PUNC _ _ 31 punc _ _ _ _ _ 33 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2778 # text = Target structure-based of small molecules that block human p 53 and CREB binding protein association . 1 Target target NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 structure-based structure-based ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 of of small molecules that NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 small of small molecules that NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 molecules of small molecules that NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 that of small molecules that NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 block blocks NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 human humer VPR _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 p page NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 53 53 NUM _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 11 and and creb binding protein association NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 12 CREB CREB NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 13 binding and creb binding protein association NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 14 protein and creb binding protein association NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 association and creb binding protein association NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2779 # text = Chem . 1 Chem Chem NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2780 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2781 # text = 13 , 1 13 13 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2782 # text = 81 - 90 . 1 81 81 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 - 81 - 90 . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 90 90 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 . 81 - 90 . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2783 # text = Santisteban , MS. , Kalashnikova , T. and Smith , MM. ( 2000 ) . 1 Santisteban santisteban NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 MS. MS. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Kalashnikova Kalashnikova NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 7 T. T. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 8 and t. and smith NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 Smith Smith NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 MM. MM. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 2000 2000 NUM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2784 # text = Histone H2A.Z regulats transcription and is partially redundant with nucleosome remodeling complexes . 1 Histone histone h2a.z regulats transcription and is partially redundant with nucleosome remodeling complexes NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 H2A.Z H2A.Z NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 3 regulats histone h2a.z regulats transcription and is partially redundant with nucleosome remodeling complexes NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 4 transcription histone h2a.z regulats transcription and is partially redundant with nucleosome remodeling complexes NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 5 and histone h2a.z regulats transcription and is partially redundant with nucleosome remodeling complexes NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 6 is histone h2a.z regulats transcription and is partially redundant with nucleosome remodeling complexes NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 7 partially histone h2a.z regulats transcription and is partially redundant with nucleosome remodeling complexes NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 8 redundant histone h2a.z regulats transcription and is partially redundant with nucleosome remodeling complexes NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 9 with histone h2a.z regulats transcription and is partially redundant with nucleosome remodeling complexes NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 10 nucleosome histone h2a.z regulats transcription and is partially redundant with nucleosome remodeling complexes NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 11 remodeling histone h2a.z regulats transcription and is partially redundant with nucleosome remodeling complexes NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 complexes histone h2a.z regulats transcription and is partially redundant with nucleosome remodeling complexes NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2785 # text = Cell 103 , 411 - 422 . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 103 103 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 411 411 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 411 - 422 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 422 422 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2786 # text = Schalch , T. , Duda , S. , Sargent , DF. and Richmond , TJ. ( 2005 ) . 1 Schalch Schalch NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 T. T. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 5 Duda Duda NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Sargent Sargent NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 11 DF. DF. NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 12 and df. and richmond NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 Richmond Richmond NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 15 TJ. TJ. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 2005 2005 NUM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2787 # text = X -ray structure of a tetranucleosome and its implications for the chromatin fibre . 1 X x ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 -ray ray NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 structure structure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 of of a tetranucleosome and its implications for the chromatin fibre NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 5 a of a tetranucleosome and its implications for the chromatin fibre NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 6 tetranucleosome of a tetranucleosome and its implications for the chromatin fibre NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 7 and of a tetranucleosome and its implications for the chromatin fibre NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 8 its of a tetranucleosome and its implications for the chromatin fibre NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 9 implications of a tetranucleosome and its implications for the chromatin fibre NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 10 for of a tetranucleosome and its implications for the chromatin fibre NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 11 the of a tetranucleosome and its implications for the chromatin fibre NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 12 chromatin of a tetranucleosome and its implications for the chromatin fibre NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 fibre of a tetranucleosome and its implications for the chromatin fibre NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2788 # text = Nature 436 , 138 - 141 . 1 Nature nature NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 436 436 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 138 138 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 138 - 141 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 141 141 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2789 # text = Shang , 1 Shang Shang NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2790 # text = E . , Nickerson , HD. , Wen , 1 E e NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Nickerson Nickerson NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 HD. HD. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Wen Wen NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2791 # text = D . , Wang , X . 1 D d NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Wang Wang NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 X X ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2792 # text = and Wolgemuth , DJ. ( 2007 ) . 1 and and wolgemuth NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 Wolgemuth Wolgemuth NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 DJ. DJ. NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 ( ( PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2007 2007 NUM _ _ 4 parenth _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2793 # text = The first bromodomain of Brdt , a testis-specific member of the BET sub-family of double-bromodomain-containing proteins , is essential for male germ cell differentiation .. 1 The the first bromodomain of brdt NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 first the first bromodomain of brdt NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 3 bromodomain the first bromodomain of brdt NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 of the first bromodomain of brdt NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Brdt Brdt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 7 a a testis-specific member of the bet sub-family of double-bromodomain-containing proteins NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 8 testis-specific a testis-specific member of the bet sub-family of double-bromodomain-containing proteins NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 9 member a testis-specific member of the bet sub-family of double-bromodomain-containing proteins NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 10 of a testis-specific member of the bet sub-family of double-bromodomain-containing proteins NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 11 the a testis-specific member of the bet sub-family of double-bromodomain-containing proteins NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 12 BET BET NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 13 sub-family a testis-specific member of the bet sub-family of double-bromodomain-containing proteins NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 14 of a testis-specific member of the bet sub-family of double-bromodomain-containing proteins NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 15 double-bromodomain-containing a testis-specific member of the bet sub-family of double-bromodomain-containing proteins NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 proteins a testis-specific member of the bet sub-family of double-bromodomain-containing proteins NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 18 is is essential for male germ cell differentiation .. NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 19 essential is essential for male germ cell differentiation .. NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 20 for is essential for male germ cell differentiation .. NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 21 male is essential for male germ cell differentiation .. NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 22 germ is essential for male germ cell differentiation .. NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 23 cell is essential for male germ cell differentiation .. NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 24 differentiation is essential for male germ cell differentiation .. NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 .. is essential for male germ cell differentiation .. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2794 # text = Development 134 , 3507 - 3515 . 1 Development development NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 134 134 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 3507 3507 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 3507 - 3515 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 3515 3515 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2795 # text = Shang , 1 Shang Shang NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2796 # text = E . , Salazar , G. , Crowley , TE. , Wang , X. , Lopez , RA. , Wang , X . 1 E e NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Salazar Salazar NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 G. G. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Crowley Crowley NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 TE. TE. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 12 Wang Wang NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 14 X. X. NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 16 Lopez Lopez NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 18 RA. RA. NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 Wang Wang NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 X X ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2797 # text = and 1 and and ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2798 # text = Wolgemuth , DJ. ( 2004 ) . 1 Wolgemuth Wolgemuth NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 DJ. DJ. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2004 2004 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2799 # text = Identification of unique , differentiation stage-specific patterns of expression of the bromodomain-containing genes 1 Identification identification of unique NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 of identification of unique NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 unique identification of unique NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 5 differentiation differentiation stage-specific patterns of expression of the bromodomain-containing genes NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 6 stage-specific differentiation stage-specific patterns of expression of the bromodomain-containing genes NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 7 patterns differentiation stage-specific patterns of expression of the bromodomain-containing genes NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 8 of differentiation stage-specific patterns of expression of the bromodomain-containing genes NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 9 expression differentiation stage-specific patterns of expression of the bromodomain-containing genes NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 10 of differentiation stage-specific patterns of expression of the bromodomain-containing genes NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 11 the differentiation stage-specific patterns of expression of the bromodomain-containing genes NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 12 bromodomain-containing differentiation stage-specific patterns of expression of the bromodomain-containing genes NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 genes differentiation stage-specific patterns of expression of the bromodomain-containing genes NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2800 # text = Brd 2 , Brd 3 , Brd 4 , and Brdt in the mouse testis .. 1 Brd Brd NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 2 2 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 4 Brd Brd NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 3 3 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 Brd Brd NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 4 4 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 10 and and brdt in the mouse testis .. NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 11 Brdt Brdt NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 12 in and brdt in the mouse testis .. NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 13 the and brdt in the mouse testis .. NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 14 mouse and brdt in the mouse testis .. NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 15 testis and brdt in the mouse testis .. NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 .. and brdt in the mouse testis .. NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2801 # text = Gene Expr . 1 Gene gêner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Expr Expr NOM _ _ 1 subj _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2802 # text = Patterns 4 , 513 - 519 . 1 Patterns pattern NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 513 513 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 513 - 519 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 519 519 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2803 # text = Shirley , CR. , Hayashi , S. , Mounsey , S. , Yanagimachi , R. and Meistrich , ML . 1 Shirley shirley NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 3 CR. CR. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 5 Hayashi Hayashi NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 9 Mounsey Mounsey NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 11 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 13 Yanagimachi Yanagimachi NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 15 R. R. NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 and r. and meistrich NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 Meistrich Meistrich NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 ML ML NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2804 # text = ( 2004 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 2004 2004 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2805 # text = Abnormalities and reduced reproductive potential of sperm from Tnp 1 - and Tnp 2 -null double mutant mice . 1 Abnormalities abnormalities and reduced reproductive potential of sperm from tnp 1 - and tnp 2 -null NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 2 and abnormalities and reduced reproductive potential of sperm from tnp 1 - and tnp 2 -null NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 3 reduced abnormalities and reduced reproductive potential of sperm from tnp 1 - and tnp 2 -null NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 4 reproductive abnormalities and reduced reproductive potential of sperm from tnp 1 - and tnp 2 -null NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 5 potential abnormalities and reduced reproductive potential of sperm from tnp 1 - and tnp 2 -null NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 6 of abnormalities and reduced reproductive potential of sperm from tnp 1 - and tnp 2 -null NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 7 sperm abnormalities and reduced reproductive potential of sperm from tnp 1 - and tnp 2 -null NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 8 from abnormalities and reduced reproductive potential of sperm from tnp 1 - and tnp 2 -null NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 9 Tnp Tnp NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 10 1 1 NUM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 11 - abnormalities and reduced reproductive potential of sperm from tnp 1 - and tnp 2 -null PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 12 and abnormalities and reduced reproductive potential of sperm from tnp 1 - and tnp 2 -null NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 13 Tnp Tnp NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 14 2 2 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 -null abnormalities and reduced reproductive potential of sperm from tnp 1 - and tnp 2 -null NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 double double ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 17 mutant mutant ADJ _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 mice miche NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2806 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2807 # text = Reprod . 1 Reprod Re NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2808 # text = 71 , 1220 - 1229 . 1 71 71 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 1220 1220 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 1220 - 1229 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 1229 1229 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2809 # text = Shogren-Knaak , M. , Ishii , H. , Sun , J. , Pazin , MJ. , Davie , JR. and 1 Shogren-Knaak Shogren-Knaak NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 Ishii Ishii NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 7 H. H. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 9 Sun Sun NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 11 J. J. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 13 Pazin Pazin NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 15 MJ. MJ. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 17 Davie Davie NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 19 JR. JR. NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 and jr. and NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2810 # text = Peterson , CL. ( 2006 ) . 1 Peterson peterson NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 CL. CL. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2006 2006 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2811 # text = Histone H4-K16 acetylation controls chromatin structure and protein interactions . 1 Histone histone h4-k16 acetylation controls chromatin structure and protein interactions NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 H4-K16 H4-K16 NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 3 acetylation histone h4-k16 acetylation controls chromatin structure and protein interactions NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 4 controls histone h4-k16 acetylation controls chromatin structure and protein interactions NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 5 chromatin histone h4-k16 acetylation controls chromatin structure and protein interactions NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 6 structure histone h4-k16 acetylation controls chromatin structure and protein interactions NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 7 and histone h4-k16 acetylation controls chromatin structure and protein interactions NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 8 protein histone h4-k16 acetylation controls chromatin structure and protein interactions NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 interactions histone h4-k16 acetylation controls chromatin structure and protein interactions NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2812 # text = Science 311 , 844 - 847 . 1 Science science NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 311 311 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 844 844 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 844 - 847 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 847 847 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2813 # text = Singleton , S. , Mudrak , O. , Morshedi , M. , Oehninger , S. , Zalenskaya , I. and 1 Singleton singleton NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 3 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 5 Mudrak Mudrak NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 7 O. O. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 9 Morshedi Morshedi NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 13 Oehninger Oehninger NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 15 S. S. NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 17 Zalenskaya Zalenskaya NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 19 I. I. NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 and i. and NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2814 # text = Zalensky , 1 Zalensky Zalensky NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2815 # text = A . ( 2007 ) . 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 2007 2007 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2816 # text = Characterisation of a human sperm cell subpopulation marked by the presence of the TSH2B histone . 1 Characterisation characterisation of NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 of characterisation of NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 human humer VPR _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 sperm sperme NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 cell cell ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 subpopulation subpopulation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 marked marked by the presence of the tsh2b histone NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 9 by marked by the presence of the tsh2b histone NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 10 the marked by the presence of the tsh2b histone NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 11 presence marked by the presence of the tsh2b histone NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 12 of marked by the presence of the tsh2b histone NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 13 the marked by the presence of the tsh2b histone NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 14 TSH2B TSH2B NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 histone marked by the presence of the tsh2b histone NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2817 # text = Reprod . 1 Reprod Re NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2818 # text = Fertil . 1 Fertil Fertil NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2819 # text = Dev . 1 Dev Dev NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2820 # text = 19 , 392 - 397 . 1 19 19 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 392 392 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 392 - 397 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 397 397 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2821 # text = Smith , CL. and Peterson , CL. ( 2005 ) . 1 Smith smith NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 CL. CL. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and cl. and peterson NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Peterson Peterson NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 CL. CL. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 2005 2005 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2822 # text = ATP-dependent chromatin remodeling . 1 ATP-dependent ATP-dependent NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 chromatin chromatin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 remodeling re- NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2823 # text = Curr . 1 Curr Curr NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2824 # text = Top . 1 Top top NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2825 # text = Dev . 1 Dev Dev NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2826 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2827 # text = 65 , 115 - 148 . 1 65 65 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 115 115 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 115 - 148 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 148 148 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2828 # text = Springhetti , EM. , Istomina , NE. , Whisstock , JC. , Nikitina , T. , Woodcock , CL. and Grigoryev , SA. ( 2003 ) . 1 Springhetti Springhetti NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 3 EM. EM. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 5 Istomina Istomina NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 7 NE. NE. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 9 Whisstock Whisstock NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 11 JC. JC. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 13 Nikitina Nikitina NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 15 T. T. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 17 Woodcock Woodcock NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 19 CL. CL. NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 20 and cl. and grigoryev NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 Grigoryev Grigoryev NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 23 SA. SA. NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 24 ( ( PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 2003 2003 NUM _ _ 11 parenth _ _ _ _ _ 26 ) ) PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2829 # text = Role of the M-loop and reactive center loop domains in the folding and bridging of nucleosome arrays by MENT . 1 Role role of the m-loop and reactive center loop domains in the folding and bridging of nucleosome arrays by ment NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 2 of role of the m-loop and reactive center loop domains in the folding and bridging of nucleosome arrays by ment NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 3 the role of the m-loop and reactive center loop domains in the folding and bridging of nucleosome arrays by ment NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 4 M-loop M-loop NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 5 and role of the m-loop and reactive center loop domains in the folding and bridging of nucleosome arrays by ment NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 6 reactive role of the m-loop and reactive center loop domains in the folding and bridging of nucleosome arrays by ment NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 7 center role of the m-loop and reactive center loop domains in the folding and bridging of nucleosome arrays by ment NUM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 8 loop role of the m-loop and reactive center loop domains in the folding and bridging of nucleosome arrays by ment NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 9 domains role of the m-loop and reactive center loop domains in the folding and bridging of nucleosome arrays by ment NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 10 in role of the m-loop and reactive center loop domains in the folding and bridging of nucleosome arrays by ment NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 11 the role of the m-loop and reactive center loop domains in the folding and bridging of nucleosome arrays by ment NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 12 folding role of the m-loop and reactive center loop domains in the folding and bridging of nucleosome arrays by ment NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 13 and role of the m-loop and reactive center loop domains in the folding and bridging of nucleosome arrays by ment NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 14 bridging role of the m-loop and reactive center loop domains in the folding and bridging of nucleosome arrays by ment NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 15 of role of the m-loop and reactive center loop domains in the folding and bridging of nucleosome arrays by ment NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 16 nucleosome role of the m-loop and reactive center loop domains in the folding and bridging of nucleosome arrays by ment NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 17 arrays role of the m-loop and reactive center loop domains in the folding and bridging of nucleosome arrays by ment NOM _ _ 19 periph _ _ _ _ _ 18 by role of the m-loop and reactive center loop domains in the folding and bridging of nucleosome arrays by ment NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 MENT MENT NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2830 # text = J. Biol . 1 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Biol Biol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2831 # text = Chem . 1 Chem Chem NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2832 # text = 278 , 43384 - 43393 . 1 278 278 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 43384 43384 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 43384 - 43393 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 43393 43393 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2833 # text = Steger , K. , Klonisch , T. , Gavenis , K. , Drabent , 1 Steger steger NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 K. K. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Klonisch Klonisch NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 T. T. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 9 Gavenis Gavenis NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 K. K. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Drabent Drabent NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2834 # text = B . , Doenecke , 1 B b NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Doenecke Doenecke NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2835 # text = D . and 1 D d NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 and and ADV _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2836 # text = Bergmann , M. ( 1998 ) . 1 Bergmann Bergmann NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 1998 1998 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2837 # text = Expression of mRNA and protein of nucleoproteins during human spermiogenesis . 1 Expression expression of mrna and protein of nucleoproteins during human spermiogenesis NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 of expression of mrna and protein of nucleoproteins during human spermiogenesis NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 3 mRNA expression of mrna and protein of nucleoproteins during human spermiogenesis NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 4 and expression of mrna and protein of nucleoproteins during human spermiogenesis NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 protein expression of mrna and protein of nucleoproteins during human spermiogenesis NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 6 of expression of mrna and protein of nucleoproteins during human spermiogenesis NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 7 nucleoproteins expression of mrna and protein of nucleoproteins during human spermiogenesis NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 8 during expression of mrna and protein of nucleoproteins during human spermiogenesis NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 9 human expression of mrna and protein of nucleoproteins during human spermiogenesis NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 spermiogenesis expression of mrna and protein of nucleoproteins during human spermiogenesis NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2838 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2839 # text = Hum . 1 Hum hum NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2840 # text = Reprod . 1 Reprod Re NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2841 # text = 4 , 939 - 945 . 1 4 4 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 939 939 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 939 - 945 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 945 945 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2842 # text = Sterner , DE. and Berger , SL. ( 2000 ) . 1 Sterner Sterner NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 DE. DE. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and de. and berger NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Berger Berger NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 SL. SL. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 2000 2000 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2843 # text = Acetylation of histones and transcription-related factors . 1 Acetylation acetylation of histones and transcription-related factors NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 of acetylation of histones and transcription-related factors NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 histones acetylation of histones and transcription-related factors NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 and acetylation of histones and transcription-related factors NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 transcription-related acetylation of histones and transcription-related factors NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 factors acetylation of histones and transcription-related factors NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2844 # text = Microbiol . 1 Microbiol microbiol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2845 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2846 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2847 # text = Rev . 1 Rev Rev NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2848 # text = 64 , 435 - 459 . 1 64 64 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 435 435 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 435 - 459 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 459 459 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2849 # text = Strahl , BD. and Allis , CD. ( 2000 ) . 1 Strahl Strahl NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 BD. BD. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and bd. and allis NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Allis Allis NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 CD. CD. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 2000 2000 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2850 # text = The language of covalent histone modifications . 1 The the language of NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 2 language the language of NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 of the language of NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 covalent co- VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 histone histone NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 modifications modification NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2851 # text = Nature 403 , 1 Nature nature NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 403 403 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2852 # text = 41 - 45 . 1 41 41 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 - 41 - 45 . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 45 45 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 . 41 - 45 . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2853 # text = Strohner , R. , Wachsmuth , M. , Dachauer , K. , Mazurkiewicz , J. , Hochstatter , J. , Rippe , K. and Längst , G. ( 2005 ) . 1 Strohner Strohner NOM _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 R. R. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 Wachsmuth Wachsmuth NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 7 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 9 Dachauer Dachauer NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 11 K. K. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 13 Mazurkiewicz Mazurkiewicz NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 15 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 17 Hochstatter Hochstatter NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 19 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 21 Rippe Rippe VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 23 K. K. NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 24 and k. and längst NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 Längst Längst NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 G. G. NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 28 ( ( PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 29 2005 2005 NUM _ _ 27 parenth _ _ _ _ _ 30 ) ) PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 31 . . PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2854 # text = A 'loop recapture 'mechanism for 1 A à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 2 ' " PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 loop loup NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 recapture recapturer VRB _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 ' " PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 6 mechanism mechanism for NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 for mechanism for NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2855 # text = ACF-dependent nucleosome remodeling . 1 ACF-dependent ACF-dependent NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 nucleosome nucléé NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 remodeling re- NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2856 # text = Nat . 1 Nat Nat NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2857 # text = Struct . 1 Struct Struct NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2858 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2859 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2860 # text = 12 , 683 - 690 . 1 12 12 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 683 683 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 683 - 690 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 690 690 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2861 # text = Stucki , M. , Clapperton , JA. , Mohammad , 1 Stucki Stucki NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 5 Clapperton Clapperton NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 JA. JA. NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Mohammad Mohammad NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2862 # text = D . , Yaffe , MB. , Smerdon , SJ. and 1 D d NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Yaffe Yaffe NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 MB. MB. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Smerdon Smerdon NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 10 SJ. SJ. NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 and sj. and NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2863 # text = Jackson , SP. ( 2005 ) . 1 Jackson jackson NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 SP. SP. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2005 2005 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2864 # text = MDC1 directly binds phosphorylated histone H2AX to regulate cellular responses to DNA double-strand breaks . 1 MDC1 mdc1 directly binds phosphorylated histone h2ax to regulate cellular responses to dna double-strand breaks NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 2 directly mdc1 directly binds phosphorylated histone h2ax to regulate cellular responses to dna double-strand breaks NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 3 binds mdc1 directly binds phosphorylated histone h2ax to regulate cellular responses to dna double-strand breaks NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 4 phosphorylated mdc1 directly binds phosphorylated histone h2ax to regulate cellular responses to dna double-strand breaks NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 5 histone mdc1 directly binds phosphorylated histone h2ax to regulate cellular responses to dna double-strand breaks NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 6 H2AX H2AX NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 7 to mdc1 directly binds phosphorylated histone h2ax to regulate cellular responses to dna double-strand breaks NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 8 regulate mdc1 directly binds phosphorylated histone h2ax to regulate cellular responses to dna double-strand breaks NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 9 cellular mdc1 directly binds phosphorylated histone h2ax to regulate cellular responses to dna double-strand breaks NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 10 responses mdc1 directly binds phosphorylated histone h2ax to regulate cellular responses to dna double-strand breaks NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 11 to mdc1 directly binds phosphorylated histone h2ax to regulate cellular responses to dna double-strand breaks NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 12 DNA DNA NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 13 double-strand mdc1 directly binds phosphorylated histone h2ax to regulate cellular responses to dna double-strand breaks NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 breaks mdc1 directly binds phosphorylated histone h2ax to regulate cellular responses to dna double-strand breaks NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2865 # text = Cell 123 , 1213 - 1226 . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 123 123 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 1213 1213 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 1213 - 1226 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 1226 1226 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2866 # text = Sullivan , 1 Sullivan sullivan NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2867 # text = B . and Karpen , G. ( 2001 ) . 1 B b NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 and and karpen NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Karpen Karpen NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 G. G. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 2001 2001 NUM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2868 # text = Centromere identity in Drosophila is not determined in vivo by replication timing . 1 Centromere centromere identity in drosophila is not determined NUM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 identity centromere identity in drosophila is not determined NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 3 in centromere identity in drosophila is not determined NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 4 Drosophila Drosophila NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 5 is centromere identity in drosophila is not determined NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 6 not centromere identity in drosophila is not determined NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 determined centromere identity in drosophila is not determined NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 in in ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 vivo vive NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 by by NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 replication replication NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 timing timing NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2869 # text = J. Cell Biol . 1 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Cell Cell ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 Biol Biol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2870 # text = 154 , 683 - 690 . 1 154 154 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 683 683 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 683 - 690 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 690 690 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2871 # text = Suto , RK. , Clarkson , MJ. , Tremethick , DJ. and Luger , K. ( 2000 ) . 1 Suto Suto NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 RK. RK. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 5 Clarkson Clarkson NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 MJ. MJ. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Tremethick Tremethick NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 11 DJ. DJ. NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 12 and dj. and luger NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 Luger Luger NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 15 K. K. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 2000 2000 NUM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2872 # text = Crystal structure of a nucleosome core particle containing the variant histone 1 Crystal crystal structure of a nucleosome core particle containing the NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 structure crystal structure of a nucleosome core particle containing the NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 3 of crystal structure of a nucleosome core particle containing the NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 4 a crystal structure of a nucleosome core particle containing the NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 5 nucleosome crystal structure of a nucleosome core particle containing the NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 6 core crystal structure of a nucleosome core particle containing the NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 7 particle crystal structure of a nucleosome core particle containing the NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 8 containing crystal structure of a nucleosome core particle containing the NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 the crystal structure of a nucleosome core particle containing the NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 variant varier VPR _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 histone histone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2873 # text = H2A.Z. Nat . 1 H2A.Z. H2A.Z. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Nat Nat NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2874 # text = Struct . 1 Struct Struct NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2875 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2876 # text = 7 , 1121 - 1124 . 1 7 7 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 1121 1121 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 1121 - 1124 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 1124 1124 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2877 # text = Taverna , SD. , Li , H. , Ruthenburg , AJ. , Allis , CD. and Patel , DJ. ( 2007 ) . 1 Taverna taverna NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 3 SD. SD. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 5 Li Li NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 H. H. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 9 Ruthenburg Ruthenburg NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 11 AJ. AJ. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 13 Allis Allis NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 15 CD. CD. NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 and cd. and patel NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 Patel Patel NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 19 DJ. DJ. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 2007 2007 NUM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 22 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2878 # text = How chromatin-binding modules interpret histone modifications : 1 How How NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 chromatin-binding chromatin-binding ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 modules module NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 interpret inter- ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 histone histone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 modifications modification NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 : : PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2879 # text = lessons from professional pocket pickers . 1 lessons léser VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 from frou NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 professional professional ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 pocket rocket NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 5 pickers picorer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2880 # text = Nat . 1 Nat Nat NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2881 # text = Struct . 1 Struct Struct NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2882 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2883 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2884 # text = 14 , 1025 - 1040 . 1 14 14 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 1025 1025 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 1025 - 1040 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 1040 1040 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2885 # text = Thiru , 1 Thiru Thiru NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2886 # text = A . , Nietlispach , 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Nietlispach Nietlispach NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2887 # text = D . , Mott , HR. , Okuwaki , M. , Lyon , 1 D d NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Mott Mott NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 HR. HR. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Okuwaki Okuwaki NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 10 M. monsieur NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 Lyon Lyon NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2888 # text = D . , Nielsen , PR. , Hirshberg , M. , Verreault , 1 D d NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Nielsen Nielsen NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 PR. PR. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Hirshberg Hirshberg NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 10 M. monsieur NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 Verreault Verreault NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2889 # text = A . , Murzina , NV. and Laue , ED. ( 2004 ) . 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Murzina Murzina NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 6 NV. NV. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and nv. and laue NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Laue Laue NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 10 ED. ED. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 2004 2004 NUM _ _ 4 parenth _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2890 # text = Structural basis of HP1 / PXVXL motif peptide interactions and HP1 localisation to heterochromatin . 1 Structural structural basis of hp1 / pxvxl NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 basis structural basis of hp1 / pxvxl NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 of structural basis of hp1 / pxvxl NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 HP1 HP1 NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 / structural basis of hp1 / pxvxl PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 PXVXL PXVXL NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 motif motif NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 peptide peptide NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 interactions interaction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 and and hp1 localisation to heterochromatin NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 11 HP1 HP1 NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 12 localisation and hp1 localisation to heterochromatin NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 13 to and hp1 localisation to heterochromatin NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 heterochromatin and hp1 localisation to heterochromatin NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2891 # text = EMBO J. 23 , 489 - 499 . 1 EMBO embo NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 23 23 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 489 489 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 - 489 - 499 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 499 499 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2892 # text = Thoma , 1 Thoma Thoma NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2893 # text = F . , Koller , T. and Klug , 1 F f NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Koller Koller NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 T. T. NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 7 and t. and klug NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Klug Klug NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2894 # text = A . ( 1979 ) . 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 1979 1979 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2895 # text = Involvement of histone H1 in the organization of the nucleosome and of the salt-dependent superstructures of chromatin . 1 Involvement involvement of histone h1 in the organization of the nucleosome and of the salt-dependent superstructures of chromatin NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 2 of involvement of histone h1 in the organization of the nucleosome and of the salt-dependent superstructures of chromatin NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 3 histone involvement of histone h1 in the organization of the nucleosome and of the salt-dependent superstructures of chromatin NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 4 H1 H1 NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 5 in involvement of histone h1 in the organization of the nucleosome and of the salt-dependent superstructures of chromatin NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 6 the involvement of histone h1 in the organization of the nucleosome and of the salt-dependent superstructures of chromatin NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 7 organization involvement of histone h1 in the organization of the nucleosome and of the salt-dependent superstructures of chromatin NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 8 of involvement of histone h1 in the organization of the nucleosome and of the salt-dependent superstructures of chromatin NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 9 the involvement of histone h1 in the organization of the nucleosome and of the salt-dependent superstructures of chromatin NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 10 nucleosome involvement of histone h1 in the organization of the nucleosome and of the salt-dependent superstructures of chromatin NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 11 and involvement of histone h1 in the organization of the nucleosome and of the salt-dependent superstructures of chromatin NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 12 of involvement of histone h1 in the organization of the nucleosome and of the salt-dependent superstructures of chromatin NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 13 the involvement of histone h1 in the organization of the nucleosome and of the salt-dependent superstructures of chromatin NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 14 salt-dependent involvement of histone h1 in the organization of the nucleosome and of the salt-dependent superstructures of chromatin NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 15 superstructures involvement of histone h1 in the organization of the nucleosome and of the salt-dependent superstructures of chromatin NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 16 of involvement of histone h1 in the organization of the nucleosome and of the salt-dependent superstructures of chromatin NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 chromatin involvement of histone h1 in the organization of the nucleosome and of the salt-dependent superstructures of chromatin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2896 # text = J. Cell Biol . 1 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Cell Cell ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 Biol Biol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2897 # text = 83 , 403 - 427 . 1 83 83 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 403 403 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 403 - 427 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 427 427 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2898 # text = Thoma , 1 Thoma Thoma NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2899 # text = F . , Losa , R. and Koller , T. ( 1983 ) . 1 F f NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Losa Losa NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 R. R. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and r. and koller NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Koller Koller NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 T. T. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 1983 1983 NUM _ _ 10 parenth _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2900 # text = Involvement of the domains of histones H1 and H5 in the structural organization of soluble chromatin . 1 Involvement involvement of the domains of histones h1 and h5 in the structural organization of soluble chromatin NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 2 of involvement of the domains of histones h1 and h5 in the structural organization of soluble chromatin NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 3 the involvement of the domains of histones h1 and h5 in the structural organization of soluble chromatin NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 4 domains involvement of the domains of histones h1 and h5 in the structural organization of soluble chromatin NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 5 of involvement of the domains of histones h1 and h5 in the structural organization of soluble chromatin NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 6 histones involvement of the domains of histones h1 and h5 in the structural organization of soluble chromatin NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 7 H1 H1 NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 8 and involvement of the domains of histones h1 and h5 in the structural organization of soluble chromatin NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 9 H5 H5 NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 10 in involvement of the domains of histones h1 and h5 in the structural organization of soluble chromatin NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 11 the involvement of the domains of histones h1 and h5 in the structural organization of soluble chromatin NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 12 structural involvement of the domains of histones h1 and h5 in the structural organization of soluble chromatin NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 13 organization involvement of the domains of histones h1 and h5 in the structural organization of soluble chromatin NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 14 of involvement of the domains of histones h1 and h5 in the structural organization of soluble chromatin NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 15 soluble involvement of the domains of histones h1 and h5 in the structural organization of soluble chromatin NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 chromatin involvement of the domains of histones h1 and h5 in the structural organization of soluble chromatin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2901 # text = J . 1 J J NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2902 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2903 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2904 # text = 167 , 619 - 640 . 1 167 167 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 619 619 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 619 - 640 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 640 640 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2905 # text = Tremethick , DJ. ( 2007 ) . 1 Tremethick Tremethick NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 DJ. DJ. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2007 2007 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2906 # text = Higher-order structures of chromatin : 1 Higher-order higher-order structures of chromatin NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 structures higher-order structures of chromatin NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 3 of higher-order structures of chromatin NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 chromatin higher-order structures of chromatin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 : : PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2907 # text = the elusive 1 the the elusive NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 elusive the elusive NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2908 # text = 30 nm fiber . 1 30 30 NUM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 nm 30 nm fiber NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 fiber 30 nm fiber NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2909 # text = Cell 128 , 651 - 654 . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 128 128 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 651 651 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 651 - 654 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 654 654 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2910 # text = Trojer , P. and Reinberg , 1 Trojer Trojer NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 P. P. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and p. and reinberg NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Reinberg Reinberg NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2911 # text = D . ( 2008 ) . 1 D d NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 2008 2008 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2912 # text = Beyond histone methyl-lysine binding : 1 Beyond beyond histone methyl-lysine binding NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 histone beyond histone methyl-lysine binding NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 3 methyl-lysine beyond histone methyl-lysine binding NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 binding beyond histone methyl-lysine binding NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 : : PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2913 # text = how malignant malignant brain tumor ( MBT ) protein L3MBTL1 impacts chromatin structure . 1 how hop INT _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 malignant mal- NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 3 malignant malignant NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 brain brain NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 tumor Tudor NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ( ( PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 MBT MBT NOM _ _ 4 parenth _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 9 protein protein ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 10 L3MBTL1 L3MBTL1 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 impacts impacts NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 12 chromatin chromatine NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 13 structure structurer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2914 # text = Cell Cycle 7 , 578 - 585 . 1 Cell cell ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 Cycle Cycle NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 7 7 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 578 578 NUM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 - 578 - 585 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 585 585 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2915 # text = Tse , 1 Tse Tse NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2916 # text = C . , Sera , T. , Wolffe , AP. and Hansen , JC. ( 1998 ) . 1 C c NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Sera Sera VRB _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 T. T. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Wolffe Wolffe NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 AP. AP. NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 11 and ap. and hansen NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 Hansen Hansen NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 14 JC. JC. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 ( ( PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 1998 1998 NUM _ _ 14 parenth _ _ _ _ _ 17 ) ) PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2917 # text = Disruption of higher-order folding by core histone acetylation dramatically enhances transcription of nucleosomal arrays by RNA polymerase III . 1 Disruption disruption of higher-order folding NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 of disruption of higher-order folding NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 3 higher-order disruption of higher-order folding NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 folding disruption of higher-order folding NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 by by NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 core core NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 histone histone NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 acetylation acetylation dramatically enhances transcription of nucleosomal arrays by rna polymerase iii NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 9 dramatically acetylation dramatically enhances transcription of nucleosomal arrays by rna polymerase iii NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 10 enhances acetylation dramatically enhances transcription of nucleosomal arrays by rna polymerase iii NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 11 transcription acetylation dramatically enhances transcription of nucleosomal arrays by rna polymerase iii NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 12 of acetylation dramatically enhances transcription of nucleosomal arrays by rna polymerase iii NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 13 nucleosomal acetylation dramatically enhances transcription of nucleosomal arrays by rna polymerase iii NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 14 arrays acetylation dramatically enhances transcription of nucleosomal arrays by rna polymerase iii NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 15 by acetylation dramatically enhances transcription of nucleosomal arrays by rna polymerase iii NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 16 RNA RNA NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 17 polymerase acetylation dramatically enhances transcription of nucleosomal arrays by rna polymerase iii NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 III III NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2918 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2919 # text = Cell . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2920 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2921 # text = 18 , 4629 - 4638 . 1 18 18 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 4629 4629 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 4629 - 4638 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 4638 4638 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2922 # text = Tsunaka , Y. , Kajimura , N. , Tate , S. and Morikawa , K. ( 2005 ) . 1 Tsunaka Tsunaka NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 Y. Y. NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 Kajimura Kajimura NOM _ _ 9 subj _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 N. N. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 9 Tate Tate VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 11 S. S. NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 12 and s. and morikawa NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 Morikawa Morikawa NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 15 K. K. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 2005 2005 NUM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2923 # text = Alteration of the nucleosomal DNA path in the crystal structure of a human nucleosome core particle . 1 Alteration alteration of the nucleosomal dna path in the crystal structure of NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 2 of alteration of the nucleosomal dna path in the crystal structure of NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 3 the alteration of the nucleosomal dna path in the crystal structure of NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 4 nucleosomal alteration of the nucleosomal dna path in the crystal structure of NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 5 DNA DNA NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 6 path alteration of the nucleosomal dna path in the crystal structure of NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 7 in alteration of the nucleosomal dna path in the crystal structure of NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 8 the alteration of the nucleosomal dna path in the crystal structure of NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 9 crystal alteration of the nucleosomal dna path in the crystal structure of NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 10 structure alteration of the nucleosomal dna path in the crystal structure of NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 of alteration of the nucleosomal dna path in the crystal structure of NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 12 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 human humer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 nucleosome nucléé NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 core core NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 particle partial ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2924 # text = Nucleic Acids Res . 1 Nucleic Nucleic NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Acids Acids NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 Res Res NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2925 # text = 33 , 3424 - 3434 . 1 33 33 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 3424 3424 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 3424 - 3434 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 3434 3434 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2926 # text = Utley , RT. , Lacoste , N. , Jobin-Robitaille , O. , Allard , S. and Côté , J . 1 Utley Utley NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 3 RT. RT. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 5 Lacoste Lacoste NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 7 N. N. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 9 Jobin-Robitaille Jobin-Robitaille NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 11 O. O. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 13 Allard Allard NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 15 S. S. NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 and s. and côté NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 Côté Côté NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 J J NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2927 # text = ( 2005 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 2005 2005 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2928 # text = Regulation of NuA 4 histone acetyltransferase activity in transcription and DNA repair by phosphorylation of histone H4 . 1 Regulation regulation of nua 4 histone acetyltransferase activity NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 of regulation of nua 4 histone acetyltransferase activity NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 3 NuA NuA NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 4 4 4 NUM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 5 histone regulation of nua 4 histone acetyltransferase activity NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 6 acetyltransferase regulation of nua 4 histone acetyltransferase activity NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 activity regulation of nua 4 histone acetyltransferase activity NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 in in ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 transcription transcription NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 10 and and dna NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 DNA DNA NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 repair repair VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 by by NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 phosphorylation phosphorylation NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 of off ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 16 histone histone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 H4 H4 NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2929 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2930 # text = Cell . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2931 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2932 # text = 25 , 8179 - 8190 . 1 25 25 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 8179 8179 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 8179 - 8190 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 8190 8190 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2933 # text = van Roijen , HJ. , Ooms , MP. , Spaargaren , MC. , Baarends , WM. , Weber , RF. , Grootegoed , JA. and Vreeburg , JT. ( 1998 ) . 1 van van NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 Roijen Roijen NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 HJ. HJ. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 6 Ooms Ooms NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 8 MP. MP. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 10 Spaargaren Spaargaren NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 12 MC. MC. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 14 Baarends Baarends NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 16 WM. WM. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 18 Weber Weber NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 20 RF. RF. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 Grootegoed Grootegoed NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 24 JA. JA. NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 25 and ja. and vreeburg NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 26 Vreeburg Vreeburg NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 28 JT. JT. NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 29 ( ( PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 30 1998 1998 NUM _ _ 22 parenth _ _ _ _ _ 31 ) ) PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2934 # text = Immunoexpression of testis-specific histone 2B in human spermatozoa and testis tissue . 1 Immunoexpression immunoexpression of testis-specific NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 of immunoexpression of testis-specific NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 testis-specific immunoexpression of testis-specific NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 histone histone NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 2B 2B NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 in in ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 human humer ADJ _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 spermatozoa spermatozoa and testis tissue NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 9 and spermatozoa and testis tissue NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 10 testis spermatozoa and testis tissue NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 tissue spermatozoa and testis tissue NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2935 # text = Hum . 1 Hum hum NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2936 # text = Reprod . 1 Reprod Re NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2937 # text = 13 , 1559 - 1566 . 1 13 13 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 1559 1559 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 1559 - 1566 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 1566 1566 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2938 # text = VanDemark , AP. , Kasten , MM. , Ferris , 1 VanDemark VanDemark NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 AP. AP. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Kasten Kasten NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 MM. MM. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Ferris Ferris NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2939 # text = E . , Heroux , 1 E e NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Heroux Heroux NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2940 # text = A . , Hill , CP. and Cairns , BR. ( 2007 ) . 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 Hill Hill NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 6 CP. CP. NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 7 and cp. and cairns NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 Cairns Cairns NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 10 BR. BR. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 ( ( PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 12 2007 2007 NUM _ _ 4 parenth _ _ _ _ _ 13 ) ) PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2941 # text = Autoregulation of the rsc 4 tandem bromodomain by gcn 5 acetylation .. 1 Autoregulation autoregulation of the rsc 4 tandem bromodomain by gcn 5 acetylation .. NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 of autoregulation of the rsc 4 tandem bromodomain by gcn 5 acetylation .. NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 3 the autoregulation of the rsc 4 tandem bromodomain by gcn 5 acetylation .. NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 4 rsc autoregulation of the rsc 4 tandem bromodomain by gcn 5 acetylation .. NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 5 4 4 NUM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 6 tandem autoregulation of the rsc 4 tandem bromodomain by gcn 5 acetylation .. NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 7 bromodomain autoregulation of the rsc 4 tandem bromodomain by gcn 5 acetylation .. NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 8 by autoregulation of the rsc 4 tandem bromodomain by gcn 5 acetylation .. NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 9 gcn autoregulation of the rsc 4 tandem bromodomain by gcn 5 acetylation .. NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 10 5 5 NUM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 11 acetylation autoregulation of the rsc 4 tandem bromodomain by gcn 5 acetylation .. NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 .. autoregulation of the rsc 4 tandem bromodomain by gcn 5 acetylation .. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2942 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2943 # text = Cell 27 , 817 - 828 . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 27 27 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 817 817 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 817 - 828 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 828 828 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2944 # text = Varga-Weisz , P D ; 1 Varga-Weisz Varga-Weisz NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 P P NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 D D NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ; ; PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2945 # text = Blank , T A ; 1 Blank Blank NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 T T NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 4 A A VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 ; ; PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2946 # text = Becker , P B. ( 1995 ) . 1 Becker becker NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 P P NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 B. B. NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 ( ( PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 1995 1995 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2947 # text = Energy-dependent chromatin accessibility and nucleosome mobility in a cell-free system . 1 Energy-dependent energy-dependent chromatin accessibility and nucleosome mobility NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 chromatin energy-dependent chromatin accessibility and nucleosome mobility NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 accessibility energy-dependent chromatin accessibility and nucleosome mobility NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 and energy-dependent chromatin accessibility and nucleosome mobility NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 nucleosome energy-dependent chromatin accessibility and nucleosome mobility NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 mobility energy-dependent chromatin accessibility and nucleosome mobility NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 in in ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 a avoir VRB _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 cell-free cell NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 system system NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2948 # text = EMBO 1 EMBO embo NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2949 # text = J. 14 , 2209 - 2216 . 1 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 14 14 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 2209 2209 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 2209 - 2216 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 2216 2216 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2950 # text = W. L . DeLano . ( 2002 ) . 1 W. w. l NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 L L NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 DeLano DeLano NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 ( ( PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 2002 2002 NUM _ _ 4 parenth _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2951 # text = The pymol molecular graphics system .. , CA : 1 The the pymol molecular NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 pymol the pymol molecular NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 molecular the pymol molecular NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 graphics graphics ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 system system NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 .. ... PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 CA CA NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 : : PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2952 # text = DeLano . 1 DeLano DeLano NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2953 # text = Walfridsson , J. , Khorosjutina , O. , Matikainen , P. , Gustafsson , CM. and 1 Walfridsson Walfridsson NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 3 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 5 Khorosjutina Khorosjutina NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 O. O. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 9 Matikainen Matikainen NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 11 P. P. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 13 Gustafsson Gustafsson NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 15 CM. CM. NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 and cm. and NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2954 # text = Ekwall , K. ( 2007 ) . 1 Ekwall Ekwall NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 K. K. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2007 2007 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2955 # text = A genome-wide role for CHD remodelling factors and Nap 1 in nucleosome disassembly . 1 A a genome-wide role for chd remodelling factors and nap 1 in nucleosome disassembly NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 2 genome-wide a genome-wide role for chd remodelling factors and nap 1 in nucleosome disassembly NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 3 role a genome-wide role for chd remodelling factors and nap 1 in nucleosome disassembly NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 4 for a genome-wide role for chd remodelling factors and nap 1 in nucleosome disassembly NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 5 CHD CHD NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 6 remodelling a genome-wide role for chd remodelling factors and nap 1 in nucleosome disassembly NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 7 factors a genome-wide role for chd remodelling factors and nap 1 in nucleosome disassembly NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 8 and a genome-wide role for chd remodelling factors and nap 1 in nucleosome disassembly NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 9 Nap Nap NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 10 1 1 NUM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 11 in a genome-wide role for chd remodelling factors and nap 1 in nucleosome disassembly NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 12 nucleosome a genome-wide role for chd remodelling factors and nap 1 in nucleosome disassembly NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 disassembly a genome-wide role for chd remodelling factors and nap 1 in nucleosome disassembly NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2956 # text = EMBO J. 26 , 2868 - 2879 . 1 EMBO embo NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 26 26 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2868 2868 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 - 2868 - 2879 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 2879 2879 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2957 # text = Wei , L. , Jamonnak , N. , Choy , J. , Wang , Z. and Zheng , W. ( 2008 ) . 1 Wei wei NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 3 L. L. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 5 Jamonnak Jamonnak NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 N. N. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 9 Choy Choy NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 11 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 13 Wang Wang NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 15 Z. Z. NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 and z. and zheng NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 Zheng Zheng NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 19 W. W. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 2008 2008 NUM _ _ 9 parenth _ _ _ _ _ 22 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2958 # text = Differential binding modes of the bromodomains of CREB-binding protein ( CBP ) and p 300 with acetylated MyoD. Biochem . 1 Differential differential binding modes of the bromodomains of creb-binding NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 binding differential binding modes of the bromodomains of creb-binding NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 3 modes differential binding modes of the bromodomains of creb-binding NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 4 of differential binding modes of the bromodomains of creb-binding NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 the differential binding modes of the bromodomains of creb-binding NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 6 bromodomains differential binding modes of the bromodomains of creb-binding NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 7 of differential binding modes of the bromodomains of creb-binding NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 CREB-binding CREB-binding NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 protein protein ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 ( ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 CBP CBP NOM _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 12 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 13 and and ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 14 p page NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 15 300 300 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 with dire VRB _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 17 acetylated acétyle NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 MyoD. MyoD. NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 Biochem Biochem NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2959 # text = Biophys . 1 Biophys Biophys NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2960 # text = Res . 1 Res ré NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2961 # text = Commun . 1 Commun commun ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2962 # text = 368 , 279 - 284 . 1 368 368 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 279 279 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 279 - 284 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 284 284 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2963 # text = White , CL. , Suto , RK. and Luger , K. ( 2001 ) . 1 White white NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 CL. CL. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Suto Suto NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 RK. RK. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 8 and rk. and luger NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 Luger Luger NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 K. K. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 2001 2001 NUM _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2964 # text = Structure of the yeast nucleosome core particle reveals fundamental changes in internucleosome interactions . 1 Structure structure of the yeast nucleosome core particle reveals fundamental NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 2 of structure of the yeast nucleosome core particle reveals fundamental NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 3 the structure of the yeast nucleosome core particle reveals fundamental NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 4 yeast structure of the yeast nucleosome core particle reveals fundamental NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 5 nucleosome structure of the yeast nucleosome core particle reveals fundamental NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 6 core structure of the yeast nucleosome core particle reveals fundamental NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 7 particle structure of the yeast nucleosome core particle reveals fundamental NOM _ _ 9 periph _ _ _ _ _ 8 reveals structure of the yeast nucleosome core particle reveals fundamental NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 fundamental structure of the yeast nucleosome core particle reveals fundamental NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 changes change NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 in in ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 internucleosome internucleosome ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 interactions interaction NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2965 # text = EMBO J. 20 , 5207 - 5218 . 1 EMBO embo NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 20 20 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 5207 5207 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 - 5207 - 5218 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 5218 5218 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2966 # text = Woodcock , CL. ( 2006 ) . 1 Woodcock Woodcock NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 CL. CL. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2006 2006 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2967 # text = Chromatin architecture . 1 Chromatin Chromatin NOM _ _ 2 subj _ _ _ _ _ 2 architecture architecturer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2968 # text = Curr . 1 Curr Curr NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2969 # text = Opin . 1 Opin Opin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2970 # text = Struct . 1 Struct Struct NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2971 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2972 # text = 16 , 213 - 220 . 1 16 16 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 213 213 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 213 - 220 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 220 220 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2973 # text = Wu , S. and Chiang , 1 Wu Wu NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 S. S. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and s. and chiang NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Chiang Chiang NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2974 # text = C . ( 2007 ) . 1 C c NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 2007 2007 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2975 # text = The double bromodomain-containing chromatin adaptor Brd 4 and transcriptional regulation . 1 The the double bromodomain-containing chromatin adaptor brd 4 and transcriptional regulation NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 2 double the double bromodomain-containing chromatin adaptor brd 4 and transcriptional regulation NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 3 bromodomain-containing the double bromodomain-containing chromatin adaptor brd 4 and transcriptional regulation NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 4 chromatin the double bromodomain-containing chromatin adaptor brd 4 and transcriptional regulation NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 5 adaptor the double bromodomain-containing chromatin adaptor brd 4 and transcriptional regulation NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 6 Brd Brd NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 7 4 4 NUM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 8 and the double bromodomain-containing chromatin adaptor brd 4 and transcriptional regulation NOM _ _ 10 periph _ _ _ _ _ 9 transcriptional the double bromodomain-containing chromatin adaptor brd 4 and transcriptional regulation NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 10 regulation the double bromodomain-containing chromatin adaptor brd 4 and transcriptional regulation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2976 # text = J. Biol . 1 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Biol Biol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2977 # text = Chem . 1 Chem Chem NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2978 # text = 282 , 13141 - 13145 . 1 282 282 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 13141 13141 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 13141 - 13145 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 13145 13145 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2979 # text = Wu , S. , Lee , 1 Wu Wu NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Lee Lee NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2980 # text = A . , Hou , SY. , Kemper , JK. , Erdjument-Bromage , H. , Tempst , P. and Chiang , 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 4 Hou Hou NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 6 SY. SY. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 8 Kemper Kemper NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 10 JK. JK. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 12 Erdjument-Bromage Erdjument-Bromage NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 14 H. H. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 16 Tempst Tempst NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 18 P. P. NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 19 and p. and chiang NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 Chiang Chiang NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2981 # text = C . ( 2006 ) . 1 C c NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 2006 2006 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2982 # text = Brd 4 links chromatin targeting to HPV transcriptional silencing . 1 Brd Brd NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 links links NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 chromatin chromatin targeting to hpv transcriptional silencing NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 5 targeting chromatin targeting to hpv transcriptional silencing NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 6 to chromatin targeting to hpv transcriptional silencing NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 7 HPV HPV NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 8 transcriptional chromatin targeting to hpv transcriptional silencing NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 silencing chromatin targeting to hpv transcriptional silencing NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2983 # text = Genes Dev . 1 Genes gêne NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Dev Dev NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2984 # text = 20 , 2383 - 2396 . 1 20 20 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 2383 2383 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 2383 - 2396 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 2396 2396 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2985 # text = Wu , S. , Zhou , T. and Chiang , 1 Wu Wu NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 Zhou Zhou NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 T. T. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 8 and t. and chiang NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 Chiang Chiang NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2986 # text = C . ( 2003 ) . 1 C c NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 2003 2003 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2987 # text = Human mediator enhances activator-facilitated recruitment of RNA polymerase II and promoter recognition by TATA-binding protein ( TBP ) independently of TBP-associated factors . 1 Human human mediator enhances activator-facilitated recruitment of rna polymerase ii and promoter NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 mediator human mediator enhances activator-facilitated recruitment of rna polymerase ii and promoter NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 3 enhances human mediator enhances activator-facilitated recruitment of rna polymerase ii and promoter NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 4 activator-facilitated human mediator enhances activator-facilitated recruitment of rna polymerase ii and promoter NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 5 recruitment human mediator enhances activator-facilitated recruitment of rna polymerase ii and promoter NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 6 of human mediator enhances activator-facilitated recruitment of rna polymerase ii and promoter NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 7 RNA RNA NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 8 polymerase human mediator enhances activator-facilitated recruitment of rna polymerase ii and promoter NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 9 II II NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 10 and human mediator enhances activator-facilitated recruitment of rna polymerase ii and promoter NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 promoter human mediator enhances activator-facilitated recruitment of rna polymerase ii and promoter NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 recognition recognition NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 13 by By NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 TATA-binding TATA-binding VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 protein protein ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 TBP TBP NOM _ _ 14 parenth _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 19 independently independently of tbp-associated factors NOM _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 20 of independently of tbp-associated factors NOM _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 21 TBP-associated TBP-associated NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 22 factors independently of tbp-associated factors NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2988 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2989 # text = Cell . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2990 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2991 # text = 23 , 6229 - 6242 . 1 23 23 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 6229 6229 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 6229 - 6242 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 6242 6242 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2992 # text = Wyatt , P. ( 1993 ) . 1 Wyatt Wyatt NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 P. P. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 1993 1993 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2993 # text = Light scattering and the absolute characterization of macromolecules . 1 Light light scattering and the absolute characterization of macromolecules NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 2 scattering light scattering and the absolute characterization of macromolecules NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 3 and light scattering and the absolute characterization of macromolecules NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 4 the light scattering and the absolute characterization of macromolecules NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 absolute light scattering and the absolute characterization of macromolecules NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 6 characterization light scattering and the absolute characterization of macromolecules NOM _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 7 of light scattering and the absolute characterization of macromolecules NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 macromolecules light scattering and the absolute characterization of macromolecules NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 . . PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2994 # text = Analytica chimica acta 272 , 1 Analytica Analytica NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 chimica chimica ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 acta acter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 272 272 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2995 # text = 1 - 40 . 1 1 1 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 2 - 1 - 40 . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 40 40 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 . 1 - 40 . PUNC _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2996 # text = Yan , W. , Ma , L. , Burns , KH. and Matzuk , MM. ( 2003 ) . 1 Yan Yan NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 W. W. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 5 Ma Ma NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 L. L. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Burns Burns NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 11 KH. KH. NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 12 and kh. and matzuk NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 Matzuk Matzuk NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 15 MM. MM. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 2003 2003 NUM _ _ 13 parenth _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2997 # text = HILS1 is a spermatid-specific linker histone H 1 -like protein implicated in chromatin remodeling during mammalian spermiogenesis . 1 HILS1 hils1 is a spermatid-specific linker histone h NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 2 is hils1 is a spermatid-specific linker histone h NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 3 a hils1 is a spermatid-specific linker histone h NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 4 spermatid-specific hils1 is a spermatid-specific linker histone h NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 5 linker hils1 is a spermatid-specific linker histone h NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 6 histone hils1 is a spermatid-specific linker histone h NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 H H NOM _ _ 10 subj _ _ _ _ _ 8 1 1 NUM _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 -like like NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 protein protéiner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 implicated implicated in chromatin remodeling during mammalian spermiogenesis NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 12 in implicated in chromatin remodeling during mammalian spermiogenesis NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 13 chromatin implicated in chromatin remodeling during mammalian spermiogenesis NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 14 remodeling implicated in chromatin remodeling during mammalian spermiogenesis NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 15 during implicated in chromatin remodeling during mammalian spermiogenesis NOM _ _ 17 periph _ _ _ _ _ 16 mammalian implicated in chromatin remodeling during mammalian spermiogenesis NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 spermiogenesis implicated in chromatin remodeling during mammalian spermiogenesis NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2998 # text = Proc . 1 Proc Proc NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-2999 # text = Natl . 1 Natl Natl NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3000 # text = Acad . 1 Acad Acad NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3001 # text = Sci . 1 Sci Sci NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3002 # text = U.S.A . 1 U.S.A u.s.a NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3003 # text = 100 , 10546 - 10551 . 1 100 100 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 10546 10546 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 10546 - 10551 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 10551 10551 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3004 # text = Yang , X . ( 2004 ) . 1 Yang yang NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 3 X X ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 5 ( ( PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 2004 2004 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3005 # text = Lysine acetylation and the bromodomain : 1 Lysine lysine acetylation and the bromodomain NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 acetylation lysine acetylation and the bromodomain NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 3 and lysine acetylation and the bromodomain NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 the lysine acetylation and the bromodomain NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 bromodomain lysine acetylation and the bromodomain NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 : : PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3006 # text = a new partnership for signaling .. 1 a a new partnership for signaling .. NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 new a new partnership for signaling .. NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 3 partnership a new partnership for signaling .. NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 4 for a new partnership for signaling .. NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 signaling a new partnership for signaling .. NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 .. a new partnership for signaling .. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3007 # text = Bioessays 26 , 1076 - 1087 . 1 Bioessays Bioessays NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 26 26 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 1076 1076 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 1076 - 1087 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 1087 1087 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3008 # text = Yang , Z. , He , N. and Zhou , Q. ( 2008 ) . 1 Yang yang NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 Z. Z. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 He He NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 N. N. NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 8 and n. and zhou NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 9 Zhou Zhou NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 Q. Q. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 12 ( ( PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 2008 2008 NUM _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 14 ) ) PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3009 # text = Brd 4 recruits P-TEFb to chromosomes at late mitosis to promote G1 gene expression and cell cycle progression . 1 Brd brd 4 recruits p-tefb to chromosomes at late mitosis to promote g1 gene expression and NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 3 recruits brd 4 recruits p-tefb to chromosomes at late mitosis to promote g1 gene expression and NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 4 P-TEFb P-TEFb NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 5 to brd 4 recruits p-tefb to chromosomes at late mitosis to promote g1 gene expression and NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 6 chromosomes brd 4 recruits p-tefb to chromosomes at late mitosis to promote g1 gene expression and NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 7 at brd 4 recruits p-tefb to chromosomes at late mitosis to promote g1 gene expression and NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 8 late brd 4 recruits p-tefb to chromosomes at late mitosis to promote g1 gene expression and NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 9 mitosis brd 4 recruits p-tefb to chromosomes at late mitosis to promote g1 gene expression and NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 10 to brd 4 recruits p-tefb to chromosomes at late mitosis to promote g1 gene expression and NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 11 promote brd 4 recruits p-tefb to chromosomes at late mitosis to promote g1 gene expression and NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 12 G1 G1 NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 13 gene brd 4 recruits p-tefb to chromosomes at late mitosis to promote g1 gene expression and NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 14 expression brd 4 recruits p-tefb to chromosomes at late mitosis to promote g1 gene expression and NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 and brd 4 recruits p-tefb to chromosomes at late mitosis to promote g1 gene expression and NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 cell cell ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 cycle cycle NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 progression progression NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3010 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3011 # text = Cell . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3012 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3013 # text = 28 , 967 - 976 . 1 28 28 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 967 967 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 967 - 976 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 976 976 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3014 # text = Yang , Z. , Yik , JHN . , Chen , R. , He , N. , Jang , MK. , Ozato , K. and Zhou , Q . 1 Yang yang NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 3 Z. Z. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 5 Yik Yik NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 7 JHN JHN NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 10 Chen Chen NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 12 R. R. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 14 He He NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 16 N. N. NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 18 Jang Jang NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 20 MK. MK. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 22 Ozato Ozato NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 24 K. K. NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 25 and k. and zhou NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 26 Zhou Zhou NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 Q Q NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 29 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3015 # text = ( 2005 ) . 1 ( ( PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 2 2005 2005 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 ) ) PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3016 # text = Recruitment of P-TEFb for stimulation of transcriptional elongation by the bromodomain protein Brd 4 . 1 Recruitment recruitment of p-tefb for stimulation of transcriptional elongation by the bromodomain protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 2 of recruitment of p-tefb for stimulation of transcriptional elongation by the bromodomain protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 3 P-TEFb P-TEFb NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 4 for recruitment of p-tefb for stimulation of transcriptional elongation by the bromodomain protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 5 stimulation recruitment of p-tefb for stimulation of transcriptional elongation by the bromodomain protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 6 of recruitment of p-tefb for stimulation of transcriptional elongation by the bromodomain protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 7 transcriptional recruitment of p-tefb for stimulation of transcriptional elongation by the bromodomain protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 8 elongation recruitment of p-tefb for stimulation of transcriptional elongation by the bromodomain protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 9 by recruitment of p-tefb for stimulation of transcriptional elongation by the bromodomain protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 10 the recruitment of p-tefb for stimulation of transcriptional elongation by the bromodomain protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 11 bromodomain recruitment of p-tefb for stimulation of transcriptional elongation by the bromodomain protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 12 protein recruitment of p-tefb for stimulation of transcriptional elongation by the bromodomain protein brd 4 NOM _ _ 14 periph _ _ _ _ _ 13 Brd Brd NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 4 4 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3017 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3018 # text = Cell 19 , 535 - 545 . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 19 19 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 535 535 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 535 - 545 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 545 545 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3019 # text = You , J. , Srinivasan , V. , Denis , GV. , Harrington , WJJ . , Ballestas , ME. , Kaye , KM. and Howley , PM. ( 2006 ) . 1 You You NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 3 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 5 Srinivasan Srinivasan NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 7 V. V. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 9 Denis Denis NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 11 GV. GV. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 13 Harrington Harrington NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 15 WJJ WJJ NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 18 Ballestas Ballestas NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 20 ME. ME. NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 22 Kaye Kaye NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 23 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 24 KM. KM. NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 25 and km. and howley NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 26 Howley Howley NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 27 , , PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 28 PM. PM. NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 29 ( ( PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 30 2006 2006 NUM _ _ 22 parenth _ _ _ _ _ 31 ) ) PUNC _ _ 30 punc _ _ _ _ _ 32 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3020 # text = Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus latency-associated nuclear antigen interacts with bromodomain protein Brd 4 on host mitotic chromosomes . 1 Kaposi's kaposi's sarcoma-associated herpesvirus latency-associated nuclear antigen interacts with bromodomain protein brd 4 on host mitotic chromosomes NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 2 sarcoma-associated kaposi's sarcoma-associated herpesvirus latency-associated nuclear antigen interacts with bromodomain protein brd 4 on host mitotic chromosomes NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 3 herpesvirus kaposi's sarcoma-associated herpesvirus latency-associated nuclear antigen interacts with bromodomain protein brd 4 on host mitotic chromosomes NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 4 latency-associated kaposi's sarcoma-associated herpesvirus latency-associated nuclear antigen interacts with bromodomain protein brd 4 on host mitotic chromosomes NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 5 nuclear kaposi's sarcoma-associated herpesvirus latency-associated nuclear antigen interacts with bromodomain protein brd 4 on host mitotic chromosomes NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 6 antigen kaposi's sarcoma-associated herpesvirus latency-associated nuclear antigen interacts with bromodomain protein brd 4 on host mitotic chromosomes NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 7 interacts kaposi's sarcoma-associated herpesvirus latency-associated nuclear antigen interacts with bromodomain protein brd 4 on host mitotic chromosomes NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 8 with kaposi's sarcoma-associated herpesvirus latency-associated nuclear antigen interacts with bromodomain protein brd 4 on host mitotic chromosomes NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 9 bromodomain kaposi's sarcoma-associated herpesvirus latency-associated nuclear antigen interacts with bromodomain protein brd 4 on host mitotic chromosomes NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 10 protein kaposi's sarcoma-associated herpesvirus latency-associated nuclear antigen interacts with bromodomain protein brd 4 on host mitotic chromosomes NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 11 Brd Brd NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 12 4 4 NUM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 13 on kaposi's sarcoma-associated herpesvirus latency-associated nuclear antigen interacts with bromodomain protein brd 4 on host mitotic chromosomes NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 14 host kaposi's sarcoma-associated herpesvirus latency-associated nuclear antigen interacts with bromodomain protein brd 4 on host mitotic chromosomes NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 15 mitotic kaposi's sarcoma-associated herpesvirus latency-associated nuclear antigen interacts with bromodomain protein brd 4 on host mitotic chromosomes NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 chromosomes kaposi's sarcoma-associated herpesvirus latency-associated nuclear antigen interacts with bromodomain protein brd 4 on host mitotic chromosomes NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3021 # text = J. Virol . 1 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Virol Virol NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3022 # text = 80 , 8909 - 8919 . 1 80 80 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 8909 8909 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 8909 - 8919 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 8919 8919 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3023 # text = Young , JI. , Hong , EP. , Castle , JC. , Crespo-Barreto , J. , Bowman , AB. , Rose , MF. , Kang , 1 Young young NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 JI. JI. NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 Hong Hong NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 EP. EP. NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 9 Castle Castle NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 JC. JC. NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 13 Crespo-Barreto Crespo-Barreto NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 J. J. NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 17 Bowman Bowman NOM _ _ 21 subj _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 19 AB. AB. NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 21 Rose Rose VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 23 punc _ _ _ _ _ 23 MF. MF. NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 25 Kang Kang NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3024 # text = D . , Richman , R. , Johnson , JM. , Berget , S. and Zoghbi , HY. ( 2005 ) . 1 D d NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Richman Richman NOM _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 R. R. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 8 Johnson Johnson NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 10 JM. JM. NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 12 Berget Berget NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 14 S. S. NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 15 and s. and zoghbi NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 Zoghbi Zoghbi NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 18 HY. HY. NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 2005 2005 NUM _ _ 12 parenth _ _ _ _ _ 21 ) ) PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 22 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3025 # text = Regulation of RNA splicing by the methylation-dependent transcriptional repressor methyl-CpG binding protein 2 . 1 Regulation regulation of rna splicing by the methylation-dependent transcriptional repressor methyl-cpg binding protein 2 NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 2 of regulation of rna splicing by the methylation-dependent transcriptional repressor methyl-cpg binding protein 2 NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 3 RNA RNA NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 4 splicing regulation of rna splicing by the methylation-dependent transcriptional repressor methyl-cpg binding protein 2 NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 5 by regulation of rna splicing by the methylation-dependent transcriptional repressor methyl-cpg binding protein 2 NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 6 the regulation of rna splicing by the methylation-dependent transcriptional repressor methyl-cpg binding protein 2 NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 7 methylation-dependent regulation of rna splicing by the methylation-dependent transcriptional repressor methyl-cpg binding protein 2 NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 8 transcriptional regulation of rna splicing by the methylation-dependent transcriptional repressor methyl-cpg binding protein 2 NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 9 repressor regulation of rna splicing by the methylation-dependent transcriptional repressor methyl-cpg binding protein 2 NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 10 methyl-CpG regulation of rna splicing by the methylation-dependent transcriptional repressor methyl-cpg binding protein 2 NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 11 binding regulation of rna splicing by the methylation-dependent transcriptional repressor methyl-cpg binding protein 2 NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 12 protein regulation of rna splicing by the methylation-dependent transcriptional repressor methyl-cpg binding protein 2 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 2 2 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3026 # text = Proc . 1 Proc Proc NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3027 # text = Natl . 1 Natl Natl NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3028 # text = Acad . 1 Acad Acad NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3029 # text = Sci . 1 Sci Sci NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3030 # text = U.S.A . 102 , 17551 - 17558 . 1 U.S.A u.s.a NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 102 102 NUM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 17551 17551 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 - 17551 - 17558 PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 17558 17558 NUM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3031 # text = Zeng , L. and Zhou , MM. ( 2002 ) . 1 Zeng Zeng NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 3 L. L. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and l. and zhou NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Zhou Zhou NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 MM. MM. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 2002 2002 NUM _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 11 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3032 # text = Bromodomain : 1 Bromodomain Bromodomain NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3033 # text = an acetyl-lysine binding domain . 1 an an acetyl-lysine binding domain NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 acetyl-lysine an acetyl-lysine binding domain NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 3 binding an acetyl-lysine binding domain NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 domain an acetyl-lysine binding domain NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3034 # text = FEBS Lett . 1 FEBS FEBS NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Lett Lett NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3035 # text = 513 , 124 - 128 . 1 513 513 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 124 124 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 124 - 128 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 128 128 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3036 # text = Zeng , L. , Li , J. , Muller , M. , Yan , S. , Mujtaba , S. , Pan , 1 Zeng Zeng NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 3 L. L. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 5 Li Li NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 7 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 9 Muller Muller NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 13 Yan Yan NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 15 S. S. NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 17 Mujtaba Mujtaba NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 19 S. S. NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 Pan Pan NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 22 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3037 # text = C . , Wang , Z. and 1 C c NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 Wang Wang NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 Z. Z. NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 and z. and NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3038 # text = Zhou , M. ( 2005 ) . 1 Zhou Zhou NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 ( ( PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 2005 2005 NUM _ _ 3 parenth _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3039 # text = Selective small molecules blocking HIV- 1 Tat and coactivator PCAF association . 1 Selective selective small molecules blocking hiv- 1 tat and coactivator pcaf association NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 2 small selective small molecules blocking hiv- 1 tat and coactivator pcaf association NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 3 molecules selective small molecules blocking hiv- 1 tat and coactivator pcaf association NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 4 blocking selective small molecules blocking hiv- 1 tat and coactivator pcaf association NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 5 HIV- HIV- NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 6 1 1 NUM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 7 Tat Tat NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 8 and selective small molecules blocking hiv- 1 tat and coactivator pcaf association NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 9 coactivator selective small molecules blocking hiv- 1 tat and coactivator pcaf association NOM _ _ 11 periph _ _ _ _ _ 10 PCAF PCAF NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 association selective small molecules blocking hiv- 1 tat and coactivator pcaf association NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 12 . . PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3040 # text = J. Am . 1 J. J. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 Am Am NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3041 # text = Chem . 1 Chem Chem NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3042 # text = Soc . 1 Soc soc NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3043 # text = 127 , 2376 - 2377 . 1 127 127 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 2376 2376 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 2376 - 2377 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 2377 2377 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3044 # text = Zeng , L. , Zhang , Q. , Gerona-Navarro , G. , Moshkina , N. and Zhou , M. ( 2008 ) . 1 Zeng Zeng NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 3 L. L. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 5 Zhang Zhang NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 Q. Q. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 9 Gerona-Navarro Gerona-Navarro NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 G. G. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 Moshkina Moshkina NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 15 N. N. NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 16 and n. and zhou NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 17 Zhou Zhou NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 18 , , PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 19 M. monsieur NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 2008 2008 NUM _ _ 17 parenth _ _ _ _ _ 22 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 23 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3045 # text = Structural basis of site-specific histone recognition by the bromodomains of human coactivators PCAF and CBP / p 300 . 1 Structural structural basis of site-specific NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 basis structural basis of site-specific NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 3 of structural basis of site-specific NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 site-specific structural basis of site-specific NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 histone histone NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 recognition recognition NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 by by NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 8 the the NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 9 bromodomains bromodomains NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 10 of of NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 11 human human NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 12 coactivators coactivators NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 13 PCAF PCAF NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 14 and and NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 CBP CBP NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 / sur PUNC _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 p page NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 300 300 NUM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3046 # text = Structure 16 , 643 - 652 . 1 Structure structure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 16 16 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 643 643 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 643 - 652 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 652 652 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3047 # text = Zhang , Y. , Smith , CL. , Saha , 1 Zhang Zhang NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 Y. Y. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 5 Smith Smith NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 CL. CL. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Saha Saha NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3048 # text = A . , Grill , SW. , Mihardja , S. , Smith , SB. , Cairns , BR. , Peterson , CL. and Bustamante , 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 4 Grill Grill NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 6 SW. SW. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 8 Mihardja Mihardja NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 10 S. S. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 12 Smith Smith NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 13 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 14 SB. SB. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 16 Cairns Cairns NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 18 BR. BR. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 19 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 20 Peterson Peterson NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 22 CL. CL. NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 23 and cl. and bustamante NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 24 Bustamante Bustamante NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3049 # text = C . ( 2006 ) . 1 C c NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 2006 2006 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3050 # text = DNA translocation and loop formation mechanism of chromatin remodeling by SWI / SNF and RSC . 1 DNA dna translocation and loop formation mechanism of chromatin remodeling by swi / snf and rsc NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 2 translocation dna translocation and loop formation mechanism of chromatin remodeling by swi / snf and rsc NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 3 and dna translocation and loop formation mechanism of chromatin remodeling by swi / snf and rsc NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 4 loop dna translocation and loop formation mechanism of chromatin remodeling by swi / snf and rsc NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 5 formation dna translocation and loop formation mechanism of chromatin remodeling by swi / snf and rsc NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 6 mechanism dna translocation and loop formation mechanism of chromatin remodeling by swi / snf and rsc NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 7 of dna translocation and loop formation mechanism of chromatin remodeling by swi / snf and rsc NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 8 chromatin dna translocation and loop formation mechanism of chromatin remodeling by swi / snf and rsc NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 9 remodeling dna translocation and loop formation mechanism of chromatin remodeling by swi / snf and rsc NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 10 by dna translocation and loop formation mechanism of chromatin remodeling by swi / snf and rsc NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 11 SWI SWI NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 12 / dna translocation and loop formation mechanism of chromatin remodeling by swi / snf and rsc PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 13 SNF SNF NOM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 14 and dna translocation and loop formation mechanism of chromatin remodeling by swi / snf and rsc NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 RSC RSC NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3051 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3052 # text = Cell 24 , 559 - 568 . 1 Cell cell NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 24 24 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 559 559 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 - 559 - 568 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 568 568 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3053 # text = Zhao , M. , Shirley , CR. , Mounsey , S. and Meistrich , ML. ( 2004 ) . 1 Zhao Zhao NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 5 Shirley Shirley NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 7 CR. CR. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 9 Mounsey Mounsey NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 11 S. S. NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 12 and s. and meistrich NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 Meistrich Meistrich NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 15 ML. ML. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 16 ( ( PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 2004 2004 NUM _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 18 ) ) PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3054 # text = Nucleoprotein transitions during spermiogenesis in mice with transition nuclear protein Tnp 1 and Tnp 2 mutations . 1 Nucleoprotein nucleoprotein transitions during spermiogenesis NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 transitions nucleoprotein transitions during spermiogenesis NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 3 during nucleoprotein transitions during spermiogenesis NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 spermiogenesis nucleoprotein transitions during spermiogenesis NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 in in ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 6 mice miche NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 with dire ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 8 transition transition NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 nuclear nucléaire ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 protein protéine NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 Tnp Tnp NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 12 1 1 NUM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 13 and tnp 1 and tnp 2 mutations NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 14 Tnp Tnp NOM _ _ 16 periph _ _ _ _ _ 15 2 2 NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 mutations tnp 1 and tnp 2 mutations NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3055 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3056 # text = Reprod . 1 Reprod Re NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3057 # text = 71 , 1016 - 1025 . 1 71 71 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 1016 1016 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 1016 - 1025 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 1025 1025 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3058 # text = Zhou , J. , Fan , JY. , Rangasamy , 1 Zhou Zhou NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 5 Fan Fan NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 7 JY. JY. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 Rangasamy Rangasamy NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3059 # text = D . and Tremethick , DJ. ( 2007 ) . 1 D d NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 and and tremethick NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 Tremethick Tremethick NOM _ _ 6 periph _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 DJ. DJ. NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 ( ( PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 8 2007 2007 NUM _ _ 6 parenth _ _ _ _ _ 9 ) ) PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 10 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3060 # text = The nucleosome surface regulates chromatin compaction and couples it with transcriptional repression . 1 The the nucleosome surface regulates chromatin compaction and NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 nucleosome the nucleosome surface regulates chromatin compaction and NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 3 surface the nucleosome surface regulates chromatin compaction and NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 4 regulates the nucleosome surface regulates chromatin compaction and NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 5 chromatin the nucleosome surface regulates chromatin compaction and NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 6 compaction the nucleosome surface regulates chromatin compaction and NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 and the nucleosome surface regulates chromatin compaction and NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 couples couple NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 it hit NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 with dire VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 transcriptional transcriptional ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 repression répression NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 . . PUNC _ _ 10 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3061 # text = Nat . 1 Nat Nat NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3062 # text = Struct . 1 Struct Struct NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3063 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3064 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3065 # text = 14 , 1070 - 1076 . 1 14 14 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 1070 1070 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 1070 - 1076 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 1076 1076 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3066 # text = Zlatanova , J. and Thakar , 1 Zlatanova Zlatanova NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 3 J. J. NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 and j. and thakar NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 Thakar Thakar NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3067 # text = A . ( 2008 ) . 1 A avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 2008 2008 NUM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3068 # text = H2A.Z : 1 H2A.Z H2A.Z NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3069 # text = view from the top . 1 view vie NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 from frou NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 the thé NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 top top NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3070 # text = Structure 1 Structure structure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3071 # text = 16 , 166 - 179 . 1 16 16 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 166 166 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 166 - 179 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 179 179 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3072 # text = Zofall , M. , Persinger , J. , Kassabov , SR. and Bartholomew , 1 Zofall Zofall NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 3 M. monsieur NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 5 Persinger Persinger NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 J. J. NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 9 Kassabov Kassabov NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 SR. SR. NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 12 and sr. and bartholomew NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 Bartholomew Bartholomew NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3073 # text = B . ( 2006 ) . 1 B b NOM _ _ 4 periph _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 2006 2006 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 ) ) PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3074 # text = Chromatin remodeling remodeling by ISW2 and SWI / SNF requires DNA translocation inside the nucleosome . 1 Chromatin Chromatin NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 remodeling re- NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 3 remodeling remodeling NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 4 by by NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 5 ISW2 ISW2 NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 6 and and NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 7 SWI SWI NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 8 / / PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 9 SNF SNF NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 10 requires requires NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 DNA DNA NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 12 translocation translocation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 inside in A+V _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 the the nucleosome NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 nucleosome the nucleosome NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3075 # text = Nat . 1 Nat Nat NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3076 # text = Struct . 1 Struct Struct NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3077 # text = Mol . 1 Mol mol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3078 # text = Biol . 1 Biol biol NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3079 # text = 13 , 339 - 346 . 1 13 13 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 339 339 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 - 339 - 346 PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 5 346 346 NUM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3080 # text = Annexes 1 Annexes annexe NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3081 # text = Annexe 1 1 Annexe annexer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 1 1 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3082 # text = Librairies utilisées pour définir le résidu acétyl-lysine dans le programme cns 1 Librairies librairie NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 utilisées utiliser VPP _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 pour pour PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 définir définir VNF _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 résidu résidu NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 acétyl-lysine acétyle-lysine NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 dans dans PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 9 le le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 programme programme NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 cns cas NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3083 # text = Fichier protein rep . 1 Fichier fichier NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 protein protein ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 4 rep reps NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3084 # text = par ( paramètres concernant les angles et les liaisons ) 1 par par NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 paramètres paramètre NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 concernant concerner VPR _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 angles angle NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 8 les le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 liaisons liaison NOM _ _ 6 para _ _ _ _ _ 10 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3085 # text = ACC O * Bonds * ACC F bond C CH3E 947.200 1.516 ! 1 ACC O ( PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 2 * - PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 3 Bonds Bonds NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 * - PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 5 ACC F ) PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ 6 bond bond NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 C C NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 CH3E CH3E NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 947.200 947.200 NUM _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 1.516 1.516 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 11 ! ! PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3086 # text = 0.025 1 0.025 0.025 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3087 # text = ACC O * Angles * ACC F angle CH3E C NH 1 440 . 686 116 .500 angle CH3E C O 485.856 120 .800 1 ACC O ( PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 2 * - PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 3 Angles Angles NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 * - PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 5 ACC F ) PUNC _ _ 22 punc _ _ _ _ _ 6 angle angle NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 CH3E CH3E NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 C C NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 NH NH NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 1 1 NUM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 11 440 440 NUM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 12 . 1 440 . 686 116 .500 PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 13 686 686 NUM _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 14 116 116 NUM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 15 .500 1 440 . 686 116 .500 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 angle angle NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 CH3E CH3E NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 C C NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 O O ADV _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 485.856 485.856 NUM _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 21 120 120 NUM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 22 .800 485.856 120 .800 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3088 # text = ACC O * Dihedral angles * ACC F dihe CH2E NH 1 C CH3E $kdih rigid 1 0.0 dihe CH2E NH 1 C O $kdih rigid 1 180.0 1 ACC O ( PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 2 * - PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 3 Dihedral Dihedral NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 angles angles NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 * - PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 6 ACC F ) PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 7 dihe dire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 CH2E CH2E NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 NH NH NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 1 1 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 11 C C NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 CH3E CH3E NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 $kdih $kdih ADV _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 14 PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 15 rigid rigide ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 1 1 NUM _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 0.0 0.0 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 18 dihe dire ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 CH2E CH2E NOM _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 20 NH NH NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 1 1 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 C C NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 O O ADV _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 24 $kdih $kdih ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 25 PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 26 rigid rigide ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 27 1 1 NUM _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 180.0 180.0 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3089 # text = ACC O * Improper angles * ACC F impr C O CH3E NH 1 $kimpr strong 0 0.0 1 ACC O ( PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 2 * - PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 3 Improper Improper NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 angles angles NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 * - PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 6 ACC F ) PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 impr in- PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 C C NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 O O NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 CH3E CH3E NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 NH NH NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 12 1 1 NUM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 13 $kimpr $kimpr PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 14 PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 15 strong string NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 0 0 NUM _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 0.0 0.0 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3090 # text = Fichier protein . 1 Fichier fichier NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 protein protein ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 PUNC _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3091 # text = top ( paramètres concernant la topologie ) 1 top top NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 paramètres paramètre NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 concernant concerner VPR _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 topologie topologie NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3092 # text = RESIDue ALY 1 RESIDue RESIDue NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ALY ALY NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3093 # text = GROUp 1 GROUp GROUp NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3094 # text = ATOM N TYPE NH1 CHARge - 0.35 END 1 ATOM ATOM NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 N N NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 TYPE TYPE NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 NH1 NH1 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 CHARge CHARge VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 - - 0.35 PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 7 0.35 0.35 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 END END NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3095 # text = ATOM H TYPE = H CHARge = 0.25 END 1 ATOM ATOM NOM _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 H H NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 TYPE TYPE NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 H H NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 CHARge CHARge ADJ _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 0.25 0.25 NUM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 END END NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3096 # text = ATOM CA TYPE CH1E CHARge 0.10 END 1 ATOM ATOM NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 CA CA NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 TYPE TYPE VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 CH1E CH1E NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 CHARge CHARge NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 0.10 0.10 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 END END NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3097 # text = ATOM CB TYPE CH2E CHARge 0.0 END 1 ATOM ATOM NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 CB CB NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 TYPE TYPE NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 CH2E CH2E NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 CHARge CHARge VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 0.0 0.0 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 END END NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3098 # text = ATOM CG TYPE CH2E CHARge 0.0 END 1 ATOM ATOM NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 CG CG NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 TYPE TYPE NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 CH2E CH2E NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 CHARge CHARge VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 0.0 0.0 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 END END NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3099 # text = ATOM CD TYPE CH2E CHARge 0.0 END 1 ATOM ATOM NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 CD CD NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 3 TYPE TYPE NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 CH2E CH2E NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 CHARge CHARge VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 0.0 0.0 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 END END NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3100 # text = ATOM CE TYPE CH2E CHARge 0.0 END 1 ATOM ATOM NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 CE CE DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 TYPE TYPE NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 CH2E CH2E NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 CHARge CHARge VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 0.0 0.0 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 END END NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3101 # text = ATOM NZ TYPE NH1 CHARge - 0.35 END 1 ATOM ATOM NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 NZ NZ NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 TYPE TYPE NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 NH1 NH1 NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 CHARge CHARge VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 - - 0.35 PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 7 0.35 0.35 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 END END NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3102 # text = ATOM OH TYPE O CHARge - 0.55 END 1 ATOM ATOM NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 OH OH ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 TYPE TYPE ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 O O ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 CHARge CHARge VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 - - 0.55 PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 7 0.55 0.55 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 END END NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3103 # text = ATOM CH TYPE C CHARge 0.55 END 1 ATOM ATOM NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 CH CH NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 TYPE TYPE VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 C C NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 CHARge CHARge NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 0.55 0.55 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 END END NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3104 # text = ATOM CH3 TYPE CH3E CHARge 0.0 END 1 ATOM ATOM NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 CH3 CH3 NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 TYPE TYPE NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 CH3E CH3E NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 CHARge CHARge VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 0.0 0.0 NUM _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 END END NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3105 # text = ATOM C TYPE C CHARge 0.55 END 1 ATOM ATOM NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 C C NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 TYPE TYPE VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 C C NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 CHARge CHARge ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 0.55 0.55 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 END END NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3106 # text = ATOM O TYPE O CHARge - 0.55 END 1 ATOM ATOM NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 2 O O ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 TYPE TYPE ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 O O ADV _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 CHARge CHARge VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 - - 0.55 PUNC _ _ 8 punc _ _ _ _ _ 7 0.55 0.55 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 END END NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3107 # text = BOND N CA 1 BOND bond NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 N N NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 CA CA NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3108 # text = BOND CA C 1 BOND bond NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 CA CA NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 C C NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3109 # text = BOND C O 1 BOND bond NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 C C NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 O O NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3110 # text = BOND N H 1 BOND bond NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 N N NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 H H NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3111 # text = BOND CA CB 1 BOND bond NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 CA CA NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 CB CB NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3112 # text = BOND CB CG 1 BOND bond NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 CB CB NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 CG CG NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3113 # text = BOND CG CD 1 BOND bond NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 CG CG NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 CD CD NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3114 # text = BOND CD CE 1 BOND bond NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 CD CD NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 CE CE NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3115 # text = BOND CE NZ 1 BOND bond NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 CE CE NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 NZ NZ NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3116 # text = BOND NZ CH 1 BOND bond NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 NZ NZ NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 CH CH NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3117 # text = BOND CH OH 1 BOND bond NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 CH CH NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 OH OH ADV _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3118 # text = BOND CH CH3 1 BOND bond NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 CH CH NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 CH3 CH3 NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3119 # text = DIHEdral N CA CB CG 1 DIHEdral DIHEdral ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 N N NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 CA CA NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 CB CB NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 CG CG NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3120 # text = DIHEdral CA CB CG CD 1 DIHEdral DIHEdral NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 CA CA NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 CB CB NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 4 CG CG NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 CD CD NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3121 # text = DIHEdral CB CG CD CE 1 DIHEdral DIHEdral NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 CB CB NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 3 CG CG NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 CD CD NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 CE CE NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3122 # text = DIHEdral CG CD CE NZ 1 DIHEdral DIHEdral NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 CG CG NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 CD CD NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 CE CE NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 NZ NZ NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3123 # text = DIHEdral CD CE NZ CH 1 DIHEdral DIHEdral ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 CD CD NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 CE CE NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 NZ NZ NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 CH CH NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3124 # text = DIHEdral CE NZ CH OH ! 1 DIHEdral DIHEdral ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 CE CE NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 NZ NZ NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 CH CH NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 OH OH NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 ! ! PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3125 # text = flat ? ( 0 degrees = cis ) 0.08 1 flat flat ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 0 0 NUM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 5 degrees dégréer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 cis situé ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 9 0.08 0.08 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3126 # text = DIHEdral CE NZ CH CH3 ! 1 DIHEdral DIHEdral ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 CE CE NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 NZ NZ NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 CH CH NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 CH3 CH3 NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 ! ! PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3127 # text = flat ? ( 180 degrees = trans ) 179.66 1 flat flat ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ? ? PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 ( ( PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 180 180 NUM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 5 degrees dégréer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 = égaler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 trans trans NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 8 ) ) PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 9 179.66 179.66 NUM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3128 # text = IMPRoper CA N C CB ! 1 IMPRoper IMPRoper NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 CA CA NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 N N NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 C C NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 CB CB NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 ! ! PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3129 # text = chirality or flatness improper 36.08 1 chirality chirality ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 or or NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 flatness flatter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 improper in- NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 36.08 36.08 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3130 # text = IMPRoper CH OH CH3 NZ ! 1 IMPRoper IMPRoper NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 CH CH NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 OH OH NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 CH3 CH3 NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 NZ NZ NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 6 ! ! PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3131 # text = chirality or flatness improper - 0.25 1 chirality chirality ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 or or NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 flatness flatter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 improper in- NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 - - PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 6 0.25 0.25 NUM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3132 # text = END ACC O RESIdue ALY ACC F 1 END end NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ACC O ( PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ 3 RESIdue RESIdue NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 ALY ALY NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 ACC F ) PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3133 # text = Annexe 2 1 Annexe annexer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 2 2 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3134 # text = Alignement de séquence des homologues de la famille BET ( d'après Wu , 2007 ) 1 Alignement alignement NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 séquence séquence NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 des de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 homologues homologue NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 la le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 famille famille NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 BET BET NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 ( ( PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ 11 d' de PRE _ _ 8 parenth _ _ _ _ _ 12 après après PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 Wu Wu NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ 15 2007 2007 NUM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 ) ) PUNC _ _ 11 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3135 # text = Annexe 3 1 Annexe annexer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 3 3 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3136 # text = Structures et affinités de bromodomaines 1 Structures structure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 et et COO _ _ 3 mark _ _ _ _ _ 3 affinités affinité NOM _ _ 1 para _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 bromodomaines brome NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3137 # text = Annexe 4 1 Annexe annexer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 4 4 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3138 # text = Résultats détaillés des mesures d'ITC 1 Résultats résultat NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 détaillés détaillé ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 mesures mesure NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 d' de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ITC ITC NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3139 # text = Explication des figures : 1 Explication explication NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 des de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 figures figure NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3140 # text = Panneau du haut : 1 Panneau panneau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 du de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 haut haut NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3141 # text = variations de chaleur résultant de la titration du peptide dans la cellule contenant la solution de protéine ( en noir ) ou le tampon seul ( en rouge ) . 1 variations variation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 chaleur chaleur NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 résultant résulter VPR _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 titration titration NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 du de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 peptide peptide NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 dans dans PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 la le DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 cellule cellule NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 contenant contenir VPR _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 la le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 solution solution NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 de de PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 protéine protéine NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 ( ( PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 19 en en PRE _ _ 13 parenth _ _ _ _ _ 20 noir noir NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 ) ) PUNC _ _ 19 punc _ _ _ _ _ 22 ou ou COO _ _ 24 mark _ _ _ _ _ 23 le le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 tampon tampon NOM _ _ 12 para _ _ _ _ _ 25 seul seul ADJ _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 ( ( PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 27 en en PRE _ _ 24 parenth _ _ _ _ _ 28 rouge rouge NOM _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 ) ) PUNC _ _ 27 punc _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3142 # text = Dans les cas où les isothermes se superposent , la courbe de la dilution du peptide est décalée vers le haut pour plus de clarté . 1 Dans dans PRE _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 2 les le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 cas cas NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 où où PRQ _ _ 8 periph _ _ _ _ _ 5 les le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 isothermes isotherme NOM _ _ 8 subj _ _ _ _ _ 7 se se CLI _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 superposent superposer VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 10 la le DET _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 courbe courbe NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 12 de de PRE _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 la le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 dilution dilution NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 du de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 peptide peptide NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 est être VRB _ _ 18 aux _ _ _ _ _ 18 décalée décaler VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 vers vers PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 le le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 haut haut NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 pour pour PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 23 plus plus ADV _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 clarté clarté NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3143 # text = Panneau du bas : 1 Panneau panneau NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 du de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 bas bas NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3144 # text = données intégrées de la dilution du peptide ( en rouge ) et de l'interaction entre la protéine et le peptide après la soustraction du signal dû à la dilution du peptide ( en noir ) . 1 données donnée NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 intégrées intégré ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 de de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 la le DET _ _ 5 spe _ _ _ _ _ 5 dilution dilution NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 du de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 peptide peptide NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 en en PRE _ _ 5 parenth _ _ _ _ _ 10 rouge rouge NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 12 et et COO _ _ 13 mark _ _ _ _ _ 13 de de PRE _ _ 3 para _ _ _ _ _ 14 l' le DET _ _ 15 spe _ _ _ _ _ 15 interaction interaction NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 entre entre PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 protéine protéine NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 19 et et COO _ _ 21 mark _ _ _ _ _ 20 le le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 peptide peptide NOM _ _ 18 para _ _ _ _ _ 22 après après PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 la le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 soustraction soustraction NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 25 du de PRE _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 signal signal NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 dû devoir VPP _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 à à PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 la le DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 dilution dilution NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 du de PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 peptide peptide NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 33 ( ( PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 34 en en PRE _ _ 30 parenth _ _ _ _ _ 35 noir noir NOM _ _ 34 dep _ _ _ _ _ 36 ) ) PUNC _ _ 34 punc _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3145 # text = La courbe théorique représentant le meilleur fit ( en vert ) est indiquée lorsque la détermination des paramètres N ( nombre de site ) , Ka ( constante d'association ) , ? 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 courbe courbe NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 3 théorique théorique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 représentant représenter VPR _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 le le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 meilleur meilleur ADJ _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 fit faire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 ( ( PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 9 en en PRE _ _ 7 parenth _ _ _ _ _ 10 vert vert NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 ) ) PUNC _ _ 9 punc _ _ _ _ _ 12 est est NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 13 indiquée indiqué ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 14 lorsque lorsque CSU _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 la le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 détermination détermination NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 des de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 paramètres paramètre NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 N N NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 nombre nombre NOM _ _ 18 parenth _ _ _ _ _ 22 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 site site NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 25 , , PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ 26 Ka Ka NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 27 ( ( PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 28 constante constante NOM _ _ 26 parenth _ _ _ _ _ 29 d' de PRE _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 association association NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 ) ) PUNC _ _ 28 punc _ _ _ _ _ 32 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 33 ? ? PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3146 # text = H ( différence d'enthalpie ) et ? 1 H heure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 différence différence NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 enthalpie enthalpie NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 7 et et COO _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 ? ? PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3147 # text = S ( différence d'entropie ) associés à la réaction de fixation a été possible . 1 S S NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 2 ( ( PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 3 différence différence NOM _ _ 1 parenth _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 entropie entropie NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 ) ) PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ 7 associés associer ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 réaction réaction NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 fixation fixation NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 a avoir VRB _ _ 14 aux _ _ _ _ _ 14 été être VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 possible possible ADJ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3148 # text = Dans le cas où la détermination des paramètres n'a pas été possible , les données de l'expérience ( en noir ) sont représentée sans soustraction du signal de la dilution du peptide pour une meilleure comparaison des deux signaux . 1 Dans dans PRE _ _ 25 periph _ _ _ _ _ 2 le le DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 cas cas NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 où où PRQ _ _ 12 periph _ _ _ _ _ 5 la le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 détermination détermination NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 7 des de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 paramètres paramètre NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 n' ne ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 10 a avoir VRB _ _ 12 aux _ _ _ _ _ 11 pas pas ADV _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 été être VPP _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 13 possible possible ADJ _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 15 les le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 16 données donnée NOM _ _ 24 subj _ _ _ _ _ 17 de de PRE _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 l' le DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 19 expérience expérience NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 20 ( ( PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 21 en en PRE _ _ 16 parenth _ _ _ _ _ 22 noir noir NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ 24 sont être VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 25 représentée représenter VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 26 sans sans PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 soustraction soustraction NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 du de PRE _ _ 27 dep _ _ _ _ _ 29 signal signal NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 de de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 la le DET _ _ 32 spe _ _ _ _ _ 32 dilution dilution NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 du de PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 peptide peptide NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 pour pour PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 36 une un DET _ _ 38 spe _ _ _ _ _ 37 meilleure meilleur ADJ _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 38 comparaison comparaison NOM _ _ 35 dep _ _ _ _ _ 39 des de PRE _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 deux deux NUM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 41 signaux signal NOM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 42 . . PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3149 # text = Table du bas : 1 Table table NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 du de PRE _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 bas bas NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3150 # text = Pour chaque expérience , concentrations de peptide et de protéine utilisée , nombre de site et constante de dissociation déterminée . 1 Pour pour PRE _ _ 20 periph _ _ _ _ _ 2 chaque chaque DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 expérience expérience NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 5 concentrations concentration NOM _ _ 3 para _ _ _ _ _ 6 de de PRE _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 peptide peptide NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 9 mark _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 6 para _ _ _ _ _ 10 protéine protéine NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 utilisée utiliser ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 nombre nombre NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 site site NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 et et COO _ _ 17 mark _ _ _ _ _ 17 constante constante NOM _ _ 9 para _ _ _ _ _ 18 de de PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 dissociation dissociation NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 déterminée déterminer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 21 . . PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3151 # text = Pour chaque série d'expérience , valeurs moyennes des paramètres de la liaison . 1 Pour pour PRE _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 chaque chaque DET _ _ 3 spe _ _ _ _ _ 3 série série NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 d' de PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 expérience expérience NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 7 punc _ _ _ _ _ 7 valeurs valeur NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 moyennes moyen ADJ _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 des de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 paramètres paramètre NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 liaison liaison NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3152 # text = Annexe 5 1 Annexe annexer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 5 5 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3153 # text = Article soumis : 1 Article article NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 soumis soumettre ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 : : PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3154 # text = La mutation K61Q de Brdt et l'infertilité masculine 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 mutation mutation NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 K61Q K61Q NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 de de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 Brdt Brdt NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 et et COO _ _ 8 mark _ _ _ _ _ 7 l' le DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 8 infertilité infertilité NOM _ _ 5 para _ _ _ _ _ 9 masculine masculin ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3155 # text = Résumé 1 Résumé résumer VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3156 # text = Les modifications post-transcriptionnelles qui régulent la structure et la fonction de la chromatine sont reconnues par de multiples modules protéiques , dont les bromodomaines . 1 Les le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 modifications modification NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 3 post-transcriptionnelles post-transcriptionnelles ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 qui qui PRQ _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 5 régulent réguler VRB _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 6 la le DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 structure structure NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 et et COO _ _ 10 mark _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 fonction fonction NOM _ _ 7 para _ _ _ _ _ 11 de de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 la le DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 chromatine chromatine NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 sont être VRB _ _ 15 aux _ _ _ _ _ 15 reconnues reconnaître VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 16 par par PRE _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 de un DET _ _ 19 spe _ _ _ _ _ 18 multiples multiple ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 modules module NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 protéiques protéique ADJ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 22 dont dont PRQ _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 23 les le DET _ _ 24 spe _ _ _ _ _ 24 bromodomaines brome NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 15 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3157 # text = Alors que la reconnaissance de modifications individuelles des histones par ces modules est bien caractérisée , la reconnaissance d'histones portant plusieurs modifications est mal connue . 1 Alors alors que CSU _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 2 que alors que CSU _ _ 26 periph _ _ _ _ _ 3 la le DET _ _ 4 spe _ _ _ _ _ 4 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 15 subj _ _ _ _ _ 5 de de PRE _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 modifications modification NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 individuelles individuel ADJ _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 des de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 histones histone NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 par par PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 ces ce DET _ _ 12 spe _ _ _ _ _ 12 modules module NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 est être VRB _ _ 15 aux _ _ _ _ _ 14 bien bien ADV _ _ 15 periph _ _ _ _ _ 15 caractérisée caractériser VPP _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 2 punc _ _ _ _ _ 17 la le DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 18 reconnaissance reconnaissance NOM _ _ 26 subj _ _ _ _ _ 19 d' de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 histones histone NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 portant porter VPR _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 plusieurs plusieurs DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 modifications modification NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 est être VRB _ _ 26 aux _ _ _ _ _ 25 mal mal ADV _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 26 connue connaître VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 26 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3158 # text = Nous avons étudié comment Brdt s'associe à la chromatine acétylée par l'intermédiaire de ses deux bromodomaines ( BD1 et BD2 ) pour induire sa compaction au cours des dernières étapes de la spermatogenèse . 1 Nous nous CLS _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 3 aux _ _ _ _ _ 3 étudié étudier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 comment comment? ADV _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 5 Brdt Brdt NOM _ _ 7 subj _ _ _ _ _ 6 s' s' CLI _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 associe associer VRB _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 8 à à PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 la le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 chromatine chromatine NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 acétylée acétyle NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 par par PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 l' le DET _ _ 14 spe _ _ _ _ _ 14 intermédiaire intermédiaire NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 15 de de PRE _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 ses son DET _ _ 18 spe _ _ _ _ _ 17 deux deux NUM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 bromodomaines oromo NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 ( ( PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 20 BD1 BD1 NOM _ _ 18 parenth _ _ _ _ _ 21 et et COO _ _ 22 mark _ _ _ _ _ 22 BD2 BD2 NOM _ _ 20 para _ _ _ _ _ 23 ) ) PUNC _ _ 20 punc _ _ _ _ _ 24 pour pour PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 25 induire induire VNF _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 sa son DET _ _ 27 spe _ _ _ _ _ 27 compaction compaction NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 28 au au cours de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 29 cours au cours de DET _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 des au cours de PRE _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 31 dernières dernier ADJ _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 32 étapes étape NOM _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 33 de de PRE _ _ 32 dep _ _ _ _ _ 34 la le DET _ _ 35 spe _ _ _ _ _ 35 spermatogenèse spermatogenèse NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3159 # text = Nous avons également étudié l'effet de la mutation K61Q du premier bromodomaine de Brdt , impliquée dans certains cas d'infertilité masculine . 1 Nous nous CLS _ _ 4 subj _ _ _ _ _ 2 avons avoir VRB _ _ 4 aux _ _ _ _ _ 3 également également ADV _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 étudié étudier VPP _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 l' le DET _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 effet effet NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 7 de de PRE _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 la le DET _ _ 9 spe _ _ _ _ _ 9 mutation mutation NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 10 K61Q K61Q NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 du de PRE _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 premier premier ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 bromodomaine oromo NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 de de PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 Brdt Brdt NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 impliquée impliquer VPP _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 18 dans dans PRE _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 certains certain DET _ _ 20 spe _ _ _ _ _ 20 cas cas NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 21 d' de PRE _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 infertilité infertilité NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 masculine masculin ADJ _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 . . PUNC _ _ 4 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3160 # text = BD1 , bien que présentant une structure de bromodomaine classique , se montre sélectif pour des formes di-acétylées de la queue N terminale de l'histone H4 avec une préférence pour le peptide H 4 -K 5 / K 8 ac et ne montre pas d'affinité pour les peptides mono-acétylés H 4 -K 5 ac , H 4 -K 8 ac et H 4 -K 12 ac . 1 BD1 BD1 NOM _ _ 60 periph _ _ _ _ _ 2 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 3 bien bien que CSU _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 4 que bien que CSU _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 présentant présenter VPR _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 6 une un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 structure structure NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 de de PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 bromodomaine oromo NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 classique classique ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ 12 se se CLI _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 montre montrer VRB _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 14 sélectif sélectif ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 pour pour PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 16 des un DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 formes forme NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 18 di-acétylées di-acétylées NOM _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 de de PRE _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 la le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 queue queue NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 N N NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 terminale terminal ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 de de PRE _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 25 l' le DET _ _ 26 spe _ _ _ _ _ 26 histone histone NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 27 H4 H4 NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 avec avec PRE _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 une un DET _ _ 30 spe _ _ _ _ _ 30 préférence préférence NOM _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 31 pour pour PRE _ _ 30 dep _ _ _ _ _ 32 le le DET _ _ 33 spe _ _ _ _ _ 33 peptide peptide NOM _ _ 31 dep _ _ _ _ _ 34 H H NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 35 4 4 NUM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 36 -K -K VPR _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 37 5 5 NUM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 / sur PUNC _ _ 44 punc _ _ _ _ _ 39 K K NOM _ _ 38 dep _ _ _ _ _ 40 8 8 NUM _ _ 41 spe _ _ _ _ _ 41 ac ace NOM _ _ 13 subj _ _ _ _ _ 42 et et COO _ _ 44 mark _ _ _ _ _ 43 ne ne ADV _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 44 montre montrer VRB _ _ 13 para _ _ _ _ _ 45 pas pas ADV _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 46 d' de PRE _ _ 44 dep _ _ _ _ _ 47 affinité affinité NOM _ _ 60 periph _ _ _ _ _ 48 pour pour PRE _ _ 60 periph _ _ _ _ _ 49 les le DET _ _ 60 periph _ _ _ _ _ 50 peptides peptide NOM _ _ 60 periph _ _ _ _ _ 51 mono-acétylés mono- NOM _ _ 60 periph _ _ _ _ _ 52 H H NOM _ _ 60 periph _ _ _ _ _ 53 4 4 NUM _ _ 60 periph _ _ _ _ _ 54 -K -K ADJ _ _ 60 periph _ _ _ _ _ 55 5 5 NUM _ _ 60 periph _ _ _ _ _ 56 ac ac ADJ _ _ 60 periph _ _ _ _ _ 57 , , PUNC _ _ 56 punc _ _ _ _ _ 58 H H NOM _ _ 60 periph _ _ _ _ _ 59 4 4 NUM _ _ 60 dep _ _ _ _ _ 60 -K -K VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 61 8 8 NUM _ _ 60 dep _ _ _ _ _ 62 ac ac ADJ _ _ 60 dep _ _ _ _ _ 63 et et COO _ _ 60 dep _ _ _ _ _ 64 H H NOM _ _ 60 dep _ _ _ _ _ 65 4 4 NUM _ _ 60 dep _ _ _ _ _ 66 -K -K NOM _ _ 60 dep _ _ _ _ _ 67 12 12 NUM _ _ 60 dep _ _ _ _ _ 68 ac ace NOM _ _ 60 dep _ _ _ _ _ 69 . . PUNC _ _ 60 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3161 # text = Au contraire , BD2 présente un spécificité pour l'histone H3 mono-acétylée sur K18 . 1 Au à PRE _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 contraire contraire NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 BD2 BD2 NOM _ _ 5 subj _ _ _ _ _ 5 présente présenter VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 un un DET _ _ 7 spe _ _ _ _ _ 7 spécificité spécificité NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 pour pour PRE _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 l' le DET _ _ 10 spe _ _ _ _ _ 10 histone histone NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 H3 H3 NOM _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 mono-acétylée mono-acétylée ADJ _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 13 sur sur PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 14 K18 K18 NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 . . PUNC _ _ 5 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3162 # text = La structure cristallographique du complexe 1 La le DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 structure structure NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 cristallographique cristallographique ADJ _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 du de PRE _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 5 complexe complexe NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3163 # text = Brdt-BD 1 / H 4 -K 5 / K 8 ac révèle que les deux lysines acétylées se placent ensemble dans la cavité hydrophobe du bromodomaine . 1 Brdt-BD Brdt-BD NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 2 1 1 NUM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 / sur PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 H H NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 4 4 NUM _ _ 6 spe _ _ _ _ _ 6 -K -K NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 7 5 5 NUM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 / sur PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 9 K K NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 8 8 NUM _ _ 11 spe _ _ _ _ _ 11 ac ace NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 révèle révéler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 que que CSU _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 les le DET _ _ 16 spe _ _ _ _ _ 15 deux deux NUM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 lysines lysine NOM _ _ 19 subj _ _ _ _ _ 17 acétylées acétyle NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 18 se se CLI _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 placent placer VRB _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 20 ensemble ensemble ADV _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 dans dans PRE _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 22 la le DET _ _ 23 spe _ _ _ _ _ 23 cavité cavité NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 hydrophobe hydrophobe ADJ _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 du de PRE _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 bromodomaine bromé NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 . . PUNC _ _ 12 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3164 # text = Ces observations mettent en évidence un nouveau mode de lecture du code histone par lequel un bromodomaine reconnaît spécifiquement le motif formé par l'acétylation de deux lysines adjacentes . 1 Ces ce DET _ _ 2 spe _ _ _ _ _ 2 observations observation NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 3 mettent mettre VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 en en PRE _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 évidence évidence NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 un un DET _ _ 8 spe _ _ _ _ _ 7 nouveau nouveau ADJ _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 8 mode mode NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 9 de de PRE _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 10 lecture lecture NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 du de PRE _ _ 10 dep _ _ _ _ _ 12 code code NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 histone histone NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 par par PRE _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 15 lequel lequel PRQ _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 un un DET _ _ 17 spe _ _ _ _ _ 17 bromodomaine bromé NOM _ _ 18 subj _ _ _ _ _ 18 reconnaît reconnaître VRB _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 19 spécifiquement spécifiquement ADV _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 20 le le DET _ _ 21 spe _ _ _ _ _ 21 motif motif NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 22 formé former VPP _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 par par PRE _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 l' le DET _ _ 25 spe _ _ _ _ _ 25 acétylation acétylation NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 26 de de PRE _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 27 deux deux NUM _ _ 28 spe _ _ _ _ _ 28 lysines lysine NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 29 adjacentes adjacent ADJ _ _ 28 dep _ _ _ _ _ 30 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3165 # text = Mots clefs spermatogenèse , BRDT , bromodomaine , acetylation , histone , cristallographie aux rayons X , ITC . 1 Mots mots NOM _ _ 3 subj _ _ _ _ _ 2 clefs clef NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 spermatogenèse spermatogenèse VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 5 BRDT BRDT NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 7 bromodomaine brome NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 8 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 9 acetylation acetylation NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 10 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 11 histone histone NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 12 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 13 cristallographie cristallographie NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 14 aux à PRE _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 rayons rayons NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 X X ADJ _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ 18 ITC ITC NOM _ _ 15 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 3 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3166 # text = Summary 1 Summary Summary NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3167 # text = Post-translational histone modifications that regulate chromatin structure and function are recognized by diverse protein modules , including bromodomains . 1 Post-translational Post-translational NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 histone histone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 modifications modification NOM _ _ 2 dep _ _ _ _ _ 4 that that regulate chromatin structure and function are recognized NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 5 regulate that regulate chromatin structure and function are recognized NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 6 chromatin that regulate chromatin structure and function are recognized NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 7 structure that regulate chromatin structure and function are recognized NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 8 and that regulate chromatin structure and function are recognized NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 9 function that regulate chromatin structure and function are recognized NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 10 are that regulate chromatin structure and function are recognized NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 11 recognized that regulate chromatin structure and function are recognized NOM _ _ 14 subj _ _ _ _ _ 12 by By NOM _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 13 diverse divers ADJ _ _ 11 dep _ _ _ _ _ 14 protein protéiner VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 15 modules module NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 , , PUNC _ _ 17 punc _ _ _ _ _ 17 including inclure NOM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 18 bromodomains bromodomains ADJ _ _ 17 dep _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 14 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3168 # text = While the recognition of individual histone marks by such modules is well characterized , the recognition of histones bearing multiple modifications is only poorly understood . 1 While while the recognition of individual NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 2 the while the recognition of individual NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 3 recognition while the recognition of individual NOM _ _ 5 periph _ _ _ _ _ 4 of while the recognition of individual NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 5 individual while the recognition of individual NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 6 histone histone NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 7 marks mark NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 by by NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 9 such such NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 10 modules modules NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 11 is is NOM _ _ 13 periph _ _ _ _ _ 12 well well NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 13 characterized characterized NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 , , PUNC _ _ 25 punc _ _ _ _ _ 15 the the recognition of histones bearing multiple modifications is only poorly understood NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 16 recognition the recognition of histones bearing multiple modifications is only poorly understood NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 17 of the recognition of histones bearing multiple modifications is only poorly understood NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 18 histones the recognition of histones bearing multiple modifications is only poorly understood NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 19 bearing the recognition of histones bearing multiple modifications is only poorly understood NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 20 multiple the recognition of histones bearing multiple modifications is only poorly understood NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 21 modifications the recognition of histones bearing multiple modifications is only poorly understood NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 22 is the recognition of histones bearing multiple modifications is only poorly understood NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 23 only the recognition of histones bearing multiple modifications is only poorly understood NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 24 poorly the recognition of histones bearing multiple modifications is only poorly understood NOM _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 understood the recognition of histones bearing multiple modifications is only poorly understood NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3169 # text = Here we investigate how Brdt , a testis-specific member of the BET family of nuclear proteins , associates with hyperacetylated histones through its two bromodomains ( BD1 and BD2 ) to mediate chromatin remodelling during spermiogenesis . 1 Here Here NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 we we ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 investigate investir NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 4 how how VPR _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 5 Brdt Brdt NOM _ _ 4 dep _ _ _ _ _ 6 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 7 a a testis-specific member of the bet family of nuclear proteins NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 8 testis-specific a testis-specific member of the bet family of nuclear proteins NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 9 member a testis-specific member of the bet family of nuclear proteins NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 10 of a testis-specific member of the bet family of nuclear proteins NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 11 the a testis-specific member of the bet family of nuclear proteins NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 12 BET BET NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 13 family a testis-specific member of the bet family of nuclear proteins NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 14 of a testis-specific member of the bet family of nuclear proteins NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 15 nuclear a testis-specific member of the bet family of nuclear proteins NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 16 proteins a testis-specific member of the bet family of nuclear proteins NOM _ _ 5 dep _ _ _ _ _ 17 , , PUNC _ _ 36 punc _ _ _ _ _ 18 associates associates with hyperacetylated histones through its two bromodomains ( bd1 and bd2 ) to mediate chromatin remodelling during spermiogenesis NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 19 with associates with hyperacetylated histones through its two bromodomains ( bd1 and bd2 ) to mediate chromatin remodelling during spermiogenesis NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 20 hyperacetylated associates with hyperacetylated histones through its two bromodomains ( bd1 and bd2 ) to mediate chromatin remodelling during spermiogenesis NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 21 histones associates with hyperacetylated histones through its two bromodomains ( bd1 and bd2 ) to mediate chromatin remodelling during spermiogenesis NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 22 through associates with hyperacetylated histones through its two bromodomains ( bd1 and bd2 ) to mediate chromatin remodelling during spermiogenesis NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 23 its associates with hyperacetylated histones through its two bromodomains ( bd1 and bd2 ) to mediate chromatin remodelling during spermiogenesis NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 24 two associates with hyperacetylated histones through its two bromodomains ( bd1 and bd2 ) to mediate chromatin remodelling during spermiogenesis NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 25 bromodomains associates with hyperacetylated histones through its two bromodomains ( bd1 and bd2 ) to mediate chromatin remodelling during spermiogenesis NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 26 ( associates with hyperacetylated histones through its two bromodomains ( bd1 and bd2 ) to mediate chromatin remodelling during spermiogenesis PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 27 BD1 BD1 NOM _ _ 36 parenth _ _ _ _ _ 28 and associates with hyperacetylated histones through its two bromodomains ( bd1 and bd2 ) to mediate chromatin remodelling during spermiogenesis NOM _ _ 27 para _ _ _ _ _ 29 BD2 BD2 NOM _ _ 28 para _ _ _ _ _ 30 ) associates with hyperacetylated histones through its two bromodomains ( bd1 and bd2 ) to mediate chromatin remodelling during spermiogenesis PUNC _ _ 29 punc _ _ _ _ _ 31 to associates with hyperacetylated histones through its two bromodomains ( bd1 and bd2 ) to mediate chromatin remodelling during spermiogenesis NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 32 mediate associates with hyperacetylated histones through its two bromodomains ( bd1 and bd2 ) to mediate chromatin remodelling during spermiogenesis NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 33 chromatin associates with hyperacetylated histones through its two bromodomains ( bd1 and bd2 ) to mediate chromatin remodelling during spermiogenesis NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 34 remodelling associates with hyperacetylated histones through its two bromodomains ( bd1 and bd2 ) to mediate chromatin remodelling during spermiogenesis NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 35 during associates with hyperacetylated histones through its two bromodomains ( bd1 and bd2 ) to mediate chromatin remodelling during spermiogenesis NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 36 spermiogenesis associates with hyperacetylated histones through its two bromodomains ( bd1 and bd2 ) to mediate chromatin remodelling during spermiogenesis NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 37 . . PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3170 # text = Unlike canonical bromodomains , BD1 fails to bind singly acetylated histone tails but has the remarkable ability to recognize histone tails bearing two or more acetyl-lysine marks , with preference for a histone H4 tail dually acetylated on lysines 5 and 8 . 1 Unlike unlike canonical bromodomains NOM _ _ 3 periph _ _ _ _ _ 2 canonical unlike canonical bromodomains NOM _ _ 3 dep _ _ _ _ _ 3 bromodomains unlike canonical bromodomains NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 4 , , PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 5 BD1 BD1 NOM _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 6 fails bd1 fails to bind singly acetylated histone tails but has the remarkable ability to recognize histone tails bearing NOM _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 7 to bd1 fails to bind singly acetylated histone tails but has the remarkable ability to recognize histone tails bearing NOM _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 8 bind bd1 fails to bind singly acetylated histone tails but has the remarkable ability to recognize histone tails bearing NOM _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 9 singly bd1 fails to bind singly acetylated histone tails but has the remarkable ability to recognize histone tails bearing NOM _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 10 acetylated bd1 fails to bind singly acetylated histone tails but has the remarkable ability to recognize histone tails bearing NOM _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 11 histone bd1 fails to bind singly acetylated histone tails but has the remarkable ability to recognize histone tails bearing NOM _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 12 tails bd1 fails to bind singly acetylated histone tails but has the remarkable ability to recognize histone tails bearing NOM _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 13 but bd1 fails to bind singly acetylated histone tails but has the remarkable ability to recognize histone tails bearing NOM _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 14 has bd1 fails to bind singly acetylated histone tails but has the remarkable ability to recognize histone tails bearing NOM _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 15 the bd1 fails to bind singly acetylated histone tails but has the remarkable ability to recognize histone tails bearing NOM _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 16 remarkable bd1 fails to bind singly acetylated histone tails but has the remarkable ability to recognize histone tails bearing NOM _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 17 ability bd1 fails to bind singly acetylated histone tails but has the remarkable ability to recognize histone tails bearing NOM _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 18 to bd1 fails to bind singly acetylated histone tails but has the remarkable ability to recognize histone tails bearing NOM _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 19 recognize bd1 fails to bind singly acetylated histone tails but has the remarkable ability to recognize histone tails bearing NOM _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 20 histone bd1 fails to bind singly acetylated histone tails but has the remarkable ability to recognize histone tails bearing NOM _ _ 22 periph _ _ _ _ _ 21 tails bd1 fails to bind singly acetylated histone tails but has the remarkable ability to recognize histone tails bearing NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 22 bearing bd1 fails to bind singly acetylated histone tails but has the remarkable ability to recognize histone tails bearing NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 23 two tao NOM _ _ 22 dep _ _ _ _ _ 24 or or COO _ _ 25 mark _ _ _ _ _ 25 more more NOM _ _ 23 para _ _ _ _ _ 26 acetyl-lysine acétyle-lysine NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 27 marks mark NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 28 , , PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ 29 with with preference for a histone h4 tail dually acetylated NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 30 preference with preference for a histone h4 tail dually acetylated NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 31 for with preference for a histone h4 tail dually acetylated NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 32 a with preference for a histone h4 tail dually acetylated NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 33 histone with preference for a histone h4 tail dually acetylated NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 34 H4 H4 NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 35 tail with preference for a histone h4 tail dually acetylated NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 36 dually with preference for a histone h4 tail dually acetylated NOM _ _ 37 dep _ _ _ _ _ 37 acetylated with preference for a histone h4 tail dually acetylated NOM _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 38 on on CLS _ _ 0 root _ _ _ _ _ 39 lysines lysine NOM _ _ 41 subj _ _ _ _ _ 40 5 5 NUM _ _ 39 dep _ _ _ _ _ 41 and and VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 42 8 8 NUM _ _ 41 dep _ _ _ _ _ 43 . . PUNC _ _ 41 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3171 # text = In contrast , BD2 selectively associates with a histone H3 tail acetylated on lysine 18 but cannot discriminate mono- , di- and tetra-acetylated tails . 1 In in ADJ _ _ 0 root _ _ _ _ _ 2 contrast contrer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 4 BD2 BD2 NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 5 selectively sélectif NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 6 associates associer VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 with dit NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 8 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 9 histone histone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 10 H3 H3 NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 11 tail h3 tail acetylated NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 12 acetylated h3 tail acetylated NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 13 on on CLS _ _ 0 root _ _ _ _ _ 14 lysine lysine NOM _ _ 16 subj _ _ _ _ _ 15 18 18 NUM _ _ 14 dep _ _ _ _ _ 16 but boire VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 17 cannot cannot discriminate mono- NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 18 discriminate cannot discriminate mono- NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 19 mono- cannot discriminate mono- NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 20 , , PUNC _ _ 24 punc _ _ _ _ _ 21 di- di- and tetra-acetylated tails NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 22 and di- and tetra-acetylated tails NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 23 tetra-acetylated di- and tetra-acetylated tails NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 24 tails di- and tetra-acetylated tails NOM _ _ 16 dep _ _ _ _ _ 25 . . PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3172 # text = High-resolution crystal structures of BD1 and BD2 bound to their cognate substrates reveal the basis of this specificity . 1 High-resolution high-resolution crystal structures of bd1 and bd2 bound to their cognate substrates reveal the basis of this specificity NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 2 crystal high-resolution crystal structures of bd1 and bd2 bound to their cognate substrates reveal the basis of this specificity NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 3 structures high-resolution crystal structures of bd1 and bd2 bound to their cognate substrates reveal the basis of this specificity NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 4 of high-resolution crystal structures of bd1 and bd2 bound to their cognate substrates reveal the basis of this specificity NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 5 BD1 BD1 NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 6 and high-resolution crystal structures of bd1 and bd2 bound to their cognate substrates reveal the basis of this specificity NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 7 BD2 BD2 NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 8 bound high-resolution crystal structures of bd1 and bd2 bound to their cognate substrates reveal the basis of this specificity NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 9 to high-resolution crystal structures of bd1 and bd2 bound to their cognate substrates reveal the basis of this specificity NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 10 their high-resolution crystal structures of bd1 and bd2 bound to their cognate substrates reveal the basis of this specificity NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 11 cognate high-resolution crystal structures of bd1 and bd2 bound to their cognate substrates reveal the basis of this specificity NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 12 substrates high-resolution crystal structures of bd1 and bd2 bound to their cognate substrates reveal the basis of this specificity NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 13 reveal high-resolution crystal structures of bd1 and bd2 bound to their cognate substrates reveal the basis of this specificity NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 14 the high-resolution crystal structures of bd1 and bd2 bound to their cognate substrates reveal the basis of this specificity NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 15 basis high-resolution crystal structures of bd1 and bd2 bound to their cognate substrates reveal the basis of this specificity NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 16 of high-resolution crystal structures of bd1 and bd2 bound to their cognate substrates reveal the basis of this specificity NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 17 this high-resolution crystal structures of bd1 and bd2 bound to their cognate substrates reveal the basis of this specificity NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 specificity high-resolution crystal structures of bd1 and bd2 bound to their cognate substrates reveal the basis of this specificity NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 . . PUNC _ _ 18 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3173 # text = Selectivity of BD1 for a di-acetylated tail is due to a widened binding pocket that essentially accommodates the two acetyllysine residues as a single epitope . 1 Selectivity selectivity of bd1 for a di-acetylated tail is due to a widened binding pocket that essentially accommodates the two acetyllysine residues NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 2 of selectivity of bd1 for a di-acetylated tail is due to a widened binding pocket that essentially accommodates the two acetyllysine residues NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 3 BD1 BD1 NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 4 for selectivity of bd1 for a di-acetylated tail is due to a widened binding pocket that essentially accommodates the two acetyllysine residues NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 5 a selectivity of bd1 for a di-acetylated tail is due to a widened binding pocket that essentially accommodates the two acetyllysine residues NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 6 di-acetylated selectivity of bd1 for a di-acetylated tail is due to a widened binding pocket that essentially accommodates the two acetyllysine residues NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 7 tail selectivity of bd1 for a di-acetylated tail is due to a widened binding pocket that essentially accommodates the two acetyllysine residues NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 8 is selectivity of bd1 for a di-acetylated tail is due to a widened binding pocket that essentially accommodates the two acetyllysine residues NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 9 due selectivity of bd1 for a di-acetylated tail is due to a widened binding pocket that essentially accommodates the two acetyllysine residues NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 10 to selectivity of bd1 for a di-acetylated tail is due to a widened binding pocket that essentially accommodates the two acetyllysine residues NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 11 a selectivity of bd1 for a di-acetylated tail is due to a widened binding pocket that essentially accommodates the two acetyllysine residues NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 12 widened selectivity of bd1 for a di-acetylated tail is due to a widened binding pocket that essentially accommodates the two acetyllysine residues NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 13 binding selectivity of bd1 for a di-acetylated tail is due to a widened binding pocket that essentially accommodates the two acetyllysine residues NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 14 pocket selectivity of bd1 for a di-acetylated tail is due to a widened binding pocket that essentially accommodates the two acetyllysine residues NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 15 that selectivity of bd1 for a di-acetylated tail is due to a widened binding pocket that essentially accommodates the two acetyllysine residues NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 16 essentially selectivity of bd1 for a di-acetylated tail is due to a widened binding pocket that essentially accommodates the two acetyllysine residues NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 17 accommodates selectivity of bd1 for a di-acetylated tail is due to a widened binding pocket that essentially accommodates the two acetyllysine residues NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 18 the selectivity of bd1 for a di-acetylated tail is due to a widened binding pocket that essentially accommodates the two acetyllysine residues NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 19 two selectivity of bd1 for a di-acetylated tail is due to a widened binding pocket that essentially accommodates the two acetyllysine residues NOM _ _ 21 periph _ _ _ _ _ 20 acetyllysine selectivity of bd1 for a di-acetylated tail is due to a widened binding pocket that essentially accommodates the two acetyllysine residues NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 21 residues selectivity of bd1 for a di-acetylated tail is due to a widened binding pocket that essentially accommodates the two acetyllysine residues NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 22 as as NOM _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 a avoir VRB _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 24 single single NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 25 epitope épitope NOM _ _ 24 dep _ _ _ _ _ 26 . . PUNC _ _ 21 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3174 # text = Our findings highlight the complexity of the histone code by exemplifying a mode for the combinatorial readout of histone modifications in which two distinct post-translational marks on a histone tail are simultaneously recognized by a single chromatin-interaction module . 1 Our our findings highlight the complexity of the NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 2 findings our findings highlight the complexity of the NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 3 highlight our findings highlight the complexity of the NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 4 the our findings highlight the complexity of the NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 5 complexity our findings highlight the complexity of the NOM _ _ 7 periph _ _ _ _ _ 6 of our findings highlight the complexity of the NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 7 the our findings highlight the complexity of the NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 8 histone histone NOM _ _ 7 dep _ _ _ _ _ 9 code code NOM _ _ 12 subj _ _ _ _ _ 10 by By NOM _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 11 exemplifying exemplifying ADJ _ _ 9 dep _ _ _ _ _ 12 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 13 mode mode NOM _ _ 12 dep _ _ _ _ _ 14 for for the combinatorial readout of NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 15 the for the combinatorial readout of NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 16 combinatorial for the combinatorial readout of NOM _ _ 18 periph _ _ _ _ _ 17 readout for the combinatorial readout of NOM _ _ 18 dep _ _ _ _ _ 18 of for the combinatorial readout of NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 19 histone histone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 20 modifications modification NOM _ _ 19 dep _ _ _ _ _ 21 in in ADJ _ _ 20 dep _ _ _ _ _ 22 which chiche ADJ _ _ 21 dep _ _ _ _ _ 23 two tao NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 24 distinct distinct ADJ _ _ 25 dep _ _ _ _ _ 25 post-translational post-translational ADJ _ _ 26 dep _ _ _ _ _ 26 marks mark NOM _ _ 23 dep _ _ _ _ _ 27 on on CLS _ _ 28 subj _ _ _ _ _ 28 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 29 histone histone NOM _ _ 0 root _ _ _ _ _ 30 tail tail are simultaneously recognized NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 31 are tail are simultaneously recognized NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 32 simultaneously tail are simultaneously recognized NOM _ _ 33 dep _ _ _ _ _ 33 recognized tail are simultaneously recognized NOM _ _ 29 dep _ _ _ _ _ 34 by By NOM _ _ 35 subj _ _ _ _ _ 35 a avoir VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 36 single single NOM _ _ 38 subj _ _ _ _ _ 37 chromatin-interaction chromatine-interaction NOM _ _ 36 dep _ _ _ _ _ 38 module moduler VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 39 . . PUNC _ _ 38 punc _ _ _ _ _ # sent_id = cefc-scientext-these_281_bio_Moriniere-3175 # text = Keywords spermatogenesis , BRDT , bromodomain , acetylation , histone , X ray crystallography , ITC . 1 Keywords Keywords NOM _ _ 6 subj _ _ _ _ _ 2 spermatogenesis spermatogenesis ADJ _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 3 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 4 BRDT BRDT NOM _ _ 1 dep _ _ _ _ _ 5 , , PUNC _ _ 1 punc _ _ _ _ _ 6 bromodomain bromodomain VRB _ _ 0 root _ _ _ _ _ 7 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 8 acetylation acetylation NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 9 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 10 histone histone NOM _ _ 8 dep _ _ _ _ _ 11 , , PUNC _ _ 13 punc _ _ _ _ _ 12 X X DET _ _ 13 spe _ _ _ _ _ 13 ray ray NOM _ _ 6 dep _ _ _ _ _ 14 crystallography crystallography ADJ _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 15 , , PUNC _ _ 16 punc _ _ _ _ _ 16 ITC ITC NOM _ _ 13 dep _ _ _ _ _ 17 . . PUNC _ _ 6 punc _ _ _ _ _